Bilateria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298 #22 Chordata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298 #22 Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298 #22 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298 #22 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 153 ENSGT00940000156138 ENSGT00940000154273.a ENSGT00950000183106.a.b ENSGT00940000157383 ENSGT00940000156657 ENSGT00440000033697 ENSGT00940000156612 ENSGT00390000002109 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298 #22 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000159480 ENSGT01030000234564.b ENSGT00940000162526 ENSGT00950000183086.a.b ENSGT00940000156605 ENSGT00390000017343 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000159164 ENSGT00390000017213.A #37 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 725 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298 #22 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 107 ENSGT00940000159748 ENSGT01030000234629.A ENSGT00390000013354 ENSGT00940000156036 ENSGT00940000168539 ENSGT00390000017343 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000159164 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000168928 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298 #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000159540 #14 Amniota ANCESTRAL SPECIES 53 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000180930 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298 #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 ENSGT01000000214413.b.a.b.a Mammalia ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000158576 ENSGT01050000244838.B ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298 #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 ENSGT01000000214413.b.a.b.a Theria DUPLICATION Theria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01050000244838.B ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 ENSGT01000000214413.b.a.b.a Eutheria ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT01050000244838.B ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Primates DUPLICATION Primates DUPLICATION Primates ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.a.a #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.a.a #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT00910000146795 #33 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.a.a #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00910000146741 ENSGT00910000146645 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00910000148152 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.a.a #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Cercopithecidae DUPLICATION Cercopithecidae DUPLICATION Cercopithecidae DUPLICATION Cercopithecidae DUPLICATION Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.a.a.a.a.a #22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00910000146741 ENSGT00910000146645 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00910000148152 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.a.a.a.a.a.a #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT00910000146795 #33 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 229 ENSGT00580000082664.b.a.b ENSGT00940000153298.n.a.a.a.a.a.a #22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.a.a.a.a.a #22 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000162469 ENSGT00940000158576 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.a.a.a.a.a.a #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT00910000146795 #33 ENSGT01030000237444 #34 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 Rhesus MODERN SPECIES 2 KCNA5 (ENSMMUG00000022887) #7 ENSMMUG00000056181 #8 NTF3 (ENSMMUG00000014646) #9 VWF (ENSMMUG00000022893) #10 ENSMMUG00000061974 #11 CD9 (ENSMMUG00000004470) #12 PLEKHG6 (ENSMMUG00000000375) #13 TNFRSF1A (ENSMMUG00000000377) #14 SCNN1A (ENSMMUG00000020212) #15 LTBR (ENSMMUG00000020213) #16 ENSMMUG00000053013 #17 TAPBPL (ENSMMUG00000014265) #18 VAMP1 (ENSMMUG00000053354) #19 MRPL51 (ENSMMUG00000018676) #20 NCAPD2 (ENSMMUG00000018677) #21 GAPDH (ENSMMUG00000018679) #22 IFFO1 (ENSMMUG00000018681) #23 NOP2 (ENSMMUG00000018683) #24 CHD4 (ENSMMUG00000018685) #25 LPAR5 (ENSMMUG00000017619) #26 ACRBP (ENSMMUG00000016983) #27 ING4 (ENSMMUG00000016985) #28 ZNF384 (ENSMMUG00000016990) #29 PIANP (ENSMMUG00000050979) #30 COPS7A (ENSMMUG00000009583) #31 MLF2 (ENSMMUG00000012206) #32 ENSMMUG00000050151 #33 ENSMMUG00000039070 #34 LAG3 (ENSMMUG00000056979) #35 CD4 (ENSMMUG00000013202) #36 GPR162 (ENSMMUG00000049147) #37 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 241 ENSGT00580000082664.b.a.b ENSGT00940000153298.n.a.a.a.a.a.a #22 Olive baboon DUPLICATION Olive baboon MODERN SPECIES 4 ENSPANG00000025325 SIGMAR1 (ENSPANG00000025324) ARID3C (ENSPANG00000025316) DCTN3 (ENSPANG00000032813) RPP25L (ENSPANG00000033963) CNTFR (ENSPANG00000025318) ENHO (ENSPANG00000011315) DNAI1 (ENSPANG00000025319) FAM219A (ENSPANG00000025320) C9orf24 (ENSPANG00000025321) MYORG (ENSPANG00000004832) NUDT2 (ENSPANG00000035572) KIF24 (ENSPANG00000025323) UBAP1 (ENSPANG00000025315) DCAF12 (ENSPANG00000025306) ENSPANG00000025164 #22 UBAP2 (ENSPANG00000025308) UBE2R2 (ENSPANG00000025309) NOL6 (ENSPANG00000025310) AQP3 (ENSPANG00000048614) ENSPANG00000025305 NFX1 (ENSPANG00000025304) ENSPANG00000031145 BAG1 (ENSPANG00000025295) SPINK4 (ENSPANG00000025296) B4GALT1 (ENSPANG00000025297) SMU1 (ENSPANG00000025298) ENSPANG00000025299 ENSPANG00000025300 APTX (ENSPANG00000025301) TMEM215 (ENSPANG00000004499) Olive baboon MODERN SPECIES 14 OR2A12 (ENSPANG00000038805) OR2A2 (ENSPANG00000046769) OR2A14 (ENSPANG00000036964) ENSPANG00000046917 ENSPANG00000050261 ENSPANG00000040450 ENSPANG00000038612 ARHGEF5 (ENSPANG00000016463) NOBOX (ENSPANG00000018829) ENSPANG00000045091 TPK1 (ENSPANG00000002884) ENSPANG00000042289 ##17 ENSPANG00000029439 ENSPANG00000047822 ENSPANG00000040234 ENSPANG00000014626 #22 CNTNAP2 (ENSPANG00000008720) ENSPANG00000046018 C7orf33 (ENSPANG00000007102) ENSPANG00000039378 ##17 ENSPANG00000034490 CUL1 (ENSPANG00000000866) EZH2 (ENSPANG00000018691) PDIA4 (ENSPANG00000017763) ZNF425 (ENSPANG00000021720) ZNF398 (ENSPANG00000046420) ENSPANG00000042111 ZNF783 (ENSPANG00000008719) ZNF777 (ENSPANG00000023421) ZNF746 (ENSPANG00000017316) KRBA1 (ENSPANG00000013260) Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.a.a.a.a.a #22 Sooty mangabey MODERN SPECIES 609 ANO2 (ENSCATG00000031462) VWF (ENSCATG00000015582) #10 CD9 (ENSCATG00000042280) #12 PLEKHG6 (ENSCATG00000036270) #13 TNFRSF1A (ENSCATG00000034361) #14 SCNN1A (ENSCATG00000044711) #15 LTBR (ENSCATG00000033469) #16 CD27 (ENSCATG00000035274) TAPBPL (ENSCATG00000045104) #18 ENSCATG00000041389 VAMP1 (ENSCATG00000037454) #19 ENSCATG00000040777 ENSCATG00000035721 MRPL51 (ENSCATG00000035810) #20 NCAPD2 (ENSCATG00000040137) #21 ENSCATG00000044359 #22 IFFO1 (ENSCATG00000028701) #23 ENSCATG00000006182 #24 CHD4 (ENSCATG00000006345) #25 LPAR5 (ENSCATG00000006398) #26 ACRBP (ENSCATG00000034388) #27 ING4 (ENSCATG00000030917) #28 ZNF384 (ENSCATG00000008991) #29 PIANP (ENSCATG00000035419) #30 COPS7A (ENSCATG00000030189) #31 MLF2 (ENSCATG00000040743) #32 ENSCATG00000041394 #33 LAG3 (ENSCATG00000042803) #35 CD4 (ENSCATG00000038270) #36 GPR162 (ENSCATG00000029723) #37 P3H3 (ENSCATG00000040167) Vervet Monkey DUPLICATION Vervet Monkey MODERN SPECIES 2 KCNA1 (ENSCSAG00000019220) KCNA5 (ENSCSAG00000019221) #7 NTF3 (ENSCSAG00000010965) #9 ANO2 (ENSCSAG00000010915) VWF (ENSCSAG00000010786) #10 CD9 (ENSCSAG00000010749) #12 PLEKHG6 (ENSCSAG00000010727) #13 TNFRSF1A (ENSCSAG00000010687) #14 SCNN1A (ENSCSAG00000010676) #15 LTBR (ENSCSAG00000010660) #16 CD27 (ENSCSAG00000010635) TAPBPL (ENSCSAG00000010603) #18 ENSCSAG00000010592 #19 MRPL51 (ENSCSAG00000010565) #20 NCAPD2 (ENSCSAG00000010550) #21 ENSCSAG00000010531 #22 IFFO1 (ENSCSAG00000010518) #23 NOP2 (ENSCSAG00000010484) CHD4 (ENSCSAG00000010429) #25 LPAR5 (ENSCSAG00000019222) #26 ACRBP (ENSCSAG00000010413) #27 ING4 (ENSCSAG00000010403) #28 ZNF384 (ENSCSAG00000010379) #29 PIANP (ENSCSAG00000010351) #30 COPS7A (ENSCSAG00000010346) #31 MLF2 (ENSCSAG00000010338) #32 ENSCSAG00000010328 LAG3 (ENSCSAG00000010305) #35 CD4 (ENSCSAG00000010263) #36 GPR162 (ENSCSAG00000010255) #37 P3H3 (ENSCSAG00000010242) Vervet Monkey MODERN SPECIES 15 ENSCSAG00000012474 RELL2 (ENSCSAG00000012463) FCHSD1 (ENSCSAG00000012453) ARAP3 (ENSCSAG00000012438) ENSCSAG00000000483 PCDH1 (ENSCSAG00000012421) DELE1 (ENSCSAG00000012414) PCDH12 (ENSCSAG00000012406) RNF14 (ENSCSAG00000012400) GNPDA1 (ENSCSAG00000012395) NDFIP1 (ENSCSAG00000012390) SPRY4 (ENSCSAG00000012384) FGF1 (ENSCSAG00000012382) ARHGAP26 (ENSCSAG00000012374) NR3C1 (ENSCSAG00000012355) ENSCSAG00000012347 #22 HMHB1 (ENSCSAG00000012344) YIPF5 (ENSCSAG00000012338) KCTD16 (ENSCSAG00000000482) PRELID2 (ENSCSAG00000012305) GRXCR2 (ENSCSAG00000012295) SH3RF2 (ENSCSAG00000012292) PLAC8L1 (ENSCSAG00000012285) LARS1 (ENSCSAG00000012280) ENSCSAG00000019715 RBM27 (ENSCSAG00000012270) POU4F3 (ENSCSAG00000012256) TCERG1 (ENSCSAG00000012253) GPR151 (ENSCSAG00000019716) PPP2R2B (ENSCSAG00000012240) STK32A (ENSCSAG00000012228) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 471 ENSGT00390000008712 ENSGT00730000111116 ENSGT00940000156994 ENSGT00940000156972 ENSGT00940000161291 ENSGT00390000005372 ENSGT00940000160454 ENSGT00940000153173.b.a ENSGT00940000153979.A ENSGT00940000155518 ENSGT00940000153298.n.a.a.a.a.a.a #22 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 990 SLC4A10 (ENSRROG00000035249) DPP4 (ENSRROG00000044466) GCG (ENSRROG00000040389) ENSRROG00000041536 FAP (ENSRROG00000037166) IFIH1 (ENSRROG00000030959) GCA (ENSRROG00000032090) ENSRROG00000021640 #22 KCNH7 (ENSRROG00000042455) ENSRROG00000013338 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1026 GCG (ENSRBIG00000037468) FAP (ENSRBIG00000038012) IFIH1 (ENSRBIG00000029188) GCA (ENSRBIG00000000271) ENSRBIG00000034718 #22 KCNH7 (ENSRBIG00000039134) ENSRBIG00000030858 FIGN (ENSRBIG00000031693) ENSRBIG00000029608 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00910000146741 ENSGT00910000146645 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00910000148152 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.a.a.a.a.a.b ##22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.a.a.a.a.b ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00910000146741 ENSGT00910000146645 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00910000148152 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.a.a.a.a.a.b ##22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT00910000146795 #33 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00910000146741 ENSGT00910000146645 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00910000148152 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.a.a.a.a.a.b ##22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT00910000146795 #33 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 ENSGT01000000214413.b.a.b.a Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 66 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00910000146741 ENSGT00910000146645 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00910000148152 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.a.a.a.a.a.b ##22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT00910000146795 #33 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 ENSGT01000000214413.b.a.b.a Sooty mangabey MODERN SPECIES 235 INSC (ENSCATG00000035904) CALCB (ENSCATG00000041190) CALCA (ENSCATG00000027244) ENSCATG00000042154 CYP2R1 (ENSCATG00000039518) PDE3B (ENSCATG00000038221) PSMA1 (ENSCATG00000014932) COPB1 (ENSCATG00000040822) ENSCATG00000005978 RRAS2 (ENSCATG00000043382) SPON1 (ENSCATG00000031426) FAR1 (ENSCATG00000039474) PTH (ENSCATG00000011856) BTBD10 (ENSCATG00000020038) BMAL1 (ENSCATG00000014877) ENSCATG00000031725 ##22 ENSCATG00000035301 RASSF10 (ENSCATG00000023676) ENSCATG00000015452 TEAD1 (ENSCATG00000043730) ENSCATG00000018831 PARVA (ENSCATG00000041795) ENSCATG00000000895 MICAL2 (ENSCATG00000045145) DKK3 (ENSCATG00000029806) USP47 (ENSCATG00000034539) GALNT18 (ENSCATG00000008794) EIF4G2 (ENSCATG00000040907) CTR9 (ENSCATG00000033343) IRAG1 (ENSCATG00000039606) LYVE1 (ENSCATG00000009025) Drill MODERN SPECIES 866 VWF (ENSMLEG00000006574) #10 ENSMLEG00000001187 CD9 (ENSMLEG00000044399) #12 PLEKHG6 (ENSMLEG00000041883) #13 TNFRSF1A (ENSMLEG00000041673) #14 SCNN1A (ENSMLEG00000034622) #15 LTBR (ENSMLEG00000029285) #16 CD27 (ENSMLEG00000029295) TAPBPL (ENSMLEG00000029420) #18 ENSMLEG00000037220 VAMP1 (ENSMLEG00000042043) #19 ENSMLEG00000040133 ENSMLEG00000037892 MRPL51 (ENSMLEG00000033346) #20 NCAPD2 (ENSMLEG00000029348) #21 GAPDH (ENSMLEG00000017088) ##22 IFFO1 (ENSMLEG00000041307) #23 ENSMLEG00000043675 #24 CHD4 (ENSMLEG00000024661) #25 ACRBP (ENSMLEG00000040276) #27 ING4 (ENSMLEG00000028668) #28 ZNF384 (ENSMLEG00000027305) #29 PIANP (ENSMLEG00000041991) #30 COPS7A (ENSMLEG00000037093) #31 MLF2 (ENSMLEG00000037897) #32 ENSMLEG00000039403 #33 LAG3 (ENSMLEG00000009222) #35 CD4 (ENSMLEG00000032879) #36 GPR162 (ENSMLEG00000013920) #37 P3H3 (ENSMLEG00000013218) GNB3 (ENSMLEG00000025857) Macaca ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00910000146741 ENSGT00910000146645 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.a.a.a.a.a.b ##22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT00910000146795 #33 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 593 ANO2 (ENSMNEG00000032451) VWF (ENSMNEG00000042662) #10 CD9 (ENSMNEG00000042314) #12 ENSMNEG00000019715 PLEKHG6 (ENSMNEG00000029942) #13 TNFRSF1A (ENSMNEG00000030151) #14 SCNN1A (ENSMNEG00000029812) #15 LTBR (ENSMNEG00000030358) #16 CD27 (ENSMNEG00000007757) TAPBPL (ENSMNEG00000013053) #18 ENSMNEG00000033079 VAMP1 (ENSMNEG00000006897) #19 ENSMNEG00000040627 MRPL51 (ENSMNEG00000032063) #20 NCAPD2 (ENSMNEG00000038279) #21 GAPDH (ENSMNEG00000040437) ##22 IFFO1 (ENSMNEG00000039291) #23 ENSMNEG00000034027 #24 CHD4 (ENSMNEG00000044776) #25 LPAR5 (ENSMNEG00000011351) #26 ACRBP (ENSMNEG00000042749) #27 ING4 (ENSMNEG00000038607) #28 ZNF384 (ENSMNEG00000029452) #29 PIANP (ENSMNEG00000033631) #30 COPS7A (ENSMNEG00000031298) #31 MLF2 (ENSMNEG00000034081) #32 ENSMNEG00000033214 #33 LAG3 (ENSMNEG00000024032) #35 CD4 (ENSMNEG00000043009) #36 GPR162 (ENSMNEG00000041385) #37 P3H3 (ENSMNEG00000028584) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 54 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00910000146741 ENSGT01030000240266 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821.n #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.a.a.a.a.a.b ##22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT00910000146795 #33 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2549 NTF3 (ENSRROG00000011645) #9 ANO2 (ENSRROG00000039334) VWF (ENSRROG00000042864) #10 CD9 (ENSRROG00000013322) #12 PLEKHG6 (ENSRROG00000041873) #13 TNFRSF1A (ENSRROG00000029169) #14 SCNN1A (ENSRROG00000044856) #15 LTBR (ENSRROG00000041807) #16 CD27 (ENSRROG00000030539) ENSRROG00000033196 TAPBPL (ENSRROG00000045610) #18 VAMP1 (ENSRROG00000035855) #19 ENSRROG00000033245 #20 NCAPD2 (ENSRROG00000037510) #21 ENSRROG00000030690 ##22 IFFO1 (ENSRROG00000039769) #23 NOP2 (ENSRROG00000041019) CHD4 (ENSRROG00000042446) #25 LPAR5 (ENSRROG00000018849) #26 ACRBP (ENSRROG00000036460) #27 ING4 (ENSRROG00000040119) #28 ZNF384 (ENSRROG00000034990) #29 PIANP (ENSRROG00000034978) #30 COPS7A (ENSRROG00000041726) #31 MLF2 (ENSRROG00000038823) #32 ENSRROG00000044634 #33 LAG3 (ENSRROG00000030083) #35 CD4 (ENSRROG00000028161) #36 GPR162 (ENSRROG00000042378) #37 P3H3 (ENSRROG00000030746) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.a.a.a.b ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.a.a.a.b ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.a.a.a.b ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.a.a.a.b ##22 Olive baboon MODERN SPECIES 19 KCNA5 (ENSPANG00000006640) #7 NTF3 (ENSPANG00000018735) #9 VWF (ENSPANG00000026470) #10 CD9 (ENSPANG00000019524) #12 ENSPANG00000035005 PLEKHG6 (ENSPANG00000010167) #13 TNFRSF1A (ENSPANG00000025410) #14 SCNN1A (ENSPANG00000009143) #15 ENSPANG00000013116 #16 ENSPANG00000047682 #16 CD27 (ENSPANG00000010690) TAPBPL (ENSPANG00000017797) #18 VAMP1 (ENSPANG00000024944) #19 MRPL51 (ENSPANG00000044908) #20 NCAPD2 (ENSPANG00000017213) #21 ENSPANG00000020757 ##22 IFFO1 (ENSPANG00000006041) #23 ENSPANG00000024426 #24 CHD4 (ENSPANG00000025409) #25 LPAR5 (ENSPANG00000011288) #26 ACRBP (ENSPANG00000017796) #27 ING4 (ENSPANG00000008024) #28 ZNF384 (ENSPANG00000014845) #29 PIANP (ENSPANG00000019209) #30 COPS7A (ENSPANG00000010017) #31 MLF2 (ENSPANG00000012265) #32 ENSPANG00000001015 #33 LAG3 (ENSPANG00000001016) #35 CD4 (ENSPANG00000020297) #36 GPR162 (ENSPANG00000014122) #37 P3H3 (ENSPANG00000020167) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.a.a.b ##22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000158947 ENSGT00950000183011.c.a.a ENSGT00950000182931.B.a.b ENSGT00390000008859.b.d.k.a.a ENSGT00940000156361.B ENSGT00940000157665 ENSGT00940000158083 ENSGT00940000155356 ENSGT00940000158175 ENSGT00940000157025 ENSGT00940000169252 ENSGT00940000160958 ENSGT00390000001969.a ENSGT00390000011648.b ENSGT00940000156496 ENSGT00940000153298.n.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000158791 ENSGT00940000154955.f ENSGT00510000047030.xb.a.d ENSGT00940000155644 ENSGT00940000160965 ENSGT00950000182945.b.a.a.b.a ENSGT00940000156024 ENSGT00950000183119.a.e.a.d.b ENSGT00390000000873.a.a ENSGT00940000159166 ENSGT00950000182852.B ENSGT00940000155343 ENSGT00940000158400 ENSGT00530000063849.B ENSGT00940000160251.g Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 3344 ENSRROG00000026617 ENSRROG00000035234 ##22 LRIG2 (ENSRROG00000045450) SLC16A1 (ENSRROG00000045095) ENSRROG00000042524 TAFA3 (ENSRROG00000044261) PPM1J (ENSRROG00000042626) RHOC (ENSRROG00000035409) MOV10 (ENSRROG00000041135) CAPZA1 (ENSRROG00000038535) ST7L (ENSRROG00000036748) WNT2B (ENSRROG00000033069) CTTNBP2NL (ENSRROG00000031464) ENSRROG00000009633 KCND3 (ENSRROG00000034849) DDX20 (ENSRROG00000030608) INKA2 (ENSRROG00000024632) Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 299 AMPD1 (ENSRBIG00000042678) DENND2C (ENSRBIG00000040882) BCAS2 (ENSRBIG00000036310) TRIM33 (ENSRBIG00000044424) SYT6 (ENSRBIG00000033598) OLFML3 (ENSRBIG00000037707) HIPK1 (ENSRBIG00000028252) DCLRE1B (ENSRBIG00000032633) AP4B1 (ENSRBIG00000041004) ENSRBIG00000028387 PTPN22 (ENSRBIG00000039476) RSBN1 (ENSRBIG00000038594) PHTF1 (ENSRBIG00000033612) MAGI3 (ENSRBIG00000030469) ENSRBIG00000032312 ENSRBIG00000033233 ##22 LRIG2 (ENSRBIG00000032197) SLC16A1 (ENSRBIG00000029892) TAFA3 (ENSRBIG00000040034) PPM1J (ENSRBIG00000030076) RHOC (ENSRBIG00000040896) MOV10 (ENSRBIG00000040802) CAPZA1 (ENSRBIG00000015622) ST7L (ENSRBIG00000042439) WNT2B (ENSRBIG00000027268) CTTNBP2NL (ENSRBIG00000038104) ENSRBIG00000020563 KCND3 (ENSRBIG00000027724) DDX20 (ENSRBIG00000030629) INKA2 (ENSRBIG00000020811) RAP1A (ENSRBIG00000016227) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.a.b ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.a.b ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 228 ENSGT00580000082664.b.b ENSGT00940000153298.n.a.a.b ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 240 ENSGT00580000082664.b.b ENSGT00940000153298.n.a.a.b ##22 Olive baboon MODERN SPECIES 16 UBD (ENSPANG00000041372) OR10C1 (ENSPANG00000037061) OR11A1 (ENSPANG00000040622) ENSPANG00000017571 OR5V1 (ENSPANG00000003458) OR14J1 (ENSPANG00000041457) ENSPANG00000013952 OR2J3 (ENSPANG00000019387) ENSPANG00000038289 OR2B3 (ENSPANG00000048715) OR2W1 (ENSPANG00000050377) ENSPANG00000042549 ##11 ZNF311 (ENSPANG00000047970) TRIM27 (ENSPANG00000006411) ENSPANG00000047616 ENSPANG00000043609 ##22 ENSPANG00000038283 ENSPANG00000049126 ##11 SCAND3 (ENSPANG00000026311) GPX5 (ENSPANG00000009596) GPX6 (ENSPANG00000032181) ZSCAN12 (ENSPANG00000026498) ZKSCAN3 (ENSPANG00000008440) ZSCAN31 (ENSPANG00000020275) PGBD1 (ENSPANG00000016270) ZSCAN26 (ENSPANG00000026502) NKAPL (ENSPANG00000045195) ZKSCAN4 (ENSPANG00000026499) ZSCAN9 (ENSPANG00000013432) ENSPANG00000042263 ZKSCAN8 (ENSPANG00000007710) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.a #22 Gibbon MODERN SPECIES 15 NTF3 (ENSNLEG00000003262) #9 ANO2 (ENSNLEG00000003269) VWF (ENSNLEG00000003335) #10 CD9 (ENSNLEG00000003491) #12 PLEKHG6 (ENSNLEG00000003548) #13 TNFRSF1A (ENSNLEG00000034897) #14 ENSNLEG00000035453 #15 ENSNLEG00000003663 #16 CD27 (ENSNLEG00000003696) ENSNLEG00000032099 TAPBPL (ENSNLEG00000003709) #18 ENSNLEG00000030784 VAMP1 (ENSNLEG00000003714) #19 MRPL51 (ENSNLEG00000033120) #20 NCAPD2 (ENSNLEG00000003743) #21 GAPDH (ENSNLEG00000003825) #22 IFFO1 (ENSNLEG00000004195) #23 NOP2 (ENSNLEG00000004242) CHD4 (ENSNLEG00000004330) #25 LPAR5 (ENSNLEG00000004406) #26 ACRBP (ENSNLEG00000004414) #27 ING4 (ENSNLEG00000004431) #28 ZNF384 (ENSNLEG00000004506) #29 PIANP (ENSNLEG00000032075) #30 COPS7A (ENSNLEG00000004510) #31 MLF2 (ENSNLEG00000004587) #32 ENSNLEG00000004666 #33 ENSNLEG00000004668 #35 CD4 (ENSNLEG00000004671) #36 GPR162 (ENSNLEG00000004700) #37 P3H3 (ENSNLEG00000004705) Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.a #22 Orangutan MODERN SPECIES 3 KCNA1 (ENSPPYG00000004174) KCNA5 (ENSPPYG00000004176) #7 NTF3 (ENSPPYG00000004178) #9 ANO2 (ENSPPYG00000004179) VWF (ENSPPYG00000004180) #10 CD9 (ENSPPYG00000004181) #12 PLEKHG6 (ENSPPYG00000004182) #13 TNFRSF1A (ENSPPYG00000004183) #14 SCNN1A (ENSPPYG00000004184) #15 LTBR (ENSPPYG00000039662) #16 CD27 (ENSPPYG00000029486) TAPBPL (ENSPPYG00000004186) #18 VAMP1 (ENSPPYG00000004187) #19 MRPL51 (ENSPPYG00000025846) #20 NCAPD2 (ENSPPYG00000004188) #21 GAPDH (ENSPPYG00000004189) #22 IFFO1 (ENSPPYG00000004190) #23 ENSPPYG00000004191 #24 CHD4 (ENSPPYG00000004192) #25 LPAR5 (ENSPPYG00000004193) #26 ACRBP (ENSPPYG00000004194) #27 ING4 (ENSPPYG00000004195) #28 ZNF384 (ENSPPYG00000004196) #29 PIANP (ENSPPYG00000004197) #30 COPS7A (ENSPPYG00000004198) #31 MLF2 (ENSPPYG00000004199) #32 ENSPPYG00000041549 #33 LAG3 (ENSPPYG00000004201) #35 CD4 (ENSPPYG00000004202) #36 GPR162 (ENSPPYG00000038576) #37 P3H3 (ENSPPYG00000004203) Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.a #22 Gorilla MODERN SPECIES 7 CD19 (ENSGGOG00000016827) RABEP2 (ENSGGOG00000008495) ENSGGOG00000008480 SH2B1 (ENSGGOG00000008472) TUFM (ENSGGOG00000014136) ATXN2L (ENSGGOG00000014112) EIF3C (ENSGGOG00000026919) ENSGGOG00000000809 ENSGGOG00000000807 NUPR1 (ENSGGOG00000000172) IL27 (ENSGGOG00000027232) APOBR (ENSGGOG00000001087) CLN3 (ENSGGOG00000015016) ENSGGOG00000022677 SBK1 (ENSGGOG00000000573) ENSGGOG00000022519 #22 ENSGGOG00000040086 ENSGGOG00000037385 XPO6 (ENSGGOG00000005609) ENSGGOG00000022579 ENSGGOG00000038647 KATNIP (ENSGGOG00000017086) GTF3C1 (ENSGGOG00000016666) IL21R (ENSGGOG00000041263) IL4R (ENSGGOG00000003023) NSMCE1 (ENSGGOG00000006501) KDM8 (ENSGGOG00000006500) ENSGGOG00000037200 ENSGGOG00000040712 HS3ST4 (ENSGGOG00000009681) ZKSCAN2 (ENSGGOG00000004769) Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.a #22 Pan ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.a #22 Chimpanzee MODERN SPECIES 7 ATP2A1 (ENSPTRG00000007941) SH2B1 (ENSPTRG00000007940) TUFM (ENSPTRG00000007939) ATXN2L (ENSPTRG00000007938) ENSPTRG00000044092 ENSPTRG00000051496 SULT1A2 (ENSPTRG00000034249) SGF29 (ENSPTRG00000007925) NUPR1 (ENSPTRG00000007926) IL27 (ENSPTRG00000007927) LAT (ENSPTRG00000034140) SPNS1 (ENSPTRG00000048927) NFATC2IP (ENSPTRG00000007945) CLN3 (ENSPTRG00000007930) SBK1 (ENSPTRG00000046337) ENSPTRG00000048258 #22 XPO6 (ENSPTRG00000007919) GSG1L (ENSPTRG00000007918) ENSPTRG00000046233 KATNIP (ENSPTRG00000007917) GTF3C1 (ENSPTRG00000007915) IL21R (ENSPTRG00000052817) IL4R (ENSPTRG00000007913) NSMCE1 (ENSPTRG00000007912) KDM8 (ENSPTRG00000007910) ENSPTRG00000044737 ENSPTRG00000048703 ENSPTRG00000047452 ENSPTRG00000046595 HS3ST4 (ENSPTRG00000045995) ZKSCAN2 (ENSPTRG00000007906) Platyrrhini DUPLICATION Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.a.c #22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.a.c #22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.a.c #22 Capuchin MODERN SPECIES 353 CCDC39 (ENSCCAG00000021606) TTC14 (ENSCCAG00000025759) PEX5L (ENSCCAG00000026024) USP13 (ENSCCAG00000021400) NDUFB5 (ENSCCAG00000022016) ENSCCAG00000002926 MRPL47 (ENSCCAG00000037348) ACTL6A (ENSCCAG00000029449) GNB4 (ENSCCAG00000025823) MFN1 (ENSCCAG00000021450) ZNF639 (ENSCCAG00000025690) ENSCCAG00000034140 PIK3CA (ENSCCAG00000028165) ENSCCAG00000037391 #22 ZMAT3 (ENSCCAG00000036721) KCNMB2 (ENSCCAG00000028554) Platyrrhini DUPLICATION Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.a.d.a #22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.a.d.a #22 Cebidae_a DUPLICATION Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.a.d.a.a #22 Capuchin DUPLICATION Capuchin MODERN SPECIES 71 PKD2L1 (ENSCCAG00000033020) ENSCCAG00000027065 CWF19L1 (ENSCCAG00000031321) CHUK (ENSCCAG00000033466) ERLIN1 (ENSCCAG00000036463) CPN1 (ENSCCAG00000031716) DNMBP (ENSCCAG00000036319) ABCC2 (ENSCCAG00000037977) CUTC (ENSCCAG00000034368) COX15 (ENSCCAG00000013919) ENTPD7 (ENSCCAG00000031589) SLC25A28 (ENSCCAG00000022364) NKX2-3 (ENSCCAG00000028510) GOT1 (ENSCCAG00000036234) CNNM1 (ENSCCAG00000037324) ENSCCAG00000020087 #22 ENSCCAG00000023659 CAMK2A (ENSCCAG00000029738) SLC6A7 (ENSCCAG00000033881) CDX1 (ENSCCAG00000029914) PDGFRB (ENSCCAG00000031575) ENSCCAG00000026641 CSF1R (ENSCCAG00000033803) HMGXB3 (ENSCCAG00000023989) ENSCCAG00000030622 SLC26A2 (ENSCCAG00000020161) PDE6A (ENSCCAG00000037978) PPARGC1B (ENSCCAG00000026909) ARHGEF37 (ENSCCAG00000035607) CSNK1A1 (ENSCCAG00000036479) IL17B (ENSCCAG00000037576) Capuchin MODERN SPECIES 64 COL27A1 (ENSCCAG00000022780) ENSCCAG00000028236 AKNA (ENSCCAG00000009981) WHRN (ENSCCAG00000027002) ATP6V1G1 (ENSCCAG00000037427) TMEM268 (ENSCCAG00000037664) TEX53 (ENSCCAG00000026542) TEX48 (ENSCCAG00000036693) ENSCCAG00000007846 TNFSF15 (ENSCCAG00000012013) EIF3H (ENSCCAG00000019598) TNFSF8 (ENSCCAG00000034171) ENSCCAG00000037527 WDFY3 (ENSCCAG00000035926) CDS1 (ENSCCAG00000036656) ENSCCAG00000022113 #22 NKX6-1 (ENSCCAG00000017913) GPAT3 (ENSCCAG00000033634) ABRAXAS1 (ENSCCAG00000019644) ENSCCAG00000026577 HELQ (ENSCCAG00000036773) HPSE (ENSCCAG00000010592) COQ2 (ENSCCAG00000034402) PLAC8 (ENSCCAG00000024786) COPS4 (ENSCCAG00000031360) LIN54 (ENSCCAG00000019361) THAP9 (ENSCCAG00000032516) SEC31A (ENSCCAG00000020772) ENSCCAG00000034517 SCD5 (ENSCCAG00000033284) TMEM150C (ENSCCAG00000000599) Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 70 TEX29 (ENSSBOG00000029787) ARHGEF7 (ENSSBOG00000014203) ANKRD10 (ENSSBOG00000024976) ING1 (ENSSBOG00000018909) CARS2 (ENSSBOG00000018552) NAXD (ENSSBOG00000021199) COL4A2 (ENSSBOG00000022396) COL4A1 (ENSSBOG00000035112) IRS2 (ENSSBOG00000033562) MYO16 (ENSSBOG00000036268) TNFSF13B (ENSSBOG00000033235) ABHD13 (ENSSBOG00000019782) LIG4 (ENSSBOG00000019029) ENSSBOG00000024651 ENSSBOG00000023659 ENSSBOG00000035667 #22 NALF1 (ENSSBOG00000025953) ENSSBOG00000021398 ARGLU1 (ENSSBOG00000025713) EFNB2 (ENSSBOG00000030780) ENSSBOG00000021042 ENSSBOG00000025314 SLC10A2 (ENSSBOG00000033035) ENSSBOG00000027930 METTL21EP (ENSSBOG00000032455) ENSSBOG00000024890 POGLUT2 (ENSSBOG00000019020) TEX30 (ENSSBOG00000021338) ENSSBOG00000018830 METTL21C (ENSSBOG00000025136) TPP2 (ENSSBOG00000019200) Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.a.d.a.b #22 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 42 RPS13 (ENSSBOG00000031967) ENSSBOG00000029329 PLEKHA7 (ENSSBOG00000035289) C11orf58 (ENSSBOG00000024393) SOX6 (ENSSBOG00000032558) INSC (ENSSBOG00000010393) CALCB (ENSSBOG00000034921) ENSSBOG00000032369 CYP2R1 (ENSSBOG00000025157) ENSSBOG00000020446 PDE3B (ENSSBOG00000022041) ENSSBOG00000034107 COPB1 (ENSSBOG00000034691) ENSSBOG00000016009 RRAS2 (ENSSBOG00000031627) ENSSBOG00000014032 #22 SPON1 (ENSSBOG00000033038) ENSSBOG00000032346 PTH (ENSSBOG00000031787) ENSSBOG00000032795 BMAL1 (ENSSBOG00000031375) RASSF10 (ENSSBOG00000018129) TEAD1 (ENSSBOG00000016687) ENSSBOG00000014534 ENSSBOG00000024037 ENSSBOG00000028604 PARVA (ENSSBOG00000022244) ENSSBOG00000021582 ENSSBOG00000033370 MICAL2 (ENSSBOG00000016986) DKK3 (ENSSBOG00000026748) Capuchin MODERN SPECIES 450 LONRF2 (ENSCCAG00000023179) ENSCCAG00000025621 #22 ENSCCAG00000021996 Marmoset MODERN SPECIES 21 NTF3 (ENSCJAG00000000605) #9 ANO2 (ENSCJAG00000000606) VWF (ENSCJAG00000000613) #10 CD9 (ENSCJAG00000000659) #12 PLEKHG6 (ENSCJAG00000000666) #13 TNFRSF1A (ENSCJAG00000000674) #14 SCNN1A (ENSCJAG00000000689) #15 LTBR (ENSCJAG00000000706) #16 CD27 (ENSCJAG00000000719) TAPBPL (ENSCJAG00000000722) #18 VAMP1 (ENSCJAG00000044254) #19 ENSCJAG00000046151 ENSCJAG00000065290 #20 NCAPD2 (ENSCJAG00000007561) #21 ENSCJAG00000084549 #20 ENSCJAG00000008234 #22 IFFO1 (ENSCJAG00000037676) #23 NOP2 (ENSCJAG00000008179) CHD4 (ENSCJAG00000008114) #25 LPAR5 (ENSCJAG00000083060) #26 ACRBP (ENSCJAG00000008090) #27 ING4 (ENSCJAG00000008004) #28 ZNF384 (ENSCJAG00000007944) #29 PIANP (ENSCJAG00000007910) #30 COPS7A (ENSCJAG00000007835) #31 MLF2 (ENSCJAG00000007681) #32 ENSCJAG00000038843 LAG3 (ENSCJAG00000007657) #35 CD4 (ENSCJAG00000007635) #36 GPR162 (ENSCJAG00000044634) #37 P3H3 (ENSCJAG00000007528) Platyrrhini DUPLICATION Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00910000146645 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a.g #21 ENSGT00940000153298.n.a.a.d.b.a #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Cebidae ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00910000146645 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a.g #21 ENSGT00940000153298.n.a.a.d.b.a #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 94 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00910000146645 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a.g #21 ENSGT00940000153298.n.a.a.d.b.a #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 197 KCNA5 (ENSSBOG00000036379) #7 NTF3 (ENSSBOG00000025798) #9 ANO2 (ENSSBOG00000031554) VWF (ENSSBOG00000029305) #10 CD9 (ENSSBOG00000021142) #12 PLEKHG6 (ENSSBOG00000029167) #13 TNFRSF1A (ENSSBOG00000029812) #14 SCNN1A (ENSSBOG00000028462) #15 LTBR (ENSSBOG00000031167) #16 CD27 (ENSSBOG00000023847) ENSSBOG00000019610 TAPBPL (ENSSBOG00000025031) #18 VAMP1 (ENSSBOG00000017216) #19 MRPL51 (ENSSBOG00000028416) #20 ENSSBOG00000029006 #21 ENSSBOG00000030439 #22 IFFO1 (ENSSBOG00000020913) #23 NOP2 (ENSSBOG00000034622) CHD4 (ENSSBOG00000020782) #25 LPAR5 (ENSSBOG00000016658) #26 ACRBP (ENSSBOG00000020904) #27 ING4 (ENSSBOG00000016889) #28 ZNF384 (ENSSBOG00000020182) #29 PIANP (ENSSBOG00000022052) #30 COPS7A (ENSSBOG00000016629) #31 ENSSBOG00000024104 ENSSBOG00000004230 Capuchin MODERN SPECIES 206 NR6A1 (ENSCCAG00000024096) NR5A1 (ENSCCAG00000024659) ADGRD2 (ENSCCAG00000033790) PSMB7 (ENSCCAG00000025367) NEK6 (ENSCCAG00000019309) LHX2 (ENSCCAG00000022112) DENND1A (ENSCCAG00000020125) CRB2 (ENSCCAG00000033115) STRBP (ENSCCAG00000027357) RABGAP1 (ENSCCAG00000024911) ENSCCAG00000033724 ZBTB26 (ENSCCAG00000003111) ZBTB6 (ENSCCAG00000020024) RC3H2 (ENSCCAG00000001404) PDCL (ENSCCAG00000019775) ENSCCAG00000013468 #22 Mas night monkey MODERN SPECIES 274 CD27 (ENSANAG00000036800) TAPBPL (ENSANAG00000017857) #18 VAMP1 (ENSANAG00000037847) #19 ENSANAG00000018367 ENSANAG00000021671 #20 NCAPD2 (ENSANAG00000036586) #21 ENSANAG00000036575 #22 IFFO1 (ENSANAG00000016258) #23 ENSANAG00000026027 #24 CHD4 (ENSANAG00000035685) #25 ACRBP (ENSANAG00000032730) #27 ING4 (ENSANAG00000018382) #28 ZNF384 (ENSANAG00000032088) #29 PIANP (ENSANAG00000026580) #30 COPS7A (ENSANAG00000037741) #31 ENSANAG00000032919 ENSANAG00000035023 ENSANAG00000036949 ENSANAG00000034921 MLF2 (ENSANAG00000023951) #32 PTMS (ENSANAG00000025029) LAG3 (ENSANAG00000027143) #35 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.a.d.b.b #22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.a.d.b.b #22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.a.d.b.b #22 Capuchin MODERN SPECIES 187 KCNA5 (ENSCCAG00000032585) #7 NTF3 (ENSCCAG00000037158) #9 ANO2 (ENSCCAG00000022139) VWF (ENSCCAG00000029371) #10 CD9 (ENSCCAG00000035576) #12 PLEKHG6 (ENSCCAG00000024072) #13 TNFRSF1A (ENSCCAG00000036380) #14 SCNN1A (ENSCCAG00000024002) #15 LTBR (ENSCCAG00000037636) #16 CD27 (ENSCCAG00000032627) TAPBPL (ENSCCAG00000019333) #18 ENSCCAG00000030371 VAMP1 (ENSCCAG00000030242) #19 MRPL51 (ENSCCAG00000030846) #20 ENSCCAG00000037395 #21 ENSCCAG00000036787 #22 IFFO1 (ENSCCAG00000031460) #23 ENSCCAG00000037712 #24 CHD4 (ENSCCAG00000009686) #25 ACRBP (ENSCCAG00000019365) #27 ING4 (ENSCCAG00000027875) #28 ZNF384 (ENSCCAG00000032088) #29 PIANP (ENSCCAG00000029227) #30 ENSCCAG00000031566 COPS7A (ENSCCAG00000028279) #31 DYRK4 (ENSCCAG00000030043) RAD51AP1 (ENSCCAG00000032881) C12orf4 (ENSCCAG00000020852) FGF6 (ENSCCAG00000033191) FGF23 (ENSCCAG00000022167) TIGAR (ENSCCAG00000022810) Marmoset MODERN SPECIES 7 IMPAD1 (ENSCJAG00000016573) ENSCJAG00000061141 ENSCJAG00000073997 FAM110B (ENSCJAG00000008657) ENSCJAG00000073685 UBXN2B (ENSCJAG00000008666) CYP7A1 (ENSCJAG00000008684) SDCBP (ENSCJAG00000008697) NSMAF (ENSCJAG00000008834) ENSCJAG00000070948 ENSCJAG00000082557 ENSCJAG00000052054 TOX (ENSCJAG00000008958) ENSCJAG00000051398 ENSCJAG00000072177 ENSCJAG00000044576 #22 ENSCJAG00000078019 CA8 (ENSCJAG00000008976) RAB2A (ENSCJAG00000009000) CHD7 (ENSCJAG00000009025) CLVS1 (ENSCJAG00000040445) ASPH (ENSCJAG00000009122) ENSCJAG00000073133 ##17 NKAIN3 (ENSCJAG00000067094) GGH (ENSCJAG00000009191) TTPA (ENSCJAG00000009205) YTHDF3 (ENSCJAG00000009217) ENSCJAG00000074156 CYP7B1 (ENSCJAG00000009244) ENSCJAG00000070972 ENSCJAG00000074189 Mas night monkey MODERN SPECIES 1113 GSDMC (ENSANAG00000028301) ENSANAG00000019986 #22 CYRIB (ENSANAG00000022149) ASAP1 (ENSANAG00000029467) ENSANAG00000025378 ADCY8 (ENSANAG00000034325) EFR3A (ENSANAG00000035079) OC90 (ENSANAG00000035842) HHLA1 (ENSANAG00000037286) KCNQ3 (ENSANAG00000034954) DNAAF11 (ENSANAG00000033459) TMEM71 (ENSANAG00000038216) ENSANAG00000035493 SLA (ENSANAG00000028835) TG (ENSANAG00000036910) CCN4 (ENSANAG00000027636) NDRG1 (ENSANAG00000033030) Primates ANCESTRAL SPECIES 103 ENSGT00580000082664.b ENSGT00940000153298.n.a.b ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 119 ENSGT00580000082664.b ENSGT00940000153298.n.a.b ##22 Simiiformes DUPLICATION Simiiformes DUPLICATION Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.a.a ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 164 ENSGT00580000082664.b ENSGT00940000153298.n.a.b.a.a ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 221 ENSGT00580000082664.b ENSGT00940000153298.n.a.b.a.a ##22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.a.a ##22 Black snub-nosed monkey DUPLICATION Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 695 IZUMO1R (ENSRBIG00000034661) GPR83 (ENSRBIG00000043352) MRE11 (ENSRBIG00000034693) ANKRD49 (ENSRBIG00000043961) ENSRBIG00000026350 C11orf97 (ENSRBIG00000041747) PIWIL4 (ENSRBIG00000039745) AMOTL1 (ENSRBIG00000043234) CWC15 (ENSRBIG00000030781) KDM4D (ENSRBIG00000029429) KDM4E (ENSRBIG00000035068) ENSRBIG00000023300 ENSRBIG00000036245 ##22 ENSRBIG00000041837 ENDOD1 (ENSRBIG00000025792) ENSRBIG00000027014 SESN3 (ENSRBIG00000031220) FAM76B (ENSRBIG00000006024) CEP57 (ENSRBIG00000014037) MTMR2 (ENSRBIG00000028147) MAML2 (ENSRBIG00000001400) CCDC82 (ENSRBIG00000030883) JRKL (ENSRBIG00000029080) Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 587 ZNF638 (ENSRBIG00000029826) DYSF (ENSRBIG00000039973) ENSRBIG00000039117 ##22 SAMD5 (ENSRBIG00000039187) STXBP5 (ENSRBIG00000034499) ENSRBIG00000028345 ADGB (ENSRBIG00000033722) ENSRBIG00000031319 GRM1 (ENSRBIG00000030680) Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 3114 PDE8B (ENSRROG00000030744) ENSRROG00000040707 WDR41 (ENSRROG00000001190) OTP (ENSRROG00000020103) ENSRROG00000040410 AP3B1 (ENSRROG00000033567) ENSRROG00000032349 ENSRROG00000036497 ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 224 ENSGT00580000082664.b ENSGT00940000153298.n.a.b.a.a ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 227 ENSGT00580000082664.b.a.a ENSGT00940000153298.n.a.b.a.a ##22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.a.a ##22 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.a.a ##22 Crab-eating macaque DUPLICATION Crab-eating macaque MODERN SPECIES 2 NTF3 (ENSMFAG00000029473) #9 ANO2 (ENSMFAG00000045036) ENSMFAG00000047933 ENSMFAG00000061332 VWF (ENSMFAG00000039466) #10 CD9 (ENSMFAG00000034485) #12 PLEKHG6 (ENSMFAG00000032181) #13 TNFRSF1A (ENSMFAG00000042238) #14 SCNN1A (ENSMFAG00000035743) #15 LTBR (ENSMFAG00000043569) #16 VAMP1 (ENSMFAG00000035441) #19 TAPBPL (ENSMFAG00000035334) #18 ENSMFAG00000051196 ENSMFAG00000051100 ##17 NCAPD2 (ENSMFAG00000036998) #21 ENSMFAG00000001880 ##22 IFFO1 (ENSMFAG00000045145) #23 NOP2 (ENSMFAG00000004333) CHD4 (ENSMFAG00000003188) #25 LPAR5 (ENSMFAG00000064722) #26 ACRBP (ENSMFAG00000005997) #27 ING4 (ENSMFAG00000001174) #28 ZNF384 (ENSMFAG00000037538) #29 PIANP (ENSMFAG00000001518) #30 COPS7A (ENSMFAG00000038467) #31 MLF2 (ENSMFAG00000060388) #32 ENSMFAG00000033048 #33 CD4 (ENSMFAG00000041228) #36 GPR162 (ENSMFAG00000037690) #37 GNB3 (ENSMFAG00000029449) CDCA3 (ENSMFAG00000042353) Crab-eating macaque MODERN SPECIES 3 ENSMFAG00000061715 ITGB6 (ENSMFAG00000002303) ENSMFAG00000045696 ENSMFAG00000060781 PLA2R1 (ENSMFAG00000041834) LY75 (ENSMFAG00000033999) CD302 (ENSMFAG00000038264) MARCHF7 (ENSMFAG00000032793) ENSMFAG00000002815 ENSMFAG00000058581 BAZ2B (ENSMFAG00000037367) WDSUB1 (ENSMFAG00000023412) TANC1 (ENSMFAG00000042358) DAPL1 (ENSMFAG00000029280) ENSMFAG00000061795 ENSMFAG00000043045 ##22 PKP4 (ENSMFAG00000008546) CCDC148 (ENSMFAG00000038269) UPP2 (ENSMFAG00000003209) ENSMFAG00000058914 ##17 ACVR1 (ENSMFAG00000042305) ACVR1C (ENSMFAG00000042281) CYTIP (ENSMFAG00000043861) ERMN (ENSMFAG00000045944) GALNT5 (ENSMFAG00000036566) ENSMFAG00000059673 GPD2 (ENSMFAG00000031606) NR4A2 (ENSMFAG00000036654) ENSMFAG00000048164 ENSMFAG00000043008 ENSMFAG00000050325 Platyrrhini DUPLICATION Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.a.a.e ##22 Cebidae DUPLICATION Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.a.a.e.a ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.a.a.e.a ##22 Capuchin MODERN SPECIES 83 ESR2 (ENSCCAG00000029359) ENSCCAG00000034981 SYNE2 (ENSCCAG00000026686) ENSCCAG00000019506 SGPP1 (ENSCCAG00000034001) PPP2R5E (ENSCCAG00000037562) GPHB5 (ENSCCAG00000027509) RHOJ (ENSCCAG00000024987) KCNH5 (ENSCCAG00000034193) ENSCCAG00000025329 ENSCCAG00000018604 SYT16 (ENSCCAG00000026935) ENSCCAG00000022752 SNAPC1 (ENSCCAG00000034167) ENSCCAG00000028667 ENSCCAG00000025133 ##22 PRKCH (ENSCCAG00000019880) TMEM30B (ENSCCAG00000009844) SLC38A6 (ENSCCAG00000035278) TRMT5 (ENSCCAG00000037835) MNAT1 (ENSCCAG00000034022) SIX4 (ENSCCAG00000022445) SIX1 (ENSCCAG00000021734) SIX6 (ENSCCAG00000034242) C14orf39 (ENSCCAG00000033742) PPM1A (ENSCCAG00000023707) DHRS7 (ENSCCAG00000025684) PCNX4 (ENSCCAG00000031427) LRRC9 (ENSCCAG00000027847) RTN1 (ENSCCAG00000029137) CCDC175 (ENSCCAG00000029109) Marmoset MODERN SPECIES 8 OXSM (ENSCJAG00000004087) ENSCJAG00000070184 LRRC3B (ENSCJAG00000071256) ENSCJAG00000077804 NEK10 (ENSCJAG00000004112) ENSCJAG00000079217 SLC4A7 (ENSCJAG00000004141) EOMES (ENSCJAG00000004263) ENSCJAG00000004272 AZI2 (ENSCJAG00000004276) ZCWPW2 (ENSCJAG00000004300) RBMS3 (ENSCJAG00000004312) ENSCJAG00000078451 TGFBR2 (ENSCJAG00000004363) GADL1 (ENSCJAG00000004395) ENSCJAG00000065510 ##22 STT3B (ENSCJAG00000004428) ENSCJAG00000069679 OSBPL10 (ENSCJAG00000004447) GPD1L (ENSCJAG00000039489) ENSCJAG00000078219 CMTM8 (ENSCJAG00000011776) ENSCJAG00000078801 CMTM7 (ENSCJAG00000043564) CMTM6 (ENSCJAG00000040951) DYNC1LI1 (ENSCJAG00000011783) CNOT10 (ENSCJAG00000011843) ENSCJAG00000083351 ##17 ENSCJAG00000075858 TRIM71 (ENSCJAG00000011921) ENSCJAG00000075987 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.a.a.e.b ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.a.a.e.b ##22 Capuchin MODERN SPECIES 928 B4GALT7 (ENSCCAG00000024518) TMED9 (ENSCCAG00000033883) ENSCCAG00000037643 ##22 Mas night monkey MODERN SPECIES 906 ENSANAG00000035233 ENSANAG00000036084 ENSANAG00000035834 ENSANAG00000038393 ENSANAG00000016721 ENSANAG00000038269 ENSANAG00000024839 KRBOX5 (ENSANAG00000027751) ENSANAG00000038261 ENSANAG00000024644 ENSANAG00000022403 ##22 ENSANAG00000020429 ENSANAG00000037397 AHSP (ENSANAG00000010533) RUSF1 (ENSANAG00000027786) SLC5A2 (ENSANAG00000034352) TGFB1I1 (ENSANAG00000024534) ARMC5 (ENSANAG00000035888) COX6A2 (ENSANAG00000021157) ITGAX (ENSANAG00000016257) TRIM72 (ENSANAG00000030700) PYCARD (ENSANAG00000013955) ENSANAG00000021591 PRSS36 (ENSANAG00000035060) PRSS8 (ENSANAG00000034382) KAT8 (ENSANAG00000024175) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.a.a.f ##22 Mas night monkey MODERN SPECIES 472 GRIK5 (ENSANAG00000038058) ZNF574 (ENSANAG00000034608) POU2F2 (ENSANAG00000035824) DEDD2 (ENSANAG00000028365) ZNF526 (ENSANAG00000035364) GSK3A (ENSANAG00000035264) ERF (ENSANAG00000029577) CIC (ENSANAG00000025026) ENSANAG00000000178 PRR19 (ENSANAG00000035399) TMEM145 (ENSANAG00000022076) MEGF8 (ENSANAG00000028714) CNFN (ENSANAG00000028219) LIPE (ENSANAG00000019026) CXCL17 (ENSANAG00000034293) ENSANAG00000013269 ##22 ENSANAG00000024195 CEACAM8 (ENSANAG00000030725) Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.a.a.f ##22 Marmoset MODERN SPECIES 6 ISY1 (ENSCJAG00000017419) CNBP (ENSCJAG00000017430) ENSCJAG00000083673 COPG1 (ENSCJAG00000017327) HMCES (ENSCJAG00000017396) H1-10 (ENSCJAG00000039596) EFCAB12 (ENSCJAG00000017314) MBD4 (ENSCJAG00000017293) IFT122 (ENSCJAG00000017213) ENSCJAG00000087235 ENSCJAG00000076224 RHO (ENSCJAG00000017195) ENSCJAG00000017209 PLXND1 (ENSCJAG00000005429) TMCC1 (ENSCJAG00000017178) ENSCJAG00000021040 ##22 TRH (ENSCJAG00000047087) RBSN (ENSCJAG00000017163) MRPS25 (ENSCJAG00000017160) ENSCJAG00000058001 NR2C2 (ENSCJAG00000017131) FGD5 (ENSCJAG00000017099) C3orf20 (ENSCJAG00000017083) CCDC174 (ENSCJAG00000017045) GRIP2 (ENSCJAG00000017014) SLC6A6 (ENSCJAG00000016992) ENSCJAG00000079599 ENSCJAG00000042664 XPC (ENSCJAG00000016952) ENSCJAG00000087072 ENSCJAG00000072125 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 138 ENSGT00580000082664.b ENSGT00940000153298.n.a.b.a.b ##22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 139 ENSGT00580000082664.b ENSGT00940000153298.n.a.b.a.b ##22 Cebidae DUPLICATION Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.a.b.a ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.a.b.a ##22 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 94 SMIM45 (ENSSBOG00000018953) CENPM (ENSSBOG00000031289) TNFRSF13C (ENSSBOG00000030226) SHISA8 (ENSSBOG00000031370) SREBF2 (ENSSBOG00000032953) CCDC134 (ENSSBOG00000030156) MEI1 (ENSSBOG00000026823) ENSSBOG00000024134 ENSSBOG00000024724 DESI1 (ENSSBOG00000023969) PMM1 (ENSSBOG00000035346) CSDC2 (ENSSBOG00000035590) POLR3H (ENSSBOG00000020652) ENSSBOG00000029050 ENSSBOG00000025096 ENSSBOG00000015322 ##22 TEF (ENSSBOG00000024378) ZC3H7B (ENSSBOG00000034962) ENSSBOG00000022447 CHADL (ENSSBOG00000032007) L3MBTL2 (ENSSBOG00000028967) EP300 (ENSSBOG00000027132) RBX1 (ENSSBOG00000023412) XPNPEP3 (ENSSBOG00000034216) ENSSBOG00000029053 SLC25A17 (ENSSBOG00000022585) MCHR1 (ENSSBOG00000036058) MRTFA (ENSSBOG00000019487) SGSM3 (ENSSBOG00000027400) ADSL (ENSSBOG00000030059) TNRC6B (ENSSBOG00000029743) Cebidae DUPLICATION Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.a.b.b.a ##22 Marmoset MODERN SPECIES 5 PREPL (ENSCJAG00000000754) SLC3A1 (ENSCJAG00000000766) ENSCJAG00000080387 PPM1B (ENSCJAG00000000781) LRPPRC (ENSCJAG00000000794) ABCG8 (ENSCJAG00000000833) ABCG5 (ENSCJAG00000000847) DYNC2LI1 (ENSCJAG00000000860) PLEKHH2 (ENSCJAG00000014373) C1GALT1C1L (ENSCJAG00000054433) THADA (ENSCJAG00000014464) ZFP36L2 (ENSCJAG00000014571) HAAO (ENSCJAG00000014593) OXER1 (ENSCJAG00000014607) MTA3 (ENSCJAG00000014614) ENSCJAG00000044469 ##22 KCNG3 (ENSCJAG00000014695) COX7A2L (ENSCJAG00000061936) EML4 (ENSCJAG00000014719) ENSCJAG00000072265 PKDCC (ENSCJAG00000014835) ENSCJAG00000076545 SLC8A1 (ENSCJAG00000023118) THUMPD2 (ENSCJAG00000014891) TMEM178A (ENSCJAG00000040463) MAP4K3 (ENSCJAG00000014920) ENSCJAG00000041834 SOS1 (ENSCJAG00000015029) ENSCJAG00000015081 MORN2 (ENSCJAG00000040859) DHX57 (ENSCJAG00000015097) Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.a.b.b.a ##22 Capuchin MODERN SPECIES 13 ENSCCAG00000006343 ARG2 (ENSCCAG00000027237) PIGH (ENSCCAG00000035097) PLEKHH1 (ENSCCAG00000031526) TMEM229B (ENSCCAG00000016856) PLEK2 (ENSCCAG00000029270) EIF2S1 (ENSCCAG00000028622) ATP6V1D (ENSCCAG00000037989) PALS1 (ENSCCAG00000031683) FAM71D (ENSCCAG00000026161) ENSCCAG00000022214 GPHN (ENSCCAG00000020521) MSR1 (ENSCCAG00000034933) ENSCCAG00000037687 LRATD2 (ENSCCAG00000020357) ENSCCAG00000037347 ##22 ENSCCAG00000031130 ENSCCAG00000018472 MYC (ENSCCAG00000032999) GSDMC (ENSCCAG00000021127) CYRIB (ENSCCAG00000032744) ASAP1 (ENSCCAG00000022593) ADCY8 (ENSCCAG00000029810) EFR3A (ENSCCAG00000019655) OC90 (ENSCCAG00000031064) HHLA1 (ENSCCAG00000036215) KCNQ3 (ENSCCAG00000028183) DNAAF11 (ENSCCAG00000031017) TMEM71 (ENSCCAG00000028721) PHF20L1 (ENSCCAG00000020490) SLA (ENSCCAG00000031926) Cebidae DUPLICATION Cebidae DUPLICATION Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.a.b.b.b.a.a ##22 Marmoset MODERN SPECIES 2 YAP1 (ENSCJAG00000000627) CFAP300 (ENSCJAG00000000623) CEP126 (ENSCJAG00000000621) ANGPTL5 (ENSCJAG00000000619) ENSCJAG00000082031 TRPC6 (ENSCJAG00000000595) ENSCJAG00000058230 PGR (ENSCJAG00000000583) ARHGAP42 (ENSCJAG00000000566) ENSCJAG00000023196 ENSCJAG00000073241 CNTN5 (ENSCJAG00000000543) ENSCJAG00000078589 ENSCJAG00000068576 ENSCJAG00000073640 ENSCJAG00000023377 ##22 ENSCJAG00000074342 ENSCJAG00000074166 ENSCJAG00000069774 JRKL (ENSCJAG00000043270) CCDC82 (ENSCJAG00000004365) MAML2 (ENSCJAG00000004359) MTMR2 (ENSCJAG00000004327) CEP57 (ENSCJAG00000004281) FAM76B (ENSCJAG00000040122) ENSCJAG00000004220 ENDOD1 (ENSCJAG00000039825) ENSCJAG00000072491 KDM4D (ENSCJAG00000023319) CWC15 (ENSCJAG00000040352) AMOTL1 (ENSCJAG00000004124) Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.a.b.b.b.a.a ##22 Capuchin MODERN SPECIES 282 ENSCCAG00000025352 DCAF8L1 (ENSCCAG00000024695) ENSCCAG00000025117 ##22 ENSCCAG00000020805 ENSCCAG00000031811 IL1RAPL1 (ENSCCAG00000026068) NR0B1 (ENSCCAG00000032350) Cebidae ANCESTRAL SPECIES 157 ENSGT00580000082664.b ENSGT00940000153298.n.a.b.a.b.b.b.a.b ##22 Marmoset MODERN SPECIES 20 HOXA2 (ENSCJAG00000008032) HOXA3 (ENSCJAG00000043202) HOXA4 (ENSCJAG00000008058) HOXA5 (ENSCJAG00000047690) HOXA6 (ENSCJAG00000077854) HOXA7 (ENSCJAG00000080800) HOXA9 (ENSCJAG00000038531) HOXA10 (ENSCJAG00000081224) HOXA11 (ENSCJAG00000008187) HOXA13 (ENSCJAG00000008192) EVX1 (ENSCJAG00000008197) ENSCJAG00000081981 ENSCJAG00000081017 HIBADH (ENSCJAG00000008204) ENSCJAG00000034676 ENSCJAG00000071766 ##22 ENSCJAG00000072346 ENSCJAG00000070066 ENSCJAG00000041938 TAX1BP1 (ENSCJAG00000008245) JAZF1 (ENSCJAG00000048491) ENSCJAG00000069906 CREB5 (ENSCJAG00000042700) ENSCJAG00000076535 TRIL (ENSCJAG00000045826) CPVL (ENSCJAG00000008379) CHN2 (ENSCJAG00000008406) ENSCJAG00000085693 WIPF3 (ENSCJAG00000008466) SCRN1 (ENSCJAG00000047722) ENSCJAG00000052671 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.a.b.b.b.a.b ##22 Capuchin MODERN SPECIES 325 WDR72 (ENSCCAG00000026897) ENSCCAG00000037326 ##22 ONECUT1 (ENSCCAG00000027805) FAM214A (ENSCCAG00000032913) ARPP19 (ENSCCAG00000022191) MYO5A (ENSCCAG00000001972) ENSCCAG00000025828 ENSCCAG00000034030 ENSCCAG00000032533 MYO5C (ENSCCAG00000032934) GNB5 (ENSCCAG00000034924) ENSCCAG00000031947 MAPK6 (ENSCCAG00000026546) LEO1 (ENSCCAG00000025911) TMOD3 (ENSCCAG00000036997) ENSCCAG00000038068 TMOD2 (ENSCCAG00000022858) Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.a.b.b.b.b ##22 Marmoset MODERN SPECIES 20 ASB15 (ENSCJAG00000017456) ENSCJAG00000083655 IQUB (ENSCJAG00000017429) ENSCJAG00000080491 SLC13A1 (ENSCJAG00000044845) TAS2R16 (ENSCJAG00000021941) CADPS2 (ENSCJAG00000017339) FEZF1 (ENSCJAG00000017326) AASS (ENSCJAG00000017282) PTPRZ1 (ENSCJAG00000017225) ENSCJAG00000074556 FAM3C (ENSCJAG00000017203) WNT16 (ENSCJAG00000039822) CPED1 (ENSCJAG00000017180) ING3 (ENSCJAG00000017145) ENSCJAG00000046997 ##22 TSPAN12 (ENSCJAG00000017120) KCND2 (ENSCJAG00000022123) ENSCJAG00000073110 ENSCJAG00000085674 ENSCJAG00000082231 ENSCJAG00000073402 ENSCJAG00000087352 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.a.b ##22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.a.b ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.a.b ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.a.b ##22 Gorilla MODERN SPECIES 16 GPR149 (ENSGGOG00000001655) DHX36 (ENSGGOG00000034937) ARHGEF26 (ENSGGOG00000009951) RAP2B (ENSGGOG00000041894) ENSGGOG00000039329 ENSGGOG00000039036 P2RY1 (ENSGGOG00000000031) MBNL1 (ENSGGOG00000009430) SUCNR1 (ENSGGOG00000004299) AADAC (ENSGGOG00000002253) AADACL2 (ENSGGOG00000008913) IGSF10 (ENSGGOG00000002875) P2RY13 (ENSGGOG00000014509) P2RY14 (ENSGGOG00000022809) GPR171 (ENSGGOG00000000612) ENSGGOG00000027217 ##22 MED12L (ENSGGOG00000015584) CLRN1 (ENSGGOG00000000147) MINDY4B (ENSGGOG00000016678) SIAH2 (ENSGGOG00000014662) ERICH6 (ENSGGOG00000017013) ENSGGOG00000039079 SELENOT (ENSGGOG00000028291) EIF2A (ENSGGOG00000015391) SERP1 (ENSGGOG00000015388) TSC22D2 (ENSGGOG00000024379) ENSGGOG00000007109 RNF13 (ENSGGOG00000007103) ANKUB1 (ENSGGOG00000011489) COMMD2 (ENSGGOG00000003255) WWTR1 (ENSGGOG00000000214) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.a.b ##22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.a.b ##22 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2112 ENSRROG00000016696 ZNF800 (ENSRROG00000040558) ENSRROG00000029281 ##22 GCC1 (ENSRROG00000031945) ARF5 (ENSRROG00000041157) FSCN3 (ENSRROG00000042888) PAX4 (ENSRROG00000015595) SND1 (ENSRROG00000033020) LRRC4 (ENSRROG00000032151) LEP (ENSRROG00000033244) RBM28 (ENSRROG00000040747) PRRT4 (ENSRROG00000042520) IMPDH1 (ENSRROG00000045406) HILPDA (ENSRROG00000022886) GARIN1A (ENSRROG00000035800) GARIN1B (ENSRROG00000045564) CALU (ENSRROG00000039876) OPN1SW (ENSRROG00000035396) Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.b ##22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.b ##22 Mas night monkey MODERN SPECIES 267 ENSANAG00000030190 ENSANAG00000029532 ##22 OSBPL6 (ENSANAG00000021990) RBM45 (ENSANAG00000034660) ENSANAG00000023263 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000158576 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.a.b ##22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a.f #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Bushbaby DUPLICATION Bushbaby DUPLICATION Bushbaby MODERN SPECIES 247 FUT9 (ENSOGAG00000008092) ENSOGAG00000025302 UFL1 (ENSOGAG00000004124) FHL5 (ENSOGAG00000016431) GPR63 (ENSOGAG00000031802) NDUFAF4 (ENSOGAG00000004311) KLHL32 (ENSOGAG00000004315) MMS22L (ENSOGAG00000004316) ENSOGAG00000026283 ##22 POU3F2 (ENSOGAG00000024248) FBXL4 (ENSOGAG00000009292) FAXC (ENSOGAG00000015137) COQ3 (ENSOGAG00000015139) ENSOGAG00000015143 USP45 (ENSOGAG00000001114) ENSOGAG00000025707 CCNC (ENSOGAG00000001116) PRDM13 (ENSOGAG00000031927) MCHR2 (ENSOGAG00000008232) ENSOGAG00000027279 SIM1 (ENSOGAG00000009865) ASCC3 (ENSOGAG00000009875) Bushbaby MODERN SPECIES 226 KRTAP11-1 (ENSOGAG00000016317) TIAM1 (ENSOGAG00000004005) ENSOGAG00000029301 ENSOGAG00000014646 SCAF4 (ENSOGAG00000014653) ENSOGAG00000033329 HUNK (ENSOGAG00000010230) MIS18A (ENSOGAG00000017137) MRAP (ENSOGAG00000017139) URB1 (ENSOGAG00000017140) EVA1C (ENSOGAG00000009260) CFAP298 (ENSOGAG00000006008) SYNJ1 (ENSOGAG00000006010) PAXBP1 (ENSOGAG00000003344) C21orf62 (ENSOGAG00000027318) ENSOGAG00000032768 ##22 OLIG2 (ENSOGAG00000026818) OLIG1 (ENSOGAG00000033584) ENSOGAG00000027625 IFNAR2 (ENSOGAG00000012668) IL10RB (ENSOGAG00000028739) IFNAR1 (ENSOGAG00000015030) ENSOGAG00000029748 IFNGR2 (ENSOGAG00000029006) TMEM50B (ENSOGAG00000000249) DNAJC28 (ENSOGAG00000015823) GART (ENSOGAG00000015814) SON (ENSOGAG00000027319) DONSON (ENSOGAG00000032566) CRYZL1 (ENSOGAG00000015836) ITSN1 (ENSOGAG00000015839) Bushbaby MODERN SPECIES 124 OR5K3 (ENSOGAG00000027773) OR5H2 (ENSOGAG00000025642) ENSOGAG00000026883 ENSOGAG00000028905 ENSOGAG00000027971 OR5AC2 (ENSOGAG00000012172) GABRR3 (ENSOGAG00000012170) RIOX2 (ENSOGAG00000012164) ENSOGAG00000012159 ENSOGAG00000030475 ARL6 (ENSOGAG00000000536) ENSOGAG00000000535 ENSOGAG00000033469 ENSOGAG00000029221 ENSOGAG00000033348 ENSOGAG00000030126 ##22 NSUN3 (ENSOGAG00000001776) STX19 (ENSOGAG00000001774) ARL13B (ENSOGAG00000001771) PROS1 (ENSOGAG00000001770) ENSOGAG00000030999 ENSOGAG00000033367 ENSOGAG00000010941 EPHA3 (ENSOGAG00000013293) ENSOGAG00000028160 ENSOGAG00000029652 C3orf38 (ENSOGAG00000028975) ENSOGAG00000029395 ENSOGAG00000034600 CGGBP1 (ENSOGAG00000034139) HTR1F (ENSOGAG00000027352) Lemuriformes DUPLICATION Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.e ##22 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.e ##22 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 83 ENSPCOG00000022335 DLX6 (ENSPCOG00000018676) DLX5 (ENSPCOG00000024882) ENSPCOG00000016090 TAC1 (ENSPCOG00000021374) ENSPCOG00000025256 C1GALT1 (ENSPCOG00000015839) ENSPCOG00000018949 COL28A1 (ENSPCOG00000022435) MIOS (ENSPCOG00000011418) RPA3 (ENSPCOG00000022659) UMAD1 (ENSPCOG00000016044) GLCCI1 (ENSPCOG00000008498) ICA1 (ENSPCOG00000003590) NXPH1 (ENSPCOG00000018464) ENSPCOG00000018675 ##22 Mouse lemur MODERN SPECIES 11 TDRD5 (ENSMICG00000017589) NPHS2 (ENSMICG00000002674) AXDND1 (ENSMICG00000002668) ENSMICG00000028572 SOAT1 (ENSMICG00000005177) ENSMICG00000028075 ENSMICG00000035049 ABL2 (ENSMICG00000003616) TOR3A (ENSMICG00000004404) FAM20B (ENSMICG00000043296) ANGPTL1 (ENSMICG00000002492) RALGPS2 (ENSMICG00000002482) TEX35 (ENSMICG00000031350) CLEC20A (ENSMICG00000042193) RASAL2 (ENSMICG00000016969) ENSMICG00000037292 ##22 SEC16B (ENSMICG00000003111) BRINP2 (ENSMICG00000006000) ASTN1 (ENSMICG00000005992) PAPPA2 (ENSMICG00000005975) ENSMICG00000028635 COP1 (ENSMICG00000008564) TNR (ENSMICG00000045123) TNN (ENSMICG00000004867) MRPS14 (ENSMICG00000037413) CACYBP (ENSMICG00000004856) ENSMICG00000035798 RABGAP1L (ENSMICG00000004841) RC3H1 (ENSMICG00000003000) SERPINC1 (ENSMICG00000002980) ZBTB37 (ENSMICG00000002978) Lemuriformes DUPLICATION Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.f.a ##22 Lemuriformes_a DUPLICATION Lemuriformes_a DUPLICATION Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.f.a.a.a ##22 Greater bamboo lemur DUPLICATION Greater bamboo lemur DUPLICATION Greater bamboo lemur DUPLICATION Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 746 OR8B4 (ENSPSMG00000001733) OR8B8 (ENSPSMG00000001735) ENSPSMG00000001747 OR8B12 (ENSPSMG00000001751) OR8A1 (ENSPSMG00000001759) PANX3 (ENSPSMG00000001765) TBRG1 (ENSPSMG00000001809) SIAE (ENSPSMG00000001847) SPA17 (ENSPSMG00000001864) NRGN (ENSPSMG00000001870) VSIG2 (ENSPSMG00000001874) ESAM (ENSPSMG00000001880) MSANTD2 (ENSPSMG00000001888) ENSPSMG00000001899 ##22 ROBO3 (ENSPSMG00000001946) ROBO4 (ENSPSMG00000001965) DPEP2NB (ENSPSMG00000001972) HEPACAM (ENSPSMG00000001979) ENSPSMG00000001987 ENSPSMG00000001998 ENSPSMG00000002003 SLC37A2 (ENSPSMG00000002030) TMEM218 (ENSPSMG00000002050) PKNOX2 (ENSPSMG00000002082) FEZ1 (ENSPSMG00000002118) EI24 (ENSPSMG00000002170) STT3A (ENSPSMG00000002250) CHEK1 (ENSPSMG00000002459) ACRV1 (ENSPSMG00000002765) Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 982 TWF1 (ENSPSMG00000015438) IRAK4 (ENSPSMG00000015376) PUS7L (ENSPSMG00000015334) ADAMTS20 (ENSPSMG00000015278) PRICKLE1 (ENSPSMG00000015162) ZCRB1 (ENSPSMG00000015075) ENSPSMG00000014935 YAF2 (ENSPSMG00000014763) GXYLT1 (ENSPSMG00000014624) ENSPSMG00000014587 ##22 PDZRN4 (ENSPSMG00000014579) Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 976 ENSPSMG00000014375 AMOT (ENSPSMG00000014395) LHFPL1 (ENSPSMG00000014402) RTL4 (ENSPSMG00000014410) ENSPSMG00000014418 ##22 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 410 TNIK (ENSPSMG00000016825) PLD1 (ENSPSMG00000016300) TMEM212 (ENSPSMG00000016184) FNDC3B (ENSPSMG00000016159) GHSR (ENSPSMG00000016081) TNFSF10 (ENSPSMG00000016074) NCEH1 (ENSPSMG00000016040) ECT2 (ENSPSMG00000015943) SPATA16 (ENSPSMG00000015748) ENSPSMG00000015718 ##22 NLGN1 (ENSPSMG00000015706) NAALADL2 (ENSPSMG00000015690) TBL1XR1 (ENSPSMG00000015636) ENSPSMG00000015530 ENSPSMG00000015513 KCNMB2 (ENSPSMG00000015503) ENSPSMG00000015400 GPC5 (ENSPSMG00000015390) Coquerels sifaka MODERN SPECIES 377 ENSPCOG00000015233 ##22 TMTC2 (ENSPCOG00000005514) METTL25 (ENSPCOG00000018725) CCDC59 (ENSPCOG00000013658) Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.f.a.a.b ##22 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 162 TUT4 (ENSPCOG00000007824) GPX7 (ENSPCOG00000014808) SHISAL2A (ENSPCOG00000018477) COA7 (ENSPCOG00000020312) ZYG11B (ENSPCOG00000025135) ZYG11A (ENSPCOG00000020864) ECHDC2 (ENSPCOG00000020898) SCP2 (ENSPCOG00000005361) PODN (ENSPCOG00000021758) SLC1A7 (ENSPCOG00000000052) CPT2 (ENSPCOG00000028785) CZIB (ENSPCOG00000028784) MAGOH (ENSPCOG00000003826) LRP8 (ENSPCOG00000024828) DMRTB1 (ENSPCOG00000021346) ENSPCOG00000011405 ##22 GLIS1 (ENSPCOG00000025844) NDC1 (ENSPCOG00000016099) YIPF1 (ENSPCOG00000017844) DIO1 (ENSPCOG00000018795) IFT25 (ENSPCOG00000019800) LRRC42 (ENSPCOG00000019083) LDLRAD1 (ENSPCOG00000022857) TMEM59 (ENSPCOG00000003105) TCEANC2 (ENSPCOG00000013078) CDCP2 (ENSPCOG00000022595) CYB5RL (ENSPCOG00000020741) MRPL37 (ENSPCOG00000010897) SSBP3 (ENSPCOG00000024890) ACOT11 (ENSPCOG00000024394) FAM151A (ENSPCOG00000027508) Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 1220 ENSPSMG00000005085 ENSPSMG00000005083 ##22 ZC3H15 (ENSPSMG00000005059) ITGAV (ENSPSMG00000004806) FAM171B (ENSPSMG00000004528) ZSWIM2 (ENSPSMG00000004498) CALCRL (ENSPSMG00000004480) TFPI (ENSPSMG00000004452) Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.a.b.f.a.b ##22 Coquerels sifaka DUPLICATION Coquerels sifaka MODERN SPECIES 271 MED14 (ENSPCOG00000016287) ENSPCOG00000013254 ENSPCOG00000027830 ##22 ENSPCOG00000022654 ##22 USP9X (ENSPCOG00000028687) DDX3X (ENSPCOG00000027628) NYX (ENSPCOG00000018457) ENSPCOG00000013948 CASK (ENSPCOG00000025249) ENSPCOG00000010714 ENSPCOG00000027023 MAOA (ENSPCOG00000022947) MAOB (ENSPCOG00000025423) NDP (ENSPCOG00000022161) EFHC2 (ENSPCOG00000016137) FUNDC1 (ENSPCOG00000017139) KDM6A (ENSPCOG00000028617) DIPK2B (ENSPCOG00000028661) ENSPCOG00000026336 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 271 MED14 (ENSPCOG00000016287) ENSPCOG00000013254 ENSPCOG00000027830 ##22 ENSPCOG00000022654 ##22 USP9X (ENSPCOG00000028687) DDX3X (ENSPCOG00000027628) NYX (ENSPCOG00000018457) ENSPCOG00000013948 CASK (ENSPCOG00000025249) ENSPCOG00000010714 ENSPCOG00000027023 MAOA (ENSPCOG00000022947) MAOB (ENSPCOG00000025423) NDP (ENSPCOG00000022161) EFHC2 (ENSPCOG00000016137) FUNDC1 (ENSPCOG00000017139) KDM6A (ENSPCOG00000028617) DIPK2B (ENSPCOG00000028661) Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 530 GALC (ENSPSMG00000017660) GPR65 (ENSPSMG00000017596) KCNK10 (ENSPSMG00000017581) ENSPSMG00000017563 SPATA7 (ENSPSMG00000017508) PTPN21 (ENSPSMG00000017371) ZC3H14 (ENSPSMG00000016980) ENSPSMG00000016649 ##22 EML5 (ENSPSMG00000016628) TTC8 (ENSPSMG00000016430) FOXN3 (ENSPSMG00000015904) EFCAB11 (ENSPSMG00000015847) TDP1 (ENSPSMG00000015801) KCNK13 (ENSPSMG00000015639) PSMC1 (ENSPSMG00000015625) NRDE2 (ENSPSMG00000015589) CALM1 (ENSPSMG00000015556) TTC7B (ENSPSMG00000015449) RPS6KA5 (ENSPSMG00000015265) ENSPSMG00000015193 ENSPSMG00000015182 GPR68 (ENSPSMG00000015179) ##26 CCDC88C (ENSPSMG00000015136) Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00940000158576 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.a.b.f.b ##22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a.f #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Mouse lemur DUPLICATION Mouse lemur DUPLICATION Mouse lemur DUPLICATION Mouse lemur MODERN SPECIES 169 GPKOW (ENSMICG00000045083) MAGIX (ENSMICG00000029530) PLP2 (ENSMICG00000006344) PRICKLE3 (ENSMICG00000006347) SYP (ENSMICG00000006351) CACNA1F (ENSMICG00000006356) CCDC22 (ENSMICG00000006380) FOXP3 (ENSMICG00000006391) PPP1R3F (ENSMICG00000006403) ENSMICG00000029015 ENSMICG00000044560 ENSMICG00000037290 ENSMICG00000034023 USP27X (ENSMICG00000041837) ENSMICG00000037833 ENSMICG00000043583 ##22 ENSMICG00000029745 CLCN5 (ENSMICG00000002433) ENSMICG00000036849 AKAP4 (ENSMICG00000027376) ENSMICG00000044465 DGKK (ENSMICG00000010584) SHROOM4 (ENSMICG00000013797) ENSMICG00000038751 ENSMICG00000027765 NUDT11 (ENSMICG00000014540) ENSMICG00000045193 ENSMICG00000001475 ENSMICG00000030664 ENSMICG00000038739 ENSMICG00000027063 Mouse lemur MODERN SPECIES 29 KCNA6 (ENSMICG00000043479) KCNA1 (ENSMICG00000042284) NTF3 (ENSMICG00000027428) #9 ANO2 (ENSMICG00000004767) VWF (ENSMICG00000004782) #10 CD9 (ENSMICG00000009235) #12 PLEKHG6 (ENSMICG00000009241) #13 TNFRSF1A (ENSMICG00000009249) #14 SCNN1A (ENSMICG00000009254) #15 ENSMICG00000030640 #16 CD27 (ENSMICG00000043982) TAPBPL (ENSMICG00000006498) #18 VAMP1 (ENSMICG00000006507) #19 MRPL51 (ENSMICG00000027914) #20 NCAPD2 (ENSMICG00000006519) #21 ENSMICG00000006546 ##22 IFFO1 (ENSMICG00000006558) #23 NOP2 (ENSMICG00000006570) CHD4 (ENSMICG00000006588) #25 ACRBP (ENSMICG00000006616) #27 ING4 (ENSMICG00000006626) #28 ZNF384 (ENSMICG00000006636) #29 PIANP (ENSMICG00000026350) #30 COPS7A (ENSMICG00000013661) #31 MLF2 (ENSMICG00000048017) #32 PTMS (ENSMICG00000036709) LAG3 (ENSMICG00000044236) #35 CD4 (ENSMICG00000027649) #36 GPR162 (ENSMICG00000001963) #37 P3H3 (ENSMICG00000042131) GNB3 (ENSMICG00000015148) Mouse lemur MODERN SPECIES 28 ENSMICG00000046611 KCNQ5 (ENSMICG00000006444) ENSMICG00000027311 ENSMICG00000028258 RIMS1 (ENSMICG00000008520) LMBRD1 (ENSMICG00000038204) COL19A1 (ENSMICG00000003072) COL9A1 (ENSMICG00000003102) FAM135A (ENSMICG00000027973) SDHAF4 (ENSMICG00000001287) SMAP1 (ENSMICG00000008161) B3GAT2 (ENSMICG00000035385) OGFRL1 (ENSMICG00000017326) ADGRB3 (ENSMICG00000009819) ENSMICG00000026811 ENSMICG00000046359 ##22 ENSMICG00000034194 PHF3 (ENSMICG00000029510) ENSMICG00000047651 ENSMICG00000041524 ENSMICG00000043683 LGSN (ENSMICG00000035402) KHDRBS2 (ENSMICG00000010315) PRIM2 (ENSMICG00000045096) RAB23 (ENSMICG00000014037) BAG2 (ENSMICG00000043661) ZNF451 (ENSMICG00000014017) KIAA1586 (ENSMICG00000033000) BEND6 (ENSMICG00000037952) ENSMICG00000042096 DST (ENSMICG00000011069) Mouse lemur DUPLICATION Mouse lemur MODERN SPECIES 169 SPIN4 (ENSMICG00000033616) BRS3 (ENSMICG00000047770) HTATSF1 (ENSMICG00000009348) CD40LG (ENSMICG00000017847) ARHGEF6 (ENSMICG00000017848) RBMX (ENSMICG00000006856) ENSMICG00000028289 ENSMICG00000029803 ZIC3 (ENSMICG00000042529) ENSMICG00000047186 ENSMICG00000042750 ENSMICG00000006392 ENSMICG00000005523 ENSMICG00000028954 ENSMICG00000027784 ENSMICG00000033041 ##22 F9 (ENSMICG00000016427) MCF2 (ENSMICG00000016443) ENSMICG00000037295 ATP11C (ENSMICG00000017620) CXorf66 (ENSMICG00000042583) ENSMICG00000043090 ENSMICG00000044078 ENSMICG00000043299 ENSMICG00000045052 ENSMICG00000028378 ENSMICG00000041505 ENSMICG00000031449 IKBKG (ENSMICG00000035937) G6PD (ENSMICG00000016481) FAM3A (ENSMICG00000016470) Mouse lemur MODERN SPECIES 3 ENSMICG00000008198 CCDC152 (ENSMICG00000001272) GHR (ENSMICG00000038266) FBXO4 (ENSMICG00000006133) OXCT1 (ENSMICG00000012578) PLCXD3 (ENSMICG00000014443) C6 (ENSMICG00000012415) MROH2B (ENSMICG00000012385) C7 (ENSMICG00000012365) CARD6 (ENSMICG00000043072) ENSMICG00000012351 PRKAA1 (ENSMICG00000036665) PTGER4 (ENSMICG00000027186) ENSMICG00000047886 DAB2 (ENSMICG00000006730) ENSMICG00000026620 ##22 C9 (ENSMICG00000006710) FYB1 (ENSMICG00000030963) RICTOR (ENSMICG00000006675) OSMR (ENSMICG00000006658) LIFR (ENSMICG00000017232) EGFLAM (ENSMICG00000017230) GDNF (ENSMICG00000038777) WDR70 (ENSMICG00000027615) NUP155 (ENSMICG00000017202) CPLANE1 (ENSMICG00000012526) NIPBL (ENSMICG00000012468) SLC1A3 (ENSMICG00000012786) RANBP3L (ENSMICG00000017831) NADK2 (ENSMICG00000031635) SKP2 (ENSMICG00000017829) Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000158576 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.a.b.f.b ##22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a.f #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 1119 GPR63 (ENSPSMG00000015864) FHL5 (ENSPSMG00000015858) UFL1 (ENSPSMG00000015836) FUT9 (ENSPSMG00000015770) MANEA (ENSPSMG00000015753) ENSPSMG00000015723 ##22 EPHA7 (ENSPSMG00000015710) Coquerels sifaka DUPLICATION Coquerels sifaka MODERN SPECIES 128 KCNA6 (ENSPCOG00000013268) KCNA1 (ENSPCOG00000013721) NTF3 (ENSPCOG00000022944) #9 ANO2 (ENSPCOG00000016390) VWF (ENSPCOG00000025072) #10 CD9 (ENSPCOG00000018215) #12 PLEKHG6 (ENSPCOG00000025731) #13 TNFRSF1A (ENSPCOG00000026430) #14 SCNN1A (ENSPCOG00000010597) #15 LTBR (ENSPCOG00000003892) #16 CD27 (ENSPCOG00000025005) TAPBPL (ENSPCOG00000022121) #18 VAMP1 (ENSPCOG00000024868) #19 ENSPCOG00000024470 #20 NCAPD2 (ENSPCOG00000022291) #21 ENSPCOG00000015049 ##22 IFFO1 (ENSPCOG00000019348) #23 ENSPCOG00000002562 #24 CHD4 (ENSPCOG00000018635) #25 ACRBP (ENSPCOG00000018439) #27 ING4 (ENSPCOG00000011355) #28 ZNF384 (ENSPCOG00000024423) #29 PIANP (ENSPCOG00000015290) #30 COPS7A (ENSPCOG00000023849) #31 MLF2 (ENSPCOG00000021173) #32 ENSPCOG00000019129 #33 LAG3 (ENSPCOG00000026047) #35 CD4 (ENSPCOG00000015849) #36 GPR162 (ENSPCOG00000018277) #37 P3H3 (ENSPCOG00000024751) GNB3 (ENSPCOG00000028837) Coquerels sifaka MODERN SPECIES 1007 IRF5 (ENSPCOG00000011325) KCP (ENSPCOG00000017217) ATP6V1FNB (ENSPCOG00000021691) ATP6V1F (ENSPCOG00000015785) FLNC (ENSPCOG00000017493) CCDC136 (ENSPCOG00000019053) OPN1SW (ENSPCOG00000020982) CALU (ENSPCOG00000027459) GARIN1B (ENSPCOG00000019037) GARIN1A (ENSPCOG00000026970) IMPDH1 (ENSPCOG00000017804) PRRT4 (ENSPCOG00000014989) RBM28 (ENSPCOG00000016797) LEP (ENSPCOG00000014023) LRRC4 (ENSPCOG00000019833) ENSPCOG00000021188 ##22 SND1 (ENSPCOG00000026791) PAX4 (ENSPCOG00000019659) FSCN3 (ENSPCOG00000006185) ARF5 (ENSPCOG00000027640) GCC1 (ENSPCOG00000013515) MRPS30 (ENSPCOG00000018431) FGF10 (ENSPCOG00000003326) NNT (ENSPCOG00000016719) PAIP1 (ENSPCOG00000020257) C5orf34 (ENSPCOG00000024989) TMEM267 (ENSPCOG00000025607) CCL28 (ENSPCOG00000007673) HMGCS1 (ENSPCOG00000013478) NIM1K (ENSPCOG00000001729) ZNF131 (ENSPCOG00000013460) Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.b ##22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.b ##22 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.b ##22 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.b ##22 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 1137 ENSPSMG00000019179 ##22 Mouse lemur DUPLICATION Mouse lemur MODERN SPECIES 31 MEF2A (ENSMICG00000034803) LRRC28 (ENSMICG00000028987) TTC23 (ENSMICG00000007312) SYNM (ENSMICG00000007299) IGF1R (ENSMICG00000010119) ENSMICG00000010148 ENSMICG00000045619 ARRDC4 (ENSMICG00000037963) NR2F2 (ENSMICG00000035561) ENSMICG00000016758 RGMA (ENSMICG00000026641) CHD2 (ENSMICG00000000332) FAM174B (ENSMICG00000046366) ENSMICG00000044575 OCA2 (ENSMICG00000000034) ENSMICG00000027022 ##22 GABRG3 (ENSMICG00000000033) GABRA5 (ENSMICG00000000032) GABRB3 (ENSMICG00000027069) ATP10A (ENSMICG00000001113) ENSMICG00000037691 UBE3A (ENSMICG00000027572) FAM135B (ENSMICG00000005212) COL22A1 (ENSMICG00000005224) KCNK9 (ENSMICG00000004397) ENSMICG00000037374 ENSMICG00000045662 TRAPPC9 (ENSMICG00000004399) CHRAC1 (ENSMICG00000042491) AGO2 (ENSMICG00000004427) PTK2 (ENSMICG00000004440) Mouse lemur MODERN SPECIES 169 ARX (ENSMICG00000044540) POLA1 (ENSMICG00000002524) PCYT1B (ENSMICG00000009068) PDK3 (ENSMICG00000009061) ENSMICG00000009517 EIF2S3B (ENSMICG00000017858) KLHL15 (ENSMICG00000038607) CXorf58 (ENSMICG00000036290) ENSMICG00000010756 SAT1 (ENSMICG00000028733) ACOT9 (ENSMICG00000003532) PRDX4 (ENSMICG00000031550) PTCHD1 (ENSMICG00000000824) PHEX (ENSMICG00000000193) ENSMICG00000000192 ENSMICG00000037442 ##22 ENSMICG00000030382 MBTPS2 (ENSMICG00000008917) ENSMICG00000044479 SMPX (ENSMICG00000008915) KLHL34 (ENSMICG00000028251) CNKSR2 (ENSMICG00000002912) RPS6KA3 (ENSMICG00000004112) EIF1AX (ENSMICG00000004110) MAP7D2 (ENSMICG00000004105) BCLAF3 (ENSMICG00000004101) SH3KBP1 (ENSMICG00000004092) MAP3K15 (ENSMICG00000004080) PDHA1 (ENSMICG00000004067) ADGRG2 (ENSMICG00000004232) PHKA2 (ENSMICG00000004212) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.b ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.b ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.b ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.b ##22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.b ##22 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 467 ENSRBIG00000043778 POT1 (ENSRBIG00000040275) GRM8 (ENSRBIG00000015208) ZNF800 (ENSRBIG00000035623) ENSRBIG00000015509 ##22 GCC1 (ENSRBIG00000028126) ARF5 (ENSRBIG00000039868) FSCN3 (ENSRBIG00000037881) PAX4 (ENSRBIG00000032983) ENSRBIG00000027782 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00910000146741 ENSGT00910000146645 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00910000148152 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.b ##22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT00910000146795 #33 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Gibbon MODERN SPECIES 449 ENSNLEG00000031525 USP11 (ENSNLEG00000003207) CDK16 (ENSNLEG00000003184) UBA1 (ENSNLEG00000003096) RBM10 (ENSNLEG00000003018) NDUFB11 (ENSNLEG00000003004) RGN (ENSNLEG00000002955) JADE3 (ENSNLEG00000002888) RP2 (ENSNLEG00000031771) SLC9A7 (ENSNLEG00000002859) ENSNLEG00000033712 CHST7 (ENSNLEG00000002858) ZNF674 (ENSNLEG00000002837) KRBOX4 (ENSNLEG00000002829) ENSNLEG00000030246 ENSNLEG00000004194 ##22 ENSNLEG00000030017 ENSNLEG00000035785 ENSNLEG00000034858 ENSNLEG00000031205 ENSNLEG00000027704 DIPK2B (ENSNLEG00000036003) KDM6A (ENSNLEG00000002537) ENSNLEG00000034223 FUNDC1 (ENSNLEG00000002513) ENSNLEG00000035492 ENSNLEG00000031843 ENSNLEG00000036235 ENSNLEG00000036149 MAOB (ENSNLEG00000002389) MAOA (ENSNLEG00000002271) Hominidae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00910000146741 ENSGT00910000146645 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00910000148152 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.b ##22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT00910000146795 #33 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00510000046986.n.a.b ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00910000146741 ENSGT00910000146645 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00910000148152 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.b ##22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00510000046986.n.a.b ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00910000148152 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.b ##22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Pan ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00510000046986.n.a.b ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00950000183030.m.b.b.m.b ENSGT00390000008496.eb ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00910000148152 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.b ##22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT00910000146795 #33 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 ENSGT01000000214413.b.a.b.a Bonobo DUPLICATION Bonobo MODERN SPECIES 3 VWF (ENSPPAG00000025674) #10 CD9 (ENSPPAG00000029663) #12 PLEKHG6 (ENSPPAG00000030565) #13 TNFRSF1A (ENSPPAG00000017841) #14 ENSPPAG00000034540 #15 LTBR (ENSPPAG00000037185) #16 ENSPPAG00000028653 ENSPPAG00000034129 CD27 (ENSPPAG00000036587) TAPBPL (ENSPPAG00000039890) #18 ENSPPAG00000040975 VAMP1 (ENSPPAG00000034853) #19 ENSPPAG00000034755 MRPL51 (ENSPPAG00000040001) #20 NCAPD2 (ENSPPAG00000041747) #21 ENSPPAG00000039909 ##22 IFFO1 (ENSPPAG00000037226) #23 ENSPPAG00000030215 #24 CHD4 (ENSPPAG00000029007) #25 LPAR5 (ENSPPAG00000014365) #26 ACRBP (ENSPPAG00000042742) #27 ING4 (ENSPPAG00000035325) #28 ZNF384 (ENSPPAG00000043539) #29 PIANP (ENSPPAG00000028216) #30 COPS7A (ENSPPAG00000022715) #31 MLF2 (ENSPPAG00000034825) #32 ENSPPAG00000033598 #33 LAG3 (ENSPPAG00000026677) #35 CD4 (ENSPPAG00000034703) #36 GPR162 (ENSPPAG00000005842) #37 P3H3 (ENSPPAG00000036812) Bonobo MODERN SPECIES 15 ENSPPAG00000003514 RALB (ENSPPAG00000035798) ENSPPAG00000030838 EPB41L5 (ENSPPAG00000037104) PTPN4 (ENSPPAG00000007018) ENSPPAG00000038871 ENSPPAG00000032632 CFAP221 (ENSPPAG00000026562) SCTR (ENSPPAG00000011217) TMEM37 (ENSPPAG00000039178) DBI (ENSPPAG00000038470) C2orf76 (ENSPPAG00000041702) STEAP3 (ENSPPAG00000029473) C1QL2 (ENSPPAG00000035484) MARCO (ENSPPAG00000038285) ENSPPAG00000033812 ##22 INSIG2 (ENSPPAG00000033913) CCDC93 (ENSPPAG00000039658) ENSPPAG00000028222 DDX18 (ENSPPAG00000033473) DPP10 (ENSPPAG00000025416) ACTR3 (ENSPPAG00000040697) SLC35F5 (ENSPPAG00000006288) Chimpanzee MODERN SPECIES 3 CD9 (ENSPTRG00000004567) #12 ENSPTRG00000049700 PLEKHG6 (ENSPTRG00000004569) #13 TNFRSF1A (ENSPTRG00000004570) #14 SCNN1A (ENSPTRG00000004571) #15 LTBR (ENSPTRG00000004572) #16 ENSPTRG00000048966 ENSPTRG00000050411 CD27 (ENSPTRG00000029823) TAPBPL (ENSPTRG00000004573) #18 ENSPTRG00000051882 VAMP1 (ENSPTRG00000004574) #19 ENSPTRG00000044427 MRPL51 (ENSPTRG00000004575) #20 NCAPD2 (ENSPTRG00000004576) #21 GAPDH (ENSPTRG00000004577) ##22 IFFO1 (ENSPTRG00000004578) #23 NOP2 (ENSPTRG00000004579) #24 CHD4 (ENSPTRG00000004580) #25 LPAR5 (ENSPTRG00000004581) #26 ACRBP (ENSPTRG00000004582) #27 ING4 (ENSPTRG00000004583) #28 ZNF384 (ENSPTRG00000004584) #29 PIANP (ENSPTRG00000004585) #30 COPS7A (ENSPTRG00000004586) #31 MLF2 (ENSPTRG00000004587) #32 PTMS (ENSPTRG00000004588) #33 LAG3 (ENSPTRG00000024384) #35 CD4 (ENSPTRG00000004590) #36 GPR162 (ENSPTRG00000038667) #37 P3H3 (ENSPTRG00000004591) Human MODERN SPECIES 3 KCNA1 (ENSG00000111262) KCNA5 (ENSG00000130037) #7 NTF3 (ENSG00000185652) #9 ANO2 (ENSG00000047617) VWF (ENSG00000110799) #10 CD9 (ENSG00000010278) #12 PLEKHG6 (ENSG00000008323) #13 TNFRSF1A (ENSG00000067182) #14 SCNN1A (ENSG00000111319) #15 LTBR (ENSG00000111321) #16 CD27 (ENSG00000139193) TAPBPL (ENSG00000139192) #18 VAMP1 (ENSG00000139190) #19 MRPL51 (ENSG00000111639) #20 NCAPD2 (ENSG00000010292) #21 GAPDH (ENSG00000111640) ##22 IFFO1 (ENSG00000010295) #23 NOP2 (ENSG00000111641) CHD4 (ENSG00000111642) #25 LPAR5 (ENSG00000184574) #26 ACRBP (ENSG00000111644) #27 ING4 (ENSG00000111653) #28 ZNF384 (ENSG00000126746) #29 PIANP (ENSG00000139200) #30 COPS7A (ENSG00000111652) #31 MLF2 (ENSG00000089693) #32 PTMS (ENSG00000159335) LAG3 (ENSG00000089692) #35 CD4 (ENSG00000010610) #36 GPR162 (ENSG00000250510) #37 P3H3 (ENSG00000110811) Gorilla DUPLICATION Gorilla MODERN SPECIES 3 ENSGGOG00000028258 PLEKHG6 (ENSGGOG00000011884) #13 TNFRSF1A (ENSGGOG00000011904) #14 SCNN1A (ENSGGOG00000010834) #15 LTBR (ENSGGOG00000010848) #16 ENSGGOG00000024862 ENSGGOG00000022764 CD27 (ENSGGOG00000004650) TAPBPL (ENSGGOG00000004655) #18 ENSGGOG00000041472 VAMP1 (ENSGGOG00000036332) #19 ENSGGOG00000004659 ENSGGOG00000041204 MRPL51 (ENSGGOG00000016199) #20 NCAPD2 (ENSGGOG00000009536) #21 GAPDH (ENSGGOG00000009553) ##22 IFFO1 (ENSGGOG00000009558) #23 NOP2 (ENSGGOG00000001926) CHD4 (ENSGGOG00000001930) #25 LPAR5 (ENSGGOG00000001937) #26 ACRBP (ENSGGOG00000025663) #27 ING4 (ENSGGOG00000016035) #28 ZNF384 (ENSGGOG00000016048) #29 PIANP (ENSGGOG00000016057) #30 COPS7A (ENSGGOG00000009184) #31 MLF2 (ENSGGOG00000007930) #32 ENSGGOG00000014593 #33 LAG3 (ENSGGOG00000003225) #35 CD4 (ENSGGOG00000003230) #36 GPR162 (ENSGGOG00000040285) #37 P3H3 (ENSGGOG00000002603) Gorilla MODERN SPECIES 523 DDX3X (ENSGGOG00000003181) ENSGGOG00000043590 ENSGGOG00000043505 ENSGGOG00000039583 USP9X (ENSGGOG00000004363) ENSGGOG00000024562 ENSGGOG00000037299 ENSGGOG00000024940 ENSGGOG00000043097 ENSGGOG00000042324 MED14 (ENSGGOG00000004125) CXorf38 (ENSGGOG00000013906) ATP6AP2 (ENSGGOG00000000532) IMPDH (ENSGGOG00000040015) BCOR (ENSGGOG00000014889) ENSGGOG00000042064 ##22 ENSGGOG00000039451 ENSGGOG00000028188 TSPAN7 (ENSGGOG00000013841) OTC (ENSGGOG00000011703) RPGR (ENSGGOG00000023793) SRPX (ENSGGOG00000007123) SYTL5 (ENSGGOG00000002396) CYBB (ENSGGOG00000007874) XK (ENSGGOG00000016059) LANCL3 (ENSGGOG00000024460) PRRG1 (ENSGGOG00000010895) CFAP47 (ENSGGOG00000039948) MAGEB16 (ENSGGOG00000003549) FAM47B (ENSGGOG00000001615) TMEM47 (ENSGGOG00000039748) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.b ##22 Mas night monkey DUPLICATION Mas night monkey MODERN SPECIES 609 MAGED1 (ENSANAG00000010771) GSPT2 (ENSANAG00000031086) ENSANAG00000021376 ##22 Mas night monkey MODERN SPECIES 902 ENSANAG00000025786 ##22 NUFIP1 (ENSANAG00000019736) ENSANAG00000023959 KCTD4 (ENSANAG00000018346) GTF2F2 (ENSANAG00000029406) ENSANAG00000037538 ENSANAG00000011705 ENSANAG00000023331 ENSANAG00000031206 SLC25A30 (ENSANAG00000027572) COG3 (ENSANAG00000023990) ERICH6B (ENSANAG00000022961) CBY2 (ENSANAG00000028568) SIAH3 (ENSANAG00000027513) ZC3H13 (ENSANAG00000033079) CPB2 (ENSANAG00000024089) Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.b ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.b ##22 Capuchin DUPLICATION Capuchin MODERN SPECIES 162 PPP4R1 (ENSCCAG00000023335) ENSCCAG00000037472 ##22 RALBP1 (ENSCCAG00000023709) TWSG1 (ENSCCAG00000015677) ANKRD12 (ENSCCAG00000027145) NDUFV2 (ENSCCAG00000025556) ENSCCAG00000032300 MTCL1 (ENSCCAG00000034435) RAB12 (ENSCCAG00000022862) PTPRM (ENSCCAG00000030484) LRRC30 (ENSCCAG00000032058) LAMA1 (ENSCCAG00000024596) ARHGAP28 (ENSCCAG00000020308) L3MBTL4 (ENSCCAG00000022099) ENSCCAG00000037663 EPB41L3 (ENSCCAG00000009201) ENSCCAG00000035725 Capuchin MODERN SPECIES 112 CBS (ENSCCAG00000032722) PKNOX1 (ENSCCAG00000022902) ENSCCAG00000022392 WDR4 (ENSCCAG00000022755) PDE9A (ENSCCAG00000001044) ENSCCAG00000033172 SLC37A1 (ENSCCAG00000033553) RSPH1 (ENSCCAG00000029158) UBASH3A (ENSCCAG00000029676) TMPRSS3 (ENSCCAG00000038076) TFF1 (ENSCCAG00000022303) TFF2 (ENSCCAG00000022205) TFF3 (ENSCCAG00000022195) ABCG1 (ENSCCAG00000022414) UMODL1 (ENSCCAG00000028529) ENSCCAG00000030168 ##22 ZBTB21 (ENSCCAG00000037414) ENSCCAG00000029556 PRDM15 (ENSCCAG00000030489) RIPK4 (ENSCCAG00000029896) TMPRSS2 (ENSCCAG00000030906) MX1 (ENSCCAG00000025192) ENSCCAG00000020180 MX2 (ENSCCAG00000029612) FAM3B (ENSCCAG00000030600) BACE2 (ENSCCAG00000035482) ENSCCAG00000015027 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Glires ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Rodentia ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT01100000267007 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000158576 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT01100000267007 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000158576 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Marmotini ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00940000158576 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b.k #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Alpin marmot DUPLICATION Alpin marmot MODERN SPECIES 69 KCNA1 (ENSMMMG00000018158) KCNA5 (ENSMMMG00000018154) #7 NTF3 (ENSMMMG00000018129) #9 ANO2 (ENSMMMG00000018106) VWF (ENSMMMG00000017987) #10 CD9 (ENSMMMG00000017985) #12 PLEKHG6 (ENSMMMG00000017961) #13 TNFRSF1A (ENSMMMG00000017946) #14 SCNN1A (ENSMMMG00000017899) #15 LTBR (ENSMMMG00000017889) #16 CD27 (ENSMMMG00000017884) TAPBPL (ENSMMMG00000017876) #18 VAMP1 (ENSMMMG00000017864) #19 MRPL51 (ENSMMMG00000017860) #20 NCAPD2 (ENSMMMG00000017813) #21 ENSMMMG00000017572 #22 IFFO1 (ENSMMMG00000017549) #23 NOP2 (ENSMMMG00000017537) CHD4 (ENSMMMG00000017466) #25 LPAR5 (ENSMMMG00000017458) #26 ACRBP (ENSMMMG00000017414) #27 ING4 (ENSMMMG00000017397) #28 ZNF384 (ENSMMMG00000017132) #29 PIANP (ENSMMMG00000017119) #30 COPS7A (ENSMMMG00000017113) #31 MLF2 (ENSMMMG00000017103) #32 ENSMMMG00000017097 LAG3 (ENSMMMG00000017001) #35 CD4 (ENSMMMG00000016990) #36 GPR162 (ENSMMMG00000016980) #37 P3H3 (ENSMMMG00000016960) Alpin marmot MODERN SPECIES 97 ENSMMMG00000010130 FTSJ3 (ENSMMMG00000010083) DDX42 (ENSMMMG00000010051) ENSMMMG00000010027 CCDC47 (ENSMMMG00000010015) STRADA (ENSMMMG00000009934) LIMD2 (ENSMMMG00000009910) ENSMMMG00000009870 MAP3K3 (ENSMMMG00000009851) TACO1 (ENSMMMG00000009841) DCAF7 (ENSMMMG00000009832) KCNH6 (ENSMMMG00000009756) ENSMMMG00000009720 ACE (ENSMMMG00000009655) CYB561 (ENSMMMG00000009645) ENSMMMG00000009634 #22 TANC2 (ENSMMMG00000009607) ENSMMMG00000009576 ENSMMMG00000009570 MRC2 (ENSMMMG00000009525) TLK2 (ENSMMMG00000009390) ENSMMMG00000009379 ENSMMMG00000009369 ENSMMMG00000009363 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 111 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b.k #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Squirrel MODERN SPECIES 309 NTF3 (ENSSTOG00000021165) #9 ANO2 (ENSSTOG00000015852) VWF (ENSSTOG00000015861) #10 ENSSTOG00000001348 #12 PLEKHG6 (ENSSTOG00000010044) #13 TNFRSF1A (ENSSTOG00000010063) #14 SCNN1A (ENSSTOG00000013304) #15 LTBR (ENSSTOG00000013322) #16 CD27 (ENSSTOG00000007440) TAPBPL (ENSSTOG00000007459) #18 VAMP1 (ENSSTOG00000007482) #19 MRPL51 (ENSSTOG00000007484) #20 NCAPD2 (ENSSTOG00000007493) #21 ENSSTOG00000007538 #22 IFFO1 (ENSSTOG00000007566) #23 ENSSTOG00000033133 CHD4 (ENSSTOG00000007601) #25 LPAR5 (ENSSTOG00000026737) #26 ENSSTOG00000009882 #27 ING4 (ENSSTOG00000009890) #28 ZNF384 (ENSSTOG00000009902) #29 PIANP (ENSSTOG00000028660) #30 COPS7A (ENSSTOG00000027250) #31 ENSSTOG00000009908 #32 PTMS (ENSSTOG00000034819) LAG3 (ENSSTOG00000015581) #35 CD4 (ENSSTOG00000027178) #36 GPR162 (ENSSTOG00000020091) #37 P3H3 (ENSSTOG00000015582) Eurasian red squirrel DUPLICATION Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 14 KCNA5 (ENSSVLG00005011478) #7 NTF3 (ENSSVLG00005011507) #9 ANO2 (ENSSVLG00005011671) VWF (ENSSVLG00005012648) #10 CD9 (ENSSVLG00005013052) #12 PLEKHG6 (ENSSVLG00005013449) #13 TNFRSF1A (ENSSVLG00005013664) #14 SCNN1A (ENSSVLG00005013781) #15 ENSSVLG00005013962 LTBR (ENSSVLG00005014074) #16 CD27 (ENSSVLG00005014318) TAPBPL (ENSSVLG00005014372) #18 VAMP1 (ENSSVLG00005014405) #19 MRPL51 (ENSSVLG00005014541) #20 ENSSVLG00005014610 ENSSVLG00005014703 #22 ENSSVLG00005014899 #23 NOP2 (ENSSVLG00005014954) CHD4 (ENSSVLG00005015376) #25 LPAR5 (ENSSVLG00005018041) #26 ACRBP (ENSSVLG00005018087) #27 ING4 (ENSSVLG00005018357) #28 ENSSVLG00005018564 #29 PIANP (ENSSVLG00005018592) #30 ENSSVLG00005018640 #31 MLF2 (ENSSVLG00005018671) #32 ENSSVLG00005018711 #33 LAG3 (ENSSVLG00005018831) #35 CD4 (ENSSVLG00005018976) #36 GPR162 (ENSSVLG00005019129) #37 P3H3 (ENSSVLG00005019312) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 5 LIPT1 (ENSSVLG00005014850) ENSSVLG00005014814 C2orf15 (ENSSVLG00005014789) TSGA10 (ENSSVLG00005014435) CRACDL (ENSSVLG00005014046) ENSSVLG00005013927 ENSSVLG00005013836 ENSSVLG00005013734 ENSSVLG00005013684 INPP4A (ENSSVLG00005013494) CNGA3 (ENSSVLG00005013237) ENSSVLG00005013156 VWA3B (ENSSVLG00005012929) TMEM131 (ENSSVLG00005012815) ZAP70 (ENSSVLG00005012562) ENSSVLG00005012495 #22 ACTR1B (ENSSVLG00005012172) COX5B (ENSSVLG00005012122) ENSSVLG00005011994 ENSSVLG00005011946 SEMA4C (ENSSVLG00005011743) ANKRD39 (ENSSVLG00005011694) ANKRD23 (ENSSVLG00005011456) CNNM4 (ENSSVLG00005011163) LMAN2L (ENSSVLG00005011060) ENSSVLG00005010875 KANSL3 (ENSSVLG00005010774) ARID5A (ENSSVLG00005010563) NEURL3 (ENSSVLG00005010485) NCAPH (ENSSVLG00005010189) ITPRIPL1 (ENSSVLG00005010139) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES CCN3 (ENSSVLG00005002612) MAL2 (ENSSVLG00005002595) COLEC10 (ENSSVLG00005002580) TNFRSF11B (ENSSVLG00005002562) SAMD12 (ENSSVLG00005002548) EXT1 (ENSSVLG00005002516) MED30 (ENSSVLG00005002500) SLC30A8 (ENSSVLG00005002466) AARD (ENSSVLG00005002450) RAD21 (ENSSVLG00005002416) ENSSVLG00005002391 UTP23 (ENSSVLG00005002373) EIF3H (ENSSVLG00005002349) ENSSVLG00005002331 TRPS1 (ENSSVLG00005002245) ENSSVLG00005002187 #22 ENSSVLG00005002158 ENSSVLG00005002148 CSMD3 (ENSSVLG00005001710) ENSSVLG00005001557 ENSSVLG00005001548 ENSSVLG00005001538 KCNV1 (ENSSVLG00005001530) ENSSVLG00005001510 SYBU (ENSSVLG00005001459) EBAG9 (ENSSVLG00005001423) PKHD1L1 (ENSSVLG00005001320) ENY2 (ENSSVLG00005001233) NUDCD1 (ENSSVLG00005001220) TRHR (ENSSVLG00005001205) TMEM74 (ENSSVLG00005001194) Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000158576 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT01100000267007 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 24 KCNA5 (ENSHGLG00000001161) #7 NTF3 (ENSHGLG00000001196) #9 ENSHGLG00000032394 VWF (ENSHGLG00000001451) #10 CD9 (ENSHGLG00000001625) #12 PLEKHG6 (ENSHGLG00000001657) #13 TNFRSF1A (ENSHGLG00000001689) #14 SCNN1A (ENSHGLG00000001735) #15 LTBR (ENSHGLG00000032405) #16 CD27 (ENSHGLG00000046681) TAPBPL (ENSHGLG00000001831) #18 ENSHGLG00000001867 #19 MRPL51 (ENSHGLG00000050005) #20 NCAPD2 (ENSHGLG00000001934) #21 ENSHGLG00000036344 GAPDH (ENSHGLG00000002856) #22 IFFO1 (ENSHGLG00000002934) #23 NOP2 (ENSHGLG00000042932) CHD4 (ENSHGLG00000003093) #25 LPAR5 (ENSHGLG00000033434) #26 ENSHGLG00000047116 ACRBP (ENSHGLG00000003358) #27 Ing4 (ENSHGLG00000003447) #28 ENSHGLG00000039857 ZNF384 (ENSHGLG00000003572) #29 PIANP (ENSHGLG00000003689) #30 COPS7A (ENSHGLG00000032684) #31 MLF2 (ENSHGLG00000003883) #32 PTMS (ENSHGLG00000038669) LAG3 (ENSHGLG00000004095) #35 CD4 (ENSHGLG00000004194) #36 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000158576 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Guinea pig MODERN SPECIES 107 TSPAN9 (ENSCPOG00000038895) TEAD4 (ENSCPOG00000020720) TULP3 (ENSCPOG00000004928) RHNO1 (ENSCPOG00000035546) FOXM1 (ENSCPOG00000015373) TEX52 (ENSCPOG00000008276) PLEKHG6 (ENSCPOG00000000576) #13 TNFRSF1A (ENSCPOG00000031352) #14 SCNN1A (ENSCPOG00000006185) #15 LTBR (ENSCPOG00000035613) #16 CD27 (ENSCPOG00000008449) TAPBPL (ENSCPOG00000008460) #18 VAMP1 (ENSCPOG00000008473) #19 MRPL51 (ENSCPOG00000008478) #20 NCAPD2 (ENSCPOG00000008480) #21 Gapdh (ENSCPOG00000026350) #22 IFFO1 (ENSCPOG00000001041) #23 NOP2 (ENSCPOG00000020690) CHD4 (ENSCPOG00000008504) #25 ACRBP (ENSCPOG00000012300) #27 ING4 (ENSCPOG00000012311) #28 ZNF384 (ENSCPOG00000012313) #29 PIANP (ENSCPOG00000000349) #30 COPS7A (ENSCPOG00000000315) #31 MLF2 (ENSCPOG00000035372) #32 PTMS (ENSCPOG00000021676) LAG3 (ENSCPOG00000012321) #35 ENSCPOG00000012324 #36 GPR162 (ENSCPOG00000038691) #37 P3H3 (ENSCPOG00000012330) GNB3 (ENSCPOG00000025068) Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000158576 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 120 KCNA1 (ENSCLAG00000013088) KCNA5 (ENSCLAG00000018083) #7 NTF3 (ENSCLAG00000016065) #9 ANO2 (ENSCLAG00000015450) VWF (ENSCLAG00000014671) #10 CD9 (ENSCLAG00000013477) #12 PLEKHG6 (ENSCLAG00000015229) #13 TNFRSF1A (ENSCLAG00000016084) #14 SCNN1A (ENSCLAG00000015244) #15 LTBR (ENSCLAG00000013106) #16 CD27 (ENSCLAG00000016154) TAPBPL (ENSCLAG00000016184) #18 VAMP1 (ENSCLAG00000012860) #19 MRPL51 (ENSCLAG00000011881) #20 NCAPD2 (ENSCLAG00000013118) #21 GAPDH (ENSCLAG00000013783) #22 IFFO1 (ENSCLAG00000014944) #23 NOP2 (ENSCLAG00000014440) CHD4 (ENSCLAG00000012244) #25 LPAR5 (ENSCLAG00000014166) #26 ENSCLAG00000014500 #27 ING4 (ENSCLAG00000014519) #28 ZNF384 (ENSCLAG00000015550) #29 PIANP (ENSCLAG00000016394) #30 COPS7A (ENSCLAG00000014244) #31 MLF2 (ENSCLAG00000013739) #32 PTMS (ENSCLAG00000016337) LAG3 (ENSCLAG00000014680) #35 CD4 (ENSCLAG00000016197) #36 GPR162 (ENSCLAG00000015020) #37 P3H3 (ENSCLAG00000012569) Degu DUPLICATION Degu DUPLICATION Degu DUPLICATION Degu DUPLICATION Degu DUPLICATION Degu DUPLICATION Degu MODERN SPECIES 62 CAPN15 (ENSODEG00000015214) RAB11FIP3 (ENSODEG00000015247) DECR2 (ENSODEG00000015304) NME4 (ENSODEG00000016834) ENSODEG00000015417 MRPL28 (ENSODEG00000015538) AXIN1 (ENSODEG00000015585) PDIA2 (ENSODEG00000015401) ARHGDIG (ENSODEG00000015826) RGS11 (ENSODEG00000016707) FAM234A (ENSODEG00000015423) ENSODEG00000015706 ENSODEG00000015850 HBQ1 (ENSODEG00000015997) ENSODEG00000015802 ENSODEG00000020287 #22 ENSODEG00000015409 HBZ (ENSODEG00000015908) NPRL3 (ENSODEG00000016564) RHBDF1 (ENSODEG00000016052) SNRNP25 (ENSODEG00000016175) POLR3K (ENSODEG00000015558) IL9R (ENSODEG00000016050) ENSODEG00000016277 VPREB1 (ENSODEG00000015252) TOP3B (ENSODEG00000015541) PPM1F (ENSODEG00000016321) MAPK1 (ENSODEG00000015816) YPEL1 (ENSODEG00000016029) PPIL2 (ENSODEG00000015998) ENSODEG00000016999 Degu MODERN SPECIES 255 TEX45 (ENSODEG00000012588) ZNF358 (ENSODEG00000012219) MCOLN1 (ENSODEG00000012479) PNPLA6 (ENSODEG00000012572) ENSODEG00000012129 XAB2 (ENSODEG00000011794) PET100 (ENSODEG00000011997) PCP2 (ENSODEG00000011839) STXBP2 (ENSODEG00000012329) RETN (ENSODEG00000012179) TRAPPC5 (ENSODEG00000012661) FCER2 (ENSODEG00000012810) CLEC4G (ENSODEG00000011804) ENSODEG00000010680 ENSODEG00000012346 ENSODEG00000011218 #22 ENSODEG00000012311 ENSODEG00000011113 ENSODEG00000010671 EVI5L (ENSODEG00000012663) ENSODEG00000010815 LRRC8E (ENSODEG00000011497) MAP2K7 (ENSODEG00000012972) TGFBR3L (ENSODEG00000011690) SNAPC2 (ENSODEG00000011415) CTXN1 (ENSODEG00000019975) TIMM44 (ENSODEG00000011966) ELAVL1 (ENSODEG00000012189) CERS4 (ENSODEG00000012322) CD320 (ENSODEG00000011308) NDUFA7 (ENSODEG00000011906) Degu MODERN SPECIES 228 ALCAM (ENSODEG00000005450) CBLB (ENSODEG00000005613) ENSODEG00000019090 ENSODEG00000005010 #22 ENSODEG00000005023 ENSODEG00000005074 ENSODEG00000019157 BBX (ENSODEG00000005151) ENSODEG00000005329 IFT57 (ENSODEG00000005424) ENSODEG00000019189 ENSODEG00000005470 MYH15 (ENSODEG00000004613) CIP2A (ENSODEG00000004774) DZIP3 (ENSODEG00000004949) TRAT1 (ENSODEG00000005139) Degu MODERN SPECIES 298 TBX15 (ENSODEG00000001193) WARS2 (ENSODEG00000001212) ENSODEG00000018671 #22 ENSODEG00000001230 ENSODEG00000001240 HAO2 (ENSODEG00000001256) ENSODEG00000001440 ENSODEG00000001448 ENSODEG00000018670 ENSODEG00000001464 ZNF697 (ENSODEG00000001481) PHGDH (ENSODEG00000001506) HMGCS2 (ENSODEG00000000553) REG4 (ENSODEG00000000629) ENSODEG00000000642 ENSODEG00000000653 NOTCH2 (ENSODEG00000000797) ENSODEG00000001721 Degu MODERN SPECIES 219 KCNA5 (ENSODEG00000019098) #7 NTF3 (ENSODEG00000003025) #9 ENSODEG00000018854 ANO2 (ENSODEG00000002927) VWF (ENSODEG00000002617) #10 CD9 (ENSODEG00000005241) #12 PLEKHG6 (ENSODEG00000005186) #13 TNFRSF1A (ENSODEG00000004861) #14 SCNN1A (ENSODEG00000004767) #15 LTBR (ENSODEG00000004616) #16 CD27 (ENSODEG00000004529) TAPBPL (ENSODEG00000004477) #18 VAMP1 (ENSODEG00000004453) #19 MRPL51 (ENSODEG00000004435) #20 NCAPD2 (ENSODEG00000004156) #21 ENSODEG00000004114 #22 ENSODEG00000003579 #23 ENSODEG00000003567 CHD4 (ENSODEG00000003114) #25 ACRBP (ENSODEG00000002969) #27 ING4 (ENSODEG00000002865) #28 ZNF384 (ENSODEG00000002585) #29 PIANP (ENSODEG00000002502) #30 ENSODEG00000002475 COPS7A (ENSODEG00000002432) #31 MLF2 (ENSODEG00000002383) #32 ENSODEG00000002310 LAG3 (ENSODEG00000002278) #35 ENSODEG00000002251 ENSODEG00000018791 GPR162 (ENSODEG00000003518) #37 Degu MODERN SPECIES 95 ENSODEG00000005975 CYP7A1 (ENSODEG00000006021) UBXN2B (ENSODEG00000006103) BPNT2 (ENSODEG00000006152) PENK (ENSODEG00000002736) ENSODEG00000002751 SDR16C5 (ENSODEG00000002794) ENSODEG00000002863 PLAG1 (ENSODEG00000002880) LYN (ENSODEG00000002925) ENSODEG00000018874 TGS1 (ENSODEG00000002948) ENSODEG00000003120 XKR4 (ENSODEG00000003156) ENSODEG00000003202 ENSODEG00000018873 #22 ENSODEG00000002691 ENSODEG00000002737 ENSODEG00000002753 ENSODEG00000002823 ATP6V1H (ENSODEG00000002840) ENSODEG00000002936 OPRK1 (ENSODEG00000002988) NPBWR1 (ENSODEG00000019191) ENSODEG00000003047 ENSODEG00000003192 ENSODEG00000003208 ST18 (ENSODEG00000003288) PCMTD1 (ENSODEG00000003571) SNTG1 (ENSODEG00000003621) ENSODEG00000003654 Degu MODERN SPECIES 73 UPP2 (ENSODEG00000014593) CCDC148 (ENSODEG00000014894) ENSODEG00000020204 PKP4 (ENSODEG00000014779) DAPL1 (ENSODEG00000014464) TANC1 (ENSODEG00000014910) WDSUB1 (ENSODEG00000014178) BAZ2B (ENSODEG00000014127) ENSODEG00000015125 MARCHF7 (ENSODEG00000013942) CD302 (ENSODEG00000015670) LY75 (ENSODEG00000014691) ENSODEG00000014957 ITGB6 (ENSODEG00000013253) RBMS1 (ENSODEG00000013934) ENSODEG00000020118 #22 ENSODEG00000013723 PSMD14 (ENSODEG00000015872) TBR1 (ENSODEG00000013807) SLC4A10 (ENSODEG00000013195) DPP4 (ENSODEG00000013321) GCG (ENSODEG00000013560) FAP (ENSODEG00000013259) IFIH1 (ENSODEG00000013586) GCA (ENSODEG00000013215) KCNH7 (ENSODEG00000013646) FIGN (ENSODEG00000013392) GRB14 (ENSODEG00000013239) COBLL1 (ENSODEG00000013366) SLC38A11 (ENSODEG00000013030) ENSODEG00000012704 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n #22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n #22 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 158 Ndufa9 (ENSJJAG00000007801) Kcna6 (ENSJJAG00000013867) Kcna1 (ENSJJAG00000006988) Ntf3 (ENSJJAG00000004637) #9 Ano2 (ENSJJAG00000004730) Vwf (ENSJJAG00000023254) #10 Cd9 (ENSJJAG00000022710) #12 Plekhg6 (ENSJJAG00000022183) #13 Scnn1a (ENSJJAG00000021122) #15 Ltbr (ENSJJAG00000020376) #16 Cd27 (ENSJJAG00000019993) Tapbpl (ENSJJAG00000019548) #18 ENSJJAG00000019185 Mrpl51 (ENSJJAG00000018962) #20 Ncapd2 (ENSJJAG00000017993) #21 ENSJJAG00000017186 #22 Iffo1 (ENSJJAG00000015968) #23 ENSJJAG00000015505 Chd4 (ENSJJAG00000012394) #25 Lpar5 (ENSJJAG00000010456) #26 ENSJJAG00000010370 #27 Ing4 (ENSJJAG00000009788) #28 Zfp384 (ENSJJAG00000003875) #29 Pianp (ENSJJAG00000000549) #30 Cops7a (ENSJJAG00000010387) #31 Mlf2 (ENSJJAG00000009196) #32 ENSJJAG00000008935 Lag3 (ENSJJAG00000007735) #35 Cd4 (ENSJJAG00000006130) #36 Gpr162 (ENSJJAG00000004130) #37 P3h3 (ENSJJAG00000002354) Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n #22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n #22 Murinae DUPLICATION Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.j #22 Rat MODERN SPECIES 11 Tars1 (ENSRNOG00000019023) ENSRNOG00000069715 ENSRNOG00000030171 ENSRNOG00000032427 Npr3 (ENSRNOG00000019184) ENSRNOG00000030204 Sub1 (ENSRNOG00000067555) Zfr (ENSRNOG00000011627) Mtmr12 (ENSRNOG00000022929) Golph3 (ENSRNOG00000012186) Pdzd2 (ENSRNOG00000013140) Ftl1-ps14 (ENSRNOG00000065602) RGD1306502 (ENSRNOG00000022745) Drosha (ENSRNOG00000013451) Cdh6 (ENSRNOG00000013535) ENSRNOG00000067563 #22 AABR07008608.1 (ENSRNOG00000055439) Cdh9 (ENSRNOG00000033837) Cdh10 (ENSRNOG00000009771) ENSRNOG00000066871 ENSRNOG00000068443 Cdh12 (ENSRNOG00000026392) AABR07008724.1 (ENSRNOG00000019037) ENSRNOG00000068483 Cdh18 (ENSRNOG00000010535) Basp1 (ENSRNOG00000066065) Cwc15-ps3 (ENSRNOG00000025157) Myo10 (ENSRNOG00000010161) Zfp622 (ENSRNOG00000010589) AABR07008911.1 (ENSRNOG00000056969) Marchf11 (ENSRNOG00000024461) Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.j #22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.j #22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.j #22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.j #22 spretus MODERN SPECIES 2 Tenm2 (MGP_SPRETEiJ_G0017051) Wwc1 (MGP_SPRETEiJ_G0017050) Rars (MGP_SPRETEiJ_G0017049) Fbll1 (MGP_SPRETEiJ_G0017048) Pank3 (MGP_SPRETEiJ_G0017047) Slit3 (MGP_SPRETEiJ_G0017046) Spdl1 (MGP_SPRETEiJ_G0017045) Insyn2b (MGP_SPRETEiJ_G0017044) Dock2 (MGP_SPRETEiJ_G0017043) Foxi1 (MGP_SPRETEiJ_G0017042) Lcp2 (MGP_SPRETEiJ_G0017041) Kcnmb1 (MGP_SPRETEiJ_G0017040) Kcnip1 (MGP_SPRETEiJ_G0017039) MGP_SPRETEiJ_G0017038 Gabrp (MGP_SPRETEiJ_G0017037) MGP_SPRETEiJ_G0017036 #22 MGP_SPRETEiJ_G0017035 Tlx3 (MGP_SPRETEiJ_G0017034) Npm1 (MGP_SPRETEiJ_G0017033) Fgf18 (MGP_SPRETEiJ_G0017032) Smim23 (MGP_SPRETEiJ_G0017031) Fbxw11 (MGP_SPRETEiJ_G0017030) Stk10 (MGP_SPRETEiJ_G0017029) Efcab9 (MGP_SPRETEiJ_G0017028) Ubtd2 (MGP_SPRETEiJ_G0017027) Sh3pxd2b (MGP_SPRETEiJ_G0017026) MGP_SPRETEiJ_G0017025 Mpg (MGP_SPRETEiJ_G0017024) Nprl3 (MGP_SPRETEiJ_G0017023) Rhbdf1 (MGP_SPRETEiJ_G0017022) MGP_SPRETEiJ_G0017021 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.k #22 Rat MODERN SPECIES 13 Fmnl2 (ENSRNOG00000055567) Prpf40a (ENSRNOG00000004864) Arl6ip6 (ENSRNOG00000005074) Micos10-ps2 (ENSRNOG00000065751) Rprm (ENSRNOG00000005109) Galnt13 (ENSRNOG00000005335) ENSRNOG00000065543 Kcnj3 (ENSRNOG00000005369) Nr4a2 (ENSRNOG00000005600) Gpd2 (ENSRNOG00000033824) Galnt5 (ENSRNOG00000004645) Ermn (ENSRNOG00000021472) Cytip (ENSRNOG00000004772) Acvr1c (ENSRNOG00000004828) Acvr1 (ENSRNOG00000005033) Gapdh-ps1 (ENSRNOG00000071205) #22 Upp2 (ENSRNOG00000005341) Ccdc148 (ENSRNOG00000057740) Pkp4 (ENSRNOG00000005504) Dapl1 (ENSRNOG00000005743) ENSRNOG00000064239 Tanc1 (ENSRNOG00000025394) Wdsub1 (ENSRNOG00000005990) Baz2b (ENSRNOG00000056984) LOC100361645 (ENSRNOG00000031951) Marchf7 (ENSRNOG00000006241) Cd302 (ENSRNOG00000006623) Ly75 (ENSRNOG00000007012) Pla2r1 (ENSRNOG00000008129) Itgb6 (ENSRNOG00000008346) Rbms1 (ENSRNOG00000008482) Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n #22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n #22 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 188 Pamr1 (ENSCGRG00001023148) Fjx1 (ENSCGRG00001010732) Trim44 (ENSCGRG00001024631) ENSCGRG00001024835 Ldlrad3 (ENSCGRG00001024912) ENSCGRG00001017501 Prr5l (ENSCGRG00001018581) Traf6 (ENSCGRG00001019275) Rag1 (ENSCGRG00001002046) Rag2 (ENSCGRG00001011151) Iftap (ENSCGRG00001020974) ENSCGRG00001003416 ENSCGRG00001002351 ENSCGRG00001011370 Lrrc4c (ENSCGRG00001011183) ENSCGRG00001022153 #22 ENSCGRG00001002994 ENSCGRG00001023209 Ttc17 (ENSCGRG00001008891) Hsd17b12 (ENSCGRG00001024805) Alkbh3 (ENSCGRG00001014489) Gm13889 (ENSCGRG00001015067) Accs (ENSCGRG00001017403) Ext2 (ENSCGRG00001018610) Alx4 (ENSCGRG00001013158) Cd82 (ENSCGRG00001014213) Tspan18 (ENSCGRG00001014966) Trp53i11 (ENSCGRG00001015881) ENSCGRG00001016971 Syt13 (ENSCGRG00001017740) Chst1 (ENSCGRG00001010952) Golden Hamster MODERN SPECIES 721 ENSMAUG00000001414 #22 ENSMAUG00000016868 Bach2 (ENSMAUG00000016851) Gja10 (ENSMAUG00000020453) Casp8ap2 (ENSMAUG00000018512) ENSMAUG00000014080 Ankrd6 (ENSMAUG00000011054) Rragd (ENSMAUG00000021734) Gabrr1 (ENSMAUG00000019124) ENSMAUG00000017845 Pnrc1 (ENSMAUG00000012518) Rngtt (ENSMAUG00000021153) Cnr1 (ENSMAUG00000014040) Spaca1 (ENSMAUG00000010690) Akirin2 (ENSMAUG00000013076) Rars2 (ENSMAUG00000008929) Upper Galilee mountains blind mole rat DUPLICATION Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1885 Kcna5 (ENSNGAG00000001282) #7 Ntf3 (ENSNGAG00000023064) #9 Ano2 (ENSNGAG00000006568) Vwf (ENSNGAG00000022403) #10 Cd9 (ENSNGAG00000014189) #12 ENSNGAG00000022639 Plekhg6 (ENSNGAG00000011808) #13 Tnfrsf1a (ENSNGAG00000019085) #14 Scnn1a (ENSNGAG00000019351) #15 Ltbr (ENSNGAG00000022402) #16 Cd27 (ENSNGAG00000019654) Tapbpl (ENSNGAG00000023020) #18 Vamp1 (ENSNGAG00000011610) #19 Mrpl51 (ENSNGAG00000022754) #20 Ncapd2 (ENSNGAG00000021912) #21 ENSNGAG00000013476 #22 Iffo1 (ENSNGAG00000013363) #23 Nop2 (ENSNGAG00000019010) Chd4 (ENSNGAG00000016920) #25 Acrbp (ENSNGAG00000022774) #27 Ing4 (ENSNGAG00000016704) #28 Zfp384 (ENSNGAG00000011316) #29 Pianp (ENSNGAG00000013944) #30 Cops7a (ENSNGAG00000022873) #31 Mlf2 (ENSNGAG00000016666) #32 ENSNGAG00000021065 Lag3 (ENSNGAG00000009790) #35 ENSNGAG00000022963 #36 Gpr162 (ENSNGAG00000002840) #37 P3h3 (ENSNGAG00000015076) Gnb3 (ENSNGAG00000023501) Upper Galilee mountains blind mole rat DUPLICATION Upper Galilee mountains blind mole rat DUPLICATION Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 922 Fgf1 (ENSNGAG00000023588) ENSNGAG00000011614 #22 Spry4 (ENSNGAG00000023023) Ndfip1 (ENSNGAG00000023008) ENSNGAG00000022512 Rnf14 (ENSNGAG00000011674) Pcdh12 (ENSNGAG00000010710) Dele1 (ENSNGAG00000018387) Pcdh1 (ENSNGAG00000015865) ENSNGAG00000014600 Arap3 (ENSNGAG00000023362) Fchsd1 (ENSNGAG00000019709) ENSNGAG00000018010 Hdac3 (ENSNGAG00000012179) ENSNGAG00000004201 Pcdhgc3 (ENSNGAG00000022970) Pcdhga11 (ENSNGAG00000011680) Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 997 ENSNGAG00000000089 Sostdc1 (ENSNGAG00000000175) ENSNGAG00000017134 ENSNGAG00000013686 #22 Ankmy2 (ENSNGAG00000016932) Bzw2 (ENSNGAG00000015192) Upper Galilee mountains blind mole rat DUPLICATION Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 722 Zfp949 (ENSNGAG00000024150) ENSNGAG00000011756 #22 Syncrip (ENSNGAG00000020647) Snx14 (ENSNGAG00000019697) Nt5e (ENSNGAG00000006974) Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 500 Srek1ip1 (ENSNGAG00000021556) Shisal2b (ENSNGAG00000011993) Rgs7bp (ENSNGAG00000001316) Rnf180 (ENSNGAG00000010291) Htr1a (ENSNGAG00000010968) Ipo11 (ENSNGAG00000007024) Dimt1 (ENSNGAG00000024364) Kif2a (ENSNGAG00000017429) ENSNGAG00000021151 Zswim6 (ENSNGAG00000017421) ENSNGAG00000024020 Ndufaf2 (ENSNGAG00000021740) Ercc8 (ENSNGAG00000013684) Elovl7 (ENSNGAG00000024148) Depdc1b (ENSNGAG00000015994) ENSNGAG00000024358 #22 ENSNGAG00000009337 ENSNGAG00000010555 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000158576 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Pika MODERN SPECIES 1014 NTF3 (ENSOPRG00000012279) #9 ANO2 (ENSOPRG00000012282) VWF (ENSOPRG00000012313) #10 CD9 (ENSOPRG00000012372) #12 PLEKHG6 (ENSOPRG00000012382) #13 TNFRSF1A (ENSOPRG00000012410) #14 LTBR (ENSOPRG00000012422) #16 CD27 (ENSOPRG00000012447) TAPBPL (ENSOPRG00000012454) #18 VAMP1 (ENSOPRG00000012475) #19 NCAPD2 (ENSOPRG00000012480) #21 GAPDH (ENSOPRG00000012514) #22 Rabbit DUPLICATION Rabbit DUPLICATION Rabbit MODERN SPECIES 19 ENSOCUG00000030707 NTF3 (ENSOCUG00000016450) #9 ENSOCUG00000039598 ENSOCUG00000006775 VWF (ENSOCUG00000006783) #10 ENSOCUG00000010123 #12 PLEKHG6 (ENSOCUG00000010130) #13 TNFRSF1A (ENSOCUG00000010146) #14 SCNN1A (ENSOCUG00000010152) #15 LTBR (ENSOCUG00000001292) #16 CD27 (ENSOCUG00000008159) TAPBPL (ENSOCUG00000008163) #18 VAMP1 (ENSOCUG00000021107) #19 MRPL51 (ENSOCUG00000008170) #20 NCAPD2 (ENSOCUG00000008176) #21 ENSOCUG00000029891 #22 ENSOCUG00000008198 #23 NOP2 (ENSOCUG00000008203) CHD4 (ENSOCUG00000008215) #25 LPAR5 (ENSOCUG00000026551) #26 ACRBP (ENSOCUG00000003737) #27 ING4 (ENSOCUG00000003742) #28 ZNF384 (ENSOCUG00000003747) #29 PIANP (ENSOCUG00000003749) #30 COPS7A (ENSOCUG00000011187) #31 ENSOCUG00000003750 #32 LAG3 (ENSOCUG00000011196) #35 ENSOCUG00000012911 #36 GPR162 (ENSOCUG00000030705) #37 P3H3 (ENSOCUG00000012916) GNB3 (ENSOCUG00000012934) Rabbit MODERN SPECIES ENSOCUG00000028054 PCSK5 (ENSOCUG00000001616) ENSOCUG00000001622 GCNT1 (ENSOCUG00000007916) PRUNE2 (ENSOCUG00000008553) FOXB2 (ENSOCUG00000002111) VPS13A (ENSOCUG00000001328) GNA14 (ENSOCUG00000005507) GNAQ (ENSOCUG00000016559) CEP78 (ENSOCUG00000007758) PSAT1 (ENSOCUG00000007765) ENSOCUG00000026996 ENSOCUG00000024344 TLE4 (ENSOCUG00000011891) ENSOCUG00000032761 ENSOCUG00000022657 #22 ENSOCUG00000000531 ENSOCUG00000035151 ENSOCUG00000027027 ENSOCUG00000032438 ENSOCUG00000023951 ENSOCUG00000034184 ENSOCUG00000027755 ENSOCUG00000039432 RASEF (ENSOCUG00000001548) MFSD14B (ENSOCUG00000005373) ZNF484 (ENSOCUG00000029283) IARS1 (ENSOCUG00000016888) NOL8 (ENSOCUG00000008053) CENPP (ENSOCUG00000007236) OGN (ENSOCUG00000009017) Rabbit MODERN SPECIES 20 ORYCUNV1R1540 (ENSOCUG00000032812) XPC (ENSOCUG00000011079) ORYCUNV1R1507 (ENSOCUG00000031825) ORYCUNV1R1638 (ENSOCUG00000035671) ORYCUNV1R1541 (ENSOCUG00000031125) ORYCUNV1R1632 (ENSOCUG00000033938) ORYCUNV1R1524 (ENSOCUG00000027158) CHCHD4 (ENSOCUG00000023806) TMEM43 (ENSOCUG00000011074) ENSOCUG00000011088 SLC6A6 (ENSOCUG00000001144) GRIP2 (ENSOCUG00000001145) CCDC174 (ENSOCUG00000008451) ENSOCUG00000039627 ENSOCUG00000015577 ENSOCUG00000025023 #22 FGD5 (ENSOCUG00000006961) NR2C2 (ENSOCUG00000006975) MRPS25 (ENSOCUG00000006984) RBSN (ENSOCUG00000006988) TRH (ENSOCUG00000006337) TMCC1 (ENSOCUG00000013071) PLXND1 (ENSOCUG00000013049) ENSOCUG00000029379 RHO (ENSOCUG00000013036) IFT122 (ENSOCUG00000013015) MBD4 (ENSOCUG00000013006) ENSOCUG00000012999 ENSOCUG00000023407 CAND2 (ENSOCUG00000009266) ENSOCUG00000031173 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Laurasiatheria_a DUPLICATION Laurasiatheria_a DUPLICATION Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.p.a #22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.p.a #22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.p.a #22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.p.a #22 Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.p.a #22 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00390000006915.c.d ENSGT00940000160481 ENSGT01100000263506.b.a ENSGT00940000161604.a ENSGT00940000161713 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.b.j ENSGT00940000153525.h.d.b.a ENSGT00440000033895 ENSGT00940000163297.d ENSGT00940000161342.e ENSGT01090000260076.b.a ENSGT00940000161533.C ENSGT00940000161113 ENSGT00940000166486.e ENSGT00390000001700.a.b.a ENSGT00940000153298.n.p.a #22 ENSGT00390000005094 ENSGT00940000158347 ENSGT00940000159451 ENSGT00940000161952 ENSGT00940000160785 ENSGT00940000161221 ENSGT00530000063786.b ENSGT00940000162863 ENSGT00390000015219 ENSGT00950000183035.a.a ENSGT00950000182803.B.d.a.i.a ENSGT00940000156656 ENSGT00390000003197.i.b ENSGT00940000159460 ENSGT00940000164181 Dog MODERN SPECIES 144 RAB9B (ENSCAFG00845023869) ENSCAFG00845023955 ENSCAFG00845024075 SLC25A53 (ENSCAFG00845024107) ENSCAFG00845024140 ENSCAFG00845024204 ENSCAFG00845024263 FAM199X (ENSCAFG00845015897) ESX1 (ENSCAFG00845015935) ENSCAFG00845016080 IL1RAPL2 (ENSCAFG00845016119) NRK (ENSCAFG00845016215) SERPINA7 (ENSCAFG00845016407) ENSCAFG00845016460 PWWP3B (ENSCAFG00845016500) ENSCAFG00845016546 #22 RADX (ENSCAFG00845016635) RNF128 (ENSCAFG00845016725) TBC1D8B (ENSCAFG00845016942) ENSCAFG00845017120 CLDN2 (ENSCAFG00845017181) MORC4 (ENSCAFG00845017263) RBM41 (ENSCAFG00845017359) ENSCAFG00845017493 PIH1D3 (ENSCAFG00845017612) ENSCAFG00845017692 FRMPD3 (ENSCAFG00845017719) PRPS1 (ENSCAFG00845017825) TSC22D3 (ENSCAFG00845018025) MID2 (ENSCAFG00845018213) NCBP2L (ENSCAFG00845018480) Dingo MODERN SPECIES 347 SLC25A53 (ENSCAFG00020007000) ENSCAFG00020006998 ENSCAFG00020006993 ENSCAFG00020006988 FAM199X (ENSCAFG00020006986) ENSCAFG00020006982 ENSCAFG00020006980 ENSCAFG00020006976 ENSCAFG00020006969 ENSCAFG00020006962 SERPINA7 (ENSCAFG00020006955) ENSCAFG00020006950 PWWP3B (ENSCAFG00020006943) ENSCAFG00020006941 ENSCAFG00020006940 ENSCAFG00020006937 #22 RADX (ENSCAFG00020006912) RNF128 (ENSCAFG00020006883) TBC1D8B (ENSCAFG00020006806) RIPPLY1 (ENSCAFG00020006796) CLDN2 (ENSCAFG00020006782) MORC4 (ENSCAFG00020006778) RBM41 (ENSCAFG00020006764) ENSCAFG00020006752 DNAAF6 (ENSCAFG00020006746) ENSCAFG00020006744 FRMPD3 (ENSCAFG00020006712) ENSCAFG00020006709 ENSCAFG00020006708 ENSCAFG00020006695 NCBP2L (ENSCAFG00020006690) Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.p.a #22 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.p.a #22 American mink MODERN SPECIES 132 ENSNVIG00000000181 #22 FAM81A (ENSNVIG00000000188) MYO1E (ENSNVIG00000000225) CCNB2 (ENSNVIG00000000283) RNF111 (ENSNVIG00000000316) ENSNVIG00000000355 ENSNVIG00000000361 SLTM (ENSNVIG00000000365) MINDY2 (ENSNVIG00000000373) ENSNVIG00000000402 ADA10 (ENSNVIG00000000408) LIPC (ENSNVIG00000000464) AL1A2 (ENSNVIG00000000690) AQP9 (ENSNVIG00000000811) GRL1A (ENSNVIG00000000834) MYZAP (ENSNVIG00000000857) Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.p.a #22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.p.a #22 Camelidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.p.a #22 Arabian camel MODERN SPECIES 1 OR51E2 (ENSCDRG00005001263) ENSCDRG00005001272 OR51E1 (ENSCDRG00005001277) OR51D1 (ENSCDRG00005001280) TRIM68 (ENSCDRG00005001287) ENSCDRG00005001300 ENSCDRG00005001305 ENSCDRG00005001318 ENSCDRG00005001327 ENSCDRG00005001354 ENSCDRG00005001376 ENSCDRG00005001386 TRIM21 (ENSCDRG00005001404) RRM1 (ENSCDRG00005001431) STIM1 (ENSCDRG00005001504) ENSCDRG00005001763 #22 ENSCDRG00005001773 PGAP2 (ENSCDRG00005001795) NUP98 (ENSCDRG00005001857) CHRNA10 (ENSCDRG00005000126) ART1 (ENSCDRG00005000164) ART5 (ENSCDRG00005000179) ENSCDRG00005000213 ENSCDRG00005000233 RNF121 (ENSCDRG00005000310) ENSCDRG00005000432 NUMA1 (ENSCDRG00005000496) LAMTOR1 (ENSCDRG00005000668) LRRC51 (ENSCDRG00005000728) TOMT (ENSCDRG00005000758) ENSCDRG00005000800 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 165 ENSGT01090000263215 ENSGT00940000153298.n.p.b #22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 143 ENSGT01090000263215 ENSGT00940000153298.n.p.b #22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 135 ENSGT01090000263215 ENSGT00940000153298.n.p.b #22 Equus ANCESTRAL SPECIES 189 ENSGT01090000263215 ENSGT00940000153298.n.p.b #22 Horse MODERN SPECIES 480 ENSECAG00000047785 ARHGEF9 (ENSECAG00000014934) AMER1 (ENSECAG00000004232) MTMR8 (ENSECAG00000009594) ENSECAG00000044480 ENSECAG00000046943 ZC4H2 (ENSECAG00000018089) ZC3H12B (ENSECAG00000020993) LAS1L (ENSECAG00000021891) MSN (ENSECAG00000012900) ENSECAG00000058640 VSIG4 (ENSECAG00000023766) ENSECAG00000057357 HEPH (ENSECAG00000006789) ENSECAG00000049385 ENSECAG00000043057 #22 ENSECAG00000050099 AR (ENSECAG00000010160) OPHN1 (ENSECAG00000011510) ENSECAG00000047807 ENSECAG00000047480 STARD8 (ENSECAG00000005912) EFNB1 (ENSECAG00000012319) PJA1 (ENSECAG00000043590) NALF2 (ENSECAG00000013474) EDA (ENSECAG00000026865) AWAT2 (ENSECAG00000015526) ENSECAG00000023513 DGAT2L6 (ENSECAG00000006583) AWAT1 (ENSECAG00000007956) P2RY4 (ENSECAG00000038211) Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.p.b #22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.p.b #22 Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.p.b #22 Red fox DUPLICATION Red fox MODERN SPECIES 63 DVL3 (ENSVVUG00000007239) AP2M1 (ENSVVUG00000007272) ABCF3 (ENSVVUG00000007284) VWA5B2 (ENSVVUG00000007308) ALG3 (ENSVVUG00000007356) EEF1AKMT4 (ENSVVUG00000007363) CAMK2N2 (ENSVVUG00000007368) ECE2 (ENSVVUG00000007481) PSMD2 (ENSVVUG00000012151) EIF4G1 (ENSVVUG00000012160) FAM131A (ENSVVUG00000012207) CLCN2 (ENSVVUG00000012222) POLR2H (ENSVVUG00000012241) THPO (ENSVVUG00000012250) CHRD (ENSVVUG00000012254) ENSVVUG00000012269 #22 ENSVVUG00000012276 EPHB3 (ENSVVUG00000012282) MAGEF1 (ENSVVUG00000012292) VPS8 (ENSVVUG00000012306) C3orf70 (ENSVVUG00000012491) EHHADH (ENSVVUG00000012497) MAP3K13 (ENSVVUG00000012507) ENSVVUG00000012541 TMEM41A (ENSVVUG00000012554) LIPH (ENSVVUG00000012568) SENP2 (ENSVVUG00000012596) IGF2BP2 (ENSVVUG00000012616) ENSVVUG00000012975 TRA2B (ENSVVUG00000012980) ETV5 (ENSVVUG00000012993) Red fox MODERN SPECIES 131 MOCS2 (ENSVVUG00000025658) ITGA2 (ENSVVUG00000025507) ENSVVUG00000025502 ITGA1 (ENSVVUG00000025501) PELO (ENSVVUG00000025499) ENSVVUG00000025496 ISL1 (ENSVVUG00000025489) ENSVVUG00000025487 PARP8 (ENSVVUG00000025465) EMB (ENSVVUG00000025462) ENSVVUG00000025461 HCN1 (ENSVVUG00000025456) ENSVVUG00000025455 MRPS30 (ENSVVUG00000025454) FGF10 (ENSVVUG00000025452) ENSVVUG00000025445 #22 NNT (ENSVVUG00000025440) PAIP1 (ENSVVUG00000025408) CUNH5orf34 (ENSVVUG00000025400) TMEM267 (ENSVVUG00000025399) CCL28 (ENSVVUG00000025397) HMGCS1 (ENSVVUG00000025389) NIM1K (ENSVVUG00000025384) ZNF131 (ENSVVUG00000025370) ENSVVUG00000025369 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.p.b #22 Dingo MODERN SPECIES 138 RGS12 (ENSCAFG00020014622) HGFAC (ENSCAFG00020014624) DOK7 (ENSCAFG00020014626) LRPAP1 (ENSCAFG00020014629) ADRA2C (ENSCAFG00020014633) HMX1 (ENSCAFG00020014639) CPZ (ENSCAFG00020014642) TRMT44 (ENSCAFG00020014653) ENSCAFG00020014681 ACOX3 (ENSCAFG00020014686) HTRA3 (ENSCAFG00020014735) SH3TC1 (ENSCAFG00020014736) ABLIM2 (ENSCAFG00020014758) AFAP1 (ENSCAFG00020014815) SORCS2 (ENSCAFG00020014834) ENSCAFG00020014970 #22 GRPEL1 (ENSCAFG00020014974) TADA2B (ENSCAFG00020014977) ENSCAFG00020014980 TBC1D14 (ENSCAFG00020014982) KIAA0232 (ENSCAFG00020014988) BLOC1S4 (ENSCAFG00020015002) S100P (ENSCAFG00020015006) ENSCAFG00020015008 ENSCAFG00020015024 ENSCAFG00020015026 ENSCAFG00020015037 ENSCAFG00020015112 PPP2R2C (ENSCAFG00020015119) CRABP1 (ENSCAFG00020015129) ENSCAFG00020015137 Dog DUPLICATION Dog DUPLICATION Dog MODERN SPECIES 14 SPRY2 (ENSCAFG00845028431) ENSCAFG00845028507 ENSCAFG00845028540 ENSCAFG00845028564 ENSCAFG00845028573 ENSCAFG00845006476 SLITRK1 (ENSCAFG00845006513) ENSCAFG00845006551 ENSCAFG00845006574 ENSCAFG00845006596 ENSCAFG00845006620 SLITRK5 (ENSCAFG00845006790) ENSCAFG00845006931 ENSCAFG00845006956 ENSCAFG00845007169 ENSCAFG00845007227 #22 GPC6 (ENSCAFG00845007327) ENSCAFG00845007433 DCT (ENSCAFG00845007479) TGDS (ENSCAFG00845007622) GPR180 (ENSCAFG00845007777) SOX21 (ENSCAFG00845007844) ABCC4 (ENSCAFG00845008054) CLDN10 (ENSCAFG00845008850) DZIP1 (ENSCAFG00845008906) DNAJC3 (ENSCAFG00845009205) UGGT2 (ENSCAFG00845009495) ENSCAFG00845009831 ENSCAFG00845010209 OXGR1 (ENSCAFG00845019088) MBNL2 (ENSCAFG00845019234) Dog MODERN SPECIES 15 ENSCAFG00845024788 CNOT10 (ENSCAFG00845023808) TRIM71 (ENSCAFG00845023600) CCR4 (ENSCAFG00845023571) TMPPE (ENSCAFG00845023550) GLB1 (ENSCAFG00845023378) CRTAP (ENSCAFG00845023248) SUSD5 (ENSCAFG00845023061) FBXL2 (ENSCAFG00845022675) UBP1 (ENSCAFG00845022384) CLASP2 (ENSCAFG00845020608) SNRK (ENSCAFG00845020337) ENSCAFG00845020275 ENSCAFG00845020239 ENSCAFG00845020203 ENSCAFG00845020170 #22 ABHD5 (ENSCAFG00845020085) ENSCAFG00845019724 ENSCAFG00845019630 ENSCAFG00845019385 ZNF445 (ENSCAFG00845019305) ENSCAFG00845019227 ENSCAFG00845029250 NANP (ENSCAFG00845029217) NINL (ENSCAFG00845029110) GINS1 (ENSCAFG00845029067) ENSCAFG00845029035 ABHD12 (ENSCAFG00845028992) PYGB (ENSCAFG00845028916) ENTPD6 (ENSCAFG00845028707) VSX1 (ENSCAFG00845028643) Dog MODERN SPECIES ARFGEF3 (ENSCAFG00845006884) NHSL1 (ENSCAFG00845007489) HEBP2 (ENSCAFG00845007775) ENSCAFG00845007820 CCDC28A (ENSCAFG00845010054) ENSCAFG00845010111 ENSCAFG00845010165 ENSCAFG00845010329 ABRACL (ENSCAFG00845010575) HECA (ENSCAFG00845010601) TXLNB (ENSCAFG00845010652) CITED2 (ENSCAFG00845010679) ENSCAFG00845010804 ENSCAFG00845010818 ENSCAFG00845010915 ENSCAFG00845010927 #22 NMBR (ENSCAFG00845010954) GJE1 (ENSCAFG00845010994) VTA1 (ENSCAFG00845011029) ADGRG6 (ENSCAFG00845011283) ENSCAFG00845011718 HIVEP2 (ENSCAFG00845011748) ENSCAFG00845011773 AIG1 (ENSCAFG00845011826) ENSCAFG00845011947 ADAT2 (ENSCAFG00845011977) PEX3 (ENSCAFG00845012053) FUCA2 (ENSCAFG00845012120) PHACTR2 (ENSCAFG00845012219) ZC2HC1B (ENSCAFG00845012485) ENSCAFG00845012627 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.q #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.q #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.q #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Camelidae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000158576 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.q #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Arabian camel MODERN SPECIES 27 KCNA5 (ENSCDRG00005009093) #7 NTF3 (ENSCDRG00005009117) #9 ANO2 (ENSCDRG00005009195) VWF (ENSCDRG00005009803) #10 CD9 (ENSCDRG00005010377) #12 PLEKHG6 (ENSCDRG00005010653) #13 TNFRSF1A (ENSCDRG00005010816) #14 SCNN1A (ENSCDRG00005010881) #15 ENSCDRG00005011011 #16 ENSCDRG00005011060 #16 ENSCDRG00005011099 TAPBPL (ENSCDRG00005011181) #18 VAMP1 (ENSCDRG00005011313) #19 MRPL51 (ENSCDRG00005011359) #20 NCAPD2 (ENSCDRG00005011412) #21 GAPDH (ENSCDRG00005011757) #22 IFFO1 (ENSCDRG00005011863) #23 NOP2 (ENSCDRG00005012504) CHD4 (ENSCDRG00005012738) #25 LPAR5 (ENSCDRG00005018243) #26 ACRBP (ENSCDRG00005018263) #27 ING4 (ENSCDRG00005018381) #28 ZNF384 (ENSCDRG00005018592) #29 PIANP (ENSCDRG00005018699) #30 COPS7A (ENSCDRG00005018742) #31 MLF2 (ENSCDRG00005018784) #32 PTMS (ENSCDRG00005018819) LAG3 (ENSCDRG00005018858) #35 CD4 (ENSCDRG00005018894) #36 GPR162 (ENSCDRG00005018926) #37 P3H3 (ENSCDRG00005018977) Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.q #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Cetacea ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000158576 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821.g #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.q #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000158576 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821.g #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.q #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Sperm whale MODERN SPECIES 151 GAPDH (ENSPCTG00005014498) #22 IFFO1 (ENSPCTG00005014549) #23 NOP2 (ENSPCTG00005015086) CHD4 (ENSPCTG00005015922) #25 LPAR5 (ENSPCTG00005019413) #26 ACRBP (ENSPCTG00005019434) #27 ING4 (ENSPCTG00005019618) #28 ENSPCTG00005019803 #29 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000158576 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821.g #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.q #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Dolphin MODERN SPECIES 3421 MRPL51 (ENSTTRG00000016086) #20 NCAPD2 (ENSTTRG00000016088) #21 GAPDH (ENSTTRG00000016094) #22 IFFO1 (ENSTTRG00000016097) #23 NOP2 (ENSTTRG00000016100) CHD4 (ENSTTRG00000016102) #25 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000158576 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821.g #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.q #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000158576 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821.g #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.q #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Beluga whale MODERN SPECIES 23 KCNA5 (ENSDLEG00000006712) #7 NTF3 (ENSDLEG00000006715) #9 ANO2 (ENSDLEG00000006729) ENSDLEG00000006754 VWF (ENSDLEG00000007022) #10 CD9 (ENSDLEG00000014732) #12 PLEKHG6 (ENSDLEG00000014777) #13 TNFRSF1A (ENSDLEG00000014826) #14 SCNN1A (ENSDLEG00000014848) #15 LTBR (ENSDLEG00000014872) #16 CD27 (ENSDLEG00000014916) TAPBPL (ENSDLEG00000014928) #18 VAMP1 (ENSDLEG00000014958) #19 MRPL51 (ENSDLEG00000014972) #20 NCAPD2 (ENSDLEG00000014985) #21 GAPDH (ENSDLEG00000015049) #22 IFFO1 (ENSDLEG00000015074) #23 NOP2 (ENSDLEG00000015109) CHD4 (ENSDLEG00000015142) #25 LPAR5 (ENSDLEG00000015210) #26 ENSDLEG00000015216 #27 ING4 (ENSDLEG00000015223) #28 ZNF384 (ENSDLEG00000015249) #29 PIANP (ENSDLEG00000015302) #30 COPS7A (ENSDLEG00000015324) #31 MLF2 (ENSDLEG00000015348) #32 LAG3 (ENSDLEG00000015366) #35 CD4 (ENSDLEG00000015440) #36 GPR162 (ENSDLEG00000015459) #37 P3H3 (ENSDLEG00000015481) ENSDLEG00000015588 Vaquita MODERN SPECIES 1 KCNA1 (ENSPSNG00000008879) KCNA5 (ENSPSNG00000008856) #7 NTF3 (ENSPSNG00000008822) #9 ANO2 (ENSPSNG00000008259) VWF (ENSPSNG00000007898) #10 CD9 (ENSPSNG00000007840) #12 PLEKHG6 (ENSPSNG00000007509) #13 TNFRSF1A (ENSPSNG00000007444) #14 SCNN1A (ENSPSNG00000007201) #15 LTBR (ENSPSNG00000007107) #16 CD27 (ENSPSNG00000007050) TAPBPL (ENSPSNG00000007018) #18 VAMP1 (ENSPSNG00000006961) #19 MRPL51 (ENSPSNG00000006911) #20 NCAPD2 (ENSPSNG00000006782) #21 GAPDH (ENSPSNG00000006718) #22 IFFO1 (ENSPSNG00000006501) #23 NOP2 (ENSPSNG00000006400) CHD4 (ENSPSNG00000006181) #25 LPAR5 (ENSPSNG00000006141) #26 ACRBP (ENSPSNG00000006101) #27 ING4 (ENSPSNG00000005989) #28 ZNF384 (ENSPSNG00000005851) #29 PIANP (ENSPSNG00000005778) #30 COPS7A (ENSPSNG00000005746) #31 MLF2 (ENSPSNG00000005707) #32 PTMS (ENSPSNG00000005689) LAG3 (ENSPSNG00000005663) #35 CD4 (ENSPSNG00000005617) #36 GPR162 (ENSPSNG00000005573) #37 P3H3 (ENSPSNG00000005493) Blue whale MODERN SPECIES 1 KCNA6 (ENSBMSG00010022492) KCNA1 (ENSBMSG00010022494) KCNA5 (ENSBMSG00010012135) #7 NTF3 (ENSBMSG00010012141) #9 ANO2 (ENSBMSG00010012182) VWF (ENSBMSG00010012312) #10 CD9 (ENSBMSG00010012380) #12 PLEKHG6 (ENSBMSG00010012458) #13 TNFRSF1A (ENSBMSG00010012591) #14 SCNN1A (ENSBMSG00010012651) #15 LTBR (ENSBMSG00010012695) #16 CD27 (ENSBMSG00010012719) TAPBPL (ENSBMSG00010012737) #18 VAMP1 (ENSBMSG00010012768) #19 ENSBMSG00010012842 #20 GAPDH (ENSBMSG00010012883) #22 IFFO1 (ENSBMSG00010012925) #23 ENSBMSG00010013081 ENSBMSG00010013094 CHD4 (ENSBMSG00010013201) #25 LPAR5 (ENSBMSG00010013959) #26 ACRBP (ENSBMSG00010014002) #27 ING4 (ENSBMSG00010014218) #28 ZNF384 (ENSBMSG00010014353) #29 PIANP (ENSBMSG00010014495) #30 COPS7A (ENSBMSG00010014553) #31 MLF2 (ENSBMSG00010014597) #32 PTMS (ENSBMSG00010014712) LAG3 (ENSBMSG00010014753) #35 CD4 (ENSBMSG00010014905) #36 GPR162 (ENSBMSG00010014987) #37 Pecora ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.q #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Percora_a ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT01050000244838.B ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.q #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Bovidae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT01050000244838.B ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.q #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Bovinae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT01050000244838.B ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.q #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033.c.a #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Bos ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT01050000244838.B ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.q #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033.c.a #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Bos_a ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT01050000244838.B ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.q #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033.c.a #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Domestic yak MODERN SPECIES 24 KCNA1 (ENSBGRG00000011151) ENSBGRG00000011119 NTF3 (ENSBGRG00000011039) #9 ANO2 (ENSBGRG00000010076) VWF (ENSBGRG00000002102) #10 CD9 (ENSBGRG00000001613) #12 PLEKHG6 (ENSBGRG00000001519) #13 TNFRSF1A (ENSBGRG00000001449) #14 SCNN1A (ENSBGRG00000001315) #15 ENSBGRG00000001292 LTBR (ENSBGRG00000001281) #16 CD27 (ENSBGRG00000001262) ENSBGRG00000001236 #18 VAMP1 (ENSBGRG00000001169) #19 MRPL51 (ENSBGRG00000001145) #20 ENSBGRG00000001042 #22 ENSBGRG00000001026 #23 IFFO1 (ENSBGRG00000000872) #23 NOP2 (ENSBGRG00000000846) CHD4 (ENSBGRG00000000684) #25 LPAR5 (ENSBGRG00000000647) #26 ACRBP (ENSBGRG00000000596) #27 ENSBGRG00000000548 #28 ZNF384 (ENSBGRG00000000467) #29 PIANP (ENSBGRG00000000449) #30 COPS7A (ENSBGRG00000000425) #31 MLF2 (ENSBGRG00000000386) #32 PTMS (ENSBGRG00000000358) LAG 3 (ENSBGRG00000000330) #35 CD4 (ENSBGRG00000000298) #36 GPR162 (ENSBGRG00000022613) #37 Wild yak MODERN SPECIES 2103 CD9 (ENSBMUG00000006345) #12 PLEKHG6 (ENSBMUG00000006422) #13 TNFRSF1A (ENSBMUG00000006501) #14 SCNN1A (ENSBMUG00000006521) #15 LTBR (ENSBMUG00000006531) #16 CD27 (ENSBMUG00000006538) TAPBPL (ENSBMUG00000006543) #18 ENSBMUG00000006576 #19 MRPL51 (ENSBMUG00000006603) #20 NCAPD2 (ENSBMUG00000006625) #21 ENSBMUG00000007065 #22 IFFO1 (ENSBMUG00000008419) #23 NOP2 (ENSBMUG00000008536) CHD4 (ENSBMUG00000008731) #25 LPAR5 (ENSBMUG00000009068) #26 ACRBP (ENSBMUG00000009077) #27 ENSBMUG00000009099 #28 ZNF384 (ENSBMUG00000009149) #29 PIANP (ENSBMUG00000009210) #30 COPS7A (ENSBMUG00000009260) #31 MLF2 (ENSBMUG00000009291) #32 ENSBMUG00000009305 LAG3 (ENSBMUG00000009333) #35 CD4 (ENSBMUG00000009372) #36 ENSBMUG00000009392 #37 P3H3 (ENSBMUG00000009413) Bos_b ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000154384.h.a ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.q #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033.c.a #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 24 KCNA5 (ENSBIXG00005021354) #7 NTF3 (ENSBIXG00005021338) #9 ANO2 (ENSBIXG00005021270) ENSBIXG00005020908 VWF (ENSBIXG00005020874) #10 CD9 (ENSBIXG00005003523) #12 PLEKHG6 (ENSBIXG00005020777) #13 TNFRSF1A (ENSBIXG00005020704) #14 SCNN1A (ENSBIXG00005003494) #15 LTBR (ENSBIXG00005005674) #16 CD27 (ENSBIXG00005020535) TAPBPL (ENSBIXG00005003468) #18 ENSBIXG00005003464 #19 MRPL51 (ENSBIXG00005006150) #20 NCAPD2 (ENSBIXG00005020400) #21 GAPDH (ENSBIXG00005020359) #22 IFFO1 (ENSBIXG00005003425) #23 NOP2 (ENSBIXG00005020264) CHD4 (ENSBIXG00005020206) #25 LPAR5 (ENSBIXG00005019955) #26 ACRBP (ENSBIXG00005019947) #27 ING4 (ENSBIXG00005019901) #28 ZNF384 (ENSBIXG00005019825) #29 PIANP (ENSBIXG00005003237) #30 ENSBIXG00005003230 COPS7A (ENSBIXG00005019728) #31 ENSBIXG00005019647 MLF2 (ENSBIXG00005019632) #32 PTMS (ENSBIXG00005019569) LAG3 (ENSBIXG00005019525) #35 CD4 (ENSBIXG00005019448) #36 American bison MODERN SPECIES 3130 KCNA5 (ENSBBBG00000001935) #7 NTF3 (ENSBBBG00000002324) #9 ENSBBBG00000007400 ANO2 (ENSBBBG00000012336) VWF (ENSBBBG00000012369) #10 CD9 (ENSBBBG00000002367) #12 PLEKHG6 (ENSBBBG00000012442) #13 ENSBBBG00000012468 #14 SCNN1A (ENSBBBG00000012488) #15 LTBR (ENSBBBG00000002397) #16 CD27 (ENSBBBG00000009087) ENSBBBG00000002403 #18 VAMP1 (ENSBBBG00000012550) #19 MRPL51 (ENSBBBG00000012567) #20 NCAPD2 (ENSBBBG00000012598) #21 GAPDH (ENSBBBG00000012745) #22 IFFO1 (ENSBBBG00000002480) #23 NOP2 (ENSBBBG00000012839) CHD4 (ENSBBBG00000013055) #25 LPAR5 (ENSBBBG00000013073) #26 ACRBP (ENSBBBG00000013082) #27 ENSBBBG00000013090 #28 ZNF384 (ENSBBBG00000013145) #29 PIANP (ENSBBBG00000008904) #30 ENSBBBG00000013164 #31 ENSBBBG00000013172 MLF2 (ENSBBBG00000013185) #32 PTMS (ENSBBBG00000013194) LAG3 (ENSBBBG00000001644) #35 CD4 (ENSBBBG00000013265) #36 ENSBBBG00000002685 #37 Caprinae DUPLICATION Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00440000038159.rb.b ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.q.b #22 ENSGT00580000082664.a.a ENSGT00940000153298.n.q.a #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Goat MODERN SPECIES 24 KCNA5 (ENSCHIG00000001846) #7 NTF3 (ENSCHIG00000012334) #9 ANO2 (ENSCHIG00000016148) VWF (ENSCHIG00000012979) #10 ENSCHIG00000007426 CD9 (ENSCHIG00000008887) #12 PLEKHG6 (ENSCHIG00000013835) #13 TNFRSF1A (ENSCHIG00000012735) #14 SCNN1A (ENSCHIG00000009435) #15 LTBR (ENSCHIG00000022975) #16 CD27 (ENSCHIG00000021715) TAPBPL (ENSCHIG00000016665) #18 VAMP1 (ENSCHIG00000014523) #19 MRPL51 (ENSCHIG00000011385) #20 NCAPD2 (ENSCHIG00000015626) #21 ENSCHIG00000022516 #22 IFFO1 (ENSCHIG00000019031) #23 NOP2 (ENSCHIG00000018560) CHD4 (ENSCHIG00000020766) #25 LPAR5 (ENSCHIG00000004907) #26 ACRBP (ENSCHIG00000011452) #27 ING4 (ENSCHIG00000025231) #28 ZNF384 (ENSCHIG00000012248) #29 PIANP (ENSCHIG00000017399) #30 COPS7A (ENSCHIG00000013096) #31 MLF2 (ENSCHIG00000014233) #32 LAG3 (ENSCHIG00000012648) #35 CD4 (ENSCHIG00000010446) #36 GPR162 (ENSCHIG00000019485) #37 P3H3 (ENSCHIG00000000989) GNB3 (ENSCHIG00000012696) Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 16 SCNN1G (ENSOARG00020024623) USP31 (ENSOARG00020024514) HS3ST2 (ENSOARG00020024500) ENSOARG00020024487 OTOA (ENSOARG00020024423) IGSF6 (ENSOARG00020024403) METTL9 (ENSOARG00020024391) ENSOARG00020024374 POLR3E (ENSOARG00020024225) EEF2K (ENSOARG00020024161) SDR42E2 (ENSOARG00020024126) VWA3A (ENSOARG00020024028) MOSMO (ENSOARG00020023990) PDZD9 (ENSOARG00020023959) UQCRC2 (ENSOARG00020023912) GAPDH (ENSOARG00020023897) #22 ENSOARG00020022837 ENSOARG00020019048 CRYM (ENSOARG00020018778) ANKS4B (ENSOARG00020018721) ZP2 (ENSOARG00020018522) TMEM159 (ENSOARG00020018441) DNAH3 (ENSOARG00020017885) LYRM1 (ENSOARG00020017780) DCUN1D3 (ENSOARG00020017732) REXO5 (ENSOARG00020017408) ACSM3 (ENSOARG00020017247) THUMPD1 (ENSOARG00020017213) ACSM4 (ENSOARG00020017105) ENSOARG00020017057 ACSM1 (ENSOARG00020017006) Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00440000038159.rb.b ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.q.b #22 ENSGT00580000082664.a.a ENSGT00940000153298.n.q.a #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 19 KCNA5 (ENSOARG00020009091) #7 NTF3 (ENSOARG00020009049) #9 ANO2 (ENSOARG00020008165) VWF (ENSOARG00020006721) #10 ENSOARG00020006562 CD9 (ENSOARG00020006407) #12 PLEKHG6 (ENSOARG00020006252) #13 TNFRSF1A (ENSOARG00020006166) #14 SCNN1A (ENSOARG00020006047) #15 LTBR (ENSOARG00020005918) #16 CD27 (ENSOARG00020005885) ENSOARG00020005857 #18 VAMP1 (ENSOARG00020005818) #19 MRPL51 (ENSOARG00020005788) #20 NCAPD2 (ENSOARG00020005706) #21 ENSOARG00020005655 #22 IFFO1 (ENSOARG00020005394) #23 NOP2 (ENSOARG00020005339) CHD4 (ENSOARG00020004976) #25 LPAR5 (ENSOARG00020004931) #26 ACRBP (ENSOARG00020004837) #27 ING4 (ENSOARG00020004785) #28 ZNF384 (ENSOARG00020004680) #29 PIANP (ENSOARG00020004619) #30 COPS7A (ENSOARG00020004603) #31 MLF2 (ENSOARG00020004578) #32 PTMS (ENSOARG00020004551) LAG3 (ENSOARG00020004514) #35 CD4 (ENSOARG00020004460) #36 GPR162 (ENSOARG00020004446) #37 P3H3 (ENSOARG00020023431) Goat MODERN SPECIES 1 USP50 (ENSCHIG00000010248) USP8 (ENSCHIG00000013071) GABPB1 (ENSCHIG00000010179) HDC (ENSCHIG00000017262) SLC27A2 (ENSCHIG00000016543) ATP8B4 (ENSCHIG00000020664) DTWD1 (ENSCHIG00000011812) ENSCHIG00000020807 FGF7 (ENSCHIG00000015574) GALK2 (ENSCHIG00000021093) COPS2 (ENSCHIG00000021490) SECISBP2L (ENSCHIG00000017527) ENSCHIG00000007799 SHC4 (ENSCHIG00000013813) CEP152 (ENSCHIG00000020655) ENSCHIG00000008960 #22 ENSCHIG00000016675 FBN1 (ENSCHIG00000021045) ENSCHIG00000010553 SLC12A1 (ENSCHIG00000020238) CTXN2 (ENSCHIG00000013170) MYEF2 (ENSCHIG00000022164) SLC24A5 (ENSCHIG00000012687) SEMA6D (ENSCHIG00000012568) ENSCHIG00000011868 BLOC1S6 (ENSCHIG00000021707) SLC30A4 (ENSCHIG00000020960) C15orf48 (ENSCHIG00000009615) SPATA5L1 (ENSCHIG00000020089) GATM (ENSCHIG00000017304) SLC28A2 (ENSCHIG00000021565) Siberian musk deer DUPLICATION Siberian musk deer DUPLICATION Siberian musk deer DUPLICATION Siberian musk deer MODERN SPECIES 1247 KCNA1 (ENSMMSG00000018186) KCNA5 (ENSMMSG00000018200) #7 NTF3 (ENSMMSG00000018211) #9 ANO2 (ENSMMSG00000018256) VWF (ENSMMSG00000018577) #10 CD9 (ENSMMSG00000018829) #12 PLEKHG6 (ENSMMSG00000018872) #13 TNFRSF1A (ENSMMSG00000018960) #14 SCNN1A (ENSMMSG00000019053) #15 LTBR (ENSMMSG00000019158) #16 CD27 (ENSMMSG00000019226) TAPBPL (ENSMMSG00000019259) #18 VAMP1 (ENSMMSG00000019324) #19 ENSMMSG00000019365 #20 NCAPD2 (ENSMMSG00000019414) #21 ENSMMSG00000019587 #22 IFFO1 (ENSMMSG00000019638) #23 NOP2 (ENSMMSG00000019764) CHD4 (ENSMMSG00000020011) #25 LPAR5 (ENSMMSG00000021424) #26 ACRBP (ENSMMSG00000021440) #27 ING4 (ENSMMSG00000021540) #28 ZNF384 (ENSMMSG00000021579) #29 PIANP (ENSMMSG00000021673) #30 COPS7A (ENSMMSG00000021708) #31 MLF2 (ENSMMSG00000021729) #32 PTMS (ENSMMSG00000021756) LAG3 (ENSMMSG00000021775) #35 CD4 (ENSMMSG00000021846) #36 GPR162 (ENSMMSG00000021887) #37 P3H3 (ENSMMSG00000021912) Siberian musk deer MODERN SPECIES 48 GRXCR2 (ENSMMSG00000003194) PRELID2 (ENSMMSG00000003206) ENSMMSG00000003223 ENSMMSG00000003232 KCTD16 (ENSMMSG00000003235) ENSMMSG00000003245 ENSMMSG00000003260 NR3C1 (ENSMMSG00000003275) ARHGAP26 (ENSMMSG00000003321) ENSMMSG00000003377 #22 ENSMMSG00000003396 SPRY4 (ENSMMSG00000003413) NDFIP1 (ENSMMSG00000003431) ENSMMSG00000003449 RNF14 (ENSMMSG00000003466) PCDH12 (ENSMMSG00000003488) DELE1 (ENSMMSG00000003513) ENSMMSG00000003546 PCDH1 (ENSMMSG00000003563) ARAP3 (ENSMMSG00000003600) FCHSD1 (ENSMMSG00000003720) RELL2 (ENSMMSG00000003780) HDAC3 (ENSMMSG00000003806) DIAPH1 (ENSMMSG00000003825) PCDHGA4 (ENSMMSG00000003880) Siberian musk deer MODERN SPECIES 346 MAP3K19 (ENSMMSG00000022186) RAB3GAP1 (ENSMMSG00000021868) ENSMMSG00000021832 ZRANB3 (ENSMMSG00000021800) R3HDM1 (ENSMMSG00000020848) UBXN4 (ENSMMSG00000020749) LCT (ENSMMSG00000020663) MCM6 (ENSMMSG00000020619) DARS1 (ENSMMSG00000020589) CXCR4 (ENSMMSG00000020562) THSD7B (ENSMMSG00000020400) ENSMMSG00000020372 HNMT (ENSMMSG00000020352) SPOPL (ENSMMSG00000020288) NXPH2 (ENSMMSG00000020261) ENSMMSG00000020252 #22 ENSMMSG00000020234 ENSMMSG00000020212 ENSMMSG00000020194 LRP1B (ENSMMSG00000019882) ENSMMSG00000019836 KYNU (ENSMMSG00000019754) ARHGAP15 (ENSMMSG00000019673) GTDC1 (ENSMMSG00000019550) ENSMMSG00000019525 ZEB2 (ENSMMSG00000019357) ENSMMSG00000019314 ENSMMSG00000019276 ENSMMSG00000019266 ACVR2A (ENSMMSG00000019227) ORC4 (ENSMMSG00000019167) Siberian musk deer MODERN SPECIES 279 ENSMMSG00000005872 #22 ENSMMSG00000005849 ENSMMSG00000005800 CADM2 (ENSMMSG00000005641) VGLL3 (ENSMMSG00000005580) CHMP2B (ENSMMSG00000005505) POU1F1 (ENSMMSG00000005357) CGGBP1 (ENSMMSG00000005329) ZNF654 (ENSMMSG00000005277) C3orf38 (ENSMMSG00000005242) CSNKA2IP (ENSMMSG00000005187) ENSMMSG00000005161 EPHA3 (ENSMMSG00000005101) PROS1 (ENSMMSG00000004821) STX19 (ENSMMSG00000004737) ARL13B (ENSMMSG00000004620) Yarkand deer DUPLICATION Yarkand deer MODERN SPECIES 536 ENSCHYG00000008814 ENSCHYG00000008797 #22 Yarkand deer DUPLICATION Yarkand deer DUPLICATION Yarkand deer DUPLICATION Yarkand deer MODERN SPECIES 25 ENSCHYG00000020988 ENSCHYG00000021054 ENSCHYG00000021098 ENSCHYG00000021124 ENSCHYG00000021137 GPM6A (ENSCHYG00000021180) WDR17 (ENSCHYG00000021271) ENSCHYG00000021801 ASB5 (ENSCHYG00000021912) SPCS3 (ENSCHYG00000022146) ENSCHYG00000022200 VEGFC (ENSCHYG00000022266) NEIL3 (ENSCHYG00000022358) AGA (ENSCHYG00000022427) ENSCHYG00000022545 ENSCHYG00000022559 #22 TENM3 (ENSCHYG00000022619) DCTD (ENSCHYG00000022883) WWC2 (ENSCHYG00000022971) CDKN2AIP (ENSCHYG00000023261) ING2 (ENSCHYG00000023296) ENSCHYG00000023315 TRAPPC11 (ENSCHYG00000023408) STOX2 (ENSCHYG00000023957) ENPP6 (ENSCHYG00000024145) IRF2 (ENSCHYG00000024184) CASP3 (ENSCHYG00000008657) PRIMPOL (ENSCHYG00000008693) CENPU (ENSCHYG00000008853) ACSL1 (ENSCHYG00000009253) HELT (ENSCHYG00000009820) Yarkand deer MODERN SPECIES 14 NTF3 (ENSCHYG00000026438) #9 ANO2 (ENSCHYG00000026287) VWF (ENSCHYG00000026172) #10 CD9 (ENSCHYG00000026113) #12 PLEKHG6 (ENSCHYG00000026050) #13 TNFRSF1A (ENSCHYG00000025998) #14 SCNN1A (ENSCHYG00000025885) #15 LTBR (ENSCHYG00000025819) #16 CD27 (ENSCHYG00000025790) ENSCHYG00000025783 TAPBPL (ENSCHYG00000025766) #18 ENSCHYG00000025715 #19 ENSCHYG00000025696 MRPL51 (ENSCHYG00000025676) #20 NCAPD2 (ENSCHYG00000025563) #21 ENSCHYG00000025387 #22 IFFO1 (ENSCHYG00000025348) #23 NOP2 (ENSCHYG00000025184) CHD4 (ENSCHYG00000025019) #25 LPAR5 (ENSCHYG00000024995) #26 ACRBP (ENSCHYG00000024938) #27 ING4 (ENSCHYG00000024855) #28 ZNF384 (ENSCHYG00000024746) #29 PIANP (ENSCHYG00000024684) #30 COPS7A (ENSCHYG00000024633) #31 MLF2 (ENSCHYG00000024596) #32 ENSCHYG00000024584 LAG3 (ENSCHYG00000024522) #35 CD4 (ENSCHYG00000024477) #36 GPR162 (ENSCHYG00000024446) #37 P3H3 (ENSCHYG00000024241) Yarkand deer MODERN SPECIES 28 ZNF827 (ENSCHYG00000001410) C4orf51 (ENSCHYG00000001340) MMAA (ENSCHYG00000001302) SMAD1 (ENSCHYG00000001287) OTUD4 (ENSCHYG00000001224) ABCE1 (ENSCHYG00000001201) ANAPC10 (ENSCHYG00000001160) HHIP (ENSCHYG00000001103) FREM3 (ENSCHYG00000001026) SMARCA5 (ENSCHYG00000000935) GAB1 (ENSCHYG00000000879) ENSCHYG00000000861 USP38 (ENSCHYG00000000822) ENSCHYG00000000800 INPP4B (ENSCHYG00000000675) ENSCHYG00000000643 #22 IL15 (ENSCHYG00000000606) ZNF330 (ENSCHYG00000000564) RNF150 (ENSCHYG00000000469) TBC1D9 (ENSCHYG00000000347) UCP1 (ENSCHYG00000000315) ENSCHYG00000000307 ELMOD2 (ENSCHYG00000000281) MGAT4D (ENSCHYG00000000222) CLGN (ENSCHYG00000000178) ENSCHYG00000000146 MAML3 (ENSCHYG00000000075) MGST2 (ENSCHYG00000000058) ENSCHYG00000004005 SETD7 (ENSCHYG00000003984) RAB33B (ENSCHYG00000003973) Yarkand deer MODERN SPECIES 30 ZSCAN12 (ENSCHYG00000005825) ZSCAN31 (ENSCHYG00000005844) PGBD1 (ENSCHYG00000005868) ZSCAN26 (ENSCHYG00000005890) ENSCHYG00000005909 ENSCHYG00000005925 ZSCAN9 (ENSCHYG00000005965) ENSCHYG00000006004 ENSCHYG00000006026 ZKSCAN8 (ENSCHYG00000006048) ZSCAN16 (ENSCHYG00000006096) ENSCHYG00000006130 ZNF165 (ENSCHYG00000006149) ENSCHYG00000006167 ENSCHYG00000006189 ENSCHYG00000006200 #22 ENSCHYG00000006225 ENSCHYG00000006245 OR2B6 (ENSCHYG00000006255) ENSCHYG00000006269 ENSCHYG00000006279 ENSCHYG00000006288 ENSCHYG00000006303 H3C12 (ENSCHYG00000006313) ENSCHYG00000006323 ENSCHYG00000006334 ENSCHYG00000006342 H1-5 (ENSCHYG00000006349) ENSCHYG00000006356 ENSCHYG00000006366 ENSCHYG00000006376 Suina ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000158576 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.q #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Chacoan peccary MODERN SPECIES 901 KCNA1 (ENSCWAG00000017957) KCNA5 (ENSCWAG00000017966) #7 NTF3 (ENSCWAG00000018000) #9 ANO2 (ENSCWAG00000018045) VWF (ENSCWAG00000018464) #10 CD9 (ENSCWAG00000018715) #12 PLEKHG6 (ENSCWAG00000018796) #13 TNFRSF1A (ENSCWAG00000019019) #14 SCNN1A (ENSCWAG00000019063) #15 LTBR (ENSCWAG00000019319) #16 CD27 (ENSCWAG00000019371) TAPBPL (ENSCWAG00000019420) #18 VAMP1 (ENSCWAG00000019488) #19 MRPL51 (ENSCWAG00000019574) #20 NCAPD2 (ENSCWAG00000019604) #21 GAPDH (ENSCWAG00000019631) #22 IFFO1 (ENSCWAG00000019666) #23 NOP2 (ENSCWAG00000019949) CHD4 (ENSCWAG00000020000) #25 LPAR5 (ENSCWAG00000020180) #26 ACRBP (ENSCWAG00000020184) #27 ING4 (ENSCWAG00000020218) #28 ZNF384 (ENSCWAG00000003930) #29 PIANP (ENSCWAG00000004033) #30 COPS7A (ENSCWAG00000004095) #31 MLF2 (ENSCWAG00000004129) #32 PTMS (ENSCWAG00000004167) LAG3 (ENSCWAG00000004203) #35 ENSCWAG00000004259 #36 ENSCWAG00000004287 #36 GPR162 (ENSCWAG00000004328) #37 Pig MODERN SPECIES 13 KCNA6 (ENSSSCG00000060060) KCNA1 (ENSSSCG00000000716) KCNA5 (ENSSSCG00000056277) #7 NTF3 (ENSSSCG00000033544) #9 VWF (ENSSSCG00000000712) #10 CD9 (ENSSSCG00000022230) #12 PLEKHG6 (ENSSSCG00000000709) #13 TNFRSF1A (ENSSSCG00000000708) #14 SCNN1A (ENSSSCG00000000707) #15 LTBR (ENSSSCG00000000706) #16 CD27 (ENSSSCG00000063084) TAPBPL (ENSSSCG00000000704) #18 ENSSSCG00000000703 #19 MRPL51 (ENSSSCG00000039662) #20 NCAPD2 (ENSSSCG00000000693) #21 GAPDH (ENSSSCG00000000694) #22 IFFO1 (ENSSSCG00000000695) #23 NOP2 (ENSSSCG00000000696) CHD4 (ENSSSCG00000000697) #25 LPAR5 (ENSSSCG00000000699) #26 ACRBP (ENSSSCG00000000700) #27 ING4 (ENSSSCG00000044078) #28 ZNF384 (ENSSSCG00000000702) #29 PIANP (ENSSSCG00000000692) #30 ENSSSCG00000058867 COPS7A (ENSSSCG00000000691) #31 MLF2 (ENSSSCG00000000690) #32 ENSSSCG00000022176 LAG3 (ENSSSCG00000000688) #35 CD4 (ENSSSCG00000000687) #36 GPR162 (ENSSSCG00000000680) #37 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.q #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.q #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Equus DUPLICATION Equus DUPLICATION Equus ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00890000139491 ENSGT00940000156785 ENSGT00530000063599.B ENSGT00390000002174.b ENSGT00390000018829.a.a ENSGT00390000006330.a.a ENSGT01020000230389.b.a.a.b ENSGT00390000010463.a.b ENSGT01050000244905.E ENSGT01050000244905.D ENSGT00940000155752 ENSGT00940000155812 ENSGT00950000185696 ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000156056.A ENSGT00940000153298.n.q.g.a #22 ENSGT00580000082664.a.a ENSGT00940000160335 ENSGT00940000155282 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155466 ENSGT00940000167666 ENSGT00390000005285 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016484 ENSGT00950000182908.D ENSGT00390000005254.i.a.b ENSGT00390000018393 ENSGT00940000155367 ENSGT00390000005727.a.b.b Horse MODERN SPECIES 9 INPP1 (ENSECAG00000024698) MFSD6 (ENSECAG00000004707) NEMP2 (ENSECAG00000008498) ENSECAG00000036006 NAB1 (ENSECAG00000009106) ENSECAG00000040779 GLS (ENSECAG00000010549) STAT1 (ENSECAG00000009039) STAT4 (ENSECAG00000023170) MYO1B (ENSECAG00000017765) NABP1 (ENSECAG00000016773) ENSECAG00000049122 CAVIN2 (ENSECAG00000055807) TMEFF2 (ENSECAG00000020863) ENSECAG00000049056 ENSECAG00000003944 #22 ENSECAG00000053879 ENSECAG00000059223 SLC39A10 (ENSECAG00000006518) DNAH7 (ENSECAG00000009699) STK17B (ENSECAG00000000520) HECW2 (ENSECAG00000000544) ENSECAG00000047100 CCDC150 (ENSECAG00000010941) GTF3C3 (ENSECAG00000014763) C2orf66 (ENSECAG00000058124) PGAP1 (ENSECAG00000019980) ANKRD44 (ENSECAG00000008835) ENSECAG00000034847 SF3B1 (ENSECAG00000021657) COQ10B (ENSECAG00000006436) Donkey MODERN SPECIES 24 HIBCH (ENSEASG00005021030) INPP1 (ENSEASG00005021019) MFSD6 (ENSEASG00005021013) NEMP2 (ENSEASG00005021006) ENSEASG00005020998 NAB1 (ENSEASG00005020993) ENSEASG00005032199 GLS (ENSEASG00005020981) STAT1 (ENSEASG00005020970) STAT4 (ENSEASG00005020914) MYO1B (ENSEASG00005020872) NABP1 (ENSEASG00005020861) ENSEASG00005023585 CAVIN2 (ENSEASG00005027165) ENSEASG00005020854 ENSEASG00005029879 #22 ENSEASG00005025902 SLC39A10 (ENSEASG00005020825) DNAH7 (ENSEASG00005020795) STK17B (ENSEASG00005020775) HECW2 (ENSEASG00005020398) CCDC150 (ENSEASG00005020257) GTF3C3 (ENSEASG00005020250) C2orf66 (ENSEASG00005029887) PGAP1 (ENSEASG00005020202) ANKRD44 (ENSEASG00005020169) ENSEASG00005020167 SF3B1 (ENSEASG00005020159) COQ10B (ENSEASG00005032559) ENSEASG00005020152 HSPE1 (ENSEASG00005034821) Equus ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.q.g.b #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Donkey DUPLICATION Donkey DUPLICATION Donkey MODERN SPECIES 14 KCNA5 (ENSEASG00005038261) #7 NTF3 (ENSEASG00005016993) #9 ANO2 (ENSEASG00005016961) VWF (ENSEASG00005016355) #10 CD9 (ENSEASG00005016182) #12 PLEKHG6 (ENSEASG00005016179) #13 TNFRSF1A (ENSEASG00005016176) #14 SCNN1A (ENSEASG00005016173) #15 LTBR (ENSEASG00005016171) #16 VAMP1 (ENSEASG00005037737) #19 ENSEASG00005036568 TAPBPL (ENSEASG00005016162) #18 ENSEASG00005035678 MRPL51 (ENSEASG00005035991) #20 NCAPD2 (ENSEASG00005016158) #21 ENSEASG00005016156 #22 IFFO1 (ENSEASG00005016154) #23 NOP2 (ENSEASG00005016153) CHD4 (ENSEASG00005016150) #25 LPAR5 (ENSEASG00005033413) #26 ACRBP (ENSEASG00005025354) #27 ING4 (ENSEASG00005016144) #28 ZNF384 (ENSEASG00005016142) #29 PIANP (ENSEASG00005016141) #30 COPS7A (ENSEASG00005016138) #31 MLF2 (ENSEASG00005016135) #32 ENSEASG00005016131 LAG3 (ENSEASG00005016128) #35 CD4 (ENSEASG00005016122) #36 GPR162 (ENSEASG00005016119) #37 P3H3 (ENSEASG00005016118) Donkey MODERN SPECIES 3 LYN (ENSEASG00005016369) TGS1 (ENSEASG00005016371) TMEM68 (ENSEASG00005016372) XKR4 (ENSEASG00005035480) RP1 (ENSEASG00005016381) SOX17 (ENSEASG00005028498) ENSEASG00005025388 ENSEASG00005035435 ENSEASG00005027512 ENSEASG00005035589 ENSEASG00005029551 LYPLA1 (ENSEASG00005020322) TCEA1 (ENSEASG00005020313) RGS20 (ENSEASG00005020310) ATP6V1H (ENSEASG00005020298) ENSEASG00005026860 #22 ENSEASG00005009805 OPRK1 (ENSEASG00005026342) NPBWR1 (ENSEASG00005020280) RB1CC1 (ENSEASG00005020230) ALKAL1 (ENSEASG00005020213) ST18 (ENSEASG00005020200) PCMTD1 (ENSEASG00005020195) SNTG1 (ENSEASG00005020185) PPDPFL (ENSEASG00005024997) ENSEASG00005009186 CLXN (ENSEASG00005009190) UBE2V2 (ENSEASG00005024827) MCM4 (ENSEASG00005009194) ENSEASG00005035234 ENSEASG00005037902 Donkey MODERN SPECIES 36 ENSEASG00005018021 ENSEASG00005025594 ENSEASG00005038050 ENSEASG00005017724 ENSEASG00005018527 ENSEASG00005031175 ENSEASG00005022377 AMER1 (ENSEASG00005022417) ASB12 (ENSEASG00005022418) ZC4H2 (ENSEASG00005002136) ZC3H12B (ENSEASG00005006995) LAS1L (ENSEASG00005006987) MSN (ENSEASG00005006981) VSIG4 (ENSEASG00005012887) HEPH (ENSEASG00005020500) ENSEASG00005020293 #22 ENSEASG00005033352 AR (ENSEASG00005005676) ENSEASG00005025864 ENSEASG00005033055 ENSEASG00005033037 YIPF6 (ENSEASG00005034308) STARD8 (ENSEASG00005007082) EFNB1 (ENSEASG00005037551) PJA1 (ENSEASG00005036564) NALF2 (ENSEASG00005012674) EDA (ENSEASG00005029641) AWAT2 (ENSEASG00005019750) OTUD6A (ENSEASG00005018639) ENSEASG00005008955 DGAT2L6 (ENSEASG00005008959) Horse MODERN SPECIES 27 KCNA5 (ENSECAG00000003033) #7 ENSECAG00000028778 NTF3 (ENSECAG00000024611) #9 ANO2 (ENSECAG00000024617) VWF (ENSECAG00000010778) #10 CD9 (ENSECAG00000003002) #12 PLEKHG6 (ENSECAG00000012373) #13 TNFRSF1A (ENSECAG00000016330) #14 SCNN1A (ENSECAG00000001443) #15 LTBR (ENSECAG00000000458) #16 VAMP1 (ENSECAG00000014602) #19 CD27 (ENSECAG00000011126) TAPBPL (ENSECAG00000012920) #18 ENSECAG00000040327 NCAPD2 (ENSECAG00000017796) #21 GAPDH (ENSECAG00000022051) #22 IFFO1 (ENSECAG00000010254) #23 NOP2 (ENSECAG00000012639) CHD4 (ENSECAG00000022005) #25 ACRBP (ENSECAG00000023343) #27 LPAR5 (ENSECAG00000023339) #26 ING4 (ENSECAG00000024784) #28 ZNF384 (ENSECAG00000009490) #29 PIANP (ENSECAG00000015893) #30 COPS7A (ENSECAG00000015911) #31 MLF2 (ENSECAG00000022587) #32 ENSECAG00000042372 LAG3 (ENSECAG00000002971) #35 CD4 (ENSECAG00000009049) #36 ENSECAG00000054174 P3H3 (ENSECAG00000021815) Equus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.q.h #22 Donkey MODERN SPECIES 1 PRLR (ENSEASG00005014937) AGXT2 (ENSEASG00005014944) DNAJC21 (ENSEASG00005014955) RAD1 (ENSEASG00005014974) BRIX1 (ENSEASG00005014968) TTC23L (ENSEASG00005014976) RAI14 (ENSEASG00005014978) ENSEASG00005029203 C1QTNF3 (ENSEASG00005033612) AMACR (ENSEASG00005035206) SLC45A2 (ENSEASG00005014986) RXFP3 (ENSEASG00005014988) ADAMTS12 (ENSEASG00005015016) TARS1 (ENSEASG00005015075) NPR3 (ENSEASG00005015081) ENSEASG00005034914 #22 SUB1 (ENSEASG00005032129) ZFR (ENSEASG00005007104) MTMR12 (ENSEASG00005007107) GOLPH3 (ENSEASG00005023797) ENSEASG00005007126 ENSEASG00005037387 ENSEASG00005024236 ENSEASG00005025268 C5orf22 (ENSEASG00005007146) DROSHA (ENSEASG00005007149) ENSEASG00005035698 CDH6 (ENSEASG00005007155) ENSEASG00005023693 CDH9 (ENSEASG00005007157) CDH10 (ENSEASG00005007161) Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.q #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000005848 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.q #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Microbat MODERN SPECIES 947 NR2C1 (ENSMLUG00000015807) NDUFA12 (ENSMLUG00000027131) KCNA5 (ENSMLUG00000015804) #7 NTF3 (ENSMLUG00000012482) #9 ANO2 (ENSMLUG00000015973) VWF (ENSMLUG00000015993) #10 CD9 (ENSMLUG00000006901) #12 PLEKHG6 (ENSMLUG00000014270) #13 TNFRSF1A (ENSMLUG00000014278) #14 SCNN1A (ENSMLUG00000014284) #15 LTBR (ENSMLUG00000014294) #16 CD27 (ENSMLUG00000014298) TAPBPL (ENSMLUG00000014300) #18 VAMP1 (ENSMLUG00000014307) #19 NCAPD2 (ENSMLUG00000014309) #21 ENSMLUG00000014320 #22 IFFO1 (ENSMLUG00000014327) #23 NOP2 (ENSMLUG00000014333) CHD4 (ENSMLUG00000014343) #25 LPAR5 (ENSMLUG00000013768) #26 ACRBP (ENSMLUG00000025466) #27 ING4 (ENSMLUG00000029523) #28 ZNF384 (ENSMLUG00000013771) #29 PIANP (ENSMLUG00000004845) #30 COPS7A (ENSMLUG00000013776) #31 MLF2 (ENSMLUG00000013779) #32 PTMS (ENSMLUG00000013783) LAG3 (ENSMLUG00000013787) #35 CD4 (ENSMLUG00000024020) #36 GPR162 (ENSMLUG00000022349) #37 P3H3 (ENSMLUG00000006754) Carnivora ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.q #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Felidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.q #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Cat MODERN SPECIES 238 KCNA5 (ENSFCAG00000009372) #7 NTF3 (ENSFCAG00000006859) #9 ANO2 (ENSFCAG00000006860) ENSFCAG00000034293 VWF (ENSFCAG00000006861) #10 CD9 (ENSFCAG00000034944) #12 PLEKHG6 (ENSFCAG00000006865) #13 TNFRSF1A (ENSFCAG00000006868) #14 SCNN1A (ENSFCAG00000006869) #15 LTBR (ENSFCAG00000008592) #16 CD27 (ENSFCAG00000006870) TAPBPL (ENSFCAG00000006871) #18 VAMP1 (ENSFCAG00000036228) #19 MRPL51 (ENSFCAG00000043270) #20 NCAPD2 (ENSFCAG00000006873) #21 GAPDH (ENSFCAG00000006874) #22 IFFO1 (ENSFCAG00000029815) #23 NOP2 (ENSFCAG00000006876) CHD4 (ENSFCAG00000006877) #25 LPAR5 (ENSFCAG00000006878) #26 ACRBP (ENSFCAG00000006879) #27 ING4 (ENSFCAG00000006880) #28 ZNF384 (ENSFCAG00000006882) #29 PIANP (ENSFCAG00000024891) #30 COPS7A (ENSFCAG00000043178) #31 ENSFCAG00000032640 PTMS (ENSFCAG00000043997) LAG3 (ENSFCAG00000006886) #35 CD4 (ENSFCAG00000004269) #36 GPR162 (ENSFCAG00000024524) #37 P3H3 (ENSFCAG00000004270) Panthera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.q #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Tiger MODERN SPECIES 306 NTF3 (ENSPTIG00000013497) #9 ANO2 (ENSPTIG00000021152) VWF (ENSPTIG00000017098) #10 CD9 (ENSPTIG00000015011) #12 PLEKHG6 (ENSPTIG00000010482) #13 ENSPTIG00000009056 #14 SCNN1A (ENSPTIG00000005994) #15 LTBR (ENSPTIG00000005394) #16 ENSPTIG00000006690 CD27 (ENSPTIG00000004351) TAPBPL (ENSPTIG00000019354) #18 ENSPTIG00000018791 VAMP1 (ENSPTIG00000018179) #19 MRPL51 (ENSPTIG00000016877) #20 NCAPD2 (ENSPTIG00000015885) #21 GAPDH (ENSPTIG00000010777) #22 ENSPTIG00000009245 #23 NOP2 (ENSPTIG00000020543) CHD4 (ENSPTIG00000010979) #25 ACRBP (ENSPTIG00000008221) #27 ING4 (ENSPTIG00000020118) #28 ZNF384 (ENSPTIG00000014865) #29 PIANP (ENSPTIG00000013952) #30 COPS7A (ENSPTIG00000011947) #31 MLF2 (ENSPTIG00000010093) #32 PTMS (ENSPTIG00000009333) ENSPTIG00000008812 #34 LAG3 (ENSPTIG00000008140) #35 CD4 (ENSPTIG00000006621) #36 ENSPTIG00000005722 #37 P3H3 (ENSPTIG00000003404) Panthera_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.q #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 lion MODERN SPECIES 7 KCNA1 (ENSPLOG00000014395) KCNA5 (ENSPLOG00000014421) #7 NTF3 (ENSPLOG00000014447) #9 ANO2 (ENSPLOG00000014508) VWF (ENSPLOG00000015265) #10 CD9 (ENSPLOG00000015832) #12 PLEKHG6 (ENSPLOG00000000617) #13 TNFRSF1A (ENSPLOG00000000829) #14 SCNN1A (ENSPLOG00000000874) #15 LTBR (ENSPLOG00000000954) #16 CD27 (ENSPLOG00000001037) TAPBPL (ENSPLOG00000001078) #18 VAMP1 (ENSPLOG00000001138) #19 MRPL51 (ENSPLOG00000001173) #20 NCAPD2 (ENSPLOG00000001201) #21 GAPDH (ENSPLOG00000001339) #22 IFFO1 (ENSPLOG00000001507) #23 NOP2 (ENSPLOG00000001635) CHD4 (ENSPLOG00000001912) #25 LPAR5 (ENSPLOG00000002380) #26 ACRBP (ENSPLOG00000002396) #27 ING4 (ENSPLOG00000002451) #28 ZNF384 (ENSPLOG00000002498) #29 PIANP (ENSPLOG00000002539) #30 COPS7A (ENSPLOG00000002565) #31 MLF2 (ENSPLOG00000002583) #32 PTMS (ENSPLOG00000002603) LAG3 (ENSPLOG00000002630) #35 CD4 (ENSPLOG00000002666) #36 GPR162 (ENSPLOG00000002701) #37 P3H3 (ENSPLOG00000002749) leopard DUPLICATION leopard MODERN SPECIES 45 KCNA5 (ENSPPRG00000017539) #7 NTF3 (ENSPPRG00000019625) #9 ANO2 (ENSPPRG00000001953) VWF (ENSPPRG00000004677) #10 CD9 (ENSPPRG00000005804) #12 PLEKHG6 (ENSPPRG00000008925) #13 TNFRSF1A (ENSPPRG00000009962) #14 SCNN1A (ENSPPRG00000012858) #15 LTBR (ENSPPRG00000016051) #16 CD27 (ENSPPRG00000020532) ENSPPRG00000022113 TAPBPL (ENSPPRG00000022848) #18 VAMP1 (ENSPPRG00000000234) #19 MRPL51 (ENSPPRG00000000742) #20 NCAPD2 (ENSPPRG00000001126) #21 ENSPPRG00000005020 #22 IFFO1 (ENSPPRG00000008354) #23 NOP2 (ENSPPRG00000012300) CHD4 (ENSPPRG00000001388) #25 ACRBP (ENSPPRG00000002388) #27 ING4 (ENSPPRG00000004136) #28 ZNF384 (ENSPPRG00000006494) #29 PIANP (ENSPPRG00000007131) #30 COPS7A (ENSPPRG00000008884) #31 ENSPPRG00000009219 PTMS (ENSPPRG00000009564) LAG3 (ENSPPRG00000010078) #35 CD4 (ENSPPRG00000011287) #36 ENSPPRG00000012222 #37 P3H3 (ENSPPRG00000012543) GNB3 (ENSPPRG00000013637) leopard MODERN SPECIES 34 ENSPPRG00000024812 ENSPPRG00000024829 DEPTOR (ENSPPRG00000024837) DSCC1 (ENSPPRG00000024843) TAF2 (ENSPPRG00000024848) ENPP2 (ENSPPRG00000024856) CCN3 (ENSPPRG00000024868) MAL2 (ENSPPRG00000024870) COLEC10 (ENSPPRG00000024879) TNFRSF11B (ENSPPRG00000024881) SAMD12 (ENSPPRG00000024883) EXT1 (ENSPPRG00000024885) MED30 (ENSPPRG00000024892) SLC30A8 (ENSPPRG00000024895) RAD21 (ENSPPRG00000024897) ENSPPRG00000024901 #22 UTP23 (ENSPPRG00000024902) EIF3H (ENSPPRG00000024911) TRPS1 (ENSPPRG00000024926) Caniformia DUPLICATION Caniformia DUPLICATION Caniformia ANCESTRAL SPECIES 69 ENSGT00940000153298.n.q.k.a #22 ENSGT00580000082664.a.a ENSGT00940000153112.D.h Canidae DUPLICATION Canidae ANCESTRAL SPECIES 105 ENSGT00940000153298.n.q.k.a.a #22 ENSGT00580000082664.a.a ENSGT00940000153112.D.h.a.a Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 80 ENSGT00940000153298.n.q.k.a.a #22 ENSGT00580000082664.a.a ENSGT00940000153112.D.h.a.a.a.a Dingo DUPLICATION Dingo DUPLICATION Dingo MODERN SPECIES 288 ENSCAFG00020006444 ELMO1 (ENSCAFG00020006437) AOAH (ENSCAFG00020006420) ANLN (ENSCAFG00020006404) MATCAP2 (ENSCAFG00020006400) EEPD1 (ENSCAFG00020006388) SEPTIN7 (ENSCAFG00020006386) HERPUD2 (ENSCAFG00020006382) TBX20 (ENSCAFG00020006360) DPY19L2 (ENSCAFG00020006325) DPY19L1 (ENSCAFG00020006169) ENSCAFG00020006137 NPSR1 (ENSCAFG00020006115) BMPER (ENSCAFG00020006089) BBS9 (ENSCAFG00020005454) ENSCAFG00020005434 #22 ENSCAFG00020005429 NT5C3A (ENSCAFG00020005370) FKBP9 (ENSCAFG00020005057) ENSCAFG00020005048 ENSCAFG00020005039 KBTBD2 (ENSCAFG00020005032) AVL9 (ENSCAFG00020004955) LSM5 (ENSCAFG00020004946) ENSCAFG00020004937 PDE1C (ENSCAFG00020004721) PPP1R17 (ENSCAFG00020004652) ITPRID1 (ENSCAFG00020004648) NEUROD6 (ENSCAFG00020004640) ADCYAP1R1 (ENSCAFG00020004417) GHRHR (ENSCAFG00020004373) Dingo MODERN SPECIES 295 SMIM10L1 (ENSCAFG00020006472) ENSCAFG00020006464 ENSCAFG00020006458 TAS2R10 (ENSCAFG00020006443) TAS2R9 (ENSCAFG00020006441) TAS2R7 (ENSCAFG00020006436) ENSCAFG00020006432 YBX3 (ENSCAFG00020006412) STYK1 (ENSCAFG00020006396) ENSCAFG00020006394 ENSCAFG00020006392 ENSCAFG00020006375 ENSCAFG00020006368 ENSCAFG00020006359 ENSCAFG00020006348 ENSCAFG00020006344 #22 ENSCAFG00020006328 ENSCAFG00020006261 KLRK1 (ENSCAFG00020006243) GABARAPL1 (ENSCAFG00020006236) TMEM52B (ENSCAFG00020006230) OLR1 (ENSCAFG00020006225) CLEC7A (ENSCAFG00020006207) CLEC1A (ENSCAFG00020006202) CLEC9A (ENSCAFG00020006193) CLEC1B (ENSCAFG00020006181) CLEC12B (ENSCAFG00020006172) CLEC12A (ENSCAFG00020006168) CLEC2A (ENSCAFG00020006157) CLEC2B (ENSCAFG00020006154) KLRF1 (ENSCAFG00020006152) Dingo MODERN SPECIES 231 SOX6 (ENSCAFG00020017327) INSC (ENSCAFG00020017307) ENSCAFG00020017290 ENSCAFG00020017285 ENSCAFG00020017277 CALCB (ENSCAFG00020017275) ENSCAFG00020017268 ENSCAFG00020017266 CYP2R1 (ENSCAFG00020017254) PDE3B (ENSCAFG00020017213) ENSCAFG00020017202 COPB1 (ENSCAFG00020017195) RRAS2 (ENSCAFG00020017190) SPON1 (ENSCAFG00020017055) FAR1 (ENSCAFG00020016575) ENSCAFG00020016558 #22 PTH (ENSCAFG00020016557) BTBD10 (ENSCAFG00020016555) BMAL1 (ENSCAFG00020016447) RASSF10 (ENSCAFG00020016424) TEAD1 (ENSCAFG00020016417) PARVA (ENSCAFG00020016402) MICAL2 (ENSCAFG00020016361) DKK3 (ENSCAFG00020016344) USP47 (ENSCAFG00020016333) ENSCAFG00020016327 GALNT18 (ENSCAFG00020016314) ENSCAFG00020016299 ZBED5 (ENSCAFG00020016298) EIF4G2 (ENSCAFG00020015650) CTR9 (ENSCAFG00020014706) Dog MODERN SPECIES 144 APOOL (ENSCAFG00845023656) ENSCAFG00845023778 ENSCAFG00845023827 ZNF711 (ENSCAFG00845023911) POF1B (ENSCAFG00845024223) CHM (ENSCAFG00845024883) DACH2 (ENSCAFG00845025244) ENSCAFG00845025538 ENSCAFG00845025670 KLHL4 (ENSCAFG00845025779) ENSCAFG00845025970 PABPC5 (ENSCAFG00845026000) ENSCAFG00845026042 FAM133A (ENSCAFG00845026207) ENSCAFG00845026229 ENSCAFG00845026288 #22 ENSCAFG00845026333 ENSCAFG00845026405 ENSCAFG00845026782 ENSCAFG00845026879 ENSCAFG00845026948 ENSCAFG00845026974 ENSCAFG00845015511 ENSCAFG00845015550 ENSCAFG00845015610 ENSCAFG00845015773 PCDH19 (ENSCAFG00845015810) ENSCAFG00845015858 TNMD (ENSCAFG00845015896) TSPAN6 (ENSCAFG00845015955) SRPX2 (ENSCAFG00845016052) Red fox DUPLICATION Red fox MODERN SPECIES 5 MYL3 (ENSVVUG00000005008) PTH1R (ENSVVUG00000004619) CCDC12 (ENSVVUG00000004582) NBEAL2 (ENSVVUG00000003652) ENSVVUG00000003556 SETD2 (ENSVVUG00000003511) KIF9 (ENSVVUG00000003479) KLHL18 (ENSVVUG00000003468) PTPN23 (ENSVVUG00000002068) SCAP (ENSVVUG00000000038) ELP6 (ENSVVUG00000029814) CSPG5 (ENSVVUG00000029808) SMARCC1 (ENSVVUG00000029795) DHX30 (ENSVVUG00000029792) MAP4 (ENSVVUG00000029788) ENSVVUG00000029783 #22 CDC25A (ENSVVUG00000029781) CAMP (ENSVVUG00000029779) NME6 (ENSVVUG00000029778) ENSVVUG00000029776 CCDC51 (ENSVVUG00000029756) ATRIP (ENSVVUG00000029747) TREX1 (ENSVVUG00000029738) SHISA5 (ENSVVUG00000029737) PFKFB4 (ENSVVUG00000029734) UCN2 (ENSVVUG00000029730) UQCRC1 (ENSVVUG00000029619) TMEM89 (ENSVVUG00000029617) SLC26A6 (ENSVVUG00000029593) CELSR3 (ENSVVUG00000029449) NCKIPSD (ENSVVUG00000029416) Red fox MODERN SPECIES 70 ST5 (ENSVVUG00000027853) C11orf16 (ENSVVUG00000027851) ASCL3 (ENSVVUG00000027850) AKIP1 (ENSVVUG00000027849) TMEM9B (ENSVVUG00000027846) NRIP3 (ENSVVUG00000027845) SCUBE2 (ENSVVUG00000027840) DENND5A (ENSVVUG00000027839) TMEM41B (ENSVVUG00000027837) ENSVVUG00000027836 IPO7 (ENSVVUG00000025822) ZNF143 (ENSVVUG00000025760) WEE1 (ENSVVUG00000025755) SWAP70 (ENSVVUG00000025754) ENSVVUG00000025753 ENSVVUG00000025751 #22 ENSVVUG00000025749 SBF2 (ENSVVUG00000025733) ENSVVUG00000025731 AMPD3 (ENSVVUG00000025719) RNF141 (ENSVVUG00000025703) LYVE1 (ENSVVUG00000025700) IRAG1 (ENSVVUG00000025694) CTR9 (ENSVVUG00000025690) EIF4G2 (ENSVVUG00000025335) ZBED5 (ENSVVUG00000025297) ENSVVUG00000025296 GALNT18 (ENSVVUG00000025293) ENSVVUG00000025285 USP47 (ENSVVUG00000025275) DKK3 (ENSVVUG00000025251) Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.q.k.a.b #22 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.q.k.a.b #22 Dingo MODERN SPECIES 138 QDPR (ENSCAFG00020012248) CLRN2 (ENSCAFG00020012251) LAP3 (ENSCAFG00020012262) MED28 (ENSCAFG00020012266) FAM184B (ENSCAFG00020012270) ENSCAFG00020012281 MAEA (ENSCAFG00020012285) UVSSA (ENSCAFG00020012302) NKX1-1 (ENSCAFG00020012312) FAM53A (ENSCAFG00020012319) SLBP (ENSCAFG00020012334) TMEM129 (ENSCAFG00020012337) TACC3 (ENSCAFG00020012340) FGFR3 (ENSCAFG00020012349) LETM1 (ENSCAFG00020012352) ENSCAFG00020012359 #22 NSD2 (ENSCAFG00020012364) NELFA (ENSCAFG00020012377) C4orf48 (ENSCAFG00020012395) NAT8L (ENSCAFG00020012398) POLN (ENSCAFG00020012402) HAUS3 (ENSCAFG00020012427) MXD4 (ENSCAFG00020012430) ZFYVE28 (ENSCAFG00020012447) CFAP99 (ENSCAFG00020012449) RNF4 (ENSCAFG00020012490) FAM193A (ENSCAFG00020012546) TNIP2 (ENSCAFG00020012703) SH3BP2 (ENSCAFG00020012726) ADD1 (ENSCAFG00020012740) MFSD10 (ENSCAFG00020012765) Red fox MODERN SPECIES 17 FSTL4 (ENSVVUG00000021423) ENSVVUG00000021429 ENSVVUG00000021578 ENSVVUG00000024517 ZCCHC10 (ENSVVUG00000024519) AFF4 (ENSVVUG00000024524) ENSVVUG00000024534 UQCRQ (ENSVVUG00000024537) GDF9 (ENSVVUG00000024542) SHROOM1 (ENSVVUG00000024544) SEPTIN8 (ENSVVUG00000024548) KIF3A (ENSVVUG00000024559) IL4 (ENSVVUG00000024569) IL13 (ENSVVUG00000024578) RAD50 (ENSVVUG00000024587) ENSVVUG00000024602 #22 IL5 (ENSVVUG00000024604) IRF1 (ENSVVUG00000024606) SLC22A5 (ENSVVUG00000024615) SLC22A4 (ENSVVUG00000024619) P4HA2 (ENSVVUG00000024626) PDLIM4 (ENSVVUG00000024637) CSF2 (ENSVVUG00000024639) ACSL6 (ENSVVUG00000024815) FNIP1 (ENSVVUG00000028633) RAPGEF6 (ENSVVUG00000028832) CDC42SE2 (ENSVVUG00000029180) LYRM7 (ENSVVUG00000029182) ENSVVUG00000029183 ENSVVUG00000029185 ENSVVUG00000029190 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.q.k.b #22 Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.q.k.b #22 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.q.k.b #22 Dingo MODERN SPECIES 276 ENSCAFG00020013436 ENSCAFG00020013447 ENSCAFG00020013449 DST (ENSCAFG00020013702) BEND6 (ENSCAFG00020015862) ENSCAFG00020015866 ENSCAFG00020015868 KIAA1586 (ENSCAFG00020015871) ZNF451 (ENSCAFG00020015879) BAG2 (ENSCAFG00020015898) RAB23 (ENSCAFG00020015900) PRIM2 (ENSCAFG00020015903) ENSCAFG00020015907 KHDRBS2 (ENSCAFG00020015926) ENSCAFG00020015930 ENSCAFG00020015933 #22 ENSCAFG00020015940 LGSN (ENSCAFG00020015951) PTP4A1 (ENSCAFG00020015958) ENSCAFG00020015972 ENSCAFG00020015989 ENSCAFG00020016031 ENSCAFG00020016032 ENSCAFG00020016039 ENSCAFG00020016041 Dog MODERN SPECIES 11 PROB1 (ENSCAFG00845000748) SPATA24 (ENSCAFG00845000773) DNAJC18 (ENSCAFG00845000811) ECSCR (ENSCAFG00845000875) SMIM33 (ENSCAFG00845000957) UBE2D2 (ENSCAFG00845000981) CXXC5 (ENSCAFG00845001003) PSD2 (ENSCAFG00845001040) NRG2 (ENSCAFG00845001070) PURA (ENSCAFG00845001158) IGIP (ENSCAFG00845001175) ENSCAFG00845001205 PFDN1 (ENSCAFG00845001230) HBEGF (ENSCAFG00845001249) SLC4A9 (ENSCAFG00845001336) ENSCAFG00845001482 #22 ANKHD1 (ENSCAFG00845001622) EIF4EBP3 (ENSCAFG00845001691) APBB3 (ENSCAFG00845001716) APBB3 (ENSCAFG00845001840) SLC35A4 (ENSCAFG00845001883) CD14 (ENSCAFG00845001909) TMCO6 (ENSCAFG00845001948) NDUFA2 (ENSCAFG00845001992) IK (ENSCAFG00845002021) WDR55 (ENSCAFG00845002039) DND1 (ENSCAFG00845002066) HARS1 (ENSCAFG00845002179) HARS2 (ENSCAFG00845002374) ZMAT2 (ENSCAFG00845002442) ENSCAFG00845002466 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.q.k.b #22 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.q.k.b #22 American mink MODERN SPECIES 212 RNASET2 (ENSNVIG00000018487) RPS6KA2 (ENSNVIG00000018379) MPC1 (ENSNVIG00000018351) SFT2D1 (ENSNVIG00000018339) TBXT (ENSNVIG00000018332) PDE10A (ENSNVIG00000018209) C6orf118 (ENSNVIG00000018192) ENSNVIG00000018185 #22 QKI (ENSNVIG00000018179) PACRG (ENSNVIG00000018167) Ursidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.q.k.b #22 Ursus ANCESTRAL SPECIES 103 ENSGT00940000158576 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b.j #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.q.k.b #22 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873.b #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00390000017343 Polar bear MODERN SPECIES 484 KCNA1 (ENSUMAG00000007743) KCNA5 (ENSUMAG00000007733) #7 NTF3 (ENSUMAG00000007725) #9 ANO2 (ENSUMAG00000007545) VWF (ENSUMAG00000007512) #10 CD9 (ENSUMAG00000007507) #12 PLEKHG6 (ENSUMAG00000007501) #13 ENSUMAG00000007495 #14 SCNN1A (ENSUMAG00000007429) #15 LTBR (ENSUMAG00000007402) #16 CD27 (ENSUMAG00000007399) TAPBPL (ENSUMAG00000007397) #18 ENSUMAG00000007395 #19 MRPL51 (ENSUMAG00000007393) #20 NCAPD2 (ENSUMAG00000007255) #21 GAPDH (ENSUMAG00000007239) #22 NOP2 (ENSUMAG00000007220) CHD4 (ENSUMAG00000005336) #25 ACRBP (ENSUMAG00000005096) #27 ING4 (ENSUMAG00000005092) #28 ZNF384 (ENSUMAG00000005073) #29 PIANP (ENSUMAG00000005067) #30 COPS7A (ENSUMAG00000005057) #31 MLF2 (ENSUMAG00000005049) #32 LAG3 (ENSUMAG00000005008) #35 CD4 (ENSUMAG00000004996) #36 P3H3 (ENSUMAG00000004936) GNB3 (ENSUMAG00000004881) CDCA3 (ENSUMAG00000004864) USP5 (ENSUMAG00000004200) TPI1 (ENSUMAG00000004130) Caniformia ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.q.l #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.q.l #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES 95 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.q.l #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 American mink MODERN SPECIES 333 NTF3 (ENSNVIG00000024751) #9 ANO2 (ENSNVIG00000024735) VWF (ENSNVIG00000024722) #10 CD9 (ENSNVIG00000024720) #12 PLEKHG6 (ENSNVIG00000024709) #13 TNFRSF1A (ENSNVIG00000024699) #14 SCNN1A (ENSNVIG00000024691) #15 LTBR (ENSNVIG00000024684) #16 CD27 (ENSNVIG00000024681) TAPBPL (ENSNVIG00000024679) #18 ENSNVIG00000024678 VAMP1 (ENSNVIG00000024673) #19 RM51 (ENSNVIG00000024669) #20 NCAPD2 (ENSNVIG00000024666) #21 ENSNVIG00000024662 #22 IFFO1 (ENSNVIG00000024654) #23 ENSNVIG00000024651 NOP2 (ENSNVIG00000024649) CHD4 (ENSNVIG00000024642) #25 LPAR5 (ENSNVIG00000024641) #26 ACRBP (ENSNVIG00000024640) #27 ING4 (ENSNVIG00000024639) #28 ZNF384 (ENSNVIG00000024638) #29 PIANP (ENSNVIG00000024637) #30 CSN7A (ENSNVIG00000024636) #31 MLF2 (ENSNVIG00000024635) #32 PTMS (ENSNVIG00000024634) LAG3 (ENSNVIG00000024633) #35 CD4 (ENSNVIG00000024632) #36 GPR162 (ENSNVIG00000024631) #37 Ferret DUPLICATION Ferret MODERN SPECIES 577 ENSMPUG00000014933 #22 ENSMPUG00000014939 Ferret MODERN SPECIES 284 NTF3 (ENSMPUG00000020130) #9 ANO2 (ENSMPUG00000016940) VWF (ENSMPUG00000016935) #10 CD9 (ENSMPUG00000016921) #12 PLEKHG6 (ENSMPUG00000016918) #13 TNFRSF1A (ENSMPUG00000016915) #14 LTBR (ENSMPUG00000016913) #16 SCNN1A (ENSMPUG00000016912) #15 CD27 (ENSMPUG00000016908) TAPBPL (ENSMPUG00000016907) #18 VAMP1 (ENSMPUG00000016905) #19 MRPL51 (ENSMPUG00000016904) #20 NCAPD2 (ENSMPUG00000016901) #21 GAPDH (ENSMPUG00000016891) #22 IFFO1 (ENSMPUG00000016884) #23 NOP2 (ENSMPUG00000016865) CHD4 (ENSMPUG00000016859) #25 LPAR5 (ENSMPUG00000020129) #26 ACRBP (ENSMPUG00000016855) #27 ING4 (ENSMPUG00000016840) #28 ZNF384 (ENSMPUG00000016838) #29 PIANP (ENSMPUG00000016836) #30 COPS7A (ENSMPUG00000016835) #31 MLF2 (ENSMPUG00000016834) #32 PTMS (ENSMPUG00000016830) ENSMPUG00000016828 LAG3 (ENSMPUG00000016825) #35 CD4 (ENSMPUG00000016809) #36 GPR162 (ENSMPUG00000016806) #37 Ursidae ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000158576 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b.j #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.q.l #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873.b #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 ENSGT01000000214413.b.a.b.a Ursus ANCESTRAL SPECIES 351 ENSGT00940000180930 ENSGT00940000153298.n.q.l #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 American black bear MODERN SPECIES 236 ENSUAMG00000022690 VWF (ENSUAMG00000022599) #10 CD9 (ENSUAMG00000022552) #12 PLEKHG6 (ENSUAMG00000022549) #13 TNFRSF1A (ENSUAMG00000022547) #14 ENSUAMG00000022546 #15 ENSUAMG00000022545 #15 ENSUAMG00000022544 #16 ENSUAMG00000022543 #16 CD27 (ENSUAMG00000022542) TAPBPL (ENSUAMG00000022541) #18 VAMP1 (ENSUAMG00000022540) #19 MRPL51 (ENSUAMG00000022539) #20 ENSUAMG00000022537 GAPDH (ENSUAMG00000022520) #22 ENSUAMG00000022518 #23 Giant Panda DUPLICATION Giant Panda MODERN SPECIES 1980 ENSAMEG00000026592 #22 Giant Panda MODERN SPECIES 7 KCNA5 (ENSAMEG00000020277) #7 NTF3 (ENSAMEG00000019233) #9 ANO2 (ENSAMEG00000011274) VWF (ENSAMEG00000011272) #10 ENSAMEG00000006889 CD9 (ENSAMEG00000014604) #12 ENSAMEG00000014597 #13 TNFRSF1A (ENSAMEG00000014569) #14 SCNN1A (ENSAMEG00000014498) #15 LTBR (ENSAMEG00000014476) #16 CD27 (ENSAMEG00000014466) TAPBPL (ENSAMEG00000014448) #18 VAMP1 (ENSAMEG00000014438) #19 MRPL51 (ENSAMEG00000014426) #20 NCAPD2 (ENSAMEG00000014358) #21 GAPDH (ENSAMEG00000014329) #22 IFFO1 (ENSAMEG00000014300) #23 NOP2 (ENSAMEG00000014268) CHD4 (ENSAMEG00000014179) #25 LPAR5 (ENSAMEG00000031134) #26 ACRBP (ENSAMEG00000014163) #27 ING4 (ENSAMEG00000014135) #28 ZNF384 (ENSAMEG00000014121) #29 PIANP (ENSAMEG00000014112) #30 COPS7A (ENSAMEG00000014096) #31 MLF2 (ENSAMEG00000014077) #32 ENSAMEG00000014074 LAG3 (ENSAMEG00000014063) #35 CD4 (ENSAMEG00000014043) #36 GPR162 (ENSAMEG00000014035) #37 P3H3 (ENSAMEG00000014022) Giant Panda MODERN SPECIES 1923 ENSAMEG00000025937 #22 Giant Panda MODERN SPECIES 1941 ENSAMEG00000027817 #22 Canidae DUPLICATION Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.q.l.g #22 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.q.l.g #22 Dingo MODERN SPECIES 347 ENSCAFG00020008757 ZNF711 (ENSCAFG00020008733) POF1B (ENSCAFG00020008592) CHM (ENSCAFG00020008573) ENSCAFG00020008551 ENSCAFG00020008549 DACH2 (ENSCAFG00020008532) KLHL4 (ENSCAFG00020008498) ENSCAFG00020008484 ENSCAFG00020008461 ENSCAFG00020008456 NAP1L3 (ENSCAFG00020008423) ENSCAFG00020008407 ENSCAFG00020008403 ENSCAFG00020008379 ENSCAFG00020008310 #22 ENSCAFG00020008305 DIAPH2 (ENSCAFG00020008109) ENSCAFG00020008028 ENSCAFG00020008007 ENSCAFG00020008000 ENSCAFG00020007977 ENSCAFG00020007945 ENSCAFG00020007941 ENSCAFG00020007938 ENSCAFG00020007908 PCDH19 (ENSCAFG00020007882) ENSCAFG00020007874 TNMD (ENSCAFG00020007869) TSPAN6 (ENSCAFG00020007783) SRPX2 (ENSCAFG00020007764) Canidae DUPLICATION Canidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000158576 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.q.l.h.a #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000158576 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n.q.l.h.a #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Dog MODERN SPECIES 19 KCNA1 (ENSCAFG00845030371) KCNA5 (ENSCAFG00845030339) #7 NTF3 (ENSCAFG00845030324) #9 ANO2 (ENSCAFG00845030210) VWF (ENSCAFG00845029798) #10 CD9 (ENSCAFG00845029613) #12 PLEKHG6 (ENSCAFG00845029568) #13 ENSCAFG00845029433 #14 SCNN1A (ENSCAFG00845029331) #15 LTBR (ENSCAFG00845029256) #16 CD27 (ENSCAFG00845029234) TAPBPL (ENSCAFG00845029155) #18 VAMP1 (ENSCAFG00845029081) #19 MRPL51 (ENSCAFG00845029018) #20 NCAPD2 (ENSCAFG00845028959) #21 GAPDH (ENSCAFG00845028918) #22 IFFO1 (ENSCAFG00845028853) #23 NOP2 (ENSCAFG00845028743) CHD4 (ENSCAFG00845028632) #25 LPAR5 (ENSCAFG00845028579) #26 ACRBP (ENSCAFG00845028419) #27 ENSCAFG00845028378 ZNF384 (ENSCAFG00845028247) #29 PIANP (ENSCAFG00845028055) #30 COPS7A (ENSCAFG00845027958) #31 MLF2 (ENSCAFG00845027898) #32 PTMS (ENSCAFG00845027847) LAG3 (ENSCAFG00845027788) #35 CD4 (ENSCAFG00845027739) #36 GPR162 (ENSCAFG00845027631) #37 P3H3 (ENSCAFG00845027539) Dingo MODERN SPECIES 304 ENSCAFG00020002944 ENSCAFG00020002951 ENSCAFG00020002987 CCDC115 (ENSCAFG00020002989) PALLD (ENSCAFG00020003032) CBR4 (ENSCAFG00020003413) ENSCAFG00020003414 ENSCAFG00020003425 ENSCAFG00020003428 SH3RF1 (ENSCAFG00020003443) NEK1 (ENSCAFG00020003641) CLCN3 (ENSCAFG00020006092) HPF1 (ENSCAFG00020011689) MFAP3L (ENSCAFG00020011703) AADAT (ENSCAFG00020011708) ENSCAFG00020011716 #22 ENSCAFG00020011729 ENSCAFG00020011745 ENSCAFG00020011750 GALNTL6 (ENSCAFG00020011754) ENSCAFG00020011757 GALNT7 (ENSCAFG00020011759) HMGB2 (ENSCAFG00020011761) SAP30 (ENSCAFG00020011765) SCRG1 (ENSCAFG00020011766) HAND2 (ENSCAFG00020011768) FBXO8 (ENSCAFG00020011774) CEP44 (ENSCAFG00020011776) HPGD (ENSCAFG00020011781) GLRA3 (ENSCAFG00020011792) ADAM29 (ENSCAFG00020011928) Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.q.l.h.b #22 Red fox MODERN SPECIES 25 ONECUT2 (ENSVVUG00000014932) ST8SIA3 (ENSVVUG00000014931) ENSVVUG00000014923 WDR7 (ENSVVUG00000014912) TXNL1 (ENSVVUG00000014906) TCF4 (ENSVVUG00000014890) CCDC68 (ENSVVUG00000014885) RAB27B (ENSVVUG00000014878) ENSVVUG00000014874 ENSVVUG00000014866 CUNH18orf54 (ENSVVUG00000014859) CUNH18orf54 (ENSVVUG00000014854) STARD6 (ENSVVUG00000014848) POLI (ENSVVUG00000014845) MBD2 (ENSVVUG00000014700) ENSVVUG00000014674 #22 DCC (ENSVVUG00000014667) ENSVVUG00000014654 MEX3C (ENSVVUG00000014636) SMAD4 (ENSVVUG00000014609) ELAC1 (ENSVVUG00000014595) ME2 (ENSVVUG00000014587) MRO (ENSVVUG00000014571) MC2R (ENSVVUG00000014566) MC5R (ENSVVUG00000014564) RNMT (ENSVVUG00000014550) FAM210A (ENSVVUG00000014540) LDLRAD4 (ENSVVUG00000014523) ENSVVUG00000014500 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.n.q.l.h.b #22 Dog MODERN SPECIES 35 ENSCAFG00845002447 ACBD6 (ENSCAFG00845002431) LHX4 (ENSCAFG00845002410) QSOX1 (ENSCAFG00845002288) ENSCAFG00845002252 CEP350 (ENSCAFG00845002165) TOR1AIP1 (ENSCAFG00845002082) ENSCAFG00845002008 ENSCAFG00845001988 ENSCAFG00845001973 ENSCAFG00845001949 ENSCAFG00845001932 ENSCAFG00845001892 CENPF (ENSCAFG00845001752) PTPN14 (ENSCAFG00845001665) ENSCAFG00845001638 #22 SMYD2 (ENSCAFG00845001630) PROX1 (ENSCAFG00845001606) RPS6KC1 (ENSCAFG00845001399) ANGEL2 (ENSCAFG00845001293) VASH2 (ENSCAFG00845001231) ENSCAFG00845001182 FLVCR1 (ENSCAFG00845001151) ENSCAFG00845001121 TATDN3 (ENSCAFG00845003857) ENSCAFG00845003831 NSL1 (ENSCAFG00845003808) BATF3 (ENSCAFG00845003785) ENSCAFG00845003779 GARIN4 (ENSCAFG00845003772) ATF3 (ENSCAFG00845003749) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000158576 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000158576 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 ENSGT01000000214413.b.a.b.a Tenrec MODERN SPECIES 1331 ENSETEG00000013743 #20 NCAPD2 (ENSETEG00000013744) #21 GAPDH (ENSETEG00000013749) #22 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000158576 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.n #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 ENSGT01000000214413.b.a.b.a Elephant DUPLICATION Elephant MODERN SPECIES 108 KCNA5 (ENSLAFG00000007935) #7 ENSLAFG00000028245 NTF3 (ENSLAFG00000002319) #9 ANO2 (ENSLAFG00000002320) VWF (ENSLAFG00000002327) #10 CD9 (ENSLAFG00000027050) #12 PLEKHG6 (ENSLAFG00000021440) #13 TNFRSF1A (ENSLAFG00000017153) #14 SCNN1A (ENSLAFG00000000723) #15 LTBR (ENSLAFG00000029559) #16 CD27 (ENSLAFG00000021608) TAPBPL (ENSLAFG00000016109) #18 VAMP1 (ENSLAFG00000002104) #19 MRPL51 (ENSLAFG00000002106) #20 NCAPD2 (ENSLAFG00000016117) #21 ENSLAFG00000002780 #22 IFFO1 (ENSLAFG00000002782) #23 NOP2 (ENSLAFG00000002784) CHD4 (ENSLAFG00000022842) #25 LPAR5 (ENSLAFG00000022468) #26 ACRBP (ENSLAFG00000008377) #27 ING4 (ENSLAFG00000008379) #28 ZNF384 (ENSLAFG00000008381) #29 PIANP (ENSLAFG00000025728) #30 COPS7A (ENSLAFG00000004634) #31 MLF2 (ENSLAFG00000013649) #32 LAG3 (ENSLAFG00000032271) #35 CD4 (ENSLAFG00000029166) #36 GPR162 (ENSLAFG00000022632) #37 P3H3 (ENSLAFG00000006551) GNB3 (ENSLAFG00000006559) Elephant MODERN SPECIES 49 RFT1 (ENSLAFG00000002792) PRKCD (ENSLAFG00000015864) TKT (ENSLAFG00000005325) DCP1A (ENSLAFG00000005837) CACNA1D (ENSLAFG00000022132) CHDH (ENSLAFG00000021479) ENSLAFG00000021630 IL17RB (ENSLAFG00000011145) ACTR8 (ENSLAFG00000001366) LRTM1 (ENSLAFG00000014120) CACNA2D3 (ENSLAFG00000014102) WNT5A (ENSLAFG00000002683) ENSLAFG00000032538 ENSLAFG00000018319 CCDC66 (ENSLAFG00000011093) ENSLAFG00000026000 #22 TASOR (ENSLAFG00000011103) ARHGEF3 (ENSLAFG00000001382) IL17RD (ENSLAFG00000012520) HESX1 (ENSLAFG00000032415) APPL1 (ENSLAFG00000014294) ASB14 (ENSLAFG00000014301) DNAH12 (ENSLAFG00000014308) PDE12 (ENSLAFG00000002821) ARF4 (ENSLAFG00000006203) DENND6A (ENSLAFG00000003914) SLMAP (ENSLAFG00000000245) FLNB (ENSLAFG00000006278) DNASE1L3 (ENSLAFG00000006296) ABHD6 (ENSLAFG00000016818) RPP14 (ENSLAFG00000031481) Hyrax MODERN SPECIES 212 NCAPD2 (ENSPCAG00000006779) #21 GAPDH (ENSPCAG00000006928) #22 IFFO1 (ENSPCAG00000006972) #23 NOP2 (ENSPCAG00000007033) CHD4 (ENSPCAG00000007120) #25 Theria DUPLICATION Theria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Steppe mouse DUPLICATION Steppe mouse MODERN SPECIES 2972 ENSMSIG00000000838 ##22 Etaa1 (ENSMSIG00000000849) C1d (ENSMSIG00000000910) Dnaaf10 (ENSMSIG00000000934) ENSMSIG00000000962 ENSMSIG00000000988 ENSMSIG00000001023 Plek (ENSMSIG00000001053) Fbxo48 (ENSMSIG00000001105) Egfr (ENSMSIG00000001122) ENSMSIG00000001156 ENSMSIG00000001187 Steppe mouse MODERN SPECIES 2824 ENSMSIG00000026087 Emc2 (ENSMSIG00000026075) Eif3e (ENSMSIG00000026057) ENSMSIG00000026050 ##22 Rspo2 (ENSMSIG00000026035) Angpt1 (ENSMSIG00000026004) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Degu MODERN SPECIES 141 SLC48A1 (ENSODEG00000003853) RAPGEF3 (ENSODEG00000003613) ENDOU (ENSODEG00000003517) RPAP3 (ENSODEG00000003489) PCED1B (ENSODEG00000003479) ENSODEG00000018996 AMIGO2 (ENSODEG00000018958) ENSODEG00000003462 ENSODEG00000003450 SLC38A2 (ENSODEG00000003379) SLC38A1 (ENSODEG00000003269) SCAF11 (ENSODEG00000003223) ENSODEG00000019076 ENSODEG00000004013 ARID2 (ENSODEG00000003976) ENSODEG00000003928 ##22 ENSODEG00000018973 ENSODEG00000018965 ENSODEG00000003909 ANO6 (ENSODEG00000003814) NELL2 (ENSODEG00000003669) TMEM117 (ENSODEG00000003583) ENSODEG00000003529 ENSODEG00000018930 PUS7L (ENSODEG00000003484) ADAMTS20 (ENSODEG00000003382) PRICKLE1 (ENSODEG00000003320) PPHLN1 (ENSODEG00000003297) ENSODEG00000003268 ENSODEG00000003254 YAF2 (ENSODEG00000004846) Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Eurasian red squirrel DUPLICATION Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 15 TRIM23 (ENSSVLG00005004375) TRAPPC13 (ENSSVLG00005004304) SGTB (ENSSVLG00005012822) ENSSVLG00005012778 NLN (ENSSVLG00005012726) ERBIN (ENSSVLG00005012390) SREK1 (ENSSVLG00005012169) ENSSVLG00005012082 ENSSVLG00005012037 ##22 MAST4 (ENSSVLG00005010486) CD180 (ENSSVLG00005010276) ENSSVLG00005010238 ENSSVLG00005010209 ENSSVLG00005010183 PIK3R1 (ENSSVLG00005010056) ENSSVLG00005010000 ##22 SLC30A5 (ENSSVLG00005009911) CCNB1 (ENSSVLG00005009823) CENPH (ENSSVLG00005009762) ENSSVLG00005009714 CDK7 (ENSSVLG00005009632) CCDC125 (ENSSVLG00005009466) ENSSVLG00005009362 RAD17 (ENSSVLG00005009140) MARVELD2 (ENSSVLG00005008937) OCLN (ENSSVLG00005008798) ENSSVLG00005008740 ENSSVLG00005008651 CRHBP (ENSSVLG00005008579) S100Z (ENSSVLG00005008555) ENSSVLG00005008549 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 15 RAD17 (ENSSVLG00005009140) ENSSVLG00005009362 CCDC125 (ENSSVLG00005009466) CDK7 (ENSSVLG00005009632) ENSSVLG00005009714 CENPH (ENSSVLG00005009762) CCNB1 (ENSSVLG00005009823) SLC30A5 (ENSSVLG00005009911) ENSSVLG00005010000 ##22 PIK3R1 (ENSSVLG00005010056) ENSSVLG00005010183 ENSSVLG00005010209 ENSSVLG00005010238 CD180 (ENSSVLG00005010276) MAST4 (ENSSVLG00005010486) ENSSVLG00005012037 ##22 ENSSVLG00005012082 SREK1 (ENSSVLG00005012169) ERBIN (ENSSVLG00005012390) NLN (ENSSVLG00005012726) ENSSVLG00005012778 SGTB (ENSSVLG00005012822) TRAPPC13 (ENSSVLG00005004304) TRIM23 (ENSSVLG00005004375) PPWD1 (ENSSVLG00005004415) CENPK (ENSSVLG00005004475) ADAMTS6 (ENSSVLG00005004515) CWC27 (ENSSVLG00005004548) SREK1IP1 (ENSSVLG00005004571) SHISAL2B (ENSSVLG00005004593) RGS7BP (ENSSVLG00005004610) Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 248 F13B (ENSUPAG00010002536) ENSUPAG00010002568 ZBTB41 (ENSUPAG00010002609) CRB1 (ENSUPAG00010002619) DENND1B (ENSUPAG00010002659) C1orf53 (ENSUPAG00010002739) LHX9 (ENSUPAG00010002748) NEK7 (ENSUPAG00010002784) ATP6V1G3 (ENSUPAG00010002806) PTPRC (ENSUPAG00010002835) NR5A2 (ENSUPAG00010006584) ENSUPAG00010006611 ##22 ZNF281 (ENSUPAG00010006619) Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 724 NTF3 (ENSRBIG00000034368) #9 ANO2 (ENSRBIG00000033075) VWF (ENSRBIG00000037765) #10 CD9 (ENSRBIG00000041088) #12 PLEKHG6 (ENSRBIG00000035904) #13 TNFRSF1A (ENSRBIG00000043065) #14 SCNN1A (ENSRBIG00000029623) #15 LTBR (ENSRBIG00000032304) #16 CD27 (ENSRBIG00000028838) TAPBPL (ENSRBIG00000043531) #18 ENSRBIG00000034062 VAMP1 (ENSRBIG00000037948) #19 ENSRBIG00000029955 ENSRBIG00000029250 #20 NCAPD2 (ENSRBIG00000041534) #21 ENSRBIG00000042567 ##22 IFFO1 (ENSRBIG00000032577) #23 ENSRBIG00000044511 #24 ENSRBIG00000033304 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Beluga whale MODERN SPECIES 36 RNF24 (ENSDLEG00000019164) PANK2 (ENSDLEG00000019076) MAVS (ENSDLEG00000019055) ENSDLEG00000019048 AP5S1 (ENSDLEG00000019043) CDC25B (ENSDLEG00000019007) CENPB (ENSDLEG00000018997) SPEF1 (ENSDLEG00000018962) CUNH20orf27 (ENSDLEG00000018952) ENSDLEG00000018893 SIGLEC1 (ENSDLEG00000018732) ENSDLEG00000018103 ENSDLEG00000018030 ENSDLEG00000017544 ENSDLEG00000017473 ENSDLEG00000017400 ##22 ATRN (ENSDLEG00000016980) DNAAF9 (ENSDLEG00000015321) SLC4A11 (ENSDLEG00000014943) ENSDLEG00000014901 ENSDLEG00000014890 DDRGK1 (ENSDLEG00000014873) LZTS3 (ENSDLEG00000014855) FASTKD5 (ENSDLEG00000014849) UBOX5 (ENSDLEG00000014837) AVP (ENSDLEG00000014830) OXT (ENSDLEG00000014822) MRPS26 (ENSDLEG00000014812) GNRH2 (ENSDLEG00000014803) PTPRA (ENSDLEG00000014710) VPS16 (ENSDLEG00000014501) Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Yarkand deer DUPLICATION Yarkand deer MODERN SPECIES 31 RFTN2 (ENSCHYG00000013201) MARS2 (ENSCHYG00000013177) BOLL (ENSCHYG00000012765) PLCL1 (ENSCHYG00000012427) ENSCHYG00000012371 SATB2 (ENSCHYG00000012100) ENSCHYG00000011965 C2orf69 (ENSCHYG00000011903) TYW5 (ENSCHYG00000011850) MAIP1 (ENSCHYG00000011759) ENSCHYG00000011736 SPATS2L (ENSCHYG00000011390) KCTD18 (ENSCHYG00000011325) SGO2 (ENSCHYG00000011236) AOX1 (ENSCHYG00000010517) ENSCHYG00000010452 ##22 ENSCHYG00000010410 ENSCHYG00000009851 ENSCHYG00000009654 BZW1 (ENSCHYG00000009251) ENSCHYG00000004999 CLK1 (ENSCHYG00000004911) PPIL3 (ENSCHYG00000004901) NIF3L1 (ENSCHYG00000004879) ORC2 (ENSCHYG00000004839) HYCC2 (ENSCHYG00000004790) ENSCHYG00000004767 CFLAR (ENSCHYG00000004722) CASP8 (ENSCHYG00000004683) FLACC1 (ENSCHYG00000004659) TRAK2 (ENSCHYG00000004632) Yarkand deer MODERN SPECIES 31 FARSB (ENSCHYG00000022658) ENSCHYG00000022621 MOGAT1 (ENSCHYG00000022580) ACSL3 (ENSCHYG00000022341) KCNE4 (ENSCHYG00000022309) SCG2 (ENSCHYG00000022276) AP1S3 (ENSCHYG00000022169) WDFY1 (ENSCHYG00000022020) MRPL44 (ENSCHYG00000021987) SERPINE2 (ENSCHYG00000021898) FAM124B (ENSCHYG00000021856) CUL3 (ENSCHYG00000021376) CCDC195 (ENSCHYG00000021314) DOCK10 (ENSCHYG00000020928) NYAP2 (ENSCHYG00000020801) ENSCHYG00000020734 ##22 ENSCHYG00000020698 IRS1 (ENSCHYG00000020656) ENSCHYG00000020613 RHBDD1 (ENSCHYG00000020452) COL4A4 (ENSCHYG00000018791) ENSCHYG00000018528 ENSCHYG00000017266 TM4SF20 (ENSCHYG00000017177) AGFG1 (ENSCHYG00000016822) ENSCHYG00000016720 ENSCHYG00000016686 ENSCHYG00000016605 ENSCHYG00000016581 SCYGR8 (ENSCHYG00000016560) CCL20 (ENSCHYG00000016439) Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Siberian musk deer MODERN SPECIES 1183 COPB2 (ENSMMSG00000007584) RBP2 (ENSMMSG00000007546) RBP1 (ENSMMSG00000007523) NMNAT3 (ENSMMSG00000007475) CLSTN2 (ENSMMSG00000007374) TRIM42 (ENSMMSG00000007340) SLC25A36 (ENSMMSG00000007138) SPSB4 (ENSMMSG00000007102) ENSMMSG00000007071 PXYLP1 (ENSMMSG00000006978) RASA2 (ENSMMSG00000006905) RNF7 (ENSMMSG00000006837) GRK7 (ENSMMSG00000006798) ENSMMSG00000006771 ENSMMSG00000006756 ENSMMSG00000006733 ##22 TFDP2 (ENSMMSG00000006589) GK5 (ENSMMSG00000006474) XRN1 (ENSMMSG00000006235) ATR (ENSMMSG00000006162) PLS1 (ENSMMSG00000006112) TRPC1 (ENSMMSG00000006046) PCOLCE2 (ENSMMSG00000005995) PAQR9 (ENSMMSG00000005982) U2SURP (ENSMMSG00000005820) CHST2 (ENSMMSG00000005775) SLC9A9 (ENSMMSG00000005673) DIPK2A (ENSMMSG00000005617) PLOD2 (ENSMMSG00000005367) PLSCR4 (ENSMMSG00000005249) ENSMMSG00000005202 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Bos_a ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000153832.f.y.d.a.a.b ENSGT00940000153832.f.x.b.a ENSGT00940000155811 ENSGT00940000157033 ENSGT00550000074930 ENSGT00940000155040.b ENSGT00940000157777 ENSGT00940000157998 ENSGT00530000063626.b ENSGT00390000001285 ENSGT00950000183039.A ENSGT00530000063539.a.v ENSGT00940000156088 ENSGT00940000157212.B ENSGT00940000159679 ENSGT00940000153298.m.a ##22 ENSGT00940000155323.a ENSGT00550000074846.`b ENSGT00950000182955.a.b.b ENSGT00390000002848 ENSGT00940000155870.b ENSGT00940000158267 ENSGT00940000164528 ENSGT00940000155915 ENSGT00950000183062.a.a.b ENSGT00940000156242 ENSGT00390000013995.b.b ENSGT00940000173599 ENSGT00730000111061.p ENSGT00390000016228 ENSGT00940000157529 Wild yak MODERN SPECIES 105 ENSBMUG00000006429 ENSBMUG00000006433 CNOT2 (ENSBMUG00000006457) KCNMB4 (ENSBMUG00000006472) ENSBMUG00000006480 PTPRB (ENSBMUG00000006695) PTPRR (ENSBMUG00000007089) CPNE8 (ENSBMUG00000007243) ENSBMUG00000007251 ##22 KIF21A (ENSBMUG00000007479) ENSBMUG00000007814 ABCD2 (ENSBMUG00000007818) Domestic yak MODERN SPECIES 24 ENSBGRG00000023408 ENSBGRG00000023471 ENSBGRG00000007422 YEATS4 (ENSBGRG00000007500) FRS2 (ENSBGRG00000007705) CCT2 (ENSBGRG00000007901) LRRC10 (ENSBGRG00000008156) ENSBGRG00000008385 RAB3IP (ENSBGRG00000008446) MYRFL (ENSBGRG00000008765) CNOT2 (ENSBGRG00000009161) KCNMB4 (ENSBGRG00000009357) PTPRB (ENSBGRG00000009450) PTPRR (ENSBGRG00000011534) CPNE8 (ENSBGRG00000012044) ENSBGRG00000012374 ##22 KIF21A (ENSBGRG00000012509) ABCD2 (ENSBGRG00000014998) C12orf40 (ENSBGRG00000015186) SLC2A13 (ENSBGRG00000015360) LRRK2 (ENSBGRG00000015531) ENSBGRG00000016248 ENSBGRG00000016370 CNTN1 (ENSBGRG00000016476) ENSBGRG00000017368 PDZRN4 (ENSBGRG00000017386) GXYLT1 (ENSBGRG00000017528) YAF2 (ENSBGRG00000017721) PPHLN1 (ENSBGRG00000017994) ENSBGRG00000018534 ENSBGRG00000018622 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 19 CFAP36 (ENSOARG00020000353) PPP4R3B (ENSOARG00020000304) PNPT1 (ENSOARG00020000229) EFEMP1 (ENSOARG00020000199) CCDC85A (ENSOARG00020003231) FANCL (ENSOARG00020003084) ENSOARG00020003034 ENSOARG00020003018 BCL11A (ENSOARG00020002953) PAPOLG (ENSOARG00020002875) REL (ENSOARG00020002832) PUS10 (ENSOARG00020002818) PEX13 (ENSOARG00020002802) SANBR (ENSOARG00020002778) MRPL19 (ENSOARG00020002714) ENSOARG00020002681 ##22 ENSOARG00020002672 EVA1A (ENSOARG00020002662) SEPTIN10 (ENSOARG00020002613) CCDC138 (ENSOARG00020002474) RANBP2 (ENSOARG00020002287) ENSOARG00020002071 ENSOARG00020001948 SLC5A7 (ENSOARG00020001925) ST6GAL2 (ENSOARG00020001914) ENSOARG00020001906 UXS1 (ENSOARG00020001860) ECRG4 (ENSOARG00020001846) NCK2 (ENSOARG00020001838) TTL (ENSOARG00020001816) POLR1B (ENSOARG00020001752) Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Equus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Horse MODERN SPECIES 30 TGS1 (ENSECAG00000019399) TMEM68 (ENSECAG00000000568) XKR4 (ENSECAG00000006978) RP1 (ENSECAG00000007686) ENSECAG00000043138 ENSECAG00000051067 MRPL15 (ENSECAG00000012110) LYPLA1 (ENSECAG00000016530) ENSECAG00000052889 TCEA1 (ENSECAG00000013436) ENSECAG00000050151 RGS20 (ENSECAG00000018510) ENSECAG00000044966 ATP6V1H (ENSECAG00000024159) OPRK1 (ENSECAG00000014442) ENSECAG00000047787 ##22 NPBWR1 (ENSECAG00000005077) RB1CC1 (ENSECAG00000017579) ALKAL1 (ENSECAG00000039026) ENSECAG00000058919 ENSECAG00000053325 PCMTD1 (ENSECAG00000022204) ENSECAG00000053013 PXDNL (ENSECAG00000022817) ENSECAG00000019962 SNTG1 (ENSECAG00000000087) ENSECAG00000000401 ENSECAG00000056104 ENSECAG00000051290 PPDPFL (ENSECAG00000040755) SNAI2 (ENSECAG00000010120) Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 5 RIMS2 (ENSRFEG00010020235) DCAF13 (ENSRFEG00010020165) ENSRFEG00010020145 CTHRC1 (ENSRFEG00010020112) FZD6 (ENSRFEG00010020069) BAALC (ENSRFEG00010020012) ATP6V1C1 (ENSRFEG00010019958) ENSRFEG00010019866 KLF10 (ENSRFEG00010019834) ODF1 (ENSRFEG00010019798) UBR5 (ENSRFEG00010019728) RRM2B (ENSRFEG00010019621) NCALD (ENSRFEG00010019578) GRHL2 (ENSRFEG00010019555) ENSRFEG00010019533 ENSRFEG00010019510 ##22 ENSRFEG00010019469 ZNF706 (ENSRFEG00010019443) YWHAZ (ENSRFEG00010019368) PABPC1 (ENSRFEG00010018981) SNX31 (ENSRFEG00010018757) ANKRD46 (ENSRFEG00010018712) RNF19A (ENSRFEG00010018669) SPAG1 (ENSRFEG00010018396) ENSRFEG00010018329 FBXO43 (ENSRFEG00010018248) RGS22 (ENSRFEG00010017161) ENSRFEG00010017088 VPS13B (ENSRFEG00010016767) OSR2 (ENSRFEG00010016629) STK3 (ENSRFEG00010016550) Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Felidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Panthera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Panthera_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 leopard MODERN SPECIES 100 VIPR2 (ENSPPRG00000008355) DYNC2I1 (ENSPPRG00000009013) ESYT2 (ENSPPRG00000010108) NCAPG2 (ENSPPRG00000012938) ENSPPRG00000013187 DNAJB6 (ENSPPRG00000014279) UBE3C (ENSPPRG00000018222) ENSPPRG00000018523 ENSPPRG00000019502 LMBR1 (ENSPPRG00000000213) RNF32 (ENSPPRG00000000886) SHH (ENSPPRG00000001063) ENSPPRG00000001410 ENSPPRG00000001556 ##22 ENSPPRG00000001926 ENSPPRG00000002064 EN2 (ENSPPRG00000002234) INSIG1 (ENSPPRG00000002510) HTR5A (ENSPPRG00000002723) PAXIP1 (ENSPPRG00000003450) DPP6 (ENSPPRG00000006688) ENSPPRG00000007943 XRCC2 (ENSPPRG00000008124) CCT8L2 (ENSPPRG00000016812) KMT2C (ENSPPRG00000010608) GALNT11 (ENSPPRG00000011292) GALNTL5 (ENSPPRG00000012696) PRKAG2 (ENSPPRG00000017828) RHEB (ENSPPRG00000018707) Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 American mink MODERN SPECIES 22 TSN19 (ENSNVIG00000000703) LRRIQ1 (ENSNVIG00000000618) ALX1 (ENSNVIG00000000603) RASSF9 (ENSNVIG00000000592) NEUT (ENSNVIG00000000561) MGT4C (ENSNVIG00000000536) ENSNVIG00000000519 C12orf50 (ENSNVIG00000000495) C12orf29 (ENSNVIG00000000481) CEP290 (ENSNVIG00000000345) TMTC3 (ENSNVIG00000000330) ENSNVIG00000000305 DUSP6 (ENSNVIG00000000281) POC1B (ENSNVIG00000000231) ATP2B1 (ENSNVIG00000000007) ENSNVIG00000023933 ##22 CCER1 (ENSNVIG00000023927) EPYC (ENSNVIG00000023926) KERA (ENSNVIG00000023924) LUM (ENSNVIG00000023923) DCN (ENSNVIG00000023917) BTG1 (ENSNVIG00000023913) EEA1 (ENSNVIG00000023904) ENSNVIG00000023902 ENSNVIG00000023900 ENSNVIG00000023897 ENSNVIG00000023894 SOCS2 (ENSNVIG00000023891) Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Red fox MODERN SPECIES 98 TRAM1L1 (ENSVVUG00000008075) ENSVVUG00000008040 ENSVVUG00000008039 ENSVVUG00000008001 ENSVVUG00000007997 ENSVVUG00000007981 NDST4 (ENSVVUG00000007972) UGT8 (ENSVVUG00000007954) ARSJ (ENSVVUG00000007950) CAMK2D (ENSVVUG00000007922) ENSVVUG00000005739 ENSVVUG00000002513 LARP7 (ENSVVUG00000002274) ZGRF1 (ENSVVUG00000002203) ENSVVUG00000002181 ENSVVUG00000002176 ##22 NDUFA1 (ENSVVUG00000002163) ALPK1 (ENSVVUG00000002069) TIFA (ENSVVUG00000002050) AP1AR (ENSVVUG00000002032) ENSVVUG00000002024 ENSVVUG00000001983 PITX2 (ENSVVUG00000001959) ENSVVUG00000001947 ENPEP (ENSVVUG00000001907) ENSVVUG00000001891 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Dingo DUPLICATION Dingo MODERN SPECIES 326 CNOT10 (ENSCAFG00020001836) TRIM71 (ENSCAFG00020002354) CCR4 (ENSCAFG00020002363) GLB1 (ENSCAFG00020002368) TMPPE (ENSCAFG00020002374) CRTAP (ENSCAFG00020002375) ENSCAFG00020002378 ENSCAFG00020002380 ENSCAFG00020002387 FBXL2 (ENSCAFG00020002395) UBP1 (ENSCAFG00020002404) CLASP2 (ENSCAFG00020002594) SNRK (ENSCAFG00020005597) ANO10 (ENSCAFG00020005621) ENSCAFG00020005627 ENSCAFG00020005630 ##22 ABHD5 (ENSCAFG00020005633) ENSCAFG00020005662 TOPAZ1 (ENSCAFG00020005672) TCAIM (ENSCAFG00020005698) ZNF445 (ENSCAFG00020005703) ENSCAFG00020005711 ENSCAFG00020005712 ENSCAFG00020005719 NINL (ENSCAFG00020005723) GINS1 (ENSCAFG00020005786) ENSCAFG00020005810 PYGB (ENSCAFG00020005902) ENTPD6 (ENSCAFG00020005916) VSX1 (ENSCAFG00020005925) ACSS1 (ENSCAFG00020005947) Dingo MODERN SPECIES 271 RABGAP1L (ENSCAFG00020017104) RC3H1 (ENSCAFG00020017112) SERPINC1 (ENSCAFG00020017142) ZBTB37 (ENSCAFG00020017191) DARS2 (ENSCAFG00020017227) CENPL (ENSCAFG00020017339) KLHL20 (ENSCAFG00020017347) ANKRD45 (ENSCAFG00020017352) TEX50 (ENSCAFG00020017355) ENSCAFG00020017360 PRDX6 (ENSCAFG00020017363) ENSCAFG00020017364 ENSCAFG00020017375 TNFSF18 (ENSCAFG00020017381) ENSCAFG00020017383 ENSCAFG00020017386 ##22 ENSCAFG00020017389 ENSCAFG00020017391 FASLG (ENSCAFG00020017393) SUCO (ENSCAFG00020017469) C1orf105 (ENSCAFG00020018674) PIGC (ENSCAFG00020018676) ENSCAFG00020018678 DNM3 (ENSCAFG00020018810) METTL13 (ENSCAFG00020021213) VAMP4 (ENSCAFG00020021237) MYOC (ENSCAFG00020021241) PRRC2C (ENSCAFG00020021350) FMO4 (ENSCAFG00020022037) FMO1 (ENSCAFG00020022043) FMO2 (ENSCAFG00020022048) Marsupialia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.a ##22 Tasmanian devil MODERN SPECIES ENSSHAG00000026741 CCIN (ENSSHAG00000007165) CLTA (ENSSHAG00000024140) GNE (ENSSHAG00000008041) RNF38 (ENSSHAG00000022975) MELK (ENSSHAG00000010319) PAX5 (ENSSHAG00000012375) ENSSHAG00000014234 ZCCHC7 (ENSSHAG00000014544) GRHPR (ENSSHAG00000015897) ZBTB5 (ENSSHAG00000015981) POLR1E (ENSSHAG00000021869) FBXO10 (ENSSHAG00000016176) ENSSHAG00000016364 ENSSHAG00000030934 ENSSHAG00000027500 ##22 FRMPD1 (ENSSHAG00000016751) TRMT10B (ENSSHAG00000016905) EXOSC3 (ENSSHAG00000024727) ENSSHAG00000016975 ENSSHAG00000017042 ENSSHAG00000027920 SHB (ENSSHAG00000027399) ALDH1B1 (ENSSHAG00000014168) ENSSHAG00000014227 ENSSHAG00000009588 ENSSHAG00000014496 ENSSHAG00000014857 ENSSHAG00000029355 ENSSHAG00000015254 TMOD1 (ENSSHAG00000015336) Opossum MODERN SPECIES 2 ST18 (ENSMODG00000009635) ENSMODG00000025613 RB1CC1 (ENSMODG00000009612) NPBWR1 (ENSMODG00000009573) OPRK1 (ENSMODG00000009510) ENSMODG00000040801 ATP6V1H (ENSMODG00000009431) ENSMODG00000024926 RGS20 (ENSMODG00000009398) ENSMODG00000009389 LYPLA1 (ENSMODG00000009367) MRPL15 (ENSMODG00000009360) ENSMODG00000024927 ENSMODG00000027805 ENSMODG00000009188 ENSMODG00000044310 ##22 XKR4 (ENSMODG00000025611) TMEM68 (ENSMODG00000009183) TGS1 (ENSMODG00000009174) LYN (ENSMODG00000009142) RPS20 (ENSMODG00000045434) MOS (ENSMODG00000024929) PLAG1 (ENSMODG00000043175) ENSMODG00000024930 SDR16C5 (ENSMODG00000009095) ENSMODG00000009075 PENK (ENSMODG00000049693) ENSMODG00000038941 BPNT2 (ENSMODG00000008961) FAM110B (ENSMODG00000008907) UBXN2B (ENSMODG00000008866) Theria DUPLICATION Theria DUPLICATION Theria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a ##22 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a ##22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.m.b.a.a ##22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT01100000267007 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 Kangaroo rat MODERN SPECIES 388 D6Wsu163e (ENSDORG00000024396) ENSDORG00000030145 Akap3 (ENSDORG00000015855) Ndufa9 (ENSDORG00000001278) Kcna6 (ENSDORG00000005125) Kcna1 (ENSDORG00000012602) Ntf3 (ENSDORG00000029285) #9 Ano2 (ENSDORG00000025195) Vwf (ENSDORG00000026775) #10 Cd9 (ENSDORG00000013724) #12 Plekhg6 (ENSDORG00000006748) #13 Scnn1a (ENSDORG00000003134) #15 Vamp1 (ENSDORG00000015989) #19 Mrpl51 (ENSDORG00000028160) #20 Ncapd2 (ENSDORG00000015992) #21 ENSDORG00000027336 ##22 Chd4 (ENSDORG00000001847) #25 Lpar5 (ENSDORG00000026918) #26 Ing4 (ENSDORG00000015718) #28 Zfp384 (ENSDORG00000015720) #29 Pianp (ENSDORG00000024889) #30 ENSDORG00000025741 #31 ENSDORG00000015958 ENSDORG00000024725 Lag3 (ENSDORG00000001547) #35 Gpr162 (ENSDORG00000019800) #37 P3h3 (ENSDORG00000011727) Gnb3 (ENSDORG00000016512) Cdca3 (ENSDORG00000013173) Usp5 (ENSDORG00000013174) Tpi1 (ENSDORG00000013175) Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.m.b.a.a ##22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT01100000267007 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 Muroidea ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.m.b.a.a ##22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT01100000267007 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 Muroidea_A DUPLICATION Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a.a ##22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.m.b.a.a.a ##22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01100000264105 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00950000182825.B ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.m.b.a.a.a ##22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01100000264105 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Chinese hamster chok1gshd DUPLICATION Chinese hamster chok1gshd DUPLICATION Chinese hamster chok1gshd DUPLICATION Chinese hamster chok1gshd DUPLICATION Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 289 Ntf3 (ENSCGRG00001015283) #9 Ano2 (ENSCGRG00001013479) Vwf (ENSCGRG00001000364) #10 Cd9 (ENSCGRG00001022703) #12 ENSCGRG00001015575 Plekhg6 (ENSCGRG00001021507) #13 Tnfrsf1a (ENSCGRG00001021062) #14 Scnn1a (ENSCGRG00001020304) #15 Ltbr (ENSCGRG00001015407) #16 ENSCGRG00001013937 Cd27 (ENSCGRG00001009970) ENSCGRG00001020124 #18 Vamp1 (ENSCGRG00001014055) #19 ENSCGRG00001010566 #20 Ncapd2 (ENSCGRG00001002247) #21 ENSCGRG00001006857 ##22 Iffo1 (ENSCGRG00001000162) #23 Nop2 (ENSCGRG00001020970) Chd4 (ENSCGRG00001020662) #25 Lpar5 (ENSCGRG00001014775) #26 Acrbp (ENSCGRG00001017982) #27 Ing4 (ENSCGRG00001016033) #28 Zfp384 (ENSCGRG00001013065) #29 Pianp (ENSCGRG00001015100) #30 Cops7a (ENSCGRG00001014256) #31 Mlf2 (ENSCGRG00001010430) #32 Ptms (ENSCGRG00001001584) Lag3 (ENSCGRG00001022458) #35 Cd4 (ENSCGRG00001013261) #36 Gpr162 (ENSCGRG00001003162) #37 P3h3 (ENSCGRG00001000528) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 188 Trim69 (ENSCGRG00001016620) Terb2 (ENSCGRG00001009237) Sord (ENSCGRG00001006100) Duox2 (ENSCGRG00001024853) Duoxa2 (ENSCGRG00001002266) Duoxa1 (ENSCGRG00001023908) Duox1 (ENSCGRG00001021686) Shf (ENSCGRG00001024124) ENSCGRG00001023496 Gatm (ENSCGRG00001021815) Spata5l1 (ENSCGRG00001022792) AA467197 (ENSCGRG00001022257) Slc30a4 (ENSCGRG00001015143) Bloc1s6 (ENSCGRG00001023580) Sqor (ENSCGRG00001021599) ENSCGRG00001010885 ##22 Sema6d (ENSCGRG00001005980) Slc24a5 (ENSCGRG00001014479) ENSCGRG00001024080 Ctxn2 (ENSCGRG00001010557) Slc12a1 (ENSCGRG00001018507) ENSCGRG00001010033 Fbn1 (ENSCGRG00001019162) Cep152 (ENSCGRG00001000747) Eid1 (ENSCGRG00001010267) Shc4 (ENSCGRG00001000927) Secisbp2l (ENSCGRG00001018900) Cops2 (ENSCGRG00001014155) Galk2 (ENSCGRG00001023593) ENSCGRG00001022441 Fgf7 (ENSCGRG00001021672) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 92 Lims2 (ENSCGRG00001024065) ENSCGRG00001000872 Sft2d3 (ENSCGRG00001018784) Wdr33 (ENSCGRG00001018500) Polr2d (ENSCGRG00001013608) Ammecr1l (ENSCGRG00001015916) Sap130 (ENSCGRG00001007656) ENSCGRG00001010765 ENSCGRG00001009399 Slc25a46 (ENSCGRG00001020573) Syt4 (ENSCGRG00001014925) Rit2 (ENSCGRG00001005747) Pik3c3 (ENSCGRG00001012349) ENSCGRG00001023989 ENSCGRG00001018958 ENSCGRG00001014391 ##22 Celf4 (ENSCGRG00001018085) AW554918 (ENSCGRG00001004328) Tpgs2 (ENSCGRG00001016331) Fhod3 (ENSCGRG00001001610) Elp2 (ENSCGRG00001007789) Slc39a6 (ENSCGRG00001014525) Rprd1a (ENSCGRG00001013116) 2700062C07Rik (ENSCGRG00001016462) Galnt1 (ENSCGRG00001009490) Ino80c (ENSCGRG00001023869) Zfp24 (ENSCGRG00001022125) Zfp35 (ENSCGRG00001021560) ENSCGRG00001000297 Zfp397 (ENSCGRG00001023645) Mapre2 (ENSCGRG00001018790) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 144 Gdf3 (ENSCGRG00001012294) Apobec1 (ENSCGRG00001011130) Aicda (ENSCGRG00001009654) Mfap5 (ENSCGRG00001004460) ENSCGRG00001000042 ##22 Rimklb (ENSCGRG00001022642) Phc1 (ENSCGRG00001019563) M6pr (ENSCGRG00001016862) Klrg1 (ENSCGRG00001016252) ENSCGRG00001014902 ENSCGRG00001011744 ENSCGRG00001005252 A2m (ENSCGRG00001019386) Iqsec3 (ENSCGRG00001017723) Slc6a12 (ENSCGRG00001014552) Slc6a13 (ENSCGRG00001010837) Usp18 (ENSCGRG00001008570) Tuba8 (ENSCGRG00001006489) Pex26 (ENSCGRG00001000447) Mical3 (ENSCGRG00001021782) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 1 Ankrd37 (ENSCGRG00001015273) Lrp2bp (ENSCGRG00001005458) Snx25 (ENSCGRG00001013747) Cfap97 (ENSCGRG00001012133) Slc25a4 (ENSCGRG00001007127) ENSCGRG00001003795 Helt (ENSCGRG00001013119) Acsl1 (ENSCGRG00001012242) Cenpu (ENSCGRG00001024299) Primpol (ENSCGRG00001016107) CASP 3 (ENSCGRG00001015469) Irf2 (ENSCGRG00001014578) ENSCGRG00001014136 Enpp6 (ENSCGRG00001013812) Stox2 (ENSCGRG00001013096) ENSCGRG00001003901 ##22 Trappc11 (ENSCGRG00001018304) Rwdd4a (ENSCGRG00001018945) Ing2 (ENSCGRG00001017801) Cdkn2aip (ENSCGRG00001016194) ENSCGRG00001015210 Wwc2 (ENSCGRG00001016882) Dctd (ENSCGRG00001016053) Tenm3 (ENSCGRG00001021107) Aga (ENSCGRG00001019108) Neil3 (ENSCGRG00001018596) Vegfc (ENSCGRG00001014310) Spcs3 (ENSCGRG00001013944) Asb5 (ENSCGRG00001013169) Spata4 (ENSCGRG00001012374) Wdr17 (ENSCGRG00001010983) Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.m.b.a.a.a ##22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01100000264105 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Prairie vole DUPLICATION Prairie vole DUPLICATION Prairie vole DUPLICATION Prairie vole DUPLICATION Prairie vole DUPLICATION Prairie vole MODERN SPECIES 80 Fam163a (ENSMOCG00000020187) Tor1aip2 (ENSMOCG00000014435) ENSMOCG00000006601 Tor1aip1 (ENSMOCG00000016290) ENSMOCG00000009954 Cep350 (ENSMOCG00000016460) Qsox1 (ENSMOCG00000008140) Lhx4 (ENSMOCG00000020771) Acbd6 (ENSMOCG00000020443) Xpr1 (ENSMOCG00000011713) BC034090 (ENSMOCG00000009825) Stx6 (ENSMOCG00000000832) Mr1 (ENSMOCG00000020384) Ier5 (ENSMOCG00000001094) Cacna1e (ENSMOCG00000019081) ENSMOCG00000007666 ##22 ENSMOCG00000022939 Rgsl1 (ENSMOCG00000017154) Rnasel (ENSMOCG00000009828) Rgs16 (ENSMOCG00000009143) Rgs8 (ENSMOCG00000008371) ENSMOCG00000014924 Npl (ENSMOCG00000003625) Dhx9 (ENSMOCG00000019404) Shcbp1l (ENSMOCG00000019422) Lamc1 (ENSMOCG00000009799) Lamc2 (ENSMOCG00000021091) Nmnat2 (ENSMOCG00000020545) Smg7 (ENSMOCG00000020748) Ncf2 (ENSMOCG00000020870) ENSMOCG00000017610 Prairie vole MODERN SPECIES 80 ENSMOCG00000009954 Tor1aip1 (ENSMOCG00000016290) ENSMOCG00000006601 Tor1aip2 (ENSMOCG00000014435) Fam163a (ENSMOCG00000020187) Tdrd5 (ENSMOCG00000005624) Nphs2 (ENSMOCG00000016752) Axdnd1 (ENSMOCG00000005137) ENSMOCG00000017817 Soat1 (ENSMOCG00000016867) Abl2 (ENSMOCG00000002257) Tor3a (ENSMOCG00000007507) Fam20b (ENSMOCG00000002075) Ralgps2 (ENSMOCG00000014796) Angptl1 (ENSMOCG00000023001) ENSMOCG00000005700 ##22 Tex35 (ENSMOCG00000004939) Rasal2 (ENSMOCG00000020510) Cryzl2 (ENSMOCG00000019394) Sec16b (ENSMOCG00000021485) ENSMOCG00000007911 Brinp2 (ENSMOCG00000012372) Astn1 (ENSMOCG00000022681) Pappa2 (ENSMOCG00000001768) Cop1 (ENSMOCG00000016946) Tnr (ENSMOCG00000005133) Tnn (ENSMOCG00000019938) Mrps14 (ENSMOCG00000019730) Cacybp (ENSMOCG00000022835) ENSMOCG00000001406 Gpr52 (ENSMOCG00000007360) Prairie vole MODERN SPECIES 1 ENSMOCG00000017305 Hook1 (ENSMOCG00000020291) ENSMOCG00000016214 Fggy (ENSMOCG00000017533) Jun (ENSMOCG00000006483) Mysm1 (ENSMOCG00000001327) Eqtn (ENSMOCG00000018858) Tek (ENSMOCG00000017310) Lrrc19 (ENSMOCG00000008422) Ift74 (ENSMOCG00000002321) Plaa (ENSMOCG00000017762) Caap1 (ENSMOCG00000012535) ENSMOCG00000003689 Tusc1 (ENSMOCG00000019464) Izumo3 (ENSMOCG00000019669) ENSMOCG00000018411 ##22 Elavl2 (ENSMOCG00000016960) ENSMOCG00000004079 Dmrta1 (ENSMOCG00000002337) Cdkn2b (ENSMOCG00000015669) ENSMOCG00000013892 Mtap (ENSMOCG00000012400) ENSMOCG00000003644 ENSMOCG00000004406 ENSMOCG00000003427 ENSMOCG00000004176 Klhl9 (ENSMOCG00000003966) ENSMOCG00000022936 ENSMOCG00000002912 ENSMOCG00000003333 ENSMOCG00000003596 Prairie vole MODERN SPECIES 7 Gatc (ENSMOCG00000005051) Triap1 (ENSMOCG00000005593) ENSMOCG00000006758 Msi1 (ENSMOCG00000002286) Pla2g1b (ENSMOCG00000010330) Sirt4 (ENSMOCG00000016396) Pxn (ENSMOCG00000014430) ENSMOCG00000012309 Gcn1 (ENSMOCG00000000746) Rab35 (ENSMOCG00000019999) Bicdl1 (ENSMOCG00000019402) Cit (ENSMOCG00000012761) Prkab1 (ENSMOCG00000006183) Tmem233 (ENSMOCG00000002502) Ccdc60 (ENSMOCG00000011345) ENSMOCG00000007613 ##22 Hspb8 (ENSMOCG00000009705) Srrm4 (ENSMOCG00000006737) Suds3 (ENSMOCG00000001519) Taok3 (ENSMOCG00000015684) ENSMOCG00000001486 Vsig10 (ENSMOCG00000014068) Wsb2 (ENSMOCG00000021973) Rfc5 (ENSMOCG00000013450) Ksr2 (ENSMOCG00000016878) Nos1 (ENSMOCG00000000970) Fbxo21 (ENSMOCG00000011172) Tesc (ENSMOCG00000013995) Fbxw8 (ENSMOCG00000020447) Rnft2 (ENSMOCG00000022819) Spring1 (ENSMOCG00000013278) Prairie vole DUPLICATION Prairie vole MODERN SPECIES 84 Kcna5 (ENSMOCG00000002810) #7 ENSMOCG00000015356 Ntf3 (ENSMOCG00000001488) #9 Ano2 (ENSMOCG00000000380) Vwf (ENSMOCG00000005320) #10 Cd9 (ENSMOCG00000022019) #12 Plekhg6 (ENSMOCG00000006971) #13 Tnfrsf1a (ENSMOCG00000013868) #14 Scnn1a (ENSMOCG00000000794) #15 Ltbr (ENSMOCG00000015975) #16 Cd27 (ENSMOCG00000017717) Tapbpl (ENSMOCG00000000244) #18 Vamp1 (ENSMOCG00000019201) #19 Mrpl51 (ENSMOCG00000013685) #20 ENSMOCG00000000297 #21 ENSMOCG00000000471 ##22 Iffo1 (ENSMOCG00000003850) #23 Nop2 (ENSMOCG00000017237) Chd4 (ENSMOCG00000020624) #25 Lpar5 (ENSMOCG00000021762) #26 Acrbp (ENSMOCG00000017657) #27 Ing4 (ENSMOCG00000010335) #28 Zfp384 (ENSMOCG00000022768) #29 Pianp (ENSMOCG00000012046) #30 Cops7a (ENSMOCG00000018184) #31 ENSMOCG00000000196 #32 Ptms (ENSMOCG00000011411) Lag3 (ENSMOCG00000016856) #35 Cd4 (ENSMOCG00000007576) #36 Gpr162 (ENSMOCG00000018395) #37 P3h3 (ENSMOCG00000014085) Prairie vole MODERN SPECIES 102 Atp6v1c1 (ENSMOCG00000003343) Baalc (ENSMOCG00000016406) Fzd6 (ENSMOCG00000018634) Cthrc1 (ENSMOCG00000003229) ENSMOCG00000001296 Slc25a32 (ENSMOCG00000014663) Dcaf13 (ENSMOCG00000011609) ENSMOCG00000017431 Rims2 (ENSMOCG00000001988) Dcstamp (ENSMOCG00000005844) Dpys (ENSMOCG00000003058) Lrp12 (ENSMOCG00000018668) ENSMOCG00000019475 ##22 Zfpm2 (ENSMOCG00000013738) ENSMOCG00000018803 Abra (ENSMOCG00000011808) Angpt1 (ENSMOCG00000015180) Rspo2 (ENSMOCG00000017286) Eif3e (ENSMOCG00000014831) Emc2 (ENSMOCG00000004849) Tmem74 (ENSMOCG00000003138) Trhr (ENSMOCG00000020887) Nudcd1 (ENSMOCG00000001394) Eny2 (ENSMOCG00000012387) Pkhd1l1 (ENSMOCG00000020807) Ebag9 (ENSMOCG00000008680) Sybu (ENSMOCG00000008712) ENSMOCG00000008423 Prairie vole MODERN SPECIES 357 Bpifa2 (ENSMOCG00000020017) Bpifa3 (ENSMOCG00000007021) Bpifa1 (ENSMOCG00000022067) Bpifa5 (ENSMOCG00000015053) Bpifb1 (ENSMOCG00000011657) Bpifb5 (ENSMOCG00000002643) Cdk5rap1 (ENSMOCG00000002846) Snta1 (ENSMOCG00000005630) Cbfa2t2 (ENSMOCG00000015541) 1700003F12Rik (ENSMOCG00000019597) Necab3 (ENSMOCG00000000497) E2f1 (ENSMOCG00000012464) Pxmp4 (ENSMOCG00000003745) Zfp341 (ENSMOCG00000004075) Chmp4b (ENSMOCG00000022208) ENSMOCG00000017228 ##22 Raly (ENSMOCG00000009450) Eif2s2 (ENSMOCG00000012809) a (ENSMOCG00000006735) ENSMOCG00000021599 Itch (ENSMOCG00000015148) Dynlrb1 (ENSMOCG00000001553) Map1lc3a (ENSMOCG00000022232) Pigu (ENSMOCG00000012991) Trp53inp2 (ENSMOCG00000000724) ENSMOCG00000000295 Ggt7 (ENSMOCG00000012611) Acss2 (ENSMOCG00000001936) Gss (ENSMOCG00000015352) Myh7b (ENSMOCG00000021150) Trpc4ap (ENSMOCG00000006945) Northern American deer mouse DUPLICATION Northern American deer mouse MODERN SPECIES 16 Ntf3 (ENSPEMG00000016431) #9 Ano2 (ENSPEMG00000014319) Vwf (ENSPEMG00000010217) #10 Cd9 (ENSPEMG00000008270) #12 Plekhg6 (ENSPEMG00000013888) #13 Tnfrsf1a (ENSPEMG00000009612) #14 Scnn1a (ENSPEMG00000012010) #15 Ltbr (ENSPEMG00000014957) #16 ENSPEMG00000025965 Cd27 (ENSPEMG00000012177) ENSPEMG00000028083 Tapbpl (ENSPEMG00000003668) #18 Vamp1 (ENSPEMG00000006934) #19 Mrpl51 (ENSPEMG00000008667) #20 Ncapd2 (ENSPEMG00000016112) #21 ENSPEMG00000001195 ##22 Iffo1 (ENSPEMG00000008539) #23 Nop2 (ENSPEMG00000013138) Chd4 (ENSPEMG00000010290) #25 Lpar5 (ENSPEMG00000019056) #26 Acrbp (ENSPEMG00000010165) #27 Ing4 (ENSPEMG00000018496) #28 Zfp384 (ENSPEMG00000016282) #29 Pianp (ENSPEMG00000013120) #30 Cops7a (ENSPEMG00000002860) #31 Mlf2 (ENSPEMG00000013094) #32 ENSPEMG00000016593 Lag3 (ENSPEMG00000018743) #35 ENSPEMG00000024347 #36 Gpr162 (ENSPEMG00000017095) #37 P3h3 (ENSPEMG00000011450) Northern American deer mouse MODERN SPECIES 330 ENSPEMG00000012067 ##22 Muroidea_A DUPLICATION Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.m.b.a.a.b.a ##22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT01100000267007 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01100000264105 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 Murinae DUPLICATION Murinae DUPLICATION Murinae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000158576 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.m.b.a.a.b.a.a.a ##22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT01100000267007 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01100000264105 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 Mus ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000158576 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.m.b.a.a.b.a.a.a ##22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01100000264105 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Mus_A ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000158576 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.m.b.a.a.b.a.a.a ##22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01100000264105 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Mus_B DUPLICATION Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a.b.a.a.a.a ##22 Mouse MODERN SPECIES 17 Smad1 (ENSMUSG00000031681) Mmaa (ENSMUSG00000037022) 1700011L22Rik (ENSMUSG00000031682) Zfp827 (ENSMUSG00000071064) Lsm6 (ENSMUSG00000031683) Slc10a7 (ENSMUSG00000031684) Rbmxl1 (ENSMUSG00000037070) Pou4f2 (ENSMUSG00000031688) Ttc29 (ENSMUSG00000037101) Ednra (ENSMUSG00000031616) Tmem184c (ENSMUSG00000031617) Prmt9 (ENSMUSG00000037134) Arhgap10 (ENSMUSG00000037148) Nr3c2 (ENSMUSG00000031618) Iqcm (ENSMUSG00000031620) Gm10358 (ENSMUSG00000110469) ##22 Rasd2 (ENSMUSG00000034472) Mcm5 (ENSMUSG00000005410) Hmox1 (ENSMUSG00000005413) Tom1 (ENSMUSG00000042870) Hmgxb4 (ENSMUSG00000034518) Isx (ENSMUSG00000031621) Large1 (ENSMUSG00000004383) F2rl3 (ENSMUSG00000050147) Sin3b (ENSMUSG00000031622) Nwd1 (ENSMUSG00000048148) Tmem38a (ENSMUSG00000031791) Smim7 (ENSMUSG00000044600) Med26 (ENSMUSG00000045248) Slc35e1 (ENSMUSG00000019731) Cherp (ENSMUSG00000052488) Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a.b.a.a.a.a ##22 Steppe mouse MODERN SPECIES 3024 ENSMSIG00000005560 ##22 ENSMSIG00000005551 Uggt1 (ENSMSIG00000005383) Neurl3 (ENSMSIG00000005348) Arid5a (ENSMSIG00000005133) Kansl3 (ENSMSIG00000004959) Fer1l5 (ENSMSIG00000004804) ENSMSIG00000004755 Cnnm4 (ENSMSIG00000004737) ENSMSIG00000004727 Ankrd23 (ENSMSIG00000004650) Ankrd39 (ENSMSIG00000004625) Sema4c (ENSMSIG00000004577) ENSMSIG00000004554 Fam178b (ENSMSIG00000004445) ENSMSIG00000004406 Mus_B DUPLICATION Mus_B DUPLICATION Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a.b.a.a.a.b.a.a ##22 Mouse MODERN SPECIES 5 Il3ra (ENSMUSG00000068758) Or2t1 (ENSMUSG00000072707) Or2t6 (ENSMUSG00000052417) Psmd6 (ENSMUSG00000021737) Atxn7 (ENSMUSG00000021738) Thoc7 (ENSMUSG00000053453) Gm11100 (ENSMUSG00000079357) Cdhr18 (ENSMUSG00000084902) Sntn (ENSMUSG00000044772) Synpr (ENSMUSG00000056296) Cadps (ENSMUSG00000054423) Fezf2 (ENSMUSG00000021743) Gm49355 (ENSMUSG00000114378) 3830406C13Rik (ENSMUSG00000033111) PTPRG (ENSMUSG00000121513) Gm3839 (ENSMUSG00000097148) ##22 Fhit (ENSMUSG00000060579) Cfap20dc (ENSMUSG00000021747) Fam3d (ENSMUSG00000021749) Fam107a (ENSMUSG00000021750) Acox2 (ENSMUSG00000021751) Kctd6 (ENSMUSG00000021752) Pdhb (ENSMUSG00000021748) Pxk (ENSMUSG00000033885) Rpp14 (ENSMUSG00000023156) Abhd6 (ENSMUSG00000025277) Dnase1l3 (ENSMUSG00000025279) Gm45521 (ENSMUSG00000109649) Flnb (ENSMUSG00000025278) Gm10128 (ENSMUSG00000063277) Gm10338 (ENSMUSG00000094706) Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a.b.a.a.a.b.a.a ##22 Steppe mouse MODERN SPECIES 3264 Ube2f (ENSMSIG00000025282) ENSMSIG00000025346 Rbm44 (ENSMSIG00000025367) Lrrfip1 (ENSMSIG00000025383) ENSMSIG00000025514 Prlh (ENSMSIG00000025590) Mlph (ENSMSIG00000025599) Col6a3 (ENSMSIG00000025643) ENSMSIG00000025965 Cops8 (ENSMSIG00000025975) Ackr3 (ENSMSIG00000025992) Iqca (ENSMSIG00000026003) Asb18 (ENSMSIG00000026105) Gbx2 (ENSMSIG00000026131) Agap1 (ENSMSIG00000026135) ENSMSIG00000026271 ##22 Sh3bp4 (ENSMSIG00000026285) Arl4c (ENSMSIG00000026322) ENSMSIG00000026330 ENSMSIG00000026335 Spp2 (ENSMSIG00000026338) Trpm8 (ENSMSIG00000026361) Hjurp (ENSMSIG00000026452) ENSMSIG00000026481 Mroh2a (ENSMSIG00000026486) Ugt1a1 (ENSMSIG00000026581) Dnajb3 (ENSMSIG00000026596) Mus_B ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00950000182825.B ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.m.b.a.a.b.a.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904.e.a #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01100000264105 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Mus_C ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00950000182825.B ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.m.b.a.a.b.a.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904.e.a #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00940000168330 ENSGT01100000264105 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Steppe mouse DUPLICATION Steppe mouse MODERN SPECIES 2453 Plekhg6 (ENSMSIG00000007258) #13 Tnfrsf1a (ENSMSIG00000007222) #14 Scnn1a (ENSMSIG00000007175) #15 Ltbr (ENSMSIG00000007137) #16 ENSMSIG00000007122 Cd27 (ENSMSIG00000007002) Tapbpl (ENSMSIG00000006978) #18 Vamp1 (ENSMSIG00000006906) #19 Mrpl51 (ENSMSIG00000006876) #20 Ncapd2 (ENSMSIG00000006811) #21 ENSMSIG00000006759 ##22 Iffo1 (ENSMSIG00000006668) #23 Nop2 (ENSMSIG00000006620) Chd4 (ENSMSIG00000006341) #25 Lpar5 (ENSMSIG00000006314) #26 Acrbp (ENSMSIG00000006066) #27 Ing4 (ENSMSIG00000005976) #28 Zfp384 (ENSMSIG00000005490) #29 Pianp (ENSMSIG00000005454) #30 Cops7a (ENSMSIG00000005376) #31 Steppe mouse MODERN SPECIES 3257 ENSMSIG00000011119 ENSMSIG00000011113 ##22 ENSMSIG00000011080 Pou3f2 (ENSMSIG00000011067) Fbxl4 (ENSMSIG00000011047) Faxc (ENSMSIG00000010979) Coq3 (ENSMSIG00000010952) Pnisr (ENSMSIG00000010869) Usp45 (ENSMSIG00000010762) Tstd3 (ENSMSIG00000010751) Ccnc (ENSMSIG00000010655) Prdm13 (ENSMSIG00000010623) ENSMSIG00000010612 Mouse MODERN SPECIES 15 Kcna5 (ENSMUSG00000045534) #7 Ntf3 (ENSMUSG00000049107) #9 Ano2 (ENSMUSG00000038115) Vwf (ENSMUSG00000001930) #10 Cd9 (ENSMUSG00000030342) #12 Plekhg6 (ENSMUSG00000038167) #13 Tnfrsf1a (ENSMUSG00000030341) #14 Scnn1a (ENSMUSG00000030340) #15 Ltbr (ENSMUSG00000030339) #16 Tuba3a (ENSMUSG00000067702) Cd27 (ENSMUSG00000030336) Tapbpl (ENSMUSG00000038213) #18 Vamp1 (ENSMUSG00000030337) #19 Mrpl51 (ENSMUSG00000030335) #20 Ncapd2 (ENSMUSG00000038252) #21 Gapdh (ENSMUSG00000057666) ##22 Iffo1 (ENSMUSG00000038271) #23 Nop2 (ENSMUSG00000038279) Chd4 (ENSMUSG00000063870) #25 Lpar5 (ENSMUSG00000067714) #26 Acrbp (ENSMUSG00000072770) #27 Ing4 (ENSMUSG00000030330) #28 Zfp384 (ENSMUSG00000038346) #29 Pianp (ENSMUSG00000030329) #30 Cops7a (ENSMUSG00000030127) #31 Mlf2 (ENSMUSG00000030120) #32 Ptms (ENSMUSG00000030122) Lag3 (ENSMUSG00000030124) #35 Cd4 (ENSMUSG00000023274) #36 Gpr162 (ENSMUSG00000038390) #37 P3h3 (ENSMUSG00000023191) Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a.b.a.a.a.b.b ##22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a.b.a.a.a.b.b ##22 Steppe mouse DUPLICATION Steppe mouse MODERN SPECIES 3380 Slc25a38 (ENSMSIG00000002254) ENSMSIG00000002215 Rpsa (ENSMSIG00000002112) Mobp (ENSMSIG00000026540) ENSMSIG00000026519 Myrip (ENSMSIG00000026454) ENSMSIG00000026436 Entpd3 (ENSMSIG00000026423) Rpl14 (ENSMSIG00000026415) ENSMSIG00000026396 Ctnnb1 (ENSMSIG00000026366) Ulk4 (ENSMSIG00000023580) Trak1 (ENSMSIG00000023343) Cck (ENSMSIG00000023310) Lyzl4 (ENSMSIG00000023296) ENSMSIG00000023284 ##22 Vipr1 (ENSMSIG00000023239) Ss18l2 (ENSMSIG00000023200) Nktr (ENSMSIG00000023148) Zfp651 (ENSMSIG00000023124) Klhl40 (ENSMSIG00000023110) Hhatl (ENSMSIG00000023088) Ccdc13 (ENSMSIG00000023071) Higd1a (ENSMSIG00000023055) Ackr2 (ENSMSIG00000023045) Cyp8b1 (ENSMSIG00000023040) Gask1a (ENSMSIG00000023006) Pomgnt2 (ENSMSIG00000023000) Snrk (ENSMSIG00000022916) Ano10 (ENSMSIG00000022790) Abhd5 (ENSMSIG00000022728) Steppe mouse MODERN SPECIES 46 Ttc19 (ENSMSIG00000018495) ENSMSIG00000018478 Ncor1 (ENSMSIG00000017542) Pigl (ENSMSIG00000017496) ENSMSIG00000017486 ENSMSIG00000017479 Trpv2 (ENSMSIG00000017440) Lrrc75a (ENSMSIG00000017410) Mmgt2 (ENSMSIG00000017400) Zfp287 (ENSMSIG00000017280) ENSMSIG00000017266 Zfp286 (ENSMSIG00000017187) Fbxw10 (ENSMSIG00000016995) Tvp23b (ENSMSIG00000016977) Cdrt4 (ENSMSIG00000016960) ENSMSIG00000016949 ##22 Tekt3 (ENSMSIG00000016911) Pmp22 (ENSMSIG00000016837) ENSMSIG00000016830 ENSMSIG00000016811 ENSMSIG00000016798 ENSMSIG00000016790 ENSMSIG00000016785 Rat DUPLICATION Rat MODERN SPECIES 15 C5h9orf152 (ENSRNOG00000012068) Akap2 (ENSRNOG00000011504) Ptpn3 (ENSRNOG00000011425) Epb41l4b (ENSRNOG00000056550) Frrs1l (ENSRNOG00000043103) Tmem245 (ENSRNOG00000026271) Ctnnal1 (ENSRNOG00000010593) Abitram (ENSRNOG00000010532) Elp1 (ENSRNOG00000016725) Actl7a (ENSRNOG00000016641) Actl7b (ENSRNOG00000016621) AABR07048312.1 (ENSRNOG00000029600) Klf4 (ENSRNOG00000016299) Rad23b (ENSRNOG00000016137) ENSRNOG00000063835 ENSRNOG00000066746 ##22 ENSRNOG00000067901 Zfp462 (ENSRNOG00000032048) LOC120103152 (ENSRNOG00000034161) ENSRNOG00000065525 LOC685311 (ENSRNOG00000065946) RGD1564956 (ENSRNOG00000017640) Tmem38b (ENSRNOG00000028063) Tal2 (ENSRNOG00000028082) Fktn (ENSRNOG00000028129) LOC100360453 (ENSRNOG00000033177) Fsd1l (ENSRNOG00000059876) Slc44a1 (ENSRNOG00000055089) Abca1 (ENSRNOG00000018126) AABR07048271.1 (ENSRNOG00000033271) Nipsnap3a (ENSRNOG00000010332) Rat MODERN SPECIES 14 Kcna5 (ENSRNOG00000019719) #7 Ntf3 (ENSRNOG00000019716) #9 Ano2 (ENSRNOG00000023561) Vwf (ENSRNOG00000019689) #10 Cd9 (ENSRNOG00000019556) #12 ENSRNOG00000064217 Plekhg6 (ENSRNOG00000019528) #13 Tnfrsf1a (ENSRNOG00000031312) #14 Scnn1a (ENSRNOG00000019368) #15 Ltbr (ENSRNOG00000019264) #16 Tuba3b (ENSRNOG00000031707) Cd27 (ENSRNOG00000027466) Vamp1 (ENSRNOG00000019219) #19 Mrpl51 (ENSRNOG00000019165) #20 Ncapd2 (ENSRNOG00000055300) #21 LOC108351137 (ENSRNOG00000018630) ##22 Iffo1 (ENSRNOG00000018533) #23 Nop2 (ENSRNOG00000018453) Chd4 (ENSRNOG00000018309) #25 Lpar5 (ENSRNOG00000021401) #26 Ing4 (ENSRNOG00000023363) #28 Acrbp (ENSRNOG00000017399) #27 ENSRNOG00000066393 Zfp384 (ENSRNOG00000017066) #29 Pianp (ENSRNOG00000017052) #30 Cops7a (ENSRNOG00000016778) #31 Mlf2 (ENSRNOG00000016589) #32 AC115420.4 (ENSRNOG00000060308) Ptms (ENSRNOG00000060098) Lag3 (ENSRNOG00000021334) #35 ENSRNOG00000071219 #36 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a.b.a.a.b ##22 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a.b.a.a.b ##22 Shrew mouse MODERN SPECIES 11 Kcna1 (MGP_PahariEiJ_G0022647) Kcna5 (MGP_PahariEiJ_G0022646) #7 Ntf3 (MGP_PahariEiJ_G0022645) #9 Ano2 (MGP_PahariEiJ_G0022644) Vwf (MGP_PahariEiJ_G0022643) #10 Cd9 (MGP_PahariEiJ_G0022642) #12 Plekhg6 (MGP_PahariEiJ_G0022641) #13 Tnfrsf1a (MGP_PahariEiJ_G0022640) #14 Scnn1a (MGP_PahariEiJ_G0022639) #15 Ltbr (MGP_PahariEiJ_G0022638) #16 Cd27 (MGP_PahariEiJ_G0022637) Tapbpl (MGP_PahariEiJ_G0022636) #18 Vamp1 (MGP_PahariEiJ_G0022635) #19 Mrpl51 (MGP_PahariEiJ_G0022634) #20 Ncapd2 (MGP_PahariEiJ_G0022633) #21 MGP_PahariEiJ_G0022632 ##22 Iffo1 (MGP_PahariEiJ_G0022631) #23 MGP_PahariEiJ_G0022630 Chd4 (MGP_PahariEiJ_G0022629) #25 Lpar5 (MGP_PahariEiJ_G0022628) #26 Acrbp (MGP_PahariEiJ_G0022627) #27 Ing4 (MGP_PahariEiJ_G0022626) #28 Zfp384 (MGP_PahariEiJ_G0022625) #29 Pianp (MGP_PahariEiJ_G0022624) #30 Cops7a (MGP_PahariEiJ_G0022623) #31 MGP_PahariEiJ_G0022622 MGP_PahariEiJ_G0022621 Lag3 (MGP_PahariEiJ_G0022620) #35 MGP_PahariEiJ_G0022619 #36 Gpr162 (MGP_PahariEiJ_G0022618) #37 P3h3 (MGP_PahariEiJ_G0022617) Rat MODERN SPECIES 11 Dbt (ENSRNOG00000015029) Lrrc39 (ENSRNOG00000015117) Trmt13 (ENSRNOG00000015140) Sass6 (ENSRNOG00000015211) Hiat1-ps1 (ENSRNOG00000015502) Agl (ENSRNOG00000016214) Frrs1 (ENSRNOG00000016351) Palmd (ENSRNOG00000058609) 4930455H04Rik (ENSRNOG00000070759) AABR07013057.1 (ENSRNOG00000060159) AABR07013065.1 (ENSRNOG00000055846) Plppr4 (ENSRNOG00000016872) Plppr5 (ENSRNOG00000016878) Snx7 (ENSRNOG00000017077) Dpyd (ENSRNOG00000017105) AABR07013086.1 (ENSRNOG00000023365) ##22 Ptbp2 (ENSRNOG00000010827) Rwdd3 (ENSRNOG00000029893) Tlcd4 (ENSRNOG00000025160) Alg14 (ENSRNOG00000011528) Cnn3 (ENSRNOG00000011559) Slc44a3 (ENSRNOG00000011723) ENSRNOG00000063273 F3 (ENSRNOG00000011800) Abcd3 (ENSRNOG00000011929) Arhgap29 (ENSRNOG00000012563) Gclm (ENSRNOG00000013409) Dnttip2 (ENSRNOG00000025025) Bcar3 (ENSRNOG00000013737) Fnbp1l (ENSRNOG00000013798) Pde5a (ENSRNOG00000014443) Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a.b.a.b ##22 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a.b.a.b ##22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a.b.a.b ##22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a.b.a.b ##22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a.b.a.b ##22 Steppe mouse MODERN SPECIES 33 Fshb (ENSMSIG00000015133) ENSMSIG00000015115 Arl14ep (ENSMSIG00000015063) Mpped2 (ENSMSIG00000015026) ENSMSIG00000015003 ##22 ENSMSIG00000014903 ENSMSIG00000014856 Immp1l (ENSMSIG00000014838) Elp4 (ENSMSIG00000014816) Pax6 (ENSMSIG00000014511) ENSMSIG00000014497 Them7 (ENSMSIG00000014482) Wt1 (ENSMSIG00000014372) ENSMSIG00000014324 ENSMSIG00000014312 Eif3m (ENSMSIG00000014235) ENSMSIG00000014230 ENSMSIG00000014200 Rat MODERN SPECIES 7 Casp3 (ENSRNOG00000010475) Primpol (ENSRNOG00000022320) Cenpu (ENSRNOG00000022261) Acsl1 (ENSRNOG00000010633) AABR07005806.1 (ENSRNOG00000057653) Helt (ENSRNOG00000010785) Slc25a4 (ENSRNOG00000010830) Cfap97 (ENSRNOG00000032192) Snx25 (ENSRNOG00000011116) Lrp2bp (ENSRNOG00000011178) Ankrd37 (ENSRNOG00000031335) Ufsp2 (ENSRNOG00000012087) C16h4orf47 (ENSRNOG00000038819) Ccdc110 (ENSRNOG00000045697) Pdlim3 (ENSRNOG00000012658) AABR07025010.1 (ENSRNOG00000033057) ##22 Sorbs2 (ENSRNOG00000013391) Tlr3 (ENSRNOG00000021726) Fam149a (ENSRNOG00000021693) Cyp4v3 (ENSRNOG00000042426) Klkb1 (ENSRNOG00000014118) F11 (ENSRNOG00000013684) Mtnr1a (ENSRNOG00000028744) Fat1 (ENSRNOG00000030954) Adam34l (ENSRNOG00000056277) Adam34 (ENSRNOG00000038743) AABR07025818.1 (ENSRNOG00000052883) Adam26a (ENSRNOG00000068728) AABR07025819.1 (ENSRNOG00000038744) Zfp42 (ENSRNOG00000067356) Triml2 (ENSRNOG00000028299) Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a.b.b ##22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a.b.b ##22 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a.b.b ##22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a.b.b ##22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a.b.b ##22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a.b.b ##22 Steppe mouse DUPLICATION Steppe mouse DUPLICATION Steppe mouse DUPLICATION Steppe mouse MODERN SPECIES 2845 Rnf185 (ENSMSIG00000003936) ENSMSIG00000003911 Pla2g3 (ENSMSIG00000003865) Inpp5j (ENSMSIG00000003757) Selenom (ENSMSIG00000003733) Smtn (ENSMSIG00000003334) ENSMSIG00000003292 ENSMSIG00000003275 Morc2a (ENSMSIG00000003158) Osbp2 (ENSMSIG00000003063) ENSMSIG00000003026 ENSMSIG00000003003 Dusp18 (ENSMSIG00000002994) Slc35e4 (ENSMSIG00000002976) Tcn2 (ENSMSIG00000002908) ENSMSIG00000002894 ##22 4930556J24Rik (ENSMSIG00000002859) Pes1 (ENSMSIG00000002758) Gal3st1 (ENSMSIG00000002697) Sec14l4 (ENSMSIG00000002672) ENSMSIG00000002649 Mtfp1 (ENSMSIG00000002619) Sec14l2 (ENSMSIG00000002585) ENSMSIG00000002570 Rnf215 (ENSMSIG00000002532) Ccdc157 (ENSMSIG00000002493) Sf3a1 (ENSMSIG00000002366) Tbc1d10a (ENSMSIG00000002229) Castor1 (ENSMSIG00000002199) Osm (ENSMSIG00000002174) Lif (ENSMSIG00000002129) Steppe mouse MODERN SPECIES 3295 ENSMSIG00000006271 ENSMSIG00000006258 ##22 ENSMSIG00000006202 Celf4 (ENSMSIG00000005335) Steppe mouse MODERN SPECIES 3294 Rab39 (ENSMSIG00000003361) ENSMSIG00000003120 Npat (ENSMSIG00000003045) Atm (ENSMSIG00000002482) 4930550C14Rik (ENSMSIG00000002342) Poglut3 (ENSMSIG00000002258) Exph5 (ENSMSIG00000002225) ENSMSIG00000002169 ENSMSIG00000002160 Ddx10 (ENSMSIG00000002113) ENSMSIG00000002094 AI593442 (ENSMSIG00000002076) ENSMSIG00000002067 Zc3h12c (ENSMSIG00000023596) Rdx (ENSMSIG00000023566) ENSMSIG00000023562 ##22 Fdx1 (ENSMSIG00000023526) Steppe mouse MODERN SPECIES 2330 Ugt2b34 (ENSMSIG00000003246) ENSMSIG00000003208 ENSMSIG00000003201 ##22 Ythdc1 (ENSMSIG00000002806) Tmprss11e (ENSMSIG00000002742) Tmprss11b (ENSMSIG00000002680) Rat MODERN SPECIES 4 Ncstn (ENSRNOG00000005355) Nhlh1 (ENSRNOG00000005166) Vangl2 (ENSRNOG00000004889) Slamf6 (ENSRNOG00000038286) Cd84 (ENSRNOG00000022884) Slamf1 (ENSRNOG00000059073) Cd48 (ENSRNOG00000004737) ENSRNOG00000062700 Slamf7 (ENSRNOG00000023209) Ly9 (ENSRNOG00000025069) Cd244 (ENSRNOG00000064255) Cd244 (ENSRNOG00000068754) Itln1 (ENSRNOG00000004678) LOC100359583 (ENSRNOG00000025731) F11r (ENSRNOG00000004414) ENSRNOG00000068856 ##22 Arhgap30 (ENSRNOG00000004192) Tstd1 (ENSRNOG00000004255) Nectin4 (ENSRNOG00000004029) Klhdc9 (ENSRNOG00000004022) Nit1 (ENSRNOG00000003881) Dedd (ENSRNOG00000003779) Pfdn2 (ENSRNOG00000066932) Ufc1 (ENSRNOG00000003706) Usp21 (ENSRNOG00000038347) B4galt3 (ENSRNOG00000003551) Adamts4 (ENSRNOG00000003538) Ppox (ENSRNOG00000003567) Ndufs2 (ENSRNOG00000038372) Fcer1g (ENSRNOG00000024159) Apoa2 (ENSRNOG00000003500) Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a.b.b ##22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a.b.b ##22 Prairie vole MODERN SPECIES 12 ENSMOCG00000020653 Anapc10 (ENSMOCG00000017245) Abce1 (ENSMOCG00000013213) Otud4 (ENSMOCG00000012639) Smad1 (ENSMOCG00000002828) Mmaa (ENSMOCG00000000542) 1700011L22Rik (ENSMOCG00000010556) Zfp827 (ENSMOCG00000020399) ENSMOCG00000002657 Lsm6 (ENSMOCG00000020049) Slc10a7 (ENSMOCG00000007838) ENSMOCG00000017327 Pou4f2 (ENSMOCG00000014811) Ttc29 (ENSMOCG00000010925) ENSMOCG00000018841 ENSMOCG00000010337 ##22 Ednra (ENSMOCG00000017745) ENSMOCG00000016788 Rasd2 (ENSMOCG00000014090) Hmox1 (ENSMOCG00000005130) Tom1 (ENSMOCG00000010687) Hmgxb4 (ENSMOCG00000005178) Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a ##22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a ##22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a ##22 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a ##22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a ##22 Greater horseshoe bat DUPLICATION Greater horseshoe bat DUPLICATION Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 11 PCOLCE2 (ENSRFEG00010005148) PAQR9 (ENSRFEG00010005166) U2SURP (ENSRFEG00010005180) ENSRFEG00010005199 CHST2 (ENSRFEG00010005206) SLC9A9 (ENSRFEG00010005221) DIPK2A (ENSRFEG00010005250) ENSRFEG00010005260 PLOD2 (ENSRFEG00010005288) PLSCR4 (ENSRFEG00010005346) ENSRFEG00010005376 PLSCR1 (ENSRFEG00010005408) PLSCR5 (ENSRFEG00010005460) ZIC4 (ENSRFEG00010005534) ZIC1 (ENSRFEG00010005593) ENSRFEG00010005605 ##22 AGTR1 (ENSRFEG00010005628) CPB1 (ENSRFEG00010005647) CPA3 (ENSRFEG00010005703) ENSRFEG00010005735 GYG1 (ENSRFEG00010005772) HLTF (ENSRFEG00010005836) HPS3 (ENSRFEG00010006011) CP (ENSRFEG00010006210) ENSRFEG00010006508 TM4SF18 (ENSRFEG00010007025) TM4SF1 (ENSRFEG00010007070) TM4SF4 (ENSRFEG00010007100) WWTR1 (ENSRFEG00010007131) COMMD2 (ENSRFEG00010007155) ANKUB1 (ENSRFEG00010007185) Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 20 ISG20 (ENSRFEG00010008901) AEN (ENSRFEG00010008945) DET1 (ENSRFEG00010008995) MRPS11 (ENSRFEG00010009068) MRPL46 (ENSRFEG00010009099) NTRK3 (ENSRFEG00010009240) AGBL1 (ENSRFEG00010009486) KLHL25 (ENSRFEG00010009518) AKAP13 (ENSRFEG00010009623) SV2B (ENSRFEG00010010164) SLCO3A1 (ENSRFEG00010010224) ST8SIA2 (ENSRFEG00010010423) FAM174B (ENSRFEG00010010589) CHD2 (ENSRFEG00010010750) RGMA (ENSRFEG00010011018) ENSRFEG00010011043 ##22 MCTP2 (ENSRFEG00010011139) NR2F2 (ENSRFEG00010011894) ARRDC4 (ENSRFEG00010012007) ENSRFEG00010012055 ENSRFEG00010012112 IGF1R (ENSRFEG00010012281) SYNM (ENSRFEG00010012407) TTC23 (ENSRFEG00010012513) LRRC28 (ENSRFEG00010012612) MEF2A (ENSRFEG00010012816) LYSMD4 (ENSRFEG00010013232) ADAMTS17 (ENSRFEG00010013302) CERS3 (ENSRFEG00010013357) LINS1 (ENSRFEG00010013393) ASB7 (ENSRFEG00010013431) Greater horseshoe bat DUPLICATION Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 8 ENSRFEG00010011446 UBE2E2 (ENSRFEG00010011378) ENSRFEG00010011222 NKIRAS1 (ENSRFEG00010011183) ENSRFEG00010011144 NR1D2 (ENSRFEG00010011056) THRB (ENSRFEG00010010882) RARB (ENSRFEG00010010823) TOP2B (ENSRFEG00010010294) NGLY1 (ENSRFEG00010010150) OXSM (ENSRFEG00010010038) LRRC3B (ENSRFEG00010010014) ENSRFEG00010010003 NEK10 (ENSRFEG00010009104) SLC4A7 (ENSRFEG00010008194) ENSRFEG00010008101 ##22 EOMES (ENSRFEG00010007965) CMC1 (ENSRFEG00010007886) AZI2 (ENSRFEG00010007841) ZCWPW2 (ENSRFEG00010007754) RBMS3 (ENSRFEG00010007564) TGFBR2 (ENSRFEG00010007495) GADL1 (ENSRFEG00010007234) STT3B (ENSRFEG00010007149) OSBPL10 (ENSRFEG00010007069) GPD1L (ENSRFEG00010007017) CMTM8 (ENSRFEG00010006920) CMTM6 (ENSRFEG00010006857) DYNC1LI1 (ENSRFEG00010006794) CNOT10 (ENSRFEG00010006629) TRIM71 (ENSRFEG00010006548) Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 1 NTN4 (ENSRFEG00010019959) SNRPF (ENSRFEG00010019886) CCDC38 (ENSRFEG00010019857) AMDHD1 (ENSRFEG00010019814) HAL (ENSRFEG00010019753) LTA4H (ENSRFEG00010019582) ELK3 (ENSRFEG00010019517) CDK17 (ENSRFEG00010019452) CFAP54 (ENSRFEG00010018994) NEDD1 (ENSRFEG00010018827) ENSRFEG00010018650 ENSRFEG00010018608 ENSRFEG00010018576 APAF1 (ENSRFEG00010018386) ENSRFEG00010018331 ENSRFEG00010018324 ##22 ANKS1B (ENSRFEG00010017872) ENSRFEG00010017816 BLTP3B (ENSRFEG00010017660) ACTR6 (ENSRFEG00010017580) SCYL2 (ENSRFEG00010017358) SLC17A8 (ENSRFEG00010017004) NR1H4 (ENSRFEG00010016901) GAS2L3 (ENSRFEG00010016827) ANO4 (ENSRFEG00010016021) SLC5A8 (ENSRFEG00010015766) UTP20 (ENSRFEG00010015715) ARL1 (ENSRFEG00010015513) ENSRFEG00010015420 MYBPC1 (ENSRFEG00010013747) CHPT1 (ENSRFEG00010013493) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a ##22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000162469 ENSGT00940000158576 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.m.b.a.a ##22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01030000234816 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Armadillo DUPLICATION Armadillo DUPLICATION Armadillo MODERN SPECIES 3295 ENSDNOG00000005799 ENSDNOG00000045836 LRRCC1 (ENSDNOG00000011333) E2F5 (ENSDNOG00000009802) ENSDNOG00000009828 CA13 (ENSDNOG00000032060) CA1 (ENSDNOG00000014903) ENSDNOG00000043023 CA3 (ENSDNOG00000044877) CA2 (ENSDNOG00000043973) ENSDNOG00000049521 ##22 PSKH2 (ENSDNOG00000011495) ATP6V0D2 (ENSDNOG00000008447) WWP1 (ENSDNOG00000019937) RMDN1 (ENSDNOG00000046346) CPNE3 (ENSDNOG00000014867) MMP16 (ENSDNOG00000015771) RIPK2 (ENSDNOG00000038605) OSGIN2 (ENSDNOG00000039511) NBN (ENSDNOG00000010843) DECR1 (ENSDNOG00000043391) CALB1 (ENSDNOG00000044661) ENSDNOG00000039191 TMEM64 (ENSDNOG00000004256) ENSDNOG00000018952 NECAB1 (ENSDNOG00000016197) Armadillo MODERN SPECIES 508 ENSDNOG00000035788 #10 CD9 (ENSDNOG00000006191) #12 PLEKHG6 (ENSDNOG00000006637) #13 TNFRSF1A (ENSDNOG00000006656) #14 SCNN1A (ENSDNOG00000036126) #15 LTBR (ENSDNOG00000047421) #16 CD27 (ENSDNOG00000035400) TAPBPL (ENSDNOG00000035668) #18 VAMP1 (ENSDNOG00000001131) #19 MRPL51 (ENSDNOG00000001127) #20 NCAPD2 (ENSDNOG00000001128) #21 ENSDNOG00000038191 ##22 IFFO1 (ENSDNOG00000036248) #23 NOP2 (ENSDNOG00000001133) CHD4 (ENSDNOG00000001134) #25 LPAR5 (ENSDNOG00000045302) #26 ACRBP (ENSDNOG00000042457) #27 ING4 (ENSDNOG00000041413) #28 ZNF384 (ENSDNOG00000003936) #29 PIANP (ENSDNOG00000037888) #30 COPS7A (ENSDNOG00000001998) #31 ENSDNOG00000000758 #32 PTMS (ENSDNOG00000024120) LAG3 (ENSDNOG00000002426) #35 CD4 (ENSDNOG00000002205) #36 GPR162 (ENSDNOG00000039746) #37 P3H3 (ENSDNOG00000036097) Armadillo DUPLICATION Armadillo DUPLICATION Armadillo MODERN SPECIES 2813 ENSDNOG00000035447 ENSDNOG00000034525 ENSDNOG00000035854 KIF21A (ENSDNOG00000016343) ENSDNOG00000040272 ##22 ABCD2 (ENSDNOG00000049146) C12orf40 (ENSDNOG00000005525) SLC2A13 (ENSDNOG00000040772) Armadillo MODERN SPECIES 910 ENSDNOG00000041180 ##22 PBX2 (ENSDNOG00000042174) AGER (ENSDNOG00000034611) RNF5 (ENSDNOG00000033018) AGPAT1 (ENSDNOG00000031697) ENSDNOG00000024209 ATF6B (ENSDNOG00000042135) PRRT1 (ENSDNOG00000039982) TNXB (ENSDNOG00000044250) CYP21A2 (ENSDNOG00000043254) ENSDNOG00000048858 STK19 (ENSDNOG00000036273) DXO (ENSDNOG00000038155) SKIC2 (ENSDNOG00000037590) ENSDNOG00000041886 ENSDNOG00000042923 Armadillo DUPLICATION Armadillo MODERN SPECIES 2096 NKAIN3 (ENSDNOG00000001766) GGH (ENSDNOG00000040880) TTPA (ENSDNOG00000046523) YTHDF3 (ENSDNOG00000037156) ENSDNOG00000033171 ##22 BHLHE22 (ENSDNOG00000004738) CYP7B1 (ENSDNOG00000004741) Armadillo MODERN SPECIES 1706 ENSDNOG00000046127 ##22 ENSDNOG00000044037 ENSDNOG00000038180 ENSDNOG00000049419 ENSDNOG00000037749 ALCAM (ENSDNOG00000013819) CBLB (ENSDNOG00000004663) Marsupialia DUPLICATION Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000162469 ENSGT00940000158576 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.m.b.a.a.g ##22 ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000162469 ENSGT00940000158576 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.m.b.a.a.g ##22 ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01050000246306 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000162469 ENSGT00940000158576 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.m.b.a.a.g ##22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01050000246306 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000162469 ENSGT00940000158576 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b.e #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.m.b.a.a.g ##22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01050000246306 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Common wonbat MODERN SPECIES 997 NCAPD2 (ENSVURG00010014147) #21 ENSVURG00010014133 ##22 koala MODERN SPECIES 56 AICDA (ENSPCIG00000023974) APOBEC1 (ENSPCIG00000023973) GDF3 (ENSPCIG00000023971) NTF3 (ENSPCIG00000023966) #9 ANO2 (ENSPCIG00000031141) VWF (ENSPCIG00000011924) #10 ENSPCIG00000011779 #12 PLEKHG6 (ENSPCIG00000033584) #13 ENSPCIG00000001174 #14 ENSPCIG00000001193 #15 ENSPCIG00000036806 ENSPCIG00000001727 VAMP1 (ENSPCIG00000001751) #19 MRPL51 (ENSPCIG00000013024) #20 NCAPD2 (ENSPCIG00000013026) #21 ENSPCIG00000008527 ##22 ENSPCIG00000033646 #23 NOP2 (ENSPCIG00000001788) CHD4 (ENSPCIG00000001846) #25 LPAR5 (ENSPCIG00000001908) #26 ENSPCIG00000001915 #27 ING4 (ENSPCIG00000001929) #28 ZNF384 (ENSPCIG00000001942) #29 PIANP (ENSPCIG00000001968) #30 COPS7A (ENSPCIG00000001977) #31 MLF2 (ENSPCIG00000001988) #32 ENSPCIG00000032253 ENSPCIG00000002003 #35 ENSPCIG00000002019 #36 GPR162 (ENSPCIG00000034794) #37 P3H3 (ENSPCIG00000002057) Marsupialia DUPLICATION Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000159310 ENSGT00390000001680 ENSGT00940000156046 ENSGT00530000063822.a.a ENSGT00940000155379 ENSGT00940000154234.a ENSGT00390000016768 ENSGT00440000034605 ENSGT00940000160574 ENSGT00390000006218 ENSGT00530000063981.b ENSGT00940000155426 ENSGT00390000008679 ENSGT00390000012559 ENSGT00390000013149.g.b ENSGT00940000153298.m.b.a.a.h.a ##22 ENSGT00940000157405 ENSGT00390000010991 ENSGT00390000006196 ENSGT00940000154860 ENSGT00940000157226 ENSGT00390000016821 ENSGT00940000164760 ENSGT00940000161101 ENSGT00940000156620 ENSGT00940000159662 ENSGT00940000158481 ENSGT00940000157667 ENSGT00390000017249 ENSGT00940000159837 ENSGT00940000160226 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000159310 ENSGT00390000001680 ENSGT00940000156046 ENSGT00530000063822.a.a ENSGT00940000155379 ENSGT00940000154234.a ENSGT00390000016768 ENSGT00440000034605 ENSGT00940000160574 ENSGT00390000006218 ENSGT00530000063981.b ENSGT00940000155426 ENSGT00390000008679 ENSGT00390000012559 ENSGT00390000013149.h ENSGT00940000153298.m.b.a.a.h.a ##22 ENSGT00940000157405 ENSGT00390000010991 ENSGT00390000006196 ENSGT00940000154860 ENSGT00940000157226 ENSGT00390000016821 ENSGT00940000164760 ENSGT00940000161101 ENSGT00940000156620 ENSGT00940000159662 ENSGT00940000158481 ENSGT00940000157667 ENSGT00390000017249 ENSGT00940000159837 ENSGT00940000160226 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00940000159310 ENSGT00390000001680 ENSGT00940000156046 ENSGT00530000063822.a.a ENSGT00940000155379 ENSGT00940000154234.a ENSGT00390000016768 ENSGT00440000034605 ENSGT00940000160574 ENSGT00390000006218 ENSGT00530000063981.b ENSGT00940000155426 ENSGT00390000008679 ENSGT00390000012559 ENSGT00390000013149.g.a ENSGT00940000153298.m.b.a.a.h.a ##22 ENSGT00940000157405 ENSGT00390000010991 ENSGT00390000006196 ENSGT00940000154860 ENSGT00940000157226 ENSGT00390000016821 ENSGT00940000164760 ENSGT00940000161101 ENSGT00940000156620 ENSGT00940000159662 ENSGT00940000158481 ENSGT00940000157667 ENSGT00390000017249 ENSGT00940000159837 ENSGT00940000160226 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00940000159310 ENSGT00390000001680 ENSGT00940000156046 ENSGT00530000063822.a.a ENSGT00940000155379 ENSGT00940000154234.a ENSGT00390000016768 ENSGT00440000034605 ENSGT00940000160574 ENSGT00390000006218 ENSGT00530000063981.b ENSGT00940000155426 ENSGT00390000008679 ENSGT00390000012559 ENSGT00390000013149.g.a ENSGT00940000153298.m.b.a.a.h.a ##22 ENSGT00390000008099.`c.a ENSGT00940000157405 ENSGT00390000010991 ENSGT00390000006196 ENSGT00940000154860 ENSGT00940000157226 ENSGT00390000016821 ENSGT00940000164760 ENSGT00940000161101 ENSGT00940000156620 ENSGT00940000159662 ENSGT00940000158481 ENSGT00940000157667 ENSGT00390000017249 ENSGT00940000159837 Common wonbat MODERN SPECIES 1058 APIP (ENSVURG00010011869) PDHX (ENSVURG00010011855) ENSVURG00010011839 SLC1A2 (ENSVURG00010011805) PAMR1 (ENSVURG00010011784) FJX1 (ENSVURG00010011780) LDLRAD3 (ENSVURG00010011775) COMMD9 (ENSVURG00010011757) PRR5L (ENSVURG00010011749) TRAF6 (ENSVURG00010011738) RAG1 (ENSVURG00010011733) RAG2 (ENSVURG00010011726) ENSVURG00010011715 ENSVURG00010011704 ENSVURG00010011691 ENSVURG00010011681 ##22 ENSVURG00010011671 LRRC4C (ENSVURG00010011660) API5 (ENSVURG00010011565) TTC17 (ENSVURG00010011530) HSD17B12 (ENSVURG00010011495) ALKBH3 (ENSVURG00010011481) C11orf96 (ENSVURG00010011478) ENSVURG00010011462 ACCS (ENSVURG00010011433) EXT2 (ENSVURG00010011405) ALX4 (ENSVURG00010011388) CD82 (ENSVURG00010011375) TSPAN18 (ENSVURG00010011338) TP53I11 (ENSVURG00010011301) PRDM11 (ENSVURG00010011272) koala MODERN SPECIES 291 ENSPCIG00000037450 ENSPCIG00000034046 ENSPCIG00000024783 ##22 ENSPCIG00000033251 ENSPCIG00000009473 Tasmanian devil MODERN SPECIES 5 EHF (ENSSHAG00000010046) APIP (ENSSHAG00000011523) PDHX (ENSSHAG00000029847) ENSSHAG00000021071 ENSSHAG00000027755 SLC1A2 (ENSSHAG00000003454) PAMR1 (ENSSHAG00000006602) ENSSHAG00000027936 LDLRAD3 (ENSSHAG00000030828) COMMD9 (ENSSHAG00000013073) PRR5L (ENSSHAG00000027462) TRAF6 (ENSSHAG00000021499) RAG1 (ENSSHAG00000030524) RAG2 (ENSSHAG00000027759) ENSSHAG00000024309 ENSSHAG00000032308 ##22 LRRC4C (ENSSHAG00000015017) ENSSHAG00000018895 TTC17 (ENSSHAG00000018903) HSD17B12 (ENSSHAG00000026618) ALKBH3 (ENSSHAG00000024968) ENSSHAG00000008476 ACCS (ENSSHAG00000008665) EXT2 (ENSSHAG00000025904) ALX4 (ENSSHAG00000030684) ENSSHAG00000000290 ENSSHAG00000021679 ENSSHAG00000031773 CD82 (ENSSHAG00000020992) TSPAN18 (ENSSHAG00000020531) TP53I11 (ENSSHAG00000032139) Opossum MODERN SPECIES 4 SLC1A2 (ENSMODG00000019823) PAMR1 (ENSMODG00000019829) FJX1 (ENSMODG00000024473) LDLRAD3 (ENSMODG00000019832) COMMD9 (ENSMODG00000019834) PRR5L (ENSMODG00000019835) TRAF6 (ENSMODG00000019837) RAG1 (ENSMODG00000024470) RAG2 (ENSMODG00000024469) ENSMODG00000019838 ENSMODG00000046213 ENSMODG00000046146 ENSMODG00000051556 ENSMODG00000027830 ENSMODG00000029605 ENSMODG00000024462 ##22 ENSMODG00000044338 LRRC4C (ENSMODG00000024461) ENSMODG00000048963 ENSMODG00000050454 API5 (ENSMODG00000019854) TTC17 (ENSMODG00000019858) HSD17B12 (ENSMODG00000019862) ALKBH3 (ENSMODG00000019863) C11orf96 (ENSMODG00000040262) ENSMODG00000019866 ENSMODG00000019865 ENSMODG00000019867 EXT2 (ENSMODG00000019868) ALX4 (ENSMODG00000019869) CD82 (ENSMODG00000040483) Marsupialia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a.h.b ##22 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a.h.b ##22 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a.h.b ##22 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.a.h.b ##22 koala MODERN SPECIES 104 RECK (ENSPCIG00000014867) ENSPCIG00000014862 ENSPCIG00000014863 CCIN (ENSPCIG00000014861) CLTA (ENSPCIG00000014859) GNE (ENSPCIG00000014854) ENSPCIG00000014848 RNF38 (ENSPCIG00000014839) MELK (ENSPCIG00000014826) PAX5 (ENSPCIG00000014813) ZCCHC7 (ENSPCIG00000014809) GRHPR (ENSPCIG00000014804) POLR1E (ENSPCIG00000014798) FBXO10 (ENSPCIG00000014795) ENSPCIG00000035940 ENSPCIG00000032470 ##22 ENSPCIG00000037145 TRMT10B (ENSPCIG00000014749) EXOSC3 (ENSPCIG00000014744) ENSPCIG00000014737 DCAF10 (ENSPCIG00000014733) ENSPCIG00000034779 SHB (ENSPCIG00000006737) ENSPCIG00000006739 IGFBPL1 (ENSPCIG00000006741) ENSPCIG00000006744 TDRD7 (ENSPCIG00000011622) TMOD1 (ENSPCIG00000015787) TSTD2 (ENSPCIG00000015792) NCBP1 (ENSPCIG00000015800) XPA (ENSPCIG00000015811) Theria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000158576 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.m.b.a.a.g ##22 ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 ENSGT01000000214413.b.a.b.a Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000158576 ENSGT00940000161860 #7 ENSGT00390000007725.A.a #9 ENSGT00940000155840.C ENSGT00940000155810 #10 ENSGT00940000155083.b #12 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00940000159540 #14 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000162178 #16 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.m.b.a.a.g ##22 ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01050000246306 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Tasmanian devil DUPLICATION Tasmanian devil DUPLICATION Tasmanian devil DUPLICATION Tasmanian devil DUPLICATION Tasmanian devil MODERN SPECIES 3 SWT1 (ENSSHAG00000009241) IVNS1ABP (ENSSHAG00000010210) HMCN1 (ENSSHAG00000014526) ENSSHAG00000015244 TPR (ENSSHAG00000015305) ODR4 (ENSSHAG00000015497) PDC (ENSSHAG00000015671) PTGS2 (ENSSHAG00000016171) PLA2G4A (ENSSHAG00000016618) ENSSHAG00000005427 ENSSHAG00000030508 ENSSHAG00000031269 BRINP3 (ENSSHAG00000007307) ENSSHAG00000027804 RGS18 (ENSSHAG00000006527) ENSSHAG00000029586 ##22 RGS21 (ENSSHAG00000022729) RGS1 (ENSSHAG00000025712) ENSSHAG00000023026 RGS2 (ENSSHAG00000021123) UCHL5 (ENSSHAG00000030758) RO60 (ENSSHAG00000027682) GLRX2 (ENSSHAG00000031431) CDC73 (ENSSHAG00000013464) B3GALT2 (ENSSHAG00000026757) ENSSHAG00000000199 ENSSHAG00000025160 KCNT2 (ENSSHAG00000007306) ENSSHAG00000003041 F13B (ENSSHAG00000001242) ASPM (ENSSHAG00000003389) Tasmanian devil MODERN SPECIES ENSSHAG00000021434 ENSSHAG00000005908 TNFRSF17 (ENSSHAG00000024421) SNX29 (ENSSHAG00000008175) ENSSHAG00000027355 SHISA9 (ENSSHAG00000027430) ENSSHAG00000025972 ERCC4 (ENSSHAG00000011596) MRTFB (ENSSHAG00000000780) PARN (ENSSHAG00000008493) BFAR (ENSSHAG00000009290) ENSSHAG00000009421 ENSSHAG00000010261 TXNDC11 (ENSSHAG00000010572) SNN (ENSSHAG00000023754) ENSSHAG00000030911 ##22 LITAF (ENSSHAG00000021684) ENSSHAG00000013004 RMI2 (ENSSHAG00000030487) ENSSHAG00000023877 ENSSHAG00000031517 CLEC16A (ENSSHAG00000001870) CIITA (ENSSHAG00000006475) TVP23A (ENSSHAG00000025041) NUBP1 (ENSSHAG00000008299) TEKT5 (ENSSHAG00000026102) EMP2 (ENSSHAG00000027677) ENSSHAG00000010436 GRIN2A (ENSSHAG00000008553) HAPSTR1 (ENSSHAG00000010529) USP7 (ENSSHAG00000012123) Tasmanian devil MODERN SPECIES 4 ENSSHAG00000026667 ENSSHAG00000027811 KCNA1 (ENSSHAG00000031762) KCNA5 (ENSSHAG00000011548) #7 NTF3 (ENSSHAG00000006721) #9 ANO2 (ENSSHAG00000030277) ENSSHAG00000026710 VWF (ENSSHAG00000012094) #10 CD9 (ENSSHAG00000013749) #12 PLEKHG6 (ENSSHAG00000014065) #13 SCNN1A (ENSSHAG00000014354) #15 LTBR (ENSSHAG00000028116) #16 ENSSHAG00000014740 ENSSHAG00000029190 #20 NCAPD2 (ENSSHAG00000014814) #21 ENSSHAG00000014953 ##22 IFFO1 (ENSSHAG00000027937) #23 ENSSHAG00000031410 #24 ENSSHAG00000015079 #25 ENSSHAG00000015251 #27 LPAR5 (ENSSHAG00000015208) #26 ING4 (ENSSHAG00000015278) #28 ZNF384 (ENSSHAG00000025785) #29 PIANP (ENSSHAG00000015440) #30 COPS7A (ENSSHAG00000015469) #31 MLF2 (ENSSHAG00000028020) #32 ENSSHAG00000024269 ENSSHAG00000015690 #35 ENSSHAG00000015840 #36 GPR162 (ENSSHAG00000015934) #37 P3H3 (ENSSHAG00000015960) Tasmanian devil MODERN SPECIES ENSSHAG00000001596 ENSSHAG00000029226 ENSSHAG00000031027 ENSSHAG00000028474 ENSSHAG00000001742 ENSSHAG00000028143 ENSSHAG00000020497 ENSSHAG00000030532 ENSSHAG00000029933 ENSSHAG00000029047 ENSSHAG00000000711 ENSSHAG00000023979 ENSSHAG00000000512 ENSSHAG00000022856 ENSSHAG00000002869 ENSSHAG00000032276 ##22 ENSSHAG00000000737 ENSSHAG00000029330 ENSSHAG00000025024 ENSSHAG00000026767 ENSSHAG00000002215 ENSSHAG00000003519 ENSSHAG00000032350 ENSSHAG00000027676 ENSSHAG00000001292 ENSSHAG00000001988 ENSSHAG00000002528 ENSSHAG00000002181 ENSSHAG00000029203 ENSSHAG00000028329 ENSSHAG00000028301 Tasmanian devil MODERN SPECIES 3 ENSSHAG00000018282 ENSSHAG00000018287 ENSSHAG00000018326 C1orf116 (ENSSHAG00000030831) ENSSHAG00000026664 PFKFB2 (ENSSHAG00000029947) ENSSHAG00000027732 ENSSHAG00000018568 ENSSHAG00000018654 ENSSHAG00000027565 ENSSHAG00000002879 ENSSHAG00000029606 ENSSHAG00000027282 ENSSHAG00000027916 PLXNA2 (ENSSHAG00000007314) ENSSHAG00000031566 ##22 CAMK1G (ENSSHAG00000009646) LAMB3 (ENSSHAG00000010013) G0S2 (ENSSHAG00000024852) HSD11B1 (ENSSHAG00000028213) TRAF3IP3 (ENSSHAG00000011020) C1orf74 (ENSSHAG00000029419) IRF6 (ENSSHAG00000001714) UTP25 (ENSSHAG00000030819) SYT14 (ENSSHAG00000026173) SERTAD4 (ENSSHAG00000026265) HHAT (ENSSHAG00000006396) KCNH1 (ENSSHAG00000029794) RCOR3 (ENSSHAG00000014006) TRAF5 (ENSSHAG00000014289) RD3 (ENSSHAG00000020730) Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Wallaby MODERN SPECIES 1054 ENSMEUG00000015225 #18 ENSMEUG00000015238 VAMP1 (ENSMEUG00000015246) #19 MRPL51 (ENSMEUG00000015252) #20 NCAPD2 (ENSMEUG00000015256) #21 GAPDH (ENSMEUG00000015273) ##22 IFFO1 (ENSMEUG00000015279) #23 NOP2 (ENSMEUG00000015287) CHD4 (ENSMEUG00000015294) #25 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 koala MODERN SPECIES 256 ENSPCIG00000018462 NIPAL4 (ENSPCIG00000018461) ENSPCIG00000031610 FNDC9 (ENSPCIG00000018459) ENSPCIG00000018455 ITK (ENSPCIG00000030175) MED7 (ENSPCIG00000030172) ENSPCIG00000034280 ENSPCIG00000005949 ENSPCIG00000005948 SGCD (ENSPCIG00000005944) ENSPCIG00000019224 ENSPCIG00000029208 ENSPCIG00000004563 ##22 MRPL22 (ENSPCIG00000019225) GEMIN5 (ENSPCIG00000019228) CNOT8 (ENSPCIG00000030984) ENSPCIG00000035769 FAXDC2 (ENSPCIG00000019237) LARP1 (ENSPCIG00000019242) HAND1 (ENSPCIG00000019244) Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Armadillo MODERN SPECIES 1278 ENSDNOG00000048872 ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Equus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Horse MODERN SPECIES 26 ENSECAG00000047290 ENSECAG00000009794 CD34 (ENSECAG00000024973) PLXNA2 (ENSECAG00000001716) CAMK1G (ENSECAG00000014588) G0S2 (ENSECAG00000003535) LAMB3 (ENSECAG00000008204) HSD11B1 (ENSECAG00000019243) TRAF3IP3 (ENSECAG00000011355) C5H1orf74 (ENSECAG00000003211) IRF6 (ENSECAG00000007482) UTP25 (ENSECAG00000022381) SYT14 (ENSECAG00000017972) SERTAD4 (ENSECAG00000015692) HHAT (ENSECAG00000013905) ENSECAG00000030219 ##22 ENSECAG00000060378 ENSECAG00000055405 KCNH1 (ENSECAG00000000431) RCOR3 (ENSECAG00000013308) TRAF5 (ENSECAG00000007165) RD3 (ENSECAG00000037071) SLC30A1 (ENSECAG00000003051) ENSECAG00000029157 NEK2 (ENSECAG00000020920) LPGAT1 (ENSECAG00000013187) INTS7 (ENSECAG00000018806) DTL (ENSECAG00000011878) ENSECAG00000046910 PPP2R5A (ENSECAG00000007665) PACC1 (ENSECAG00000018726) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Squirrel MODERN SPECIES 80 ENSSTOG00000034900 HCN1 (ENSSTOG00000008842) MRPS30 (ENSSTOG00000015844) FGF10 (ENSSTOG00000023167) NNT (ENSSTOG00000011209) PAIP1 (ENSSTOG00000011203) C5orf34 (ENSSTOG00000011197) ENSSTOG00000016333 CCL28 (ENSSTOG00000005720) HMGCS1 (ENSSTOG00000005698) NIM1K (ENSSTOG00000025018) ZNF131 (ENSSTOG00000015383) ZNF622 (ENSSTOG00000000623) RETREG1 (ENSSTOG00000024173) MYO10 (ENSSTOG00000004826) ENSSTOG00000024457 ##22 CDH18 (ENSSTOG00000012038) Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Degu MODERN SPECIES 256 DEF8 (ENSODEG00000003777) ENSODEG00000003697 DBNDD1 (ENSODEG00000003664) GAS8 (ENSODEG00000003436) ENSODEG00000003363 ENSODEG00000003885 JPH3 (ENSODEG00000003822) ZCCHC14 (ENSODEG00000003749) ENSODEG00000003687 FBXO31 (ENSODEG00000003564) FOXL1 (ENSODEG00000003524) MTHFSD (ENSODEG00000003482) FOXF1 (ENSODEG00000003466) IRF8 (ENSODEG00000005035) ENSODEG00000005014 ENSODEG00000005004 ##22 ENSODEG00000004994 EMC8 (ENSODEG00000004987) C16orf74 (ENSODEG00000004976) GINS2 (ENSODEG00000004957) GSE1 (ENSODEG00000004855) CIBAR2 (ENSODEG00000004799) KIAA0513 (ENSODEG00000004724) ZDHHC7 (ENSODEG00000004683) CRISPLD2 (ENSODEG00000004620) USP10 (ENSODEG00000004533) KLHL36 (ENSODEG00000004503) COTL1 (ENSODEG00000004482) MEAK7 (ENSODEG00000004440) ATP2C2 (ENSODEG00000005743) Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Steppe mouse MODERN SPECIES 3425 Bdp1 (ENSMSIG00000028772) Mccc2 (ENSMSIG00000028762) Cartpt (ENSMSIG00000028754) Map1b (ENSMSIG00000028737) Mrps27 (ENSMSIG00000028728) Ptcd2 (ENSMSIG00000028722) Zfp366 (ENSMSIG00000028719) ENSMSIG00000028710 ENSMSIG00000028708 H2bl1 (ENSMSIG00000028702) Tnpo1 (ENSMSIG00000028677) Fcho2 (ENSMSIG00000028641) Tmem171 (ENSMSIG00000028636) Tmem174 (ENSMSIG00000028632) ENSMSIG00000028625 ENSMSIG00000028624 ##22 ENSMSIG00000028622 ENSMSIG00000028616 ENSMSIG00000028609 Ankra2 (ENSMSIG00000028570) Utp15 (ENSMSIG00000028561) ENSMSIG00000028558 Arhgef28 (ENSMSIG00000028543) Enc1 (ENSMSIG00000028530) Hexb (ENSMSIG00000028524) Gfm2 (ENSMSIG00000028449) Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.a.b ##22 Prairie vole MODERN SPECIES 14 Sctr (ENSMOCG00000002265) Cfap221 (ENSMOCG00000019701) Tmem177 (ENSMOCG00000020308) Ptpn4 (ENSMOCG00000019512) Epb41l5 (ENSMOCG00000014769) Ralb (ENSMOCG00000014139) Inhbb (ENSMOCG00000023014) Gli2 (ENSMOCG00000015946) Tfcp2l1 (ENSMOCG00000016470) Clasp1 (ENSMOCG00000004583) Nifk (ENSMOCG00000001962) Tsn (ENSMOCG00000013248) ENSMOCG00000018277 ENSMOCG00000010878 ENSMOCG00000019760 ENSMOCG00000000633 ##22 ENSMOCG00000010740 ENSMOCG00000001250 Cdh20 (ENSMOCG00000014345) Rnf152 (ENSMOCG00000020478) Pign (ENSMOCG00000011826) Relch (ENSMOCG00000015326) Tnfrsf11a (ENSMOCG00000001050) Zcchc2 (ENSMOCG00000021627) Phlpp1 (ENSMOCG00000011825) Bcl2 (ENSMOCG00000015172) Kdsr (ENSMOCG00000007564) Vps4b (ENSMOCG00000001006) Taf1a (ENSMOCG00000017898) Zp3r (ENSMOCG00000013017) C4bp (ENSMOCG00000002177) Northern American deer mouse MODERN SPECIES 107 ENSPEMG00000024153 ##22 Theria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Opossum DUPLICATION Opossum MODERN SPECIES 7 KCNA6 (ENSMODG00000018007) ENSMODG00000028583 KCNA1 (ENSMODG00000024850) KCNA5 (ENSMODG00000024849) #7 NTF3 (ENSMODG00000018011) #9 ANO2 (ENSMODG00000018017) ENSMODG00000018053 #12 PLEKHG6 (ENSMODG00000018054) #13 ENSMODG00000018056 #14 ENSMODG00000037213 #15 ENSMODG00000048629 #15 LTBR (ENSMODG00000018059) #16 ENSMODG00000018060 MRPL51 (ENSMODG00000018063) #20 NCAPD2 (ENSMODG00000018064) #21 ENSMODG00000018066 ##22 ENSMODG00000018067 #23 NOP2 (ENSMODG00000018077) CHD4 (ENSMODG00000018094) #25 LPAR5 (ENSMODG00000018099) #26 ENSMODG00000018101 #27 ING4 (ENSMODG00000018103) #28 ZNF384 (ENSMODG00000018105) #29 PIANP (ENSMODG00000018107) #30 COPS7A (ENSMODG00000018110) #31 MLF2 (ENSMODG00000018113) #32 ENSMODG00000018136 #35 CD4 (ENSMODG00000027359) #36 GPR162 (ENSMODG00000040272) #37 P3H3 (ENSMODG00000018141) GNB3 (ENSMODG00000018145) Opossum MODERN SPECIES 3 EXOSC8 (ENSMODG00000040252) ALG5 (ENSMODG00000010043) ENSMODG00000010017 ENSMODG00000009995 SERTM1 (ENSMODG00000024121) ENSMODG00000041669 CCNA1 (ENSMODG00000009993) SPART (ENSMODG00000009980) ENSMODG00000009974 DCLK1 (ENSMODG00000009947) MAB21L1 (ENSMODG00000024122) NBEA (ENSMODG00000009914) ENSMODG00000039285 ENSMODG00000024124 RFC3 (ENSMODG00000009764) ENSMODG00000017351 ##22 ENSMODG00000045424 STARD13 (ENSMODG00000009691) KL (ENSMODG00000009636) PDS5B (ENSMODG00000009630) ENSMODG00000009531 ENSMODG00000042297 N4BP2L1 (ENSMODG00000009524) ENSMODG00000009516 ZAR1L (ENSMODG00000009462) FRY (ENSMODG00000009454) RXFP2 (ENSMODG00000009382) ENSMODG00000045047 B3GLCT (ENSMODG00000009353) HSPH1 (ENSMODG00000009347) ENSMODG00000009305 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Tree shrew MODERN SPECIES 1908 ENSTBEG00000000670 #18 VAMP1 (ENSTBEG00000000808) #19 MRPL51 (ENSTBEG00000000936) #20 NCAPD2 (ENSTBEG00000000988) #21 GAPDH (ENSTBEG00000001510) ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 287 NTF3 (ENSUPAG00010013302) #9 ANO2 (ENSUPAG00010013264) VWF (ENSUPAG00010013201) #10 CD9 (ENSUPAG00010013184) #12 PLEKHG6 (ENSUPAG00010013161) #13 TNFRSF1A (ENSUPAG00010013146) #14 SCNN1A (ENSUPAG00010013073) #15 LTBR (ENSUPAG00010013063) #16 CD27 (ENSUPAG00010013052) TAPBPL (ENSUPAG00010013043) #18 VAMP1 (ENSUPAG00010013015) #19 MRPL51 (ENSUPAG00010013007) #20 NCAPD2 (ENSUPAG00010012965) #21 ENSUPAG00010012916 ##22 IFFO1 (ENSUPAG00010012871) #23 NOP2 (ENSUPAG00010012834) CHD4 (ENSUPAG00010012693) #25 LPAR5 (ENSUPAG00010012680) #26 ACRBP (ENSUPAG00010012647) #27 ING4 (ENSUPAG00010012637) #28 ZNF384 (ENSUPAG00010012380) #29 PIANP (ENSUPAG00010012361) #30 COPS7A (ENSUPAG00010012353) #31 ENSUPAG00010012348 MLF2 (ENSUPAG00010012341) #32 ENSUPAG00010012331 LAG3 (ENSUPAG00010012322) #35 CD4 (ENSUPAG00010012311) #36 GPR162 (ENSUPAG00010012307) #37 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 5 SNRNP27 (ENSSVLG00005016010) ENSSVLG00005015884 ANXA4 (ENSSVLG00005015817) AAK1 (ENSSVLG00005022357) ENSSVLG00005022342 NFU1 (ENSSVLG00005022277) GFPT1 (ENSSVLG00005022235) ENSSVLG00005022183 ANTXR1 (ENSSVLG00005022150) GKN1 (ENSSVLG00005022077) GKN2 (ENSSVLG00005021978) ENSSVLG00005021937 BMP10 (ENSSVLG00005021912) ARHGAP25 (ENSSVLG00005021763) PROKR1 (ENSSVLG00005021730) ENSSVLG00005021708 ##22 APLF (ENSSVLG00005021663) FBXO48 (ENSSVLG00005021637) PLEK (ENSSVLG00005021563) CNRIP1 (ENSSVLG00005021502) PPP3R1 (ENSSVLG00005021432) PNO1 (ENSSVLG00005021413) DNAAF10 (ENSSVLG00005021285) C1D (ENSSVLG00005021246) ETAA1 (ENSSVLG00005021110) MEIS1 (ENSSVLG00005020894) ENSSVLG00005020854 SPRED2 (ENSSVLG00005020765) ACTR2 (ENSSVLG00005020565) ENSSVLG00005020476 CEP68 (ENSSVLG00005020379) Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 1 Prlr (ENSCGRG00001006147) Spef2 (ENSCGRG00001023075) Il7r (ENSCGRG00001016104) Capsl (ENSCGRG00001008670) Lmbrd2 (ENSCGRG00001023603) Skp2 (ENSCGRG00001022106) Nadk2 (ENSCGRG00001022039) Ranbp3l (ENSCGRG00001024211) Slc1a3 (ENSCGRG00001011815) ENSCGRG00001008847 Nipbl (ENSCGRG00001024039) Cplane1 (ENSCGRG00001023647) Nup155 (ENSCGRG00001023185) Wdr70 (ENSCGRG00001024618) Gdnf (ENSCGRG00001024149) ENSCGRG00001024626 ##22 ENSCGRG00001024378 Egflam (ENSCGRG00001023724) Lifr (ENSCGRG00001003293) Osmr (ENSCGRG00001017859) Rictor (ENSCGRG00001009015) Fyb (ENSCGRG00001022410) C9 (ENSCGRG00001021695) Dab2 (ENSCGRG00001021141) ENSCGRG00001012741 ENSCGRG00001008646 ENSCGRG00001020504 Ptger4 (ENSCGRG00001020213) Ttc33 (ENSCGRG00001019815) Prkaa1 (ENSCGRG00001001697) ENSCGRG00001012869 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 22 Dgkh (ENSPEMG00000020442) Vwa8 (ENSPEMG00000016456) Rgcc (ENSPEMG00000013380) Naa16 (ENSPEMG00000021265) Mtrf1 (ENSPEMG00000020982) Kbtbd7 (ENSPEMG00000015250) Wbp4 (ENSPEMG00000021764) Elf1 (ENSPEMG00000021551) ENSPEMG00000001486 Cnmd (ENSPEMG00000001366) Pcdh8 (ENSPEMG00000002218) Olfm4 (ENSPEMG00000018107) ENSPEMG00000008810 Pcdh17 (ENSPEMG00000029088) ENSPEMG00000012614 ENSPEMG00000008782 ##22 Diaph3 (ENSPEMG00000013687) Tdrd3 (ENSPEMG00000004287) Pcdh20 (ENSPEMG00000000491) Pcdh9 (ENSPEMG00000019867) ENSPEMG00000028743 Spertl (ENSPEMG00000020149) ENSPEMG00000025539 Klhl1 (ENSPEMG00000019703) ENSPEMG00000026815 Dach1 (ENSPEMG00000019832) ENSPEMG00000025061 Bora (ENSPEMG00000024902) Dis3 (ENSPEMG00000019729) Pibf1 (ENSPEMG00000020121) Klf5 (ENSPEMG00000019820) Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Rat MODERN SPECIES 4 Edem3 (ENSRNOG00000028358) Niban1 (ENSRNOG00000002403) ENSRNOG00000064602 Rnf2 (ENSRNOG00000002454) Trmt1l (ENSRNOG00000002580) Swt1 (ENSRNOG00000032258) Ivns1abp (ENSRNOG00000002618) Hmcn1 (ENSRNOG00000028627) Prg4 (ENSRNOG00000002385) Tpr (ENSRNOG00000002394) Odr4 (ENSRNOG00000002473) Pdc (ENSRNOG00000002517) Ptgs2 (ENSRNOG00000002525) ENSRNOG00000066166 Pla2g4a (ENSRNOG00000002657) Gapdh-ps17 (ENSRNOG00000022174) ##22 Brinp3 (ENSRNOG00000002811) Rgs18 (ENSRNOG00000003959) ENSRNOG00000065694 Rgs21 (ENSRNOG00000056369) Rgs1 (ENSRNOG00000003895) Rgs13 (ENSRNOG00000003888) Rgs2 (ENSRNOG00000003687) ENSRNOG00000070924 Uchl5 (ENSRNOG00000003545) Ro60 (ENSRNOG00000003434) Glrx2 (ENSRNOG00000003385) B3galt2 (ENSRNOG00000003251) Cdc73 (ENSRNOG00000003258) LOC108352643 (ENSRNOG00000068606) Kcnt2 (ENSRNOG00000013312) Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES 186 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 Hedgehog MODERN SPECIES 490 ENSEEUG00000011280 #21 GAPDH (ENSEEUG00000011444) ##22 IFFO1 (ENSEEUG00000011508) #23 NOP2 (ENSEEUG00000011692) ENSEEUG00000011777 #25 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Narwhal MODERN SPECIES 313 KCNA1 (ENSMMNG00015014253) KCNA5 (ENSMMNG00015014257) #7 NTF3 (ENSMMNG00015014262) #9 ANO2 (ENSMMNG00015014305) VWF (ENSMMNG00015014423) #10 CD9 (ENSMMNG00015014479) #12 PLEKHG6 (ENSMMNG00015014516) #13 TNFRSF1A (ENSMMNG00015014562) #14 SCNN1A (ENSMMNG00015014598) #15 LTBR (ENSMMNG00015014642) #16 CD27 (ENSMMNG00015014673) TAPBPL (ENSMMNG00015014697) #18 VAMP1 (ENSMMNG00015014734) #19 MRPL51 (ENSMMNG00015014780) #20 NCAPD2 (ENSMMNG00015014856) #21 GAPDH (ENSMMNG00015014916) ##22 IFFO1 (ENSMMNG00015014957) #23 NOP2 (ENSMMNG00015014983) CHD4 (ENSMMNG00015015036) #25 ACRBP (ENSMMNG00015015110) #27 ING4 (ENSMMNG00015015173) #28 ZNF384 (ENSMMNG00015015269) #29 PIANP (ENSMMNG00015015305) #30 COPS7A (ENSMMNG00015015318) #31 MLF2 (ENSMMNG00015015337) #32 PTMS (ENSMMNG00015015353) LAG3 (ENSMMNG00015015366) #35 CD4 (ENSMMNG00015015391) #36 GPR162 (ENSMMNG00015015414) #37 P3H3 (ENSMMNG00015015434) GNB3 (ENSMMNG00015015448) Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Bos_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b ##22 Cow MODERN SPECIES 24 KCNA5 (ENSBTAG00000007553) #7 NTF3 (ENSBTAG00000010223) #9 ANO2 (ENSBTAG00000012246) ENSBTAG00000011758 VWF (ENSBTAG00000012265) #10 CD9 (ENSBTAG00000014764) #12 PLEKHG6 (ENSBTAG00000004208) #13 TNFRSF1A (ENSBTAG00000004211) #14 SCNN1A (ENSBTAG00000002631) #15 LTBR (ENSBTAG00000015312) #16 CD27 (ENSBTAG00000014725) TAPBPL (ENSBTAG00000014728) #18 VAMP1 (ENSBTAG00000014603) #19 MRPL51 (ENSBTAG00000014729) #20 NCAPD2 (ENSBTAG00000014730) #21 GAPDH (ENSBTAG00000014731) ##22 IFFO1 (ENSBTAG00000030369) #23 NOP2 (ENSBTAG00000014733) CHD4 (ENSBTAG00000014734) #25 LPAR5 (ENSBTAG00000004541) #26 ACRBP (ENSBTAG00000034246) #27 ING4 (ENSBTAG00000017064) #28 ZNF384 (ENSBTAG00000017072) #29 PIANP (ENSBTAG00000001099) #30 COPS7A (ENSBTAG00000011111) #31 MLF2 (ENSBTAG00000014931) #32 PTMS (ENSBTAG00000018451) LAG3 (ENSBTAG00000034295) #35 ENSBTAG00000051680 CD4 (ENSBTAG00000003255) #36 GPR162 (ENSBTAG00000034385) #37 Laurasiatheria_b DUPLICATION Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b.c ##22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b.c ##22 Caniformia DUPLICATION Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b.c.a ##22 Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b.c.a ##22 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b.c.a ##22 Dingo MODERN SPECIES 343 PHF20 (ENSCAFG00020005691) SCAND1 (ENSCAFG00020005777) ENSCAFG00020005787 EPB41L1 (ENSCAFG00020005807) AAR2 (ENSCAFG00020005856) ENSCAFG00020005862 ENSCAFG00020005865 ENSCAFG00020005870 ENSCAFG00020005874 ENSCAFG00020005881 RAB5IF (ENSCAFG00020005885) SLA2 (ENSCAFG00020005890) ENSCAFG00020005893 DSN1 (ENSCAFG00020005917) SOGA1 (ENSCAFG00020005922) ENSCAFG00020005973 ##22 TLDC2 (ENSCAFG00020005977) SAMHD1 (ENSCAFG00020006094) RBL1 (ENSCAFG00020012391) ENSCAFG00020012444 ENSCAFG00020012473 RPN2 (ENSCAFG00020012479) GHRH (ENSCAFG00020012483) MANBAL (ENSCAFG00020012487) SRC (ENSCAFG00020012489) BLCAP (ENSCAFG00020012493) NNAT (ENSCAFG00020012495) CTNNBL1 (ENSCAFG00020012512) VSTM2L (ENSCAFG00020012514) TTI1 (ENSCAFG00020012517) RPRD1B (ENSCAFG00020012523) Dog MODERN SPECIES 17 ENSCAFG00845025102 ENSCAFG00845025152 ENSCAFG00845025275 CCDC115 (ENSCAFG00845025350) PALLD (ENSCAFG00845025456) CBR4 (ENSCAFG00845026026) ENSCAFG00845026075 ENSCAFG00845026158 ENSCAFG00845026241 SH3RF1 (ENSCAFG00845026368) NEK1 (ENSCAFG00845026873) CLCN3 (ENSCAFG00845028065) HPF1 (ENSCAFG00845028301) MFAP3L (ENSCAFG00845028385) AADAT (ENSCAFG00845028500) ENSCAFG00845028616 ##22 ENSCAFG00845028629 GALNTL6 (ENSCAFG00845016564) ENSCAFG00845016810 ENSCAFG00845016838 ENSCAFG00845016982 HMGB2 (ENSCAFG00845017050) SAP30 (ENSCAFG00845017098) SCRG1 (ENSCAFG00845017141) HAND2 (ENSCAFG00845017182) FBXO8 (ENSCAFG00845017782) CEP44 (ENSCAFG00845017832) HPGD (ENSCAFG00845018083) GLRA3 (ENSCAFG00845018265) ADAM29 (ENSCAFG00845018395) ENSCAFG00845018425 Red fox MODERN SPECIES 44 ENSVVUG00000017274 ENSVVUG00000017279 RBFOX1 (ENSVVUG00000017311) TMEM114 (ENSVVUG00000017347) METTL22 (ENSVVUG00000017351) ABAT (ENSVVUG00000017363) ENSVVUG00000017369 TMEM186 (ENSVVUG00000017371) PMM2 (ENSVVUG00000017372) CARHSP1 (ENSVVUG00000017377) USP7 (ENSVVUG00000017390) HAPSTR1 (ENSVVUG00000017458) GRIN2A (ENSVVUG00000017527) ENSVVUG00000017825 ENSVVUG00000017828 ENSVVUG00000017831 ##22 ENSVVUG00000017834 EMP2 (ENSVVUG00000017836) TEKT5 (ENSVVUG00000017841) NUBP1 (ENSVVUG00000017845) TVP23A (ENSVVUG00000017853) CIITA (ENSVVUG00000017857) CLEC16A (ENSVVUG00000017880) SOCS1 (ENSVVUG00000017915) ENSVVUG00000017918 ENSVVUG00000017923 ENSVVUG00000017927 LITAF (ENSVVUG00000017969) SNN (ENSVVUG00000017985) TXNDC11 (ENSVVUG00000018015) ZC3H7A (ENSVVUG00000018163) Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b.c.b ##22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b.c.b ##22 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b.c.b ##22 American mink MODERN SPECIES 11 POLR3A (ENSNVIG00000003446) DLG5 (ENSNVIG00000003623) KCNMA1 (ENSNVIG00000003936) LRMDA (ENSNVIG00000007862) ZNF503 (ENSNVIG00000007904) COMTD1 (ENSNVIG00000007928) VDAC2 (ENSNVIG00000007976) SAMD8 (ENSNVIG00000008018) DUSP13 (ENSNVIG00000008093) DUSP29 (ENSNVIG00000008146) KAT6B (ENSNVIG00000008156) ENSNVIG00000008395 ADK (ENSNVIG00000008422) AP3M1 (ENSNVIG00000008511) VCL (ENSNVIG00000008540) ENSNVIG00000008639 ##22 UROK (ENSNVIG00000008659) CAMK2G (ENSNVIG00000008742) NDST2 (ENSNVIG00000009010) ZSWIM8 (ENSNVIG00000009105) CHCHD1 (ENSNVIG00000009208) ENSNVIG00000009223 FUT11 (ENSNVIG00000009230) ENSNVIG00000009237 SYNPO2L (ENSNVIG00000009281) MYOZ1 (ENSNVIG00000009286) USP54 (ENSNVIG00000009315) PPP3CB (ENSNVIG00000009379) MSS51 (ENSNVIG00000009507) ANXA7 (ENSNVIG00000009547) CFAP70 (ENSNVIG00000009593) Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b.c.b ##22 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b.c.b ##22 Dog MODERN SPECIES 29 RAPGEF4 (ENSCAFG00845028929) MAP3K20 (ENSCAFG00845029200) ENSCAFG00845029341 SP3 (ENSCAFG00845029530) OLA1 (ENSCAFG00845029594) SP9 (ENSCAFG00845029658) CIR1 (ENSCAFG00845015697) SCRN3 (ENSCAFG00845015754) GPR155 (ENSCAFG00845015821) ENSCAFG00845015883 WIPF1 (ENSCAFG00845016036) CHRNA1 (ENSCAFG00845016336) CHN1 (ENSCAFG00845017147) ATF2 (ENSCAFG00845017708) ATP5MC3 (ENSCAFG00845018248) ENSCAFG00845018368 ##22 LNPK (ENSCAFG00845018510) EVX2 (ENSCAFG00845018704) HOXD13 (ENSCAFG00845018741) HOXD12 (ENSCAFG00845018775) ENSCAFG00845018802 HOXD9 (ENSCAFG00845018856) HOXD10 (ENSCAFG00845019028) HOXD4 (ENSCAFG00845019072) HOXD3 (ENSCAFG00845019275) HOXD1 (ENSCAFG00845019313) MTX2 (ENSCAFG00845019381) HNRNPA3 (ENSCAFG00845019864) NFE2L2 (ENSCAFG00845020022) AGPS (ENSCAFG00845020190) TTC30A (ENSCAFG00845020493) Laurasiatheria_b DUPLICATION Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b.d.a ##22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b.d.a ##22 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b.d.a ##22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b.d.a ##22 Microbat MODERN SPECIES 1214 ENSMLUG00000023940 ENSMLUG00000027149 ##22 ENSMLUG00000014756 LRRTM4 (ENSMLUG00000014201) Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 1 NDUFA12 (ENSRFEG00010000814) KCNA5 (ENSRFEG00010000848) #7 NTF3 (ENSRFEG00010000870) #9 ANO2 (ENSRFEG00010000920) VWF (ENSRFEG00010001025) #10 CD9 (ENSRFEG00010001199) #12 PLEKHG6 (ENSRFEG00010001287) #13 TNFRSF1A (ENSRFEG00010001395) #14 SCNN1A (ENSRFEG00010001487) #15 VAMP1 (ENSRFEG00010001570) #19 LTBR (ENSRFEG00010001600) #16 CD27 (ENSRFEG00010001691) TAPBPL (ENSRFEG00010001724) #18 MRPL51 (ENSRFEG00010001755) #20 NCAPD2 (ENSRFEG00010001784) #21 ENSRFEG00010001850 ##22 IFFO1 (ENSRFEG00010001885) #23 NOP2 (ENSRFEG00010001957) CHD4 (ENSRFEG00010002190) #25 LPAR5 (ENSRFEG00010002641) #26 ACRBP (ENSRFEG00010002675) #27 ING4 (ENSRFEG00010002769) #28 ZNF384 (ENSRFEG00010002854) #29 PIANP (ENSRFEG00010002897) #30 ENSRFEG00010002934 COPS7A (ENSRFEG00010002955) #31 MLF2 (ENSRFEG00010002982) #32 PTMS (ENSRFEG00010003014) LAG3 (ENSRFEG00010003036) #35 CD4 (ENSRFEG00010003064) #36 GPR162 (ENSRFEG00010003086) #37 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b.d.a ##22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b.d.a ##22 Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b.d.a ##22 Red fox DUPLICATION Red fox MODERN SPECIES 78 ENSVVUG00000029152 ENSVVUG00000029151 ENSVVUG00000029148 ENSVVUG00000029147 ENSVVUG00000029146 ENSVVUG00000029144 ##22 TDRD3 (ENSVVUG00000029140) DIAPH3 (ENSVVUG00000028837) ENSVVUG00000028816 PCDH17 (ENSVVUG00000028814) ENSVVUG00000028813 ENSVVUG00000028807 ENSVVUG00000028805 ENSVVUG00000028804 ENSVVUG00000028792 ENSVVUG00000028790 OLFM4 (ENSVVUG00000028777) PCDH8 (ENSVVUG00000028776) CNMD (ENSVVUG00000028772) SUGT1 (ENSVVUG00000028767) ELF1 (ENSVVUG00000028763) Red fox MODERN SPECIES 31 MAP3K3 (ENSVVUG00000005830) TACO1 (ENSVVUG00000005809) ENSVVUG00000005807 DCAF7 (ENSVVUG00000005804) KCNH6 (ENSVVUG00000005784) ENSVVUG00000005759 ACE (ENSVVUG00000005728) CYB561 (ENSVVUG00000005723) TANC2 (ENSVVUG00000005635) MARCHF10 (ENSVVUG00000005620) MRC2 (ENSVVUG00000005555) TLK2 (ENSVVUG00000005522) ENSVVUG00000005506 EFCAB3 (ENSVVUG00000005501) ENSVVUG00000005455 ENSVVUG00000005452 ##22 ITGB3 (ENSVVUG00000005435) MYL4 (ENSVVUG00000005422) CDC27 (ENSVVUG00000005408) ENSVVUG00000005406 KANSL1 (ENSVVUG00000005395) MAPT (ENSVVUG00000005337) ENSVVUG00000005327 CRHR1 (ENSVVUG00000005211) ARL17A (ENSVVUG00000005175) NSF (ENSVVUG00000005154) ENSVVUG00000005141 WNT9B (ENSVVUG00000005120) GOSR2 (ENSVVUG00000005103) LYZL6 (ENSVVUG00000005096) Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b.d.b ##22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b.d.b ##22 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b.d.b ##22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.m.b.b.d.b ##22 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 2 BACE1 (ENSRFEG00010009508) RNF214 (ENSRFEG00010009434) PCSK7 (ENSRFEG00010009375) ENSRFEG00010009353 SIDT2 (ENSRFEG00010009244) PAFAH1B2 (ENSRFEG00010009155) ENSRFEG00010009106 SIK3 (ENSRFEG00010008977) APOA1 (ENSRFEG00010008873) ENSRFEG00010008809 APOA4 (ENSRFEG00010008766) ENSRFEG00010008710 APOA5 (ENSRFEG00010008677) ZNF259 (ENSRFEG00010008540) BUD13 (ENSRFEG00010008489) ENSRFEG00010008409 ##22 ENSRFEG00010008357 CADM1 (ENSRFEG00010007749) NXPE1 (ENSRFEG00010007603) REXO2 (ENSRFEG00010007459) ENSRFEG00010007427 RBM7 (ENSRFEG00010007375) C11orf71 (ENSRFEG00010007332) NNMT (ENSRFEG00010007304) ZBTB16 (ENSRFEG00010007284) HTR3A (ENSRFEG00010007230) HTR3B (ENSRFEG00010007133) USP28 (ENSRFEG00010006791) ZW10 (ENSRFEG00010015705) TMPRSS5 (ENSRFEG00010014953) DRD2 (ENSRFEG00010014855) Platypus MODERN SPECIES 87 ENSOANG00000043479 ENSOANG00000014697 ENSOANG00000051292 FGF6 (ENSOANG00000020755) C12orf4 (ENSOANG00000039330) ENSOANG00000011973 ENSOANG00000002548 AKAP3 (ENSOANG00000042546) NDUFA9 (ENSOANG00000015719) KCNA6 (ENSOANG00000014376) KCNA1 (ENSOANG00000008085) KCNA5 (ENSOANG00000044609) #7 NTF3 (ENSOANG00000001146) #9 ANO2 (ENSOANG00000036505) VWF (ENSOANG00000040443) #10 GAPDH (ENSOANG00000004492) #22 CD9 (ENSOANG00000048710) #12 ENSOANG00000038811 #13 ENSOANG00000044825 #14 SCNN1A (ENSOANG00000001688) #15 ENSOANG00000039739 #16 ENSOANG00000007602 #18 ENSOANG00000038559 #19 MRPL51 (ENSOANG00000003012) #20 NCAPD2 (ENSOANG00000003013) #21 ENSOANG00000043432 #23 NOP2 (ENSOANG00000047605) CHD4 (ENSOANG00000015700) #25 LPAR5 (ENSOANG00000050733) #26 ENSOANG00000037768 #27 ING4 (ENSOANG00000036657) #28 Sauria ANCESTRAL SPECIES 49 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000180930 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298 #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00990000212708 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 65 ENSGT00940000160920 ENSGT00940000154273.a ENSGT00940000171511 ENSGT00950000183106.a.b ENSGT00940000157383 ENSGT00940000156657 ENSGT00940000168148 ENSGT00440000033697 ENSGT01090000260044.D.i ENSGT00940000153255 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000180930 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298 #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00990000212708 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00940000168928 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 tuatara MODERN SPECIES 1253 KIF21B (ENSSPUG00000015766) ENSSPUG00000015502 ENSSPUG00000015490 TRIM45 (ENSSPUG00000015481) VTCN1 (ENSSPUG00000015444) SCNN1A (ENSSPUG00000015425) #15 VAMP1 (ENSSPUG00000015408) #19 MRPL51 (ENSSPUG00000015396) #20 ENSSPUG00000015391 NCAPD2 (ENSSPUG00000015362) #21 GAPDH (ENSSPUG00000015279) #22 IFFO1 (ENSSPUG00000015263) #23 NOP2 (ENSSPUG00000015240) CHD4 (ENSSPUG00000015131) #25 LPAR5 (ENSSPUG00000015098) #26 ENSSPUG00000014998 ING4 (ENSSPUG00000014965) #28 ZNF384 (ENSSPUG00000014935) #29 COPS7A (ENSSPUG00000014867) #31 MLF2 (ENSSPUG00000014850) #32 ENSSPUG00000014840 #36 GNB3 (ENSSPUG00000014719) ENSSPUG00000014712 USP5 (ENSSPUG00000014695) TPI1 (ENSSPUG00000014685) LRRC23 (ENSSPUG00000014664) Episquamata ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT01050000244815.B.a.b ENSGT00940000160920 ENSGT00940000154273.a ENSGT00950000183106.a.b ENSGT00940000157383 ENSGT00940000156657 ENSGT00940000168148 ENSGT00440000033697 ENSGT01100000263477.C ENSGT01090000260044.D.i.a.a ENSGT00940000153255 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298 #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00990000212708 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00990000211157 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Toxicofera ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000156687.g.e ENSGT01050000244815.B.a.b ENSGT00940000160920 ENSGT00940000154273.a ENSGT00950000183106.a.b ENSGT00940000157383 ENSGT00940000156657 ENSGT00440000033697 ENSGT01100000263477.C ENSGT01090000260044.D.i.a.a ENSGT00940000153255 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298 #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00990000211157 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 ENSGT01000000214413.b.a.b.a Elapidae ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00440000033697 ENSGT01090000260044.D.i.a.a.b ENSGT00940000153255 ENSGT01090000260044.D.i.a.b ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298 #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033.e #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT00940000168928 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT01030000236833 Indian cobra MODERN SPECIES 1 CLCN1 (ENSNNAG00000007371) ENSNNAG00000015703 ENSNNAG00000015688 ENSNNAG00000015679 ENSNNAG00000015647 ENSNNAG00000015627 ENSNNAG00000015536 ENSNNAG00000015502 ENSNNAG00000015497 ENSNNAG00000015489 ENSNNAG00000015485 SCNN1A (ENSNNAG00000015407) #15 VAMP1 (ENSNNAG00000015372) #19 MRPL51 (ENSNNAG00000015367) #20 NCAPD2 (ENSNNAG00000015351) #21 GAPDH (ENSNNAG00000015325) #22 IFFO1 (ENSNNAG00000015319) #23 NOP2 (ENSNNAG00000015292) CHD4 (ENSNNAG00000014801) #25 LPAR5 (ENSNNAG00000014754) #26 ENSNNAG00000014724 #28 ENSNNAG00000014716 #27 ENSNNAG00000014706 #28 ZNF384 (ENSNNAG00000014615) #29 COPS7A (ENSNNAG00000014570) #31 MLF2 (ENSNNAG00000014552) #32 ENSNNAG00000014534 ENSNNAG00000014513 GPR162 (ENSNNAG00000014481) #37 P3H3 (ENSNNAG00000014400) GNB3 (ENSNNAG00000014368) Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES 47 ENSGT01090000260044.D.i.a.a.a ENSGT01090000260044.D.i.a.b ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298 #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033.e #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT00940000168928 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000168539 Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT01090000260044.D.i.a.a.a ENSGT01090000260044.D.i.a.b ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298 #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033.e #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT00940000168928 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000168539 Eastern brown snake MODERN SPECIES 59 ENSPTXG00000017330 ENSPTXG00000017333 ENSPTXG00000017335 ENSPTXG00000017337 SCNN1A (ENSPTXG00000017340) #15 VAMP1 (ENSPTXG00000017350) #19 MRPL51 (ENSPTXG00000017351) #20 NCAPD2 (ENSPTXG00000017352) #21 GAPDH (ENSPTXG00000017354) #22 IFFO1 (ENSPTXG00000017355) #23 NOP2 (ENSPTXG00000017361) CHD4 (ENSPTXG00000017528) #25 LPAR5 (ENSPTXG00000019079) #26 ACRBP (ENSPTXG00000019083) #27 ING4 (ENSPTXG00000019084) #28 ZNF384 (ENSPTXG00000014216) #29 PIANP (ENSPTXG00000014220) #30 COPS7A (ENSPTXG00000014221) #31 MLF2 (ENSPTXG00000014223) #32 GPR162 (ENSPTXG00000014224) #37 P3H3 (ENSPTXG00000014225) GNB3 (ENSPTXG00000014230) ENSPTXG00000014233 USP5 (ENSPTXG00000014234) Mainland tiger snake MODERN SPECIES 384 ENSNSUG00000015745 SCNN1A (ENSNSUG00000015746) #15 VAMP1 (ENSNSUG00000015747) #19 MRPL51 (ENSNSUG00000015748) #20 NCAPD2 (ENSNSUG00000015749) #21 GAPDH (ENSNSUG00000015751) #22 IFFO1 (ENSNSUG00000015752) #23 NOP2 (ENSNSUG00000015753) CHD4 (ENSNSUG00000015782) #25 LPAR5 (ENSNSUG00000018702) #26 ENSNSUG00000018703 #27 ENSNSUG00000018709 #28 ZNF384 (ENSNSUG00000018710) #29 Blue-lipped sea krait MODERN SPECIES 7556 GAPDH (ENSLLTG00000010621) #22 IFFO1 (ENSLLTG00000010640) #23 NOP2 (ENSLLTG00000010661) CHD4 (ENSLLTG00000010750) #25 Lizard MODERN SPECIES 994 ENSACAG00000006853 ENSACAG00000041858 ENSACAG00000034729 ENSACAG00000036395 ENSACAG00000038435 ENSACAG00000042900 ENSACAG00000038456 ENSACAG00000006850 ENSACAG00000045492 ENSACAG00000034747 ENSACAG00000035988 ENSACAG00000006704 #15 VAMP1 (ENSACAG00000006678) #19 MRPL51 (ENSACAG00000042185) #20 NCAPD2 (ENSACAG00000006580) #21 GAPDH (ENSACAG00000006502) #22 IFFO1 (ENSACAG00000006451) #23 NOP2 (ENSACAG00000006397) CHD4 (ENSACAG00000006231) #25 LPAR5 (ENSACAG00000006228) #26 ENSACAG00000006209 #27 ING4 (ENSACAG00000006150) #28 ZNF384 (ENSACAG00000006099) #29 PIANP (ENSACAG00000006078) #30 Laterata ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00950000186294 ENSGT01050000244815.B.a.b ENSGT00940000160920 ENSGT00940000154273.a ENSGT00950000183106.a.b ENSGT00940000157383 ENSGT00940000156657 ENSGT00940000168148 ENSGT00440000033697 ENSGT01100000263477.C ENSGT01090000260044.D.i.a.a ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298 #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00990000212708 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00990000211157 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Common wall lizard MODERN SPECIES 8 ENSPMRG00000020861 ENSPMRG00000020856 ENSPMRG00000020851 ENSPMRG00000020848 ENSPMRG00000020843 ENSPMRG00000020838 ENSPMRG00000020830 ENSPMRG00000020822 ENSPMRG00000020812 ENSPMRG00000018681 ENSPMRG00000018676 SCNN1A (ENSPMRG00000018663) #15 NCAPD2 (ENSPMRG00000018629) #21 IFFO1 (ENSPMRG00000018615) #23 NOP2 (ENSPMRG00000018604) GAPDH (ENSPMRG00000018588) #22 CHD4 (ENSPMRG00000018512) #25 ENSPMRG00000018490 LPAR5 (ENSPMRG00000018488) #26 ENSPMRG00000018478 ENSPMRG00000018471 ING4 (ENSPMRG00000018462) #28 ENSPMRG00000018449 ZNF384 (ENSPMRG00000018429) #29 PIANP (ENSPMRG00000018419) #30 COPS7A (ENSPMRG00000018410) #31 ENSPMRG00000018406 MLF2 (ENSPMRG00000018362) #32 LAG3 (ENSPMRG00000018333) #35 ENSPMRG00000018312 GPR162 (ENSPMRG00000018296) #37 Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 45 ENSSMRG00000011070 MIX23 (ENSSMRG00000011076) FAM162A (ENSSMRG00000011077) KPNA1 (ENSSMRG00000011078) FBXO40 (ENSSMRG00000011079) STYK1 (ENSSMRG00000011080) SYCE3 (ENSSMRG00000011083) ADGRL3 (ENSSMRG00000011162) ENSSMRG00000011202 DUSP12 (ENSSMRG00000011206) ENSSMRG00000011255 SCNN1A (ENSSMRG00000011262) #15 VAMP1 (ENSSMRG00000011272) #19 MRPL51 (ENSSMRG00000011274) #20 NCAPD2 (ENSSMRG00000011275) #21 GAPDH (ENSSMRG00000011286) #22 IFFO1 (ENSSMRG00000011735) #23 NOP2 (ENSSMRG00000011771) CHD4 (ENSSMRG00000011880) #25 LPAR5 (ENSSMRG00000019102) #26 ENSSMRG00000019103 ENSSMRG00000019105 #27 ING4 (ENSSMRG00000019106) #28 ZNF384 (ENSSMRG00000019107) #29 PIANP (ENSSMRG00000019109) #30 COPS7A (ENSSMRG00000019110) #31 ENSSMRG00000019111 MLF2 (ENSSMRG00000019112) #32 ENSSMRG00000019113 ENSSMRG00000019114 GPR162 (ENSSMRG00000019118) #37 Archelosauria ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00820000127150 ENSGT00940000157498 ENSGT00940000161500 ENSGT00940000157596 ENSGT00940000154826 ENSGT00940000155717 ENSGT00390000011053 ENSGT00640000091497.a.o ENSGT01050000244950.a.a.a ENSGT00950000183204.a ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000180930 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298 #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00990000212708 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT00950000185787 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 Cryptodira ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155444 ENSGT00820000127150 ENSGT00940000157498 ENSGT00940000157596.j ENSGT00940000154826 ENSGT00940000155717 ENSGT00390000011053 ENSGT00640000091497.a.o ENSGT01050000244950.a.a.a ENSGT00950000183204.a ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000180930 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298 #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00940000159654 ENSGT00940000153675.a.a.b ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT00950000185787 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 Chinese turtle MODERN SPECIES 1166 CSTA (ENSPSIG00000017000) ENSPSIG00000016991 MIX23 (ENSPSIG00000016987) FAM162A (ENSPSIG00000016970) KPNA1 (ENSPSIG00000016887) FBXO40 (ENSPSIG00000016880) SCNN1A (ENSPSIG00000016541) #15 ENSPSIG00000016512 MRPL51 (ENSPSIG00000016487) #20 NCAPD2 (ENSPSIG00000016447) #21 GAPDH (ENSPSIG00000016258) #22 IFFO1 (ENSPSIG00000016191) #23 NOP2 (ENSPSIG00000016127) CHD4 (ENSPSIG00000015546) #25 LPAR5 (ENSPSIG00000001680) #26 ENSPSIG00000015498 ACRBP (ENSPSIG00000015272) #27 ING4 (ENSPSIG00000015200) #28 ENSPSIG00000015173 #29 PIANP (ENSPSIG00000015128) #30 COPS7A (ENSPSIG00000015085) #31 MLF2 (ENSPSIG00000014808) #32 ENSPSIG00000014771 #35 ENSPSIG00000014631 #36 GPR162 (ENSPSIG00000014547) #37 P3H3 (ENSPSIG00000014258) Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00820000127150 ENSGT00940000157498 ENSGT00940000157596.j ENSGT00940000154826 ENSGT00940000155717 ENSGT00390000011053 ENSGT00640000091497.a.o ENSGT01050000244950.a.a.a ENSGT00950000183204.a ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821.x #20 ENSGT00940000180930 ENSGT00390000018821.w #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298 #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00940000159654 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT00950000185787 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 Emydidae ANCESTRAL SPECIES 57 ENSGT00940000155717.b ENSGT00390000011053 ENSGT00640000091497.a.o ENSGT01050000244950.a.a.a ENSGT00950000183204.a ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821.x #20 ENSGT00940000153298 #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00940000159654 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT00940000168928 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Three-toed box turtle MODERN SPECIES 357 ENSTMTG00000004451 MIX23 (ENSTMTG00000004437) FAM162A (ENSTMTG00000004416) KPNA1 (ENSTMTG00000004353) FBXO40 (ENSTMTG00000004340) SCNN1A (ENSTMTG00000004309) #15 VAMP1 (ENSTMTG00000004297) #19 MRPL51 (ENSTMTG00000004280) #20 GAPDH (ENSTMTG00000004141) #22 IFFO1 (ENSTMTG00000004114) #23 NOP2 (ENSTMTG00000004069) CHD4 (ENSTMTG00000003980) #25 LPAR5 (ENSTMTG00000003957) #26 ENSTMTG00000003778 ACRBP (ENSTMTG00000003723) #27 ING4 (ENSTMTG00000003702) #28 ZNF384 (ENSTMTG00000003676) #29 PIANP (ENSTMTG00000003558) #30 COPS7A (ENSTMTG00000003508) #31 MLF2 (ENSTMTG00000003474) #32 ENSTMTG00000003450 ENSTMTG00000003376 #35 ENSTMTG00000008800 GPR162 (ENSTMTG00000008765) #37 painted turtle MODERN SPECIES 920 ENSCPBG00000000710 MIX23 (ENSCPBG00000000693) ENSCPBG00000000668 FAM162A (ENSCPBG00000000645) KPNA1 (ENSCPBG00000000593) FBXO40 (ENSCPBG00000000558) SCNN1A (ENSCPBG00000000498) #15 VAMP1 (ENSCPBG00000000451) #19 ENSCPBG00000000417 #20 GAPDH (ENSCPBG00000027732) #22 IFFO1 (ENSCPBG00000027730) #23 NOP2 (ENSCPBG00000027725) CHD4 (ENSCPBG00000027716) #25 LPAR5 (ENSCPBG00000027715) #26 ENSCPBG00000027713 ACRBP (ENSCPBG00000027712) #27 ING4 (ENSCPBG00000027709) #28 ZNF384 (ENSCPBG00000027704) #29 PIANP (ENSCPBG00000027702) #30 COPS7A (ENSCPBG00000027700) #31 MLF2 (ENSCPBG00000027696) #32 ENSCPBG00000027692 ENSCPBG00000027689 #36 GPR162 (ENSCPBG00000027687) #37 P3H3 (ENSCPBG00000027684) Testudinidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155418.a.a ENSGT00940000157596.j ENSGT00940000154826 ENSGT00940000155717 ENSGT00940000165953 ENSGT00390000011053 ENSGT00640000091497.a.o ENSGT01050000244950.a.a.a ENSGT00950000183204.a ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821.x #20 ENSGT00940000180930 ENSGT00390000018821.w #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298 #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00940000169199 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT00950000185787 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 Goode s thornscrub tortoise MODERN SPECIES MAN1A2 (ENSGEVG00005002823) ENSGEVG00005002850 CASR (ENSGEVG00005002867) CSTB (ENSGEVG00005002885) ENSGEVG00005002892 ENSGEVG00005002899 MIX23 (ENSGEVG00005002925) FAM162A (ENSGEVG00005002958) KPNA1 (ENSGEVG00005002970) FBXO40 (ENSGEVG00005002988) SCNN1A (ENSGEVG00005002994) #15 VAMP1 (ENSGEVG00005003014) #19 MRPL51 (ENSGEVG00005003025) #20 ENSGEVG00005003033 NCAPD2 (ENSGEVG00005003050) #21 GAPDH (ENSGEVG00005003083) #22 IFFO1 (ENSGEVG00005003106) #23 NOP2 (ENSGEVG00005003128) LPAR5 (ENSGEVG00005003431) #26 ENSGEVG00005003453 ENSGEVG00005003499 #27 ING4 (ENSGEVG00005003505) #28 ZNF384 (ENSGEVG00005003517) #29 PIANP (ENSGEVG00005003529) #30 COPS7A (ENSGEVG00005003541) #31 MLF2 (ENSGEVG00005008774) #32 ENSGEVG00005008802 ENSGEVG00005008834 #35 ENSGEVG00005008875 #36 ENSGEVG00005008896 ENSGEVG00005008913 Abingdon island giant tortoise DUPLICATION Abingdon island giant tortoise MODERN SPECIES 2530 GAPDH (ENSCABG00000011114) #22 Abingdon island giant tortoise MODERN SPECIES 987 ENSCABG00000013322 ENSCABG00000013323 PTPRN2 (ENSCABG00000013325) ENSCABG00000013332 ENSCABG00000013334 UBE3C (ENSCABG00000013366) MNX1 (ENSCABG00000013625) NOM1 (ENSCABG00000013627) LMBR1 (ENSCABG00000013634) RNF32 (ENSCABG00000013638) ENSCABG00000013641 #22 SHH (ENSCABG00000013644) Abingdon island giant tortoise MODERN SPECIES 833 ENSCABG00000020385 #20 NCAPD2 (ENSCABG00000020381) #21 ENSCABG00000020225 #22 Archosauria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00820000127150 ENSGT00940000157498 ENSGT00940000161500 ENSGT00940000157596 ENSGT00940000154826 ENSGT00940000155717 ENSGT00390000011053 ENSGT00640000091497.a.o ENSGT01050000244950.a.a.a ENSGT00950000183204.a ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00730000114155 ENSGT00940000153298 #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00990000212708 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT00950000185787 ENSGT00940000168928 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 Aves ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157498 ENSGT00940000161500 ENSGT00940000157596 ENSGT00940000154826 ENSGT00940000155717 ENSGT00390000011053 ENSGT00640000091497.a.o ENSGT01050000244950.a.a.a ENSGT00950000183204.a ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00730000114155 ENSGT00940000153298 #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00990000212708 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT00950000185787 ENSGT00940000168928 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 African ostrich MODERN SPECIES 972 ENSSCUG00000017834 CASR (ENSSCUG00000017836) CSTB (ENSSCUG00000017840) ENSSCUG00000017842 CSTA (ENSSCUG00000017844) ENSSCUG00000017845 FAM162A (ENSSCUG00000017847) KPNA1 (ENSSCUG00000017848) FBXO40 (ENSSCUG00000017851) TAPBPL (ENSSCUG00000017852) #18 ENSSCUG00000017860 #15 VAMP1 (ENSSCUG00000017868) #19 NCAPD2 (ENSSCUG00000017870) #21 ENSSCUG00000017873 ENSSCUG00000017875 GAPDH (ENSSCUG00000017876) #22 IFFO1 (ENSSCUG00000017877) #23 NOP2 (ENSSCUG00000017879) CHD4 (ENSSCUG00000017880) #25 LPAR5 (ENSSCUG00000017882) #26 ENSSCUG00000017883 ENSSCUG00000017884 ACRBP (ENSSCUG00000017885) #27 ING4 (ENSSCUG00000017887) #28 ZNF384 (ENSSCUG00000017890) #29 ENSSCUG00000017892 PIANP (ENSSCUG00000017894) #30 COPS7A (ENSSCUG00000017895) #31 ENSSCUG00000017897 MLF2 (ENSSCUG00000017898) #32 ENSSCUG00000017901 Neognathae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000157498 ENSGT00940000161500 ENSGT00940000157596 ENSGT00940000154826 ENSGT00940000155717 ENSGT00390000011053 ENSGT00640000091497.a.o ENSGT01050000244950.a.a.a ENSGT00950000183204.a ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00730000114155 ENSGT00940000153298 #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT00950000185787 ENSGT00940000168928 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157498 ENSGT00940000161500 ENSGT00940000157596 ENSGT00940000154826 ENSGT00940000155717 ENSGT00390000011053 ENSGT00640000091497.a.o ENSGT01050000244950.a.a.a ENSGT00950000183204.a ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00730000114155 ENSGT00940000153298 #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT00950000185787 ENSGT00940000168928 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 Passeriformes ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000155444 ENSGT00940000157498 ENSGT00940000161500 ENSGT00940000157596 ENSGT00940000154826 ENSGT00940000155717 ENSGT00390000011053 ENSGT00640000091497.a.o ENSGT01050000244950.a.a.a ENSGT00950000183204.a ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00730000114155 ENSGT00940000153298 #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT00950000185787 ENSGT00940000168928 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Great tit MODERN SPECIES MAN1A2 (ENSPMJG00000010162) ENSPMJG00000010158 CASR (ENSPMJG00000010157) CSTB (ENSPMJG00000010104) ENSPMJG00000010103 MIX23 (ENSPMJG00000010102) FAM162A (ENSPMJG00000010101) KPNA1 (ENSPMJG00000010100) FBXO40 (ENSPMJG00000010099) SCNN1A (ENSPMJG00000010098) #15 VAMP1 (ENSPMJG00000010097) #19 MRPL51 (ENSPMJG00000010096) #20 NCAPD2 (ENSPMJG00000010094) #21 ENSPMJG00000010093 ENSPMJG00000010092 #23 GAPDH (ENSPMJG00000007398) #22 ENSPMJG00000007376 #23 NOP2 (ENSPMJG00000007352) CHD4 (ENSPMJG00000007345) #25 LPAR5 (ENSPMJG00000007344) #26 ENSPMJG00000007341 ENSPMJG00000007337 #27 ING4 (ENSPMJG00000007335) #28 ZNF384 (ENSPMJG00000007327) #29 PIANP (ENSPMJG00000007323) #30 COPS7A (ENSPMJG00000007320) #31 MLF2 (ENSPMJG00000007317) #32 ENSPMJG00000007316 ENSPMJG00000007313 ENSPMJG00000007310 #36 GPR162 (ENSPMJG00000007307) #37 Passeriformes_d ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000155444 ENSGT00940000157498 ENSGT00940000161500 ENSGT00940000157596 ENSGT00940000154826 ENSGT00940000155717 ENSGT00390000011053 ENSGT00640000091497.a.o ENSGT01050000244950.a.a.a ENSGT00950000183204.a ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00730000114155 ENSGT00940000153298 #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT00950000185787 ENSGT00940000168928 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Flycatcher MODERN SPECIES ENSFALG00000027701 ENSFALG00000004998 ENSFALG00000004988 ENSFALG00000004975 ENSFALG00000004967 ENSFALG00000027758 MIX23 (ENSFALG00000004953) ENSFALG00000004944 KPNA1 (ENSFALG00000004916) ENSFALG00000004892 ENSFALG00000004870 #15 VAMP1 (ENSFALG00000004846) #19 MRPL51 (ENSFALG00000004836) #20 NCAPD2 (ENSFALG00000004826) #21 ENSFALG00000004823 GAPDH (ENSFALG00000023061) #22 IFFO1 (ENSFALG00000004808) #23 NOP2 (ENSFALG00000004797) CHD4 (ENSFALG00000004785) #25 LPAR5 (ENSFALG00000014540) #26 ACRBP (ENSFALG00000004771) #27 ING4 (ENSFALG00000004756) #28 PIANP (ENSFALG00000004734) #30 COPS7A (ENSFALG00000027863) #31 ENSFALG00000004741 #29 ENSFALG00000023328 ENSFALG00000004715 ENSFALG00000004705 #36 GPR162 (ENSFALG00000004699) #37 P3H3 (ENSFALG00000004696) GNB3 (ENSFALG00000004692) Passeriformes_g ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000155444 ENSGT00940000157498 ENSGT00940000161500 ENSGT00940000157596 ENSGT00940000154826 ENSGT00940000155717 ENSGT00390000011053 ENSGT00640000091497.a.o ENSGT01050000244950.a.a.a ENSGT00950000183204.a ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00730000114155 ENSGT00940000153298 #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT00950000185787 ENSGT00940000168928 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Passeroidea ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000155444 ENSGT00940000157498 ENSGT00940000161500 ENSGT00940000157596 ENSGT00940000154826 ENSGT00940000155717 ENSGT00390000011053 ENSGT00640000091497.a.o ENSGT01050000244950.a.a.a ENSGT00950000183204.a ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00730000114155 ENSGT00940000153298 #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT00950000185787 ENSGT00940000168928 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT00940000159164 Zebra finch MODERN SPECIES WARS2 (ENSTGUG00000021527) HAO2 (ENSTGUG00000013351) MAN1A2 (ENSTGUG00000013350) CD86 (ENSTGUG00000013349) CASR (ENSTGUG00000013348) CSTB (ENSTGUG00000013347) MIX23 (ENSTGUG00000023858) FAM162A (ENSTGUG00000028619) KPNA1 (ENSTGUG00000013344) FBXO40 (ENSTGUG00000013343) SCNN1A (ENSTGUG00000013342) #15 VAMP1 (ENSTGUG00000029109) #19 NCAPD2 (ENSTGUG00000013339) #21 ENSTGUG00000025583 ENSTGUG00000025317 GAPDH (ENSTGUG00000013338) #22 ENSTGUG00000021208 IFFO1 (ENSTGUG00000028638) #23 NOP2 (ENSTGUG00000013336) CHD4 (ENSTGUG00000013329) #25 LPAR5 (ENSTGUG00000013328) #26 ACRBP (ENSTGUG00000013326) #27 ING4 (ENSTGUG00000013323) #28 ZNF384 (ENSTGUG00000013319) #29 PIANP (ENSTGUG00000023446) #30 COPS7A (ENSTGUG00000013312) #31 ENSTGUG00000013310 #32 ENSTGUG00000013307 ENSTGUG00000013304 #36 GPR162 (ENSTGUG00000018169) #37 P3H3 (ENSTGUG00000013302) Common canary MODERN SPECIES 4 LPCAT3 (ENSSCAG00000014751) EMG1 (ENSSCAG00000014723) ENSSCAG00000014717 PHB2 (ENSSCAG00000014710) PTPN6 (ENSSCAG00000014698) C12orf57 (ENSSCAG00000014688) ATN1 (ENSSCAG00000014678) ENO2 (ENSSCAG00000014656) LRRC23 (ENSSCAG00000014644) FBXO40 (ENSSCAG00000014639) SCNN1A (ENSSCAG00000014632) #15 VAMP1 (ENSSCAG00000014630) #19 MRPL51 (ENSSCAG00000014627) #20 NCAPD2 (ENSSCAG00000014615) #21 ENSSCAG00000014608 GAPDH (ENSSCAG00000014296) #22 IFFO1 (ENSSCAG00000014177) #23 ENSSCAG00000014175 CHD4 (ENSSCAG00000012159) #25 ENSSCAG00000011715 LPAR5 (ENSSCAG00000011712) #26 ENSSCAG00000011706 #27 ING4 (ENSSCAG00000011701) #28 ZNF384 (ENSSCAG00000011700) #29 PIANP (ENSSCAG00000011676) #30 COPS7A (ENSSCAG00000011644) #31 MLF2 (ENSSCAG00000011635) #32 ENSSCAG00000011629 ENSSCAG00000011620 ENSSCAG00000011595 #36 GPR162 (ENSSCAG00000011592) #37 Medium ground finch MODERN SPECIES 23 ENSGFOG00000001359 MAN1A2 (ENSGFOG00000001368) ENSGFOG00000001401 CASR (ENSGFOG00000001412) CSTB (ENSGFOG00000001425) CSTA (ENSGFOG00000001450) MIX23 (ENSGFOG00000001601) FAM162A (ENSGFOG00000001617) KPNA1 (ENSGFOG00000001625) FBXO40 (ENSGFOG00000001639) SCNN1A (ENSGFOG00000001648) #15 VAMP1 (ENSGFOG00000001664) #19 MRPL51 (ENSGFOG00000001666) #20 NCAPD2 (ENSGFOG00000001676) #21 ENSGFOG00000001719 GAPDH (ENSGFOG00000001749) #22 IFFO1 (ENSGFOG00000001865) #23 NOP2 (ENSGFOG00000001873) CHD4 (ENSGFOG00000002570) #25 LPAR5 (ENSGFOG00000013232) #26 ACRBP (ENSGFOG00000013235) #27 ING4 (ENSGFOG00000013241) #28 ZNF384 (ENSGFOG00000013243) #29 PIANP (ENSGFOG00000013247) #30 COPS7A (ENSGFOG00000013250) #31 MLF2 (ENSGFOG00000013254) #32 ENSGFOG00000013258 ENSGFOG00000013260 ENSGFOG00000013276 #36 GPR162 (ENSGFOG00000013280) #37 P3H3 (ENSGFOG00000013283) Neognathae_c ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000157498 ENSGT00940000161500 ENSGT00940000157596 ENSGT00940000154826 ENSGT00940000155717 ENSGT00390000011053 ENSGT00640000091497.a.o ENSGT01050000244950.a.a.a ENSGT00950000183204.a ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00730000114155 ENSGT00940000153298 #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 Golden eagle MODERN SPECIES 23 MAN1A2 (ENSACCG00020016033) CD86 (ENSACCG00020016015) CASR (ENSACCG00020016005) CSTB (ENSACCG00020015994) CSTA (ENSACCG00020015985) MIX23 (ENSACCG00020015971) ENSACCG00020015948 KPNA1 (ENSACCG00020015930) FBXO40 (ENSACCG00020015916) TAPBPL (ENSACCG00020015886) #18 SCNN1A (ENSACCG00020015809) #15 VAMP1 (ENSACCG00020015750) #19 MRPL51 (ENSACCG00020015731) #20 NCAPD2 (ENSACCG00020015694) #21 ENSACCG00020015675 GAPDH (ENSACCG00020015661) #22 IFFO1 (ENSACCG00020015652) #23 NOP2 (ENSACCG00020015636) CHD4 (ENSACCG00020014713) #25 LPAR5 (ENSACCG00020013710) #26 ENSACCG00020013696 ACRBP (ENSACCG00020013667) #27 ING4 (ENSACCG00020013592) #28 ZNF384 (ENSACCG00020013549) #29 PIANP (ENSACCG00020013498) #30 COPS7A (ENSACCG00020013469) #31 MLF2 (ENSACCG00020013447) #32 ENSACCG00020013433 ENSACCG00020013369 #35 ENSACCG00020013263 #36 GPR162 (ENSACCG00020013153) #37 Kakapo MODERN SPECIES 28 ENSSHBG00005009363 SLC22A15 (ENSSHBG00005009376) MAB21L3 (ENSSHBG00005009404) ATP1A1 (ENSSHBG00005009427) ENSSHBG00005009455 ENSSHBG00005009467 MIX23 (ENSSHBG00005009487) FAM162A (ENSSHBG00005009499) KPNA1 (ENSSHBG00005009510) FBXO40 (ENSSHBG00005009521) SCNN1A (ENSSHBG00005009530) #15 VAMP1 (ENSSHBG00005009551) #19 MRPL51 (ENSSHBG00005009560) #20 NCAPD2 (ENSSHBG00005000924) #21 ENSSHBG00005000939 GAPDH (ENSSHBG00005000947) #22 IFFO1 (ENSSHBG00005000954) #23 NOP2 (ENSSHBG00005005753) CHD4 (ENSSHBG00005005796) #25 LPAR5 (ENSSHBG00005005929) #26 ENSSHBG00005005961 ENSSHBG00005005978 ING4 (ENSSHBG00005006006) #28 ZNF384 (ENSSHBG00005006044) #29 PIANP (ENSSHBG00005006099) #30 COPS7A (ENSSHBG00005006120) #31 MLF2 (ENSSHBG00005006148) #32 ENSSHBG00005006180 ENSSHBG00005006239 ENSSHBG00005006346 #36 GPR162 (ENSSHBG00005007180) #37 Galloanserae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000157498 ENSGT00940000161500 ENSGT00940000157596 ENSGT00940000154826 ENSGT00940000155717 ENSGT00390000011053 ENSGT00640000091497.a.o ENSGT01050000244950.a.a.a ENSGT00950000183204.a ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00730000114155 ENSGT00940000153298 #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT00950000185787 ENSGT00940000168928 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 Phasianidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157498 ENSGT00940000161500 ENSGT00940000157596 ENSGT00940000154826 ENSGT00940000155717 ENSGT00390000011053 ENSGT00640000091497.a.o ENSGT01050000244950.a.a.a ENSGT00950000183204.a ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00730000114155 ENSGT00940000153298 #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT00950000185787 ENSGT00940000168928 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 Phasianidae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157498 ENSGT00940000161500 ENSGT00940000157596 ENSGT00940000154826 ENSGT00940000155717 ENSGT00390000011053 ENSGT00640000091497.a.o ENSGT01050000244950.a.a.a ENSGT00950000183204.a ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00730000114155 ENSGT00940000153298 #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT00950000185787 ENSGT00940000168928 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 ENSGT00390000001745 #36 ENSGT00390000017213.A #37 Chicken MODERN SPECIES MAN1A2 (ENSGALG00010023053) CD86 (ENSGALG00010021372) CASR (ENSGALG00010021732) CSTB (ENSGALG00010021752) CSTA (ENSGALG00010021760) CCDC58 (ENSGALG00010021767) FAM162A (ENSGALG00010021786) KPNA1 (ENSGALG00010026081) FBXO40 (ENSGALG00010021826) TAPBPL (ENSGALG00010021854) #18 SCNN1A (ENSGALG00010021866) #15 VAMP1 (ENSGALG00010021801) #19 MRPL51 (ENSGALG00010021922) #20 NCAPD2 (ENSGALG00010021989) #21 CNP1 (ENSGALG00010022017) GAPDH (ENSGALG00010022038) #22 IFFO1 (ENSGALG00010022052) #23 NOP2 (ENSGALG00010022069) CHD4 (ENSGALG00010022093) #25 LPAR5 (ENSGALG00010021601) #26 ENSGALG00010021608 ACRBP (ENSGALG00010021614) #27 ING4 (ENSGALG00010021674) #28 ZNF384 (ENSGALG00010021687) #29 PIANP (ENSGALG00010021697) #30 COPS7A (ENSGALG00010021704) #31 MLF2 (ENSGALG00010021530) #32 ENSGALG00010023320 LAG3 (ENSGALG00010023324) #35 CD4 (ENSGALG00010023331) #36 GPR162 (ENSGALG00010023336) #37 Turkey MODERN SPECIES ENSMGAG00000014116 ENSMGAG00000014120 GPR162 (ENSMGAG00000014115) #37 ENSMGAG00000018668 ENSMGAG00000014111 CD4 (ENSMGAG00000014113) #36 ENSMGAG00000014109 #32 ENSMGAG00000014106 #31 ENSMGAG00000014103 #30 ZNF384 (ENSMGAG00000014101) #29 ENSMGAG00000014096 #26 ENSMGAG00000014097 #27 ING4 (ENSMGAG00000014098) #28 CHD4 (ENSMGAG00000014084) #25 NOP2 (ENSMGAG00000014082) GAPDH (ENSMGAG00000014005) #22 ENSMGAG00000014081 #23 ENSMGAG00000014095 ENSMGAG00000018438 MRPL51 (ENSMGAG00000014092) #20 ENSMGAG00000014003 #15 ENSMGAG00000014091 #19 ENSMGAG00000014001 ENSMGAG00000014002 #18 ENSMGAG00000019527 ENSMGAG00000013997 ENSMGAG00000013998 MIX23 (ENSMGAG00000013996) ENSMGAG00000013991 ENSMGAG00000013992 ENSMGAG00000013994 Japanese quail MODERN SPECIES ENSCJPG00005016702 MAN1A2 (ENSCJPG00005016703) CD86 (ENSCJPG00005016704) CASR (ENSCJPG00005016705) CSTB (ENSCJPG00005016706) MIX23 (ENSCJPG00005016707) FAM162A (ENSCJPG00005016708) KPNA1 (ENSCJPG00005016710) FBXO40 (ENSCJPG00005016711) TAPBPL (ENSCJPG00005016712) #18 SCNN1A (ENSCJPG00005016713) #15 VAMP1 (ENSCJPG00005016714) #19 MRPL51 (ENSCJPG00005016715) #20 NCAPD2 (ENSCJPG00005016716) #21 ENSCJPG00005016718 GAPDH (ENSCJPG00005016719) #22 IFFO1 (ENSCJPG00005016720) #23 ENSCJPG00005016725 CHD4 (ENSCJPG00005016726) #25 LPAR5 (ENSCJPG00005016728) #26 ACRBP (ENSCJPG00005016729) #27 ING4 (ENSCJPG00005016730) #28 ZNF384 (ENSCJPG00005016731) #29 PIANP (ENSCJPG00005016732) #30 COPS7A (ENSCJPG00005016746) #31 MLF2 (ENSCJPG00005016747) #32 ENSCJPG00005016749 ENSCJPG00005016750 ENSCJPG00005016751 #36 GPR162 (ENSCJPG00005016752) #37 P3H3 (ENSCJPG00005016753) Anatidae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000018717.b.a.b ENSGT00940000155444 ENSGT00940000157498 ENSGT00940000161500 ENSGT00940000157596 ENSGT00940000154826 ENSGT00390000011053 ENSGT00640000091497.a.o ENSGT01050000244950.a.a.a ENSGT00950000183204.a ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000161390 #19 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00730000114155 ENSGT00940000153298 #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00930000151052 ENSGT00940000159654 ENSGT00940000153675.a.a.b ENSGT00390000000826 #27 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT00940000159873 #31 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT00950000185787 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #35 Pink-footed goose MODERN SPECIES 319 TAPBPL (ENSABRG00000012770) #18 SCNN1A (ENSABRG00000012757) #15 VAMP1 (ENSABRG00000012750) #19 MRPL51 (ENSABRG00000012749) #20 NCAPD2 (ENSABRG00000012735) #21 GAPDH (ENSABRG00000012729) #22 IFFO1 (ENSABRG00000012700) #23 ENSABRG00000012688 CHD4 (ENSABRG00000012671) #25 LPAR5 (ENSABRG00000012668) #26 ENSABRG00000012659 ACRBP (ENSABRG00000012652) #27 ING4 (ENSABRG00000012599) #28 ZNF384 (ENSABRG00000012587) #29 PIANP (ENSABRG00000012579) #30 COPS7A (ENSABRG00000012574) #31 MLF2 (ENSABRG00000012568) #32 ENSABRG00000012557 LAG3 (ENSABRG00000012548) #35 ENSABRG00000012533 #36 GPR162 (ENSABRG00000012527) #37 Australian saltwater crocodile MODERN SPECIES 60 PTCRA (ENSCPRG00005008097) ENSCPRG00005008091 POLR1B (ENSCPRG00005008080) TTL (ENSCPRG00005008072) TAPBPL (ENSCPRG00005008048) #18 SCNN1A (ENSCPRG00005008027) #15 VAMP1 (ENSCPRG00005008021) #19 ENSCPRG00005008010 MRPL51 (ENSCPRG00005008007) #20 NCAPD2 (ENSCPRG00005007847) #21 ENSCPRG00005007828 ENSCPRG00005007821 MAG (ENSCPRG00005007802) LSR (ENSCPRG00005007774) GAPDHS (ENSCPRG00005007750) GAPDH (ENSCPRG00005007744) #22 IFFO1 (ENSCPRG00005007699) #23 NOP2 (ENSCPRG00005007691) CHD4 (ENSCPRG00005006161) #25 LPAR5 (ENSCPRG00005005932) #26 ENSCPRG00005005863 ENSCPRG00005005847 ING4 (ENSCPRG00005005824) #28 ZNF384 (ENSCPRG00005005809) #29 PIANP (ENSCPRG00005005804) #30 COPS7A (ENSCPRG00005005800) #31 MLF2 (ENSCPRG00005005783) #32 ENSCPRG00005005775 ENSCPRG00005005769 ENSCPRG00005005677 GPR162 (ENSCPRG00005005667) #37 Anura ANCESTRAL SPECIES 104 ENSGT00390000013354 ENSGT00940000156036 ENSGT00940000168539 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000159164 ENSGT00390000001652.e ENSGT00390000017213.A #37 ENSGT01010000229504 ENSGT00940000168928 ENSGT00390000005023.a #32 ENSGT00510000049460 #30 ENSGT01000000218818 ENSGT00940000156904 #29 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298 #22 ENSGT00510000046803.b.b #23 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000155088 #25 ENSGT00950000183136.b.b #26 ENSGT00390000000826.a #27 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000160952 #15 ENSGT00940000159540 #14 Leishan spiny toad DUPLICATION Leishan spiny toad DUPLICATION Leishan spiny toad DUPLICATION Leishan spiny toad MODERN SPECIES 9 USP5 (ENSLLEG00000014032) ENSLLEG00000013931 GNB3 (ENSLLEG00000013724) P3H3 (ENSLLEG00000013626) ENSLLEG00000013598 ENSLLEG00000013521 GPR162 (ENSLLEG00000013469) #37 ENSLLEG00000013414 ENSLLEG00000013367 MLF2 (ENSLLEG00000013309) #32 PIANP (ENSLLEG00000013255) #30 ENSLLEG00000013203 ZNF384 (ENSLLEG00000013153) #29 ING4 (ENSLLEG00000012932) #28 NCAPD2 (ENSLLEG00000012569) #21 ENSLLEG00000012378 #22 IFFO1 (ENSLLEG00000012304) #23 NOP2 (ENSLLEG00000012191) CHD4 (ENSLLEG00000011789) #25 ENSLLEG00000011744 LPAR5 (ENSLLEG00000011710) #26 ENSLLEG00000011570 #27 MRPL51 (ENSLLEG00000011509) #20 ENSLLEG00000011487 TAPBPL (ENSLLEG00000011421) #18 SCNN1A (ENSLLEG00000011175) #15 ENSLLEG00000011089 ENSLLEG00000010948 ENSLLEG00000010118 ENSLLEG00000010017 ENSLLEG00000009979 Leishan spiny toad MODERN SPECIES 959 ENSLLEG00000010085 ENSLLEG00000010050 ENSLLEG00000009987 #22 ENSLLEG00000009886 ENSLLEG00000009768 Leishan spiny toad MODERN SPECIES ENSLLEG00000015080 ENSLLEG00000015002 ENSLLEG00000014910 ENSLLEG00000014881 ENSLLEG00000014822 ENSLLEG00000014795 ENSLLEG00000014631 ENSLLEG00000014522 ENSLLEG00000014508 ENSLLEG00000014481 ENSLLEG00000014402 ENSLLEG00000014290 ENSLLEG00000014145 ENSLLEG00000014057 ENSLLEG00000014015 ENSLLEG00000013951 #22 ENSLLEG00000013912 ENSLLEG00000013893 ENSLLEG00000027600 GFRA4 (ENSLLEG00000027570) ENSLLEG00000027547 ATRN (ENSLLEG00000027210) DNAAF9 (ENSLLEG00000026980) ENSLLEG00000026896 ENSLLEG00000026871 SLC4A11 (ENSLLEG00000026555) ENSLLEG00000026501 ENSLLEG00000026488 ENSLLEG00000026465 DDRGK1 (ENSLLEG00000026398) ENSLLEG00000026355 Leishan spiny toad MODERN SPECIES 1 ENSLLEG00000022209 PSMC3 (ENSLLEG00000022403) ENSLLEG00000023282 RAPSN (ENSLLEG00000023499) CELF1 (ENSLLEG00000023639) PTPMT1 (ENSLLEG00000024438) KBTBD4 (ENSLLEG00000024539) NDUFS3 (ENSLLEG00000024831) C1QTNF4 (ENSLLEG00000024939) MTCH2 (ENSLLEG00000024984) ENSLLEG00000025090 AGBL2 (ENSLLEG00000025192) FNBP4 (ENSLLEG00000025466) NUP160 (ENSLLEG00000025631) ENSLLEG00000025845 ENSLLEG00000025893 #22 ENSLLEG00000025966 EXT2 (ENSLLEG00000026298) ENSLLEG00000026382 ENSLLEG00000026394 ALX4 (ENSLLEG00000026424) ENSLLEG00000026456 ENSLLEG00000026475 ENSLLEG00000026496 CD82 (ENSLLEG00000026529) ENSLLEG00000026615 OSBPL5 (ENSLLEG00000026745) ENSLLEG00000026916 ENSLLEG00000026929 ENSLLEG00000026965 CARS1 (ENSLLEG00000027019) Frog MODERN SPECIES 7 tpi1 (ENSXETG00000023924) usp5 (ENSXETG00000023925) gnb3 (ENSXETG00000009466) rassf6 (ENSXETG00000011541) XB5901519 [provisional:tprg1l] (ENSXETG00000043473) gpr162 (ENSXETG00000035772) #37 cd4 (ENSXETG00000036441) mlf2 (ENSXETG00000011538) #32 ENSXETG00000035333 ENSXETG00000044747 pianp (ENSXETG00000031467) #30 XB1017155 [provisional] (ENSXETG00000026414) znf384 (ENSXETG00000011532) #29 ing4 (ENSXETG00000035975) #28 ncapd2 (ENSXETG00000011528) #21 gapdh (ENSXETG00000033975) #22 ENSXETG00000049149 #23 ENSXETG00000026411 ##23 nop2 (ENSXETG00000011515) #24 chd4 (ENSXETG00000026410) #25 LPAR5 (ENSXETG00000018959) #26 TAPBPL (ENSXETG00000018958) #18 ltbr (ENSXETG00000044559) scnn1a (ENSXETG00000018954) #15 tnfrsf1a (ENSXETG00000032118) #14 ENSXETG00000025330 ENSXETG00000032606 ENSXETG00000037975 ENSXETG00000036891 ENSXETG00000040694 ENSXETG00000038140 Coelacanth MODERN SPECIES 1294 ENSLACG00000022535 ING4 (ENSLACG00000012058) #28 ncapd2 (ENSLACG00000011632) #21 GAPDH (ENSLACG00000011191) #22 ENSLACG00000010385 GPR162 (ENSLACG00000009003) #37 P3H3 (ENSLACG00000008027) GNB3 (ENSLACG00000007482) ENSLACG00000007132 USP5 (ENSLACG00000006506) TPI1 (ENSLACG00000006017) SPSB2 (ENSLACG00000005624) ENSLACG00000005189 ENSLACG00000005021 ENSLACG00000003562 ENSLACG00000003293 LRRC23 (ENSLACG00000003272) ENSLACG00000002451 ENO2 (ENSLACG00000001952) Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 464 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000153298 #22 ENSGT01100000263524.B.a.a ENSGT00940000159540.d #14 ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00390000018821 #20 Reedfish DUPLICATION Reedfish MODERN SPECIES 17 casp2 (ENSECRG00000008267) ENSECRG00000008284 ENSECRG00000008303 ENSECRG00000008330 ENSECRG00000008347 zgc:92606 (ENSECRG00000008356) ENSECRG00000008370 emg1 (ENSECRG00000008388) ENSECRG00000008398 ENSECRG00000008404 ENSECRG00000008410 nop2 (ENSECRG00000008420) ing4 (ENSECRG00000008453) #28 ncapd2 (ENSECRG00000008492) #21 ENSECRG00000008543 gapdh (ENSECRG00000008565) #22 opn9 (ENSECRG00000008619) IFFO1 (ENSECRG00000008680) #23 ENSECRG00000008701 ENSECRG00000008717 ENSECRG00000008738 ENSECRG00000008764 #14 ENSECRG00000008779 #18 ENSECRG00000008790 ENSECRG00000008803 #19 VAMP1 (ENSECRG00000008811) #19 mrpl51 (ENSECRG00000008820) #20 ENSECRG00000008833 ENSECRG00000008850 ENSECRG00000008860 ENSECRG00000008883 Reedfish MODERN SPECIES 16 ece1 (ENSECRG00000010411) EIF4G3 (ENSECRG00000010358) HP1BP3 (ENSECRG00000010318) ENSECRG00000010297 ddx19a (ENSECRG00000010279) ubxn10 (ENSECRG00000010262) taf10 (ENSECRG00000010249) ube2j2 (ENSECRG00000010231) acap3b (ENSECRG00000010173) PUSL1 (ENSECRG00000010119) ENSECRG00000010110 ints11 (ENSECRG00000009949) cptp (ENSECRG00000009886) c1qtnf12 (ENSECRG00000009868) tmem269 (ENSECRG00000009833) gapdh (ENSECRG00000009820) #22 ENSECRG00000009808 USP48 (ENSECRG00000009784) HSPG2 (ENSECRG00000009522) casp9 (ENSECRG00000009432) DNAJC16 (ENSECRG00000009396) agmat (ENSECRG00000009385) pink1 (ENSECRG00000009371) sdf4 (ENSECRG00000009351) b3galt6 (ENSECRG00000009337) ENSECRG00000009309 ENSECRG00000009285 EPHA8 (ENSECRG00000008414) ENSECRG00000008139 cldn19 (ENSECRG00000008120) P3H1 (ENSECRG00000008098) Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 353 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00390000015492.A ENSGT00940000153298 #22 ENSGT01100000263524.B.a.a ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000159540.d #14 ENSGT00940000161250 #13 Spotted gar MODERN SPECIES 665 ENSLOCG00000007220 ENSLOCG00000007201 ENSLOCG00000007181 cldc1 (ENSLOCG00000007155) ENSLOCG00000007140 ENSLOCG00000007125 mrpl51 (ENSLOCG00000007108) #20 ENSLOCG00000007097 ENSLOCG00000007084 si:ch73-368j24.8 (ENSLOCG00000007070) ENSLOCG00000017863 nop2 (ENSLOCG00000007050) ing4 (ENSLOCG00000007026) #28 ncapd2 (ENSLOCG00000006987) #21 nppcl (ENSLOCG00000006971) gapdh (ENSLOCG00000006948) #22 opn9 (ENSLOCG00000006934) IFFO1 (ENSLOCG00000006916) #23 ENSLOCG00000006898 tnfrsf1a (ENSLOCG00000006877) #14 ENSLOCG00000006859 #13 ENSLOCG00000006844 #18 ENSLOCG00000006814 scn2b (ENSLOCG00000006785) scn4ba (ENSLOCG00000006768) ENSLOCG00000006753 ENSLOCG00000006729 TMPRSS13 (ENSLOCG00000006710) fxyd6 (ENSLOCG00000006698) DSCAML1 (ENSLOCG00000006671) ENSLOCG00000006650 Osteoglossocephalai DUPLICATION Osteoglossocephalai DUPLICATION Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000165997 ENSGT00940000157871.h.a ENSGT00440000033697 ENSGT00940000156657 ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00950000183106.a.b.b ENSGT00940000154273.a ENSGT00940000156745.b ENSGT00390000000305 ENSGT00950000183089.d ENSGT00940000170732 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00390000015492.A ENSGT00940000153298.i.a #22 ENSGT01100000263524.B.a.a ENSGT00510000046803.b.a.a ##23 ENSGT00940000159540.d #14 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT01050000245031 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000164382.b.b ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00950000183084.b.a.a.a ENSGT00950000183084.b.a.a.b ENSGT00950000183126.b.a ENSGT00940000165886 ENSGT00940000159480 ENSGT00940000155088.b.a.b #25 ENSGT00940000166118 Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234571.b.b.b.a.a ENSGT00390000002109 ENSGT00940000165997 ENSGT00940000157871.h.a ENSGT00440000033697 ENSGT00940000156657 ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00950000183106.a.b.b ENSGT00940000154273.a ENSGT00940000156745.b ENSGT00390000000305 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00390000015492.A ENSGT00940000153298.i.a #22 ENSGT01100000263524.B.a.a ENSGT00510000046803.b.a.a ##23 ENSGT00950000183126.b.a.c.b ENSGT00940000159540.d #14 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT01050000245031 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000164382.b.b ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00950000183084.b.a.a.a ENSGT00950000183084.b.a.a.b ENSGT00950000183126.b.a.c.a ENSGT00940000165886 ENSGT00940000159480 ENSGT00940000155088.b.a.b #25 P. kingsleyae MODERN SPECIES 460 ENSPKIG00000025088 phc1 (ENSPKIG00000025100) styk1b (ENSPKIG00000025125) gstk1 (ENSPKIG00000025146) casp2 (ENSPKIG00000025158) CLCN1 (ENSPKIG00000025201) FAM131B (ENSPKIG00000025259) ENSPKIG00000025270 zyx (ENSPKIG00000025278) ENSPKIG00000025289 emg1 (ENSPKIG00000025303) ENSPKIG00000025311 #24 ing4 (ENSPKIG00000025320) #28 ncapd2 (ENSPKIG00000025333) #21 nppcl (ENSPKIG00000025346) gapdh (ENSPKIG00000025348) #22 IFFO1 (ENSPKIG00000025355) ##23 ENSPKIG00000025359 Asian bonytongue MODERN SPECIES 9 ENSSFOG00015002044 m6pr (ENSSFOG00015002126) phc1 (ENSSFOG00015002146) styk1b (ENSSFOG00015002221) gstk1 (ENSSFOG00015002232) casp2 (ENSSFOG00015031568) CLCN1 (ENSSFOG00015028467) FAM131B (ENSSFOG00015024845) zyx (ENSSFOG00015002363) ENSSFOG00015002399 emg1 (ENSSFOG00015002421) nop2 (ENSSFOG00015002458) ing4 (ENSSFOG00015028773) #28 ncapd2 (ENSSFOG00015002522) #21 nppcl (ENSSFOG00015028383) gapdh (ENSSFOG00015002639) #22 opn9 (ENSSFOG00015002653) IFFO1 (ENSSFOG00015031111) ##23 tnfrsf1a (ENSSFOG00015026646) #14 ENSSFOG00015002720 #13 ENSSFOG00015002737 mrpl51 (ENSSFOG00015002742) #20 vamp1b (ENSSFOG00015027800) ENSSFOG00015002753 #18 c1r (ENSSFOG00015002767) ENSSFOG00015002777 ENSSFOG00015032958 rbp5 (ENSSFOG00015031066) ptpn6 (ENSSFOG00015002824) CHD4 (ENSSFOG00015002908) #25 wnt4b (ENSSFOG00015013205) Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033697 ENSGT00940000166290 ENSGT00940000156657 ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00940000154273.a ENSGT00940000157383.h.b.b ENSGT00950000183106.a.b.b ENSGT00940000168198 ENSGT00940000156745.b ENSGT00390000000305 ENSGT00940000170732 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00390000015492.A ENSGT00940000153298.i.a #22 ENSGT01100000263524.B.a.a ENSGT00510000046803.b.a.a ##23 ENSGT00940000159540.d #14 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT01050000245031 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000164382.b.b ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00950000183084.b.a.a.a ENSGT00940000157473.b.b ENSGT00940000157473.b.a ENSGT00950000183084.b.a.a.b ENSGT00950000183126.b.a ENSGT00940000165886 ENSGT00940000159480 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000166290 ENSGT00940000156657 ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00940000154273.a ENSGT00940000157383.h.b.b ENSGT00950000183106.a.b.b ENSGT00940000168198 ENSGT00940000156745.b ENSGT00390000000305 ENSGT00940000170732 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000180930 ENSGT00390000015492.A ENSGT00940000153298.i.a #22 ENSGT01100000263524.B.a.a ENSGT00510000046803.b.a.a ##23 ENSGT00940000159540.d #14 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT01050000245031 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000164382.b.b ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00950000183084.b.a.a.a ENSGT00940000157473.b.a ENSGT00940000157473.b.b ENSGT00950000183084.b.a.a.b ENSGT00950000183126.b.a ENSGT00940000165886 ENSGT00940000159480 Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000165997.b ENSGT00940000157871.h.a ENSGT00940000156657 ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00950000183106.a.b.b ENSGT00940000154273.a ENSGT00940000156745.b ENSGT00390000000305 ENSGT00940000170732 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00950000183089.d.c ENSGT00940000161554.g ENSGT00940000159033.m #28 ENSGT00940000180930 ENSGT00390000015492.A ENSGT00940000153298.i.a #22 ENSGT01100000263524.B.a.a ENSGT00510000046803.b.a.a ##23 ENSGT00940000159540.d #14 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT01050000245031 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000164382.b.b ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00950000183084.b.a.a.a ENSGT00940000157473.b.b.m.b ENSGT00940000157473.b.b.m.a ENSGT00950000183084.b.a.a.b ENSGT00950000183126.b.a ENSGT00940000165886 ENSGT00940000159480 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000154273.a.n ENSGT00940000156745.b ENSGT00390000000305.e ENSGT00940000170732 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000157383.g.a.b ENSGT00950000183106.a.b.b.e.b.a ENSGT00940000154273.a.m ENSGT00390000000305.f ENSGT00950000183089.d.c ENSGT00940000161554.g ENSGT00940000159033.m #28 ENSGT00940000180930 ENSGT00390000015492.A.b ENSGT00390000015492.A.a ENSGT00940000153298.i.a #22 ENSGT01100000263524.B.a.a ENSGT00510000046803.b.a.a.e.a ##23 ENSGT00940000159540.d.c #14 ENSGT00940000161250.e #13 ENSGT00510000046803.b.a.a.f ##23 ENSGT00940000159540.d.d #14 ENSGT00940000161250.f #13 ENSGT01050000245031 ENSGT00390000018821.f #20 ENSGT00940000164382.b.b.d ENSGT00940000160453.a #18 ENSGT00390000018821.e #20 ENSGT00940000164382.b.b.c ENSGT00940000160453.b #18 ENSGT00950000183084.b.a.a.a Huchen DUPLICATION Huchen MODERN SPECIES 2416 ENSHHUG00000038488 ENSHHUG00000038490 FAM131B (ENSHHUG00000038492) zyx (ENSHHUG00000038501) emg1 (ENSHHUG00000038512) ENSHHUG00000038521 ENSHHUG00000038529 nop2 (ENSHHUG00000038533) ING4 (ENSHHUG00000038606) #28 ENSHHUG00000038619 ENSHHUG00000038635 ENSHHUG00000038726 #21 ENSHHUG00000038757 nppcl (ENSHHUG00000038772) gapdh (ENSHHUG00000038812) #22 opn9 (ENSHHUG00000040338) IFFO1 (ENSHHUG00000040345) ##23 Huchen MODERN SPECIES 1607 ENSHHUG00000039423 zyx (ENSHHUG00000039432) ENSHHUG00000039457 emg1 (ENSHHUG00000039476) ENSHHUG00000039482 ENSHHUG00000039485 nop2 (ENSHHUG00000039490) ING4 (ENSHHUG00000039512) #28 ncapd2 (ENSHHUG00000039552) #21 nppcl (ENSHHUG00000039711) gapdh (ENSHHUG00000039746) #22 ENSHHUG00000040743 IFFO1 (ENSHHUG00000040747) ##23 ENSHHUG00000040753 #14 ENSHHUG00000040759 #13 ENSHHUG00000040772 mrpl51 (ENSHHUG00000040776) #20 ENSHHUG00000040783 ENSHHUG00000040798 #18 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 216 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00390000015492.A.a ENSGT00940000153298.i.a #22 ENSGT01100000263524.B.a.a ENSGT00510000046803.b.a.a.e.a ##23 ENSGT00510000046803.b.a.a.f ##23 ENSGT00940000159540.d.c #14 ENSGT00940000161250.e #13 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 53 ENSGT00940000166381.g.b ENSGT00940000156687.g.o.b ENSGT00940000166507.f ENSGT00940000166772.b ENSGT01030000234571.b.b.b.a.a.l ENSGT00390000002109.d ENSGT00940000165997.b.d ENSGT00940000157871.h.a.e ENSGT00440000033697.mb ENSGT00940000166290 ENSGT00940000156657.f ENSGT00950000183106.a.b.b.f.a.a ENSGT00940000159033.m.d #28 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00390000015492.A.a ENSGT00940000153298.i.a #22 ENSGT01100000263524.B.a.a.c ENSGT00510000046803.b.a.a.e.a.b ##23 ENSGT00940000159540.d.c #14 ENSGT00940000161250.f.b #13 ENSGT01050000245031.e ENSGT00390000018821.f #20 ENSGT00940000164382.b.b.d ENSGT00940000160453.a #18 ENSGT00950000183084.b.a.a.a.e.a ENSGT00950000183126.b.a.u.a.b ENSGT00940000165886.g ENSGT00940000159480.d.a.a.a ENSGT00940000159480.d.b ENSGT00940000155088.b.a.b.i.b #25 ENSGT00940000166118.c Oncorhynchus_a DUPLICATION Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 97 ENSGT00440000033697.lb ENSGT00940000156657.e ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00950000183106.a.b.b.f.a.b ENSGT00940000154273.a.n ENSGT00940000156745.b ENSGT00390000000305.e.c.a ENSGT00950000183089.d.c ENSGT00940000161554.g.c ENSGT00940000161554.g.d ENSGT00940000159033.m.c #28 ENSGT00390000015492.A.b ENSGT00940000153298.i.a.c #22 ENSGT01100000263524.B.a.a.d ENSGT00510000046803.b.a.a.e.a.a ##23 ENSGT00940000159540.d.d #14 ENSGT00940000161250.f.a #13 ENSGT01050000245031.f ENSGT00940000167184 ENSGT00940000164382.b.b.c ENSGT00940000160453.b #18 ENSGT00950000183084.b.a.a.a.e.b ENSGT00950000183084.b.a.a.a.f ENSGT00940000157473.b.b.m.a ENSGT00950000183084.b.a.a.b ENSGT00950000183126.b.a.u.a.a ENSGT00940000165886.h ENSGT00940000159480.d.a.b Coho salmon MODERN SPECIES 4 ENSOKIG00005006742 phc1 (ENSOKIG00005006727) ENSOKIG00005006719 GSTK1 (ENSOKIG00005006696) ENSOKIG00005006687 casp2 (ENSOKIG00005006673) CLCN1 (ENSOKIG00005006022) FAM131B (ENSOKIG00005005925) zyx (ENSOKIG00005005908) ENSOKIG00005005882 emg1 (ENSOKIG00005005863) ENSOKIG00005005848 nop2 (ENSOKIG00005005625) ING4 (ENSOKIG00005005595) #28 nppcl (ENSOKIG00005005568) gapdh (ENSOKIG00005004231) #22 opn9 (ENSOKIG00005004102) IFFO1 (ENSOKIG00005004088) ##23 tnfrsf1a (ENSOKIG00005004067) #14 ENSOKIG00005004059 #13 ENSOKIG00005004047 ENSOKIG00005004040 ENSOKIG00005004036 ENSOKIG00005004025 #18 ENSOKIG00005003898 ENSOKIG00005003874 ENSOKIG00005003871 ENSOKIG00005003864 ENSOKIG00005003853 ptpn6 (ENSOKIG00005046791) CHD4 (ENSOKIG00005036503) #25 Chinook salmon MODERN SPECIES 15 CYTH2 (ENSOTSG00005015510) ENSOTSG00005015607 ENSOTSG00005015609 zgc:158689 (ENSOTSG00005015610) ENSOTSG00005015611 ndufa3 (ENSOTSG00005015612) tfpt (ENSOTSG00005015614) cnot3a (ENSOTSG00005015621) ENSOTSG00005015692 emg1 (ENSOTSG00005034894) ENSOTSG00005034896 nop2 (ENSOTSG00005034916) ING4 (ENSOTSG00005034918) #28 ENSOTSG00005034923 nppcl (ENSOTSG00005034929) gapdh (ENSOTSG00005034934) #22 opn9 (ENSOTSG00005035359) ENSOTSG00005035362 ENSOTSG00005035363 wnt4b (ENSOTSG00005035364) mlf2 (ENSOTSG00005035365) #32 ENSOTSG00005035367 trim35-28 (ENSOTSG00005035369) MEGF8 (ENSOTSG00005035371) ENSOTSG00005035375 ENSOTSG00005035376 ENSOTSG00005035377 kirrel3l (ENSOTSG00005035383) ST14 (ENSOTSG00005035391) ENSOTSG00005035411 ENSOTSG00005035417 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 93 ENSGT00940000156687.g.o.b ENSGT00940000166507.f ENSGT00940000166772.b ENSGT01030000234571.b.b.b.a.a.l ENSGT00390000002109.d ENSGT00940000165997.b.c.b ENSGT00940000157871.h.a.e ENSGT00440000033697.mb ENSGT00940000166290 ENSGT00940000156657.f ENSGT00950000183106.a.b.b.f.a.a ENSGT00940000159033.m.d #28 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000180930 ENSGT00390000015492.A.a ENSGT00940000153298.i.a.d #22 ENSGT01100000263524.B.a.a.c ENSGT00510000046803.b.a.a.e.a.b ##23 ENSGT00940000159540.d.c #14 ENSGT00940000161250.f.b #13 ENSGT01050000245031.e ENSGT00390000018821.f #20 ENSGT00940000164382.b.b.d ENSGT00940000160453.a #18 ENSGT00950000183084.b.a.a.a.e.a ENSGT00950000183126.b.a.u.a.b ENSGT00940000165886.g ENSGT00940000159480.d.a.a.a ENSGT00940000159480.d.b ENSGT00940000155088.b.a.b.i.b #25 ENSGT00940000166118.c Chinook salmon MODERN SPECIES 28 MMP15 (ENSOTSG00005028343) ENSOTSG00005028353 ENSOTSG00005028354 ENSOTSG00005028356 slc7a6os (ENSOTSG00005028358) slc7a6 (ENSOTSG00005028360) ENSOTSG00005028603 adgrg1 (ENSOTSG00005028604) ccdc102a (ENSOTSG00005028605) DOK4 (ENSOTSG00005028607) ENSOTSG00005028608 ZNF536 (ENSOTSG00005028611) ncapd2 (ENSOTSG00005028617) #21 ENSOTSG00005028657 nppcl (ENSOTSG00005028662) gapdh (ENSOTSG00005028664) #22 opn9 (ENSOTSG00005028690) IFFO1 (ENSOTSG00005028692) ##23 tnfrsf1a (ENSOTSG00005028699) #14 ccne1 (ENSOTSG00005028702) zgc:162297 (ENSOTSG00005028704) si:ch211-260e23.9 (ENSOTSG00005028706) ENSOTSG00005028707 C19orf12 (ENSOTSG00005028708) PLEKHF1 (ENSOTSG00005028709) pop4 (ENSOTSG00005028710) vstm2b (ENSOTSG00005028712) uqcrfs1 (ENSOTSG00005028714) SHCBP1 (ENSOTSG00005028715) hrh3 (ENSOTSG00005028749) vps35 (ENSOTSG00005028757) Coho salmon MODERN SPECIES 11 styk1b (ENSOKIG00005018907) GSTK1 (ENSOKIG00005018917) ENSOKIG00005018938 ENSOKIG00005018952 casp2 (ENSOKIG00005018968) FAM131B (ENSOKIG00005019028) ENSOKIG00005019054 zyx (ENSOKIG00005019059) ENSOKIG00005019073 emg1 (ENSOKIG00005019110) ENSOKIG00005019121 nop2 (ENSOKIG00005019143) ING4 (ENSOKIG00005019264) #28 ncapd2 (ENSOKIG00005019394) #21 nppcl (ENSOKIG00005019522) gapdh (ENSOKIG00005019546) #22 opn9 (ENSOKIG00005019619) IFFO1 (ENSOKIG00005019650) ##23 tnfrsf1a (ENSOKIG00005019675) #14 ENSOKIG00005019691 #13 ENSOKIG00005019701 mrpl51 (ENSOKIG00005019717) #20 ENSOKIG00005019724 ENSOKIG00005019739 ENSOKIG00005019753 ENSOKIG00005019758 rbp5 (ENSOKIG00005019774) ptpn6 (ENSOKIG00005019829) CHD4 (ENSOKIG00005020351) #25 ENSOKIG00005025067 wnt4b (ENSOKIG00005025084) Rainbow trout DUPLICATION Rainbow trout MODERN SPECIES 11 zgc:92606 (ENSOMYG00000005236) ENSOMYG00000005270 ENSOMYG00000005329 phc1 (ENSOMYG00000005427) ENSOMYG00000077435 ENSOMYG00000005635 casp2 (ENSOMYG00000065485) CLCN1 (ENSOMYG00000025938) FAM131B (ENSOMYG00000026016) zyx (ENSOMYG00000074173) emg1 (ENSOMYG00000026043) nop2 (ENSOMYG00000026083) ENSOMYG00000026130 #28 ENSOMYG00000026172 nppcl (ENSOMYG00000026203) gapdh (ENSOMYG00000005987) #22 opn9 (ENSOMYG00000026218) ENSOMYG00000026223 ##23 ENSOMYG00000061898 ENSOMYG00000069319 tnfrsf1a (ENSOMYG00000030134) #14 lag-3 (ENSOMYG00000029131) ENSOMYG00000063022 #20 ENSOMYG00000030178 tapbpl (ENSOMYG00000030183) #18 c1r (ENSOMYG00000030195) ENSOMYG00000030265 ENSOMYG00000030336 ENSOMYG00000030358 rbp5 (ENSOMYG00000066856) ptpn6 (ENSOMYG00000077381) Rainbow trout MODERN SPECIES 21 phc1 (ENSOMYG00000027823) ENSOMYG00000027843 ENSOMYG00000027885 ENSOMYG00000027967 ENSOMYG00000028026 ENSOMYG00000056867 ENSOMYG00000028112 ENSOMYG00000066273 ENSOMYG00000028172 ENSOMYG00000028212 ENSOMYG00000054287 nop2 (ENSOMYG00000028283) ENSOMYG00000028402 #28 ENSOMYG00000028707 #21 wu:fj39g12 (ENSOMYG00000028902) gapdh (ENSOMYG00000028924) #22 opn9 (ENSOMYG00000028935) ENSOMYG00000029000 ##23 ENSOMYG00000065625 ENSOMYG00000070662 TNFR1b (ENSOMYG00000029089) #14 ENSOMYG00000029108 #13 ENSOMYG00000030160 MRPL51 (ENSOMYG00000029144) #20 ENSOMYG00000029160 ENSOMYG00000029193 #18 c1r (ENSOMYG00000029228) tnfr (ENSOMYG00000029243) ENSOMYG00000062218 rbp5 (ENSOMYG00000029259) ptpn6 (ENSOMYG00000062402) Salmo DUPLICATION Salmo ANCESTRAL SPECIES 77 ENSGT00940000154273.a.m ENSGT00390000000305.e ENSGT00940000170732 ENSGT00940000161554.g.e ENSGT00390000015492.A.b ENSGT00940000153298.i.a.g #22 ENSGT00510000046803.b.a.a.f.a ##23 ENSGT00940000159540.d.d #14 ENSGT00940000161250.f #13 ENSGT01050000245031.d ENSGT00390000018821.e #20 ENSGT00940000164382.b.b.c ENSGT00940000160453.b #18 ENSGT00950000183084.b.a.a.a.d ENSGT00940000157473.b.b.m.b.a ENSGT00940000157473.b.b.m.a.b ENSGT00950000183084.b.a.a.b ENSGT00950000183126.b.a.u.a ENSGT00940000165886.g ENSGT00940000159480.c.a ENSGT00390000008714.b.e.a.a Atlantic salmon MODERN SPECIES 24 si:dkey-26c10.5 (ENSSSAG00000003167) ENSSSAG00000107469 mprd (ENSSSAG00000003208) phc1 (ENSSSAG00000003218) ENSSSAG00000003236 ENSSSAG00000003260 casp2 (ENSSSAG00000110175) CLCN1 (ENSSSAG00000091733) FAM131B (ENSSSAG00000041605) zyx (ENSSSAG00000102439) emg1 (ENSSSAG00000096027) ENSSSAG00000074635 nop2 (ENSSSAG00000074583) ENSSSAG00000003904 #28 anfc1 (ENSSSAG00000074569) gapdh (ENSSSAG00000042521) #22 ENSSSAG00000074511 ##23 tnr1a (ENSSSAG00000074496) #14 ENSSSAG00000074493 #13 ENSSSAG00000003882 ENSSSAG00000113607 #20 tapbpl (ENSSSAG00000074475) #18 ENSSSAG00000074481 c1r (ENSSSAG00000074469) ENSSSAG00000003825 ENSSSAG00000052027 ENSSSAG00000003871 ENSSSAG00000117865 rbp5 (ENSSSAG00000074455) ptpn6 (ENSSSAG00000071957) ENSSSAG00000062647 #25 River trout MODERN SPECIES 22 ENSSTUG00000000223 trpv6 (ENSSTUG00000000166) si:dkey-26c10.5 (ENSSTUG00000000151) zgc:92606 (ENSSTUG00000000147) m6pr (ENSSTUG00000000143) phc1 (ENSSTUG00000000138) styk1b (ENSSTUG00000000132) GSTK1 (ENSSTUG00000000125) ENSSTUG00000000117 casp2 (ENSSTUG00000000112) emg1 (ENSSTUG00000000107) ENSSTUG00000000063 nop2 (ENSSTUG00000049684) ING4 (ENSSTUG00000049680) #28 nppcl (ENSSTUG00000049672) gapdh (ENSSTUG00000049645) #22 opn9 (ENSSTUG00000049638) IFFO1 (ENSSTUG00000049632) ##23 tnfrsf1a (ENSSTUG00000049628) #14 ENSSTUG00000049626 #13 ENSSTUG00000049622 mrpl51 (ENSSTUG00000049618) #20 vamp1b (ENSSTUG00000049615) ENSSTUG00000049614 #18 c1r (ENSSTUG00000049601) ENSSTUG00000049599 ENSSTUG00000049598 ENSSTUG00000049596 ENSSTUG00000049594 rbp5 (ENSSTUG00000049591) ptpn6 (ENSSTUG00000049558) Salmo ANCESTRAL SPECIES 57 ENSGT00440000033697.mb.b ENSGT00440000033697.lb ENSGT00940000166290.d ENSGT00940000156657.c ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00950000183106.a.b.b.f.a.b ENSGT00940000154273.a.n ENSGT00940000156745.b ENSGT00390000000305.f ENSGT00950000183089.d.c.a ENSGT00950000183089.d.c.b ENSGT00940000161554.g.f ENSGT00940000159033.m #28 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00390000015492.A.a ENSGT00940000153298.i.a.h #22 ENSGT01100000263524.B.a.a ENSGT00510000046803.b.a.a.f.b ##23 ENSGT00940000159540.d.c #14 ENSGT00940000161250.e #13 ENSGT01050000245031.c ENSGT00390000018821.f #20 ENSGT00940000164382.b.b.d ENSGT00940000160453.a #18 ENSGT00950000183084.b.a.a.a.c ENSGT00940000157473.b.b.m.a.a ENSGT00950000183126.b.a.u.b ENSGT00940000165886.h ENSGT00940000159480.c.b ENSGT00940000155088.b.a.b.j.a.a #25 ENSGT00940000166118.e Atlantic salmon MODERN SPECIES 11 phc1 (ENSSSAG00000007566) ENSSSAG00000121918 ENSSSAG00000007549 ENSSSAG00000007543 casp2 (ENSSSAG00000074679) CLCN1 (ENSSSAG00000041555) FAM131B (ENSSSAG00000074655) zyx (ENSSSAG00000041622) ENSSSAG00000041656 emg1 (ENSSSAG00000116271) ENSSSAG00000115333 nop2 (ENSSSAG00000041757) ENSSSAG00000042230 #28 ENSSSAG00000042306 #21 ANFC1 (ENSSSAG00000042457) gapdh (ENSSSAG00000099398) #22 opn9 (ENSSSAG00000044705) ENSSSAG00000083434 ##23 tnfrsf1a (ENSSSAG00000051406) #14 ENSSSAG00000105430 ENSSSAG00000051391 #13 ENSSSAG00000003335 mrpl51 (ENSSSAG00000046358) #20 ENSSSAG00000082903 ENSSSAG00000046397 #18 ENSSSAG00000046468 ENSSSAG00000002963 ENSSSAG00000101489 rbp5 (ENSSSAG00000116434) ptpn6 (ENSSSAG00000039390) ENSSSAG00000093791 #25 River trout MODERN SPECIES 30 styk1b (ENSSTUG00000017071) GSTK1 (ENSSTUG00000017087) ENSSTUG00000017109 casp2 (ENSSTUG00000017154) CLCN1 (ENSSTUG00000017236) FAM131B (ENSSTUG00000017262) ENSSTUG00000017280 zyx (ENSSTUG00000017287) ENSSTUG00000017308 emg1 (ENSSTUG00000017350) ENSSTUG00000017372 nop2 (ENSSTUG00000017381) ING4 (ENSSTUG00000017488) #28 ncapd2 (ENSSTUG00000017527) #21 nppcl (ENSSTUG00000017629) gapdh (ENSSTUG00000017645) #22 IFFO1 (ENSSTUG00000017694) ##23 ENSSTUG00000017721 #14 ENSSTUG00000017766 #13 ENSSTUG00000017791 mrpl51 (ENSSTUG00000017799) #20 ENSSTUG00000017813 ENSSTUG00000017821 #18 ENSSTUG00000017869 ENSSTUG00000018113 ENSSTUG00000018135 ENSSTUG00000018206 rbp5 (ENSSTUG00000018217) ptpn6 (ENSSTUG00000018319) wnt4b (ENSSTUG00000018771) cdc42l (ENSSTUG00000018784) Northern pike MODERN SPECIES 19 styk1b (ENSELUG00000017075) ENSELUG00000027552 gstk1 (ENSELUG00000017094) ENSELUG00000017118 casp2 (ENSELUG00000017141) CLCN1 (ENSELUG00000017193) FAM131B (ENSELUG00000017256) zyx (ENSELUG00000017311) ENSELUG00000017356 emg1 (ENSELUG00000033748) ENSELUG00000017376 nop2 (ENSELUG00000017384) ING4 (ENSELUG00000017411) #28 ncapd2 (ENSELUG00000017486) #21 nppcl (ENSELUG00000028261) gapdh (ENSELUG00000017541) #22 opn9 (ENSELUG00000017580) ENSELUG00000017619 ##23 tnfrsf1a (ENSELUG00000001251) #14 ENSELUG00000030078 #13 ENSELUG00000000712 mrpl51 (ENSELUG00000017748) #20 vamp1b (ENSELUG00000017767) ENSELUG00000017787 #18 c1r (ENSELUG00000017805) ENSELUG00000032734 ENSELUG00000017961 ENSELUG00000017902 ENSELUG00000017977 rbp5 (ENSELUG00000029027) ptpn6 (ENSELUG00000018008) Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000157871.h.a ENSGT00440000033697 ENSGT00940000166290 ENSGT00940000156657 ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00950000183106.a.b.b ENSGT00940000154273.a ENSGT00940000156745.b ENSGT00940000170732 ENSGT00390000000305 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000180930 ENSGT00390000015492.A ENSGT00940000153298.i.a #22 ENSGT01100000263524.B.a.a ENSGT00510000046803.b.a.a ##23 ENSGT00940000159540.d #14 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000164382.b.b ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00950000183084.b.a.a.a ENSGT00940000157473.b.b ENSGT00950000183084.b.a.a.b ENSGT00940000157473.b.a ENSGT00950000183126.b.a ENSGT00940000165886 ENSGT00940000159480 ENSGT00940000155088.b.a.b #25 Cod MODERN SPECIES 2 ENSGMOG00000010951 ENSGMOG00000011005 ENSGMOG00000011025 ENSGMOG00000036330 zyx (ENSGMOG00000011033) FAM131B (ENSGMOG00000011054) CLCN1 (ENSGMOG00000011061) casp2 (ENSGMOG00000011091) ENSGMOG00000035919 gstk1 (ENSGMOG00000011109) ENSGMOG00000011118 phc1 (ENSGMOG00000011128) ENSGMOG00000011157 #28 ENSGMOG00000010393 #21 nppcl (ENSGMOG00000010388) gapdh (ENSGMOG00000010369) #22 opn9 (ENSGMOG00000010351) ENSGMOG00000010332 ##23 ENSGMOG00000028409 tnfrsf1a (ENSGMOG00000010317) #14 ENSGMOG00000025384 #13 ENSGMOG00000031167 #20 ENSGMOG00000010294 ENSGMOG00000010280 #18 ENSGMOG00000015889 ENSGMOG00000015935 ENSGMOG00000015977 ENSGMOG00000016008 dgat1b (ENSGMOG00000016023) ENSGMOG00000034988 ENSGMOG00000024141 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157871.h.a ENSGT00440000033697 ENSGT00940000166290 ENSGT00940000156657 ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00950000183106.a.b.b ENSGT00940000154273.a ENSGT00940000156745.b ENSGT00940000170732 ENSGT00390000000305 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000180930 ENSGT00390000015492.A ENSGT00940000153298.i.a #22 ENSGT01100000263524.B.a.a ENSGT00510000046803.b.a.a ##23 ENSGT00940000159540.d #14 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00990000203876 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000164382.b.b ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00950000183084.b.a.a.a ENSGT00940000157473.b.a ENSGT00940000157473.b.b ENSGT00950000183084.b.a.a.b ENSGT00950000183126.b.a ENSGT00940000165886 ENSGT00940000159480 Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 7 m6pr (ENSMMDG00005011855) phc1 (ENSMMDG00005011857) styk1b (ENSMMDG00005011862) gstk1 (ENSMMDG00005011864) ENSMMDG00005011870 casp2 (ENSMMDG00005011875) ENSMMDG00005011877 FAM131B (ENSMMDG00005011882) ENSMMDG00005011883 ENSMMDG00005011885 emg1 (ENSMMDG00005011886) nop2 (ENSMMDG00005001395) ing4 (ENSMMDG00005001445) #28 ncapd2 (ENSMMDG00005001584) #21 nppcl (ENSMMDG00005003983) gapdh (ENSMMDG00005003998) #22 opn9 (ENSMMDG00005004031) IFFO1 (ENSMMDG00005004040) ##23 tnfrsf1a (ENSMMDG00005004054) #14 ENSMMDG00005004080 mrpl51 (ENSMMDG00005004094) #20 vamp1b (ENSMMDG00005004110) ENSMMDG00005004146 #18 c1r (ENSMMDG00005004273) ENSMMDG00005005240 ENSMMDG00005005251 rbp5 (ENSMMDG00005005254) ptpn6 (ENSMMDG00005005255) CHD4 (ENSMMDG00005005430) #25 wnt4b (ENSMMDG00005012050) ENSMMDG00005012066 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157871.h.a ENSGT00440000033697 ENSGT00940000166290 ENSGT00940000156657 ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00950000183106.a.b.b ENSGT00940000154273.a ENSGT00940000156745.b ENSGT00940000170732 ENSGT00390000000305 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000180930 ENSGT00390000015492.A ENSGT00940000153298.i.a #22 ENSGT01100000263524.B.a.a ENSGT00510000046803.b.a.a ##23 ENSGT00940000159540.d #14 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00990000203876 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000164382.b.b ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00950000183084.b.a.a.a ENSGT00940000157473.b.a ENSGT00940000157473.b.b ENSGT00950000183084.b.a.a.b ENSGT00950000183126.b.a ENSGT00940000165886 ENSGT00940000159480 Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 164 ENSHCOG00000018130 m6pr (ENSHCOG00000018102) ENSHCOG00000018089 styk1b (ENSHCOG00000018042) gstk1 (ENSHCOG00000018025) ENSHCOG00000017991 casp2 (ENSHCOG00000017957) ENSHCOG00000017949 FAM131B (ENSHCOG00000017932) zyx (ENSHCOG00000017876) emg1 (ENSHCOG00000017870) nop2 (ENSHCOG00000017852) ing4 (ENSHCOG00000017838) #28 ncapd2 (ENSHCOG00000017819) #21 nppcl (ENSHCOG00000017806) gapdh (ENSHCOG00000017735) #22 IFFO1 (ENSHCOG00000017700) ##23 tnfrsf1a (ENSHCOG00000017672) #14 ENSHCOG00000017663 #13 ENSHCOG00000017659 mrpl51 (ENSHCOG00000017637) #20 vamp1b (ENSHCOG00000017631) ENSHCOG00000017616 #18 ENSHCOG00000017610 ENSHCOG00000017586 rbp5 (ENSHCOG00000017577) ptpn6 (ENSHCOG00000017567) CHD4 (ENSHCOG00000017525) #25 wnt4b (ENSHCOG00000017447) cdc42l (ENSHCOG00000017429) mlf2 (ENSHCOG00000017416) #32 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000157871.h.a ENSGT00440000033697 ENSGT00940000166290 ENSGT00940000156657 ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00950000183106.a.b.b ENSGT00940000154273.a ENSGT00940000156745.b ENSGT00940000170732 ENSGT00390000000305 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000180930 ENSGT00390000015492.A ENSGT00940000153298.i.a #22 ENSGT01100000263524.B.a.a ENSGT00510000046803.b.a.a ##23 ENSGT00940000159540.d #14 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00990000203876 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000164382.b.b ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00950000183084.b.a.a.a.a.a ENSGT00950000183084.b.a.a.a.a.b ENSGT00940000157473.b.a ENSGT00940000157473.b.b ENSGT00950000183084.b.a.a.a.b ENSGT00950000183084.b.a.a.b ENSGT00950000183126.b.a Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000165997.b ENSGT00940000157871.h.a ENSGT00440000033697 ENSGT00940000166290 ENSGT00940000156657 ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00950000183106.a.b.b ENSGT00940000154273.a ENSGT00940000156745.b ENSGT00940000170732 ENSGT00390000000305 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00390000015492.A ENSGT00940000153298.i.a #22 ENSGT01100000263524.B.a.a ENSGT00510000046803.b.a.a ##23 ENSGT00940000159540.d #14 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00990000203876 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000164382.b.b ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00950000183084.b.a.a.a.a.a ENSGT00950000183084.b.a.a.a.a.b ENSGT00940000157473.b.a ENSGT00940000157473.b.b ENSGT00950000183084.b.a.a.b ENSGT00950000183126.b.a ENSGT00940000165886 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000165997.b ENSGT00940000157871.h.a ENSGT00440000033697 ENSGT00940000166290 ENSGT00940000156657 ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00950000183106.a.b.b ENSGT00940000154273.a ENSGT00940000156745.b ENSGT00940000170732 ENSGT00390000000305 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00390000015492.A ENSGT00940000153298.i.a #22 ENSGT01100000263524.B.a.a ENSGT00510000046803.b.a.a ##23 ENSGT00940000159540.d #14 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00990000203876 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000164382.b.b ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00950000183084.b.a.a.a.a.a ENSGT00950000183084.b.a.a.a.a.b ENSGT00950000183084.b.a.a.b ENSGT00950000183126.b.a ENSGT00940000165886 ENSGT00940000159480 ENSGT00940000155088.b.a.b #25 Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000157619.a.a ENSGT00940000156612 ENSGT00940000157871.h.a ENSGT00440000033697 ENSGT00940000166290 ENSGT00940000156657 ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00950000183106.a.b.b ENSGT00940000154273.a ENSGT00940000156745.b ENSGT00390000000305 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00390000015492.A ENSGT00940000153298.i.a #22 ENSGT01100000263524.B.a.a ENSGT00510000046803.b.a.a ##23 ENSGT00940000159540.d #14 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00990000203876 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000164382.b.b ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00950000183084.b.a.a.a.a.a ENSGT00950000183084.b.a.a.a.a.b ENSGT00950000183084.b.a.a.b ENSGT00950000183126.b.a ENSGT00940000165886 ENSGT00940000159480 ENSGT00940000155088.b.a.b #25 Fugu DUPLICATION Fugu MODERN SPECIES 85 CLCN1 (ENSTRUG00000032062) ENSTRUG00000027640 zyx (ENSTRUG00000027395) ENSTRUG00000026234 emg1 (ENSTRUG00000026227) nop2 (ENSTRUG00000032033) ing4 (ENSTRUG00000026091) #28 ncapd2 (ENSTRUG00000030092) #21 cnp-1 (ENSTRUG00000032711) gapdh (ENSTRUG00000030301) #22 opn9 (ENSTRUG00000031969) IFFO1 (ENSTRUG00000004325) ##23 tnfrsf1a (ENSTRUG00000032740) #14 ENSTRUG00000028282 #13 ENSTRUG00000029684 mrpl51 (ENSTRUG00000031945) #20 vamp1b (ENSTRUG00000031129) ENSTRUG00000030832 #18 ENSTRUG00000027094 ENSTRUG00000027348 rbp5 (ENSTRUG00000032478) Fugu MODERN SPECIES 19 prpf3 (ENSTRUG00000033026) ENSTRUG00000026697 crabp2a (ENSTRUG00000031837) phc1 (ENSTRUG00000014816) ENSTRUG00000014759 casp2 (ENSTRUG00000014714) CLCN1 (ENSTRUG00000001381) FAM131B (ENSTRUG00000022010) zyx (ENSTRUG00000001652) ENSTRUG00000028257 emg1 (ENSTRUG00000001906) nop2 (ENSTRUG00000002011) ing4 (ENSTRUG00000002482) #28 ncapd2 (ENSTRUG00000031017) #21 cnp-1 (ENSTRUG00000003628) gapdh (ENSTRUG00000003708) #22 opn9 (ENSTRUG00000004176) IFFO1 (ENSTRUG00000028147) ##23 tnfrsf1a (ENSTRUG00000004666) #14 ENSTRUG00000022658 #13 ENSTRUG00000025885 mrpl51 (ENSTRUG00000025696) #20 vamp1b (ENSTRUG00000004770) ENSTRUG00000022920 #18 ENSTRUG00000020996 ENSTRUG00000004928 ENSTRUG00000006385 ENSTRUG00000026890 ENSTRUG00000028166 #18 c1r (ENSTRUG00000032830) ENSTRUG00000023940 Tetraodon MODERN SPECIES 23 ca14 (ENSTNIG00000008056) crabp2a (ENSTNIG00000008055) ENSTNIG00000008054 styk1b (ENSTNIG00000008053) gstk1 (ENSTNIG00000001719) ENSTNIG00000008052 casp2 (ENSTNIG00000008051) CLCN1 (ENSTNIG00000008050) ENSTNIG00000008049 zyx (ENSTNIG00000008048) emg1 (ENSTNIG00000008047) nop2 (ENSTNIG00000008046) ing4 (ENSTNIG00000008045) #28 ncapd2 (ENSTNIG00000008044) #21 nppcl (ENSTNIG00000008043) gapdh (ENSTNIG00000008042) #22 IFFO1 (ENSTNIG00000008041) ##23 tnfrsf1a (ENSTNIG00000008040) #14 ENSTNIG00000008039 #13 mrpl51 (ENSTNIG00000008038) #20 vamp1b (ENSTNIG00000005766) ENSTNIG00000008037 #18 c1r (ENSTNIG00000008036) ENSTNIG00000008035 ENSTNIG00000008034 rbp5 (ENSTNIG00000008033) ptpn6 (ENSTNIG00000008032) CHD4 (ENSTNIG00000008031) #25 lpcat3 (ENSTNIG00000008030) CLSTN3 (ENSTNIG00000008029) pex5 (ENSTNIG00000008028) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000165997.b ENSGT00940000157871.h.a ENSGT00440000033697 ENSGT00940000166290 ENSGT00940000156657 ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00950000183106.a.b.b ENSGT00940000154273.a ENSGT00940000156745.b ENSGT00940000170732 ENSGT00390000000305 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00390000015492.A ENSGT00940000153298.i.a #22 ENSGT01100000263524.B.a.a ENSGT00510000046803.b.a.a ##23 ENSGT00940000159540.d #14 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00990000203876 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000164382.b.b ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00950000183084.b.a.a.a.a.a ENSGT00950000183084.b.a.a.a.a.b ENSGT00950000183084.b.a.a.b ENSGT00950000183126.b.a ENSGT00940000165886 ENSGT00940000159480 ENSGT00940000155088.b.a.b #25 Ballan wrasse MODERN SPECIES 664 zyx (ENSLBEG00000007489) ENSLBEG00000007459 emg1 (ENSLBEG00000007424) nop2 (ENSLBEG00000007281) ing4 (ENSLBEG00000007255) #28 ncapd2 (ENSLBEG00000007169) #21 nppcl (ENSLBEG00000007075) gapdh (ENSLBEG00000007024) #22 opn9 (ENSLBEG00000006998) IFFO1 (ENSLBEG00000006921) ##23 ENSLBEG00000006834 #14 ENSLBEG00000006789 #13 ENSLBEG00000006765 mrpl51 (ENSLBEG00000006744) #20 vamp1b (ENSLBEG00000006721) ENSLBEG00000006703 #18 ENSLBEG00000006686 ENSLBEG00000006671 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000165997.b ENSGT00940000157871.h.a ENSGT00440000033697 ENSGT00940000166290 ENSGT00940000156657 ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00950000183106.a.b.b ENSGT00940000154273.a ENSGT00940000156745.b ENSGT00940000170732 ENSGT00390000000305 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00390000015492.A ENSGT00940000153298.i.a #22 ENSGT01100000263524.B.a.a ENSGT00510000046803.b.a.a ##23 ENSGT00940000159540.d #14 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00990000203876 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000164382.b.b ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00950000183084.b.a.a.a.a.a.f.b ENSGT00950000183084.b.a.a.a.a.b ENSGT00950000183084.b.a.a.b ENSGT00950000183126.b.a ENSGT00940000165886 ENSGT00940000159480 ENSGT00940000155088.b.a.b #25 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000165997.b ENSGT00940000157871.h.a ENSGT00440000033697 ENSGT00940000166290 ENSGT00940000156657 ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00950000183106.a.b.b ENSGT00940000154273.a ENSGT00940000156745.b ENSGT00940000170732 ENSGT00390000000305 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00390000015492.A ENSGT00940000153298.i.a #22 ENSGT01100000263524.B.a.a ENSGT00510000046803.b.a.a ##23 ENSGT00940000159540.d #14 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00990000203876 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000164382.b.b ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00950000183084.b.a.a.a.a.b ENSGT00950000183084.b.a.a.b ENSGT00950000183126.b.a ENSGT00940000165886 ENSGT00940000159480 ENSGT00940000155088.b.a.b #25 ENSGT00940000166118 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000165997.b ENSGT00940000157871.h.a ENSGT00440000033697 ENSGT00940000166290 ENSGT00940000156657 ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00950000183106.a.b.b ENSGT00940000154273.a ENSGT00940000156745.b ENSGT00940000170732 ENSGT00390000000305 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00390000015492.A ENSGT00940000153298.i.a #22 ENSGT01100000263524.B.a.a ENSGT00510000046803.b.a.a ##23 ENSGT00940000159540.d #14 ENSGT01000000221290 ENSGT00990000203876 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000164382.b.b ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000157473.b.b ENSGT00950000183084.b.a.a.a.b ENSGT00950000183084.b.a.a.a.a.b ENSGT00950000183084.b.a.a.b ENSGT00950000183126.b.a ENSGT00940000165886 ENSGT00940000159480 Pike perch MODERN SPECIES 15 ENSSLUG00000005167 styk1b (ENSSLUG00000005180) gstk1 (ENSSLUG00000005187) ENSSLUG00000005200 casp2 (ENSSLUG00000005230) CLCN1 (ENSSLUG00000005581) FAM131B (ENSSLUG00000009806) ENSSLUG00000009819 ENSSLUG00000009826 ENSSLUG00000009839 emg1 (ENSSLUG00000009846) nop2 (ENSSLUG00000009873) ing4 (ENSSLUG00000010189) #28 ncapd2 (ENSSLUG00000010221) #21 nppcl (ENSSLUG00000010931) gapdh (ENSSLUG00000010963) #22 opn9 (ENSSLUG00000012270) IFFO1 (ENSSLUG00000012278) ##23 tnfrsf1a (ENSSLUG00000012284) #14 ENSSLUG00000012291 ENSSLUG00000012295 mrpl51 (ENSSLUG00000012300) #20 vamp1b (ENSSLUG00000012307) ENSSLUG00000012309 #18 c1r (ENSSLUG00000012329) ENSSLUG00000012394 ENSSLUG00000012402 rbp5 (ENSSLUG00000012411) ptpn6 (ENSSLUG00000012474) CHD4 (ENSSLUG00000014277) #25 wnt4b (ENSSLUG00000023205) Channel bull blenny MODERN SPECIES 7 dpy19l1l (ENSCGOG00000007755) tbx20 (ENSCGOG00000007944) herpud2 (ENSCGOG00000007959) ENSCGOG00000007982 ENSCGOG00000007984 casp2 (ENSCGOG00000007987) FAM131B (ENSCGOG00000007997) zyx (ENSCGOG00000008004) ENSCGOG00000008008 ENSCGOG00000008019 emg1 (ENSCGOG00000008021) nop2 (ENSCGOG00000008032) ing4 (ENSCGOG00000008180) #28 ncapd2 (ENSCGOG00000008211) #21 nppcl (ENSCGOG00000008532) gapdh (ENSCGOG00000001626) #22 ENSCGOG00000001801 ENSCGOG00000001804 ENSCGOG00000001810 rbp5 (ENSCGOG00000001814) ptpn6 (ENSCGOG00000001844) ENSCGOG00000002434 CHD4 (ENSCGOG00000002438) #25 wnt4b (ENSCGOG00000002447) cdc42l (ENSCGOG00000002487) mlf2 (ENSCGOG00000002581) #32 ENO2 (ENSCGOG00000002584) ENO2 (ENSCGOG00000002611) ENSCGOG00000002613 #25 CHD4 (ENSCGOG00000002674) #25 wnt4b (ENSCGOG00000002888) Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT01030000234571.b.b.b.a.a ENSGT00390000002109 ENSGT00940000165997.b ENSGT00940000157871.h.a ENSGT00440000033697 ENSGT00940000166290 ENSGT00940000156657 ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00950000183106.a.b.b ENSGT00940000154273.a ENSGT00390000000305 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00390000015492.A ENSGT00940000153298.i.a #22 ENSGT01100000263524.B.a.a ENSGT00510000046803.b.a.a ##23 ENSGT00940000159540.d #14 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00990000203876 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000164382.b.b ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00950000183084.b.a.a.a.a.b ENSGT00950000183084.b.a.a.b ENSGT00950000183126.b.a ENSGT00940000165886 ENSGT00940000159480 ENSGT00940000155088.b.a.b #25 ENSGT00940000166118 Stickleback MODERN SPECIES 19 zgc:92606 (ENSGACG00000010464) ENSGACG00000010446 m6pr (ENSGACG00000010442) phc1 (ENSGACG00000010438) styk1b (ENSGACG00000010432) gstk1 (ENSGACG00000010408) ENSGACG00000010403 casp2 (ENSGACG00000010380) CLCN1 (ENSGACG00000010357) FAM131B (ENSGACG00000010348) zyx (ENSGACG00000010340) emg1 (ENSGACG00000010330) nop2 (ENSGACG00000010317) ncapd2 (ENSGACG00000010292) #21 nppcl (ENSGACG00000010291) gapdh (ENSGACG00000010219) #22 opn9 (ENSGACG00000010215) ENSGACG00000010213 IFFO1 (ENSGACG00000010207) ##23 tnfrsf1a (ENSGACG00000010200) #14 ENSGACG00000010195 #13 mrpl51 (ENSGACG00000010193) #20 vamp1b (ENSGACG00000010179) ENSGACG00000010169 #18 c1r (ENSGACG00000010132) ENSGACG00000010128 rbp5 (ENSGACG00000010125) ptpn6 (ENSGACG00000010111) CHD4 (ENSGACG00000010099) #25 wnt4b (ENSGACG00000010089) cdc42l (ENSGACG00000010059) Lumpfish MODERN SPECIES 7 ENSCLMG00005021295 m6pr (ENSCLMG00005001356) ENSCLMG00005001375 styk1b (ENSCLMG00005001392) gstk1 (ENSCLMG00005001422) ENSCLMG00005001441 casp2 (ENSCLMG00005001471) ENSCLMG00005001482 FAM131B (ENSCLMG00005001510) ENSCLMG00005001544 emg1 (ENSCLMG00005001559) nop2 (ENSCLMG00005001738) ing4 (ENSCLMG00005002494) #28 ncapd2 (ENSCLMG00005002517) #21 nppcl (ENSCLMG00005002536) gapdh (ENSCLMG00005002539) #22 opn9 (ENSCLMG00005002636) IFFO1 (ENSCLMG00005002640) ##23 tnfrsf1a (ENSCLMG00005002643) #14 ENSCLMG00005002644 #13 ENSCLMG00005002647 mrpl51 (ENSCLMG00005002648) #20 vamp1b (ENSCLMG00005002652) ENSCLMG00005002654 #18 c1r (ENSCLMG00005002655) ENSCLMG00005002657 ENSCLMG00005002660 rbp5 (ENSCLMG00005002661) ptpn6 (ENSCLMG00005002665) CHD4 (ENSCLMG00005002733) #25 wnt4b (ENSCLMG00005006421) Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000165997.b ENSGT00940000157871.h.a ENSGT00440000033697 ENSGT00940000166290 ENSGT00940000156657 ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00950000183106.a.b.b ENSGT00940000154273.a ENSGT00940000156745.b ENSGT00940000170732 ENSGT00390000000305 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00390000015492.A ENSGT00940000153298.i.a #22 ENSGT01100000263524.B.a.a ENSGT00510000046803.b.a.a ##23 ENSGT00940000159540.d #14 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00990000203876 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000164382.b.b ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00950000183084.b.a.a.a.a.a.f.b ENSGT00950000183084.b.a.a.a.a.b ENSGT00950000183084.b.a.a.b ENSGT00950000183126.b.a ENSGT00940000165886 ENSGT00940000159480 ENSGT00940000155088.b.a.b #25 Gilthead seabream MODERN SPECIES 8 m6pr (ENSSAUG00010015279) phc1 (ENSSAUG00010015281) styk1b (ENSSAUG00010015284) gstk1 (ENSSAUG00010015286) ENSSAUG00010015292 casp2 (ENSSAUG00010015299) CLCN1 (ENSSAUG00010015311) FAM131B (ENSSAUG00010015518) ENSSAUG00010015522 ENSSAUG00010015525 emg1 (ENSSAUG00010015530) nop2 (ENSSAUG00010015542) ing4 (ENSSAUG00010015995) #28 ncapd2 (ENSSAUG00010016000) #21 nppcl (ENSSAUG00010016053) gapdh (ENSSAUG00010016061) #22 ENSSAUG00010016570 opn9 (ENSSAUG00010016573) IFFO1 (ENSSAUG00010016577) ##23 tnfrsf1a (ENSSAUG00010016590) #14 ENSSAUG00010016595 #13 ENSSAUG00010016597 mrpl51 (ENSSAUG00010016600) #20 vamp1b (ENSSAUG00010016603) ENSSAUG00010016608 #18 c1r (ENSSAUG00010016612) c1r (ENSSAUG00010016621) ENSSAUG00010016635 c1r (ENSSAUG00010016637) ENSSAUG00010016641 ENSSAUG00010016642 Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000165997.b ENSGT00940000157871.h.a ENSGT00440000033697 ENSGT00940000166290 ENSGT00940000156657 ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00950000183106.a.b.b ENSGT00940000154273.a ENSGT00940000156745.b ENSGT00940000170732 ENSGT00390000000305 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00390000015492.A ENSGT00940000153298.i.a #22 ENSGT01100000263524.B.a.a ENSGT00510000046803.b.a.a ##23 ENSGT00940000159540.d #14 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00990000203876 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000164382.b.b ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00950000183084.b.a.a.a.a.a.f.b ENSGT00950000183084.b.a.a.a.a.b ENSGT00950000183084.b.a.a.b ENSGT00950000183126.b.a ENSGT00940000165886 ENSGT00940000159480 ENSGT00940000155088.b.a.b #25 Large yellow croaker MODERN SPECIES 484 phc1 (ENSLCRG00005008561) styk1b (ENSLCRG00005008553) gstk1 (ENSLCRG00005008532) ENSLCRG00005008512 casp2 (ENSLCRG00005008475) CLCN1 (ENSLCRG00005006944) FAM131B (ENSLCRG00005006798) zyx (ENSLCRG00005006787) ENSLCRG00005006769 ENSLCRG00005006763 emg1 (ENSLCRG00005006755) nop2 (ENSLCRG00005006719) ing4 (ENSLCRG00005006702) #28 ncapd2 (ENSLCRG00005006486) #21 nppcl (ENSLCRG00005006436) gapdh (ENSLCRG00005004127) #22 opn9 (ENSLCRG00005003991) IFFO1 (ENSLCRG00005003990) ##23 ENSLCRG00005003989 #14 ENSLCRG00005003988 #13 ENSLCRG00005003987 ENSLCRG00005003986 mrpl51 (ENSLCRG00005003985) #20 vamp1b (ENSLCRG00005003983) ENSLCRG00005003981 #18 ENSLCRG00005003980 STX12 (ENSLCRG00005003962) vegfaa (ENSLCRG00005003953) NAGA (ENSLCRG00005003907) rrp15 (ENSLCRG00005003869) tgfb2 (ENSLCRG00005003829) European seabass MODERN SPECIES 6 ENSDLAG00005001050 ENSDLAG00005001002 ENSDLAG00005000985 ENSDLAG00005000975 ENSDLAG00005000965 ENSDLAG00005000962 casp2 (ENSDLAG00005000956) ENSDLAG00005000649 FAM131B (ENSDLAG00005000561) ENSDLAG00005000542 ENSDLAG00005027607 ENSDLAG00005000454 ENSDLAG00005000438 #28 ENSDLAG00005000362 #21 nppcl (ENSDLAG00005000338) gapdh (ENSDLAG00005000264) #22 opn9 (ENSDLAG00005000197) ENSDLAG00005033949 ##23 tnfrsf1a (ENSDLAG00005000170) #14 ENSDLAG00005000159 #13 ENSDLAG00005000147 ENSDLAG00005031484 #20 ENSDLAG00005000119 ENSDLAG00005012350 #18 ENSDLAG00005034042 ENSDLAG00005034647 c1r (ENSDLAG00005027182) ptpn6 (ENSDLAG00005011202) ENSDLAG00005009374 #25 wnt4b (ENSDLAG00005009297) cdc42l (ENSDLAG00005028019) Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000165997.b ENSGT00940000157871.h.a ENSGT00440000033697 ENSGT00940000166290 ENSGT00940000156657 ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00950000183106.a.b.b ENSGT00940000154273.a ENSGT00940000156745.b ENSGT00940000170732 ENSGT00390000000305 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00390000015492.A ENSGT00940000153298.i.a #22 ENSGT01100000263524.B.a.a ENSGT00510000046803.b.a.a ##23 ENSGT00940000159540.d #14 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00990000203876 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000164382.b.b ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00950000183084.b.a.a.a.a.b ENSGT00950000183084.b.a.a.b ENSGT00940000157473.b.b ENSGT00940000157473.b.a ENSGT00950000183126.b.a ENSGT00940000165886 ENSGT00940000159480 Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000165997.b ENSGT00940000157871.h.a ENSGT00440000033697 ENSGT00940000166290 ENSGT00940000156657 ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00950000183106.a.b.b ENSGT00940000154273.a ENSGT00940000156745.b ENSGT00940000170732 ENSGT00390000000305 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00390000015492.A ENSGT00940000153298.i.a #22 ENSGT00510000046803.b.a.a ##23 ENSGT00940000159540.d #14 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00990000203876 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000164382.b.b ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00950000183084.b.a.a.a.a.b ENSGT00950000183084.b.a.a.b ENSGT00940000157473.b.b ENSGT00940000157473.b.a ENSGT00950000183126.b.a ENSGT00940000165886 ENSGT00940000159480 ENSGT00940000155088.b.a.b #25 Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000002109 ENSGT00940000165997.b ENSGT00940000157871.h.a ENSGT00440000033697 ENSGT00940000166290 ENSGT00940000156657 ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00950000183106.a.b.b ENSGT00940000154273.a ENSGT00940000156745.b ENSGT00940000170732 ENSGT00390000000305 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00390000015492.A ENSGT00940000153298.i.a #22 ENSGT00510000046803.b.a.a ##23 ENSGT00940000159540.d #14 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00990000203876 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000164382.b.b ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00950000183084.b.a.a.a.a.b ENSGT00950000183084.b.a.a.b ENSGT00940000157473.b.b ENSGT00940000157473.b.a ENSGT00950000183126.b.a ENSGT00940000165886 ENSGT00940000159480 ENSGT00940000155088.b.a.b #25 Climbing perch MODERN SPECIES 7 ENSATEG00000026202 ENSATEG00000028551 ENSATEG00000021744 ENSATEG00000021732 casp2 (ENSATEG00000021703) CLCN1 (ENSATEG00000029396) zyx (ENSATEG00000021671) FAM131B (ENSATEG00000021681) ENSATEG00000021656 ENSATEG00000025338 ENSATEG00000026791 ENSATEG00000021636 #24 ENSATEG00000021620 #28 ENSATEG00000021597 #21 nppcl (ENSATEG00000028362) gapdh (ENSATEG00000021562) #22 ENSATEG00000021534 ##23 tnfrsf1a (ENSATEG00000021520) #14 ENSATEG00000021502 #13 ENSATEG00000021485 ENSATEG00000021472 #20 ENSATEG00000021461 #18 ENSATEG00000021453 ENSATEG00000021426 ENSATEG00000021386 c1s.2 (ENSATEG00000021318) ENSATEG00000021298 ENSATEG00000027269 rbp5 (ENSATEG00000021284) ptpn6 (ENSATEG00000021186) ENSATEG00000021141 #25 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 7 m6pr (ENSBSLG00000013169) ENSBSLG00000023977 styk1b (ENSBSLG00000023970) gstk4 (ENSBSLG00000023932) ENSBSLG00000023903 casp2 (ENSBSLG00000023856) CLCN1 (ENSBSLG00000022598) FAM131B (ENSBSLG00000022491) zyx (ENSBSLG00000022476) ENSBSLG00000022448 ENSBSLG00000022442 ENSBSLG00000022405 #24 ENSBSLG00000022339 #28 ENSBSLG00000021788 #21 nppcl (ENSBSLG00000021693) gapdh (ENSBSLG00000021486) #22 IFFO1 (ENSBSLG00000021449) ##23 tnfrsf1a (ENSBSLG00000021384) #14 ENSBSLG00000021365 #13 ENSBSLG00000021313 mrpl51 (ENSBSLG00000021301) #20 vamp1b (ENSBSLG00000021283) ENSBSLG00000021256 #18 c1r (ENSBSLG00000021166) ENSBSLG00000021142 ENSBSLG00000021088 rbp5 (ENSBSLG00000020986) ptpn6 (ENSBSLG00000020434) CHD4 (ENSBSLG00000014755) #25 wnt4b (ENSBSLG00000014501) cdc42l (ENSBSLG00000014473) Zig-zag eel MODERN SPECIES 7 rasip1 (ENSMAMG00000020051) cox6b2 (ENSMAMG00000027053) ENSMAMG00000000311 ENSMAMG00000000352 trpv6 (ENSMAMG00000001214) trpv6 (ENSMAMG00000001026) si:dkey-26c10.5 (ENSMAMG00000001155) zgc:92606 (ENSMAMG00000027818) ENSMAMG00000001384 ENSMAMG00000001455 phc1 (ENSMAMG00000001468) ENSMAMG00000001546 ENSMAMG00000001558 ENSMAMG00000026231 ENSMAMG00000025465 ENSMAMG00000002122 #22 ENSMAMG00000025282 ENSMAMG00000024388 ENSMAMG00000025599 ENSMAMG00000001761 casp2 (ENSMAMG00000001598) ENSMAMG00000027002 ENSMAMG00000028076 FAM131B (ENSMAMG00000001825) ENSMAMG00000001850 ENSMAMG00000001864 ENSMAMG00000001888 ENSMAMG00000001909 ENSMAMG00000001932 #28 ENSMAMG00000001947 #21 ENSMAMG00000026561 Carangaria ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000165997.b ENSGT00940000157871.h.a ENSGT00440000033697 ENSGT00940000166290 ENSGT00940000156657 ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00950000183106.a.b.b ENSGT00940000154273.a ENSGT00940000156745.b ENSGT00940000170732 ENSGT00390000000305 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00390000015492.A ENSGT00940000153298.i.a #22 ENSGT01100000263524.B.a.a ENSGT00510000046803.b.a.a ##23 ENSGT00940000159540.d #14 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00990000203876 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000164382.b.b ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00950000183084.b.a.a.a.a.b ENSGT00950000183084.b.a.a.b ENSGT00950000183126.b.a ENSGT00940000165886 ENSGT00940000159480 ENSGT00940000155088.b.a.b #25 ENSGT00940000166118 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000165997.b ENSGT00940000157871.h.a ENSGT00440000033697 ENSGT00940000166290 ENSGT00940000156657 ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00950000183106.a.b.b ENSGT00940000154273.a ENSGT00940000156745.b ENSGT00940000170732 ENSGT00390000000305 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00390000015492.A ENSGT00940000153298.i.a #22 ENSGT01100000263524.B.a.a ENSGT00510000046803.b.a.a ##23 ENSGT00940000159540.d #14 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00990000203876 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000164382.b.b ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00950000183084.b.a.a.a.a.b ENSGT00950000183084.b.a.a.b ENSGT00950000183126.b.a ENSGT00940000165886 ENSGT00940000159480 ENSGT00940000155088.b.a.b #25 ENSGT00940000166118 Seriola ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00390000002109 ENSGT00940000165997.b ENSGT00940000157871.h.a ENSGT00440000033697 ENSGT00940000166290 ENSGT00940000156657 ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00950000183106.a.b.b ENSGT00940000154273.a ENSGT00940000156745.b ENSGT00940000170732 ENSGT00390000000305 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00390000015492.A ENSGT00940000153298.i.a #22 ENSGT01100000263524.B.a.a ENSGT00510000046803.b.a.a ##23 ENSGT00940000159540.d #14 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00990000203876 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000164382.b.b ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00950000183084.b.a.a.a.a.b ENSGT00950000183084.b.a.a.b ENSGT00950000183126.b.a ENSGT00940000165886 ENSGT00940000159480 ENSGT00940000155088.b.a.b #25 ENSGT00940000166118 Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3126 m6pr (ENSSLDG00000023238) phc1 (ENSSLDG00000023243) styk1b (ENSSLDG00000023258) gstk1 (ENSSLDG00000023290) ENSSLDG00000023307 casp2 (ENSSLDG00000023329) CLCN1 (ENSSLDG00000023359) FAM131B (ENSSLDG00000023398) zyx (ENSSLDG00000023410) ENSSLDG00000023425 emg1 (ENSSLDG00000023439) ENSSLDG00000023452 #24 ing4 (ENSSLDG00000023463) #28 ncapd2 (ENSSLDG00000023476) #21 nppcl (ENSSLDG00000023511) gapdh (ENSSLDG00000023514) #22 opn9 (ENSSLDG00000023539) IFFO1 (ENSSLDG00000023563) ##23 tnfrsf1a (ENSSLDG00000023603) #14 ENSSLDG00000023616 #13 ENSSLDG00000023628 mrpl51 (ENSSLDG00000023639) #20 vamp1b (ENSSLDG00000023642) ENSSLDG00000023650 #18 c1r (ENSSLDG00000023710) ENSSLDG00000023748 ENSSLDG00000023763 rbp5 (ENSSLDG00000023776) ptpn6 (ENSSLDG00000023788) CHD4 (ENSSLDG00000023821) #25 wnt4b (ENSSLDG00000023860) Greater amberjack MODERN SPECIES 88 m6pr (ENSSDUG00000010933) phc1 (ENSSDUG00000010951) styk1b (ENSSDUG00000011003) ENSSDUG00000011032 gstk1 (ENSSDUG00000011059) casp2 (ENSSDUG00000011181) CLCN1 (ENSSDUG00000011240) FAM131B (ENSSDUG00000011289) zyx (ENSSDUG00000011311) ENSSDUG00000011328 emg1 (ENSSDUG00000011345) ENSSDUG00000011360 #24 ing4 (ENSSDUG00000011444) #28 ncapd2 (ENSSDUG00000011470) #21 nppcl (ENSSDUG00000011571) gapdh (ENSSDUG00000011613) #22 opn9 (ENSSDUG00000011638) IFFO1 (ENSSDUG00000011662) ##23 tnfrsf1a (ENSSDUG00000011676) #14 ENSSDUG00000011699 #13 ENSSDUG00000011758 mrpl51 (ENSSDUG00000011778) #20 vamp1b (ENSSDUG00000011784) ENSSDUG00000011795 #18 c1r (ENSSDUG00000011807) ENSSDUG00000011894 ENSSDUG00000011920 rbp5 (ENSSDUG00000011941) ptpn6 (ENSSDUG00000011963) CHD4 (ENSSDUG00000012051) #25 wnt4b (ENSSDUG00000012919) Barramundi perch MODERN SPECIES 234 ENSLCAG00010010185 styk1b (ENSLCAG00010010191) gstk1 (ENSLCAG00010010194) ENSLCAG00010010195 casp2 (ENSLCAG00010010203) CLCN1 (ENSLCAG00010010275) FAM131B (ENSLCAG00010010725) ENSLCAG00010010728 ENSLCAG00010010733 ENSLCAG00010010740 emg1 (ENSLCAG00010010744) nop2 (ENSLCAG00010010748) ing4 (ENSLCAG00010010751) #28 ncapd2 (ENSLCAG00010010761) #21 nppcl (ENSLCAG00010010783) gapdh (ENSLCAG00010010862) #22 IFFO1 (ENSLCAG00010011284) ##23 tnfrsf1a (ENSLCAG00010011286) #14 ENSLCAG00010011291 #13 ENSLCAG00010011293 mrpl51 (ENSLCAG00010011297) #20 ENSLCAG00010011300 #18 Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000002109 ENSGT00940000165997.b ENSGT00940000157871.h.a ENSGT00440000033697 ENSGT00940000166290 ENSGT00940000156657 ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00950000183106.a.b.b ENSGT00940000154273.a ENSGT00940000156745.b ENSGT00390000000305 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00390000015492.A ENSGT00940000153298.i.a #22 ENSGT00510000046803.b.a.a ##23 ENSGT00940000159540.d #14 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00990000203876 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000164382.b.b ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00950000183084.b.a.a.a.a.b ENSGT00950000183084.b.a.a.b ENSGT00950000183126.b.a ENSGT00940000165886 ENSGT00940000159480 ENSGT00940000155088.b.a.b #25 ENSGT00940000166118 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.a.a Turbot MODERN SPECIES ENSSMAG00000012075 phc1 (ENSSMAG00000012041) ENSSMAG00000012025 gstk1 (ENSSMAG00000012007) ENSSMAG00000011960 casp2 (ENSSMAG00000011941) ENSSMAG00000011881 FAM131B (ENSSMAG00000011863) ENSSMAG00000011819 ENSSMAG00000011759 ENSSMAG00000011806 ENSSMAG00000011738 ENSSMAG00000011718 #28 ENSSMAG00000011611 #21 nppcl (ENSSMAG00000011599) gapdh (ENSSMAG00000011551) #22 ENSSMAG00000011533 ##23 tnfrsf1a (ENSSMAG00000029921) #14 ENSSMAG00000011489 ENSSMAG00000011505 ENSSMAG00000011479 #20 ENSSMAG00000011452 ENSSMAG00000011433 #18 c1r (ENSSMAG00000011398) ENSSMAG00000011384 ENSSMAG00000011373 rbp5 (ENSSMAG00000011365) ptpn6 (ENSSMAG00000011269) ENSSMAG00000010969 #25 wnt4b (ENSSMAG00000010935) cdc42l (ENSSMAG00000010911) Tongue sole MODERN SPECIES 4 phc1 (ENSCSEG00000020222) styk1b (ENSCSEG00000020218) gstk1 (ENSCSEG00000020205) ENSCSEG00000020193 casp2 (ENSCSEG00000020158) CLCN1 (ENSCSEG00000020151) ENSCSEG00000020149 FAM131B (ENSCSEG00000020146) zyx (ENSCSEG00000020144) ENSCSEG00000020138 emg1 (ENSCSEG00000020136) nop2 (ENSCSEG00000020126) ing4 (ENSCSEG00000020055) #28 ncapd2 (ENSCSEG00000020024) #21 nppcl (ENSCSEG00000020017) gapdh (ENSCSEG00000020009) #22 IFFO1 (ENSCSEG00000019999) ##23 ENSCSEG00000019994 #14 ENSCSEG00000019985 #13 ENSCSEG00000019982 mrpl51 (ENSCSEG00000019976) #20 vamp1b (ENSCSEG00000019972) cdc42l (ENSCSEG00000019970) wnt4b (ENSCSEG00000019966) CHD4 (ENSCSEG00000019943) #25 ptpn6 (ENSCSEG00000019874) rbp5 (ENSCSEG00000019868) ENSCSEG00000019863 #18 mlf2 (ENSCSEG00000019862) #32 ENO2 (ENSCSEG00000019850) ENSCSEG00000019848 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000157871.h.a ENSGT00440000033697 ENSGT00940000166290 ENSGT00940000156657 ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00950000183106.a.b.b ENSGT00940000154273.a ENSGT00940000156745.b ENSGT00940000170732 ENSGT00390000000305 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000180930 ENSGT00390000015492.A ENSGT00940000153298.i.a #22 ENSGT01100000263524.B.a.a ENSGT00510000046803.b.a.a ##23 ENSGT00940000159540.d #14 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00990000203876 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000164382.b.b ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00950000183084.b.a.a.a.a.a ENSGT00950000183084.b.a.a.a.a.b ENSGT00940000157473.b.b ENSGT00950000183084.b.a.a.a.b ENSGT00950000183084.b.a.a.b ENSGT00950000183126.b.a ENSGT00940000165886 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000166290 ENSGT00940000156657 ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00940000157383.h.b.b ENSGT00940000157383.h.b.a ENSGT00950000183106.a.b.b ENSGT00940000154273.a ENSGT00940000156745.b ENSGT00940000170732 ENSGT00390000000305 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000180930 ENSGT00390000015492.A ENSGT00940000153298.i.a #22 ENSGT01100000263524.B.a.a ENSGT00510000046803.b.a.a ##23 ENSGT00940000159540.d #14 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00990000203876 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000164382.b.b ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000157473.b.b ENSGT00950000183084.b.a.a.a.a.a ENSGT00950000183084.b.a.a.a.a.b ENSGT00950000183084.b.a.a.b ENSGT00950000183126.b.a ENSGT00940000165886 ENSGT00940000159480 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 50 ENSGT00440000033697 ENSGT00940000156657 ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00940000157383.h.b.b ENSGT00940000157383.h.b.a ENSGT00950000183106.a.b.b ENSGT00940000154273.a ENSGT00940000156745.b ENSGT00940000170732 ENSGT00390000000305 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00940000180930 ENSGT00390000015492.A ENSGT00940000153298.i.a #22 ENSGT01100000263524.B.a.a ENSGT00510000046803.b.a.a ##23 ENSGT00940000159540.d #14 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00990000203876 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000164382.b.b ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00950000183084.b.a.a.a.a.b ENSGT00950000183084.b.a.a.b ENSGT00950000183126.b.a ENSGT00940000165886 ENSGT00940000159480 ENSGT00940000155088.b.a.b #25 ENSGT00940000159249.a Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT00940000157871.h.a ENSGT00440000033697 ENSGT00940000156657 ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00940000157383.h.b.b ENSGT00940000157383.h.b.a ENSGT00950000183106.a.b.b ENSGT00940000154273.a ENSGT00940000156745.b ENSGT00940000170732 ENSGT00390000000305 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00390000015492.A ENSGT00940000153298.i.a #22 ENSGT01100000263524.B.a.a ENSGT00510000046803.b.a.a ##23 ENSGT00940000159540.d #14 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00990000203876 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000164382.b.b ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00950000183084.b.a.a.a.a.b ENSGT00950000183084.b.a.a.b ENSGT00950000183126.b.a ENSGT00940000165886 ENSGT00940000159480 ENSGT00940000155088.b.a.b #25 ENSGT00940000166118 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 232 ENSGT00940000156745.b ENSGT00940000170732 ENSGT00390000000305 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00390000015492.A ENSGT00940000153298.i.a #22 ENSGT01100000263524.B.a.a ENSGT00510000046803.b.a.a ##23 ENSGT00940000159540.d #14 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00990000203876 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000164382.b.b Orange clownfish MODERN SPECIES 21 styk1b (ENSAPEG00000010813) ENSAPEG00000010850 ENSAPEG00000010859 casp2 (ENSAPEG00000010904) ENSAPEG00000010933 ENSAPEG00000010958 ENSAPEG00000010967 FAM131B (ENSAPEG00000010988) zyx (ENSAPEG00000011032) emg1 (ENSAPEG00000011094) ENSAPEG00000011127 nop2 (ENSAPEG00000011152) ing4 (ENSAPEG00000011274) #28 ncapd2 (ENSAPEG00000011300) #21 nppcl (ENSAPEG00000011500) gapdh (ENSAPEG00000011522) #22 opn9 (ENSAPEG00000011578) IFFO1 (ENSAPEG00000011593) ##23 tnfrsf1a (ENSAPEG00000011730) #14 ENSAPEG00000011741 #13 ENSAPEG00000011771 mrpl51 (ENSAPEG00000011818) #20 vamp1b (ENSAPEG00000011832) Clown anemonefish MODERN SPECIES 3595 ENSAOCG00000006491 ENSAOCG00000006505 emg1 (ENSAOCG00000006520) ENSAOCG00000006545 #24 ing4 (ENSAOCG00000006561) #28 ncapd2 (ENSAOCG00000006587) #21 nppcl (ENSAOCG00000006600) gapdh (ENSAOCG00000006631) #22 opn9 (ENSAOCG00000006707) IFFO1 (ENSAOCG00000006752) ##23 Spiny chromis MODERN SPECIES 1446 nppcl (ENSAPOG00000010119) gapdh (ENSAPOG00000010177) #22 opn9 (ENSAPOG00000010194) IFFO1 (ENSAPOG00000010208) ##23 tnfrsf1a (ENSAPOG00000010225) #14 ENSAPOG00000010263 mrpl51 (ENSAPOG00000010274) #20 vamp1b (ENSAPOG00000010343) ENSAPOG00000010358 #18 ENSAPOG00000010394 Bicolor damselfish MODERN SPECIES 167 gapdh (ENSSPAG00000001247) #22 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000157871.h.a ENSGT00440000033697 ENSGT00940000166290 ENSGT00940000156657 ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00940000157383.h.b.b ENSGT00950000183106.a.b.b ENSGT00940000154273.a ENSGT00940000156745.b ENSGT00940000170732 ENSGT00390000000305 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00390000015492.A ENSGT00940000153298.i.a #22 ENSGT00510000046803.b.a.a ##23 ENSGT00940000159540.d #14 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00990000203876 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000164382.b.b ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00940000157473.b.b ENSGT00950000183084.b.a.a.a.a.a ENSGT00950000183084.b.a.a.a.a.b ENSGT00950000183084.b.a.a.b ENSGT00950000183126.b.a ENSGT00940000165886.a ENSGT00940000159480 ENSGT00940000155088.b.a.b #25 Midas cichlid MODERN SPECIES 1183 m6pr (ENSACIG00000011382) ENSACIG00000011412 styk1b (ENSACIG00000011473) gstk4 (ENSACIG00000011494) casp2 (ENSACIG00000011524) CLCN1 (ENSACIG00000011631) ENSACIG00000011666 FAM131B (ENSACIG00000011676) zyx (ENSACIG00000011698) ENSACIG00000011745 emg1 (ENSACIG00000011786) nop2 (ENSACIG00000011803) ing4 (ENSACIG00000011881) #28 ncapd2 (ENSACIG00000011898) #21 nppcl (ENSACIG00000012027) gapdh (ENSACIG00000012073) #22 IFFO1 (ENSACIG00000012091) ##23 tnfrsf1a (ENSACIG00000012111) #14 ENSACIG00000012128 mrpl51 (ENSACIG00000012151) #20 vamp1b (ENSACIG00000012160) ENSACIG00000012186 #18 ENSACIG00000012201 ENSACIG00000012218 c1r (ENSACIG00000012239) ENSACIG00000012296 rbp5 (ENSACIG00000012325) ptpn6 (ENSACIG00000012339) CHD4 (ENSACIG00000012387) #25 wnt4b (ENSACIG00000012475) cdc42l (ENSACIG00000012492) Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000157871.h.a ENSGT00440000033697 ENSGT00940000166290 ENSGT00940000156657 ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00950000183106.a.b.b ENSGT00940000154273.a ENSGT00940000168198 ENSGT00940000156745.b ENSGT00940000170732 ENSGT00390000000305 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00390000015492.A ENSGT00940000153298.i.a #22 ENSGT00510000046803.b.a.a ##23 ENSGT00940000159540.d #14 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00990000203876 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000164382.b.b ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00950000183084.b.a.a.a.a.a ENSGT00950000183084.b.a.a.a.a.b ENSGT00950000183084.b.a.a.b ENSGT00950000183126.b.a ENSGT00940000165886.a ENSGT00940000159480 ENSGT00940000155088.b.a.b #25 ENSGT00940000166118 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000156612 ENSGT00940000157871.h.a ENSGT00440000033697 ENSGT00940000166290 ENSGT00940000156657 ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00950000183106.a.b.b ENSGT00940000168198 ENSGT00940000156745.b ENSGT00940000170732 ENSGT00390000000305 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00390000015492.A ENSGT00940000153298.i.a #22 ENSGT00510000046803.b.a.a ##23 ENSGT00940000159540.d #14 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00990000203876 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000164382.b.b ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00950000183084.b.a.a.a.a.a ENSGT00950000183084.b.a.a.a.a.b ENSGT00950000183084.b.a.a.b ENSGT00950000183126.b.a ENSGT00940000165886.a ENSGT00940000159480 ENSGT00940000155088.b.a.b #25 ENSGT00940000166118 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000156612 ENSGT00940000157871.h.a ENSGT00440000033697 ENSGT00940000166290 ENSGT00940000156657 ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00950000183106.a.b.b ENSGT00940000168198 ENSGT00940000156745.b ENSGT00940000170732 ENSGT00390000000305 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00390000015492.A ENSGT00940000153298.i.a #22 ENSGT00510000046803.b.a.a ##23 ENSGT00940000159540.d #14 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00990000203876 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000164382.b.b ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00950000183084.b.a.a.a.a.a ENSGT00950000183084.b.a.a.a.a.b ENSGT00950000183084.b.a.a.b ENSGT00950000183126.b.a ENSGT00940000165886.a ENSGT00940000159480 ENSGT00940000155088.b.a.b #25 ENSGT00940000166118 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 338 m6pr (ENSHBUG00000014587) ENSHBUG00000014593 styk1b (ENSHBUG00000014638) gstk1 (ENSHBUG00000014649) casp2 (ENSHBUG00000014666) CLCN1 (ENSHBUG00000014750) ENSHBUG00000014771 ENSHBUG00000014815 ENSHBUG00000014825 ENSHBUG00000014843 emg1 (ENSHBUG00000014862) nop2 (ENSHBUG00000014908) ing4 (ENSHBUG00000014922) #28 ncapd2 (ENSHBUG00000015269) #21 nppcl (ENSHBUG00000015288) gapdh (ENSHBUG00000015326) #22 IFFO1 (ENSHBUG00000015385) ##23 tnfrsf1a (ENSHBUG00000015452) #14 ENSHBUG00000015475 #13 ENSHBUG00000015487 mrpl51 (ENSHBUG00000015507) #20 vamp1b (ENSHBUG00000015513) ENSHBUG00000015520 #18 c1r (ENSHBUG00000015714) c1r (ENSHBUG00000015759) ENSHBUG00000015777 ENSHBUG00000000461 rbp5 (ENSHBUG00000015787) ptpn6 (ENSHBUG00000015887) CHD4 (ENSHBUG00000016000) #25 wnt4b (ENSHBUG00000016023) Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000156612 ENSGT00940000157871.h.a ENSGT00440000033697 ENSGT00940000166290 ENSGT00940000156657 ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00950000183106.a.b.b ENSGT00940000168198 ENSGT00940000156745.b ENSGT00940000170732 ENSGT00390000000305 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00390000015492.A ENSGT00940000153298.i.a #22 ENSGT00510000046803.b.a.a ##23 ENSGT00940000159540.d #14 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00990000203876 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000164382.b.b ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00950000183084.b.a.a.a.a.a ENSGT00950000183084.b.a.a.a.a.b ENSGT00950000183084.b.a.a.b ENSGT00950000183126.b.a ENSGT00940000165886.a ENSGT00940000159480 ENSGT00940000155088.b.a.b #25 ENSGT00940000166118 P. nyererei MODERN SPECIES 340 ENSPNYG00000023245 styk1b (ENSPNYG00000023239) gstk1 (ENSPNYG00000023236) ENSPNYG00000023223 casp2 (ENSPNYG00000023215) CLCN1 (ENSPNYG00000023197) ENSPNYG00000023190 ENSPNYG00000023182 ENSPNYG00000023176 emg1 (ENSPNYG00000023172) ENSPNYG00000023168 nop2 (ENSPNYG00000023163) ing4 (ENSPNYG00000023159) #28 ncapd2 (ENSPNYG00000023147) #21 nppcl (ENSPNYG00000023137) gapdh (ENSPNYG00000023126) #22 IFFO1 (ENSPNYG00000023118) ##23 tnfrsf1a (ENSPNYG00000023108) #14 ENSPNYG00000023100 mrpl51 (ENSPNYG00000023096) #20 vamp1b (ENSPNYG00000023090) ENSPNYG00000023086 #18 ENSPNYG00000023081 c1r (ENSPNYG00000023071) ENSPNYG00000023063 ENSPNYG00000023058 rbp5 (ENSPNYG00000023055) ptpn6 (ENSPNYG00000023046) CHD4 (ENSPNYG00000023020) #25 wnt4b (ENSPNYG00000023006) cdc42l (ENSPNYG00000023002) Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000002109 ENSGT00940000156612 ENSGT00940000157871.h.a ENSGT00440000033697 ENSGT00940000166290 ENSGT00940000156657 ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00950000183106.a.b.b ENSGT00940000168198 ENSGT00940000170732 ENSGT00390000000305 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00390000015492.A ENSGT00940000153298.i.a #22 ENSGT00510000046803.b.a.a ##23 ENSGT00940000159540.d #14 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00990000203876 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000164382.b.b ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00950000183084.b.a.a.a.a.a ENSGT00950000183084.b.a.a.a.a.b ENSGT00950000183084.b.a.a.b ENSGT00950000183126.b.a ENSGT00940000165886.a ENSGT00940000159480 ENSGT00940000155088.b.a.b #25 ENSGT00940000166118 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1093 m6pr (ENSMZEG00005017448) ENSMZEG00005017459 styk1b (ENSMZEG00005017467) gstk1 (ENSMZEG00005017477) casp2 (ENSMZEG00005017481) CLCN1 (ENSMZEG00005017499) ENSMZEG00005017518 ENSMZEG00005017525 ENSMZEG00005017533 ENSMZEG00005017540 emg1 (ENSMZEG00005017546) nop2 (ENSMZEG00005017552) ing4 (ENSMZEG00005017575) #28 ncapd2 (ENSMZEG00005017584) #21 nppcl (ENSMZEG00005017599) gapdh (ENSMZEG00005017606) #22 IFFO1 (ENSMZEG00005017621) ##23 tnfrsf1a (ENSMZEG00005017631) #14 ENSMZEG00005017640 #13 ENSMZEG00005017646 mrpl51 (ENSMZEG00005017651) #20 vamp1b (ENSMZEG00005017659) ENSMZEG00005017663 #18 c1r (ENSMZEG00005017676) ENSMZEG00005017699 ENSMZEG00005017721 ENSMZEG00005017724 rbp5 (ENSMZEG00005017730) ptpn6 (ENSMZEG00005017741) CHD4 (ENSMZEG00005017761) #25 wnt4b (ENSMZEG00005017768) Eastern happy MODERN SPECIES 2 ENSACLG00000023277 styk1b (ENSACLG00000023346) gstk1 (ENSACLG00000023395) ENSACLG00000023405 casp2 (ENSACLG00000023429) CLCN1 (ENSACLG00000023478) ENSACLG00000023566 ENSACLG00000023591 ENSACLG00000023641 ENSACLG00000023667 emg1 (ENSACLG00000023688) ENSACLG00000023702 #24 ing4 (ENSACLG00000023713) #28 ncapd2 (ENSACLG00000023758) #21 nppcl (ENSACLG00000024000) gapdh (ENSACLG00000024004) #22 IFFO1 (ENSACLG00000024040) ##23 tnfrsf1a (ENSACLG00000024260) #14 ENSACLG00000024268 ENSACLG00000024272 mrpl51 (ENSACLG00000024277) #20 vamp1b (ENSACLG00000024283) ENSACLG00000024298 #18 c1r (ENSACLG00000024311) c1r (ENSACLG00000024323) ENSACLG00000024330 ENSACLG00000024367 rbp5 (ENSACLG00000024378) ptpn6 (ENSACLG00000024401) CHD4 (ENSACLG00000024468) #25 wnt4b (ENSACLG00000024555) Lyretail cichlid MODERN SPECIES 386 m6pr (ENSNBRG00000001598) phc1 (ENSNBRG00000001543) styk1b (ENSNBRG00000001475) gstk1 (ENSNBRG00000001453) ENSNBRG00000001411 casp2 (ENSNBRG00000001343) CLCN1 (ENSNBRG00000001323) FAM131B (ENSNBRG00000001276) ENSNBRG00000001211 emg1 (ENSNBRG00000001192) ENSNBRG00000001168 nop2 (ENSNBRG00000001113) ing4 (ENSNBRG00000000796) #28 ncapd2 (ENSNBRG00000000599) #21 nppcl (ENSNBRG00000000591) gapdh (ENSNBRG00000000547) #22 IFFO1 (ENSNBRG00000000483) ##23 tnfrsf1a (ENSNBRG00000000450) #14 ENSNBRG00000000404 mrpl51 (ENSNBRG00000000391) #20 vamp1b (ENSNBRG00000000325) ENSNBRG00000000257 #18 ENSNBRG00000021811 c1r (ENSNBRG00000021761) ENSNBRG00000021730 ENSNBRG00000021719 rbp5 (ENSNBRG00000021709) ptpn6 (ENSNBRG00000021680) CHD4 (ENSNBRG00000021576) #25 wnt4b (ENSNBRG00000021557) cdc42l (ENSNBRG00000021542) Nile tilapia MODERN SPECIES 2 ENSONIG00000029070 styk1b (ENSONIG00000030941) gstk1 (ENSONIG00000012866) ENSONIG00000012872 casp2 (ENSONIG00000012874) CLCN1 (ENSONIG00000012880) FAM131B (ENSONIG00000012888) zyx (ENSONIG00000012889) ENSONIG00000012891 ENSONIG00000012892 emg1 (ENSONIG00000012893) nop2 (ENSONIG00000012896) ing4 (ENSONIG00000012899) #28 ncapd2 (ENSONIG00000012903) #21 nppcl (ENSONIG00000039427) gapdh (ENSONIG00000012916) #22 ENSONIG00000031664 IFFO1 (ENSONIG00000012923) ##23 tnfrsf1a (ENSONIG00000012925) #14 ENSONIG00000036169 #13 ENSONIG00000012927 mrpl51 (ENSONIG00000041702) #20 vamp1b (ENSONIG00000035965) ENSONIG00000012935 #18 c1r (ENSONIG00000039055) c1r (ENSONIG00000012936) ENSONIG00000042930 ENSONIG00000012947 rbp5 (ENSONIG00000012948) ptpn6 (ENSONIG00000012950) CHD4 (ENSONIG00000012953) #25 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000165997.b ENSGT00940000157871.h.a ENSGT00440000033697 ENSGT00940000166290 ENSGT00940000156657 ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00950000183106.a.b.b ENSGT00940000154273.a ENSGT00940000156745.b ENSGT00940000170732 ENSGT00390000000305 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00390000015492.A ENSGT00940000153298.i.a #22 ENSGT00510000046803.b.a.a ##23 ENSGT00940000159540.d #14 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00990000203876 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000164382.b.b ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00950000183084.b.a.a.a.a.b ENSGT00940000157473.b.b ENSGT00950000183084.b.a.a.a.b ENSGT00950000183084.b.a.a.b ENSGT00950000183126.b.a ENSGT00940000165886 ENSGT00940000159480 ENSGT00940000155088.b.a.b #25 Oryzias ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000157871.h.a ENSGT00440000033697 ENSGT00940000166290 ENSGT00940000156657 ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00950000183106.a.b.b ENSGT00940000154273.a ENSGT00940000168198 ENSGT00940000156745.b ENSGT00940000170732 ENSGT00390000000305 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00390000015492.A ENSGT00940000153298.i.a #22 ENSGT00510000046803.b.a.a ##23 ENSGT00940000159540.d #14 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00990000203876 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000164382.b.b ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00950000183084.b.a.a.a.a.b ENSGT00950000183084.b.a.a.b ENSGT00950000183126.b.a ENSGT00940000165886 ENSGT00940000159480 ENSGT00940000155088.b.a.b #25 ENSGT00940000166118 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.a.a.b Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000002109 ENSGT00940000156612 ENSGT00940000157871.h.a ENSGT00440000033697 ENSGT00940000166290 ENSGT00940000156657 ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00950000183106.a.b.b ENSGT00940000154273.a ENSGT00940000170732 ENSGT00390000000305 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00390000015492.A ENSGT00940000153298.i.a #22 ENSGT00510000046803.b.a.a ##23 ENSGT00940000159540.d #14 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00990000203876 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000164382.b.b ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00950000183084.b.a.a.a.a.b ENSGT00950000183084.b.a.a.b ENSGT00950000183126.b.a ENSGT00940000165886 ENSGT00940000159480 ENSGT00940000155088.b.a.b #25 ENSGT00940000166118 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.a.a.b Indian medaka MODERN SPECIES 5 m6pr (ENSOMEG00000012267) ENSOMEG00000012311 styk1b (ENSOMEG00000012341) gstk4 (ENSOMEG00000012381) ENSOMEG00000012452 casp2 (ENSOMEG00000012485) CLCN1 (ENSOMEG00000012527) FAM131B (ENSOMEG00000012572) zyx (ENSOMEG00000012638) ENSOMEG00000012664 emg1 (ENSOMEG00000012687) nop2 (ENSOMEG00000012751) ing4 (ENSOMEG00000012769) #28 ncapd2 (ENSOMEG00000012846) #21 nppcl (ENSOMEG00000012872) gapdh (ENSOMEG00000012911) #22 IFFO1 (ENSOMEG00000012942) ##23 tnfrsf1a (ENSOMEG00000012971) #14 ENSOMEG00000013005 #13 ENSOMEG00000013020 mrpl51 (ENSOMEG00000013053) #20 vamp1b (ENSOMEG00000013069) ENSOMEG00000013100 #18 c1r (ENSOMEG00000013179) ENSOMEG00000013221 ENSOMEG00000013249 rbp5 (ENSOMEG00000013276) ptpn6 (ENSOMEG00000013303) CHD4 (ENSOMEG00000013408) #25 wnt4b (ENSOMEG00000013453) cdc42l (ENSOMEG00000013478) Javanese ricefish MODERN SPECIES 7 m6pr (ENSOJAG00000013171) ENSOJAG00000013196 styk1b (ENSOJAG00000013221) gstk1 (ENSOJAG00000013263) ENSOJAG00000013279 casp2 (ENSOJAG00000013287) CLCN1 (ENSOJAG00000013352) FAM131B (ENSOJAG00000013852) ENSOJAG00000013871 ENSOJAG00000013884 emg1 (ENSOJAG00000013894) nop2 (ENSOJAG00000013913) ing4 (ENSOJAG00000014015) #28 ncapd2 (ENSOJAG00000014058) #21 nppcl (ENSOJAG00000014352) gapdh (ENSOJAG00000014377) #22 IFFO1 (ENSOJAG00000015141) ##23 tnfrsf1a (ENSOJAG00000015148) #14 ENSOJAG00000007490 #13 ENSOJAG00000007504 mrpl51 (ENSOJAG00000007511) #20 vamp1b (ENSOJAG00000007549) ENSOJAG00000007561 #18 c1r (ENSOJAG00000007602) ENSOJAG00000007837 ENSOJAG00000007845 ENSOJAG00000007906 rbp5 (ENSOJAG00000007923) ptpn6 (ENSOJAG00000008029) CHD4 (ENSOJAG00000009186) #25 wnt4b (ENSOJAG00000011876) Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000156612 ENSGT00940000157871.h.a ENSGT00440000033697 ENSGT00940000166290 ENSGT00940000156657 ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00950000183106.a.b.b ENSGT00940000168198 ENSGT00940000156745.b ENSGT00940000170732 ENSGT00390000000305 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00390000015492.A ENSGT00940000153298.i.a #22 ENSGT00510000046803.b.a.a ##23 ENSGT00940000159540.d #14 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00990000203876 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000164382.b.b ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00950000183084.b.a.a.a.a.b ENSGT00950000183084.b.a.a.b ENSGT00950000183126.b.a ENSGT00940000165886 ENSGT00940000159480 ENSGT00940000155088.b.a.b #25 ENSGT00940000166118 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.a.a.b Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 7 ENSORLG00000012017 styk1b (ENSORLG00000012057) ENSORLG00000024298 ENSORLG00000030271 casp2 (ENSORLG00000012073) CLCN1 (ENSORLG00000012097) FAM131B (ENSORLG00000026897) ENSORLG00000012132 ENSORLG00000012141 ENSORLG00000024076 emg1 (ENSORLG00000012146) ENSORLG00000012153 #24 ing4 (ENSORLG00000012172) #28 ENSORLG00000024287 wu:fj39g12 (ENSORLG00000012204) gapdh (ENSORLG00000012224) #22 IFFO1 (ENSORLG00000029960) ##23 tnfrsf1a (ENSORLG00000012260) #14 ENSORLG00000012267 #13 ENSORLG00000023416 mrpl51 (ENSORLG00000026054) #20 vamp1b (ENSORLG00000012300) ENSORLG00000012315 #18 c1r (ENSORLG00000012352) ENSORLG00000012367 ENSORLG00000028634 rbp5 (ENSORLG00000012372) ptpn6 (ENSORLG00000012425) ENSORLG00000012477 #25 wnt4b (ENSORLG00000012515) cdc42l (ENSORLG00000024257) Chinese medaka MODERN SPECIES 467 ENSOSIG00000005414 m6pr (ENSOSIG00000005415) styk1b (ENSOSIG00000005421) gstk1 (ENSOSIG00000005423) ENSOSIG00000005426 casp2 (ENSOSIG00000005428) ENSOSIG00000005431 CLCN1 (ENSOSIG00000005489) FAM131B (ENSOSIG00000011695) ENSOSIG00000011696 emg1 (ENSOSIG00000011697) nop2 (ENSOSIG00000011699) ing4 (ENSOSIG00000011785) #28 ncapd2 (ENSOSIG00000011789) #21 nppcl (ENSOSIG00000011826) gapdh (ENSOSIG00000011836) #22 IFFO1 (ENSOSIG00000012400) ##23 tnfrsf1a (ENSOSIG00000012404) #14 ENSOSIG00000012405 mrpl51 (ENSOSIG00000012409) #20 vamp1b (ENSOSIG00000012413) ENSOSIG00000012418 #18 c1r (ENSOSIG00000012425) ENSOSIG00000012432 ENSOSIG00000012435 rbp5 (ENSOSIG00000012439) ptpn6 (ENSOSIG00000012454) CHD4 (ENSOSIG00000013891) #25 wnt4b (ENSOSIG00000014384) cdc42l (ENSOSIG00000014388) mlf2 (ENSOSIG00000014389) #32 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000165997.b ENSGT00940000157871.h.a ENSGT00440000033697 ENSGT00940000166290 ENSGT00940000156657 ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00950000183106.a.b.b ENSGT00940000154273.a.j ENSGT00940000156745.b ENSGT00940000170732 ENSGT00390000000305 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00390000015492.A ENSGT00940000153298.i.a #22 ENSGT00510000046803.b.a.a ##23 ENSGT00940000159540.d #14 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00990000203876 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000164382.b.b ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00950000183084.b.a.a.a.a.b ENSGT00940000157473.b.b ENSGT00950000183084.b.a.a.a.b ENSGT00950000183084.b.a.a.b ENSGT00950000183126.b.a ENSGT00940000165886 ENSGT00940000159480 ENSGT00940000155088.b.a.b #25 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000165997.a ENSGT00940000157871.h.a ENSGT00440000033697 ENSGT00940000166290 ENSGT00940000156657 ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00950000183106.a.b.b ENSGT00940000154273.a.j ENSGT00940000156745.b ENSGT00940000170732 ENSGT00390000000305 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00390000015492.A ENSGT00940000153298.i.a #22 ENSGT00510000046803.b.a.a ##23 ENSGT00940000159540.d #14 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00990000203876 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000164382.b.b ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00950000183084.b.a.a.a.a.b ENSGT00950000183084.b.a.a.b ENSGT00950000183126.b.a ENSGT00940000165886 ENSGT00940000159480 ENSGT00940000155088.b.a.b #25 ENSGT00940000166118 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.a.a.d.a Mangrove rivulus MODERN SPECIES 33 m6pr (ENSKMAG00000006791) ENSKMAG00000006802 styk1b (ENSKMAG00000006822) gstk1 (ENSKMAG00000006840) casp2 (ENSKMAG00000006878) CLCN1 (ENSKMAG00000006908) ENSKMAG00000006956 zyx (ENSKMAG00000006977) ENSKMAG00000007007 ENSKMAG00000007054 emg1 (ENSKMAG00000007069) ENSKMAG00000007111 #24 ing4 (ENSKMAG00000007187) #28 ncapd2 (ENSKMAG00000007222) #21 nppcl (ENSKMAG00000007368) gapdh (ENSKMAG00000007391) #22 IFFO1 (ENSKMAG00000007591) ##23 tnfrsf1a (ENSKMAG00000007634) #14 ENSKMAG00000007663 #13 mrpl51 (ENSKMAG00000007684) #20 vamp1b (ENSKMAG00000007705) ENSKMAG00000007746 #18 c1r (ENSKMAG00000007760) ENSKMAG00000007780 ENSKMAG00000007791 rbp5 (ENSKMAG00000007816) ptpn6 (ENSKMAG00000007851) CHD4 (ENSKMAG00000007932) #25 wnt4b (ENSKMAG00000008001) cdc42l (ENSKMAG00000008044) cdc42l (ENSKMAG00000008074) Turquoise killifish MODERN SPECIES 1614 M6PR (ENSNFUG00015001800) ENSNFUG00015001802 ENSNFUG00015001814 styk1b (ENSNFUG00015001819) GSTK1 (ENSNFUG00015001827) ENSNFUG00015001834 casp2 (ENSNFUG00015001845) CLCN1 (ENSNFUG00015001938) FAM131B (ENSNFUG00015002096) ZYX (ENSNFUG00015002111) OLA.5378 (ENSNFUG00015002121) nop2 (ENSNFUG00015002131) NCAPD2 (ENSNFUG00015002147) #28 ncapd2 (ENSNFUG00015002195) #21 CNP-1 (ENSNFUG00015002287) GAPDH (ENSNFUG00015002376) #22 IFFO1 (ENSNFUG00015002677) ##23 tnfrsf1a (ENSNFUG00015002691) #14 ENSNFUG00015002699 #13 ENSNFUG00015002706 MRPL51 (ENSNFUG00015002713) #20 vamp1b (ENSNFUG00015002717) ENSNFUG00015000162 ENSNFUG00015000190 #18 c1r (ENSNFUG00015000234) RBP1A (ENSNFUG00015000267) ptpn6 (ENSNFUG00015000317) CHD4 (ENSNFUG00015000413) #25 WNT4B (ENSNFUG00015000563) cdc42l (ENSNFUG00015000579) mlf2 (ENSNFUG00015000592) #32 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156612 ENSGT00940000157871.h.a ENSGT00440000033697 ENSGT00940000166290 ENSGT00940000156657 ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00950000183106.a.b.b ENSGT00940000154273.a.j ENSGT00940000156745.b ENSGT00940000170732 ENSGT00390000000305 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00390000015492.A ENSGT00940000153298.i.a #22 ENSGT00510000046803.b.a.a ##23 ENSGT00940000159540.d #14 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00990000203876 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000164382.b.b ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00950000183084.b.a.a.a.a.b ENSGT00940000157473.b.b ENSGT00950000183084.b.a.a.a.b ENSGT00950000183084.b.a.a.b ENSGT00950000183126.b.a ENSGT00940000165886 ENSGT00940000159480 ENSGT00940000155088.b.a.b #25 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000156612 ENSGT00940000157871.h.a ENSGT00440000033697 ENSGT00940000166290 ENSGT00940000156657 ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00950000183106.a.b.b ENSGT00940000154273.a.j ENSGT00940000156745.b ENSGT00390000000305.h ENSGT00940000170732 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00390000015492.A ENSGT00940000153298.i.a #22 ENSGT00510000046803.b.a.a ##23 ENSGT00940000159540.d #14 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00990000203876 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000164382.b.b ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00950000183084.b.a.a.a.a.b ENSGT00940000157473.b.b ENSGT00950000183084.b.a.a.b ENSGT00950000183126.b.a ENSGT00940000165886 ENSGT00940000159480 ENSGT00940000155088.b.a.b #25 ENSGT00940000166118 Mummichog MODERN SPECIES 2274 ncapd2 (ENSFHEG00000013295) #21 nppcl (ENSFHEG00000013151) gapdh (ENSFHEG00000013138) #22 IFFO1 (ENSFHEG00000013095) ##23 tnfrsf1a (ENSFHEG00000013041) #14 ENSFHEG00000012995 mrpl51 (ENSFHEG00000012964) #20 vamp1b (ENSFHEG00000012960) ENSFHEG00000012942 #18 c1r (ENSFHEG00000012915) ENSFHEG00000012901 ENSFHEG00000000283 ENSFHEG00000012860 rbp5 (ENSFHEG00000012853) ptpn6 (ENSFHEG00000012828) ENSFHEG00000012736 wnt4b (ENSFHEG00000012446) cdc42l (ENSFHEG00000012415) Sheepshead minnow MODERN SPECIES 160 ENSCVAG00000001191 m6pr (ENSCVAG00000001189) phc1 (ENSCVAG00000001187) styk1b (ENSCVAG00000001183) gstk1 (ENSCVAG00000001180) casp2 (ENSCVAG00000001178) CLCN1 (ENSCVAG00000001174) FAM131B (ENSCVAG00000001171) zyx (ENSCVAG00000001168) ENSCVAG00000001166 emg1 (ENSCVAG00000001164) nop2 (ENSCVAG00000001162) ing4 (ENSCVAG00000001160) #28 ncapd2 (ENSCVAG00000001158) #21 nppcl (ENSCVAG00000000045) gapdh (ENSCVAG00000001151) #22 IFFO1 (ENSCVAG00000001148) ##23 tnfrsf1a (ENSCVAG00000001144) #14 ENSCVAG00000001143 #13 ENSCVAG00000001140 mrpl51 (ENSCVAG00000001138) #20 vamp1b (ENSCVAG00000001137) ENSCVAG00000001136 #18 c1r (ENSCVAG00000001134) ENSCVAG00000001132 ENSCVAG00000001131 rbp5 (ENSCVAG00000001130) ptpn6 (ENSCVAG00000001129) CHD4 (ENSCVAG00000001128) #25 wnt4b (ENSCVAG00000001126) cdc42l (ENSCVAG00000001125) Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000165997.b ENSGT00940000157871.h.a ENSGT00440000033697 ENSGT00940000166290 ENSGT00940000156657 ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00950000183106.a.b.b ENSGT00940000154273.a.j ENSGT00940000156745.b ENSGT00940000170732 ENSGT00390000000305 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00390000015492.A ENSGT00940000153298.i.a #22 ENSGT00510000046803.b.a.a ##23 ENSGT00940000159540.d #14 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00990000203876 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000164382.b.b ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00950000183084.b.a.a.a.a.b ENSGT00940000157473.b.b ENSGT00950000183084.b.a.a.a.b ENSGT00950000183084.b.a.a.b ENSGT00950000183126.b.a ENSGT00940000165886 ENSGT00940000159480 ENSGT00940000155088.b.a.b #25 Poecilia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000165997.b ENSGT00940000157871.h.a ENSGT00440000033697 ENSGT00940000166290 ENSGT00940000156657 ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00950000183106.a.b.b ENSGT00940000154273.a.j ENSGT00940000156745.b ENSGT00940000170732 ENSGT00390000000305 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00390000015492.A ENSGT00940000153298.i.a #22 ENSGT00510000046803.b.a.a ##23 ENSGT00940000159540.d #14 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00990000203876 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000164382.b.b ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00950000183084.b.a.a.a.a.b ENSGT00940000157473.b.b ENSGT00950000183084.b.a.a.a.b ENSGT00950000183084.b.a.a.b ENSGT00950000183126.b.a ENSGT00940000165886 ENSGT00940000159480 ENSGT00940000155088.b.a.b #25 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000157871.h.a ENSGT00440000033697 ENSGT00940000166290 ENSGT00940000156657 ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00950000183106.a.b.b ENSGT00940000168198 ENSGT00940000154273.a.j ENSGT00940000156745.b ENSGT00940000170732 ENSGT00390000000305 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00390000015492.A ENSGT00940000153298.i.a #22 ENSGT00510000046803.b.a.a ##23 ENSGT00940000159540.d #14 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT00990000203876 ENSGT00390000018821 #20 ENSGT00940000164382.b.b ENSGT00940000160453 #18 ENSGT00950000183084.b.a.a.a.a.b ENSGT00950000183084.b.a.a.b ENSGT00950000183126.b.a ENSGT00940000165886 ENSGT00940000159480 ENSGT00940000155088.b.a.b #25 ENSGT00940000166118 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.a.a.c Amazon molly MODERN SPECIES 286 phc1 (ENSPFOG00000012550) styk1b (ENSPFOG00000012584) gstk1 (ENSPFOG00000012604) ENSPFOG00000012641 casp2 (ENSPFOG00000012707) CLCN1 (ENSPFOG00000012772) FAM131B (ENSPFOG00000012923) ENSPFOG00000012963 ENSPFOG00000012999 ENSPFOG00000013022 emg1 (ENSPFOG00000013034) nop2 (ENSPFOG00000013054) ing4 (ENSPFOG00000013196) #28 ncapd2 (ENSPFOG00000013227) #21 nppcl (ENSPFOG00000013515) gapdh (ENSPFOG00000024059) #22 IFFO1 (ENSPFOG00000013521) ##23 ENSPFOG00000021871 ENSPFOG00000022946 tnfrsf1a (ENSPFOG00000013634) #14 ENSPFOG00000013664 #13 ENSPFOG00000013679 mrpl51 (ENSPFOG00000013680) #20 vamp1b (ENSPFOG00000013702) ENSPFOG00000013728 #18 c1r (ENSPFOG00000013760) ENSPFOG00000024460 ENSPFOG00000013858 rbp5 (ENSPFOG00000013861) ptpn6 (ENSPFOG00000013863) CHD4 (ENSPFOG00000013889) #25 Sailfin molly MODERN SPECIES 760 zyx (ENSPLAG00000006109) ENSPLAG00000006063 ENSPLAG00000006036 emg1 (ENSPLAG00000000125) nop2 (ENSPLAG00000005975) ing4 (ENSPLAG00000000120) #28 ncapd2 (ENSPLAG00000005906) #21 nppcl (ENSPLAG00000005892) gapdh (ENSPLAG00000005851) #22 IFFO1 (ENSPLAG00000005820) ##23 tnfrsf1a (ENSPLAG00000005764) #14 ENSPLAG00000005747 #13 ENSPLAG00000005734 mrpl51 (ENSPLAG00000000112) #20 vamp1b (ENSPLAG00000005704) ENSPLAG00000005683 #18 c1r (ENSPLAG00000005673) ENSPLAG00000005653 ENSPLAG00000005609 ENSPLAG00000005588 ENSPLAG00000005551 Guppy MODERN SPECIES 446 ENSPREG00000010032 m6pr (ENSPREG00000010054) ENSPREG00000010082 gstk1 (ENSPREG00000010100) ENSPREG00000010117 casp2 (ENSPREG00000010153) CLCN1 (ENSPREG00000010305) FAM131B (ENSPREG00000010352) zyx (ENSPREG00000010371) ENSPREG00000010390 emg1 (ENSPREG00000010409) nop2 (ENSPREG00000010428) ing4 (ENSPREG00000010462) #28 ncapd2 (ENSPREG00000010722) #21 nppcl (ENSPREG00000010852) gapdh (ENSPREG00000010888) #22 IFFO1 (ENSPREG00000010909) ##23 tnfrsf1a (ENSPREG00000010956) #14 ENSPREG00000010991 #13 ENSPREG00000011015 mrpl51 (ENSPREG00000011034) #20 vamp1b (ENSPREG00000011046) ENSPREG00000011079 #18 ENSPREG00000011152 ENSPREG00000011225 ENSPREG00000011273 ENSPREG00000011291 rbp5 (ENSPREG00000011326) ptpn6 (ENSPREG00000011333) CHD4 (ENSPREG00000011359) #25 wnt4b (ENSPREG00000011407) Platyfish MODERN SPECIES 17 ENSXMAG00000011631 styk1b (ENSXMAG00000011629) gstk1 (ENSXMAG00000011613) ENSXMAG00000011599 casp2 (ENSXMAG00000011588) CLCN1 (ENSXMAG00000011547) FAM131B (ENSXMAG00000025630) zyx (ENSXMAG00000011533) ENSXMAG00000011525 emg1 (ENSXMAG00000011508) ENSXMAG00000011523 nop2 (ENSXMAG00000011483) ing4 (ENSXMAG00000025696) #28 ncapd2 (ENSXMAG00000011455) #21 nppcl (ENSXMAG00000026582) gapdh (ENSXMAG00000011432) #22 IFFO1 (ENSXMAG00000011423) ##23 tnfrsf1a (ENSXMAG00000024956) #14 ENSXMAG00000011412 #13 ENSXMAG00000011411 mrpl51 (ENSXMAG00000011410) #20 vamp1b (ENSXMAG00000011407) ENSXMAG00000011401 #18 c1r (ENSXMAG00000011372) ENSXMAG00000026464 ENSXMAG00000011370 rbp5 (ENSXMAG00000011354) ptpn6 (ENSXMAG00000011352) CHD4 (ENSXMAG00000011263) #25 wnt4b (ENSXMAG00000011250) cdc42l (ENSXMAG00000011242) Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 200 ENSGT00390000002109 ENSGT00940000165997.b ENSGT00940000157871.h.a ENSGT00440000033697 ENSGT00940000166290 ENSGT00940000156657 ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00950000183106.a.b.b ENSGT00940000154273.a ENSGT00940000156745.b ENSGT00390000000305 ENSGT00390000000510 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00390000015492.A ENSGT00940000153298.i.a #22 ENSGT01100000263524.B.a.a ENSGT00510000046803.b.a.a ##23 ENSGT00940000159540.d #14 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT01050000245031 Otophysi ANCESTRAL SPECIES 177 ENSGT00940000154371.a.b.a ENSGT00940000153496.b ENSGT00940000162720.b.b.a ENSGT00390000013183.d.b.a ENSGT01030000234571.b.b.b.a.a.g ENSGT00390000002109 ENSGT00940000156657 ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00950000183106.a.b.b ENSGT00940000154273.a ENSGT00940000156745.b ENSGT00390000000305 ENSGT00390000000510 ENSGT00940000161554 ENSGT00390000015492.A ENSGT00940000153298.i.a #22 ENSGT01100000263524.B.a.a ENSGT00510000046803.b.a.a ##23 ENSGT00940000159540.d #14 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT01050000245031 ENSGT00390000012976 ENSGT00940000165838 ENSGT00940000158808 ENSGT01030000234586.B.a.b ENSGT00940000159286.a.b.d Characiphysae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153496.b ENSGT00940000162720.b.b.a ENSGT00390000013183.d.b.a ENSGT01030000234571.b.b.b.a.a.h ENSGT01030000234571.b.b.b.a.a.g ENSGT00390000002109 ENSGT00940000156657 ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00950000183106.a.b.b ENSGT00940000154273.a ENSGT00940000156745.b ENSGT00390000000305 ENSGT00390000000510 ENSGT00940000161554 ENSGT00390000015492.A ENSGT00940000153298.i.a #22 ENSGT01100000263524.B.a.a ENSGT00510000046803.b.a.a ##23 ENSGT00940000159540.d #14 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT01050000245031 ENSGT00390000012976 ENSGT00940000165838 ENSGT00940000158808 ENSGT01030000234586.B.a.b ENSGT00940000159286.a.b.d ENSGT00940000158641.a.b ENSGT00940000163785.a.a.b ENSGT00390000003488.b.b ENSGT00940000160002 ENSGT00390000010811 Channel catfish MODERN SPECIES TMEM238 (ENSIPUG00000008846) ccdc106a (ENSIPUG00000008764) ENSIPUG00000008743 ENSIPUG00000008719 M6pr (ENSIPUG00000008681) casp2 (ENSIPUG00000008552) CLCN1 (ENSIPUG00000008413) ENSIPUG00000008379 FAM131B (ENSIPUG00000008365) zyx (ENSIPUG00000008337) ENSIPUG00000008285 emg1 (ENSIPUG00000008261) gtf3c6 (ENSIPUG00000008252) nop2 (ENSIPUG00000008198) wu:fj39g12 (ENSIPUG00000008182) gapdh (ENSIPUG00000007949) #22 Iffo1 (ENSIPUG00000007925) ##23 tnfrsf1a (ENSIPUG00000007897) #14 ENSIPUG00000007881 ENSIPUG00000007752 #13 rpl18 (ENSIPUG00000007810) si:ch211-120k19.1 (ENSIPUG00000007726) ENSIPUG00000007640 kcnj14 (ENSIPUG00000007594) ENSIPUG00000007570 sema6c (ENSIPUG00000007475) ENSIPUG00000007446 tnfaip8l2b (ENSIPUG00000007411) lysmd1 (ENSIPUG00000007401) scnm1 (ENSIPUG00000007327) drc1 (ENSIPUG00000007293) Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000153496.b ENSGT00940000162720.b.b.a ENSGT00390000013183.d.b.a ENSGT01030000234571.b.b.b.a.a.h ENSGT01030000234571.b.b.b.a.a.g ENSGT00390000002109 ENSGT00940000156657 ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00950000183106.a.b.b ENSGT00940000154273.a ENSGT00940000156745.b ENSGT00390000000305 ENSGT00390000000510 ENSGT00940000161554 ENSGT00390000015492.A ENSGT00940000153298.i.a #22 ENSGT01100000263524.B.a.a ENSGT00510000046803.b.a.a ##23 ENSGT00940000159540.d #14 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT01050000245031 ENSGT00390000012976 ENSGT00940000165838 ENSGT00940000158808 ENSGT01030000234586.B.a.b ENSGT00940000159286.a.b.d ENSGT00940000158641.a.b ENSGT00940000163785.a.a.b ENSGT00390000003488.b.b ENSGT00940000160002 ENSGT00390000010811 Characoidei ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000153496.b ENSGT00940000162720.b.b.a ENSGT00390000013183.d.b.a ENSGT01030000234571.b.b.b.a.a.h ENSGT01030000234571.b.b.b.a.a.g ENSGT00390000002109 ENSGT00940000156657 ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00950000183106.a.b.b ENSGT00940000154273.a ENSGT00940000156745.b ENSGT00390000000305 ENSGT00390000000510 ENSGT00940000161554 ENSGT00390000015492.A ENSGT00940000153298.i.a #22 ENSGT01100000263524.B.a.a ENSGT00510000046803.b.a.a ##23 ENSGT00940000159540.d #14 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT01050000245031 ENSGT00390000012976 ENSGT00940000165838 ENSGT00940000158808 ENSGT01030000234586.B.a.b ENSGT00940000159286.a.b.d ENSGT00940000158641.a.b ENSGT00940000163785.a.a.b ENSGT00390000003488.b.b ENSGT00940000160002 ENSGT00390000010811 Mexicana tetra MODERN SPECIES 1 ENSAMXG00000039301 ENSAMXG00000019061 TMEM238 (ENSAMXG00000025100) ccdc106a (ENSAMXG00000019054) ENSAMXG00000041889 m6pr (ENSAMXG00000037010) casp2 (ENSAMXG00000019043) CLCN1 (ENSAMXG00000019025) FAM131B (ENSAMXG00000019016) zyx (ENSAMXG00000019006) ENSAMXG00000018998 emg1 (ENSAMXG00000018994) gtf3c6 (ENSAMXG00000038574) nop2 (ENSAMXG00000018985) nppcl (ENSAMXG00000018980) gapdh (ENSAMXG00000039361) #22 opn9 (ENSAMXG00000018966) IFFO1 (ENSAMXG00000018953) ##23 rpl18 (ENSAMXG00000018919) tnfrsf1a (ENSAMXG00000018943) #14 ENSAMXG00000032096 #13 ENSAMXG00000018926 si:ch211-120k19.1 (ENSAMXG00000030967) ENSAMXG00000018895 ENSAMXG00000029653 ENSAMXG00000025099 sema6e (ENSAMXG00000018856) ENSAMXG00000030258 tnfaip8l2b (ENSAMXG00000042047) lysmd1 (ENSAMXG00000018833) scnm1 (ENSAMXG00000018828) Red-bellied piranha MODERN SPECIES 67 TMEM238 (ENSPNAG00000020329) ccdc106a (ENSPNAG00000020318) ENSPNAG00000020258 ENSPNAG00000020242 m6pr (ENSPNAG00000020210) casp2 (ENSPNAG00000020200) CLCN1 (ENSPNAG00000003638) FAM131B (ENSPNAG00000020111) zyx (ENSPNAG00000003623) ENSPNAG00000005020 emg1 (ENSPNAG00000019953) ENSPNAG00000019928 gtf3c6 (ENSPNAG00000019896) nop2 (ENSPNAG00000019880) nppcl (ENSPNAG00000006757) gapdh (ENSPNAG00000019846) #22 opn9 (ENSPNAG00000019811) IFFO1 (ENSPNAG00000019791) ##23 tnfrsf1a (ENSPNAG00000005582) #14 ENSPNAG00000019746 #13 ENSPNAG00000019699 rpl18 (ENSPNAG00000019682) si:ch211-120k19.1 (ENSPNAG00000019638) ENSPNAG00000019561 KCNJ14 (ENSPNAG00000019030) ENSPNAG00000019002 sema6e (ENSPNAG00000018992) Electric eel MODERN SPECIES 100 ENSEEEG00000019664 ENSEEEG00000019666 ENSEEEG00000019670 ccdc106a (ENSEEEG00000019671) ENSEEEG00000019673 m6pr (ENSEEEG00000019680) casp2 (ENSEEEG00000019681) ENSEEEG00000019685 FAM131B (ENSEEEG00000019687) ENSEEEG00000019689 ENSEEEG00000019691 emg1 (ENSEEEG00000019695) gtf3c6 (ENSEEEG00000019696) nop2 (ENSEEEG00000019698) nppcl (ENSEEEG00000019703) gapdh (ENSEEEG00000019740) #22 IFFO1 (ENSEEEG00000021205) ##23 tnfrsf1a (ENSEEEG00000021206) #14 ENSEEEG00000021207 #13 ENSEEEG00000021209 rpl18 (ENSEEEG00000021210) si:ch211-120k19.1 (ENSEEEG00000021213) ENSEEEG00000021216 ENSEEEG00000021229 ENSEEEG00000021326 sema6e (ENSEEEG00000021337) tnfaip8l2b (ENSEEEG00000021426) lysmd1 (ENSEEEG00000021428) scnm1 (ENSEEEG00000021430) tmod4 (ENSEEEG00000021435) VPS72 (ENSEEEG00000021441) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 122 ENSGT00940000154371.a.b.a ENSGT00940000153496.b ENSGT00940000162720.b.b.a ENSGT00390000013183.d.b.a ENSGT01030000234571.b.b.b.a.a.g ENSGT00390000002109 ENSGT00940000156657 ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00950000183106.a.b.b ENSGT00940000154273.a ENSGT00940000156745.b ENSGT00390000000305 ENSGT00390000000510 ENSGT00940000161554 ENSGT00390000015492.A.e ENSGT00940000153298.i.a #22 ENSGT01100000263524.B.a.a ENSGT00510000046803.b.a.a ##23 ENSGT00940000159540.d.e #14 ENSGT00940000161250 #13 ENSGT01050000245031 ENSGT00390000012976 ENSGT00940000165838 ENSGT00940000158808 ENSGT01030000234586.B.a.b ENSGT00940000159286.a.b.d Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 184 ENSGT00940000161554.a ENSGT00390000015492.A.e.a ENSGT00940000153298.i.a.k #22 ENSGT01100000263524.B.a.a.h ENSGT00510000046803.b.a.a.b ##23 ENSGT00940000159540.d.e.a #14 ENSGT00940000161250.a #13 ENSGT01050000245031.a ENSGT00390000012976.cb.b ENSGT00390000012976.bb ENSGT00940000165838.b ENSGT00940000158808.db ENSGT01030000234586.B.a.b.d ENSGT00940000159286.a.b.d.a.a ENSGT00390000005708 ENSGT00390000007287 ENSGT00940000156475.e ENSGT00940000158500.h Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00940000161554.a ENSGT00390000015492.A.e.a ENSGT00940000153298.i.a.k #22 ENSGT01100000263524.B.a.a.h ENSGT00510000046803.b.a.a.b ##23 ENSGT00940000159540.d.e.a #14 ENSGT00940000161250.a #13 ENSGT01050000245031.a ENSGT00390000012976.cb.b ENSGT00390000012976.bb ENSGT00940000165838.b ENSGT00940000158808.db ENSGT01030000234586.B.a.b.d ENSGT00940000159286.a.b.d.a.a ENSGT00390000005708 ENSGT00390000007287 ENSGT00940000156475.e ENSGT00940000158500.h Common carp reference MODERN SPECIES 2 ENSCCRG00000065601 ENSCCRG00000070058 ENSCCRG00000004317 ENSCCRG00000004286 ccdc106a (ENSCCRG00000004290) m6pr (ENSCCRG00000055112) casp2 (ENSCCRG00000004051) ENSCCRG00000003542 FAM131B (ENSCCRG00000003503) ENSCCRG00000072147 ENSCCRG00000004410 emg1 (ENSCCRG00000064393) ENSCCRG00000075090 nop2 (ENSCCRG00000081383) nppcl (ENSCCRG00000004477) gapdh (ENSCCRG00000006135) #22 opn9 (ENSCCRG00000080639) ENSCCRG00000006119 ##23 tnfrsf1a (ENSCCRG00000055767) #14 ENSCCRG00000022070 ENSCCRG00000022062 #13 rpl18 (ENSCCRG00000021874) ENSCCRG00000006196 ENSCCRG00000058399 ENSCCRG00000062476 ENSCCRG00000028782 STK31 (ENSCCRG00000028789) NPY (ENSCCRG00000058074) pals2a (ENSCCRG00000081363) OSBPL3 (ENSCCRG00000030504) ENSCCRG00000012400 Golden-line barbel MODERN SPECIES 407 nppcl (ENSSGRG00000054796) gapdh (ENSSGRG00000054819) #22 IFFO1 (ENSSGRG00000054965) ##23 tnfrsf1a (ENSSGRG00000054968) #14 ENSSGRG00000054970 RPL18 (ENSSGRG00000054971) si:ch211-120k19.1 (ENSSGRG00000054972) ENSSGRG00000054974 ENSSGRG00000054975 ENSSGRG00000054978 snapc3 (ENSSGRG00000054979) ENSSGRG00000054980 NPY (ENSSGRG00000054981) pals2a (ENSSGRG00000054982) OSBPL3 (ENSSGRG00000054994) ENSSGRG00000055011 cbx3b (ENSSGRG00000055012) Goldfish MODERN SPECIES 35 ENSCARG00000025926 TMEM238 (ENSCARG00000025954) ccdc106a (ENSCARG00000025965) ENSCARG00000025991 m6pr (ENSCARG00000026036) casp2 (ENSCARG00000026057) CLCN1 (ENSCARG00000026125) FAM131B (ENSCARG00000026569) zyx (ENSCARG00000026589) ENSCARG00000026608 emg1 (ENSCARG00000026628) gtf3c6 (ENSCARG00000026634) nop2 (ENSCARG00000026645) nppcl (ENSCARG00000026742) ENSCARG00000026752 gapdh (ENSCARG00000026847) #22 IFFO1 (ENSCARG00000028889) ##23 tnfrsf1a (ENSCARG00000028933) #14 ENSCARG00000028957 #13 ENSCARG00000028988 rpl18 (ENSCARG00000029007) ENSCARG00000029058 ENSCARG00000029086 snapc3 (ENSCARG00000029093) STK31 (ENSCARG00000029133) NPY (ENSCARG00000029165) pals2a (ENSCARG00000029207) gsdmeb (ENSCARG00000029680) OSBPL3 (ENSCARG00000029868) ENSCARG00000036597 cbx3b (ENSCARG00000036637) Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 106 ENSGT01030000234571.b.b.b.a.a.g.a ENSGT00390000002109.a ENSGT00940000156657.a ENSGT00940000157383.g.b.b ENSGT00950000183106.a.b.b.g ENSGT00940000154273.a.h ENSGT00940000156745.b.a ENSGT00390000000305 ENSGT00390000000510 ENSGT00940000161554.b ENSGT00390000015492.A.e.b ENSGT00940000153298.i.a.l #22 ENSGT01100000263524.B.a.a.g ENSGT00510000046803.b.a.a.a ##23 ENSGT00940000159540.d.e.b #14 ENSGT00940000161250.b #13 ENSGT01050000245031.b ENSGT00390000012976.cb.a ENSGT00940000165838.a ENSGT00940000158808.eb ENSGT01030000234586.B.a.b.c ENSGT00940000159286.a.b.d.a.b ENSGT00940000158500.g ENSGT00940000155880.e.c ENSGT00940000155957.a.a ENSGT00940000165630.c ENSGT00940000166701.b Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000153496.b.h ENSGT00940000162720.b.b.a ENSGT00390000013183.d.b.a.l ENSGT01030000234571.b.b.b.a.a.g.a ENSGT00390000002109.a ENSGT00940000156657.a ENSGT00940000157383.g.b.b ENSGT00950000183106.a.b.b.g ENSGT00940000168198.a ENSGT00940000156745.b.a ENSGT00390000000305.b ENSGT00940000156745.b.b ENSGT00390000000305.a ENSGT00390000000510 ENSGT00940000161554.b ENSGT00940000153298.i.a.l #22 ENSGT01100000263524.B.a.a.g ENSGT00510000046803.b.a.a.a ##23 ENSGT00940000159540.d.e.b #14 ENSGT00940000161250.b #13 ENSGT01050000245031.b ENSGT00390000012976.cb.a ENSGT00940000165838.a ENSGT00940000158808.eb ENSGT01030000234586.B.a.b.c ENSGT00940000159286.a.b.d.a.b ENSGT00940000158500.g ENSGT00940000155880.e.c ENSGT00940000155957.a.a ENSGT00940000165630.c ENSGT00940000166701.b Golden-line barbel MODERN SPECIES 221 zgc:174935 (ENSSGRG00000032606) ENSSGRG00000032603 ccdc106a (ENSSGRG00000032593) m6pr (ENSSGRG00000032587) ENSSGRG00000032586 casp2 (ENSSGRG00000032582) ENSSGRG00000032578 CLCN1 (ENSSGRG00000032576) FAM131B (ENSSGRG00000032575) zyx (ENSSGRG00000032573) emg1 (ENSSGRG00000032572) emg1 (ENSSGRG00000032570) gtf3c6 (ENSSGRG00000032569) nop2 (ENSSGRG00000032567) nppcl (ENSSGRG00000032566) gapdh (ENSSGRG00000029912) #22 opn9 (ENSSGRG00000029836) IFFO1 (ENSSGRG00000029835) ##23 tnfrsf1a (ENSSGRG00000029832) #14 rpl18 (ENSSGRG00000029807) si:ch211-120k19.1 (ENSSGRG00000029804) ENSSGRG00000022083 ENSSGRG00000021931 ENSSGRG00000021929 pals2a (ENSSGRG00000021062) gsdmeb (ENSSGRG00000021043) OSBPL3 (ENSSGRG00000020394) ENSSGRG00000020392 ENSSGRG00000020390 cbx3b (ENSSGRG00000020389) snx10b (ENSSGRG00000020388) Goldfish MODERN SPECIES 7 zgc:174935 (ENSCARG00000019710) ENSCARG00000019716 ENSCARG00000019731 TMEM238 (ENSCARG00000019750) ccdc106a (ENSCARG00000019759) ENSCARG00000019775 m6pr (ENSCARG00000019780) casp2 (ENSCARG00000019787) CLCN1 (ENSCARG00000019833) FAM131B (ENSCARG00000020592) zyx (ENSCARG00000020612) emg1 (ENSCARG00000020632) gtf3c6 (ENSCARG00000020639) nop2 (ENSCARG00000020653) nppcl (ENSCARG00000020925) gapdh (ENSCARG00000020960) #22 opn9 (ENSCARG00000021241) IFFO1 (ENSCARG00000021251) ##23 tnfrsf1a (ENSCARG00000021258) #14 ENSCARG00000021275 rpl18 (ENSCARG00000021291) si:ch211-120k19.1 (ENSCARG00000021330) ENSCARG00000002025 ENSCARG00000002281 ENSCARG00000002284 pals2a (ENSCARG00000002327) gsdmeb (ENSCARG00000002448) OSBPL3 (ENSCARG00000002717) ENSCARG00000007463 cbx3b (ENSCARG00000007689) snx10b (ENSCARG00000007694) Zebrafish MODERN SPECIES 7 them4 (ENSDARG00000061621) si:dkey-87o1.2 (ENSDARG00000095796) zgc:174935 (ENSDARG00000079255) ENSDARG00000079530 ccdc106a (ENSDARG00000004211) m6pr (ENSDARG00000018432) casp2 (ENSDARG00000062052) CLCN1 (ENSDARG00000012269) FAM131B (ENSDARG00000070575) zyx (ENSDARG00000075733) ENSDARG00000076950 emg1 (ENSDARG00000056914) gtf3c6 (ENSDARG00000043301) nop2 (ENSDARG00000043304) nppcl (ENSDARG00000043460) gapdh (ENSDARG00000043457) #22 opn9 (ENSDARG00000104231) IFFO1 (ENSDARG00000062108) ##23 ENSDARG00000094366 ENSDARG00000105423 tnfrsf1a (ENSDARG00000018569) #14 ENSDARG00000086056 #13 rpl18 (ENSDARG00000029533) si:ch211-120k19.1 (ENSDARG00000075517) ENSDARG00000073732 ENSDARG00000075914 ENSDARG00000040816 c4b (ENSDARG00000038424) ENSDARG00000001760 ENSDARG00000037550 ENSDARG00000053431 Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 190 ENSGT00940000165997.b ENSGT00940000157871.h.a ENSGT00440000033697.eb ENSGT00440000033697.db.b ENSGT00940000166290 ENSGT00940000156657 ENSGT00940000157383.g.b ENSGT00950000183106.a.b.b ENSGT00940000154273.a ENSGT00940000156745.b ENSGT00390000000305 ENSGT00390000000510 ENSGT00940000161554 ENSGT00940000153566.a #21 ENSGT00390000015492.A ENSGT00940000153298.i.a #22 ENSGT01100000263524.B.a.a.f Atlantic herring MODERN SPECIES 2 m6pr (ENSCHAG00000020879) phc1 (ENSCHAG00000020884) styk1b (ENSCHAG00000020899) ENSCHAG00000020967 ENSCHAG00000021030 casp2 (ENSCHAG00000021054) CLCN1 (ENSCHAG00000021193) FAM131B (ENSCHAG00000021753) zyx (ENSCHAG00000021777) ENSCHAG00000021783 emg1 (ENSCHAG00000021790) gtf3c6 (ENSCHAG00000021812) nop2 (ENSCHAG00000021833) ncapd2 (ENSCHAG00000021974) #21 nppcl (ENSCHAG00000002336) gapdh (ENSCHAG00000002631) #22 opn9 (ENSCHAG00000006887) ENSCHAG00000006939 ENSCHAG00000006974 ENSCHAG00000007000 ENSCHAG00000007011 ethe1 (ENSCHAG00000007032) ENSCHAG00000007058 drd2l (ENSCHAG00000007117) ENSCHAG00000007168 xrcc1 (ENSCHAG00000007179) ENSCHAG00000007300 ENSCHAG00000007312 ENSCHAG00000007336 ENSCHAG00000007350 lim2.5 (ENSCHAG00000007372) Denticle herring MODERN SPECIES 14 GSTK1 (ENSDCDG00000021800) MYLK (ENSDCDG00000021733) ENSDCDG00000019672 arl6ip6 (ENSDCDG00000019579) KCNJ3 (ENSDCDG00000019577) ino80db (ENSDCDG00000019570) ndufs1 (ENSDCDG00000019539) eef1b2 (ENSDCDG00000019503) ADAM23 (ENSDCDG00000019044) nbn (ENSDCDG00000018983) OSGIN2 (ENSDCDG00000018976) ENSDCDG00000018970 gtpbp10 (ENSDCDG00000018342) ncapd2 (ENSDCDG00000017694) #21 nppcl (ENSDCDG00000017623) gapdh (ENSDCDG00000017435) #22 ENSDCDG00000017394 styk1b (ENSDCDG00000017385) phc1 (ENSDCDG00000017378) m6pr (ENSDCDG00000017372) psmd4b (ENSDCDG00000017334) pip5k1ab (ENSDCDG00000017214) ENSDCDG00000017203 ENSDCDG00000017193 ENSDCDG00000015076 ENSDCDG00000015012 ENSDCDG00000015008 KCNN3 (ENSDCDG00000014941) adar (ENSDCDG00000014830) ENSDCDG00000014816 ENSDCDG00000014810 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.i.b #22 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 52 ENSGT00390000009359.a.a ENSGT00940000160411.j ENSGT01050000244814.b.a ENSGT00940000159441.j ENSGT00940000162720.b.b.b ENSGT00390000013183.d.b.b ENSGT01050000244961.b.h ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b ENSGT00390000007786.b.h ENSGT01060000248591.b.a ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.b.b.b ENSGT00940000160313 ENSGT00940000167696 ENSGT00940000157383.g.a ENSGT00950000183106.a.b.a ENSGT00940000153298.i.b #22 ENSGT00510000046803.b.a.b ##23 ENSGT00940000164382.b.a ENSGT00940000155088.b.a.a #25 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.b ENSGT00950000182805.a.a.b.a.c.b ENSGT00390000013354.b.b ENSGT01000000214413.b.a.b.a.b ENSGT00520000055635.c.b.a ENSGT00940000157292.fc.a ENSGT00940000160115.a.b ENSGT00940000165134.a.a ENSGT00940000165364.a.b ENSGT00390000015391 ENSGT00390000005284.a ENSGT00940000154370.c.a Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000014743.i ENSGT00940000162254.a ENSGT00530000064557.a.g ENSGT00940000165399.a.a.h ENSGT00940000159109.b ENSGT01050000244961.b.h ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b ENSGT00390000007786.b.h ENSGT01060000248591.b.a ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.b.b.b ENSGT00940000160313 ENSGT00940000167696 ENSGT00940000157383.g.a ENSGT00950000183106.a.b.a ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000153298.i.b #22 ENSGT00510000046803.b.a.b ##23 ENSGT00940000164382.b.a Otophysi ANCESTRAL SPECIES 64 ENSGT00390000014743.i ENSGT00940000162254.a ENSGT00530000064557.a.g ENSGT00940000165399.a.a.h ENSGT00940000159109.b ENSGT01050000244961.b.h ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b ENSGT00390000007786.b.h ENSGT01060000248591.b.a ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.b.b.b ENSGT00940000160313 ENSGT00940000167696 ENSGT00940000157383.g.a ENSGT00950000183106.a.b.a ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000153298.i.b #22 ENSGT00510000046803.b.a.b ##23 ENSGT00940000164382.b.a ENSGT01010000223632 ENSGT01030000235274 ENSGT00940000163756.c.a ENSGT00390000010641.i.b ENSGT00940000154743.A.a.b ENSGT01060000248708.b ENSGT00940000154947.k ENSGT00940000157471.b ENSGT00440000034367 ENSGT00940000156698.c ENSGT00940000157203.d ENSGT00940000160917 ENSGT00940000157619.a.b Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 75 ENSGT00940000165399.a.a.h ENSGT00530000064557.a.g ENSGT00940000162254.a ENSGT00390000014743.i ENSGT00940000155556.d ENSGT00390000013183.d.b.b ENSGT00940000162720.b.b.b ENSGT00940000159441.j ENSGT01050000244814.b.a ENSGT00940000160411.j ENSGT00390000009359.a.a ENSGT00940000167696 ENSGT00940000157383.g.a ENSGT00950000183106.a.b.a ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000153298.i.b #22 ENSGT00510000046803.b.a.b ##23 ENSGT00940000164382.b.a ENSGT01010000223632 ENSGT01030000235274 ENSGT00940000163756.c.a ENSGT00390000010641.i.b ENSGT00940000154743.A.a.b ENSGT01060000248708.b ENSGT00940000154947.k ENSGT00940000157471.b ENSGT00440000034367 ENSGT00940000156698.c ENSGT00940000157203.d ENSGT00940000160917 ENSGT00940000157619.a.b Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 61 ENSGT00940000165399.a.a.h ENSGT00530000064557.a.g ENSGT00940000162254.a ENSGT00390000014743.i ENSGT00940000155556.d ENSGT00390000013183.d.b.b ENSGT00940000162720.b.b.b ENSGT00940000159441.j ENSGT01050000244814.b.a ENSGT00940000160411.j ENSGT00390000009359.a.a ENSGT00940000167696 ENSGT00940000157383.g.a ENSGT00950000183106.a.b.a ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000153298.i.b #22 ENSGT00510000046803.b.a.b ##23 ENSGT00940000164382.b.a ENSGT01010000223632 ENSGT01030000235274 ENSGT00940000163756.c.a ENSGT00390000010641.i.b ENSGT00940000154743.A.a.b ENSGT01060000248708.b ENSGT00940000154947.k ENSGT00940000157471.b ENSGT00440000034367 ENSGT00940000156698.c ENSGT00940000157203.d ENSGT00940000160917 ENSGT00940000157619.a.b Characoidei ANCESTRAL SPECIES 183 ENSGT00940000165399.a.a.h ENSGT00530000064557.a.g ENSGT00940000162254.a ENSGT00390000014743.i ENSGT00940000155556.d ENSGT00390000013183.d.b.b ENSGT00940000162720.b.b.b ENSGT00940000159441.j ENSGT01050000244814.b.a ENSGT00940000160411.j ENSGT00390000009359.a.a ENSGT00940000167696 ENSGT00940000157383.g.a ENSGT00950000183106.a.b.a ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000153298.i.b #22 ENSGT00510000046803.b.a.b ##23 ENSGT00940000164382.b.a ENSGT01010000223632 ENSGT01030000235274.c ENSGT00940000163756.c.a.f Red-bellied piranha MODERN SPECIES 566 GAPDH (ENSPNAG00000002606) #22 ENSPNAG00000002584 ##23 vamp1a (ENSPNAG00000013150) ENSPNAG00000013139 ENSPNAG00000002570 ENSPNAG00000013097 ENSPNAG00000013081 ENSPNAG00000013058 ENSPNAG00000013045 ENSPNAG00000002530 ENSPNAG00000002524 ENSPNAG00000002520 ENSPNAG00000002516 ENSPNAG00000002511 ENSPNAG00000012999 ENSPNAG00000002500 Mexicana tetra MODERN SPECIES 59 olah (ENSAMXG00000033072) tekt2 (ENSAMXG00000035414) ENSAMXG00000024913 si:dkey-211g8.7 (ENSAMXG00000042863) si:dkey-211g8.6 (ENSAMXG00000024912) usf2 (ENSAMXG00000032427) lim2.4 (ENSAMXG00000037053) si:dkey-211g8.1 (ENSAMXG00000033208) ENSAMXG00000029623 epn1b (ENSAMXG00000009556) necap1 (ENSAMXG00000035678) ENSAMXG00000009547 clcn1a (ENSAMXG00000009534) ENSAMXG00000009525 ing4 (ENSAMXG00000035816) #28 GAPDH (ENSAMXG00000042532) #22 IFFO1 (ENSAMXG00000009506) ##23 vamp1a (ENSAMXG00000040959) si:ch211-232m10.6 (ENSAMXG00000042596) rcvrn3 (ENSAMXG00000035674) tmem238a (ENSAMXG00000024911) ccdc106b (ENSAMXG00000038213) u2af2b (ENSAMXG00000039454) cnot3b (ENSAMXG00000009447) ENSAMXG00000037109 znf865 (ENSAMXG00000032106) dbpa (ENSAMXG00000009417) Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 53 ENSGT00940000155556.d ENSGT00390000014743.i ENSGT00940000162254.a ENSGT00530000064557.a.g ENSGT00940000165399.a.a.h ENSGT00940000159109.b ENSGT01050000244961.b.h ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b ENSGT00390000007786.b.h ENSGT01060000248591.b.a ENSGT00940000160313 ENSGT00940000167696 ENSGT00940000157383.g.a ENSGT00950000183106.a.b.a ENSGT00940000159033 #28 ENSGT00940000153298.i.b #22 ENSGT00510000046803.b.a.b ##23 ENSGT00940000164382.b.a ENSGT01020000230438.B.a.a.s ENSGT01050000244814.a.a.b.b.b.a.a.d.b ENSGT00940000160704.a.b ENSGT00990000203527.a.a.a.e.b ENSGT00990000203527.b ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015518 ENSGT00940000155256.d.b.b ENSGT00940000158616 ENSGT00990000204044 ENSGT00730000111056.h ENSGT01050000244883.B.d ENSGT00940000165835.b Atlantic herring MODERN SPECIES 10 ccdc106b (ENSCHAG00000021095) u2af2b (ENSCHAG00000021104) cnot3b (ENSCHAG00000021156) SHISA7 (ENSCHAG00000021279) znf865 (ENSCHAG00000021315) dbpa (ENSCHAG00000021319) ENSCHAG00000021326 cacng7a (ENSCHAG00000021330) cacng6a (ENSCHAG00000021371) ENSCHAG00000021381 slc2a3a (ENSCHAG00000021395) ENSCHAG00000021930 clcn1a (ENSCHAG00000021956) ENSCHAG00000022262 ing4 (ENSCHAG00000022286) #28 GAPDH (ENSCHAG00000022388) #22 IFFO1 (ENSCHAG00000023970) ##23 vamp1a (ENSCHAG00000000544) si:dkey-211g8.1 (ENSCHAG00000000591) lim2.4 (ENSCHAG00000000669) usf2 (ENSCHAG00000000793) si:dkey-211g8.6 (ENSCHAG00000001082) tekt2 (ENSCHAG00000001121) olah (ENSCHAG00000001201) ago3b (ENSCHAG00000001696) slc9a3.2 (ENSCHAG00000009668) lipea (ENSCHAG00000010782) ENSCHAG00000011466 ENSCHAG00000011484 tomm40l (ENSCHAG00000011996) ENSCHAG00000012111 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 72 ENSGT00390000013183.d.b.b ENSGT00940000181026 ENSGT00940000165399.a.a ENSGT00940000159109.b ENSGT01050000244961.b.h ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b ENSGT00390000007786.b.h ENSGT01060000248591.b.a ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.b.b.b ENSGT00940000164148.a.a.d ENSGT00940000160313 ENSGT00940000165997.a ENSGT00940000167696 ENSGT00940000157383.g.a ENSGT00950000183106.a.b.a ENSGT00940000153298.i.b #22 ENSGT00510000046803.b.a.b ##23 ENSGT00940000164382.b.a ENSGT00940000155088.b.a.a #25 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.b ENSGT00950000182805.a.a.b.a.c.b ENSGT00390000013354.b.b ENSGT01000000214413.b.a.b.a.b ENSGT01030000234575.c.a.a.b ENSGT01100000263479.I.b ENSGT00520000055635.c.b.a ENSGT00940000159960.c ENSGT00940000157292.fc.a ENSGT00940000160115.a.b ENSGT00940000165134.a.a ENSGT00940000165364.a.b Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000165399.a.a ENSGT00940000159109.b ENSGT01050000244961.b.h ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b ENSGT00390000007786.b.h ENSGT01060000248591.b.a ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.b.b.b ENSGT00940000164148.a.a.d ENSGT00940000160313 ENSGT00940000165997.a ENSGT00940000156612 ENSGT00940000167696 ENSGT00940000157383.g.a ENSGT00950000183106.a.b.a ENSGT00940000159033.n #28 ENSGT00940000153298.i.b #22 ENSGT00510000046803.b.a.b ##23 ENSGT00940000164382.b.a ENSGT00400000022326.b.a.b.b.a.b ENSGT00940000155088.b.a.a #25 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.b.k ENSGT00950000182805.a.a.b.a.c.b ENSGT00390000013354.b.b ENSGT01000000214413.b.a.b.a.b ENSGT01030000234575.c.a.a.b ENSGT01100000263479.I.b ENSGT00940000158852.d ENSGT00940000161799 ENSGT00520000055635.c.b.a ENSGT00940000159960.c ENSGT00940000157292.fc.a Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 278 ENSGT00530000064557.b ENSGT00940000165399.a.a.e ENSGT00940000159109.b.b ENSGT01050000244961.b.h.c ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b.a ENSGT00390000007786.b.h.a ENSGT01060000248591.b.a.g ENSGT00940000164148.a.a.d ENSGT00940000160313.d ENSGT00940000165997.a.b ENSGT00940000167696.c ENSGT00940000157383.g.a.a.a ENSGT00950000183106.a.b.a.c ENSGT01100000263568.b.a.c.a.g.b ENSGT00940000159033.n.b #28 ENSGT00940000153298.i.b.a #22 ENSGT00940000153298.i.b.b.b #22 ENSGT00510000046803.b.a.b.c ##23 ENSGT00940000164382.b.a.b ENSGT01100000263533.b.a.a.a.b.a.a Salmoninae_a DUPLICATION Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 48 ENSGT00530000064557.b ENSGT00940000165399.a.a.e ENSGT00940000159109.b.b ENSGT01050000244961.b.h.c ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b.a ENSGT00390000007786.b.h.a ENSGT01060000248591.b.a.g ENSGT00940000164148.a.a.d.a.a ENSGT00940000160313.d ENSGT00940000165997.a.b ENSGT00940000167696.c ENSGT00940000157383.g.a.a.a ENSGT00950000183106.a.b.a.c ENSGT01100000263568.b.a.c.a.g.b ENSGT00940000159033.n.b #28 ENSGT00940000153298.i.b.a.a #22 ENSGT00940000153298.i.b.b.a.b #22 ENSGT00510000046803.b.a.b.c ##23 ENSGT00940000164382.b.a.b ENSGT01100000263533.b.a.a.a.b.a.a ENSGT01050000246012.a ENSGT00400000022326.b.a.b.b.a.b.b ENSGT00940000155088.b.a.a.e.b #25 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.b.k.b ENSGT00950000182805.a.a.b.a.c.b.d ENSGT00390000013354.b.b.d ENSGT01000000214413.b.a.b.a.b.b ENSGT01030000234575.c.a.a.b.f ENSGT01100000263479.I.b.d ENSGT00940000158852.d.b.a ENSGT00940000161799 Salmo ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000181026.a ENSGT00940000165399.a.a.e ENSGT00940000159109.b.b ENSGT01050000244961.b.h.c ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b.a ENSGT00390000007786.b.h.a ENSGT01060000248591.b.a.g ENSGT00940000164148.a.a.d.a.a ENSGT00940000160313.d ENSGT00940000165997.a.b ENSGT00940000167696.c ENSGT00940000157383.g.a.a.a ENSGT00950000183106.a.b.a.c ENSGT01100000263568.b.a.c.a.g.b ENSGT00940000159033.n.b #28 ENSGT00940000153298.i.b.a.a #22 ENSGT00940000153298.i.b.b.a.b #22 ENSGT00510000046803.b.a.b.c ##23 ENSGT00940000164382.b.a.b ENSGT01100000263533.b.a.a.a.b.a.a ENSGT00940000155088.b.a.a.e.b #25 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.b.k.b ENSGT00950000182805.a.a.b.a.c.b.d ENSGT00390000013354.b.b.d ENSGT01000000214413.b.a.b.a.b.b ENSGT01030000234575.c.a.a.b.f ENSGT01100000263479.I.b.d ENSGT00940000158852.d.b.a ENSGT00940000166708.r ENSGT01100000263568.b.a.c.b.a.a.b.b.a ENSGT00520000055635.c.b.a.a River trout MODERN SPECIES 29 ENSSTUG00000029244 dbpa (ENSSTUG00000029234) ENSSTUG00000029221 cacng7a (ENSSTUG00000029215) cacng8a (ENSSTUG00000029209) cacng6a (ENSSTUG00000029203) cox6b2 (ENSSTUG00000029180) slc2a3a (ENSSTUG00000029101) ENSSTUG00000029065 ENSSTUG00000029048 clcn1a (ENSSTUG00000028484) ENSSTUG00000028449 ENSSTUG00000028437 ing4 (ENSSTUG00000028383) #28 ENSSTUG00000028374 #22 GAPDH (ENSSTUG00000028027) #22 IFFO1 (ENSSTUG00000027984) ##23 vamp1a (ENSSTUG00000027961) ENSSTUG00000027952 ENSSTUG00000027940 ENSSTUG00000027936 chd4a (ENSSTUG00000024836) #25 ENSSTUG00000024695 eno2 (ENSSTUG00000024605) tpi1a (ENSSTUG00000024575) gnb3b (ENSSTUG00000024538) zgc:174904 (ENSSTUG00000024517) ENSSTUG00000024500 GRIK5 (ENSSTUG00000024354) ENSSTUG00000024283 ENSSTUG00000024271 Atlantic salmon MODERN SPECIES 5 ENSSSAG00000054932 ENSSSAG00000104376 cacng7a (ENSSSAG00000102787) ENSSSAG00000095720 cacng8a (ENSSSAG00000067858) cacng6a (ENSSSAG00000067866) ENSSSAG00000067869 ENSSSAG00000067873 slc2a3a (ENSSSAG00000067915) ENSSSAG00000069229 ENSSSAG00000069235 clcn1a (ENSSSAG00000069350) ENSSSAG00000073626 ENSSSAG00000082474 ing4 (ENSSSAG00000073628) #28 ENSSSAG00000073639 #22 ENSSSAG00000073832 #22 ENSSSAG00000073838 ##23 vamp1a (ENSSSAG00000073860) ENSSSAG00000073862 chd4a (ENSSSAG00000073889) #25 CDC42 (ENSSSAG00000113384) enog (ENSSSAG00000074139) tpi1a (ENSSSAG00000074195) gnb3b (ENSSSAG00000074198) ENSSSAG00000074205 ENSSSAG00000086881 ENSSSAG00000074232 ENSSSAG00000074408 ENSSSAG00000108670 gsk3aa (ENSSSAG00000074433) Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 40 ENSGT00530000064557.b ENSGT00940000165399.a.a.e ENSGT00940000159109.b.b ENSGT01050000244961.b.h.c ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b.a ENSGT00390000007786.b.h.a ENSGT01060000248591.b.a.g ENSGT00940000164148.a.a.d.a.a ENSGT00940000160313.d ENSGT00940000165997.a.b ENSGT00940000167696.c ENSGT00940000157383.g.a.a.a ENSGT00950000183106.a.b.a.c ENSGT01100000263568.b.a.c.a.g.b ENSGT00940000159033.n.b #28 ENSGT00940000153298.i.b.a.a #22 ENSGT00940000153298.i.b.b.b #22 ENSGT00510000046803.b.a.b.c ##23 ENSGT00940000164382.b.a.b ENSGT01100000263533.b.a.a.a.b.a.a ENSGT01050000246012.a ENSGT00400000022326.b.a.b.b.a.b.b ENSGT00940000155088.b.a.a.e.b #25 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.b.k.b ENSGT00950000182805.a.a.b.a.c.b.d ENSGT00390000013354.b.b.d ENSGT01000000214413.b.a.b.a.b.b ENSGT01030000234575.c.a.a.b.f ENSGT01100000263479.I.b.d ENSGT00940000158852.d.b.a ENSGT00940000166708.p Rainbow trout MODERN SPECIES 24 cnot3b (ENSOMYG00000021877) ENSOMYG00000021805 dbpa (ENSOMYG00000042298) cacng7a (ENSOMYG00000042278) cacng8a (ENSOMYG00000061259) cacng6a (ENSOMYG00000042272) ENSOMYG00000055241 ENSOMYG00000042267 slc2a3a (ENSOMYG00000042172) ENSOMYG00000042110 ENSOMYG00000042137 clcn1a (ENSOMYG00000042038) ENSOMYG00000042009 ENSOMYG00000042001 ing4 (ENSOMYG00000041991) #28 ENSOMYG00000039944 #22 ENSOMYG00000039216 ##23 vamp1a (ENSOMYG00000052501) ENSOMYG00000039188 ENSOMYG00000052949 ENSOMYG00000023806 chd4a (ENSOMYG00000028964) #25 ENSOMYG00000046676 eno2 (ENSOMYG00000026831) tpi1a (ENSOMYG00000026581) gnb3b (ENSOMYG00000052956) zgc:174904 (ENSOMYG00000026548) ENSOMYG00000026537 ENSOMYG00000026360 ENSOMYG00000026250 ENSOMYG00000026227 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000165399.a.a.f ENSGT00940000159109.b.a ENSGT01050000244961.b.h.d ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b.b ENSGT00390000007786.b.h.b ENSGT01060000248591.b.a.h ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.b.b.b ENSGT01000000221559 ENSGT00940000164148.a.a.d.a.b ENSGT00940000160313.c ENSGT00940000165997.a.a ENSGT00940000167696.d ENSGT00940000157383.g.a.a.b ENSGT00950000183106.a.b.a.d ENSGT00940000159033.n.a #28 ENSGT00940000153298.i.b.a.b #22 ENSGT00940000153298.i.b.b.a.a #22 ENSGT00510000046803.b.a.b.d ##23 ENSGT00940000164382.b.a.a ENSGT00400000022326.b.a.b.b.a.b.a ENSGT01100000263533.b.a.a.a.b.a.b ENSGT00940000155088.b.a.a.e.a #25 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.b.k.a ENSGT00950000182805.a.a.b.a.c.b.c ENSGT00390000013354.b.b.c ENSGT01000000214413.b.a.b.a.b.a ENSGT01030000234575.c.a.a.b.e ENSGT01100000263479.I.b.c ENSGT00940000158852.d.b.b ENSGT01100000263568.b.a.c.b.a.a.b.a.d.b ENSGT00520000055635.c.b.a.b Salmo ANCESTRAL SPECIES 40 ENSGT00940000159109.b.a ENSGT01050000244961.b.h.d ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b.b ENSGT00390000007786.b.h.b ENSGT01060000248591.b.a.h ENSGT00940000182004 ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.b.b.b ENSGT00940000164148.a.a.d.a.b ENSGT00940000160313.c ENSGT00940000165997.a.a ENSGT00940000167696.d ENSGT00940000157383.g.a.a.b ENSGT00950000183106.a.b.a.d ENSGT01100000263568.b.a.c.a.g.a.b ENSGT00940000159033.n.a #28 ENSGT00940000153298.i.b.a.b #22 ENSGT00940000153298.i.b.b.a.a #22 ENSGT00510000046803.b.a.b.d ##23 ENSGT00940000164382.b.a.a ENSGT00400000022326.b.a.b.b.a.b.a ENSGT01050000246012.b ENSGT01100000263533.b.a.a.a.b.a.b ENSGT00940000155088.b.a.a.e.a #25 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.b.k.a ENSGT00950000182805.a.a.b.a.c.b.c ENSGT00390000013354.b.b.c ENSGT01000000214413.b.a.b.a.b.a ENSGT01030000234575.c.a.a.b.e ENSGT01100000263479.I.b.c ENSGT00940000158852.d.b.b ENSGT01100000263568.b.a.c.b.a.a.b.a.d.b Atlantic salmon MODERN SPECIES 19 dbpa (ENSSSAG00000100996) ENSSSAG00000092390 ENSSSAG00000067393 cacng7a (ENSSSAG00000110495) cacng8a (ENSSSAG00000096806) cacng6a (ENSSSAG00000120673) ENSSSAG00000055239 ENSSSAG00000082226 ENSSSAG00000055251 ENSSSAG00000057675 ENSSSAG00000057687 clcn1a (ENSSSAG00000057862) ENSSSAG00000067474 ENSSSAG00000116941 ing4 (ENSSSAG00000118702) #28 ENSSSAG00000067521 #22 ENSSSAG00000067995 #22 ENSSSAG00000068561 ##23 ENSSSAG00000119761 vamp1a (ENSSSAG00000104713) chd4a (ENSSSAG00000068761) #25 ENSSSAG00000074128 eno2 (ENSSSAG00000070432) tpi1a (ENSSSAG00000070498) gnb3b (ENSSSAG00000070506) zgc:174904 (ENSSSAG00000070511) ENSSSAG00000070515 ENSSSAG00000070559 ENSSSAG00000070636 gsk3aa (ENSSSAG00000003471) ENSSSAG00000071083 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.i.b.a.b #22 Rainbow trout MODERN SPECIES 9 cacng7a (ENSOMYG00000044498) cacng8a (ENSOMYG00000044502) cacng6a (ENSOMYG00000044504) ENSOMYG00000044508 ENSOMYG00000044515 ENSOMYG00000056300 ENSOMYG00000058223 ENSOMYG00000044523 slc2a3a (ENSOMYG00000044559) ENSOMYG00000044571 ENSOMYG00000044575 clcn1a (ENSOMYG00000044641) ENSOMYG00000045296 ENSOMYG00000055077 ENSOMYG00000045308 ENSOMYG00000045336 #22 ENSOMYG00000045507 #22 ENSOMYG00000045527 ##23 vamp1a (ENSOMYG00000045533) ENSOMYG00000039173 chd4a (ENSOMYG00000045794) #25 ENSOMYG00000064568 eno2 (ENSOMYG00000046693) tpi1a (ENSOMYG00000046714) ENSOMYG00000049501 gnb3b (ENSOMYG00000061604) zgc:174904 (ENSOMYG00000046729) ENSOMYG00000046737 ENSOMYG00000046758 ENSOMYG00000046766 ENSOMYG00000046782 Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 217 ENSGT00940000181026.b.a ENSGT00940000165399.a.a.f ENSGT00940000159109.b.a ENSGT01050000244961.b.h.d ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b.b ENSGT00390000007786.b.h.b ENSGT01060000248591.b.a.h ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.b.b.b ENSGT01000000221559 ENSGT00940000160313.c ENSGT00940000165997.a.a ENSGT00940000167696.d ENSGT00940000157383.g.a.a.b ENSGT00950000183106.a.b.a.d ENSGT00940000159033.n.a #28 ENSGT00940000153298.i.b.b.a #22 ENSGT00510000046803.b.a.b.d ##23 ENSGT00940000164382.b.a.a ENSGT00400000022326.b.a.b.b.a.b.a ENSGT01050000246012 ENSGT00400000022326.b.a.b.b.a.b.b ENSGT00940000155088.b.a.a.e.b #25 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.b.k.b ENSGT00950000182805.a.a.b.a.c.b.d ENSGT00390000013354.b.b.d ENSGT01000000214413.b.a.b.a.b.b ENSGT00980000202540 ENSGT01100000263479.I.b.d ENSGT00940000158852.d.b.a ENSGT00940000161799 Salmoninae_a DUPLICATION Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000159109.b.a ENSGT01050000244961.b.h.d ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b.b ENSGT00390000007786.b.h.b ENSGT01060000248591.b.a.h ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.b.b.b ENSGT01000000221559 ENSGT00940000164148.a.a.d.a.b ENSGT00940000160313.c ENSGT00940000165997.a.a ENSGT00940000167696.d ENSGT00940000157383.g.a.a.b ENSGT00950000183106.a.b.a.d ENSGT00940000159033.n.a #28 ENSGT00940000153298.i.b.a.b #22 ENSGT00940000153298.i.b.b.a.a #22 ENSGT00510000046803.b.a.b.d ##23 ENSGT00940000164382.b.a.a ENSGT00400000022326.b.a.b.b.a.b.a ENSGT01100000263533.b.a.a.a.b.a.b ENSGT00940000155088.b.a.a.e.a #25 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.b.k.a ENSGT00950000182805.a.a.b.a.c.b.c ENSGT00390000013354.b.b.c ENSGT01000000214413.b.a.b.a.b.a ENSGT01030000234575.c.a.a.b.e ENSGT01100000263479.I.b.c ENSGT00940000158852.d.b.b ENSGT01100000263568.b.a.c.b.a.a.b.a.d.b ENSGT00520000055635.c.b.a.b ENSGT00940000159960.c.e Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000181026.b.a ENSGT00940000165399.a.a.f ENSGT00940000159109.b.a ENSGT01050000244961.b.h.d ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b.b ENSGT00390000007786.b.h.b ENSGT01060000248591.b.a.h ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.b.b.b ENSGT01000000221559 ENSGT00940000164148.a.a.d.a.b ENSGT00940000160313.c ENSGT00940000165997.a.a ENSGT00940000167696.d ENSGT00940000157383.g.a.a.b ENSGT00950000183106.a.b.a.d ENSGT00940000153298.i.b.b.a.a #22 ENSGT00510000046803.b.a.b.d ##23 ENSGT00940000164382.b.a.a ENSGT00400000022326.b.a.b.b.a.b.a ENSGT01100000263533.b.a.a.a.b.a.b ENSGT00940000155088.b.a.a.e.a #25 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.b.k.a ENSGT00950000182805.a.a.b.a.c.b.c ENSGT00390000013354.b.b.c ENSGT01000000214413.b.a.b.a.b.a ENSGT01030000234575.c.a.a.b.e ENSGT01100000263479.I.b.c ENSGT00940000158852.d.b.b ENSGT01100000263568.b.a.c.b.a.a.b.a.d.b.a ENSGT01100000263568.b.a.c.b.a.a.b.a.d.b.b ENSGT00520000055635.c.b.a.b Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000162254.a.d ENSGT00940000181026.b.a ENSGT00940000165399.a.a.f ENSGT00940000159109.b.a ENSGT01050000244961.b.h.d ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b.b ENSGT00390000007786.b.h.b ENSGT01060000248591.b.a.h ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.b.b.b ENSGT00940000164148.a.a.d.a.b ENSGT00940000160313.c ENSGT00940000165997.a.a ENSGT00940000167696.d ENSGT00940000157383.g.a.a.b ENSGT00950000183106.a.b.a.d ENSGT00940000153298.i.b.b.a.a #22 ENSGT00510000046803.b.a.b.d ##23 ENSGT00940000164382.b.a.a ENSGT00940000155088.b.a.a.e.a #25 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.b.k.a ENSGT00950000182805.a.a.b.a.c.b.c ENSGT00390000013354.b.b.c ENSGT01000000214413.b.a.b.a.b.a ENSGT00530000065251.n.a.b ENSGT01030000234575.c.a.a.b.e ENSGT01100000263479.I.b.c ENSGT00940000158852.d.b.b ENSGT01100000263568.b.a.c.b.a.a.b.a.d.b.a ENSGT01100000263568.b.a.c.b.a.a.b.a.d.b.b ENSGT00520000055635.c.b.a.b ENSGT00940000159960.c.e Coho salmon MODERN SPECIES 8 ENSOKIG00005040321 ENSOKIG00005040298 dbpa (ENSOKIG00005040290) ENSOKIG00005040210 cacng7a (ENSOKIG00005040196) cacng8a (ENSOKIG00005040182) cacng6a (ENSOKIG00005040166) ENSOKIG00005040153 ENSOKIG00005040144 ENSOKIG00005040101 slc2a3a (ENSOKIG00005040035) ENSOKIG00005039998 ENSOKIG00005039967 clcn1a (ENSOKIG00005039250) ENSOKIG00005039102 GAPDH (ENSOKIG00005038795) #22 IFFO1 (ENSOKIG00005038746) ##23 vamp1a (ENSOKIG00005038728) ENSOKIG00005038713 ENSOKIG00005038703 chd4a (ENSOKIG00005035509) #25 eno2 (ENSOKIG00005035121) ENSOKIG00005035021 tpi1a (ENSOKIG00005034939) gnb3b (ENSOKIG00005034927) ENSOKIG00005034906 zgc:174904 (ENSOKIG00005034864) ENSOKIG00005034851 GRIK5 (ENSOKIG00005034498) ENSOKIG00005034458 ENSOKIG00005034429 Rainbow trout MODERN SPECIES 9 cacng8a (ENSOMYG00000044502) cacng6a (ENSOMYG00000044504) ENSOMYG00000044508 ENSOMYG00000044515 ENSOMYG00000056300 ENSOMYG00000058223 ENSOMYG00000044523 slc2a3a (ENSOMYG00000044559) ENSOMYG00000044571 ENSOMYG00000044575 clcn1a (ENSOMYG00000044641) ENSOMYG00000045296 ENSOMYG00000055077 ENSOMYG00000045308 ENSOMYG00000045336 #22 ENSOMYG00000045507 #22 ENSOMYG00000045527 ##23 vamp1a (ENSOMYG00000045533) ENSOMYG00000039173 chd4a (ENSOMYG00000045794) #25 ENSOMYG00000064568 eno2 (ENSOMYG00000046693) tpi1a (ENSOMYG00000046714) ENSOMYG00000049501 gnb3b (ENSOMYG00000061604) zgc:174904 (ENSOMYG00000046729) ENSOMYG00000046737 ENSOMYG00000046758 ENSOMYG00000046766 ENSOMYG00000046782 gsk3aa (ENSOMYG00000046825) Salmo ANCESTRAL SPECIES 40 ENSGT01050000244961.b.h.d ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b.b ENSGT00390000007786.b.h.b ENSGT01060000248591.b.a.h ENSGT00940000182004 ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.b.b.b ENSGT00940000164148.a.a.d.a.b ENSGT00940000160313.c ENSGT00940000165997.a.a ENSGT00940000167696.d ENSGT00940000157383.g.a.a.b ENSGT00950000183106.a.b.a.d ENSGT01100000263568.b.a.c.a.g.a.b ENSGT00940000159033.n.a #28 ENSGT00940000153298.i.b.a.b #22 ENSGT00940000153298.i.b.b.a.a #22 ENSGT00510000046803.b.a.b.d ##23 ENSGT00940000164382.b.a.a ENSGT00400000022326.b.a.b.b.a.b.a ENSGT01050000246012.b ENSGT01100000263533.b.a.a.a.b.a.b ENSGT00940000155088.b.a.a.e.a #25 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.b.k.a ENSGT00950000182805.a.a.b.a.c.b.c ENSGT00390000013354.b.b.c ENSGT01000000214413.b.a.b.a.b.a ENSGT01030000234575.c.a.a.b.e ENSGT01100000263479.I.b.c ENSGT00940000158852.d.b.b ENSGT01100000263568.b.a.c.b.a.a.b.a.d.b ENSGT00520000055635.c.b.a.b Atlantic salmon MODERN SPECIES 19 ENSSSAG00000092390 ENSSSAG00000067393 cacng7a (ENSSSAG00000110495) cacng8a (ENSSSAG00000096806) cacng6a (ENSSSAG00000120673) ENSSSAG00000055239 ENSSSAG00000082226 ENSSSAG00000055251 ENSSSAG00000057675 ENSSSAG00000057687 clcn1a (ENSSSAG00000057862) ENSSSAG00000067474 ENSSSAG00000116941 ing4 (ENSSSAG00000118702) #28 ENSSSAG00000067521 #22 ENSSSAG00000067995 #22 ENSSSAG00000068561 ##23 ENSSSAG00000119761 vamp1a (ENSSSAG00000104713) chd4a (ENSSSAG00000068761) #25 ENSSSAG00000074128 eno2 (ENSSSAG00000070432) tpi1a (ENSSSAG00000070498) gnb3b (ENSSSAG00000070506) zgc:174904 (ENSSSAG00000070511) ENSSSAG00000070515 ENSSSAG00000070559 ENSSSAG00000070636 gsk3aa (ENSSSAG00000003471) ENSSSAG00000071083 erf (ENSSSAG00000081836) River trout MODERN SPECIES 27 ENSSTUG00000050736 ENSSTUG00000050740 cacng7a (ENSSTUG00000050742) cacng8a (ENSSTUG00000050743) cacng6a (ENSSTUG00000050747) ENSSTUG00000050749 ENSSTUG00000050751 cox6b2 (ENSSTUG00000050753) slc2a3a (ENSSTUG00000050766) ENSSTUG00000050782 ENSSTUG00000050792 clcn1a (ENSSTUG00000050795) ENSSTUG00000050822 ENSSTUG00000050826 ing4 (ENSSTUG00000050827) #28 GAPDH (ENSSTUG00000050840) #22 IFFO1 (ENSSTUG00000050920) ##23 vamp1a (ENSSTUG00000050925) ENSSTUG00000050926 ENSSTUG00000050927 ENSSTUG00000020529 chd4a (ENSSTUG00000020584) #25 cdc42l (ENSSTUG00000023027) eno2 (ENSSTUG00000023051) tpi1a (ENSSTUG00000023175) gnb3b (ENSSTUG00000023237) zgc:174904 (ENSSTUG00000023258) ENSSTUG00000023296 GRIK5 (ENSSTUG00000023338) ENSSTUG00000024191 gsk3aa (ENSSTUG00000024309) Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 48 ENSGT00940000165399.a.a.e ENSGT00940000159109.b.b ENSGT01050000244961.b.h.c ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b.a ENSGT00390000007786.b.h.a ENSGT01060000248591.b.a.g ENSGT00940000164148.a.a.d.a.a ENSGT00940000160313.d ENSGT00940000165997.a.b ENSGT00940000167696.c ENSGT00940000157383.g.a.a.a ENSGT00950000183106.a.b.a.c ENSGT01100000263568.b.a.c.a.g.b ENSGT00940000159033.n.b #28 ENSGT00940000153298.i.b.a.a #22 ENSGT00940000153298.i.b.b.a.b #22 ENSGT00510000046803.b.a.b.c ##23 ENSGT00940000164382.b.a.b ENSGT01100000263533.b.a.a.a.b.a.a ENSGT01050000246012.a ENSGT00400000022326.b.a.b.b.a.b.b ENSGT00940000155088.b.a.a.e.b #25 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.b.k.b ENSGT00950000182805.a.a.b.a.c.b.d ENSGT00390000013354.b.b.d ENSGT01000000214413.b.a.b.a.b.b ENSGT01030000234575.c.a.a.b.f ENSGT01100000263479.I.b.d ENSGT00940000158852.d.b.a ENSGT00940000161799 ENSGT01100000263568.b.a.c.b.a.a.b.b.a Salmo ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000165399.a.a.e ENSGT00940000159109.b.b ENSGT01050000244961.b.h.c ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b.a ENSGT00390000007786.b.h.a ENSGT01060000248591.b.a.g ENSGT00940000164148.a.a.d.a.a ENSGT00940000160313.d ENSGT00940000165997.a.b ENSGT00940000167696.c ENSGT00940000157383.g.a.a.a ENSGT00950000183106.a.b.a.c ENSGT01100000263568.b.a.c.a.g.b ENSGT00940000159033.n.b #28 ENSGT00940000153298.i.b.a.a #22 ENSGT00940000153298.i.b.b.a.b #22 ENSGT00510000046803.b.a.b.c ##23 ENSGT00940000164382.b.a.b ENSGT01100000263533.b.a.a.a.b.a.a ENSGT00940000155088.b.a.a.e.b #25 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.b.k.b ENSGT00950000182805.a.a.b.a.c.b.d ENSGT00390000013354.b.b.d ENSGT01000000214413.b.a.b.a.b.b ENSGT01030000234575.c.a.a.b.f ENSGT01100000263479.I.b.d ENSGT00940000158852.d.b.a ENSGT00940000166708.r ENSGT01100000263568.b.a.c.b.a.a.b.b.a ENSGT00520000055635.c.b.a.a ENSGT00940000159960.c.f Atlantic salmon MODERN SPECIES 5 ENSSSAG00000104376 cacng7a (ENSSSAG00000102787) ENSSSAG00000095720 cacng8a (ENSSSAG00000067858) cacng6a (ENSSSAG00000067866) ENSSSAG00000067869 ENSSSAG00000067873 slc2a3a (ENSSSAG00000067915) ENSSSAG00000069229 ENSSSAG00000069235 clcn1a (ENSSSAG00000069350) ENSSSAG00000073626 ENSSSAG00000082474 ing4 (ENSSSAG00000073628) #28 ENSSSAG00000073639 #22 ENSSSAG00000073832 #22 ENSSSAG00000073838 ##23 vamp1a (ENSSSAG00000073860) ENSSSAG00000073862 chd4a (ENSSSAG00000073889) #25 CDC42 (ENSSSAG00000113384) enog (ENSSSAG00000074139) tpi1a (ENSSSAG00000074195) gnb3b (ENSSSAG00000074198) ENSSSAG00000074205 ENSSSAG00000086881 ENSSSAG00000074232 ENSSSAG00000074408 ENSSSAG00000108670 gsk3aa (ENSSSAG00000074433) ENSSSAG00000074899 River trout MODERN SPECIES 29 ENSSTUG00000029267 ENSSTUG00000029244 dbpa (ENSSTUG00000029234) ENSSTUG00000029221 cacng7a (ENSSTUG00000029215) cacng8a (ENSSTUG00000029209) cacng6a (ENSSTUG00000029203) cox6b2 (ENSSTUG00000029180) slc2a3a (ENSSTUG00000029101) ENSSTUG00000029065 ENSSTUG00000029048 clcn1a (ENSSTUG00000028484) ENSSTUG00000028449 ENSSTUG00000028437 ing4 (ENSSTUG00000028383) #28 ENSSTUG00000028374 #22 GAPDH (ENSSTUG00000028027) #22 IFFO1 (ENSSTUG00000027984) ##23 vamp1a (ENSSTUG00000027961) ENSSTUG00000027952 ENSSTUG00000027940 ENSSTUG00000027936 chd4a (ENSSTUG00000024836) #25 ENSSTUG00000024695 eno2 (ENSSTUG00000024605) tpi1a (ENSSTUG00000024575) gnb3b (ENSSTUG00000024538) zgc:174904 (ENSSTUG00000024517) ENSSTUG00000024500 GRIK5 (ENSSTUG00000024354) ENSSTUG00000024283 Huchen MODERN SPECIES 525 ENSHHUG00000038964 ENSHHUG00000038959 cacng7a (ENSHHUG00000038956) cacng8a (ENSHHUG00000038951) cacng6a (ENSHHUG00000038948) ENSHHUG00000038942 ENSHHUG00000038931 ENSHHUG00000038919 slc2a3a (ENSHHUG00000038861) ENSHHUG00000038846 ENSHHUG00000038843 clcn1a (ENSHHUG00000038755) ENSHHUG00000038727 ENSHHUG00000038634 ing4 (ENSHHUG00000038621) #28 GAPDH (ENSHHUG00000035744) #22 IFFO1 (ENSHHUG00000035713) ##23 vamp1a (ENSHHUG00000035710) ENSHHUG00000035693 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 278 ENSGT00940000165399.a.a.e ENSGT00940000159109.b.b ENSGT01050000244961.b.h.c ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b.a ENSGT00390000007786.b.h.a ENSGT01060000248591.b.a.g ENSGT00940000164148.a.a.d ENSGT00940000160313.d ENSGT00940000165997.a.b ENSGT00940000167696.c ENSGT00940000157383.g.a.a.a ENSGT00950000183106.a.b.a.c ENSGT01100000263568.b.a.c.a.g.b ENSGT00940000159033.n.b #28 ENSGT00940000153298.i.b.a #22 ENSGT00940000153298.i.b.b.b #22 ENSGT00510000046803.b.a.b.c ##23 ENSGT00940000164382.b.a.b ENSGT01100000263533.b.a.a.a.b.a.a Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.i.b.b.b #22 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 40 ENSGT00940000165399.a.a.e ENSGT00940000159109.b.b ENSGT01050000244961.b.h.c ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b.a ENSGT00390000007786.b.h.a ENSGT01060000248591.b.a.g ENSGT00940000164148.a.a.d.a.a ENSGT00940000160313.d ENSGT00940000165997.a.b ENSGT00940000167696.c ENSGT00940000157383.g.a.a.a ENSGT00950000183106.a.b.a.c ENSGT01100000263568.b.a.c.a.g.b ENSGT00940000159033.n.b #28 ENSGT00940000153298.i.b.a.a #22 ENSGT00940000153298.i.b.b.b #22 ENSGT00510000046803.b.a.b.c ##23 ENSGT00940000164382.b.a.b ENSGT01100000263533.b.a.a.a.b.a.a ENSGT01050000246012.a ENSGT00400000022326.b.a.b.b.a.b.b ENSGT00940000155088.b.a.a.e.b #25 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.b.k.b ENSGT00950000182805.a.a.b.a.c.b.d ENSGT00390000013354.b.b.d ENSGT01000000214413.b.a.b.a.b.b ENSGT01030000234575.c.a.a.b.f ENSGT01100000263479.I.b.d ENSGT00940000158852.d.b.a ENSGT00940000166708.p ENSGT01100000263568.b.a.c.b.a.a.b.b.a Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00530000064557.b ENSGT00940000165399.a.a.e ENSGT00940000159109.b.b ENSGT01050000244961.b.h.c ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b.a ENSGT00390000007786.b.h.a ENSGT01060000248591.b.a.g ENSGT00940000164148.a.a.d.b ENSGT00940000160313.d ENSGT00940000165997.a.b ENSGT00940000167696.c ENSGT00940000157383.g.a.a.a ENSGT00950000183106.a.b.a.c ENSGT01100000263568.b.a.c.a.g.b ENSGT00940000159033.n.b #28 ENSGT00940000153298.i.b.b.b #22 ENSGT00510000046803.b.a.b.c ##23 ENSGT00940000164382.b.a.b ENSGT01100000263533.b.a.a.a.b.a.a ENSGT00940000159960.c.f ENSGT01050000246012.a ENSGT00400000022326.b.a.b.b.a.b.b ENSGT00940000155088.b.a.a.e.b #25 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.b.k.b ENSGT00950000182805.a.a.b.a.c.b.d ENSGT00390000013354.b.b.d ENSGT01000000214413.b.a.b.a.b.b ENSGT01030000234575.c.a.a.b.f ENSGT01100000263479.I.b.d ENSGT00940000158852.d.b.a ENSGT00940000166708.p Coho salmon MODERN SPECIES 5 dbpa (ENSOKIG00005015462) ENSOKIG00005015484 ENSOKIG00005015574 cacng7a (ENSOKIG00005015585) cacng8a (ENSOKIG00005015608) cacng6a (ENSOKIG00005015621) ENSOKIG00005015634 ENSOKIG00005015642 slc2a3a (ENSOKIG00005015681) ENSOKIG00005015819 ENSOKIG00005015828 clcn1a (ENSOKIG00005015872) ENSOKIG00005016158 ENSOKIG00005016182 ing4 (ENSOKIG00005016193) #28 GAPDH (ENSOKIG00005016307) #22 IFFO1 (ENSOKIG00005017552) ##23 vamp1a (ENSOKIG00005017578) ENSOKIG00005017588 ENSOKIG00005017616 ENSOKIG00005017624 chd4a (ENSOKIG00005017787) #25 ENSOKIG00005019769 eno2 (ENSOKIG00005019807) ENSOKIG00005019885 tpi1a (ENSOKIG00005019895) gnb3b (ENSOKIG00005019956) ENSOKIG00005019967 ENSOKIG00005019991 GRIK5 (ENSOKIG00005020072) ENSOKIG00005020917 Chinook salmon MODERN SPECIES 4 ENSOTSG00005002330 dbpa (ENSOTSG00005002211) ENSOTSG00005002208 cacng7a (ENSOTSG00005002196) cacng8a (ENSOTSG00005002193) cacng6a (ENSOTSG00005002188) ENSOTSG00005001886 ENSOTSG00005001684 ENSOTSG00005001646 slc2a3a (ENSOTSG00005047484) ENSOTSG00005047483 ENSOTSG00005047482 clcn1a (ENSOTSG00005047382) ENSOTSG00005047350 ing4 (ENSOTSG00005047348) #28 GAPDH (ENSOTSG00005047309) #22 IFFO1 (ENSOTSG00005047300) ##23 vamp1a (ENSOTSG00005047293) chd4a (ENSOTSG00005047156) #25 cdc42l (ENSOTSG00005047149) eno2 (ENSOTSG00005047120) tpi1a (ENSOTSG00005047118) gnb3b (ENSOTSG00005047116) ENSOTSG00005047115 zgc:174904 (ENSOTSG00005047114) ENSOTSG00005047112 GRIK5 (ENSOTSG00005047107) ENSOTSG00005047104 ENSOTSG00005047103 gsk3aa (ENSOTSG00005047101) erf (ENSOTSG00005047098) Huchen MODERN SPECIES 312 ENSHHUG00000026992 dbpa (ENSHHUG00000026996) GRIN2D (ENSHHUG00000027000) cacng7a (ENSHHUG00000027023) cacng8a (ENSHHUG00000027024) cacng6a (ENSHHUG00000027025) ENSHHUG00000027026 cox6b2 (ENSHHUG00000027027) slc2a3a (ENSHHUG00000027067) ENSHHUG00000027194 ENSHHUG00000027207 clcn1a (ENSHHUG00000027212) ENSHHUG00000027232 ENSHHUG00000027238 ing4 (ENSHHUG00000027252) #28 GAPDH (ENSHHUG00000027363) #22 IFFO1 (ENSHHUG00000032381) ##23 vamp1a (ENSHHUG00000032386) ENSHHUG00000032390 ENSHHUG00000032393 ENSHHUG00000032397 chd4a (ENSHHUG00000032400) #25 cdc42l (ENSHHUG00000032782) eno2 (ENSHHUG00000032834) tpi1a (ENSHHUG00000033051) gnb3b (ENSHHUG00000033087) ENSHHUG00000033092 ENSHHUG00000033124 GRIK5 (ENSHHUG00000033139) Northern pike DUPLICATION Northern pike MODERN SPECIES 9 ENSELUG00000031795 dbpa (ENSELUG00000034052) GRIN2D (ENSELUG00000022174) cacng7a (ENSELUG00000022111) cacng8a (ENSELUG00000022086) ENSELUG00000022040 ENSELUG00000028839 cacng6a (ENSELUG00000029838) cox6b2 (ENSELUG00000022012) slc2a3a (ENSELUG00000021978) ENSELUG00000021937 ENSELUG00000021912 clcn1a (ENSELUG00000021862) ENSELUG00000021741 ing4 (ENSELUG00000021663) #28 GAPDH (ENSELUG00000021642) #22 GAPDH (ENSELUG00000021616) #22 IFFO1 (ENSELUG00000021568) ##23 vamp1a (ENSELUG00000021474) ENSELUG00000034467 ENSELUG00000021459 ENSELUG00000026707 ENSELUG00000029497 chd4a (ENSELUG00000021276) #25 cdc42l (ENSELUG00000021203) eno2 (ENSELUG00000021163) tpi1a (ENSELUG00000021130) gnb3b (ENSELUG00000021120) zgc:174904 (ENSELUG00000021109) ENSELUG00000021090 GRIK5 (ENSELUG00000021029) Northern pike MODERN SPECIES 9 dbpa (ENSELUG00000034052) GRIN2D (ENSELUG00000022174) cacng7a (ENSELUG00000022111) cacng8a (ENSELUG00000022086) ENSELUG00000022040 ENSELUG00000028839 cacng6a (ENSELUG00000029838) cox6b2 (ENSELUG00000022012) slc2a3a (ENSELUG00000021978) ENSELUG00000021937 ENSELUG00000021912 clcn1a (ENSELUG00000021862) ENSELUG00000021741 ing4 (ENSELUG00000021663) #28 GAPDH (ENSELUG00000021642) #22 GAPDH (ENSELUG00000021616) #22 IFFO1 (ENSELUG00000021568) ##23 vamp1a (ENSELUG00000021474) ENSELUG00000034467 ENSELUG00000021459 ENSELUG00000026707 ENSELUG00000029497 chd4a (ENSELUG00000021276) #25 cdc42l (ENSELUG00000021203) eno2 (ENSELUG00000021163) tpi1a (ENSELUG00000021130) gnb3b (ENSELUG00000021120) zgc:174904 (ENSELUG00000021109) ENSELUG00000021090 GRIK5 (ENSELUG00000021029) ENSELUG00000020968 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 128 ENSGT00530000064557.b ENSGT00940000165399.a.a ENSGT00940000159109.b ENSGT01050000244961.b.h ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b ENSGT00390000007786.b.h ENSGT00940000178794 ENSGT01060000248591.b.a ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.b.b.b ENSGT00940000164148.a.a.d ENSGT00940000160313 ENSGT00940000165997.a ENSGT00940000167696 ENSGT00940000157383.g.a ENSGT00950000183106.a.b.a ENSGT00940000153298.i.b #22 ENSGT00510000046803.b.a.b ##23 ENSGT00940000164382.b.a ENSGT00940000155088.b.a.a #25 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.a.b ENSGT00950000182805.a.a.b.a.c.b ENSGT00390000013354.b.b ENSGT01000000214413.b.a.b.a.b ENSGT01030000234575.c.a.a.b ENSGT01100000263479.I.b Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000162254.a ENSGT00530000064557.b ENSGT00940000165399.a.a ENSGT00940000159109.b ENSGT01050000244961.b.h ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b ENSGT00390000007786.b.h ENSGT01060000248591.b.a ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.b.b.b ENSGT00940000164148.a.a.c.b ENSGT00940000160313 ENSGT00940000165997.a ENSGT00940000167696 ENSGT00940000157383.g.a ENSGT00950000183106.a.b.a ENSGT00940000153298.i.b #22 ENSGT00510000046803.b.a.b ##23 ENSGT00940000164382.b.a ENSGT00940000155088.b.a.a #25 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.a.b ENSGT00950000182805.a.a.b.a.c.b ENSGT00390000013354.b.b ENSGT01000000214413.b.a.b.a.b ENSGT01030000234575.c.a.a.b Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000162254.a ENSGT00530000064557.b ENSGT00940000165399.a.a ENSGT00940000159109.b ENSGT01050000244961.b.h ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b ENSGT00390000007786.b.h ENSGT01060000248591.b.a ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.b.b.b ENSGT00940000164148.a.a.c.b ENSGT00940000160313 ENSGT00940000165997.a ENSGT00940000167696 ENSGT00940000157383.g.a ENSGT00950000183106.a.b.a ENSGT00940000153298.i.b #22 ENSGT00510000046803.b.a.b ##23 ENSGT00940000164382.b.a ENSGT00940000155088.b.a.a #25 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.a.b ENSGT00950000182805.a.a.b.a.c.b ENSGT00390000013354.b.b ENSGT01000000214413.b.a.b.a.b ENSGT01030000234575.c.a.a.b Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000162254.a ENSGT00530000064557.b ENSGT00940000165399.a.a ENSGT00940000159109.b ENSGT01050000244961.b.h ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b ENSGT00390000007786.b.h ENSGT01060000248591.b.a ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.b.b.b ENSGT00940000164148.a.a.c.b ENSGT00940000160313 ENSGT00940000165997.a ENSGT00940000167696 ENSGT00940000157383.g.a ENSGT00950000183106.a.b.a ENSGT00940000153298.i.b #22 ENSGT00510000046803.b.a.b ##23 ENSGT00940000164382.b.a ENSGT00940000155088.b.a.a #25 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.a.b.b ENSGT00950000182805.a.a.b.a.c.b ENSGT00390000013354.b.b ENSGT01000000214413.b.a.b.a.b ENSGT01030000234575.c.a.a.b ENSGT01090000260033.b ENSGT01080000257344.a.b.b.b.b.b.b.a.b.b.a.b ENSGT01030000234589.g.a ENSGT00940000153770.l.a ENSGT01100000263549.j.b.h ENSGT01080000257344.a.b.b.b.b.b.b.b.b.a.b ENSGT00390000016811.g.g.b Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000165399.a.a ENSGT00940000159109.b ENSGT01050000244961.b.h ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b ENSGT00390000007786.b.h ENSGT01060000248591.b.a ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.b.b.b ENSGT00940000164148.a.a.c.b ENSGT00940000160313 ENSGT00940000156612 ENSGT00940000165997.a ENSGT00940000157871.h.b ENSGT00940000167696 ENSGT00940000157383.g.a ENSGT00950000183106.a.b.a ENSGT00940000153298.i.b #22 ENSGT00510000046803.b.a.b ##23 ENSGT00940000164382.b.a ENSGT00940000155088.b.a.a #25 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.a.b.b ENSGT00950000182805.a.a.b.a.c.b ENSGT00390000013354.b.b ENSGT01000000214413.b.a.b.a.b ENSGT01030000234575.c.a.a.b ENSGT00390000016811.g.g.b ENSGT00940000164041.b.b ENSGT00390000005809 ENSGT00940000156272 ENSGT00940000158932 ENSGT00390000017802.c ENSGT00950000183156.a.b.b.b.b.a.c.b Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00530000064557.b ENSGT00940000165399.a.a ENSGT00940000159109.b ENSGT01050000244961.b.h ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b ENSGT00390000007786.b.h ENSGT01060000248591.b.a ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.b.b.b ENSGT00940000164148.a.a.c.b ENSGT00940000160313 ENSGT00940000156612 ENSGT00940000165997.a ENSGT00940000157871.h.b ENSGT00940000157383.g.a ENSGT00950000183106.a.b.a ENSGT00940000153298.i.b #22 ENSGT00510000046803.b.a.b ##23 ENSGT00940000164382.b.a ENSGT00940000155088.b.a.a #25 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.a.b.b ENSGT00950000182805.a.a.b.a.c.b ENSGT00390000013354.b.b ENSGT01000000214413.b.a.b.a.b ENSGT01030000234575.c.a.a.b ENSGT01080000257344.a.b.b.b.b.b.b.b.b.a.b ENSGT00940000153770.l.a ENSGT01100000263549.j.b.g.a ENSGT00940000153770.k ENSGT00940000153094 ENSGT01100000263549.j.b.h ENSGT01100000263549.j.a Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00530000064557.b ENSGT00940000165399.a.a ENSGT00940000159109.b ENSGT01050000244961.b.h ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b ENSGT00390000007786.b.h ENSGT01060000248591.b.a ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.b.b.b ENSGT00940000164148.a.a.c.b ENSGT00940000160313 ENSGT00940000156612 ENSGT00940000165997.a ENSGT00940000157871.h.b ENSGT00940000157383.g.a ENSGT00950000183106.a.b.a ENSGT00940000153298.i.b #22 ENSGT00510000046803.b.a.b ##23 ENSGT00940000164382.b.a ENSGT00940000155088.b.a.a #25 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.a.b.b ENSGT00950000182805.a.a.b.a.c.b ENSGT00390000013354.b.b ENSGT01000000214413.b.a.b.a.b ENSGT01030000234575.c.a.a.b ENSGT01080000257344.a.b.b.b.b.b.b.b.b.a.b ENSGT00940000153770.l.a ENSGT01100000263549.j.b.h ENSGT01100000263549.j.a ENSGT01030000234589.g.a.f ENSGT01080000257344.a.b.b.b.b.b.b.a.a.d ENSGT00940000153770.l.b.a.a Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 112 ENSGT00390000013183.d.b.b ENSGT00390000014743.i ENSGT00940000162254.a ENSGT00530000064557.b ENSGT00940000165399.a.a ENSGT00940000159109.b ENSGT01050000244961.b.h ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b ENSGT00390000007786.b.h ENSGT01060000248591.b.a ENSGT00940000164148.a.a.d ENSGT00940000160313 ENSGT00940000157871.h.b ENSGT00940000157383.g.a ENSGT00950000183106.a.b.a ENSGT00940000153298.i.b #22 ENSGT00510000046803.b.a.b ##23 ENSGT00940000164382.b.a ENSGT00940000155088.b.a.a #25 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.a.b.b ENSGT00950000182805.a.a.b.a.c.b ENSGT00390000013354.b.b ENSGT01000000214413.b.a.b.a.b ENSGT01030000234575.c.a.a.b Mangrove rivulus MODERN SPECIES 103 cnot3b (ENSKMAG00000018723) ENSKMAG00000018757 ENSKMAG00000018789 dbpa (ENSKMAG00000018798) ENSKMAG00000018820 cacng7a (ENSKMAG00000018871) cacng8a (ENSKMAG00000018899) cacng6a (ENSKMAG00000018912) ENSKMAG00000018933 cox6b2 (ENSKMAG00000018951) slc2a3a (ENSKMAG00000018976) ENSKMAG00000018997 ENSKMAG00000019019 clcn1a (ENSKMAG00000019056) FAM131B (ENSKMAG00000019114) GAPDH (ENSKMAG00000019144) #22 IFFO1 (ENSKMAG00000019224) ##23 vamp1a (ENSKMAG00000019252) chd4a (ENSKMAG00000019286) #25 cdc42l (ENSKMAG00000019361) eno2 (ENSKMAG00000019388) tpi1a (ENSKMAG00000019444) gnb3b (ENSKMAG00000019467) ENSKMAG00000019488 rcvrn3 (ENSKMAG00000019513) si:ch211-232m10.6 (ENSKMAG00000019523) epn1b (ENSKMAG00000019541) necap1 (ENSKMAG00000019560) ENSKMAG00000019581 ENSKMAG00000019596 ENSKMAG00000019625 Turquoise killifish MODERN SPECIES 1628 necap1 (ENSNFUG00015017743) epn1b (ENSNFUG00015017740) si:ch211-232m10.6 (ENSNFUG00015017736) rcvrn3 (ENSNFUG00015017733) RBM48 (ENSNFUG00015017728) pex1 (ENSNFUG00015017713) elmo1 (ENSNFUG00015017686) COX6B1 (ENSNFUG00015017670) ENSNFUG00015017669 slc2a3a (ENSNFUG00015017612) ENSNFUG00015017551 ENSNFUG00015017527 clcn1a (ENSNFUG00015015463) ENSNFUG00015015256 FAM131BA (ENSNFUG00015015240) GAPDH (ENSNFUG00015014874) #22 IFFO1 (ENSNFUG00015014809) ##23 vamp1a (ENSNFUG00015014776) cdc42l (ENSNFUG00015022431) eno2 (ENSNFUG00015022373) tpi1a (ENSNFUG00015022362) gnb3b (ENSNFUG00015022355) CLEP (ENSNFUG00015022351) sytl1 (ENSNFUG00015022342) ENSNFUG00015022332 gpr3 (ENSNFUG00015022328) WASF2 (ENSNFUG00015022325) AHDC1 (ENSNFUG00015022322) yrk (ENSNFUG00015022291) MATN1 (ENSNFUG00015022287) matn1 (ENSNFUG00015022282) Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000162254.a ENSGT00530000064557.b ENSGT00940000165399.a.a ENSGT00940000159109.b ENSGT01050000244961.b.h ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b ENSGT00390000007786.b.h ENSGT01060000248591.b.a ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.b.b.b ENSGT00940000164148.a.a.c.b ENSGT00940000160313 ENSGT00940000165997.a ENSGT00940000157871.h.b ENSGT00940000157383.g.a ENSGT00950000183106.a.b.a ENSGT00940000153298.i.b #22 ENSGT00510000046803.b.a.b ##23 ENSGT00940000164382.b.a ENSGT00940000155088.b.a.a #25 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.a.b.b ENSGT00950000182805.a.a.b.a.c.b ENSGT00390000013354.b.b ENSGT01000000214413.b.a.b.a.b ENSGT01030000234575.c.a.a.b ENSGT01080000257344.a.b.b.b.b.b.b.b.b.a.b Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000162254.a ENSGT00530000064557.b ENSGT00940000165399.a.a ENSGT00940000159109.b ENSGT01050000244961.b.h ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b ENSGT00390000007786.b.h ENSGT01060000248591.b.a ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.b.b.b ENSGT00940000164148.a.a.c.b ENSGT00940000160313 ENSGT00940000165997.a ENSGT00940000157871.h.b ENSGT00940000157383.g.a ENSGT00950000183106.a.b.a ENSGT00940000153298.i.b #22 ENSGT00510000046803.b.a.b ##23 ENSGT00940000164382.b.a ENSGT00940000155088.b.a.a #25 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.a.b.b ENSGT00950000182805.a.a.b.a.c.b ENSGT00390000013354.b.b ENSGT01000000214413.b.a.b.a.b ENSGT01030000234575.c.a.a.b ENSGT01080000257344.a.b.b.b.b.b.b.b.b.a.b ENSGT01030000234589.g.a.f.e.a.a.b.a.b ENSGT01080000257344.a.b.b.b.b.b.b.a.b.b.a.b.d.a.a.a.b.b ENSGT01080000257344.a.b.b.b.b.b.b.a.b.b.a.b.d.a.b.a.a.a ENSGT01030000234589.g.a.f.e.a.b ENSGT01080000257344.a.b.b.b.b.b.b.a.b.b.a.b.d.a.a.a.b.a ENSGT01030000234589.g.a.f.e.a.a.b.b.a Poecilia ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00940000162254.a ENSGT00530000064557.b ENSGT00940000165399.a.a ENSGT00940000159109.b ENSGT01050000244961.b.h ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b ENSGT00390000007786.b.h ENSGT01060000248591.b.a ENSGT00940000164148.a.a.c.b ENSGT00940000160313 ENSGT00940000165997.a ENSGT00940000167696 ENSGT00940000157871.h.b ENSGT00940000157383.g.a ENSGT00950000183106.a.b.a ENSGT00940000153298.i.b #22 ENSGT00510000046803.b.a.b ##23 ENSGT00940000164382.b.a ENSGT00940000155088.b.a.a #25 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.a.b.b ENSGT00950000182805.a.a.b.a.c.b ENSGT00390000013354.b.b ENSGT01000000214413.b.a.b.a.b ENSGT01030000234575.c.a.a.b ENSGT01080000257344.a.b.b.b.b.b.b.b.b.a.b ENSGT01030000234589.g.a.f.e.a.a.b.a.b ENSGT01080000257344.a.b.b.b.b.b.b.a.b.b.a.b.d.a.b.a.b ENSGT01080000257344.a.b.b.b.b.b.b.a.b.b.a.a ENSGT01080000257344.a.b.b.b.b.b.b.a.b.b.a.b.d.a.b.b.b NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 116 ENSGT00390000014743.i ENSGT00940000162254.a ENSGT00530000064557.b ENSGT00940000165399.a.a ENSGT00940000159109.b ENSGT01050000244961.b.h ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b ENSGT00390000007786.b.h ENSGT01060000248591.b.a ENSGT00940000164148.a.a.c.b ENSGT00940000160313 ENSGT00940000165997.a ENSGT00940000167696 ENSGT00940000157383.g.a ENSGT00950000183106.a.b.a ENSGT00940000153298.i.b #22 ENSGT00510000046803.b.a.b ##23 ENSGT00940000164382.b.a ENSGT00940000155088.b.a.a #25 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.a.b.b ENSGT00950000182805.a.a.b.a.c.b ENSGT00390000013354.b.b ENSGT01000000214413.b.a.b.a.b ENSGT01030000234575.c.a.a.b ENSGT01080000257344.a.b.b.b.b.b.b.b.b.a.b ENSGT01030000234589.g.a.f.e.a.a.b.a.b ENSGT01080000257344.a.b.b.b.b.b.b.a.b.b.a.b.d.a.b.a.b Sailfin molly MODERN SPECIES 499 ENSPLAG00000000310 cox6b2 (ENSPLAG00000012897) slc2a3a (ENSPLAG00000012887) ENSPLAG00000012859 ENSPLAG00000012849 ENSPLAG00000012838 ENSPLAG00000012818 GAPDH (ENSPLAG00000000772) #22 IFFO1 (ENSPLAG00000012749) ##23 vamp1a (ENSPLAG00000012737) chd4a (ENSPLAG00000012712) #25 cdc42l (ENSPLAG00000012623) eno2 (ENSPLAG00000012609) tpi1a (ENSPLAG00000012565) gnb3b (ENSPLAG00000012547) ENSPLAG00000012493 ENSPLAG00000012482 ENSPLAG00000000278 Amazon molly MODERN SPECIES 408 cnot3b (ENSPFOG00000007168) ENSPFOG00000007386 ENSPFOG00000007425 dbpa (ENSPFOG00000007430) ENSPFOG00000007486 cacng7a (ENSPFOG00000007821) cacng8a (ENSPFOG00000007865) cacng6a (ENSPFOG00000007911) ENSPFOG00000007981 ENSPFOG00000008098 slc2a3a (ENSPFOG00000008108) ENSPFOG00000008249 ENSPFOG00000008308 clcn1a (ENSPFOG00000008368) ENSPFOG00000008843 GAPDH (ENSPFOG00000008901) #22 IFFO1 (ENSPFOG00000009010) ##23 vamp1a (ENSPFOG00000009077) chd4a (ENSPFOG00000009089) #25 cdc42l (ENSPFOG00000009652) eno2 (ENSPFOG00000009663) tpi1a (ENSPFOG00000009922) gnb3b (ENSPFOG00000010022) ENSPFOG00000010063 ENSPFOG00000010088 ENSPFOG00000020411 ENSPFOG00000022868 ENSPFOG00000010102 ENSPFOG00000010110 Guppy MODERN SPECIES 441 ENSPREG00000000799 ENSPREG00000000808 ENSPREG00000000827 dbpa (ENSPREG00000000847) ENSPREG00000000885 cacng7a (ENSPREG00000000897) cacng8a (ENSPREG00000000929) cacng6a (ENSPREG00000000969) ENSPREG00000000971 slc2a3a (ENSPREG00000000986) ENSPREG00000001037 ENSPREG00000001050 clcn1a (ENSPREG00000001065) ENSPREG00000001093 ENSPREG00000001108 GAPDH (ENSPREG00000001118) #22 IFFO1 (ENSPREG00000001168) ##23 vamp1a (ENSPREG00000001178) chd4a (ENSPREG00000001202) #25 cdc42l (ENSPREG00000001350) eno2 (ENSPREG00000001377) tpi1a (ENSPREG00000001427) gnb3b (ENSPREG00000001456) ENSPREG00000001471 ENSPREG00000001483 ENSPREG00000001494 ENSPREG00000001522 ENSPREG00000001539 ENSPREG00000001553 ENSPREG00000001601 ENSPREG00000001619 Platyfish MODERN SPECIES 4 ENSXMAG00000029753 dbpa (ENSXMAG00000027468) ENSXMAG00000025071 ENSXMAG00000014145 cacng7a (ENSXMAG00000000890) cacng8a (ENSXMAG00000022436) cacng6a (ENSXMAG00000000905) ENSXMAG00000025047 ENSXMAG00000029120 ENSXMAG00000000922 slc2a3a (ENSXMAG00000000924) ENSXMAG00000000955 ENSXMAG00000026955 ENSXMAG00000025832 ENSXMAG00000001004 GAPDH (ENSXMAG00000001007) #22 IFFO1 (ENSXMAG00000001023) ##23 vamp1a (ENSXMAG00000025157) chd4a (ENSXMAG00000001037) #25 cdc42l (ENSXMAG00000030031) eno2 (ENSXMAG00000001110) tpi1a (ENSXMAG00000001163) gnb3b (ENSXMAG00000001191) ENSXMAG00000001225 ENSXMAG00000027060 ENSXMAG00000020260 ENSXMAG00000025614 ENSXMAG00000021678 ENSXMAG00000028235 ENSXMAG00000025758 ENSXMAG00000029225 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 150 ENSGT00940000162254.a ENSGT00530000064557.b ENSGT00940000165399.a.a ENSGT00940000159109.b ENSGT01050000244961.b.h ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b ENSGT00390000007786.b.h ENSGT01060000248591.b.a ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.b.b.b ENSGT00940000164148.a.a.c.b ENSGT00940000160313 ENSGT00940000165997.a ENSGT00940000157871.h.b ENSGT00940000157383.g.a ENSGT00950000183106.a.b.a ENSGT00940000153298.i.b #22 ENSGT00510000046803.b.a.b ##23 ENSGT00940000164382.b.a ENSGT00940000155088.b.a.a #25 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.a.b.b ENSGT00950000182805.a.a.b.a.c.b ENSGT00390000013354.b.b ENSGT01000000214413.b.a.b.a.b ENSGT01030000234575.c.a.a.b Sheepshead minnow MODERN SPECIES 255 ADAMTS18 (ENSCVAG00000003402) GAPDH (ENSCVAG00000003432) #22 IFFO1 (ENSCVAG00000003445) ##23 vamp1a (ENSCVAG00000003455) chd4a (ENSCVAG00000004940) #25 ENSCVAG00000005006 eno2 (ENSCVAG00000005068) tpi1a (ENSCVAG00000005106) gnb3b (ENSCVAG00000005124) ENSCVAG00000005136 ENSCVAG00000005148 ENSCVAG00000005159 ENSCVAG00000005172 ENSCVAG00000005195 ENSCVAG00000005205 ENSCVAG00000005251 ENSCVAG00000005264 Mummichog MODERN SPECIES 2323 ccdc106b (ENSFHEG00000001690) cnot3b (ENSFHEG00000001696) ENSFHEG00000001702 ENSFHEG00000001706 dbpa (ENSFHEG00000001710) cacng7a (ENSFHEG00000001713) cacng8a (ENSFHEG00000001719) cacng6a (ENSFHEG00000001723) ENSFHEG00000001727 cox6b2 (ENSFHEG00000001729) slc2a3a (ENSFHEG00000001861) ENSFHEG00000001900 ENSFHEG00000001906 clcn1a (ENSFHEG00000001934) ENSFHEG00000001946 GAPDH (ENSFHEG00000001966) #22 IFFO1 (ENSFHEG00000001981) ##23 vamp1a (ENSFHEG00000001992) chd4a (ENSFHEG00000002013) #25 ENSFHEG00000002021 ENSFHEG00000002024 eno2 (ENSFHEG00000002030) tpi1a (ENSFHEG00000002037) gnb3b (ENSFHEG00000002045) ENSFHEG00000002056 ENSFHEG00000002060 ENSFHEG00000002065 ENSFHEG00000002070 ENSFHEG00000002077 ENSFHEG00000002086 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00530000064557.b ENSGT00940000165399.a.a ENSGT00940000159109.b ENSGT01050000244961.b.h ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b ENSGT00390000007786.b.h ENSGT01060000248591.b.a ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.b.b.b ENSGT00940000164148.a.a.c.b ENSGT00940000160313 ENSGT00940000165997.a ENSGT00940000157871.h.b ENSGT00940000167696 ENSGT00940000157383.g.a ENSGT00950000183106.a.b.a ENSGT00940000153298.i.b #22 ENSGT00510000046803.b.a.b ##23 ENSGT00940000164382.b.a ENSGT00940000155088.b.a.a #25 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.a.b.b ENSGT00950000182805.a.a.b.a.c.b ENSGT00390000013354.b.b ENSGT01000000214413.b.a.b.a.b ENSGT01030000234575.c.a.a.b ENSGT00390000016811.g.g.b ENSGT00940000164041.b.b ENSGT00390000005809 ENSGT00940000156272 ENSGT00940000158932 ENSGT00390000017802.c ENSGT00950000183156.a.b.b.b.b.a.c.b Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00530000064557.b ENSGT00940000177770 ENSGT00940000165399.a.a ENSGT00940000159109.b ENSGT01050000244961.b.h ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b ENSGT00390000007786.b.h ENSGT01060000248591.b.a ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.b.b.b ENSGT00940000164148.a.a.c.b ENSGT00940000160313 ENSGT00940000165997.a ENSGT00940000157871.h.b ENSGT00940000157383.g.a ENSGT00950000183106.a.b.a ENSGT00940000153298.i.b #22 ENSGT00510000046803.b.a.b ##23 ENSGT00940000164382.b.a ENSGT00940000155088.b.a.a #25 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b ENSGT00940000153675.a.a.a.a.a.b.a.a ENSGT00950000182805.a.a.b.a.c.b ENSGT00390000013354.b.b ENSGT01000000214413.b.a.b.a.b ENSGT01030000234575.c.a.a.b ENSGT00390000016811.g.g.b ENSGT00940000164041.b.b ENSGT00390000005809 ENSGT00940000156272 ENSGT00940000158932 ENSGT00390000017802.c Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00530000064557.b ENSGT00940000177770 ENSGT00940000165399.a.a ENSGT00940000159109.b ENSGT01050000244961.b.h ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b ENSGT00390000007786.b.h ENSGT01060000248591.b.a ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.b.b.b ENSGT00940000164148.a.a.c.b ENSGT00940000160313 ENSGT00940000165997.a ENSGT00940000157871.h.b ENSGT00940000157383.g.a ENSGT00950000183106.a.b.a ENSGT00940000153298.i.b #22 ENSGT00510000046803.b.a.b ##23 ENSGT00940000164382.b.a ENSGT00940000155088.b.a.a #25 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000153675.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b ENSGT00950000182805.a.a.b.a.c.b ENSGT00390000013354.b.b ENSGT01000000214413.b.a.b.a.b ENSGT01030000234575.c.a.a.b ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.b.a.b.b.k.b.b ENSGT00390000016811.g.g.b ENSGT00940000164041.b.b ENSGT00390000005809 ENSGT00940000156272 ENSGT00940000158932 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00530000064557.b ENSGT00940000177770 ENSGT00940000165399.a.a ENSGT00940000159109.b ENSGT01050000244961.b.h ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b ENSGT00390000007786.b.h ENSGT01060000248591.b.a ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.b.b.b ENSGT00940000164148.a.a.c.b ENSGT00940000160313 ENSGT00940000165997.a ENSGT00940000157871.h.b ENSGT00940000157383.g.a ENSGT00950000183106.a.b.a ENSGT00940000153298.i.b #22 ENSGT00510000046803.b.a.b ##23 ENSGT00940000164382.b.a ENSGT00940000155088.b.a.a #25 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000153675.a.a.a.a.a.b.a.a ENSGT00950000182805.a.a.b.a.c.b ENSGT00390000013354.b.b ENSGT01000000214413.b.a.b.a.b ENSGT01030000234575.c.a.a.b ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.b.a.b.b.k.b.b ENSGT00390000016811.g.g.b ENSGT00940000164041.b.b ENSGT00390000005809 ENSGT00940000156272 ENSGT00940000158932 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00530000064557.b ENSGT00940000177770 ENSGT00940000165399.a.a ENSGT00940000159109.b ENSGT01050000244961.b.h ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b ENSGT00390000007786.b.h ENSGT01060000248591.b.a ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.b.b.b ENSGT00940000164148.a.a.c.b ENSGT00940000160313 ENSGT00940000165997.a ENSGT00940000157871.h.b ENSGT00940000157383.g.a ENSGT00950000183106.a.b.a ENSGT00940000153298.i.b #22 ENSGT00510000046803.b.a.b ##23 ENSGT00940000164382.b.a ENSGT00940000155088.b.a.a #25 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000153675.a.a.a.a.a.b.a.a ENSGT00950000182805.a.a.b.a.c.b ENSGT00390000013354.b.b ENSGT01000000214413.b.a.b.a.b ENSGT01030000234575.c.a.a.b ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.b.a.b.b.k.b.b ENSGT00390000016811.g.g.b ENSGT00940000164041.b.b ENSGT00390000005809 ENSGT00940000156272 ENSGT00940000158932 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 430 ENSHBUG00000019643 ENSHBUG00000019624 ENSHBUG00000019620 dbpa (ENSHBUG00000019610) ENSHBUG00000019571 cacng7a (ENSHBUG00000019562) cacng8a (ENSHBUG00000019531) cacng6a (ENSHBUG00000019495) ENSHBUG00000019480 cox6b2 (ENSHBUG00000019464) slc2a3a (ENSHBUG00000019447) ENSHBUG00000019414 ENSHBUG00000019374 clcn1a (ENSHBUG00000019359) FAM131B (ENSHBUG00000019339) GAPDH (ENSHBUG00000019289) #22 IFFO1 (ENSHBUG00000019238) ##23 vamp1a (ENSHBUG00000000975) chd4a (ENSHBUG00000019146) #25 ENSHBUG00000018498 CDC42 (ENSHBUG00000018481) Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00530000064557.b ENSGT00940000177770 ENSGT00940000165399.a.a ENSGT00940000159109.b ENSGT01050000244961.b.h ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b ENSGT00390000007786.b.h ENSGT01060000248591.b.a ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.b.b.b ENSGT00940000164148.a.a.c.b ENSGT00940000160313 ENSGT00940000165997.a ENSGT00940000157871.h.b ENSGT00940000157383.g.a ENSGT00950000183106.a.b.a ENSGT00940000153298.i.b #22 ENSGT00510000046803.b.a.b ##23 ENSGT00940000164382.b.a ENSGT00940000155088.b.a.a #25 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000153675.a.a.a.a.a.b.a.a ENSGT00950000182805.a.a.b.a.c.b ENSGT00390000013354.b.b ENSGT01000000214413.b.a.b.a.b ENSGT01030000234575.c.a.a.b ENSGT00940000176860.g.b.b ENSGT00390000016811.g.g.b ENSGT00940000164041.b.b ENSGT00390000005809 ENSGT00940000156272 ENSGT00940000158932 P. nyererei MODERN SPECIES 450 cnot3b (ENSPNYG00000003358) ENSPNYG00000003312 ENSPNYG00000003301 dbpa (ENSPNYG00000003280) cacng7a (ENSPNYG00000003254) cacng8a (ENSPNYG00000003234) cacng6a (ENSPNYG00000003224) ENSPNYG00000003153 cox6b2 (ENSPNYG00000003127) slc2a3a (ENSPNYG00000003077) ENSPNYG00000003057 ENSPNYG00000003042 ENSPNYG00000003005 ENSPNYG00000002993 FAM131B (ENSPNYG00000002956) GAPDH (ENSPNYG00000002902) #22 IFFO1 (ENSPNYG00000002816) ##23 vamp1a (ENSPNYG00000002787) chd4a (ENSPNYG00000002663) #25 cdc42l (ENSPNYG00000002622) cdc42l (ENSPNYG00000002586) eno2 (ENSPNYG00000002540) tpi1a (ENSPNYG00000002511) gnb3b (ENSPNYG00000002013) ENSPNYG00000001980 ENSPNYG00000001970 ENSPNYG00000001953 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00530000064557.b ENSGT00940000177770 ENSGT00940000165399.a.a ENSGT00940000159109.b ENSGT01050000244961.b.h ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b ENSGT00390000007786.b.h ENSGT01060000248591.b.a ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.b.b.b ENSGT00940000164148.a.a.c.b ENSGT00940000160313 ENSGT00940000165997.a ENSGT00940000157871.h.b ENSGT00940000157383.g.a ENSGT00950000183106.a.b.a ENSGT00940000153298.i.b #22 ENSGT00510000046803.b.a.b ##23 ENSGT00940000164382.b.a ENSGT00940000155088.b.a.a #25 ENSGT00940000163568 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.a ENSGT00940000153675.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b ENSGT00940000153675.a.a.a.a.a.b.a.a ENSGT00950000182805.a.a.b.a.c.b ENSGT00390000013354.b.b ENSGT01000000214413.b.a.b.a.b ENSGT01030000234575.c.a.a.b ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.b.a.b.b.k.b.b ENSGT01080000257344.a.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a.a.a.a.a.a.a.b.a.a.b ENSGT01030000234589.g.a.e.a.e.a.b.b ENSGT01080000257344.a.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a.a.a.a.b.b.b Eastern happy MODERN SPECIES 13 ENSACLG00000016648 dbpa (ENSACLG00000016636) ENSACLG00000016551 ENSACLG00000016488 cacng7a (ENSACLG00000016436) cacng8a (ENSACLG00000016387) cacng6a (ENSACLG00000016369) ENSACLG00000016365 ENSACLG00000016355 cox6b2 (ENSACLG00000016348) slc2a3a (ENSACLG00000016241) ENSACLG00000016193 ENSACLG00000016167 ENSACLG00000016147 FAM131B (ENSACLG00000016111) GAPDH (ENSACLG00000016047) #22 IFFO1 (ENSACLG00000016005) ##23 vamp1a (ENSACLG00000015982) chd4a (ENSACLG00000015837) #25 ENSACLG00000015726 ENSACLG00000015700 cdc42l (ENSACLG00000015681) CDC42 (ENSACLG00000015656) cdc42l (ENSACLG00000015587) eno2 (ENSACLG00000015525) tpi1a (ENSACLG00000015501) gnb3b (ENSACLG00000015467) ENSACLG00000015419 ENSACLG00000015411 ENSACLG00000015368 ENSACLG00000015354 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1104 cnot3b (ENSMZEG00005002466) ENSMZEG00005002444 ENSMZEG00005002430 ENSMZEG00005002421 dbpa (ENSMZEG00005002409) cacng7a (ENSMZEG00005002392) cacng8a (ENSMZEG00005002366) cacng6a (ENSMZEG00005002362) ENSMZEG00005002348 cox6b2 (ENSMZEG00005002334) slc2a3a (ENSMZEG00005002302) ENSMZEG00005002269 ENSMZEG00005002252 clcn1a (ENSMZEG00005002212) FAM131B (ENSMZEG00005002153) GAPDH (ENSMZEG00005002111) #22 IFFO1 (ENSMZEG00005002090) ##23 vamp1a (ENSMZEG00005002060) chd4a (ENSMZEG00005001706) #25 ENSMZEG00005001687 ENSMZEG00005001669 CDC42 (ENSMZEG00005001665) cdc42l (ENSMZEG00005001645) eno2 (ENSMZEG00005001608) tpi1a (ENSMZEG00005001578) gnb3b (ENSMZEG00005001568) ENSMZEG00005001551 ENSMZEG00005001540 ENSMZEG00005001527 ENSMZEG00005001514 ENSMZEG00005001502 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 408 cnot3b (ENSNBRG00000003336) ENSNBRG00000003309 ENSNBRG00000003299 dbpa (ENSNBRG00000003282) cacng7a (ENSNBRG00000003260) cacng8a (ENSNBRG00000003244) cacng6a (ENSNBRG00000003238) ENSNBRG00000003186 cox6b2 (ENSNBRG00000003154) slc2a3a (ENSNBRG00000003105) ENSNBRG00000003098 ENSNBRG00000003086 ENSNBRG00000003058 ENSNBRG00000003046 ENSNBRG00000003015 GAPDH (ENSNBRG00000002965) #22 IFFO1 (ENSNBRG00000002780) ##23 vamp1a (ENSNBRG00000002691) CHD4 (ENSNBRG00000002589) #25 CDC42 (ENSNBRG00000002551) cdc42l (ENSNBRG00000002330) ENSNBRG00000002304 tpi1a (ENSNBRG00000001907) gnb3b (ENSNBRG00000001863) ENSNBRG00000001848 ENSNBRG00000001839 Nile tilapia MODERN SPECIES 13 ENSONIG00000030112 dbpa (ENSONIG00000007041) ENSONIG00000030855 ENSONIG00000007037 cacng7a (ENSONIG00000012788) cacng8a (ENSONIG00000007032) cacng6a (ENSONIG00000007030) ENSONIG00000007028 ENSONIG00000007026 cox6b2 (ENSONIG00000040242) slc2a3a (ENSONIG00000007021) ENSONIG00000007017 ENSONIG00000036944 clcn1a (ENSONIG00000007006) ENSONIG00000007005 GAPDH (ENSONIG00000007002) #22 IFFO1 (ENSONIG00000029238) ##23 vamp1a (ENSONIG00000035566) chd4a (ENSONIG00000006992) #25 ENSONIG00000006991 cdc42l (ENSONIG00000006990) cdc42l (ENSONIG00000030755) cdc42l (ENSONIG00000032247) eno2 (ENSONIG00000006984) tpi1a (ENSONIG00000032967) gnb3b (ENSONIG00000006978) ENSONIG00000039833 ENSONIG00000028400 ENSONIG00000030117 ENSONIG00000031771 ENSONIG00000037104 Midas cichlid MODERN SPECIES 913 GAPDH (ENSACIG00000019642) #22 IFFO1 (ENSACIG00000019619) ##23 vamp1a (ENSACIG00000019603) chd4a (ENSACIG00000019310) #25 ENSACIG00000019286 cdc42l (ENSACIG00000019258) cdc42l (ENSACIG00000019248) Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000162254.a ENSGT00530000064557.b ENSGT00940000165399.a.a ENSGT00940000159109.b ENSGT01050000244961.b.h ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b ENSGT00390000007786.b.h ENSGT01060000248591.b.a ENSGT00940000164148.a.a.c.b ENSGT00940000160313 ENSGT00940000156612 ENSGT00940000165997.a ENSGT00940000167696 ENSGT00940000157383.g.a ENSGT00950000183106.a.b.a ENSGT00940000153298.i.b #22 ENSGT00510000046803.b.a.b ##23 ENSGT00940000164382.b.a ENSGT00940000155088.b.a.a #25 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.a.b.b ENSGT00950000182805.a.a.b.a.c.b ENSGT00390000013354.b.b ENSGT01000000214413.b.a.b.a.b ENSGT01030000234575.c.a.a.b ENSGT00940000167426.b ENSGT00940000167426.a ENSGT00390000014107.a.b ENSGT00940000160576 ENSGT00940000159459 ENSGT00940000162418 ENSGT00630000089917 Bicolor damselfish MODERN SPECIES 460 ENSSPAG00000014213 ENSSPAG00000014189 ENSSPAG00000014177 FAM131B (ENSSPAG00000014146) ENSSPAG00000014107 #22 IFFO1 (ENSSPAG00000014078) ##23 vamp1a (ENSSPAG00000014065) chd4a (ENSSPAG00000013983) #25 cdc42l (ENSSPAG00000013949) eno2 (ENSSPAG00000013903) tpi1a (ENSSPAG00000013875) gnb3b (ENSSPAG00000013181) ENSSPAG00000013129 ENSSPAG00000013118 ENSSPAG00000013109 ENSSPAG00000013084 ENSSPAG00000013061 ENSSPAG00000013048 RNF5 (ENSSPAG00000013024) slc44a4 (ENSSPAG00000012998) Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 109 ENSGT00940000162254.a ENSGT00530000064557.b ENSGT00940000165399.a.a ENSGT00940000159109.b ENSGT01050000244961.b.h ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b ENSGT00390000007786.b.h ENSGT01060000248591.b.a ENSGT00940000164148.a.a.c.b ENSGT00940000160313 ENSGT00940000156612 ENSGT00940000165997.a ENSGT00940000167696 ENSGT00940000157383.g.a ENSGT00950000183106.a.b.a ENSGT00940000153298.i.b #22 ENSGT00510000046803.b.a.b ##23 ENSGT00940000164382.b.a.e.a ENSGT00940000155088.b.a.a #25 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.a.b.b ENSGT00950000182805.a.a.b.a.c.b ENSGT00390000013354.b.b ENSGT01000000214413.b.a.b.a.b ENSGT01030000234575.c.a.a.b ENSGT01100000263533.b.b.a.b.b Spiny chromis MODERN SPECIES 1101 clcn1a (ENSAPOG00000017619) FAM131B (ENSAPOG00000017511) GAPDH (ENSAPOG00000017468) #22 IFFO1 (ENSAPOG00000017405) ##23 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 101 ENSGT00390000014743.i ENSGT00940000162254.a ENSGT00530000064557.b ENSGT00940000165399.a.a ENSGT00940000159109.b ENSGT01050000244961.b.h ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b ENSGT00390000007786.b.h ENSGT01060000248591.b.a ENSGT00940000164148.a.a.c.b ENSGT00940000160313 ENSGT00940000165997.a ENSGT00940000167696 ENSGT00940000157383.g.a ENSGT00950000183106.a.b.a ENSGT00940000153298.i.b #22 ENSGT00510000046803.b.a.b ##23 ENSGT00940000164382.b.a.e.a ENSGT00940000155088.b.a.a #25 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.a.b.b ENSGT00950000182805.a.a.b.a.c.b ENSGT00390000013354.b.b ENSGT01000000214413.b.a.b.a.b ENSGT01030000234575.c.a.a.b ENSGT01100000263533.b.b.a.b.b ENSGT00950000182774.b.a.b.a.b.a.a.a.b.b.c.a ENSGT00940000167426.b ENSGT00940000167426.a ENSGT00390000014107.a.b ENSGT00940000160576 ENSGT00940000159459 Clown anemonefish DUPLICATION Clown anemonefish MODERN SPECIES 2630 GAPDH (ENSAOCG00000004907) #22 IFFO1 (ENSAOCG00000004936) ##23 IFFO1 (ENSAOCG00000004952) ##23 Clown anemonefish DUPLICATION Clown anemonefish MODERN SPECIES 2508 GAPDH (ENSAOCG00000002815) #22 Clown anemonefish MODERN SPECIES 731 PHKA2 (ENSAOCG00000024162) ppef1 (ENSAOCG00000024194) RS1 (ENSAOCG00000024210) cdkl5 (ENSAOCG00000024243) SCML2 (ENSAOCG00000024259) NHS (ENSAOCG00000024274) ace2 (ENSAOCG00000001769) ENSAOCG00000024302 zgc:113276 (ENSAOCG00000024316) dmd (ENSAOCG00000024530) gtf3c3 (ENSAOCG00000024580) HECW2 (ENSAOCG00000024590) rpl31 (ENSAOCG00000024591) chst10 (ENSAOCG00000024594) MAP4K4 (ENSAOCG00000024616) GAPDH (ENSAOCG00000024626) #22 Orange clownfish DUPLICATION Orange clownfish MODERN SPECIES 8 ENSAPEG00000002498 ENSAPEG00000002480 ENSAPEG00000002458 cacng7a (ENSAPEG00000002401) cacng8a (ENSAPEG00000002370) cacng6a (ENSAPEG00000002362) ENSAPEG00000002353 cox6b2 (ENSAPEG00000002333) slc2a3a (ENSAPEG00000002296) ENSAPEG00000002278 ENSAPEG00000002257 ENSAPEG00000002220 ENSAPEG00000002197 ENSAPEG00000002174 FAM131B (ENSAPEG00000002116) GAPDH (ENSAPEG00000002063) #22 IFFO1 (ENSAPEG00000001956) ##23 ENSAPEG00000001921 vamp1a (ENSAPEG00000001906) chd4a (ENSAPEG00000001757) #25 cdc42l (ENSAPEG00000001722) ENSAPEG00000001699 eno2 (ENSAPEG00000001636) ENSAPEG00000001601 gnb3b (ENSAPEG00000001566) ENSAPEG00000001558 ENSAPEG00000001556 ENSAPEG00000001546 ENSAPEG00000001504 ENSAPEG00000001383 RNF5 (ENSAPEG00000001310) Orange clownfish MODERN SPECIES 16 bmpr2a (ENSAPEG00000009919) FAM117B (ENSAPEG00000009980) ical1 (ENSAPEG00000010018) wdr12 (ENSAPEG00000010107) nop58 (ENSAPEG00000010178) ENSAPEG00000010243 tmem47 (ENSAPEG00000010252) ENSAPEG00000010270 dmd (ENSAPEG00000010447) gtf3c3 (ENSAPEG00000011007) HECW2 (ENSAPEG00000011093) rpl31 (ENSAPEG00000011120) chst10 (ENSAPEG00000011160) MAP4K4 (ENSAPEG00000011232) ENSAPEG00000011443 GAPDH (ENSAPEG00000011459) #22 ENSAPEG00000011488 sowahcb (ENSAPEG00000011503) cep70 (ENSAPEG00000011536) adarb1a (ENSAPEG00000011629) slx9 (ENSAPEG00000011677) ENSAPEG00000011685 cnot9 (ENSAPEG00000011704) ENSAPEG00000011757 DONSON (ENSAPEG00000011848) runx1 (ENSAPEG00000011997) ENSAPEG00000012078 ENSAPEG00000012095 ENSAPEG00000012131 mgat5 (ENSAPEG00000012172) clic5a (ENSAPEG00000012257) Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000162254.a ENSGT00530000064557.b ENSGT00940000165399.a.a ENSGT00940000159109.b ENSGT01050000244961.b.h ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b ENSGT00390000007786.b.h ENSGT01060000248591.b.a ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.b.b.b ENSGT00940000164148.a.a.c.b ENSGT00940000160313 ENSGT00940000165997.a ENSGT00940000167696 ENSGT00940000157383.g.a ENSGT00950000183106.a.b.a ENSGT00940000153298.i.b #22 ENSGT00510000046803.b.a.b ##23 ENSGT00940000164382.b.a ENSGT00940000155088.b.a.a #25 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.a.b.b ENSGT00950000182805.a.a.b.a.c.b ENSGT00390000013354.b.b ENSGT01000000214413.b.a.b.a.b ENSGT01030000234575.c.a.a.b ENSGT01080000257344.a.b.b.b.b.b.b.a.b.b.a.b ENSGT01030000234589.g.a ENSGT01100000263549.j.a.g.a ENSGT01080000257344.a.b.b.b.b.b.b.b.b.a.b ENSGT00940000153770.l.a ENSGT01100000263549.j.b.h ENSGT00940000153770.l.b.b.a Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000162254.a ENSGT00530000064557.b ENSGT00940000165399.a.a ENSGT00940000159109.b ENSGT01050000244961.b.h ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b ENSGT00390000007786.b.h ENSGT01060000248591.b.a ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.b.b.b ENSGT00940000164148.a.a.c.b ENSGT00940000160313 ENSGT00940000165997.a ENSGT00940000167696 ENSGT00940000157383.g.a ENSGT00950000183106.a.b.a ENSGT00940000153298.i.b #22 ENSGT00510000046803.b.a.b ##23 ENSGT00940000164382.b.a ENSGT00940000155088.b.a.a #25 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.a.b.b ENSGT00950000182805.a.a.b.a.c.b ENSGT00390000013354.b.b ENSGT01000000214413.b.a.b.a.b ENSGT01030000234575.c.a.a.b ENSGT01080000257344.a.b.b.b.b.b.b.a.b.b.a.b ENSGT01030000234589.g.a ENSGT00940000153770.l.a ENSGT00940000153770.l.b.b.b ENSGT01100000263549.j.a.h ENSGT01100000263549.j.b.h ENSGT01080000257344.a.b.b.b.b.b.b.b.b.a.b Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000162254.a ENSGT00530000064557.b ENSGT00940000165399.a.a ENSGT00940000159109.b ENSGT01050000244961.b.h ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b ENSGT00390000007786.b.h ENSGT01060000248591.b.a ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.b.b.b ENSGT00940000164148.a.a.c.b ENSGT00940000160313 ENSGT00940000165997.a ENSGT00940000167696 ENSGT00940000157383.g.a ENSGT00950000183106.a.b.a ENSGT00940000153298.i.b #22 ENSGT00510000046803.b.a.b ##23 ENSGT00940000164382.b.a ENSGT00940000155088.b.a.a #25 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.a.b.b ENSGT00950000182805.a.a.b.a.c.b ENSGT00390000013354.b.b ENSGT01000000214413.b.a.b.a.b ENSGT01030000234575.c.a.a.b ENSGT01080000257344.a.b.b.b.b.b.b.a.b.b.a.b ENSGT01030000234589.g.a.j ENSGT00940000153770.l.a ENSGT01100000263549.j.b.g.b ENSGT01080000257344.a.b.b.b.a.a.b ENSGT01080000257344.a.b.b.a.a.b.a.b ENSGT01030000234589.g.a.i.b Ballan wrasse MODERN SPECIES 855 GAPDH (ENSLBEG00000022249) #22 ENSLBEG00000022151 ENSLBEG00000022093 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000162254.a ENSGT00530000064557.b ENSGT00940000165399.a.a ENSGT00940000159109.b ENSGT01050000244961.b.h ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b ENSGT00390000007786.b.h ENSGT01060000248591.b.a ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.b.b.b ENSGT00940000164148.a.a.c.b ENSGT00940000160313 ENSGT00940000165997.a ENSGT00940000167696 ENSGT00940000157383.g.a ENSGT00950000183106.a.b.a ENSGT00940000153298.i.b #22 ENSGT00510000046803.b.a.b ##23 ENSGT00940000164382.b.a ENSGT00940000155088.b.a.a.i.b #25 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.a.b.b ENSGT00950000182805.a.a.b.a.c.b ENSGT00390000013354.b.b ENSGT01000000214413.b.a.b.a.b ENSGT01030000234575.c.a.a.b ENSGT01080000257344.a.b.b.b.b.b.b.a.b.b.a.b ENSGT01030000234589.g.a.j ENSGT00940000153770.l.a ENSGT00940000153770.l.b.b.b ENSGT01100000263549.j.a.h ENSGT01100000263549.j.b.h ENSGT01080000257344.a.b.b.b.b.b.b.b.b.a.b Perciformes ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000014743.i ENSGT00940000162254.a ENSGT00530000064557.b ENSGT00940000165399.a.a ENSGT00940000159109.b ENSGT01050000244961.b.h ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b ENSGT00390000007786.b.h ENSGT01060000248591.b.a ENSGT00940000164148.a.a.c.b ENSGT00940000160313 ENSGT00940000165997.a ENSGT00940000167696 ENSGT00940000157383.g.a ENSGT00950000183106.a.b.a ENSGT00940000153298.i.b #22 ENSGT00990000209266 ENSGT00510000046803.b.a.b ##23 ENSGT00940000164382.b.a ENSGT00940000155088.b.a.a.i.b #25 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.a.b.b ENSGT00950000182805.a.a.b.a.c.b ENSGT00390000013354.b.b ENSGT01000000214413.b.a.b.a.b ENSGT01030000234575.c.a.a.b ENSGT00940000154869.b.d ENSGT01030000234589.g.a.j ENSGT00940000153770.l.a ENSGT01100000263549.j.b.h ENSGT01080000257344.a.b.b.b.b.b.b.b.b.a.b ENSGT01080000257344.a.b.b.b.b.a.b Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT01050000244814.b.a ENSGT00940000159441.j ENSGT00390000013183.d.b.b ENSGT00390000014743.i ENSGT00940000165399.a.a ENSGT00940000159109.b ENSGT01050000244961.b.h ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b ENSGT00390000007786.b.h ENSGT01060000248591.b.a ENSGT00940000160313 ENSGT00940000165997.a ENSGT00940000167696 ENSGT00940000157383.g.a ENSGT00950000183106.a.b.a ENSGT00940000153298.i.b #22 ENSGT00990000209266 ENSGT00510000046803.b.a.b ##23 ENSGT00940000155088.b.a.a.i.b #25 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.a.b.a.a ENSGT00950000182805.a.a.b.a.c.b ENSGT00390000013354.b.b ENSGT01000000214413.b.a.b.a.b ENSGT01030000234575.c.a.a.b ENSGT00940000154869.b.d ENSGT01030000234589.g.a.j ENSGT01100000263549.j.a.h ENSGT00940000153770.l.b.a.a ENSGT01080000257344.a.b.b.b.b.b.b.a.a.g ENSGT01030000234589.g.a.i.a.b ENSGT00390000016811.g.g.b Stickleback MODERN SPECIES 224 GAPDH (ENSGACG00000018725) #22 IFFO1 (ENSGACG00000018722) ##23 chd4a (ENSGACG00000018705) #25 cdc42l (ENSGACG00000018701) ENSGACG00000018699 ENSGACG00000018698 Lumpfish MODERN SPECIES 2 rcvrn3 (ENSCLMG00005013509) dbpa (ENSCLMG00005013513) ENSCLMG00005013514 cacng7a (ENSCLMG00005013519) ENSCLMG00005013523 ENSCLMG00005013525 ENSCLMG00005013527 cacng8a (ENSCLMG00005013528) cacng6a (ENSCLMG00005013529) ENSCLMG00005013532 slc2a3a (ENSCLMG00005013533) ENSCLMG00005013534 ENSCLMG00005001284 ENSCLMG00005001290 ENSCLMG00005001299 GAPDH (ENSCLMG00005001335) #22 ENSCLMG00005001376 IFFO1 (ENSCLMG00005001417) ##23 vamp1a (ENSCLMG00005001494) ENSCLMG00005001720 ENSCLMG00005001724 ENSCLMG00005001726 chd4a (ENSCLMG00005001787) #25 ENSCLMG00005002249 ENSCLMG00005002252 ENSCLMG00005002264 ENSCLMG00005002285 ENSCLMG00005002286 #25 ENSCLMG00005002288 #25 ENSCLMG00005002291 #25 ENSCLMG00005002293 #25 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000014743.i ENSGT00940000162254.a ENSGT00530000064557.b ENSGT00940000165399.a.a ENSGT00940000159109.b ENSGT01050000244961.b.h ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b ENSGT00390000007786.b.h ENSGT01060000248591.b.a ENSGT00940000164148.a.a.c.b ENSGT00940000160313 ENSGT00940000165997.a ENSGT00940000167696 ENSGT00940000157383.g.a ENSGT00950000183106.a.b.a ENSGT00940000153298.i.b #22 ENSGT00990000209266 ENSGT00510000046803.b.a.b ##23 ENSGT00940000164382.b.a ENSGT00940000155088.b.a.a.i.b #25 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.a.b.b ENSGT00950000182805.a.a.b.a.c.b ENSGT00390000013354.b.b ENSGT01000000214413.b.a.b.a.b ENSGT01030000234575.c.a.a.b ENSGT01100000263549.j.b.h ENSGT01030000234589.g.a.j ENSGT00940000153770.l.a ENSGT01100000263549.j.a.h ENSGT01030000234589.g.a.i.a.a ENSGT01080000257344.a.b.b.b.b.b.b.a.a.h.a Channel bull blenny MODERN SPECIES 2 ENSCGOG00000010901 ENSCGOG00000010897 dbpa (ENSCGOG00000010895) ENSCGOG00000010853 cacng7a (ENSCGOG00000010846) cacng8a (ENSCGOG00000010843) cacng6a (ENSCGOG00000010839) ENSCGOG00000010836 cox6b2 (ENSCGOG00000010819) slc2a3a (ENSCGOG00000009540) ENSCGOG00000009476 ENSCGOG00000009475 ENSCGOG00000009473 clcn1a (ENSCGOG00000008215) ENSCGOG00000008185 GAPDH (ENSCGOG00000004346) #22 IFFO1 (ENSCGOG00000017803) ##23 vamp1a (ENSCGOG00000017801) ENSCGOG00000017800 chd4a (ENSCGOG00000011371) #25 cdc42l (ENSCGOG00000011074) eno2 (ENSCGOG00000010214) tpi1a (ENSCGOG00000010145) gnb3b (ENSCGOG00000010143) ENSCGOG00000010142 ENSCGOG00000010138 ENSCGOG00000010136 ENSCGOG00000010132 ENSCGOG00000010036 ENSCGOG00000009980 ENSCGOG00000009973 Pike perch MODERN SPECIES 121 ccdc106b (ENSSLUG00000005141) cnot3b (ENSSLUG00000005216) ENSSLUG00000006333 dbpa (ENSSLUG00000006340) ENSSLUG00000006358 cacng7a (ENSSLUG00000006368) cacng8a (ENSSLUG00000006378) cacng6a (ENSSLUG00000006394) ENSSLUG00000006402 cox6b2 (ENSSLUG00000006447) slc2a3a (ENSSLUG00000006458) ENSSLUG00000006471 ENSSLUG00000006529 clcn1a (ENSSLUG00000006558) ENSSLUG00000007009 GAPDH (ENSSLUG00000007149) #22 ENSSLUG00000009276 IFFO1 (ENSSLUG00000009291) ##23 vamp1a (ENSSLUG00000009331) chd4a (ENSSLUG00000009671) #25 cdc42l (ENSSLUG00000020288) eno2 (ENSSLUG00000020328) tpi1a (ENSSLUG00000020450) gnb3b (ENSSLUG00000020458) ENSSLUG00000020465 ENSSLUG00000020472 ENSSLUG00000020477 ENSSLUG00000020481 ENSSLUG00000020483 ENSSLUG00000020487 ENSSLUG00000020490 Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00940000162254.a ENSGT00530000064557.b ENSGT00940000165399.a.a ENSGT00940000159109.b ENSGT01050000244961.b.h ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b ENSGT00390000007786.b.h ENSGT01060000248591.b.a ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.b.b.b ENSGT00940000164148.a.a.c.b ENSGT00940000160313 ENSGT00940000165997.a ENSGT00940000167696 ENSGT00940000157383.g.a ENSGT00950000183106.a.b.a ENSGT00940000153298.i.b #22 ENSGT00510000046803.b.a.b ##23 ENSGT00940000164382.b.a ENSGT00940000155088.b.a.a.i.b #25 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.a.b.b ENSGT00950000182805.a.a.b.a.c.b ENSGT00390000013354.b.b ENSGT01000000214413.b.a.b.a.b ENSGT01030000234575.c.a.a.b ENSGT00390000016811.g.g.b ENSGT00940000164041.b.b ENSGT00390000005809 ENSGT00940000156272 ENSGT00940000158932 ENSGT00390000017802.c ENSGT00950000183156.a.b.b.b.b.a.c.b Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream MODERN SPECIES 17 cnot3b (ENSSAUG00010020247) ENSSAUG00010020240 ENSSAUG00010020237 dbpa (ENSSAUG00010020235) ENSSAUG00010020231 cacng7a (ENSSAUG00010020229) cacng8a (ENSSAUG00010020227) cacng6a (ENSSAUG00010020226) ENSSAUG00010020223 ENSSAUG00010020222 cox6b2 (ENSSAUG00010020219) slc2a3a (ENSSAUG00010020170) ENSSAUG00010020163 ENSSAUG00010020160 clcn1a (ENSSAUG00010018904) GAPDH (ENSSAUG00010018830) #22 FAM131B (ENSSAUG00010018814) ENSSAUG00010018810 ENSSAUG00010018808 GAPDH (ENSSAUG00010016909) #22 ENSSAUG00010016892 ENSSAUG00010016890 ENSSAUG00010016885 vamp1a (ENSSAUG00010016878) ENSSAUG00010016876 IFFO1 (ENSSAUG00010016868) ##23 vamp1a (ENSSAUG00010016855) chd4a (ENSSAUG00010000813) #25 cdc42l (ENSSAUG00010000398) eno2 (ENSSAUG00010000343) tpi1a (ENSSAUG00010000295) Gilthead seabream MODERN SPECIES 17 ENSSAUG00010020231 cacng7a (ENSSAUG00010020229) cacng8a (ENSSAUG00010020227) cacng6a (ENSSAUG00010020226) ENSSAUG00010020223 ENSSAUG00010020222 cox6b2 (ENSSAUG00010020219) slc2a3a (ENSSAUG00010020170) ENSSAUG00010020163 ENSSAUG00010020160 clcn1a (ENSSAUG00010018904) GAPDH (ENSSAUG00010018830) #22 FAM131B (ENSSAUG00010018814) ENSSAUG00010018810 ENSSAUG00010018808 GAPDH (ENSSAUG00010016909) #22 ENSSAUG00010016892 ENSSAUG00010016890 ENSSAUG00010016885 vamp1a (ENSSAUG00010016878) ENSSAUG00010016876 IFFO1 (ENSSAUG00010016868) ##23 vamp1a (ENSSAUG00010016855) chd4a (ENSSAUG00010000813) #25 cdc42l (ENSSAUG00010000398) eno2 (ENSSAUG00010000343) tpi1a (ENSSAUG00010000295) gnb3b (ENSSAUG00010000285) ENSSAUG00010000278 ENSSAUG00010000275 ENSSAUG00010000268 Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00940000162254.a ENSGT00530000064557.b ENSGT00940000165399.a.a ENSGT00940000159109.b ENSGT01050000244961.b.h ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b ENSGT00390000007786.b.h ENSGT01060000248591.b.a ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.b.b.b ENSGT00940000164148.a.a.c.b ENSGT00940000160313 ENSGT00940000165997.a ENSGT00940000167696 ENSGT00940000157383.g.a ENSGT00950000183106.a.b.a ENSGT00940000153298.i.b #22 ENSGT00510000046803.b.a.b ##23 ENSGT00940000164382.b.a ENSGT00940000155088.b.a.a.i.b #25 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.a.b.b ENSGT00950000182805.a.a.b.a.c.b ENSGT00390000013354.b.b ENSGT01000000214413.b.a.b.a.b ENSGT01030000234575.c.a.a.b ENSGT00390000016811.g.g.b ENSGT00940000164041.b.b ENSGT00940000156272 ENSGT00940000158932 ENSGT00390000017802.c ENSGT00950000183156.a.b.b.b.b.a.c.b ENSGT00950000183108.a.d Large yellow croaker MODERN SPECIES 484 cnot3b (ENSLCRG00005023919) ENSLCRG00005023914 ENSLCRG00005023913 dbpa (ENSLCRG00005023911) ENSLCRG00005023910 cacng7a (ENSLCRG00005023909) cacng8a (ENSLCRG00005023908) cacng6a (ENSLCRG00005023907) ENSLCRG00005023906 ENSLCRG00005023905 cox6b2 (ENSLCRG00005023904) slc2a3a (ENSLCRG00005023901) ENSLCRG00005023900 ENSLCRG00005023899 clcn1a (ENSLCRG00005023892) GAPDH (ENSLCRG00005023875) #22 ENSLCRG00005023873 IFFO1 (ENSLCRG00005023872) ##23 vamp1a (ENSLCRG00005023871) chd4a (ENSLCRG00005022145) #25 cdc42l (ENSLCRG00005021221) eno2 (ENSLCRG00005021112) tpi1a (ENSLCRG00005021080) gnb3b (ENSLCRG00005021061) ENSLCRG00005021055 si:dkeyp-92c9.2 (ENSLCRG00005021052) myo1g (ENSLCRG00005020898) si:ch211-195b13.1 (ENSLCRG00005019965) eya3 (ENSLCRG00005019698) ENSLCRG00005019648 xkr8.3 (ENSLCRG00005019647) European seabass MODERN SPECIES 22 ENSDLAG00005034299 dbpa (ENSDLAG00005034022) ENSDLAG00005008780 cacng7a (ENSDLAG00005008844) cacng8a (ENSDLAG00005008862) cacng6a (ENSDLAG00005008871) ENSDLAG00005008880 ENSDLAG00005008884 ENSDLAG00005031917 slc2a3a (ENSDLAG00005008911) ENSDLAG00005009087 ENSDLAG00005009133 clcn1a (ENSDLAG00005009206) ENSDLAG00005011895 ENSDLAG00005011919 ENSDLAG00005011957 #22 ENSDLAG00005027051 ##23 vamp1a (ENSDLAG00005034920) chd4a (ENSDLAG00005012933) #25 ENSDLAG00005022362 eno2 (ENSDLAG00005022376) tpi1a (ENSDLAG00005022577) gnb3b (ENSDLAG00005022583) ENSDLAG00005022591 ENSDLAG00005022595 ENSDLAG00005018280 ENSDLAG00005031326 ENSDLAG00005032896 ENSDLAG00005034375 ENSDLAG00005002971 ENSDLAG00005034304 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000162254.a ENSGT00530000064557.b ENSGT00940000165399.a.a ENSGT00940000159109.b ENSGT01050000244961.b.h ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b ENSGT00390000007786.b.h ENSGT01060000248591.b.a ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.b.b.b ENSGT00940000164148.a.a.c.b ENSGT00940000160313 ENSGT00940000165997.a ENSGT00940000167696 ENSGT00940000157383.g.a ENSGT00950000183106.a.b.a ENSGT00940000153298.i.b #22 ENSGT00510000046803.b.a.b ##23 ENSGT00940000164382.b.a ENSGT00940000155088.b.a.a #25 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.a.b.b ENSGT00950000182805.a.a.b.a.c.b ENSGT00390000013354.b.b ENSGT01000000214413.b.a.b.a.b ENSGT01030000234575.c.a.a.b ENSGT00940000178336.d ENSGT00390000016811.g.g.b ENSGT00940000164041.b.b ENSGT00390000005809 ENSGT00940000156272 ENSGT00940000158932 ENSGT00390000017802.c Carangaria ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000014743.i ENSGT00940000162254.a ENSGT00940000177770 ENSGT00530000064557.b ENSGT00940000165399.a.a ENSGT00940000159109.b ENSGT01050000244961.b.h ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b ENSGT00390000007786.b.h ENSGT01060000248591.b.a ENSGT00940000160313 ENSGT00940000165997.a ENSGT00940000157871.h.b ENSGT00940000157383.g.a ENSGT00950000183106.a.b.a ENSGT00940000153298.i.b #22 ENSGT00510000046803.b.a.b ##23 ENSGT00940000164382.b.a ENSGT00940000155088.b.a.a #25 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.a.b.b ENSGT00950000182805.a.a.b.a.c.b ENSGT00390000013354.b.b ENSGT01000000214413.b.a.b.a.b ENSGT01030000234575.c.a.a.b ENSGT01080000257344.a.b.b.b.b.b.b.a.b.a.b ENSGT00390000016811.g.g.b ENSGT00940000164041.b.b ENSGT00390000005809 ENSGT00940000156272 ENSGT00940000158932 ENSGT00390000017802.c Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 49 ENSGT00940000162720.b.b.b ENSGT00390000013183.d.b.b ENSGT00390000014743.i ENSGT00530000064557.b ENSGT00940000165399.a.a ENSGT00940000159109.b ENSGT01050000244961.b.h ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b ENSGT00390000007786.b.h ENSGT01060000248591.b.a ENSGT00940000160313 ENSGT00940000165997.a ENSGT00940000157871.h.b ENSGT00940000157383.g.a ENSGT00950000183106.a.b.a ENSGT00940000153298.i.b #22 ENSGT00510000046803.b.a.b ##23 ENSGT00940000164382.b.a ENSGT00940000155088.b.a.a #25 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.a.b.b ENSGT00950000182805.a.a.b.a.c.b ENSGT00390000013354.b.b ENSGT01000000214413.b.a.b.a.b ENSGT01030000234575.c.a.a.b ENSGT00390000016811.g.g.b ENSGT00390000005809 ENSGT00940000156272 ENSGT00940000158932 ENSGT00390000017802.c ENSGT00950000183156.a.b.b.b.b.a.c.b ENSGT00950000183108.a.d Turbot MODERN SPECIES 14 hsd17b8 (ENSSMAG00000034900) ccdc106b (ENSSMAG00000016070) cnot3b (ENSSMAG00000016031) ENSSMAG00000023995 dbpa (ENSSMAG00000015990) ENSSMAG00000035892 cacng7a (ENSSMAG00000012206) cacng8a (ENSSMAG00000012239) cacng6a (ENSSMAG00000012253) ENSSMAG00000012266 slc2a3a (ENSSMAG00000012273) ENSSMAG00000012309 ENSSMAG00000012329 clcn1a (ENSSMAG00000012360) ENSSMAG00000012482 ENSSMAG00000012513 #22 ENSSMAG00000012550 ##23 vamp1a (ENSSMAG00000012567) ENSSMAG00000012594 #25 ENSSMAG00000036069 ENSSMAG00000032328 ENSSMAG00000034530 ENSSMAG00000034226 tmem238a (ENSSMAG00000037750) rcvrn3 (ENSSMAG00000012870) si:ch211-232m10.6 (ENSSMAG00000012886) ENSSMAG00000012924 epn1b (ENSSMAG00000012897) necap1 (ENSSMAG00000012932) ENSSMAG00000012943 ENSSMAG00000012964 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00390000013183.d.b.b ENSGT00390000014743.i ENSGT00940000162254.a ENSGT00940000177770 ENSGT00940000165399.a.a ENSGT00940000159109.b ENSGT01050000244961.b.h ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b ENSGT00390000007786.b.h ENSGT01060000248591.b.a ENSGT00940000160313 ENSGT00940000165997.a ENSGT00940000157871.h.b ENSGT00940000157383.g.a ENSGT00950000183106.a.b.a ENSGT00940000153298.i.b #22 ENSGT00510000046803.b.a.b ##23 ENSGT00940000164382.b.a ENSGT00940000155088.b.a.a #25 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.a.b.b ENSGT00950000182805.a.a.b.a.c.b ENSGT00390000013354.b.b ENSGT01000000214413.b.a.b.a.b ENSGT01030000234575.c.a.a.b ENSGT01080000257344.a.b.b.b.b.b.b.a.b.a.b ENSGT00390000016811.g.g.b ENSGT00940000164041.b.b ENSGT00390000005809 ENSGT00940000156272 ENSGT00940000158932 ENSGT00390000017802.c Seriola ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT00390000013183.d.b.b ENSGT00390000014743.i ENSGT00940000162254.a ENSGT00940000177770 ENSGT00940000165399.a.a ENSGT00940000159109.b ENSGT01050000244961.b.h ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b ENSGT00390000007786.b.h ENSGT01060000248591.b.a ENSGT00940000160313 ENSGT00940000165997.a ENSGT00940000157871.h.b ENSGT00940000157383.g.a ENSGT00950000183106.a.b.a ENSGT00940000153298.i.b #22 ENSGT00510000046803.b.a.b ##23 ENSGT00940000164382.b.a ENSGT00940000155088.b.a.a #25 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.a.b.b ENSGT00950000182805.a.a.b.a.c.b ENSGT00390000013354.b.b ENSGT01000000214413.b.a.b.a.b ENSGT01030000234575.c.a.a.b ENSGT00390000016811.g.g.b ENSGT00940000164041.b.b ENSGT00390000005809 ENSGT00940000156272 ENSGT00940000158932 ENSGT00390000017802.c ENSGT00950000183156.a.b.b.b.b.a.c.b Greater amberjack MODERN SPECIES 122 cnot3b (ENSSDUG00000003428) ENSSDUG00000003416 ENSSDUG00000003409 dbpa (ENSSDUG00000003384) ENSSDUG00000003334 cacng7a (ENSSDUG00000003295) cacng8a (ENSSDUG00000003279) cacng6a (ENSSDUG00000003265) ENSSDUG00000003254 ENSSDUG00000003246 slc2a3a (ENSSDUG00000003222) ENSSDUG00000003193 ENSSDUG00000003169 clcn1a (ENSSDUG00000003093) FAM131B (ENSSDUG00000003068) GAPDH (ENSSDUG00000003034) #22 IFFO1 (ENSSDUG00000002985) ##23 vamp1a (ENSSDUG00000002970) chd4a (ENSSDUG00000002891) #25 cdc42l (ENSSDUG00000002871) eno2 (ENSSDUG00000002844) tpi1a (ENSSDUG00000002818) gnb3b (ENSSDUG00000002466) ENSSDUG00000002437 ENSSDUG00000002422 ENSSDUG00000002407 Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 2931 ccdc106b (ENSSLDG00000014360) cnot3b (ENSSLDG00000014376) ENSSLDG00000014412 ENSSLDG00000014436 dbpa (ENSSLDG00000014452) ENSSLDG00000014468 cacng7a (ENSSLDG00000014490) cacng8a (ENSSLDG00000014509) cacng6a (ENSSLDG00000014534) ENSSLDG00000014553 slc2a3a (ENSSLDG00000014566) ENSSLDG00000014594 ENSSLDG00000014627 clcn1a (ENSSLDG00000014698) ENSSLDG00000014745 GAPDH (ENSSLDG00000014809) #22 IFFO1 (ENSSLDG00000014839) ##23 Barramundi perch MODERN SPECIES 207 ENSLCAG00010024509 ENSLCAG00010024517 dbpa (ENSLCAG00010024520) ENSLCAG00010024525 ENSLCAG00010024543 cacng7a (ENSLCAG00010024573) cacng8a (ENSLCAG00010024575) cacng6a (ENSLCAG00010024577) ENSLCAG00010024579 slc2a3a (ENSLCAG00010024586) ENSLCAG00010024590 ENSLCAG00010024591 ENSLCAG00010024593 clcn1a (ENSLCAG00010024642) FAM131B (ENSLCAG00010024750) GAPDH (ENSLCAG00010024811) #22 IFFO1 (ENSLCAG00010024916) ##23 Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000162254.a ENSGT00530000064557.b ENSGT00940000165399.a.a ENSGT00940000159109.b ENSGT01050000244961.b.h ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b ENSGT00390000007786.b.h ENSGT01060000248591.b.a ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.b.b.b ENSGT00940000164148.a.a.c.b ENSGT00940000160313 ENSGT00940000165997.a ENSGT00940000167696 ENSGT00940000157383.g.a ENSGT00950000183106.a.b.a ENSGT00940000153298.i.b #22 ENSGT00510000046803.b.a.b ##23 ENSGT00940000164382.b.a ENSGT00940000155088.b.a.a #25 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.a.b.b ENSGT00950000182805.a.a.b.a.c.b ENSGT00390000013354.b.b ENSGT01000000214413.b.a.b.a.b ENSGT01030000234575.c.a.a.b ENSGT01080000257344.a.b.b.b.b.b.b.b.b.a.b ENSGT01020000230438.B.a.a ENSGT00530000064569.a.d ENSGT00530000064569.a.c ENSGT00940000160076 ENSGT01100000263475.g.b.i.b.b.a.b.a.b ENSGT01100000263475.g.b.i.b.b.a.a Zig-zag eel MODERN SPECIES 2 ccdc106b (ENSMAMG00000019371) cnot3b (ENSMAMG00000019357) ENSMAMG00000025432 ENSMAMG00000026196 dbpa (ENSMAMG00000019316) ENSMAMG00000019291 CACNG7 (ENSMAMG00000027363) cacng8a (ENSMAMG00000019257) cacng6a (ENSMAMG00000019250) ENSMAMG00000019212 slc2a3a (ENSMAMG00000019203) ENSMAMG00000019190 ENSMAMG00000019183 clcn1a (ENSMAMG00000019173) ENSMAMG00000019156 ENSMAMG00000019129 #22 ENSMAMG00000028318 ##23 ENSMAMG00000019108 ##23 vamp1a (ENSMAMG00000019095) chd4a (ENSMAMG00000018954) #25 ENSMAMG00000028681 eno2 (ENSMAMG00000018899) tpi1a (ENSMAMG00000018869) gnb3b (ENSMAMG00000018850) ENSMAMG00000018842 ENSMAMG00000028119 ENSMAMG00000028302 ENSMAMG00000019835 ENSMAMG00000018800 ENSMAMG00000024962 ENSMAMG00000018792 Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00940000162254.a ENSGT00530000064557.b ENSGT00940000165399.a.a ENSGT00940000159109.b ENSGT01050000244961.b.h ENSGT01050000244893.c.b.a.g.b ENSGT00390000007786.b.h ENSGT01060000248591.b.a ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.b.b.b ENSGT00940000164148.a.a.c.b ENSGT00940000160313 ENSGT00940000165997.a ENSGT00940000167696 ENSGT00940000157383.g.a ENSGT00950000183106.a.b.a ENSGT00940000153298.i.b #22 ENSGT00510000046803.b.a.b ##23 ENSGT00940000164382.b.a ENSGT00940000155088.b.a.a #25 ENSGT00940000153675.a.a.a.a.a.b.b ENSGT00950000182805.a.a.b.a.c.b ENSGT01000000214413.b.a.b.a.b ENSGT01030000234575.c.a.a.b ENSGT01080000257344.a.b.b.b.b.b.b.b.b.a.b ENSGT01020000230438.B.a.a ENSGT00530000064569.a.d ENSGT00530000064569.a.c ENSGT00940000160076 ENSGT01100000263475.g.b.i.b.b.a.b.a.b Climbing perch MODERN SPECIES 2 ENSATEG00000028751 dbpa (ENSATEG00000015850) ENSATEG00000009553 ENSATEG00000015893 cacng7a (ENSATEG00000015926) cacng8a (ENSATEG00000029552) cacng6a (ENSATEG00000027694) ENSATEG00000016002 ENSATEG00000030087 ENSATEG00000016013 slc2a3a (ENSATEG00000016028) ENSATEG00000016055 ENSATEG00000016101 clcn1a (ENSATEG00000016129) ENSATEG00000016204 ENSATEG00000016228 #22 ENSATEG00000027358 ##23 vamp1a (ENSATEG00000016306) ENSATEG00000016428 #25 ENSATEG00000028693 ENSATEG00000027696 ENSATEG00000028558 ENSATEG00000016653 ENSATEG00000016674 ENSATEG00000028381 ENSATEG00000030135 ENSATEG00000029008 ENSATEG00000025458 ENSATEG00000016706 ENSATEG00000016762 ENSATEG00000026085 Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 2 ENSMMDG00005023873 ENSMMDG00005023870 ENSMMDG00005023793 ENSMMDG00005023788 cacng7a (ENSMMDG00005023785) cacng8a (ENSMMDG00005023781) cacng6a (ENSMMDG00005023775) ENSMMDG00005023771 cox6b2 (ENSMMDG00005023766) slc2a3a (ENSMMDG00005023763) ENSMMDG00005023760 ENSMMDG00005023757 clcn1a (ENSMMDG00005023754) ENSMMDG00005023752 ENSMMDG00005023751 GAPDH (ENSMMDG00005023310) #22 IFFO1 (ENSMMDG00005023259) ##23 vamp1a (ENSMMDG00005023253) chd4a (ENSMMDG00005008844) #25 cdc42l (ENSMMDG00005008593) eno2 (ENSMMDG00005008148) tpi1a (ENSMMDG00005008138) gnb3b (ENSMMDG00005008136) ENSMMDG00005008135 GRIK5 (ENSMMDG00005008125) RING1 (ENSMMDG00005008119) rps18 (ENSMMDG00005008103) VPS52 (ENSMMDG00005008070) ENSMMDG00005008064 ENSMMDG00005008060 ENSMMDG00005008054 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.j #22 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.j #22 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.j #22 Otophysi ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.j #22 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.j #22 Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.j #22 Electric eel MODERN SPECIES 59 epn1b (ENSEEEG00000008485) necap1 (ENSEEEG00000008482) ENSEEEG00000008475 clcn1a (ENSEEEG00000007829) FAM131B (ENSEEEG00000007815) ing4 (ENSEEEG00000007813) #28 ENSEEEG00000007706 #22 IFFO1 (ENSEEEG00000007691) ##23 vamp1a (ENSEEEG00000007690) ndufv1 (ENSEEEG00000007653) ENSEEEG00000007649 clk2a (ENSEEEG00000006851) ENSEEEG00000006829 setdb1a (ENSEEEG00000006828) lrrc71 (ENSEEEG00000006827) ENSEEEG00000006823 scamp3 (ENSEEEG00000006822) crabp2b (ENSEEEG00000006804) mrps21 (ENSEEEG00000006801) rprd2a (ENSEEEG00000006790) celf3a (ENSEEEG00000006785) cers2a (ENSEEEG00000006778) Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.j #22 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.j #22 Cod MODERN SPECIES 14 cnot3b (ENSGMOG00000027580) ENSGMOG00000030805 ENSGMOG00000033068 dbpa (ENSGMOG00000022826) ENSGMOG00000031882 ENSGMOG00000005608 ENSGMOG00000023309 ENSGMOG00000035093 ENSGMOG00000026777 slc2a3a (ENSGMOG00000023964) ENSGMOG00000036562 ENSGMOG00000027191 ENSGMOG00000030329 ENSGMOG00000035267 ENSGMOG00000022208 ENSGMOG00000015445 #22 ENSGMOG00000026526 ##23 ENSGMOG00000037043 ENSGMOG00000017923 #25 ENSGMOG00000025818 ENSGMOG00000028858 ENSGMOG00000024518 ENSGMOG00000031224 ENSGMOG00000034582 ENSGMOG00000027523 psmb8a (ENSGMOG00000005704) psmb13a (ENSGMOG00000032447) psmb12 (ENSGMOG00000005681) psmb9a (ENSGMOG00000005664) tap2a (ENSGMOG00000005729) ENSGMOG00000012804 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.j #22 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.j #22 Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 59 ENSHCOG00000013063 #22 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.j #22 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.j #22 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.j #22 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.j #22 Bicolor damselfish MODERN SPECIES 191 GAPDH (ENSSPAG00000001797) #22 Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.j #22 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.j #22 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.j #22 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.j #22 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298.j #22 Chinook salmon MODERN SPECIES 1929 ENSOTSG00005018969 #22 ENSOTSG00005018967 Huchen DUPLICATION Huchen MODERN SPECIES 10961 ENSHHUG00000019259 #22 ENSHHUG00000019306 #22 Huchen MODERN SPECIES 10961 ENSHHUG00000019306 #22 ENSHHUG00000019259 #22 Cyclostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298 #22 Hagfish DUPLICATION Hagfish MODERN SPECIES 367 ENSEBUG00000006141 ENSEBUG00000010768 ENSEBUG00000008715 ENSEBUG00000013868 ENSEBUG00000005091 mfn2 (ENSEBUG00000014863) alpl (ENSEBUG00000007697) rbp7b (ENSEBUG00000013450) ENSEBUG00000002397 ENSEBUG00000004716 ENSEBUG00000009189 ENSEBUG00000016877 ENSEBUG00000009530 ENSEBUG00000002976 ENSEBUG00000010741 gapdh (ENSEBUG00000006892) #22 ENSEBUG00000010165 ENSEBUG00000015498 ddx19a (ENSEBUG00000001119) ENSEBUG00000007707 emg1 (ENSEBUG00000008287) ENSEBUG00000016800 ENSEBUG00000009113 #14 cdk11b (ENSEBUG00000014440) CHD3 (ENSEBUG00000008310) ccnl1a (ENSEBUG00000013214) gabarapa (ENSEBUG00000015205) ENSEBUG00000011617 cxxc1a (ENSEBUG00000009187) ENSEBUG00000000539 ENSEBUG00000015889 Hagfish MODERN SPECIES 367 kdsr (ENSEBUG00000012052) ENSEBUG00000003505 ENSEBUG00000003233 rab5if (ENSEBUG00000005833) ENSEBUG00000008361 ENSEBUG00000011675 ENSEBUG00000008226 ENSEBUG00000009917 ENSEBUG00000001607 ENSEBUG00000012638 gmds (ENSEBUG00000004163) ENSEBUG00000012210 ENSEBUG00000009957 ENSEBUG00000015300 ENSEBUG00000015196 gapdh (ENSEBUG00000016902) #22 ENSEBUG00000002990 ENSEBUG00000003219 ENSEBUG00000009872 ENSEBUG00000006141 ENSEBUG00000010768 ENSEBUG00000008715 ENSEBUG00000013868 ENSEBUG00000005091 mfn2 (ENSEBUG00000014863) alpl (ENSEBUG00000007697) rbp7b (ENSEBUG00000013450) ENSEBUG00000002397 ENSEBUG00000004716 ENSEBUG00000009189 ENSEBUG00000016877 Lamprey DUPLICATION Lamprey MODERN SPECIES 5971 gapdh (ENSPMAG00000010298) #22 Lamprey MODERN SPECIES 2863 gapdh (ENSPMAG00000009321) #22 Ciona ANCESTRAL SPECIES 1409 ENSGT00940000153298 #22 ENSGT00940000155581.A.a.a Ciona savignyi DUPLICATION Ciona savignyi MODERN SPECIES 40 ENSCSAVG00000007052 ENSCSAVG00000007056 ENSCSAVG00000007070 ENSCSAVG00000007072 ENSCSAVG00000007075 ENSCSAVG00000007253 ENSCSAVG00000007377 ENSCSAVG00000007380 ENSCSAVG00000007390 ENSCSAVG00000007391 ENSCSAVG00000007398 ENSCSAVG00000007411 ENSCSAVG00000007427 ENSCSAVG00000007434 ENSCSAVG00000007437 ENSCSAVG00000007442 #22 ENSCSAVG00000007457 ENSCSAVG00000007462 ENSCSAVG00000007468 ENSCSAVG00000007471 ENSCSAVG00000007474 ENSCSAVG00000007476 ENSCSAVG00000007480 ENSCSAVG00000007482 ENSCSAVG00000007487 ENSCSAVG00000007490 ENSCSAVG00000007495 ENSCSAVG00000007496 ENSCSAVG00000007502 ENSCSAVG00000007510 ENSCSAVG00000007511 Ciona savignyi MODERN SPECIES 44 ENSCSAVG00000003364 ENSCSAVG00000003372 ENSCSAVG00000003374 ENSCSAVG00000003375 ENSCSAVG00000003615 ENSCSAVG00000003624 ENSCSAVG00000003630 ENSCSAVG00000003635 ENSCSAVG00000003640 ENSCSAVG00000003644 ENSCSAVG00000003658 ENSCSAVG00000003666 ENSCSAVG00000003859 ENSCSAVG00000003870 ENSCSAVG00000004352 ENSCSAVG00000004357 #22 ENSCSAVG00000004367 ENSCSAVG00000004509 ENSCSAVG00000004515 ENSCSAVG00000004566 ENSCSAVG00000004574 ENSCSAVG00000004675 ENSCSAVG00000004860 ENSCSAVG00000004868 ENSCSAVG00000004880 ENSCSAVG00000004883 ENSCSAVG00000004886 ENSCSAVG00000004908 ENSCSAVG00000004924 ENSCSAVG00000004929 ENSCSAVG00000004960 Ciona intestinalis MODERN SPECIES 2 ENSCING00000020986 ENSCING00000019736 ENSCING00000021526 ENSCING00000022627 ENSCING00000017945 ENSCING00000020921 ENSCING00000020016 ENSCING00000023027 ENSCING00000020685 ENSCING00000020492 ENSCING00000018049 ENSCING00000021097 ENSCING00000020728 ENSCING00000024368 ENSCING00000019211 ENSCING00000024528 #22 ENSCING00000020583 ENSCING00000019557 ENSCING00000024931 ENSCING00000022105 ENSCING00000018854 ENSCING00000021198 ENSCING00000019636 ENSCING00000022041 ENSCING00000021052 ENSCING00000021934 ENSCING00000021859 nf45 (ENSCING00000003447) ENSCING00000003455 ENSCING00000018505 ENSCING00000024130 Ecdysozoa ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153298 #22 Caenorhabditis elegans DUPLICATION Caenorhabditis elegans DUPLICATION Caenorhabditis elegans MODERN SPECIES 6 F28B4.3 (WBGene00017892) rgl-1 (WBGene00017891) F28B4.4 (WBGene00017893) F28B4.1 (WBGene00017890) fax-1 (WBGene00001400) klp-4 (WBGene00002217) C15C7.6 (WBGene00015792) pfut-1 (WBGene00015793) syx-6 (WBGene00015789) gcc-1 (WBGene00002220) bbln-1 (WBGene00015791) C15C7.4 (WBGene00015790) K10B3.1 (WBGene00019609) spc-1 (WBGene00004951) mai-1 (WBGene00003124) gpd-2 (WBGene00001684) #22 gpd-3 (WBGene00001685) #22 gpcp-1 (WBGene00019612) K10B3.5 (WBGene00019611) ztf-13 (WBGene00018704) sec-3 (WBGene00018703) wrt-2 (WBGene00006948) pccb-1 (WBGene00018701) F52E4.5 (WBGene00018702) twk-16 (WBGene00006670) ceh-31 (WBGene00000452) ceh-30 (WBGene00000451) rsef-1 (WBGene00016344) twk-26 (WBGene00006679) cnnm-3 (WBGene00016343) M02F4.2 (WBGene00019736) Caenorhabditis elegans MODERN SPECIES 6 rgl-1 (WBGene00017891) F28B4.4 (WBGene00017893) F28B4.1 (WBGene00017890) fax-1 (WBGene00001400) klp-4 (WBGene00002217) C15C7.6 (WBGene00015792) pfut-1 (WBGene00015793) syx-6 (WBGene00015789) gcc-1 (WBGene00002220) bbln-1 (WBGene00015791) C15C7.4 (WBGene00015790) K10B3.1 (WBGene00019609) spc-1 (WBGene00004951) mai-1 (WBGene00003124) gpd-2 (WBGene00001684) #22 gpd-3 (WBGene00001685) #22 gpcp-1 (WBGene00019612) K10B3.5 (WBGene00019611) ztf-13 (WBGene00018704) sec-3 (WBGene00018703) wrt-2 (WBGene00006948) pccb-1 (WBGene00018701) F52E4.5 (WBGene00018702) twk-16 (WBGene00006670) ceh-31 (WBGene00000452) ceh-30 (WBGene00000451) rsef-1 (WBGene00016344) twk-26 (WBGene00006679) cnnm-3 (WBGene00016343) M02F4.2 (WBGene00019736) clec-265 (WBGene00019738) Caenorhabditis elegans DUPLICATION Caenorhabditis elegans MODERN SPECIES 1 ZK945.4 (WBGene00014166) ZK945.6 (WBGene00014168) ZK945.7 (WBGene00014169) ZK945.8 (WBGene00014170) lov-1 (WBGene00003058) F27E5.7 (WBGene00044035) F27E5.8 (WBGene00044027) F27E5.5 (WBGene00009194) F27E5.9 (WBGene00206354) phg-1 (WBGene00004017) asah-2 (WBGene00009192) F27E5.3 (WBGene00009193) pax-3 (WBGene00003939) nlp-63 (WBGene00044028) daf-19 (WBGene00000914) gpd-4 (WBGene00001686) #22 wbp-11 (WBGene00009364) F33H1.4 (WBGene00009365) srd-1 (WBGene00005079) srd-2 (WBGene00005080) cdc-25.4 (WBGene00000389) R05H5.7 (WBGene00011041) srb-6 (WBGene00005071) R05H5.3 (WBGene00011038) R05H5.4 (WBGene00011039) arv-1 (WBGene00011040) T01E8.1 (WBGene00011331) ref-1 (WBGene00004334) plc-3 (WBGene00004038) srh-135 (WBGene00005352) T01E8.8 (WBGene00011335) Caenorhabditis elegans MODERN SPECIES 1 M02G9.4 (WBGene00194935) M02G9.2 (WBGene00010831) M02G9.1 (WBGene00010830) pro-2 (WBGene00007413) C07E3.10 (WBGene00007420) stip-1 (WBGene00007412) C07E3.9 (WBGene00007419) C07E3.8 (WBGene00007418) C07E3.3 (WBGene00007414) C07E3.4 (WBGene00007415) ceh-57 (WBGene00007416) ceh-58 (WBGene00007417) ztf-27 (WBGene00011661) T09F3.2 (WBGene00011662) T09F3.7 (WBGene00303079) gpd-1 (WBGene00001683) #22 T09F3.4 (WBGene00011663) T09F3.5 (WBGene00011664) E04D5.5 (WBGene00008484) eif-2A (WBGene00008480) E04D5.2 (WBGene00008481) cut-4 (WBGene00008482) E04D5.4 (WBGene00008483) ZK673.1 (WBGene00014057) ZK673.2 (WBGene00014058) lin-56 (WBGene00003038) ZK673.4 (WBGene00014060) ZK673.11 (WBGene00014065) ZK673.5 (WBGene00014061) ZK673.6 (WBGene00014062) sdz-37 (WBGene00014064) Fruitfly DUPLICATION Fruitfly DUPLICATION Fruitfly MODERN SPECIES 17 CG30377 (FBgn0050377) Dgk (FBgn0085390) Atg10 (FBgn0040780) CG12822 (FBgn0033229) Prosalpha1R (FBgn0050382) CG18853 (FBgn0042173) Prosalpha1 (FBgn0263121) phr (FBgn0003082) CG30383 (FBgn0050383) cathD (FBgn0029093) puml (FBgn0033226) TTLL12 (FBgn0033225) sax (FBgn0003317) Nop17l (FBgn0033224) PolZ1 (FBgn0002891) Gapdh1 (FBgn0001091) #22 CG12824 (FBgn0033222) CG12825 (FBgn0033221) CanB2 (FBgn0015614) cn (FBgn0000337) CG46385 (FBgn0286778) Gdap2 (FBgn0042135) CG1946 (FBgn0033216) Dgat2 (FBgn0033215) CG1941 (FBgn0033214) tor (FBgn0003733) CG34216 (FBgn0085245) CG30496 (FBgn0050496) Coq9 (FBgn0050493) LRR (FBgn0033212) U2A (FBgn0033210) Fruitfly MODERN SPECIES 26 CG15602 (FBgn0030694) PGRP-LE (FBgn0030695) sd (FBgn0003345) CG8509 (FBgn0030696) Chc (FBgn0000319) CG8565 (FBgn0030697) ArgRS (FBgn0027093) CG8578 (FBgn0030699) sun (FBgn0014391) UBL3 (FBgn0026076) CG15914 (FBgn0030700) Myb (FBgn0002914) CG46440 (FBgn0287210) AlkB (FBgn0065035) Gbeta13F (FBgn0001105) Gapdh2 (FBgn0001092) #22 CG16952 (FBgn0030701) tay (FBgn0260938) MSBP (FBgn0030703) CG15916 (FBgn0030704) shi (FBgn0003392) CycD (FBgn0010315) Lrp4 (FBgn0030706) CG8916 (FBgn0030707) Lcch3 (FBgn0010240) Ranbp16 (FBgn0053180) Stim (FBgn0045073) CG8924 (FBgn0030710) Rrp47 (FBgn0030711) mmd (FBgn0259110) Or13a (FBgn0030715) Fruitfly MODERN SPECIES 17 CG43371 (FBgn0263114) CG43327 (FBgn0263032) CG43328 (FBgn0263033) RhoGEF2 (FBgn0023172) Dark (FBgn0263864) CG8963 (FBgn0034181) Ehbp1 (FBgn0034180) CG6805 (FBgn0034179) NiPp1 (FBgn0026402) AsnRS-m (FBgn0034177) ste24a (FBgn0034176) ste24b (FBgn0034175) ste24c (FBgn0050462) CG30461 (FBgn0050461) Cbp53E (FBgn0004580) CG9010 (FBgn0034173) #22 CG6665 (FBgn0034172) PIG-V (FBgn0265174) Ufm1 (FBgn0085220) mute (FBgn0085444) Vha16-4 (FBgn0262513) CG34190 (FBgn0085219) CG15614 (FBgn0034168) CG43789 (FBgn0264330) CG43788 (FBgn0264329) Pkc53E (FBgn0003091) inaC (FBgn0004784) CG6472 (FBgn0034166) CG8910 (FBgn0025833) CG6435 (FBgn0034165) CG6429 (FBgn0046999)