Neopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b #25 Osteoglossocephalai DUPLICATION Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.a #25 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 293 ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a ##12 ENSGT01020000230605 ENSGT00940000165118.a.a.a.b ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.a.c.a ##25 ENSGT00940000166432.c.b.b.a ##37 ENSGT00940000166867 ENSGT00940000165759 ENSGT00940000164468.a.a.b.b ENSGT00940000164468.a.b.a.b ENSGT00940000164983.d.b ENSGT00940000181572 ENSGT00940000164468.a.a.a.a ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.a.a.b ENSGT00940000164983.d.a.b ENSGT01020000232025 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 296 ENSGT00940000164725.a.a.a.a ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.a ##12 ENSGT00940000164173.b.a.c.a ##25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a #25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a #37 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a #36 ENSGT00940000177513.a ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000156683 Acanthomorphata DUPLICATION Acanthomorphata DUPLICATION Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 614 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 527 ENSGT01100000264160 #18 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 Pinecone sodierfish DUPLICATION Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 1 ENSMMDG00005002722 #7 ENSMMDG00005002746 #8 ENSMMDG00005002771 #9 ENSMMDG00005002794 #10 ENSMMDG00005002799 #11 ENSMMDG00005002805 #12 ENSMMDG00005002823 #13 ENSMMDG00005002843 #14 ENSMMDG00005002929 #15 ENSMMDG00005002938 #16 ENSMMDG00005002943 #17 ENSMMDG00005002947 #18 ENSMMDG00005002957 #19 ENSMMDG00005002973 #20 ENSMMDG00005002981 #21 ENSMMDG00005002984 #22 ENSMMDG00005002989 #23 ENSMMDG00005002994 #24 ENSMMDG00005003000 #25 pcdh2ac (ENSMMDG00005003028) #26 ENSMMDG00005003176 #27 ENSMMDG00005003181 #28 ENSMMDG00005003194 #29 ENSMMDG00005003201 #30 ENSMMDG00005003206 #31 ENSMMDG00005003210 #32 ENSMMDG00005003219 #33 ENSMMDG00005003228 #34 ENSMMDG00005003235 #35 ENSMMDG00005003245 #36 ENSMMDG00005003250 #37 Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 1 ENSMMDG00005002746 #8 ENSMMDG00005002771 #9 ENSMMDG00005002794 #10 ENSMMDG00005002799 #11 ENSMMDG00005002805 #12 ENSMMDG00005002823 #13 ENSMMDG00005002843 #14 ENSMMDG00005002929 #15 ENSMMDG00005002938 #16 ENSMMDG00005002943 #17 ENSMMDG00005002947 #18 ENSMMDG00005002957 #19 ENSMMDG00005002973 #20 ENSMMDG00005002981 #21 ENSMMDG00005002984 #22 ENSMMDG00005002989 #23 ENSMMDG00005002994 #24 ENSMMDG00005003000 #25 pcdh2ac (ENSMMDG00005003028) #26 ENSMMDG00005003176 #27 ENSMMDG00005003181 #28 ENSMMDG00005003194 #29 ENSMMDG00005003201 #30 ENSMMDG00005003206 #31 ENSMMDG00005003210 #32 ENSMMDG00005003219 #33 ENSMMDG00005003228 #34 ENSMMDG00005003235 #35 ENSMMDG00005003245 #36 ENSMMDG00005003250 #37 ENSMMDG00005003253 ##37 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 226 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 47 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT01090000260159 #27 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 56 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01100000264899 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 58 ENSGT01030000236108 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01100000264899 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 50 ENSGT01030000236108 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01100000264899 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 Ballan wrasse MODERN SPECIES 4092 ENSLBEG00000006457 #23 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 56 ENSGT01030000236108 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01100000264899 Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000159553.b ENSGT01010000224686 ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.j ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01100000264899 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.`b #25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.f #37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 ENSSAUG00010004690 ENSSAUG00010004699 ##12 ENSSAUG00010004703 ##12 ENSSAUG00010004705 #8 ENSSAUG00010004707 #12 ENSSAUG00010004714 #12 ENSSAUG00010004718 ENSSAUG00010004720 #12 ENSSAUG00010004722 #12 ENSSAUG00010004724 #15 ENSSAUG00010004734 #15 ENSSAUG00010004736 #15 ENSSAUG00010004738 ENSSAUG00010004742 ##25 ENSSAUG00010004745 #23 ENSSAUG00010004748 #23 ENSSAUG00010004749 ENSSAUG00010004750 #25 ENSSAUG00010004752 #25 ENSSAUG00010004753 #25 ENSSAUG00010004755 ##25 ENSSAUG00010004757 #27 ENSSAUG00010004761 #35 ENSSAUG00010004762 #35 ENSSAUG00010004765 #29 ENSSAUG00010004768 ##37 ENSSAUG00010004772 ##37 ENSSAUG00010004775 ##37 ENSSAUG00010004777 #37 ENSSAUG00010004780 ##37 ENSSAUG00010004782 ##37 Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 ENSSAUG00010004689 ENSSAUG00010004690 ENSSAUG00010004699 ##12 ENSSAUG00010004703 ##12 ENSSAUG00010004705 #8 ENSSAUG00010004707 #12 ENSSAUG00010004714 #12 ENSSAUG00010004718 ENSSAUG00010004720 #12 ENSSAUG00010004722 #12 ENSSAUG00010004724 #15 ENSSAUG00010004734 #15 ENSSAUG00010004736 #15 ENSSAUG00010004738 ENSSAUG00010004742 ##25 ENSSAUG00010004745 #23 ENSSAUG00010004748 #23 ENSSAUG00010004749 ENSSAUG00010004750 #25 ENSSAUG00010004752 #25 ENSSAUG00010004753 #25 ENSSAUG00010004755 ##25 ENSSAUG00010004757 #27 ENSSAUG00010004761 #35 ENSSAUG00010004762 #35 ENSSAUG00010004765 #29 ENSSAUG00010004768 ##37 ENSSAUG00010004772 ##37 ENSSAUG00010004775 ##37 ENSSAUG00010004777 #37 ENSSAUG00010004780 ##37 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000166070 ENSGT00940000158371 ENSGT00390000009004.d ENSGT00940000155898 ENSGT00940000159553.b ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.a #25 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.b #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 106 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 Pike perch MODERN SPECIES 18 ENSSLUG00000004894 pcdh2aa1 (ENSSLUG00000004874) ##12 ENSSLUG00000004868 ##12 ENSSLUG00000004866 ##12 ENSSLUG00000004863 ENSSLUG00000004862 ENSSLUG00000004857 ##12 ENSSLUG00000004846 #8 ENSSLUG00000004828 #9 ENSSLUG00000004815 #12 ENSSLUG00000004811 #20 ENSSLUG00000004807 #15 ENSSLUG00000004799 #15 ENSSLUG00000004793 ##25 ENSSLUG00000004785 #15 ENSSLUG00000004756 #23 ENSSLUG00000004748 ##25 ENSSLUG00000004735 #25 pcdh2ac (ENSSLUG00000004719) #26 ENSSLUG00000004703 #35 ENSSLUG00000004697 #29 ENSSLUG00000004693 #35 ENSSLUG00000004688 #35 ENSSLUG00000004680 #35 ENSSLUG00000004678 #27 ENSSLUG00000004673 #33 ENSSLUG00000004655 #36 ENSSLUG00000004651 ##37 ENSSLUG00000004650 ##37 ENSSLUG00000004645 #35 ENSSLUG00000004639 #37 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b.h #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01100000264899 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b.h #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01100000264899 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000181572 ENSGT00940000164468.a.a.a.a ENSGT00940000165759.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.a.b Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b.h #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01100000264899 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000164468.a.a.a.a ENSGT00940000165759.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.b ENSGT00940000166867 ENSGT00940000165759.a.a ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.a.a.a.c.b ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.a.a.b.b.a.a ENSGT00940000164468.a.a.b.a.b.c.b ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.a.a.b.a ENSGT00940000164468.a.a.b.a.b.d.b Climbing perch MODERN SPECIES 1 ENSATEG00000009797 ENSATEG00000028437 ENSATEG00000009868 ##12 ENSATEG00000009920 #8 ENSATEG00000026867 #8 ENSATEG00000029287 #11 ENSATEG00000009934 #12 ENSATEG00000026331 #12 ENSATEG00000009989 #12 ENSATEG00000009995 ENSATEG00000010011 ##12 ENSATEG00000010033 #20 ENSATEG00000010050 #15 ENSATEG00000010083 #15 ENSATEG00000010146 #15 ENSATEG00000010272 #23 ENSATEG00000010199 ENSATEG00000010216 ENSATEG00000010266 ENSATEG00000027862 ##25 ENSATEG00000026440 #35 ENSATEG00000028985 #35 ENSATEG00000010434 #35 ENSATEG00000025547 #35 ENSATEG00000028351 #35 ENSATEG00000028288 #35 ENSATEG00000026496 #36 ENSATEG00000025685 ##37 ENSATEG00000010489 ##37 ENSATEG00000029727 ##37 ENSATEG00000010543 ##37 Carangaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.f #37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.k ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000159725 ENSGT00940000165759.b.a.a ENSGT00940000177103 ENSGT00940000156683 Seriola ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.e.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.e.b ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a.e #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a.b #35 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.j.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.k ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000159725 Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3259 ENSSLDG00000001573 ENSSLDG00000001476 ##12 ENSSLDG00000001456 ENSSLDG00000001401 ##12 ENSSLDG00000001370 ENSSLDG00000001326 #9 ENSSLDG00000001304 #12 ENSSLDG00000001283 ##12 ENSSLDG00000001262 #20 ENSSLDG00000001252 #9 ENSSLDG00000001232 ##25 ENSSLDG00000001211 #15 ENSSLDG00000001175 ##25 ENSSLDG00000001165 #19 ENSSLDG00000001154 ENSSLDG00000001128 #23 ENSSLDG00000001120 #21 ENSSLDG00000001101 ENSSLDG00000001084 #25 ENSSLDG00000001052 #25 ENSSLDG00000001036 ##25 pcdh2ac (ENSSLDG00000000958) #26 ENSSLDG00000000897 #35 ENSSLDG00000000862 #35 ENSSLDG00000000787 #35 ENSSLDG00000000448 #36 ENSSLDG00000000422 ##37 ENSSLDG00000000410 ##37 ENSSLDG00000000240 ##37 ENSSLDG00000000209 ##37 ENSSLDG00000000184 ##37 Greater amberjack MODERN SPECIES 275 ENSSDUG00000017451 ##12 ENSSDUG00000017443 ENSSDUG00000017438 #8 ENSSDUG00000017428 ENSSDUG00000017418 #9 ENSSDUG00000017408 #12 ENSSDUG00000017385 #9 ENSSDUG00000017378 ENSSDUG00000017367 #20 ENSSDUG00000017348 ##25 ENSSDUG00000017340 #23 ENSSDUG00000017329 #20 ENSSDUG00000017321 #19 ENSSDUG00000017307 ##25 ENSSDUG00000017292 ##25 ENSSDUG00000017283 ##25 ENSSDUG00000017279 ENSSDUG00000017270 #21 ENSSDUG00000017263 ENSSDUG00000017252 ##25 pcdh2ac (ENSSDUG00000017069) #26 ENSSDUG00000017023 ##25 ENSSDUG00000017016 #35 ENSSDUG00000017009 #35 ENSSDUG00000016999 ##37 ENSSDUG00000016989 #35 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT01030000236108 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01090000260212 ENSGT01090000260159 #27 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 110 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.g ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000178703 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.f.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000165759.b.a.a Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b.f.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b.f.a #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.o.a.a.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.o.a.b #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.o.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.p #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.f.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a.m ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 Orange clownfish MODERN SPECIES 4 ENSAPEG00000014759 #8 ENSAPEG00000014713 #9 ENSAPEG00000014699 #12 ENSAPEG00000014660 #12 ENSAPEG00000014647 ENSAPEG00000014641 #20 ENSAPEG00000014628 ##25 ENSAPEG00000014619 ##25 ENSAPEG00000014614 #20 ENSAPEG00000014604 ##25 ENSAPEG00000014585 #15 ENSAPEG00000014572 ##25 ENSAPEG00000014557 #19 ENSAPEG00000014543 ENSAPEG00000014528 #21 ENSAPEG00000014520 #23 ENSAPEG00000014312 #25 ENSAPEG00000014282 #27 ENSAPEG00000014133 #25 pcdh2ac (ENSAPEG00000014114) #26 ENSAPEG00000014085 #35 ENSAPEG00000014079 #35 ENSAPEG00000014053 #35 ENSAPEG00000014040 ENSAPEG00000014011 #35 ENSAPEG00000013996 #35 ENSAPEG00000013978 #33 ENSAPEG00000013946 #36 ENSAPEG00000013925 #35 ENSAPEG00000013896 ##37 ENSAPEG00000013878 ##37 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00990000205184 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.x #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00990000211570 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 P. nyererei MODERN SPECIES 296 ENSPNYG00000001964 ENSPNYG00000001990 ##12 ENSPNYG00000002003 #7 ENSPNYG00000002015 ENSPNYG00000002026 ##12 ENSPNYG00000002050 ##12 ENSPNYG00000002073 #9 ENSPNYG00000002123 ENSPNYG00000002147 ENSPNYG00000002160 ##25 ENSPNYG00000002176 ##25 ENSPNYG00000002201 ##25 ENSPNYG00000002217 ##25 ENSPNYG00000002235 #20 ENSPNYG00000002244 #19 ENSPNYG00000002261 #23 ENSPNYG00000002272 #21 ENSPNYG00000002293 ##25 ENSPNYG00000002390 ##25 pcdh2ac (ENSPNYG00000002432) #26 ENSPNYG00000002474 #35 ENSPNYG00000002485 #35 ENSPNYG00000002501 #33 ENSPNYG00000002519 ENSPNYG00000002527 ##37 ENSPNYG00000002547 #35 ENSPNYG00000002559 ##37 ENSPNYG00000002580 ENSPNYG00000002596 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00940000177060 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.f #37 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 537 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 Turquoise killifish MODERN SPECIES 554 ENSNFUG00015017386 ENSNFUG00015017372 #23 ENSNFUG00015017369 ENSNFUG00015017325 #19 ENSNFUG00015017319 #25 pcdh2ac (ENSNFUG00015017312) #26 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 71 ENSGT00940000177060 ENSGT00950000183286 ENSGT00990000205184 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 116 ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000163777.b.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00940000177060 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.f #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.e.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.f #37 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 322 ENSCVAG00000011295 ENSCVAG00000011289 ENSCVAG00000011269 pcdh2aa1 (ENSCVAG00000011254) ##12 ENSCVAG00000011234 ENSCVAG00000011220 ENSCVAG00000011208 ##12 ENSCVAG00000011191 ##12 ENSCVAG00000011174 #11 ENSCVAG00000011160 #12 ENSCVAG00000011157 ##12 ENSCVAG00000011134 #21 pcdh2ac (ENSCVAG00000011115) #26 ENSCVAG00000011088 ##25 ENSCVAG00000011080 ##25 ENSCVAG00000011065 #23 ENSCVAG00000010928 #25 ENSCVAG00000010882 #35 ENSCVAG00000010856 #35 ENSCVAG00000010850 #35 ENSCVAG00000010808 #35 ENSCVAG00000010790 ##37 ENSCVAG00000010777 ##37 ENSCVAG00000010747 #37 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 54 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a.e.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 Platyfish MODERN SPECIES 15 ENSXMAG00000027122 ##12 ENSXMAG00000027032 ENSXMAG00000025920 ##12 ENSXMAG00000022763 #8 ENSXMAG00000021470 #11 ENSXMAG00000020972 ENSXMAG00000029775 #12 ENSXMAG00000021646 ##12 ENSXMAG00000021457 ENSXMAG00000008338 #15 ENSXMAG00000028268 ##25 ENSXMAG00000021394 ##25 ENSXMAG00000026013 ##25 ENSXMAG00000025189 ##25 ENSXMAG00000021710 ENSXMAG00000024357 #23 ENSXMAG00000025065 ENSXMAG00000025626 ##25 ENSXMAG00000028407 #25 ENSXMAG00000029821 #25 ENSXMAG00000021550 ##25 ENSXMAG00000022961 ##25 pcdh2ac (ENSXMAG00000023782) #26 ENSXMAG00000020851 ##37 ENSXMAG00000023606 ##37 ENSXMAG00000021123 ##37 ENSXMAG00000021523 ##37 ENSXMAG00000025058 #37 ENSXMAG00000025081 #37 ENSXMAG00000023226 #37 ENSXMAG00000025751 #37 Oryzias ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000002137 ENSGT00940000166070 ENSGT00940000158371 ENSGT01030000234599.a.b.c ENSGT00390000009004.d ENSGT00940000155898 ENSGT00940000159553.b ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.`b.b.b ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a.d ##25 ENSGT01030000236108 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a.c ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.b.b.b.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.b.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.h ##37 ENSGT00970000195503 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.i ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 100 ENSGT01100000264160 #18 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT01100000266157 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.a.a.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.b.b.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.b.b.b.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000165759.a.b.d ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.a.a.b.b.a.a.a.a Javanese ricefish MODERN SPECIES 1 ENSOJAG00000007130 ENSOJAG00000007158 ENSOJAG00000007177 ENSOJAG00000007209 ENSOJAG00000007239 ##12 ENSOJAG00000007284 #9 pcdh2ac (ENSOJAG00000007320) #26 ENSOJAG00000007379 ENSOJAG00000007393 ##12 ENSOJAG00000007414 #9 ENSOJAG00000007493 #12 ENSOJAG00000007530 #12 ENSOJAG00000007555 ENSOJAG00000007569 ##25 ENSOJAG00000007606 #18 ENSOJAG00000007610 #23 ENSOJAG00000007622 ##25 ENSOJAG00000007643 #25 ENSOJAG00000007675 ##25 ENSOJAG00000007685 ENSOJAG00000007712 #35 ENSOJAG00000007738 #35 ENSOJAG00000007765 #35 ENSOJAG00000007910 ##37 ENSOJAG00000007942 #35 ENSOJAG00000007960 #35 ENSOJAG00000007979 ##37 ENSOJAG00000007995 #35 ENSOJAG00000008007 ##37 ENSOJAG00000008030 #35 ENSOJAG00000008057 ##37 Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.z ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.b ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.l #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT01030000236108 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a.c ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.b.b.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.b.b.b.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.b.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.h ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.i ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b.e ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b.f ##37 Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 1 ENSORLG00000023399 pcdh2aa1 (ENSORLG00000021994) ##12 ENSORLG00000028629 ##12 ENSORLG00000028208 ##12 ENSORLG00000030495 ENSORLG00000022312 #8 ENSORLG00000028903 #11 ENSORLG00000004181 #12 ENSORLG00000027606 ##12 ENSORLG00000029528 ENSORLG00000026864 ##25 ENSORLG00000026652 ENSORLG00000029341 ##25 ENSORLG00000024772 #19 ENSORLG00000004176 #21 ENSORLG00000004171 #23 ENSORLG00000023815 ##25 ENSORLG00000026259 ENSORLG00000029952 #25 ENSORLG00000024089 #25 ENSORLG00000028645 ENSORLG00000024851 ##25 pcdh2ab10 (ENSORLG00000022081) ##25 pcdh2ac (ENSORLG00000029405) #26 ENSORLG00000025371 #35 ENSORLG00000026934 #35 ENSORLG00000025477 #35 ENSORLG00000030492 #35 ENSORLG00000024469 #35 ENSORLG00000025135 ##37 ENSORLG00000030466 #35 Cod DUPLICATION Cod MODERN SPECIES 1 ENSGMOG00000031088 ENSGMOG00000026457 ##12 ENSGMOG00000028556 #11 ENSGMOG00000022183 #11 ENSGMOG00000023743 #11 ENSGMOG00000029116 ##12 ENSGMOG00000032159 #11 ENSGMOG00000029002 #11 ENSGMOG00000036845 #11 ENSGMOG00000027255 #12 ENSGMOG00000033714 ENSGMOG00000026316 #15 ENSGMOG00000035028 ENSGMOG00000026633 #23 ENSGMOG00000032829 #15 ENSGMOG00000025708 #23 ENSGMOG00000028781 ##25 ENSGMOG00000029676 ##25 ENSGMOG00000023528 #25 ENSGMOG00000036517 ##37 ENSGMOG00000028481 ##37 ENSGMOG00000034233 ##37 ENSGMOG00000023799 ##37 ENSGMOG00000035300 ##37 ENSGMOG00000029887 ##37 ENSGMOG00000031191 ##37 ENSGMOG00000022796 ##37 ENSGMOG00000019646 ##37 ENSGMOG00000030280 ##37 ENSGMOG00000035852 ##37 ENSGMOG00000022458 ##37 Cod MODERN SPECIES 1 ENSGMOG00000022876 ENSGMOG00000035504 ##12 ENSGMOG00000031088 ENSGMOG00000026457 ##12 ENSGMOG00000028556 #11 ENSGMOG00000022183 #11 ENSGMOG00000023743 #11 ENSGMOG00000029116 ##12 ENSGMOG00000032159 #11 ENSGMOG00000029002 #11 ENSGMOG00000036845 #11 ENSGMOG00000027255 #12 ENSGMOG00000033714 ENSGMOG00000026316 #15 ENSGMOG00000035028 ENSGMOG00000026633 #23 ENSGMOG00000032829 #15 ENSGMOG00000025708 #23 ENSGMOG00000028781 ##25 ENSGMOG00000029676 ##25 ENSGMOG00000023528 #25 ENSGMOG00000036517 ##37 ENSGMOG00000028481 ##37 ENSGMOG00000034233 ##37 ENSGMOG00000023799 ##37 ENSGMOG00000035300 ##37 ENSGMOG00000029887 ##37 ENSGMOG00000031191 ##37 ENSGMOG00000022796 ##37 ENSGMOG00000019646 ##37 ENSGMOG00000030280 ##37 Acanthomorphata DUPLICATION Acanthomorphata DUPLICATION Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000159725 ENSGT00940000156683 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000164468.a.a.a.a Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.f #37 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000159725 ENSGT00940000156683 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000164468.a.a.a.a ENSGT00940000165759.b.a.a ENSGT00940000165759.a.b Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000159725 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 99 ENSKMAG00000009260 ENSKMAG00000009251 ENSKMAG00000009232 pcdh2aa1 (ENSKMAG00000009189) ##12 ENSKMAG00000009160 ##12 ENSKMAG00000009148 ENSKMAG00000009114 ##12 ENSKMAG00000009069 ##12 ENSKMAG00000009055 ##25 ENSKMAG00000009036 #19 ENSKMAG00000009001 ##25 ENSKMAG00000008928 ##25 ENSKMAG00000008637 #21 ENSKMAG00000008569 #25 ENSKMAG00000008538 ##25 ENSKMAG00000008503 ##25 pcdh2ab8 (ENSKMAG00000008473) ##25 pcdh2ac (ENSKMAG00000008379) #26 ENSKMAG00000008313 #35 ENSKMAG00000008291 #35 ENSKMAG00000008252 ##37 ENSKMAG00000008210 ##37 ENSKMAG00000008192 ##37 ENSKMAG00000008161 ##37 ENSKMAG00000008140 #37 ENSKMAG00000008126 #37 ENSKMAG00000008110 #37 ENSKMAG00000008103 ENSKMAG00000008083 #37 Oryzias ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 Chinese medaka MODERN SPECIES 3145 ENSOSIG00000001498 ##25 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000177004 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000165759.b.a.a ENSGT00940000177103 ENSGT00940000165759.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.b ENSGT00940000166867 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.x #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00990000211570 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.l #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.b.i ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.e ##37 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005000994 #12 ENSMZEG00005001006 #12 ENSMZEG00005001024 #15 ENSMZEG00005001048 ##25 ENSMZEG00005001068 #15 ENSMZEG00005001074 ##25 ENSMZEG00005001087 ##25 ENSMZEG00005001112 #19 ENSMZEG00005001122 #21 ENSMZEG00005001133 #21 ENSMZEG00005001148 ##25 ENSMZEG00005001175 #25 ENSMZEG00005001191 ENSMZEG00005001204 #25 ENSMZEG00005001496 ##25 ENSMZEG00005001585 ##25 pcdh2ac (ENSMZEG00005001600) #26 ENSMZEG00005001606 #35 ENSMZEG00005001612 #35 ENSMZEG00005001626 ENSMZEG00005001638 #35 ENSMZEG00005001643 #35 ENSMZEG00005001657 #35 ENSMZEG00005001678 #33 ENSMZEG00005001693 #35 ENSMZEG00005001713 ENSMZEG00005001722 ##37 ENSMZEG00005001729 ##37 ENSMZEG00005001737 #37 ENSMZEG00005001751 ENSMZEG00005001776 P. nyererei MODERN SPECIES 296 ENSPNYG00000002015 ENSPNYG00000002026 ##12 ENSPNYG00000002050 ##12 ENSPNYG00000002073 #9 ENSPNYG00000002123 ENSPNYG00000002147 ENSPNYG00000002160 ##25 ENSPNYG00000002176 ##25 ENSPNYG00000002201 ##25 ENSPNYG00000002217 ##25 ENSPNYG00000002235 #20 ENSPNYG00000002244 #19 ENSPNYG00000002261 #23 ENSPNYG00000002272 #21 ENSPNYG00000002293 ##25 ENSPNYG00000002390 ##25 pcdh2ac (ENSPNYG00000002432) #26 ENSPNYG00000002474 #35 ENSPNYG00000002485 #35 ENSPNYG00000002501 #33 ENSPNYG00000002519 ENSPNYG00000002527 ##37 ENSPNYG00000002547 #35 ENSPNYG00000002559 ##37 ENSPNYG00000002580 ENSPNYG00000002596 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 349 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 Bicolor damselfish MODERN SPECIES 1164 ENSSPAG00000011168 ENSSPAG00000011158 #20 ENSSPAG00000011135 ##25 ENSSPAG00000011093 ##25 ENSSPAG00000011080 ENSSPAG00000011048 #21 ENSSPAG00000011039 ENSSPAG00000011031 #27 ENSSPAG00000011018 ##25 ENSSPAG00000011012 ##25 ENSSPAG00000011005 ##25 ENSSPAG00000010996 pcdh2ab8 (ENSSPAG00000010986) ##25 ENSSPAG00000010979 #35 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.r #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000159725 ENSGT00940000165759.b.a.a ENSGT00940000177103 ENSGT00940000156683 ENSGT00940000164468.a.a.a.a ENSGT00940000165759.b.a.b.a.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.b ENSGT00940000165759.a.b Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000177060 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000178344 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000159725 ENSGT00940000165759.b.a.a ENSGT00940000165759.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.a.b ENSGT00940000166867 ENSGT00940000165759.a.a Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 50 ENSGT01030000236108 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01100000264899 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.j ##12 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.b #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.`b #25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.f #37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.j ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01100000264899 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.`b #25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.f #37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.r #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 ENSSAUG00010004714 #12 ENSSAUG00010004718 ENSSAUG00010004720 #12 ENSSAUG00010004722 #12 ENSSAUG00010004724 #15 ENSSAUG00010004734 #15 ENSSAUG00010004736 #15 ENSSAUG00010004738 ENSSAUG00010004742 ##25 ENSSAUG00010004745 #23 ENSSAUG00010004748 #23 ENSSAUG00010004749 ENSSAUG00010004750 #25 ENSSAUG00010004752 #25 ENSSAUG00010004753 #25 ENSSAUG00010004755 ##25 ENSSAUG00010004757 #27 ENSSAUG00010004761 #35 ENSSAUG00010004762 #35 ENSSAUG00010004765 #29 ENSSAUG00010004768 ##37 ENSSAUG00010004772 ##37 ENSSAUG00010004775 ##37 ENSSAUG00010004777 #37 ENSSAUG00010004780 ##37 ENSSAUG00010004782 ##37 ENSSAUG00010004783 ##37 ENSSAUG00010004785 ##37 ENSSAUG00010004787 ##37 ENSSAUG00010004789 ##37 ENSSAUG00010004797 #37 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01100000264899 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.r #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000159725 ENSGT00940000165759.b.a.a ENSGT00940000165759.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.b ENSGT00940000166867 Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b.h #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01100000264899 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000181572 ENSGT00940000164468.a.a.a.a ENSGT00940000165759.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.b ENSGT00940000166867 ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.a.a.a.c.b ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.a.a.b.b.a.a ENSGT00940000164468.a.a.b.a.b.c.b ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.a.a.b.a Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.r #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000181572 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 1 ENSBSLG00000008495 ENSBSLG00000008503 #7 ENSBSLG00000008510 #11 ENSBSLG00000008521 #8 ENSBSLG00000008537 #9 ENSBSLG00000008556 #12 ENSBSLG00000008573 #12 ENSBSLG00000008592 #9 ENSBSLG00000008609 ENSBSLG00000008614 ##12 ENSBSLG00000008618 ##25 ENSBSLG00000008630 ##25 ENSBSLG00000008634 #21 ENSBSLG00000008652 #25 ENSBSLG00000008657 #25 ENSBSLG00000008661 ##25 ENSBSLG00000008670 ##37 ENSBSLG00000008677 ENSBSLG00000008684 ##37 ENSBSLG00000008693 ##37 ENSBSLG00000008700 ENSBSLG00000008703 #37 ENSBSLG00000008705 #37 ENSBSLG00000008713 ##37 ENSBSLG00000008719 ##37 ENSBSLG00000008731 ENSBSLG00000008739 #35 ENSBSLG00000008744 ##37 ENSBSLG00000008745 #37 ENSBSLG00000008750 ##37 ENSBSLG00000008995 Carangaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.f #37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.k ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000159725 ENSGT00940000165759.b.a.a ENSGT00940000177103 ENSGT00940000156683 ENSGT00940000164468.a.a.a.a ENSGT00940000165759.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.b ENSGT00940000166867 Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch MODERN SPECIES 808 ENSLCAG00010001220 ##25 ENSLCAG00010001224 #20 ENSLCAG00010001230 ##25 ENSLCAG00010001235 ##25 ENSLCAG00010001241 ENSLCAG00010001246 #21 ENSLCAG00010001256 ENSLCAG00010001259 ENSLCAG00010001261 #25 ENSLCAG00010001263 #25 ENSLCAG00010001264 ##25 ENSLCAG00010001267 ##25 Barramundi perch MODERN SPECIES 127 ENSLCAG00010002486 ##12 ENSLCAG00010002482 #11 ENSLCAG00010002479 #12 ENSLCAG00010002477 ENSLCAG00010002476 #12 ENSLCAG00010002474 #12 ENSLCAG00010002472 ENSLCAG00010002470 ##25 ENSLCAG00010002469 #15 ENSLCAG00010002463 ##25 ENSLCAG00010002459 ##25 ENSLCAG00010002458 ##25 ENSLCAG00010002454 ##25 ENSLCAG00010002451 #25 ENSLCAG00010002447 #25 ENSLCAG00010002446 ##25 pcdh2ac (ENSLCAG00010002441) #26 ENSLCAG00010002440 #35 ENSLCAG00010002439 #35 ENSLCAG00010002434 #35 ENSLCAG00010002433 #35 ENSLCAG00010002430 ##37 Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 Tongue sole MODERN SPECIES 6 ENSCSEG00000006372 ENSCSEG00000006348 #7 ENSCSEG00000006344 ##12 ENSCSEG00000006338 ENSCSEG00000006336 ENSCSEG00000006331 #12 ENSCSEG00000006327 ENSCSEG00000006324 ##25 ENSCSEG00000006319 #19 ENSCSEG00000006317 #21 ENSCSEG00000006313 ENSCSEG00000006308 #25 ENSCSEG00000006307 ##25 ENSCSEG00000006302 #27 pcdh2ab8 (ENSCSEG00000006301) ##25 ENSCSEG00000006284 ##25 ENSCSEG00000006271 #35 ENSCSEG00000006267 ENSCSEG00000006266 #36 ENSCSEG00000006261 ##37 ENSCSEG00000006256 #36 ENSCSEG00000006249 ##37 ENSCSEG00000006245 ##37 ENSCSEG00000006244 #35 ENSCSEG00000006240 #35 ENSCSEG00000006238 ENSCSEG00000006234 ENSCSEG00000006226 ENSCSEG00000006222 ENSCSEG00000006218 ENSCSEG00000006201 Cod DUPLICATION Cod MODERN SPECIES 1 ENSGMOG00000028556 #11 ENSGMOG00000022183 #11 ENSGMOG00000023743 #11 ENSGMOG00000029116 ##12 ENSGMOG00000032159 #11 ENSGMOG00000029002 #11 ENSGMOG00000036845 #11 ENSGMOG00000027255 #12 ENSGMOG00000033714 ENSGMOG00000026316 #15 ENSGMOG00000035028 ENSGMOG00000026633 #23 ENSGMOG00000032829 #15 ENSGMOG00000025708 #23 ENSGMOG00000028781 ##25 ENSGMOG00000029676 ##25 ENSGMOG00000023528 #25 ENSGMOG00000036517 ##37 ENSGMOG00000028481 ##37 ENSGMOG00000034233 ##37 ENSGMOG00000023799 ##37 ENSGMOG00000035300 ##37 ENSGMOG00000029887 ##37 ENSGMOG00000031191 ##37 ENSGMOG00000022796 ##37 ENSGMOG00000019646 ##37 ENSGMOG00000030280 ##37 ENSGMOG00000035852 ##37 ENSGMOG00000022458 ##37 ENSGMOG00000029631 ##37 ENSGMOG00000033237 ##37 Cod MODERN SPECIES 1 ENSGMOG00000026457 ##12 ENSGMOG00000028556 #11 ENSGMOG00000022183 #11 ENSGMOG00000023743 #11 ENSGMOG00000029116 ##12 ENSGMOG00000032159 #11 ENSGMOG00000029002 #11 ENSGMOG00000036845 #11 ENSGMOG00000027255 #12 ENSGMOG00000033714 ENSGMOG00000026316 #15 ENSGMOG00000035028 ENSGMOG00000026633 #23 ENSGMOG00000032829 #15 ENSGMOG00000025708 #23 ENSGMOG00000028781 ##25 ENSGMOG00000029676 ##25 ENSGMOG00000023528 #25 ENSGMOG00000036517 ##37 ENSGMOG00000028481 ##37 ENSGMOG00000034233 ##37 ENSGMOG00000023799 ##37 ENSGMOG00000035300 ##37 ENSGMOG00000029887 ##37 ENSGMOG00000031191 ##37 ENSGMOG00000022796 ##37 ENSGMOG00000019646 ##37 ENSGMOG00000030280 ##37 ENSGMOG00000035852 ##37 ENSGMOG00000022458 ##37 ENSGMOG00000029631 ##37 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 183 ENSGT00940000178344 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b #37 ENSGT00940000165759.a.b ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.a.a.b.b.a.a ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000156683 ENSGT00940000164468.a.a.a.a ENSGT00940000165759.b ENSGT00940000166867 ENSGT00940000165759.a.a Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000164725.a.a.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b ##12 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.a ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b #37 ENSGT00940000156683 ENSGT00940000164468.a.a.a.a ENSGT00940000165759.b.a.b.a.a ENSGT01100000264470 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 102 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000178344 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b #37 ENSGT00940000165759.b.a.a ENSGT01100000264470 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 47 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT01090000260159 #27 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.r #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000159725 ENSGT00940000165759.b.a.a ENSGT00940000177103 ENSGT00940000156683 ENSGT00940000164468.a.a.a.a ENSGT00940000165759.b.a.b.a.a.b Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01100000264899 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.r #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000159725 ENSGT00940000165759.b.a.a ENSGT00940000165759.a.b Carangaria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.f #37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000159725 ENSGT00940000165759.b.a.a ENSGT00940000165759.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.b ENSGT00940000166867 ENSGT00940000164468.a.a.a.a Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.f #37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.k ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000159725 ENSGT00940000165759.b.a.a ENSGT00940000177103 ENSGT00940000156683 ENSGT00940000164468.a.a.a.a ENSGT00940000165759.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.b Seriola ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a.e #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a.b #35 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.j.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.k ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000159725 ENSGT00940000165759.b.a.a ENSGT00940000177103 ENSGT00940000165759.a.b.q ENSGT00940000165759.b.a.b.a.a.b Greater amberjack MODERN SPECIES 275 ENSSDUG00000017418 #9 ENSSDUG00000017408 #12 ENSSDUG00000017385 #9 ENSSDUG00000017378 ENSSDUG00000017367 #20 ENSSDUG00000017348 ##25 ENSSDUG00000017340 #23 ENSSDUG00000017329 #20 ENSSDUG00000017321 #19 ENSSDUG00000017307 ##25 ENSSDUG00000017292 ##25 ENSSDUG00000017283 ##25 ENSSDUG00000017279 ENSSDUG00000017270 #21 ENSSDUG00000017263 ENSSDUG00000017252 ##25 pcdh2ac (ENSSDUG00000017069) #26 ENSSDUG00000017023 ##25 ENSSDUG00000017016 #35 ENSSDUG00000017009 #35 ENSSDUG00000016999 ##37 ENSSDUG00000016989 #35 ENSSDUG00000016984 ##37 ENSSDUG00000016964 ##37 ENSSDUG00000016934 ##37 ENSSDUG00000016918 ##37 ENSSDUG00000016884 ##37 ENSSDUG00000016868 ##37 Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3259 ENSSLDG00000001326 #9 ENSSLDG00000001304 #12 ENSSLDG00000001283 ##12 ENSSLDG00000001262 #20 ENSSLDG00000001252 #9 ENSSLDG00000001232 ##25 ENSSLDG00000001211 #15 ENSSLDG00000001175 ##25 ENSSLDG00000001165 #19 ENSSLDG00000001154 ENSSLDG00000001128 #23 ENSSLDG00000001120 #21 ENSSLDG00000001101 ENSSLDG00000001084 #25 ENSSLDG00000001052 #25 ENSSLDG00000001036 ##25 pcdh2ac (ENSSLDG00000000958) #26 ENSSLDG00000000897 #35 ENSSLDG00000000862 #35 ENSSLDG00000000787 #35 ENSSLDG00000000448 #36 ENSSLDG00000000422 ##37 ENSSLDG00000000410 ##37 ENSSLDG00000000240 ##37 ENSSLDG00000000209 ##37 ENSSLDG00000000184 ##37 ENSSLDG00000000142 #37 ENSSLDG00000000096 ENSSLDG00000024565 ENSSLDG00000024561 ENSSLDG00000024550 Barramundi perch MODERN SPECIES 808 ENSLCAG00010001220 ##25 ENSLCAG00010001224 #20 ENSLCAG00010001230 ##25 ENSLCAG00010001235 ##25 ENSLCAG00010001241 ENSLCAG00010001246 #21 ENSLCAG00010001256 ENSLCAG00010001259 ENSLCAG00010001261 #25 ENSLCAG00010001263 #25 ENSLCAG00010001264 ##25 ENSLCAG00010001267 ##25 Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 Tongue sole MODERN SPECIES 6 ENSCSEG00000006385 ENSCSEG00000006382 ENSCSEG00000006376 ENSCSEG00000006372 ENSCSEG00000006348 #7 ENSCSEG00000006344 ##12 ENSCSEG00000006338 ENSCSEG00000006336 ENSCSEG00000006331 #12 ENSCSEG00000006327 ENSCSEG00000006324 ##25 ENSCSEG00000006319 #19 ENSCSEG00000006317 #21 ENSCSEG00000006313 ENSCSEG00000006308 #25 ENSCSEG00000006307 ##25 ENSCSEG00000006302 #27 pcdh2ab8 (ENSCSEG00000006301) ##25 ENSCSEG00000006284 ##25 ENSCSEG00000006271 #35 ENSCSEG00000006267 ENSCSEG00000006266 #36 ENSCSEG00000006261 ##37 ENSCSEG00000006256 #36 ENSCSEG00000006249 ##37 ENSCSEG00000006245 ##37 ENSCSEG00000006244 #35 ENSCSEG00000006240 #35 ENSCSEG00000006238 ENSCSEG00000006234 ENSCSEG00000006226 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000165759.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.b ENSGT00940000166867 ENSGT00940000165759.a.a ENSGT00940000177068 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000159725 ENSGT00940000156683 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.f #37 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000159725 ENSGT00940000156683 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000164468.a.a.a.a ENSGT00940000165759.b.a.a Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00670000098059.c.a ENSGT00940000156077.g.a ENSGT00390000000002.a.a.a.nb.a ENSGT00390000002137 ENSGT00940000166070 ENSGT00940000158371 ENSGT01030000234599.a.b.c ENSGT00390000009004.d ENSGT00940000179774 ENSGT00940000155898 ENSGT00940000159553.b ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000159725 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.b ##37 ENSGT00940000156683 ENSGT00940000164468.a.a.a.a ENSGT00940000165759.b.a.a ENSGT00940000165759.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.b ENSGT00940000166867 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000000002.a.a.a.nb.a ENSGT00390000002137.a ENSGT00940000166070 ENSGT00940000158371 ENSGT00940000165312 ENSGT00940000176229 ENSGT00390000009004.d ENSGT00940000179774 ENSGT00940000155898 ENSGT00940000159553.b ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.eb.b.b ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.f.d.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.e.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.f.d.b.a #35 ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.a.a.a.c.a.b ENSGT00940000164468.a.a.b.a.b.d.b ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.a.b ENSGT00940000164983.d.a.b ENSGT00940000164983.d.a.a.a.a.b.a.a ENSGT00940000164983.d.a.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000164983.d.a.a.a.b ENSGT00940000163777.a ENSGT00940000159910 Platyfish DUPLICATION Platyfish MODERN SPECIES 15 ENSXMAG00000020972 ENSXMAG00000029775 #12 ENSXMAG00000021646 ##12 ENSXMAG00000021457 ENSXMAG00000008338 #15 ENSXMAG00000028268 ##25 ENSXMAG00000021394 ##25 ENSXMAG00000026013 ##25 ENSXMAG00000025189 ##25 ENSXMAG00000021710 ENSXMAG00000024357 #23 ENSXMAG00000025065 ENSXMAG00000025626 ##25 ENSXMAG00000028407 #25 ENSXMAG00000029821 #25 ENSXMAG00000021550 ##25 ENSXMAG00000022961 ##25 pcdh2ac (ENSXMAG00000023782) #26 ENSXMAG00000020851 ##37 ENSXMAG00000023606 ##37 ENSXMAG00000021123 ##37 ENSXMAG00000021523 ##37 ENSXMAG00000025058 #37 ENSXMAG00000025081 #37 ENSXMAG00000023226 #37 ENSXMAG00000025751 #37 ENSXMAG00000024422 #37 ENSXMAG00000024900 #35 PCDHGB4 (ENSXMAG00000020965) ENSXMAG00000028443 ENSXMAG00000029229 #35 Platyfish MODERN SPECIES 15 ENSXMAG00000025920 ##12 ENSXMAG00000022763 #8 ENSXMAG00000021470 #11 ENSXMAG00000020972 ENSXMAG00000029775 #12 ENSXMAG00000021646 ##12 ENSXMAG00000021457 ENSXMAG00000008338 #15 ENSXMAG00000028268 ##25 ENSXMAG00000021394 ##25 ENSXMAG00000026013 ##25 ENSXMAG00000025189 ##25 ENSXMAG00000021710 ENSXMAG00000024357 #23 ENSXMAG00000025065 ENSXMAG00000025626 ##25 ENSXMAG00000028407 #25 ENSXMAG00000029821 #25 ENSXMAG00000021550 ##25 ENSXMAG00000022961 ##25 pcdh2ac (ENSXMAG00000023782) #26 ENSXMAG00000020851 ##37 ENSXMAG00000023606 ##37 ENSXMAG00000021123 ##37 ENSXMAG00000021523 ##37 ENSXMAG00000025058 #37 ENSXMAG00000025081 #37 ENSXMAG00000023226 #37 ENSXMAG00000025751 #37 ENSXMAG00000024422 #37 ENSXMAG00000024900 #35 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 78 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.f.d.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.e.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.f.d.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.f.d.b.b #35 ENSGT00940000177513.a ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.f.c #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e.hb.b #37 ENSGT00940000156683 ENSGT00940000165759.b.a.a ENSGT00940000165759.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.a.b.h.b NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 234 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000177060 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.f.d.a #35 ENSGT00940000177513.b Sailfin molly MODERN SPECIES 832 ENSPLAG00000022163 ##12 ENSPLAG00000022132 ##12 ENSPLAG00000022119 ENSPLAG00000022112 ##12 ENSPLAG00000022093 ENSPLAG00000022078 ENSPLAG00000022070 ##12 ENSPLAG00000022049 #8 ENSPLAG00000022038 ##12 ENSPLAG00000022019 ##25 ENSPLAG00000022008 ##25 ENSPLAG00000021994 #20 ENSPLAG00000021982 #21 ENSPLAG00000021965 ENSPLAG00000021947 #25 ENSPLAG00000021911 ##25 pcdh2ac (ENSPLAG00000021883) #26 ENSPLAG00000021613 #35 ENSPLAG00000021597 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 116 ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000163777.b.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00940000177060 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.f #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.e.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.f #37 Mummichog MODERN SPECIES 728 ENSFHEG00000006615 #11 ENSFHEG00000006632 #9 ENSFHEG00000006656 #12 ENSFHEG00000006678 #12 ENSFHEG00000006695 #12 ENSFHEG00000006751 ##25 ENSFHEG00000006762 ENSFHEG00000006774 ##25 ENSFHEG00000006783 #21 ENSFHEG00000000183 ENSFHEG00000006796 ##25 ENSFHEG00000006925 ##25 ENSFHEG00000006940 #25 ENSFHEG00000007008 ##25 pcdh2ab8 (ENSFHEG00000007019) ##25 pcdh2ac (ENSFHEG00000007030) #26 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.b ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000159725 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 99 ENSKMAG00000009266 ENSKMAG00000009260 ENSKMAG00000009251 ENSKMAG00000009232 pcdh2aa1 (ENSKMAG00000009189) ##12 ENSKMAG00000009160 ##12 ENSKMAG00000009148 ENSKMAG00000009114 ##12 ENSKMAG00000009069 ##12 ENSKMAG00000009055 ##25 ENSKMAG00000009036 #19 ENSKMAG00000009001 ##25 ENSKMAG00000008928 ##25 ENSKMAG00000008637 #21 ENSKMAG00000008569 #25 ENSKMAG00000008538 ##25 ENSKMAG00000008503 ##25 pcdh2ab8 (ENSKMAG00000008473) ##25 pcdh2ac (ENSKMAG00000008379) #26 ENSKMAG00000008313 #35 ENSKMAG00000008291 #35 ENSKMAG00000008252 ##37 ENSKMAG00000008210 ##37 ENSKMAG00000008192 ##37 ENSKMAG00000008161 ##37 ENSKMAG00000008140 #37 ENSKMAG00000008126 #37 ENSKMAG00000008110 #37 ENSKMAG00000008103 ENSKMAG00000008083 #37 Oryzias ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT01030000234599.a.b.c ENSGT00390000009004.d ENSGT00940000155898 ENSGT00940000159553.b ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.`b.b.b ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a.d ##25 ENSGT01030000236108 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a.c ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.b.b.b.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.b.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.h ##37 ENSGT00970000195503 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.i ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000165759.a.b.d ENSGT00940000164468.a.a.b.a.b.c.a ENSGT00940000164468.a.a.b.a.b.c.b Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.l #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT01030000236108 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a.c ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.b.b.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.b.b.b.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.b.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.h ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.i ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b.e ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b.f ##37 Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 1 ENSORLG00000028903 #11 ENSORLG00000004181 #12 ENSORLG00000027606 ##12 ENSORLG00000029528 ENSORLG00000026864 ##25 ENSORLG00000026652 ENSORLG00000029341 ##25 ENSORLG00000024772 #19 ENSORLG00000004176 #21 ENSORLG00000004171 #23 ENSORLG00000023815 ##25 ENSORLG00000026259 ENSORLG00000029952 #25 ENSORLG00000024089 #25 ENSORLG00000028645 ENSORLG00000024851 ##25 pcdh2ab10 (ENSORLG00000022081) ##25 pcdh2ac (ENSORLG00000029405) #26 ENSORLG00000025371 #35 ENSORLG00000026934 #35 ENSORLG00000025477 #35 ENSORLG00000030492 #35 ENSORLG00000024469 #35 ENSORLG00000025135 ##37 ENSORLG00000030466 #35 ENSORLG00000029802 ##37 ENSORLG00000028443 #35 ENSORLG00000029389 ##37 ENSORLG00000028019 ##37 ENSORLG00000029900 ##37 ENSORLG00000025167 #35 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000165759.b.a.a ENSGT00940000177103 ENSGT00940000165759.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.b Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004.d.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000156683 ENSGT00940000165759.b.a.a Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004.d.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00990000211570 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.l #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.e ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004.d.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004.d.b ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00990000211570 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.l #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.b.j ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.x #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00990000211570 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.l #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.b.i ##37 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000177004.d.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.w.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.x #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00990000211570 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.l #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.w.b.a #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.x #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.m #25 ENSGT00940000178344 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.n #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.l #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.b.i.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e.ab.a #37 ENSGT00940000165759.b.a.a Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005000982 #12 ENSMZEG00005000994 #12 ENSMZEG00005001006 #12 ENSMZEG00005001024 #15 ENSMZEG00005001048 ##25 ENSMZEG00005001068 #15 ENSMZEG00005001074 ##25 ENSMZEG00005001087 ##25 ENSMZEG00005001112 #19 ENSMZEG00005001122 #21 ENSMZEG00005001133 #21 ENSMZEG00005001148 ##25 ENSMZEG00005001175 #25 ENSMZEG00005001191 ENSMZEG00005001204 #25 ENSMZEG00005001496 ##25 ENSMZEG00005001585 ##25 pcdh2ac (ENSMZEG00005001600) #26 ENSMZEG00005001606 #35 ENSMZEG00005001612 #35 ENSMZEG00005001626 ENSMZEG00005001638 #35 ENSMZEG00005001643 #35 ENSMZEG00005001657 #35 ENSMZEG00005001678 #33 ENSMZEG00005001693 #35 ENSMZEG00005001713 ENSMZEG00005001722 ##37 ENSMZEG00005001729 ##37 ENSMZEG00005001737 #37 ENSMZEG00005001751 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000010982 #12 ENSACLG00000010995 #9 ENSACLG00000011008 #12 ENSACLG00000011017 ##25 ENSACLG00000011028 #15 ENSACLG00000011046 ##25 ENSACLG00000011053 ##25 ENSACLG00000011068 ##25 ENSACLG00000011086 #20 ENSACLG00000011091 ##25 ENSACLG00000011099 #19 ENSACLG00000011102 #21 ENSACLG00000011124 ##25 ENSACLG00000011157 #25 ENSACLG00000011178 #25 ENSACLG00000011363 ##25 pcdh2ab8 (ENSACLG00000011367) ##25 ENSACLG00000011696 #35 ENSACLG00000011712 #35 ENSACLG00000011729 #35 ENSACLG00000011758 #35 ENSACLG00000011766 #35 ENSACLG00000011774 #33 ENSACLG00000011784 ##37 ENSACLG00000011797 #36 ENSACLG00000011808 #35 ENSACLG00000011825 ##37 ENSACLG00000011865 ##37 ENSACLG00000011887 ##37 ENSACLG00000011937 ##37 ENSACLG00000011969 ##37 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000032228 ENSONIG00000036227 ENSONIG00000027109 #7 ENSONIG00000041059 ENSONIG00000032107 #8 ENSONIG00000034641 #9 ENSONIG00000030596 ##12 ENSONIG00000035556 #9 ENSONIG00000037921 ##25 ENSONIG00000021365 #15 ENSONIG00000034871 ##25 ENSONIG00000033250 ENSONIG00000021350 #21 ENSONIG00000029948 ENSONIG00000031283 #25 ENSONIG00000035146 ##25 pcdh2ac (ENSONIG00000030416) #26 ENSONIG00000032670 #35 ENSONIG00000029451 #35 ENSONIG00000028830 #35 ENSONIG00000042593 #35 ENSONIG00000028202 #35 ENSONIG00000040060 #33 ENSONIG00000031218 #36 ENSONIG00000004967 #35 ENSONIG00000029266 ENSONIG00000004968 ##37 ENSONIG00000041668 ##37 ENSONIG00000032226 ##37 ENSONIG00000036968 ##37 ENSONIG00000032033 #37 Midas cichlid MODERN SPECIES 115 ENSACIG00000014219 #12 ENSACIG00000014208 ENSACIG00000014155 ENSACIG00000014126 ##12 ENSACIG00000014100 ##25 ENSACIG00000014090 ##25 ENSACIG00000014073 ##25 ENSACIG00000014064 ##25 ENSACIG00000014056 ENSACIG00000014036 #21 ENSACIG00000014025 #20 ENSACIG00000014013 #27 ENSACIG00000014005 #25 ENSACIG00000013994 #25 ENSACIG00000013973 #25 ENSACIG00000013959 ##25 ENSACIG00000013949 #27 pcdh2ab8 (ENSACIG00000013935) ##25 pcdh2ac (ENSACIG00000013746) #26 ENSACIG00000013723 ##37 ENSACIG00000013643 #35 ENSACIG00000013633 #33 ENSACIG00000013629 ##37 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 349 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 Spiny chromis MODERN SPECIES 1673 ENSAPOG00000006784 ##25 ENSAPOG00000006895 #25 pcdh2ac (ENSAPOG00000006909) #26 ENSAPOG00000006923 #35 ENSAPOG00000006938 ENSAPOG00000006953 #35 ENSAPOG00000006981 #33 ENSAPOG00000007001 ##37 ENSAPOG00000007048 #35 ENSAPOG00000007056 ##37 Bicolor damselfish MODERN SPECIES 1164 ENSSPAG00000011168 ENSSPAG00000011158 #20 ENSSPAG00000011135 ##25 ENSSPAG00000011093 ##25 ENSSPAG00000011080 ENSSPAG00000011048 #21 ENSSPAG00000011039 ENSSPAG00000011031 #27 ENSSPAG00000011018 ##25 ENSSPAG00000011012 ##25 ENSSPAG00000011005 ##25 ENSSPAG00000010996 pcdh2ab8 (ENSSPAG00000010986) ##25 ENSSPAG00000010979 #35 Acanthomorphata DUPLICATION Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 183 ENSGT00940000178344 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b #37 ENSGT00940000165759.a.b ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.a.a.b.b.a.a ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000156683 ENSGT00940000164468.a.a.a.a Cod MODERN SPECIES 1 ENSGMOG00000022183 #11 ENSGMOG00000023743 #11 ENSGMOG00000029116 ##12 ENSGMOG00000032159 #11 ENSGMOG00000029002 #11 ENSGMOG00000036845 #11 ENSGMOG00000027255 #12 ENSGMOG00000033714 ENSGMOG00000026316 #15 ENSGMOG00000035028 ENSGMOG00000026633 #23 ENSGMOG00000032829 #15 ENSGMOG00000025708 #23 ENSGMOG00000028781 ##25 ENSGMOG00000029676 ##25 ENSGMOG00000023528 #25 ENSGMOG00000036517 ##37 ENSGMOG00000028481 ##37 ENSGMOG00000034233 ##37 ENSGMOG00000023799 ##37 ENSGMOG00000035300 ##37 ENSGMOG00000029887 ##37 ENSGMOG00000031191 ##37 ENSGMOG00000022796 ##37 ENSGMOG00000019646 ##37 ENSGMOG00000030280 ##37 ENSGMOG00000035852 ##37 ENSGMOG00000022458 ##37 ENSGMOG00000029631 ##37 ENSGMOG00000033237 ##37 ENSGMOG00000032709 #37 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b ##12 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.a ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b #37 ENSGT00940000156683 ENSGT00940000164468.a.a.a.a ENSGT00940000165759.b.a.b.a.a ENSGT01100000264470 ENSGT00940000165759.b.a.b.a.b ENSGT01060000248675 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 102 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000178344 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b #37 ENSGT00940000165759.b.a.a ENSGT01100000264470 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000177060 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000177513.a ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000165759.b.a.a ENSGT00940000165759.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.b ENSGT00940000166867 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000165759.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.b ENSGT00940000166867 ENSGT00940000165759.a.a Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000159725 ENSGT00940000156683 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000164468.a.a.a.a ENSGT00940000165759.b.a.a Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.f #37 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000159725 ENSGT00940000156683 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000164468.a.a.a.a Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000157489 ENSGT00670000098059.c.a ENSGT00940000156077.g.a ENSGT00390000000002.a.a.a.nb.a ENSGT00390000002137 ENSGT00940000166070 ENSGT00940000158371 ENSGT01030000234599.a.b.c ENSGT00390000009004.d ENSGT00940000179774 ENSGT00940000155898 ENSGT00940000159553.b ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000159725 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.b ##37 ENSGT00940000156683 ENSGT00940000164468.a.a.a.a ENSGT00940000165759.b.a.a ENSGT00940000165759.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.b Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000156077.g.a ENSGT00390000000002.a.a.a.nb.a ENSGT00390000002137.a ENSGT00940000166070 ENSGT00940000158371 ENSGT00940000165312 ENSGT00940000176229 ENSGT00390000009004.d ENSGT00940000179774 ENSGT00940000155898 ENSGT00940000159553.b ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.eb.b.b ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.f.d.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.e.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.f.d.b.a #35 ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.a.a.a.c.a.b ENSGT00940000164468.a.a.b.a.b.d.b ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.a.b ENSGT00940000164983.d.a.b ENSGT00940000164983.d.a.a.a.a.b.a.a ENSGT00940000164983.d.a.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000164983.d.a.a.a.b ENSGT00940000163777.a Poecilia ANCESTRAL SPECIES 78 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.f.d.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.e.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.f.d.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.f.d.b.b #35 ENSGT00940000177513.a ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.f.c #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e.hb.b #37 ENSGT00940000156683 ENSGT00940000165759.b.a.a ENSGT00940000165759.a.b NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 234 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a.e.b ##12 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000177060 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.f.d.a #35 ENSGT00940000177513.b Sailfin molly MODERN SPECIES 832 ENSPLAG00000022176 ENSPLAG00000022163 ##12 ENSPLAG00000022132 ##12 ENSPLAG00000022119 ENSPLAG00000022112 ##12 ENSPLAG00000022093 ENSPLAG00000022078 ENSPLAG00000022070 ##12 ENSPLAG00000022049 #8 ENSPLAG00000022038 ##12 ENSPLAG00000022019 ##25 ENSPLAG00000022008 ##25 ENSPLAG00000021994 #20 ENSPLAG00000021982 #21 ENSPLAG00000021965 ENSPLAG00000021947 #25 ENSPLAG00000021911 ##25 pcdh2ac (ENSPLAG00000021883) #26 ENSPLAG00000021613 #35 ENSPLAG00000021597 Guppy DUPLICATION Guppy MODERN SPECIES 440 ENSPREG00000001329 #12 ENSPREG00000001318 #12 ENSPREG00000001306 ENSPREG00000001293 ##25 ENSPREG00000001277 ##25 ENSPREG00000001221 ##25 ENSPREG00000001149 ##25 ENSPREG00000001136 #20 ENSPREG00000001124 ##25 ENSPREG00000001113 ENSPREG00000001096 ##25 ENSPREG00000001077 ENSPREG00000001039 #25 ENSPREG00000001020 #27 ENSPREG00000000942 #25 ENSPREG00000000911 #25 ENSPREG00000000855 #35 ENSPREG00000000826 #35 ENSPREG00000000805 ENSPREG00000000775 #35 ENSPREG00000000765 #35 ENSPREG00000000747 ENSPREG00000000730 #35 ENSPREG00000000710 ##37 ENSPREG00000000692 ##37 ENSPREG00000000594 ##37 ENSPREG00000019198 ENSPREG00000019190 #36 ENSPREG00000019183 ENSPREG00000019174 ENSPREG00000019155 Guppy MODERN SPECIES 440 ENSPREG00000001343 #11 ENSPREG00000001329 #12 ENSPREG00000001318 #12 ENSPREG00000001306 ENSPREG00000001293 ##25 ENSPREG00000001277 ##25 ENSPREG00000001221 ##25 ENSPREG00000001149 ##25 ENSPREG00000001136 #20 ENSPREG00000001124 ##25 ENSPREG00000001113 ENSPREG00000001096 ##25 ENSPREG00000001077 ENSPREG00000001039 #25 ENSPREG00000001020 #27 ENSPREG00000000942 #25 ENSPREG00000000911 #25 ENSPREG00000000855 #35 ENSPREG00000000826 #35 ENSPREG00000000805 ENSPREG00000000775 #35 ENSPREG00000000765 #35 ENSPREG00000000747 ENSPREG00000000730 #35 ENSPREG00000000710 ##37 ENSPREG00000000692 ##37 ENSPREG00000000594 ##37 ENSPREG00000019198 ENSPREG00000019190 #36 ENSPREG00000019183 ENSPREG00000019174 Guppy MODERN SPECIES 440 ENSPREG00000001375 ENSPREG00000001368 ##12 ENSPREG00000001343 #11 ENSPREG00000001329 #12 ENSPREG00000001318 #12 ENSPREG00000001306 ENSPREG00000001293 ##25 ENSPREG00000001277 ##25 ENSPREG00000001221 ##25 ENSPREG00000001149 ##25 ENSPREG00000001136 #20 ENSPREG00000001124 ##25 ENSPREG00000001113 ENSPREG00000001096 ##25 ENSPREG00000001077 ENSPREG00000001039 #25 ENSPREG00000001020 #27 ENSPREG00000000942 #25 ENSPREG00000000911 #25 ENSPREG00000000855 #35 ENSPREG00000000826 #35 ENSPREG00000000805 ENSPREG00000000775 #35 ENSPREG00000000765 #35 ENSPREG00000000747 ENSPREG00000000730 #35 ENSPREG00000000710 ##37 ENSPREG00000000692 ##37 ENSPREG00000000594 ##37 ENSPREG00000019198 ENSPREG00000019190 #36 Platyfish DUPLICATION Platyfish MODERN SPECIES 15 ENSXMAG00000021470 #11 ENSXMAG00000020972 ENSXMAG00000029775 #12 ENSXMAG00000021646 ##12 ENSXMAG00000021457 ENSXMAG00000008338 #15 ENSXMAG00000028268 ##25 ENSXMAG00000021394 ##25 ENSXMAG00000026013 ##25 ENSXMAG00000025189 ##25 ENSXMAG00000021710 ENSXMAG00000024357 #23 ENSXMAG00000025065 ENSXMAG00000025626 ##25 ENSXMAG00000028407 #25 ENSXMAG00000029821 #25 ENSXMAG00000021550 ##25 ENSXMAG00000022961 ##25 pcdh2ac (ENSXMAG00000023782) #26 ENSXMAG00000020851 ##37 ENSXMAG00000023606 ##37 ENSXMAG00000021123 ##37 ENSXMAG00000021523 ##37 ENSXMAG00000025058 #37 ENSXMAG00000025081 #37 ENSXMAG00000023226 #37 ENSXMAG00000025751 #37 ENSXMAG00000024422 #37 ENSXMAG00000024900 #35 PCDHGB4 (ENSXMAG00000020965) ENSXMAG00000028443 Platyfish MODERN SPECIES 15 ENSXMAG00000022763 #8 ENSXMAG00000021470 #11 ENSXMAG00000020972 ENSXMAG00000029775 #12 ENSXMAG00000021646 ##12 ENSXMAG00000021457 ENSXMAG00000008338 #15 ENSXMAG00000028268 ##25 ENSXMAG00000021394 ##25 ENSXMAG00000026013 ##25 ENSXMAG00000025189 ##25 ENSXMAG00000021710 ENSXMAG00000024357 #23 ENSXMAG00000025065 ENSXMAG00000025626 ##25 ENSXMAG00000028407 #25 ENSXMAG00000029821 #25 ENSXMAG00000021550 ##25 ENSXMAG00000022961 ##25 pcdh2ac (ENSXMAG00000023782) #26 ENSXMAG00000020851 ##37 ENSXMAG00000023606 ##37 ENSXMAG00000021123 ##37 ENSXMAG00000021523 ##37 ENSXMAG00000025058 #37 ENSXMAG00000025081 #37 ENSXMAG00000023226 #37 ENSXMAG00000025751 #37 ENSXMAG00000024422 #37 ENSXMAG00000024900 #35 PCDHGB4 (ENSXMAG00000020965) NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 116 ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000163777.b.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00940000177060 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.f #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.e.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.f #37 Mummichog MODERN SPECIES 728 ENSFHEG00000006615 #11 ENSFHEG00000006632 #9 ENSFHEG00000006656 #12 ENSFHEG00000006678 #12 ENSFHEG00000006695 #12 ENSFHEG00000006751 ##25 ENSFHEG00000006762 ENSFHEG00000006774 ##25 ENSFHEG00000006783 #21 ENSFHEG00000000183 ENSFHEG00000006796 ##25 ENSFHEG00000006925 ##25 ENSFHEG00000006940 #25 ENSFHEG00000007008 ##25 pcdh2ab8 (ENSFHEG00000007019) ##25 pcdh2ac (ENSFHEG00000007030) #26 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 322 ENSCVAG00000011289 ENSCVAG00000011269 pcdh2aa1 (ENSCVAG00000011254) ##12 ENSCVAG00000011234 ENSCVAG00000011220 ENSCVAG00000011208 ##12 ENSCVAG00000011191 ##12 ENSCVAG00000011174 #11 ENSCVAG00000011160 #12 ENSCVAG00000011157 ##12 ENSCVAG00000011134 #21 pcdh2ac (ENSCVAG00000011115) #26 ENSCVAG00000011088 ##25 ENSCVAG00000011080 ##25 ENSCVAG00000011065 #23 ENSCVAG00000010928 #25 ENSCVAG00000010882 #35 ENSCVAG00000010856 #35 ENSCVAG00000010850 #35 ENSCVAG00000010808 #35 ENSCVAG00000010790 ##37 ENSCVAG00000010777 ##37 ENSCVAG00000010747 #37 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.b ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000159725 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 99 ENSKMAG00000009276 ENSKMAG00000009266 ENSKMAG00000009260 ENSKMAG00000009251 ENSKMAG00000009232 pcdh2aa1 (ENSKMAG00000009189) ##12 ENSKMAG00000009160 ##12 ENSKMAG00000009148 ENSKMAG00000009114 ##12 ENSKMAG00000009069 ##12 ENSKMAG00000009055 ##25 ENSKMAG00000009036 #19 ENSKMAG00000009001 ##25 ENSKMAG00000008928 ##25 ENSKMAG00000008637 #21 ENSKMAG00000008569 #25 ENSKMAG00000008538 ##25 ENSKMAG00000008503 ##25 pcdh2ab8 (ENSKMAG00000008473) ##25 pcdh2ac (ENSKMAG00000008379) #26 ENSKMAG00000008313 #35 ENSKMAG00000008291 #35 ENSKMAG00000008252 ##37 ENSKMAG00000008210 ##37 ENSKMAG00000008192 ##37 ENSKMAG00000008161 ##37 ENSKMAG00000008140 #37 ENSKMAG00000008126 #37 ENSKMAG00000008110 #37 ENSKMAG00000008103 ENSKMAG00000008083 #37 Turquoise killifish MODERN SPECIES 554 ENSNFUG00015017386 ENSNFUG00015017372 #23 ENSNFUG00015017369 ENSNFUG00015017325 #19 ENSNFUG00015017319 #25 pcdh2ac (ENSNFUG00015017312) #26 Oryzias ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000158371 ENSGT01030000234599.a.b.c ENSGT00390000009004.d ENSGT00940000155898 ENSGT00940000159553.b ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.`b.b.b ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a.d ##25 ENSGT01030000236108 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a.c ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.b.b.b.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.b.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.h ##37 ENSGT00970000195503 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.i ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000165759.a.b.d ENSGT00940000164468.a.a.b.a.b.c.a Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 100 ENSGT01100000264160 #18 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT01100000266157 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.a.a.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.b.b.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.b.b.b.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000165759.a.b.d ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.a.a.b.b.a.a.a.a Javanese ricefish MODERN SPECIES 1 ENSOJAG00000007177 ENSOJAG00000007209 ENSOJAG00000007239 ##12 ENSOJAG00000007284 #9 pcdh2ac (ENSOJAG00000007320) #26 ENSOJAG00000007379 ENSOJAG00000007393 ##12 ENSOJAG00000007414 #9 ENSOJAG00000007493 #12 ENSOJAG00000007530 #12 ENSOJAG00000007555 ENSOJAG00000007569 ##25 ENSOJAG00000007606 #18 ENSOJAG00000007610 #23 ENSOJAG00000007622 ##25 ENSOJAG00000007643 #25 ENSOJAG00000007675 ##25 ENSOJAG00000007685 ENSOJAG00000007712 #35 ENSOJAG00000007738 #35 ENSOJAG00000007765 #35 ENSOJAG00000007910 ##37 ENSOJAG00000007942 #35 ENSOJAG00000007960 #35 ENSOJAG00000007979 ##37 ENSOJAG00000007995 #35 ENSOJAG00000008007 ##37 ENSOJAG00000008030 #35 ENSOJAG00000008057 ##37 ENSOJAG00000008077 #37 ENSOJAG00000008105 Indian medaka MODERN SPECIES 326 ENSOMEG00000016367 #25 Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.b ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.l #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT01030000236108 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a.c ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.b.b.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.b.b.b.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.b.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.h ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.i ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b.e ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b.f ##37 Chinese medaka MODERN SPECIES 3524 ENSOSIG00000003295 #25 Japanese Medaka HdrR DUPLICATION Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 1 ENSORLG00000028208 ##12 ENSORLG00000030495 ENSORLG00000022312 #8 ENSORLG00000028903 #11 ENSORLG00000004181 #12 ENSORLG00000027606 ##12 ENSORLG00000029528 ENSORLG00000026864 ##25 ENSORLG00000026652 ENSORLG00000029341 ##25 ENSORLG00000024772 #19 ENSORLG00000004176 #21 ENSORLG00000004171 #23 ENSORLG00000023815 ##25 ENSORLG00000026259 ENSORLG00000029952 #25 ENSORLG00000024089 #25 ENSORLG00000028645 ENSORLG00000024851 ##25 pcdh2ab10 (ENSORLG00000022081) ##25 pcdh2ac (ENSORLG00000029405) #26 ENSORLG00000025371 #35 ENSORLG00000026934 #35 ENSORLG00000025477 #35 ENSORLG00000030492 #35 ENSORLG00000024469 #35 ENSORLG00000025135 ##37 ENSORLG00000030466 #35 ENSORLG00000029802 ##37 ENSORLG00000028443 #35 ENSORLG00000029389 ##37 Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 1 ENSORLG00000030495 ENSORLG00000022312 #8 ENSORLG00000028903 #11 ENSORLG00000004181 #12 ENSORLG00000027606 ##12 ENSORLG00000029528 ENSORLG00000026864 ##25 ENSORLG00000026652 ENSORLG00000029341 ##25 ENSORLG00000024772 #19 ENSORLG00000004176 #21 ENSORLG00000004171 #23 ENSORLG00000023815 ##25 ENSORLG00000026259 ENSORLG00000029952 #25 ENSORLG00000024089 #25 ENSORLG00000028645 ENSORLG00000024851 ##25 pcdh2ab10 (ENSORLG00000022081) ##25 pcdh2ac (ENSORLG00000029405) #26 ENSORLG00000025371 #35 ENSORLG00000026934 #35 ENSORLG00000025477 #35 ENSORLG00000030492 #35 ENSORLG00000024469 #35 ENSORLG00000025135 ##37 ENSORLG00000030466 #35 ENSORLG00000029802 ##37 ENSORLG00000028443 #35 ENSORLG00000029389 ##37 ENSORLG00000028019 ##37 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000165759.b.a.a ENSGT00940000177103 ENSGT00940000165759.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.a.b Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.g ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000178703 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000177513.a ENSGT00940000166432.d.h.a.b.f.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000165759.b.a.b.a.a.a.b ENSGT00940000165759.b.a.a Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 110 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.g ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000178703 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.f.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000165759.b.a.a ENSGT00940000177103 Spiny chromis MODERN SPECIES 1673 ENSAPOG00000006784 ##25 ENSAPOG00000006895 #25 pcdh2ac (ENSAPOG00000006909) #26 ENSAPOG00000006923 #35 ENSAPOG00000006938 ENSAPOG00000006953 #35 ENSAPOG00000006981 #33 ENSAPOG00000007001 ##37 ENSAPOG00000007048 #35 ENSAPOG00000007056 ##37 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b.f.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b.f.a #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.o.a.a.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.o.a.b #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.o.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.p #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.f.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a.m ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.g ##37 Clown anemonefish DUPLICATION Clown anemonefish MODERN SPECIES 1335 ENSAOCG00000010182 #8 ENSAOCG00000010194 #8 ENSAOCG00000002009 #12 ENSAOCG00000010226 #12 ENSAOCG00000002555 ##25 ENSAOCG00000010257 #15 ENSAOCG00000010271 ##25 ENSAOCG00000010281 ##25 ENSAOCG00000010293 #19 ENSAOCG00000010312 ENSAOCG00000002556 #21 ENSAOCG00000010336 #25 ENSAOCG00000000647 #25 ENSAOCG00000010495 #25 pcdh2ab10 (ENSAOCG00000010528) ##25 pcdh2ac (ENSAOCG00000010573) #26 ENSAOCG00000010594 ENSAOCG00000010607 Clown anemonefish MODERN SPECIES 1335 ENSAOCG00000010182 #8 ENSAOCG00000010194 #8 ENSAOCG00000002009 #12 ENSAOCG00000010226 #12 ENSAOCG00000002555 ##25 ENSAOCG00000010257 #15 ENSAOCG00000010271 ##25 ENSAOCG00000010281 ##25 ENSAOCG00000010293 #19 ENSAOCG00000010312 ENSAOCG00000002556 #21 ENSAOCG00000010336 #25 ENSAOCG00000000647 #25 ENSAOCG00000010495 #25 pcdh2ab10 (ENSAOCG00000010528) ##25 pcdh2ac (ENSAOCG00000010573) #26 ENSAOCG00000010594 ENSAOCG00000010607 Clown anemonefish MODERN SPECIES 1335 ENSAOCG00000010182 #8 ENSAOCG00000010194 #8 ENSAOCG00000002009 #12 ENSAOCG00000010226 #12 ENSAOCG00000002555 ##25 ENSAOCG00000010257 #15 ENSAOCG00000010271 ##25 ENSAOCG00000010281 ##25 ENSAOCG00000010293 #19 ENSAOCG00000010312 ENSAOCG00000002556 #21 ENSAOCG00000010336 #25 ENSAOCG00000000647 #25 ENSAOCG00000010495 #25 pcdh2ab10 (ENSAOCG00000010528) ##25 pcdh2ac (ENSAOCG00000010573) #26 ENSAOCG00000010594 ENSAOCG00000010607 Orange clownfish DUPLICATION Orange clownfish MODERN SPECIES 4 ENSAPEG00000014660 #12 ENSAPEG00000014647 ENSAPEG00000014641 #20 ENSAPEG00000014628 ##25 ENSAPEG00000014619 ##25 ENSAPEG00000014614 #20 ENSAPEG00000014604 ##25 ENSAPEG00000014585 #15 ENSAPEG00000014572 ##25 ENSAPEG00000014557 #19 ENSAPEG00000014543 ENSAPEG00000014528 #21 ENSAPEG00000014520 #23 ENSAPEG00000014312 #25 ENSAPEG00000014282 #27 ENSAPEG00000014133 #25 pcdh2ac (ENSAPEG00000014114) #26 ENSAPEG00000014085 #35 ENSAPEG00000014079 #35 ENSAPEG00000014053 #35 ENSAPEG00000014040 ENSAPEG00000014011 #35 ENSAPEG00000013996 #35 ENSAPEG00000013978 #33 ENSAPEG00000013946 #36 ENSAPEG00000013925 #35 ENSAPEG00000013896 ##37 ENSAPEG00000013878 ##37 ENSAPEG00000013862 ##37 ENSAPEG00000013842 ##37 ENSAPEG00000013836 Orange clownfish MODERN SPECIES 4 ENSAPEG00000014713 #9 ENSAPEG00000014699 #12 ENSAPEG00000014660 #12 ENSAPEG00000014647 ENSAPEG00000014641 #20 ENSAPEG00000014628 ##25 ENSAPEG00000014619 ##25 ENSAPEG00000014614 #20 ENSAPEG00000014604 ##25 ENSAPEG00000014585 #15 ENSAPEG00000014572 ##25 ENSAPEG00000014557 #19 ENSAPEG00000014543 ENSAPEG00000014528 #21 ENSAPEG00000014520 #23 ENSAPEG00000014312 #25 ENSAPEG00000014282 #27 ENSAPEG00000014133 #25 pcdh2ac (ENSAPEG00000014114) #26 ENSAPEG00000014085 #35 ENSAPEG00000014079 #35 ENSAPEG00000014053 #35 ENSAPEG00000014040 ENSAPEG00000014011 #35 ENSAPEG00000013996 #35 ENSAPEG00000013978 #33 ENSAPEG00000013946 #36 ENSAPEG00000013925 #35 ENSAPEG00000013896 ##37 ENSAPEG00000013878 ##37 ENSAPEG00000013862 ##37 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004.d.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000156683 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004.d.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00990000211570 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.l #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.e ##37 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004.d.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004.d.b ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00990000211570 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.l #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.b.j ##37 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.x #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00990000211570 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.l #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000177004.d.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.w.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.x #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00990000211570 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.l #35 Haplochromini_B DUPLICATION Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000177004.d.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.w.b.a #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.x #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.m #25 ENSGT00940000178344 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.n #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.l #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005000894 #8 ENSMZEG00005000946 #9 ENSMZEG00005000958 ENSMZEG00005000982 #12 ENSMZEG00005000994 #12 ENSMZEG00005001006 #12 ENSMZEG00005001024 #15 ENSMZEG00005001048 ##25 ENSMZEG00005001068 #15 ENSMZEG00005001074 ##25 ENSMZEG00005001087 ##25 ENSMZEG00005001112 #19 ENSMZEG00005001122 #21 ENSMZEG00005001133 #21 ENSMZEG00005001148 ##25 ENSMZEG00005001175 #25 ENSMZEG00005001191 ENSMZEG00005001204 #25 ENSMZEG00005001496 ##25 ENSMZEG00005001585 ##25 pcdh2ac (ENSMZEG00005001600) #26 ENSMZEG00005001606 #35 ENSMZEG00005001612 #35 ENSMZEG00005001626 ENSMZEG00005001638 #35 ENSMZEG00005001643 #35 ENSMZEG00005001657 #35 ENSMZEG00005001678 #33 ENSMZEG00005001693 #35 ENSMZEG00005001713 ENSMZEG00005001722 ##37 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000010956 #12 ENSACLG00000010963 #12 ENSACLG00000010982 #12 ENSACLG00000010995 #9 ENSACLG00000011008 #12 ENSACLG00000011017 ##25 ENSACLG00000011028 #15 ENSACLG00000011046 ##25 ENSACLG00000011053 ##25 ENSACLG00000011068 ##25 ENSACLG00000011086 #20 ENSACLG00000011091 ##25 ENSACLG00000011099 #19 ENSACLG00000011102 #21 ENSACLG00000011124 ##25 ENSACLG00000011157 #25 ENSACLG00000011178 #25 ENSACLG00000011363 ##25 pcdh2ab8 (ENSACLG00000011367) ##25 ENSACLG00000011696 #35 ENSACLG00000011712 #35 ENSACLG00000011729 #35 ENSACLG00000011758 #35 ENSACLG00000011766 #35 ENSACLG00000011774 #33 ENSACLG00000011784 ##37 ENSACLG00000011797 #36 ENSACLG00000011808 #35 ENSACLG00000011825 ##37 ENSACLG00000011865 ##37 ENSACLG00000011887 ##37 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000177004.d.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.w.b.a #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.x #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.m #25 ENSGT00940000178344 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.n #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.l #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.b.i.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e.ab.a #37 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000010963 #12 ENSACLG00000010982 #12 ENSACLG00000010995 #9 ENSACLG00000011008 #12 ENSACLG00000011017 ##25 ENSACLG00000011028 #15 ENSACLG00000011046 ##25 ENSACLG00000011053 ##25 ENSACLG00000011068 ##25 ENSACLG00000011086 #20 ENSACLG00000011091 ##25 ENSACLG00000011099 #19 ENSACLG00000011102 #21 ENSACLG00000011124 ##25 ENSACLG00000011157 #25 ENSACLG00000011178 #25 ENSACLG00000011363 ##25 pcdh2ab8 (ENSACLG00000011367) ##25 ENSACLG00000011696 #35 ENSACLG00000011712 #35 ENSACLG00000011729 #35 ENSACLG00000011758 #35 ENSACLG00000011766 #35 ENSACLG00000011774 #33 ENSACLG00000011784 ##37 ENSACLG00000011797 #36 ENSACLG00000011808 #35 ENSACLG00000011825 ##37 ENSACLG00000011865 ##37 ENSACLG00000011887 ##37 ENSACLG00000011937 ##37 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005000958 ENSMZEG00005000982 #12 ENSMZEG00005000994 #12 ENSMZEG00005001006 #12 ENSMZEG00005001024 #15 ENSMZEG00005001048 ##25 ENSMZEG00005001068 #15 ENSMZEG00005001074 ##25 ENSMZEG00005001087 ##25 ENSMZEG00005001112 #19 ENSMZEG00005001122 #21 ENSMZEG00005001133 #21 ENSMZEG00005001148 ##25 ENSMZEG00005001175 #25 ENSMZEG00005001191 ENSMZEG00005001204 #25 ENSMZEG00005001496 ##25 ENSMZEG00005001585 ##25 pcdh2ac (ENSMZEG00005001600) #26 ENSMZEG00005001606 #35 ENSMZEG00005001612 #35 ENSMZEG00005001626 ENSMZEG00005001638 #35 ENSMZEG00005001643 #35 ENSMZEG00005001657 #35 ENSMZEG00005001678 #33 ENSMZEG00005001693 #35 ENSMZEG00005001713 ENSMZEG00005001722 ##37 ENSMZEG00005001729 ##37 ENSMZEG00005001737 #37 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000037611 ENSONIG00000032228 ENSONIG00000036227 ENSONIG00000027109 #7 ENSONIG00000041059 ENSONIG00000032107 #8 ENSONIG00000034641 #9 ENSONIG00000030596 ##12 ENSONIG00000035556 #9 ENSONIG00000037921 ##25 ENSONIG00000021365 #15 ENSONIG00000034871 ##25 ENSONIG00000033250 ENSONIG00000021350 #21 ENSONIG00000029948 ENSONIG00000031283 #25 ENSONIG00000035146 ##25 pcdh2ac (ENSONIG00000030416) #26 ENSONIG00000032670 #35 ENSONIG00000029451 #35 ENSONIG00000028830 #35 ENSONIG00000042593 #35 ENSONIG00000028202 #35 ENSONIG00000040060 #33 ENSONIG00000031218 #36 ENSONIG00000004967 #35 ENSONIG00000029266 ENSONIG00000004968 ##37 ENSONIG00000041668 ##37 ENSONIG00000032226 ##37 ENSONIG00000036968 ##37 Midas cichlid DUPLICATION Midas cichlid MODERN SPECIES 115 ENSACIG00000014227 #12 ENSACIG00000014219 #12 ENSACIG00000014208 ENSACIG00000014155 ENSACIG00000014126 ##12 ENSACIG00000014100 ##25 ENSACIG00000014090 ##25 ENSACIG00000014073 ##25 ENSACIG00000014064 ##25 ENSACIG00000014056 ENSACIG00000014036 #21 ENSACIG00000014025 #20 ENSACIG00000014013 #27 ENSACIG00000014005 #25 ENSACIG00000013994 #25 ENSACIG00000013973 #25 ENSACIG00000013959 ##25 ENSACIG00000013949 #27 pcdh2ab8 (ENSACIG00000013935) ##25 pcdh2ac (ENSACIG00000013746) #26 ENSACIG00000013723 ##37 ENSACIG00000013643 #35 ENSACIG00000013633 #33 ENSACIG00000013629 ##37 Midas cichlid MODERN SPECIES 115 ENSACIG00000014245 #8 ENSACIG00000014237 ENSACIG00000014227 #12 ENSACIG00000014219 #12 ENSACIG00000014208 ENSACIG00000014155 ENSACIG00000014126 ##12 ENSACIG00000014100 ##25 ENSACIG00000014090 ##25 ENSACIG00000014073 ##25 ENSACIG00000014064 ##25 ENSACIG00000014056 ENSACIG00000014036 #21 ENSACIG00000014025 #20 ENSACIG00000014013 #27 ENSACIG00000014005 #25 ENSACIG00000013994 #25 ENSACIG00000013973 #25 ENSACIG00000013959 ##25 ENSACIG00000013949 #27 pcdh2ab8 (ENSACIG00000013935) ##25 pcdh2ac (ENSACIG00000013746) #26 ENSACIG00000013723 ##37 ENSACIG00000013643 #35 ENSACIG00000013633 #33 ENSACIG00000013629 ##37 Midas cichlid MODERN SPECIES 115 ENSACIG00000014237 ENSACIG00000014227 #12 ENSACIG00000014219 #12 ENSACIG00000014208 ENSACIG00000014155 ENSACIG00000014126 ##12 ENSACIG00000014100 ##25 ENSACIG00000014090 ##25 ENSACIG00000014073 ##25 ENSACIG00000014064 ##25 ENSACIG00000014056 ENSACIG00000014036 #21 ENSACIG00000014025 #20 ENSACIG00000014013 #27 ENSACIG00000014005 #25 ENSACIG00000013994 #25 ENSACIG00000013973 #25 ENSACIG00000013959 ##25 ENSACIG00000013949 #27 pcdh2ab8 (ENSACIG00000013935) ##25 pcdh2ac (ENSACIG00000013746) #26 ENSACIG00000013723 ##37 ENSACIG00000013643 #35 ENSACIG00000013633 #33 ENSACIG00000013629 ##37 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.r #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000159725 ENSGT00940000165759.b.a.a ENSGT00940000177103 ENSGT00940000156683 ENSGT00940000164468.a.a.a.a Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01100000264899 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.r #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000159725 ENSGT00940000165759.b.a.a Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b.h #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01100000264899 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000181572 ENSGT00940000164468.a.a.a.a ENSGT00940000165759.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.b ENSGT00940000166867 ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.a.a.a.c.b ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.a.a.b.b.a.a ENSGT00940000164468.a.a.b.a.b.c.b Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.r #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000181572 Siamese fighting fish DUPLICATION Siamese fighting fish MODERN SPECIES 1 ENSBSLG00000008363 pcdh2ac (ENSBSLG00000008390) #26 ENSBSLG00000008495 ENSBSLG00000008503 #7 ENSBSLG00000008510 #11 ENSBSLG00000008521 #8 ENSBSLG00000008537 #9 ENSBSLG00000008556 #12 ENSBSLG00000008573 #12 ENSBSLG00000008592 #9 ENSBSLG00000008609 ENSBSLG00000008614 ##12 ENSBSLG00000008618 ##25 ENSBSLG00000008630 ##25 ENSBSLG00000008634 #21 ENSBSLG00000008652 #25 ENSBSLG00000008657 #25 ENSBSLG00000008661 ##25 ENSBSLG00000008670 ##37 ENSBSLG00000008677 ENSBSLG00000008684 ##37 ENSBSLG00000008693 ##37 ENSBSLG00000008700 ENSBSLG00000008703 #37 ENSBSLG00000008705 #37 ENSBSLG00000008713 ##37 ENSBSLG00000008719 ##37 ENSBSLG00000008731 ENSBSLG00000008739 #35 ENSBSLG00000008744 ##37 ENSBSLG00000008745 #37 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 1 pcdh2ac (ENSBSLG00000008390) #26 ENSBSLG00000008495 ENSBSLG00000008503 #7 ENSBSLG00000008510 #11 ENSBSLG00000008521 #8 ENSBSLG00000008537 #9 ENSBSLG00000008556 #12 ENSBSLG00000008573 #12 ENSBSLG00000008592 #9 ENSBSLG00000008609 ENSBSLG00000008614 ##12 ENSBSLG00000008618 ##25 ENSBSLG00000008630 ##25 ENSBSLG00000008634 #21 ENSBSLG00000008652 #25 ENSBSLG00000008657 #25 ENSBSLG00000008661 ##25 ENSBSLG00000008670 ##37 ENSBSLG00000008677 ENSBSLG00000008684 ##37 ENSBSLG00000008693 ##37 ENSBSLG00000008700 ENSBSLG00000008703 #37 ENSBSLG00000008705 #37 ENSBSLG00000008713 ##37 ENSBSLG00000008719 ##37 ENSBSLG00000008731 ENSBSLG00000008739 #35 ENSBSLG00000008744 ##37 ENSBSLG00000008745 #37 ENSBSLG00000008750 ##37 Zig-zag eel MODERN SPECIES 1 ENSMAMG00000005084 ##12 ENSMAMG00000028444 ##12 ENSMAMG00000005059 ENSMAMG00000004908 #8 ENSMAMG00000004869 ENSMAMG00000025351 #12 ENSMAMG00000026543 #12 ENSMAMG00000028695 ENSMAMG00000004797 #20 ENSMAMG00000024580 ##25 ENSMAMG00000026967 #15 ENSMAMG00000004622 #15 ENSMAMG00000004617 ENSMAMG00000026670 #21 ENSMAMG00000024788 ##25 ENSMAMG00000004456 #25 ENSMAMG00000025800 ##37 ENSMAMG00000026498 #35 ENSMAMG00000004396 #35 ENSMAMG00000004391 #18 ENSMAMG00000004045 #33 ENSMAMG00000026949 #36 ENSMAMG00000028733 ##37 ENSMAMG00000026871 ##37 ENSMAMG00000027401 ##37 ENSMAMG00000004029 ##37 ENSMAMG00000027892 ##37 ENSMAMG00000003981 #37 ENSMAMG00000004003 ##37 ENSMAMG00000003924 ENSMAMG00000003908 Carangaria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.f #37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000159725 ENSGT00940000165759.b.a.a ENSGT00940000165759.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.b ENSGT00940000166867 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.f #37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.k ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000159725 ENSGT00940000165759.b.a.a ENSGT00940000177103 ENSGT00940000156683 ENSGT00940000164468.a.a.a.a ENSGT00940000165759.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.a.b Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch MODERN SPECIES 127 ENSLCAG00010002490 ENSLCAG00010002486 ##12 ENSLCAG00010002482 #11 ENSLCAG00010002479 #12 ENSLCAG00010002477 ENSLCAG00010002476 #12 ENSLCAG00010002474 #12 ENSLCAG00010002472 ENSLCAG00010002470 ##25 ENSLCAG00010002469 #15 ENSLCAG00010002463 ##25 ENSLCAG00010002459 ##25 ENSLCAG00010002458 ##25 ENSLCAG00010002454 ##25 ENSLCAG00010002451 #25 ENSLCAG00010002447 #25 ENSLCAG00010002446 ##25 pcdh2ac (ENSLCAG00010002441) #26 ENSLCAG00010002440 #35 ENSLCAG00010002439 #35 ENSLCAG00010002434 #35 ENSLCAG00010002433 #35 ENSLCAG00010002430 ##37 Barramundi perch MODERN SPECIES 808 ENSLCAG00010001220 ##25 ENSLCAG00010001224 #20 ENSLCAG00010001230 ##25 ENSLCAG00010001235 ##25 ENSLCAG00010001241 ENSLCAG00010001246 #21 ENSLCAG00010001256 ENSLCAG00010001259 ENSLCAG00010001261 #25 ENSLCAG00010001263 #25 ENSLCAG00010001264 ##25 ENSLCAG00010001267 ##25 Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch MODERN SPECIES 808 ENSLCAG00010001220 ##25 ENSLCAG00010001224 #20 ENSLCAG00010001230 ##25 ENSLCAG00010001235 ##25 ENSLCAG00010001241 ENSLCAG00010001246 #21 ENSLCAG00010001256 ENSLCAG00010001259 ENSLCAG00010001261 #25 ENSLCAG00010001263 #25 ENSLCAG00010001264 ##25 ENSLCAG00010001267 ##25 Barramundi perch MODERN SPECIES 127 ENSLCAG00010002494 ENSLCAG00010002490 ENSLCAG00010002486 ##12 ENSLCAG00010002482 #11 ENSLCAG00010002479 #12 ENSLCAG00010002477 ENSLCAG00010002476 #12 ENSLCAG00010002474 #12 ENSLCAG00010002472 ENSLCAG00010002470 ##25 ENSLCAG00010002469 #15 ENSLCAG00010002463 ##25 ENSLCAG00010002459 ##25 ENSLCAG00010002458 ##25 ENSLCAG00010002454 ##25 ENSLCAG00010002451 #25 ENSLCAG00010002447 #25 ENSLCAG00010002446 ##25 pcdh2ac (ENSLCAG00010002441) #26 ENSLCAG00010002440 #35 ENSLCAG00010002439 #35 ENSLCAG00010002434 #35 ENSLCAG00010002433 #35 ENSLCAG00010002430 ##37 Seriola ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a.e #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a.b #35 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.j.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.k ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000159725 ENSGT00940000165759.b.a.a ENSGT00940000177103 ENSGT00940000165759.a.b.q Yellowtail amberjack DUPLICATION Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3259 ENSSLDG00000001370 ENSSLDG00000001326 #9 ENSSLDG00000001304 #12 ENSSLDG00000001283 ##12 ENSSLDG00000001262 #20 ENSSLDG00000001252 #9 ENSSLDG00000001232 ##25 ENSSLDG00000001211 #15 ENSSLDG00000001175 ##25 ENSSLDG00000001165 #19 ENSSLDG00000001154 ENSSLDG00000001128 #23 ENSSLDG00000001120 #21 ENSSLDG00000001101 ENSSLDG00000001084 #25 ENSSLDG00000001052 #25 ENSSLDG00000001036 ##25 pcdh2ac (ENSSLDG00000000958) #26 ENSSLDG00000000897 #35 ENSSLDG00000000862 #35 ENSSLDG00000000787 #35 ENSSLDG00000000448 #36 ENSSLDG00000000422 ##37 ENSSLDG00000000410 ##37 ENSSLDG00000000240 ##37 ENSSLDG00000000209 ##37 ENSSLDG00000000184 ##37 ENSSLDG00000000142 #37 ENSSLDG00000000096 ENSSLDG00000024565 ENSSLDG00000024561 Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3259 ENSSLDG00000001401 ##12 ENSSLDG00000001370 ENSSLDG00000001326 #9 ENSSLDG00000001304 #12 ENSSLDG00000001283 ##12 ENSSLDG00000001262 #20 ENSSLDG00000001252 #9 ENSSLDG00000001232 ##25 ENSSLDG00000001211 #15 ENSSLDG00000001175 ##25 ENSSLDG00000001165 #19 ENSSLDG00000001154 ENSSLDG00000001128 #23 ENSSLDG00000001120 #21 ENSSLDG00000001101 ENSSLDG00000001084 #25 ENSSLDG00000001052 #25 ENSSLDG00000001036 ##25 pcdh2ac (ENSSLDG00000000958) #26 ENSSLDG00000000897 #35 ENSSLDG00000000862 #35 ENSSLDG00000000787 #35 ENSSLDG00000000448 #36 ENSSLDG00000000422 ##37 ENSSLDG00000000410 ##37 ENSSLDG00000000240 ##37 ENSSLDG00000000209 ##37 ENSSLDG00000000184 ##37 ENSSLDG00000000142 #37 ENSSLDG00000000096 ENSSLDG00000024565 Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 Tongue sole MODERN SPECIES 6 ENSCSEG00000006387 ENSCSEG00000006385 ENSCSEG00000006382 ENSCSEG00000006376 ENSCSEG00000006372 ENSCSEG00000006348 #7 ENSCSEG00000006344 ##12 ENSCSEG00000006338 ENSCSEG00000006336 ENSCSEG00000006331 #12 ENSCSEG00000006327 ENSCSEG00000006324 ##25 ENSCSEG00000006319 #19 ENSCSEG00000006317 #21 ENSCSEG00000006313 ENSCSEG00000006308 #25 ENSCSEG00000006307 ##25 ENSCSEG00000006302 #27 pcdh2ab8 (ENSCSEG00000006301) ##25 ENSCSEG00000006284 ##25 ENSCSEG00000006271 #35 ENSCSEG00000006267 ENSCSEG00000006266 #36 ENSCSEG00000006261 ##37 ENSCSEG00000006256 #36 ENSCSEG00000006249 ##37 ENSCSEG00000006245 ##37 ENSCSEG00000006244 #35 ENSCSEG00000006240 #35 ENSCSEG00000006238 ENSCSEG00000006234 Turbot DUPLICATION Turbot MODERN SPECIES 4 pcdh2aa1 (ENSSMAG00000016187) ##12 ENSSMAG00000016163 ##12 ENSSMAG00000033861 ENSSMAG00000034636 #8 ENSSMAG00000022434 #8 ENSSMAG00000023632 ##12 ENSSMAG00000025748 #9 ENSSMAG00000023362 ENSSMAG00000001346 #12 ENSSMAG00000022345 ENSSMAG00000028799 ##25 ENSSMAG00000021880 ##25 ENSSMAG00000001405 ##25 ENSSMAG00000001579 ENSSMAG00000023812 ##25 ENSSMAG00000024294 #25 ENSSMAG00000031943 ENSSMAG00000025670 #25 pcdh2ab10 (ENSSMAG00000033635) ##25 pcdh2ac (ENSSMAG00000030691) #26 ENSSMAG00000033759 #29 ENSSMAG00000024154 #35 ENSSMAG00000037132 ##37 ENSSMAG00000033616 ENSSMAG00000024825 ##37 ENSSMAG00000025683 ##37 ENSSMAG00000032750 ##37 ENSSMAG00000030566 ##37 ENSSMAG00000035316 ##37 ENSSMAG00000031027 #37 ENSSMAG00000025150 Turbot MODERN SPECIES 4 ENSSMAG00000033861 ENSSMAG00000034636 #8 ENSSMAG00000022434 #8 ENSSMAG00000023632 ##12 ENSSMAG00000025748 #9 ENSSMAG00000023362 ENSSMAG00000001346 #12 ENSSMAG00000022345 ENSSMAG00000028799 ##25 ENSSMAG00000021880 ##25 ENSSMAG00000001405 ##25 ENSSMAG00000001579 ENSSMAG00000023812 ##25 ENSSMAG00000024294 #25 ENSSMAG00000031943 ENSSMAG00000025670 #25 pcdh2ab10 (ENSSMAG00000033635) ##25 pcdh2ac (ENSSMAG00000030691) #26 ENSSMAG00000033759 #29 ENSSMAG00000024154 #35 ENSSMAG00000037132 ##37 ENSSMAG00000033616 ENSSMAG00000024825 ##37 ENSSMAG00000025683 ##37 ENSSMAG00000032750 ##37 ENSSMAG00000030566 ##37 ENSSMAG00000035316 ##37 ENSSMAG00000031027 #37 ENSSMAG00000025150 ENSSMAG00000025946 ENSSMAG00000018588 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000178344 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000159725 ENSGT00940000165759.b.a.a ENSGT00940000165759.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.a.b ENSGT00940000166867 ENSGT00940000165759.a.a ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.b ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.a.a.a.c.b Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000166070 ENSGT00940000158371 ENSGT00390000009004.d ENSGT00940000155898 ENSGT00940000159553.b ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00990000205184 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.r #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000165759.b.a.b.a.a.b.p ENSGT00940000165759.b.a.b.a.b ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.a.a.b.a ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.a.a.b.b.a.a ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.a.a.a.c.a ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.a.a.b.b.a.b.b.a ENSGT00940000164983.d.a.a.a.b ENSGT00940000164983.d.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000163777.a ENSGT00940000165759.b.a.a ENSGT00940000165759.b.a.b.a.a.b.o Fugu MODERN SPECIES 5 ENSTRUG00000020114 ENSTRUG00000001035 ##12 ENSTRUG00000029711 ENSTRUG00000023244 #12 ENSTRUG00000021621 #12 ENSTRUG00000033047 ENSTRUG00000023579 #12 ENSTRUG00000027859 ENSTRUG00000021733 #12 ENSTRUG00000028834 ENSTRUG00000033286 ENSTRUG00000025468 #20 ENSTRUG00000025673 #15 ENSTRUG00000025647 ##25 ENSTRUG00000028370 ##25 ENSTRUG00000023702 #25 pcdh2ac (ENSTRUG00000025164) #26 ENSTRUG00000019736 #35 ENSTRUG00000023463 #35 ENSTRUG00000002066 #35 ENSTRUG00000023622 #36 ENSTRUG00000032017 #36 ENSTRUG00000023371 #37 ENSTRUG00000032477 ENSTRUG00000032190 ENSTRUG00000021983 ENSTRUG00000030010 ENSTRUG00000014108 ENSTRUG00000025098 ENSTRUG00000022585 ENSTRUG00000032880 Eupecaria_A DUPLICATION Eupecaria_A DUPLICATION Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 50 ENSGT01030000236108 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01100000264899 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 Ballan wrasse MODERN SPECIES 182 ENSLBEG00000001817 ENSLBEG00000001840 #12 ENSLBEG00000001871 #12 ENSLBEG00000001911 #12 ENSLBEG00000001932 #12 ENSLBEG00000001969 ##12 ENSLBEG00000002011 ##25 ENSLBEG00000002048 ##25 ENSLBEG00000002071 ##25 ENSLBEG00000002088 ENSLBEG00000002103 ##25 ENSLBEG00000002118 ENSLBEG00000002126 #27 ENSLBEG00000002149 #25 ENSLBEG00000002165 #25 ENSLBEG00000002205 #25 ENSLBEG00000002221 pcdh2ab8 (ENSLBEG00000002246) ##25 pcdh2ac (ENSLBEG00000002305) #26 ENSLBEG00000002317 #35 ENSLBEG00000002335 #35 ENSLBEG00000002381 #35 ENSLBEG00000002501 #36 ENSLBEG00000002517 ##37 ENSLBEG00000002534 ##37 ENSLBEG00000002553 ##37 ENSLBEG00000002569 ##37 ENSLBEG00000002642 ##37 ENSLBEG00000002832 #37 ENSLBEG00000002976 #37 ENSLBEG00000003051 #37 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.j ##12 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.b #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.`b #25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.f #37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.j ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01100000264899 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.`b #25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.f #37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.r #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.b #35 Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 ENSSAUG00010004703 ##12 ENSSAUG00010004705 #8 ENSSAUG00010004707 #12 ENSSAUG00010004714 #12 ENSSAUG00010004718 ENSSAUG00010004720 #12 ENSSAUG00010004722 #12 ENSSAUG00010004724 #15 ENSSAUG00010004734 #15 ENSSAUG00010004736 #15 ENSSAUG00010004738 ENSSAUG00010004742 ##25 ENSSAUG00010004745 #23 ENSSAUG00010004748 #23 ENSSAUG00010004749 ENSSAUG00010004750 #25 ENSSAUG00010004752 #25 ENSSAUG00010004753 #25 ENSSAUG00010004755 ##25 ENSSAUG00010004757 #27 ENSSAUG00010004761 #35 ENSSAUG00010004762 #35 ENSSAUG00010004765 #29 ENSSAUG00010004768 ##37 ENSSAUG00010004772 ##37 ENSSAUG00010004775 ##37 ENSSAUG00010004777 #37 ENSSAUG00010004780 ##37 ENSSAUG00010004782 ##37 ENSSAUG00010004783 ##37 ENSSAUG00010004785 ##37 Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 ENSSAUG00010004707 #12 ENSSAUG00010004714 #12 ENSSAUG00010004718 ENSSAUG00010004720 #12 ENSSAUG00010004722 #12 ENSSAUG00010004724 #15 ENSSAUG00010004734 #15 ENSSAUG00010004736 #15 ENSSAUG00010004738 ENSSAUG00010004742 ##25 ENSSAUG00010004745 #23 ENSSAUG00010004748 #23 ENSSAUG00010004749 ENSSAUG00010004750 #25 ENSSAUG00010004752 #25 ENSSAUG00010004753 #25 ENSSAUG00010004755 ##25 ENSSAUG00010004757 #27 ENSSAUG00010004761 #35 ENSSAUG00010004762 #35 ENSSAUG00010004765 #29 ENSSAUG00010004768 ##37 ENSSAUG00010004772 ##37 ENSSAUG00010004775 ##37 ENSSAUG00010004777 #37 ENSSAUG00010004780 ##37 ENSSAUG00010004782 ##37 ENSSAUG00010004783 ##37 ENSSAUG00010004785 ##37 ENSSAUG00010004787 ##37 ENSSAUG00010004789 ##37 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.a #25 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.b #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.f #37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000156683 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000158371 ENSGT00390000009004.d ENSGT00940000155898 ENSGT00940000159553.b ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.i.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.a #25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.f #37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000156683 ENSGT00940000165759.b.a.a ENSGT00940000165759.a.b ENSGT01060000248675 ENSGT00940000165759.b.a.b.b ENSGT00940000166867 ENSGT00940000165759.b.a.b.a.a.b ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.a.a.a.c.b ENSGT00940000164468.a.a.a.a Pike perch MODERN SPECIES 18 ENSSLUG00000004868 ##12 ENSSLUG00000004866 ##12 ENSSLUG00000004863 ENSSLUG00000004862 ENSSLUG00000004857 ##12 ENSSLUG00000004846 #8 ENSSLUG00000004828 #9 ENSSLUG00000004815 #12 ENSSLUG00000004811 #20 ENSSLUG00000004807 #15 ENSSLUG00000004799 #15 ENSSLUG00000004793 ##25 ENSSLUG00000004785 #15 ENSSLUG00000004756 #23 ENSSLUG00000004748 ##25 ENSSLUG00000004735 #25 pcdh2ac (ENSSLUG00000004719) #26 ENSSLUG00000004703 #35 ENSSLUG00000004697 #29 ENSSLUG00000004693 #35 ENSSLUG00000004688 #35 ENSSLUG00000004680 #35 ENSSLUG00000004678 #27 ENSSLUG00000004673 #33 ENSSLUG00000004655 #36 ENSSLUG00000004651 ##37 ENSSLUG00000004650 ##37 ENSSLUG00000004645 #35 ENSSLUG00000004639 #37 ENSSLUG00000004637 ##37 ENSSLUG00000004544 ##37 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.b #12 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.b #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.`b #25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.r #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000159725 ENSGT00940000165759.b.a.a ENSGT00940000165759.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.a.b ENSGT00940000166867 ENSGT00940000165759.a.a ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.b ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.a.a.a.c.b Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.b #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.`b #25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.f #37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.r #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.b #25 Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 ENSSAUG00010004705 #8 ENSSAUG00010004707 #12 ENSSAUG00010004714 #12 ENSSAUG00010004718 ENSSAUG00010004720 #12 ENSSAUG00010004722 #12 ENSSAUG00010004724 #15 ENSSAUG00010004734 #15 ENSSAUG00010004736 #15 ENSSAUG00010004738 ENSSAUG00010004742 ##25 ENSSAUG00010004745 #23 ENSSAUG00010004748 #23 ENSSAUG00010004749 ENSSAUG00010004750 #25 ENSSAUG00010004752 #25 ENSSAUG00010004753 #25 ENSSAUG00010004755 ##25 ENSSAUG00010004757 #27 ENSSAUG00010004761 #35 ENSSAUG00010004762 #35 ENSSAUG00010004765 #29 ENSSAUG00010004768 ##37 ENSSAUG00010004772 ##37 ENSSAUG00010004775 ##37 ENSSAUG00010004777 #37 ENSSAUG00010004780 ##37 ENSSAUG00010004782 ##37 ENSSAUG00010004783 ##37 ENSSAUG00010004785 ##37 ENSSAUG00010004787 ##37 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.a #25 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.b #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.f #37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000156683 ENSGT00940000165759.b.a.a ENSGT00940000165759.b.a.b.a.a.b Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000158371 ENSGT00390000009004.d ENSGT00940000155898 ENSGT00940000159553.b ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.b #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.f #37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000165759.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.a.b ENSGT00940000166867 ENSGT00940000165759.a.a ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.a.a.b.b.a.a ENSGT00940000164468.a.a.b.a.b.c.b ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.a.a.b.b.a.b.a ENSGT00940000164983.d.a.b ENSGT00940000164983.d.a.a.a.a.b.b Lumpfish MODERN SPECIES 1 ENSCLMG00005017322 ENSCLMG00005017323 ##12 ENSCLMG00005017325 ENSCLMG00005017327 ENSCLMG00005017329 #8 ENSCLMG00005017333 #12 ENSCLMG00005001287 #12 ENSCLMG00005001296 #12 ENSCLMG00005001399 ##25 ENSCLMG00005001636 #15 ENSCLMG00005001644 #19 ENSCLMG00005001653 #21 ENSCLMG00005001663 ENSCLMG00005001671 ##25 ENSCLMG00005001678 ENSCLMG00005001688 #25 ENSCLMG00005001698 #27 pcdh2ac (ENSCLMG00005001736) #26 ENSCLMG00005001878 #35 ENSCLMG00005001881 #35 ENSCLMG00005001886 #35 ENSCLMG00005001887 #35 ENSCLMG00005001890 #35 ENSCLMG00005001891 #35 ENSCLMG00005001894 #33 ENSCLMG00005001898 #37 ENSCLMG00005001900 ##37 ENSCLMG00005001902 #35 ENSCLMG00005001906 ENSCLMG00005001910 ENSCLMG00005001914 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.b #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.`b #25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.r #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000159725 ENSGT00940000165759.b.a.a ENSGT00940000165759.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.a.b ENSGT00940000166867 ENSGT00940000165759.a.a ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.b ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.a.a.a.c.b ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.a.a.b.a ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.a.a.b.b.a.a Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.b #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.`b #25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.f #37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.r #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000165759.b.a.a Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.j ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01100000264899 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.`b #25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.f #37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.r #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000181572 ENSGT00940000164468.a.a.a.a ENSGT00940000165759.a.b Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000002137 ENSGT00940000166070 ENSGT00940000158371 ENSGT00940000170031 ENSGT00390000009004.d ENSGT00940000155898 ENSGT00940000159553.b ENSGT01010000224686 ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.j ##12 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.`b #25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.f #37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.r #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000181572 ENSGT00940000164468.a.a.a.a ENSGT00940000165759.a.b European seabass MODERN SPECIES 12 ENSDLAG00005035091 ##12 ENSDLAG00005035023 #11 ENSDLAG00005027408 ##12 ENSDLAG00005016635 #12 ENSDLAG00005028538 #12 ENSDLAG00005027175 #12 ENSDLAG00005034627 #12 pcdh2ab5 (ENSDLAG00005022013) ##25 ENSDLAG00005028279 ##25 ENSDLAG00005028968 ##25 ENSDLAG00005029590 ##25 ENSDLAG00005002365 ENSDLAG00005012248 #20 ENSDLAG00005032497 ENSDLAG00005029568 ##25 ENSDLAG00005002726 #25 pcdh2ab10 (ENSDLAG00005017238) ##25 pcdh2ac (ENSDLAG00005020172) #26 ENSDLAG00005032844 #35 ENSDLAG00005018658 #35 ENSDLAG00005019241 #33 ENSDLAG00005027070 #37 ENSDLAG00005030151 ##37 ENSDLAG00005026638 ##37 ENSDLAG00005018567 #37 ENSDLAG00005033651 ##37 ENSDLAG00005017171 ##37 ENSDLAG00005033095 ##37 ENSDLAG00005035062 ENSDLAG00005017161 #37 ENSDLAG00005018203 ##37 Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse MODERN SPECIES 182 ENSLBEG00000001784 #12 ENSLBEG00000001817 ENSLBEG00000001840 #12 ENSLBEG00000001871 #12 ENSLBEG00000001911 #12 ENSLBEG00000001932 #12 ENSLBEG00000001969 ##12 ENSLBEG00000002011 ##25 ENSLBEG00000002048 ##25 ENSLBEG00000002071 ##25 ENSLBEG00000002088 ENSLBEG00000002103 ##25 ENSLBEG00000002118 ENSLBEG00000002126 #27 ENSLBEG00000002149 #25 ENSLBEG00000002165 #25 ENSLBEG00000002205 #25 ENSLBEG00000002221 pcdh2ab8 (ENSLBEG00000002246) ##25 pcdh2ac (ENSLBEG00000002305) #26 ENSLBEG00000002317 #35 ENSLBEG00000002335 #35 ENSLBEG00000002381 #35 ENSLBEG00000002501 #36 ENSLBEG00000002517 ##37 ENSLBEG00000002534 ##37 ENSLBEG00000002553 ##37 ENSLBEG00000002569 ##37 ENSLBEG00000002642 ##37 ENSLBEG00000002832 #37 ENSLBEG00000002976 #37 Ballan wrasse MODERN SPECIES 182 ENSLBEG00000001750 ##12 ENSLBEG00000001784 #12 ENSLBEG00000001817 ENSLBEG00000001840 #12 ENSLBEG00000001871 #12 ENSLBEG00000001911 #12 ENSLBEG00000001932 #12 ENSLBEG00000001969 ##12 ENSLBEG00000002011 ##25 ENSLBEG00000002048 ##25 ENSLBEG00000002071 ##25 ENSLBEG00000002088 ENSLBEG00000002103 ##25 ENSLBEG00000002118 ENSLBEG00000002126 #27 ENSLBEG00000002149 #25 ENSLBEG00000002165 #25 ENSLBEG00000002205 #25 ENSLBEG00000002221 pcdh2ab8 (ENSLBEG00000002246) ##25 pcdh2ac (ENSLBEG00000002305) #26 ENSLBEG00000002317 #35 ENSLBEG00000002335 #35 ENSLBEG00000002381 #35 ENSLBEG00000002501 #36 ENSLBEG00000002517 ##37 ENSLBEG00000002534 ##37 ENSLBEG00000002553 ##37 ENSLBEG00000002569 ##37 ENSLBEG00000002642 ##37 ENSLBEG00000002832 #37 Tiger tail seahorse DUPLICATION Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 239 ENSHCOG00000014378 ##12 ENSHCOG00000014366 ##12 ENSHCOG00000014353 ##12 ENSHCOG00000014317 ##12 ENSHCOG00000014293 ENSHCOG00000014280 #8 ENSHCOG00000014273 #11 ENSHCOG00000014271 #12 ENSHCOG00000014264 #12 ENSHCOG00000014257 #12 ENSHCOG00000014248 #9 ENSHCOG00000014221 ##25 ENSHCOG00000014050 ##25 ENSHCOG00000014011 ##25 ENSHCOG00000000663 ENSHCOG00000013984 #25 ENSHCOG00000013966 #25 pcdh2ab8 (ENSHCOG00000013952) ##25 pcdh2ac (ENSHCOG00000013879) #26 ENSHCOG00000013778 #35 ENSHCOG00000013765 ENSHCOG00000013753 #35 ENSHCOG00000013733 #35 ENSHCOG00000013724 ENSHCOG00000013704 ##37 ENSHCOG00000013624 ##37 ENSHCOG00000013615 ##37 ENSHCOG00000013603 ##37 Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 239 ENSHCOG00000014366 ##12 ENSHCOG00000014353 ##12 ENSHCOG00000014317 ##12 ENSHCOG00000014293 ENSHCOG00000014280 #8 ENSHCOG00000014273 #11 ENSHCOG00000014271 #12 ENSHCOG00000014264 #12 ENSHCOG00000014257 #12 ENSHCOG00000014248 #9 ENSHCOG00000014221 ##25 ENSHCOG00000014050 ##25 ENSHCOG00000014011 ##25 ENSHCOG00000000663 ENSHCOG00000013984 #25 ENSHCOG00000013966 #25 pcdh2ab8 (ENSHCOG00000013952) ##25 pcdh2ac (ENSHCOG00000013879) #26 ENSHCOG00000013778 #35 ENSHCOG00000013765 ENSHCOG00000013753 #35 ENSHCOG00000013733 #35 ENSHCOG00000013724 ENSHCOG00000013704 ##37 ENSHCOG00000013624 ##37 ENSHCOG00000013615 ##37 ENSHCOG00000013603 ##37 Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 1 ENSMMDG00005002794 #10 ENSMMDG00005002799 #11 ENSMMDG00005002805 #12 ENSMMDG00005002823 #13 ENSMMDG00005002843 #14 ENSMMDG00005002929 #15 ENSMMDG00005002938 #16 ENSMMDG00005002943 #17 ENSMMDG00005002947 #18 ENSMMDG00005002957 #19 ENSMMDG00005002973 #20 ENSMMDG00005002981 #21 ENSMMDG00005002984 #22 ENSMMDG00005002989 #23 ENSMMDG00005002994 #24 ENSMMDG00005003000 #25 pcdh2ac (ENSMMDG00005003028) #26 ENSMMDG00005003176 #27 ENSMMDG00005003181 #28 ENSMMDG00005003194 #29 ENSMMDG00005003201 #30 ENSMMDG00005003206 #31 ENSMMDG00005003210 #32 ENSMMDG00005003219 #33 ENSMMDG00005003228 #34 ENSMMDG00005003235 #35 ENSMMDG00005003245 #36 ENSMMDG00005003250 #37 ENSMMDG00005003253 ##37 ENSMMDG00005003256 ENSMMDG00005003263 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 183 ENSGT00940000178344 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b #37 ENSGT00940000165759.a.b ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.a.a.b.b.a.a ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000156683 ENSGT00940000164468.a.a.a.a ENSGT00940000165759.b ENSGT00940000166867 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 453 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 102 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000178344 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b #37 ENSGT00940000165759.b.a.a ENSGT01100000264470 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000177513.a ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000165759.b.a.a ENSGT00940000165759.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.b Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000165759.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.b ENSGT00940000166867 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000159725 Oryzias ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000166070 ENSGT00940000158371 ENSGT01030000234599.a.b.c ENSGT00390000009004.d ENSGT00940000155898 ENSGT00940000159553.b ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.`b.b.b ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a.d ##25 ENSGT01030000236108 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a.c ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.b.b.b.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.b.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.h ##37 ENSGT00970000195503 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.i ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000165759.a.b.d Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.b ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.l #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT01030000236108 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a.c ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.b.b.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.b.b.b.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.b.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.h ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.i ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b.e ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b.f ##37 Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 1 pcdh2aa1 (ENSORLG00000021994) ##12 ENSORLG00000028629 ##12 ENSORLG00000028208 ##12 ENSORLG00000030495 ENSORLG00000022312 #8 ENSORLG00000028903 #11 ENSORLG00000004181 #12 ENSORLG00000027606 ##12 ENSORLG00000029528 ENSORLG00000026864 ##25 ENSORLG00000026652 ENSORLG00000029341 ##25 ENSORLG00000024772 #19 ENSORLG00000004176 #21 ENSORLG00000004171 #23 ENSORLG00000023815 ##25 ENSORLG00000026259 ENSORLG00000029952 #25 ENSORLG00000024089 #25 ENSORLG00000028645 ENSORLG00000024851 ##25 pcdh2ab10 (ENSORLG00000022081) ##25 pcdh2ac (ENSORLG00000029405) #26 ENSORLG00000025371 #35 ENSORLG00000026934 #35 ENSORLG00000025477 #35 ENSORLG00000030492 #35 ENSORLG00000024469 #35 ENSORLG00000025135 ##37 ENSORLG00000030466 #35 ENSORLG00000029802 ##37 Chinese medaka MODERN SPECIES 1760 ENSOSIG00000001922 ##25 Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 100 ENSGT01100000264160 #18 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT01100000266157 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.a.a.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.b.b.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.b.b.b.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000165759.a.b.d ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.a.a.b.b.a.a.a.a Javanese ricefish MODERN SPECIES 1 ENSOJAG00000007158 ENSOJAG00000007177 ENSOJAG00000007209 ENSOJAG00000007239 ##12 ENSOJAG00000007284 #9 pcdh2ac (ENSOJAG00000007320) #26 ENSOJAG00000007379 ENSOJAG00000007393 ##12 ENSOJAG00000007414 #9 ENSOJAG00000007493 #12 ENSOJAG00000007530 #12 ENSOJAG00000007555 ENSOJAG00000007569 ##25 ENSOJAG00000007606 #18 ENSOJAG00000007610 #23 ENSOJAG00000007622 ##25 ENSOJAG00000007643 #25 ENSOJAG00000007675 ##25 ENSOJAG00000007685 ENSOJAG00000007712 #35 ENSOJAG00000007738 #35 ENSOJAG00000007765 #35 ENSOJAG00000007910 ##37 ENSOJAG00000007942 #35 ENSOJAG00000007960 #35 ENSOJAG00000007979 ##37 ENSOJAG00000007995 #35 ENSOJAG00000008007 ##37 ENSOJAG00000008030 #35 ENSOJAG00000008057 ##37 ENSOJAG00000008077 #37 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00940000177060 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.f #37 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a.e.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a.f ##12 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 Guppy MODERN SPECIES 440 ENSPREG00000001405 ##12 ENSPREG00000001390 ##12 ENSPREG00000001375 ENSPREG00000001368 ##12 ENSPREG00000001343 #11 ENSPREG00000001329 #12 ENSPREG00000001318 #12 ENSPREG00000001306 ENSPREG00000001293 ##25 ENSPREG00000001277 ##25 ENSPREG00000001221 ##25 ENSPREG00000001149 ##25 ENSPREG00000001136 #20 ENSPREG00000001124 ##25 ENSPREG00000001113 ENSPREG00000001096 ##25 ENSPREG00000001077 ENSPREG00000001039 #25 ENSPREG00000001020 #27 ENSPREG00000000942 #25 ENSPREG00000000911 #25 ENSPREG00000000855 #35 ENSPREG00000000826 #35 ENSPREG00000000805 ENSPREG00000000775 #35 ENSPREG00000000765 #35 ENSPREG00000000747 ENSPREG00000000730 #35 ENSPREG00000000710 ##37 ENSPREG00000000692 ##37 ENSPREG00000000594 ##37 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000165759.b.a.a ENSGT00940000177103 ENSGT00940000165759.a.b Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004.d.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004.d.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00990000211570 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.l #35 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004.d.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004.d.b ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00990000211570 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.l #35 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00990000205184 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.x #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00990000211570 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.l #35 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 501 ENSHBUG00000009287 ##12 ENSHBUG00000000235 ##12 ENSHBUG00000009323 ##12 ENSHBUG00000009334 #12 ENSHBUG00000009340 ##12 ENSHBUG00000009365 #7 ENSHBUG00000009372 ENSHBUG00000009382 ##12 ENSHBUG00000001186 #8 ENSHBUG00000009406 #8 ENSHBUG00000009423 #9 ENSHBUG00000009443 #12 ENSHBUG00000009453 #20 ENSHBUG00000009467 ##25 ENSHBUG00000009569 #19 ENSHBUG00000000251 ##25 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000177004.d.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.w.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.x #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00990000211570 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000177004.d.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.w.b.a #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.x #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.m #25 ENSGT00940000178344 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.n #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.l #35 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000010945 ENSACLG00000010956 #12 ENSACLG00000010963 #12 ENSACLG00000010982 #12 ENSACLG00000010995 #9 ENSACLG00000011008 #12 ENSACLG00000011017 ##25 ENSACLG00000011028 #15 ENSACLG00000011046 ##25 ENSACLG00000011053 ##25 ENSACLG00000011068 ##25 ENSACLG00000011086 #20 ENSACLG00000011091 ##25 ENSACLG00000011099 #19 ENSACLG00000011102 #21 ENSACLG00000011124 ##25 ENSACLG00000011157 #25 ENSACLG00000011178 #25 ENSACLG00000011363 ##25 pcdh2ab8 (ENSACLG00000011367) ##25 ENSACLG00000011696 #35 ENSACLG00000011712 #35 ENSACLG00000011729 #35 ENSACLG00000011758 #35 ENSACLG00000011766 #35 ENSACLG00000011774 #33 ENSACLG00000011784 ##37 ENSACLG00000011797 #36 ENSACLG00000011808 #35 ENSACLG00000011825 ##37 ENSACLG00000011865 ##37 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005000870 #8 ENSMZEG00005000894 #8 ENSMZEG00005000946 #9 ENSMZEG00005000958 ENSMZEG00005000982 #12 ENSMZEG00005000994 #12 ENSMZEG00005001006 #12 ENSMZEG00005001024 #15 ENSMZEG00005001048 ##25 ENSMZEG00005001068 #15 ENSMZEG00005001074 ##25 ENSMZEG00005001087 ##25 ENSMZEG00005001112 #19 ENSMZEG00005001122 #21 ENSMZEG00005001133 #21 ENSMZEG00005001148 ##25 ENSMZEG00005001175 #25 ENSMZEG00005001191 ENSMZEG00005001204 #25 ENSMZEG00005001496 ##25 ENSMZEG00005001585 ##25 pcdh2ac (ENSMZEG00005001600) #26 ENSMZEG00005001606 #35 ENSMZEG00005001612 #35 ENSMZEG00005001626 ENSMZEG00005001638 #35 ENSMZEG00005001643 #35 ENSMZEG00005001657 #35 ENSMZEG00005001678 #33 ENSMZEG00005001693 #35 ENSMZEG00005001713 P. nyererei MODERN SPECIES 296 ENSPNYG00000002003 #7 ENSPNYG00000002015 ENSPNYG00000002026 ##12 ENSPNYG00000002050 ##12 ENSPNYG00000002073 #9 ENSPNYG00000002123 ENSPNYG00000002147 ENSPNYG00000002160 ##25 ENSPNYG00000002176 ##25 ENSPNYG00000002201 ##25 ENSPNYG00000002217 ##25 ENSPNYG00000002235 #20 ENSPNYG00000002244 #19 ENSPNYG00000002261 #23 ENSPNYG00000002272 #21 ENSPNYG00000002293 ##25 ENSPNYG00000002390 ##25 pcdh2ac (ENSPNYG00000002432) #26 ENSPNYG00000002474 #35 ENSPNYG00000002485 #35 ENSPNYG00000002501 #33 ENSPNYG00000002519 ENSPNYG00000002527 ##37 ENSPNYG00000002547 #35 ENSPNYG00000002559 ##37 ENSPNYG00000002580 ENSPNYG00000002596 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 Bicolor damselfish MODERN SPECIES 1164 ENSSPAG00000011168 ENSSPAG00000011158 #20 ENSSPAG00000011135 ##25 ENSSPAG00000011093 ##25 ENSSPAG00000011080 ENSSPAG00000011048 #21 ENSSPAG00000011039 ENSSPAG00000011031 #27 ENSSPAG00000011018 ##25 ENSSPAG00000011012 ##25 ENSSPAG00000011005 ##25 ENSSPAG00000010996 pcdh2ab8 (ENSSPAG00000010986) ##25 ENSSPAG00000010979 #35 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.r #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000159725 ENSGT00940000165759.b.a.a ENSGT00940000177103 ENSGT00940000156683 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000178344 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000159725 ENSGT00940000165759.b.a.a ENSGT00940000165759.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.a.b Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000002137 ENSGT00940000166070 ENSGT00940000158371 ENSGT00390000009004.d ENSGT00940000155898 ENSGT00940000159553.b ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00990000205184 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.r #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000165759.b.a.b.a.a.b.p ENSGT00940000165759.b.a.b.a.b ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.a.a.b.a ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.a.a.b.b.a.a ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.a.a.a.c.a ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.a.a.b.b.a.b.b.a ENSGT00940000164983.d.a.a.a.b ENSGT00940000164983.d.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000163777.a ENSGT00940000165759.b.a.a Fugu MODERN SPECIES 5 ENSTRUG00000001724 ##12 ENSTRUG00000020114 ENSTRUG00000001035 ##12 ENSTRUG00000029711 ENSTRUG00000023244 #12 ENSTRUG00000021621 #12 ENSTRUG00000033047 ENSTRUG00000023579 #12 ENSTRUG00000027859 ENSTRUG00000021733 #12 ENSTRUG00000028834 ENSTRUG00000033286 ENSTRUG00000025468 #20 ENSTRUG00000025673 #15 ENSTRUG00000025647 ##25 ENSTRUG00000028370 ##25 ENSTRUG00000023702 #25 pcdh2ac (ENSTRUG00000025164) #26 ENSTRUG00000019736 #35 ENSTRUG00000023463 #35 ENSTRUG00000002066 #35 ENSTRUG00000023622 #36 ENSTRUG00000032017 #36 ENSTRUG00000023371 #37 ENSTRUG00000032477 ENSTRUG00000032190 ENSTRUG00000021983 ENSTRUG00000030010 ENSTRUG00000014108 ENSTRUG00000025098 ENSTRUG00000022585 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.b #12 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.b #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.`b #25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.r #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000159725 ENSGT00940000165759.b.a.a ENSGT00940000165759.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.a.b ENSGT00940000166867 ENSGT00940000165759.a.a Ballan wrasse MODERN SPECIES 182 ENSLBEG00000001691 ##12 ENSLBEG00000001700 ##12 ENSLBEG00000001716 #8 ENSLBEG00000001750 ##12 ENSLBEG00000001784 #12 ENSLBEG00000001817 ENSLBEG00000001840 #12 ENSLBEG00000001871 #12 ENSLBEG00000001911 #12 ENSLBEG00000001932 #12 ENSLBEG00000001969 ##12 ENSLBEG00000002011 ##25 ENSLBEG00000002048 ##25 ENSLBEG00000002071 ##25 ENSLBEG00000002088 ENSLBEG00000002103 ##25 ENSLBEG00000002118 ENSLBEG00000002126 #27 ENSLBEG00000002149 #25 ENSLBEG00000002165 #25 ENSLBEG00000002205 #25 ENSLBEG00000002221 pcdh2ab8 (ENSLBEG00000002246) ##25 pcdh2ac (ENSLBEG00000002305) #26 ENSLBEG00000002317 #35 ENSLBEG00000002335 #35 ENSLBEG00000002381 #35 ENSLBEG00000002501 #36 ENSLBEG00000002517 ##37 ENSLBEG00000002534 ##37 ENSLBEG00000002553 ##37 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.j ##12 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.b #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.`b #25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.f #37 Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.j ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01100000264899 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.`b #25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.f #37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.r #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000181572 ENSGT00940000164468.a.a.a.a Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000000002.a.a.a.nb.a ENSGT00390000002137 ENSGT00940000166070 ENSGT00940000158371 ENSGT00940000170031 ENSGT00390000009004.d ENSGT00940000155898 ENSGT00940000159553.b ENSGT01010000224686 ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.j ##12 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.`b #25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.f #37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.r #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000181572 ENSGT00940000164468.a.a.a.a European seabass MODERN SPECIES 12 ENSDLAG00005032461 ##12 ENSDLAG00005035091 ##12 ENSDLAG00005035023 #11 ENSDLAG00005027408 ##12 ENSDLAG00005016635 #12 ENSDLAG00005028538 #12 ENSDLAG00005027175 #12 ENSDLAG00005034627 #12 pcdh2ab5 (ENSDLAG00005022013) ##25 ENSDLAG00005028279 ##25 ENSDLAG00005028968 ##25 ENSDLAG00005029590 ##25 ENSDLAG00005002365 ENSDLAG00005012248 #20 ENSDLAG00005032497 ENSDLAG00005029568 ##25 ENSDLAG00005002726 #25 pcdh2ab10 (ENSDLAG00005017238) ##25 pcdh2ac (ENSDLAG00005020172) #26 ENSDLAG00005032844 #35 ENSDLAG00005018658 #35 ENSDLAG00005019241 #33 ENSDLAG00005027070 #37 ENSDLAG00005030151 ##37 ENSDLAG00005026638 ##37 ENSDLAG00005018567 #37 ENSDLAG00005033651 ##37 ENSDLAG00005017171 ##37 ENSDLAG00005033095 ##37 ENSDLAG00005035062 ENSDLAG00005017161 #37 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000159553.b ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.a #25 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.b #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.f #37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000002137 ENSGT00940000166070 ENSGT00940000158371 ENSGT00390000009004.d ENSGT00940000155898 ENSGT00940000159553.b ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.b #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.f #37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000165759.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.a.b ENSGT00940000166867 ENSGT00940000165759.a.a ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.a.a.b.b.a.a ENSGT00940000164468.a.a.b.a.b.c.b ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.a.a.b.b.a.b.a Lumpfish MODERN SPECIES 1 ENSCLMG00005017319 pcdh2aa1 (ENSCLMG00005017320) ##12 ENSCLMG00005017322 ENSCLMG00005017323 ##12 ENSCLMG00005017325 ENSCLMG00005017327 ENSCLMG00005017329 #8 ENSCLMG00005017333 #12 ENSCLMG00005001287 #12 ENSCLMG00005001296 #12 ENSCLMG00005001399 ##25 ENSCLMG00005001636 #15 ENSCLMG00005001644 #19 ENSCLMG00005001653 #21 ENSCLMG00005001663 ENSCLMG00005001671 ##25 ENSCLMG00005001678 ENSCLMG00005001688 #25 ENSCLMG00005001698 #27 pcdh2ac (ENSCLMG00005001736) #26 ENSCLMG00005001878 #35 ENSCLMG00005001881 #35 ENSCLMG00005001886 #35 ENSCLMG00005001887 #35 ENSCLMG00005001890 #35 ENSCLMG00005001891 #35 ENSCLMG00005001894 #33 ENSCLMG00005001898 #37 ENSCLMG00005001900 ##37 ENSCLMG00005001902 #35 ENSCLMG00005001906 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000166070 ENSGT00940000158371 ENSGT00390000009004.d ENSGT00940000155898 ENSGT00940000159553.b ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.i.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.a #25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.f #37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000156683 ENSGT00940000165759.b.a.a ENSGT00940000165759.a.b ENSGT01060000248675 ENSGT00940000165759.b.a.b.b ENSGT00940000166867 ENSGT00940000165759.b.a.b.a.a.b ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.a.a.a.c.b Channel bull blenny DUPLICATION Channel bull blenny MODERN SPECIES 1 ENSCGOG00000001372 ##12 ENSCGOG00000001370 #12 ENSCGOG00000001366 #12 ENSCGOG00000001365 ENSCGOG00000001362 #12 ENSCGOG00000001357 #12 ENSCGOG00000001354 ENSCGOG00000001353 #12 ENSCGOG00000001352 #9 ENSCGOG00000001334 ##25 ENSCGOG00000001331 ##25 ENSCGOG00000001329 ##25 ENSCGOG00000001327 ENSCGOG00000001324 #21 ENSCGOG00000001321 #21 ENSCGOG00000001309 ##25 ENSCGOG00000001294 ##25 pcdh2ac (ENSCGOG00000001277) #26 ENSCGOG00000016133 #35 ENSCGOG00000016130 ##37 ENSCGOG00000016126 #35 ENSCGOG00000016115 #35 ENSCGOG00000016111 #35 ENSCGOG00000016106 #35 ENSCGOG00000016097 #37 ENSCGOG00000016090 ##37 ENSCGOG00000016088 ##37 ENSCGOG00000016070 ##37 ENSCGOG00000016066 #37 ENSCGOG00000016065 #37 ENSCGOG00000016059 Channel bull blenny MODERN SPECIES 1 ENSCGOG00000001370 #12 ENSCGOG00000001366 #12 ENSCGOG00000001365 ENSCGOG00000001362 #12 ENSCGOG00000001357 #12 ENSCGOG00000001354 ENSCGOG00000001353 #12 ENSCGOG00000001352 #9 ENSCGOG00000001334 ##25 ENSCGOG00000001331 ##25 ENSCGOG00000001329 ##25 ENSCGOG00000001327 ENSCGOG00000001324 #21 ENSCGOG00000001321 #21 ENSCGOG00000001309 ##25 ENSCGOG00000001294 ##25 pcdh2ac (ENSCGOG00000001277) #26 ENSCGOG00000016133 #35 ENSCGOG00000016130 ##37 ENSCGOG00000016126 #35 ENSCGOG00000016115 #35 ENSCGOG00000016111 #35 ENSCGOG00000016106 #35 ENSCGOG00000016097 #37 ENSCGOG00000016090 ##37 ENSCGOG00000016088 ##37 ENSCGOG00000016070 ##37 ENSCGOG00000016066 #37 ENSCGOG00000016065 #37 ENSCGOG00000016059 ENSCGOG00000016052 Pike perch MODERN SPECIES 18 pcdh2aa1 (ENSSLUG00000004874) ##12 ENSSLUG00000004868 ##12 ENSSLUG00000004866 ##12 ENSSLUG00000004863 ENSSLUG00000004862 ENSSLUG00000004857 ##12 ENSSLUG00000004846 #8 ENSSLUG00000004828 #9 ENSSLUG00000004815 #12 ENSSLUG00000004811 #20 ENSSLUG00000004807 #15 ENSSLUG00000004799 #15 ENSSLUG00000004793 ##25 ENSSLUG00000004785 #15 ENSSLUG00000004756 #23 ENSSLUG00000004748 ##25 ENSSLUG00000004735 #25 pcdh2ac (ENSSLUG00000004719) #26 ENSSLUG00000004703 #35 ENSSLUG00000004697 #29 ENSSLUG00000004693 #35 ENSSLUG00000004688 #35 ENSSLUG00000004680 #35 ENSSLUG00000004678 #27 ENSSLUG00000004673 #33 ENSSLUG00000004655 #36 ENSSLUG00000004651 ##37 ENSSLUG00000004650 ##37 ENSSLUG00000004645 #35 ENSSLUG00000004639 #37 ENSSLUG00000004637 ##37 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b.h #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01100000264899 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.r #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000159725 Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b.h #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01100000264899 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000181572 ENSGT00940000164468.a.a.a.a ENSGT00940000165759.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.b ENSGT00940000166867 ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.a.a.a.c.b ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.a.a.b.b.a.a Zig-zag eel MODERN SPECIES 1 ENSMAMG00000028262 ##12 ENSMAMG00000005084 ##12 ENSMAMG00000028444 ##12 ENSMAMG00000005059 ENSMAMG00000004908 #8 ENSMAMG00000004869 ENSMAMG00000025351 #12 ENSMAMG00000026543 #12 ENSMAMG00000028695 ENSMAMG00000004797 #20 ENSMAMG00000024580 ##25 ENSMAMG00000026967 #15 ENSMAMG00000004622 #15 ENSMAMG00000004617 ENSMAMG00000026670 #21 ENSMAMG00000024788 ##25 ENSMAMG00000004456 #25 ENSMAMG00000025800 ##37 ENSMAMG00000026498 #35 ENSMAMG00000004396 #35 ENSMAMG00000004391 #18 ENSMAMG00000004045 #33 ENSMAMG00000026949 #36 ENSMAMG00000028733 ##37 ENSMAMG00000026871 ##37 ENSMAMG00000027401 ##37 ENSMAMG00000004029 ##37 ENSMAMG00000027892 ##37 ENSMAMG00000003981 #37 ENSMAMG00000004003 ##37 ENSMAMG00000003924 Carangaria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.f #37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000159725 ENSGT00940000165759.b.a.a ENSGT00940000165759.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.b Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 Turbot MODERN SPECIES 4 ENSSMAG00000034972 pcdh2aa1 (ENSSMAG00000016187) ##12 ENSSMAG00000016163 ##12 ENSSMAG00000033861 ENSSMAG00000034636 #8 ENSSMAG00000022434 #8 ENSSMAG00000023632 ##12 ENSSMAG00000025748 #9 ENSSMAG00000023362 ENSSMAG00000001346 #12 ENSSMAG00000022345 ENSSMAG00000028799 ##25 ENSSMAG00000021880 ##25 ENSSMAG00000001405 ##25 ENSSMAG00000001579 ENSSMAG00000023812 ##25 ENSSMAG00000024294 #25 ENSSMAG00000031943 ENSSMAG00000025670 #25 pcdh2ab10 (ENSSMAG00000033635) ##25 pcdh2ac (ENSSMAG00000030691) #26 ENSSMAG00000033759 #29 ENSSMAG00000024154 #35 ENSSMAG00000037132 ##37 ENSSMAG00000033616 ENSSMAG00000024825 ##37 ENSSMAG00000025683 ##37 ENSSMAG00000032750 ##37 ENSSMAG00000030566 ##37 ENSSMAG00000035316 ##37 ENSSMAG00000031027 #37 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.a.c #24 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.a.c #24 Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 1 ENSMMDG00005002771 #9 ENSMMDG00005002794 #10 ENSMMDG00005002799 #11 ENSMMDG00005002805 #12 ENSMMDG00005002823 #13 ENSMMDG00005002843 #14 ENSMMDG00005002929 #15 ENSMMDG00005002938 #16 ENSMMDG00005002943 #17 ENSMMDG00005002947 #18 ENSMMDG00005002957 #19 ENSMMDG00005002973 #20 ENSMMDG00005002981 #21 ENSMMDG00005002984 #22 ENSMMDG00005002989 #23 ENSMMDG00005002994 #24 ENSMMDG00005003000 #25 pcdh2ac (ENSMMDG00005003028) #26 ENSMMDG00005003176 #27 ENSMMDG00005003181 #28 ENSMMDG00005003194 #29 ENSMMDG00005003201 #30 ENSMMDG00005003206 #31 ENSMMDG00005003210 #32 ENSMMDG00005003219 #33 ENSMMDG00005003228 #34 ENSMMDG00005003235 #35 ENSMMDG00005003245 #36 ENSMMDG00005003250 #37 ENSMMDG00005003253 ##37 ENSMMDG00005003256 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.a.c #24 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.a.c #24 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.a.c #24 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.a.c #24 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.a.c #24 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.a.c #24 Turquoise killifish MODERN SPECIES 705 ENSNFUG00015016692 ##12 ENSNFUG00015016701 #12 ENSNFUG00015016721 ##25 ENSNFUG00015016725 #24 Protacanthopterygii DUPLICATION Protacanthopterygii DUPLICATION Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 523 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.a #25 Salmoninae DUPLICATION Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 2152 ENSGT01100000264160 #18 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.a.a.a #25 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 1013 ENSGT01100000264160 #18 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.a.a.a #25 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 845 ENSGT01100000264160 #18 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.a.a.a #25 Rainbow trout MODERN SPECIES 5 APBB2 (ENSOMYG00000004030) ENSOMYG00000004005 bicc2 (ENSOMYG00000003957) ENSOMYG00000003889 etf1a (ENSOMYG00000003831) fbxw11a (ENSOMYG00000003651) fgf18a (ENSOMYG00000074698) ENSOMYG00000003429 ENSOMYG00000067496 ENSOMYG00000014270 ENSOMYG00000073966 ##12 ENSOMYG00000014233 ENSOMYG00000066180 ##12 ENSOMYG00000014209 #15 ENSOMYG00000014216 #18 ENSOMYG00000014194 #25 ENSOMYG00000050218 ENSOMYG00000014181 pcdh2ac (ENSOMYG00000014118) #26 ENSOMYG00000028940 ENSOMYG00000014078 ENSOMYG00000013998 ENSOMYG00000060650 ENSOMYG00000013987 ENSOMYG00000054583 ENSOMYG00000013971 ENSOMYG00000013957 ENSOMYG00000053259 ENSOMYG00000058034 ENSOMYG00000061064 ENSOMYG00000013911 Huchen MODERN SPECIES 2430 ENSHHUG00000043743 ##25 ENSHHUG00000043747 ##25 ENSHHUG00000043825 #25 ENSHHUG00000043827 #26 ENSHHUG00000043832 #25 ENSHHUG00000043835 #25 ENSHHUG00000043839 #25 ENSHHUG00000043895 #30 ENSHHUG00000043899 #30 ENSHHUG00000043919 pcdh1g32 (ENSHHUG00000043929) ENSHHUG00000043960 ENSHHUG00000043965 ENSHHUG00000043970 ENSHHUG00000043978 ENSHHUG00000043981 ENSHHUG00000043984 ENSHHUG00000043996 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 40 ENSGT00940000156077.g.a ENSGT00940000157352.b ENSGT00390000000002.a.a.a.nb.a ENSGT00390000002137.d ENSGT00940000166070 ENSGT00950000186323 ENSGT00940000158371.nb.a ENSGT00390000009004.d.e ENSGT00940000155898.v.a ENSGT00940000159553.b.c ENSGT00940000163777.b.a.a.e ENSGT00940000164725.a.a.b.g.a.b.a.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a ENSGT00940000165118.b.a.b ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.a.a.b #25 Huchen MODERN SPECIES 2430 ENSHHUG00000043743 ##25 ENSHHUG00000043747 ##25 ENSHHUG00000043825 #25 ENSHHUG00000043827 #26 ENSHHUG00000043832 #25 ENSHHUG00000043835 #25 ENSHHUG00000043839 #25 ENSHHUG00000043895 #30 ENSHHUG00000043899 #30 ENSHHUG00000043919 pcdh1g32 (ENSHHUG00000043929) ENSHHUG00000043960 ENSHHUG00000043965 ENSHHUG00000043970 ENSHHUG00000043978 ENSHHUG00000043981 ENSHHUG00000043984 ENSHHUG00000043996 ENSHHUG00000043997 ENSHHUG00000044000 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 191 ENSGT00940000164725.a.a.b.g.a.b.b ENSGT00940000165118.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.a.b ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.a.a.b #25 ENSGT00940000165118.a.a.a.b.j ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.b.a ##25 ENSGT01100000264435 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.a.a.b #25 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 395 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.a.a.b #25 ENSGT00940000165118.a.a.a.b.j ##12 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 40 ENSGT00940000162201.p.d ENSGT00670000098059.c.a.a.a ENSGT00940000156077.g.a ENSGT00940000157352.b ENSGT00390000000002.a.a.a.nb.a.fb ENSGT00390000002137.d ENSGT00940000166070 ENSGT00950000186323 ENSGT00940000158371.nb.a ENSGT00390000009004.d.e ENSGT00940000155898.v.a ENSGT00940000159553.b.c ENSGT00940000163777.b.a.a.e ENSGT00940000164725.a.b.b.a ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.a.a.b #25 ENSGT00940000165118.a.a.a.b.j ##12 Chinook salmon MODERN SPECIES 13 bicc2 (ENSOTSG00005002887) ENSOTSG00005002881 ENSOTSG00005002871 ENSOTSG00005002866 SPOCK1 (ENSOTSG00005002855) etf1a (ENSOTSG00005002849) fbxw11a (ENSOTSG00005002726) fgf18a (ENSOTSG00005002713) ENSOTSG00005002709 ENSOTSG00005002702 ##12 ENSOTSG00005002698 ENSOTSG00005002688 ##12 ENSOTSG00005002681 ##12 ENSOTSG00005002679 #18 ENSOTSG00005002677 ##25 ENSOTSG00005001792 #25 ENSOTSG00005022741 ##12 ENSOTSG00005022740 #30 ENSOTSG00005022739 #37 ENSOTSG00005022738 ENSOTSG00005022736 #30 ENSOTSG00005022735 ENSOTSG00005022734 ENSOTSG00005022678 ENSOTSG00005022673 ENSOTSG00005022672 ENSOTSG00005022671 ENSOTSG00005022670 ENSOTSG00005022669 ENSOTSG00005022667 ENSOTSG00005022666 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.a.b #25 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.a.b #25 Salmo DUPLICATION Salmo ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.a.b.a #25 Atlantic salmon DUPLICATION Atlantic salmon MODERN SPECIES 28 ENSSSAG00000002499 ##12 ENSSSAG00000109231 ##12 ENSSSAG00000002645 #26 ENSSSAG00000102342 ##12 ENSSSAG00000108860 ##12 ENSSSAG00000116202 ##12 ENSSSAG00000090133 ##12 ENSSSAG00000099988 ##12 ENSSSAG00000107105 ##25 ENSSSAG00000002684 ENSSSAG00000076143 ##25 ENSSSAG00000002674 #25 ENSSSAG00000002666 #25 ENSSSAG00000092987 #25 ENSSSAG00000002198 #25 ENSSSAG00000100420 #25 ENSSSAG00000002168 #25 ENSSSAG00000117938 #30 ENSSSAG00000005875 #30 ENSSSAG00000002624 #30 ENSSSAG00000103449 #30 ENSSSAG00000095445 #30 ENSSSAG00000002631 #30 ENSSSAG00000002598 #30 ENSSSAG00000065216 #30 ENSSSAG00000002636 #30 ENSSSAG00000114140 ENSSSAG00000082816 ENSSSAG00000121883 ENSSSAG00000086148 ENSSSAG00000002570 Atlantic salmon MODERN SPECIES 28 ENSSSAG00000002102 pcdh2aa1 (ENSSSAG00000109974) ##12 ENSSSAG00000002499 ##12 ENSSSAG00000109231 ##12 ENSSSAG00000002645 #26 ENSSSAG00000102342 ##12 ENSSSAG00000108860 ##12 ENSSSAG00000116202 ##12 ENSSSAG00000090133 ##12 ENSSSAG00000099988 ##12 ENSSSAG00000107105 ##25 ENSSSAG00000002684 ENSSSAG00000076143 ##25 ENSSSAG00000002674 #25 ENSSSAG00000002666 #25 ENSSSAG00000092987 #25 ENSSSAG00000002198 #25 ENSSSAG00000100420 #25 ENSSSAG00000002168 #25 ENSSSAG00000117938 #30 ENSSSAG00000005875 #30 ENSSSAG00000002624 #30 ENSSSAG00000103449 #30 ENSSSAG00000095445 #30 ENSSSAG00000002631 #30 ENSSSAG00000002598 #30 ENSSSAG00000065216 #30 ENSSSAG00000002636 #30 ENSSSAG00000114140 ENSSSAG00000082816 ENSSSAG00000121883 River trout MODERN SPECIES 4 ube2ka (ENSSTUG00000043820) ENSSTUG00000043837 ENSSTUG00000043844 SPOCK1 (ENSSTUG00000043878) etf1a (ENSSTUG00000043906) fbxw11a (ENSSTUG00000043926) fgf18a (ENSSTUG00000043988) ENSSTUG00000044014 ENSSTUG00000044021 ENSSTUG00000044026 ENSSTUG00000044031 ##12 ENSSTUG00000044048 #26 ENSSTUG00000044073 ##12 ENSSTUG00000044078 ENSSTUG00000001003 #25 ENSSTUG00000001010 #25 ENSSTUG00000001231 #25 ENSSTUG00000001237 #27 ENSSTUG00000001238 #30 ENSSTUG00000001243 #30 ENSSTUG00000001259 #30 ENSSTUG00000001270 #30 ENSSTUG00000001277 #30 ENSSTUG00000001282 #30 ENSSTUG00000001288 #30 ENSSTUG00000001297 ENSSTUG00000001334 ENSSTUG00000001339 ENSSTUG00000001343 ENSSTUG00000001348 ENSSTUG00000001357 Salmo ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.a.b.b #25 Atlantic salmon MODERN SPECIES 28 ENSSSAG00000084167 ENSSSAG00000002102 pcdh2aa1 (ENSSSAG00000109974) ##12 ENSSSAG00000002499 ##12 ENSSSAG00000109231 ##12 ENSSSAG00000002645 #26 ENSSSAG00000102342 ##12 ENSSSAG00000108860 ##12 ENSSSAG00000116202 ##12 ENSSSAG00000090133 ##12 ENSSSAG00000099988 ##12 ENSSSAG00000107105 ##25 ENSSSAG00000002684 ENSSSAG00000076143 ##25 ENSSSAG00000002674 #25 ENSSSAG00000002666 #25 ENSSSAG00000092987 #25 ENSSSAG00000002198 #25 ENSSSAG00000100420 #25 ENSSSAG00000002168 #25 ENSSSAG00000117938 #30 ENSSSAG00000005875 #30 ENSSSAG00000002624 #30 ENSSSAG00000103449 #30 ENSSSAG00000095445 #30 ENSSSAG00000002631 #30 ENSSSAG00000002598 #30 ENSSSAG00000065216 #30 ENSSSAG00000002636 #30 ENSSSAG00000114140 ENSSSAG00000082816 Protacanthopterygii DUPLICATION Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00950000186323 ENSGT00940000158371 ENSGT00390000009004.d ENSGT00940000155898 ENSGT00940000159553.b ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.a.b.g.a.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.a ##12 ENSGT00940000164725.a.a.b.h ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.b.g.b ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.a.b.i.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.a #25 ENSGT01020000230605.d ENSGT00940000165118.a.a.a.b.j ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.b ##25 ENSGT01100000264435 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.b #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.f #25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.i.b.a.a.a.b #30 ENSGT00940000156683 ENSGT00940000164468.a.a.a.a ENSGT00940000165759 ENSGT01060000248675 ENSGT00940000164468.a.a.b.b Salmoninae DUPLICATION Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 2151 ENSGT00940000165118.a.a.a.b.i.a.b ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.a.a.a #25 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 179 ENSGT00940000164725.a.b.b.b ENSGT00940000164725.a.a.b.h ENSGT00940000164725.a.b.b.a ENSGT00940000164725.a.a.b.g.b.b ENSGT00940000165118.a.a.b.a.a.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.b.i.a.b ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.a.a.a #25 ENSGT00940000160554.b.a #26 ENSGT00940000166432.d.i.b.a.a.a.b.b #30 ENSGT01060000248675.c.a.a ENSGT00940000165759.c.b.a.a.a.a ENSGT01060000248675.c.b.a.b.b.a ENSGT00940000165759.c.a.b.b Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 189 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.b.b #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.a.a.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.f #25 ENSGT00940000160554.b.b #26 ENSGT00940000166432.d.i.b.b.a.a #30 Rainbow trout MODERN SPECIES 23 ENSOMYG00000029659 ENSOMYG00000068350 ENSOMYG00000058810 ENSOMYG00000053318 ENSOMYG00000029557 etf1a (ENSOMYG00000029512) fbxw11a (ENSOMYG00000029481) fgf18a (ENSOMYG00000070472) ENSOMYG00000029328 ENSOMYG00000067822 ENSOMYG00000029300 ENSOMYG00000058400 ##12 ENSOMYG00000029256 ##12 ENSOMYG00000052894 #15 ENSOMYG00000055661 #25 ENSOMYG00000014188 #25 ENSOMYG00000029205 ##12 ENSOMYG00000049642 #30 ENSOMYG00000068998 #30 ENSOMYG00000028971 #30 ENSOMYG00000057216 #30 ENSOMYG00000028955 ENSOMYG00000029034 #30 ENSOMYG00000066599 ENSOMYG00000055471 #30 ENSOMYG00000028656 ENSOMYG00000028646 ENSOMYG00000028588 ENSOMYG00000028597 ENSOMYG00000075441 ENSOMYG00000063365 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000155797.f.b.b ENSGT00940000166715.c ENSGT00390000000002.a.b.i.a ENSGT01000000220889 ENSGT00940000154477.jc.b.k.b ENSGT00940000156324.f.b.b ENSGT01050000244823.d.a.b.b.b ENSGT00940000155521.a.b.h ENSGT00950000185626.a.a.b ENSGT01060000248588.a.c.a.b.f ENSGT00390000009004.c.f ENSGT00940000155898.u.b ENSGT00940000159553.a.d ENSGT00940000164725.a.b.a.d ENSGT00940000164173.b.a.c.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.a.a.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.a.a.b #25 ENSGT00940000160554.a.d ##26 ENSGT00940000164468.a.a.a.b.a.a ENSGT00950000183116.b.a.a.b.a.a.b ENSGT00390000017848.b ENSGT00940000153664.A.b.a ENSGT00940000167013.j ENSGT00940000157176.b.c ENSGT01070000253744.b.a.a.b.b ENSGT00940000156522.c.b.d ENSGT00940000157548.r.a ENSGT00940000156575.p ENSGT00940000158663.d ENSGT00940000164214.k.b.c Chinook salmon MODERN SPECIES 32 ints10 (ENSOTSG00005002198) ube2ka (ENSOTSG00005002031) CHRNA9 (ENSOTSG00005002027) ENSOTSG00005002022 ENSOTSG00005002020 etf1a (ENSOTSG00005001998) fbxw11a (ENSOTSG00005001281) fgf18a (ENSOTSG00005001270) ENSOTSG00005001261 ENSOTSG00005001259 pcdh2aa1 (ENSOTSG00005001255) ##12 ENSOTSG00005001249 ##12 ENSOTSG00005001247 ##25 ENSOTSG00005001245 #27 ENSOTSG00005001240 #25 ENSOTSG00005001234 #25 ENSOTSG00005001233 #27 ENSOTSG00005001229 #25 pcdh2ac (ENSOTSG00005001224) #26 ENSOTSG00005001216 #30 ENSOTSG00005001213 #30 ENSOTSG00005001208 #30 ENSOTSG00005001205 #30 ENSOTSG00005001197 #30 ENSOTSG00005001110 #30 ENSOTSG00005001090 ENSOTSG00005001084 ENSOTSG00005001078 ENSOTSG00005001072 ENSOTSG00005001066 ENSOTSG00005001063 Salmo ANCESTRAL SPECIES 235 ENSGT01090000261645 ENSGT00940000165118.a.a.a.b.i.b.a.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.b.i.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.b.i.a.b ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.a.a.a #25 ENSGT00940000160554.b.a #26 ENSGT00940000166432.d.i.b.a.a.a.b.b #30 ENSGT01060000248675.c.a.a ENSGT00940000165759.c.b.a.a.a.a ENSGT01060000248675.c.b.a.b.b.a ENSGT00940000165759.c.a.b.b Atlantic salmon MODERN SPECIES 24 ENSSSAG00000117007 ENSSSAG00000010424 ENSSSAG00000100643 ENSSSAG00000113037 ##12 ENSSSAG00000099666 ENSSSAG00000002141 ENSSSAG00000094768 ##12 ENSSSAG00000083483 ##12 ENSSSAG00000118396 ##12 ENSSSAG00000099465 ENSSSAG00000002350 ##12 ENSSSAG00000097123 ##12 ENSSSAG00000002164 #26 ENSSSAG00000002153 ##12 ENSSSAG00000074422 ##12 ENSSSAG00000091944 #25 ENSSSAG00000002608 #30 ENSSSAG00000112834 ENSSSAG00000002336 ENSSSAG00000107826 ENSSSAG00000103198 ENSSSAG00000091216 ENSSSAG00000117104 ENSSSAG00000002291 ENSSSAG00000114051 ENSSSAG00000122252 ENSSSAG00000113899 ENSSSAG00000110864 ENSSSAG00000116621 ENSSSAG00000098808 ENSSSAG00000114414 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 721 ENSGT00940000165118.a.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.b.i.b.a.b.a ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.a.b.j ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.b.a ##25 ENSGT01100000264435 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.a.a.b #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.b.a.b #25 ENSGT00940000160554.b.b #26 ENSGT00940000166432.d.i.b.b.a.a #30 Huchen MODERN SPECIES 1558 pcdh2ab5 (ENSHHUG00000041497) ##25 ENSHHUG00000041500 #25 ENSHHUG00000041563 #25 ENSHHUG00000041567 #25 ENSHHUG00000041575 #25 ENSHHUG00000041584 #26 ENSHHUG00000041589 #30 ENSHHUG00000041600 #30 ENSHHUG00000041610 #30 ENSHHUG00000041657 #30 ENSHHUG00000041686 #30 ENSHHUG00000041694 #30 ENSHHUG00000041697 ENSHHUG00000041867 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 191 ENSGT00940000164725.a.a.b.g.a.b.b ENSGT00940000165118.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.a.b ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.a.a.b #25 ENSGT00940000165118.a.a.a.b.j ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.b.a ##25 ENSGT01100000264435 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.a.a.b #25 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.a.a.b #25 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000000002.a.b.i.a ENSGT01000000220889 ENSGT00940000154477.jc.b.k.b ENSGT00940000156324.f.b.b ENSGT01050000244823.d.a.b.b.b ENSGT00940000155521.a.b.h ENSGT00950000185626.a.a.b ENSGT01060000248588.a.c.a.b.f ENSGT00390000009004.c.f ENSGT00940000155898.u.b ENSGT00940000159553.a.d ENSGT00940000164725.a.b.a.d ENSGT00940000164173.b.a.c.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.a.a.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.a.a.b #25 ENSGT00940000160554.a.d ##26 ENSGT00940000164468.a.a.a.b.a.a ENSGT00950000183116.b.a.a.b.a.a.b ENSGT00390000017848.b ENSGT00940000153664.A.b.a ENSGT00940000167013.j ENSGT00940000157176.b.c ENSGT01070000253744.b.a.a.b.b ENSGT00940000156522.c.b.d ENSGT00940000157548.r.a ENSGT00940000156575.p ENSGT00940000158663.d ENSGT00940000164214.k.b.c ENSGT00940000165511.b.d ENSGT00940000157079.b.z.b Chinook salmon MODERN SPECIES 32 ENSOTSG00005002405 ints10 (ENSOTSG00005002198) ube2ka (ENSOTSG00005002031) CHRNA9 (ENSOTSG00005002027) ENSOTSG00005002022 ENSOTSG00005002020 etf1a (ENSOTSG00005001998) fbxw11a (ENSOTSG00005001281) fgf18a (ENSOTSG00005001270) ENSOTSG00005001261 ENSOTSG00005001259 pcdh2aa1 (ENSOTSG00005001255) ##12 ENSOTSG00005001249 ##12 ENSOTSG00005001247 ##25 ENSOTSG00005001245 #27 ENSOTSG00005001240 #25 ENSOTSG00005001234 #25 ENSOTSG00005001233 #27 ENSOTSG00005001229 #25 pcdh2ac (ENSOTSG00005001224) #26 ENSOTSG00005001216 #30 ENSOTSG00005001213 #30 ENSOTSG00005001208 #30 ENSOTSG00005001205 #30 ENSOTSG00005001197 #30 ENSOTSG00005001110 #30 ENSOTSG00005001090 ENSOTSG00005001084 ENSOTSG00005001078 ENSOTSG00005001072 ENSOTSG00005001066 Salmo ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00390000009004.d.f ENSGT00940000155898.v.b ENSGT00940000159553.b.d ENSGT00940000163777.b.a.a.f ENSGT00940000164725.a.b.b.b ENSGT00940000164725.a.a.b.h ENSGT00940000164725.a.b.b.a ENSGT00940000164725.a.a.b.g.a.b.b ENSGT00940000165118.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.a.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.b.j ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.b.a ##25 ENSGT01100000264435 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.a.a.b #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.b.a.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000160554.b.b #26 ENSGT00940000166432.d.i.b.b.b.a.a #30 ENSGT00940000166432.d.i.b.a.a.a.a #30 ENSGT00940000164468.a.a.a.a.b.b ENSGT00940000166432.d.i.b.a.a.b #30 ENSGT00940000166432.d.i.b.b.a.b.a #30 Atlantic salmon MODERN SPECIES 28 ENSSSAG00000107023 ENSSSAG00000084167 ENSSSAG00000002102 pcdh2aa1 (ENSSSAG00000109974) ##12 ENSSSAG00000002499 ##12 ENSSSAG00000109231 ##12 ENSSSAG00000002645 #26 ENSSSAG00000102342 ##12 ENSSSAG00000108860 ##12 ENSSSAG00000116202 ##12 ENSSSAG00000090133 ##12 ENSSSAG00000099988 ##12 ENSSSAG00000107105 ##25 ENSSSAG00000002684 ENSSSAG00000076143 ##25 ENSSSAG00000002674 #25 ENSSSAG00000002666 #25 ENSSSAG00000092987 #25 ENSSSAG00000002198 #25 ENSSSAG00000100420 #25 ENSSSAG00000002168 #25 ENSSSAG00000117938 #30 ENSSSAG00000005875 #30 ENSSSAG00000002624 #30 ENSSSAG00000103449 #30 ENSSSAG00000095445 #30 ENSSSAG00000002631 #30 ENSSSAG00000002598 #30 ENSSSAG00000065216 #30 ENSSSAG00000002636 #30 ENSSSAG00000114140 River trout MODERN SPECIES 4 tlr1 (ENSSTUG00000043800) ube2ka (ENSSTUG00000043820) ENSSTUG00000043837 ENSSTUG00000043844 SPOCK1 (ENSSTUG00000043878) etf1a (ENSSTUG00000043906) fbxw11a (ENSSTUG00000043926) fgf18a (ENSSTUG00000043988) ENSSTUG00000044014 ENSSTUG00000044021 ENSSTUG00000044026 ENSSTUG00000044031 ##12 ENSSTUG00000044048 #26 ENSSTUG00000044073 ##12 ENSSTUG00000044078 ENSSTUG00000001003 #25 ENSSTUG00000001010 #25 ENSSTUG00000001231 #25 ENSSTUG00000001237 #27 ENSSTUG00000001238 #30 ENSSTUG00000001243 #30 ENSSTUG00000001259 #30 ENSSTUG00000001270 #30 ENSSTUG00000001277 #30 ENSSTUG00000001282 #30 ENSSTUG00000001288 #30 ENSSTUG00000001297 ENSSTUG00000001334 ENSSTUG00000001339 ENSSTUG00000001343 ENSSTUG00000001348 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.a.b #25 Huchen DUPLICATION Huchen MODERN SPECIES 1558 pcdh2ab5 (ENSHHUG00000041497) ##25 ENSHHUG00000041500 #25 ENSHHUG00000041563 #25 ENSHHUG00000041567 #25 ENSHHUG00000041575 #25 ENSHHUG00000041584 #26 ENSHHUG00000041589 #30 ENSHHUG00000041600 #30 ENSHHUG00000041610 #30 ENSHHUG00000041657 #30 ENSHHUG00000041686 #30 ENSHHUG00000041694 #30 ENSHHUG00000041697 ENSHHUG00000041867 Huchen MODERN SPECIES 2430 ENSHHUG00000043743 ##25 ENSHHUG00000043747 ##25 ENSHHUG00000043825 #25 ENSHHUG00000043827 #26 ENSHHUG00000043832 #25 ENSHHUG00000043835 #25 ENSHHUG00000043839 #25 ENSHHUG00000043895 #30 ENSHHUG00000043899 #30 ENSHHUG00000043919 pcdh1g32 (ENSHHUG00000043929) ENSHHUG00000043960 ENSHHUG00000043965 ENSHHUG00000043970 ENSHHUG00000043978 ENSHHUG00000043981 ENSHHUG00000043984 ENSHHUG00000043996 ENSHHUG00000043997 ENSHHUG00000044000 pcdh2g13 (ENSHHUG00000044003) Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000164725.a.a.b.g.a.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.a ##12 ENSGT00940000164725.a.a.b.h ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.b.g.b ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.a.b.i.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.a #25 ENSGT01020000230605.d ENSGT00940000165118.a.a.a.b.j ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.b ##25 ENSGT01100000264435 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.b #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.f #25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.i.b.a.a.a.b #30 ENSGT00940000156683 ENSGT00940000164468.a.a.a.a ENSGT00940000165759 ENSGT01060000248675 ENSGT00940000164468.a.a.b.b ENSGT00940000164468.a.b.a.b ENSGT00940000164983.d.b ENSGT00940000164983.d.a.a.d.a ENSGT00940000163777.a ENSGT00940000159910 ENSGT01030000235223 Salmoninae DUPLICATION Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 667 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.a.b.i.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.b.a.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.f #25 ENSGT00940000160554.b.a #26 ENSGT00940000166432.d.i.b.a.a.a.b.b #30 ENSGT00940000156683 ENSGT00940000164468.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000165759.c.b.a.b ENSGT00940000165759.c.a.b.a ENSGT01060000248675.c.b.a.b ENSGT00940000165759.c.a.b.b Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 154 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.b.a.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.f #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.b.a.b #25 ENSGT00940000160554.b.b #26 ENSGT00940000166432.d.i.b.b.a.a #30 ENSGT00940000166432.d.i.b.b.b.b #30 ENSGT00940000178703 ENSGT00940000166432.d.i.b.a.a.b #30 ENSGT00940000166432.d.i.b.b.a.b.a #30 ENSGT00940000165759.c.b.a.a.a.b ENSGT00940000164468.a.a.b.b.c.b.a.a ENSGT00940000166867.s.a ENSGT00940000164468.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000165759.c.b.b ENSGT00940000164468.a.a.b.b.d Salmo ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00940000155898.v.b ENSGT00940000159553.b.d ENSGT00940000163777.b.a.a.f ENSGT00940000164725.a.b.b.b ENSGT00940000164725.a.a.b.h ENSGT00940000164725.a.b.b.a ENSGT00940000164725.a.a.b.g.a.b.b ENSGT00940000165118.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.a.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.b.j ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.b.a ##25 ENSGT01100000264435 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.a.a.b #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.b.a.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000160554.b.b #26 ENSGT00940000166432.d.i.b.b.b.a.a #30 ENSGT00940000166432.d.i.b.a.a.a.a #30 ENSGT00940000164468.a.a.a.a.b.b ENSGT00940000166432.d.i.b.a.a.b #30 ENSGT00940000166432.d.i.b.b.a.b.a #30 River trout MODERN SPECIES 4 ENSSTUG00000043837 ENSSTUG00000043844 SPOCK1 (ENSSTUG00000043878) etf1a (ENSSTUG00000043906) fbxw11a (ENSSTUG00000043926) fgf18a (ENSSTUG00000043988) ENSSTUG00000044014 ENSSTUG00000044021 ENSSTUG00000044026 ENSSTUG00000044031 ##12 ENSSTUG00000044048 #26 ENSSTUG00000044073 ##12 ENSSTUG00000044078 ENSSTUG00000001003 #25 ENSSTUG00000001010 #25 ENSSTUG00000001231 #25 ENSSTUG00000001237 #27 ENSSTUG00000001238 #30 ENSSTUG00000001243 #30 ENSSTUG00000001259 #30 ENSSTUG00000001270 #30 ENSSTUG00000001277 #30 ENSSTUG00000001282 #30 ENSSTUG00000001288 #30 ENSSTUG00000001297 ENSSTUG00000001334 ENSSTUG00000001339 ENSSTUG00000001343 ENSSTUG00000001348 ENSSTUG00000001357 ENSSTUG00000001366 Huchen MODERN SPECIES 1558 pcdh2ab5 (ENSHHUG00000041497) ##25 ENSHHUG00000041500 #25 ENSHHUG00000041563 #25 ENSHHUG00000041567 #25 ENSHHUG00000041575 #25 ENSHHUG00000041584 #26 ENSHHUG00000041589 #30 ENSHHUG00000041600 #30 ENSHHUG00000041610 #30 ENSHHUG00000041657 #30 ENSHHUG00000041686 #30 ENSHHUG00000041694 #30 ENSHHUG00000041697 ENSHHUG00000041867 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 721 ENSGT00940000165118.a.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.b.i.b.a.b.a ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.a.b.j ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.b.a ##25 ENSGT01100000264435 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.a.a.b #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.b.a.b #25 ENSGT00940000160554.b.b #26 ENSGT00940000166432.d.i.b.b.a.a #30 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 154 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.b.a.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.f #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.b.a.b #25 ENSGT00940000160554.b.b #26 ENSGT00940000166432.d.i.b.b.a.a #30 ENSGT00940000166432.d.i.b.b.b.b #30 ENSGT00940000178703 ENSGT00940000166432.d.i.b.a.a.b #30 ENSGT00940000166432.d.i.b.b.a.b.a #30 ENSGT00940000165759.c.b.a.a.a.b ENSGT00940000164468.a.a.b.b.c.b.a.a ENSGT00940000166867.s.a ENSGT00940000164468.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000165759.c.b.b ENSGT00940000164468.a.a.b.b.d ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.a.a.b.b ENSGT00940000164468.a.a.b.b.c.a.a ENSGT00940000164468.a.b.a.b Salmo ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.b.a.b #25 Atlantic salmon MODERN SPECIES 28 ENSSSAG00000109231 ##12 ENSSSAG00000002645 #26 ENSSSAG00000102342 ##12 ENSSSAG00000108860 ##12 ENSSSAG00000116202 ##12 ENSSSAG00000090133 ##12 ENSSSAG00000099988 ##12 ENSSSAG00000107105 ##25 ENSSSAG00000002684 ENSSSAG00000076143 ##25 ENSSSAG00000002674 #25 ENSSSAG00000002666 #25 ENSSSAG00000092987 #25 ENSSSAG00000002198 #25 ENSSSAG00000100420 #25 ENSSSAG00000002168 #25 ENSSSAG00000117938 #30 ENSSSAG00000005875 #30 ENSSSAG00000002624 #30 ENSSSAG00000103449 #30 ENSSSAG00000095445 #30 ENSSSAG00000002631 #30 ENSSSAG00000002598 #30 ENSSSAG00000065216 #30 ENSSSAG00000002636 #30 ENSSSAG00000114140 ENSSSAG00000082816 ENSSSAG00000121883 ENSSSAG00000086148 ENSSSAG00000002570 ENSSSAG00000002557 Huchen MODERN SPECIES 1558 pcdh2ab5 (ENSHHUG00000041497) ##25 ENSHHUG00000041500 #25 ENSHHUG00000041563 #25 ENSHHUG00000041567 #25 ENSHHUG00000041575 #25 ENSHHUG00000041584 #26 ENSHHUG00000041589 #30 ENSHHUG00000041600 #30 ENSHHUG00000041610 #30 ENSHHUG00000041657 #30 ENSHHUG00000041686 #30 ENSHHUG00000041694 #30 ENSHHUG00000041697 ENSHHUG00000041867 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 1873 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.b.b #25 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 779 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.b.b #25 Salmo ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.b.b #25 Atlantic salmon MODERN SPECIES 28 pcdh2aa1 (ENSSSAG00000109974) ##12 ENSSSAG00000002499 ##12 ENSSSAG00000109231 ##12 ENSSSAG00000002645 #26 ENSSSAG00000102342 ##12 ENSSSAG00000108860 ##12 ENSSSAG00000116202 ##12 ENSSSAG00000090133 ##12 ENSSSAG00000099988 ##12 ENSSSAG00000107105 ##25 ENSSSAG00000002684 ENSSSAG00000076143 ##25 ENSSSAG00000002674 #25 ENSSSAG00000002666 #25 ENSSSAG00000092987 #25 ENSSSAG00000002198 #25 ENSSSAG00000100420 #25 ENSSSAG00000002168 #25 ENSSSAG00000117938 #30 ENSSSAG00000005875 #30 ENSSSAG00000002624 #30 ENSSSAG00000103449 #30 ENSSSAG00000095445 #30 ENSSSAG00000002631 #30 ENSSSAG00000002598 #30 ENSSSAG00000065216 #30 ENSSSAG00000002636 #30 ENSSSAG00000114140 ENSSSAG00000082816 ENSSSAG00000121883 ENSSSAG00000086148 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 189 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.b.b #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.a.a.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.f #25 ENSGT00940000160554.b.b #26 ENSGT00940000166432.d.i.b.b.a.a #30 Rainbow trout MODERN SPECIES 23 ENSOMYG00000029771 ENSOMYG00000029659 ENSOMYG00000068350 ENSOMYG00000058810 ENSOMYG00000053318 ENSOMYG00000029557 etf1a (ENSOMYG00000029512) fbxw11a (ENSOMYG00000029481) fgf18a (ENSOMYG00000070472) ENSOMYG00000029328 ENSOMYG00000067822 ENSOMYG00000029300 ENSOMYG00000058400 ##12 ENSOMYG00000029256 ##12 ENSOMYG00000052894 #15 ENSOMYG00000055661 #25 ENSOMYG00000014188 #25 ENSOMYG00000029205 ##12 ENSOMYG00000049642 #30 ENSOMYG00000068998 #30 ENSOMYG00000028971 #30 ENSOMYG00000057216 #30 ENSOMYG00000028955 ENSOMYG00000029034 #30 ENSOMYG00000066599 ENSOMYG00000055471 #30 ENSOMYG00000028656 ENSOMYG00000028646 ENSOMYG00000028588 ENSOMYG00000028597 ENSOMYG00000075441 Northern pike MODERN SPECIES 3 fgf18a (ENSELUG00000018447) ENSELUG00000018411 ENSELUG00000018402 ENSELUG00000018394 ENSELUG00000028568 ENSELUG00000018382 ENSELUG00000018313 ##12 ENSELUG00000032563 ENSELUG00000018162 ##12 ENSELUG00000028092 ENSELUG00000029025 #15 ENSELUG00000026095 ENSELUG00000000741 ##25 ENSELUG00000018100 ##25 ENSELUG00000030369 ##25 ENSELUG00000018036 #25 ENSELUG00000018006 ENSELUG00000032665 ##25 ENSELUG00000018000 ##25 ENSELUG00000033843 #30 ENSELUG00000027397 #30 pcdh1g31 (ENSELUG00000017950) ENSELUG00000026183 #30 ENSELUG00000017927 ENSELUG00000028255 ENSELUG00000026213 ENSELUG00000017752 TRPC7 (ENSELUG00000017696) DOCK2 (ENSELUG00000000655) ENSELUG00000017266 hrh2a (ENSELUG00000017240) Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.a ##12 ENSGT00940000164725.a.a.b.h ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.b.g.b ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.a.b.i.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.a #25 ENSGT01020000230605.d ENSGT00940000165118.a.a.a.b.j ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.b ##25 ENSGT01100000264435 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.b #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.f #25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.i.b.a.a.a.b #30 ENSGT00940000156683 ENSGT00940000164468.a.a.a.a ENSGT00940000165759 ENSGT01060000248675 ENSGT00940000164468.a.a.b.b ENSGT00940000164468.a.b.a.b ENSGT00940000164983.d.b ENSGT00940000164983.d.a.a.d.a ENSGT00940000163777.a ENSGT00940000159910 ENSGT01030000235223 ENSGT01060000248588.a.c.a.a ENSGT00940000154903 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 667 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.a.b.i.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.b.a.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.f #25 ENSGT00940000160554.b.a #26 ENSGT00940000166432.d.i.b.a.a.a.b.b #30 ENSGT00940000156683 ENSGT00940000164468.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000165759.c.b.a.b ENSGT00940000165759.c.a.b.a ENSGT01060000248675.c.b.a.b ENSGT00940000165759.c.a.b.b Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 154 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.b.a.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.f #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.b.a.b #25 ENSGT00940000160554.b.b #26 ENSGT00940000166432.d.i.b.b.a.a #30 ENSGT00940000166432.d.i.b.b.b.b #30 ENSGT00940000178703 ENSGT00940000166432.d.i.b.a.a.b #30 ENSGT00940000166432.d.i.b.b.a.b.a #30 ENSGT00940000165759.c.b.a.a.a.b ENSGT00940000164468.a.a.b.b.c.b.a.a ENSGT00940000166867.s.a ENSGT00940000164468.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000165759.c.b.b ENSGT00940000164468.a.a.b.b.d ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.a.a.b.b ENSGT00940000164468.a.a.b.b.c.a.a Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 189 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.b.b #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.a.a.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.f #25 ENSGT00940000160554.b.b #26 ENSGT00940000166432.d.i.b.b.a.a #30 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 158 ENSGT00390000002137.c ENSGT00990000211609.a ENSGT00940000158371.nb.b ENSGT00390000009004.d.f ENSGT00940000155898.v.b ENSGT00940000159553.b.d ENSGT00940000163777.b.a.a.f ENSGT00940000164725.a.a.b.h ENSGT00940000164725.a.a.b.g.b.a ENSGT00940000165118.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000166432.d.i.b.a.a.b #30 ENSGT00940000166432.d.i.b.b.a.b.a #30 ENSGT00940000178703.e ENSGT00940000164983.d.a.a.d.a.b.a.a ENSGT00940000164173.b.b.b.a.f #25 ENSGT00940000160554.b.b #26 ENSGT00940000166432.d.i.b.b.a.a #30 ENSGT00940000178703.f Chinook salmon MODERN SPECIES 32 CHRNA9 (ENSOTSG00005002027) ENSOTSG00005002022 ENSOTSG00005002020 etf1a (ENSOTSG00005001998) fbxw11a (ENSOTSG00005001281) fgf18a (ENSOTSG00005001270) ENSOTSG00005001261 ENSOTSG00005001259 pcdh2aa1 (ENSOTSG00005001255) ##12 ENSOTSG00005001249 ##12 ENSOTSG00005001247 ##25 ENSOTSG00005001245 #27 ENSOTSG00005001240 #25 ENSOTSG00005001234 #25 ENSOTSG00005001233 #27 ENSOTSG00005001229 #25 pcdh2ac (ENSOTSG00005001224) #26 ENSOTSG00005001216 #30 ENSOTSG00005001213 #30 ENSOTSG00005001208 #30 ENSOTSG00005001205 #30 ENSOTSG00005001197 #30 ENSOTSG00005001110 #30 ENSOTSG00005001090 ENSOTSG00005001084 ENSOTSG00005001078 ENSOTSG00005001072 ENSOTSG00005001066 ENSOTSG00005001063 ENSOTSG00005001058 ENSOTSG00005001018 Huchen DUPLICATION Huchen MODERN SPECIES 2430 ENSHHUG00000043743 ##25 ENSHHUG00000043747 ##25 ENSHHUG00000043825 #25 ENSHHUG00000043827 #26 ENSHHUG00000043832 #25 ENSHHUG00000043835 #25 ENSHHUG00000043839 #25 ENSHHUG00000043895 #30 ENSHHUG00000043899 #30 ENSHHUG00000043919 pcdh1g32 (ENSHHUG00000043929) ENSHHUG00000043960 ENSHHUG00000043965 ENSHHUG00000043970 ENSHHUG00000043978 ENSHHUG00000043981 ENSHHUG00000043984 ENSHHUG00000043996 ENSHHUG00000043997 ENSHHUG00000044000 pcdh2g13 (ENSHHUG00000044003) ENSHHUG00000044006 Huchen MODERN SPECIES 4072 ENSHHUG00000007703 ENSHHUG00000007695 ##25 ENSHHUG00000007460 #25 ENSHHUG00000007447 #30 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 66 ENSGT00940000158371 ENSGT00390000009004.d ENSGT00940000155898.r ENSGT00940000159553.b ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a ##12 ENSGT01020000230605 ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.a.b ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d #37 ENSGT00940000177513 ENSGT00940000156683 ENSGT00940000181572 ENSGT00940000164468.a.a.a.a ENSGT00940000165759 ENSGT00940000166867 ENSGT00940000164468.a.a.b.b.f ENSGT00940000164983.d.a.b ENSGT01020000232025 ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.a.a.b ENSGT00940000164468.a.a.b.b.e.b Otophysi ANCESTRAL SPECIES 116 ENSGT00390000009004.d ENSGT00940000155898.r ENSGT00940000159553.b ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.b.a.b ENSGT00940000164725.a.a.b.a.a ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000164725.a.a.b.b ENSGT00940000165118.a.a.b.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.a.b ##12 ENSGT00940000164173.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.f.b #37 ENSGT00940000177513 ENSGT00940000166432.d.f.a.b #37 ENSGT00940000156683 ENSGT00940000166432.d.f.a.a #37 ENSGT00940000181572 ENSGT00940000164468.a.a.a.a ENSGT00940000165759.e.a ENSGT00940000164468.a.a.b.b.e.b ENSGT01060000248675 ENSGT00940000164468.a.a.b.b.e.a.b ENSGT00940000164468.a.b.a.b Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 198 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.a.c.a.a ##25 ENSGT00940000160554.a ##26 ENSGT00940000166432.d.g #37 ENSGT00940000178703 ENSGT00940000166432.c.b.a ##37 ENSGT00940000166867 ENSGT00940000165759.f ENSGT00940000164468.a.a.b.b.f.b.a ENSGT00940000164983.d.a.b ENSGT01020000232025 Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 217 ENSGT00940000164725.a.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.b.a.a.b.a.b.a ENSGT00940000164725.a.a.b.a.a.b.a.b.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.a.b ##12 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.a.b ##12 ENSGT00940000164173.a.a.c ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.a.c.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.a.c.a.b.c ##25 Characoidei ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT00390000008961.a ENSGT00940000166070 ENSGT00940000158371 ENSGT00390000009004.d ENSGT00940000155898.r ENSGT00940000159553.b ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.b.a.a.b.a.b.a ENSGT00940000165118.a.a.b.b.a.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.a.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.b ##12 ENSGT00940000164173.a.a.c ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.a.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.a.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000163777.a.j.a ENSGT00940000159910 ENSGT01060000248588.a.c.a.a ENSGT01090000260190 ENSGT00940000154903 ENSGT00940000158761.a ENSGT00390000006975.g.b ENSGT00940000160629.b ENSGT00940000158048.c ENSGT00390000000610 ENSGT00940000166590 Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha MODERN SPECIES 95 ENSPNAG00000011422 ENSPNAG00000001729 ENSPNAG00000001731 ENSPNAG00000011439 ENSPNAG00000011444 ENSPNAG00000011456 ##12 ENSPNAG00000011467 ##12 ENSPNAG00000011478 ##12 ENSPNAG00000011494 ##12 ENSPNAG00000011499 ENSPNAG00000011504 ##12 pcdh2ab5 (ENSPNAG00000001772) ##25 ENSPNAG00000011530 #25 ENSPNAG00000011537 #27 ENSPNAG00000001792 #27 ENSPNAG00000005074 #25 ENSPNAG00000004900 ##25 ENSPNAG00000005841 #27 ENSPNAG00000001847 ##12 pcdh2ac (ENSPNAG00000011721) #26 ENSPNAG00000001896 #37 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 95 etf1a (ENSPNAG00000011377) fbxw11a (ENSPNAG00000011390) fgf18a (ENSPNAG00000011409) ENSPNAG00000011422 ENSPNAG00000001729 ENSPNAG00000001731 ENSPNAG00000011439 ENSPNAG00000011444 ENSPNAG00000011456 ##12 ENSPNAG00000011467 ##12 ENSPNAG00000011478 ##12 ENSPNAG00000011494 ##12 ENSPNAG00000011499 ENSPNAG00000011504 ##12 pcdh2ab5 (ENSPNAG00000001772) ##25 ENSPNAG00000011530 #25 ENSPNAG00000011537 #27 ENSPNAG00000001792 #27 ENSPNAG00000005074 #25 ENSPNAG00000004900 ##25 ENSPNAG00000005841 #27 ENSPNAG00000001847 ##12 pcdh2ac (ENSPNAG00000011721) #26 ENSPNAG00000001896 #37 Mexicana tetra MODERN SPECIES 23 ENSAMXG00000024854 ENSAMXG00000043757 ENSAMXG00000032715 ENSAMXG00000036837 ENSAMXG00000036613 ENSAMXG00000036687 ENSAMXG00000030725 ENSAMXG00000035121 ##12 ENSAMXG00000040436 ##12 ENSAMXG00000015901 ##12 ENSAMXG00000035077 ##12 ENSAMXG00000041384 ##12 ENSAMXG00000038392 ##25 pcdh2ab5 (ENSAMXG00000043213) ##25 ENSAMXG00000031366 ENSAMXG00000029715 #25 ENSAMXG00000040705 #27 ENSAMXG00000043391 #27 ENSAMXG00000038126 ##25 ENSAMXG00000036627 ##25 ENSAMXG00000029903 pcdh2ac (ENSAMXG00000015873) #26 ENSAMXG00000044074 #37 ENSAMXG00000039158 #37 ENSAMXG00000034902 #37 ENSAMXG00000040841 #37 ENSAMXG00000030514 #37 ENSAMXG00000033700 ENSAMXG00000031276 ENSAMXG00000030167 #37 ENSAMXG00000040961 Electric eel MODERN SPECIES 106 fgf18a (ENSEEEG00000014081) ENSEEEG00000014075 ENSEEEG00000014070 ENSEEEG00000014069 ENSEEEG00000014068 ENSEEEG00000014067 ENSEEEG00000014065 ENSEEEG00000014064 ##12 ENSEEEG00000014062 ##12 ENSEEEG00000014061 ##12 ENSEEEG00000014060 ##12 ENSEEEG00000014058 ##12 ENSEEEG00000014056 ##12 pcdh2ab1 (ENSEEEG00000014055) ##25 ENSEEEG00000014053 ENSEEEG00000014052 #25 ENSEEEG00000014051 #27 pcdh2ab5 (ENSEEEG00000014006) ##25 ENSEEEG00000014001 ##25 ENSEEEG00000014000 ##25 ENSEEEG00000013998 ##25 ENSEEEG00000013997 ##25 Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.a #25 Atlantic herring MODERN SPECIES 12 fgf18a (ENSCHAG00000001992) ENSCHAG00000001961 ENSCHAG00000001940 ENSCHAG00000001926 ENSCHAG00000001918 ENSCHAG00000001905 ENSCHAG00000001895 ENSCHAG00000001881 ##12 ENSCHAG00000001859 ENSCHAG00000001831 ENSCHAG00000001771 ##12 ENSCHAG00000001752 ENSCHAG00000001743 ##12 ENSCHAG00000001721 ##12 ENSCHAG00000001711 ##12 ENSCHAG00000001690 #25 ENSCHAG00000001654 ##25 ENSCHAG00000001643 ##25 ENSCHAG00000001634 ##25 pcdh2ac (ENSCHAG00000001496) #26 ENSCHAG00000001404 #37 ENSCHAG00000001365 ENSCHAG00000001343 #37 ENSCHAG00000001307 #37 ENSCHAG00000001245 #37 ENSCHAG00000001189 #37 ENSCHAG00000001034 #37 ENSCHAG00000000919 ENSCHAG00000000866 ENSCHAG00000000840 ENSCHAG00000000763 Osteoglossocephalai DUPLICATION Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 384 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT01030000236108 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000177513.a ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT01030000236108 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01090000260212 ENSGT01090000260159 #27 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00940000177060 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000159553.b ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.b ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000159725 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 99 fbxw11a (ENSKMAG00000009338) fgf18a (ENSKMAG00000009296) ENSKMAG00000009286 ENSKMAG00000009276 ENSKMAG00000009266 ENSKMAG00000009260 ENSKMAG00000009251 ENSKMAG00000009232 pcdh2aa1 (ENSKMAG00000009189) ##12 ENSKMAG00000009160 ##12 ENSKMAG00000009148 ENSKMAG00000009114 ##12 ENSKMAG00000009069 ##12 ENSKMAG00000009055 ##25 ENSKMAG00000009036 #19 ENSKMAG00000009001 ##25 ENSKMAG00000008928 ##25 ENSKMAG00000008637 #21 ENSKMAG00000008569 #25 ENSKMAG00000008538 ##25 ENSKMAG00000008503 ##25 pcdh2ab8 (ENSKMAG00000008473) ##25 pcdh2ac (ENSKMAG00000008379) #26 ENSKMAG00000008313 #35 ENSKMAG00000008291 #35 ENSKMAG00000008252 ##37 ENSKMAG00000008210 ##37 ENSKMAG00000008192 ##37 ENSKMAG00000008161 ##37 ENSKMAG00000008140 #37 ENSKMAG00000008126 #37 Cyprinodontoidei DUPLICATION Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 71 ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00950000183286 ENSGT00990000205184 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 54 ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.fb ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a.e.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 Platyfish MODERN SPECIES 15 ENSXMAG00000021083 ##12 ENSXMAG00000023389 ENSXMAG00000029330 ENSXMAG00000027122 ##12 ENSXMAG00000027032 ENSXMAG00000025920 ##12 ENSXMAG00000022763 #8 ENSXMAG00000021470 #11 ENSXMAG00000020972 ENSXMAG00000029775 #12 ENSXMAG00000021646 ##12 ENSXMAG00000021457 ENSXMAG00000008338 #15 ENSXMAG00000028268 ##25 ENSXMAG00000021394 ##25 ENSXMAG00000026013 ##25 ENSXMAG00000025189 ##25 ENSXMAG00000021710 ENSXMAG00000024357 #23 ENSXMAG00000025065 ENSXMAG00000025626 ##25 ENSXMAG00000028407 #25 ENSXMAG00000029821 #25 ENSXMAG00000021550 ##25 ENSXMAG00000022961 ##25 pcdh2ac (ENSXMAG00000023782) #26 ENSXMAG00000020851 ##37 ENSXMAG00000023606 ##37 ENSXMAG00000021123 ##37 ENSXMAG00000021523 ##37 ENSXMAG00000025058 #37 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.fb ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a.e.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a.f ##12 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 Guppy MODERN SPECIES 440 ENSPREG00000001474 ENSPREG00000001466 ENSPREG00000001450 ENSPREG00000001444 ENSPREG00000001405 ##12 ENSPREG00000001390 ##12 ENSPREG00000001375 ENSPREG00000001368 ##12 ENSPREG00000001343 #11 ENSPREG00000001329 #12 ENSPREG00000001318 #12 ENSPREG00000001306 ENSPREG00000001293 ##25 ENSPREG00000001277 ##25 ENSPREG00000001221 ##25 ENSPREG00000001149 ##25 ENSPREG00000001136 #20 ENSPREG00000001124 ##25 ENSPREG00000001113 ENSPREG00000001096 ##25 ENSPREG00000001077 ENSPREG00000001039 #25 ENSPREG00000001020 #27 ENSPREG00000000942 #25 ENSPREG00000000911 #25 ENSPREG00000000855 #35 ENSPREG00000000826 #35 ENSPREG00000000805 ENSPREG00000000775 #35 ENSPREG00000000765 #35 ENSPREG00000000747 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 116 ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000163777.b.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00940000177060 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.f #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.e.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.f #37 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 322 ENSCVAG00000011308 ENSCVAG00000011295 ENSCVAG00000011289 ENSCVAG00000011269 pcdh2aa1 (ENSCVAG00000011254) ##12 ENSCVAG00000011234 ENSCVAG00000011220 ENSCVAG00000011208 ##12 ENSCVAG00000011191 ##12 ENSCVAG00000011174 #11 ENSCVAG00000011160 #12 ENSCVAG00000011157 ##12 ENSCVAG00000011134 #21 pcdh2ac (ENSCVAG00000011115) #26 ENSCVAG00000011088 ##25 ENSCVAG00000011080 ##25 ENSCVAG00000011065 #23 ENSCVAG00000010928 #25 ENSCVAG00000010882 #35 ENSCVAG00000010856 #35 ENSCVAG00000010850 #35 ENSCVAG00000010808 #35 ENSCVAG00000010790 ##37 ENSCVAG00000010777 ##37 ENSCVAG00000010747 #37 Mummichog MODERN SPECIES 728 ENSFHEG00000006615 #11 ENSFHEG00000006632 #9 ENSFHEG00000006656 #12 ENSFHEG00000006678 #12 ENSFHEG00000006695 #12 ENSFHEG00000006751 ##25 ENSFHEG00000006762 ENSFHEG00000006774 ##25 ENSFHEG00000006783 #21 ENSFHEG00000000183 ENSFHEG00000006796 ##25 ENSFHEG00000006925 ##25 ENSFHEG00000006940 #25 ENSFHEG00000007008 ##25 pcdh2ab8 (ENSFHEG00000007019) ##25 pcdh2ac (ENSFHEG00000007030) #26 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a.b ##25 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a.b ##25 Mummichog MODERN SPECIES 728 ENSFHEG00000006615 #11 ENSFHEG00000006632 #9 ENSFHEG00000006656 #12 ENSFHEG00000006678 #12 ENSFHEG00000006695 #12 ENSFHEG00000006751 ##25 ENSFHEG00000006762 ENSFHEG00000006774 ##25 ENSFHEG00000006783 #21 ENSFHEG00000000183 ENSFHEG00000006796 ##25 ENSFHEG00000006925 ##25 ENSFHEG00000006940 #25 ENSFHEG00000007008 ##25 pcdh2ab8 (ENSFHEG00000007019) ##25 pcdh2ac (ENSFHEG00000007030) #26 Oryzias DUPLICATION Oryzias ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00670000098059.c.a ENSGT00940000156077.g.a ENSGT00390000000002.a.a.a.nb.a ENSGT00390000002137 ENSGT00940000166070 ENSGT00940000158371 ENSGT01030000234599.a.b.c ENSGT00390000009004.d ENSGT00940000155898 ENSGT00940000159553.b ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.`b.b.b ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a.d ##25 ENSGT01030000236108 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a.c ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.b.b.b.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.b.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.h ##37 ENSGT00970000195503 Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.`b.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.`b.a ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.z ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.b ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.l #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT01030000236108 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a.c ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.b.b.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.b.b.b.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.b.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.h ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.i ##37 Chinese medaka MODERN SPECIES 2027 ENSOSIG00000002017 ##25 Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 1 ENSORLG00000023628 ENSORLG00000022127 ENSORLG00000028462 ENSORLG00000023399 pcdh2aa1 (ENSORLG00000021994) ##12 ENSORLG00000028629 ##12 ENSORLG00000028208 ##12 ENSORLG00000030495 ENSORLG00000022312 #8 ENSORLG00000028903 #11 ENSORLG00000004181 #12 ENSORLG00000027606 ##12 ENSORLG00000029528 ENSORLG00000026864 ##25 ENSORLG00000026652 ENSORLG00000029341 ##25 ENSORLG00000024772 #19 ENSORLG00000004176 #21 ENSORLG00000004171 #23 ENSORLG00000023815 ##25 ENSORLG00000026259 ENSORLG00000029952 #25 ENSORLG00000024089 #25 ENSORLG00000028645 ENSORLG00000024851 ##25 pcdh2ab10 (ENSORLG00000022081) ##25 pcdh2ac (ENSORLG00000029405) #26 ENSORLG00000025371 #35 ENSORLG00000026934 #35 ENSORLG00000025477 #35 ENSORLG00000030492 #35 Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.`b.a ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b.g.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b.g.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a.d #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.k #12 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a.c #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a.c ##25 Javanese ricefish MODERN SPECIES 1 ENSOJAG00000007103 ENSOJAG00000007109 ENSOJAG00000007130 ENSOJAG00000007158 ENSOJAG00000007177 ENSOJAG00000007209 ENSOJAG00000007239 ##12 ENSOJAG00000007284 #9 pcdh2ac (ENSOJAG00000007320) #26 ENSOJAG00000007379 ENSOJAG00000007393 ##12 ENSOJAG00000007414 #9 ENSOJAG00000007493 #12 ENSOJAG00000007530 #12 ENSOJAG00000007555 ENSOJAG00000007569 ##25 ENSOJAG00000007606 #18 ENSOJAG00000007610 #23 ENSOJAG00000007622 ##25 ENSOJAG00000007643 #25 ENSOJAG00000007675 ##25 ENSOJAG00000007685 ENSOJAG00000007712 #35 ENSOJAG00000007738 #35 ENSOJAG00000007765 #35 ENSOJAG00000007910 ##37 ENSOJAG00000007942 #35 ENSOJAG00000007960 #35 ENSOJAG00000007979 ##37 ENSOJAG00000007995 #35 ENSOJAG00000008007 ##37 Indian medaka MODERN SPECIES 16 ENSOMEG00000003771 ENSOMEG00000003765 #11 ENSOMEG00000000083 ENSOMEG00000003750 #11 ENSOMEG00000003745 #9 ENSOMEG00000003738 #12 ENSOMEG00000003727 ENSOMEG00000003720 #9 ENSOMEG00000003703 #9 ENSOMEG00000003694 #9 ENSOMEG00000003685 #9 ENSOMEG00000003673 #9 ENSOMEG00000003662 ##12 ENSOMEG00000003654 pcdh2ab5 (ENSOMEG00000003648) ##25 ENSOMEG00000003631 ##25 ENSOMEG00000003616 pcdh2ac (ENSOMEG00000003560) #26 ENSOMEG00000003493 ENSOMEG00000003484 #27 ENSOMEG00000003472 pcdh2ab8 (ENSOMEG00000003465) ##25 ENSOMEG00000003456 #35 ENSOMEG00000003420 #35 ENSOMEG00000003412 #35 ENSOMEG00000003391 #35 ENSOMEG00000003352 #35 ENSOMEG00000003333 #35 ENSOMEG00000003323 #35 ENSOMEG00000003318 #35 ENSOMEG00000003299 #35 Oryzias ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000162201.p ENSGT00940000157489 ENSGT00670000098059.c.a ENSGT00940000156077.g.a ENSGT00390000000002.a.a.a.nb.a ENSGT00390000002137 ENSGT00940000166070 ENSGT00940000158371 ENSGT01030000234599.a.b.c ENSGT00390000009004.d ENSGT00940000155898 ENSGT00940000159553.b ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.`b.b.b ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a.d ##25 ENSGT01030000236108 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a.c ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.b.b.b.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.b.b.a #35 Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 272 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a.d ##25 ENSGT01030000236108 Indian medaka MODERN SPECIES 377 ENSOMEG00000011559 ##25 ENSOMEG00000011542 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00990000205184 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.g ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 Bicolor damselfish MODERN SPECIES 1164 ENSSPAG00000011168 ENSSPAG00000011158 #20 ENSSPAG00000011135 ##25 ENSSPAG00000011093 ##25 ENSSPAG00000011080 ENSSPAG00000011048 #21 ENSSPAG00000011039 ENSSPAG00000011031 #27 ENSSPAG00000011018 ##25 ENSSPAG00000011012 ##25 ENSSPAG00000011005 ##25 ENSSPAG00000010996 pcdh2ab8 (ENSSPAG00000010986) ##25 ENSSPAG00000010979 #35 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 110 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.g ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l.a.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l.a.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b.f.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b.f.a #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.o.a.a.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.o.a.b #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.o.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.p #35 Clown anemonefish DUPLICATION Clown anemonefish DUPLICATION Clown anemonefish MODERN SPECIES 37 ENSAOCG00000022342 #20 ENSAOCG00000022346 ##25 ENSAOCG00000022352 ##25 ENSAOCG00000022364 ##25 ENSAOCG00000022389 #19 Clown anemonefish MODERN SPECIES 1335 ENSAOCG00000010182 #8 ENSAOCG00000010194 #8 ENSAOCG00000002009 #12 ENSAOCG00000010226 #12 ENSAOCG00000002555 ##25 ENSAOCG00000010257 #15 ENSAOCG00000010271 ##25 ENSAOCG00000010281 ##25 ENSAOCG00000010293 #19 ENSAOCG00000010312 ENSAOCG00000002556 #21 ENSAOCG00000010336 #25 ENSAOCG00000000647 #25 ENSAOCG00000010495 #25 pcdh2ab10 (ENSAOCG00000010528) ##25 pcdh2ac (ENSAOCG00000010573) #26 ENSAOCG00000010594 ENSAOCG00000010607 Clown anemonefish MODERN SPECIES 37 ENSAOCG00000022342 #20 ENSAOCG00000022346 ##25 ENSAOCG00000022352 ##25 ENSAOCG00000022364 ##25 ENSAOCG00000022389 #19 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 265 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 299 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000177060 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004.d.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004.d.b ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.y.a.a.a ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.y.a.b.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00990000205184 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.x #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.a #35 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.y.a.b.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00990000205184 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000177004.d.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.w.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.x #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.a #35 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00990000205184 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000177004.d.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.w.b.a #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.x #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.m #25 ENSGT00940000178344 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.n #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.a #35 Eastern happy DUPLICATION Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000010832 #7 ENSACLG00000010842 ENSACLG00000010851 ##12 ENSACLG00000010858 ##12 ENSACLG00000010875 ##12 pcdh2ac (ENSACLG00000010885) #26 ENSACLG00000010910 #8 ENSACLG00000010945 ENSACLG00000010956 #12 ENSACLG00000010963 #12 ENSACLG00000010982 #12 ENSACLG00000010995 #9 ENSACLG00000011008 #12 ENSACLG00000011017 ##25 ENSACLG00000011028 #15 ENSACLG00000011046 ##25 ENSACLG00000011053 ##25 ENSACLG00000011068 ##25 ENSACLG00000011086 #20 ENSACLG00000011091 ##25 ENSACLG00000011099 #19 ENSACLG00000011102 #21 ENSACLG00000011124 ##25 ENSACLG00000011157 #25 ENSACLG00000011178 #25 ENSACLG00000011363 ##25 pcdh2ab8 (ENSACLG00000011367) ##25 ENSACLG00000011696 #35 ENSACLG00000011712 #35 ENSACLG00000011729 #35 ENSACLG00000011758 #35 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000010875 ##12 pcdh2ac (ENSACLG00000010885) #26 ENSACLG00000010910 #8 ENSACLG00000010945 ENSACLG00000010956 #12 ENSACLG00000010963 #12 ENSACLG00000010982 #12 ENSACLG00000010995 #9 ENSACLG00000011008 #12 ENSACLG00000011017 ##25 ENSACLG00000011028 #15 ENSACLG00000011046 ##25 ENSACLG00000011053 ##25 ENSACLG00000011068 ##25 ENSACLG00000011086 #20 ENSACLG00000011091 ##25 ENSACLG00000011099 #19 ENSACLG00000011102 #21 ENSACLG00000011124 ##25 ENSACLG00000011157 #25 ENSACLG00000011178 #25 ENSACLG00000011363 ##25 pcdh2ab8 (ENSACLG00000011367) ##25 ENSACLG00000011696 #35 ENSACLG00000011712 #35 ENSACLG00000011729 #35 ENSACLG00000011758 #35 ENSACLG00000011766 #35 ENSACLG00000011774 #33 ENSACLG00000011784 ##37 ENSACLG00000011797 #36 P. nyererei MODERN SPECIES 296 ENSPNYG00000001869 ENSPNYG00000001894 ENSPNYG00000001914 ENSPNYG00000001930 pcdh2aa1 (ENSPNYG00000001937) ##12 ENSPNYG00000001964 ENSPNYG00000001990 ##12 ENSPNYG00000002003 #7 ENSPNYG00000002015 ENSPNYG00000002026 ##12 ENSPNYG00000002050 ##12 ENSPNYG00000002073 #9 ENSPNYG00000002123 ENSPNYG00000002147 ENSPNYG00000002160 ##25 ENSPNYG00000002176 ##25 ENSPNYG00000002201 ##25 ENSPNYG00000002217 ##25 ENSPNYG00000002235 #20 ENSPNYG00000002244 #19 ENSPNYG00000002261 #23 ENSPNYG00000002272 #21 ENSPNYG00000002293 ##25 ENSPNYG00000002390 ##25 pcdh2ac (ENSPNYG00000002432) #26 ENSPNYG00000002474 #35 ENSPNYG00000002485 #35 ENSPNYG00000002501 #33 ENSPNYG00000002519 ENSPNYG00000002527 ##37 ENSPNYG00000002547 #35 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000159553.b ENSGT01010000224686 ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.r #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 58 ENSGT01030000236108 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01100000264899 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 50 ENSGT01030000236108 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01100000264899 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 56 ENSGT01030000236108 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01100000264899 Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 112 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000177312 Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 88 ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.i.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000177312 European seabass DUPLICATION European seabass DUPLICATION European seabass MODERN SPECIES 12 ENSDLAG00005031244 ENSDLAG00005032943 pcdh2aa1 (ENSDLAG00005022000) ##12 ENSDLAG00005021993 ##12 ENSDLAG00005032508 ENSDLAG00005032461 ##12 ENSDLAG00005035091 ##12 ENSDLAG00005035023 #11 ENSDLAG00005027408 ##12 ENSDLAG00005016635 #12 ENSDLAG00005028538 #12 ENSDLAG00005027175 #12 ENSDLAG00005034627 #12 pcdh2ab5 (ENSDLAG00005022013) ##25 ENSDLAG00005028279 ##25 ENSDLAG00005028968 ##25 ENSDLAG00005029590 ##25 ENSDLAG00005002365 ENSDLAG00005012248 #20 ENSDLAG00005032497 ENSDLAG00005029568 ##25 ENSDLAG00005002726 #25 pcdh2ab10 (ENSDLAG00005017238) ##25 pcdh2ac (ENSDLAG00005020172) #26 ENSDLAG00005032844 #35 ENSDLAG00005018658 #35 ENSDLAG00005019241 #33 ENSDLAG00005027070 #37 ENSDLAG00005030151 ##37 ENSDLAG00005026638 ##37 ENSDLAG00005018567 #37 European seabass MODERN SPECIES 12 ENSDLAG00005032943 pcdh2aa1 (ENSDLAG00005022000) ##12 ENSDLAG00005021993 ##12 ENSDLAG00005032508 ENSDLAG00005032461 ##12 ENSDLAG00005035091 ##12 ENSDLAG00005035023 #11 ENSDLAG00005027408 ##12 ENSDLAG00005016635 #12 ENSDLAG00005028538 #12 ENSDLAG00005027175 #12 ENSDLAG00005034627 #12 pcdh2ab5 (ENSDLAG00005022013) ##25 ENSDLAG00005028279 ##25 ENSDLAG00005028968 ##25 ENSDLAG00005029590 ##25 ENSDLAG00005002365 ENSDLAG00005012248 #20 ENSDLAG00005032497 ENSDLAG00005029568 ##25 ENSDLAG00005002726 #25 pcdh2ab10 (ENSDLAG00005017238) ##25 pcdh2ac (ENSDLAG00005020172) #26 ENSDLAG00005032844 #35 ENSDLAG00005018658 #35 ENSDLAG00005019241 #33 ENSDLAG00005027070 #37 ENSDLAG00005030151 ##37 ENSDLAG00005026638 ##37 ENSDLAG00005018567 #37 ENSDLAG00005033651 ##37 European seabass MODERN SPECIES 12 ENSDLAG00005030788 ENSDLAG00005031244 ENSDLAG00005032943 pcdh2aa1 (ENSDLAG00005022000) ##12 ENSDLAG00005021993 ##12 ENSDLAG00005032508 ENSDLAG00005032461 ##12 ENSDLAG00005035091 ##12 ENSDLAG00005035023 #11 ENSDLAG00005027408 ##12 ENSDLAG00005016635 #12 ENSDLAG00005028538 #12 ENSDLAG00005027175 #12 ENSDLAG00005034627 #12 pcdh2ab5 (ENSDLAG00005022013) ##25 ENSDLAG00005028279 ##25 ENSDLAG00005028968 ##25 ENSDLAG00005029590 ##25 ENSDLAG00005002365 ENSDLAG00005012248 #20 ENSDLAG00005032497 ENSDLAG00005029568 ##25 ENSDLAG00005002726 #25 pcdh2ab10 (ENSDLAG00005017238) ##25 pcdh2ac (ENSDLAG00005020172) #26 ENSDLAG00005032844 #35 ENSDLAG00005018658 #35 ENSDLAG00005019241 #33 ENSDLAG00005027070 #37 ENSDLAG00005030151 ##37 ENSDLAG00005026638 ##37 Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 ENSSAUG00010004685 ENSSAUG00010004689 ENSSAUG00010004690 ENSSAUG00010004699 ##12 ENSSAUG00010004703 ##12 ENSSAUG00010004705 #8 ENSSAUG00010004707 #12 ENSSAUG00010004714 #12 ENSSAUG00010004718 ENSSAUG00010004720 #12 ENSSAUG00010004722 #12 ENSSAUG00010004724 #15 ENSSAUG00010004734 #15 ENSSAUG00010004736 #15 ENSSAUG00010004738 ENSSAUG00010004742 ##25 ENSSAUG00010004745 #23 ENSSAUG00010004748 #23 ENSSAUG00010004749 ENSSAUG00010004750 #25 ENSSAUG00010004752 #25 ENSSAUG00010004753 #25 ENSSAUG00010004755 ##25 ENSSAUG00010004757 #27 ENSSAUG00010004761 #35 ENSSAUG00010004762 #35 ENSSAUG00010004765 #29 ENSSAUG00010004768 ##37 ENSSAUG00010004772 ##37 ENSSAUG00010004775 ##37 ENSSAUG00010004777 #37 Ballan wrasse MODERN SPECIES 182 ENSLBEG00000001631 ##12 ENSLBEG00000001659 ##12 ENSLBEG00000001691 ##12 ENSLBEG00000001700 ##12 ENSLBEG00000001716 #8 ENSLBEG00000001750 ##12 ENSLBEG00000001784 #12 ENSLBEG00000001817 ENSLBEG00000001840 #12 ENSLBEG00000001871 #12 ENSLBEG00000001911 #12 ENSLBEG00000001932 #12 ENSLBEG00000001969 ##12 ENSLBEG00000002011 ##25 ENSLBEG00000002048 ##25 ENSLBEG00000002071 ##25 ENSLBEG00000002088 ENSLBEG00000002103 ##25 ENSLBEG00000002118 ENSLBEG00000002126 #27 ENSLBEG00000002149 #25 ENSLBEG00000002165 #25 ENSLBEG00000002205 #25 ENSLBEG00000002221 pcdh2ab8 (ENSLBEG00000002246) ##25 pcdh2ac (ENSLBEG00000002305) #26 ENSLBEG00000002317 #35 ENSLBEG00000002335 #35 ENSLBEG00000002381 #35 ENSLBEG00000002501 #36 ENSLBEG00000002517 ##37 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b.h #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01100000264899 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.r #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 Carangaria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a ##12 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b.h #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.f #37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a ##12 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b.h #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.f #37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.k ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch MODERN SPECIES 127 ENSLCAG00010002501 ##12 ENSLCAG00010002497 ENSLCAG00010002494 ENSLCAG00010002490 ENSLCAG00010002486 ##12 ENSLCAG00010002482 #11 ENSLCAG00010002479 #12 ENSLCAG00010002477 ENSLCAG00010002476 #12 ENSLCAG00010002474 #12 ENSLCAG00010002472 ENSLCAG00010002470 ##25 ENSLCAG00010002469 #15 ENSLCAG00010002463 ##25 ENSLCAG00010002459 ##25 ENSLCAG00010002458 ##25 ENSLCAG00010002454 ##25 ENSLCAG00010002451 #25 ENSLCAG00010002447 #25 ENSLCAG00010002446 ##25 pcdh2ac (ENSLCAG00010002441) #26 ENSLCAG00010002440 #35 ENSLCAG00010002439 #35 ENSLCAG00010002434 #35 ENSLCAG00010002433 #35 ENSLCAG00010002430 ##37 Barramundi perch MODERN SPECIES 808 ENSLCAG00010001220 ##25 ENSLCAG00010001224 #20 ENSLCAG00010001230 ##25 ENSLCAG00010001235 ##25 ENSLCAG00010001241 ENSLCAG00010001246 #21 ENSLCAG00010001256 ENSLCAG00010001259 ENSLCAG00010001261 #25 ENSLCAG00010001263 #25 ENSLCAG00010001264 ##25 ENSLCAG00010001267 ##25 Barramundi perch MODERN SPECIES 808 ENSLCAG00010001220 ##25 ENSLCAG00010001224 #20 ENSLCAG00010001230 ##25 ENSLCAG00010001235 ##25 ENSLCAG00010001241 ENSLCAG00010001246 #21 ENSLCAG00010001256 ENSLCAG00010001259 ENSLCAG00010001261 #25 ENSLCAG00010001263 #25 ENSLCAG00010001264 ##25 ENSLCAG00010001267 ##25 Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch MODERN SPECIES 127 ENSLCAG00010002508 ENSLCAG00010002505 ##12 ENSLCAG00010002501 ##12 ENSLCAG00010002497 ENSLCAG00010002494 ENSLCAG00010002490 ENSLCAG00010002486 ##12 ENSLCAG00010002482 #11 ENSLCAG00010002479 #12 ENSLCAG00010002477 ENSLCAG00010002476 #12 ENSLCAG00010002474 #12 ENSLCAG00010002472 ENSLCAG00010002470 ##25 ENSLCAG00010002469 #15 ENSLCAG00010002463 ##25 ENSLCAG00010002459 ##25 ENSLCAG00010002458 ##25 ENSLCAG00010002454 ##25 ENSLCAG00010002451 #25 ENSLCAG00010002447 #25 ENSLCAG00010002446 ##25 pcdh2ac (ENSLCAG00010002441) #26 ENSLCAG00010002440 #35 ENSLCAG00010002439 #35 ENSLCAG00010002434 #35 ENSLCAG00010002433 #35 ENSLCAG00010002430 ##37 Barramundi perch MODERN SPECIES 127 ENSLCAG00010002497 ENSLCAG00010002494 ENSLCAG00010002490 ENSLCAG00010002486 ##12 ENSLCAG00010002482 #11 ENSLCAG00010002479 #12 ENSLCAG00010002477 ENSLCAG00010002476 #12 ENSLCAG00010002474 #12 ENSLCAG00010002472 ENSLCAG00010002470 ##25 ENSLCAG00010002469 #15 ENSLCAG00010002463 ##25 ENSLCAG00010002459 ##25 ENSLCAG00010002458 ##25 ENSLCAG00010002454 ##25 ENSLCAG00010002451 #25 ENSLCAG00010002447 #25 ENSLCAG00010002446 ##25 pcdh2ac (ENSLCAG00010002441) #26 ENSLCAG00010002440 #35 ENSLCAG00010002439 #35 ENSLCAG00010002434 #35 ENSLCAG00010002433 #35 ENSLCAG00010002430 ##37 Seriola ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.u ENSGT00940000164725.a.a.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.e.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.e.b ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a.e #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a.b #35 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 Greater amberjack MODERN SPECIES 275 ENSSDUG00000017451 ##12 ENSSDUG00000017443 ENSSDUG00000017438 #8 ENSSDUG00000017428 ENSSDUG00000017418 #9 ENSSDUG00000017408 #12 ENSSDUG00000017385 #9 ENSSDUG00000017378 ENSSDUG00000017367 #20 ENSSDUG00000017348 ##25 ENSSDUG00000017340 #23 ENSSDUG00000017329 #20 ENSSDUG00000017321 #19 ENSSDUG00000017307 ##25 ENSSDUG00000017292 ##25 ENSSDUG00000017283 ##25 ENSSDUG00000017279 ENSSDUG00000017270 #21 ENSSDUG00000017263 ENSSDUG00000017252 ##25 pcdh2ac (ENSSDUG00000017069) #26 ENSSDUG00000017023 ##25 ENSSDUG00000017016 #35 ENSSDUG00000017009 #35 ENSSDUG00000016999 ##37 ENSSDUG00000016989 #35 ENSSDUG00000016984 ##37 ENSSDUG00000016964 ##37 ENSSDUG00000016934 ##37 ENSSDUG00000016918 ##37 Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000155898 ENSGT00940000159553.b ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 Turbot MODERN SPECIES 4 ENSSMAG00000030226 ENSSMAG00000001605 ENSSMAG00000034972 pcdh2aa1 (ENSSMAG00000016187) ##12 ENSSMAG00000016163 ##12 ENSSMAG00000033861 ENSSMAG00000034636 #8 ENSSMAG00000022434 #8 ENSSMAG00000023632 ##12 ENSSMAG00000025748 #9 ENSSMAG00000023362 ENSSMAG00000001346 #12 ENSSMAG00000022345 ENSSMAG00000028799 ##25 ENSSMAG00000021880 ##25 ENSSMAG00000001405 ##25 ENSSMAG00000001579 ENSSMAG00000023812 ##25 ENSSMAG00000024294 #25 ENSSMAG00000031943 ENSSMAG00000025670 #25 pcdh2ab10 (ENSSMAG00000033635) ##25 pcdh2ac (ENSSMAG00000030691) #26 ENSSMAG00000033759 #29 ENSSMAG00000024154 #35 ENSSMAG00000037132 ##37 ENSSMAG00000033616 ENSSMAG00000024825 ##37 ENSSMAG00000025683 ##37 ENSSMAG00000032750 ##37 ENSSMAG00000030566 ##37 Tiger tail seahorse DUPLICATION Tiger tail seahorse DUPLICATION Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 239 ENSHCOG00000014421 ENSHCOG00000014416 ENSHCOG00000014404 ENSHCOG00000014388 ENSHCOG00000014378 ##12 ENSHCOG00000014366 ##12 ENSHCOG00000014353 ##12 ENSHCOG00000014317 ##12 ENSHCOG00000014293 ENSHCOG00000014280 #8 ENSHCOG00000014273 #11 ENSHCOG00000014271 #12 ENSHCOG00000014264 #12 ENSHCOG00000014257 #12 ENSHCOG00000014248 #9 ENSHCOG00000014221 ##25 ENSHCOG00000014050 ##25 ENSHCOG00000014011 ##25 ENSHCOG00000000663 ENSHCOG00000013984 #25 ENSHCOG00000013966 #25 pcdh2ab8 (ENSHCOG00000013952) ##25 pcdh2ac (ENSHCOG00000013879) #26 ENSHCOG00000013778 #35 ENSHCOG00000013765 ENSHCOG00000013753 #35 ENSHCOG00000013733 #35 ENSHCOG00000013724 ENSHCOG00000013704 ##37 ENSHCOG00000013624 ##37 ENSHCOG00000013615 ##37 Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 239 ENSHCOG00000014404 ENSHCOG00000014388 ENSHCOG00000014378 ##12 ENSHCOG00000014366 ##12 ENSHCOG00000014353 ##12 ENSHCOG00000014317 ##12 ENSHCOG00000014293 ENSHCOG00000014280 #8 ENSHCOG00000014273 #11 ENSHCOG00000014271 #12 ENSHCOG00000014264 #12 ENSHCOG00000014257 #12 ENSHCOG00000014248 #9 ENSHCOG00000014221 ##25 ENSHCOG00000014050 ##25 ENSHCOG00000014011 ##25 ENSHCOG00000000663 ENSHCOG00000013984 #25 ENSHCOG00000013966 #25 pcdh2ab8 (ENSHCOG00000013952) ##25 pcdh2ac (ENSHCOG00000013879) #26 ENSHCOG00000013778 #35 ENSHCOG00000013765 ENSHCOG00000013753 #35 ENSHCOG00000013733 #35 ENSHCOG00000013724 ENSHCOG00000013704 ##37 ENSHCOG00000013624 ##37 ENSHCOG00000013615 ##37 ENSHCOG00000013603 ##37 Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 239 ENSHCOG00000014416 ENSHCOG00000014404 ENSHCOG00000014388 ENSHCOG00000014378 ##12 ENSHCOG00000014366 ##12 ENSHCOG00000014353 ##12 ENSHCOG00000014317 ##12 ENSHCOG00000014293 ENSHCOG00000014280 #8 ENSHCOG00000014273 #11 ENSHCOG00000014271 #12 ENSHCOG00000014264 #12 ENSHCOG00000014257 #12 ENSHCOG00000014248 #9 ENSHCOG00000014221 ##25 ENSHCOG00000014050 ##25 ENSHCOG00000014011 ##25 ENSHCOG00000000663 ENSHCOG00000013984 #25 ENSHCOG00000013966 #25 pcdh2ab8 (ENSHCOG00000013952) ##25 pcdh2ac (ENSHCOG00000013879) #26 ENSHCOG00000013778 #35 ENSHCOG00000013765 ENSHCOG00000013753 #35 ENSHCOG00000013733 #35 ENSHCOG00000013724 ENSHCOG00000013704 ##37 ENSHCOG00000013624 ##37 ENSHCOG00000013615 ##37 ENSHCOG00000013603 ##37 Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 Northern pike MODERN SPECIES 3 etf1a (ENSELUG00000018668) fbxw11a (ENSELUG00000018591) fgf18a (ENSELUG00000018447) ENSELUG00000018411 ENSELUG00000018402 ENSELUG00000018394 ENSELUG00000028568 ENSELUG00000018382 ENSELUG00000018313 ##12 ENSELUG00000032563 ENSELUG00000018162 ##12 ENSELUG00000028092 ENSELUG00000029025 #15 ENSELUG00000026095 ENSELUG00000000741 ##25 ENSELUG00000018100 ##25 ENSELUG00000030369 ##25 ENSELUG00000018036 #25 ENSELUG00000018006 ENSELUG00000032665 ##25 ENSELUG00000018000 ##25 ENSELUG00000033843 #30 ENSELUG00000027397 #30 pcdh1g31 (ENSELUG00000017950) ENSELUG00000026183 #30 ENSELUG00000017927 ENSELUG00000028255 ENSELUG00000026213 ENSELUG00000017752 TRPC7 (ENSELUG00000017696) DOCK2 (ENSELUG00000000655) Osteoglossocephalai DUPLICATION Osteoglossocephalai DUPLICATION Osteoglossocephalai DUPLICATION Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a #19 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a #19 Euteleosteomorpha DUPLICATION Euteleosteomorpha DUPLICATION Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 614 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 Cod DUPLICATION Cod MODERN SPECIES 1 ENSGMOG00000028762 ENSGMOG00000035354 ##12 ENSGMOG00000022876 ENSGMOG00000035504 ##12 ENSGMOG00000031088 ENSGMOG00000026457 ##12 ENSGMOG00000028556 #11 ENSGMOG00000022183 #11 ENSGMOG00000023743 #11 ENSGMOG00000029116 ##12 ENSGMOG00000032159 #11 ENSGMOG00000029002 #11 ENSGMOG00000036845 #11 ENSGMOG00000027255 #12 ENSGMOG00000033714 ENSGMOG00000026316 #15 ENSGMOG00000035028 ENSGMOG00000026633 #23 ENSGMOG00000032829 #15 ENSGMOG00000025708 #23 ENSGMOG00000028781 ##25 ENSGMOG00000029676 ##25 ENSGMOG00000023528 #25 ENSGMOG00000036517 ##37 ENSGMOG00000028481 ##37 ENSGMOG00000034233 ##37 ENSGMOG00000023799 ##37 ENSGMOG00000035300 ##37 ENSGMOG00000029887 ##37 ENSGMOG00000031191 ##37 ENSGMOG00000022796 ##37 Cod MODERN SPECIES 1 ENSGMOG00000035504 ##12 ENSGMOG00000031088 ENSGMOG00000026457 ##12 ENSGMOG00000028556 #11 ENSGMOG00000022183 #11 ENSGMOG00000023743 #11 ENSGMOG00000029116 ##12 ENSGMOG00000032159 #11 ENSGMOG00000029002 #11 ENSGMOG00000036845 #11 ENSGMOG00000027255 #12 ENSGMOG00000033714 ENSGMOG00000026316 #15 ENSGMOG00000035028 ENSGMOG00000026633 #23 ENSGMOG00000032829 #15 ENSGMOG00000025708 #23 ENSGMOG00000028781 ##25 ENSGMOG00000029676 ##25 ENSGMOG00000023528 #25 ENSGMOG00000036517 ##37 ENSGMOG00000028481 ##37 ENSGMOG00000034233 ##37 ENSGMOG00000023799 ##37 ENSGMOG00000035300 ##37 ENSGMOG00000029887 ##37 ENSGMOG00000031191 ##37 ENSGMOG00000022796 ##37 ENSGMOG00000019646 ##37 ENSGMOG00000030280 ##37 ENSGMOG00000035852 ##37 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000155898 ENSGT00940000159553.b ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a ENSGT00940000164725.a.a.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b ##12 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.a ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a ##37 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 226 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 47 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT01090000260159 #27 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 Platyfish MODERN SPECIES 15 ENSXMAG00000021521 ENSXMAG00000027616 ENSXMAG00000026701 ##12 ENSXMAG00000021083 ##12 ENSXMAG00000023389 ENSXMAG00000029330 ENSXMAG00000027122 ##12 ENSXMAG00000027032 ENSXMAG00000025920 ##12 ENSXMAG00000022763 #8 ENSXMAG00000021470 #11 ENSXMAG00000020972 ENSXMAG00000029775 #12 ENSXMAG00000021646 ##12 ENSXMAG00000021457 ENSXMAG00000008338 #15 ENSXMAG00000028268 ##25 ENSXMAG00000021394 ##25 ENSXMAG00000026013 ##25 ENSXMAG00000025189 ##25 ENSXMAG00000021710 ENSXMAG00000024357 #23 ENSXMAG00000025065 ENSXMAG00000025626 ##25 ENSXMAG00000028407 #25 ENSXMAG00000029821 #25 ENSXMAG00000021550 ##25 ENSXMAG00000022961 ##25 pcdh2ac (ENSXMAG00000023782) #26 ENSXMAG00000020851 ##37 ENSXMAG00000023606 ##37 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00990000205184 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004.d.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000164725.a.a.a.a.e ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.y.b.a ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004.d.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.a #35 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 fbxw11a (ENSONIG00000004953) fgf18a (ENSONIG00000004960) ENSONIG00000004963 ENSONIG00000027254 ENSONIG00000028843 ENSONIG00000037611 ENSONIG00000032228 ENSONIG00000036227 ENSONIG00000027109 #7 ENSONIG00000041059 ENSONIG00000032107 #8 ENSONIG00000034641 #9 ENSONIG00000030596 ##12 ENSONIG00000035556 #9 ENSONIG00000037921 ##25 ENSONIG00000021365 #15 ENSONIG00000034871 ##25 ENSONIG00000033250 ENSONIG00000021350 #21 ENSONIG00000029948 ENSONIG00000031283 #25 ENSONIG00000035146 ##25 pcdh2ac (ENSONIG00000030416) #26 ENSONIG00000032670 #35 ENSONIG00000029451 #35 ENSONIG00000028830 #35 ENSONIG00000042593 #35 ENSONIG00000028202 #35 ENSONIG00000040060 #33 ENSONIG00000031218 #36 ENSONIG00000004967 #35 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004.d.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004.d.b ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.b #35 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000009004.d ENSGT00940000155898 ENSGT00940000159553.b ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.y.a.a.a ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.y.a.b.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00990000205184 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.x #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.a #35 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000159553.b ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.y.a.a.a ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.y.a.b.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00990000205184 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000177004.d.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.w.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.x #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.a #35 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000163564 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00990000205184 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000177004.d.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.w.b.a #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.x #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.m #25 ENSGT00940000178344 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.n #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.a #35 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000010593 ##12 ENSACLG00000010832 #7 ENSACLG00000010842 ENSACLG00000010851 ##12 ENSACLG00000010858 ##12 ENSACLG00000010875 ##12 pcdh2ac (ENSACLG00000010885) #26 ENSACLG00000010910 #8 ENSACLG00000010945 ENSACLG00000010956 #12 ENSACLG00000010963 #12 ENSACLG00000010982 #12 ENSACLG00000010995 #9 ENSACLG00000011008 #12 ENSACLG00000011017 ##25 ENSACLG00000011028 #15 ENSACLG00000011046 ##25 ENSACLG00000011053 ##25 ENSACLG00000011068 ##25 ENSACLG00000011086 #20 ENSACLG00000011091 ##25 ENSACLG00000011099 #19 ENSACLG00000011102 #21 ENSACLG00000011124 ##25 ENSACLG00000011157 #25 ENSACLG00000011178 #25 ENSACLG00000011363 ##25 pcdh2ab8 (ENSACLG00000011367) ##25 ENSACLG00000011696 #35 ENSACLG00000011712 #35 ENSACLG00000011729 #35 Zebra mbuna DUPLICATION Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005000694 ##12 ENSMZEG00005000708 ENSMZEG00005000745 ##12 ENSMZEG00005000832 ENSMZEG00005000843 #7 ENSMZEG00005000854 ##12 ENSMZEG00005000870 #8 ENSMZEG00005000894 #8 ENSMZEG00005000946 #9 ENSMZEG00005000958 ENSMZEG00005000982 #12 ENSMZEG00005000994 #12 ENSMZEG00005001006 #12 ENSMZEG00005001024 #15 ENSMZEG00005001048 ##25 ENSMZEG00005001068 #15 ENSMZEG00005001074 ##25 ENSMZEG00005001087 ##25 ENSMZEG00005001112 #19 ENSMZEG00005001122 #21 ENSMZEG00005001133 #21 ENSMZEG00005001148 ##25 ENSMZEG00005001175 #25 ENSMZEG00005001191 ENSMZEG00005001204 #25 ENSMZEG00005001496 ##25 ENSMZEG00005001585 ##25 pcdh2ac (ENSMZEG00005001600) #26 ENSMZEG00005001606 #35 ENSMZEG00005001612 #35 ENSMZEG00005001626 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005000652 ENSMZEG00005000675 ##12 ENSMZEG00005000694 ##12 ENSMZEG00005000708 ENSMZEG00005000745 ##12 ENSMZEG00005000832 ENSMZEG00005000843 #7 ENSMZEG00005000854 ##12 ENSMZEG00005000870 #8 ENSMZEG00005000894 #8 ENSMZEG00005000946 #9 ENSMZEG00005000958 ENSMZEG00005000982 #12 ENSMZEG00005000994 #12 ENSMZEG00005001006 #12 ENSMZEG00005001024 #15 ENSMZEG00005001048 ##25 ENSMZEG00005001068 #15 ENSMZEG00005001074 ##25 ENSMZEG00005001087 ##25 ENSMZEG00005001112 #19 ENSMZEG00005001122 #21 ENSMZEG00005001133 #21 ENSMZEG00005001148 ##25 ENSMZEG00005001175 #25 ENSMZEG00005001191 ENSMZEG00005001204 #25 ENSMZEG00005001496 ##25 ENSMZEG00005001585 ##25 pcdh2ac (ENSMZEG00005001600) #26 ENSMZEG00005001606 #35 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 110 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 Spiny chromis MODERN SPECIES 3678 ENSAPOG00000022117 #15 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.v.b ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l.a.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l.a.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b.f.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b.f.a #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.o.a.a.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.o.a.b #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.o.b #35 Clown anemonefish MODERN SPECIES 1335 ENSAOCG00000010182 #8 ENSAOCG00000010194 #8 ENSAOCG00000002009 #12 ENSAOCG00000010226 #12 ENSAOCG00000002555 ##25 ENSAOCG00000010257 #15 ENSAOCG00000010271 ##25 ENSAOCG00000010281 ##25 ENSAOCG00000010293 #19 ENSAOCG00000010312 ENSAOCG00000002556 #21 ENSAOCG00000010336 #25 ENSAOCG00000000647 #25 ENSAOCG00000010495 #25 pcdh2ab10 (ENSAOCG00000010528) ##25 pcdh2ac (ENSAOCG00000010573) #26 ENSAOCG00000010594 ENSAOCG00000010607 Orange clownfish MODERN SPECIES 4 ENSAPEG00000014852 ##12 ENSAPEG00000014837 ##12 ENSAPEG00000014817 ##12 ENSAPEG00000014792 ##12 ENSAPEG00000014772 ##12 ENSAPEG00000014759 #8 ENSAPEG00000014713 #9 ENSAPEG00000014699 #12 ENSAPEG00000014660 #12 ENSAPEG00000014647 ENSAPEG00000014641 #20 ENSAPEG00000014628 ##25 ENSAPEG00000014619 ##25 ENSAPEG00000014614 #20 ENSAPEG00000014604 ##25 ENSAPEG00000014585 #15 ENSAPEG00000014572 ##25 ENSAPEG00000014557 #19 ENSAPEG00000014543 ENSAPEG00000014528 #21 ENSAPEG00000014520 #23 ENSAPEG00000014312 #25 ENSAPEG00000014282 #27 ENSAPEG00000014133 #25 pcdh2ac (ENSAPEG00000014114) #26 ENSAPEG00000014085 #35 ENSAPEG00000014079 #35 ENSAPEG00000014053 #35 ENSAPEG00000014040 ENSAPEG00000014011 #35 ENSAPEG00000013996 #35 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 56 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01100000264899 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b.h #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01100000264899 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000160554.b #26 Carangaria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000177060 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a ##12 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b.h #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.f #37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000177060 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a ##12 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b.h #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.f #37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.k ##37 Seriola DUPLICATION Seriola ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.t.a ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.u ENSGT00940000164725.a.a.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.e.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.e.b ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a.e #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a.b #35 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 Greater amberjack MODERN SPECIES 361 ENSSDUG00000002615 #20 ENSSDUG00000002604 ##25 ENSSDUG00000002590 #15 ENSSDUG00000002568 #15 Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3259 ENSSLDG00000001638 ENSSLDG00000001620 ENSSLDG00000001614 ##12 ENSSLDG00000001589 ENSSLDG00000001573 ENSSLDG00000001476 ##12 ENSSLDG00000001456 ENSSLDG00000001401 ##12 ENSSLDG00000001370 ENSSLDG00000001326 #9 ENSSLDG00000001304 #12 ENSSLDG00000001283 ##12 ENSSLDG00000001262 #20 ENSSLDG00000001252 #9 ENSSLDG00000001232 ##25 ENSSLDG00000001211 #15 ENSSLDG00000001175 ##25 ENSSLDG00000001165 #19 ENSSLDG00000001154 ENSSLDG00000001128 #23 ENSSLDG00000001120 #21 ENSSLDG00000001101 ENSSLDG00000001084 #25 ENSSLDG00000001052 #25 ENSSLDG00000001036 ##25 pcdh2ac (ENSSLDG00000000958) #26 ENSSLDG00000000897 #35 ENSSLDG00000000862 #35 ENSSLDG00000000787 #35 ENSSLDG00000000448 #36 ENSSLDG00000000422 ##37 Seriola ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a.f #15 Greater amberjack MODERN SPECIES 361 ENSSDUG00000002615 #20 ENSSDUG00000002604 ##25 ENSSDUG00000002590 #15 ENSSDUG00000002568 #15 Barramundi perch MODERN SPECIES 127 ENSLCAG00010002511 ENSLCAG00010002508 ENSLCAG00010002505 ##12 ENSLCAG00010002501 ##12 ENSLCAG00010002497 ENSLCAG00010002494 ENSLCAG00010002490 ENSLCAG00010002486 ##12 ENSLCAG00010002482 #11 ENSLCAG00010002479 #12 ENSLCAG00010002477 ENSLCAG00010002476 #12 ENSLCAG00010002474 #12 ENSLCAG00010002472 ENSLCAG00010002470 ##25 ENSLCAG00010002469 #15 ENSLCAG00010002463 ##25 ENSLCAG00010002459 ##25 ENSLCAG00010002458 ##25 ENSLCAG00010002454 ##25 ENSLCAG00010002451 #25 ENSLCAG00010002447 #25 ENSLCAG00010002446 ##25 pcdh2ac (ENSLCAG00010002441) #26 ENSLCAG00010002440 #35 ENSLCAG00010002439 #35 ENSLCAG00010002434 #35 ENSLCAG00010002433 #35 ENSLCAG00010002430 ##37 Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b.h #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01100000264899 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000181572 ENSGT00940000164468.a.a.a.a ENSGT00940000165759.a.b Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b.h #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01100000264899 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000164468.a.a.a.a ENSGT00940000165759.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.b ENSGT00940000166867 ENSGT00940000165759.a.a ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.a.a.a.c.b ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.a.a.b.b.a.a ENSGT00940000164468.a.a.b.a.b.c.b ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.a.a.b.a Climbing perch DUPLICATION Climbing perch DUPLICATION Climbing perch MODERN SPECIES 1 ENSATEG00000009721 ENSATEG00000009754 ENSATEG00000009797 ENSATEG00000028437 ENSATEG00000009868 ##12 ENSATEG00000009920 #8 ENSATEG00000026867 #8 ENSATEG00000029287 #11 ENSATEG00000009934 #12 ENSATEG00000026331 #12 ENSATEG00000009989 #12 ENSATEG00000009995 ENSATEG00000010011 ##12 ENSATEG00000010033 #20 ENSATEG00000010050 #15 ENSATEG00000010083 #15 ENSATEG00000010146 #15 ENSATEG00000010272 #23 ENSATEG00000010199 ENSATEG00000010216 ENSATEG00000010266 ENSATEG00000027862 ##25 ENSATEG00000026440 #35 ENSATEG00000028985 #35 ENSATEG00000010434 #35 ENSATEG00000025547 #35 ENSATEG00000028351 #35 ENSATEG00000028288 #35 ENSATEG00000026496 #36 ENSATEG00000025685 ##37 ENSATEG00000010489 ##37 Climbing perch MODERN SPECIES 1 fgf18a (ENSATEG00000030153) ENSATEG00000009721 ENSATEG00000009754 ENSATEG00000009797 ENSATEG00000028437 ENSATEG00000009868 ##12 ENSATEG00000009920 #8 ENSATEG00000026867 #8 ENSATEG00000029287 #11 ENSATEG00000009934 #12 ENSATEG00000026331 #12 ENSATEG00000009989 #12 ENSATEG00000009995 ENSATEG00000010011 ##12 ENSATEG00000010033 #20 ENSATEG00000010050 #15 ENSATEG00000010083 #15 ENSATEG00000010146 #15 ENSATEG00000010272 #23 ENSATEG00000010199 ENSATEG00000010216 ENSATEG00000010266 ENSATEG00000027862 ##25 ENSATEG00000026440 #35 ENSATEG00000028985 #35 ENSATEG00000010434 #35 ENSATEG00000025547 #35 ENSATEG00000028351 #35 ENSATEG00000028288 #35 ENSATEG00000026496 #36 ENSATEG00000025685 ##37 Climbing perch MODERN SPECIES 1 ENSATEG00000009754 ENSATEG00000009797 ENSATEG00000028437 ENSATEG00000009868 ##12 ENSATEG00000009920 #8 ENSATEG00000026867 #8 ENSATEG00000029287 #11 ENSATEG00000009934 #12 ENSATEG00000026331 #12 ENSATEG00000009989 #12 ENSATEG00000009995 ENSATEG00000010011 ##12 ENSATEG00000010033 #20 ENSATEG00000010050 #15 ENSATEG00000010083 #15 ENSATEG00000010146 #15 ENSATEG00000010272 #23 ENSATEG00000010199 ENSATEG00000010216 ENSATEG00000010266 ENSATEG00000027862 ##25 ENSATEG00000026440 #35 ENSATEG00000028985 #35 ENSATEG00000010434 #35 ENSATEG00000025547 #35 ENSATEG00000028351 #35 ENSATEG00000028288 #35 ENSATEG00000026496 #36 ENSATEG00000025685 ##37 ENSATEG00000010489 ##37 ENSATEG00000029727 ##37 Zig-zag eel DUPLICATION Zig-zag eel MODERN SPECIES 1 ENSMAMG00000028517 ENSMAMG00000005132 ENSMAMG00000005120 ENSMAMG00000025285 ENSMAMG00000028262 ##12 ENSMAMG00000005084 ##12 ENSMAMG00000028444 ##12 ENSMAMG00000005059 ENSMAMG00000004908 #8 ENSMAMG00000004869 ENSMAMG00000025351 #12 ENSMAMG00000026543 #12 ENSMAMG00000028695 ENSMAMG00000004797 #20 ENSMAMG00000024580 ##25 ENSMAMG00000026967 #15 ENSMAMG00000004622 #15 ENSMAMG00000004617 ENSMAMG00000026670 #21 ENSMAMG00000024788 ##25 ENSMAMG00000004456 #25 ENSMAMG00000025800 ##37 ENSMAMG00000026498 #35 ENSMAMG00000004396 #35 ENSMAMG00000004391 #18 ENSMAMG00000004045 #33 ENSMAMG00000026949 #36 ENSMAMG00000028733 ##37 ENSMAMG00000026871 ##37 ENSMAMG00000027401 ##37 ENSMAMG00000004029 ##37 Zig-zag eel MODERN SPECIES 1 ENSMAMG00000005132 ENSMAMG00000005120 ENSMAMG00000025285 ENSMAMG00000028262 ##12 ENSMAMG00000005084 ##12 ENSMAMG00000028444 ##12 ENSMAMG00000005059 ENSMAMG00000004908 #8 ENSMAMG00000004869 ENSMAMG00000025351 #12 ENSMAMG00000026543 #12 ENSMAMG00000028695 ENSMAMG00000004797 #20 ENSMAMG00000024580 ##25 ENSMAMG00000026967 #15 ENSMAMG00000004622 #15 ENSMAMG00000004617 ENSMAMG00000026670 #21 ENSMAMG00000024788 ##25 ENSMAMG00000004456 #25 ENSMAMG00000025800 ##37 ENSMAMG00000026498 #35 ENSMAMG00000004396 #35 ENSMAMG00000004391 #18 ENSMAMG00000004045 #33 ENSMAMG00000026949 #36 ENSMAMG00000028733 ##37 ENSMAMG00000026871 ##37 ENSMAMG00000027401 ##37 ENSMAMG00000004029 ##37 ENSMAMG00000027892 ##37 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT01010000224686 ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000178344 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000157352.b ENSGT00390000000002.a.a.a.nb.a ENSGT00390000002137 ENSGT00940000166070 ENSGT00940000158371 ENSGT00390000009004.d ENSGT00940000155898 ENSGT00940000159553.b ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00990000205184 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.r #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000165759.b.a.b.a.a.b.p ENSGT00940000165759.b.a.b.a.b ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.a.a.b.a ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.a.a.b.b.a.a ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.a.a.a.c.a ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.a.a.b.b.a.b.b.a ENSGT00940000164983.d.a.a.a.b ENSGT00940000164983.d.a.a.a.a.a.b Fugu MODERN SPECIES 5 ENSTRUG00000001739 #7 ENSTRUG00000028874 ENSTRUG00000001724 ##12 ENSTRUG00000020114 ENSTRUG00000001035 ##12 ENSTRUG00000029711 ENSTRUG00000023244 #12 ENSTRUG00000021621 #12 ENSTRUG00000033047 ENSTRUG00000023579 #12 ENSTRUG00000027859 ENSTRUG00000021733 #12 ENSTRUG00000028834 ENSTRUG00000033286 ENSTRUG00000025468 #20 ENSTRUG00000025673 #15 ENSTRUG00000025647 ##25 ENSTRUG00000028370 ##25 ENSTRUG00000023702 #25 pcdh2ac (ENSTRUG00000025164) #26 ENSTRUG00000019736 #35 ENSTRUG00000023463 #35 ENSTRUG00000002066 #35 ENSTRUG00000023622 #36 ENSTRUG00000032017 #36 ENSTRUG00000023371 #37 ENSTRUG00000032477 ENSTRUG00000032190 ENSTRUG00000021983 ENSTRUG00000030010 ENSTRUG00000014108 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.b #12 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.b #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.`b #25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.r #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000159725 ENSGT00940000165759.b.a.a Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT01010000224686 ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.j ##12 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.b #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.`b #25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000155898 ENSGT00940000159553.b ENSGT01010000224686 ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.j ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01100000264899 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.`b #25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.f #37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 fbxw11a (ENSSAUG00010004669) fgf18a (ENSSAUG00010004678) ENSSAUG00010004682 ENSSAUG00010004685 ENSSAUG00010004689 ENSSAUG00010004690 ENSSAUG00010004699 ##12 ENSSAUG00010004703 ##12 ENSSAUG00010004705 #8 ENSSAUG00010004707 #12 ENSSAUG00010004714 #12 ENSSAUG00010004718 ENSSAUG00010004720 #12 ENSSAUG00010004722 #12 ENSSAUG00010004724 #15 ENSSAUG00010004734 #15 ENSSAUG00010004736 #15 ENSSAUG00010004738 ENSSAUG00010004742 ##25 ENSSAUG00010004745 #23 ENSSAUG00010004748 #23 ENSSAUG00010004749 ENSSAUG00010004750 #25 ENSSAUG00010004752 #25 ENSSAUG00010004753 #25 ENSSAUG00010004755 ##25 ENSSAUG00010004757 #27 ENSSAUG00010004761 #35 ENSSAUG00010004762 #35 ENSSAUG00010004765 #29 ENSSAUG00010004768 ##37 Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 fgf18a (ENSSAUG00010004678) ENSSAUG00010004682 ENSSAUG00010004685 ENSSAUG00010004689 ENSSAUG00010004690 ENSSAUG00010004699 ##12 ENSSAUG00010004703 ##12 ENSSAUG00010004705 #8 ENSSAUG00010004707 #12 ENSSAUG00010004714 #12 ENSSAUG00010004718 ENSSAUG00010004720 #12 ENSSAUG00010004722 #12 ENSSAUG00010004724 #15 ENSSAUG00010004734 #15 ENSSAUG00010004736 #15 ENSSAUG00010004738 ENSSAUG00010004742 ##25 ENSSAUG00010004745 #23 ENSSAUG00010004748 #23 ENSSAUG00010004749 ENSSAUG00010004750 #25 ENSSAUG00010004752 #25 ENSSAUG00010004753 #25 ENSSAUG00010004755 ##25 ENSSAUG00010004757 #27 ENSSAUG00010004761 #35 ENSSAUG00010004762 #35 ENSSAUG00010004765 #29 ENSSAUG00010004768 ##37 ENSSAUG00010004772 ##37 Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 etf1a (ENSSAUG00010004652) fbxw11a (ENSSAUG00010004669) fgf18a (ENSSAUG00010004678) ENSSAUG00010004682 ENSSAUG00010004685 ENSSAUG00010004689 ENSSAUG00010004690 ENSSAUG00010004699 ##12 ENSSAUG00010004703 ##12 ENSSAUG00010004705 #8 ENSSAUG00010004707 #12 ENSSAUG00010004714 #12 ENSSAUG00010004718 ENSSAUG00010004720 #12 ENSSAUG00010004722 #12 ENSSAUG00010004724 #15 ENSSAUG00010004734 #15 ENSSAUG00010004736 #15 ENSSAUG00010004738 ENSSAUG00010004742 ##25 ENSSAUG00010004745 #23 ENSSAUG00010004748 #23 ENSSAUG00010004749 ENSSAUG00010004750 #25 ENSSAUG00010004752 #25 ENSSAUG00010004753 #25 ENSSAUG00010004755 ##25 ENSSAUG00010004757 #27 ENSSAUG00010004761 #35 ENSSAUG00010004762 #35 ENSSAUG00010004765 #29 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000002137 ENSGT00940000166070 ENSGT00940000158371 ENSGT00390000009004.d ENSGT00940000155898 ENSGT00940000159553.b ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.a #25 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.b #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 112 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 Lumpfish MODERN SPECIES 1 fgf18a (ENSCLMG00005017305) ENSCLMG00005017311 ENSCLMG00005017313 ENSCLMG00005017316 ENSCLMG00005017319 pcdh2aa1 (ENSCLMG00005017320) ##12 ENSCLMG00005017322 ENSCLMG00005017323 ##12 ENSCLMG00005017325 ENSCLMG00005017327 ENSCLMG00005017329 #8 ENSCLMG00005017333 #12 ENSCLMG00005001287 #12 ENSCLMG00005001296 #12 ENSCLMG00005001399 ##25 ENSCLMG00005001636 #15 ENSCLMG00005001644 #19 ENSCLMG00005001653 #21 ENSCLMG00005001663 ENSCLMG00005001671 ##25 ENSCLMG00005001678 ENSCLMG00005001688 #25 ENSCLMG00005001698 #27 pcdh2ac (ENSCLMG00005001736) #26 ENSCLMG00005001878 #35 ENSCLMG00005001881 #35 ENSCLMG00005001886 #35 ENSCLMG00005001887 #35 ENSCLMG00005001890 #35 ENSCLMG00005001891 #35 ENSCLMG00005001894 #33 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 106 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 Pike perch DUPLICATION Pike perch DUPLICATION Pike perch MODERN SPECIES 18 ENSSLUG00000000254 ENSSLUG00000000246 ENSSLUG00000000243 ENSSLUG00000004894 pcdh2aa1 (ENSSLUG00000004874) ##12 ENSSLUG00000004868 ##12 ENSSLUG00000004866 ##12 ENSSLUG00000004863 ENSSLUG00000004862 ENSSLUG00000004857 ##12 ENSSLUG00000004846 #8 ENSSLUG00000004828 #9 ENSSLUG00000004815 #12 ENSSLUG00000004811 #20 ENSSLUG00000004807 #15 ENSSLUG00000004799 #15 ENSSLUG00000004793 ##25 ENSSLUG00000004785 #15 ENSSLUG00000004756 #23 ENSSLUG00000004748 ##25 ENSSLUG00000004735 #25 pcdh2ac (ENSSLUG00000004719) #26 ENSSLUG00000004703 #35 ENSSLUG00000004697 #29 ENSSLUG00000004693 #35 ENSSLUG00000004688 #35 ENSSLUG00000004680 #35 ENSSLUG00000004678 #27 ENSSLUG00000004673 #33 ENSSLUG00000004655 #36 ENSSLUG00000004651 ##37 Pike perch MODERN SPECIES 18 ENSSLUG00000000243 ENSSLUG00000004894 pcdh2aa1 (ENSSLUG00000004874) ##12 ENSSLUG00000004868 ##12 ENSSLUG00000004866 ##12 ENSSLUG00000004863 ENSSLUG00000004862 ENSSLUG00000004857 ##12 ENSSLUG00000004846 #8 ENSSLUG00000004828 #9 ENSSLUG00000004815 #12 ENSSLUG00000004811 #20 ENSSLUG00000004807 #15 ENSSLUG00000004799 #15 ENSSLUG00000004793 ##25 ENSSLUG00000004785 #15 ENSSLUG00000004756 #23 ENSSLUG00000004748 ##25 ENSSLUG00000004735 #25 pcdh2ac (ENSSLUG00000004719) #26 ENSSLUG00000004703 #35 ENSSLUG00000004697 #29 ENSSLUG00000004693 #35 ENSSLUG00000004688 #35 ENSSLUG00000004680 #35 ENSSLUG00000004678 #27 ENSSLUG00000004673 #33 ENSSLUG00000004655 #36 ENSSLUG00000004651 ##37 ENSSLUG00000004650 ##37 ENSSLUG00000004645 #35 Pike perch MODERN SPECIES 18 fgf18a (ENSSLUG00000000260) ENSSLUG00000000254 ENSSLUG00000000246 ENSSLUG00000000243 ENSSLUG00000004894 pcdh2aa1 (ENSSLUG00000004874) ##12 ENSSLUG00000004868 ##12 ENSSLUG00000004866 ##12 ENSSLUG00000004863 ENSSLUG00000004862 ENSSLUG00000004857 ##12 ENSSLUG00000004846 #8 ENSSLUG00000004828 #9 ENSSLUG00000004815 #12 ENSSLUG00000004811 #20 ENSSLUG00000004807 #15 ENSSLUG00000004799 #15 ENSSLUG00000004793 ##25 ENSSLUG00000004785 #15 ENSSLUG00000004756 #23 ENSSLUG00000004748 ##25 ENSSLUG00000004735 #25 pcdh2ac (ENSSLUG00000004719) #26 ENSSLUG00000004703 #35 ENSSLUG00000004697 #29 ENSSLUG00000004693 #35 ENSSLUG00000004688 #35 ENSSLUG00000004680 #35 ENSSLUG00000004678 #27 ENSSLUG00000004673 #33 ENSSLUG00000004655 #36 Pinecone sodierfish DUPLICATION Pinecone sodierfish DUPLICATION Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 1 ENSMMDG00005002658 ENSMMDG00005002666 ENSMMDG00005002675 ENSMMDG00005002691 ENSMMDG00005002702 ##12 ENSMMDG00005002712 ##12 ENSMMDG00005002716 ENSMMDG00005002722 #7 ENSMMDG00005002746 #8 ENSMMDG00005002771 #9 ENSMMDG00005002794 #10 ENSMMDG00005002799 #11 ENSMMDG00005002805 #12 ENSMMDG00005002823 #13 ENSMMDG00005002843 #14 ENSMMDG00005002929 #15 ENSMMDG00005002938 #16 ENSMMDG00005002943 #17 ENSMMDG00005002947 #18 ENSMMDG00005002957 #19 ENSMMDG00005002973 #20 ENSMMDG00005002981 #21 ENSMMDG00005002984 #22 ENSMMDG00005002989 #23 ENSMMDG00005002994 #24 ENSMMDG00005003000 #25 pcdh2ac (ENSMMDG00005003028) #26 ENSMMDG00005003176 #27 ENSMMDG00005003181 #28 ENSMMDG00005003194 #29 ENSMMDG00005003201 #30 Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 1 ENSMMDG00005002630 ENSMMDG00005002658 ENSMMDG00005002666 ENSMMDG00005002675 ENSMMDG00005002691 ENSMMDG00005002702 ##12 ENSMMDG00005002712 ##12 ENSMMDG00005002716 ENSMMDG00005002722 #7 ENSMMDG00005002746 #8 ENSMMDG00005002771 #9 ENSMMDG00005002794 #10 ENSMMDG00005002799 #11 ENSMMDG00005002805 #12 ENSMMDG00005002823 #13 ENSMMDG00005002843 #14 ENSMMDG00005002929 #15 ENSMMDG00005002938 #16 ENSMMDG00005002943 #17 ENSMMDG00005002947 #18 ENSMMDG00005002957 #19 ENSMMDG00005002973 #20 ENSMMDG00005002981 #21 ENSMMDG00005002984 #22 ENSMMDG00005002989 #23 ENSMMDG00005002994 #24 ENSMMDG00005003000 #25 pcdh2ac (ENSMMDG00005003028) #26 ENSMMDG00005003176 #27 ENSMMDG00005003181 #28 ENSMMDG00005003194 #29 Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 1 fgf18a (ENSMMDG00005002597) ENSMMDG00005002630 ENSMMDG00005002658 ENSMMDG00005002666 ENSMMDG00005002675 ENSMMDG00005002691 ENSMMDG00005002702 ##12 ENSMMDG00005002712 ##12 ENSMMDG00005002716 ENSMMDG00005002722 #7 ENSMMDG00005002746 #8 ENSMMDG00005002771 #9 ENSMMDG00005002794 #10 ENSMMDG00005002799 #11 ENSMMDG00005002805 #12 ENSMMDG00005002823 #13 ENSMMDG00005002843 #14 ENSMMDG00005002929 #15 ENSMMDG00005002938 #16 ENSMMDG00005002943 #17 ENSMMDG00005002947 #18 ENSMMDG00005002957 #19 ENSMMDG00005002973 #20 ENSMMDG00005002981 #21 ENSMMDG00005002984 #22 ENSMMDG00005002989 #23 ENSMMDG00005002994 #24 ENSMMDG00005003000 #25 pcdh2ac (ENSMMDG00005003028) #26 ENSMMDG00005003176 #27 ENSMMDG00005003181 #28 Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.a.b.g.a.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.a ##12 ENSGT00940000164725.a.a.b.h ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.b.g.b ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.a.b.i.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.a #25 ENSGT01020000230605.d ENSGT00940000165118.a.a.a.b.j ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.b ##25 ENSGT01100000264435 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.b #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.f #25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.i.b.a.a.a.b #30 ENSGT00940000156683 ENSGT00940000164468.a.a.a.a ENSGT00940000165759 ENSGT01060000248675 ENSGT00940000164468.a.a.b.b ENSGT00940000164468.a.b.a.b ENSGT00940000164983.d.b ENSGT00940000164983.d.a.a.d.a ENSGT00940000163777.a ENSGT00940000159910 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 1873 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.b.b #25 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 779 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.b.b #25 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 189 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.b.b #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.a.a.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.f #25 ENSGT00940000160554.b.b #26 ENSGT00940000166432.d.i.b.b.a.a #30 Rainbow trout DUPLICATION Rainbow trout MODERN SPECIES 23 ENSOMYG00000029960 ENSOMYG00000029771 ENSOMYG00000029659 ENSOMYG00000068350 ENSOMYG00000058810 ENSOMYG00000053318 ENSOMYG00000029557 etf1a (ENSOMYG00000029512) fbxw11a (ENSOMYG00000029481) fgf18a (ENSOMYG00000070472) ENSOMYG00000029328 ENSOMYG00000067822 ENSOMYG00000029300 ENSOMYG00000058400 ##12 ENSOMYG00000029256 ##12 ENSOMYG00000052894 #15 ENSOMYG00000055661 #25 ENSOMYG00000014188 #25 ENSOMYG00000029205 ##12 ENSOMYG00000049642 #30 ENSOMYG00000068998 #30 ENSOMYG00000028971 #30 ENSOMYG00000057216 #30 ENSOMYG00000028955 ENSOMYG00000029034 #30 ENSOMYG00000066599 ENSOMYG00000055471 #30 ENSOMYG00000028656 ENSOMYG00000028646 ENSOMYG00000028588 ENSOMYG00000028597 Rainbow trout MODERN SPECIES 5 chrna9 (ENSOMYG00000004143) NSUN7 (ENSOMYG00000004095) APBB2 (ENSOMYG00000004030) ENSOMYG00000004005 bicc2 (ENSOMYG00000003957) ENSOMYG00000003889 etf1a (ENSOMYG00000003831) fbxw11a (ENSOMYG00000003651) fgf18a (ENSOMYG00000074698) ENSOMYG00000003429 ENSOMYG00000067496 ENSOMYG00000014270 ENSOMYG00000073966 ##12 ENSOMYG00000014233 ENSOMYG00000066180 ##12 ENSOMYG00000014209 #15 ENSOMYG00000014216 #18 ENSOMYG00000014194 #25 ENSOMYG00000050218 ENSOMYG00000014181 pcdh2ac (ENSOMYG00000014118) #26 ENSOMYG00000028940 ENSOMYG00000014078 ENSOMYG00000013998 ENSOMYG00000060650 ENSOMYG00000013987 ENSOMYG00000054583 ENSOMYG00000013971 ENSOMYG00000013957 ENSOMYG00000053259 ENSOMYG00000058034 Northern pike MODERN SPECIES 3 ENSELUG00000018755 bicc2 (ENSELUG00000018740) SPOCK1 (ENSELUG00000018715) etf1a (ENSELUG00000018668) fbxw11a (ENSELUG00000018591) fgf18a (ENSELUG00000018447) ENSELUG00000018411 ENSELUG00000018402 ENSELUG00000018394 ENSELUG00000028568 ENSELUG00000018382 ENSELUG00000018313 ##12 ENSELUG00000032563 ENSELUG00000018162 ##12 ENSELUG00000028092 ENSELUG00000029025 #15 ENSELUG00000026095 ENSELUG00000000741 ##25 ENSELUG00000018100 ##25 ENSELUG00000030369 ##25 ENSELUG00000018036 #25 ENSELUG00000018006 ENSELUG00000032665 ##25 ENSELUG00000018000 ##25 ENSELUG00000033843 #30 ENSELUG00000027397 #30 pcdh1g31 (ENSELUG00000017950) ENSELUG00000026183 #30 ENSELUG00000017927 ENSELUG00000028255 ENSELUG00000026213 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b #19 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b #19 Euacanthomorphacea DUPLICATION Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000159553.b ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a ENSGT00940000164725.a.a.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b ##12 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.a ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b #37 Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 1 ENSMMDG00005002702 ##12 ENSMMDG00005002712 ##12 ENSMMDG00005002716 ENSMMDG00005002722 #7 ENSMMDG00005002746 #8 ENSMMDG00005002771 #9 ENSMMDG00005002794 #10 ENSMMDG00005002799 #11 ENSMMDG00005002805 #12 ENSMMDG00005002823 #13 ENSMMDG00005002843 #14 ENSMMDG00005002929 #15 ENSMMDG00005002938 #16 ENSMMDG00005002943 #17 ENSMMDG00005002947 #18 ENSMMDG00005002957 #19 ENSMMDG00005002973 #20 ENSMMDG00005002981 #21 ENSMMDG00005002984 #22 ENSMMDG00005002989 #23 ENSMMDG00005002994 #24 ENSMMDG00005003000 #25 pcdh2ac (ENSMMDG00005003028) #26 ENSMMDG00005003176 #27 ENSMMDG00005003181 #28 ENSMMDG00005003194 #29 ENSMMDG00005003201 #30 ENSMMDG00005003206 #31 ENSMMDG00005003210 #32 ENSMMDG00005003219 #33 ENSMMDG00005003228 #34 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 102 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000178344 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b #37 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000177513.a Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000165759.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.a.b Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 Oryzias ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000156077.g.a ENSGT00390000000002.a.a.a.nb.a ENSGT00390000002137 ENSGT00940000166070 ENSGT00940000158371 ENSGT01030000234599.a.b.c ENSGT00390000009004.d ENSGT00940000155898 ENSGT00940000159553.b ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.`b.b.b ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a.d ##25 ENSGT01030000236108 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a.c ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.b.b.b.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.b.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.h ##37 ENSGT00970000195503 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.b.a #35 Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.`b.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.`b.a ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.z ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.b ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.l #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT01030000236108 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a.c ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.b.b.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.b.b.b.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.b.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.h ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.i ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b.e ##37 Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 1 ENSORLG00000022127 ENSORLG00000028462 ENSORLG00000023399 pcdh2aa1 (ENSORLG00000021994) ##12 ENSORLG00000028629 ##12 ENSORLG00000028208 ##12 ENSORLG00000030495 ENSORLG00000022312 #8 ENSORLG00000028903 #11 ENSORLG00000004181 #12 ENSORLG00000027606 ##12 ENSORLG00000029528 ENSORLG00000026864 ##25 ENSORLG00000026652 ENSORLG00000029341 ##25 ENSORLG00000024772 #19 ENSORLG00000004176 #21 ENSORLG00000004171 #23 ENSORLG00000023815 ##25 ENSORLG00000026259 ENSORLG00000029952 #25 ENSORLG00000024089 #25 ENSORLG00000028645 ENSORLG00000024851 ##25 pcdh2ab10 (ENSORLG00000022081) ##25 pcdh2ac (ENSORLG00000029405) #26 ENSORLG00000025371 #35 ENSORLG00000026934 #35 ENSORLG00000025477 #35 ENSORLG00000030492 #35 ENSORLG00000024469 #35 Chinese medaka MODERN SPECIES 4074 ENSOSIG00000014268 #19 ENSOSIG00000014269 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000155898 ENSGT00940000159553.b ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.b ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000159725 Turquoise killifish MODERN SPECIES 554 ENSNFUG00015017386 ENSNFUG00015017372 #23 ENSNFUG00015017369 ENSNFUG00015017325 #19 ENSNFUG00015017319 #25 pcdh2ac (ENSNFUG00015017312) #26 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 99 etf1a (ENSKMAG00000009423) fbxw11a (ENSKMAG00000009338) fgf18a (ENSKMAG00000009296) ENSKMAG00000009286 ENSKMAG00000009276 ENSKMAG00000009266 ENSKMAG00000009260 ENSKMAG00000009251 ENSKMAG00000009232 pcdh2aa1 (ENSKMAG00000009189) ##12 ENSKMAG00000009160 ##12 ENSKMAG00000009148 ENSKMAG00000009114 ##12 ENSKMAG00000009069 ##12 ENSKMAG00000009055 ##25 ENSKMAG00000009036 #19 ENSKMAG00000009001 ##25 ENSKMAG00000008928 ##25 ENSKMAG00000008637 #21 ENSKMAG00000008569 #25 ENSKMAG00000008538 ##25 ENSKMAG00000008503 ##25 pcdh2ab8 (ENSKMAG00000008473) ##25 pcdh2ac (ENSKMAG00000008379) #26 ENSKMAG00000008313 #35 ENSKMAG00000008291 #35 ENSKMAG00000008252 ##37 ENSKMAG00000008210 ##37 ENSKMAG00000008192 ##37 ENSKMAG00000008161 ##37 ENSKMAG00000008140 #37 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00990000205184 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.g ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000178703 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 110 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.g ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000178703 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l.a.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b.f.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b.f.a #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.o.a.a.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.o.a.b #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.o.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.p #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.f.b ##37 Clown anemonefish DUPLICATION Clown anemonefish MODERN SPECIES 1335 ENSAOCG00000010182 #8 ENSAOCG00000010194 #8 ENSAOCG00000002009 #12 ENSAOCG00000010226 #12 ENSAOCG00000002555 ##25 ENSAOCG00000010257 #15 ENSAOCG00000010271 ##25 ENSAOCG00000010281 ##25 ENSAOCG00000010293 #19 ENSAOCG00000010312 ENSAOCG00000002556 #21 ENSAOCG00000010336 #25 ENSAOCG00000000647 #25 ENSAOCG00000010495 #25 pcdh2ab10 (ENSAOCG00000010528) ##25 pcdh2ac (ENSAOCG00000010573) #26 ENSAOCG00000010594 ENSAOCG00000010607 Clown anemonefish MODERN SPECIES 37 ENSAOCG00000022342 #20 ENSAOCG00000022346 ##25 ENSAOCG00000022352 ##25 ENSAOCG00000022364 ##25 ENSAOCG00000022389 #19 Orange clownfish MODERN SPECIES 4 ENSAPEG00000014817 ##12 ENSAPEG00000014792 ##12 ENSAPEG00000014772 ##12 ENSAPEG00000014759 #8 ENSAPEG00000014713 #9 ENSAPEG00000014699 #12 ENSAPEG00000014660 #12 ENSAPEG00000014647 ENSAPEG00000014641 #20 ENSAPEG00000014628 ##25 ENSAPEG00000014619 ##25 ENSAPEG00000014614 #20 ENSAPEG00000014604 ##25 ENSAPEG00000014585 #15 ENSAPEG00000014572 ##25 ENSAPEG00000014557 #19 ENSAPEG00000014543 ENSAPEG00000014528 #21 ENSAPEG00000014520 #23 ENSAPEG00000014312 #25 ENSAPEG00000014282 #27 ENSAPEG00000014133 #25 pcdh2ac (ENSAPEG00000014114) #26 ENSAPEG00000014085 #35 ENSAPEG00000014079 #35 ENSAPEG00000014053 #35 ENSAPEG00000014040 ENSAPEG00000014011 #35 ENSAPEG00000013996 #35 ENSAPEG00000013978 #33 ENSAPEG00000013946 #36 Spiny chromis DUPLICATION Spiny chromis MODERN SPECIES 4399 ENSAPOG00000010612 #19 Spiny chromis MODERN SPECIES 4387 ENSAPOG00000011134 #19 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 186 ENSGT00940000177004.d.b ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 190 ENSGT00940000177004.d.b ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004.d.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004.d.b ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00990000211570 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.y.a.b.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00990000205184 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.x #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.b.b ##37 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00990000205184 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000177004.d.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.w.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.x #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.b.b ##37 P. nyererei MODERN SPECIES 296 pcdh2aa1 (ENSPNYG00000001937) ##12 ENSPNYG00000001964 ENSPNYG00000001990 ##12 ENSPNYG00000002003 #7 ENSPNYG00000002015 ENSPNYG00000002026 ##12 ENSPNYG00000002050 ##12 ENSPNYG00000002073 #9 ENSPNYG00000002123 ENSPNYG00000002147 ENSPNYG00000002160 ##25 ENSPNYG00000002176 ##25 ENSPNYG00000002201 ##25 ENSPNYG00000002217 ##25 ENSPNYG00000002235 #20 ENSPNYG00000002244 #19 ENSPNYG00000002261 #23 ENSPNYG00000002272 #21 ENSPNYG00000002293 ##25 ENSPNYG00000002390 ##25 pcdh2ac (ENSPNYG00000002432) #26 ENSPNYG00000002474 #35 ENSPNYG00000002485 #35 ENSPNYG00000002501 #33 ENSPNYG00000002519 ENSPNYG00000002527 ##37 ENSPNYG00000002547 #35 ENSPNYG00000002559 ##37 ENSPNYG00000002580 ENSPNYG00000002596 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00990000205184 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000177004.d.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.w.b.a #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.x #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.m #25 ENSGT00940000178344 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.n #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005000832 ENSMZEG00005000843 #7 ENSMZEG00005000854 ##12 ENSMZEG00005000870 #8 ENSMZEG00005000894 #8 ENSMZEG00005000946 #9 ENSMZEG00005000958 ENSMZEG00005000982 #12 ENSMZEG00005000994 #12 ENSMZEG00005001006 #12 ENSMZEG00005001024 #15 ENSMZEG00005001048 ##25 ENSMZEG00005001068 #15 ENSMZEG00005001074 ##25 ENSMZEG00005001087 ##25 ENSMZEG00005001112 #19 ENSMZEG00005001122 #21 ENSMZEG00005001133 #21 ENSMZEG00005001148 ##25 ENSMZEG00005001175 #25 ENSMZEG00005001191 ENSMZEG00005001204 #25 ENSMZEG00005001496 ##25 ENSMZEG00005001585 ##25 pcdh2ac (ENSMZEG00005001600) #26 ENSMZEG00005001606 #35 ENSMZEG00005001612 #35 ENSMZEG00005001626 ENSMZEG00005001638 #35 ENSMZEG00005001643 #35 ENSMZEG00005001657 #35 Eastern happy MODERN SPECIES 11 pcdh2ac (ENSACLG00000010885) #26 ENSACLG00000010910 #8 ENSACLG00000010945 ENSACLG00000010956 #12 ENSACLG00000010963 #12 ENSACLG00000010982 #12 ENSACLG00000010995 #9 ENSACLG00000011008 #12 ENSACLG00000011017 ##25 ENSACLG00000011028 #15 ENSACLG00000011046 ##25 ENSACLG00000011053 ##25 ENSACLG00000011068 ##25 ENSACLG00000011086 #20 ENSACLG00000011091 ##25 ENSACLG00000011099 #19 ENSACLG00000011102 #21 ENSACLG00000011124 ##25 ENSACLG00000011157 #25 ENSACLG00000011178 #25 ENSACLG00000011363 ##25 pcdh2ab8 (ENSACLG00000011367) ##25 ENSACLG00000011696 #35 ENSACLG00000011712 #35 ENSACLG00000011729 #35 ENSACLG00000011758 #35 ENSACLG00000011766 #35 ENSACLG00000011774 #33 ENSACLG00000011784 ##37 ENSACLG00000011797 #36 ENSACLG00000011808 #35 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 501 pcdh2aa1 (ENSHBUG00000009276) ##12 ENSHBUG00000009287 ##12 ENSHBUG00000000235 ##12 ENSHBUG00000009323 ##12 ENSHBUG00000009334 #12 ENSHBUG00000009340 ##12 ENSHBUG00000009365 #7 ENSHBUG00000009372 ENSHBUG00000009382 ##12 ENSHBUG00000001186 #8 ENSHBUG00000009406 #8 ENSHBUG00000009423 #9 ENSHBUG00000009443 #12 ENSHBUG00000009453 #20 ENSHBUG00000009467 ##25 ENSHBUG00000009569 #19 ENSHBUG00000000251 ##25 Lyretail cichlid DUPLICATION Lyretail cichlid MODERN SPECIES 292 ENSNBRG00000007915 ENSNBRG00000007729 ##12 ENSNBRG00000007703 ENSNBRG00000007631 ##12 ENSNBRG00000007606 ##12 ENSNBRG00000007597 ##12 ENSNBRG00000007572 ENSNBRG00000007525 #8 ENSNBRG00000007507 ENSNBRG00000007498 #20 ENSNBRG00000007487 ##25 ENSNBRG00000007473 ##25 ENSNBRG00000007468 #20 ENSNBRG00000007438 #19 ENSNBRG00000007430 #20 ENSNBRG00000007284 #19 ENSNBRG00000007249 ENSNBRG00000007229 #21 ENSNBRG00000007214 pcdh2ac (ENSNBRG00000007023) #26 ENSNBRG00000006973 #35 ENSNBRG00000006965 ENSNBRG00000006928 ##37 ENSNBRG00000006776 ##37 PCDHGB4 (ENSNBRG00000006507) ENSNBRG00000006465 ENSNBRG00000006317 ENSNBRG00000006280 ENSNBRG00000006273 ENSNBRG00000006262 ENSNBRG00000006253 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 292 ENSNBRG00000008036 ENSNBRG00000007925 ENSNBRG00000007915 ENSNBRG00000007729 ##12 ENSNBRG00000007703 ENSNBRG00000007631 ##12 ENSNBRG00000007606 ##12 ENSNBRG00000007597 ##12 ENSNBRG00000007572 ENSNBRG00000007525 #8 ENSNBRG00000007507 ENSNBRG00000007498 #20 ENSNBRG00000007487 ##25 ENSNBRG00000007473 ##25 ENSNBRG00000007468 #20 ENSNBRG00000007438 #19 ENSNBRG00000007430 #20 ENSNBRG00000007284 #19 ENSNBRG00000007249 ENSNBRG00000007229 #21 ENSNBRG00000007214 pcdh2ac (ENSNBRG00000007023) #26 ENSNBRG00000006973 #35 ENSNBRG00000006965 ENSNBRG00000006928 ##37 ENSNBRG00000006776 ##37 PCDHGB4 (ENSNBRG00000006507) ENSNBRG00000006465 ENSNBRG00000006317 ENSNBRG00000006280 ENSNBRG00000006273 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.a ##12 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 162 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT01090000260158 #20 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 165 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT01090000260158 #20 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 151 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT01090000260158 #20 Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 169 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT01090000260158 #20 Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 150 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT01090000260212 Large yellow croaker MODERN SPECIES ENSLCRG00005000071 ENSLCRG00005000068 ENSLCRG00005000064 ENSLCRG00005000062 ENSLCRG00005000058 ENSLCRG00005000053 ENSLCRG00005017069 ENSLCRG00005017068 ##12 ENSLCRG00005017067 ENSLCRG00005017065 ENSLCRG00005017064 ENSLCRG00005017062 ENSLCRG00005017061 ENSLCRG00005017059 ENSLCRG00005017058 ##25 ENSLCRG00005017056 #19 ENSLCRG00005017053 #20 ENSLCRG00005017052 pcdh2ac (ENSLCRG00005017049) #26 ENSLCRG00005017046 #35 ENSLCRG00005017045 ##37 ENSLCRG00005017044 #35 ENSLCRG00005017043 ##37 ENSLCRG00005017042 ##37 ENSLCRG00005017041 #37 ENSLCRG00005017040 #37 ENSLCRG00005017039 ENSLCRG00005017038 ENSLCRG00005017037 ENSLCRG00005017036 ENSLCRG00005017035 Perciformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000156077.g.a ENSGT00940000157352.b ENSGT00390000000002.a.a.a.nb.a ENSGT00390000002137 ENSGT00940000166070 ENSGT00940000158371 ENSGT00390000009004.d ENSGT00940000155898 ENSGT00940000159553.b ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.b #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.f #37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000165759.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.a.b ENSGT00940000166867 ENSGT00940000165759.a.a Lumpfish MODERN SPECIES 1 ENSCLMG00005017311 ENSCLMG00005017313 ENSCLMG00005017316 ENSCLMG00005017319 pcdh2aa1 (ENSCLMG00005017320) ##12 ENSCLMG00005017322 ENSCLMG00005017323 ##12 ENSCLMG00005017325 ENSCLMG00005017327 ENSCLMG00005017329 #8 ENSCLMG00005017333 #12 ENSCLMG00005001287 #12 ENSCLMG00005001296 #12 ENSCLMG00005001399 ##25 ENSCLMG00005001636 #15 ENSCLMG00005001644 #19 ENSCLMG00005001653 #21 ENSCLMG00005001663 ENSCLMG00005001671 ##25 ENSCLMG00005001678 ENSCLMG00005001688 #25 ENSCLMG00005001698 #27 pcdh2ac (ENSCLMG00005001736) #26 ENSCLMG00005001878 #35 ENSCLMG00005001881 #35 ENSCLMG00005001886 #35 ENSCLMG00005001887 #35 ENSCLMG00005001890 #35 ENSCLMG00005001891 #35 ENSCLMG00005001894 #33 ENSCLMG00005001898 #37 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b.h #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01100000264899 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.r #35 Carangaria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b.h #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.f #37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000159725 Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 180 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 Tongue sole MODERN SPECIES 6 ENSCSEG00000006396 ENSCSEG00000006391 ENSCSEG00000006389 ENSCSEG00000006387 ENSCSEG00000006385 ENSCSEG00000006382 ENSCSEG00000006376 ENSCSEG00000006372 ENSCSEG00000006348 #7 ENSCSEG00000006344 ##12 ENSCSEG00000006338 ENSCSEG00000006336 ENSCSEG00000006331 #12 ENSCSEG00000006327 ENSCSEG00000006324 ##25 ENSCSEG00000006319 #19 ENSCSEG00000006317 #21 ENSCSEG00000006313 ENSCSEG00000006308 #25 ENSCSEG00000006307 ##25 ENSCSEG00000006302 #27 pcdh2ab8 (ENSCSEG00000006301) ##25 ENSCSEG00000006284 ##25 ENSCSEG00000006271 #35 ENSCSEG00000006267 ENSCSEG00000006266 #36 ENSCSEG00000006261 ##37 ENSCSEG00000006256 #36 ENSCSEG00000006249 ##37 ENSCSEG00000006245 ##37 ENSCSEG00000006244 #35 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b.h #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.f #37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.k ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000159725 ENSGT00940000165759.b.a.a Seriola ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.e.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.e.b ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a.e #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a.b #35 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.j.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.k ##37 Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3259 ENSSLDG00000001614 ##12 ENSSLDG00000001589 ENSSLDG00000001573 ENSSLDG00000001476 ##12 ENSSLDG00000001456 ENSSLDG00000001401 ##12 ENSSLDG00000001370 ENSSLDG00000001326 #9 ENSSLDG00000001304 #12 ENSSLDG00000001283 ##12 ENSSLDG00000001262 #20 ENSSLDG00000001252 #9 ENSSLDG00000001232 ##25 ENSSLDG00000001211 #15 ENSSLDG00000001175 ##25 ENSSLDG00000001165 #19 ENSSLDG00000001154 ENSSLDG00000001128 #23 ENSSLDG00000001120 #21 ENSSLDG00000001101 ENSSLDG00000001084 #25 ENSSLDG00000001052 #25 ENSSLDG00000001036 ##25 pcdh2ac (ENSSLDG00000000958) #26 ENSSLDG00000000897 #35 ENSSLDG00000000862 #35 ENSSLDG00000000787 #35 ENSSLDG00000000448 #36 ENSSLDG00000000422 ##37 ENSSLDG00000000410 ##37 ENSSLDG00000000240 ##37 Greater amberjack MODERN SPECIES 275 ENSSDUG00000017451 ##12 ENSSDUG00000017443 ENSSDUG00000017438 #8 ENSSDUG00000017428 ENSSDUG00000017418 #9 ENSSDUG00000017408 #12 ENSSDUG00000017385 #9 ENSSDUG00000017378 ENSSDUG00000017367 #20 ENSSDUG00000017348 ##25 ENSSDUG00000017340 #23 ENSSDUG00000017329 #20 ENSSDUG00000017321 #19 ENSSDUG00000017307 ##25 ENSSDUG00000017292 ##25 ENSSDUG00000017283 ##25 ENSSDUG00000017279 ENSSDUG00000017270 #21 ENSSDUG00000017263 ENSSDUG00000017252 ##25 pcdh2ac (ENSSDUG00000017069) #26 ENSSDUG00000017023 ##25 ENSSDUG00000017016 #35 ENSSDUG00000017009 #35 ENSSDUG00000016999 ##37 ENSSDUG00000016989 #35 ENSSDUG00000016984 ##37 ENSSDUG00000016964 ##37 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000177513.a ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000155898 ENSGT00940000159553.b ENSGT01010000224686 ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.r #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000159553.b ENSGT01010000224686 ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000178344 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.b #12 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.b #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.`b #25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.r #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000159725 Ballan wrasse MODERN SPECIES 182 ENSLBEG00000001554 ENSLBEG00000001616 ENSLBEG00000001631 ##12 ENSLBEG00000001659 ##12 ENSLBEG00000001691 ##12 ENSLBEG00000001700 ##12 ENSLBEG00000001716 #8 ENSLBEG00000001750 ##12 ENSLBEG00000001784 #12 ENSLBEG00000001817 ENSLBEG00000001840 #12 ENSLBEG00000001871 #12 ENSLBEG00000001911 #12 ENSLBEG00000001932 #12 ENSLBEG00000001969 ##12 ENSLBEG00000002011 ##25 ENSLBEG00000002048 ##25 ENSLBEG00000002071 ##25 ENSLBEG00000002088 ENSLBEG00000002103 ##25 ENSLBEG00000002118 ENSLBEG00000002126 #27 ENSLBEG00000002149 #25 ENSLBEG00000002165 #25 ENSLBEG00000002205 #25 ENSLBEG00000002221 pcdh2ab8 (ENSLBEG00000002246) ##25 pcdh2ac (ENSLBEG00000002305) #26 ENSLBEG00000002317 #35 ENSLBEG00000002335 #35 ENSLBEG00000002381 #35 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000159553.b ENSGT01010000224686 ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.j ##12 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.b #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.`b #25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000000002.a.a.a.nb.a ENSGT00390000002137 ENSGT00940000166070 ENSGT00940000158371 ENSGT00390000009004.d ENSGT00940000155898 ENSGT00940000159553.b ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.a #25 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.b #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 112 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 Lumpfish MODERN SPECIES 1 fbxw11a (ENSCLMG00005017302) fgf18a (ENSCLMG00005017305) ENSCLMG00005017311 ENSCLMG00005017313 ENSCLMG00005017316 ENSCLMG00005017319 pcdh2aa1 (ENSCLMG00005017320) ##12 ENSCLMG00005017322 ENSCLMG00005017323 ##12 ENSCLMG00005017325 ENSCLMG00005017327 ENSCLMG00005017329 #8 ENSCLMG00005017333 #12 ENSCLMG00005001287 #12 ENSCLMG00005001296 #12 ENSCLMG00005001399 ##25 ENSCLMG00005001636 #15 ENSCLMG00005001644 #19 ENSCLMG00005001653 #21 ENSCLMG00005001663 ENSCLMG00005001671 ##25 ENSCLMG00005001678 ENSCLMG00005001688 #25 ENSCLMG00005001698 #27 pcdh2ac (ENSCLMG00005001736) #26 ENSCLMG00005001878 #35 ENSCLMG00005001881 #35 ENSCLMG00005001886 #35 ENSCLMG00005001887 #35 ENSCLMG00005001890 #35 ENSCLMG00005001891 #35 Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 112 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000177312 Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 88 ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.i.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000177312 European seabass MODERN SPECIES 12 ENSDLAG00005004381 ENSDLAG00005030788 ENSDLAG00005031244 ENSDLAG00005032943 pcdh2aa1 (ENSDLAG00005022000) ##12 ENSDLAG00005021993 ##12 ENSDLAG00005032508 ENSDLAG00005032461 ##12 ENSDLAG00005035091 ##12 ENSDLAG00005035023 #11 ENSDLAG00005027408 ##12 ENSDLAG00005016635 #12 ENSDLAG00005028538 #12 ENSDLAG00005027175 #12 ENSDLAG00005034627 #12 pcdh2ab5 (ENSDLAG00005022013) ##25 ENSDLAG00005028279 ##25 ENSDLAG00005028968 ##25 ENSDLAG00005029590 ##25 ENSDLAG00005002365 ENSDLAG00005012248 #20 ENSDLAG00005032497 ENSDLAG00005029568 ##25 ENSDLAG00005002726 #25 pcdh2ab10 (ENSDLAG00005017238) ##25 pcdh2ac (ENSDLAG00005020172) #26 ENSDLAG00005032844 #35 ENSDLAG00005018658 #35 ENSDLAG00005019241 #33 ENSDLAG00005027070 #37 ENSDLAG00005030151 ##37 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b.h #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01100000264899 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b.h #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01100000264899 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000181572 ENSGT00940000164468.a.a.a.a Zig-zag eel MODERN SPECIES 1 ENSMAMG00000005203 ENSMAMG00000028517 ENSMAMG00000005132 ENSMAMG00000005120 ENSMAMG00000025285 ENSMAMG00000028262 ##12 ENSMAMG00000005084 ##12 ENSMAMG00000028444 ##12 ENSMAMG00000005059 ENSMAMG00000004908 #8 ENSMAMG00000004869 ENSMAMG00000025351 #12 ENSMAMG00000026543 #12 ENSMAMG00000028695 ENSMAMG00000004797 #20 ENSMAMG00000024580 ##25 ENSMAMG00000026967 #15 ENSMAMG00000004622 #15 ENSMAMG00000004617 ENSMAMG00000026670 #21 ENSMAMG00000024788 ##25 ENSMAMG00000004456 #25 ENSMAMG00000025800 ##37 ENSMAMG00000026498 #35 ENSMAMG00000004396 #35 ENSMAMG00000004391 #18 ENSMAMG00000004045 #33 ENSMAMG00000026949 #36 ENSMAMG00000028733 ##37 ENSMAMG00000026871 ##37 ENSMAMG00000027401 ##37 Carangaria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a ##12 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b.h #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.f #37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000158371 ENSGT00390000009004.d ENSGT00940000155898 ENSGT00940000159553.b ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 Turbot MODERN SPECIES 4 fgf18a (ENSSMAG00000001622) ENSSMAG00000001613 ENSSMAG00000030226 ENSSMAG00000001605 ENSSMAG00000034972 pcdh2aa1 (ENSSMAG00000016187) ##12 ENSSMAG00000016163 ##12 ENSSMAG00000033861 ENSSMAG00000034636 #8 ENSSMAG00000022434 #8 ENSSMAG00000023632 ##12 ENSSMAG00000025748 #9 ENSSMAG00000023362 ENSSMAG00000001346 #12 ENSSMAG00000022345 ENSSMAG00000028799 ##25 ENSSMAG00000021880 ##25 ENSSMAG00000001405 ##25 ENSSMAG00000001579 ENSSMAG00000023812 ##25 ENSSMAG00000024294 #25 ENSSMAG00000031943 ENSSMAG00000025670 #25 pcdh2ab10 (ENSSMAG00000033635) ##25 pcdh2ac (ENSSMAG00000030691) #26 ENSSMAG00000033759 #29 ENSSMAG00000024154 #35 ENSSMAG00000037132 ##37 ENSSMAG00000033616 ENSSMAG00000024825 ##37 ENSSMAG00000025683 ##37 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a ##12 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b.h #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.f #37 Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch MODERN SPECIES 808 ENSLCAG00010001220 ##25 ENSLCAG00010001224 #20 ENSLCAG00010001230 ##25 ENSLCAG00010001235 ##25 ENSLCAG00010001241 ENSLCAG00010001246 #21 ENSLCAG00010001256 ENSLCAG00010001259 ENSLCAG00010001261 #25 ENSLCAG00010001263 #25 ENSLCAG00010001264 ##25 ENSLCAG00010001267 ##25 Barramundi perch MODERN SPECIES 127 ENSLCAG00010002515 ENSLCAG00010002511 ENSLCAG00010002508 ENSLCAG00010002505 ##12 ENSLCAG00010002501 ##12 ENSLCAG00010002497 ENSLCAG00010002494 ENSLCAG00010002490 ENSLCAG00010002486 ##12 ENSLCAG00010002482 #11 ENSLCAG00010002479 #12 ENSLCAG00010002477 ENSLCAG00010002476 #12 ENSLCAG00010002474 #12 ENSLCAG00010002472 ENSLCAG00010002470 ##25 ENSLCAG00010002469 #15 ENSLCAG00010002463 ##25 ENSLCAG00010002459 ##25 ENSLCAG00010002458 ##25 ENSLCAG00010002454 ##25 ENSLCAG00010002451 #25 ENSLCAG00010002447 #25 ENSLCAG00010002446 ##25 pcdh2ac (ENSLCAG00010002441) #26 ENSLCAG00010002440 #35 ENSLCAG00010002439 #35 ENSLCAG00010002434 #35 ENSLCAG00010002433 #35 ENSLCAG00010002430 ##37 Seriola ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.t.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.t.a ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.u ENSGT00940000164725.a.a.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.e.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.e.b ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a.e #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a.b #35 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3259 ENSSLDG00000001688 ENSSLDG00000001638 ENSSLDG00000001620 ENSSLDG00000001614 ##12 ENSSLDG00000001589 ENSSLDG00000001573 ENSSLDG00000001476 ##12 ENSSLDG00000001456 ENSSLDG00000001401 ##12 ENSSLDG00000001370 ENSSLDG00000001326 #9 ENSSLDG00000001304 #12 ENSSLDG00000001283 ##12 ENSSLDG00000001262 #20 ENSSLDG00000001252 #9 ENSSLDG00000001232 ##25 ENSSLDG00000001211 #15 ENSSLDG00000001175 ##25 ENSSLDG00000001165 #19 ENSSLDG00000001154 ENSSLDG00000001128 #23 ENSSLDG00000001120 #21 ENSSLDG00000001101 ENSSLDG00000001084 #25 ENSSLDG00000001052 #25 ENSSLDG00000001036 ##25 pcdh2ac (ENSSLDG00000000958) #26 ENSSLDG00000000897 #35 ENSSLDG00000000862 #35 ENSSLDG00000000787 #35 ENSSLDG00000000448 #36 Greater amberjack DUPLICATION Greater amberjack MODERN SPECIES 361 ENSSDUG00000002615 #20 ENSSDUG00000002604 ##25 ENSSDUG00000002590 #15 ENSSDUG00000002568 #15 Greater amberjack MODERN SPECIES 275 ENSSDUG00000017451 ##12 ENSSDUG00000017443 ENSSDUG00000017438 #8 ENSSDUG00000017428 ENSSDUG00000017418 #9 ENSSDUG00000017408 #12 ENSSDUG00000017385 #9 ENSSDUG00000017378 ENSSDUG00000017367 #20 ENSSDUG00000017348 ##25 ENSSDUG00000017340 #23 ENSSDUG00000017329 #20 ENSSDUG00000017321 #19 ENSSDUG00000017307 ##25 ENSSDUG00000017292 ##25 ENSSDUG00000017283 ##25 ENSSDUG00000017279 ENSSDUG00000017270 #21 ENSSDUG00000017263 ENSSDUG00000017252 ##25 pcdh2ac (ENSSDUG00000017069) #26 ENSSDUG00000017023 ##25 ENSSDUG00000017016 #35 ENSSDUG00000017009 #35 ENSSDUG00000016999 ##37 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00990000205184 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004.d.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 Midas cichlid MODERN SPECIES 115 etf1a (ENSACIG00000014875) fbxw11a (ENSACIG00000014780) fgf18a (ENSACIG00000014756) ENSACIG00000014385 ENSACIG00000014342 ENSACIG00000014330 pcdh2aa1 (ENSACIG00000014308) ##12 ENSACIG00000014255 ##12 ENSACIG00000014245 #8 ENSACIG00000014237 ENSACIG00000014227 #12 ENSACIG00000014219 #12 ENSACIG00000014208 ENSACIG00000014155 ENSACIG00000014126 ##12 ENSACIG00000014100 ##25 ENSACIG00000014090 ##25 ENSACIG00000014073 ##25 ENSACIG00000014064 ##25 ENSACIG00000014056 ENSACIG00000014036 #21 ENSACIG00000014025 #20 ENSACIG00000014013 #27 ENSACIG00000014005 #25 ENSACIG00000013994 #25 ENSACIG00000013973 #25 ENSACIG00000013959 ##25 ENSACIG00000013949 #27 pcdh2ab8 (ENSACIG00000013935) ##25 pcdh2ac (ENSACIG00000013746) #26 ENSACIG00000013723 ##37 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.x ENSGT00940000164725.a.a.a.a.e ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.y.b.a ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004.d.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.b #35 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 etf1a (ENSONIG00000004951) fbxw11a (ENSONIG00000004953) fgf18a (ENSONIG00000004960) ENSONIG00000004963 ENSONIG00000027254 ENSONIG00000028843 ENSONIG00000037611 ENSONIG00000032228 ENSONIG00000036227 ENSONIG00000027109 #7 ENSONIG00000041059 ENSONIG00000032107 #8 ENSONIG00000034641 #9 ENSONIG00000030596 ##12 ENSONIG00000035556 #9 ENSONIG00000037921 ##25 ENSONIG00000021365 #15 ENSONIG00000034871 ##25 ENSONIG00000033250 ENSONIG00000021350 #21 ENSONIG00000029948 ENSONIG00000031283 #25 ENSONIG00000035146 ##25 pcdh2ac (ENSONIG00000030416) #26 ENSONIG00000032670 #35 ENSONIG00000029451 #35 ENSONIG00000028830 #35 ENSONIG00000042593 #35 ENSONIG00000028202 #35 ENSONIG00000040060 #33 ENSONIG00000031218 #36 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004.d.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004.d.b ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000158371 ENSGT00390000009004.d ENSGT00940000155898 ENSGT00940000159553.b ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.y.a.a.a ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.y.a.b.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00990000205184 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.x #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.b #35 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000155898 ENSGT00940000159553.b ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.y.a.a.a ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.y.a.b.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00990000205184 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000177004.d.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.w.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.x #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.b #35 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000163564 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00990000205184 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000177004.d.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.w.b.a #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.x #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.m #25 ENSGT00940000178344 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.n #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.b #35 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000010566 ENSACLG00000010593 ##12 ENSACLG00000010832 #7 ENSACLG00000010842 ENSACLG00000010851 ##12 ENSACLG00000010858 ##12 ENSACLG00000010875 ##12 pcdh2ac (ENSACLG00000010885) #26 ENSACLG00000010910 #8 ENSACLG00000010945 ENSACLG00000010956 #12 ENSACLG00000010963 #12 ENSACLG00000010982 #12 ENSACLG00000010995 #9 ENSACLG00000011008 #12 ENSACLG00000011017 ##25 ENSACLG00000011028 #15 ENSACLG00000011046 ##25 ENSACLG00000011053 ##25 ENSACLG00000011068 ##25 ENSACLG00000011086 #20 ENSACLG00000011091 ##25 ENSACLG00000011099 #19 ENSACLG00000011102 #21 ENSACLG00000011124 ##25 ENSACLG00000011157 #25 ENSACLG00000011178 #25 ENSACLG00000011363 ##25 pcdh2ab8 (ENSACLG00000011367) ##25 ENSACLG00000011696 #35 ENSACLG00000011712 #35 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005000675 ##12 ENSMZEG00005000694 ##12 ENSMZEG00005000708 ENSMZEG00005000745 ##12 ENSMZEG00005000832 ENSMZEG00005000843 #7 ENSMZEG00005000854 ##12 ENSMZEG00005000870 #8 ENSMZEG00005000894 #8 ENSMZEG00005000946 #9 ENSMZEG00005000958 ENSMZEG00005000982 #12 ENSMZEG00005000994 #12 ENSMZEG00005001006 #12 ENSMZEG00005001024 #15 ENSMZEG00005001048 ##25 ENSMZEG00005001068 #15 ENSMZEG00005001074 ##25 ENSMZEG00005001087 ##25 ENSMZEG00005001112 #19 ENSMZEG00005001122 #21 ENSMZEG00005001133 #21 ENSMZEG00005001148 ##25 ENSMZEG00005001175 #25 ENSMZEG00005001191 ENSMZEG00005001204 #25 ENSMZEG00005001496 ##25 ENSMZEG00005001585 ##25 pcdh2ac (ENSMZEG00005001600) #26 ENSMZEG00005001606 #35 ENSMZEG00005001612 #35 P. nyererei MODERN SPECIES 296 fgf18a (ENSPNYG00000001852) ENSPNYG00000001869 ENSPNYG00000001894 ENSPNYG00000001914 ENSPNYG00000001930 pcdh2aa1 (ENSPNYG00000001937) ##12 ENSPNYG00000001964 ENSPNYG00000001990 ##12 ENSPNYG00000002003 #7 ENSPNYG00000002015 ENSPNYG00000002026 ##12 ENSPNYG00000002050 ##12 ENSPNYG00000002073 #9 ENSPNYG00000002123 ENSPNYG00000002147 ENSPNYG00000002160 ##25 ENSPNYG00000002176 ##25 ENSPNYG00000002201 ##25 ENSPNYG00000002217 ##25 ENSPNYG00000002235 #20 ENSPNYG00000002244 #19 ENSPNYG00000002261 #23 ENSPNYG00000002272 #21 ENSPNYG00000002293 ##25 ENSPNYG00000002390 ##25 pcdh2ac (ENSPNYG00000002432) #26 ENSPNYG00000002474 #35 ENSPNYG00000002485 #35 ENSPNYG00000002501 #33 ENSPNYG00000002519 ENSPNYG00000002527 ##37 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 501 ENSHBUG00000009263 pcdh2aa1 (ENSHBUG00000009276) ##12 ENSHBUG00000009287 ##12 ENSHBUG00000000235 ##12 ENSHBUG00000009323 ##12 ENSHBUG00000009334 #12 ENSHBUG00000009340 ##12 ENSHBUG00000009365 #7 ENSHBUG00000009372 ENSHBUG00000009382 ##12 ENSHBUG00000001186 #8 ENSHBUG00000009406 #8 ENSHBUG00000009423 #9 ENSHBUG00000009443 #12 ENSHBUG00000009453 #20 ENSHBUG00000009467 ##25 ENSHBUG00000009569 #19 ENSHBUG00000000251 ##25 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 292 etf1a (ENSNBRG00000008918) fbxw11a (ENSNBRG00000008857) fgf18a (ENSNBRG00000008832) ENSNBRG00000008036 ENSNBRG00000007925 ENSNBRG00000007915 ENSNBRG00000007729 ##12 ENSNBRG00000007703 ENSNBRG00000007631 ##12 ENSNBRG00000007606 ##12 ENSNBRG00000007597 ##12 ENSNBRG00000007572 ENSNBRG00000007525 #8 ENSNBRG00000007507 ENSNBRG00000007498 #20 ENSNBRG00000007487 ##25 ENSNBRG00000007473 ##25 ENSNBRG00000007468 #20 ENSNBRG00000007438 #19 ENSNBRG00000007430 #20 ENSNBRG00000007284 #19 ENSNBRG00000007249 ENSNBRG00000007229 #21 ENSNBRG00000007214 pcdh2ac (ENSNBRG00000007023) #26 ENSNBRG00000006973 #35 ENSNBRG00000006965 ENSNBRG00000006928 ##37 ENSNBRG00000006776 ##37 PCDHGB4 (ENSNBRG00000006507) ENSNBRG00000006465 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000159553.b ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.b.b ##37 Bicolor damselfish MODERN SPECIES 2575 ENSSPAG00000002490 #12 ENSSPAG00000002516 #12 ENSSPAG00000002540 #12 ENSSPAG00000002590 ##12 ENSSPAG00000002603 ENSSPAG00000002609 ##25 ENSSPAG00000002618 #20 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 110 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.v.a ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.v.b ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l.a.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l.a.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b.f.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b.f.a #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.o.a.a.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.o.a.b #35 ENSGT00940000177513.b Clown anemonefish DUPLICATION Clown anemonefish MODERN SPECIES 1335 ENSAOCG00000010182 #8 ENSAOCG00000010194 #8 ENSAOCG00000002009 #12 ENSAOCG00000010226 #12 ENSAOCG00000002555 ##25 ENSAOCG00000010257 #15 ENSAOCG00000010271 ##25 ENSAOCG00000010281 ##25 ENSAOCG00000010293 #19 ENSAOCG00000010312 ENSAOCG00000002556 #21 ENSAOCG00000010336 #25 ENSAOCG00000000647 #25 ENSAOCG00000010495 #25 pcdh2ab10 (ENSAOCG00000010528) ##25 pcdh2ac (ENSAOCG00000010573) #26 ENSAOCG00000010594 ENSAOCG00000010607 Clown anemonefish MODERN SPECIES 37 ENSAOCG00000022342 #20 ENSAOCG00000022346 ##25 ENSAOCG00000022352 ##25 ENSAOCG00000022364 ##25 ENSAOCG00000022389 #19 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT01090000260159 #27 Oryzias ANCESTRAL SPECIES 86 ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.`b.a ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.k #12 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.l #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT01090000260158 #20 Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 259 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT01090000260158 #20 Chinese medaka MODERN SPECIES 2702 ENSOSIG00000004187 ##25 ENSOSIG00000004185 #20 Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 1 ENSORLG00000029888 ENSORLG00000021905 ENSORLG00000023628 ENSORLG00000022127 ENSORLG00000028462 ENSORLG00000023399 pcdh2aa1 (ENSORLG00000021994) ##12 ENSORLG00000028629 ##12 ENSORLG00000028208 ##12 ENSORLG00000030495 ENSORLG00000022312 #8 ENSORLG00000028903 #11 ENSORLG00000004181 #12 ENSORLG00000027606 ##12 ENSORLG00000029528 ENSORLG00000026864 ##25 ENSORLG00000026652 ENSORLG00000029341 ##25 ENSORLG00000024772 #19 ENSORLG00000004176 #21 ENSORLG00000004171 #23 ENSORLG00000023815 ##25 ENSORLG00000026259 ENSORLG00000029952 #25 ENSORLG00000024089 #25 ENSORLG00000028645 ENSORLG00000024851 ##25 pcdh2ab10 (ENSORLG00000022081) ##25 pcdh2ac (ENSORLG00000029405) #26 ENSORLG00000025371 #35 ENSORLG00000026934 #35 Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.`b.a ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b.g.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b.g.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a.d #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.k #12 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a.c #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a.c ##25 Indian medaka MODERN SPECIES 16 ENSOMEG00000003777 ##12 ENSOMEG00000003771 ENSOMEG00000003765 #11 ENSOMEG00000000083 ENSOMEG00000003750 #11 ENSOMEG00000003745 #9 ENSOMEG00000003738 #12 ENSOMEG00000003727 ENSOMEG00000003720 #9 ENSOMEG00000003703 #9 ENSOMEG00000003694 #9 ENSOMEG00000003685 #9 ENSOMEG00000003673 #9 ENSOMEG00000003662 ##12 ENSOMEG00000003654 pcdh2ab5 (ENSOMEG00000003648) ##25 ENSOMEG00000003631 ##25 ENSOMEG00000003616 pcdh2ac (ENSOMEG00000003560) #26 ENSOMEG00000003493 ENSOMEG00000003484 #27 ENSOMEG00000003472 pcdh2ab8 (ENSOMEG00000003465) ##25 ENSOMEG00000003456 #35 ENSOMEG00000003420 #35 ENSOMEG00000003412 #35 ENSOMEG00000003391 #35 ENSOMEG00000003352 #35 ENSOMEG00000003333 #35 ENSOMEG00000003323 #35 ENSOMEG00000003318 #35 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00940000177060 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 71 ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00950000183286 ENSGT00990000205184 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 54 ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.eb.a ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a.e.a ##12 ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.eb.b.a ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.fb ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a.e.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000159553.b ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.eb.b.a ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.fb ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a.e.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a.f ##12 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 234 ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.fb ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a.e.b ##12 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000177060 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.f.d.a #35 ENSGT00940000177513.b Amazon molly MODERN SPECIES 1200 ENSPFOG00000014786 #12 ENSPFOG00000024578 ##12 pcdh2ab3 (ENSPFOG00000020625) ##25 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 675 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 Mummichog MODERN SPECIES 728 ENSFHEG00000006615 #11 ENSFHEG00000006632 #9 ENSFHEG00000006656 #12 ENSFHEG00000006678 #12 ENSFHEG00000006695 #12 ENSFHEG00000006751 ##25 ENSFHEG00000006762 ENSFHEG00000006774 ##25 ENSFHEG00000006783 #21 ENSFHEG00000000183 ENSFHEG00000006796 ##25 ENSFHEG00000006925 ##25 ENSFHEG00000006940 #25 ENSFHEG00000007008 ##25 pcdh2ab8 (ENSFHEG00000007019) ##25 pcdh2ac (ENSFHEG00000007030) #26 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00390000009004.d ENSGT00940000155898 ENSGT00940000159553.b ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.b ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000159725 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 99 ENSKMAG00000009448 etf1a (ENSKMAG00000009423) fbxw11a (ENSKMAG00000009338) fgf18a (ENSKMAG00000009296) ENSKMAG00000009286 ENSKMAG00000009276 ENSKMAG00000009266 ENSKMAG00000009260 ENSKMAG00000009251 ENSKMAG00000009232 pcdh2aa1 (ENSKMAG00000009189) ##12 ENSKMAG00000009160 ##12 ENSKMAG00000009148 ENSKMAG00000009114 ##12 ENSKMAG00000009069 ##12 ENSKMAG00000009055 ##25 ENSKMAG00000009036 #19 ENSKMAG00000009001 ##25 ENSKMAG00000008928 ##25 ENSKMAG00000008637 #21 ENSKMAG00000008569 #25 ENSKMAG00000008538 ##25 ENSKMAG00000008503 ##25 pcdh2ab8 (ENSKMAG00000008473) ##25 pcdh2ac (ENSKMAG00000008379) #26 ENSKMAG00000008313 #35 ENSKMAG00000008291 #35 ENSKMAG00000008252 ##37 ENSKMAG00000008210 ##37 ENSKMAG00000008192 ##37 ENSKMAG00000008161 ##37 Turquoise killifish MODERN SPECIES 705 ENSNFUG00015016692 ##12 ENSNFUG00015016701 #12 ENSNFUG00015016721 ##25 ENSNFUG00015016725 #24 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.b ##25 Protacanthopterygii DUPLICATION Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.b.a ##25 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.b.a ##25 Huchen MODERN SPECIES 2430 ENSHHUG00000043743 ##25 ENSHHUG00000043747 ##25 ENSHHUG00000043825 #25 ENSHHUG00000043827 #26 ENSHHUG00000043832 #25 ENSHHUG00000043835 #25 ENSHHUG00000043839 #25 ENSHHUG00000043895 #30 ENSHHUG00000043899 #30 ENSHHUG00000043919 pcdh1g32 (ENSHHUG00000043929) ENSHHUG00000043960 ENSHHUG00000043965 ENSHHUG00000043970 ENSHHUG00000043978 ENSHHUG00000043981 ENSHHUG00000043984 Northern pike MODERN SPECIES 3 SPOCK1 (ENSELUG00000018715) etf1a (ENSELUG00000018668) fbxw11a (ENSELUG00000018591) fgf18a (ENSELUG00000018447) ENSELUG00000018411 ENSELUG00000018402 ENSELUG00000018394 ENSELUG00000028568 ENSELUG00000018382 ENSELUG00000018313 ##12 ENSELUG00000032563 ENSELUG00000018162 ##12 ENSELUG00000028092 ENSELUG00000029025 #15 ENSELUG00000026095 ENSELUG00000000741 ##25 ENSELUG00000018100 ##25 ENSELUG00000030369 ##25 ENSELUG00000018036 #25 ENSELUG00000018006 ENSELUG00000032665 ##25 ENSELUG00000018000 ##25 ENSELUG00000033843 #30 ENSELUG00000027397 #30 pcdh1g31 (ENSELUG00000017950) ENSELUG00000026183 #30 ENSELUG00000017927 ENSELUG00000028255 ENSELUG00000026213 ENSELUG00000017752 TRPC7 (ENSELUG00000017696) Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.b.b ##25 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.b.b ##25 Huchen MODERN SPECIES 2430 ENSHHUG00000043743 ##25 ENSHHUG00000043747 ##25 ENSHHUG00000043825 #25 ENSHHUG00000043827 #26 ENSHHUG00000043832 #25 ENSHHUG00000043835 #25 ENSHHUG00000043839 #25 ENSHHUG00000043895 #30 ENSHHUG00000043899 #30 ENSHHUG00000043919 pcdh1g32 (ENSHHUG00000043929) ENSHHUG00000043960 ENSHHUG00000043965 ENSHHUG00000043970 ENSHHUG00000043978 ENSHHUG00000043981 Northern pike MODERN SPECIES 3 fbxw11a (ENSELUG00000018591) fgf18a (ENSELUG00000018447) ENSELUG00000018411 ENSELUG00000018402 ENSELUG00000018394 ENSELUG00000028568 ENSELUG00000018382 ENSELUG00000018313 ##12 ENSELUG00000032563 ENSELUG00000018162 ##12 ENSELUG00000028092 ENSELUG00000029025 #15 ENSELUG00000026095 ENSELUG00000000741 ##25 ENSELUG00000018100 ##25 ENSELUG00000030369 ##25 ENSELUG00000018036 #25 ENSELUG00000018006 ENSELUG00000032665 ##25 ENSELUG00000018000 ##25 ENSELUG00000033843 #30 ENSELUG00000027397 #30 pcdh1g31 (ENSELUG00000017950) ENSELUG00000026183 #30 ENSELUG00000017927 ENSELUG00000028255 ENSELUG00000026213 ENSELUG00000017752 TRPC7 (ENSELUG00000017696) DOCK2 (ENSELUG00000000655) ENSELUG00000017266 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b ##25 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b ##25 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b ##25 Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 78 ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.b.d.a.b ENSGT00940000164725.a.a.b.d.a.a ENSGT00940000164725.a.a.b.d.b.b ENSGT00940000164725.a.a.b.d.b.a ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a ##12 ENSGT01020000230605.f ENSGT00940000165118.a.a.b.b.a.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.a.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00940000165118.a.a.a.b.b ##12 ENSGT01020000230605.e ENSGT00940000165118.a.a.a.b.a ##12 ENSGT01100000265725 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT01090000260159 #27 Atlantic herring MODERN SPECIES 12 ENSCHAG00000001926 ENSCHAG00000001918 ENSCHAG00000001905 ENSCHAG00000001895 ENSCHAG00000001881 ##12 ENSCHAG00000001859 ENSCHAG00000001831 ENSCHAG00000001771 ##12 ENSCHAG00000001752 ENSCHAG00000001743 ##12 ENSCHAG00000001721 ##12 ENSCHAG00000001711 ##12 ENSCHAG00000001690 #25 ENSCHAG00000001654 ##25 ENSCHAG00000001643 ##25 ENSCHAG00000001634 ##25 pcdh2ac (ENSCHAG00000001496) #26 ENSCHAG00000001404 #37 ENSCHAG00000001365 ENSCHAG00000001343 #37 ENSCHAG00000001307 #37 ENSCHAG00000001245 #37 ENSCHAG00000001189 #37 ENSCHAG00000001034 #37 ENSCHAG00000000919 ENSCHAG00000000866 ENSCHAG00000000840 ENSCHAG00000000763 ENSCHAG00000000693 ENSCHAG00000000660 ENSCHAG00000000636 #37 Otophysi ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b ##25 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b ##25 Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b ##25 Electric eel MODERN SPECIES 106 ENSEEEG00000014067 ENSEEEG00000014065 ENSEEEG00000014064 ##12 ENSEEEG00000014062 ##12 ENSEEEG00000014061 ##12 ENSEEEG00000014060 ##12 ENSEEEG00000014058 ##12 ENSEEEG00000014056 ##12 pcdh2ab1 (ENSEEEG00000014055) ##25 ENSEEEG00000014053 ENSEEEG00000014052 #25 ENSEEEG00000014051 #27 pcdh2ab5 (ENSEEEG00000014006) ##25 ENSEEEG00000014001 ##25 ENSEEEG00000014000 ##25 ENSEEEG00000013998 ##25 ENSEEEG00000013997 ##25 Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b ##25 Cyprininae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b ##25 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b ##25 Golden-line barbel MODERN SPECIES 217 etf1a (ENSSGRG00000049383) fbxw11a (ENSSGRG00000049378) fgf18a (ENSSGRG00000049377) ENSSGRG00000049315 ENSSGRG00000049313 ENSSGRG00000049312 ENSSGRG00000049311 ENSSGRG00000049310 ##12 ENSSGRG00000049309 ##12 ENSSGRG00000049308 ENSSGRG00000049306 ##12 ENSSGRG00000049304 ##12 pcdh2ab1 (ENSSGRG00000049303) ##25 ENSSGRG00000049302 #20 ENSSGRG00000049301 ##25 pcdh2ab5 (ENSSGRG00000049296) ##25 pcdh2ab12 (ENSSGRG00000049295) ##25 PCDHAC2 (ENSSGRG00000049293) #26 ENSSGRG00000049292 #37 ENSSGRG00000049291 ENSSGRG00000049290 #37 ENSSGRG00000049289 #37 ENSSGRG00000049287 ENSSGRG00000049286 ENSSGRG00000049285 ENSSGRG00000049284 ENSSGRG00000049283 ENSSGRG00000049281 ENSSGRG00000049280 ENSSGRG00000049279 DIAPH1 (ENSSGRG00000048132) Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b ##25 Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 523 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.a #25 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 40 ENSGT00670000098059.c.a.a.b.a ENSGT00940000156077.g.a ENSGT00940000157352.b ENSGT00390000000002.a.a.a.nb.a ENSGT00390000002137.d ENSGT00940000166070 ENSGT00950000186323 ENSGT00940000158371.nb.a ENSGT00390000009004.d.e ENSGT00940000155898.v.a ENSGT00940000159553.b.c ENSGT00940000163777.b.a.a.e ENSGT00940000164725.a.a.b.g.a.b.a.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a ENSGT00940000165118.b.a.b ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.a.a.b #25 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 191 ENSGT00940000164725.a.a.b.g.a.b.b ENSGT00940000165118.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.a.b ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.a.a.b #25 ENSGT00940000165118.a.a.a.b.j ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.b.a ##25 ENSGT01100000264435 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.a.a.b #25 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 395 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.a.a.b #25 ENSGT00940000165118.a.a.a.b.j ##12 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 40 ENSGT00390000010950.e ENSGT00940000162201.p.d ENSGT00670000098059.c.a.a.a ENSGT00940000156077.g.a ENSGT00940000157352.b ENSGT00390000000002.a.a.a.nb.a.fb ENSGT00390000002137.d ENSGT00940000166070 ENSGT00950000186323 ENSGT00940000158371.nb.a ENSGT00390000009004.d.e ENSGT00940000155898.v.a ENSGT00940000159553.b.c ENSGT00940000163777.b.a.a.e ENSGT00940000164725.a.b.b.a ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.a.a.b #25 ENSGT00940000165118.a.a.a.b.j ##12 Chinook salmon DUPLICATION Chinook salmon MODERN SPECIES 32 tomm5 (ENSOTSG00005002416) ENSOTSG00005002410 ENSOTSG00005002405 ints10 (ENSOTSG00005002198) ube2ka (ENSOTSG00005002031) CHRNA9 (ENSOTSG00005002027) ENSOTSG00005002022 ENSOTSG00005002020 etf1a (ENSOTSG00005001998) fbxw11a (ENSOTSG00005001281) fgf18a (ENSOTSG00005001270) ENSOTSG00005001261 ENSOTSG00005001259 pcdh2aa1 (ENSOTSG00005001255) ##12 ENSOTSG00005001249 ##12 ENSOTSG00005001247 ##25 ENSOTSG00005001245 #27 ENSOTSG00005001240 #25 ENSOTSG00005001234 #25 ENSOTSG00005001233 #27 ENSOTSG00005001229 #25 pcdh2ac (ENSOTSG00005001224) #26 ENSOTSG00005001216 #30 ENSOTSG00005001213 #30 ENSOTSG00005001208 #30 ENSOTSG00005001205 #30 ENSOTSG00005001197 #30 ENSOTSG00005001110 #30 ENSOTSG00005001090 ENSOTSG00005001084 ENSOTSG00005001078 Chinook salmon MODERN SPECIES 13 ENSOTSG00005002895 bicc2 (ENSOTSG00005002887) ENSOTSG00005002881 ENSOTSG00005002871 ENSOTSG00005002866 SPOCK1 (ENSOTSG00005002855) etf1a (ENSOTSG00005002849) fbxw11a (ENSOTSG00005002726) fgf18a (ENSOTSG00005002713) ENSOTSG00005002709 ENSOTSG00005002702 ##12 ENSOTSG00005002698 ENSOTSG00005002688 ##12 ENSOTSG00005002681 ##12 ENSOTSG00005002679 #18 ENSOTSG00005002677 ##25 ENSOTSG00005001792 #25 ENSOTSG00005022741 ##12 ENSOTSG00005022740 #30 ENSOTSG00005022739 #37 ENSOTSG00005022738 ENSOTSG00005022736 #30 ENSOTSG00005022735 ENSOTSG00005022734 ENSOTSG00005022678 ENSOTSG00005022673 ENSOTSG00005022672 ENSOTSG00005022671 ENSOTSG00005022670 ENSOTSG00005022669 ENSOTSG00005022667 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b ##25 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 453 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b ##25 Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 535 ENSHCOG00000012236 ##25 Percomorphaceae_B DUPLICATION Percomorphaceae_B DUPLICATION Percomorphaceae_B DUPLICATION Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT01030000236108 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01090000260212 ENSGT01090000260159 #27 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 125 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 Cyprinodontoidei DUPLICATION Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a.a ##25 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a.a ##25 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.fb ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a.e.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a.f ##12 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 Guppy MODERN SPECIES 440 ENSPREG00000001450 ENSPREG00000001444 ENSPREG00000001405 ##12 ENSPREG00000001390 ##12 ENSPREG00000001375 ENSPREG00000001368 ##12 ENSPREG00000001343 #11 ENSPREG00000001329 #12 ENSPREG00000001318 #12 ENSPREG00000001306 ENSPREG00000001293 ##25 ENSPREG00000001277 ##25 ENSPREG00000001221 ##25 ENSPREG00000001149 ##25 ENSPREG00000001136 #20 ENSPREG00000001124 ##25 ENSPREG00000001113 ENSPREG00000001096 ##25 ENSPREG00000001077 ENSPREG00000001039 #25 ENSPREG00000001020 #27 ENSPREG00000000942 #25 ENSPREG00000000911 #25 ENSPREG00000000855 #35 ENSPREG00000000826 #35 ENSPREG00000000805 ENSPREG00000000775 #35 ENSPREG00000000765 #35 ENSPREG00000000747 ENSPREG00000000730 #35 ENSPREG00000000710 ##37 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 71 ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00950000183286 ENSGT00990000205184 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 54 ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.eb.b.a ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.fb ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a.e.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 Platyfish MODERN SPECIES 15 ENSXMAG00000026701 ##12 ENSXMAG00000021083 ##12 ENSXMAG00000023389 ENSXMAG00000029330 ENSXMAG00000027122 ##12 ENSXMAG00000027032 ENSXMAG00000025920 ##12 ENSXMAG00000022763 #8 ENSXMAG00000021470 #11 ENSXMAG00000020972 ENSXMAG00000029775 #12 ENSXMAG00000021646 ##12 ENSXMAG00000021457 ENSXMAG00000008338 #15 ENSXMAG00000028268 ##25 ENSXMAG00000021394 ##25 ENSXMAG00000026013 ##25 ENSXMAG00000025189 ##25 ENSXMAG00000021710 ENSXMAG00000024357 #23 ENSXMAG00000025065 ENSXMAG00000025626 ##25 ENSXMAG00000028407 #25 ENSXMAG00000029821 #25 ENSXMAG00000021550 ##25 ENSXMAG00000022961 ##25 pcdh2ac (ENSXMAG00000023782) #26 ENSXMAG00000020851 ##37 ENSXMAG00000023606 ##37 ENSXMAG00000021123 ##37 ENSXMAG00000021523 ##37 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.eb.b.a ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.fb ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a.e.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a.f ##12 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 Guppy MODERN SPECIES 440 ENSPREG00000001497 ENSPREG00000001474 ENSPREG00000001466 ENSPREG00000001450 ENSPREG00000001444 ENSPREG00000001405 ##12 ENSPREG00000001390 ##12 ENSPREG00000001375 ENSPREG00000001368 ##12 ENSPREG00000001343 #11 ENSPREG00000001329 #12 ENSPREG00000001318 #12 ENSPREG00000001306 ENSPREG00000001293 ##25 ENSPREG00000001277 ##25 ENSPREG00000001221 ##25 ENSPREG00000001149 ##25 ENSPREG00000001136 #20 ENSPREG00000001124 ##25 ENSPREG00000001113 ENSPREG00000001096 ##25 ENSPREG00000001077 ENSPREG00000001039 #25 ENSPREG00000001020 #27 ENSPREG00000000942 #25 ENSPREG00000000911 #25 ENSPREG00000000855 #35 ENSPREG00000000826 #35 ENSPREG00000000805 ENSPREG00000000775 #35 ENSPREG00000000765 #35 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 116 ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000163777.b.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00940000177060 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.f #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.e.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.f #37 Mummichog MODERN SPECIES 728 ENSFHEG00000006615 #11 ENSFHEG00000006632 #9 ENSFHEG00000006656 #12 ENSFHEG00000006678 #12 ENSFHEG00000006695 #12 ENSFHEG00000006751 ##25 ENSFHEG00000006762 ENSFHEG00000006774 ##25 ENSFHEG00000006783 #21 ENSFHEG00000000183 ENSFHEG00000006796 ##25 ENSFHEG00000006925 ##25 ENSFHEG00000006940 #25 ENSFHEG00000007008 ##25 pcdh2ab8 (ENSFHEG00000007019) ##25 pcdh2ac (ENSFHEG00000007030) #26 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 322 fgf18a (ENSCVAG00000011338) ENSCVAG00000011308 ENSCVAG00000011295 ENSCVAG00000011289 ENSCVAG00000011269 pcdh2aa1 (ENSCVAG00000011254) ##12 ENSCVAG00000011234 ENSCVAG00000011220 ENSCVAG00000011208 ##12 ENSCVAG00000011191 ##12 ENSCVAG00000011174 #11 ENSCVAG00000011160 #12 ENSCVAG00000011157 ##12 ENSCVAG00000011134 #21 pcdh2ac (ENSCVAG00000011115) #26 ENSCVAG00000011088 ##25 ENSCVAG00000011080 ##25 ENSCVAG00000011065 #23 ENSCVAG00000010928 #25 ENSCVAG00000010882 #35 ENSCVAG00000010856 #35 ENSCVAG00000010850 #35 ENSCVAG00000010808 #35 ENSCVAG00000010790 ##37 ENSCVAG00000010777 ##37 ENSCVAG00000010747 #37 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00990000205184 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.g ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000178703 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 Bicolor damselfish MODERN SPECIES 1164 ENSSPAG00000011168 ENSSPAG00000011158 #20 ENSSPAG00000011135 ##25 ENSSPAG00000011093 ##25 ENSSPAG00000011080 ENSSPAG00000011048 #21 ENSSPAG00000011039 ENSSPAG00000011031 #27 ENSSPAG00000011018 ##25 ENSSPAG00000011012 ##25 ENSSPAG00000011005 ##25 ENSSPAG00000010996 pcdh2ab8 (ENSSPAG00000010986) ##25 ENSSPAG00000010979 #35 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 Spiny chromis MODERN SPECIES 4385 ENSAPOG00000011147 ##25 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004.d.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004.d.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 fgf18a (ENSONIG00000004960) ENSONIG00000004963 ENSONIG00000027254 ENSONIG00000028843 ENSONIG00000037611 ENSONIG00000032228 ENSONIG00000036227 ENSONIG00000027109 #7 ENSONIG00000041059 ENSONIG00000032107 #8 ENSONIG00000034641 #9 ENSONIG00000030596 ##12 ENSONIG00000035556 #9 ENSONIG00000037921 ##25 ENSONIG00000021365 #15 ENSONIG00000034871 ##25 ENSONIG00000033250 ENSONIG00000021350 #21 ENSONIG00000029948 ENSONIG00000031283 #25 ENSONIG00000035146 ##25 pcdh2ac (ENSONIG00000030416) #26 ENSONIG00000032670 #35 ENSONIG00000029451 #35 ENSONIG00000028830 #35 ENSONIG00000042593 #35 ENSONIG00000028202 #35 ENSONIG00000040060 #33 ENSONIG00000031218 #36 ENSONIG00000004967 #35 ENSONIG00000029266 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004.d.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004.d.b ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.a #35 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000159553.b ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.y.a.a.a ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.y.a.b.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00990000205184 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.x #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.b #35 Burton s mouthbrooder DUPLICATION Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 158 ENSHBUG00000016776 ##25 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 159 ENSHBUG00000016762 ##25 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.y.a.a.a ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.y.a.b.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00990000205184 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000177004.d.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.w.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.x #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.b #35 P. nyererei MODERN SPECIES 296 ENSPNYG00000001914 ENSPNYG00000001930 pcdh2aa1 (ENSPNYG00000001937) ##12 ENSPNYG00000001964 ENSPNYG00000001990 ##12 ENSPNYG00000002003 #7 ENSPNYG00000002015 ENSPNYG00000002026 ##12 ENSPNYG00000002050 ##12 ENSPNYG00000002073 #9 ENSPNYG00000002123 ENSPNYG00000002147 ENSPNYG00000002160 ##25 ENSPNYG00000002176 ##25 ENSPNYG00000002201 ##25 ENSPNYG00000002217 ##25 ENSPNYG00000002235 #20 ENSPNYG00000002244 #19 ENSPNYG00000002261 #23 ENSPNYG00000002272 #21 ENSPNYG00000002293 ##25 ENSPNYG00000002390 ##25 pcdh2ac (ENSPNYG00000002432) #26 ENSPNYG00000002474 #35 ENSPNYG00000002485 #35 ENSPNYG00000002501 #33 ENSPNYG00000002519 ENSPNYG00000002527 ##37 ENSPNYG00000002547 #35 ENSPNYG00000002559 ##37 ENSPNYG00000002580 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000163564 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00990000205184 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000177004.d.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.w.b.a #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.x #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.m #25 ENSGT00940000178344 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.n #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.b #35 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000010851 ##12 ENSACLG00000010858 ##12 ENSACLG00000010875 ##12 pcdh2ac (ENSACLG00000010885) #26 ENSACLG00000010910 #8 ENSACLG00000010945 ENSACLG00000010956 #12 ENSACLG00000010963 #12 ENSACLG00000010982 #12 ENSACLG00000010995 #9 ENSACLG00000011008 #12 ENSACLG00000011017 ##25 ENSACLG00000011028 #15 ENSACLG00000011046 ##25 ENSACLG00000011053 ##25 ENSACLG00000011068 ##25 ENSACLG00000011086 #20 ENSACLG00000011091 ##25 ENSACLG00000011099 #19 ENSACLG00000011102 #21 ENSACLG00000011124 ##25 ENSACLG00000011157 #25 ENSACLG00000011178 #25 ENSACLG00000011363 ##25 pcdh2ab8 (ENSACLG00000011367) ##25 ENSACLG00000011696 #35 ENSACLG00000011712 #35 ENSACLG00000011729 #35 ENSACLG00000011758 #35 ENSACLG00000011766 #35 ENSACLG00000011774 #33 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005000745 ##12 ENSMZEG00005000832 ENSMZEG00005000843 #7 ENSMZEG00005000854 ##12 ENSMZEG00005000870 #8 ENSMZEG00005000894 #8 ENSMZEG00005000946 #9 ENSMZEG00005000958 ENSMZEG00005000982 #12 ENSMZEG00005000994 #12 ENSMZEG00005001006 #12 ENSMZEG00005001024 #15 ENSMZEG00005001048 ##25 ENSMZEG00005001068 #15 ENSMZEG00005001074 ##25 ENSMZEG00005001087 ##25 ENSMZEG00005001112 #19 ENSMZEG00005001122 #21 ENSMZEG00005001133 #21 ENSMZEG00005001148 ##25 ENSMZEG00005001175 #25 ENSMZEG00005001191 ENSMZEG00005001204 #25 ENSMZEG00005001496 ##25 ENSMZEG00005001585 ##25 pcdh2ac (ENSMZEG00005001600) #26 ENSMZEG00005001606 #35 ENSMZEG00005001612 #35 ENSMZEG00005001626 ENSMZEG00005001638 #35 ENSMZEG00005001643 #35 Percomorphaceae_B DUPLICATION Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 162 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 140 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000178344 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 127 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 123 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 63 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.j ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000156077.g.a ENSGT00940000157352.b ENSGT00390000000002.a.a.a.nb.a ENSGT00390000002137 ENSGT00940000166070 ENSGT00940000158371 ENSGT00390000009004.d ENSGT00940000155898 ENSGT00940000159553.b ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.i.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.a #25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.f #37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000156683 ENSGT00940000165759.b.a.a ENSGT00940000165759.a.b ENSGT01060000248675 Channel bull blenny MODERN SPECIES 1 ENSCGOG00000001396 pcdh2aa1 (ENSCGOG00000001392) ##12 ENSCGOG00000001390 ENSCGOG00000001379 ##12 ENSCGOG00000001377 ENSCGOG00000001372 ##12 ENSCGOG00000001370 #12 ENSCGOG00000001366 #12 ENSCGOG00000001365 ENSCGOG00000001362 #12 ENSCGOG00000001357 #12 ENSCGOG00000001354 ENSCGOG00000001353 #12 ENSCGOG00000001352 #9 ENSCGOG00000001334 ##25 ENSCGOG00000001331 ##25 ENSCGOG00000001329 ##25 ENSCGOG00000001327 ENSCGOG00000001324 #21 ENSCGOG00000001321 #21 ENSCGOG00000001309 ##25 ENSCGOG00000001294 ##25 pcdh2ac (ENSCGOG00000001277) #26 ENSCGOG00000016133 #35 ENSCGOG00000016130 ##37 ENSCGOG00000016126 #35 ENSCGOG00000016115 #35 ENSCGOG00000016111 #35 ENSCGOG00000016106 #35 ENSCGOG00000016097 #37 ENSCGOG00000016090 ##37 Ballan wrasse MODERN SPECIES 182 ENSLBEG00000001616 ENSLBEG00000001631 ##12 ENSLBEG00000001659 ##12 ENSLBEG00000001691 ##12 ENSLBEG00000001700 ##12 ENSLBEG00000001716 #8 ENSLBEG00000001750 ##12 ENSLBEG00000001784 #12 ENSLBEG00000001817 ENSLBEG00000001840 #12 ENSLBEG00000001871 #12 ENSLBEG00000001911 #12 ENSLBEG00000001932 #12 ENSLBEG00000001969 ##12 ENSLBEG00000002011 ##25 ENSLBEG00000002048 ##25 ENSLBEG00000002071 ##25 ENSLBEG00000002088 ENSLBEG00000002103 ##25 ENSLBEG00000002118 ENSLBEG00000002126 #27 ENSLBEG00000002149 #25 ENSLBEG00000002165 #25 ENSLBEG00000002205 #25 ENSLBEG00000002221 pcdh2ab8 (ENSLBEG00000002246) ##25 pcdh2ac (ENSLBEG00000002305) #26 ENSLBEG00000002317 #35 ENSLBEG00000002335 #35 ENSLBEG00000002381 #35 ENSLBEG00000002501 #36 Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000000002.a.a.a.nb.a ENSGT00390000002137 ENSGT00940000166070 ENSGT00940000158371 ENSGT00390000009004.d ENSGT00940000155898 ENSGT00940000159553.b ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00990000205184 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.r #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000165759.b.a.b.a.a.b.p ENSGT00940000165759.b.a.b.a.b ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.a.a.b.a ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.a.a.b.b.a.a ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.a.a.a.c.a ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.a.a.b.b.a.b.b.a ENSGT00940000164983.d.a.a.a.b ENSGT00940000164983.d.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000163777.a Fugu MODERN SPECIES 5 ENSTRUG00000028874 ENSTRUG00000001724 ##12 ENSTRUG00000020114 ENSTRUG00000001035 ##12 ENSTRUG00000029711 ENSTRUG00000023244 #12 ENSTRUG00000021621 #12 ENSTRUG00000033047 ENSTRUG00000023579 #12 ENSTRUG00000027859 ENSTRUG00000021733 #12 ENSTRUG00000028834 ENSTRUG00000033286 ENSTRUG00000025468 #20 ENSTRUG00000025673 #15 ENSTRUG00000025647 ##25 ENSTRUG00000028370 ##25 ENSTRUG00000023702 #25 pcdh2ac (ENSTRUG00000025164) #26 ENSTRUG00000019736 #35 ENSTRUG00000023463 #35 ENSTRUG00000002066 #35 ENSTRUG00000023622 #36 ENSTRUG00000032017 #36 ENSTRUG00000023371 #37 ENSTRUG00000032477 ENSTRUG00000032190 ENSTRUG00000021983 ENSTRUG00000030010 ENSTRUG00000014108 ENSTRUG00000025098 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 155 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.r #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000181572 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 1 ENSBSLG00000008273 ENSBSLG00000008322 pcdh2aa1 (ENSBSLG00000008342) ##12 ENSBSLG00000008363 pcdh2ac (ENSBSLG00000008390) #26 ENSBSLG00000008495 ENSBSLG00000008503 #7 ENSBSLG00000008510 #11 ENSBSLG00000008521 #8 ENSBSLG00000008537 #9 ENSBSLG00000008556 #12 ENSBSLG00000008573 #12 ENSBSLG00000008592 #9 ENSBSLG00000008609 ENSBSLG00000008614 ##12 ENSBSLG00000008618 ##25 ENSBSLG00000008630 ##25 ENSBSLG00000008634 #21 ENSBSLG00000008652 #25 ENSBSLG00000008657 #25 ENSBSLG00000008661 ##25 ENSBSLG00000008670 ##37 ENSBSLG00000008677 ENSBSLG00000008684 ##37 ENSBSLG00000008693 ##37 ENSBSLG00000008700 ENSBSLG00000008703 #37 ENSBSLG00000008705 #37 ENSBSLG00000008713 ##37 ENSBSLG00000008719 ##37 ENSBSLG00000008731 Carangaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 Seriola ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 7 ENSSLDG00000000045 ##25 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT01030000236108 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01090000260212 ENSGT01090000260159 #27 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 125 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 71 ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00950000183286 ENSGT00990000205184 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 54 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a.e.a ##12 ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.eb.b.a ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.fb ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a.e.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.eb.b.a ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.fb ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a.e.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a.f ##12 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 Guppy MODERN SPECIES 440 fgf18a (ENSPREG00000001509) ENSPREG00000001497 ENSPREG00000001474 ENSPREG00000001466 ENSPREG00000001450 ENSPREG00000001444 ENSPREG00000001405 ##12 ENSPREG00000001390 ##12 ENSPREG00000001375 ENSPREG00000001368 ##12 ENSPREG00000001343 #11 ENSPREG00000001329 #12 ENSPREG00000001318 #12 ENSPREG00000001306 ENSPREG00000001293 ##25 ENSPREG00000001277 ##25 ENSPREG00000001221 ##25 ENSPREG00000001149 ##25 ENSPREG00000001136 #20 ENSPREG00000001124 ##25 ENSPREG00000001113 ENSPREG00000001096 ##25 ENSPREG00000001077 ENSPREG00000001039 #25 ENSPREG00000001020 #27 ENSPREG00000000942 #25 ENSPREG00000000911 #25 ENSPREG00000000855 #35 ENSPREG00000000826 #35 ENSPREG00000000805 ENSPREG00000000775 #35 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 234 ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.fb ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a.e.b ##12 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000177060 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.f.d.a #35 ENSGT00940000177513.b Sailfin molly MODERN SPECIES 832 ENSPLAG00000022186 ENSPLAG00000022176 ENSPLAG00000022163 ##12 ENSPLAG00000022132 ##12 ENSPLAG00000022119 ENSPLAG00000022112 ##12 ENSPLAG00000022093 ENSPLAG00000022078 ENSPLAG00000022070 ##12 ENSPLAG00000022049 #8 ENSPLAG00000022038 ##12 ENSPLAG00000022019 ##25 ENSPLAG00000022008 ##25 ENSPLAG00000021994 #20 ENSPLAG00000021982 #21 ENSPLAG00000021965 ENSPLAG00000021947 #25 ENSPLAG00000021911 ##25 pcdh2ac (ENSPLAG00000021883) #26 ENSPLAG00000021613 #35 ENSPLAG00000021597 Platyfish MODERN SPECIES 15 ENSXMAG00000027616 ENSXMAG00000026701 ##12 ENSXMAG00000021083 ##12 ENSXMAG00000023389 ENSXMAG00000029330 ENSXMAG00000027122 ##12 ENSXMAG00000027032 ENSXMAG00000025920 ##12 ENSXMAG00000022763 #8 ENSXMAG00000021470 #11 ENSXMAG00000020972 ENSXMAG00000029775 #12 ENSXMAG00000021646 ##12 ENSXMAG00000021457 ENSXMAG00000008338 #15 ENSXMAG00000028268 ##25 ENSXMAG00000021394 ##25 ENSXMAG00000026013 ##25 ENSXMAG00000025189 ##25 ENSXMAG00000021710 ENSXMAG00000024357 #23 ENSXMAG00000025065 ENSXMAG00000025626 ##25 ENSXMAG00000028407 #25 ENSXMAG00000029821 #25 ENSXMAG00000021550 ##25 ENSXMAG00000022961 ##25 pcdh2ac (ENSXMAG00000023782) #26 ENSXMAG00000020851 ##37 ENSXMAG00000023606 ##37 ENSXMAG00000021123 ##37 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00990000205184 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000179774 ENSGT00940000155898 ENSGT00940000159553.b ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 110 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 371 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 Orange clownfish MODERN SPECIES 4 ENSAPEG00000014916 ENSAPEG00000014883 ENSAPEG00000014872 ##12 ENSAPEG00000014852 ##12 ENSAPEG00000014837 ##12 ENSAPEG00000014817 ##12 ENSAPEG00000014792 ##12 ENSAPEG00000014772 ##12 ENSAPEG00000014759 #8 ENSAPEG00000014713 #9 ENSAPEG00000014699 #12 ENSAPEG00000014660 #12 ENSAPEG00000014647 ENSAPEG00000014641 #20 ENSAPEG00000014628 ##25 ENSAPEG00000014619 ##25 ENSAPEG00000014614 #20 ENSAPEG00000014604 ##25 ENSAPEG00000014585 #15 ENSAPEG00000014572 ##25 ENSAPEG00000014557 #19 ENSAPEG00000014543 ENSAPEG00000014528 #21 ENSAPEG00000014520 #23 ENSAPEG00000014312 #25 ENSAPEG00000014282 #27 ENSAPEG00000014133 #25 pcdh2ac (ENSAPEG00000014114) #26 ENSAPEG00000014085 #35 ENSAPEG00000014079 #35 ENSAPEG00000014053 #35 Spiny chromis MODERN SPECIES 3328 ENSAPOG00000000562 #20 ENSAPOG00000019628 ##25 ENSAPOG00000019608 ##25 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004.d.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.b.b ##37 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.y.b.a ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004.d.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004.d.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004.d.b ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.b #35 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000155898 ENSGT00940000159553.b ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.y.a.a.a ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.y.a.b.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00990000205184 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.x #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.y.a.a.a ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.y.a.b.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00990000205184 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000177004.d.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.w.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.x #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000163564 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00990000205184 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000177004.d.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.w.b.a #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.x #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.m #25 ENSGT00940000178344 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.n #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005000708 ENSMZEG00005000745 ##12 ENSMZEG00005000832 ENSMZEG00005000843 #7 ENSMZEG00005000854 ##12 ENSMZEG00005000870 #8 ENSMZEG00005000894 #8 ENSMZEG00005000946 #9 ENSMZEG00005000958 ENSMZEG00005000982 #12 ENSMZEG00005000994 #12 ENSMZEG00005001006 #12 ENSMZEG00005001024 #15 ENSMZEG00005001048 ##25 ENSMZEG00005001068 #15 ENSMZEG00005001074 ##25 ENSMZEG00005001087 ##25 ENSMZEG00005001112 #19 ENSMZEG00005001122 #21 ENSMZEG00005001133 #21 ENSMZEG00005001148 ##25 ENSMZEG00005001175 #25 ENSMZEG00005001191 ENSMZEG00005001204 #25 ENSMZEG00005001496 ##25 ENSMZEG00005001585 ##25 pcdh2ac (ENSMZEG00005001600) #26 ENSMZEG00005001606 #35 ENSMZEG00005001612 #35 ENSMZEG00005001626 ENSMZEG00005001638 #35 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000010842 ENSACLG00000010851 ##12 ENSACLG00000010858 ##12 ENSACLG00000010875 ##12 pcdh2ac (ENSACLG00000010885) #26 ENSACLG00000010910 #8 ENSACLG00000010945 ENSACLG00000010956 #12 ENSACLG00000010963 #12 ENSACLG00000010982 #12 ENSACLG00000010995 #9 ENSACLG00000011008 #12 ENSACLG00000011017 ##25 ENSACLG00000011028 #15 ENSACLG00000011046 ##25 ENSACLG00000011053 ##25 ENSACLG00000011068 ##25 ENSACLG00000011086 #20 ENSACLG00000011091 ##25 ENSACLG00000011099 #19 ENSACLG00000011102 #21 ENSACLG00000011124 ##25 ENSACLG00000011157 #25 ENSACLG00000011178 #25 ENSACLG00000011363 ##25 pcdh2ab8 (ENSACLG00000011367) ##25 ENSACLG00000011696 #35 ENSACLG00000011712 #35 ENSACLG00000011729 #35 ENSACLG00000011758 #35 ENSACLG00000011766 #35 Midas cichlid DUPLICATION Midas cichlid MODERN SPECIES 115 fbxw11a (ENSACIG00000014780) fgf18a (ENSACIG00000014756) ENSACIG00000014385 ENSACIG00000014342 ENSACIG00000014330 pcdh2aa1 (ENSACIG00000014308) ##12 ENSACIG00000014255 ##12 ENSACIG00000014245 #8 ENSACIG00000014237 ENSACIG00000014227 #12 ENSACIG00000014219 #12 ENSACIG00000014208 ENSACIG00000014155 ENSACIG00000014126 ##12 ENSACIG00000014100 ##25 ENSACIG00000014090 ##25 ENSACIG00000014073 ##25 ENSACIG00000014064 ##25 ENSACIG00000014056 ENSACIG00000014036 #21 ENSACIG00000014025 #20 ENSACIG00000014013 #27 ENSACIG00000014005 #25 ENSACIG00000013994 #25 ENSACIG00000013973 #25 ENSACIG00000013959 ##25 ENSACIG00000013949 #27 pcdh2ab8 (ENSACIG00000013935) ##25 pcdh2ac (ENSACIG00000013746) #26 ENSACIG00000013723 ##37 ENSACIG00000013643 #35 Midas cichlid MODERN SPECIES 115 ENSACIG00000014385 ENSACIG00000014342 ENSACIG00000014330 pcdh2aa1 (ENSACIG00000014308) ##12 ENSACIG00000014255 ##12 ENSACIG00000014245 #8 ENSACIG00000014237 ENSACIG00000014227 #12 ENSACIG00000014219 #12 ENSACIG00000014208 ENSACIG00000014155 ENSACIG00000014126 ##12 ENSACIG00000014100 ##25 ENSACIG00000014090 ##25 ENSACIG00000014073 ##25 ENSACIG00000014064 ##25 ENSACIG00000014056 ENSACIG00000014036 #21 ENSACIG00000014025 #20 ENSACIG00000014013 #27 ENSACIG00000014005 #25 ENSACIG00000013994 #25 ENSACIG00000013973 #25 ENSACIG00000013959 ##25 ENSACIG00000013949 #27 pcdh2ab8 (ENSACIG00000013935) ##25 pcdh2ac (ENSACIG00000013746) #26 ENSACIG00000013723 ##37 ENSACIG00000013643 #35 ENSACIG00000013633 #33 ENSACIG00000013629 ##37 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 162 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 140 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000178344 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 127 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 123 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 63 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.j ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00670000098059.c.a ENSGT00940000156077.g.a ENSGT00940000157352.b ENSGT00390000000002.a.a.a.nb.a ENSGT00390000002137 ENSGT00940000166070 ENSGT00940000158371 ENSGT00390000009004.d ENSGT00940000155898 ENSGT00940000159553.b ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.i.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.a #25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.f #37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000156683 ENSGT00940000165759.b.a.a ENSGT00940000165759.a.b Channel bull blenny MODERN SPECIES 1 ENSCGOG00000001399 ENSCGOG00000001396 pcdh2aa1 (ENSCGOG00000001392) ##12 ENSCGOG00000001390 ENSCGOG00000001379 ##12 ENSCGOG00000001377 ENSCGOG00000001372 ##12 ENSCGOG00000001370 #12 ENSCGOG00000001366 #12 ENSCGOG00000001365 ENSCGOG00000001362 #12 ENSCGOG00000001357 #12 ENSCGOG00000001354 ENSCGOG00000001353 #12 ENSCGOG00000001352 #9 ENSCGOG00000001334 ##25 ENSCGOG00000001331 ##25 ENSCGOG00000001329 ##25 ENSCGOG00000001327 ENSCGOG00000001324 #21 ENSCGOG00000001321 #21 ENSCGOG00000001309 ##25 ENSCGOG00000001294 ##25 pcdh2ac (ENSCGOG00000001277) #26 ENSCGOG00000016133 #35 ENSCGOG00000016130 ##37 ENSCGOG00000016126 #35 ENSCGOG00000016115 #35 ENSCGOG00000016111 #35 ENSCGOG00000016106 #35 ENSCGOG00000016097 #37 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT01030000236108 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01090000260212 ENSGT01090000260159 #27 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 125 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 71 ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00950000183286 ENSGT00990000205184 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 54 ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a.e.a ##12 ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.eb.b.a ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.fb ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a.e.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.eb.b.a ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.fb ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a.e.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a.f ##12 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 Guppy MODERN SPECIES 440 fbxw11a (ENSPREG00000001563) fgf18a (ENSPREG00000001509) ENSPREG00000001497 ENSPREG00000001474 ENSPREG00000001466 ENSPREG00000001450 ENSPREG00000001444 ENSPREG00000001405 ##12 ENSPREG00000001390 ##12 ENSPREG00000001375 ENSPREG00000001368 ##12 ENSPREG00000001343 #11 ENSPREG00000001329 #12 ENSPREG00000001318 #12 ENSPREG00000001306 ENSPREG00000001293 ##25 ENSPREG00000001277 ##25 ENSPREG00000001221 ##25 ENSPREG00000001149 ##25 ENSPREG00000001136 #20 ENSPREG00000001124 ##25 ENSPREG00000001113 ENSPREG00000001096 ##25 ENSPREG00000001077 ENSPREG00000001039 #25 ENSPREG00000001020 #27 ENSPREG00000000942 #25 ENSPREG00000000911 #25 ENSPREG00000000855 #35 ENSPREG00000000826 #35 ENSPREG00000000805 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 234 ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.fb ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a.e.b ##12 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000177060 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.f.d.a #35 ENSGT00940000177513.b Sailfin molly MODERN SPECIES 832 ENSPLAG00000022186 ENSPLAG00000022176 ENSPLAG00000022163 ##12 ENSPLAG00000022132 ##12 ENSPLAG00000022119 ENSPLAG00000022112 ##12 ENSPLAG00000022093 ENSPLAG00000022078 ENSPLAG00000022070 ##12 ENSPLAG00000022049 #8 ENSPLAG00000022038 ##12 ENSPLAG00000022019 ##25 ENSPLAG00000022008 ##25 ENSPLAG00000021994 #20 ENSPLAG00000021982 #21 ENSPLAG00000021965 ENSPLAG00000021947 #25 ENSPLAG00000021911 ##25 pcdh2ac (ENSPLAG00000021883) #26 ENSPLAG00000021613 #35 ENSPLAG00000021597 Oryzias ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 Chinese medaka MODERN SPECIES 3512 ENSOSIG00000002497 ##25 ENSOSIG00000002491 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00990000205184 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004.d.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b Midas cichlid MODERN SPECIES 115 fgf18a (ENSACIG00000014756) ENSACIG00000014385 ENSACIG00000014342 ENSACIG00000014330 pcdh2aa1 (ENSACIG00000014308) ##12 ENSACIG00000014255 ##12 ENSACIG00000014245 #8 ENSACIG00000014237 ENSACIG00000014227 #12 ENSACIG00000014219 #12 ENSACIG00000014208 ENSACIG00000014155 ENSACIG00000014126 ##12 ENSACIG00000014100 ##25 ENSACIG00000014090 ##25 ENSACIG00000014073 ##25 ENSACIG00000014064 ##25 ENSACIG00000014056 ENSACIG00000014036 #21 ENSACIG00000014025 #20 ENSACIG00000014013 #27 ENSACIG00000014005 #25 ENSACIG00000013994 #25 ENSACIG00000013973 #25 ENSACIG00000013959 ##25 ENSACIG00000013949 #27 pcdh2ab8 (ENSACIG00000013935) ##25 pcdh2ac (ENSACIG00000013746) #26 ENSACIG00000013723 ##37 ENSACIG00000013643 #35 ENSACIG00000013633 #33 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000009004.d ENSGT00940000179774 ENSGT00940000155898 ENSGT00940000159553.b ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 110 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 371 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 Orange clownfish MODERN SPECIES 4 ENSAPEG00000014921 ENSAPEG00000014916 ENSAPEG00000014883 ENSAPEG00000014872 ##12 ENSAPEG00000014852 ##12 ENSAPEG00000014837 ##12 ENSAPEG00000014817 ##12 ENSAPEG00000014792 ##12 ENSAPEG00000014772 ##12 ENSAPEG00000014759 #8 ENSAPEG00000014713 #9 ENSAPEG00000014699 #12 ENSAPEG00000014660 #12 ENSAPEG00000014647 ENSAPEG00000014641 #20 ENSAPEG00000014628 ##25 ENSAPEG00000014619 ##25 ENSAPEG00000014614 #20 ENSAPEG00000014604 ##25 ENSAPEG00000014585 #15 ENSAPEG00000014572 ##25 ENSAPEG00000014557 #19 ENSAPEG00000014543 ENSAPEG00000014528 #21 ENSAPEG00000014520 #23 ENSAPEG00000014312 #25 ENSAPEG00000014282 #27 ENSAPEG00000014133 #25 pcdh2ac (ENSAPEG00000014114) #26 ENSAPEG00000014085 #35 ENSAPEG00000014079 #35 Spiny chromis DUPLICATION Spiny chromis MODERN SPECIES 3617 ENSAPOG00000024140 ##25 Spiny chromis MODERN SPECIES 3328 ENSAPOG00000000562 #20 ENSAPOG00000019628 ##25 ENSAPOG00000019608 ##25 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000177513.a ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000165759.b.a.a Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT01030000236108 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01090000260212 ENSGT01090000260159 #27 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00990000205184 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.g ##37 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 110 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.g ##37 Amphiprion DUPLICATION Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l.a.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l.a.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b.f.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b.f.a #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.o.a.a.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.o.a.b #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.o.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 Orange clownfish MODERN SPECIES 4 ENSAPEG00000014872 ##12 ENSAPEG00000014852 ##12 ENSAPEG00000014837 ##12 ENSAPEG00000014817 ##12 ENSAPEG00000014792 ##12 ENSAPEG00000014772 ##12 ENSAPEG00000014759 #8 ENSAPEG00000014713 #9 ENSAPEG00000014699 #12 ENSAPEG00000014660 #12 ENSAPEG00000014647 ENSAPEG00000014641 #20 ENSAPEG00000014628 ##25 ENSAPEG00000014619 ##25 ENSAPEG00000014614 #20 ENSAPEG00000014604 ##25 ENSAPEG00000014585 #15 ENSAPEG00000014572 ##25 ENSAPEG00000014557 #19 ENSAPEG00000014543 ENSAPEG00000014528 #21 ENSAPEG00000014520 #23 ENSAPEG00000014312 #25 ENSAPEG00000014282 #27 ENSAPEG00000014133 #25 pcdh2ac (ENSAPEG00000014114) #26 ENSAPEG00000014085 #35 ENSAPEG00000014079 #35 ENSAPEG00000014053 #35 ENSAPEG00000014040 ENSAPEG00000014011 #35 Clown anemonefish MODERN SPECIES 1335 ENSAOCG00000010182 #8 ENSAOCG00000010194 #8 ENSAOCG00000002009 #12 ENSAOCG00000010226 #12 ENSAOCG00000002555 ##25 ENSAOCG00000010257 #15 ENSAOCG00000010271 ##25 ENSAOCG00000010281 ##25 ENSAOCG00000010293 #19 ENSAOCG00000010312 ENSAOCG00000002556 #21 ENSAOCG00000010336 #25 ENSAOCG00000000647 #25 ENSAOCG00000010495 #25 pcdh2ab10 (ENSAOCG00000010528) ##25 pcdh2ac (ENSAOCG00000010573) #26 ENSAOCG00000010594 ENSAOCG00000010607 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l.a.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l.a.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b.f.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b.f.a #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.o.a.a.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.o.a.b #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.o.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 Orange clownfish MODERN SPECIES 4 ENSAPEG00000014837 ##12 ENSAPEG00000014817 ##12 ENSAPEG00000014792 ##12 ENSAPEG00000014772 ##12 ENSAPEG00000014759 #8 ENSAPEG00000014713 #9 ENSAPEG00000014699 #12 ENSAPEG00000014660 #12 ENSAPEG00000014647 ENSAPEG00000014641 #20 ENSAPEG00000014628 ##25 ENSAPEG00000014619 ##25 ENSAPEG00000014614 #20 ENSAPEG00000014604 ##25 ENSAPEG00000014585 #15 ENSAPEG00000014572 ##25 ENSAPEG00000014557 #19 ENSAPEG00000014543 ENSAPEG00000014528 #21 ENSAPEG00000014520 #23 ENSAPEG00000014312 #25 ENSAPEG00000014282 #27 ENSAPEG00000014133 #25 pcdh2ac (ENSAPEG00000014114) #26 ENSAPEG00000014085 #35 ENSAPEG00000014079 #35 ENSAPEG00000014053 #35 ENSAPEG00000014040 ENSAPEG00000014011 #35 ENSAPEG00000013996 #35 ENSAPEG00000013978 #33 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 265 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 299 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004.d.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004.d.b ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.b.b ##37 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.y.a.a.a ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.y.a.b.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00990000205184 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.x #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00990000205184 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000177004.d.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.w.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.x #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 P. nyererei MODERN SPECIES 296 ENSPNYG00000001894 ENSPNYG00000001914 ENSPNYG00000001930 pcdh2aa1 (ENSPNYG00000001937) ##12 ENSPNYG00000001964 ENSPNYG00000001990 ##12 ENSPNYG00000002003 #7 ENSPNYG00000002015 ENSPNYG00000002026 ##12 ENSPNYG00000002050 ##12 ENSPNYG00000002073 #9 ENSPNYG00000002123 ENSPNYG00000002147 ENSPNYG00000002160 ##25 ENSPNYG00000002176 ##25 ENSPNYG00000002201 ##25 ENSPNYG00000002217 ##25 ENSPNYG00000002235 #20 ENSPNYG00000002244 #19 ENSPNYG00000002261 #23 ENSPNYG00000002272 #21 ENSPNYG00000002293 ##25 ENSPNYG00000002390 ##25 pcdh2ac (ENSPNYG00000002432) #26 ENSPNYG00000002474 #35 ENSPNYG00000002485 #35 ENSPNYG00000002501 #33 ENSPNYG00000002519 ENSPNYG00000002527 ##37 ENSPNYG00000002547 #35 ENSPNYG00000002559 ##37 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000177060 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 Oryzias ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 Chinese medaka MODERN SPECIES 3304 ENSOSIG00000002729 ##25 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00940000177060 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.f #37 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.b ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000159725 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 99 fgf18a (ENSKMAG00000009296) ENSKMAG00000009286 ENSKMAG00000009276 ENSKMAG00000009266 ENSKMAG00000009260 ENSKMAG00000009251 ENSKMAG00000009232 pcdh2aa1 (ENSKMAG00000009189) ##12 ENSKMAG00000009160 ##12 ENSKMAG00000009148 ENSKMAG00000009114 ##12 ENSKMAG00000009069 ##12 ENSKMAG00000009055 ##25 ENSKMAG00000009036 #19 ENSKMAG00000009001 ##25 ENSKMAG00000008928 ##25 ENSKMAG00000008637 #21 ENSKMAG00000008569 #25 ENSKMAG00000008538 ##25 ENSKMAG00000008503 ##25 pcdh2ab8 (ENSKMAG00000008473) ##25 pcdh2ac (ENSKMAG00000008379) #26 ENSKMAG00000008313 #35 ENSKMAG00000008291 #35 ENSKMAG00000008252 ##37 ENSKMAG00000008210 ##37 ENSKMAG00000008192 ##37 ENSKMAG00000008161 ##37 ENSKMAG00000008140 #37 ENSKMAG00000008126 #37 ENSKMAG00000008110 #37 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 71 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00950000183286 ENSGT00990000205184 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 54 ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.fb ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a.e.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 Platyfish MODERN SPECIES 15 ENSXMAG00000023389 ENSXMAG00000029330 ENSXMAG00000027122 ##12 ENSXMAG00000027032 ENSXMAG00000025920 ##12 ENSXMAG00000022763 #8 ENSXMAG00000021470 #11 ENSXMAG00000020972 ENSXMAG00000029775 #12 ENSXMAG00000021646 ##12 ENSXMAG00000021457 ENSXMAG00000008338 #15 ENSXMAG00000028268 ##25 ENSXMAG00000021394 ##25 ENSXMAG00000026013 ##25 ENSXMAG00000025189 ##25 ENSXMAG00000021710 ENSXMAG00000024357 #23 ENSXMAG00000025065 ENSXMAG00000025626 ##25 ENSXMAG00000028407 #25 ENSXMAG00000029821 #25 ENSXMAG00000021550 ##25 ENSXMAG00000022961 ##25 pcdh2ac (ENSXMAG00000023782) #26 ENSXMAG00000020851 ##37 ENSXMAG00000023606 ##37 ENSXMAG00000021123 ##37 ENSXMAG00000021523 ##37 ENSXMAG00000025058 #37 ENSXMAG00000025081 #37 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT01010000224686 ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.r #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000159725 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b.h #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01100000264899 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.r #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 155 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.r #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000181572 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 1 ENSBSLG00000008322 pcdh2aa1 (ENSBSLG00000008342) ##12 ENSBSLG00000008363 pcdh2ac (ENSBSLG00000008390) #26 ENSBSLG00000008495 ENSBSLG00000008503 #7 ENSBSLG00000008510 #11 ENSBSLG00000008521 #8 ENSBSLG00000008537 #9 ENSBSLG00000008556 #12 ENSBSLG00000008573 #12 ENSBSLG00000008592 #9 ENSBSLG00000008609 ENSBSLG00000008614 ##12 ENSBSLG00000008618 ##25 ENSBSLG00000008630 ##25 ENSBSLG00000008634 #21 ENSBSLG00000008652 #25 ENSBSLG00000008657 #25 ENSBSLG00000008661 ##25 ENSBSLG00000008670 ##37 ENSBSLG00000008677 ENSBSLG00000008684 ##37 ENSBSLG00000008693 ##37 ENSBSLG00000008700 ENSBSLG00000008703 #37 ENSBSLG00000008705 #37 ENSBSLG00000008713 ##37 ENSBSLG00000008719 ##37 ENSBSLG00000008731 ENSBSLG00000008739 #35 Carangaria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a ##12 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b.h #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.f #37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00390000009004.d ENSGT00940000155898 ENSGT00940000159553.b ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 Turbot MODERN SPECIES 4 ENSSMAG00000001613 ENSSMAG00000030226 ENSSMAG00000001605 ENSSMAG00000034972 pcdh2aa1 (ENSSMAG00000016187) ##12 ENSSMAG00000016163 ##12 ENSSMAG00000033861 ENSSMAG00000034636 #8 ENSSMAG00000022434 #8 ENSSMAG00000023632 ##12 ENSSMAG00000025748 #9 ENSSMAG00000023362 ENSSMAG00000001346 #12 ENSSMAG00000022345 ENSSMAG00000028799 ##25 ENSSMAG00000021880 ##25 ENSSMAG00000001405 ##25 ENSSMAG00000001579 ENSSMAG00000023812 ##25 ENSSMAG00000024294 #25 ENSSMAG00000031943 ENSSMAG00000025670 #25 pcdh2ab10 (ENSSMAG00000033635) ##25 pcdh2ac (ENSSMAG00000030691) #26 ENSSMAG00000033759 #29 ENSSMAG00000024154 #35 ENSSMAG00000037132 ##37 ENSSMAG00000033616 ENSSMAG00000024825 ##37 ENSSMAG00000025683 ##37 ENSSMAG00000032750 ##37 Tongue sole MODERN SPECIES 6 ENSCSEG00000006401 ENSCSEG00000006396 ENSCSEG00000006391 ENSCSEG00000006389 ENSCSEG00000006387 ENSCSEG00000006385 ENSCSEG00000006382 ENSCSEG00000006376 ENSCSEG00000006372 ENSCSEG00000006348 #7 ENSCSEG00000006344 ##12 ENSCSEG00000006338 ENSCSEG00000006336 ENSCSEG00000006331 #12 ENSCSEG00000006327 ENSCSEG00000006324 ##25 ENSCSEG00000006319 #19 ENSCSEG00000006317 #21 ENSCSEG00000006313 ENSCSEG00000006308 #25 ENSCSEG00000006307 ##25 ENSCSEG00000006302 #27 pcdh2ab8 (ENSCSEG00000006301) ##25 ENSCSEG00000006284 ##25 ENSCSEG00000006271 #35 ENSCSEG00000006267 ENSCSEG00000006266 #36 ENSCSEG00000006261 ##37 ENSCSEG00000006256 #36 ENSCSEG00000006249 ##37 ENSCSEG00000006245 ##37 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a ##12 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b.h #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.f #37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.k ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000159725 Seriola ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00940000164725.a.a.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.e.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.e.b ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a.e #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a.b #35 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.j.a ##37 Greater amberjack DUPLICATION Greater amberjack MODERN SPECIES 275 ENSSDUG00000017451 ##12 ENSSDUG00000017443 ENSSDUG00000017438 #8 ENSSDUG00000017428 ENSSDUG00000017418 #9 ENSSDUG00000017408 #12 ENSSDUG00000017385 #9 ENSSDUG00000017378 ENSSDUG00000017367 #20 ENSSDUG00000017348 ##25 ENSSDUG00000017340 #23 ENSSDUG00000017329 #20 ENSSDUG00000017321 #19 ENSSDUG00000017307 ##25 ENSSDUG00000017292 ##25 ENSSDUG00000017283 ##25 ENSSDUG00000017279 ENSSDUG00000017270 #21 ENSSDUG00000017263 ENSSDUG00000017252 ##25 pcdh2ac (ENSSDUG00000017069) #26 ENSSDUG00000017023 ##25 ENSSDUG00000017016 #35 ENSSDUG00000017009 #35 ENSSDUG00000016999 ##37 ENSSDUG00000016989 #35 ENSSDUG00000016984 ##37 ENSSDUG00000016964 ##37 ENSSDUG00000016934 ##37 ENSSDUG00000016918 ##37 ENSSDUG00000016884 ##37 Greater amberjack MODERN SPECIES 275 ENSSDUG00000017451 ##12 ENSSDUG00000017443 ENSSDUG00000017438 #8 ENSSDUG00000017428 ENSSDUG00000017418 #9 ENSSDUG00000017408 #12 ENSSDUG00000017385 #9 ENSSDUG00000017378 ENSSDUG00000017367 #20 ENSSDUG00000017348 ##25 ENSSDUG00000017340 #23 ENSSDUG00000017329 #20 ENSSDUG00000017321 #19 ENSSDUG00000017307 ##25 ENSSDUG00000017292 ##25 ENSSDUG00000017283 ##25 ENSSDUG00000017279 ENSSDUG00000017270 #21 ENSSDUG00000017263 ENSSDUG00000017252 ##25 pcdh2ac (ENSSDUG00000017069) #26 ENSSDUG00000017023 ##25 ENSSDUG00000017016 #35 ENSSDUG00000017009 #35 ENSSDUG00000016999 ##37 ENSSDUG00000016989 #35 ENSSDUG00000016984 ##37 ENSSDUG00000016964 ##37 ENSSDUG00000016934 ##37 Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3259 ENSSLDG00000001620 ENSSLDG00000001614 ##12 ENSSLDG00000001589 ENSSLDG00000001573 ENSSLDG00000001476 ##12 ENSSLDG00000001456 ENSSLDG00000001401 ##12 ENSSLDG00000001370 ENSSLDG00000001326 #9 ENSSLDG00000001304 #12 ENSSLDG00000001283 ##12 ENSSLDG00000001262 #20 ENSSLDG00000001252 #9 ENSSLDG00000001232 ##25 ENSSLDG00000001211 #15 ENSSLDG00000001175 ##25 ENSSLDG00000001165 #19 ENSSLDG00000001154 ENSSLDG00000001128 #23 ENSSLDG00000001120 #21 ENSSLDG00000001101 ENSSLDG00000001084 #25 ENSSLDG00000001052 #25 ENSSLDG00000001036 ##25 pcdh2ac (ENSSLDG00000000958) #26 ENSSLDG00000000897 #35 ENSSLDG00000000862 #35 ENSSLDG00000000787 #35 ENSSLDG00000000448 #36 ENSSLDG00000000422 ##37 ENSSLDG00000000410 ##37 Barramundi perch MODERN SPECIES 127 ENSLCAG00010002505 ##12 ENSLCAG00010002501 ##12 ENSLCAG00010002497 ENSLCAG00010002494 ENSLCAG00010002490 ENSLCAG00010002486 ##12 ENSLCAG00010002482 #11 ENSLCAG00010002479 #12 ENSLCAG00010002477 ENSLCAG00010002476 #12 ENSLCAG00010002474 #12 ENSLCAG00010002472 ENSLCAG00010002470 ##25 ENSLCAG00010002469 #15 ENSLCAG00010002463 ##25 ENSLCAG00010002459 ##25 ENSLCAG00010002458 ##25 ENSLCAG00010002454 ##25 ENSLCAG00010002451 #25 ENSLCAG00010002447 #25 ENSLCAG00010002446 ##25 pcdh2ac (ENSLCAG00010002441) #26 ENSLCAG00010002440 #35 ENSLCAG00010002439 #35 ENSLCAG00010002434 #35 ENSLCAG00010002433 #35 ENSLCAG00010002430 ##37 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000178344 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000159725 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.b #12 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.b #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.`b #25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.r #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000159725 ENSGT00940000165759.b.a.a ENSGT00940000165759.a.b Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.j ##12 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.b #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.`b #25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 Large yellow croaker MODERN SPECIES ENSLCRG00005017036 ENSLCRG00005017037 ENSLCRG00005017038 ENSLCRG00005017039 ENSLCRG00005017040 #37 ENSLCRG00005017041 #37 ENSLCRG00005017042 ##37 ENSLCRG00005017043 ##37 ENSLCRG00005017044 #35 ENSLCRG00005017045 ##37 ENSLCRG00005017046 #35 pcdh2ac (ENSLCRG00005017049) #26 ENSLCRG00005017052 ENSLCRG00005017053 #20 ENSLCRG00005017056 #19 ENSLCRG00005017058 ##25 ENSLCRG00005017059 ENSLCRG00005017061 ENSLCRG00005017062 ENSLCRG00005017064 ENSLCRG00005017065 ENSLCRG00005017067 ENSLCRG00005017068 ##12 ENSLCRG00005017069 ENSLCRG00005000053 ENSLCRG00005000058 ENSLCRG00005000062 ENSLCRG00005000064 ENSLCRG00005000068 ENSLCRG00005000071 fgf18a (ENSLCRG00005000074) Perciformes ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000158371 ENSGT00390000009004.d ENSGT00940000155898 ENSGT00940000159553.b ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.a #25 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.b #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.b.b ##37 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000157352.b ENSGT00390000000002.a.a.a.nb.a ENSGT00390000002137 ENSGT00940000166070 ENSGT00940000158371 ENSGT00390000009004.d ENSGT00940000155898 ENSGT00940000159553.b ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.i.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.a #25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.f #37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000156683 ENSGT00940000165759.b.a.a ENSGT00940000165759.a.b ENSGT01060000248675 ENSGT00940000165759.b.a.b.b Channel bull blenny MODERN SPECIES 1 pcdh2aa1 (ENSCGOG00000001392) ##12 ENSCGOG00000001390 ENSCGOG00000001379 ##12 ENSCGOG00000001377 ENSCGOG00000001372 ##12 ENSCGOG00000001370 #12 ENSCGOG00000001366 #12 ENSCGOG00000001365 ENSCGOG00000001362 #12 ENSCGOG00000001357 #12 ENSCGOG00000001354 ENSCGOG00000001353 #12 ENSCGOG00000001352 #9 ENSCGOG00000001334 ##25 ENSCGOG00000001331 ##25 ENSCGOG00000001329 ##25 ENSCGOG00000001327 ENSCGOG00000001324 #21 ENSCGOG00000001321 #21 ENSCGOG00000001309 ##25 ENSCGOG00000001294 ##25 pcdh2ac (ENSCGOG00000001277) #26 ENSCGOG00000016133 #35 ENSCGOG00000016130 ##37 ENSCGOG00000016126 #35 ENSCGOG00000016115 #35 ENSCGOG00000016111 #35 ENSCGOG00000016106 #35 ENSCGOG00000016097 #37 ENSCGOG00000016090 ##37 ENSCGOG00000016088 ##37 Pike perch MODERN SPECIES 18 ENSSLUG00000000246 ENSSLUG00000000243 ENSSLUG00000004894 pcdh2aa1 (ENSSLUG00000004874) ##12 ENSSLUG00000004868 ##12 ENSSLUG00000004866 ##12 ENSSLUG00000004863 ENSSLUG00000004862 ENSSLUG00000004857 ##12 ENSSLUG00000004846 #8 ENSSLUG00000004828 #9 ENSSLUG00000004815 #12 ENSSLUG00000004811 #20 ENSSLUG00000004807 #15 ENSSLUG00000004799 #15 ENSSLUG00000004793 ##25 ENSSLUG00000004785 #15 ENSSLUG00000004756 #23 ENSSLUG00000004748 ##25 ENSSLUG00000004735 #25 pcdh2ac (ENSSLUG00000004719) #26 ENSSLUG00000004703 #35 ENSSLUG00000004697 #29 ENSSLUG00000004693 #35 ENSSLUG00000004688 #35 ENSSLUG00000004680 #35 ENSSLUG00000004678 #27 ENSSLUG00000004673 #33 ENSSLUG00000004655 #36 ENSSLUG00000004651 ##37 ENSSLUG00000004650 ##37 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.d ##25 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.d ##25 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.d ##25 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.d ##25 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.d ##25 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.d ##25 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 292 fbxw11a (ENSNBRG00000008857) fgf18a (ENSNBRG00000008832) ENSNBRG00000008036 ENSNBRG00000007925 ENSNBRG00000007915 ENSNBRG00000007729 ##12 ENSNBRG00000007703 ENSNBRG00000007631 ##12 ENSNBRG00000007606 ##12 ENSNBRG00000007597 ##12 ENSNBRG00000007572 ENSNBRG00000007525 #8 ENSNBRG00000007507 ENSNBRG00000007498 #20 ENSNBRG00000007487 ##25 ENSNBRG00000007473 ##25 ENSNBRG00000007468 #20 ENSNBRG00000007438 #19 ENSNBRG00000007430 #20 ENSNBRG00000007284 #19 ENSNBRG00000007249 ENSNBRG00000007229 #21 ENSNBRG00000007214 pcdh2ac (ENSNBRG00000007023) #26 ENSNBRG00000006973 #35 ENSNBRG00000006965 ENSNBRG00000006928 ##37 ENSNBRG00000006776 ##37 PCDHGB4 (ENSNBRG00000006507) ENSNBRG00000006465 ENSNBRG00000006317 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.d ##25 Oryzias ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.d ##25 Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.d ##25 Javanese ricefish MODERN SPECIES 1 ENSOJAG00000007209 ENSOJAG00000007239 ##12 ENSOJAG00000007284 #9 pcdh2ac (ENSOJAG00000007320) #26 ENSOJAG00000007379 ENSOJAG00000007393 ##12 ENSOJAG00000007414 #9 ENSOJAG00000007493 #12 ENSOJAG00000007530 #12 ENSOJAG00000007555 ENSOJAG00000007569 ##25 ENSOJAG00000007606 #18 ENSOJAG00000007610 #23 ENSOJAG00000007622 ##25 ENSOJAG00000007643 #25 ENSOJAG00000007675 ##25 ENSOJAG00000007685 ENSOJAG00000007712 #35 ENSOJAG00000007738 #35 ENSOJAG00000007765 #35 ENSOJAG00000007910 ##37 ENSOJAG00000007942 #35 ENSOJAG00000007960 #35 ENSOJAG00000007979 ##37 ENSOJAG00000007995 #35 ENSOJAG00000008007 ##37 ENSOJAG00000008030 #35 ENSOJAG00000008057 ##37 ENSOJAG00000008077 #37 ENSOJAG00000008105 ENSOJAG00000008171 Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b ##25 P. kingsleyae DUPLICATION P. kingsleyae MODERN SPECIES 495 ETF1 (ENSPKIG00000003947) ENSPKIG00000003867 fgf18a (ENSPKIG00000003805) ENSPKIG00000003780 ENSPKIG00000003765 pcdh2aa1 (ENSPKIG00000003736) ##12 ENSPKIG00000003702 ENSPKIG00000003678 #12 ENSPKIG00000003657 ENSPKIG00000003642 ENSPKIG00000003628 ENSPKIG00000003616 ENSPKIG00000003597 ##12 ENSPKIG00000003589 ENSPKIG00000003573 ##25 ENSPKIG00000003540 ##25 ENSPKIG00000003508 ENSPKIG00000003475 ##25 ENSPKIG00000003445 #37 ENSPKIG00000003429 ENSPKIG00000003414 #37 ENSPKIG00000003405 #37 ENSPKIG00000003392 #37 ENSPKIG00000003378 P. kingsleyae MODERN SPECIES 39 ENSPKIG00000017047 ENSPKIG00000017011 ENSPKIG00000016989 ENSPKIG00000016950 fbxw11a (ENSPKIG00000016883) fgf18a (ENSPKIG00000016851) ENSPKIG00000016838 ENSPKIG00000016812 ENSPKIG00000016798 ENSPKIG00000016782 ENSPKIG00000016759 ENSPKIG00000016741 ENSPKIG00000016718 ENSPKIG00000016708 ##25 ENSPKIG00000016693 ENSPKIG00000016681 ##25 ENSPKIG00000016664 ENSPKIG00000016610 ##25 ENSPKIG00000016572 ENSPKIG00000016565 #27 ENSPKIG00000016549 ##25 ENSPKIG00000016536 #27 ENSPKIG00000016502 ##25 pcdh2ac (ENSPKIG00000016447) #26 ENSPKIG00000016391 #37 ENSPKIG00000016378 ENSPKIG00000016372 ENSPKIG00000016356 ENSPKIG00000016344 ENSPKIG00000016329 ENSPKIG00000016314 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 909 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 882 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 78 ENSGT00940000164725.a.a.b.d.a.a ENSGT00940000164725.a.a.b.d.b.b ENSGT00940000164725.a.a.b.d.b.a ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a ##12 ENSGT01020000230605.f ENSGT00940000165118.a.a.b.b.a.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.a.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00940000165118.a.a.a.b.b ##12 ENSGT01020000230605.e ENSGT00940000165118.a.a.a.b.a ##12 ENSGT01100000265725 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT01090000260159 #27 Denticle herring DUPLICATION Denticle herring DUPLICATION Denticle herring MODERN SPECIES 9 ENSDCDG00000031002 ENSDCDG00000031004 ENSDCDG00000031005 ENSDCDG00000031006 ENSDCDG00000031007 ENSDCDG00000031009 ##12 pcdh2ac (ENSDCDG00000031012) #26 ENSDCDG00000031015 ENSDCDG00000031016 ##12 ENSDCDG00000031017 ##12 ENSDCDG00000031020 ##12 ENSDCDG00000031023 ##12 ENSDCDG00000031028 ENSDCDG00000031030 ##12 ENSDCDG00000031033 ENSDCDG00000031034 #21 ENSDCDG00000031036 ##25 ENSDCDG00000031037 ENSDCDG00000031039 ##25 ENSDCDG00000031040 ENSDCDG00000031043 ##25 ENSDCDG00000031045 ENSDCDG00000031049 PCDHGB4 (ENSDCDG00000031053) ENSDCDG00000031056 ENSDCDG00000031060 ENSDCDG00000031062 ENSDCDG00000031066 ENSDCDG00000031074 #21 ENSDCDG00000031077 #21 ENSDCDG00000031079 Denticle herring MODERN SPECIES 9 ENSDCDG00000031033 ENSDCDG00000031034 #21 ENSDCDG00000031036 ##25 ENSDCDG00000031037 ENSDCDG00000031039 ##25 ENSDCDG00000031040 ENSDCDG00000031043 ##25 ENSDCDG00000031045 ENSDCDG00000031049 PCDHGB4 (ENSDCDG00000031053) ENSDCDG00000031056 ENSDCDG00000031060 ENSDCDG00000031062 ENSDCDG00000031066 ENSDCDG00000031074 #21 ENSDCDG00000031077 #21 ENSDCDG00000031079 ENSDCDG00000005647 #27 ENSDCDG00000005652 ##25 ENSDCDG00000005668 ##25 ENSDCDG00000005682 ENSDCDG00000005686 pcdh2ab8 (ENSDCDG00000005694) ##25 ENSDCDG00000005701 ENSDCDG00000005815 ENSDCDG00000006020 ENSDCDG00000006061 ENSDCDG00000006121 ENSDCDG00000006146 ENSDCDG00000006217 ENSDCDG00000006246 Denticle herring MODERN SPECIES 9 ENSDCDG00000031030 ##12 ENSDCDG00000031033 ENSDCDG00000031034 #21 ENSDCDG00000031036 ##25 ENSDCDG00000031037 ENSDCDG00000031039 ##25 ENSDCDG00000031040 ENSDCDG00000031043 ##25 ENSDCDG00000031045 ENSDCDG00000031049 PCDHGB4 (ENSDCDG00000031053) ENSDCDG00000031056 ENSDCDG00000031060 ENSDCDG00000031062 ENSDCDG00000031066 ENSDCDG00000031074 #21 ENSDCDG00000031077 #21 ENSDCDG00000031079 ENSDCDG00000005647 #27 ENSDCDG00000005652 ##25 ENSDCDG00000005668 ##25 ENSDCDG00000005682 ENSDCDG00000005686 pcdh2ab8 (ENSDCDG00000005694) ##25 ENSDCDG00000005701 ENSDCDG00000005815 ENSDCDG00000006020 ENSDCDG00000006061 ENSDCDG00000006121 ENSDCDG00000006146 ENSDCDG00000006217 Atlantic herring MODERN SPECIES 24 taar19p (ENSCHAG00000026642) taar15 (ENSCHAG00000026644) ENSCHAG00000026646 ENSCHAG00000026647 ENSCHAG00000026649 PCDH1 (ENSCHAG00000026651) ENSCHAG00000026653 ENSCHAG00000026655 ENSCHAG00000026657 trpc7a (ENSCHAG00000000345) etf1b (ENSCHAG00000000871) FBXW11 (ENSCHAG00000001156) fgf18b (ENSCHAG00000001751) ENSCHAG00000001901 ENSCHAG00000001910 ENSCHAG00000001915 #21 ENSCHAG00000001928 ENSCHAG00000001937 ##25 ENSCHAG00000001951 ##25 ENSCHAG00000002022 ##25 ENSCHAG00000002040 ##37 ENSCHAG00000002072 #37 ENSCHAG00000002216 #37 ENSCHAG00000002238 #37 ENSCHAG00000002260 #37 ENSCHAG00000002267 #37 ENSCHAG00000002279 #37 ENSCHAG00000002285 #37 ENSCHAG00000002308 #37 ENSCHAG00000002322 #37 ENSCHAG00000002331 #37 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 680 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 652 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a ENSGT00940000164725.a.a.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b ##12 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.a ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b #37 ENSGT00940000156683 ENSGT00940000164468.a.a.a.a Pinecone sodierfish DUPLICATION Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 1 ENSMMDG00005002716 ENSMMDG00005002722 #7 ENSMMDG00005002746 #8 ENSMMDG00005002771 #9 ENSMMDG00005002794 #10 ENSMMDG00005002799 #11 ENSMMDG00005002805 #12 ENSMMDG00005002823 #13 ENSMMDG00005002843 #14 ENSMMDG00005002929 #15 ENSMMDG00005002938 #16 ENSMMDG00005002943 #17 ENSMMDG00005002947 #18 ENSMMDG00005002957 #19 ENSMMDG00005002973 #20 ENSMMDG00005002981 #21 ENSMMDG00005002984 #22 ENSMMDG00005002989 #23 ENSMMDG00005002994 #24 ENSMMDG00005003000 #25 pcdh2ac (ENSMMDG00005003028) #26 ENSMMDG00005003176 #27 ENSMMDG00005003181 #28 ENSMMDG00005003194 #29 ENSMMDG00005003201 #30 ENSMMDG00005003206 #31 ENSMMDG00005003210 #32 ENSMMDG00005003219 #33 ENSMMDG00005003228 #34 ENSMMDG00005003235 #35 ENSMMDG00005003245 #36 Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 1 ENSMMDG00005002675 ENSMMDG00005002691 ENSMMDG00005002702 ##12 ENSMMDG00005002712 ##12 ENSMMDG00005002716 ENSMMDG00005002722 #7 ENSMMDG00005002746 #8 ENSMMDG00005002771 #9 ENSMMDG00005002794 #10 ENSMMDG00005002799 #11 ENSMMDG00005002805 #12 ENSMMDG00005002823 #13 ENSMMDG00005002843 #14 ENSMMDG00005002929 #15 ENSMMDG00005002938 #16 ENSMMDG00005002943 #17 ENSMMDG00005002947 #18 ENSMMDG00005002957 #19 ENSMMDG00005002973 #20 ENSMMDG00005002981 #21 ENSMMDG00005002984 #22 ENSMMDG00005002989 #23 ENSMMDG00005002994 #24 ENSMMDG00005003000 #25 pcdh2ac (ENSMMDG00005003028) #26 ENSMMDG00005003176 #27 ENSMMDG00005003181 #28 ENSMMDG00005003194 #29 ENSMMDG00005003201 #30 ENSMMDG00005003206 #31 ENSMMDG00005003210 #32 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 102 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000178344 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b #37 ENSGT00940000165759.b.a.a ENSGT01100000264470 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000177513.a ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000165759.b.a.a ENSGT00940000165759.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.a.b Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000165759.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.b Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000165759.b.a.a ENSGT00940000177103 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.g ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000178703 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000177513.a ENSGT00940000166432.d.h.a.b.f.a ##37 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 110 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.g ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000178703 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.f.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 Spiny chromis MODERN SPECIES 4354 ENSAPOG00000011775 #21 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l.a.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b.f.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b.f.a #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.o.a.a.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.o.a.b #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.o.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.p #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.f.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a.m ##37 Clown anemonefish MODERN SPECIES 1335 ENSAOCG00000010182 #8 ENSAOCG00000010194 #8 ENSAOCG00000002009 #12 ENSAOCG00000010226 #12 ENSAOCG00000002555 ##25 ENSAOCG00000010257 #15 ENSAOCG00000010271 ##25 ENSAOCG00000010281 ##25 ENSAOCG00000010293 #19 ENSAOCG00000010312 ENSAOCG00000002556 #21 ENSAOCG00000010336 #25 ENSAOCG00000000647 #25 ENSAOCG00000010495 #25 pcdh2ab10 (ENSAOCG00000010528) ##25 pcdh2ac (ENSAOCG00000010573) #26 ENSAOCG00000010594 ENSAOCG00000010607 Orange clownfish MODERN SPECIES 4 ENSAPEG00000014772 ##12 ENSAPEG00000014759 #8 ENSAPEG00000014713 #9 ENSAPEG00000014699 #12 ENSAPEG00000014660 #12 ENSAPEG00000014647 ENSAPEG00000014641 #20 ENSAPEG00000014628 ##25 ENSAPEG00000014619 ##25 ENSAPEG00000014614 #20 ENSAPEG00000014604 ##25 ENSAPEG00000014585 #15 ENSAPEG00000014572 ##25 ENSAPEG00000014557 #19 ENSAPEG00000014543 ENSAPEG00000014528 #21 ENSAPEG00000014520 #23 ENSAPEG00000014312 #25 ENSAPEG00000014282 #27 ENSAPEG00000014133 #25 pcdh2ac (ENSAPEG00000014114) #26 ENSAPEG00000014085 #35 ENSAPEG00000014079 #35 ENSAPEG00000014053 #35 ENSAPEG00000014040 ENSAPEG00000014011 #35 ENSAPEG00000013996 #35 ENSAPEG00000013978 #33 ENSAPEG00000013946 #36 ENSAPEG00000013925 #35 ENSAPEG00000013896 ##37 Bicolor damselfish MODERN SPECIES 1164 ENSSPAG00000011168 ENSSPAG00000011158 #20 ENSSPAG00000011135 ##25 ENSSPAG00000011093 ##25 ENSSPAG00000011080 ENSSPAG00000011048 #21 ENSSPAG00000011039 ENSSPAG00000011031 #27 ENSSPAG00000011018 ##25 ENSSPAG00000011012 ##25 ENSSPAG00000011005 ##25 ENSSPAG00000010996 pcdh2ab8 (ENSSPAG00000010986) ##25 ENSSPAG00000010979 #35 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004.d.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 Midas cichlid MODERN SPECIES 115 ENSACIG00000014330 pcdh2aa1 (ENSACIG00000014308) ##12 ENSACIG00000014255 ##12 ENSACIG00000014245 #8 ENSACIG00000014237 ENSACIG00000014227 #12 ENSACIG00000014219 #12 ENSACIG00000014208 ENSACIG00000014155 ENSACIG00000014126 ##12 ENSACIG00000014100 ##25 ENSACIG00000014090 ##25 ENSACIG00000014073 ##25 ENSACIG00000014064 ##25 ENSACIG00000014056 ENSACIG00000014036 #21 ENSACIG00000014025 #20 ENSACIG00000014013 #27 ENSACIG00000014005 #25 ENSACIG00000013994 #25 ENSACIG00000013973 #25 ENSACIG00000013959 ##25 ENSACIG00000013949 #27 pcdh2ab8 (ENSACIG00000013935) ##25 pcdh2ac (ENSACIG00000013746) #26 ENSACIG00000013723 ##37 ENSACIG00000013643 #35 ENSACIG00000013633 #33 ENSACIG00000013629 ##37 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004.d.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00990000211570 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000027254 ENSONIG00000028843 ENSONIG00000037611 ENSONIG00000032228 ENSONIG00000036227 ENSONIG00000027109 #7 ENSONIG00000041059 ENSONIG00000032107 #8 ENSONIG00000034641 #9 ENSONIG00000030596 ##12 ENSONIG00000035556 #9 ENSONIG00000037921 ##25 ENSONIG00000021365 #15 ENSONIG00000034871 ##25 ENSONIG00000033250 ENSONIG00000021350 #21 ENSONIG00000029948 ENSONIG00000031283 #25 ENSONIG00000035146 ##25 pcdh2ac (ENSONIG00000030416) #26 ENSONIG00000032670 #35 ENSONIG00000029451 #35 ENSONIG00000028830 #35 ENSONIG00000042593 #35 ENSONIG00000028202 #35 ENSONIG00000040060 #33 ENSONIG00000031218 #36 ENSONIG00000004967 #35 ENSONIG00000029266 ENSONIG00000004968 ##37 ENSONIG00000041668 ##37 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004.d.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004.d.b ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00990000211570 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 292 ENSNBRG00000007703 ENSNBRG00000007631 ##12 ENSNBRG00000007606 ##12 ENSNBRG00000007597 ##12 ENSNBRG00000007572 ENSNBRG00000007525 #8 ENSNBRG00000007507 ENSNBRG00000007498 #20 ENSNBRG00000007487 ##25 ENSNBRG00000007473 ##25 ENSNBRG00000007468 #20 ENSNBRG00000007438 #19 ENSNBRG00000007430 #20 ENSNBRG00000007284 #19 ENSNBRG00000007249 ENSNBRG00000007229 #21 ENSNBRG00000007214 pcdh2ac (ENSNBRG00000007023) #26 ENSNBRG00000006973 #35 ENSNBRG00000006965 ENSNBRG00000006928 ##37 ENSNBRG00000006776 ##37 PCDHGB4 (ENSNBRG00000006507) ENSNBRG00000006465 ENSNBRG00000006317 ENSNBRG00000006280 ENSNBRG00000006273 ENSNBRG00000006262 ENSNBRG00000006253 ENSNBRG00000006237 ENSNBRG00000006214 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00990000205184 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.x #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00990000211570 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00990000205184 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000177004.d.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.w.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.x #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00990000211570 P. nyererei MODERN SPECIES 296 ENSPNYG00000001990 ##12 ENSPNYG00000002003 #7 ENSPNYG00000002015 ENSPNYG00000002026 ##12 ENSPNYG00000002050 ##12 ENSPNYG00000002073 #9 ENSPNYG00000002123 ENSPNYG00000002147 ENSPNYG00000002160 ##25 ENSPNYG00000002176 ##25 ENSPNYG00000002201 ##25 ENSPNYG00000002217 ##25 ENSPNYG00000002235 #20 ENSPNYG00000002244 #19 ENSPNYG00000002261 #23 ENSPNYG00000002272 #21 ENSPNYG00000002293 ##25 ENSPNYG00000002390 ##25 pcdh2ac (ENSPNYG00000002432) #26 ENSPNYG00000002474 #35 ENSPNYG00000002485 #35 ENSPNYG00000002501 #33 ENSPNYG00000002519 ENSPNYG00000002527 ##37 ENSPNYG00000002547 #35 ENSPNYG00000002559 ##37 ENSPNYG00000002580 ENSPNYG00000002596 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000177004.d.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.w.b.a #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.x #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.m #25 ENSGT00940000178344 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.n #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.a.a.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.a.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.k.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.b.b ##37 Eastern happy MODERN SPECIES 11 ENSACLG00000010910 #8 ENSACLG00000010945 ENSACLG00000010956 #12 ENSACLG00000010963 #12 ENSACLG00000010982 #12 ENSACLG00000010995 #9 ENSACLG00000011008 #12 ENSACLG00000011017 ##25 ENSACLG00000011028 #15 ENSACLG00000011046 ##25 ENSACLG00000011053 ##25 ENSACLG00000011068 ##25 ENSACLG00000011086 #20 ENSACLG00000011091 ##25 ENSACLG00000011099 #19 ENSACLG00000011102 #21 ENSACLG00000011124 ##25 ENSACLG00000011157 #25 ENSACLG00000011178 #25 ENSACLG00000011363 ##25 pcdh2ab8 (ENSACLG00000011367) ##25 ENSACLG00000011696 #35 ENSACLG00000011712 #35 ENSACLG00000011729 #35 ENSACLG00000011758 #35 ENSACLG00000011766 #35 ENSACLG00000011774 #33 ENSACLG00000011784 ##37 ENSACLG00000011797 #36 ENSACLG00000011808 #35 ENSACLG00000011825 ##37 Zebra mbuna DUPLICATION Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005000854 ##12 ENSMZEG00005000870 #8 ENSMZEG00005000894 #8 ENSMZEG00005000946 #9 ENSMZEG00005000958 ENSMZEG00005000982 #12 ENSMZEG00005000994 #12 ENSMZEG00005001006 #12 ENSMZEG00005001024 #15 ENSMZEG00005001048 ##25 ENSMZEG00005001068 #15 ENSMZEG00005001074 ##25 ENSMZEG00005001087 ##25 ENSMZEG00005001112 #19 ENSMZEG00005001122 #21 ENSMZEG00005001133 #21 ENSMZEG00005001148 ##25 ENSMZEG00005001175 #25 ENSMZEG00005001191 ENSMZEG00005001204 #25 ENSMZEG00005001496 ##25 ENSMZEG00005001585 ##25 pcdh2ac (ENSMZEG00005001600) #26 ENSMZEG00005001606 #35 ENSMZEG00005001612 #35 ENSMZEG00005001626 ENSMZEG00005001638 #35 ENSMZEG00005001643 #35 ENSMZEG00005001657 #35 ENSMZEG00005001678 #33 ENSMZEG00005001693 #35 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 ENSMZEG00005000843 #7 ENSMZEG00005000854 ##12 ENSMZEG00005000870 #8 ENSMZEG00005000894 #8 ENSMZEG00005000946 #9 ENSMZEG00005000958 ENSMZEG00005000982 #12 ENSMZEG00005000994 #12 ENSMZEG00005001006 #12 ENSMZEG00005001024 #15 ENSMZEG00005001048 ##25 ENSMZEG00005001068 #15 ENSMZEG00005001074 ##25 ENSMZEG00005001087 ##25 ENSMZEG00005001112 #19 ENSMZEG00005001122 #21 ENSMZEG00005001133 #21 ENSMZEG00005001148 ##25 ENSMZEG00005001175 #25 ENSMZEG00005001191 ENSMZEG00005001204 #25 ENSMZEG00005001496 ##25 ENSMZEG00005001585 ##25 pcdh2ac (ENSMZEG00005001600) #26 ENSMZEG00005001606 #35 ENSMZEG00005001612 #35 ENSMZEG00005001626 ENSMZEG00005001638 #35 ENSMZEG00005001643 #35 ENSMZEG00005001657 #35 ENSMZEG00005001678 #33 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 Oryzias ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000000002.a.a.a.nb.a ENSGT00390000002137 ENSGT00940000166070 ENSGT00940000158371 ENSGT01030000234599.a.b.c ENSGT00390000009004.d ENSGT00940000155898 ENSGT00940000159553.b ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.`b.b.b ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a.d ##25 ENSGT01030000236108 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a.c ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.b.b.b.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.b.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.h ##37 ENSGT00970000195503 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.i ##37 Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.`b.a ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.z ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.b ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.b ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b.l #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT01030000236108 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a.c ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.b.b.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.b.b.b.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.b.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.h ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.i ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b.e ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.d.b.a #35 Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 1 ENSORLG00000028462 ENSORLG00000023399 pcdh2aa1 (ENSORLG00000021994) ##12 ENSORLG00000028629 ##12 ENSORLG00000028208 ##12 ENSORLG00000030495 ENSORLG00000022312 #8 ENSORLG00000028903 #11 ENSORLG00000004181 #12 ENSORLG00000027606 ##12 ENSORLG00000029528 ENSORLG00000026864 ##25 ENSORLG00000026652 ENSORLG00000029341 ##25 ENSORLG00000024772 #19 ENSORLG00000004176 #21 ENSORLG00000004171 #23 ENSORLG00000023815 ##25 ENSORLG00000026259 ENSORLG00000029952 #25 ENSORLG00000024089 #25 ENSORLG00000028645 ENSORLG00000024851 ##25 pcdh2ab10 (ENSORLG00000022081) ##25 pcdh2ac (ENSORLG00000029405) #26 ENSORLG00000025371 #35 ENSORLG00000026934 #35 ENSORLG00000025477 #35 ENSORLG00000030492 #35 ENSORLG00000024469 #35 ENSORLG00000025135 ##37 Chinese medaka MODERN SPECIES 3022 ENSOSIG00000009184 #21 ENSOSIG00000009185 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000177060 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.f #37 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000159725 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.b ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.l ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000159725 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 99 ENSKMAG00000009286 ENSKMAG00000009276 ENSKMAG00000009266 ENSKMAG00000009260 ENSKMAG00000009251 ENSKMAG00000009232 pcdh2aa1 (ENSKMAG00000009189) ##12 ENSKMAG00000009160 ##12 ENSKMAG00000009148 ENSKMAG00000009114 ##12 ENSKMAG00000009069 ##12 ENSKMAG00000009055 ##25 ENSKMAG00000009036 #19 ENSKMAG00000009001 ##25 ENSKMAG00000008928 ##25 ENSKMAG00000008637 #21 ENSKMAG00000008569 #25 ENSKMAG00000008538 ##25 ENSKMAG00000008503 ##25 pcdh2ab8 (ENSKMAG00000008473) ##25 pcdh2ac (ENSKMAG00000008379) #26 ENSKMAG00000008313 #35 ENSKMAG00000008291 #35 ENSKMAG00000008252 ##37 ENSKMAG00000008210 ##37 ENSKMAG00000008192 ##37 ENSKMAG00000008161 ##37 ENSKMAG00000008140 #37 ENSKMAG00000008126 #37 ENSKMAG00000008110 #37 ENSKMAG00000008103 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 71 ENSGT00990000205184 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 54 ENSGT00940000177060 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 78 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.f.d.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.e.a #35 ENSGT00940000177513.b ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.f.d.b.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.f.d.b.b #35 ENSGT00940000177513.a ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.f.c #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e.hb.b #37 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 234 ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a.fb ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a.e.b ##12 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.k.a ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000177060 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.f.d.a #35 ENSGT00940000177513.b Sailfin molly MODERN SPECIES 832 ENSPLAG00000022186 ENSPLAG00000022176 ENSPLAG00000022163 ##12 ENSPLAG00000022132 ##12 ENSPLAG00000022119 ENSPLAG00000022112 ##12 ENSPLAG00000022093 ENSPLAG00000022078 ENSPLAG00000022070 ##12 ENSPLAG00000022049 #8 ENSPLAG00000022038 ##12 ENSPLAG00000022019 ##25 ENSPLAG00000022008 ##25 ENSPLAG00000021994 #20 ENSPLAG00000021982 #21 ENSPLAG00000021965 ENSPLAG00000021947 #25 ENSPLAG00000021911 ##25 pcdh2ac (ENSPLAG00000021883) #26 ENSPLAG00000021613 #35 ENSPLAG00000021597 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 116 ENSGT00940000159553.b ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000163777.b.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT00940000177060 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.f #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.e.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.f #37 Mummichog MODERN SPECIES 728 ENSFHEG00000006615 #11 ENSFHEG00000006632 #9 ENSFHEG00000006656 #12 ENSFHEG00000006678 #12 ENSFHEG00000006695 #12 ENSFHEG00000006751 ##25 ENSFHEG00000006762 ENSFHEG00000006774 ##25 ENSFHEG00000006783 #21 ENSFHEG00000000183 ENSFHEG00000006796 ##25 ENSFHEG00000006925 ##25 ENSFHEG00000006940 #25 ENSFHEG00000007008 ##25 pcdh2ab8 (ENSFHEG00000007019) ##25 pcdh2ac (ENSFHEG00000007030) #26 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 322 etf1a (ENSCVAG00000011438) fbxw11a (ENSCVAG00000011394) fgf18a (ENSCVAG00000011338) ENSCVAG00000011308 ENSCVAG00000011295 ENSCVAG00000011289 ENSCVAG00000011269 pcdh2aa1 (ENSCVAG00000011254) ##12 ENSCVAG00000011234 ENSCVAG00000011220 ENSCVAG00000011208 ##12 ENSCVAG00000011191 ##12 ENSCVAG00000011174 #11 ENSCVAG00000011160 #12 ENSCVAG00000011157 ##12 ENSCVAG00000011134 #21 pcdh2ac (ENSCVAG00000011115) #26 ENSCVAG00000011088 ##25 ENSCVAG00000011080 ##25 ENSCVAG00000011065 #23 ENSCVAG00000010928 #25 ENSCVAG00000010882 #35 ENSCVAG00000010856 #35 ENSCVAG00000010850 #35 ENSCVAG00000010808 #35 ENSCVAG00000010790 ##37 ENSCVAG00000010777 ##37 ENSCVAG00000010747 #37 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.r #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000159725 ENSGT00940000165759.b.a.a ENSGT00940000177103 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000177060 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.b #7 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b.h #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000177004 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01100000264899 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.r #35 ENSGT00940000177513.b Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b.h #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT01100000264899 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000181572 ENSGT00940000164468.a.a.a.a ENSGT00940000165759.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.b ENSGT00940000166867 ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.a.a.a.c.b Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.r #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000181572 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 1 pcdh2aa1 (ENSBSLG00000008342) ##12 ENSBSLG00000008363 pcdh2ac (ENSBSLG00000008390) #26 ENSBSLG00000008495 ENSBSLG00000008503 #7 ENSBSLG00000008510 #11 ENSBSLG00000008521 #8 ENSBSLG00000008537 #9 ENSBSLG00000008556 #12 ENSBSLG00000008573 #12 ENSBSLG00000008592 #9 ENSBSLG00000008609 ENSBSLG00000008614 ##12 ENSBSLG00000008618 ##25 ENSBSLG00000008630 ##25 ENSBSLG00000008634 #21 ENSBSLG00000008652 #25 ENSBSLG00000008657 #25 ENSBSLG00000008661 ##25 ENSBSLG00000008670 ##37 ENSBSLG00000008677 ENSBSLG00000008684 ##37 ENSBSLG00000008693 ##37 ENSBSLG00000008700 ENSBSLG00000008703 #37 ENSBSLG00000008705 #37 ENSBSLG00000008713 ##37 ENSBSLG00000008719 ##37 ENSBSLG00000008731 ENSBSLG00000008739 #35 ENSBSLG00000008744 ##37 Zig-zag eel MODERN SPECIES 1 ENSMAMG00000025285 ENSMAMG00000028262 ##12 ENSMAMG00000005084 ##12 ENSMAMG00000028444 ##12 ENSMAMG00000005059 ENSMAMG00000004908 #8 ENSMAMG00000004869 ENSMAMG00000025351 #12 ENSMAMG00000026543 #12 ENSMAMG00000028695 ENSMAMG00000004797 #20 ENSMAMG00000024580 ##25 ENSMAMG00000026967 #15 ENSMAMG00000004622 #15 ENSMAMG00000004617 ENSMAMG00000026670 #21 ENSMAMG00000024788 ##25 ENSMAMG00000004456 #25 ENSMAMG00000025800 ##37 ENSMAMG00000026498 #35 ENSMAMG00000004396 #35 ENSMAMG00000004391 #18 ENSMAMG00000004045 #33 ENSMAMG00000026949 #36 ENSMAMG00000028733 ##37 ENSMAMG00000026871 ##37 ENSMAMG00000027401 ##37 ENSMAMG00000004029 ##37 ENSMAMG00000027892 ##37 ENSMAMG00000003981 #37 ENSMAMG00000004003 ##37 Carangaria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.f #37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000159725 ENSGT00940000165759.b.a.a ENSGT00940000165759.a.b Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 180 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 Tongue sole MODERN SPECIES 6 ENSCSEG00000006391 ENSCSEG00000006389 ENSCSEG00000006387 ENSCSEG00000006385 ENSCSEG00000006382 ENSCSEG00000006376 ENSCSEG00000006372 ENSCSEG00000006348 #7 ENSCSEG00000006344 ##12 ENSCSEG00000006338 ENSCSEG00000006336 ENSCSEG00000006331 #12 ENSCSEG00000006327 ENSCSEG00000006324 ##25 ENSCSEG00000006319 #19 ENSCSEG00000006317 #21 ENSCSEG00000006313 ENSCSEG00000006308 #25 ENSCSEG00000006307 ##25 ENSCSEG00000006302 #27 pcdh2ab8 (ENSCSEG00000006301) ##25 ENSCSEG00000006284 ##25 ENSCSEG00000006271 #35 ENSCSEG00000006267 ENSCSEG00000006266 #36 ENSCSEG00000006261 ##37 ENSCSEG00000006256 #36 ENSCSEG00000006249 ##37 ENSCSEG00000006245 ##37 ENSCSEG00000006244 #35 ENSCSEG00000006240 #35 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.f #37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.k ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000159725 ENSGT00940000165759.b.a.a ENSGT00940000177103 ENSGT00940000156683 ENSGT00940000164468.a.a.a.a Barramundi perch MODERN SPECIES 808 ENSLCAG00010001220 ##25 ENSLCAG00010001224 #20 ENSLCAG00010001230 ##25 ENSLCAG00010001235 ##25 ENSLCAG00010001241 ENSLCAG00010001246 #21 ENSLCAG00010001256 ENSLCAG00010001259 ENSLCAG00010001261 #25 ENSLCAG00010001263 #25 ENSLCAG00010001264 ##25 ENSLCAG00010001267 ##25 Seriola ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.e.b ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT01090000260158 #20 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a.e #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a.b #35 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.j.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b.k ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000159725 ENSGT00940000165759.b.a.a Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3259 ENSSLDG00000001476 ##12 ENSSLDG00000001456 ENSSLDG00000001401 ##12 ENSSLDG00000001370 ENSSLDG00000001326 #9 ENSSLDG00000001304 #12 ENSSLDG00000001283 ##12 ENSSLDG00000001262 #20 ENSSLDG00000001252 #9 ENSSLDG00000001232 ##25 ENSSLDG00000001211 #15 ENSSLDG00000001175 ##25 ENSSLDG00000001165 #19 ENSSLDG00000001154 ENSSLDG00000001128 #23 ENSSLDG00000001120 #21 ENSSLDG00000001101 ENSSLDG00000001084 #25 ENSSLDG00000001052 #25 ENSSLDG00000001036 ##25 pcdh2ac (ENSSLDG00000000958) #26 ENSSLDG00000000897 #35 ENSSLDG00000000862 #35 ENSSLDG00000000787 #35 ENSSLDG00000000448 #36 ENSSLDG00000000422 ##37 ENSSLDG00000000410 ##37 ENSSLDG00000000240 ##37 ENSSLDG00000000209 ##37 ENSSLDG00000000184 ##37 ENSSLDG00000000142 #37 Greater amberjack MODERN SPECIES 275 ENSSDUG00000017438 #8 ENSSDUG00000017428 ENSSDUG00000017418 #9 ENSSDUG00000017408 #12 ENSSDUG00000017385 #9 ENSSDUG00000017378 ENSSDUG00000017367 #20 ENSSDUG00000017348 ##25 ENSSDUG00000017340 #23 ENSSDUG00000017329 #20 ENSSDUG00000017321 #19 ENSSDUG00000017307 ##25 ENSSDUG00000017292 ##25 ENSSDUG00000017283 ##25 ENSSDUG00000017279 ENSSDUG00000017270 #21 ENSSDUG00000017263 ENSSDUG00000017252 ##25 pcdh2ac (ENSSDUG00000017069) #26 ENSSDUG00000017023 ##25 ENSSDUG00000017016 #35 ENSSDUG00000017009 #35 ENSSDUG00000016999 ##37 ENSSDUG00000016989 #35 ENSSDUG00000016984 ##37 ENSSDUG00000016964 ##37 ENSSDUG00000016934 ##37 ENSSDUG00000016918 ##37 ENSSDUG00000016884 ##37 ENSSDUG00000016868 ##37 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a #25 ENSGT00940000178344 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000159725 ENSGT00940000165759.b.a.a ENSGT00940000165759.a.b Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000177060 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.b #12 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.b #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.`b #25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.r #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000159725 ENSGT00940000165759.b.a.a ENSGT00940000165759.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.a.b ENSGT00940000166867 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.b.a ##12 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.j ##12 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.b #12 ENSGT00940000177004 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.a #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.a.a ##25 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.b #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.`b #25 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.b ##37 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000155898 ENSGT00940000159553.b ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.a.a.a.b #8 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.a #9 ENSGT00940000165118.a.a.a.a.b.b.a.a.b #12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.b #23 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.a #25 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.b #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.b #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.b #36 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.b.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.f #37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000157352.b ENSGT00390000000002.a.a.a.nb.a ENSGT00390000002137 ENSGT00940000166070 ENSGT00940000158371 ENSGT00390000009004.d ENSGT00940000155898 ENSGT00940000159553.b ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT01020000230605.c.a ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.b.a #19 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT01090000260212 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.b #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.b.a #33 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.f #37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000165759.a.b ENSGT00940000165759.b.a.b.a.a.b ENSGT00940000166867 ENSGT00940000165759.a.a ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.a.a.b.b.a.a Lumpfish MODERN SPECIES 1 ENSCLMG00005017313 ENSCLMG00005017316 ENSCLMG00005017319 pcdh2aa1 (ENSCLMG00005017320) ##12 ENSCLMG00005017322 ENSCLMG00005017323 ##12 ENSCLMG00005017325 ENSCLMG00005017327 ENSCLMG00005017329 #8 ENSCLMG00005017333 #12 ENSCLMG00005001287 #12 ENSCLMG00005001296 #12 ENSCLMG00005001399 ##25 ENSCLMG00005001636 #15 ENSCLMG00005001644 #19 ENSCLMG00005001653 #21 ENSCLMG00005001663 ENSCLMG00005001671 ##25 ENSCLMG00005001678 ENSCLMG00005001688 #25 ENSCLMG00005001698 #27 pcdh2ac (ENSCLMG00005001736) #26 ENSCLMG00005001878 #35 ENSCLMG00005001881 #35 ENSCLMG00005001886 #35 ENSCLMG00005001887 #35 ENSCLMG00005001890 #35 ENSCLMG00005001891 #35 ENSCLMG00005001894 #33 ENSCLMG00005001898 #37 ENSCLMG00005001900 ##37 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000002137 ENSGT00940000166070 ENSGT00940000158371 ENSGT00390000009004.d ENSGT00940000155898 ENSGT00940000159553.b ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a.d.a ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a.b.b.a.i.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.a.b.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b.c.b ##25 ENSGT00940000177312 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.b #21 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.d.a.b.a.z.a #25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.a.q.a #35 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.f #37 ENSGT00940000166432.d.h.a.b ##37 ENSGT00940000166432.d.h.a.a.a.a.a.a ##37 ENSGT00940000166432.d.h.b.a.a.b.e #37 ENSGT00940000156683 ENSGT00940000165759.b.a.a ENSGT00940000165759.a.b ENSGT01060000248675 ENSGT00940000165759.b.a.b.b ENSGT00940000166867 ENSGT00940000165759.b.a.b.a.a.b Channel bull blenny DUPLICATION Channel bull blenny MODERN SPECIES 1 ENSCGOG00000001377 ENSCGOG00000001372 ##12 ENSCGOG00000001370 #12 ENSCGOG00000001366 #12 ENSCGOG00000001365 ENSCGOG00000001362 #12 ENSCGOG00000001357 #12 ENSCGOG00000001354 ENSCGOG00000001353 #12 ENSCGOG00000001352 #9 ENSCGOG00000001334 ##25 ENSCGOG00000001331 ##25 ENSCGOG00000001329 ##25 ENSCGOG00000001327 ENSCGOG00000001324 #21 ENSCGOG00000001321 #21 ENSCGOG00000001309 ##25 ENSCGOG00000001294 ##25 pcdh2ac (ENSCGOG00000001277) #26 ENSCGOG00000016133 #35 ENSCGOG00000016130 ##37 ENSCGOG00000016126 #35 ENSCGOG00000016115 #35 ENSCGOG00000016111 #35 ENSCGOG00000016106 #35 ENSCGOG00000016097 #37 ENSCGOG00000016090 ##37 ENSCGOG00000016088 ##37 ENSCGOG00000016070 ##37 ENSCGOG00000016066 #37 ENSCGOG00000016065 #37 Channel bull blenny MODERN SPECIES 1 ENSCGOG00000001379 ##12 ENSCGOG00000001377 ENSCGOG00000001372 ##12 ENSCGOG00000001370 #12 ENSCGOG00000001366 #12 ENSCGOG00000001365 ENSCGOG00000001362 #12 ENSCGOG00000001357 #12 ENSCGOG00000001354 ENSCGOG00000001353 #12 ENSCGOG00000001352 #9 ENSCGOG00000001334 ##25 ENSCGOG00000001331 ##25 ENSCGOG00000001329 ##25 ENSCGOG00000001327 ENSCGOG00000001324 #21 ENSCGOG00000001321 #21 ENSCGOG00000001309 ##25 ENSCGOG00000001294 ##25 pcdh2ac (ENSCGOG00000001277) #26 ENSCGOG00000016133 #35 ENSCGOG00000016130 ##37 ENSCGOG00000016126 #35 ENSCGOG00000016115 #35 ENSCGOG00000016111 #35 ENSCGOG00000016106 #35 ENSCGOG00000016097 #37 ENSCGOG00000016090 ##37 ENSCGOG00000016088 ##37 ENSCGOG00000016070 ##37 ENSCGOG00000016066 #37 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 1211 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.b ##25 ENSGT01100000264435 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 293 ENSGT00940000164725.a.a.a.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a ##12 ENSGT01020000230605 ENSGT00940000165118.a.a.a.b ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.a.c.a ##25 ENSGT00940000166432.c.b.b.a ##37 ENSGT00940000166867 ENSGT00940000165759 ENSGT00940000164468.a.a.b.b ENSGT00940000164468.a.b.a.b ENSGT00940000164983.d.b ENSGT00940000181572 ENSGT00940000164468.a.a.a.a ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.a.a.b ENSGT00940000164983.d.a.b ENSGT01020000232025 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 841 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.b ##25 ENSGT01100000264435 Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000155898 ENSGT00940000159553.b ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.a.b.g.a.b ENSGT00940000164725.a.a.a.a ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.a ##12 ENSGT00940000164725.a.a.b.h ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.b.g.b ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.a.b.i.a ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.a #25 ENSGT01020000230605.d ENSGT00940000165118.a.a.a.b.j ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.b ##25 ENSGT01100000264435 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.a.a.a #15 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.b #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.f #25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.i.b.a.a.a.b #30 ENSGT00940000156683 ENSGT00940000164468.a.a.a.a ENSGT00940000165759 ENSGT01060000248675 ENSGT00940000164468.a.a.b.b ENSGT00940000164468.a.b.a.b ENSGT00940000164983.d.b ENSGT00940000164983.d.a.a.d.a Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 721 ENSGT00940000165118.a.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.b.i.b.a.b.a ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.a.b.j ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.b.a ##25 ENSGT01100000264435 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.a.a.b #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.b.a.b #25 ENSGT00940000160554.b.b #26 ENSGT00940000166432.d.i.b.b.a.a #30 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 191 ENSGT00940000164725.a.a.b.g.a.b.b ENSGT00940000165118.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.a.b ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.a.a.b #25 ENSGT00940000165118.a.a.a.b.j ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.b.a ##25 ENSGT01100000264435 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.a.a.b #25 Salmo ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00390000000002.a.a.a.nb.a.gb ENSGT00390000002137.c ENSGT00940000158371.nb.b ENSGT00390000009004.d.f ENSGT00940000155898.v.b ENSGT00940000159553.b.d ENSGT00940000163777.b.a.a.f ENSGT00940000164725.a.b.b.b ENSGT00940000164725.a.a.b.h ENSGT00940000164725.a.b.b.a ENSGT00940000164725.a.a.b.g.a.b.b ENSGT00940000165118.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.a.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.b.j ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.b.a ##25 ENSGT01100000264435 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.a.a.b #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.b.a.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000160554.b.b #26 ENSGT00940000166432.d.i.b.b.b.a.a #30 ENSGT00940000166432.d.i.b.a.a.a.a #30 ENSGT00940000164468.a.a.a.a.b.b ENSGT00940000166432.d.i.b.a.a.b #30 ENSGT00940000166432.d.i.b.b.a.b.a #30 Atlantic salmon MODERN SPECIES 28 fbxw11a (ENSSSAG00000070242) fgf18a (ENSSSAG00000002212) ENSSSAG00000002251 ENSSSAG00000107023 ENSSSAG00000084167 ENSSSAG00000002102 pcdh2aa1 (ENSSSAG00000109974) ##12 ENSSSAG00000002499 ##12 ENSSSAG00000109231 ##12 ENSSSAG00000002645 #26 ENSSSAG00000102342 ##12 ENSSSAG00000108860 ##12 ENSSSAG00000116202 ##12 ENSSSAG00000090133 ##12 ENSSSAG00000099988 ##12 ENSSSAG00000107105 ##25 ENSSSAG00000002684 ENSSSAG00000076143 ##25 ENSSSAG00000002674 #25 ENSSSAG00000002666 #25 ENSSSAG00000092987 #25 ENSSSAG00000002198 #25 ENSSSAG00000100420 #25 ENSSSAG00000002168 #25 ENSSSAG00000117938 #30 ENSSSAG00000005875 #30 ENSSSAG00000002624 #30 ENSSSAG00000103449 #30 ENSSSAG00000095445 #30 ENSSSAG00000002631 #30 ENSSSAG00000002598 #30 Huchen MODERN SPECIES 1558 pcdh2ab5 (ENSHHUG00000041497) ##25 ENSHHUG00000041500 #25 ENSHHUG00000041563 #25 ENSHHUG00000041567 #25 ENSHHUG00000041575 #25 ENSHHUG00000041584 #26 ENSHHUG00000041589 #30 ENSHHUG00000041600 #30 ENSHHUG00000041610 #30 ENSHHUG00000041657 #30 ENSHHUG00000041686 #30 ENSHHUG00000041694 #30 ENSHHUG00000041697 ENSHHUG00000041867 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 721 ENSGT00940000165118.a.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.b.i.b.a.b.a ##12 ENSGT01020000230605.c.b ENSGT00940000165118.a.a.a.b.j ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.b.a ##25 ENSGT01100000264435 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.a.a.b #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.b.a.b #25 ENSGT00940000160554.b.b #26 ENSGT00940000166432.d.i.b.b.a.a #30 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 191 ENSGT00940000164725.a.a.b.g.a.b.b ENSGT00940000165118.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.a.b ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.a.a.b #25 ENSGT00940000165118.a.a.a.b.j ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.b.a ##25 ENSGT01100000264435 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.a.a.b #25 Salmo ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00940000158371.nb.b ENSGT00390000009004.d.f ENSGT00940000155898.v.b ENSGT00940000159553.b.d ENSGT00940000163777.b.a.a.f ENSGT00940000164725.a.b.b.b ENSGT00940000164725.a.a.b.h ENSGT00940000164725.a.b.b.a ENSGT00940000164725.a.a.b.g.a.b.b ENSGT00940000165118.b.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.a.a.a.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.a.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.b.j ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.b.a ##25 ENSGT01100000264435 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.a.a.b #25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.b.a.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000160554.b.b #26 ENSGT00940000166432.d.i.b.b.b.a.a #30 ENSGT00940000166432.d.i.b.a.a.a.a #30 ENSGT00940000164468.a.a.a.a.b.b ENSGT00940000166432.d.i.b.a.a.b #30 ENSGT00940000166432.d.i.b.b.a.b.a #30 Atlantic salmon MODERN SPECIES 28 ENSSSAG00000002251 ENSSSAG00000107023 ENSSSAG00000084167 ENSSSAG00000002102 pcdh2aa1 (ENSSSAG00000109974) ##12 ENSSSAG00000002499 ##12 ENSSSAG00000109231 ##12 ENSSSAG00000002645 #26 ENSSSAG00000102342 ##12 ENSSSAG00000108860 ##12 ENSSSAG00000116202 ##12 ENSSSAG00000090133 ##12 ENSSSAG00000099988 ##12 ENSSSAG00000107105 ##25 ENSSSAG00000002684 ENSSSAG00000076143 ##25 ENSSSAG00000002674 #25 ENSSSAG00000002666 #25 ENSSSAG00000092987 #25 ENSSSAG00000002198 #25 ENSSSAG00000100420 #25 ENSSSAG00000002168 #25 ENSSSAG00000117938 #30 ENSSSAG00000005875 #30 ENSSSAG00000002624 #30 ENSSSAG00000103449 #30 ENSSSAG00000095445 #30 ENSSSAG00000002631 #30 ENSSSAG00000002598 #30 ENSSSAG00000065216 #30 ENSSSAG00000002636 #30 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 66 ENSGT00950000186323 ENSGT00940000158371 ENSGT00390000009004.d ENSGT00940000155898.r ENSGT00940000159553.b ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.b.a ##12 ENSGT01020000230605 ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.a.b ##12 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d #37 ENSGT00940000177513 ENSGT00940000156683 ENSGT00940000181572 ENSGT00940000164468.a.a.a.a ENSGT00940000165759 ENSGT00940000166867 ENSGT00940000164468.a.a.b.b.f ENSGT00940000164983.d.a.b ENSGT01020000232025 ENSGT00940000164468.a.a.b.a.a.a.a.b Otophysi ANCESTRAL SPECIES 116 ENSGT00940000158371 ENSGT00390000009004.d ENSGT00940000155898.r ENSGT00940000159553.b ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.b.a.b ENSGT00940000164725.a.a.b.a.a ENSGT00940000165118.b ##12 ENSGT00940000164725.a.a.b.b ENSGT00940000165118.a.a.b.a ##12 ENSGT00940000177060 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.a.b ##12 ENSGT00940000164173.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000166432.d.f.b #37 ENSGT00940000177513 ENSGT00940000166432.d.f.a.b #37 ENSGT00940000156683 ENSGT00940000166432.d.f.a.a #37 ENSGT00940000181572 ENSGT00940000164468.a.a.a.a ENSGT00940000165759.e.a ENSGT00940000164468.a.a.b.b.e.b ENSGT01060000248675 ENSGT00940000164468.a.a.b.b.e.a.b Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 198 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.a.c.a.a ##25 ENSGT00940000160554.a ##26 ENSGT00940000166432.d.g #37 ENSGT00940000178703 ENSGT00940000166432.c.b.a ##37 ENSGT00940000166867 ENSGT00940000165759.f ENSGT00940000164468.a.a.b.b.f.b.a ENSGT00940000164983.d.a.b ENSGT01020000232025 Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 217 ENSGT00940000164725.a.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.b.a.a.b.a.b.a ENSGT00940000164725.a.a.b.a.a.b.a.b.b ENSGT00940000165118.a.a.b.b.a.b ##12 ENSGT00950000183286 ENSGT00940000165118.a.a.a.b ##12 ENSGT00940000164173.a.a.c ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.a.c.a.a.b ##25 ENSGT00940000164173.b.a.c.a.b.c ##25 Characoidei ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT00940000174022 ENSGT00390000008961.a ENSGT00940000166070 ENSGT00940000158371 ENSGT00390000009004.d ENSGT00940000155898.r ENSGT00940000159553.b ENSGT00940000163777.b.a.a ENSGT00940000164725.a.b.b ENSGT00940000164725.a.a.b.a.a.b.a.b.a ENSGT00940000165118.a.a.b.b.a.b ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.b.b.a.a.a ##12 ENSGT00940000165118.a.a.a.b ##12 ENSGT00940000164173.a.a.c ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.b ##25 ENSGT00940000164173.b.b.b.a #25 ENSGT01090000260159 #27 ENSGT00940000164173.b.b.a.a.a.a ##25 ENSGT00940000164173.b.b.a.a.a.b ##25 ENSGT00940000160554.b #26 ENSGT00940000163777.a.j.a ENSGT00940000159910 ENSGT01060000248588.a.c.a.a ENSGT01090000260190 ENSGT00940000154903 ENSGT00940000158761.a ENSGT00390000006975.g.b ENSGT00940000160629.b ENSGT00940000158048.c ENSGT00390000000610 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 95 SPOCK1 (ENSPNAG00000011338) etf1a (ENSPNAG00000011377) fbxw11a (ENSPNAG00000011390) fgf18a (ENSPNAG00000011409) ENSPNAG00000011422 ENSPNAG00000001729 ENSPNAG00000001731 ENSPNAG00000011439 ENSPNAG00000011444 ENSPNAG00000011456 ##12 ENSPNAG00000011467 ##12 ENSPNAG00000011478 ##12 ENSPNAG00000011494 ##12 ENSPNAG00000011499 ENSPNAG00000011504 ##12 pcdh2ab5 (ENSPNAG00000001772) ##25 ENSPNAG00000011530 #25 ENSPNAG00000011537 #27 ENSPNAG00000001792 #27 ENSPNAG00000005074 #25 ENSPNAG00000004900 ##25 ENSPNAG00000005841 #27 ENSPNAG00000001847 ##12 pcdh2ac (ENSPNAG00000011721) #26 ENSPNAG00000001896 #37 Mexicana tetra MODERN SPECIES 23 fgf18a (ENSAMXG00000034427) ENSAMXG00000015803 ENSAMXG00000024854 ENSAMXG00000043757 ENSAMXG00000032715 ENSAMXG00000036837 ENSAMXG00000036613 ENSAMXG00000036687 ENSAMXG00000030725 ENSAMXG00000035121 ##12 ENSAMXG00000040436 ##12 ENSAMXG00000015901 ##12 ENSAMXG00000035077 ##12 ENSAMXG00000041384 ##12 ENSAMXG00000038392 ##25 pcdh2ab5 (ENSAMXG00000043213) ##25 ENSAMXG00000031366 ENSAMXG00000029715 #25 ENSAMXG00000040705 #27 ENSAMXG00000043391 #27 ENSAMXG00000038126 ##25 ENSAMXG00000036627 ##25 ENSAMXG00000029903 pcdh2ac (ENSAMXG00000015873) #26 ENSAMXG00000044074 #37 ENSAMXG00000039158 #37 ENSAMXG00000034902 #37 ENSAMXG00000040841 #37 ENSAMXG00000030514 #37 ENSAMXG00000033700 ENSAMXG00000031276 Electric eel MODERN SPECIES 106 ENSEEEG00000014070 ENSEEEG00000014069 ENSEEEG00000014068 ENSEEEG00000014067 ENSEEEG00000014065 ENSEEEG00000014064 ##12 ENSEEEG00000014062 ##12 ENSEEEG00000014061 ##12 ENSEEEG00000014060 ##12 ENSEEEG00000014058 ##12 ENSEEEG00000014056 ##12 pcdh2ab1 (ENSEEEG00000014055) ##25 ENSEEEG00000014053 ENSEEEG00000014052 #25 ENSEEEG00000014051 #27 pcdh2ab5 (ENSEEEG00000014006) ##25 ENSEEEG00000014001 ##25 ENSEEEG00000014000 ##25 ENSEEEG00000013998 ##25 ENSEEEG00000013997 ##25 Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.b ##25 Zebrafish DUPLICATION Zebrafish MODERN SPECIES 5 ENSDARG00000102198 ENSDARG00000098566 ENSDARG00000102095 ENSDARG00000101667 ENSDARG00000099487 ENSDARG00000100424 ENSDARG00000077023 ENSDARG00000099535 ##12 ENSDARG00000089297 ##25 ENSDARG00000089593 ##25 pcdh2ab2 (ENSDARG00000037691) ##25 pcdh2aa1 (ENSDARG00000037695) ##12 pcdh2ab1 (ENSDARG00000071904) ##25 pcdh2aa15 (ENSDARG00000088136) ##12 ENSDARG00000099468 ##25 pcdh2ab3 (ENSDARG00000102719) ##25 pcdh2ab5 (ENSDARG00000090348) ##25 pcdh2ab6 (ENSDARG00000091043) ##25 pcdh2ab8 (ENSDARG00000089874) ##25 pcdh2ab10 (ENSDARG00000103906) ##25 pcdh2ab12 (ENSDARG00000104080) ##25 pcdh2ac (ENSDARG00000099783) #26 ENSDARG00000104141 ##25 pcdh2ab9 (ENSDARG00000101318) #26 ENSDARG00000115882 ENSDARG00000110089 ENSDARG00000101338 #37 ENSDARG00000109361 #37 pcdh2g13 (ENSDARG00000098788) TRPC7 (ENSDARG00000079469) hrh2a (ENSDARG00000107444) Zebrafish MODERN SPECIES 5 ENSDARG00000098566 ENSDARG00000102095 ENSDARG00000101667 ENSDARG00000099487 ENSDARG00000100424 ENSDARG00000077023 ENSDARG00000099535 ##12 ENSDARG00000089297 ##25 ENSDARG00000089593 ##25 pcdh2ab2 (ENSDARG00000037691) ##25 pcdh2aa1 (ENSDARG00000037695) ##12 pcdh2ab1 (ENSDARG00000071904) ##25 pcdh2aa15 (ENSDARG00000088136) ##12 ENSDARG00000099468 ##25 pcdh2ab3 (ENSDARG00000102719) ##25 pcdh2ab5 (ENSDARG00000090348) ##25 pcdh2ab6 (ENSDARG00000091043) ##25 pcdh2ab8 (ENSDARG00000089874) ##25 pcdh2ab10 (ENSDARG00000103906) ##25 pcdh2ab12 (ENSDARG00000104080) ##25 pcdh2ac (ENSDARG00000099783) #26 ENSDARG00000104141 ##25 pcdh2ab9 (ENSDARG00000101318) #26 ENSDARG00000115882 ENSDARG00000110089 ENSDARG00000101338 #37 ENSDARG00000109361 #37 pcdh2g13 (ENSDARG00000098788) TRPC7 (ENSDARG00000079469) hrh2a (ENSDARG00000107444) ENSDARG00000114649 Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 869 ENSGT00940000164173.b.b.b.b.b.b ##25 ENSGT01100000264435 P. kingsleyae DUPLICATION P. kingsleyae MODERN SPECIES 39 ENSPKIG00000016989 ENSPKIG00000016950 fbxw11a (ENSPKIG00000016883) fgf18a (ENSPKIG00000016851) ENSPKIG00000016838 ENSPKIG00000016812 ENSPKIG00000016798 ENSPKIG00000016782 ENSPKIG00000016759 ENSPKIG00000016741 ENSPKIG00000016718 ENSPKIG00000016708 ##25 ENSPKIG00000016693 ENSPKIG00000016681 ##25 ENSPKIG00000016664 ENSPKIG00000016610 ##25 ENSPKIG00000016572 ENSPKIG00000016565 #27 ENSPKIG00000016549 ##25 ENSPKIG00000016536 #27 ENSPKIG00000016502 ##25 pcdh2ac (ENSPKIG00000016447) #26 ENSPKIG00000016391 #37 ENSPKIG00000016378 ENSPKIG00000016372 ENSPKIG00000016356 ENSPKIG00000016344 ENSPKIG00000016329 ENSPKIG00000016314 ENSPKIG00000016302 ENSPKIG00000016290 P. kingsleyae MODERN SPECIES 39 ENSPKIG00000017110 ENSPKIG00000017081 ENSPKIG00000017047 ENSPKIG00000017011 ENSPKIG00000016989 ENSPKIG00000016950 fbxw11a (ENSPKIG00000016883) fgf18a (ENSPKIG00000016851) ENSPKIG00000016838 ENSPKIG00000016812 ENSPKIG00000016798 ENSPKIG00000016782 ENSPKIG00000016759 ENSPKIG00000016741 ENSPKIG00000016718 ENSPKIG00000016708 ##25 ENSPKIG00000016693 ENSPKIG00000016681 ##25 ENSPKIG00000016664 ENSPKIG00000016610 ##25 ENSPKIG00000016572 ENSPKIG00000016565 #27 ENSPKIG00000016549 ##25 ENSPKIG00000016536 #27 ENSPKIG00000016502 ##25 pcdh2ac (ENSPKIG00000016447) #26 ENSPKIG00000016391 #37 ENSPKIG00000016378 ENSPKIG00000016372 ENSPKIG00000016356 ENSPKIG00000016344 Asian bonytongue MODERN SPECIES 4 ENSSFOG00015025203 ENSSFOG00015004491 ENSSFOG00015029606 DOCK2 (ENSSFOG00015004370) hrh2a (ENSSFOG00015004470) ENSSFOG00015004457 ENSSFOG00015004315 fbxw11a (ENSSFOG00015004257) fgf18a (ENSSFOG00015031769) ENSSFOG00015004226 ENSSFOG00015032937 ENSSFOG00015004184 ENSSFOG00015027194 ENSSFOG00015030376 pcdh2ac (ENSSFOG00015024571) #26 ENSSFOG00015004045 ##25 ENSSFOG00015030976 ##25 ENSSFOG00015003974 #27 ENSSFOG00015003984 ##25 ENSSFOG00015029877 ##25 ENSSFOG00015003820 #37 ENSSFOG00015003779 #37 ENSSFOG00015003607 ENSSFOG00015003693 #37 ENSSFOG00015003634 ENSSFOG00015028728 ENSSFOG00015030767 ENSSFOG00015032778 ENSSFOG00015030442 ENSSFOG00015029790 ENSSFOG00015003457