Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a #22 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a #22 Amniota ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a #22 Mammalia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a #22 Theria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a #22 Eutheria DUPLICATION Eutheria DUPLICATION Eutheria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000183159.a #8 ENSGT00940000157306 #9 ENSGT00390000000002.a.a.a #10 ENSGT00940000157352 ENSGT00940000156979 #11 ENSGT00940000156077 #12 ENSGT00940000160078 #13 ENSGT00940000160604 #14 ENSGT01000000219986 ENSGT00940000155155 #15 ENSGT00670000098059 #16 ENSGT00390000018294 #18 ENSGT00390000015355 #20 ENSGT00390000006234 #21 ENSGT00390000015224.d.l ##22 ENSGT00390000015224.c.a.a.a #22 ENSGT00940000157489 #23 ENSGT00730000111066 #24 ENSGT00590000083165 #25 ENSGT00940000155358 #26 ENSGT00390000017929 #27 ENSGT00390000010054.b #28 ENSGT00940000162201 #29 ENSGT00940000162884 #30 ENSGT00940000163662 #31 ENSGT00940000157456 #32 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(ENSBIXG00005013631) #25 ENSBIXG00005001670 KLHL5 (ENSBIXG00005001689) #26 TMEM156 (ENSBIXG00005013809) #27 FAM114A1 (ENSBIXG00005013840) #28 TLR6 (ENSBIXG00005013851) #29 TLR1 (ENSBIXG00005013874) #30 TLR10 (ENSBIXG00005013883) #31 KLF3 (ENSBIXG00005013914) #32 TBC1D1 (ENSBIXG00005006366) ##33 ENSBIXG00005001823 #34 PGM2 (ENSBIXG00005014080) #35 RELL1 (ENSBIXG00005014109) #36 Bos_a ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000011368 ENSGT00940000159958 #7 ENSGT00950000183159.a #8 ENSGT00940000157306 #9 ENSGT00390000000002.a.a.a #10 ENSGT00940000157352 ENSGT00940000156979 #11 ENSGT00940000156077 #12 ENSGT00940000160078 #13 ENSGT00940000160604 #14 ENSGT00940000155155 #15 ENSGT00670000098059 #16 ENSGT00390000018294 #18 ENSGT00390000015355 #20 ENSGT00390000006234 #21 ENSGT00390000015224.c.a.a.a.t.a.a.c #22 ENSGT00940000157489 #23 ENSGT00730000111066 #24 ENSGT00590000083165 #25 ENSGT00940000155358 #26 ENSGT00390000017929 #27 ENSGT00390000010054.b #28 ENSGT00940000162201 #29 ENSGT00940000162884 #30 ENSGT00940000163662 #31 ENSGT00940000157456 #32 ENSGT00940000157949.c.b ##33 ENSGT00940000157949.c.a ##33 ENSGT01030000235076 ENSGT00940000156247 #35 ENSGT00940000153446.a.a.f Domestic yak MODERN SPECIES 25 ENSBGRG00000002669 APBB2 (ENSBGRG00000002693) #10 ENSBGRG00000002737 NSUN7 (ENSBGRG00000002761) RBM47 (ENSBGRG00000002798) #11 CHRNA9 (ENSBGRG00000002828) #12 RHOH (ENSBGRG00000002839) #13 N4BP2 (ENSBGRG00000002859) #14 ENSBGRG00000002884 PDS5A (ENSBGRG00000002901) #15 UBE2K (ENSBGRG00000002976) #16 ENSBGRG00000003067 SMIM14 (ENSBGRG00000003070) #18 UGDH (ENSBGRG00000003085) #20 LIAS (ENSBGRG00000003188) #21 ENSBGRG00000003539 #22 KLB (ENSBGRG00000003576) #23 RFC1 (ENSBGRG00000003610) #24 WDR19 (ENSBGRG00000003750) #25 KLHL5 (ENSBGRG00000004023) #26 TMEM156 (ENSBGRG00000004170) #27 FAM114A1 (ENSBGRG00000004223) #28 TLR6 (ENSBGRG00000004251) #29 TLR1 (ENSBGRG00000004271) #30 TLR10 (ENSBGRG00000004282) #31 KLF3 (ENSBGRG00000004311) #32 ENSBGRG00000004364 ##33 ENSBGRG00000004393 ##33 ENSBGRG00000004450 PGM2 (ENSBGRG00000004476) #35 ENSBGRG00000004557 Bos ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000153680.a ENSGT01100000263480.a.a.a.b.b.a ENSGT00390000010564 ENSGT00390000011073 ENSGT01030000234629.D ENSGT00940000157975 ENSGT00390000016356 ENSGT00390000017679 ENSGT00950000182988.a.a ENSGT00940000159865 ENSGT00390000003197.i.a.u.a ENSGT00390000001143 ENSGT00950000183090.C ENSGT00940000159265 ENSGT00940000159409 ENSGT00390000015224.c.a.a.a.t.a.a.d #22 ENSGT00940000156929 ENSGT00510000046981 ENSGT00390000004757 ENSGT00940000156389.a ENSGT00940000158154 ENSGT00940000161593 ENSGT00940000156442 ENSGT00390000018718 ENSGT00940000155941.A ENSGT00940000162953 ENSGT00940000161771 ENSGT00940000163072 ENSGT00940000159619.a ENSGT00550000074851.n ENSGT00940000159448 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000153680.a ENSGT01100000263480.a.a.a.b.b.a ENSGT00390000010564 ENSGT00390000011073 ENSGT01030000234629.D ENSGT00940000157975 ENSGT00390000016356 ENSGT00390000017679 ENSGT00950000182988.a.a ENSGT00940000159865 ENSGT00390000003197.i.a.u.a ENSGT00390000001143 ENSGT00950000183090.C ENSGT00940000159265 ENSGT00940000159409 ENSGT00390000015224.c.a.a.a.t.a.a.d #22 ENSGT00940000156929 ENSGT00510000046981 ENSGT01100000263481.n.a.b.a.a.a.b.b.b.a.b.a ENSGT00390000004757 ENSGT00940000156389.a ENSGT00940000158154 ENSGT00940000161593 ENSGT00940000156442 ENSGT00390000018718 ENSGT00940000155941.A ENSGT00940000162953 ENSGT00940000161771 ENSGT00940000163072 ENSGT00940000159619.a ENSGT00550000074851.n Cow MODERN SPECIES SMCO1 (ENSBTAG00000013319) WDR53 (ENSBTAG00000014660) FBXO45 (ENSBTAG00000006388) NRROS (ENSBTAG00000009614) CEP19 (ENSBTAG00000013192) ENSBTAG00000049165 PIGX (ENSBTAG00000048195) PAK2 (ENSBTAG00000047856) SENP5 (ENSBTAG00000032674) NCBP2 (ENSBTAG00000008873) NCBP2AS2 (ENSBTAG00000048390) PIGZ (ENSBTAG00000011659) MELTF (ENSBTAG00000002998) DLG1 (ENSBTAG00000020378) ENSBTAG00000048826 ENSBTAG00000048225 #22 BDH1 (ENSBTAG00000000448) APOD (ENSBTAG00000023600) ENSBTAG00000050331 PPP1R2 (ENSBTAG00000006724) ACAP2 (ENSBTAG00000003378) ENSBTAG00000054986 XXYLT1 (ENSBTAG00000014564) FAM43A (ENSBTAG00000008462) LSG1 (ENSBTAG00000008461) TMEM44 (ENSBTAG00000002394) ATP13A3 (ENSBTAG00000013204) GP5 (ENSBTAG00000013203) LRRC15 (ENSBTAG00000038600) CPN2 (ENSBTAG00000032656) HES1 (ENSBTAG00000000569) Bos_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000018687 ENSGT00940000153680.a ENSGT01100000263480.a.a.a.b.b.a ENSGT00390000010564 ENSGT00390000011073 ENSGT01030000234629.D ENSGT00940000157975 ENSGT00390000016356 ENSGT00390000017679 ENSGT00950000182988.a.a ENSGT00940000159865 ENSGT00390000003197.i.a.u.a ENSGT00950000183090.C ENSGT00940000159265 ENSGT00940000159409 ENSGT00390000015224.c.a.a.a.t.a.a.d #22 ENSGT00940000156929 ENSGT00510000046981 ENSGT00390000004757 ENSGT00940000156389.a ENSGT00940000158154 ENSGT00940000161593 ENSGT00940000156442 ENSGT00390000018718 ENSGT00940000155941.A ENSGT00940000162953 ENSGT00940000161771 ENSGT00940000163072 ENSGT00940000159619.a ENSGT00550000074851.n ENSGT00940000159448 Domestic yak MODERN SPECIES RNF168 (ENSBGRG00000018769) ENSBGRG00000018793 SMCO1 (ENSBGRG00000018804) WDR53 (ENSBGRG00000018865) FBXO45 (ENSBGRG00000018893) NRROS (ENSBGRG00000018922) CEP19 (ENSBGRG00000018942) PIGX (ENSBGRG00000018965) ENSBGRG00000019060 PAK2 (ENSBGRG00000019104) SENP5 (ENSBGRG00000019330) NCBP2 (ENSBGRG00000019513) ENSBGRG00000019688 MELTF (ENSBGRG00000019730) DLG1 (ENSBGRG00000020056) ENSBGRG00000022832 #22 BDH1 (ENSBGRG00000022869) APOD (ENSBGRG00000022918) ENSBGRG00000022948 ACAP2 (ENSBGRG00000023053) XXYLT1 (ENSBGRG00000023443) FAM43A (ENSBGRG00000023485) LSG1 (ENSBGRG00000023529) TMEM44 (ENSBGRG00000023581) ATP13A3 (ENSBGRG00000023744) GP5 (ENSBGRG00000024310) LRRC15 (ENSBGRG00000024363) CPN2 (ENSBGRG00000024371) HES1 (ENSBGRG00000024386) ENSBGRG00000024652 ATP13A4 (ENSBGRG00000000183) Wild yak MODERN SPECIES 941 RNF168 (ENSBMUG00000021322) SMCO1 (ENSBMUG00000021331) WDR53 (ENSBMUG00000021347) FBXO45 (ENSBMUG00000021374) NRROS (ENSBMUG00000021382) ENSBMUG00000021393 CEP19 (ENSBMUG00000021416) PIGX (ENSBMUG00000021454) PAK2 (ENSBMUG00000021499) ENSBMUG00000021508 SENP5 (ENSBMUG00000021526) NCBP2 (ENSBMUG00000021541) ENSBMUG00000021551 MELTF (ENSBMUG00000021570) DLG1 (ENSBMUG00000021750) ENSBMUG00000021827 #22 BDH1 (ENSBMUG00000021843) APOD (ENSBMUG00000021862) ENSBMUG00000021874 ACAP2 (ENSBMUG00000021896) American bison MODERN SPECIES 2904 PDS5A (ENSBBBG00000002776) #15 UBE2K (ENSBBBG00000015119) #16 SMIM14 (ENSBBBG00000015086) #18 UGDH (ENSBBBG00000015077) #20 LIAS (ENSBBBG00000015037) #21 ENSBBBG00000000823 #22 KLB (ENSBBBG00000000872) #23 ENSBBBG00000000884 #24 ENSBBBG00000000893 #24 WDR19 (ENSBBBG00000000906) #25 KLHL5 (ENSBBBG00000000987) #26 TMEM156 (ENSBBBG00000001075) #27 FAM114A1 (ENSBBBG00000001087) #28 TLR6 (ENSBBBG00000001113) #29 TLR1 (ENSBBBG00000001122) #30 TLR10 (ENSBBBG00000001131) #31 KLF3 (ENSBBBG00000001145) #32 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.a.t.a.b #22 Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.a.t.a.b #22 Bos DUPLICATION Bos DUPLICATION Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.a.t.a.b.a.a #22 Bos_a ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00950000183121.b.b.b.a ENSGT00530000063666.a ENSGT00390000008591 ENSGT01030000235010.e.a ENSGT00940000159242 ENSGT00920000150804 ENSGT00730000111075.b ENSGT00940000161429 ENSGT00940000164351 ENSGT00390000011425.A ENSGT00940000156017 ENSGT00730000111570 ENSGT00950000183107.a.b.b ENSGT00940000162488 ENSGT00940000161206 ENSGT00390000015224.c.a.a.a.t.a.b.a.a #22 ENSGT01030000234518.D ENSGT00390000007560.k.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT00390000009948.c.l ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT00550000074618.a.b.ab.a.a.a.a ENSGT00940000163592 ENSGT00940000161697 ENSGT00390000008820.e.b.kb ENSGT00940000159568 ENSGT00390000012178.g.b.b.a.b.a ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00940000154426.b.b.h ENSGT00940000155902 Domestic yak MODERN SPECIES 69 ENSBGRG00000025313 HDX (ENSBGRG00000025367) ENSBGRG00000025377 RPS6KA6 (ENSBGRG00000012307) CYLC1 (ENSBGRG00000013173) POU3F4 (ENSBGRG00000013340) ENSBGRG00000013359 ENSBGRG00000013400 ENSBGRG00000013446 SH3BGRL (ENSBGRG00000013469) ENSBGRG00000013533 BRWD3 (ENSBGRG00000013595) TENT5D (ENSBGRG00000014080) TBX22 (ENSBGRG00000014109) ENSBGRG00000014224 ENSBGRG00000014249 #22 GPR174 (ENSBGRG00000014278) P2RY10 (ENSBGRG00000014291) LPAR4 (ENSBGRG00000014316) ENSBGRG00000014334 CYSLTR1 (ENSBGRG00000014355) ENSBGRG00000014446 TAF9B (ENSBGRG00000014722) PGK1 (ENSBGRG00000014778) ATP7A (ENSBGRG00000015150) ENSBGRG00000015336 MAGT1 (ENSBGRG00000015408) ENSBGRG00000015557 ATRX (ENSBGRG00000016038) FGF16 (ENSBGRG00000022814) PBDC1 (ENSBGRG00000022890) Bos_b ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00950000183121.b.b.b.a ENSGT00530000063666.a ENSGT00390000008591 ENSGT01030000235010.e.a ENSGT00940000159242 ENSGT00920000150804 ENSGT00730000111075.b ENSGT00940000161429 ENSGT00940000164351 ENSGT00390000011425.A ENSGT00940000156017 ENSGT00730000111570 ENSGT00950000183107.a.b.b ENSGT00940000162488 ENSGT00940000161206 ENSGT00390000015224.c.a.a.a.t.a.b.a.a #22 ENSGT01030000234518.D ENSGT00390000007560.k.b Cow MODERN SPECIES 177 ENSBTAG00000055024 RPS6KA6 (ENSBTAG00000002015) ENSBTAG00000048589 CYLC1 (ENSBTAG00000047417) POU3F4 (ENSBTAG00000015712) ENSBTAG00000039066 ENSBTAG00000051658 ENSBTAG00000048206 SH3BGRL (ENSBTAG00000010587) ENSBTAG00000049971 HMGN5 (ENSBTAG00000001877) ENSBTAG00000051240 BRWD3 (ENSBTAG00000016230) TENT5D (ENSBTAG00000045653) TBX22 (ENSBTAG00000048060) ENSBTAG00000045678 #22 GPR174 (ENSBTAG00000021437) ENSBTAG00000054002 ENSBTAG00000050883 P2RY10 (ENSBTAG00000008555) LPAR4 (ENSBTAG00000003299) ENSBTAG00000035882 CYSLTR1 (ENSBTAG00000024675) ENSBTAG00000051877 ENSBTAG00000026025 TAF9B (ENSBTAG00000000895) PGK1 (ENSBTAG00000000894) ATP7A (ENSBTAG00000010018) COX7B (ENSBTAG00000047768) MAGT1 (ENSBTAG00000045931) ENSBTAG00000053487 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 26 SPRY4 (ENSBIXG00005016759) NDFIP1 (ENSBIXG00005016690) ENSBIXG00005016650 GNPDA1 (ENSBIXG00005016638) RNF14 (ENSBIXG00005006352) PCDH12 (ENSBIXG00005016404) DELE1 (ENSBIXG00005016389) PCDH1 (ENSBIXG00005016354) ARAP3 (ENSBIXG00005007324) FCHSD1 (ENSBIXG00005016185) RELL2 (ENSBIXG00005016160) HDAC3 (ENSBIXG00005016120) DIAPH1 (ENSBIXG00005016069) ENSBIXG00005016084 ENSBIXG00005002548 ENSBIXG00005015875 #22 ENSBIXG00005015866 TAF7 (ENSBIXG00005002491) SLC25A2 (ENSBIXG00005015856) PCDHB15 (ENSBIXG00005000157) PCDHB14 (ENSBIXG00005015782) ENSBIXG00005015769 ENSBIXG00005002464 PCDHB16 (ENSBIXG00005002460) ENSBIXG00005015742 PCDHB7 (ENSBIXG00005015732) ENSBIXG00005015723 PCDHB6 (ENSBIXG00005002446) PCDHB4 (ENSBIXG00005015653) ENSBIXG00005015645 ENSBIXG00005015637 Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.a.t.a.b.a.b #22 Bos_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.a.t.a.b.a.b #22 Cow MODERN SPECIES 4 APCDD1L (ENSBTAG00000020397) VAPB (ENSBTAG00000017424) RAB22A (ENSBTAG00000018053) ENSBTAG00000052305 C13H20orf85 (ENSBTAG00000016926) ENSBTAG00000054668 PMEPA1 (ENSBTAG00000054628) ZBP1 (ENSBTAG00000012406) PCK1 (ENSBTAG00000001936) CTCFL (ENSBTAG00000013079) RBM38 (ENSBTAG00000008105) RAE1 (ENSBTAG00000010934) SPO11 (ENSBTAG00000044210) BMP7 (ENSBTAG00000015362) TFAP2C (ENSBTAG00000002065) ENSBTAG00000024608 #22 FAM209A (ENSBTAG00000031462) RTF2 (ENSBTAG00000027390) GCNT7 (ENSBTAG00000006243) CASS4 (ENSBTAG00000014555) CSTF1 (ENSBTAG00000006639) AURKA (ENSBTAG00000013009) FAM210B (ENSBTAG00000013007) MC3R (ENSBTAG00000004712) SIRPD (ENSBTAG00000033397) SIRPB2 (ENSBTAG00000006539) NSFL1C (ENSBTAG00000006533) FKBP1A (ENSBTAG00000008303) ENSBTAG00000052136 SDCBP2 (ENSBTAG00000021321) SNPH (ENSBTAG00000048366) Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.a.t.a.b.b #22 Bos_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.a.t.a.b.b #22 Wild yak MODERN SPECIES 782 ENSBMUG00000008213 #22 ENSBMUG00000008223 EPB42 (ENSBMUG00000008283) CCNDBP1 (ENSBMUG00000008340) TMEM62 (ENSBMUG00000008353) Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.a.t.a.b #22 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 25 ASAP1 (ENSOARG00020009370) CYRIB (ENSOARG00020009735) ENSOARG00020009780 ENSOARG00020009811 MYC (ENSOARG00020009900) ENSOARG00020010012 ENSOARG00020010049 ENSOARG00020010136 LRATD2 (ENSOARG00020010199) ENSOARG00020010223 TRIB1 (ENSOARG00020010295) NSMCE2 (ENSOARG00020010360) WASHC5 (ENSOARG00020010489) SQLE (ENSOARG00020011372) ZNF572 (ENSOARG00020011524) ENSOARG00020011568 #22 MTSS1 (ENSOARG00020011599) NDUFB9 (ENSOARG00020012046) TATDN1 (ENSOARG00020012205) RNF139 (ENSOARG00020012478) TRMT12 (ENSOARG00020012514) TMEM65 (ENSOARG00020012542) FER1L6 (ENSOARG00020012678) FAM91A1 (ENSOARG00020013597) ANXA13 (ENSOARG00020014445) KLHL38 (ENSOARG00020014756) FBXO32 (ENSOARG00020014812) NTAQ1 (ENSOARG00020015073) ATAD2 (ENSOARG00020015273) ZHX1 (ENSOARG00020015701) C9H8orf76 (ENSOARG00020015718) Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.a.t.b #22 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.a.t.b #22 Goat MODERN SPECIES 16 NDC80 (ENSCHIG00000000360) METTL4 (ENSCHIG00000000254) ADCYAP1 (ENSCHIG00000000212) ENSCHIG00000000177 YES1 (ENSCHIG00000000143) ENOSF1 (ENSCHIG00000000109) TYMS (ENSCHIG00000000075) CLUL1 (ENSCHIG00000012461) CETN1 (ENSCHIG00000006822) COLEC12 (ENSCHIG00000019421) THOC1 (ENSCHIG00000015399) USP14 (ENSCHIG00000006538) ENSCHIG00000001073 ROCK1 (ENSCHIG00000016132) ENSCHIG00000008866 ENSCHIG00000009159 #22 GREB1L (ENSCHIG00000025994) ESCO1 (ENSCHIG00000016783) SNRPD1 (ENSCHIG00000005557) ABHD3 (ENSCHIG00000024480) ENSCHIG00000014890 MIB1 (ENSCHIG00000002236) GATA6 (ENSCHIG00000018847) RBBP8 (ENSCHIG00000013081) CABLES1 (ENSCHIG00000024112) TMEM241 (ENSCHIG00000011954) RIOK3 (ENSCHIG00000009312) ENSCHIG00000024653 ENSCHIG00000021287 ANKRD29 (ENSCHIG00000018673) ENSCHIG00000015951 Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.a.t.b #22 Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.a.t.b #22 Bos_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.a.t.b #22 Cow MODERN SPECIES 3 ENSBTAG00000051519 TGDS (ENSBTAG00000005309) GPR180 (ENSBTAG00000005310) SOX21 (ENSBTAG00000022484) ENSBTAG00000032603 ENSBTAG00000047383 ENSBTAG00000046041 ENSBTAG00000049836 ENSBTAG00000047181 ENSBTAG00000023309 CLDN10 (ENSBTAG00000003568) DZIP1 (ENSBTAG00000003569) DNAJC3 (ENSBTAG00000012065) UGGT2 (ENSBTAG00000004401) HS6ST3 (ENSBTAG00000039065) ENSBTAG00000045566 #22 OXGR1 (ENSBTAG00000021345) MBNL2 (ENSBTAG00000018313) RAP2A (ENSBTAG00000020412) IPO5 (ENSBTAG00000039374) FARP1 (ENSBTAG00000000146) STK24 (ENSBTAG00000032234) SLC15A1 (ENSBTAG00000004440) DOCK9 (ENSBTAG00000010395) UBAC2 (ENSBTAG00000005682) GPR18 (ENSBTAG00000002240) GPR183 (ENSBTAG00000032084) ENSBTAG00000038268 TM9SF2 (ENSBTAG00000001589) CLYBL (ENSBTAG00000004165) ENSBTAG00000051991 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.a.u #22 Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.a.u #22 American bison MODERN SPECIES 243 ENSBBBG00000008213 #22 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.a.u #22 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES RNF220 (ENSOARG00020002839) TMEM53 (ENSOARG00020002864) ARMH1 (ENSOARG00020002881) RPS8 (ENSOARG00020002902) KIF2C (ENSOARG00020002926) BEST4 (ENSOARG00020003023) PLK3 (ENSOARG00020003053) DYNLT4 (ENSOARG00020003125) BTBD19 (ENSOARG00020003142) PTCH2 (ENSOARG00020003214) EIF2B3 (ENSOARG00020003516) ENSOARG00020003567 UROD (ENSOARG00020003627) HECTD3 (ENSOARG00020003787) ZSWIM5 (ENSOARG00020003848) ENSOARG00020000037 #22 HPDL (ENSOARG00020000043) MUTYH (ENSOARG00020000051) TOE1 (ENSOARG00020000052) TESK2 (ENSOARG00020000085) ENSOARG00020000128 MMACHC (ENSOARG00020000138) PRDX1 (ENSOARG00020000156) AKR1A1 (ENSOARG00020000189) ENSOARG00020000265 CCDC17 (ENSOARG00020000364) GPBP1L1 (ENSOARG00020000433) TMEM69 (ENSOARG00020000462) IPP (ENSOARG00020000478) ENSOARG00020000500 MAST2 (ENSOARG00020000575) Yarkand deer MODERN SPECIES 8 UCHL1 (ENSCHYG00000019339) #9 ENSCHYG00000019295 APBB2 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ENSGT00940000157949 #33 ENSGT01030000235076 ENSGT00940000156247 #35 ENSGT00940000159709 #36 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00950000183159.a #8 ENSGT00940000157306 #9 ENSGT00390000000002.a.a.a #10 ENSGT00940000157352 ENSGT00940000156979 #11 ENSGT00940000156077 #12 ENSGT00910000146901 ENSGT00940000160078 #13 ENSGT00940000160604 #14 ENSGT00940000155155 #15 ENSGT00910000147100 ENSGT00670000098059 #16 ENSGT00390000018294 #18 ENSGT00390000015355 #20 ENSGT00390000006234 #21 ENSGT00390000015224.c.a.a.a #22 ENSGT00940000157489 #23 ENSGT00730000111066 #24 ENSGT00590000083165 #25 ENSGT00940000155358 #26 ENSGT00390000017929 #27 ENSGT00390000010054.b #28 ENSGT00940000162201 #29 ENSGT00940000162884 #30 ENSGT00940000163662 #31 ENSGT00940000157456 #32 ENSGT00900000143434 ENSGT00940000157949 #33 ENSGT00940000156247 #35 ENSGT00940000159709 #36 ENSGT00390000013778 #37 Platyrrhini DUPLICATION Platyrrhini DUPLICATION Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.a.h.a #22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.a.h.a #22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.a.h.a #22 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 216 GDPD2 (ENSSBOG00000025477) ENSSBOG00000025898 ENSSBOG00000030916 RAB41 (ENSSBOG00000020927) ARR3 (ENSSBOG00000024637) AWAT1 (ENSSBOG00000022988) DGAT2L6 (ENSSBOG00000025537) ENSSBOG00000023660 AWAT2 (ENSSBOG00000023258) EDA (ENSSBOG00000009144) NALF2 (ENSSBOG00000026957) ENSSBOG00000027583 EFNB1 (ENSSBOG00000020665) STARD8 (ENSSBOG00000031042) YIPF6 (ENSSBOG00000021313) ENSSBOG00000014590 #22 Capuchin MODERN SPECIES 13 CCN4 (ENSCCAG00000025934) TG (ENSCCAG00000028833) SLA (ENSCCAG00000031926) PHF20L1 (ENSCCAG00000020490) TMEM71 (ENSCCAG00000028721) DNAAF11 (ENSCCAG00000031017) KCNQ3 (ENSCCAG00000028183) HHLA1 (ENSCCAG00000036215) OC90 (ENSCCAG00000031064) EFR3A (ENSCCAG00000019655) ADCY8 (ENSCCAG00000029810) ASAP1 (ENSCCAG00000022593) CYRIB (ENSCCAG00000032744) GSDMC (ENSCCAG00000021127) MYC (ENSCCAG00000032999) ENSCCAG00000018472 #22 ENSCCAG00000031130 ENSCCAG00000037347 LRATD2 (ENSCCAG00000020357) ENSCCAG00000037687 MSR1 (ENSCCAG00000034933) GPHN (ENSCCAG00000020521) ENSCCAG00000022214 FAM71D (ENSCCAG00000026161) PALS1 (ENSCCAG00000031683) ATP6V1D (ENSCCAG00000037989) EIF2S1 (ENSCCAG00000028622) PLEK2 (ENSCCAG00000029270) TMEM229B (ENSCCAG00000016856) PLEKHH1 (ENSCCAG00000031526) PIGH (ENSCCAG00000035097) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.a.h.b #22 Mas night monkey MODERN SPECIES 886 RTP3 (ENSANAG00000026632) LTF (ENSANAG00000034650) CCRL2 (ENSANAG00000030968) CCR2 (ENSANAG00000032091) CCR3 (ENSANAG00000029115) ENSANAG00000028667 FYCO1 (ENSANAG00000032948) CCR9 (ENSANAG00000020077) LZTFL1 (ENSANAG00000000596) SLC6A20 (ENSANAG00000034624) SACM1L (ENSANAG00000035029) ENSANAG00000023940 #22 LIMD1 (ENSANAG00000019956) LARS2 (ENSANAG00000034662) TMEM158 (ENSANAG00000024964) CDCP1 (ENSANAG00000034819) CLEC3B (ENSANAG00000027596) EXOSC7 (ENSANAG00000028607) ZDHHC3 (ENSANAG00000021495) TMEM42 (ENSANAG00000034383) ENSANAG00000036102 KIF15 (ENSANAG00000037629) ENSANAG00000028996 ZNF501 (ENSANAG00000018943) ZNF502 (ENSANAG00000021135) ENSANAG00000034886 ZNF35 (ENSANAG00000019550) Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.a.h.b #22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.a.h.b #22 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 93 NFATC2 (ENSSBOG00000023445) KCNG1 (ENSSBOG00000030989) MOCS3 (ENSSBOG00000016142) DPM1 (ENSSBOG00000035012) ADNP (ENSSBOG00000031931) BCAS4 (ENSSBOG00000031019) PARD6B (ENSSBOG00000033004) RIPOR3 (ENSSBOG00000020304) ENSSBOG00000021238 PEDS1 (ENSSBOG00000000313) ENSSBOG00000028538 SNAI1 (ENSSBOG00000034760) RNF114 (ENSSBOG00000027055) SPATA2 (ENSSBOG00000027105) SLC9A8 (ENSSBOG00000008701) ENSSBOG00000030451 #22 B4GALT5 (ENSSBOG00000012698) PTGIS (ENSSBOG00000032693) KCNB1 (ENSSBOG00000030068) ZNFX1 (ENSSBOG00000024677) DDX27 (ENSSBOG00000034281) ENSSBOG00000001880 STAU1 (ENSSBOG00000034448) CSE1L (ENSSBOG00000021396) ARFGEF2 (ENSSBOG00000027163) PREX1 (ENSSBOG00000022286) SULF2 (ENSSBOG00000019541) NCOA3 (ENSSBOG00000032467) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000159958 #7 ENSGT00950000183159.a #8 ENSGT00940000157306.n #9 ENSGT00390000000002.a.a.a #10 ENSGT00940000157352 ENSGT00940000156979 #11 ENSGT00940000156077 #12 ENSGT00910000146901 ENSGT00940000160078 #13 ENSGT00940000160604 #14 ENSGT00940000155155.e #15 ENSGT00670000098059 #16 ENSGT00390000018294 #18 ENSGT00390000015355 #20 ENSGT00390000006234.b #21 ENSGT00390000015224.c.a.a.a.i #22 ENSGT00940000157489 #23 ENSGT00730000111066 #24 ENSGT00590000083165 #25 ENSGT00940000155358 #26 ENSGT00390000017929 #27 ENSGT00390000010054.b #28 ENSGT00940000162201 #29 ENSGT00940000162884 #30 ENSGT00940000163662 #31 ENSGT00940000157456 #32 ENSGT00900000143434 ENSGT00940000157949 #33 ENSGT00390000009693.p.b ENSGT00940000156247.e #35 ENSGT00940000159709 #36 Mas night monkey DUPLICATION Mas night monkey MODERN SPECIES 845 APBB2 (ENSANAG00000030667) #10 ENSANAG00000038288 NSUN7 (ENSANAG00000020755) RBM47 (ENSANAG00000029440) #11 CHRNA9 (ENSANAG00000033675) #12 RHOH (ENSANAG00000018154) #13 ENSANAG00000017626 ENSANAG00000028738 #14 PDS5A (ENSANAG00000029594) #15 UBE2K (ENSANAG00000020789) #16 ENSANAG00000037699 SMIM14 (ENSANAG00000037317) #18 ENSANAG00000027822 UGDH (ENSANAG00000009489) #20 LIAS (ENSANAG00000032453) #21 ENSANAG00000027218 #22 ENSANAG00000024442 KLB (ENSANAG00000023620) #23 RFC1 (ENSANAG00000026467) #24 WDR19 (ENSANAG00000027127) #25 KLHL5 (ENSANAG00000024143) #26 TMEM156 (ENSANAG00000024309) #27 FAM114A1 (ENSANAG00000020424) #28 TLR6 (ENSANAG00000031860) #29 KLF3 (ENSANAG00000009263) #32 ENSANAG00000027982 ENSANAG00000021832 TBC1D1 (ENSANAG00000025477) #33 ENSANAG00000034818 #35 RELL1 (ENSANAG00000034604) #36 C4orf19 (ENSANAG00000031125) #37 Mas night monkey MODERN SPECIES 958 PYCR2 (ENSANAG00000027686) ENSANAG00000030058 SDE2 (ENSANAG00000028299) ENSANAG00000022092 ENSANAG00000017653 ACBD3 (ENSANAG00000034586) MIXL1 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DUPLICATION Marmoset MODERN SPECIES ENSCJAG00000072380 ENSCJAG00000069972 MYH9 (ENSCJAG00000013642) ENSCJAG00000079777 ENSCJAG00000019456 APOL6 (ENSCJAG00000080326) ENSCJAG00000071958 MB (ENSCJAG00000000506) RASD2 (ENSCJAG00000000509) MCM5 (ENSCJAG00000000511) HMOX1 (ENSCJAG00000000516) ENSCJAG00000074738 TOM1 (ENSCJAG00000000519) HMGXB4 (ENSCJAG00000000537) ISX (ENSCJAG00000071825) ENSCJAG00000022754 #22 LARGE1 (ENSCJAG00000000968) ENSCJAG00000078413 SLC5A4 (ENSCJAG00000044264) RTCB (ENSCJAG00000006128) BPIFC (ENSCJAG00000006209) FBXO7 (ENSCJAG00000006238) TIMP3 (ENSCJAG00000044183) SYN3 (ENSCJAG00000006266) MLC1 (ENSCJAG00000003866) ENSCJAG00000004900 SLC5A1 (ENSCJAG00000011369) YWHAH (ENSCJAG00000055488) DEPDC5 (ENSCJAG00000011169) PRR14L (ENSCJAG00000011163) PISD (ENSCJAG00000011154) Marmoset MODERN SPECIES 15 LIMCH1 (ENSCJAG00000019269) #8 ENSCJAG00000086935 ENSCJAG00000019346 #9 APBB2 (ENSCJAG00000019363) #10 NSUN7 (ENSCJAG00000019381) RBM47 (ENSCJAG00000019385) #11 CHRNA9 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SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.a.j.a #22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.a.j.a #22 Pan ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.a.j.a #22 Chimpanzee MODERN SPECIES 17 NSUN7 (ENSPTRG00000016007) RBM47 (ENSPTRG00000016006) #11 CHRNA9 (ENSPTRG00000016003) #12 ENSPTRG00000051473 RHOH (ENSPTRG00000050417) #13 N4BP2 (ENSPTRG00000016001) #14 ENSPTRG00000047265 ENSPTRG00000052828 PDS5A (ENSPTRG00000015999) #15 ENSPTRG00000046479 UBE2K (ENSPTRG00000050230) #16 SMIM14 (ENSPTRG00000048386) #18 UGDH (ENSPTRG00000015996) #20 ENSPTRG00000048813 LIAS (ENSPTRG00000015994) #21 ENSPTRG00000050404 #22 ENSPTRG00000043669 KLB (ENSPTRG00000015992) #23 RFC1 (ENSPTRG00000015991) #24 WDR19 (ENSPTRG00000015990) #25 KLHL5 (ENSPTRG00000015989) #26 TMEM156 (ENSPTRG00000015988) #27 FAM114A1 (ENSPTRG00000023549) #28 TLR10 (ENSPTRG00000015984) #31 KLF3 (ENSPTRG00000015983) #32 ENSPTRG00000044539 PTTG2 (ENSPTRG00000043626) TBC1D1 (ENSPTRG00000015981) #33 ENSPTRG00000051394 PGM2 (ENSPTRG00000015979) #35 ENSPTRG00000045616 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000157352 ENSGT00940000156979 #11 ENSGT00940000156077 #12 ENSGT00910000146901 ENSGT00940000160078 #13 ENSGT00940000160604 #14 ENSGT00940000155155 #15 ENSGT00910000147100 ENSGT00670000098059 #16 ENSGT00390000018294 #18 ENSGT00390000015355 #20 ENSGT00940000154143.e.d ENSGT00390000006234 #21 ENSGT00390000015224.c.a.a.a.k #22 ENSGT00910000146954 ENSGT00390000015224.c.a.a.a.j.b #22 ENSGT00940000157489 #23 ENSGT00730000111066 #24 ENSGT00590000083165 #25 ENSGT00940000155358 #26 ENSGT00390000017929 #27 ENSGT00390000010054.b #28 ENSGT00940000162201 #29 ENSGT00940000162884 #30 ENSGT00940000163662 #31 ENSGT00940000157456 #32 ENSGT00940000157949 #33 ENSGT01030000235076 ENSGT00390000009693.m.b ENSGT00940000156247 #35 ENSGT00940000159709 #36 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.a.j.b #22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.a.j.b #22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.a.j.b #22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.a.j.b #22 Pan ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.a.j.b #22 Chimpanzee DUPLICATION Chimpanzee MODERN SPECIES 972 GPR119 (ENSPTRG00000023895) RBMX2 (ENSPTRG00000022269) ENOX2 (ENSPTRG00000022270) ARHGAP36 (ENSPTRG00000022271) IGSF1 (ENSPTRG00000022273) OR13H1 (ENSPTRG00000022275) ENSPTRG00000039845 STK26 (ENSPTRG00000022277) FRMD7 (ENSPTRG00000022278) ENSPTRG00000045097 ENSPTRG00000045178 MBNL3 (ENSPTRG00000022280) HS6ST2 (ENSPTRG00000022281) USP26 (ENSPTRG00000028202) TFDP3 (ENSPTRG00000028201) ENSPTRG00000049459 #22 GPC4 (ENSPTRG00000022282) GPC3 (ENSPTRG00000022283) ENSPTRG00000049683 ENSPTRG00000043618 ENSPTRG00000043437 CCDC160 (ENSPTRG00000028200) PHF6 (ENSPTRG00000022286) HPRT1 (ENSPTRG00000022287) PLAC1 (ENSPTRG00000022289) PABIR2 (ENSPTRG00000022290) PABIR3 (ENSPTRG00000022292) MOSPD1 (ENSPTRG00000022293) ENSPTRG00000051856 ENSPTRG00000051890 ENSPTRG00000039452 Chimpanzee MODERN SPECIES 10 RHPN2 (ENSPTRG00000010801) FAAP24 (ENSPTRG00000010798) CEP89 (ENSPTRG00000010797) SLC7A9 (ENSPTRG00000010796) TDRD12 (ENSPTRG00000010795) NUDT19 (ENSPTRG00000034496) RGS9BP (ENSPTRG00000047454) ANKRD27 (ENSPTRG00000010792) PDCD5 (ENSPTRG00000010791) DPY19L3 (ENSPTRG00000010790) ZNF507 (ENSPTRG00000010789) ENSPTRG00000048388 TSHZ3 (ENSPTRG00000010788) ZNF536 (ENSPTRG00000010786) ENSPTRG00000052821 ENSPTRG00000050716 #22 URI1 (ENSPTRG00000010784) CCNE1 (ENSPTRG00000010782) C19H19orf12 (ENSPTRG00000010781) PLEKHF1 (ENSPTRG00000010780) POP4 (ENSPTRG00000010779) VSTM2B (ENSPTRG00000010778) UQCRFS1 (ENSPTRG00000010777) ENSPTRG00000049554 ZNF254 (ENSPTRG00000019222) ENSPTRG00000046645 ZNF681 (ENSPTRG00000043365) ENSPTRG00000048149 ZNF675 (ENSPTRG00000022567) ENSPTRG00000043755 ENSPTRG00000043231 Orangutan MODERN SPECIES 1 ADIRF (ENSPPYG00000038600) ENSPPYG00000002268 MMRN2 (ENSPPYG00000002269) BMPR1A (ENSPPYG00000002270) LDB3 (ENSPPYG00000002271) OPN4 (ENSPPYG00000002272) 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ENSGT00390000015224.c.a.a.a.k #22 ENSGT00910000146954 ENSGT00940000157489 #23 ENSGT00730000111066 #24 ENSGT00590000083165 #25 ENSGT00940000155358.k.a #26 ENSGT00390000017929 #27 ENSGT00390000010054.b #28 ENSGT00940000162201 #29 ENSGT00940000162884 #30 ENSGT00940000163662 #31 ENSGT00940000157456 #32 ENSGT00940000157949 #33 ENSGT00770000121815 ENSGT00940000156247 #35 ENSGT00940000159709 #36 Orangutan MODERN SPECIES 17 APBB2 (ENSPPYG00000014690) #10 NSUN7 (ENSPPYG00000014689) ENSPPYG00000036617 RBM47 (ENSPPYG00000040899) #11 CHRNA9 (ENSPPYG00000015291) #12 ENSPPYG00000030777 RHOH (ENSPPYG00000014687) #13 N4BP2 (ENSPPYG00000014686) #14 ENSPPYG00000014684 PDS5A (ENSPPYG00000014682) #15 ENSPPYG00000040313 UBE2K (ENSPPYG00000030577) #16 SMIM14 (ENSPPYG00000014678) #18 UGDH (ENSPPYG00000014677) #20 LIAS (ENSPPYG00000014676) #21 ENSPPYG00000014675 #22 KLB (ENSPPYG00000014674) #23 RFC1 (ENSPPYG00000014673) #24 WDR19 (ENSPPYG00000014672) #25 KLHL5 (ENSPPYG00000015288) #26 TMEM156 (ENSPPYG00000014671) #27 FAM114A1 (ENSPPYG00000014670) #28 TLR6 (ENSPPYG00000014669) #29 TLR1 (ENSPPYG00000014668) #30 TLR10 (ENSPPYG00000014667) #31 KLF3 (ENSPPYG00000014666) #32 TBC1D1 (ENSPPYG00000014663) #33 PGM2 (ENSPPYG00000014661) #35 RELL1 (ENSPPYG00000031559) #36 C4orf19 (ENSPPYG00000038950) #37 NWD2 (ENSPPYG00000030808) Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000000002.a.a.a #10 ENSGT00940000157352 ENSGT00940000156979 #11 ENSGT00940000156077 #12 ENSGT00910000146901 ENSGT00940000160078 #13 ENSGT00940000160604 #14 ENSGT00940000155155 #15 ENSGT00910000147100 ENSGT00670000098059 #16 ENSGT00940000162418.h ENSGT00390000018294 #18 ENSGT00390000015355 #20 ENSGT00940000154143.e.d ENSGT00390000006234 #21 ENSGT00390000015224.c.a.a.a.k #22 ENSGT00910000146954 ENSGT00940000157489 #23 ENSGT00730000111066 #24 ENSGT00590000083165 #25 ENSGT00940000155358.k.a #26 ENSGT00390000017929 #27 ENSGT00390000010054.b #28 ENSGT00940000162201 #29 ENSGT00940000162884 #30 ENSGT00940000163662 #31 ENSGT00940000157456 #32 ENSGT00950000183098.b.a.b.ib.a ENSGT00390000009693.m.b ENSGT00940000157949 #33 ENSGT00770000121815 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000157306 #9 ENSGT00390000000002.a.a.a #10 ENSGT00940000157352 ENSGT00940000156979 #11 ENSGT00940000156077 #12 ENSGT00910000146901 ENSGT00940000160078 #13 ENSGT00940000160604 #14 ENSGT00940000155155 #15 ENSGT00910000147100 ENSGT00670000098059 #16 ENSGT00390000018294 #18 ENSGT00390000015355 #20 ENSGT00940000154143.e.d ENSGT00390000006234 #21 ENSGT00390000015224.c.a.a.a.k #22 ENSGT00940000157489 #23 ENSGT00730000111066 #24 ENSGT00590000083165 #25 ENSGT00940000155358.k.a #26 ENSGT00390000017929 #27 ENSGT00390000010054.b #28 ENSGT00940000162201 #29 ENSGT00940000162884 #30 ENSGT00940000163662 #31 ENSGT00940000157456 #32 ENSGT00950000183098.b.a.b.ib.a ENSGT00390000009693.m.b ENSGT00940000157949 #33 ENSGT00770000121815 ENSGT00940000156247 #35 Human MODERN SPECIES 16 PHOX2B (ENSG00000109132) #7 LIMCH1 (ENSG00000064042) #8 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(ENSPPAG00000014660) DPP8 (ENSPPAG00000032419) IGDCC4 (ENSPPAG00000036548) IGDCC3 (ENSPPAG00000042057) PARP16 (ENSPPAG00000030232) CILP (ENSPPAG00000042751) CLPX (ENSPPAG00000040563) ENSPPAG00000035027 Gorilla DUPLICATION Gorilla MODERN SPECIES 17 APBB2 (ENSGGOG00000007435) #10 NSUN7 (ENSGGOG00000034897) RBM47 (ENSGGOG00000001367) #11 CHRNA9 (ENSGGOG00000016532) #12 ENSGGOG00000042778 N4BP2 (ENSGGOG00000005103) #14 ENSGGOG00000005583 PDS5A (ENSGGOG00000007334) #15 ENSGGOG00000036366 ENSGGOG00000025985 UBE2K (ENSGGOG00000003261) #16 SMIM14 (ENSGGOG00000038154) #18 UGDH (ENSGGOG00000025911) #20 ENSGGOG00000040886 LIAS (ENSGGOG00000014977) #21 RPL9 (ENSGGOG00000022799) #22 ENSGGOG00000037633 KLB (ENSGGOG00000013647) #23 RFC1 (ENSGGOG00000007977) #24 WDR19 (ENSGGOG00000005922) #25 KLHL5 (ENSGGOG00000001643) #26 TMEM156 (ENSGGOG00000004085) #27 FAM114A1 (ENSGGOG00000012372) #28 TLR10 (ENSGGOG00000025418) #31 KLF3 (ENSGGOG00000004667) #32 ENSGGOG00000039341 PTTG2 (ENSGGOG00000037103) ENSGGOG00000007187 #33 ENSGGOG00000024170 PGM2 (ENSGGOG00000013725) #35 RELL1 (ENSGGOG00000014944) #36 Gorilla MODERN SPECIES 6 ENSGGOG00000027762 ENSGGOG00000042211 MAP2K5 (ENSGGOG00000004734) C15orf61 (ENSGGOG00000004732) IQCH (ENSGGOG00000004722) ENSGGOG00000004714 ENSGGOG00000012045 ENSGGOG00000038329 SMAD6 (ENSGGOG00000013002) LCTL (ENSGGOG00000006350) ZWILCH (ENSGGOG00000003703) ENSGGOG00000003695 SNAPC5 (ENSGGOG00000003693) ENSGGOG00000042752 MAP2K1 (ENSGGOG00000003687) ENSGGOG00000024529 #22 TIPIN (ENSGGOG00000000061) DIS3L (ENSGGOG00000001549) MEGF11 (ENSGGOG00000000293) RAB11A (ENSGGOG00000014252) ENSGGOG00000022841 DENND4A (ENSGGOG00000014870) SLC24A1 (ENSGGOG00000016389) INTS14 (ENSGGOG00000003838) HACD3 (ENSGGOG00000022837) DPP8 (ENSGGOG00000012470) IGDCC4 (ENSGGOG00000010463) IGDCC3 (ENSGGOG00000010452) PARP16 (ENSGGOG00000022851) CILP (ENSGGOG00000042968) CLPX (ENSGGOG00000000326) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000000002.a.a.a #10 ENSGT00940000157352 ENSGT00390000018145.cb.a.a.b.b ENSGT00940000156979 #11 ENSGT00940000156077 #12 ENSGT00910000146901 ENSGT00940000160078 #13 ENSGT00940000160604 #14 ENSGT00940000155155.c #15 ENSGT00910000147100 ENSGT00670000098059 #16 ENSGT00390000018294 #18 ENSGT00390000015355 #20 ENSGT00940000154143.e.d ENSGT00390000006234 #21 ENSGT00390000015224.c.a.a.a.k #22 ENSGT00910000146954 ENSGT00390000015224.c.a.a.a.j.b #22 ENSGT00940000157489 #23 ENSGT00730000111066 #24 ENSGT00590000083165 #25 ENSGT00940000155358 #26 ENSGT00390000017929 #27 ENSGT00390000010054.b #28 ENSGT00940000162201 #29 ENSGT00940000162884 #30 ENSGT00940000163662 #31 ENSGT00940000157456 #32 ENSGT00900000143434 ENSGT00910000147773 ENSGT00390000009693.m.b Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 119 ENSGT00390000018145.cb.a.a.b.b ENSGT00940000156979 #11 ENSGT00940000156077 #12 ENSGT00910000146901 ENSGT00940000160078 #13 ENSGT00940000160604 #14 ENSGT00940000161602 ENSGT00940000155229 ENSGT00940000155155.c #15 ENSGT00910000147100 ENSGT00670000098059 #16 ENSGT00390000001374.e.a ENSGT00390000018294 #18 ENSGT00390000015355 #20 ENSGT00390000006234 #21 ENSGT00390000015224.c.a.a.a.k #22 ENSGT00940000157489 #23 ENSGT00730000111066.q #24 ENSGT00590000083165 #25 ENSGT00940000155358 #26 ENSGT00390000017929 #27 ENSGT00390000010054.b #28 ENSGT00940000162884 #30 ENSGT00940000163662 #31 ENSGT00940000157456 #32 ENSGT00900000143434 ENSGT00910000147773 ENSGT00390000009693.m.b ENSGT00940000157949 #33 ENSGT00940000156247 #35 ENSGT00940000159709 #36 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 735 ENSRROG00000007474 ENSRROG00000033501 RBM47 (ENSRROG00000044696) #11 CHRNA9 (ENSRROG00000031657) #12 ENSRROG00000031091 RHOH (ENSRROG00000021123) #13 N4BP2 (ENSRROG00000040871) #14 ENSRROG00000043145 ENSRROG00000037093 #15 ENSRROG00000043874 UBE2K (ENSRROG00000030975) #16 ENSRROG00000041757 SMIM14 (ENSRROG00000036772) #18 UGDH (ENSRROG00000001501) #20 LIAS (ENSRROG00000042971) #21 RPL9 (ENSRROG00000014078) #22 KLB (ENSRROG00000043728) #23 ENSRROG00000040664 ENSRROG00000011680 #24 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000157306 #9 ENSGT00390000000002.a.a.a #10 ENSGT00940000157352 ENSGT00390000018145.cb.a.a.b.b ENSGT00940000156979 #11 ENSGT00940000156077 #12 ENSGT00910000146901 ENSGT00940000160078 #13 ENSGT00940000160604 #14 ENSGT00940000155155.c #15 ENSGT00670000098059 #16 ENSGT00390000018294 #18 ENSGT00390000015355 #20 ENSGT00940000154143.e.d ENSGT00390000006234 #21 ENSGT00390000015224.c.a.a.a.k #22 ENSGT00910000146954 ENSGT00940000157489 #23 ENSGT00730000111066 #24 ENSGT00590000083165 #25 ENSGT00940000155358 #26 ENSGT00390000017929 #27 ENSGT00390000010054.b #28 ENSGT00940000162201 #29 ENSGT00940000162884 #30 ENSGT00940000163662 #31 ENSGT00940000157456 #32 ENSGT00900000143434 ENSGT00910000147773 ENSGT00390000009693.m.b ENSGT00940000157949 #33 Cercopithecinae_a DUPLICATION Cercopithecinae_a DUPLICATION Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.a.k.e.a #22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.a.k.e.a #22 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 193 ENSMNEG00000007339 #22 ENSMNEG00000033956 ENSMNEG00000036514 ACVR2A (ENSMNEG00000043553) ORC4 (ENSMNEG00000031287) MBD5 (ENSMNEG00000029374) EPC2 (ENSMNEG00000039186) KIF5C (ENSMNEG00000022981) LYPD6B (ENSMNEG00000036224) LYPD6 (ENSMNEG00000014126) MMADHC (ENSMNEG00000036865) ENSMNEG00000033300 RND3 (ENSMNEG00000034976) RBM43 (ENSMNEG00000030900) ENSMNEG00000043989 NMI (ENSMNEG00000036210) Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT01030000234618.F ENSGT01050000244848.C.a ENSGT01100000263493.a.b.a.a.a.a.a.a.a.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000159262 ENSGT00390000008859.b.d.k.b.f ENSGT00390000002862.i.b ENSGT00390000002862.i.a ENSGT00940000155953 ENSGT00950000182883.b.a.a ENSGT00390000015060.m.d ENSGT00940000157521.b ENSGT00390000008033 ENSGT00950000182860.a.b.b ENSGT00390000006631 ENSGT00950000183208.A.c.a.e ENSGT00390000015224.c.a.a.a.k.e.a #22 ENSGT00940000157233 ENSGT00390000016542 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00940000167556.b.b.a.b.a.a.a.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a.a.b.a.a.a ENSGT00940000158526 ENSGT00390000010822.p ENSGT00940000158539 ENSGT00390000000220.A ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000015050 ENSGT00940000157541 ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00940000157201 ENSGT00390000012204 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 3 ENSMFAG00000042200 ENSMFAG00000058697 THSD7B (ENSMFAG00000031342) ENSMFAG00000049120 ENSMFAG00000035962 ENSMFAG00000040453 SPOPL (ENSMFAG00000033909) NXPH2 (ENSMFAG00000039309) LRP1B (ENSMFAG00000036929) ENSMFAG00000064685 ENSMFAG00000049588 KYNU (ENSMFAG00000041160) ARHGAP15 (ENSMFAG00000016740) GTDC1 (ENSMFAG00000032520) ZEB2 (ENSMFAG00000030381) ENSMFAG00000052786 #22 ENSMFAG00000019961 ACVR2A (ENSMFAG00000003464) ORC4 (ENSMFAG00000031595) MBD5 (ENSMFAG00000035493) ENSMFAG00000058250 EPC2 (ENSMFAG00000002751) ENSMFAG00000052887 KIF5C (ENSMFAG00000038774) LYPD6B (ENSMFAG00000046204) LYPD6 (ENSMFAG00000002977) MMADHC (ENSMFAG00000001801) ENSMFAG00000060272 ENSMFAG00000037633 RND3 (ENSMFAG00000045221) RBM43 (ENSMFAG00000031648) Rhesus MODERN SPECIES 3 CXCR4 (ENSMMUG00000011918) ENSMMUG00000061465 THSD7B (ENSMMUG00000017081) ENSMMUG00000042063 HNMT (ENSMMUG00000006918) SPOPL (ENSMMUG00000002560) NXPH2 (ENSMMUG00000005176) ENSMMUG00000013925 LRP1B (ENSMMUG00000009885) KYNU (ENSMMUG00000021330) ARHGAP15 (ENSMMUG00000006528) GTDC1 (ENSMMUG00000011922) ZEB2 (ENSMMUG00000016845) ENSMMUG00000065347 ENSMMUG00000052142 ENSMMUG00000055627 #22 ENSMMUG00000006925 ACVR2A (ENSMMUG00000000042) ORC4 (ENSMMUG00000000043) MBD5 (ENSMMUG00000014921) ENSMMUG00000049941 ENSMMUG00000054591 EPC2 (ENSMMUG00000023176) ENSMMUG00000031468 KIF5C (ENSMMUG00000009268) LYPD6B (ENSMMUG00000009475) ENSMMUG00000056996 LYPD6 (ENSMMUG00000038492) MMADHC (ENSMMUG00000005633) ENSMMUG00000051118 ENSMMUG00000058846 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.a.k.e.a #22 Olive baboon MODERN SPECIES 1 NXPH2 (ENSPANG00000015734) ENSPANG00000038498 ENSPANG00000018859 LRP1B (ENSPANG00000007101) ENSPANG00000046031 ENSPANG00000039415 ENSPANG00000050765 KYNU (ENSPANG00000019763) ARHGAP15 (ENSPANG00000009773) GTDC1 (ENSPANG00000021875) ZEB2 (ENSPANG00000008399) ENSPANG00000040201 ENSPANG00000045723 ENSPANG00000043648 ENSPANG00000003757 ENSPANG00000015679 #22 CLIC1 (ENSPANG00000019928) ENSPANG00000035057 ACVR2A (ENSPANG00000012445) ORC4 (ENSPANG00000009846) MBD5 (ENSPANG00000015848) EPC2 (ENSPANG00000009534) ENSPANG00000042526 KIF5C (ENSPANG00000018689) LYPD6B (ENSPANG00000022096) LYPD6 (ENSPANG00000019895) ENSPANG00000048846 ENSPANG00000038761 MMADHC (ENSPANG00000019761) ENSPANG00000009096 RND3 (ENSPANG00000015939) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.a.k.e.b #22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.a.k.e.b #22 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.a.k.e.b #22 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 2 MUCL1 (ENSMFAG00000051719) TESPA1 (ENSMFAG00000040218) NEUROD4 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ENSGT00730000111066 #24 ENSGT00590000083165 #25 ENSGT00940000155358 #26 ENSGT00390000017929 #27 ENSGT00390000010054.b #28 ENSGT00940000162201 #29 ENSGT00940000162884 #30 ENSGT00940000163662 #31 ENSGT00940000157456 #32 ENSGT00900000143434 ENSGT00910000147773 ENSGT00390000009693.m.b ENSGT00940000157949 #33 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 116 ENSGT00940000157352 ENSGT00390000018052.l.a ENSGT00390000018145.cb.a.a.b.b ENSGT00940000156979 #11 ENSGT00940000156077 #12 ENSGT00910000146901 ENSGT00940000160078 #13 ENSGT00940000160604 #14 ENSGT00940000155155.c #15 ENSGT01060000249734 ENSGT00670000098059 #16 ENSGT00390000018294 #18 ENSGT00390000015355 #20 ENSGT00940000154143.e.d ENSGT00390000006234 #21 ENSGT00390000015224.c.a.a.a.k.f #22 ENSGT00910000146954 ENSGT00940000157489 #23 ENSGT00730000111066 #24 ENSGT00590000083165 #25 ENSGT00940000155358 #26 ENSGT00390000017929 #27 ENSGT00390000010054.b #28 ENSGT00940000162884 #30 ENSGT00940000163662 #31 ENSGT00940000157456 #32 ENSGT00900000143434 ENSGT00910000147773 ENSGT00390000009693.m.b ENSGT00940000157949 #33 ENSGT00940000156247 #35 Sooty mangabey MODERN SPECIES 639 ENSCATG00000033739 RBM47 (ENSCATG00000042064) #11 CHRNA9 (ENSCATG00000044901) #12 ENSCATG00000035615 RHOH (ENSCATG00000020941) #13 N4BP2 (ENSCATG00000039636) #14 ENSCATG00000039908 ENSCATG00000041746 ENSCATG00000034563 #15 ENSCATG00000004076 UBE2K (ENSCATG00000033637) #16 SMIM14 (ENSCATG00000044936) #18 UGDH (ENSCATG00000029946) #20 ENSCATG00000037258 LIAS (ENSCATG00000037444) #21 RPL9 (ENSCATG00000031890) #22 ENSCATG00000009623 KLB (ENSCATG00000025508) #23 RFC1 (ENSCATG00000015035) #24 WDR19 (ENSCATG00000038619) #25 KLHL5 (ENSCATG00000031256) #26 TMEM156 (ENSCATG00000034175) #27 FAM114A1 (ENSCATG00000045008) #28 TLR1 (ENSCATG00000018736) #30 TLR10 (ENSCATG00000020190) #31 KLF3 (ENSCATG00000013375) #32 ENSCATG00000006552 TBC1D1 (ENSCATG00000008268) #33 ENSCATG00000037748 PTTG2 (ENSCATG00000040651) PGM2 (ENSCATG00000031967) #35 Drill MODERN SPECIES 873 CHRNA9 (ENSMLEG00000038729) #12 RHOH (ENSMLEG00000025962) #13 N4BP2 (ENSMLEG00000034237) #14 ENSMLEG00000040433 ENSMLEG00000043936 #15 ENSMLEG00000005156 UBE2K (ENSMLEG00000029291) #16 SMIM14 (ENSMLEG00000038901) #18 UGDH (ENSMLEG00000039275) #20 ENSMLEG00000022091 LIAS (ENSMLEG00000036242) #21 RPL9 (ENSMLEG00000036679) #22 ENSMLEG00000027315 KLB (ENSMLEG00000038459) #23 RFC1 (ENSMLEG00000044325) #24 WDR19 (ENSMLEG00000039278) #25 KLHL5 (ENSMLEG00000040275) #26 FAM114A1 (ENSMLEG00000041313) #28 TLR1 (ENSMLEG00000027239) #30 TLR10 (ENSMLEG00000003050) #31 KLF3 (ENSMLEG00000037643) #32 PTTG2 (ENSMLEG00000034588) TBC1D1 (ENSMLEG00000038640) #33 PGM2 (ENSMLEG00000031723) #35 RELL1 (ENSMLEG00000043264) #36 C4orf19 (ENSMLEG00000033231) #37 NWD2 (ENSMLEG00000031874) Olive baboon MODERN SPECIES 13 NSUN7 (ENSPANG00000001045) ENSPANG00000048835 ENSPANG00000014103 ENSPANG00000040494 RBM47 (ENSPANG00000005980) #11 ENSPANG00000044258 CHRNA9 (ENSPANG00000040189) #12 ENSPANG00000033774 RHOH (ENSPANG00000017744) #13 N4BP2 (ENSPANG00000005533) #14 PDS5A (ENSPANG00000001639) #15 UBE2K (ENSPANG00000014212) #16 SMIM14 (ENSPANG00000006965) #18 UGDH (ENSPANG00000016219) #20 LIAS (ENSPANG00000001640) #21 RPL9 (ENSPANG00000017541) #22 KLB (ENSPANG00000018421) #23 RFC1 (ENSPANG00000016220) #24 WDR19 (ENSPANG00000003767) #25 KLHL5 (ENSPANG00000003768) #26 TMEM156 (ENSPANG00000050889) #27 FAM114A1 (ENSPANG00000016873) #28 TLR6 (ENSPANG00000045913) #29 TLR1 (ENSPANG00000018956) #30 TLR10 (ENSPANG00000034361) #31 KLF3 (ENSPANG00000000584) #32 TBC1D1 (ENSPANG00000015230) #33 ENSPANG00000048792 PGM2 (ENSPANG00000024997) #35 RELL1 (ENSPANG00000018258) #36 C4orf19 (ENSPANG00000018422) #37 Macaca ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00390000000002.a.a.a #10 ENSGT00940000157352 ENSGT00390000018052.l.a ENSGT00390000018145.cb.a.a.b.b ENSGT00940000156979 #11 ENSGT00940000156077 #12 ENSGT00910000146901 ENSGT00940000160078 #13 ENSGT00940000160604 #14 ENSGT00940000155155.c #15 ENSGT00670000098059 #16 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ENSGT00390000010054.b #28 ENSGT00940000162201 #29 ENSGT00940000162884 #30 ENSGT00940000163662 #31 ENSGT00940000157456.a #32 ENSGT01030000240362 ENSGT00940000157949 #33 ENSGT01030000235076 ENSGT01100000263493.a.b.a.a.a.b.b.b.b.c.a ENSGT00940000156247 #35 Rhesus MODERN SPECIES 15 APBB2 (ENSMMUG00000012563) #10 NSUN7 (ENSMMUG00000012561) ENSMMUG00000030357 ENSMMUG00000053608 RBM47 (ENSMMUG00000012036) #11 ENSMMUG00000040680 CHRNA9 (ENSMMUG00000030358) #12 RHOH (ENSMMUG00000063857) #13 N4BP2 (ENSMMUG00000002667) #14 PDS5A (ENSMMUG00000011323) #15 UBE2K (ENSMMUG00000011325) #16 ENSMMUG00000060423 SMIM14 (ENSMMUG00000020324) #18 UGDH (ENSMMUG00000001892) #20 LIAS (ENSMMUG00000013851) #21 RPL9 (ENSMMUG00000008553) #22 KLB (ENSMMUG00000008834) #23 RFC1 (ENSMMUG00000009324) #24 ENSMMUG00000050249 WDR19 (ENSMMUG00000002756) #25 KLHL5 (ENSMMUG00000002755) #26 TMEM156 (ENSMMUG00000002419) #27 FAM114A1 (ENSMMUG00000004471) #28 TLR6 (ENSMMUG00000002418) #29 ENSMMUG00000050528 TLR1 (ENSMMUG00000016754) #30 TLR10 (ENSMMUG00000003373) #31 KLF3 (ENSMMUG00000003363) #32 ENSMMUG00000055079 TBC1D1 (ENSMMUG00000000237) #33 ENSMMUG00000060134 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 15 KCTD8 (ENSMFAG00000049846) GRXCR1 (ENSMFAG00000037806) ENSMFAG00000056632 ATP8A1 (ENSMFAG00000038620) SHISA3 (ENSMFAG00000030992) BEND4 (ENSMFAG00000031463) SLC30A9 (ENSMFAG00000003491) DCAF4L1 (ENSMFAG00000004908) TMEM33 (ENSMFAG00000043209) PDS5A (ENSMFAG00000043276) #15 UBE2K (ENSMFAG00000030518) #16 ENSMFAG00000062205 SMIM14 (ENSMFAG00000045159) #18 UGDH (ENSMFAG00000038896) #20 LIAS (ENSMFAG00000040861) #21 RPL9 (ENSMFAG00000031293) #22 KLB (ENSMFAG00000003644) #23 RFC1 (ENSMFAG00000041957) #24 WDR19 (ENSMFAG00000001104) #25 KLHL5 (ENSMFAG00000042012) #26 TMEM156 (ENSMFAG00000043228) #27 FAM114A1 (ENSMFAG00000001528) #28 TLR6 (ENSMFAG00000002517) #29 TLR1 (ENSMFAG00000029809) #30 TLR10 (ENSMFAG00000029645) #31 KLF3 (ENSMFAG00000040858) #32 ENSMFAG00000049190 ENSMFAG00000060739 ENSMFAG00000002697 #33 ENSMFAG00000048341 ENSMFAG00000049523 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.a #22 Tree shrew DUPLICATION Tree shrew DUPLICATION Tree shrew DUPLICATION Tree shrew DUPLICATION Tree shrew DUPLICATION Tree shrew MODERN SPECIES 8847 ENSTBEG00000000339 #22 Tree shrew MODERN SPECIES 7516 ENSTBEG00000013791 #22 Tree shrew MODERN SPECIES 6467 ENSTBEG00000016586 #22 Tree shrew MODERN SPECIES 3130 ENSTBEG00000007280 #20 LIAS (ENSTBEG00000006400) #21 ENSTBEG00000006042 #22 KLB (ENSTBEG00000005041) #23 RFC1 (ENSTBEG00000003087) #24 WDR19 (ENSTBEG00000008475) #25 KLHL5 (ENSTBEG00000007829) #26 ENSTBEG00000007521 #27 FAM114A1 (ENSTBEG00000006251) #28 Tree shrew MODERN SPECIES 7168 ENSTBEG00000002164 #22 Tree shrew MODERN SPECIES 2299 ZMYM4 (ENSTBEG00000012066) ENSTBEG00000011986 #22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.a #22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.a #22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.a #22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.a #22 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 27 ENSHGLG00000002235 ENSHGLG00000002271 ENSHGLG00000002300 NETO2 (ENSHGLG00000002342) ITFG1 (ENSHGLG00000002469) PHKB (ENSHGLG00000002597) ENSHGLG00000032846 ENSHGLG00000012004 ENSHGLG00000048126 ENSHGLG00000047723 ENSHGLG00000039002 ENSHGLG00000003031 ENSHGLG00000048075 ENSHGLG00000003081 SIAH1 (ENSHGLG00000003142) ENSHGLG00000003222 #22 ENSHGLG00000019576 ENSHGLG00000044802 ENSHGLG00000011825 ENSHGLG00000018200 CHST2 (ENSHGLG00000041521) U2SURP (ENSHGLG00000017227) PAQR9 (ENSHGLG00000017213) PCOLCE2 (ENSHGLG00000017054) ENSHGLG00000048356 TRPC1 (ENSHGLG00000017039) ATR (ENSHGLG00000016875) XRN1 (ENSHGLG00000014476) GK5 (ENSHGLG00000014374) ENSHGLG00000033455 TFDP2 (ENSHGLG00000013441) Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.a #22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.a #22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.a #22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.a #22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.a #22 Rat MODERN SPECIES 7 Tusc3 (ENSRNOG00000013061) AABR07025986.2 (ENSRNOG00000057716) AABR07026002.1 (ENSRNOG00000032376) Dlc1 (ENSRNOG00000010780) Trmt9b (ENSRNOG00000011253) ENSRNOG00000066954 Lonrf1 (ENSRNOG00000053706) Prag1 (ENSRNOG00000011407) Cldn23 (ENSRNOG00000011424) LOC100910088 (ENSRNOG00000054809) Mfhas1 (ENSRNOG00000011431) Eri1 (ENSRNOG00000011448) Ppp1r3b (ENSRNOG00000011474) Tnks (ENSRNOG00000011625) Dusp4 (ENSRNOG00000011921) AABR07026048.1 (ENSRNOG00000031879) #22 Saraf (ENSRNOG00000012329) Leprotl1 (ENSRNOG00000012601) Mboat4 (ENSRNOG00000030102) Dctn6 (ENSRNOG00000013254) LOC100364509 (ENSRNOG00000050067) AABR07026059.1 (ENSRNOG00000031959) Rbpms (ENSRNOG00000013328) Gtf2e2 (ENSRNOG00000014422) Smim18 (ENSRNOG00000049689) ENSRNOG00000070491 Gsr (ENSRNOG00000014915) Ubxn8 (ENSRNOG00000015109) Ppp2cb (ENSRNOG00000015182) Tex15 (ENSRNOG00000007748) Purg (ENSRNOG00000015426) Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.a #22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.a #22 Golden Hamster MODERN SPECIES 666 Bbx (ENSMAUG00000012741) Cd47 (ENSMAUG00000009968) Ift57 (ENSMAUG00000001803) Myh15 (ENSMAUG00000002083) Cip2a (ENSMAUG00000000178) Dzip3 (ENSMAUG00000016010) ENSMAUG00000014727 ENSMAUG00000018846 Retnlb (ENSMAUG00000017128) Trat1 (ENSMAUG00000000687) Morc1 (ENSMAUG00000014778) Gm5485 (ENSMAUG00000013620) ENSMAUG00000011148 Dppa4 (ENSMAUG00000015913) ENSMAUG00000013101 ENSMAUG00000012459 #22 Nectin3 (ENSMAUG00000000044) Cd96 (ENSMAUG00000015667) Plcxd2 (ENSMAUG00000011354) Phldb2 (ENSMAUG00000010422) Abhd10 (ENSMAUG00000007568) Tagln3 (ENSMAUG00000004829) Tmprss7 (ENSMAUG00000009970) BC016579 (ENSMAUG00000010379) Gcsam (ENSMAUG00000009420) Slc9c1 (ENSMAUG00000014273) ENSMAUG00000012530 Cd200 (ENSMAUG00000006867) Btla (ENSMAUG00000010961) Atg3 (ENSMAUG00000009927) Slc35a5 (ENSMAUG00000000168) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00390000011368 ENSGT00940000159958 #7 ENSGT00950000183159.a #8 ENSGT00940000157306 #9 ENSGT00390000000002.a.a.a #10 ENSGT00940000157352 ENSGT00940000156979 #11 ENSGT00940000156077 #12 ENSGT00940000160078 #13 ENSGT00940000160604 #14 ENSGT00940000155155 #15 ENSGT00670000098059 #16 ENSGT00390000018294 #18 ENSGT00390000015355 #20 ENSGT00390000006234 #21 ENSGT00390000015224.c.a.a.a #22 ENSGT00940000157489 #23 ENSGT00730000111066 #24 ENSGT00590000083165 #25 ENSGT00940000155358 #26 ENSGT00390000017929 #27 ENSGT00390000010054.b #28 ENSGT00940000162201 #29 ENSGT00940000162884 #30 ENSGT00940000163662 #31 ENSGT00940000157456 #32 ENSGT00940000157949 #33 ENSGT00940000156247 #35 ENSGT00940000159709 #36 ENSGT00390000013778 #37 ENSGT00940000153648.b Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 53 ENSGT00390000011368 ENSGT00940000159958 #7 ENSGT00950000183159.a #8 ENSGT00940000157306 #9 ENSGT00390000000002.a.a.a #10 ENSGT00940000157352 ENSGT00940000156979 #11 ENSGT00940000156077 #12 ENSGT00940000160078 #13 ENSGT00940000160604 #14 ENSGT00940000155155 #15 ENSGT00670000098059 #16 ENSGT00390000018294 #18 ENSGT00390000015355 #20 ENSGT00390000006234 #21 ENSGT00390000015224.c.a.a.a #22 ENSGT00940000157489 #23 ENSGT00730000111066 #24 ENSGT00590000083165 #25 ENSGT00940000155358 #26 ENSGT00390000017929 #27 ENSGT00390000010054.b #28 ENSGT00940000162201 #29 ENSGT00940000162884 #30 ENSGT00940000163662 #31 ENSGT00940000157456 #32 ENSGT00940000157949 #33 ENSGT00940000156247 #35 ENSGT00940000159709 #36 ENSGT00390000013778 #37 ENSGT00940000153648.b Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 50 ENSGT00390000011368 ENSGT00940000159958 #7 ENSGT00950000183159.a #8 ENSGT00940000157306 #9 ENSGT00390000000002.a.a.a #10 ENSGT00940000157352 ENSGT00940000156979 #11 ENSGT00940000156077 #12 ENSGT00940000160078 #13 ENSGT00940000160604 #14 ENSGT00940000155155 #15 ENSGT00670000098059 #16 ENSGT00390000018294 #18 ENSGT00390000015355 #20 ENSGT00390000006234 #21 ENSGT00390000015224.c.a.a.a #22 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ENSGT00590000083165 #25 ENSGT00940000155358 #26 ENSGT00390000017929 #27 ENSGT00390000010054.b #28 ENSGT00940000162201 #29 ENSGT00940000162884 #30 ENSGT00940000163662 #31 ENSGT00940000157456 #32 ENSGT00940000157949 #33 ENSGT00940000156247 #35 ENSGT00940000159709 #36 ENSGT00390000013778 #37 Rabbit DUPLICATION Rabbit DUPLICATION Rabbit DUPLICATION Rabbit DUPLICATION Rabbit DUPLICATION Rabbit DUPLICATION Rabbit MODERN SPECIES 11 LIMCH1 (ENSOCUG00000015547) #8 ENSOCUG00000015459 UCHL1 (ENSOCUG00000001353) #9 APBB2 (ENSOCUG00000016932) #10 NSUN7 (ENSOCUG00000016920) RBM47 (ENSOCUG00000012034) #11 CHRNA9 (ENSOCUG00000017105) #12 RHOH (ENSOCUG00000005126) #13 N4BP2 (ENSOCUG00000005111) #14 PDS5A (ENSOCUG00000005880) #15 UBE2K (ENSOCUG00000005872) #16 ENSOCUG00000022085 ENSOCUG00000033560 #18 UGDH (ENSOCUG00000005531) #20 LIAS (ENSOCUG00000009096) #21 ENSOCUG00000009091 ##22 KLB (ENSOCUG00000009086) #23 RFC1 (ENSOCUG00000004739) #24 WDR19 (ENSOCUG00000004716) #25 KLHL5 (ENSOCUG00000010438) #26 TMEM156 (ENSOCUG00000000579) #27 FAM114A1 (ENSOCUG00000009603) #28 TLR6 (ENSOCUG00000006031) #29 TLR1 (ENSOCUG00000001824) #30 TLR10 (ENSOCUG00000003701) #31 KLF3 (ENSOCUG00000003698) #32 ENSOCUG00000022888 TBC1D1 (ENSOCUG00000012442) #33 PGM2 (ENSOCUG00000013740) #35 ENSOCUG00000036928 RELL1 (ENSOCUG00000003419) #36 Rabbit MODERN SPECIES 4 ENSOCUG00000035073 SLC16A1 (ENSOCUG00000016776) TAFA3 (ENSOCUG00000000280) PPM1J (ENSOCUG00000006310) ENSOCUG00000027213 MOV10 (ENSOCUG00000000276) CAPZA1 (ENSOCUG00000000270) ENSOCUG00000000269 WNT2B (ENSOCUG00000000266) CTTNBP2NL (ENSOCUG00000023315) ENSOCUG00000023372 KCND3 (ENSOCUG00000014279) DDX20 (ENSOCUG00000025939) INKA2 (ENSOCUG00000017680) RAP1A (ENSOCUG00000030320) ENSOCUG00000024498 ##22 ENSOCUG00000007822 ADORA3 (ENSOCUG00000023239) C1orf162 (ENSOCUG00000007816) ENSOCUG00000007809 WDR77 (ENSOCUG00000007801) OVGP1 (ENSOCUG00000015946) PIFO (ENSOCUG00000028213) CHI3L2 (ENSOCUG00000015772) DENND2D (ENSOCUG00000015755) CEPT1 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ENSOCUG00000024568 API5 (ENSOCUG00000034334) TTC17 (ENSOCUG00000014674) HSD17B12 (ENSOCUG00000016351) ALKBH3 (ENSOCUG00000016359) C11orf96 (ENSOCUG00000021313) ACCSL (ENSOCUG00000007146) EXT2 (ENSOCUG00000007361) ALX4 (ENSOCUG00000007369) Rabbit MODERN SPECIES 18 ENSOCUG00000035542 ENSOCUG00000027085 STRADB (ENSOCUG00000022279) TRAK2 (ENSOCUG00000000156) FLACC1 (ENSOCUG00000007135) ENSOCUG00000007128 ENSOCUG00000036865 ENSOCUG00000024651 ENSOCUG00000002567 CASP10 (ENSOCUG00000004510) CFLAR (ENSOCUG00000011072) NDUFB3 (ENSOCUG00000011069) ENSOCUG00000016854 HYCC2 (ENSOCUG00000010690) ORC2 (ENSOCUG00000010675) ENSOCUG00000021325 ##22 NIF3L1 (ENSOCUG00000010667) PPIL3 (ENSOCUG00000010661) CLK1 (ENSOCUG00000010653) ENSOCUG00000010647 ENSOCUG00000026480 ENSOCUG00000024593 ENSOCUG00000035654 AOX1 (ENSOCUG00000013971) ENSOCUG00000000547 ENSOCUG00000037416 KCTD18 (ENSOCUG00000011556) SPATS2L (ENSOCUG00000011549) ENSOCUG00000017946 ENSOCUG00000035705 ENSOCUG00000016464 Rabbit MODERN SPECIES 912 ENSOCUG00000014593 ENSOCUG00000004581 ENSOCUG00000014954 ENSOCUG00000027956 ##22 ENSOCUG00000038840 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.a.a ##22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.a.a ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.a.a ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.a.a ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.a.a ##22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.a.a ##22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.a.a ##22 Prairie vole DUPLICATION Prairie vole MODERN SPECIES 349 Slc30a9 (ENSMOCG00000014575) Tmem33 (ENSMOCG00000012538) Phox2b (ENSMOCG00000021271) #7 ENSMOCG00000000809 Uchl1 (ENSMOCG00000022795) #9 Apbb2 (ENSMOCG00000018223) #10 Nsun7 (ENSMOCG00000022890) Rbm47 (ENSMOCG00000021170) #11 Chrna9 (ENSMOCG00000013218) #12 Rhoh (ENSMOCG00000002547) #13 N4bp2 (ENSMOCG00000005150) #14 Pds5a (ENSMOCG00000018554) #15 Ube2k (ENSMOCG00000016915) #16 Ugdh (ENSMOCG00000021559) #20 Lias (ENSMOCG00000004333) #21 ENSMOCG00000013758 ##22 Klb (ENSMOCG00000022619) #23 Rfc1 (ENSMOCG00000023036) #24 Wdr19 (ENSMOCG00000017282) #25 Klhl5 (ENSMOCG00000000606) #26 Tmem156 (ENSMOCG00000011114) #27 Fam114a1 (ENSMOCG00000003632) #28 ENSMOCG00000002752 #32 ENSMOCG00000005398 ENSMOCG00000020501 Tbc1d1 (ENSMOCG00000000703) #33 Pgm2 (ENSMOCG00000002142) #35 Rell1 (ENSMOCG00000013662) #36 0610040J01Rik (ENSMOCG00000010145) #37 ENSMOCG00000004195 Nwd2 (ENSMOCG00000002726) Prairie vole MODERN SPECIES 15 Mgrn1 (ENSMOCG00000001522) Ubald1 (ENSMOCG00000022428) ENSMOCG00000021983 ENSMOCG00000004977 ENSMOCG00000022446 Nmral1 (ENSMOCG00000021416) Dnaja3 (ENSMOCG00000009730) Vasn (ENSMOCG00000009462) Coro7 (ENSMOCG00000009834) ENSMOCG00000004371 Glis2 (ENSMOCG00000022571) Tfap4 (ENSMOCG00000019994) Srl (ENSMOCG00000008208) Adcy9 (ENSMOCG00000021838) ENSMOCG00000010328 ENSMOCG00000022530 ##22 Crebbp (ENSMOCG00000016830) Trap1 (ENSMOCG00000010441) Dnase1 (ENSMOCG00000018529) ENSMOCG00000004024 Nlrc3 (ENSMOCG00000009820) Cluap1 (ENSMOCG00000004106) 1700037C18Rik (ENSMOCG00000008711) Naa60 (ENSMOCG00000016632) Zfp597 (ENSMOCG00000005901) Zfp174 (ENSMOCG00000004638) ENSMOCG00000001631 ENSMOCG00000010482 ENSMOCG00000002263 Zfp263 (ENSMOCG00000021995) Mefv (ENSMOCG00000021086) Euarchontoglires DUPLICATION Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.a.b.a ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.a.b.a ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.a.b.a ##22 Tarsier DUPLICATION Tarsier DUPLICATION Tarsier MODERN SPECIES 709 ENSTSYG00000035529 ##22 Tarsier MODERN SPECIES 752 ENSTSYG00000027256 ##22 Tarsier MODERN SPECIES 7165 ZNF529 (ENSTSYG00000005941) ZNF382 (ENSTSYG00000014470) ZNF461 (ENSTSYG00000027958) ZNF567 (ENSTSYG00000031166) ENSTSYG00000032959 ENSTSYG00000000427 ZNF146 (ENSTSYG00000034246) ZNF565 (ENSTSYG00000033964) ENSTSYG00000025699 ##22 COX7A1 (ENSTSYG00000030965) ENSTSYG00000035831 TBCB (ENSTSYG00000036938) POLR2I (ENSTSYG00000028318) OVOL3 (ENSTSYG00000030934) WDR62 (ENSTSYG00000008444) THAP8 (ENSTSYG00000004074) CLIP3 (ENSTSYG00000013828) ENSTSYG00000019400 SYNE4 (ENSTSYG00000013826) LRFN3 (ENSTSYG00000004621) TYROBP (ENSTSYG00000000470) HCST (ENSTSYG00000000471) NFKBID (ENSTSYG00000026336) Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.a.b.a ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.a.b.a ##22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.a.b.a ##22 Gibbon MODERN SPECIES 105 PHB1 (ENSNLEG00000002978) ZNF652 (ENSNLEG00000027071) ENSNLEG00000018816 ABI3 (ENSNLEG00000002938) ENSNLEG00000002931 B4GALNT2 (ENSNLEG00000002844) IGF2BP1 (ENSNLEG00000002786) GIP (ENSNLEG00000002767) SNF8 (ENSNLEG00000002743) ENSNLEG00000002739 ATP5MC1 (ENSNLEG00000002718) CALCOCO2 (ENSNLEG00000002619) TTLL6 (ENSNLEG00000002601) HOXB13 (ENSNLEG00000002594) ENSNLEG00000036120 ENSNLEG00000029075 ##22 HOXB6 (ENSNLEG00000002585) HOXB5 (ENSNLEG00000002574) HOXB4 (ENSNLEG00000002570) HOXB2 (ENSNLEG00000002566) ENSNLEG00000018815 SKAP1 (ENSNLEG00000002519) SNX11 (ENSNLEG00000002479) ENSNLEG00000002435 NFE2L1 (ENSNLEG00000002415) ENSNLEG00000002409 ENSNLEG00000002109 PRR15L (ENSNLEG00000002102) PNPO (ENSNLEG00000002062) ENSNLEG00000002058 SP6 (ENSNLEG00000002050) Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.a.b.a ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.a.b.a ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.a.b.a ##22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.a.b.a ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.a.b.a ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.a.b.a ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.a.b.a ##22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.a.b.a ##22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.a.b.a ##22 Prairie vole MODERN SPECIES 84 A2ml1 (ENSMOCG00000021791) Pzp (ENSMOCG00000000512) Fkbp4 (ENSMOCG00000004045) Itfg2 (ENSMOCG00000007429) Nrip2 (ENSMOCG00000011387) Tex52 (ENSMOCG00000019537) Foxm1 (ENSMOCG00000022353) Rhno1 (ENSMOCG00000013596) Tulp3 (ENSMOCG00000005977) Tead4 (ENSMOCG00000016979) Tspan9 (ENSMOCG00000002692) Tspan11 (ENSMOCG00000008444) Prmt8 (ENSMOCG00000002303) Cracr2a (ENSMOCG00000016052) Parp11 (ENSMOCG00000019262) ENSMOCG00000015905 ##22 Ccnd2 (ENSMOCG00000016031) Tigar (ENSMOCG00000009323) Fgf23 (ENSMOCG00000014012) Fgf6 (ENSMOCG00000013241) D6Wsu163e (ENSMOCG00000004952) Rad51ap1 (ENSMOCG00000019651) ENSMOCG00000015003 Dyrk4 (ENSMOCG00000013112) Akap3 (ENSMOCG00000012229) Ndufa9 (ENSMOCG00000008163) ENSMOCG00000010172 Kcna6 (ENSMOCG00000007165) Kcna1 (ENSMOCG00000003348) Kcna5 (ENSMOCG00000002810) ENSMOCG00000015356 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.a.b.b ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.a.b.b ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.a.b.b ##22 Tarsier MODERN SPECIES 6494 COL6A6 (ENSTSYG00000032018) COL6A5 (ENSTSYG00000012688) SMIM14 (ENSTSYG00000025656) #18 UGDH (ENSTSYG00000000454) #20 LIAS (ENSTSYG00000013876) #21 RPL9 (ENSTSYG00000033916) ##22 KLB (ENSTSYG00000006584) #23 RFC1 (ENSTSYG00000013946) #24 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.b ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.b ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.b ##22 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000159958 #7 ENSGT00950000183159.a #8 ENSGT00940000157306 #9 ENSGT00390000000002.a.a.a #10 ENSGT00940000157352 ENSGT00940000156979 #11 ENSGT00940000156077 #12 ENSGT00940000160078 #13 ENSGT00940000160604 #14 ENSGT00940000155155 #15 ENSGT00670000098059 #16 ENSGT00390000018294 #18 ENSGT00390000015355 #20 ENSGT00390000006234 #21 ENSGT00390000015224.c.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000015224.c.a.a.b.b ##22 ENSGT00940000157489 #23 ENSGT00730000111066 #24 ENSGT00590000083165 #25 ENSGT00940000155358 #26 ENSGT00390000017929 #27 ENSGT00390000010054.b #28 ENSGT00940000162201 #29 ENSGT00940000162884 #30 ENSGT00940000163662 #31 ENSGT00940000157456 #32 ENSGT00940000157949 #33 ENSGT00940000156247 #35 ENSGT00940000159709 #36 ENSGT00390000013778 #37 ENSGT00940000153648.b Pika MODERN SPECIES 2492 ENSOPRG00000010045 ##22 KLB (ENSOPRG00000010028) #23 RFC1 (ENSOPRG00000009989) #24 WDR19 (ENSOPRG00000009938) #25 Rabbit DUPLICATION Rabbit MODERN SPECIES 10 ACE (ENSOCUG00000001555) CYB561 (ENSOCUG00000026470) TANC2 (ENSOCUG00000001554) MARCHF10 (ENSOCUG00000012601) ENSOCUG00000017494 MRC2 (ENSOCUG00000031663) TLK2 (ENSOCUG00000006074) ENSOCUG00000011591 EFCAB3 (ENSOCUG00000001831) ENSOCUG00000033945 ENSOCUG00000029284 ENSOCUG00000013026 EFCAB13 (ENSOCUG00000038552) ENSOCUG00000024256 ITGB3 (ENSOCUG00000005579) ENSOCUG00000022076 ##22 MYL4 (ENSOCUG00000010829) CDC27 (ENSOCUG00000010815) KANSL1 (ENSOCUG00000011401) MAPT (ENSOCUG00000011386) SPPL2C (ENSOCUG00000028114) CRHR1 (ENSOCUG00000025701) ENSOCUG00000023198 NSF (ENSOCUG00000014783) WNT3 (ENSOCUG00000014805) WNT9B (ENSOCUG00000021211) GOSR2 (ENSOCUG00000003119) LYZL6 (ENSOCUG00000023930) RDM1 (ENSOCUG00000022704) MEIOC (ENSOCUG00000012383) CCDC43 (ENSOCUG00000017526) Rabbit MODERN SPECIES 5 SLC4A7 (ENSOCUG00000013596) ENSOCUG00000004133 EOMES (ENSOCUG00000000451) CMC1 (ENSOCUG00000012793) ENSOCUG00000014956 ZCWPW2 (ENSOCUG00000017720) ENSOCUG00000036953 RBMS3 (ENSOCUG00000004840) ENSOCUG00000026258 ENSOCUG00000030799 TGFBR2 (ENSOCUG00000015963) GADL1 (ENSOCUG00000000788) ENSOCUG00000036923 STT3B (ENSOCUG00000011918) OSBPL10 (ENSOCUG00000011925) ENSOCUG00000021645 ##22 ENSOCUG00000010093 CMTM8 (ENSOCUG00000035377) CMTM7 (ENSOCUG00000014724) ENSOCUG00000000764 DYNC1LI1 (ENSOCUG00000009535) CNOT10 (ENSOCUG00000011431) TRIM71 (ENSOCUG00000007612) GLB1 (ENSOCUG00000005824) CRTAP (ENSOCUG00000007741) SUSD5 (ENSOCUG00000015507) FBXL2 (ENSOCUG00000034278) UBP1 (ENSOCUG00000011063) ENSOCUG00000037306 CLASP2 (ENSOCUG00000000996) ENSOCUG00000035903 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.b ##22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.b ##22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.b ##22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.b ##22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.b ##22 Degu MODERN SPECIES 63 ENSODEG00000008680 ENSODEG00000007886 ENSODEG00000008390 NT5E (ENSODEG00000009213) SNX14 (ENSODEG00000009253) SYNCRIP (ENSODEG00000008768) ENSODEG00000009194 ENSODEG00000008344 ENSODEG00000019529 HTR1E (ENSODEG00000019516) Cga (ENSODEG00000009510) ENSODEG00000011652 ZNF292 (ENSODEG00000007524) SMIM8 (ENSODEG00000007885) C6orf163 (ENSODEG00000010057) ENSODEG00000009562 ##22 ENSODEG00000008775 CFAP206 (ENSODEG00000007616) SLC35A1 (ENSODEG00000009238) RARS2 (ENSODEG00000007822) ORC3 (ENSODEG00000008073) AKIRIN2 (ENSODEG00000008203) ENSODEG00000019522 ENSODEG00000019473 SPACA1 (ENSODEG00000009288) ENSODEG00000019610 CNR1 (ENSODEG00000008433) ENSODEG00000007826 ENSODEG00000019444 RNGTT (ENSODEG00000007302) ENSODEG00000019379 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 11 ENSHGLG00000044017 SOS2 (ENSHGLG00000011807) L2HGDH (ENSHGLG00000010171) DMAC2L (ENSHGLG00000042464) CDKL1 (ENSHGLG00000042701) ENSHGLG00000007162 MAP4K5 (ENSHGLG00000011509) ATL1 (ENSHGLG00000017094) ENSHGLG00000014486 ENSHGLG00000039372 NIN (ENSHGLG00000010798) ABHD12B (ENSHGLG00000017092) PYGL (ENSHGLG00000011923) TRIM9 (ENSHGLG00000011753) TMX1 (ENSHGLG00000012700) ENSHGLG00000046758 ##22 FRMD6 (ENSHGLG00000013454) GNG2 (ENSHGLG00000037657) ENSHGLG00000011931 NID2 (ENSHGLG00000012453) PTGDR (ENSHGLG00000011361) PTGER2 (ENSHGLG00000040443) TXNDC16 (ENSHGLG00000010925) ENSHGLG00000050455 GPR137C (ENSHGLG00000014860) ERO1A (ENSHGLG00000009956) PSMC6 (ENSHGLG00000012892) STYX (ENSHGLG00000009818) ENSHGLG00000014618 FERMT2 (ENSHGLG00000018139) DDHD1 (ENSHGLG00000019227) Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.b ##22 Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.b ##22 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.b ##22 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 624 TLE1 (ENSUPAG00010011030) ENSUPAG00010011100 ##22 Eurasian red squirrel DUPLICATION Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 14 ENSSVLG00005010885 ENSSVLG00005010915 SMIM10L1 (ENSSVLG00005010988) TAS2R42 (ENSSVLG00005011003) ENSSVLG00005011024 ENSSVLG00005011042 ENSSVLG00005011107 ENSSVLG00005011182 ENSSVLG00005011362 ENSSVLG00005013102 ETV6 (ENSSVLG00005013207) BCL2L14 (ENSSVLG00005013351) ENSSVLG00005013557 MANSC1 (ENSSVLG00005013792) BORCS5 (ENSSVLG00005013968) ENSSVLG00005014092 ##22 DUSP16 (ENSSVLG00005014160) ENSSVLG00005014288 CREBL2 (ENSSVLG00005014339) GPR19 (ENSSVLG00005014376) CDKN1B (ENSSVLG00005014387) APOLD1 (ENSSVLG00005014427) DDX47 (ENSSVLG00005014476) GPRC5A (ENSSVLG00005014537) GPRC5D (ENSSVLG00005014569) HEBP1 (ENSSVLG00005014606) ENSSVLG00005014743 FAM234B 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squirrel MODERN SPECIES 11 ENSSVLG00005011189 ATP10A (ENSSVLG00005010147) GABRB3 (ENSSVLG00005009710) GABRA5 (ENSSVLG00005009605) GABRG3 (ENSSVLG00005009456) ENSSVLG00005009420 OCA2 (ENSSVLG00005009249) HERC2 (ENSSVLG00005008754) ENSSVLG00005008701 NIPA1 (ENSSVLG00005008682) ENSSVLG00005008620 CYFIP1 (ENSSVLG00005008475) TUBGCP5 (ENSSVLG00005008437) FAH (ENSSVLG00005008412) ZFAND6 (ENSSVLG00005008321) ENSSVLG00005008292 ##22 BCL2A1 (ENSSVLG00005008264) MTHFS (ENSSVLG00005008240) MINAR1 (ENSSVLG00005008210) TMED3 (ENSSVLG00005008188) ANKRD34C (ENSSVLG00005008176) ENSSVLG00005008153 RASGRF1 (ENSSVLG00005007962) CTSH (ENSSVLG00005007841) MORF4L1 (ENSSVLG00005007603) ADAMTS7 (ENSSVLG00005007537) TBC1D2B (ENSSVLG00005007497) SH2D7 (ENSSVLG00005007466) CIB2 (ENSSVLG00005007403) ENSSVLG00005007289 ENSSVLG00005007245 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 18 ENSSVLG00005025387 ENSSVLG00005025393 YTHDC1 (ENSSVLG00005025412) TMPRSS11E (ENSSVLG00005025437) ENSSVLG00005025457 ENSSVLG00005025468 TMPRSS11F (ENSSVLG00005025478) ENSSVLG00005025490 TMPRSS11A (ENSSVLG00005025500) TMPRSS11D (ENSSVLG00005025516) ENSSVLG00005025527 GNRHR (ENSSVLG00005025536) UBA6 (ENSSVLG00005025549) STAP1 (ENSSVLG00005011286) CENPC (ENSSVLG00005011404) ENSSVLG00005011659 ##22 ENSSVLG00005011711 EPHA5 (ENSSVLG00005011847) ENSSVLG00005013082 TECRL (ENSSVLG00005013260) ENSSVLG00005013574 ENSSVLG00005013679 ENSSVLG00005013726 ENSSVLG00005013805 ADGRL3 (ENSSVLG00005014662) IGFBP7 (ENSSVLG00005018424) POLR2B (ENSSVLG00005018501) NOA1 (ENSSVLG00005018806) REST (ENSSVLG00005018896) ENSSVLG00005018966 HOPX (ENSSVLG00005019020) Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.b ##22 Kangaroo rat MODERN SPECIES 350 ENSDORG00000012413 Kcnj12 (ENSDORG00000004888) ENSDORG00000026977 ENSDORG00000026128 ENSDORG00000027227 ENSDORG00000028602 ENSDORG00000029302 ENSDORG00000019717 ENSDORG00000028128 ENSDORG00000025966 ENSDORG00000026610 ENSDORG00000029242 Rap1gap2 (ENSDORG00000008796) Ccdc92b 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ENSCGRG00001019287 #18 ENSCGRG00001016762 #20 Lias (ENSCGRG00001015441) #21 ENSCGRG00001020965 ##22 ENSCGRG00001019675 Klb (ENSCGRG00001018998) #23 Rfc1 (ENSCGRG00001016960) #24 Wdr19 (ENSCGRG00001023589) #25 Klhl5 (ENSCGRG00001010990) #26 Tmem156 (ENSCGRG00001022810) #27 Fam114a1 (ENSCGRG00001020236) #28 Tlr6 (ENSCGRG00001012094) #29 Tlr1 (ENSCGRG00001012288) #30 ENSCGRG00001011588 #31 Klf3 (ENSCGRG00001011019) #32 Tbc1d1 (ENSCGRG00001007939) #33 Pgm2 (ENSCGRG00001019866) #35 ENSCGRG00001017215 #36 0610040J01Rik (ENSCGRG00001016782) #37 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 1 ENSCGRG00001010578 Or9s14 (ENSCGRG00001024692) ENSCGRG00001009865 Or9s27 (ENSCGRG00001010630) ENSCGRG00001024695 Or9s23 (ENSCGRG00001010591) Or6b3 (ENSCGRG00001009820) Or6b2b (ENSCGRG00001010498) Or6b2 (ENSCGRG00001010619) Ndufa10 (ENSCGRG00001000771) Hdac4 (ENSCGRG00001003116) Twist2 (ENSCGRG00001010705) ENSCGRG00001024677 Asb1 (ENSCGRG00001024723) Traf3ip1 (ENSCGRG00001006330) ENSCGRG00001000697 ##22 Per2 (ENSCGRG00001006630) Hes6 (ENSCGRG00001024376) Ilkap (ENSCGRG00001007174) Erfe (ENSCGRG00001003481) Klhl30 (ENSCGRG00001024698) Espnl (ENSCGRG00001024719) Scly (ENSCGRG00001024710) ENSCGRG00001010672 Ramp1 (ENSCGRG00001024580) Rbm44 (ENSCGRG00001001293) ENSCGRG00001024654 Col6a3 (ENSCGRG00001024539) Cops8 (ENSCGRG00001024515) Ackr3 (ENSCGRG00001010122) Iqca (ENSCGRG00001024459) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 189 Zfp810 (ENSCGRG00001007369) Anln (ENSCGRG00001013117) 9530077C05Rik (ENSCGRG00001011224) Rp9 (ENSCGRG00001013075) Bbs9 (ENSCGRG00001023803) Bmper (ENSCGRG00001024435) Npsr1 (ENSCGRG00001018798) Dpy19l1 (ENSCGRG00001005835) Dpy19l2 (ENSCGRG00001010486) Tbx20 (ENSCGRG00001021722) Herpud2 (ENSCGRG00001007091) ENSCGRG00001021280 ENSCGRG00001005335 ENSCGRG00001010216 Eepd1 (ENSCGRG00001024478) ENSCGRG00001000691 ##22 B3gat1 (ENSCGRG00001000620) Glb1l2 (ENSCGRG00001022363) Glb1l3 (ENSCGRG00001009480) Gm1110 (ENSCGRG00001020876) Acad8 (ENSCGRG00001013515) Thyn1 (ENSCGRG00001017286) Vps26b (ENSCGRG00001022164) Ncapd3 (ENSCGRG00001000161) ENSCGRG00001012573 Jam3 (ENSCGRG00001023738) Igsf9b (ENSCGRG00001013580) Spata19 (ENSCGRG00001014202) Opcml (ENSCGRG00001007424) Ntm (ENSCGRG00001013170) ENSCGRG00001020006 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.b ##22 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.b ##22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.b ##22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.b ##22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.b ##22 spretus MODERN SPECIES Tmem37 (MGP_SPRETEiJ_G0015326) Sctr (MGP_SPRETEiJ_G0015325) Cfap221 (MGP_SPRETEiJ_G0015324) Tmem177 (MGP_SPRETEiJ_G0015323) Ptpn4 (MGP_SPRETEiJ_G0015322) Epb41l5 (MGP_SPRETEiJ_G0015321) Tmem185b (MGP_SPRETEiJ_G0015320) Ralb (MGP_SPRETEiJ_G0015319) Inhbb (MGP_SPRETEiJ_G0015318) Gli2 (MGP_SPRETEiJ_G0015317) Tfcp2l1 (MGP_SPRETEiJ_G0015316) Clasp1 (MGP_SPRETEiJ_G0015315) Nifk (MGP_SPRETEiJ_G0015314) Tsn (MGP_SPRETEiJ_G0015313) Cntnap5a (MGP_SPRETEiJ_G0015312) MGP_SPRETEiJ_G0015311 ##22 Dsel (MGP_SPRETEiJ_G0015310) Cdh19 (MGP_SPRETEiJ_G0015309) Cdh7 (MGP_SPRETEiJ_G0015308) Serpinb8 (MGP_SPRETEiJ_G0015307) MGP_SPRETEiJ_G0015306 MGP_SPRETEiJ_G0009400 Serpinb2 (MGP_SPRETEiJ_G0015305) Serpinb7 (MGP_SPRETEiJ_G0015304) Serpinb11 (MGP_SPRETEiJ_G0015303) MGP_SPRETEiJ_G0015302 MGP_SPRETEiJ_G0015301 MGP_SPRETEiJ_G0015300 MGP_SPRETEiJ_G0015299 Serpinb13 (MGP_SPRETEiJ_G0015298) Serpinb12 (MGP_SPRETEiJ_G0015297) Steppe mouse MODERN SPECIES 3242 Rcn2 (ENSMSIG00000009653) Pstpip1 (ENSMSIG00000009643) Tspan3 (ENSMSIG00000009598) Peak1 (ENSMSIG00000009563) Hmg20a (ENSMSIG00000009465) Lingo1 (ENSMSIG00000009439) Odf3l1 (ENSMSIG00000009373) Cspg4 (ENSMSIG00000009350) Snx33 (ENSMSIG00000009342) Imp3 (ENSMSIG00000009332) ENSMSIG00000009299 ##22 Snupn (ENSMSIG00000009260) Ptpn9 (ENSMSIG00000009163) Sin3a (ENSMSIG00000009029) Man2c1 (ENSMSIG00000008827) Neil1 (ENSMSIG00000008801) ENSMSIG00000008784 Trcg1 (ENSMSIG00000008739) 1700017B05Rik (ENSMSIG00000008719) Ppcdc (ENSMSIG00000008627) Scamp5 (ENSMSIG00000008605) ENSMSIG00000008593 Rpp25 (ENSMSIG00000008586) ENSMSIG00000008553 Fam219b (ENSMSIG00000008508) Mpi (ENSMSIG00000008470) Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.b ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.b ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.b ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.b ##22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.b ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.b ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.b ##22 Gorilla MODERN SPECIES 10 CEP89 (ENSGGOG00000014134) SLC7A9 (ENSGGOG00000011960) TDRD12 (ENSGGOG00000011938) NUDT19 (ENSGGOG00000007785) RGS9BP (ENSGGOG00000043355) ANKRD27 (ENSGGOG00000008596) ENSGGOG00000006169 DPY19L3 (ENSGGOG00000009160) ZNF507 (ENSGGOG00000010501) ENSGGOG00000043441 ENSGGOG00000041898 TSHZ3 (ENSGGOG00000003676) ZNF536 (ENSGGOG00000013640) ENSGGOG00000025255 URI1 (ENSGGOG00000005886) ENSGGOG00000037265 ##22 CCNE1 (ENSGGOG00000008452) C19orf12 (ENSGGOG00000014142) PLEKHF1 (ENSGGOG00000001698) VSTM2B (ENSGGOG00000009691) UQCRFS1 (ENSGGOG00000012978) ENSGGOG00000025826 ZNF254 (ENSGGOG00000041266) ZNF726 (ENSGGOG00000038878) ZNF681 (ENSGGOG00000036199) ENSGGOG00000036879 ENSGGOG00000040519 ZNF724 (ENSGGOG00000041632) ENSGGOG00000026936 ENSGGOG00000006443 ZNF728 (ENSGGOG00000043072) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.b ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.b ##22 Vervet Monkey MODERN SPECIES 19 PHOX2B (ENSCSAG00000017089) #7 LIMCH1 (ENSCSAG00000017086) #8 ENSCSAG00000017081 UCHL1 (ENSCSAG00000017078) #9 APBB2 (ENSCSAG00000017076) #10 NSUN7 (ENSCSAG00000017072) RBM47 (ENSCSAG00000017060) #11 CHRNA9 (ENSCSAG00000017058) #12 RHOH (ENSCSAG00000019690) #13 N4BP2 (ENSCSAG00000017054) #14 PDS5A (ENSCSAG00000017021) #15 UBE2K (ENSCSAG00000016961) #16 SMIM14 (ENSCSAG00000016958) #18 UGDH (ENSCSAG00000016955) #20 LIAS (ENSCSAG00000016937) #21 ENSCSAG00000016932 ##22 KLB (ENSCSAG00000016930) #23 RFC1 (ENSCSAG00000016924) #24 WDR19 (ENSCSAG00000016910) #25 ENSCSAG00000016887 KLHL5 (ENSCSAG00000016884) #26 TMEM156 (ENSCSAG00000016878) #27 FAM114A1 (ENSCSAG00000016873) #28 TLR6 (ENSCSAG00000019691) #29 TLR1 (ENSCSAG00000019692) #30 TLR10 (ENSCSAG00000019693) #31 KLF3 (ENSCSAG00000016868) #32 TBC1D1 (ENSCSAG00000016865) #33 PGM2 (ENSCSAG00000016846) #35 RELL1 (ENSCSAG00000016840) #36 C4orf19 (ENSCSAG00000016838) #37 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.b ##22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.b ##22 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 577 ENSMNEG00000032886 FRMD6 (ENSMNEG00000044483) GNG2 (ENSMNEG00000029726) ENSMNEG00000035942 RTRAF (ENSMNEG00000031967) NID2 (ENSMNEG00000044801) ENSMNEG00000043115 PTGDR (ENSMNEG00000029198) PTGER2 (ENSMNEG00000037348) TXNDC16 (ENSMNEG00000040284) GPR137C (ENSMNEG00000042110) ERO1A (ENSMNEG00000031859) ENSMNEG00000041519 STYX (ENSMNEG00000036478) GNPNAT1 (ENSMNEG00000033203) ENSMNEG00000028283 ##22 FERMT2 (ENSMNEG00000034205) ENSMNEG00000039526 DDHD1 (ENSMNEG00000044969) BMP4 (ENSMNEG00000036486) CDKN3 (ENSMNEG00000038387) CNIH1 (ENSMNEG00000029739) GMFB (ENSMNEG00000041895) ENSMNEG00000040434 SAMD4A (ENSMNEG00000031957) GCH1 (ENSMNEG00000040919) WDHD1 (ENSMNEG00000032489) SOCS4 (ENSMNEG00000018307) MAPK1IP1L (ENSMNEG00000038169) ENSMNEG00000024671 LGALS3 (ENSMNEG00000044514) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.b ##22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.b ##22 Drill MODERN SPECIES 660 WNT8B (ENSMLEG00000032662) ENSMLEG00000038669 PKD2L1 (ENSMLEG00000033807) BLOC1S2 (ENSMLEG00000044004) CWF19L1 (ENSMLEG00000036355) CHUK (ENSMLEG00000035776) ERLIN1 (ENSMLEG00000029926) CPN1 (ENSMLEG00000038257) DNMBP (ENSMLEG00000043828) ABCC2 (ENSMLEG00000037629) CUTC (ENSMLEG00000043325) COX15 (ENSMLEG00000030859) ENTPD7 (ENSMLEG00000031087) SLC25A28 (ENSMLEG00000034576) NKX2-3 (ENSMLEG00000006314) ENSMLEG00000014598 ##22 GOT1 (ENSMLEG00000028411) CNNM1 (ENSMLEG00000038123) ENSMLEG00000029234 Sooty mangabey MODERN SPECIES 659 FRMD6 (ENSCATG00000029402) GNG2 (ENSCATG00000039135) ENSCATG00000039598 RTRAF (ENSCATG00000044652) NID2 (ENSCATG00000033466) ENSCATG00000031429 PTGDR (ENSCATG00000037708) PTGER2 (ENSCATG00000039743) TXNDC16 (ENSCATG00000033073) GPR137C (ENSCATG00000037232) ERO1A (ENSCATG00000031793) ENSCATG00000030876 STYX (ENSCATG00000012449) GNPNAT1 (ENSCATG00000041819) FERMT2 (ENSCATG00000034280) ENSCATG00000035764 ##22 ENSCATG00000000732 DDHD1 (ENSCATG00000043261) BMP4 (ENSCATG00000042313) ENSCATG00000032779 CDKN3 (ENSCATG00000045220) CNIH1 (ENSCATG00000026544) GMFB (ENSCATG00000029526) ENSCATG00000029605 SAMD4A (ENSCATG00000043489) GCH1 (ENSCATG00000014083) WDHD1 (ENSCATG00000035221) SOCS4 (ENSCATG00000022174) ENSCATG00000029186 ENSCATG00000030277 LGALS3 (ENSCATG00000044749) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 110 ENSGT00390000015224.c.a.a.b.b ##22 ENSGT00520000055625.b ENSGT00940000160094 ENSGT00940000161292 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00940000162334 ENSGT00940000157649 ENSGT01060000248594.f ENSGT00950000183097.a.b ENSGT00940000155714 ENSGT00670000098080 ENSGT00940000156225.d ENSGT01000000214434.A ENSGT00510000046985.i ENSGT00940000157909 ENSGT01030000234579.A.b.x Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 699 ENSRBIG00000031667 ##22 DIPK2A (ENSRBIG00000011816) SLC9A9 (ENSRBIG00000030019) CHST2 (ENSRBIG00000026420) U2SURP (ENSRBIG00000041099) PCOLCE2 (ENSRBIG00000033789) TRPC1 (ENSRBIG00000023801) PLS1 (ENSRBIG00000043960) ATR (ENSRBIG00000037499) XRN1 (ENSRBIG00000041227) ENSRBIG00000033603 Golden snub-nosed monkey DUPLICATION Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2365 JDP2 (ENSRROG00000000567) FOS (ENSRROG00000038425) TMED10 (ENSRROG00000034110) NEK9 (ENSRROG00000011665) ZC2HC1C (ENSRROG00000045324) ENSRROG00000037333 MLH3 (ENSRROG00000029699) EIF2B2 (ENSRROG00000042761) PGF (ENSRROG00000034324) RPS6KL1 (ENSRROG00000033229) DLST (ENSRROG00000045190) PROX2 (ENSRROG00000033966) YLPM1 (ENSRROG00000039845) ENSRROG00000037201 AREL1 (ENSRROG00000031099) ENSRROG00000045039 ##22 LTBP2 (ENSRROG00000036111) ISCA2 (ENSRROG00000030258) NPC2 (ENSRROG00000037959) SYNDIG1L (ENSRROG00000041128) VRTN (ENSRROG00000010435) ABCD4 (ENSRROG00000036607) VSX2 (ENSRROG00000035399) LIN52 (ENSRROG00000038659) ALDH6A1 (ENSRROG00000035589) BBOF1 (ENSRROG00000039245) ENTPD5 (ENSRROG00000041922) COQ6 (ENSRROG00000045708) ENSRROG00000035842 ZNF410 (ENSRROG00000031456) PTGR2 (ENSRROG00000034050) Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2263 ENSRROG00000041560 ##22 DIPK2A (ENSRROG00000013599) SLC9A9 (ENSRROG00000037651) CHST2 (ENSRROG00000017813) U2SURP (ENSRROG00000043548) PAQR9 (ENSRROG00000015882) PCOLCE2 (ENSRROG00000040858) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.b ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.b ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.b ##22 Capuchin DUPLICATION Capuchin MODERN SPECIES 83 SLC38A6 (ENSCCAG00000035278) TMEM30B (ENSCCAG00000009844) PRKCH (ENSCCAG00000019880) ENSCCAG00000025133 ENSCCAG00000028667 SNAPC1 (ENSCCAG00000034167) ENSCCAG00000022752 SYT16 (ENSCCAG00000026935) ENSCCAG00000018604 ENSCCAG00000025329 KCNH5 (ENSCCAG00000034193) RHOJ (ENSCCAG00000024987) GPHB5 (ENSCCAG00000027509) PPP2R5E (ENSCCAG00000037562) SGPP1 (ENSCCAG00000034001) ENSCCAG00000019506 ##22 SYNE2 (ENSCCAG00000026686) ENSCCAG00000034981 ESR2 (ENSCCAG00000029359) MTHFD1 (ENSCCAG00000022359) ZBTB25 (ENSCCAG00000022177) ZBTB1 (ENSCCAG00000030403) HSPA2 (ENSCCAG00000029935) PPP1R36 (ENSCCAG00000027226) PLEKHG3 (ENSCCAG00000023706) SPTB (ENSCCAG00000011855) CHURC1 (ENSCCAG00000016703) GPX2 (ENSCCAG00000029816) RAB15 (ENSCCAG00000033681) FNTB (ENSCCAG00000037662) ENSCCAG00000030444 Capuchin MODERN SPECIES 47 ENSCCAG00000032225 ENSCCAG00000029185 #16 ENSCCAG00000021205 ENSCCAG00000022448 #18 UGDH (ENSCCAG00000037253) #20 LIAS (ENSCCAG00000034504) #21 ENSCCAG00000000333 ##22 KLB (ENSCCAG00000030177) #23 RFC1 (ENSCCAG00000019643) #24 WDR19 (ENSCCAG00000038131) #25 KLHL5 (ENSCCAG00000033107) #26 TMEM156 (ENSCCAG00000019785) #27 FAM114A1 (ENSCCAG00000001555) #28 ENSCCAG00000035205 KLF3 (ENSCCAG00000035557) #32 TBC1D1 (ENSCCAG00000029938) #33 ENSCCAG00000021574 ENSCCAG00000035751 #35 RELL1 (ENSCCAG00000033964) #36 C4orf19 (ENSCCAG00000025207) #37 ENSCCAG00000013077 NWD2 (ENSCCAG00000036260) Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.b ##22 Bushbaby DUPLICATION Bushbaby MODERN SPECIES 314 ENSOGAG00000033759 ENSOGAG00000025369 ##22 Bushbaby MODERN SPECIES 195 NCKAP5 (ENSOGAG00000029035) MGAT5 (ENSOGAG00000016482) TMEM163 (ENSOGAG00000016488) ACMSD (ENSOGAG00000001854) ENSOGAG00000028207 CCNT2 (ENSOGAG00000016793) MAP3K19 (ENSOGAG00000016799) RAB3GAP1 (ENSOGAG00000013299) ZRANB3 (ENSOGAG00000013307) R3HDM1 (ENSOGAG00000003136) UBXN4 (ENSOGAG00000002877) LCT (ENSOGAG00000002883) MCM6 (ENSOGAG00000008745) DARS1 (ENSOGAG00000005919) CXCR4 (ENSOGAG00000011319) ENSOGAG00000027169 ##22 THSD7B (ENSOGAG00000017173) HNMT (ENSOGAG00000006550) SPOPL (ENSOGAG00000015187) NXPH2 (ENSOGAG00000003113) ENSOGAG00000005855 ENSOGAG00000034729 ENSOGAG00000026964 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.b ##22 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.b ##22 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 874 ENSPCOG00000017711 SETD4 (ENSPCOG00000022679) ENSPCOG00000022805 ##22 RUNX1 (ENSPCOG00000018864) Mouse lemur DUPLICATION Mouse lemur MODERN SPECIES 22 GLDN (ENSMICG00000030199) DMXL2 (ENSMICG00000010807) SCG3 (ENSMICG00000010286) LYSMD2 (ENSMICG00000034220) TMOD3 (ENSMICG00000006216) ENSMICG00000041955 LEO1 (ENSMICG00000003454) ENSMICG00000000517 BCL2L10 (ENSMICG00000016608) GNB5 (ENSMICG00000001204) MYO5C (ENSMICG00000008381) MYO5A (ENSMICG00000013517) ENSMICG00000044868 ATOSA (ENSMICG00000011870) ENSMICG00000017806 ENSMICG00000046687 ##22 PYGO1 (ENSMICG00000035806) ENSMICG00000032770 PIERCE2 (ENSMICG00000030451) CCPG1 (ENSMICG00000035464) PIGB (ENSMICG00000002623) RAB27A (ENSMICG00000002622) RSL24D1 (ENSMICG00000036329) ENSMICG00000046817 UNC13C (ENSMICG00000047202) WDR72 (ENSMICG00000003702) ONECUT1 (ENSMICG00000029729) ENSMICG00000028340 ENSMICG00000042522 OR4Q2 (ENSMICG00000002537) OR4K2 (ENSMICG00000042868) Mouse lemur MODERN SPECIES 29 ENSMICG00000042936 SLC25A17 (ENSMICG00000008868) MCHR1 (ENSMICG00000008864) MRTFA (ENSMICG00000005671) SGSM3 (ENSMICG00000005645) ADSL (ENSMICG00000014085) TNRC6B (ENSMICG00000014056) FAM83F (ENSMICG00000016129) GRAP2 (ENSMICG00000016121) ENTHD1 (ENSMICG00000039602) CACNA1I (ENSMICG00000002043) RPS19BP1 (ENSMICG00000041581) ENSMICG00000045981 MIEF1 (ENSMICG00000011441) MGAT3 (ENSMICG00000034125) ENSMICG00000048095 ##22 TAB1 (ENSMICG00000011424) SYNGR1 (ENSMICG00000015846) RPL3 (ENSMICG00000015832) PDGFB (ENSMICG00000028335) CBX7 (ENSMICG00000033358) ENSMICG00000042733 ENSMICG00000041647 ENSMICG00000042615 ENSMICG00000043748 ENSMICG00000047191 CBX6 (ENSMICG00000029779) NPTXR (ENSMICG00000006434) DNAL4 (ENSMICG00000038096) SUN2 (ENSMICG00000011818) GTPBP1 (ENSMICG00000034218) Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b ##22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b ##22 Suina ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b ##22 Pig MODERN SPECIES 13 COL2A1 (ENSSSCG00000025523) ENSSSCG00000054670 ENSSSCG00000028397 VDR (ENSSSCG00000020864) HDAC7 (ENSSSCG00000027859) SLC48A1 (ENSSSCG00000036775) RAPGEF3 (ENSSSCG00000023526) ENDOU (ENSSSCG00000033142) RPAP3 (ENSSSCG00000021166) ENSSSCG00000043909 PCED1B (ENSSSCG00000000811) AMIGO2 (ENSSSCG00000000810) SLC38A4 (ENSSSCG00000026597) SLC38A2 (ENSSSCG00000000808) SLC38A1 (ENSSSCG00000000807) ENSSSCG00000034097 ##22 ENSSSCG00000059840 SCAF11 (ENSSSCG00000000806) ENSSSCG00000046889 ENSSSCG00000047850 ARID2 (ENSSSCG00000030685) ANO6 (ENSSSCG00000000804) DBX2 (ENSSSCG00000035938) NELL2 (ENSSSCG00000000802) TMEM117 (ENSSSCG00000000801) TWF1 (ENSSSCG00000000798) IRAK4 (ENSSSCG00000000799) PUS7L (ENSSSCG00000000800) ADAMTS20 (ENSSSCG00000000795) PRICKLE1 (ENSSSCG00000034491) ZCRB1 (ENSSSCG00000034066) Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b ##22 Camelidae ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000159958 #7 ENSGT00990000212839 ENSGT00950000183159.a #8 ENSGT00940000157306 #9 ENSGT00390000000002.a.a.a #10 ENSGT00940000157352 ENSGT00940000156979 #11 ENSGT00940000156077 #12 ENSGT00940000160078 #13 ENSGT00940000160604 #14 ENSGT00940000155155 #15 ENSGT00670000098059 #16 ENSGT00390000018294 #18 ENSGT00390000015355 #20 ENSGT00390000006234 #21 ENSGT00390000015224.c.a.a.b ##22 ENSGT00940000157489 #23 ENSGT00730000111066 #24 ENSGT00590000083165 #25 ENSGT00940000155358 #26 ENSGT00390000017929 #27 ENSGT00390000010054.b #28 ENSGT00940000162201 #29 ENSGT00940000162884 #30 ENSGT00940000163662 #31 ENSGT00940000157456 #32 ENSGT00940000157949 #33 ENSGT00940000156247 #35 ENSGT00940000159709 #36 ENSGT00390000013778 #37 ENSGT00940000153648.b Alpaca DUPLICATION Alpaca MODERN SPECIES 3522 ENSVPAG00000002027 #18 UGDH (ENSVPAG00000002025) #20 LIAS (ENSVPAG00000002024) #21 ENSVPAG00000002023 ##22 KLB (ENSVPAG00000002022) #23 RFC1 (ENSVPAG00000002020) #24 WDR19 (ENSVPAG00000002013) #25 KLHL5 (ENSVPAG00000002011) #26 Alpaca MODERN SPECIES 1602 ENSVPAG00000009904 ##22 TEX47 (ENSVPAG00000009903) ZNF804B (ENSVPAG00000009902) STEAP4 (ENSVPAG00000009901) SRI (ENSVPAG00000009900) ADAM22 (ENSVPAG00000009899) DBF4 (ENSVPAG00000009898) SLC25A40 (ENSVPAG00000009896) RUNDC3B (ENSVPAG00000009895) ABCB1 (ENSVPAG00000009894) ABCB4 (ENSVPAG00000009893) CROT (ENSVPAG00000009892) TMEM243 (ENSVPAG00000009891) DMTF1 (ENSVPAG00000009890) ENSVPAG00000009889 ENSVPAG00000009888 Arabian camel MODERN SPECIES 11 ENSCDRG00005004450 #7 ENSCDRG00005004465 LIMCH1 (ENSCDRG00005004629) #8 UCHL1 (ENSCDRG00005008827) #9 APBB2 (ENSCDRG00005009106) #10 NSUN7 (ENSCDRG00005009315) RBM47 (ENSCDRG00005009436) #11 CHRNA9 (ENSCDRG00005009587) #12 RHOH (ENSCDRG00005009658) #13 N4BP2 (ENSCDRG00005006332) #14 PDS5A (ENSCDRG00005006436) #15 UBE2K (ENSCDRG00005006762) #16 SMIM14 (ENSCDRG00005006861) #18 UGDH (ENSCDRG00005006935) #20 LIAS (ENSCDRG00005007094) #21 ENSCDRG00005008206 ##22 KLB (ENSCDRG00005008301) #23 RFC1 (ENSCDRG00005008364) #24 WDR19 (ENSCDRG00005008446) #25 KLHL5 (ENSCDRG00005008835) #26 TMEM156 (ENSCDRG00005010059) #27 FAM114A1 (ENSCDRG00005010142) #28 TLR6 (ENSCDRG00005010208) #29 TLR1 (ENSCDRG00005010240) #30 TLR10 (ENSCDRG00005010269) #31 KLF3 (ENSCDRG00005010297) #32 TBC1D1 (ENSCDRG00005010383) #33 PGM2 (ENSCDRG00005010550) #35 ENSCDRG00005010670 RELL1 (ENSCDRG00005010713) #36 C4orf19 (ENSCDRG00005010758) #37 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b ##22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b ##22 Percora_a DUPLICATION Percora_a DUPLICATION Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.e.a ##22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.e.a ##22 Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.e.a ##22 Bos DUPLICATION Bos ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000159447 ENSGT00940000160710 ENSGT00940000159976 ENSGT00390000000529 ENSGT00940000178229 ENSGT00940000158379 ENSGT00940000159607 ENSGT00390000018038 ENSGT00530000064123 ENSGT00390000016800 ENSGT00530000064194 ENSGT00940000153294.m.b ENSGT00390000004339.f ENSGT00390000006980 ENSGT00950000182858.A.a.a ENSGT00390000015224.c.a.a.b.e.a.a ##22 ENSGT00390000006452.b.a ENSGT00390000008726.h.a ENSGT00940000160015 ENSGT00940000157157.b ENSGT00940000159324 ENSGT00940000158199 ENSGT00940000156724 ENSGT00390000000560 ENSGT00940000160404 ENSGT00940000160570 ENSGT00390000008220 ENSGT00940000154667.a ENSGT00530000065015 ENSGT00940000159734 ENSGT00940000160316 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000159447 ENSGT00940000160710 ENSGT00940000159976 ENSGT00390000000529 ENSGT00940000178229 ENSGT00940000158379 ENSGT00940000159607 ENSGT00390000018038 ENSGT00530000064123 ENSGT00390000016800 ENSGT00530000064194 ENSGT00940000153294.m.b ENSGT00390000004339.f ENSGT00390000006980 ENSGT00950000182858.A.a.a ENSGT00390000015224.c.a.a.b.e.a.a ##22 ENSGT00390000006452.b.a ENSGT00390000008726.h.a ENSGT00940000160015 ENSGT00940000157157.b ENSGT00940000159324 ENSGT00940000158199 ENSGT00940000156724 ENSGT00390000000560 ENSGT00940000160404 ENSGT00940000160570 ENSGT00390000008220 ENSGT00940000154667.a ENSGT00530000065015 ENSGT00940000159734 ENSGT00940000160316 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 2 ADAMTSL2 (ENSBIXG00005029943) MYMK (ENSBIXG00005029930) SLC2A6 (ENSBIXG00005029919) CACFD1 (ENSBIXG00005029903) ADAMTS13 (ENSBIXG00005029885) REXO4 (ENSBIXG00005029874) STKLD1 (ENSBIXG00005029843) SURF4 (ENSBIXG00005029795) SURF2 (ENSBIXG00005029782) SURF1 (ENSBIXG00005029756) ENSBIXG00005029716 MED22 (ENSBIXG00005029700) SURF6 (ENSBIXG00005029689) ENSBIXG00005029686 ENSBIXG00005029668 ENSBIXG00005029644 ##22 DIPK1B (ENSBIXG00005029611) ENSBIXG00005029589 ENSBIXG00005029555 NOTCH1 (ENSBIXG00005029490) SEC16A (ENSBIXG00005007954) INPP5E (ENSBIXG00005000112) PMPCA (ENSBIXG00005008108) ENTR1 (ENSBIXG00005008201) SNAPC4 (ENSBIXG00005008329) CARD9 (ENSBIXG00005008353) DNLZ (ENSBIXG00005008367) GPSM1 (ENSBIXG00005008412) ENSBIXG00005008484 QSOX2 (ENSBIXG00005008520) LHX3 (ENSBIXG00005008551) Bos_a ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000159447 ENSGT00940000160710 ENSGT00940000159976 ENSGT00390000000529 ENSGT00940000178229 ENSGT00940000158379 ENSGT00940000159607 ENSGT00390000018038 ENSGT00530000064123 ENSGT00390000016800 ENSGT00530000064194 ENSGT00940000153294.m.b ENSGT00390000004339.f ENSGT00390000006980 ENSGT00950000182858.A.a.a ENSGT00390000015224.c.a.a.b.e.a.a ##22 ENSGT00390000006452.b.a ENSGT00390000008726.h.a ENSGT00940000160015 ENSGT00940000157157.b ENSGT00940000159324 ENSGT00940000158199 ENSGT00940000156724 ENSGT00390000000560 ENSGT00940000160404 ENSGT00940000160570 ENSGT00390000008220 ENSGT00940000154667.a ENSGT00530000065015 ENSGT00940000159734 ENSGT00940000160316 Domestic yak MODERN SPECIES 28 ENSBGRG00000004188 ADAMTSL2 (ENSBGRG00000004026) MYMK (ENSBGRG00000003992) SLC2A6 (ENSBGRG00000003941) CACFD1 (ENSBGRG00000003856) ADAMTS13 (ENSBGRG00000003687) REXO4 (ENSBGRG00000003644) STKLD1 (ENSBGRG00000003549) SURF4 (ENSBGRG00000003520) SURF2 (ENSBGRG00000003491) SURF1 (ENSBGRG00000003459) ENSBGRG00000025968 MED22 (ENSBGRG00000025954) SURF6 (ENSBGRG00000025947) ENSBGRG00000025935 ENSBGRG00000025928 ##22 DIPK1B (ENSBGRG00000025911) AGPAT2 (ENSBGRG00000025897) ENSBGRG00000025875 NOTCH1 (ENSBGRG00000025848) SEC16A (ENSBGRG00000025640) INPP5E (ENSBGRG00000025512) PMPCA (ENSBGRG00000025447) ENTR1 (ENSBGRG00000025355) ENSBGRG00000025344 SNAPC4 (ENSBGRG00000025195) CARD9 (ENSBGRG00000025118) DNLZ (ENSBGRG00000025104) GPSM1 (ENSBGRG00000024972) ENSBGRG00000024934 QSOX2 (ENSBGRG00000024893) Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.e.a.b ##22 Bos_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.e.a.b ##22 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 8 ARL6IP4 (ENSBIXG00005003078) OGFOD2 (ENSBIXG00005018997) ABCB9 (ENSBIXG00005019126) VPS37B (ENSBIXG00005019149) HIP1R (ENSBIXG00005019187) CCDC62 (ENSBIXG00005019229) ENSBIXG00005019274 HCAR1 (ENSBIXG00005019282) ENSBIXG00005019295 ENSBIXG00005003137 KNTC1 (ENSBIXG00005019365) RSRC2 (ENSBIXG00005007824) ZCCHC8 (ENSBIXG00005019437) CLIP1 (ENSBIXG00005019739) ENSBIXG00005019783 ENSBIXG00005000028 ##22 VPS33A (ENSBIXG00005019835) ENSBIXG00005019851 DIABLO (ENSBIXG00005019957) B3GNT4 (ENSBIXG00005019974) LRRC43 (ENSBIXG00005003282) MLXIP (ENSBIXG00005020064) BCL7A (ENSBIXG00005020098) CFAP251 (ENSBIXG00005020200) PSMD9 (ENSBIXG00005020244) HPD (ENSBIXG00005020260) ENSBIXG00005020265 SETD1B (ENSBIXG00005003413) ENSBIXG00005003423 RHOF (ENSBIXG00005020370) TMEM120B (ENSBIXG00005020423) Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.e.a ##22 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 11 IFNT6 (ENSOARG00020007406) TP-1P8 (ENSOARG00020007442) ENSOARG00020007481 IFNE (ENSOARG00020007524) ENSOARG00020007545 CDKN2A (ENSOARG00020007568) CDKN2B (ENSOARG00020007616) DMRTA1 (ENSOARG00020007643) ELAVL2 (ENSOARG00020007662) ENSOARG00020007723 IZUMO3 (ENSOARG00020007782) TUSC1 (ENSOARG00020007925) PLAA (ENSOARG00020008093) IFT74 (ENSOARG00020008192) LRRC19 (ENSOARG00020008306) ENSOARG00020008357 ##22 TEK (ENSOARG00020008433) MOB3B (ENSOARG00020008934) ENSOARG00020008983 IFNK (ENSOARG00020009030) C9orf72 (ENSOARG00020009060) LINGO2 (ENSOARG00020009133) ENSOARG00020009145 ENSOARG00020009228 ENSOARG00020009264 ACO1 (ENSOARG00020009310) RIGI (ENSOARG00020009445) ENSOARG00020009633 NDUFB6 (ENSOARG00020009670) TMEM215 (ENSOARG00020009741) ENSOARG00020009753 Siberian musk deer DUPLICATION Siberian musk deer MODERN SPECIES 243 PIGF (ENSMMSG00000010411) CRIPT (ENSMMSG00000010380) SOCS5 (ENSMMSG00000010366) ENSMMSG00000010348 MCFD2 (ENSMMSG00000010275) TTC7A (ENSMMSG00000010218) STPG4 (ENSMMSG00000010164) CALM2 (ENSMMSG00000010115) ENSMMSG00000010072 EPCAM (ENSMMSG00000010033) ENSMMSG00000009925 KCNK12 (ENSMMSG00000009891) MSH6 (ENSMMSG00000009764) FBXO11 (ENSMMSG00000009698) ENSMMSG00000009665 ENSMMSG00000009637 ##22 FOXN2 (ENSMMSG00000009580) PPP1R21 (ENSMMSG00000009439) STON1 (ENSMMSG00000009347) GTF2A1L (ENSMMSG00000009159) LHCGR (ENSMMSG00000008813) FSHR (ENSMMSG00000008638) NRXN1 (ENSMMSG00000004682) ENSMMSG00000004511 ENSMMSG00000004498 CHAC2 (ENSMMSG00000004484) ERLEC1 (ENSMMSG00000004416) ASB3 (ENSMMSG00000004359) PSME4 (ENSMMSG00000004288) ACYP2 (ENSMMSG00000004240) C2orf73 (ENSMMSG00000004228) Siberian musk deer MODERN SPECIES 257 FBN1 (ENSMMSG00000010464) ENSMMSG00000010905 SLC12A1 (ENSMMSG00000011169) CTXN2 (ENSMMSG00000011671) MYEF2 (ENSMMSG00000011680) SLC24A5 (ENSMMSG00000011715) SEMA6D (ENSMMSG00000011831) ENSMMSG00000011941 SQOR (ENSMMSG00000011958) BLOC1S6 (ENSMMSG00000012005) SLC30A4 (ENSMMSG00000012031) C15orf48 (ENSMMSG00000012059) SPATA5L1 (ENSMMSG00000012093) GATM (ENSMMSG00000012122) SLC28A2 (ENSMMSG00000012154) ENSMMSG00000012230 ##22 SHF (ENSMMSG00000012264) DUOX1 (ENSMMSG00000012375) DUOXA1 (ENSMMSG00000012480) DUOXA2 (ENSMMSG00000012519) DUOX2 (ENSMMSG00000012565) ENSMMSG00000012770 ENSMMSG00000012843 FERMT2 (ENSMMSG00000012876) DDHD1 (ENSMMSG00000012936) BMP4 (ENSMMSG00000013092) ENSMMSG00000013129 ENSMMSG00000013239 GMFB (ENSMMSG00000013304) ENSMMSG00000013332 CGRRF1 (ENSMMSG00000013338) Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.e.b ##22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.e.b ##22 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.e.b ##22 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 22 ENSOARG00020010607 MAD2L1 (ENSOARG00020010433) ENSOARG00020010353 ENSOARG00020010290 PRDM5 (ENSOARG00020009876) NDNF (ENSOARG00020023214) QRFPR (ENSOARG00020023156) ENSOARG00020023043 ENSOARG00020022998 SMIM43 (ENSOARG00020022984) EXOSC9 (ENSOARG00020022752) CCNA2 (ENSOARG00020022697) BBS7 (ENSOARG00020022348) NAF1 (ENSOARG00020022192) NPY1R (ENSOARG00020022088) ENSOARG00020022062 ##22 NPY5R (ENSOARG00020022048) TKTL2 (ENSOARG00020022023) TMA16 (ENSOARG00020021969) ENSOARG00020021780 ENSOARG00020021754 ENSOARG00020021727 ENSOARG00020021694 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.f ##22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.f ##22 Bovinae DUPLICATION Bovinae DUPLICATION Bovinae DUPLICATION Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.f.a.a.a ##22 American bison MODERN SPECIES 3175 MDGA2 (ENSBBBG00000013144) ENSBBBG00000002650 ENSBBBG00000006941 ENSBBBG00000013160 ##22 ENSBBBG00000002657 EPB42 (ENSBBBG00000013222) CCNDBP1 (ENSBBBG00000013271) TMEM62 (ENSBBBG00000013287) UBR1 (ENSBBBG00000013340) TTBK2 (ENSBBBG00000013385) CDAN1 (ENSBBBG00000013409) ENSBBBG00000002751 HAUS2 (ENSBBBG00000013436) LRRC57 (ENSBBBG00000013449) SNAP23 (ENSBBBG00000013515) ZNF106 (ENSBBBG00000013608) CAPN3 (ENSBBBG00000002966) GANC (ENSBBBG00000002998) TMEM87A (ENSBBBG00000013930) Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.f.a.a.a ##22 Bos_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.f.a.a.a ##22 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES SMCO1 (ENSBIXG00005002095) WDR53 (ENSBIXG00005002120) FBXO45 (ENSBIXG00005028962) NRROS (ENSBIXG00005005082) CEP19 (ENSBIXG00005002172) PIGX (ENSBIXG00005005074) ENSBIXG00005028898 PAK2 (ENSBIXG00005002269) SENP5 (ENSBIXG00005028817) NCBP2 (ENSBIXG00005004961) ENSBIXG00005002399 MELTF (ENSBIXG00005028632) DLG1 (ENSBIXG00005004898) ENSBIXG00005027979 ENSBIXG00005027967 ENSBIXG00005027926 ##22 BDH1 (ENSBIXG00005027899) APOD (ENSBIXG00005027860) ENSBIXG00005027819 ENSBIXG00005027794 ACAP2 (ENSBIXG00005027697) XXYLT1 (ENSBIXG00005027465) ENSBIXG00005027432 FAM43A (ENSBIXG00005007588) LSG1 (ENSBIXG00005027405) TMEM44 (ENSBIXG00005004715) ENSBIXG00005027317 ATP13A3 (ENSBIXG00005027247) GP5 (ENSBIXG00005004647) LRRC15 (ENSBIXG00005027046) CPN2 (ENSBIXG00005027039) Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.f.a.a.b ##22 American bison MODERN SPECIES 3372 ENSBBBG00000008596 ENSBBBG00000004237 ENSBBBG00000017142 ENSBBBG00000017157 ENSBBBG00000017228 ENSBBBG00000004267 DZIP1 (ENSBBBG00000004309) ENSBBBG00000006895 DNAJC3 (ENSBBBG00000017473) UGGT2 (ENSBBBG00000017576) ENSBBBG00000008773 ENSBBBG00000017599 ##22 OXGR1 (ENSBBBG00000017607) MBNL2 (ENSBBBG00000007311) RAP2A (ENSBBBG00000017655) IPO5 (ENSBBBG00000017759) FARP1 (ENSBBBG00000017811) STK24 (ENSBBBG00000017927) SLC15A1 (ENSBBBG00000017955) DOCK9 (ENSBBBG00000018467) GPR18 (ENSBBBG00000004545) GPR183 (ENSBBBG00000018495) UBAC2 (ENSBBBG00000018506) ENSBBBG00000009139 TM9SF2 (ENSBBBG00000018530) ENSBBBG00000018535 CLYBL (ENSBBBG00000018567) Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.f.a.a.b ##22 Bos_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.f.a.a.b ##22 Wild yak MODERN SPECIES 1661 DZIP1 (ENSBMUG00000025008) DNAJC3 (ENSBMUG00000024978) UGGT2 (ENSBMUG00000024962) ENSBMUG00000024936 ENSBMUG00000024930 ##22 Bovinae ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00390000000141 ENSGT00940000159611 ENSGT00950000183121.b.b.b.a ENSGT00530000063666.a ENSGT00390000008591 ENSGT00940000159242 ENSGT00730000111075.b ENSGT00940000161429 ENSGT00940000164351 ENSGT00390000011425.A ENSGT00940000156017 ENSGT00730000111570 ENSGT00950000183107.a.b.b ENSGT00940000162488 ENSGT00940000161206 ENSGT00390000015224.c.a.a.b.f.a.b ##22 ENSGT01030000234518.D ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT00940000163592 ENSGT00940000161697 ENSGT00390000008820.e.b.kb ENSGT00940000159568 ENSGT00390000012178.g.b.b.a.b.a ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00940000155902 ENSGT00940000160087 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000163487 ENSGT00940000158214 Bos ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00950000183121.b.b.b.a ENSGT00530000063666.a ENSGT00390000008591 ENSGT01030000235010.e.a ENSGT00940000159242 ENSGT00920000150804 ENSGT00730000111075.b ENSGT00940000161429 ENSGT00940000164351 ENSGT00390000011425.A ENSGT00940000156017 ENSGT00730000111570 ENSGT00950000183107.a.b.b ENSGT00940000162488 ENSGT00940000161206 ENSGT00390000015224.c.a.a.b.f.a.b ##22 ENSGT01030000234518.D ENSGT00390000007560.k.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT00390000009948.c.l ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT00940000163592 ENSGT00940000161697 ENSGT00390000008820.e.b.kb ENSGT00940000159568 ENSGT00390000012178.g.b.b.a.b.a ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00940000155902 ENSGT00940000160087 ENSGT00390000016333 Bos_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.f.a.b ##22 Wild yak MODERN SPECIES 947 ENSBMUG00000025832 ##22 GPR174 (ENSBMUG00000025831) ENSBMUG00000025828 P2RY10 (ENSBMUG00000025826) Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.f.b ##22 American bison MODERN SPECIES 3004 TMEM265 (ENSBBBG00000016113) PHKG2 (ENSBBBG00000016105) ENSBBBG00000016092 RNF40 (ENSBBBG00000016070) ENSBBBG00000002577 ZNF629 (ENSBBBG00000015954) ENSBBBG00000015941 ENSBBBG00000003958 ENSBBBG00000015900 FBXL19 (ENSBBBG00000000778) ENSBBBG00000003944 SETD1A (ENSBBBG00000015840) ENSBBBG00000015818 STX1B (ENSBBBG00000015794) STX4 (ENSBBBG00000015741) ENSBBBG00000015704 ##22 ZNF668 (ENSBBBG00000015697) ZNF646 (ENSBBBG00000015680) PRSS53 (ENSBBBG00000003914) VKORC1 (ENSBBBG00000003910) BCKDK (ENSBBBG00000015657) KAT8 (ENSBBBG00000003445) PRSS8 (ENSBBBG00000003474) PRSS36 (ENSBBBG00000015605) FUS (ENSBBBG00000003879) PYCARD (ENSBBBG00000015530) ITGAM (ENSBBBG00000015489) ENSBBBG00000002733 ITGAD (ENSBBBG00000003496) COX6A2 (ENSBBBG00000001268) ARMC5 (ENSBBBG00000001274) Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.f.b ##22 Bos_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.f.b ##22 Wild yak MODERN SPECIES 161 ENSBMUG00000001057 ##22 DIPK1B (ENSBMUG00000001082) AGPAT2 (ENSBMUG00000001095) EGFL7 (ENSBMUG00000001124) NOTCH1 (ENSBMUG00000002343) SEC16A (ENSBMUG00000003595) INPP5E (ENSBMUG00000004106) PMPCA (ENSBMUG00000004156) ENTR1 (ENSBMUG00000004170) SNAPC4 (ENSBMUG00000004338) CARD9 (ENSBMUG00000004473) DNLZ (ENSBMUG00000004493) GPSM1 (ENSBMUG00000004502) ENSBMUG00000004556 QSOX2 (ENSBMUG00000004633) LHX3 (ENSBMUG00000004664) Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b.f ##22 Rambouillet Sheep DUPLICATION Rambouillet Sheep MODERN SPECIES SIDT1 (ENSOARG00020000920) USF3 (ENSOARG00020001164) ENSOARG00020001188 ATP6V1A (ENSOARG00020001247) GRAMD1C (ENSOARG00020001279) ZDHHC23 (ENSOARG00020001306) QTRT2 (ENSOARG00020001329) DRD3 (ENSOARG00020001358) TIGIT (ENSOARG00020001397) ZBTB20 (ENSOARG00020001417) GAP43 (ENSOARG00020001439) ENSOARG00020001450 LSAMP (ENSOARG00020001493) ENSOARG00020001640 ENSOARG00020001649 ENSOARG00020001660 ##22 IGSF11 (ENSOARG00020001684) ENSOARG00020001734 UPK1B (ENSOARG00020001744) ENSOARG00020001778 B4GALT4 (ENSOARG00020001783) ARHGAP31 (ENSOARG00020001802) TMEM39A (ENSOARG00020001841) POGLUT1 (ENSOARG00020001870) TIMMDC1 (ENSOARG00020001894) CD80 (ENSOARG00020001923) ADPRH (ENSOARG00020001952) PLA1A (ENSOARG00020001966) POPDC2 (ENSOARG00020001991) ENSOARG00020002013 MAATS1 (ENSOARG00020002045) Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 2 JMJD6 (ENSOARG00020015823) METTL23 (ENSOARG00020015955) SRSF2 (ENSOARG00020016027) MFSD11 (ENSOARG00020016069) MGAT5B (ENSOARG00020016194) ENSOARG00020016717 SEC14L1 (ENSOARG00020016741) SEPTIN9 (ENSOARG00020016929) TNRC6C (ENSOARG00020017467) TMC6 (ENSOARG00020017886) TMC8 (ENSOARG00020018447) SYNGR2 (ENSOARG00020018496) TK1 (ENSOARG00020018573) AFMID (ENSOARG00020018639) ENSOARG00020018892 ENSOARG00020018998 ##22 TMEM235 (ENSOARG00020009890) ENSOARG00020009908 SOCS3 (ENSOARG00020009915) PGS1 (ENSOARG00020009946) DNAH17 (ENSOARG00020010169) CYTH1 (ENSOARG00020011632) ENSOARG00020011905 TIMP2 (ENSOARG00020012050) LGALS3BP (ENSOARG00020012170) CANT1 (ENSOARG00020012223) C1QTNF1 (ENSOARG00020012269) ENGASE (ENSOARG00020012300) RBFOX3 (ENSOARG00020012370) ENPP7 (ENSOARG00020012607) CBX2 (ENSOARG00020012762) Yarkand deer DUPLICATION Yarkand deer MODERN SPECIES 25 IRF2 (ENSCHYG00000024184) ENPP6 (ENSCHYG00000024145) STOX2 (ENSCHYG00000023957) TRAPPC11 (ENSCHYG00000023408) ENSCHYG00000023315 ING2 (ENSCHYG00000023296) CDKN2AIP (ENSCHYG00000023261) WWC2 (ENSCHYG00000022971) DCTD (ENSCHYG00000022883) TENM3 (ENSCHYG00000022619) ENSCHYG00000022559 ENSCHYG00000022545 AGA (ENSCHYG00000022427) NEIL3 (ENSCHYG00000022358) VEGFC (ENSCHYG00000022266) ENSCHYG00000022200 ##22 SPCS3 (ENSCHYG00000022146) ASB5 (ENSCHYG00000021912) ENSCHYG00000021801 WDR17 (ENSCHYG00000021271) GPM6A (ENSCHYG00000021180) ENSCHYG00000021137 ENSCHYG00000021124 ENSCHYG00000021098 ENSCHYG00000021054 ENSCHYG00000020988 ENSCHYG00000020951 ENSCHYG00000020894 ENSCHYG00000020857 ENSCHYG00000020810 ENSCHYG00000020786 Yarkand deer MODERN SPECIES 10 ENSCHYG00000022791 FBXO25 (ENSCHYG00000022825) TDRP (ENSCHYG00000022964) ENSCHYG00000023002 ENSCHYG00000023032 RUNX1 (ENSCHYG00000023067) SETD4 (ENSCHYG00000023190) ENSCHYG00000023267 ENSCHYG00000023358 ENSCHYG00000023378 ENSCHYG00000023406 DOP1B (ENSCHYG00000023458) MORC3 (ENSCHYG00000023622) CHAF1B (ENSCHYG00000023756) CLDN14 (ENSCHYG00000023819) ENSCHYG00000023833 ##22 SIM2 (ENSCHYG00000023901) HLCS (ENSCHYG00000024055) ENSCHYG00000024121 ENSCHYG00000024148 TTC3 (ENSCHYG00000024217) ENSCHYG00000024348 VPS26C (ENSCHYG00000007798) DYRK1A (ENSCHYG00000008074) KCNJ6 (ENSCHYG00000008127) ENSCHYG00000008174 KCNJ15 (ENSCHYG00000008186) ERG (ENSCHYG00000008261) ETS2 (ENSCHYG00000008759) ENSCHYG00000008930 PIK3R4 (ENSCHYG00000009005) Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b ##22 Blue whale MODERN SPECIES 40 ENSBMSG00010018543 DIPK2B (ENSBMSG00010018489) KDM6A (ENSBMSG00010018295) ENSBMSG00010018197 ENSBMSG00010018170 FUNDC1 (ENSBMSG00010018138) ENSBMSG00010018110 EFHC2 (ENSBMSG00010018037) MAOB (ENSBMSG00010017968) MAOA (ENSBMSG00010017862) ENSBMSG00010017837 ENSBMSG00010017732 ENSBMSG00010017689 ENSBMSG00010017659 ENSBMSG00010017638 ENSBMSG00010017593 ##22 GPR82 (ENSBMSG00010017574) GPR34 (ENSBMSG00010017560) ENSBMSG00010017550 CASK (ENSBMSG00010017223) ENSBMSG00010017131 NYX (ENSBMSG00010017109) ENSBMSG00010017095 DDX3X (ENSBMSG00010016859) USP9X (ENSBMSG00010016782) MED14 (ENSBMSG00010016504) CXorf38 (ENSBMSG00010016418) ENSBMSG00010016374 ENSBMSG00010016238 BCOR (ENSBMSG00010016120) MID1IP1 (ENSBMSG00010016089) Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b ##22 Sperm whale MODERN SPECIES 1045 ENSPCTG00005019645 ##22 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b ##22 Dolphin MODERN SPECIES 1263 SMIM14 (ENSTTRG00000014301) #18 UGDH (ENSTTRG00000014298) #20 LIAS (ENSTTRG00000014293) #21 ENSTTRG00000014289 ##22 KLB (ENSTTRG00000014287) #23 RFC1 (ENSTTRG00000014283) #24 WDR19 (ENSTTRG00000014278) #25 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b ##22 Vaquita MODERN SPECIES 6 TRRAP (ENSPSNG00000011688) TMEM130 (ENSPSNG00000011895) NPTX2 (ENSPSNG00000012212) BAIAP2L1 (ENSPSNG00000012292) ENSPSNG00000012465 TECPR1 (ENSPSNG00000012533) BHLHA15 (ENSPSNG00000012595) LMTK2 (ENSPSNG00000012631) ENSPSNG00000012777 ENSPSNG00000012850 ENSPSNG00000013097 ENSPSNG00000013383 PMS2 (ENSPSNG00000013449) AIMP2 (ENSPSNG00000013573) EIF2AK1 (ENSPSNG00000013745) ENSPSNG00000013966 ##22 USP42 (ENSPSNG00000013999) CYTH3 (ENSPSNG00000014047) ENSPSNG00000014115 FAM220A (ENSPSNG00000014179) ENSPSNG00000014218 RAC1 (ENSPSNG00000014278) DAGLB (ENSPSNG00000014394) ENSPSNG00000014592 KDELR2 (ENSPSNG00000014657) GRID2IP (ENSPSNG00000014825) ZDHHC4 (ENSPSNG00000015850) INTS15 (ENSPSNG00000015900) ZNF853 (ENSPSNG00000015959) ZNF316 (ENSPSNG00000016002) ZNF12 (ENSPSNG00000016057) Monodontidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b ##22 Beluga whale MODERN SPECIES 48 ENSDLEG00000020369 ENSDLEG00000020372 PDZD9 (ENSDLEG00000020380) CUNH16orf52 (ENSDLEG00000020384) VWA3A (ENSDLEG00000020400) EEF2K (ENSDLEG00000020469) POLR3E (ENSDLEG00000008497) CDR2 (ENSDLEG00000008602) ENSDLEG00000008633 METTL9 (ENSDLEG00000008655) IGSF6 (ENSDLEG00000008678) OTOA (ENSDLEG00000008724) HS3ST2 (ENSDLEG00000008843) USP31 (ENSDLEG00000008872) SCNN1G (ENSDLEG00000008999) ENSDLEG00000009034 ##22 SCNN1B (ENSDLEG00000009054) COG7 (ENSDLEG00000009125) ENSDLEG00000009230 GGA2 (ENSDLEG00000009246) ENSDLEG00000009288 EARS2 (ENSDLEG00000009316) UBFD1 (ENSDLEG00000009356) ENSDLEG00000009418 NDUFAB1 (ENSDLEG00000009430) PALB2 (ENSDLEG00000009456) DCTN5 (ENSDLEG00000009592) PLK1 (ENSDLEG00000009615) ERN2 (ENSDLEG00000009740) CHP2 (ENSDLEG00000010336) PRKCB (ENSDLEG00000010361) Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b ##22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b ##22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b ##22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b ##22 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b ##22 Ferret MODERN SPECIES 179 LIG4 (ENSMPUG00000018675) ABHD13 (ENSMPUG00000018673) TNFSF13B (ENSMPUG00000011167) MYO16 (ENSMPUG00000011157) ENSMPUG00000011154 COL4A1 (ENSMPUG00000011141) COL4A2 (ENSMPUG00000010634) RAB20 (ENSMPUG00000010630) CARS2 (ENSMPUG00000010627) ING1 (ENSMPUG00000010625) ANKRD10 (ENSMPUG00000010620) NAXD (ENSMPUG00000010617) ARHGEF7 (ENSMPUG00000010609) TEX29 (ENSMPUG00000010598) ENSMPUG00000010594 ENSMPUG00000010590 ##22 TUBGCP3 (ENSMPUG00000010469) ATP11A (ENSMPUG00000010457) ENSMPUG00000018671 MCF2L (ENSMPUG00000010436) F7 (ENSMPUG00000010383) F10 (ENSMPUG00000010244) PCID2 (ENSMPUG00000010226) CUL4A (ENSMPUG00000009958) LAMP1 (ENSMPUG00000009948) ENSMPUG00000009861 DCUN1D2 (ENSMPUG00000009807) TMCO3 (ENSMPUG00000009799) TFDP1 (ENSMPUG00000009700) ATP4B (ENSMPUG00000009485) GRK1 (ENSMPUG00000009251) American mink MODERN SPECIES 22 ALX1 (ENSNVIG00000000603) LRRIQ1 (ENSNVIG00000000618) TSN19 (ENSNVIG00000000703) S6A15 (ENSNVIG00000000728) ENSNVIG00000000773 TMTC2 (ENSNVIG00000000786) METTL25 (ENSNVIG00000000819) TAP26 (ENSNVIG00000000828) PPFIA2 (ENSNVIG00000000848) ACSS3 (ENSNVIG00000001229) LIN7A (ENSNVIG00000001269) MYF5 (ENSNVIG00000001283) MYF6 (ENSNVIG00000001298) PTPRQ (ENSNVIG00000001320) OTOGL (ENSNVIG00000001579) ENSNVIG00000001919 ##22 PPP1R12A (ENSNVIG00000001940) PAWR (ENSNVIG00000002283) SYT1 (ENSNVIG00000002313) ENSNVIG00000002371 NAV3 (ENSNVIG00000002412) E2F7 (ENSNVIG00000002695) ENSNVIG00000002763 ZDHHC17 (ENSNVIG00000002801) OSBPL8 (ENSNVIG00000002847) BBS10 (ENSNVIG00000003073) ENSNVIG00000003110 ENSNVIG00000003475 PHLDA1 (ENSNVIG00000003490) KRR1 (ENSNVIG00000003506) GLIPR1 (ENSNVIG00000003537) Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b ##22 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00520000059318 ENSGT00530000063666.a ENSGT00530000067269 ENSGT00390000008591 ENSGT00940000159242 ENSGT00730000111075.b ENSGT00940000161429 ENSGT00390000011425.A ENSGT00940000156017 ENSGT00730000111570 ENSGT00950000183107.a.b.b ENSGT00940000162488 ENSGT00950000182832.D.b ENSGT00940000161206 ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00390000015224.c.a.a.b ##22 ENSGT01030000234518.D ENSGT01100000263536.A.a.a.a ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT00940000163808 ENSGT01050000245003 ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT00940000161697 ENSGT00390000008820.e.b ENSGT00940000163576 ENSGT00940000159568 ENSGT00390000012178.g.b.b ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00980000202753 ENSGT00940000155902 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b ##22 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 25 SV2C (ENSRFEG00010014249) IQGAP2 (ENSRFEG00010014371) F2RL2 (ENSRFEG00010015786) F2R (ENSRFEG00010015825) F2RL1 (ENSRFEG00010015917) CRHBP (ENSRFEG00010015859) S100Z (ENSRFEG00010015950) AGGF1 (ENSRFEG00010016035) ZBED3 (ENSRFEG00010016086) PDE8B (ENSRFEG00010016179) WDR41 (ENSRFEG00010017690) OTP (ENSRFEG00010017860) TBCA (ENSRFEG00010017900) AP3B1 (ENSRFEG00010018051) ENSRFEG00010018153 ENSRFEG00010018181 ##22 SCAMP1 (ENSRFEG00010018228) LHFPL2 (ENSRFEG00010018294) ARSB (ENSRFEG00010018336) DMGDH (ENSRFEG00010018532) BHMT2 (ENSRFEG00010018710) BHMT (ENSRFEG00010018771) JMY (ENSRFEG00010018821) HOMER1 (ENSRFEG00010018881) TENT2 (ENSRFEG00010019113) CMYA5 (ENSRFEG00010019210) MTX3 (ENSRFEG00010019245) THBS4 (ENSRFEG00010019289) SERINC5 (ENSRFEG00010019347) SPZ1 (ENSRFEG00010019387) ZFYVE16 (ENSRFEG00010019402) Microbat DUPLICATION Microbat MODERN SPECIES 941 ENSMLUG00000027800 RPS6KA6 (ENSMLUG00000015440) ENSMLUG00000011590 POU3F4 (ENSMLUG00000004140) ENSMLUG00000006065 ENSMLUG00000025070 SH3BGRL (ENSMLUG00000010051) HMGN5 (ENSMLUG00000029467) ENSMLUG00000024815 ENSMLUG00000013978 BRWD3 (ENSMLUG00000005607) TENT5D (ENSMLUG00000000409) ENSMLUG00000024811 TBX22 (ENSMLUG00000016826) ITM2A (ENSMLUG00000010431) ENSMLUG00000025668 ##22 GPR174 (ENSMLUG00000005162) ENSMLUG00000025815 P2RY10 (ENSMLUG00000010499) LPAR4 (ENSMLUG00000006096) RTL3 (ENSMLUG00000002371) TAF9B (ENSMLUG00000014581) PGK1 (ENSMLUG00000017791) ENSMLUG00000026413 ATP7A (ENSMLUG00000025990) ENSMLUG00000022443 MAGT1 (ENSMLUG00000008595) ENSMLUG00000027763 ENSMLUG00000028355 ENSMLUG00000027761 FGF16 (ENSMLUG00000011190) Microbat DUPLICATION Microbat MODERN SPECIES 2506 TRPM4 (ENSMLUG00000004081) ENSMLUG00000029444 ##22 Microbat MODERN SPECIES 2444 ENSMLUG00000027531 ##22 VSTM1 (ENSMLUG00000023269) Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES 2499 ENSGT00390000006234 #21 ENSGT00390000015224.c.a.a.b ##22 Hedgehog DUPLICATION Hedgehog MODERN SPECIES 1243 LIAS (ENSEEUG00000004418) #21 ENSEEUG00000004394 ##22 Hedgehog MODERN SPECIES 9396 ENSEEUG00000000368 ##22 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b ##22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b ##22 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.a.b ##22 Hyrax MODERN SPECIES 2494 LIAS (ENSPCAG00000005895) #21 ENSPCAG00000005834 ##22 KLB (ENSPCAG00000005783) #23 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.b ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.b ##22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.b ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.b ##22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.b ##22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.b ##22 Camelidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.b ##22 Alpaca MODERN SPECIES 4118 ENSVPAG00000002226 ##22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.b ##22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.b ##22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.b ##22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.b ##22 Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.b ##22 Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.b ##22 Bos_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.b ##22 Cow MODERN SPECIES ENSBTAG00000050116 ENSBTAG00000013920 ENSBTAG00000049524 SPICE1 (ENSBTAG00000013937) SIDT1 (ENSBTAG00000013292) USF3 (ENSBTAG00000021000) NAA50 (ENSBTAG00000007784) ATP6V1A (ENSBTAG00000002703) GRAMD1C (ENSBTAG00000004971) ZDHHC23 (ENSBTAG00000004974) CCDC191 (ENSBTAG00000004975) QTRT2 (ENSBTAG00000004977) DRD3 (ENSBTAG00000002132) TIGIT (ENSBTAG00000011921) ZBTB20 (ENSBTAG00000011928) ENSBTAG00000047946 ##22 GAP43 (ENSBTAG00000006451) ENSBTAG00000049208 LSAMP (ENSBTAG00000049383) ENSBTAG00000048452 ENSBTAG00000048985 IGSF11 (ENSBTAG00000045704) TEX55 (ENSBTAG00000014157) UPK1B (ENSBTAG00000009014) B4GALT4 (ENSBTAG00000001390) ARHGAP31 (ENSBTAG00000000210) TMEM39A (ENSBTAG00000000213) POGLUT1 (ENSBTAG00000008562) TIMMDC1 (ENSBTAG00000012581) CD80 (ENSBTAG00000018059) ADPRH (ENSBTAG00000009391) Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.b ##22 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.b ##22 Sperm whale MODERN SPECIES 4 LNX2 (ENSPCTG00005013292) MTIF3 (ENSPCTG00005013236) GTF3A (ENSPCTG00005013180) RASL11A (ENSPCTG00005013101) RPL21 (ENSPCTG00005013013) USP12 (ENSPCTG00005012963) ENSPCTG00005012908 GPR12 (ENSPCTG00005012894) WASF3 (ENSPCTG00005012829) CDK8 (ENSPCTG00005012757) RNF6 (ENSPCTG00005012717) SHISA2 (ENSPCTG00005012685) ATP8A2 (ENSPCTG00005012320) NUP58 (ENSPCTG00005012207) MTMR6 (ENSPCTG00005012116) ENSPCTG00005012083 ##22 ENSPCTG00005012034 ENSPCTG00005011655 ENSPCTG00005011588 ENSPCTG00005011481 MIPEP (ENSPCTG00005011317) TNFRSF19 (ENSPCTG00005011147) SACS (ENSPCTG00005011024) SGCG (ENSPCTG00005010884) FGF9 (ENSPCTG00005010827) MICU2 (ENSPCTG00005010765) ZDHHC20 (ENSPCTG00005010655) MRPL57 (ENSPCTG00005010611) SKA3 (ENSPCTG00005010586) SAP18 (ENSPCTG00005010543) LATS2 (ENSPCTG00005010509) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.b ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.b ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.b ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.b ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.b ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.b ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.b ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.b ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.b ##22 Olive baboon MODERN SPECIES 13 METTL14 (ENSPANG00000015932) SEC24D (ENSPANG00000016989) SYNPO2 (ENSPANG00000008113) MYOZ2 (ENSPANG00000013128) USP53 (ENSPANG00000001095) C4orf3 (ENSPANG00000045313) FABP2 (ENSPANG00000008053) PDE5A (ENSPANG00000011908) ENSPANG00000037217 ENSPANG00000044973 MAD2L1 (ENSPANG00000019721) ENSPANG00000031623 ENSPANG00000049116 ENSPANG00000041603 PRDM5 (ENSPANG00000023612) ENSPANG00000011906 ##22 NDNF (ENSPANG00000040917) ENSPANG00000038766 TNIP3 (ENSPANG00000008756) QRFPR (ENSPANG00000039070) ENSPANG00000048379 ANXA5 (ENSPANG00000011025) ENSPANG00000038953 ENSPANG00000042448 ENSPANG00000030816 ENSPANG00000033569 ENSPANG00000045565 ENSPANG00000038330 SMIM43 (ENSPANG00000043689) EXOSC9 (ENSPANG00000000792) CCNA2 (ENSPANG00000008601) Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.b ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.b ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.b ##22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.b ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.b ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.b ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.b ##22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.b ##22 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.b ##22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.b ##22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.b ##22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.b ##22 Steppe mouse MODERN SPECIES 19 Poglut1 (ENSMSIG00000018915) Timmdc1 (ENSMSIG00000018900) ENSMSIG00000018884 Cd80 (ENSMSIG00000018801) Adprh (ENSMSIG00000018796) Pla1a (ENSMSIG00000018780) Popdc2 (ENSMSIG00000018749) Cox17 (ENSMSIG00000018737) Cfap91 (ENSMSIG00000018655) Nr1i2 (ENSMSIG00000018649) Gsk3b (ENSMSIG00000018514) Gpr156 (ENSMSIG00000018477) Lrrc58 (ENSMSIG00000018454) Btnl12 (ENSMSIG00000018429) Fstl1 (ENSMSIG00000018393) ENSMSIG00000018386 ##22 ENSMSIG00000018377 Hgd (ENSMSIG00000018328) ENSMSIG00000018320 Rabl3 (ENSMSIG00000018289) Gtf2e1 (ENSMSIG00000018274) ENSMSIG00000018266 Stxbp5l (ENSMSIG00000017754) ENSMSIG00000017745 Polq (ENSMSIG00000017530) Fbxo40 (ENSMSIG00000017504) Hcls1 (ENSMSIG00000017414) Golgb1 (ENSMSIG00000017297) Iqcb1 (ENSMSIG00000017244) Eaf2 (ENSMSIG00000017229) Slc15a2 (ENSMSIG00000017096) Rat MODERN SPECIES 12 Cabin1 (ENSRNOG00000001237) Susd2 (ENSRNOG00000033389) AABR07044631.2 (ENSRNOG00000062276) Ggt1 (ENSRNOG00000047697) Lrrc75b (ENSRNOG00000046428) Snrpd3 (ENSRNOG00000050410) Gucd1 (ENSRNOG00000049952) Upb1 (ENSRNOG00000038258) Adora2a (ENSRNOG00000001302) Specc1l (ENSRNOG00000001303) Bcr (ENSRNOG00000001304) ENSRNOG00000068163 Rab36 (ENSRNOG00000001311) Rsph14 (ENSRNOG00000001315) Gnaz (ENSRNOG00000001313) Rpl9-ps20 (ENSRNOG00000068097) ##22 Pcdh15 (ENSRNOG00000000606) Zwint (ENSRNOG00000048682) RGD1559903 (ENSRNOG00000000607) AABR07044714.1 (ENSRNOG00000053936) Ipmk (ENSRNOG00000000609) Rpl39-ps11 (ENSRNOG00000048073) Cisd1 (ENSRNOG00000000610) Ube2d1 (ENSRNOG00000000611) Tfam (ENSRNOG00000000613) ENSRNOG00000067041 Bicc1 (ENSRNOG00000000614) Phyhipl (ENSRNOG00000000274) Fam13c (ENSRNOG00000000275) Slc16a9 (ENSRNOG00000049063) Mrln (ENSRNOG00000069916) Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.b ##22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.b ##22 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 293 ENSCGRG00001006653 ##22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.b ##22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.b ##22 Naked mole-rat female DUPLICATION Naked mole-rat female MODERN SPECIES 4 DHX32 (ENSHGLG00000013097) FANK1 (ENSHGLG00000009806) ENSHGLG00000043454 ADAM12 (ENSHGLG00000014915) ENSHGLG00000004128 ENSHGLG00000017225 ENSHGLG00000043292 ENSHGLG00000015801 ENSHGLG00000017202 ENSHGLG00000046538 NPS (ENSHGLG00000011458) FOXI2 (ENSHGLG00000010615) CLRN3 (ENSHGLG00000010190) PTPRE (ENSHGLG00000015895) ENSHGLG00000046544 ENSHGLG00000021135 ##22 ENSHGLG00000039917 MGMT (ENSHGLG00000014053) EBF3 (ENSHGLG00000016339) ENSHGLG00000014516 GLRX3 (ENSHGLG00000016229) ENSHGLG00000038454 TCERG1L (ENSHGLG00000014281) ENSHGLG00000033671 ENSHGLG00000016574 ENSHGLG00000016646 JAKMIP3 (ENSHGLG00000018781) DPYSL4 (ENSHGLG00000012949) STK32C (ENSHGLG00000009808) ENSHGLG00000046735 PWWP2B (ENSHGLG00000043379) Naked mole-rat female MODERN SPECIES 31 ENSHGLG00000046508 KANTR (ENSHGLG00000037883) ENSHGLG00000019851 TSPYL2 (ENSHGLG00000003451) GPR173 (ENSHGLG00000002986) ENSHGLG00000035259 ENSHGLG00000036385 ENSHGLG00000045356 ENSHGLG00000042169 ENSHGLG00000000115 ENSHGLG00000000108 ENSHGLG00000000103 ENSHGLG00000042632 ENSHGLG00000000112 ENSHGLG00000001568 ENSHGLG00000001763 ##22 ENSHGLG00000019797 ENSHGLG00000001529 ENSHGLG00000001504 ENSHGLG00000048545 ENSHGLG00000046118 ENSHGLG00000004390 ENSHGLG00000048631 ENSHGLG00000003542 SHROOM4 (ENSHGLG00000003286) ENSHGLG00000038624 ENSHGLG00000003106 ENSHGLG00000002872 ENSHGLG00000002751 ENSHGLG00000002579 ENSHGLG00000002181 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.b ##22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.b ##22 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.b ##22 Elephant MODERN SPECIES 278 MOGS (ENSLAFG00000006045) MRPL53 (ENSLAFG00000007990) CCDC142 (ENSLAFG00000029911) LBX2 (ENSLAFG00000021732) PCGF1 (ENSLAFG00000018359) TLX2 (ENSLAFG00000018364) DQX1 (ENSLAFG00000018370) AUP1 (ENSLAFG00000018372) HTRA2 (ENSLAFG00000018377) LOXL3 (ENSLAFG00000018382) DOK1 (ENSLAFG00000027059) M1AP (ENSLAFG00000018384) HK2 (ENSLAFG00000012243) TACR1 (ENSLAFG00000015590) EVA1A (ENSLAFG00000012257) ENSLAFG00000025565 ##22 MRPL19 (ENSLAFG00000000146) GCFC2 (ENSLAFG00000002210) LRRTM4 (ENSLAFG00000004386) ENSLAFG00000028709 ENSLAFG00000002146 ENSLAFG00000030430 ENSLAFG00000017076 ENSLAFG00000026049 LRRTM1 (ENSLAFG00000018565) ENSLAFG00000006766 Tenrec MODERN SPECIES 14419 ENSETEG00000002415 ##22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a.b ##22 Armadillo DUPLICATION Armadillo MODERN SPECIES 1449 ENSDNOG00000042784 ID2 (ENSDNOG00000035918) KIDINS220 (ENSDNOG00000002905) MBOAT2 (ENSDNOG00000041557) ENSDNOG00000041786 ##22 ASAP2 (ENSDNOG00000008886) ITGB1BP1 (ENSDNOG00000008930) CPSF3 (ENSDNOG00000008940) IAH1 (ENSDNOG00000009272) ADAM17 (ENSDNOG00000009284) ENSDNOG00000033666 TAF1B (ENSDNOG00000018268) GRHL1 (ENSDNOG00000014493) KLF11 (ENSDNOG00000035689) ENSDNOG00000047738 ENSDNOG00000012581 ##22 Armadillo MODERN SPECIES 2797 SPATA45 (ENSDNOG00000003477) FLVCR1 (ENSDNOG00000031484) ENSDNOG00000038786 VASH2 (ENSDNOG00000008969) ANGEL2 (ENSDNOG00000008978) ENSDNOG00000013631 ENSDNOG00000042638 PROX1 (ENSDNOG00000001297) SMYD2 (ENSDNOG00000014059) PTPN14 (ENSDNOG00000014080) CENPF (ENSDNOG00000010010) KCNK2 (ENSDNOG00000008257) KCTD3 (ENSDNOG00000002406) USH2A (ENSDNOG00000002408) ESRRG (ENSDNOG00000037798) ENSDNOG00000037766 ##22 Armadillo MODERN SPECIES 2343 PPIP5K1 (ENSDNOG00000005820) ENSDNOG00000045635 STRC (ENSDNOG00000049170) PDIA3 (ENSDNOG00000046246) ELL3 (ENSDNOG00000017756) ENSDNOG00000025123 HYPK (ENSDNOG00000006092) MFAP1 (ENSDNOG00000006125) WDR76 (ENSDNOG00000004729) FRMD5 (ENSDNOG00000043593) ENSDNOG00000043777 ##22 GOLM2 (ENSDNOG00000017815) CTDSPL2 (ENSDNOG00000000228) EIF3J (ENSDNOG00000042545) SPG11 (ENSDNOG00000000762) ENSDNOG00000032325 ##22 PATL2 (ENSDNOG00000036837) B2M (ENSDNOG00000038230) TRIM69 (ENSDNOG00000011843) SORD (ENSDNOG00000045476) DUOX2 (ENSDNOG00000018036) DUOXA2 (ENSDNOG00000024760) DUOXA1 (ENSDNOG00000024883) DUOX1 (ENSDNOG00000018039) SHF (ENSDNOG00000033228) SLC28A2 (ENSDNOG00000008853) GATM (ENSDNOG00000003385) SPATA5L1 (ENSDNOG00000017889) Marsupialia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a #22 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a #22 Tasmanian devil MODERN SPECIES 5 TMEM33 (ENSSHAG00000014708) PHOX2B (ENSSHAG00000015235) #7 ENSSHAG00000015379 #8 UCHL1 (ENSSHAG00000020618) #9 APBB2 (ENSSHAG00000016906) #10 NSUN7 (ENSSHAG00000017276) RBM47 (ENSSHAG00000017576) #11 CHRNA9 (ENSSHAG00000017834) #12 RHOH (ENSSHAG00000031303) #13 N4BP2 (ENSSHAG00000004062) #14 PDS5A (ENSSHAG00000006136) #15 UBE2K (ENSSHAG00000021204) #16 SMIM14 (ENSSHAG00000023062) #18 UGDH (ENSSHAG00000003076) #20 LIAS (ENSSHAG00000027361) #21 ENSSHAG00000004918 #22 KLB (ENSSHAG00000005141) #23 RFC1 (ENSSHAG00000005764) #24 WDR19 (ENSSHAG00000006541) #25 ENSSHAG00000007383 #25 KLHL5 (ENSSHAG00000008601) #26 ENSSHAG00000009519 #27 FAM114A1 (ENSSHAG00000009933) #28 TLR6 (ENSSHAG00000010462) #29 TLR10 (ENSSHAG00000010643) #31 KLF3 (ENSSHAG00000026965) #32 TBC1D1 (ENSSHAG00000013165) #33 PGM2 (ENSSHAG00000005459) #35 RELL1 (ENSSHAG00000023710) #36 ENSSHAG00000002940 #37 NWD2 (ENSSHAG00000005236) Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a #22 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a #22 koala MODERN SPECIES 95 ENSPCIG00000012534 SH3GL2 (ENSPCIG00000012532) ENSPCIG00000022106 ENSPCIG00000022111 ENSPCIG00000033033 SAXO1 (ENSPCIG00000019971) ENSPCIG00000002401 ENSPCIG00000002436 FSD1L (ENSPCIG00000001982) FKTN (ENSPCIG00000001947) TAL2 (ENSPCIG00000001924) TMEM38B (ENSPCIG00000001911) ENSPCIG00000035409 ENSPCIG00000006676 KLF4 (ENSPCIG00000006850) ENSPCIG00000006853 #22 ENSPCIG00000013786 ENSPCIG00000013785 ENSPCIG00000018412 ENSPCIG00000005457 ENSPCIG00000010107 RNF20 (ENSPCIG00000010110) PGAP4 (ENSPCIG00000034771) ALDOB (ENSPCIG00000010113) MRPL50 (ENSPCIG00000031733) BAAT (ENSPCIG00000010117) ENSPCIG00000005767 Sauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a #22 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a #22 Episquamata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a #22 Laterata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015224.c.a #22 Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 23 ENSSMRG00000016264 ENSSMRG00000016258 SLITRK5 (ENSSMRG00000016254) ENSSMRG00000016253 DHPS (ENSSMRG00000016252) SLITRK6 (ENSSMRG00000016251) ENSSMRG00000016249 SLITRK1 (ENSSMRG00000016247) ENSSMRG00000016246 ENSSMRG00000016244 SPRY2 (ENSSMRG00000016242) NDFIP2 (ENSSMRG00000016238) RBM26 (ENSSMRG00000016237) OBI1 (ENSSMRG00000016234) POU4F1 (ENSSMRG00000016233) ENSSMRG00000016231 #22 EDNRB (ENSSMRG00000016230) ENSSMRG00000016229 IPO5 (ENSSMRG00000015244) FARP1 (ENSSMRG00000015242) STK24 (ENSSMRG00000015241) SLC15A1 (ENSSMRG00000015240) DOCK9 (ENSSMRG00000015239) GPR18 (ENSSMRG00000015238) ENSSMRG00000015237 UBAC2 (ENSSMRG00000015236) TM9SF2 (ENSSMRG00000015235) CLYBL (ENSSMRG00000015234) ZIC5 (ENSSMRG00000015232) ZIC2 (ENSSMRG00000015231) PCCA (ENSSMRG00000015228)