Eutheria ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000158025.a.a.b ENSGT00940000157022 #10 ENSGT00940000172381 ENSGT00940000158558 #11 ENSGT00940000158702 ENSGT00950000183139.C #12 ENSGT00510000047513 #13 ENSGT00950000182849.B.c.a #14 ENSGT00940000158204.b #15 ENSGT00390000014178 #16 ENSGT00950000182935.B.b.d ENSGT00390000001979 #18 ENSGT00940000158812 #19 ENSGT00940000157651 #20 ENSGT00530000063647.A.a #21 ENSGT00940000153095.g.b.a.a #22 ENSGT00390000006348 #23 ENSGT00940000153095.g.a ##22 ENSGT00390000017606.a.b #24 ENSGT00510000047678 #25 ENSGT00940000154768.B #26 ENSGT00390000001723 #27 ENSGT00940000160452 #28 ENSGT00940000159176 #29 ENSGT00940000160824 #30 ENSGT00950000183193.A.c.b #31 ENSGT01030000234629.E.a.b #32 ENSGT00530000063937.b #33 ENSGT00390000008964 #34 ENSGT00940000161283 #35 ENSGT00940000153496.a.a #36 Boreoeutheria DUPLICATION Boreoeutheria DUPLICATION Boreoeutheria DUPLICATION Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b #22 Euarchontoglires DUPLICATION Euarchontoglires DUPLICATION Euarchontoglires DUPLICATION Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000158025.a.a.b ENSGT00940000157022 #10 ENSGT00940000158558 #11 ENSGT00940000158702 ENSGT00950000183139.C #12 ENSGT00510000047513 #13 ENSGT00950000182849.B.c.a #14 ENSGT00940000158204.b #15 ENSGT00390000014178 #16 ENSGT00950000182935.B.b.d ENSGT00390000001979 #18 ENSGT00940000158812 #19 ENSGT00940000157651 #20 ENSGT00530000063647.A.a #21 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b ##22 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a #22 ENSGT00390000006348 #23 ENSGT00390000017606.a.b #24 ENSGT00510000047678 #25 ENSGT00940000154768.B #26 ENSGT00390000001723 #27 ENSGT00940000160452 #28 ENSGT00940000159176 #29 ENSGT00940000160824 #30 ENSGT00950000183193.A.c.b #31 ENSGT01030000234629.E.a.b #32 ENSGT00530000063937.b #33 ENSGT00390000008964 #34 ENSGT00940000161283 #35 ENSGT00940000153496.a.a #36 ENSGT00390000007652 #37 Primates DUPLICATION Primates DUPLICATION Primates DUPLICATION Primates ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000014795 #9 ENSGT00940000158025.a.a.b ENSGT00940000157022 #10 ENSGT00940000158558 #11 ENSGT00940000158702 ENSGT00950000183139.C #12 ENSGT00510000047513 #13 ENSGT00950000182849.B.c.a #14 ENSGT00940000158204.b #15 ENSGT00390000014178 #16 ENSGT00950000182935.B.b.d ENSGT00390000001979 #18 ENSGT00940000158812 #19 ENSGT00940000157651 #20 ENSGT00530000063647.A.a #21 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.a.a.b #22 ENSGT00390000006348 #23 ENSGT00390000017606.a.b #24 ENSGT00510000047678 #25 ENSGT00940000154768.B #26 ENSGT00390000001723 #27 ENSGT00940000160452 #28 ENSGT00940000159176 #29 ENSGT00940000160824 #30 ENSGT00950000183193.A.c.b #31 ENSGT01030000234629.E.a.b #32 ENSGT00530000063937.b #33 ENSGT00390000008964 #34 ENSGT00940000161283 #35 ENSGT00940000153496.a.a #36 ENSGT00390000007652 #37 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00390000014795 #9 ENSGT00940000158025.a.a.b ENSGT00940000157022 #10 ENSGT00940000158558 #11 ENSGT00940000158702 ENSGT00950000183139.C #12 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ENSGT00390000017606.a.b #24 ENSGT00510000047678 #25 ENSGT00940000154768.B #26 ENSGT00390000001723 #27 ENSGT00940000160452 #28 ENSGT00940000159176 #29 ENSGT00940000160824 #30 ENSGT00950000183193.A.c.b #31 ENSGT01030000234629.E.a.b #32 ENSGT00530000063937.b #33 ENSGT00390000008964 #34 ENSGT00940000161283 #35 ENSGT00940000153496.a.a #36 ENSGT00390000007652 #37 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000014795 #9 ENSGT00940000158025.a.a.b ENSGT00940000157022 #10 ENSGT00940000158558 #11 ENSGT00940000158702 ENSGT00950000183139.C #12 ENSGT00510000047513 #13 ENSGT00950000182849.B.c.a #14 ENSGT00940000158204.b #15 ENSGT00390000014178 #16 ENSGT00950000182935.B.b.d ENSGT00390000001979 #18 ENSGT00940000158812 #19 ENSGT00940000157651 #20 ENSGT00530000063647.A.a #21 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.a.a.b #22 ENSGT00390000006348 #23 ENSGT00390000017606.a.b #24 ENSGT00510000047678 #25 ENSGT00940000154768.B #26 ENSGT00390000001723 #27 ENSGT00940000160452 #28 ENSGT00940000159176 #29 ENSGT00940000160824 #30 ENSGT00950000183193.A.c.b #31 ENSGT01030000234629.E.a.b #32 ENSGT00530000063937.b #33 ENSGT00390000008964 #34 ENSGT00940000161283 #35 ENSGT00940000153496.a.a #36 ENSGT00390000007652 #37 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000014795 #9 ENSGT00940000158025.a.a.b ENSGT00940000157022 #10 ENSGT00940000158558 #11 ENSGT00940000158702 ENSGT00950000183139.C #12 ENSGT00510000047513 #13 ENSGT00950000182849.B.c.a #14 ENSGT00940000158204.b #15 ENSGT00390000014178 #16 ENSGT00950000182935.B.b.d ENSGT00390000001979 #18 ENSGT00940000158812 #19 ENSGT00940000157651 #20 ENSGT00530000063647.A.a #21 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.a.a.b #22 ENSGT00390000006348 #23 ENSGT00390000017606.a.b #24 ENSGT00510000047678 #25 ENSGT00940000154768.B #26 ENSGT00390000001723 #27 ENSGT00940000160452 #28 ENSGT00940000159176 #29 ENSGT00940000160824 #30 ENSGT00950000183193.A.c.b #31 ENSGT01030000234629.E.a.b #32 ENSGT00530000063937.b #33 ENSGT00390000008964 #34 ENSGT00940000161283 #35 ENSGT00940000153496.a.a #36 ENSGT00390000007652 #37 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000014795 #9 ENSGT00940000158025.a.a.b ENSGT00940000157022 #10 ENSGT00940000158558 #11 ENSGT00940000158702 ENSGT00950000183139.C #12 ENSGT00510000047513 #13 ENSGT00950000182849.B.c.a #14 ENSGT00940000158204.b #15 ENSGT00390000014178 #16 ENSGT00950000182935.B.b.d ENSGT00390000001979 #18 ENSGT00940000158812 #19 ENSGT00940000157651 #20 ENSGT00530000063647.A.a #21 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.a.a.b #22 ENSGT00390000006348 #23 ENSGT00390000017606.a.b #24 ENSGT00510000047678 #25 ENSGT00940000154768.B #26 ENSGT00390000001723 #27 ENSGT00940000160452 #28 ENSGT00940000159176 #29 ENSGT00940000160824 #30 ENSGT00950000183193.A.c.b #31 ENSGT01030000234629.E.a.b #32 ENSGT00530000063937.b #33 ENSGT00390000008964 #34 ENSGT00940000161283 #35 ENSGT00940000153496.a.a #36 ENSGT00390000007652 #37 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000014795 #9 ENSGT00940000158025.a.a.b 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1929 MLST8 (ENSRBIG00000015556) #9 CASKIN1 (ENSRBIG00000042867) TRAF7 (ENSRBIG00000028226) #10 RAB26 (ENSRBIG00000035237) #11 PKD1 (ENSRBIG00000014415) TSC2 (ENSRBIG00000039722) #12 NTHL1 (ENSRBIG00000042577) #13 NHERF2 (ENSRBIG00000032177) #14 ENSRBIG00000028093 #15 ZNF598 (ENSRBIG00000020769) #16 SYNGR3 (ENSRBIG00000042440) GFER (ENSRBIG00000035198) #18 NOXO1 (ENSRBIG00000043548) #19 TBL3 (ENSRBIG00000032982) #20 RNF151 (ENSRBIG00000030571) #21 RPS2 (ENSRBIG00000036242) #22 NDUFB10 (ENSRBIG00000044605) #23 RPL3L (ENSRBIG00000028920) #24 ENSRBIG00000044576 #25 HS3ST6 (ENSRBIG00000044265) #26 ENSRBIG00000030178 #27 HAGH (ENSRBIG00000034228) #29 IGFALS (ENSRBIG00000037270) #30 NUBP2 (ENSRBIG00000031416) #31 SPSB3 (ENSRBIG00000039428) #32 EME2 (ENSRBIG00000032429) #33 MRPS34 (ENSRBIG00000030707) #34 NME3 (ENSRBIG00000031631) #35 MAPK8IP3 (ENSRBIG00000044410) #36 JPT2 (ENSRBIG00000041459) #37 CRAMP1 (ENSRBIG00000031863) Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2643 MLST8 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ENSGT00940000158025.a.a.b ENSGT00940000157022 #10 ENSGT00940000158558 #11 ENSGT00940000158702 ENSGT00950000183139.C #12 ENSGT00510000047513 #13 ENSGT00950000182849.B.c.a #14 ENSGT00940000158204.b #15 ENSGT00390000014178 #16 ENSGT00950000182935.B.b.d ENSGT00390000001979 #18 ENSGT00940000158812 #19 ENSGT00940000157651 #20 ENSGT00530000063647.A.a #21 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.a.a.b #22 ENSGT00390000006348 #23 ENSGT00390000017606.a.b #24 ENSGT00510000047678 #25 ENSGT00940000154768.B #26 ENSGT00390000001723 #27 ENSGT00940000160452.m #28 ENSGT00940000159176 #29 ENSGT00940000160824 #30 ENSGT00950000183193.A.c.b #31 ENSGT01030000234629.E.a.b #32 ENSGT00530000063937.b #33 ENSGT00390000008964 #34 ENSGT00940000161283 #35 ENSGT00940000153496.a.a #36 ENSGT00390000007652 #37 Gibbon MODERN SPECIES 8 PGP (ENSNLEG00000031166) #7 BRICD5 (ENSNLEG00000009245) #8 MLST8 (ENSNLEG00000009208) #9 CASKIN1 (ENSNLEG00000009201) TRAF7 (ENSNLEG00000009168) #10 RAB26 (ENSNLEG00000009155) #11 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ENSGT00950000182935.B.b.d ENSGT00390000001979 #18 ENSGT00940000158812 #19 ENSGT00940000157651 #20 ENSGT00530000063647.A.a #21 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.a.a.b #22 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b.a.b.a ##22 ENSGT00390000006348 #23 ENSGT00390000017606.a.b #24 ENSGT00510000047678 #25 ENSGT00940000154768.B #26 ENSGT00390000001723 #27 ENSGT00940000160452.m #28 ENSGT00940000159176 #29 ENSGT00940000160824 #30 ENSGT00950000183193.A.c.b #31 ENSGT01030000234629.E.a.b #32 ENSGT00530000063937.b #33 ENSGT00390000008964 #34 ENSGT00940000161283 #35 ENSGT00940000153496.a.a #36 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00390000014795 #9 ENSGT00940000158025.a.a.b ENSGT00940000157022 #10 ENSGT00940000158558 #11 ENSGT00940000158702 ENSGT00950000183139.C #12 ENSGT00510000047513 #13 ENSGT00950000182849.B.c.a #14 ENSGT00940000158204.b #15 ENSGT00390000014178 #16 ENSGT00950000182935.B.b.d ENSGT00390000001979 #18 ENSGT00940000158812 #19 ENSGT00940000157651 #20 ENSGT00530000063647.A.a #21 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.a.a.b #22 ENSGT00390000006348 #23 ENSGT00390000017606.a.b #24 ENSGT00510000047678 #25 ENSGT00940000154768.B #26 ENSGT00390000001723 #27 ENSGT00940000160452.m #28 ENSGT00940000159176 #29 ENSGT00940000160824 #30 ENSGT00950000183193.A.c.b #31 ENSGT01030000234629.E.a.b #32 ENSGT00530000063937.b #33 ENSGT00390000008964 #34 ENSGT00940000161283 #35 ENSGT00940000153496.a.a #36 ENSGT00390000007652 #37 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00390000014795 #9 ENSGT00940000158025.a.a.b ENSGT00940000157022 #10 ENSGT00940000158558 #11 ENSGT00940000158702 ENSGT00950000183139.C #12 ENSGT00510000047513 #13 ENSGT00950000182849.B.c.a #14 ENSGT00940000158204.b #15 ENSGT00390000014178 #16 ENSGT00950000182935.B.b.d ENSGT00390000001979 #18 ENSGT00940000158812 #19 ENSGT00940000157651 #20 ENSGT00530000063647.A.a #21 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.a.a.b #22 ENSGT00390000006348 #23 ENSGT00390000017606.a.b #24 ENSGT00510000047678 #25 ENSGT00940000154768.B #26 ENSGT00390000001723 #27 ENSGT00940000160452.m #28 ENSGT00940000159176 #29 ENSGT00940000160824 #30 ENSGT00950000183193.A.c.b #31 ENSGT01030000234629.E.a.b #32 ENSGT00530000063937.b #33 ENSGT00390000008964 #34 ENSGT00940000161283 #35 ENSGT00940000153496.a.a #36 ENSGT00390000007652 #37 Human MODERN SPECIES 7 MLST8 (ENSG00000167965) #9 CASKIN1 (ENSG00000167971) TRAF7 (ENSG00000131653) #10 RAB26 (ENSG00000167964) #11 PKD1 (ENSG00000008710) TSC2 (ENSG00000103197) #12 NTHL1 (ENSG00000065057) #13 NHERF2 (ENSG00000065054) #14 NPW (ENSG00000183971) #15 ZNF598 (ENSG00000167962) #16 SYNGR3 (ENSG00000127561) GFER (ENSG00000127554) #18 NOXO1 (ENSG00000196408) #19 TBL3 (ENSG00000183751) #20 RNF151 (ENSG00000179580) #21 RPS2 (ENSG00000140988) #22 NDUFB10 (ENSG00000140990) #23 RPL3L (ENSG00000140986) #24 MSRB1 (ENSG00000198736) #25 HS3ST6 (ENSG00000162040) #26 ENSG00000289722 #27 MEIOB (ENSG00000162039) #27 FAHD1 (ENSG00000180185) #28 HAGH (ENSG00000063854) #29 IGFALS (ENSG00000099769) #30 NUBP2 (ENSG00000095906) #31 SPSB3 (ENSG00000162032) #32 EME2 (ENSG00000197774) #33 MRPS34 (ENSG00000074071) #34 NME3 (ENSG00000103024) #35 MAPK8IP3 (ENSG00000138834) #36 Orangutan DUPLICATION Orangutan MODERN SPECIES 25 ENSPPYG00000039599 ENSPPYG00000039398 ENSPPYG00000039689 ENSPPYG00000034940 ENSPPYG00000017530 ENSPPYG00000032228 ENSPPYG00000031909 ENSPPYG00000017531 ENSPPYG00000038616 ZNF138 (ENSPPYG00000041455) ENSPPYG00000033047 ZNF107 (ENSPPYG00000039638) ENSPPYG00000033867 #22 ENSPPYG00000031730 ENSPPYG00000038268 ZNF736 (ENSPPYG00000030569) ZNF679 (ENSPPYG00000033769) ZNF735 (ENSPPYG00000018271) ENSPPYG00000040724 ZNF727 (ENSPPYG00000034750) ZNF722 (ENSPPYG00000017541) ENSPPYG00000036019 ENSPPYG00000039012 ENSPPYG00000039000 ENSPPYG00000034458 ENSPPYG00000029410 SEPTIN14 (ENSPPYG00000017548) ENSPPYG00000035840 Orangutan MODERN SPECIES BCL10 (ENSPPYG00000001194) DDAH1 (ENSPPYG00000001193) CCN1 (ENSPPYG00000001192) ZNHIT6 (ENSPPYG00000001191) COL24A1 (ENSPPYG00000001190) ODF2L (ENSPPYG00000001189) CLCA2 (ENSPPYG00000001188) CLCA1 (ENSPPYG00000001187) CLCA4 (ENSPPYG00000001186) ENSPPYG00000039489 SH3GLB1 (ENSPPYG00000001185) ENSPPYG00000041718 HS2ST1 (ENSPPYG00000001183) LMO4 (ENSPPYG00000035178) PKN2 (ENSPPYG00000001180) ENSPPYG00000001179 #22 GTF2B (ENSPPYG00000001178) ENSPPYG00000001176 GBP3 (ENSPPYG00000001175) GBP1 (ENSPPYG00000001174) ENSPPYG00000001173 GBP2 (ENSPPYG00000001172) GBP7 (ENSPPYG00000001170) GBP4 (ENSPPYG00000001171) GBP5 (ENSPPYG00000029531) GBP6 (ENSPPYG00000029526) ENSPPYG00000001169 ENSPPYG00000032402 ENSPPYG00000041504 LRRC8C (ENSPPYG00000001168) LRRC8D (ENSPPYG00000001167) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.a.a.b #22 Mas night monkey DUPLICATION Mas night monkey MODERN SPECIES 1162 CASKIN1 (ENSANAG00000022957) ENSANAG00000029847 #10 RAB26 (ENSANAG00000027265) #11 ENSANAG00000019882 PKD1 (ENSANAG00000024591) TSC2 (ENSANAG00000023148) #12 NTHL1 (ENSANAG00000033224) #13 NHERF2 (ENSANAG00000030277) #14 NPW (ENSANAG00000026821) #15 ZNF598 (ENSANAG00000026209) #16 ENSANAG00000034896 #17 GFER (ENSANAG00000034502) #18 NOXO1 (ENSANAG00000034027) #19 TBL3 (ENSANAG00000030472) #20 RNF151 (ENSANAG00000026490) #21 ENSANAG00000022295 #22 NDUFB10 (ENSANAG00000020686) #23 RPL3L (ENSANAG00000019116) #24 MSRB1 (ENSANAG00000036834) #25 HS3ST6 (ENSANAG00000019609) #26 PRSS22 (ENSANAG00000022238) ENSANAG00000021677 PRSS21 (ENSANAG00000021600) ENSANAG00000021499 PRSS33 (ENSANAG00000021133) ELOB (ENSANAG00000017599) SRRM2 (ENSANAG00000034911) FLYWCH2 (ENSANAG00000034418) FLYWCH1 (ENSANAG00000033837) KREMEN2 (ENSANAG00000032213) PAQR4 (ENSANAG00000031007) Mas night monkey MODERN SPECIES 1197 CORO2B (ENSANAG00000035767) ITGA11 (ENSANAG00000024399) FEM1B (ENSANAG00000036003) CLN6 (ENSANAG00000031462) ENSANAG00000022199 ENSANAG00000035306 CALML4 (ENSANAG00000036088) PIAS1 (ENSANAG00000023771) SKOR1 (ENSANAG00000026767) MAP2K5 (ENSANAG00000026610) ENSANAG00000033304 C15orf61 (ENSANAG00000019347) IQCH (ENSANAG00000037205) ENSANAG00000037777 AAGAB (ENSANAG00000038049) ENSANAG00000031752 #22 SMAD3 (ENSANAG00000001462) SMAD6 (ENSANAG00000020717) ENSANAG00000024963 ENSANAG00000028396 UHRF2 (ENSANAG00000025453) GLDC (ENSANAG00000034753) KDM4C (ENSANAG00000024798) ENSANAG00000033377 DMAC1 (ENSANAG00000029014) Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.a.a.b #22 Bushbaby MODERN SPECIES 159 PGP (ENSOGAG00000027797) #7 BRICD5 (ENSOGAG00000006591) #8 MLST8 (ENSOGAG00000033928) #9 CASKIN1 (ENSOGAG00000034517) TRAF7 (ENSOGAG00000006581) #10 RAB26 (ENSOGAG00000033648) #11 PKD1 (ENSOGAG00000016616) TSC2 (ENSOGAG00000016605) #12 NTHL1 (ENSOGAG00000016602) #13 NHERF2 (ENSOGAG00000027256) #14 ZNF598 (ENSOGAG00000008022) #16 SYNGR3 (ENSOGAG00000028210) GFER (ENSOGAG00000016907) #18 NOXO1 (ENSOGAG00000010110) #19 TBL3 (ENSOGAG00000010104) #20 RPS2 (ENSOGAG00000010098) #22 NDUFB10 (ENSOGAG00000010094) #23 RPL3L (ENSOGAG00000010087) #24 HS3ST6 (ENSOGAG00000010083) #26 FAHD1 (ENSOGAG00000012662) #28 HAGH (ENSOGAG00000012660) #29 IGFALS (ENSOGAG00000012659) #30 NUBP2 (ENSOGAG00000012655) #31 SPSB3 (ENSOGAG00000027372) #32 EME2 (ENSOGAG00000012649) #33 MRPS34 (ENSOGAG00000012647) #34 NME3 (ENSOGAG00000026071) #35 MAPK8IP3 (ENSOGAG00000012639) #36 CRAMP1 (ENSOGAG00000001253) TMEM204 (ENSOGAG00000001249) JPT2 (ENSOGAG00000012638) #37 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.a.a.a ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.a.a.a ##22 Tarsier DUPLICATION Tarsier DUPLICATION Tarsier MODERN SPECIES 4955 ENSTSYG00000026457 ##22 Tarsier MODERN SPECIES 4675 ENSTSYG00000007754 CLCA4 (ENSTSYG00000013100) ENSTSYG00000037225 ##22 ENSTSYG00000032122 Tarsier MODERN SPECIES 1902 TSC2 (ENSTSYG00000025779) #12 NTHL1 (ENSTSYG00000035337) #13 SLC9A3R2 (ENSTSYG00000027539) #14 ZNF598 (ENSTSYG00000032996) #16 GFER (ENSTSYG00000029430) #18 NOXO1 (ENSTSYG00000028783) #19 TBL3 (ENSTSYG00000036142) #20 RNF151 (ENSTSYG00000001876) #21 RPS2 (ENSTSYG00000013466) ##22 NDUFB10 (ENSTSYG00000013475) #23 RPL3L (ENSTSYG00000036590) #24 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.a.a.a ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.a.a.a ##22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.a.a.a ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.a.a.a ##22 Orangutan MODERN SPECIES 8 RPH3AL (ENSPPYG00000007753) ENSPPYG00000036624 ENSPPYG00000039778 VPS53 (ENSPPYG00000007757) ENSPPYG00000007758 GEMIN4 (ENSPPYG00000007759) ENSPPYG00000007760 GLOD4 (ENSPPYG00000041102) MRM3 (ENSPPYG00000007762) NXN (ENSPPYG00000007763) TIMM22 (ENSPPYG00000007765) ABR (ENSPPYG00000007766) ENSPPYG00000041294 ##22 BHLHA9 (ENSPPYG00000007767) TRARG1 (ENSPPYG00000007768) YWHAE (ENSPPYG00000007769) CRK (ENSPPYG00000007770) MYO1C (ENSPPYG00000007771) INPP5K (ENSPPYG00000007772) PITPNA (ENSPPYG00000007773) SLC43A2 (ENSPPYG00000007774) ENSPPYG00000032436 SCARF1 (ENSPPYG00000007775) RILP (ENSPPYG00000007776) PRPF8 (ENSPPYG00000007777) TLCD2 (ENSPPYG00000035806) WDR81 (ENSPPYG00000007780) SERPINF2 (ENSPPYG00000007781) Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.a.a.a ##22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.a.a.a ##22 Pan ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00390000014795 #9 ENSGT00940000158025.a.a.b ENSGT00940000157022 #10 ENSGT00940000158558 #11 ENSGT00940000158702 ENSGT00950000183139.C #12 ENSGT00510000047513 #13 ENSGT00950000182849.B.c.a #14 ENSGT00940000158204.b #15 ENSGT00390000014178 #16 ENSGT00910000146999 #17 ENSGT00390000001979 #18 ENSGT00940000158812 #19 ENSGT00940000157651 #20 ENSGT00530000063647.A.a #21 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.a.a.a ##22 ENSGT00390000006348 #23 ENSGT00390000017606.a.b #24 ENSGT00510000047678 #25 ENSGT00940000154768.B #26 ENSGT00390000001723 #27 ENSGT00940000160452.m #28 ENSGT00940000159176 #29 ENSGT00940000160824 #30 ENSGT00950000183193.A.c.b #31 ENSGT01030000234629.E.a.b #32 ENSGT00530000063937.b #33 ENSGT00390000008964 #34 ENSGT00940000161283 #35 ENSGT00940000153496.a.a #36 ENSGT00390000007652 #37 Chimpanzee MODERN SPECIES 7 MLST8 (ENSPTRG00000007637) #9 CASKIN1 (ENSPTRG00000007645) TRAF7 (ENSPTRG00000007635) #10 RAB26 (ENSPTRG00000007634) #11 ENSPTRG00000050693 TSC2 (ENSPTRG00000031311) #12 NTHL1 (ENSPTRG00000007628) #13 NHERF2 (ENSPTRG00000007627) #14 NPW (ENSPTRG00000007626) #15 ZNF598 (ENSPTRG00000007625) #16 SYNGR3 (ENSPTRG00000007624) #17 GFER (ENSPTRG00000045515) #18 NOXO1 (ENSPTRG00000023021) #19 TBL3 (ENSPTRG00000007621) #20 RNF151 (ENSPTRG00000007620) #21 ENSPTRG00000052871 ##22 NDUFB10 (ENSPTRG00000007618) #23 RPL3L (ENSPTRG00000007617) #24 MSRB1 (ENSPTRG00000024355) #25 MEIOB (ENSPTRG00000007612) #27 FAHD1 (ENSPTRG00000046890) #28 HAGH (ENSPTRG00000007611) #29 IGFALS (ENSPTRG00000007610) #30 NUBP2 (ENSPTRG00000007609) #31 SPSB3 (ENSPTRG00000007608) #32 EME2 (ENSPTRG00000007607) #33 MRPS34 (ENSPTRG00000007606) #34 NME3 (ENSPTRG00000007605) #35 MAPK8IP3 (ENSPTRG00000007603) #36 JPT2 (ENSPTRG00000034459) #37 CRAMP1 (ENSPTRG00000007602) Gibbon MODERN SPECIES 23 OLFML2A (ENSNLEG00000017289) WDR38 (ENSNLEG00000017294) ENSNLEG00000031655 ARPC5L (ENSNLEG00000017306) GOLGA1 (ENSNLEG00000017311) SCAI (ENSNLEG00000017321) ENSNLEG00000030118 PPP6C (ENSNLEG00000017324) ENSNLEG00000035575 RABEPK (ENSNLEG00000017333) HSPA5 (ENSNLEG00000017348) GAPVD1 (ENSNLEG00000017358) MAPKAP1 (ENSNLEG00000017378) ENSNLEG00000035312 PBX3 (ENSNLEG00000034849) ENSNLEG00000032471 ##22 MVB12B (ENSNLEG00000017403) LMX1B (ENSNLEG00000017412) ZBTB34 (ENSNLEG00000018999) RALGPS1 (ENSNLEG00000017416) ANGPTL2 (ENSNLEG00000030312) GARNL3 (ENSNLEG00000017424) SLC2A8 (ENSNLEG00000017441) ZNF79 (ENSNLEG00000017444) ENSNLEG00000032140 LRSAM1 (ENSNLEG00000017448) NIBAN2 (ENSNLEG00000017459) STXBP1 (ENSNLEG00000017464) PTRH1 (ENSNLEG00000017468) ENSNLEG00000017467 TTC16 (ENSNLEG00000017470) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.a.a.a ##22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.a.a.a ##22 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 977 ENSRBIG00000027145 ENSRBIG00000031688 LRFN5 (ENSRBIG00000004548) ENSRBIG00000033410 ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.a.a.a ##22 Vervet Monkey MODERN SPECIES 7 ABCA6 (ENSCSAG00000004356) ABCA9 (ENSCSAG00000004348) ABCA8 (ENSCSAG00000004307) FAM20A (ENSCSAG00000004246) PRKAR1A (ENSCSAG00000004240) WIPI1 (ENSCSAG00000004236) ARSG (ENSCSAG00000004231) SLC16A6 (ENSCSAG00000004226) AMZ2 (ENSCSAG00000004222) ENSCSAG00000000533 KPNA2 (ENSCSAG00000004208) ENSCSAG00000004196 BPTF (ENSCSAG00000004192) NOL11 (ENSCSAG00000004179) PITPNC1 (ENSCSAG00000004167) ENSCSAG00000000532 ##22 PSMD12 (ENSCSAG00000004164) HELZ (ENSCSAG00000004152) CACNG1 (ENSCSAG00000004133) CACNG4 (ENSCSAG00000004131) CACNG5 (ENSCSAG00000004125) PRKCA (ENSCSAG00000004109) APOH (ENSCSAG00000004104) CEP112 (ENSCSAG00000004099) AXIN2 (ENSCSAG00000004096) RGS9 (ENSCSAG00000004083) GNA13 (ENSCSAG00000004040) ENSCSAG00000004037 ENSCSAG00000019015 SMURF2 (ENSCSAG00000004032) CEP95 (ENSCSAG00000004029) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.a.a.a ##22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.a.a.a ##22 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.a.a.a ##22 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 17 SEC23A (ENSMFAG00000035158) GEMIN2 (ENSMFAG00000014362) TRAPPC6B (ENSMFAG00000001450) PNN (ENSMFAG00000003712) MIA2 (ENSMFAG00000043624) ENSMFAG00000052620 ENSMFAG00000052623 ENSMFAG00000007781 ENSMFAG00000065701 ENSMFAG00000047395 ENSMFAG00000061647 ENSMFAG00000052517 LRFN5 (ENSMFAG00000039677) ENSMFAG00000058010 ENSMFAG00000047539 ENSMFAG00000023443 ##22 ENSMFAG00000030865 FSCB (ENSMFAG00000040613) ENSMFAG00000053324 ENSMFAG00000057564 ENSMFAG00000054302 C14orf28 (ENSMFAG00000032623) KLHL28 (ENSMFAG00000033166) TOGARAM1 (ENSMFAG00000041007) ENSMFAG00000000044 FANCM (ENSMFAG00000000383) MIS18BP1 (ENSMFAG00000043146) ENSMFAG00000055972 ENSMFAG00000055183 ENSMFAG00000064548 RPL10L (ENSMFAG00000053210) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.a.a.a ##22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00530000063174.a.i.f ENSGT00940000156983.a.a ENSGT01030000234579.A.b.w ENSGT00940000156467 ENSGT00940000158732 ENSGT00390000007529 ENSGT00390000016883 ENSGT00390000008178 ENSGT00390000004911 ENSGT00940000157344 ENSGT00940000158659 ENSGT00940000155413.l.a.b ENSGT00940000153408.B ENSGT00940000157824 ENSGT00550000074956 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.a.a.a ##22 ENSGT00390000012029 ENSGT00940000155345 ENSGT00940000153899.b.b ENSGT00940000157597 ENSGT00940000161234 ENSGT00390000016551 ENSGT00530000063410.a.h ENSGT00940000153464.B ENSGT00390000000583 ENSGT00950000183050.b.b.a ENSGT00940000155337 ENSGT00940000154186.a ENSGT00390000001858 ENSGT00530000063867.b ENSGT00940000157081 Sooty mangabey MODERN SPECIES 494 ENSCATG00000030944 PAPOLG (ENSCATG00000044395) REL (ENSCATG00000035174) PUS10 (ENSCATG00000045305) PEX13 (ENSCATG00000039835) SANBR (ENSCATG00000045345) ENSCATG00000045334 C2orf74 (ENSCATG00000037754) ENSCATG00000043938 ENSCATG00000038823 USP34 (ENSCATG00000042180) ENSCATG00000013431 XPO1 (ENSCATG00000032674) FAM161A (ENSCATG00000043996) CCT4 (ENSCATG00000038933) ENSCATG00000038149 ##22 COMMD1 (ENSCATG00000011551) B3GNT2 (ENSCATG00000011785) TMEM17 (ENSCATG00000038173) EHBP1 (ENSCATG00000030805) OTX1 (ENSCATG00000031998) WDPCP (ENSCATG00000043458) MDH1 (ENSCATG00000030537) ENSCATG00000010001 UGP2 (ENSCATG00000038117) VPS54 (ENSCATG00000000035) PELI1 (ENSCATG00000031456) LGALSL (ENSCATG00000029852) AFTPH (ENSCATG00000032038) ENSCATG00000045350 SERTAD2 (ENSCATG00000012102) Drill MODERN SPECIES 951 ENSMLEG00000031853 PEX13 (ENSMLEG00000042218) SANBR (ENSMLEG00000044342) C2orf74 (ENSMLEG00000041467) ENSMLEG00000028334 ENSMLEG00000036543 ENSMLEG00000029346 USP34 (ENSMLEG00000040976) XPO1 (ENSMLEG00000032004) FAM161A (ENSMLEG00000038057) CCT4 (ENSMLEG00000037693) ENSMLEG00000044216 ##22 COMMD1 (ENSMLEG00000042809) B3GNT2 (ENSMLEG00000008417) TMEM17 (ENSMLEG00000040238) EHBP1 (ENSMLEG00000031553) OTX1 (ENSMLEG00000029765) WDPCP (ENSMLEG00000040899) MDH1 (ENSMLEG00000029382) UGP2 (ENSMLEG00000038204) VPS54 (ENSMLEG00000034933) PELI1 (ENSMLEG00000028248) Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.a.a.a ##22 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.a.a.a ##22 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00390000014795 #9 ENSGT00940000158025.a.a.b ENSGT00940000157022 #10 ENSGT00940000158558 #11 ENSGT00940000158702 ENSGT00950000183139.C #12 ENSGT00510000047513 #13 ENSGT00950000182849.B.c.a #14 ENSGT00940000158204.b #15 ENSGT00390000014178 #16 ENSGT00950000182935.B.b.d ENSGT00390000001979 #18 ENSGT00940000158812 #19 ENSGT00940000157651 #20 ENSGT00530000063647.A.a #21 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.a.a.a ##22 ENSGT00390000006348 #23 ENSGT00390000017606.a.b #24 ENSGT00510000047678 #25 ENSGT00940000154768.B #26 ENSGT00390000001723 #27 ENSGT00940000160452 #28 ENSGT00940000159176 #29 ENSGT00940000160824 #30 ENSGT00950000183193.A.c.b #31 ENSGT01030000234629.E.a.b #32 ENSGT00530000063937.b #33 ENSGT00390000008964 #34 ENSGT00940000161283 #35 ENSGT00940000153496.a.a #36 ENSGT00390000007652.i #37 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 384 MLST8 (ENSPCOG00000019642) #9 CASKIN1 (ENSPCOG00000022763) TRAF7 (ENSPCOG00000013195) #10 RAB26 (ENSPCOG00000013209) #11 PKD1 (ENSPCOG00000010798) TSC2 (ENSPCOG00000019871) #12 NTHL1 (ENSPCOG00000019236) #13 NHERF2 (ENSPCOG00000004586) #14 NPW (ENSPCOG00000010961) #15 ZNF598 (ENSPCOG00000021012) #16 SYNGR3 (ENSPCOG00000021755) GFER (ENSPCOG00000014504) #18 NOXO1 (ENSPCOG00000025960) #19 TBL3 (ENSPCOG00000019749) #20 RNF151 (ENSPCOG00000015191) #21 ENSPCOG00000028664 ##22 NDUFB10 (ENSPCOG00000022126) #23 RPL3L (ENSPCOG00000014695) #24 MSRB1 (ENSPCOG00000027095) #25 HS3ST6 (ENSPCOG00000027953) #26 ENSPCOG00000002540 #27 FAHD1 (ENSPCOG00000007621) #28 HAGH (ENSPCOG00000026794) #29 IGFALS (ENSPCOG00000012687) #30 NUBP2 (ENSPCOG00000018600) #31 SPSB3 (ENSPCOG00000015385) #32 EME2 (ENSPCOG00000021099) #33 MRPS34 (ENSPCOG00000026798) #34 NME3 (ENSPCOG00000019193) #35 MAPK8IP3 (ENSPCOG00000021523) #36 ENSPCOG00000028105 #37 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.a.b ##22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.a.b ##22 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.a.b ##22 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.a.b ##22 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 390 BRICD5 (ENSPSMG00000022908) #8 MLST8 (ENSPSMG00000022953) #9 CASKIN1 (ENSPSMG00000022966) TRAF7 (ENSPSMG00000023025) #10 RAB26 (ENSPSMG00000023082) #11 TSC2 (ENSPSMG00000023695) #12 NTHL1 (ENSPSMG00000024110) #13 NHERF2 (ENSPSMG00000024127) #14 NPW (ENSPSMG00000024133) #15 ZNF598 (ENSPSMG00000024145) #16 SYNGR3 (ENSPSMG00000024155) GFER (ENSPSMG00000024165) #18 NOXO1 (ENSPSMG00000024168) #19 ENSPSMG00000024173 ENSPSMG00000024178 #21 RPS2 (ENSPSMG00000024201) ##22 NDUFB10 (ENSPSMG00000024222) #23 RPL3L (ENSPSMG00000024237) #24 MSRB1 (ENSPSMG00000024244) #25 HS3ST6 (ENSPSMG00000024249) #26 ENSPSMG00000024257 ENSPSMG00000024276 #27 FAHD1 (ENSPSMG00000024285) #28 HAGH (ENSPSMG00000024311) #29 ENSPSMG00000024318 IGFALS (ENSPSMG00000024321) #30 NUBP2 (ENSPSMG00000024328) #31 SPSB3 (ENSPSMG00000024361) #32 EME2 (ENSPSMG00000024369) #33 MRPS34 (ENSPSMG00000024379) #34 NME3 (ENSPSMG00000024387) #35 Primates DUPLICATION Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b.a ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b.a ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b.a ##22 Catarrhini DUPLICATION Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b.a.a ##22 Hominoidea DUPLICATION Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b.a.a.a ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b.a.a.a ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b.a.a.a ##22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b.a.a.a ##22 Pan ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b.a.a.a ##22 Bonobo DUPLICATION Bonobo MODERN SPECIES 3 MED13L (ENSPPAG00000034928) ENSPPAG00000008532 SPRING1 (ENSPPAG00000033564) RNFT2 (ENSPPAG00000037001) FBXW8 (ENSPPAG00000030077) TESC (ENSPPAG00000043592) FBXO21 (ENSPPAG00000010881) NOS1 (ENSPPAG00000043877) KSR2 (ENSPPAG00000033924) RFC5 (ENSPPAG00000043958) WSB2 (ENSPPAG00000029019) ENSPPAG00000020714 VSIG10 (ENSPPAG00000038988) PEBP1 (ENSPPAG00000041904) TAOK3 (ENSPPAG00000019342) ENSPPAG00000028528 ##22 SUDS3 (ENSPPAG00000038327) ENSPPAG00000009646 SRRM4 (ENSPPAG00000028134) HSPB8 (ENSPPAG00000032859) ENSPPAG00000035470 CCDC60 (ENSPPAG00000035713) TMEM233 (ENSPPAG00000028483) PRKAB1 (ENSPPAG00000033669) CIT (ENSPPAG00000036125) BICDL1 (ENSPPAG00000028291) ENSPPAG00000027445 GCN1 (ENSPPAG00000027301) RPLP0 (ENSPPAG00000029479) PXN (ENSPPAG00000033908) ENSPPAG00000025084 Bonobo MODERN SPECIES 11 CTSA (ENSPPAG00000025586) NEURL2 (ENSPPAG00000040395) SPATA25 (ENSPPAG00000039293) ZSWIM1 (ENSPPAG00000001616) ZSWIM3 (ENSPPAG00000038227) ACOT8 (ENSPPAG00000034638) SNX21 (ENSPPAG00000027685) TNNC2 (ENSPPAG00000036568) UBE2C (ENSPPAG00000030928) DNTTIP1 (ENSPPAG00000025853) WFDC3 (ENSPPAG00000011377) ENSPPAG00000041827 WFDC13 (ENSPPAG00000041514) WFDC10B (ENSPPAG00000041406) WFDC11 (ENSPPAG00000040844) ENSPPAG00000036261 ##22 WFDC9 (ENSPPAG00000035545) WFDC8 (ENSPPAG00000034054) EPPIN (ENSPPAG00000032599) WFDC6 (ENSPPAG00000032127) WFDC2 (ENSPPAG00000031602) ENSPPAG00000033220 PIGT (ENSPPAG00000031078) ENSPPAG00000038202 TP53TG5 (ENSPPAG00000034658) SYS1 (ENSPPAG00000039458) SDC4 (ENSPPAG00000026773) RBPJL (ENSPPAG00000037289) MATN4 (ENSPPAG00000035708) SLPI (ENSPPAG00000031762) SEMG2 (ENSPPAG00000029249) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b.a.a.b ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b.a.a.b ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b.a.a.b ##22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b.a.a.b ##22 Pan ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000162300.a ENSGT00940000163728.a ENSGT00940000162393.e ENSGT00940000163728.b ENSGT00940000162300.b ENSGT01030000234543.A.a ENSGT00910000147841 ENSGT00870000136493.d.h ENSGT00940000161705 ENSGT00940000154783.e.a ENSGT00940000156351 ENSGT00940000154761 ENSGT00940000153201.j.k.a.a.a.b.b.a ENSGT00940000162805 ENSGT00940000163007 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b.a.a.b ##22 ENSGT00510000047171 ENSGT00940000157038 ENSGT00390000012818.o.a.a.b ENSGT00910000147626 ENSGT00910000147298 ENSGT00390000017613.q ENSGT00530000064712 ENSGT00390000017613.r ENSGT00390000009488 ENSGT00940000159305 ENSGT00940000162822 ENSGT00950000183185.c.a.a.s ENSGT00390000014909 ENSGT00940000160325.b ENSGT00730000111371.e Bonobo MODERN SPECIES 14 REG3G (ENSPPAG00000029045) REG1B (ENSPPAG00000029495) REG1A (ENSPPAG00000041956) ENSPPAG00000036667 REG3A (ENSPPAG00000022156) CTNNA2 (ENSPPAG00000040375) ENSPPAG00000012586 ENSPPAG00000029108 LRRTM1 (ENSPPAG00000003510) ENSPPAG00000034840 SUCLG1 (ENSPPAG00000030548) DNAH6 (ENSPPAG00000034680) ENSPPAG00000038936 TRABD2A (ENSPPAG00000039836) TMSB10 (ENSPPAG00000012732) ENSPPAG00000037652 ##22 KCMF1 (ENSPPAG00000031415) TCF7L1 (ENSPPAG00000030803) ENSPPAG00000035809 ENSPPAG00000036633 ENSPPAG00000041446 ENSPPAG00000043071 ENSPPAG00000032707 RETSAT (ENSPPAG00000031643) ELMOD3 (ENSPPAG00000027146) CAPG (ENSPPAG00000035666) ENSPPAG00000037603 MAT2A (ENSPPAG00000041128) GGCX (ENSPPAG00000031307) VAMP8 (ENSPPAG00000031084) VAMP5 (ENSPPAG00000031044) Chimpanzee MODERN SPECIES 14 REG3G (ENSPTRG00000012112) REG1B (ENSPTRG00000012113) REG1A (ENSPTRG00000012114) ENSPTRG00000049611 REG3A (ENSPTRG00000012116) CTNNA2 (ENSPTRG00000049489) ENSPTRG00000044202 ENSPTRG00000049329 LRRTM1 (ENSPTRG00000012118) ENSPTRG00000046679 SUCLG1 (ENSPTRG00000012121) DNAH6 (ENSPTRG00000012125) ENSPTRG00000043159 TRABD2A (ENSPTRG00000012126) TMSB10 (ENSPTRG00000030440) ENSPTRG00000050569 ##22 KCMF1 (ENSPTRG00000012127) ENSPTRG00000050127 TCF7L1 (ENSPTRG00000012128) ENSPTRG00000044898 ENSPTRG00000050133 TGOLN2 (ENSPTRG00000012129) ENSPTRG00000044302 ENSPTRG00000048519 ENSPTRG00000051234 RETSAT (ENSPTRG00000012130) ELMOD3 (ENSPTRG00000012131) CAPG (ENSPTRG00000012132) SH2D6 (ENSPTRG00000012133) MAT2A (ENSPTRG00000012134) GGCX (ENSPTRG00000012135) Gorilla MODERN SPECIES 1 PRDX3 (ENSGGOG00000026364) GRK5 (ENSGGOG00000011618) ENSGGOG00000042904 RGS10 (ENSGGOG00000008414) ENSGGOG00000041190 TIAL1 (ENSGGOG00000001816) ENSGGOG00000024741 BAG3 (ENSGGOG00000011503) ENSGGOG00000022627 INPP5F (ENSGGOG00000005991) MCMBP (ENSGGOG00000006006) SEC23IP (ENSGGOG00000003921) ENSGGOG00000025941 ENSGGOG00000011322 WDR11 (ENSGGOG00000003069) ENSGGOG00000024510 ##22 FGFR2 (ENSGGOG00000008336) ATE1 (ENSGGOG00000008233) ENSGGOG00000010663 TACC2 (ENSGGOG00000004946) BTBD16 (ENSGGOG00000004960) PLEKHA1 (ENSGGOG00000005120) ARMS2 (ENSGGOG00000037501) HTRA1 (ENSGGOG00000004853) C10orf120 (ENSGGOG00000026034) CUZD1 (ENSGGOG00000007184) FAM24B (ENSGGOG00000007190) ENSGGOG00000006191 FAM24A (ENSGGOG00000007194) C10orf88 (ENSGGOG00000007191) PSTK (ENSGGOG00000003866) Gibbon MODERN SPECIES 1 AGR2 (ENSNLEG00000016530) AGR3 (ENSNLEG00000016546) AHR (ENSNLEG00000016550) SNX13 (ENSNLEG00000016555) HDAC9 (ENSNLEG00000016612) ENSNLEG00000019263 FERD3L (ENSNLEG00000019265) POLR1F (ENSNLEG00000035755) TMEM196 (ENSNLEG00000016677) MACC1 (ENSNLEG00000016683) ITGB8 (ENSNLEG00000016686) ABCB5 (ENSNLEG00000016694) SP8 (ENSNLEG00000016729) ENSNLEG00000032986 ENSNLEG00000032580 ENSNLEG00000026698 ##22 SP4 (ENSNLEG00000016733) ENSNLEG00000029437 DNAH11 (ENSNLEG00000016739) CDCA7L (ENSNLEG00000016758) RAPGEF5 (ENSNLEG00000016769) ENSNLEG00000016777 ENSNLEG00000032170 HYCC1 (ENSNLEG00000016785) ENSNLEG00000016798 ENSNLEG00000016801 ACTN4 (ENSNLEG00000016804) EIF3K (ENSNLEG00000033905) MAP4K1 (ENSNLEG00000016835) ENSNLEG00000034556 RASGRP4 (ENSNLEG00000016855) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b.a.a ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b.a.a ##22 Vervet Monkey MODERN SPECIES 25 ENSCSAG00000003432 CEACAM8 (ENSCSAG00000003425) CD177 (ENSCSAG00000003420) TEX101 (ENSCSAG00000003415) LYPD3 (ENSCSAG00000003412) ENSCSAG00000003408 ETHE1 (ENSCSAG00000003404) ZNF575 (ENSCSAG00000003403) XRCC1 (ENSCSAG00000003402) PINLYP (ENSCSAG00000003398) IRGQ (ENSCSAG00000003396) ZNF576 (ENSCSAG00000003393) ZNF428 (ENSCSAG00000003389) SRRM5 (ENSCSAG00000003384) CADM4 (ENSCSAG00000003382) ENSCSAG00000019620 ##22 PLAUR (ENSCSAG00000003374) IRGC (ENSCSAG00000019621) SMG9 (ENSCSAG00000003363) ENSCSAG00000003359 LYPD5 (ENSCSAG00000003357) ZNF283 (ENSCSAG00000003353) ZNF45 (ENSCSAG00000003351) ZNF221 (ENSCSAG00000003349) ZNF155 (ENSCSAG00000003345) ZNF224 (ENSCSAG00000003342) ZNF222 (ENSCSAG00000003338) ZNF284 (ENSCSAG00000003336) ZNF225 (ENSCSAG00000003334) ZNF234 (ENSCSAG00000003333) ZNF226 (ENSCSAG00000003329) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b.a.a ##22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b.a.a ##22 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b.a.a ##22 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 175 ENSMFAG00000050336 ASB9 (ENSMFAG00000032962) ASB11 (ENSMFAG00000042619) PIGA (ENSMFAG00000046118) VEGFD (ENSMFAG00000036854) PIR (ENSMFAG00000032499) BMX (ENSMFAG00000031423) ACE2 (ENSMFAG00000039194) CLTRN (ENSMFAG00000045948) ENSMFAG00000047752 CA5B (ENSMFAG00000038720) ZRSR2 (ENSMFAG00000039674) AP1S2 (ENSMFAG00000001506) GRPR (ENSMFAG00000064412) MAGEB17 (ENSMFAG00000064468) ENSMFAG00000017407 ##22 ENSMFAG00000049262 ENSMFAG00000059107 CTPS2 (ENSMFAG00000009688) S100G (ENSMFAG00000032642) SYAP1 (ENSMFAG00000031838) ENSMFAG00000047305 TXLNG (ENSMFAG00000035865) RBBP7 (ENSMFAG00000034492) REPS2 (ENSMFAG00000002922) ENSMFAG00000045438 NHS (ENSMFAG00000033586) ENSMFAG00000057357 ENSMFAG00000057834 SCML1 (ENSMFAG00000038986) RAI2 (ENSMFAG00000001310) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b.a.a ##22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b.a.a ##22 Drill MODERN SPECIES 1197 PLEKHB1 (ENSMLEG00000038380) RAB6A (ENSMLEG00000038771) ENSMLEG00000005806 MRPL48 (ENSMLEG00000025711) PAAF1 (ENSMLEG00000034763) DNAJB13 (ENSMLEG00000032553) UCP2 (ENSMLEG00000012134) UCP3 (ENSMLEG00000044066) C2CD3 (ENSMLEG00000042612) PPME1 (ENSMLEG00000038271) P4HA3 (ENSMLEG00000036980) ENSMLEG00000022481 ENSMLEG00000003269 PGM2L1 (ENSMLEG00000044334) KCNE3 (ENSMLEG00000005724) ENSMLEG00000031931 ##22 ENSMLEG00000038036 ENSMLEG00000036126 CHRDL2 (ENSMLEG00000043902) RNF169 (ENSMLEG00000040088) ENSMLEG00000028713 Catarrhini DUPLICATION Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b.a.b.a ##22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b.a.b.a ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000158025.a.a.b ENSGT00940000157022 #10 ENSGT00940000158558 #11 ENSGT00940000158702 ENSGT00950000183139.C #12 ENSGT00510000047513 #13 ENSGT00950000182849.B.c.a #14 ENSGT00940000158204.b #15 ENSGT00390000014178 #16 ENSGT00950000182935.B.b.d ENSGT00390000001979 #18 ENSGT00940000158812 #19 ENSGT00940000157651 #20 ENSGT00530000063647.A.a #21 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.a.a.b #22 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b.a.b.a ##22 ENSGT00390000006348 #23 ENSGT00390000017606.a.b #24 ENSGT00510000047678 #25 ENSGT00940000154768.B #26 ENSGT00390000001723 #27 ENSGT00940000160452.m #28 ENSGT00940000159176 #29 ENSGT00940000160824 #30 ENSGT00950000183193.A.c.b #31 ENSGT01030000234629.E.a.b #32 ENSGT00530000063937.b #33 ENSGT00390000008964 #34 ENSGT00940000161283 #35 ENSGT00940000153496.a.a #36 ENSGT00390000007652 #37 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b.a.b.a ##22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b.a.b.a ##22 Pan ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b.a.b.a ##22 Chimpanzee MODERN SPECIES 3 MED13L (ENSPTRG00000005499) SPRING1 (ENSPTRG00000005500) RNFT2 (ENSPTRG00000005501) HRK (ENSPTRG00000005502) FBXW8 (ENSPTRG00000005503) TESC (ENSPTRG00000005504) FBXO21 (ENSPTRG00000005505) NOS1 (ENSPTRG00000005506) KSR2 (ENSPTRG00000005507) RFC5 (ENSPTRG00000005509) WSB2 (ENSPTRG00000005510) ENSPTRG00000046998 VSIG10 (ENSPTRG00000005511) PEBP1 (ENSPTRG00000005512) TAOK3 (ENSPTRG00000005513) ENSPTRG00000045169 ##22 SUDS3 (ENSPTRG00000005515) ENSPTRG00000049399 SRRM4 (ENSPTRG00000005517) HSPB8 (ENSPTRG00000005518) ENSPTRG00000019450 CCDC60 (ENSPTRG00000005519) TMEM233 (ENSPTRG00000040726) PRKAB1 (ENSPTRG00000005520) ENSPTRG00000042986 CIT (ENSPTRG00000005521) BICDL1 (ENSPTRG00000005523) RAB35 (ENSPTRG00000005524) GCN1 (ENSPTRG00000005525) ENSPTRG00000044613 PXN (ENSPTRG00000005527) Gorilla MODERN SPECIES 7 MLST8 (ENSGGOG00000014221) #9 CASKIN1 (ENSGGOG00000014205) TRAF7 (ENSGGOG00000022099) #10 RAB26 (ENSGGOG00000027074) #11 PKD1 (ENSGGOG00000007016) ENSGGOG00000043551 #12 ENSGGOG00000027370 #12 NTHL1 (ENSGGOG00000023097) #13 ENSGGOG00000005919 #14 ENSGGOG00000008575 ZNF598 (ENSGGOG00000025660) #16 ENSGGOG00000007034 GFER (ENSGGOG00000006835) #18 ENSGGOG00000009392 #19 TBL3 (ENSGGOG00000009378) #20 RPS2 (ENSGGOG00000009371) ##22 NDUFB10 (ENSGGOG00000009367) #23 RPL3L (ENSGGOG00000009364) #24 ENSGGOG00000022794 #25 HS3ST6 (ENSGGOG00000009361) #26 ENSGGOG00000012261 #27 FAHD1 (ENSGGOG00000024697) #28 HAGH (ENSGGOG00000012252) #29 IGFALS (ENSGGOG00000006268) #30 NUBP2 (ENSGGOG00000006254) #31 SPSB3 (ENSGGOG00000006245) #32 EME2 (ENSGGOG00000006238) #33 MRPS34 (ENSGGOG00000006234) #34 NME3 (ENSGGOG00000006229) #35 MAPK8IP3 (ENSGGOG00000006208) #36 JPT2 (ENSGGOG00000006200) #37 Orangutan MODERN SPECIES 7 BRICD5 (ENSPPYG00000006992) #8 MLST8 (ENSPPYG00000006991) #9 CASKIN1 (ENSPPYG00000006990) TRAF7 (ENSPPYG00000006989) #10 RAB26 (ENSPPYG00000006988) #11 PKD1 (ENSPPYG00000006987) TSC2 (ENSPPYG00000006986) #12 NTHL1 (ENSPPYG00000006985) #13 NHERF2 (ENSPPYG00000006984) #14 NPW (ENSPPYG00000006983) #15 ENSPPYG00000006981 #17 GFER (ENSPPYG00000006980) #18 ENSPPYG00000006978 #19 ZNF598 (ENSPPYG00000006982) #16 RNF151 (ENSPPYG00000036334) #21 ENSPPYG00000006975 ##22 ENSPPYG00000031680 #23 ENSPPYG00000006973 #24 ENSPPYG00000006972 #25 TBL3 (ENSPPYG00000006977) #20 ENSPPYG00000030067 NDUFB10 (ENSPPYG00000006974) #23 ENSPPYG00000029764 #24 MSRB1 (ENSPPYG00000041142) #25 HS3ST6 (ENSPPYG00000006971) #26 ENSPPYG00000006968 #27 FAHD1 (ENSPPYG00000037970) #28 HAGH (ENSPPYG00000006966) #29 IGFALS (ENSPPYG00000006965) #30 ENSPPYG00000006964 #31 SPSB3 (ENSPPYG00000006963) #32 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b.a.b.a ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b.a.b.a ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b.a.b.a ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b.a.b.a ##22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 65 ENSGT00390000014795 #9 ENSGT00940000158025.a.a.b ENSGT00940000157022 #10 ENSGT00940000158558 #11 ENSGT00940000158702 ENSGT00950000183139.C #12 ENSGT00510000047513 #13 ENSGT00950000182849.B.c.a #14 ENSGT00940000158204.b #15 ENSGT00390000014178 #16 ENSGT00910000146999 #17 ENSGT00390000001979 #18 ENSGT00940000158812 #19 ENSGT00940000157651 #20 ENSGT00530000063647.A.a #21 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b.a.b.a ##22 ENSGT00390000006348 #23 ENSGT00390000017606.a.b #24 ENSGT00510000047678 #25 ENSGT00940000154768.B #26 ENSGT00390000001723 #27 ENSGT00940000160452 #28 ENSGT00940000159176 #29 ENSGT00940000160824 #30 ENSGT00950000183193.A.c.b #31 ENSGT01030000234629.E.a.b #32 ENSGT00530000063937.b #33 ENSGT00390000008964 #34 ENSGT00940000161283 #35 ENSGT00940000153496.a.a #36 ENSGT00390000007652 #37 Sooty mangabey MODERN SPECIES 104 BRICD5 (ENSCATG00000038629) #8 MLST8 (ENSCATG00000030186) #9 CASKIN1 (ENSCATG00000043453) TRAF7 (ENSCATG00000035820) #10 RAB26 (ENSCATG00000039917) #11 PKD1 (ENSCATG00000032827) TSC2 (ENSCATG00000037504) #12 NTHL1 (ENSCATG00000040433) #13 NHERF2 (ENSCATG00000015633) #14 ENSCATG00000033752 #15 ZNF598 (ENSCATG00000038825) #16 ENSCATG00000034941 #17 TBL3 (ENSCATG00000031298) #20 NOXO1 (ENSCATG00000040569) #19 RNF151 (ENSCATG00000029626) #21 ENSCATG00000040770 ##22 NDUFB10 (ENSCATG00000020227) #23 RPL3L (ENSCATG00000043808) #24 ENSCATG00000045189 #25 HS3ST6 (ENSCATG00000044878) #26 ENSCATG00000013960 #27 FAHD1 (ENSCATG00000024626) #28 HAGH (ENSCATG00000031808) #29 IGFALS (ENSCATG00000038603) #30 NUBP2 (ENSCATG00000032660) #31 SPSB3 (ENSCATG00000014492) #32 EME2 (ENSCATG00000034726) #33 MRPS34 (ENSCATG00000017392) #34 NME3 (ENSCATG00000031446) #35 MAPK8IP3 (ENSCATG00000037988) #36 JPT2 (ENSCATG00000039325) #37 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b.a.b.b ##22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b.a.b.b ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b.a.b.b ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b.a.b.b ##22 Gorilla MODERN SPECIES 6 ENSGGOG00000014832 PML (ENSGGOG00000014823) STOML1 (ENSGGOG00000014814) LOXL1 (ENSGGOG00000014810) TBC1D21 (ENSGGOG00000010112) INSYN1 (ENSGGOG00000043199) CD276 (ENSGGOG00000013930) NPTN (ENSGGOG00000000742) REC114 (ENSGGOG00000000741) HCN4 (ENSGGOG00000008824) NEO1 (ENSGGOG00000008812) ADPGK (ENSGGOG00000003911) BBS4 (ENSGGOG00000003903) HIGD2B (ENSGGOG00000015337) ARIH1 (ENSGGOG00000004230) ENSGGOG00000027721 ##22 TMEM202 (ENSGGOG00000012279) ENSGGOG00000022001 HEXA (ENSGGOG00000002909) CELF6 (ENSGGOG00000015463) PARP6 (ENSGGOG00000015451) PKM (ENSGGOG00000005062) GRAMD2A (ENSGGOG00000005059) SENP8 (ENSGGOG00000040484) ENSGGOG00000024376 MYO9A (ENSGGOG00000014766) ENSGGOG00000043004 ENSGGOG00000038708 NR2E3 (ENSGGOG00000004383) ENSGGOG00000028267 THSD4 (ENSGGOG00000001447) Orangutan MODERN SPECIES 29 PRPSAP2 (ENSPPYG00000008054) FAM83G (ENSPPYG00000008057) SLC5A10 (ENSPPYG00000008056) ENSPPYG00000040066 ENSPPYG00000034564 EPN2 (ENSPPYG00000008061) B9D1 (ENSPPYG00000008062) MAPK7 (ENSPPYG00000040621) MFAP4 (ENSPPYG00000030611) RNF112 (ENSPPYG00000008065) SLC47A1 (ENSPPYG00000008837) ALDH3A2 (ENSPPYG00000008838) SLC47A2 (ENSPPYG00000008839) ALDH3A1 (ENSPPYG00000008841) ULK2 (ENSPPYG00000008842) ENSPPYG00000033499 ##22 AKAP10 (ENSPPYG00000008844) ENSPPYG00000008845 ENSPPYG00000038646 ENSPPYG00000008847 SPECC1 (ENSPPYG00000008846) ENSPPYG00000030079 ENSPPYG00000032495 ENSPPYG00000008848 LGALS9C (ENSPPYG00000008850) ENSPPYG00000041269 ENSPPYG00000031289 ENSPPYG00000033681 ENSPPYG00000008053 ENSPPYG00000031190 USP22 (ENSPPYG00000008068) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b.a.b.b ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b.a.b.b ##22 Vervet Monkey DUPLICATION Vervet Monkey DUPLICATION Vervet Monkey MODERN SPECIES 1 DOCK10 (ENSCSAG00000007693) NYAP2 (ENSCSAG00000007681) RHBDD1 (ENSCSAG00000007672) COL4A4 (ENSCSAG00000007607) COL4A3 (ENSCSAG00000007374) MFF (ENSCSAG00000007146) TM4SF20 (ENSCSAG00000007139) AGFG1 (ENSCSAG00000007133) SLC19A3 (ENSCSAG00000007118) CCL20 (ENSCSAG00000007082) DAW1 (ENSCSAG00000007076) SPHKAP (ENSCSAG00000007061) PID1 (ENSCSAG00000007047) DNER (ENSCSAG00000007041) TRIP12 (ENSCSAG00000007030) ENSCSAG00000018783 ##22 FBXO36 (ENSCSAG00000007012) SLC16A14 (ENSCSAG00000007006) ENSCSAG00000006997 SP140 (ENSCSAG00000006962) SP140L (ENSCSAG00000006889) SP100 (ENSCSAG00000006851) CAB39 (ENSCSAG00000006836) ITM2C (ENSCSAG00000006830) GPR55 (ENSCSAG00000018785) SPATA3 (ENSCSAG00000006817) C2orf72 (ENSCSAG00000006812) PSMD1 (ENSCSAG00000006788) HTR2B (ENSCSAG00000006733) ARMC9 (ENSCSAG00000006713) B3GNT7 (ENSCSAG00000006670) Vervet Monkey MODERN SPECIES 4 MRPL18 (ENSCSAG00000012516) PNLDC1 (ENSCSAG00000012478) ENSCSAG00000012433 MAS1 (ENSCSAG00000012417) IGF2R (ENSCSAG00000012403) SLC22A1 (ENSCSAG00000012377) SLC22A2 (ENSCSAG00000012370) SLC22A3 (ENSCSAG00000012348) LPA (ENSCSAG00000012297) PLG (ENSCSAG00000012290) MAP3K4 (ENSCSAG00000012282) AGPAT4 (ENSCSAG00000012273) ENSCSAG00000018983 PRKN (ENSCSAG00000012267) QKI (ENSCSAG00000012257) ENSCSAG00000012244 ##22 C6orf118 (ENSCSAG00000012234) PDE10A (ENSCSAG00000012225) ENSCSAG00000012208 TBXT (ENSCSAG00000012200) PRR18 (ENSCSAG00000012184) SFT2D1 (ENSCSAG00000012180) RPS6KA2 (ENSCSAG00000012167) ENSCSAG00000012150 RNASET2 (ENSCSAG00000012144) CEP43 (ENSCSAG00000012128) CCR6 (ENSCSAG00000012111) GPR31 (ENSCSAG00000018984) ENSCSAG00000012101 UNC93A (ENSCSAG00000012079) TTLL2 (ENSCSAG00000012063) Vervet Monkey MODERN SPECIES 26 ENSCSAG00000005272 ENSCSAG00000005268 ENSCSAG00000005264 TMPRSS11E (ENSCSAG00000005260) YTHDC1 (ENSCSAG00000005252) TMPRSS11B (ENSCSAG00000005243) ENSCSAG00000000429 TMPRSS11F (ENSCSAG00000005238) TMPRSS11A (ENSCSAG00000005227) TMPRSS11D (ENSCSAG00000005222) GNRHR (ENSCSAG00000005216) UBA6 (ENSCSAG00000005213) STAP1 (ENSCSAG00000005207) CENPC (ENSCSAG00000005202) ENSCSAG00000005197 ENSCSAG00000000428 ##22 ENSCSAG00000000427 EPHA5 (ENSCSAG00000005186) TECRL (ENSCSAG00000005163) ADGRL3 (ENSCSAG00000005151) ENSCSAG00000005140 IGFBP7 (ENSCSAG00000005138) ENSCSAG00000000426 POLR2B (ENSCSAG00000005130) REST (ENSCSAG00000005119) ENSCSAG00000005117 HOPX (ENSCSAG00000005112) THEGL (ENSCSAG00000005107) ARL9 (ENSCSAG00000005100) SRP72 (ENSCSAG00000005079) PPAT (ENSCSAG00000005060) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b.a.b.b ##22 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1711 UNC5B (ENSRROG00000029872) SLC29A3 (ENSRROG00000027535) CDH23 (ENSRROG00000032402) VSIR (ENSRROG00000040606) ENSRROG00000044593 PSAP (ENSRROG00000033645) CHST3 (ENSRROG00000029327) ENSRROG00000035598 SPOCK2 (ENSRROG00000033157) ASCC1 (ENSRROG00000005189) ANAPC16 (ENSRROG00000038072) DDIT4 (ENSRROG00000025799) DNAJB12 (ENSRROG00000030694) MICU1 (ENSRROG00000043635) ENSRROG00000024038 ENSRROG00000037322 ##22 MCU (ENSRROG00000044644) OIT3 (ENSRROG00000031981) ENSRROG00000030596 PLA2G12B (ENSRROG00000037167) P4HA1 (ENSRROG00000044078) NUDT13 (ENSRROG00000029969) ECD (ENSRROG00000044967) FAM149B1 (ENSRROG00000044382) ENSRROG00000038925 DNAJC9 (ENSRROG00000038222) ENSRROG00000031732 MRPS16 (ENSRROG00000040939) CFAP70 (ENSRROG00000043305) ANXA7 (ENSRROG00000037933) MSS51 (ENSRROG00000042078) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b.a ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b.a ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b.a ##22 Capuchin MODERN SPECIES 317 RBFOX2 (ENSCCAG00000036584) ENSCCAG00000020135 APOL6 (ENSCCAG00000023537) ENSCCAG00000032001 MB (ENSCCAG00000031738) RASD2 (ENSCCAG00000024916) ENSCCAG00000032054 ENSCCAG00000028547 ##22 MCM5 (ENSCCAG00000034563) HMOX1 (ENSCCAG00000022715) TOM1 (ENSCCAG00000029278) HMGXB4 (ENSCCAG00000033825) ISX (ENSCCAG00000007806) LARGE1 (ENSCCAG00000014556) Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b.b ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b.b ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b.b ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b.b ##22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b.b ##22 Gibbon MODERN SPECIES 104 HNF1B (ENSNLEG00000002919) DDX52 (ENSNLEG00000002826) SYNRG (ENSNLEG00000002737) DUSP14 (ENSNLEG00000002727) TADA2A (ENSNLEG00000002646) C17orf78 (ENSNLEG00000002618) ENSNLEG00000033322 ACACA (ENSNLEG00000002421) AATF (ENSNLEG00000002354) LHX1 (ENSNLEG00000002343) ENSNLEG00000034926 MRM1 (ENSNLEG00000002300) DHRS11 (ENSNLEG00000002259) ENSNLEG00000028425 ##22 GGNBP2 (ENSNLEG00000002197) MYO19 (ENSNLEG00000002087) ZNHIT3 (ENSNLEG00000002070) ENSNLEG00000035947 ENSNLEG00000033541 ENSNLEG00000002060 NLE1 (ENSNLEG00000001898) FNDC8 (ENSNLEG00000001873) RAD51D (ENSNLEG00000001735) RFFL (ENSNLEG00000001710) LIG3 (ENSNLEG00000001704) ZNF830 (ENSNLEG00000018817) CCT6B (ENSNLEG00000001570) TMEM132E (ENSNLEG00000001552) CCL1 (ENSNLEG00000001527) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000167876 ENSGT00940000163797.b ENSGT00950000182900.D.d.b.b ENSGT00390000017840.d ENSGT00950000183199.a.a.d ENSGT00940000160633 ENSGT00550000074891 ENSGT00940000156040 ENSGT01030000234646.B.a.b ENSGT00390000013549.a.b.b ENSGT00940000158684 ENSGT00550000074801.h.c.a.b ENSGT00940000159116 ENSGT00510000048637 ENSGT00530000063666.b.h.b ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b.b ##22 ENSGT00950000183121.b.b.b.b ENSGT00390000005330 ENSGT00940000153430.a.a ENSGT00940000157080 ENSGT00940000157313 ENSGT00870000136506.ob.b ENSGT00510000048066 ENSGT00390000017542 ENSGT00940000162424 ENSGT00940000156709 ENSGT00940000159370 ENSGT00390000008256 ENSGT00950000182941.b.b ENSGT00950000183163.b ENSGT00940000155886 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 877 ENSGT00530000063666.b.h.b ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b.b ##22 ENSGT00950000183121.b.b.b.b Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2563 ENSRBIG00000038075 ##22 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2324 CXorf58 (ENSRROG00000029252) ENSRROG00000025906 APOO (ENSRROG00000028881) ENSRROG00000034497 ##22 SAT1 (ENSRROG00000042719) Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000167876 ENSGT00940000163797.b ENSGT00950000182900.D.d.b.b ENSGT00390000017840.d ENSGT00950000183199.a.a.d ENSGT00940000160633 ENSGT00550000074891 ENSGT00940000156040 ENSGT01030000234646.B.a.b ENSGT00390000013549.a.b.b ENSGT00940000158684 ENSGT00550000074801.h.c.a.b ENSGT00940000159116 ENSGT00510000048637 ENSGT00530000063666.b.h.b ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b.b ##22 ENSGT00950000183121.b.b.b.b ENSGT00390000005330 ENSGT00940000153430.a.a ENSGT00940000157080 ENSGT00940000157313 ENSGT00870000136506.ob.b ENSGT00510000048066 ENSGT00390000017542 ENSGT00940000162424 ENSGT00940000156709 ENSGT00940000159370 ENSGT00390000008256 ENSGT00950000182941.b.b ENSGT00950000183163.b ENSGT00940000155886 Vervet Monkey MODERN SPECIES 28 DDX50 (ENSCSAG00000007703) ENSCSAG00000007664 ENSCSAG00000007655 STOX1 (ENSCSAG00000007651) CCAR1 (ENSCSAG00000007643) TET1 (ENSCSAG00000007633) SLC25A16 (ENSCSAG00000007606) DNA2 (ENSCSAG00000007597) RUFY2 (ENSCSAG00000007581) HNRNPH3 (ENSCSAG00000007572) PBLD (ENSCSAG00000007555) ATOH7 (ENSCSAG00000018432) MYPN (ENSCSAG00000007529) HERC4 (ENSCSAG00000007517) SIRT1 (ENSCSAG00000007507) ENSCSAG00000018433 ##22 DNAJC12 (ENSCSAG00000007500) ENSCSAG00000007492 ENSCSAG00000007483 LRRTM3 (ENSCSAG00000007477) ENSCSAG00000007476 ENSCSAG00000007470 ENSCSAG00000018434 REEP3 (ENSCSAG00000007459) JMJD1C (ENSCSAG00000007455) NRBF2 (ENSCSAG00000007449) ENSCSAG00000018435 EGR2 (ENSCSAG00000007431) ADO (ENSCSAG00000018436) ZNF365 (ENSCSAG00000007426) RTKN2 (ENSCSAG00000007420) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000163797.b ENSGT00950000182900.D.d.b.b ENSGT00390000017840.d ENSGT00950000183199.a.a.d ENSGT00940000160633 ENSGT00550000074891 ENSGT00940000156040 ENSGT01030000234646.B.a.b ENSGT00390000013549.a.b.b.e ENSGT00390000013549.a.b.b.f ENSGT00940000158684 ENSGT00550000074801.h.c.a.b ENSGT00940000159116 ENSGT00510000048637 ENSGT00530000063666.b.h.b ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b.b ##22 ENSGT00950000183121.b.b.b.b ENSGT00390000005330 ENSGT00940000153430.a.a ENSGT00940000157080 ENSGT00940000157313 ENSGT00870000136506.ob.b ENSGT00510000048066 ENSGT00390000017542 ENSGT00940000162424 ENSGT00940000156709 ENSGT00940000159370 ENSGT00390000008256 ENSGT00950000182941.b.b ENSGT00950000183163.b ENSGT00940000155886 Cercopithecinae_b DUPLICATION Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00940000163449 ENSGT00950000183087.A.a.b.b.g.f.c.b ENSGT00390000017840.d ENSGT00950000183199.a.a.d ENSGT00940000160633 ENSGT00550000074891 ENSGT00940000156040 ENSGT01030000234646.B.a.b ENSGT00390000013549.a.b.b.e ENSGT00390000013549.a.b.b.f ENSGT00940000158684 ENSGT00550000074801.h.c.a.b ENSGT00940000159116 ENSGT00510000048637 ENSGT00530000063666.b.h.b ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b.b.a ##22 ENSGT00950000183121.b.b.b.b ENSGT00390000005330 ENSGT00940000153430.a.a ENSGT00940000157080 ENSGT00940000167221 ENSGT01050000244986.b.b.d.a.b ENSGT00940000157313 ENSGT00870000136506.ob.b ENSGT00510000048066 ENSGT00940000153558.b.i.b.a.a.b ENSGT00390000017542 ENSGT00940000162424 ENSGT00940000156709 ENSGT00940000159370 ENSGT00390000008256 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00940000159951.v ENSGT00940000159951.u ENSGT00390000017840.d ENSGT00950000183199.a.a.d ENSGT00940000160633 ENSGT00550000074891 ENSGT00940000156040 ENSGT01030000234646.B.a.b ENSGT00390000013549.a.b.b.e ENSGT00390000013549.a.b.b.f ENSGT00940000158684 ENSGT00550000074801.h.c.a.b ENSGT00940000159116 ENSGT00510000048637 ENSGT00530000063666.b.h.b ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b.b.a ##22 ENSGT00950000183121.b.b.b.b ENSGT00390000005330 ENSGT00940000153430.a.a ENSGT00940000157080 ENSGT00940000157313 ENSGT00870000136506.ob.b ENSGT00510000048066 ENSGT00940000153558.b.i.b.a.a.b ENSGT00390000017542 ENSGT00940000162424 ENSGT00940000156709 ENSGT00940000159370 ENSGT00390000008256 ENSGT00950000182941.b.b ENSGT00950000183163.b Drill MODERN SPECIES 969 POLA1 (ENSMLEG00000037959) PCYT1B (ENSMLEG00000030552) PDK3 (ENSMLEG00000044110) ENSMLEG00000030346 ENSMLEG00000029455 ZFX (ENSMLEG00000037688) ENSMLEG00000034681 KLHL15 (ENSMLEG00000012848) CXorf58 (ENSMLEG00000031197) APOO (ENSMLEG00000036419) ENSMLEG00000039447 ##22 SAT1 (ENSMLEG00000041888) ACOT9 (ENSMLEG00000009734) PRDX4 (ENSMLEG00000037898) PTCHD1 (ENSMLEG00000032417) ENSMLEG00000039553 PHEX (ENSMLEG00000036549) ENSMLEG00000041004 MBTPS2 (ENSMLEG00000033520) ENSMLEG00000031125 SMPX (ENSMLEG00000011007) KLHL34 (ENSMLEG00000027014) CNKSR2 (ENSMLEG00000034848) Olive baboon MODERN SPECIES 792 POLA1 (ENSPANG00000010729) ENSPANG00000039655 ARX (ENSPANG00000008103) PCYT1B (ENSPANG00000002970) PDK3 (ENSPANG00000017372) ENSPANG00000042252 ENSPANG00000049773 ENSPANG00000010730 ENSPANG00000020386 ZFX (ENSPANG00000000982) ENSPANG00000045157 ENSPANG00000004507 KLHL15 (ENSPANG00000010573) CXorf58 (ENSPANG00000017030) APOO (ENSPANG00000009164) ENSPANG00000010731 ##22 SAT1 (ENSPANG00000004013) ACOT9 (ENSPANG00000009587) PRDX4 (ENSPANG00000007586) ENSPANG00000048545 PTCHD1 (ENSPANG00000050101) DDX53 (ENSPANG00000037837) ENSPANG00000035706 ENSPANG00000045931 ENSPANG00000037872 CBLL2 (ENSPANG00000046007) ENSPANG00000037098 PHEX (ENSPANG00000010105) SMS (ENSPANG00000003155) MBTPS2 (ENSPANG00000024280) ENSPANG00000050152 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b.b.b ##22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b.b.b ##22 Sooty mangabey MODERN SPECIES 97 PPP2R5D (ENSCATG00000039686) MEA1 (ENSCATG00000038113) KLHDC3 (ENSCATG00000036258) RRP36 (ENSCATG00000041903) CUL7 (ENSCATG00000044582) MRPL2 (ENSCATG00000030671) KLC4 (ENSCATG00000036991) PTK7 (ENSCATG00000037287) ENSCATG00000036503 SRF (ENSCATG00000033129) CUL9 (ENSCATG00000036803) DNPH1 (ENSCATG00000034825) TTBK1 (ENSCATG00000038616) SLC22A7 (ENSCATG00000041755) CRIP3 (ENSCATG00000039382) ENSCATG00000032161 ##22 ZNF318 (ENSCATG00000018061) ABCC10 (ENSCATG00000027767) DLK2 (ENSCATG00000044667) TJAP1 (ENSCATG00000037638) LRRC73 (ENSCATG00000041876) YIPF3 (ENSCATG00000038097) POLR1C (ENSCATG00000044045) XPO5 (ENSCATG00000036321) POLH (ENSCATG00000041260) GTPBP2 (ENSCATG00000044605) MAD2L1BP (ENSCATG00000042247) RSPH9 (ENSCATG00000030811) MRPS18A (ENSCATG00000012963) VEGFA (ENSCATG00000030128) ENSCATG00000029856 Drill MODERN SPECIES 941 KLHDC3 (ENSMLEG00000043344) RRP36 (ENSMLEG00000034272) CUL7 (ENSMLEG00000027739) MRPL2 (ENSMLEG00000044312) KLC4 (ENSMLEG00000016925) PTK7 (ENSMLEG00000033822) ENSMLEG00000036459 ENSMLEG00000035203 SRF (ENSMLEG00000010779) CUL9 (ENSMLEG00000032343) DNPH1 (ENSMLEG00000041639) TTBK1 (ENSMLEG00000042191) SLC22A7 (ENSMLEG00000033756) CRIP3 (ENSMLEG00000041577) ZNF318 (ENSMLEG00000036305) ENSMLEG00000043913 ##22 ABCC10 (ENSMLEG00000043799) DLK2 (ENSMLEG00000032200) TJAP1 (ENSMLEG00000036943) LRRC73 (ENSMLEG00000042718) YIPF3 (ENSMLEG00000036767) POLR1C (ENSMLEG00000034818) XPO5 (ENSMLEG00000035689) POLH (ENSMLEG00000035423) GTPBP2 (ENSMLEG00000020440) MAD2L1BP (ENSMLEG00000028705) RSPH9 (ENSMLEG00000038825) MRPS18A (ENSMLEG00000041828) ENSMLEG00000038668 ENSMLEG00000032234 MRPL14 (ENSMLEG00000030732) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b.b ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b.b ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b.b ##22 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 89 CXCL6 (ENSSBOG00000028174) CXCL8 (ENSSBOG00000020586) RASSF6 (ENSSBOG00000033185) AFM (ENSSBOG00000027576) AFP (ENSSBOG00000033215) ALB (ENSSBOG00000026939) ANKRD17 (ENSSBOG00000034092) COX18 (ENSSBOG00000034284) ADAMTS3 (ENSSBOG00000030341) ENSSBOG00000028616 NPFFR2 (ENSSBOG00000023043) GC (ENSSBOG00000020465) SLC4A4 (ENSSBOG00000016928) DCK (ENSSBOG00000029603) MOB1B (ENSSBOG00000014041) ENSSBOG00000021157 ##22 GRSF1 (ENSSBOG00000032141) RUFY3 (ENSSBOG00000033547) UTP3 (ENSSBOG00000019914) JCHAIN (ENSSBOG00000011102) ENAM (ENSSBOG00000021873) AMBN (ENSSBOG00000024705) AMTN (ENSSBOG00000022221) MUC7 (ENSSBOG00000012785) OPRPN (ENSSBOG00000034661) ENSSBOG00000025472 CSN3 (ENSSBOG00000019016) FDCSP (ENSSBOG00000022668) ODAM (ENSSBOG00000020522) ENSSBOG00000028585 ENSSBOG00000023725 Capuchin MODERN SPECIES 867 ENSCCAG00000022740 ##22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b.b ##22 Bushbaby MODERN SPECIES 196 SIX4 (ENSOGAG00000016082) MNAT1 (ENSOGAG00000016085) TRMT5 (ENSOGAG00000016088) SLC38A6 (ENSOGAG00000016089) TMEM30B (ENSOGAG00000016099) PRKCH (ENSOGAG00000016105) HIF1A (ENSOGAG00000016112) SNAPC1 (ENSOGAG00000016122) SYT16 (ENSOGAG00000016714) ENSOGAG00000028845 ENSOGAG00000028190 KCNH5 (ENSOGAG00000011642) RHOJ (ENSOGAG00000025885) GPHB5 (ENSOGAG00000030695) PPP2R5E (ENSOGAG00000005984) ENSOGAG00000028081 ##22 WDR89 (ENSOGAG00000005991) SGPP1 (ENSOGAG00000002208) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b ##22 Primates DUPLICATION Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.a ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.a ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.a ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.a ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.a ##22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.a ##22 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1018 BCKDK (ENSRROG00000002610) PRSS53 (ENSRROG00000043569) ZNF646 (ENSRROG00000044944) ENSRROG00000024835 ZNF668 (ENSRROG00000030609) STX4 (ENSRROG00000041558) STX1B (ENSRROG00000034351) HSD3B7 (ENSRROG00000042739) ENSRROG00000039302 ENSRROG00000040062 ORAI3 (ENSRROG00000004038) FBXL19 (ENSRROG00000005888) ENSRROG00000040302 ENSRROG00000026958 BCL7C (ENSRROG00000040516) ENSRROG00000040447 ##22 ZNF629 (ENSRROG00000045778) RNF40 (ENSRROG00000001262) CFAP119 (ENSRROG00000042252) PHKG2 (ENSRROG00000033997) TMEM265 (ENSRROG00000041633) SRCAP (ENSRROG00000041306) ENSRROG00000043504 PRR14 (ENSRROG00000040066) ZNF785 (ENSRROG00000039235) ZNF689 (ENSRROG00000037465) ZNF764 (ENSRROG00000001034) Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.a ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.a ##22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.a ##22 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 197 CCDC190 (ENSMNEG00000036972) RGS4 (ENSMNEG00000032115) RGS5 (ENSMNEG00000014093) NUF2 (ENSMNEG00000035284) PBX1 (ENSMNEG00000036393) ENSMNEG00000043670 LMX1A (ENSMNEG00000029891) RXRG (ENSMNEG00000036664) LRRC52 (ENSMNEG00000036065) ENSMNEG00000034346 ##22 MGST3 (ENSMNEG00000041543) ALDH9A1 (ENSMNEG00000000543) TMCO1 (ENSMNEG00000029465) UCK2 (ENSMNEG00000040312) FAM78B (ENSMNEG00000000001) POGK (ENSMNEG00000025126) ENSMNEG00000034726 TADA1 (ENSMNEG00000011970) ILDR2 (ENSMNEG00000042117) MAEL (ENSMNEG00000042870) GPA33 (ENSMNEG00000040838) STYXL2 (ENSMNEG00000026724) POU2F1 (ENSMNEG00000032112) CD247 (ENSMNEG00000041300) CREG1 (ENSMNEG00000038518) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.a ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.a ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.a ##22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.a ##22 Pan ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000154468.hb.a ENSGT00390000004304 ENSGT00940000161545 ENSGT00940000160514 ENSGT00670000098076.i.b ENSGT00940000154156.d.m.b ENSGT00940000164483 ENSGT00990000203619.A.a ENSGT00940000155600.b ENSGT00390000018039.f ENSGT00940000160782 ENSGT00940000154443.b.a ENSGT00910000146883.C ENSGT00940000155375.c ENSGT00940000155017.z.b.a ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.a ##22 ENSGT00940000154502.g.a.a ENSGT00950000183077.a.a.a.a.a.b.b.a.b.b ENSGT00940000164052.d ENSGT00910000147092 ENSGT00390000001021 ENSGT00390000006290 ENSGT00940000163590 ENSGT00390000008856.i ENSGT00940000154156.d.m.a ENSGT00940000153737.b ENSGT00940000153112.D.n.a.a.a.b.c ENSGT00500000044890.a.a ENSGT00940000156153 ENSGT00510000047417 ENSGT00940000159616 Chimpanzee MODERN SPECIES 972 ENSPTRG00000049437 NDP (ENSPTRG00000021818) MAOB (ENSPTRG00000021817) MAOA (ENSPTRG00000021816) ENSPTRG00000045828 ENSPTRG00000052003 PPP1R2C (ENSPTRG00000043024) ENSPTRG00000047656 GPR82 (ENSPTRG00000021814) CASK (ENSPTRG00000021812) NYX (ENSPTRG00000021811) DDX3X (ENSPTRG00000049651) ENSPTRG00000042802 USP9X (ENSPTRG00000045541) ENSPTRG00000045378 ENSPTRG00000042923 ##22 ENSPTRG00000044980 ENSPTRG00000044764 ENSPTRG00000040752 ENSPTRG00000045194 MED14 (ENSPTRG00000021805) CXHXorf38 (ENSPTRG00000021804) MPC1L (ENSPTRG00000048113) ATP6AP2 (ENSPTRG00000021803) ENSPTRG00000052101 BCOR (ENSPTRG00000021802) ENSPTRG00000039246 MID1IP1 (ENSPTRG00000047112) TSPAN7 (ENSPTRG00000021800) OTC (ENSPTRG00000021799) ENSPTRG00000052456 Bonobo MODERN SPECIES 369 ENSPPAG00000041179 NDP (ENSPPAG00000028724) MAOB (ENSPPAG00000033577) MAOA (ENSPPAG00000033045) ENSPPAG00000036386 ENSPPAG00000043152 PPP1R2C (ENSPPAG00000026223) GPR82 (ENSPPAG00000032725) CASK (ENSPPAG00000039799) ENSPPAG00000032293 ENSPPAG00000028671 DDX3X (ENSPPAG00000041809) ENSPPAG00000037641 USP9X (ENSPPAG00000039671) ENSPPAG00000042937 ENSPPAG00000028929 ##22 ENSPPAG00000041897 ENSPPAG00000040577 MED14 (ENSPPAG00000044133) CXorf38 (ENSPPAG00000044103) MPC1L (ENSPPAG00000019631) ATP6AP2 (ENSPPAG00000039969) ENSPPAG00000009962 BCOR (ENSPPAG00000027608) ENSPPAG00000030291 MID1IP1 (ENSPPAG00000010366) TSPAN7 (ENSPPAG00000011857) OTC (ENSPPAG00000030732) ENSPPAG00000009040 SRPX (ENSPPAG00000036711) SYTL5 (ENSPPAG00000042432) Gibbon MODERN SPECIES 24 RO60 (ENSNLEG00000018048) GLRX2 (ENSNLEG00000018049) B3GALT2 (ENSNLEG00000033094) ENSNLEG00000018050 KCNT2 (ENSNLEG00000028906) CFH (ENSNLEG00000018052) ENSNLEG00000034827 CFHR2 (ENSNLEG00000018053) CFHR5 (ENSNLEG00000026745) F13B (ENSNLEG00000018054) ASPM (ENSNLEG00000018055) ZBTB41 (ENSNLEG00000018056) ENSNLEG00000030320 CRB1 (ENSNLEG00000018058) ENSNLEG00000030178 ENSNLEG00000035473 ##22 DENND1B (ENSNLEG00000018059) C1orf53 (ENSNLEG00000018061) LHX9 (ENSNLEG00000018062) ENSNLEG00000031194 NEK7 (ENSNLEG00000018063) ATP6V1G3 (ENSNLEG00000018064) PTPRC (ENSNLEG00000018065) NR5A2 (ENSNLEG00000018066) ENSNLEG00000030544 ZNF281 (ENSNLEG00000018067) KIF14 (ENSNLEG00000018068) DDX59 (ENSNLEG00000018069) CAMSAP2 (ENSNLEG00000018070) INAVA (ENSNLEG00000018072) ENSNLEG00000018073 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.b ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.b ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.b ##22 Catarrhini DUPLICATION Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.b.a ##22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.b.a ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.b.a ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000155824.C ENSGT00940000155272.ec.b ENSGT00390000009130.a.b ENSGT00940000155272.dc ENSGT00860000135787 ENSGT00940000154788 ENSGT00940000161351 ENSGT00390000017767.b.b ENSGT00940000161166 ENSGT00390000004380.m.a.a.b ENSGT00940000158790 ENSGT00940000155272.ec.a ENSGT00390000015214 ENSGT00940000158613 ENSGT00390000005318.b.b.b ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.b.a ##22 ENSGT00390000017955.c.s.a ENSGT00940000156790 ENSGT00950000183034.B ENSGT00390000001528 ENSGT00390000002053 ENSGT00940000161290 ENSGT00940000158387 ENSGT00940000163434 ENSGT00940000162278 ENSGT00390000015205 ENSGT00940000163099 ENSGT00940000159332 ENSGT00940000155689.c ENSGT00940000159209 ENSGT00530000063624.C Gorilla MODERN SPECIES GJA9 (ENSGGOG00000005807) RHBDL2 (ENSGGOG00000009504) AKIRIN1 (ENSGGOG00000006053) MACF1 (ENSGGOG00000022652) ENSGGOG00000039286 ENSGGOG00000039231 PABPC4 (ENSGGOG00000004002) HEYL (ENSGGOG00000008268) NT5C1A (ENSGGOG00000008274) ENSGGOG00000039917 PPIE (ENSGGOG00000015783) BMP8A (ENSGGOG00000015791) TRIT1 (ENSGGOG00000010070) MYCL (ENSGGOG00000001693) MFSD2A (ENSGGOG00000015275) ENSGGOG00000023672 ##22 CAP1 (ENSGGOG00000027527) PPT1 (ENSGGOG00000025819) RLF (ENSGGOG00000015221) TMCO2 (ENSGGOG00000015048) ZMPSTE24 (ENSGGOG00000002591) COL9A2 (ENSGGOG00000002596) SMAP2 (ENSGGOG00000004018) ZFP69B (ENSGGOG00000039613) ZFP69 (ENSGGOG00000006972) EXO5 (ENSGGOG00000024174) ZNF684 (ENSGGOG00000022914) RIMS3 (ENSGGOG00000009986) ENSGGOG00000007360 KCNQ4 (ENSGGOG00000007364) CTPS1 (ENSGGOG00000017188) Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000155824.C ENSGT00940000155272.dc ENSGT00860000135787 ENSGT00940000155272.ec.b ENSGT00940000154788 ENSGT00940000161351 ENSGT00390000017767.b.b ENSGT00940000161166 ENSGT00390000004380.m.a.a.b ENSGT00940000158790 ENSGT00940000155272.ec.a ENSGT00390000009130.a.b ENSGT00390000015214 ENSGT00940000158613 ENSGT00390000005318.b.b.b ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.b.a ##22 ENSGT00390000017955.c.s.a ENSGT00940000156790 ENSGT00950000183034.B ENSGT00390000001528 ENSGT00390000002053 ENSGT00940000161290 ENSGT00940000158387 ENSGT00940000163434 ENSGT00940000162278 ENSGT00390000015205 ENSGT00940000163099 ENSGT00940000159332 ENSGT00940000155689.c ENSGT00940000159209 ENSGT00530000063624.C Pan ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155824.C ENSGT00940000155272.ec.b ENSGT00390000009130.a.b ENSGT00940000155272.dc ENSGT00860000135787 ENSGT00940000154788 ENSGT00940000161351 ENSGT00390000017767.b.b ENSGT00940000161166 ENSGT00390000004380.m.a.a.b ENSGT00940000158790 ENSGT00940000155272.ec.a ENSGT00390000015214 ENSGT00940000158613 ENSGT00390000005318.b.b.b ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.b.a ##22 ENSGT00390000017955.c.s.a ENSGT00940000156790 ENSGT00950000183034.B ENSGT00390000001528 ENSGT00390000002053 ENSGT00940000161290 ENSGT00940000158387 ENSGT00940000163434 ENSGT00940000162278 ENSGT00390000015205 ENSGT00940000163099 ENSGT00940000159332 ENSGT00940000155689.c ENSGT00940000159209 ENSGT00530000063624.C Chimpanzee MODERN SPECIES ENSPTRG00000052337 NDUFS5 (ENSPTRG00000000568) MACF1 (ENSPTRG00000043118) ENSPTRG00000000572 ENSPTRG00000049535 PABPC4 (ENSPTRG00000000573) HEYL (ENSPTRG00000047504) NT5C1A (ENSPTRG00000000575) HPCAL4 (ENSPTRG00000000576) ENSPTRG00000044983 PPIE (ENSPTRG00000000577) BMP8B (ENSPTRG00000000578) TRIT1 (ENSPTRG00000000579) MYCL (ENSPTRG00000000580) MFSD2A (ENSPTRG00000000581) ENSPTRG00000046517 ##22 CAP1 (ENSPTRG00000000583) PPT1 (ENSPTRG00000000584) RLF (ENSPTRG00000000585) TMCO2 (ENSPTRG00000000586) ZMPSTE24 (ENSPTRG00000000587) COL9A2 (ENSPTRG00000044977) SMAP2 (ENSPTRG00000000589) ZFP69B (ENSPTRG00000000590) ZFP69 (ENSPTRG00000000591) EXO5 (ENSPTRG00000000592) ZNF684 (ENSPTRG00000000593) RIMS3 (ENSPTRG00000000594) NFYC (ENSPTRG00000000596) KCNQ4 (ENSPTRG00000000597) CITED4 (ENSPTRG00000000598) Cercopithecidae DUPLICATION Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.b.a.a ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.b.a.a ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.b.a.a ##22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.b.a.a ##22 Pig-tailed macaque DUPLICATION Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 534 ENSMNEG00000030077 ENSMNEG00000031480 CACNA2D1 (ENSMNEG00000028493) HGF (ENSMNEG00000040124) SEMA3C (ENSMNEG00000028749) CD36 (ENSMNEG00000028655) GNAT3 (ENSMNEG00000031485) GNAI1 (ENSMNEG00000038772) ENSMNEG00000032124 ##22 ENSMNEG00000039968 MAGI2 (ENSMNEG00000040294) PHTF2 (ENSMNEG00000044760) TMEM60 (ENSMNEG00000026628) ENSMNEG00000041228 PTPN12 (ENSMNEG00000039104) ENSMNEG00000032897 ##22 ENSMNEG00000012237 GSAP (ENSMNEG00000031054) FGL2 (ENSMNEG00000030792) CCDC146 (ENSMNEG00000038241) FAM185A (ENSMNEG00000038902) LRRC17 (ENSMNEG00000033049) FBXL13 (ENSMNEG00000033248) ARMC10 (ENSMNEG00000032358) NAPEPLD (ENSMNEG00000040934) PMPCB (ENSMNEG00000027584) DNAJC2 (ENSMNEG00000031186) PSMC2 (ENSMNEG00000018744) SLC26A5 (ENSMNEG00000039041) ENSMNEG00000038404 RELN (ENSMNEG00000039004) Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 534 ENSMNEG00000011105 SEMA3D (ENSMNEG00000043456) ENSMNEG00000009198 SEMA3A (ENSMNEG00000040696) SEMA3E (ENSMNEG00000044518) PCLO (ENSMNEG00000033239) ENSMNEG00000004161 ENSMNEG00000030077 ENSMNEG00000031480 CACNA2D1 (ENSMNEG00000028493) HGF (ENSMNEG00000040124) SEMA3C (ENSMNEG00000028749) CD36 (ENSMNEG00000028655) GNAT3 (ENSMNEG00000031485) GNAI1 (ENSMNEG00000038772) ENSMNEG00000032124 ##22 ENSMNEG00000039968 MAGI2 (ENSMNEG00000040294) PHTF2 (ENSMNEG00000044760) TMEM60 (ENSMNEG00000026628) ENSMNEG00000041228 PTPN12 (ENSMNEG00000039104) ENSMNEG00000032897 ##22 ENSMNEG00000012237 GSAP (ENSMNEG00000031054) FGL2 (ENSMNEG00000030792) CCDC146 (ENSMNEG00000038241) FAM185A (ENSMNEG00000038902) LRRC17 (ENSMNEG00000033049) FBXL13 (ENSMNEG00000033248) ARMC10 (ENSMNEG00000032358) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.b.a.b ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.b.a.b ##22 Cercopithecinae_a DUPLICATION Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.b.a.b.a ##22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.b.a.b.a ##22 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 77 CILP (ENSMNEG00000031330) ENSMNEG00000030071 PDCD7 (ENSMNEG00000033283) UBAP1L (ENSMNEG00000039075) KBTBD13 (ENSMNEG00000014591) RASL12 (ENSMNEG00000043863) SLC51B (ENSMNEG00000037631) MTFMT (ENSMNEG00000040880) SPG21 (ENSMNEG00000040418) ANKDD1A (ENSMNEG00000037506) PLEKHO2 (ENSMNEG00000033712) PIF1 (ENSMNEG00000035581) RBPMS2 (ENSMNEG00000019330) OAZ2 (ENSMNEG00000014297) ZNF609 (ENSMNEG00000041662) ENSMNEG00000043120 ##22 TRIP4 (ENSMNEG00000033592) PCLAF (ENSMNEG00000030492) CSNK1G1 (ENSMNEG00000044820) PPIB (ENSMNEG00000041616) SNX22 (ENSMNEG00000032129) SNX1 (ENSMNEG00000040604) ENSMNEG00000038611 DAPK2 (ENSMNEG00000037814) HERC1 (ENSMNEG00000042046) FBXL22 (ENSMNEG00000003587) USP3 (ENSMNEG00000040681) CA12 (ENSMNEG00000035236) APH1B (ENSMNEG00000034795) RAB8B (ENSMNEG00000033725) RPS27L (ENSMNEG00000033448) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.b.a.b.a ##22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.b.a.b.a ##22 Drill MODERN SPECIES 253 PARP16 (ENSMLEG00000035171) ENSMLEG00000027861 CILP (ENSMLEG00000042537) ENSMLEG00000029629 UBAP1L (ENSMLEG00000037677) KBTBD13 (ENSMLEG00000023512) RASL12 (ENSMLEG00000043142) SLC51B (ENSMLEG00000026018) MTFMT (ENSMLEG00000012111) SPG21 (ENSMLEG00000039160) ANKDD1A (ENSMLEG00000027812) PLEKHO2 (ENSMLEG00000020553) PIF1 (ENSMLEG00000037741) RBPMS2 (ENSMLEG00000035922) OAZ2 (ENSMLEG00000035152) ENSMLEG00000035161 ##22 ENSMLEG00000043031 ZNF609 (ENSMLEG00000041950) TRIP4 (ENSMLEG00000027911) PCLAF (ENSMLEG00000026006) ENSMLEG00000041658 CSNK1G1 (ENSMLEG00000030799) PPIB (ENSMLEG00000028165) SNX22 (ENSMLEG00000033044) SNX1 (ENSMLEG00000033222) ENSMLEG00000042755 DAPK2 (ENSMLEG00000033599) HERC1 (ENSMLEG00000032497) FBXL22 (ENSMLEG00000010253) USP3 (ENSMLEG00000038500) CA12 (ENSMLEG00000038571) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.b.a.b.b ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.b.a.b.b ##22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.b.a.b.b ##22 Drill MODERN SPECIES 1578 UFL1 (ENSMLEG00000004737) FHL5 (ENSMLEG00000030422) ENSMLEG00000034661 GPR63 (ENSMLEG00000027461) NDUFAF4 (ENSMLEG00000028950) KLHL32 (ENSMLEG00000041275) MMS22L (ENSMLEG00000038624) ENSMLEG00000028234 ENSMLEG00000000714 ##22 ENSMLEG00000035598 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.b.a.b ##22 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2342 TMEM247 (ENSRBIG00000044940) EPAS1 (ENSRBIG00000032880) PRKCE (ENSRBIG00000043807) SRBD1 (ENSRBIG00000033486) SIX2 (ENSRBIG00000041429) SIX3 (ENSRBIG00000031093) CAMKMT (ENSRBIG00000031044) PREPL (ENSRBIG00000030291) SLC3A1 (ENSRBIG00000032035) PPM1B (ENSRBIG00000037090) ENSRBIG00000036556 LRPPRC (ENSRBIG00000031552) ABCG8 (ENSRBIG00000024223) ABCG5 (ENSRBIG00000039579) DYNC2LI1 (ENSRBIG00000031972) ENSRBIG00000041164 ##22 C1GALT1C1L (ENSRBIG00000006561) PLEKHH2 (ENSRBIG00000035745) THADA (ENSRBIG00000028134) ENSRBIG00000035265 ZFP36L2 (ENSRBIG00000026428) Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1965 TFCP2L1 (ENSRROG00000040023) ENSRROG00000010919 GLI2 (ENSRROG00000045806) ENSRROG00000035020 INHBB (ENSRROG00000031432) RALB (ENSRROG00000015341) ENSRROG00000043624 EPB41L5 (ENSRROG00000030747) ENSRROG00000022625 ##22 PTPN4 (ENSRROG00000045340) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.b.b ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.b.b ##22 Cercopithecinae DUPLICATION Cercopithecinae DUPLICATION Cercopithecinae DUPLICATION Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.b.b.a.a.a ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.b.b.a.a.a ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.b.b.a.a.a ##22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.b.b.a.a.a ##22 Drill MODERN SPECIES 69 ENSMLEG00000032788 EPHX4 (ENSMLEG00000040616) BRDT (ENSMLEG00000020992) TGFBR3 (ENSMLEG00000042792) ENSMLEG00000032451 ENSMLEG00000032071 ENSMLEG00000036223 ENSMLEG00000014980 ##22 LRRC66 (ENSMLEG00000004735) SGCB (ENSMLEG00000034884) SPATA18 (ENSMLEG00000038985) Vervet Monkey MODERN SPECIES 28 HPS1 (ENSCSAG00000005768) ENSCSAG00000005727 ENSCSAG00000005724 GOT1 (ENSCSAG00000005721) NKX2-3 (ENSCSAG00000005719) SLC25A28 (ENSCSAG00000005717) ENTPD7 (ENSCSAG00000005714) COX15 (ENSCSAG00000005712) CUTC (ENSCSAG00000005709) ABCC2 (ENSCSAG00000005698) DNMBP (ENSCSAG00000005674) CPN1 (ENSCSAG00000005670) ERLIN1 (ENSCSAG00000005667) CHUK (ENSCSAG00000005664) CWF19L1 (ENSCSAG00000005656) ENSCSAG00000018449 ##22 BLOC1S2 (ENSCSAG00000005639) PKD2L1 (ENSCSAG00000005629) SCD (ENSCSAG00000005611) WNT8B (ENSCSAG00000005607) SEC31B (ENSCSAG00000005583) NDUFB8 (ENSCSAG00000005572) HIF1AN (ENSCSAG00000005570) PAX2 (ENSCSAG00000005568) SLF2 (ENSCSAG00000005566) SEMA4G (ENSCSAG00000005560) MRPL43 (ENSCSAG00000005558) TWNK (ENSCSAG00000005548) LZTS2 (ENSCSAG00000005545) ENSCSAG00000005544 SFXN3 (ENSCSAG00000005542) Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.b.b.a.a.b ##22 Vervet Monkey MODERN SPECIES 28 NRP1 (ENSCSAG00000011403) PARD3 (ENSCSAG00000011392) CUL2 (ENSCSAG00000011374) CREM (ENSCSAG00000011357) CCNY (ENSCSAG00000011350) GJD4 (ENSCSAG00000011343) ANKRD30BL (ENSCSAG00000011327) ENSCSAG00000011305 ENSCSAG00000011284 ENSCSAG00000011256 ENSCSAG00000011219 ZNF33A (ENSCSAG00000011206) ZNF25 (ENSCSAG00000011194) ENSCSAG00000011183 ZNF248 (ENSCSAG00000011166) ENSCSAG00000011162 ##22 ENSCSAG00000011145 BMS1 (ENSCSAG00000011118) RET (ENSCSAG00000011059) CSGALNACT2 (ENSCSAG00000010963) RASGEF1A (ENSCSAG00000010956) ENSCSAG00000019062 FXYD4 (ENSCSAG00000010947) ZNF487 (ENSCSAG00000010937) ZNF239 (ENSCSAG00000018415) ZNF485 (ENSCSAG00000010928) ZNF32 (ENSCSAG00000010921) CXCL12 (ENSCSAG00000010891) TMEM72 (ENSCSAG00000010886) RASSF4 (ENSCSAG00000010874) DEPP1 (ENSCSAG00000018416) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.b.b.a.a.b ##22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.b.b.a.a.b ##22 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.b.b.a.a.b ##22 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 165 ENSMFAG00000064126 ENSMFAG00000062219 ENSMFAG00000053207 ENSMFAG00000050944 ENSMFAG00000064256 ENSMFAG00000060976 ENSMFAG00000001919 ##22 ENSMFAG00000059930 ENSMFAG00000061635 ENSMFAG00000061937 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.b.b.a.b ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.b.b.a.b ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.b.b.a.b ##22 Olive baboon DUPLICATION Olive baboon MODERN SPECIES 128 ENSPANG00000022846 ENSPANG00000034258 ##22 Olive baboon MODERN SPECIES 5 ENSPANG00000000195 ENSPANG00000048389 TSPYL6 (ENSPANG00000038364) C2orf73 (ENSPANG00000001209) SPTBN1 (ENSPANG00000000683) EML6 (ENSPANG00000004287) RTN4 (ENSPANG00000005683) CLHC1 (ENSPANG00000016915) RPS27A (ENSPANG00000034863) MTIF2 (ENSPANG00000014549) ENSPANG00000000623 CCDC88A (ENSPANG00000021274) PPP4R3B (ENSPANG00000022844) CFAP36 (ENSPANG00000022522) ENSPANG00000038384 ENSPANG00000031278 ##22 EFEMP1 (ENSPANG00000022521) ENSPANG00000041504 ENSPANG00000043733 CCDC85A (ENSPANG00000016914) ENSPANG00000010717 VRK2 (ENSPANG00000014544) FANCL (ENSPANG00000021497) ENSPANG00000021826 BCL11A (ENSPANG00000018170) ENSPANG00000000672 PAPOLG (ENSPANG00000014543) REL (ENSPANG00000006148) PUS10 (ENSPANG00000018036) PEX13 (ENSPANG00000022181) ENSPANG00000017323 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.b.b.a.b ##22 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.b.b.a.b ##22 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 175 PRAF2 (ENSMFAG00000059455) WDR45 (ENSMFAG00000032970) GPKOW (ENSMFAG00000035346) MAGIX (ENSMFAG00000035726) ENSMFAG00000057573 PLP2 (ENSMFAG00000002955) PRICKLE3 (ENSMFAG00000037781) SYP (ENSMFAG00000037682) CACNA1F (ENSMFAG00000036714) CCDC22 (ENSMFAG00000003539) FOXP3 (ENSMFAG00000003327) ENSMFAG00000001879 ENSMFAG00000056772 ENSMFAG00000033385 PAGE1 (ENSMFAG00000041660) ENSMFAG00000032296 ##22 PAGE4 (ENSMFAG00000039425) USP27X (ENSMFAG00000035150) CLCN5 (ENSMFAG00000031675) AKAP4 (ENSMFAG00000001429) CCNB3 (ENSMFAG00000035605) SHROOM4 (ENSMFAG00000042129) ENSMFAG00000065815 BMP15 (ENSMFAG00000000610) NUDT10 (ENSMFAG00000043929) ENSMFAG00000064448 NUDT11 (ENSMFAG00000039087) ENSMFAG00000008670 GSPT2 (ENSMFAG00000036045) MAGED1 (ENSMFAG00000039711) ENSMFAG00000040747 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.b.b.b ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.b.b.b ##22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.b.b.b ##22 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 295 ENSMNEG00000041517 PPIC (ENSMNEG00000043595) PRDM6 (ENSMNEG00000036672) ENSMNEG00000036700 CEP120 (ENSMNEG00000035699) CSNK1G3 (ENSMNEG00000032668) ZNF608 (ENSMNEG00000033840) GRAMD2B (ENSMNEG00000043427) ENSMNEG00000027216 ENSMNEG00000045186 ENSMNEG00000037182 LMNB1 (ENSMNEG00000034728) MARCHF3 (ENSMNEG00000033483) ENSMNEG00000043529 ENSMNEG00000029316 ENSMNEG00000042326 ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.b.b.b ##22 Olive baboon MODERN SPECIES 2 SLC25A16 (ENSPANG00000022117) DNA2 (ENSPANG00000022119) RUFY2 (ENSPANG00000022103) HNRNPH3 (ENSPANG00000022105) PBLD (ENSPANG00000022106) MYPN (ENSPANG00000022100) HERC4 (ENSPANG00000022076) SIRT1 (ENSPANG00000022077) DNAJC12 (ENSPANG00000022078) ENSPANG00000039119 LRRTM3 (ENSPANG00000022079) CTNNA3 (ENSPANG00000022081) ENSPANG00000038013 ENSPANG00000044789 ENSPANG00000047703 ENSPANG00000001307 ##22 ENSPANG00000050030 ENSPANG00000041261 REEP3 (ENSPANG00000022060) JMJD1C (ENSPANG00000022061) ENSPANG00000030466 NRBF2 (ENSPANG00000022063) EGR2 (ENSPANG00000022064) ADO (ENSPANG00000016238) ZNF365 (ENSPANG00000022065) RTKN2 (ENSPANG00000022066) ARID5B (ENSPANG00000022067) CABCOCO1 (ENSPANG00000022059) TMEM26 (ENSPANG00000042705) ENSPANG00000017636 RHOBTB1 (ENSPANG00000022029) Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.b.b.b ##22 Sooty mangabey MODERN SPECIES 167 ENSCATG00000036885 ##22 ENSCATG00000030122 BRINP3 (ENSCATG00000015477) RGS18 (ENSCATG00000036533) RGS21 (ENSCATG00000030362) RGS1 (ENSCATG00000031319) RGS13 (ENSCATG00000040203) RGS2 (ENSCATG00000037692) ENSCATG00000016891 UCHL5 (ENSCATG00000035323) RO60 (ENSCATG00000027732) GLRX2 (ENSCATG00000018043) B3GALT2 (ENSCATG00000015456) CDC73 (ENSCATG00000041073) ENSCATG00000039300 KCNT2 (ENSCATG00000036589) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.b.b ##22 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1705 FGF12 (ENSRROG00000030928) MB21D2 (ENSRROG00000033510) ENSRROG00000001869 ##22 PLAAT1 (ENSRROG00000036130) ATP13A5 (ENSRROG00000033346) ATP13A4 (ENSRROG00000031241) OPA1 (ENSRROG00000032110) ENSRROG00000045176 HES1 (ENSRROG00000044932) ENSRROG00000027385 LRRC15 (ENSRROG00000008593) ATP13A3 (ENSRROG00000003277) TMEM44 (ENSRROG00000029826) LSG1 (ENSRROG00000037702) FAM43A (ENSRROG00000028258) ENSRROG00000042393 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1332 ENSRBIG00000038607 FFAR1 (ENSRBIG00000030347) CD22 (ENSRBIG00000022725) MAG (ENSRBIG00000030642) HAMP (ENSRBIG00000025955) USF2 (ENSRBIG00000042506) LSR (ENSRBIG00000029135) FAM187B (ENSRBIG00000030393) ENSRBIG00000031745 ENSRBIG00000034960 ENSRBIG00000034552 LGI4 (ENSRBIG00000044111) FXYD3 (ENSRBIG00000006765) HPN (ENSRBIG00000015559) DSCC1 (ENSRBIG00000034294) ENSRBIG00000030595 ##22 DEPTOR (ENSRBIG00000027804) COL14A1 (ENSRBIG00000039734) MRPL13 (ENSRBIG00000035341) MTBP (ENSRBIG00000030968) SNTB1 (ENSRBIG00000032687) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.b.b ##22 Gibbon DUPLICATION Gibbon MODERN SPECIES 15 TAS2R50 (ENSNLEG00000033280) ENSNLEG00000034000 PRR4 (ENSNLEG00000030530) ENSNLEG00000032411 TAS2R13 (ENSNLEG00000003435) ENSNLEG00000003441 ENSNLEG00000035576 SMIM10L1 (ENSNLEG00000036151) ENSNLEG00000003448 ENSNLEG00000033088 ENSNLEG00000032830 ENSNLEG00000033097 ETV6 (ENSNLEG00000003450) BCL2L14 (ENSNLEG00000003462) ENSNLEG00000027685 ENSNLEG00000026553 ##22 LRP6 (ENSNLEG00000003488) BORCS5 (ENSNLEG00000003547) DUSP16 (ENSNLEG00000003556) ENSNLEG00000029571 ENSNLEG00000003583 ENSNLEG00000003595 ENSNLEG00000003603 DDX47 (ENSNLEG00000003605) ENSNLEG00000032852 GPRC5A (ENSNLEG00000003698) GPRC5D (ENSNLEG00000003708) HEBP1 (ENSNLEG00000003717) FAM234B (ENSNLEG00000003731) ENSNLEG00000034340 GSG1 (ENSNLEG00000003746) Gibbon MODERN SPECIES 427 ENSNLEG00000031991 ##22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.b ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.b ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.b ##22 Capuchin MODERN SPECIES 45 ENSCCAG00000035874 IGF2BP3 (ENSCCAG00000027687) MALSU1 (ENSCCAG00000036592) GPNMB (ENSCCAG00000024985) NUP42 (ENSCCAG00000030624) ENSCCAG00000023426 KLHL7 (ENSCCAG00000031111) ENSCCAG00000032424 FAM126A (ENSCCAG00000027272) TOMM7 (ENSCCAG00000033041) IL6 (ENSCCAG00000023712) RAPGEF5 (ENSCCAG00000019957) CDCA7L (ENSCCAG00000021172) ENSCCAG00000037585 DNAH11 (ENSCCAG00000035150) ENSCCAG00000035249 ##22 SP4 (ENSCCAG00000030472) ENSCCAG00000033872 SP8 (ENSCCAG00000030995) ABCB5 (ENSCCAG00000031192) ITGB8 (ENSCCAG00000037918) MACC1 (ENSCCAG00000013469) TMEM196 (ENSCCAG00000030192) POLR1F (ENSCCAG00000026416) ENSCCAG00000020115 ENSCCAG00000019905 HDAC9 (ENSCCAG00000020834) ENSCCAG00000027532 SNX13 (ENSCCAG00000030831) ENSCCAG00000013414 AHR (ENSCCAG00000027846) Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.b ##22 Bushbaby MODERN SPECIES 154 PRDM8 (ENSOGAG00000026262) ANTXR2 (ENSOGAG00000010124) GK2 (ENSOGAG00000031593) NAA11 (ENSOGAG00000016917) ENSOGAG00000034058 PAQR3 (ENSOGAG00000014710) BMP2K (ENSOGAG00000014701) ANXA3 (ENSOGAG00000013988) MRPL1 (ENSOGAG00000012126) CNOT6L (ENSOGAG00000012122) ENSOGAG00000034053 ENSOGAG00000028294 CCNG2 (ENSOGAG00000005218) CCNI (ENSOGAG00000005215) SEPTIN11 (ENSOGAG00000005210) ENSOGAG00000031799 ##22 SOWAHB (ENSOGAG00000004162) ENSOGAG00000030730 SHROOM3 (ENSOGAG00000004154) CCDC158 (ENSOGAG00000016358) STBD1 (ENSOGAG00000016357) FAM47E (ENSOGAG00000016355) SCARB2 (ENSOGAG00000016348) NUP54 (ENSOGAG00000016341) ART3 (ENSOGAG00000032958) CXCL10 (ENSOGAG00000032136) CXCL9 (ENSOGAG00000011627) ENSOGAG00000011621 NAAA (ENSOGAG00000014120) PPEF2 (ENSOGAG00000014111) USO1 (ENSOGAG00000000158) Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b ##22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b ##22 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b ##22 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 7 PTH1R (ENSSVLG00005022129) CCDC12 (ENSSVLG00005022054) SETD2 (ENSSVLG00005020438) KIF9 (ENSSVLG00005020299) KLHL18 (ENSSVLG00005020218) ENSSVLG00005020103 ENSSVLG00005019989 SCAP (ENSSVLG00005019796) ELP6 (ENSSVLG00005019611) CSPG5 (ENSSVLG00005019529) ENSSVLG00005019381 DHX30 (ENSSVLG00005019208) ENSSVLG00005019060 ENSSVLG00005019006 ENSSVLG00005018981 ENSSVLG00005018945 ##22 ENSSVLG00005018918 ENSSVLG00005018901 CDC25A (ENSSVLG00005018830) CAMP (ENSSVLG00005018789) ENSSVLG00005018742 ENSSVLG00005018729 ENSSVLG00005018685 ZNF670 (ENSSVLG00005018638) ENSSVLG00005018591 ENSSVLG00005018572 ENSSVLG00005018537 ATP13A1 (ENSSVLG00005018497) GMIP (ENSSVLG00005018416) LPAR2 (ENSSVLG00005018364) PBX4 (ENSSVLG00005018272) Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b ##22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b ##22 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b ##22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b ##22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b ##22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b ##22 Steppe mouse MODERN SPECIES 3236 ENSMSIG00000026181 Cab39l (ENSMSIG00000026112) Cdadc1 (ENSMSIG00000025526) Shisa2 (ENSMSIG00000025508) ENSMSIG00000025501 ENSMSIG00000025497 Atp8a2 (ENSMSIG00000025342) Gm49336 (ENSMSIG00000025212) Mtmr6 (ENSMSIG00000025110) ENSMSIG00000025098 Spata13 (ENSMSIG00000025007) ENSMSIG00000025002 C1qtnf9 (ENSMSIG00000024999) Mipep (ENSMSIG00000024958) Tnfrsf19 (ENSMSIG00000024914) ENSMSIG00000024911 ##22 ENSMSIG00000024904 Sacs (ENSMSIG00000024830) Sgcg (ENSMSIG00000024802) Arl11 (ENSMSIG00000024796) Ebpl (ENSMSIG00000024778) Kpna3 (ENSMSIG00000024762) ENSMSIG00000024756 ENSMSIG00000024738 ENSMSIG00000024726 Trim13 (ENSMSIG00000024724) Kcnrg (ENSMSIG00000024715) Dleu7 (ENSMSIG00000024662) Rnaseh2b (ENSMSIG00000024632) Gucy1b2 (ENSMSIG00000024593) Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b ##22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b ##22 Prairie vole MODERN SPECIES 5 Myo7b (ENSMOCG00000015787) Gpr17 (ENSMOCG00000013104) Lims2 (ENSMOCG00000021728) Sft2d3 (ENSMOCG00000004795) Wdr33 (ENSMOCG00000004814) Polr2d (ENSMOCG00000019367) Ammecr1l (ENSMOCG00000007649) Sap130 (ENSMOCG00000022122) Slc25a46 (ENSMOCG00000014644) Syt4 (ENSMOCG00000006993) ENSMOCG00000004300 Rit2 (ENSMOCG00000018593) ENSMOCG00000010462 Pik3c3 (ENSMOCG00000011606) ENSMOCG00000014712 ENSMOCG00000011741 ##22 Socs6 (ENSMOCG00000010853) Rttn (ENSMOCG00000011594) ENSMOCG00000014051 ENSMOCG00000009345 Dok6 (ENSMOCG00000019557) Tmx3 (ENSMOCG00000019763) Galnt1 (ENSMOCG00000016336) ENSMOCG00000022258 Zfp24 (ENSMOCG00000013718) Zfp35 (ENSMOCG00000009796) ENSMOCG00000004636 Zfp397 (ENSMOCG00000001610) Mapre2 (ENSMOCG00000010717) Dtna (ENSMOCG00000014765) Nol4 (ENSMOCG00000021386) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.b ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.b ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.b ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.b ##22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.b ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.b ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.b ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.b ##22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.b ##22 Rat MODERN SPECIES Fus (ENSRNOG00000023360) Pycard (ENSRNOG00000019675) Trim72 (ENSRNOG00000022099) Itgam (ENSRNOG00000019728) Itgax (ENSRNOG00000036703) Itgad (ENSRNOG00000068399) Cox6a2 (ENSRNOG00000019851) LOC103691238 (ENSRNOG00000064232) Armc5 (ENSRNOG00000019935) Tgfb1i1 (ENSRNOG00000019965) Slc5a2 (ENSRNOG00000020039) Rusf1 (ENSRNOG00000020144) Ahsp (ENSRNOG00000020165) Rgs10 (ENSRNOG00000042592) Tial1 (ENSRNOG00000020271) Rps2-ps13 (ENSRNOG00000069056) ##22 Bag3 (ENSRNOG00000020298) Inpp5f (ENSRNOG00000020388) Mcmbp (ENSRNOG00000020394) Sec23ip (ENSRNOG00000020411) Plpp4 (ENSRNOG00000020424) ENSRNOG00000066085 Wdr11 (ENSRNOG00000020430) LOC102555739 (ENSRNOG00000020446) Fgfr2 (ENSRNOG00000016374) Ate1 (ENSRNOG00000024414) RGD1563285 (ENSRNOG00000069173) Nsmce4a (ENSRNOG00000020452) Tacc2 (ENSRNOG00000020457) Btbd16 (ENSRNOG00000036675) Plekha1 (ENSRNOG00000020497) Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.b ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.b ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.b ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.b ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.b ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.b ##22 Vervet Monkey DUPLICATION Vervet Monkey MODERN SPECIES 14 ADAMTS9 (ENSCSAG00000011951) MAGI1 (ENSCSAG00000011889) ENSCSAG00000011762 SLC25A26 (ENSCSAG00000011735) LRIG1 (ENSCSAG00000011724) KBTBD8 (ENSCSAG00000011713) SUCLG2 (ENSCSAG00000011704) ENSCSAG00000011694 TAFA4 (ENSCSAG00000011689) EOGT (ENSCSAG00000011678) TMF1 (ENSCSAG00000011667) UBA3 (ENSCSAG00000011650) ARL6IP5 (ENSCSAG00000011634) LMOD3 (ENSCSAG00000011626) FRMD4B (ENSCSAG00000011618) ENSCSAG00000018800 ##22 ENSCSAG00000011601 MITF (ENSCSAG00000011595) ENSCSAG00000018802 FOXP1 (ENSCSAG00000011581) ENSCSAG00000011556 GPR27 (ENSCSAG00000018804) RYBP (ENSCSAG00000011518) SHQ1 (ENSCSAG00000011514) GXYLT2 (ENSCSAG00000011498) PPP4R2 (ENSCSAG00000011489) PDZRN3 (ENSCSAG00000011455) CNTN3 (ENSCSAG00000011366) CHL1 (ENSCSAG00000011267) CNTN6 (ENSCSAG00000011221) CNTN4 (ENSCSAG00000011111) Vervet Monkey MODERN SPECIES 4 ZBTB2 (ENSCSAG00000014259) AKAP12 (ENSCSAG00000014270) ENSCSAG00000014290 MTHFD1L (ENSCSAG00000014394) PLEKHG1 (ENSCSAG00000014433) IYD (ENSCSAG00000014444) PPP1R14C (ENSCSAG00000014450) ULBP3 (ENSCSAG00000014456) UFL1 (ENSCSAG00000014473) FHL5 (ENSCSAG00000014491) ENSCSAG00000014508 GPR63 (ENSCSAG00000018980) NDUFAF4 (ENSCSAG00000014517) KLHL32 (ENSCSAG00000014531) MMS22L (ENSCSAG00000014547) ENSCSAG00000018979 ##22 POU3F2 (ENSCSAG00000018978) FBXL4 (ENSCSAG00000014559) FAXC (ENSCSAG00000014566) COQ3 (ENSCSAG00000014581) PNISR (ENSCSAG00000014595) USP45 (ENSCSAG00000014609) CCNC (ENSCSAG00000014617) PRDM13 (ENSCSAG00000014622) MCHR2 (ENSCSAG00000014637) SIM1 (ENSCSAG00000014652) ASCC3 (ENSCSAG00000014674) GRIK2 (ENSCSAG00000014687) ENSCSAG00000018977 ENSCSAG00000018976 ENSCSAG00000014695 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.b ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.b ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.b ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.b ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.b ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.b ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.b ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000154629.B.db.b.a ENSGT00390000013943 ENSGT00940000162065 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000157183.a.a.b ENSGT00940000157183.a.a.a ENSGT00940000155208 ENSGT00880000138034 ENSGT00910000148333 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ENSGT00390000011034 ENSGT00940000157330 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.b ##22 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000156543 ENSGT00940000157912 ENSGT00390000002164 ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00510000046988 ENSGT00940000159956 ENSGT00640000091563.a ENSGT00390000007441 ENSGT01030000234667.b ENSGT00990000203619.A.b.b.a ENSGT00530000063359.A ENSGT00940000162752 ENSGT00530000063927.a.a.n.a ENSGT00530000063927.a.a.n.b.b.b.a Macaca ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000006394.i.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00940000154629.B.db.b.a ENSGT00390000013943 ENSGT00940000162065 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000157183.a.a.b ENSGT00940000157183.a.a.a ENSGT00940000155208 ENSGT00880000138034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ENSGT00390000011034 ENSGT00940000157330 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.b ##22 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000156543 ENSGT00940000157912 ENSGT00390000002164 ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00510000046988 ENSGT00940000159956 ENSGT00640000091563.a ENSGT00390000007441 ENSGT01030000234667.b ENSGT00990000203619.A.b.b.a ENSGT00530000063359.A ENSGT00940000162752 ENSGT00530000063927.a.a.n.a ENSGT00530000063927.a.a.n.b.b.b.a Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 139 PLG (ENSMNEG00000042095) MAP3K4 (ENSMNEG00000032311) AGPAT4 (ENSMNEG00000037275) PRKN (ENSMNEG00000027725) PACRG (ENSMNEG00000042289) ENSMNEG00000043724 ENSMNEG00000026836 ##22 C6orf118 (ENSMNEG00000036512) PDE10A (ENSMNEG00000027445) ENSMNEG00000038868 ENSMNEG00000022920 ENSMNEG00000037990 TBXT (ENSMNEG00000040011) SFT2D1 (ENSMNEG00000034299) MPC1 (ENSMNEG00000030001) RPS6KA2 (ENSMNEG00000028453) RNASET2 (ENSMNEG00000033732) CEP43 (ENSMNEG00000044780) CCR6 (ENSMNEG00000033597) UNC93A (ENSMNEG00000033918) TTLL2 (ENSMNEG00000043374) ENSMNEG00000035667 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000154629.B.db.b.a ENSGT00390000013943 ENSGT00940000162065 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000157183.a.a.b ENSGT00940000157183.a.a.a ENSGT00940000155208 ENSGT00880000138034 ENSGT00910000148333 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ENSGT00390000011034.`c ENSGT00940000157330 ENSGT01090000260381 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.b ##22 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000156543 ENSGT00940000157912 ENSGT00390000002164 ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00510000046988 ENSGT00940000159956 ENSGT00640000091563.a ENSGT00390000007441 ENSGT01030000234667.b ENSGT00990000203619.A.b.b.a ENSGT00530000063359.A ENSGT00940000162752 ENSGT00530000063927.a.a.n.a ENSGT00940000155237 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 133 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.b ##22 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000156543 ENSGT00910000146857 ENSGT00910000147801 ENSGT00940000165037 ENSGT00390000012628.a.a.d.d.d.a ENSGT00940000157912 ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00510000046988 ENSGT00940000159956 ENSGT00640000091563.a ENSGT00390000007441 ENSGT01030000234667.b ENSGT00530000063359.A ENSGT00940000162752 Sooty mangabey MODERN SPECIES 220 PLG (ENSCATG00000039756) ENSCATG00000034269 MAP3K4 (ENSCATG00000038027) AGPAT4 (ENSCATG00000012223) PRKN (ENSCATG00000033190) PACRG (ENSCATG00000036404) ENSCATG00000038866 ENSCATG00000037623 ENSCATG00000016910 ##22 C6orf118 (ENSCATG00000034818) ENSCATG00000040268 PDE10A (ENSCATG00000039033) ENSCATG00000035247 ENSCATG00000038207 TBXT (ENSCATG00000038841) SFT2D1 (ENSCATG00000034006) Drill MODERN SPECIES 1309 PRKN (ENSMLEG00000042695) PACRG (ENSMLEG00000040096) ENSMLEG00000025987 ENSMLEG00000033347 ENSMLEG00000044157 ##22 C6orf118 (ENSMLEG00000041650) PDE10A (ENSMLEG00000036596) ENSMLEG00000035256 ENSMLEG00000004880 ENSMLEG00000032182 ENSMLEG00000039755 ENSMLEG00000035760 TBXT (ENSMLEG00000028132) SFT2D1 (ENSMLEG00000036233) MPC1 (ENSMLEG00000040167) ENSMLEG00000024978 RPS6KA2 (ENSMLEG00000018321) RNASET2 (ENSMLEG00000020984) CEP43 (ENSMLEG00000030168) CCR6 (ENSMLEG00000040801) Olive baboon MODERN SPECIES 2 EXOC6 (ENSPANG00000021552) HHEX (ENSPANG00000021555) KIF11 (ENSPANG00000021559) IDE (ENSPANG00000021569) MARCHF5 (ENSPANG00000021562) CPEB3 (ENSPANG00000021561) ENSPANG00000030166 BTAF1 (ENSPANG00000021620) FGFBP3 (ENSPANG00000045162) TNKS2 (ENSPANG00000021618) PPP1R3C (ENSPANG00000021656) HECTD2 (ENSPANG00000021659) PCGF5 (ENSPANG00000021696) ANKRD1 (ENSPANG00000021697) RPP30 (ENSPANG00000021710) ENSPANG00000016752 ##22 HTR7 (ENSPANG00000021709) KIF20B (ENSPANG00000021707) ENSPANG00000043772 PANK1 (ENSPANG00000021705) SLC16A12 (ENSPANG00000021703) IFIT5 (ENSPANG00000021702) IFIT1B (ENSPANG00000010650) IFIT3 (ENSPANG00000021698) LIPA (ENSPANG00000021738) CH25H (ENSPANG00000043199) ENSPANG00000046874 STAMBPL1 (ENSPANG00000021744) ENSPANG00000048276 ACTA2 (ENSPANG00000021748) ANKRD22 (ENSPANG00000021742) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.b ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.b ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.b ##22 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 255 ENSSBOG00000030907 ENSSBOG00000029281 ENSSBOG00000028108 ##22 NHSL2 (ENSSBOG00000024555) ERCC6L (ENSSBOG00000029416) PIN4 (ENSSBOG00000026467) ENSSBOG00000024943 CITED1 (ENSSBOG00000016010) ENSSBOG00000004798 HDAC8 (ENSSBOG00000025932) PHKA1 (ENSSBOG00000025021) Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.b ##22 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.b ##22 Mouse lemur MODERN SPECIES 6 NFKB2 (ENSMICG00000011856) GBF1 (ENSMICG00000011832) PITX3 (ENSMICG00000045312) ELOVL3 (ENSMICG00000048136) NOLC1 (ENSMICG00000011811) PPRC1 (ENSMICG00000011794) LDB1 (ENSMICG00000011785) ARMH3 (ENSMICG00000011767) KCNIP2 (ENSMICG00000011754) OGA (ENSMICG00000011745) NPM3 (ENSMICG00000044119) FGF8 (ENSMICG00000011733) FBXW4 (ENSMICG00000030032) DPCD (ENSMICG00000007381) POLL (ENSMICG00000044578) ENSMICG00000032738 ##22 BTRC (ENSMICG00000007365) LBX1 (ENSMICG00000042752) TLX1 (ENSMICG00000000020) KAZALD1 (ENSMICG00000042680) SFXN3 (ENSMICG00000000018) PDZD7 (ENSMICG00000000017) LZTS2 (ENSMICG00000000016) TWNK (ENSMICG00000045106) ENSMICG00000000014 SEMA4G (ENSMICG00000030739) SLF2 (ENSMICG00000001371) PAX2 (ENSMICG00000001357) HIF1AN (ENSMICG00000001348) NDUFB8 (ENSMICG00000001341) SEC31B (ENSMICG00000044332) Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.b ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.b ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.b ##22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.b ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.b ##22 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 50 ENSJJAG00000009646 ENSJJAG00000017231 ENSJJAG00000015498 Kank1 (ENSJJAG00000018774) Dmrt1 (ENSJJAG00000016690) Dmrt3 (ENSJJAG00000022573) Dmrt2 (ENSJJAG00000023959) ENSJJAG00000010719 Smarca2 (ENSJJAG00000010867) Vldlr (ENSJJAG00000016440) ENSJJAG00000000409 Kcnv2 (ENSJJAG00000016782) Pum3 (ENSJJAG00000012563) ENSJJAG00000010263 Rfx3 (ENSJJAG00000010280) ENSJJAG00000024335 ##22 Glis3 (ENSJJAG00000011399) Slc1a1 (ENSJJAG00000018507) ENSJJAG00000020462 Spata6l (ENSJJAG00000022941) Plpp6 (ENSJJAG00000011277) Cdc37l1 (ENSJJAG00000024330) Ak3 (ENSJJAG00000023388) ENSJJAG00000022803 Jak2 (ENSJJAG00000012271) Rln1 (ENSJJAG00000013838) Plgrkt (ENSJJAG00000010846) Ric1 (ENSJJAG00000014841) Ermp1 (ENSJJAG00000021848) Mlana (ENSJJAG00000022272) 9930021J03Rik (ENSJJAG00000016877) Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.b ##22 Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1760 Pkd1 (ENSNGAG00000023541) Tsc2 (ENSNGAG00000021283) #12 Nthl1 (ENSNGAG00000023847) #13 Nherf2 (ENSNGAG00000016521) #14 Npw (ENSNGAG00000022441) #15 Zfp598 (ENSNGAG00000021072) #16 Syngr3 (ENSNGAG00000004429) Gfer (ENSNGAG00000024200) #18 Noxo1 (ENSNGAG00000023406) #19 Rnf151 (ENSNGAG00000003547) #21 Tbl3 (ENSNGAG00000002428) #20 ENSNGAG00000013739 ##22 Ndufb10 (ENSNGAG00000015798) #23 Rpl3l (ENSNGAG00000023163) #24 Msrb1 (ENSNGAG00000015847) #25 Hs3st6 (ENSNGAG00000011421) #26 Meiob (ENSNGAG00000006985) #27 Fahd1 (ENSNGAG00000013637) #28 Hagh (ENSNGAG00000024100) #29 Igfals (ENSNGAG00000014838) #30 Nubp2 (ENSNGAG00000001165) #31 Spsb3 (ENSNGAG00000023785) #32 Mrps34 (ENSNGAG00000023629) #34 Nme3 (ENSNGAG00000022562) #35 Mapk8ip3 (ENSNGAG00000021573) #36 Jpt2 (ENSNGAG00000021166) #37 Cramp1 (ENSNGAG00000012239) Muroidea_A DUPLICATION Muroidea_A DUPLICATION Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.b.a.a ##22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.b.a.a ##22 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.b.a.a ##22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.b.a.a ##22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.b.a.a ##22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.b.a.a ##22 Steppe mouse DUPLICATION Steppe mouse DUPLICATION Steppe mouse MODERN SPECIES 3025 Tsnax (ENSMSIG00000005572) Disc1 (ENSMSIG00000005602) Sipa1l2 (ENSMSIG00000006015) Map10 (ENSMSIG00000006117) Ntpcr (ENSMSIG00000006139) Pcnx2 (ENSMSIG00000006318) Map3k21 (ENSMSIG00000006387) Kcnk1 (ENSMSIG00000006432) ENSMSIG00000006505 ##22 Steppe mouse MODERN SPECIES 2698 Pgap6 (ENSMSIG00000023816) Mrpl28 (ENSMSIG00000023867) Axin1 (ENSMSIG00000023878) Arhgdig (ENSMSIG00000023904) Pdia2 (ENSMSIG00000023925) Rgs11 (ENSMSIG00000023974) Fam234a (ENSMSIG00000024174) Luc7l (ENSMSIG00000024237) ENSMSIG00000024264 Neurl1b (ENSMSIG00000025549) ENSMSIG00000025563 Dusp1 (ENSMSIG00000025579) ENSMSIG00000025591 ##22 Ergic1 (ENSMSIG00000025604) ENSMSIG00000025620 Crebrf (ENSMSIG00000025640) Bnip1 (ENSMSIG00000025666) Nkx2-5 (ENSMSIG00000025708) Steppe mouse MODERN SPECIES 2806 Neurod2 (ENSMSIG00000016749) Ppp1r1b (ENSMSIG00000016752) Stard3 (ENSMSIG00000016764) Tcap (ENSMSIG00000016779) Pnmt (ENSMSIG00000016792) Pgap3 (ENSMSIG00000016809) Erbb2 (ENSMSIG00000016883) Mien1 (ENSMSIG00000016934) Grb7 (ENSMSIG00000016942) Ikzf3 (ENSMSIG00000017005) Zpbp2 (ENSMSIG00000017041) ENSMSIG00000017151 Lrrc3c (ENSMSIG00000017163) ENSMSIG00000017168 Gsdma3 (ENSMSIG00000017176) ENSMSIG00000017268 ##22 Rat MODERN SPECIES Lsm14a (ENSRNOG00000021133) Kctd15 (ENSRNOG00000021137) RGD1560088 (ENSRNOG00000062485) AABR07002969.1 (ENSRNOG00000052945) Cebpg (ENSRNOG00000021144) Slc7a10 (ENSRNOG00000010938) Lrp3 (ENSRNOG00000011451) Wdr88 (ENSRNOG00000037393) Gpatch1 (ENSRNOG00000011584) Snrpg (ENSRNOG00000032232) Rhpn2 (ENSRNOG00000011885) Faap24 (ENSRNOG00000022393) Cep89 (ENSRNOG00000012140) Slc7a9 (ENSRNOG00000012344) Tdrd12 (ENSRNOG00000012719) AC136661.1 (ENSRNOG00000037380) ##22 Nudt19 (ENSRNOG00000059386) Rgs9bp (ENSRNOG00000012877) Ankrd27 (ENSRNOG00000052814) Pdcd5 (ENSRNOG00000068327) Dpy19l3 (ENSRNOG00000021573) Zfp507 (ENSRNOG00000013565) Tshz3 (ENSRNOG00000013938) RGD1562402 (ENSRNOG00000031859) Zfp536 (ENSRNOG00000014163) Uri1 (ENSRNOG00000014463) Ccne1 (ENSRNOG00000014786) LOC690000 (ENSRNOG00000014966) Plekhf1 (ENSRNOG00000027724) Pop4 (ENSRNOG00000027646) Marf1-ps1 (ENSRNOG00000051237) Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.b.a.a ##22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.b.a.a ##22 Northern American deer mouse DUPLICATION Northern American deer mouse MODERN SPECIES 20 Gm1123 (ENSPEMG00000008461) Pik3cb (ENSPEMG00000021133) ENSPEMG00000026638 Faiml (ENSPEMG00000020451) Cep70 (ENSPEMG00000020889) Esyt3 (ENSPEMG00000007500) Mras (ENSPEMG00000024371) Nme9 (ENSPEMG00000028368) Armc8 (ENSPEMG00000008512) Dbr1 (ENSPEMG00000020602) A4gnt (ENSPEMG00000030991) Dzip1l (ENSPEMG00000020686) Cldn18 (ENSPEMG00000018228) ENSPEMG00000013442 Sox14 (ENSPEMG00000014791) ENSPEMG00000030347 ##22 ENSPEMG00000027282 ##22 Il20rb (ENSPEMG00000014820) Nck1 (ENSPEMG00000020513) Slc35g2 (ENSPEMG00000001592) Stag1 (ENSPEMG00000000445) Pccb (ENSPEMG00000012544) Msl2 (ENSPEMG00000027651) Ppp2r3a (ENSPEMG00000030419) ENSPEMG00000015006 ENSPEMG00000030126 Ephb1 (ENSPEMG00000017499) Ky (ENSPEMG00000026376) Cep63 (ENSPEMG00000004056) Anapc13 (ENSPEMG00000028707) ENSPEMG00000014873 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 20 Pik3cb (ENSPEMG00000021133) ENSPEMG00000026638 Faiml (ENSPEMG00000020451) Cep70 (ENSPEMG00000020889) Esyt3 (ENSPEMG00000007500) Mras (ENSPEMG00000024371) Nme9 (ENSPEMG00000028368) Armc8 (ENSPEMG00000008512) Dbr1 (ENSPEMG00000020602) A4gnt (ENSPEMG00000030991) Dzip1l (ENSPEMG00000020686) Cldn18 (ENSPEMG00000018228) ENSPEMG00000013442 Sox14 (ENSPEMG00000014791) ENSPEMG00000030347 ##22 ENSPEMG00000027282 ##22 Il20rb (ENSPEMG00000014820) Nck1 (ENSPEMG00000020513) Slc35g2 (ENSPEMG00000001592) Stag1 (ENSPEMG00000000445) Pccb (ENSPEMG00000012544) Msl2 (ENSPEMG00000027651) Ppp2r3a (ENSPEMG00000030419) ENSPEMG00000015006 ENSPEMG00000030126 Ephb1 (ENSPEMG00000017499) Ky (ENSPEMG00000026376) Cep63 (ENSPEMG00000004056) Anapc13 (ENSPEMG00000028707) ENSPEMG00000014873 Amotl2 (ENSPEMG00000015058) Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.b.a.b ##22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.b.a.b ##22 Rat MODERN SPECIES 18 Or10g9 (ENSRNOG00000058082) Or10d5jl (ENSRNOG00000052349) Or8d6 (ENSRNOG00000060221) Or8g2 (ENSRNOG00000066696) Or8g37b (ENSRNOG00000063762) Or10d5j (ENSRNOG00000058207) Or8g2c (ENSRNOG00000066313) ENSRNOG00000065616 Or8g37c (ENSRNOG00000069680) Or8g37 (ENSRNOG00000070773) Or8g4 (ENSRNOG00000055420) Or8g50 (ENSRNOG00000065779) Or8g52b (ENSRNOG00000062368) Or8g50b (ENSRNOG00000064893) Or8g52 (ENSRNOG00000071070) LOC688473 (ENSRNOG00000065186) ##22 Or10d1b (ENSRNOG00000069258) Or10n7 (ENSRNOG00000062452) Or10d4 (ENSRNOG00000031942) Or10d4c (ENSRNOG00000070638) Or10d4b (ENSRNOG00000070792) Or10n1 (ENSRNOG00000065790) RGD1311744 (ENSRNOG00000005960) Or10d1 (ENSRNOG00000063739) Or10d3 (ENSRNOG00000039236) Or8g36b (ENSRNOG00000039238) Or8g36 (ENSRNOG00000039239) Or8g36c (ENSRNOG00000066959) Or8g20 (ENSRNOG00000070488) Or8g35-ps1 (ENSRNOG00000070564) Or8g35b (ENSRNOG00000065991) Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.b.a.b ##22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.b.a.b ##22 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 1 Trio (ENSCGRG00001018514) Otulinl (ENSCGRG00001013918) Otulin (ENSCGRG00001009097) Ank (ENSCGRG00001007186) Fbxl7 (ENSCGRG00001002330) Marchf11 (ENSCGRG00001000995) Zfp622 (ENSCGRG00001024661) Retreg1 (ENSCGRG00001003409) Myo10 (ENSCGRG00001006922) Basp1 (ENSCGRG00001010849) Cdh18 (ENSCGRG00001012079) Cdh12 (ENSCGRG00001015709) Cdh10 (ENSCGRG00001001483) Cdh9 (ENSCGRG00001007635) ENSCGRG00001006251 ENSCGRG00001013307 ##22 Cdh6 (ENSCGRG00001014466) Drosha (ENSCGRG00001008885) 6030458C11Rik (ENSCGRG00001024155) ENSCGRG00001007160 Pdzd2 (ENSCGRG00001014637) 1810049J17Rik (ENSCGRG00001007233) Golph3 (ENSCGRG00001006205) Mtmr12 (ENSCGRG00001005011) Zfr (ENSCGRG00001016009) Sub1 (ENSCGRG00001003473) Npr3 (ENSCGRG00001002840) Tars (ENSCGRG00001022888) ENSCGRG00001023808 Adamts12 (ENSCGRG00001023259) Rxfp3 (ENSCGRG00001009667) Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.b.b ##22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.b.b ##22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.b.b ##22 Prairie vole MODERN SPECIES 2 Tatdn1 (ENSMOCG00000001584) Ndufb9 (ENSMOCG00000021982) Mtss1 (ENSMOCG00000011955) Sqle (ENSMOCG00000022832) Washc5 (ENSMOCG00000009448) Nsmce2 (ENSMOCG00000015988) Trib1 (ENSMOCG00000007861) Lratd2 (ENSMOCG00000000246) A1bg (ENSMOCG00000014955) Myc (ENSMOCG00000018286) ENSMOCG00000001001 ENSMOCG00000009341 Cyrib (ENSMOCG00000002789) Asap1 (ENSMOCG00000002939) Adcy8 (ENSMOCG00000012981) ENSMOCG00000002825 ##22 Efr3a (ENSMOCG00000005515) Oc90 (ENSMOCG00000003122) Hhla1 (ENSMOCG00000012232) Kcnq3 (ENSMOCG00000017138) Dnaaf11 (ENSMOCG00000022669) Tmem71 (ENSMOCG00000015889) Phf20l1 (ENSMOCG00000021213) Sla (ENSMOCG00000020997) Tg (ENSMOCG00000022735) Ccn4 (ENSMOCG00000012019) Ndrg1 (ENSMOCG00000012344) St3gal1 (ENSMOCG00000000379) Zfat (ENSMOCG00000018121) Khdrbs3 (ENSMOCG00000020954) ENSMOCG00000003737 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.b.b ##22 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.b.b ##22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.b.b ##22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.b.b ##22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.b.b ##22 Steppe mouse MODERN SPECIES 3212 Tmem200a (ENSMSIG00000016560) Samd3 (ENSMSIG00000016499) L3mbtl3 (ENSMSIG00000016318) Arhgap18 (ENSMSIG00000016199) ENSMSIG00000016187 ENSMSIG00000016179 ##22 Lama2 (ENSMSIG00000015781) ENSMSIG00000015768 ENSMSIG00000015727 Ryukyu mouse MODERN SPECIES 17 Trim67 (MGP_CAROLIEiJ_G0031712) 2810004N23Rik (MGP_CAROLIEiJ_G0031713) Gnpat (MGP_CAROLIEiJ_G0031714) Exoc8 (MGP_CAROLIEiJ_G0031715) MGP_CAROLIEiJ_G0031716 Egln1 (MGP_CAROLIEiJ_G0031717) Tsnax (MGP_CAROLIEiJ_G0031718) Disc1 (MGP_CAROLIEiJ_G0031719) Sipa1l2 (MGP_CAROLIEiJ_G0031720) Map10 (MGP_CAROLIEiJ_G0031721) Ntpcr (MGP_CAROLIEiJ_G0031722) Pcnx2 (MGP_CAROLIEiJ_G0031723) Map3k21 (MGP_CAROLIEiJ_G0031724) Kcnk1 (MGP_CAROLIEiJ_G0031725) Slc35f3 (MGP_CAROLIEiJ_G0031726) MGP_CAROLIEiJ_G0031727 ##22 Coa6 (MGP_CAROLIEiJ_G0031728) Tarbp1 (MGP_CAROLIEiJ_G0031729) Irf2bp2 (MGP_CAROLIEiJ_G0031730) Tomm20 (MGP_CAROLIEiJ_G0031731) Rbm34 (MGP_CAROLIEiJ_G0031732) Pard3 (MGP_CAROLIEiJ_G0031733) Nrp1 (MGP_CAROLIEiJ_G0031734) Itgb1 (MGP_CAROLIEiJ_G0031735) MGP_CAROLIEiJ_G0031736 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.b ##22 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.b ##22 Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.b ##22 Alpin marmot MODERN SPECIES 28 ENSMMMG00000009601 #7 BRICD5 (ENSMMMG00000009608) #8 MLST8 (ENSMMMG00000009615) #9 TRAF7 (ENSMMMG00000009664) #10 RAB26 (ENSMMMG00000009776) #11 ENSMMMG00000009812 TSC2 (ENSMMMG00000009837) #12 NTHL1 (ENSMMMG00000010821) #13 NHERF2 (ENSMMMG00000010827) #14 ENSMMMG00000010835 ZNF598 (ENSMMMG00000010846) #16 SYNGR3 (ENSMMMG00000010863) GFER (ENSMMMG00000010878) #18 NOXO1 (ENSMMMG00000010886) #19 RNF151 (ENSMMMG00000010935) #21 RPS2 (ENSMMMG00000010948) ##22 NDUFB10 (ENSMMMG00000010988) #23 RPL3L (ENSMMMG00000011010) #24 MSRB1 (ENSMMMG00000011047) #25 HS3ST6 (ENSMMMG00000011071) #26 ENSMMMG00000011082 #27 FAHD1 (ENSMMMG00000011106) #28 HAGH (ENSMMMG00000011110) #29 IGFALS (ENSMMMG00000011124) #30 NUBP2 (ENSMMMG00000011128) #31 SPSB3 (ENSMMMG00000011143) #32 EME2 (ENSMMMG00000011151) #33 MRPS34 (ENSMMMG00000011168) #34 MAPK8IP3 (ENSMMMG00000011208) #36 JPT2 (ENSMMMG00000015507) #37 CRAMP1 (ENSMMMG00000015511) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 15 CCDC125 (ENSSVLG00005009466) ENSSVLG00005009362 RAD17 (ENSSVLG00005009140) MARVELD2 (ENSSVLG00005008937) OCLN (ENSSVLG00005008798) ENSSVLG00005008740 ENSSVLG00005008651 CRHBP (ENSSVLG00005008579) S100Z (ENSSVLG00005008555) ENSSVLG00005008549 ENSSVLG00005008525 F2R (ENSSVLG00005008506) F2RL2 (ENSSVLG00005008481) IQGAP2 (ENSSVLG00005007881) SV2C (ENSSVLG00005007661) ENSSVLG00005007604 ##22 POC5 (ENSSVLG00005007522) ANKDD1B (ENSSVLG00005007433) POLK (ENSSVLG00005007352) ENSSVLG00005007250 CERT1 (ENSSVLG00005007093) HMGCR (ENSSVLG00005006942) ANKRD31 (ENSSVLG00005006845) GCNT4 (ENSSVLG00005006815) FAM169A (ENSSVLG00005006669) NSA2 (ENSSVLG00005006610) ENSSVLG00005006579 GFM2 (ENSSVLG00005006519) ENSSVLG00005006420 ENC1 (ENSSVLG00005006387) ARHGEF28 (ENSSVLG00005005963) Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.b ##22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.b ##22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.b ##22 Degu MODERN SPECIES 64 ADTRP (ENSODEG00000006208) HIVEP1 (ENSODEG00000005849) EDN1 (ENSODEG00000006667) PHACTR1 (ENSODEG00000006613) TBC1D7 (ENSODEG00000006038) GFOD1 (ENSODEG00000007338) SIRT5 (ENSODEG00000006183) NOL7 (ENSODEG00000005771) RANBP9 (ENSODEG00000005549) ENSODEG00000019114 MCUR1 (ENSODEG00000006182) ENSODEG00000019259 ENSODEG00000005642 RNF182 (ENSODEG00000019169) CD83 (ENSODEG00000005045) ENSODEG00000007629 ##22 ENSODEG00000019412 ENSODEG00000005250 ENSODEG00000005170 ENSODEG00000005101 ENSODEG00000019317 DTNBP1 (ENSODEG00000005093) ENSODEG00000006305 ENSODEG00000019375 MYLIP (ENSODEG00000005865) GMPR (ENSODEG00000005025) ATXN1 (ENSODEG00000006297) ENSODEG00000019346 STMND1 (ENSODEG00000006530) RBM24 (ENSODEG00000006411) ENSODEG00000005875 Guinea pig MODERN SPECIES 8 RARRES1 (ENSCPOG00000037396) MFSD1 (ENSCPOG00000015291) ENSCPOG00000015295 SCHIP1 (ENSCPOG00000003961) Il12a (ENSCPOG00000000016) ENSCPOG00000026743 SMC4 (ENSCPOG00000006130) TRIM59 (ENSCPOG00000006122) KPNA4 (ENSCPOG00000010671) ARL14 (ENSCPOG00000010678) PPM1L (ENSCPOG00000005920) B3GALNT1 (ENSCPOG00000002846) NMD3 (ENSCPOG00000005953) SPTSSB (ENSCPOG00000038001) OTOL1 (ENSCPOG00000000011) ENSCPOG00000021511 ##22 ENSCPOG00000024936 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b #22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b #22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b #22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b #22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b #22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b #22 Ursidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b #22 Ursus ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00930000150969.B #8 ENSGT00390000014795 #9 ENSGT00940000158025.a.a.b ENSGT00940000157022 #10 ENSGT00940000158558 #11 ENSGT00950000183139.C #12 ENSGT00510000047513 #13 ENSGT00950000182849.B.c.a #14 ENSGT00940000169534 ENSGT00390000014178 #16 ENSGT00950000182935.B.b.d ENSGT00390000001979 #18 ENSGT00940000158812.c #19 ENSGT00940000157651 #20 ENSGT00530000063647.A.a #21 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b #22 ENSGT00390000006348.f #23 ENSGT00390000017606.a.b #24 ENSGT00510000047678.e #25 ENSGT00940000154768.B #26 ENSGT00390000001723 #27 ENSGT00940000160452 #28 ENSGT00940000159176 #29 ENSGT00940000160824 #30 ENSGT00950000183193.A.c.b #31 ENSGT01030000234629.E.a.b #32 ENSGT00530000063937.b #33 ENSGT00390000008964 #34 ENSGT00940000161283 #35 ENSGT00940000153496.a.a #36 ENSGT00390000007652 #37 Polar bear MODERN SPECIES 200 E4F1 (ENSUMAG00000022322) ENSUMAG00000022321 #7 BRICD5 (ENSUMAG00000022316) #8 MLST8 (ENSUMAG00000022311) #9 ENSUMAG00000022302 RAB26 (ENSUMAG00000022292) #11 TSC2 (ENSUMAG00000022263) #12 ENSUMAG00000022259 NTHL1 (ENSUMAG00000022257) #13 ENSUMAG00000022255 #14 ZNF598 (ENSUMAG00000022253) #16 GFER (ENSUMAG00000022251) #18 NOXO1 (ENSUMAG00000022239) #19 TBL3 (ENSUMAG00000022149) #20 RNF151 (ENSUMAG00000022133) #21 RPS2 (ENSUMAG00000022123) #22 NDUFB10 (ENSUMAG00000022118) #23 RPL3L (ENSUMAG00000022104) #24 ENSUMAG00000022090 #25 ENSUMAG00000022070 #27 FAHD1 (ENSUMAG00000022065) #28 HAGH (ENSUMAG00000022061) #29 NUBP2 (ENSUMAG00000022054) #31 SPSB3 (ENSUMAG00000022049) #32 MAPK8IP3 (ENSUMAG00000021776) #36 JPT2 (ENSUMAG00000021688) #37 CRAMP1 (ENSUMAG00000021635) TMEM204 (ENSUMAG00000021614) IFT140 (ENSUMAG00000021605) TELO2 (ENSUMAG00000021492) PTX4 (ENSUMAG00000021453) Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b #22 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b #22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b #22 Microbat DUPLICATION Microbat MODERN SPECIES 1384 DSCAML1 (ENSMLUG00000006606) CEP164 (ENSMLUG00000006565) BACE1 (ENSMLUG00000007898) ENSMLUG00000024355 RNF214 (ENSMLUG00000007869) PCSK7 (ENSMLUG00000007790) TAGLN (ENSMLUG00000007781) SIDT2 (ENSMLUG00000007729) ENSMLUG00000028975 #22 PAFAH1B2 (ENSMLUG00000007710) ENSMLUG00000027199 SIK3 (ENSMLUG00000003237) ENSMLUG00000012429 ENSMLUG00000023892 ENSMLUG00000012436 ZPR1 (ENSMLUG00000014012) ENSMLUG00000014006 Microbat MODERN SPECIES 1327 ENSMLUG00000027318 GPR158 (ENSMLUG00000004392) ENSMLUG00000026194 #22 THNSL1 (ENSMLUG00000007989) ENKUR (ENSMLUG00000007962) Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b #22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b #22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b #22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b #22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b #22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b #22 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b #22 Goat MODERN SPECIES 27 PHYHIP (ENSCHIG00000011107) BMP1 (ENSCHIG00000023198) SFTPC (ENSCHIG00000018635) LGI3 (ENSCHIG00000025450) REEP4 (ENSCHIG00000025331) HR (ENSCHIG00000024758) NUDT18 (ENSCHIG00000025564) FHIP2B (ENSCHIG00000020971) DMTN (ENSCHIG00000019052) FGF17 (ENSCHIG00000026068) NPM2 (ENSCHIG00000026056) XPO7 (ENSCHIG00000016714) DOK2 (ENSCHIG00000021822) ENSCHIG00000025910 GFRA2 (ENSCHIG00000016374) ENSCHIG00000025219 #22 LZTS1 (ENSCHIG00000022362) ATP6V1B2 (ENSCHIG00000016793) SLC18A1 (ENSCHIG00000021575) LPL (ENSCHIG00000025623) ENSCHIG00000017968 ENSCHIG00000023371 ENSCHIG00000008314 ENSCHIG00000015109 ENSCHIG00000020956 ENSCHIG00000026606 ENSCHIG00000025187 ENSCHIG00000012786 INVS (ENSCHIG00000017220) ERP44 (ENSCHIG00000027236) STX17 (ENSCHIG00000015032) Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b #22 Blue whale DUPLICATION Blue whale MODERN SPECIES 6 MLST8 (ENSBMSG00010011822) #9 CASKIN1 (ENSBMSG00010011761) TRAF7 (ENSBMSG00010011706) #10 RAB26 (ENSBMSG00010011665) #11 ENSBMSG00010011658 TSC2 (ENSBMSG00010011197) #12 NTHL1 (ENSBMSG00010011060) #13 NHERF2 (ENSBMSG00010011027) #14 NPW (ENSBMSG00010011009) #15 ENSBMSG00010011003 ENSBMSG00010010978 GFER (ENSBMSG00010010965) #18 NOXO1 (ENSBMSG00010010936) #19 TBL3 (ENSBMSG00010010856) #20 RNF151 (ENSBMSG00010010820) #21 ENSBMSG00010010763 #22 NDUFB10 (ENSBMSG00010010734) #23 RPL3L (ENSBMSG00010010716) #24 MSRB1 (ENSBMSG00010010701) #25 HS3ST6 (ENSBMSG00010010685) #26 ENSBMSG00010010669 #27 FAHD1 (ENSBMSG00010010608) #28 HAGH (ENSBMSG00010010591) #29 IGFALS (ENSBMSG00010010573) #30 NUBP2 (ENSBMSG00010010561) #31 SPSB3 (ENSBMSG00010010546) #32 MRPS34 (ENSBMSG00010010537) #34 NME3 (ENSBMSG00010010525) #35 ENSBMSG00010010504 #36 JPT2 (ENSBMSG00010010484) #37 CRAMP1 (ENSBMSG00010010410) Blue whale MODERN SPECIES 12 CBX1 (ENSBMSG00010018099) SNX11 (ENSBMSG00010018006) SKAP1 (ENSBMSG00010017921) HOXB1 (ENSBMSG00010017892) HOXB2 (ENSBMSG00010017860) HOXB3 (ENSBMSG00010017838) HOXB4 (ENSBMSG00010017814) HOXB5 (ENSBMSG00010017772) HOXB6 (ENSBMSG00010017746) HOXB7 (ENSBMSG00010017724) HOXB8 (ENSBMSG00010017685) HOXB9 (ENSBMSG00010017655) HOXB13 (ENSBMSG00010017547) TTLL6 (ENSBMSG00010017444) CALCOCO2 (ENSBMSG00010017255) ENSBMSG00010017179 #22 ATP5MC1 (ENSBMSG00010017142) UBE2Z (ENSBMSG00010017102) SNF8 (ENSBMSG00010017067) GIP (ENSBMSG00010017026) IGF2BP1 (ENSBMSG00010016894) B4GALNT2 (ENSBMSG00010016748) GNGT2 (ENSBMSG00010016723) ABI3 (ENSBMSG00010016693) ENSBMSG00010016656 ZNF652 (ENSBMSG00010016625) PHB1 (ENSBMSG00010016580) NGFR (ENSBMSG00010016537) NXPH3 (ENSBMSG00010016515) ENSBMSG00010016496 SPOP (ENSBMSG00010016457) Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.a ##22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.a ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.a ##22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.a ##22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.a ##22 Equus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.a ##22 Horse MODERN SPECIES 16 SNAPC1 (ENSECAG00000017606) HIF1A (ENSECAG00000015597) PRKCH (ENSECAG00000013529) TMEM30B (ENSECAG00000045114) SLC38A6 (ENSECAG00000005163) TRMT5 (ENSECAG00000000057) ENSECAG00000046358 MNAT1 (ENSECAG00000023790) SIX4 (ENSECAG00000023515) SIX1 (ENSECAG00000022919) SIX6 (ENSECAG00000022806) C24H14orf39 (ENSECAG00000022230) PPM1A (ENSECAG00000016814) DHRS7 (ENSECAG00000011422) PCNX4 (ENSECAG00000000365) ENSECAG00000019407 ##22 LRRC9 (ENSECAG00000015680) RTN1 (ENSECAG00000024305) CCDC175 (ENSECAG00000018680) ENSECAG00000050328 JKAMP (ENSECAG00000026924) L3HYPDH (ENSECAG00000017914) GPR135 (ENSECAG00000034061) DAAM1 (ENSECAG00000009258) ENSECAG00000009184 ENSECAG00000038995 DACT1 (ENSECAG00000009167) KIAA0586 (ENSECAG00000017695) TIMM9 (ENSECAG00000017063) TOMM20L (ENSECAG00000053300) ARID4A (ENSECAG00000019256) Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.a ##22 Felidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.a ##22 Panthera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.a ##22 Tiger MODERN SPECIES 590 CCNF (ENSPTIG00000016632) RNPS1 (ENSPTIG00000015643) ENSPTIG00000015543 ENSPTIG00000015335 #7 BRICD5 (ENSPTIG00000015207) #8 MLST8 (ENSPTIG00000014849) #9 TRAF7 (ENSPTIG00000014610) #10 ENSPTIG00000014331 RAB26 (ENSPTIG00000014200) #11 NTHL1 (ENSPTIG00000011471) #13 NHERF2 (ENSPTIG00000011167) #14 GFER (ENSPTIG00000011023) #18 ENSPTIG00000010738 #19 TBL3 (ENSPTIG00000010377) #20 ENSPTIG00000010338 #21 ENSPTIG00000010284 ##22 NDUFB10 (ENSPTIG00000009910) #23 RPL3L (ENSPTIG00000009722) #24 MSRB1 (ENSPTIG00000009446) #25 HS3ST6 (ENSPTIG00000009671) #26 ENSPTIG00000009036 #27 FAHD1 (ENSPTIG00000009011) #28 HAGH (ENSPTIG00000008853) #29 NUBP2 (ENSPTIG00000008814) #31 EME2 (ENSPTIG00000008505) #33 MAPK8IP3 (ENSPTIG00000007779) #36 JPT2 (ENSPTIG00000007704) #37 TMEM204 (ENSPTIG00000006591) IFT140 (ENSPTIG00000005835) TELO2 (ENSPTIG00000005753) PTX4 (ENSPTIG00000005448) Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.a ##22 Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.a ##22 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.a ##22 Dog MODERN SPECIES 5 THSD7A (ENSCAFG00845025032) PHF14 (ENSCAFG00845024252) NXPH1 (ENSCAFG00845023794) ICA1 (ENSCAFG00845023498) GLCCI1 (ENSCAFG00845023274) ENSCAFG00845023104 ENSCAFG00845023019 MIOS (ENSCAFG00845022762) ENSCAFG00845022480 ENSCAFG00845022359 ASNS (ENSCAFG00845022196) ENSCAFG00845022098 DLX5 (ENSCAFG00845022026) DLX6 (ENSCAFG00845021877) ENSCAFG00845021649 ENSCAFG00845021558 ##22 SLC25A13 (ENSCAFG00845021467) DYNC1I1 (ENSCAFG00845021237) PDK4 (ENSCAFG00845021015) ASB4 (ENSCAFG00845020937) PON2 (ENSCAFG00845020811) PON1 (ENSCAFG00845020697) PON1 (ENSCAFG00845020626) PPP1R9A (ENSCAFG00845019528) PEG10 (ENSCAFG00845019307) SGCE (ENSCAFG00845018808) CASD1 (ENSCAFG00845018361) COL1A2 (ENSCAFG00845017038) BET1 (ENSCAFG00845016464) ENSCAFG00845016402 TFPI2 (ENSCAFG00845016351) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.a ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.a ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.a ##22 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.a ##22 Rabbit MODERN SPECIES 10 ENSOCUG00000001108 CAMTA2 (ENSOCUG00000001109) INCA1 (ENSOCUG00000032954) KIF1C (ENSOCUG00000025068) ENSOCUG00000034911 ZNF232 (ENSOCUG00000029527) SCIMP (ENSOCUG00000025793) RABEP1 (ENSOCUG00000004778) NUP88 (ENSOCUG00000004787) RPAIN (ENSOCUG00000004793) DHX33 (ENSOCUG00000004805) DERL2 (ENSOCUG00000004811) MIS12 (ENSOCUG00000024925) ENSOCUG00000027233 WSCD1 (ENSOCUG00000003426) ENSOCUG00000022355 ##22 AIPL1 (ENSOCUG00000027395) PIMREG (ENSOCUG00000002818) PITPNM3 (ENSOCUG00000002824) KIAA0753 (ENSOCUG00000002832) ENSOCUG00000016557 MED31 (ENSOCUG00000016562) SLC13A5 (ENSOCUG00000009885) ENSOCUG00000006561 FBXO39 (ENSOCUG00000024705) TEKT1 (ENSOCUG00000026874) SMTNL2 (ENSOCUG00000000696) MYBBP1A (ENSOCUG00000012076) GGT6 (ENSOCUG00000024484) SPNS2 (ENSOCUG00000012070) SPNS3 (ENSOCUG00000015007) Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.a ##22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.a ##22 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.a ##22 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.a ##22 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 478 KLHL23 (ENSPCOG00000028044) CFAP210 (ENSPCOG00000006861) PPIG (ENSPCOG00000016588) FASTKD1 (ENSPCOG00000024955) KLHL41 (ENSPCOG00000018624) BBS5 (ENSPCOG00000027299) LRP2 (ENSPCOG00000008020) DHRS9 (ENSPCOG00000020628) ABCB11 (ENSPCOG00000022330) G6PC2 (ENSPCOG00000021912) SPC25 (ENSPCOG00000009341) NOSTRIN (ENSPCOG00000021408) CERS6 (ENSPCOG00000019829) STK39 (ENSPCOG00000028579) B3GALT1 (ENSPCOG00000011545) ENSPCOG00000013338 ##22 XIRP2 (ENSPCOG00000011918) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.a ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.a ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.a ##22 Cercopithecidae DUPLICATION Cercopithecidae DUPLICATION Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.a.a.a ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.a.a.a ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.a.a.a ##22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.a.a.a ##22 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 76 ACP5 (ENSMNEG00000017004) ZNF823 (ENSMNEG00000028895) ZNF441 (ENSMNEG00000036807) ENSMNEG00000013170 ZNF700 (ENSMNEG00000030711) ZNF878 (ENSMNEG00000043778) ZNF844 (ENSMNEG00000035679) ENSMNEG00000037632 ENSMNEG00000030980 ENSMNEG00000043154 ZNF20 (ENSMNEG00000040795) ZNF433 (ENSMNEG00000002805) ZNF136 (ENSMNEG00000037166) ENSMNEG00000039188 ENSMNEG00000034426 ENSMNEG00000026629 ##22 ZNF44 (ENSMNEG00000035561) ZNF563 (ENSMNEG00000042428) ZNF442 (ENSMNEG00000032289) ZNF799 (ENSMNEG00000045374) ZNF709 (ENSMNEG00000030534) ZNF564 (ENSMNEG00000045548) ZNF490 (ENSMNEG00000045546) ZNF791 (ENSMNEG00000045545) MAN2B1 (ENSMNEG00000045549) WDR83OS (ENSMNEG00000045544) WDR83 (ENSMNEG00000045547) DHPS (ENSMNEG00000044271) ENSMNEG00000042372 FBXW9 (ENSMNEG00000039654) TNPO2 (ENSMNEG00000041024) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.a.a.a ##22 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 911 ZNF823 (ENSRBIG00000031886) ZNF441 (ENSRBIG00000027708) ZNF700 (ENSRBIG00000043636) ZNF878 (ENSRBIG00000041827) ENSRBIG00000036076 ENSRBIG00000042654 ENSRBIG00000027955 ENSRBIG00000041844 ZNF20 (ENSRBIG00000042307) ZNF625 (ENSRBIG00000039898) ZNF136 (ENSRBIG00000030283) ENSRBIG00000032118 ENSRBIG00000015818 ##22 ZNF563 (ENSRBIG00000016161) ZNF442 (ENSRBIG00000012240) ZNF799 (ENSRBIG00000042859) ZNF44 (ENSRBIG00000029636) ZNF564 (ENSRBIG00000031165) ZNF490 (ENSRBIG00000026285) ZNF791 (ENSRBIG00000000657) MAN2B1 (ENSRBIG00000037745) WDR83OS (ENSRBIG00000027854) WDR83 (ENSRBIG00000027958) DHPS (ENSRBIG00000031601) ENSRBIG00000040808 FBXW9 (ENSRBIG00000037412) TNPO2 (ENSRBIG00000036652) TRIR (ENSRBIG00000031142) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.a.a.b ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.a.a.b ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.a.a.b ##22 Macaca ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00440000033807 ENSGT00940000159770 ENSGT00940000157123 ENSGT00940000154546.gb ENSGT00940000159083 ENSGT00850000133584 ENSGT00950000182767.b.b.d.hb.b.a.b.a.a.a.a ENSGT01100000263477.F ENSGT00390000005569.x.a.a.b ENSGT00940000160835 ENSGT00940000158360 ENSGT00940000155427 ENSGT00940000156923 ENSGT00950000182901.a.a.b.b.a.b.a.a.a.b ENSGT00940000154268.f.k.a ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.a.a.b ##22 ENSGT00950000182883.a.b.a ENSGT00390000005530.a.b ENSGT00950000183046.b ENSGT00940000155405.kb ENSGT00390000003051 ENSGT00390000008029 ENSGT00390000015038 ENSGT00940000161647 ENSGT00940000155000.u ENSGT00760000119441.b ENSGT00390000001994 ENSGT00390000002457 ENSGT00390000008610.a.b.a.b ENSGT00510000046985.h.b.a.b ENSGT00390000010029 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00440000033807 ENSGT00940000159770 ENSGT00940000157123 ENSGT00940000154546.gb ENSGT00940000159083 ENSGT00850000133584 ENSGT00950000182767.b.b.d.hb.b.a.b.a.b ENSGT01100000263477.F ENSGT00390000005569.x.a.a.b ENSGT00940000160835 ENSGT00940000158360 ENSGT00940000155427 ENSGT00940000156923 ENSGT00950000182901.a.a.b.b.a.b.a.a.a.b ENSGT00940000154268.f.k.a ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.a.a.b ##22 ENSGT00950000182883.a.b.a ENSGT00390000005530.a.b ENSGT00950000183046.b ENSGT00390000003051 ENSGT00390000008029 ENSGT00390000015038 ENSGT00940000161647 ENSGT00940000155000.u ENSGT00390000001994 ENSGT00390000002457 ENSGT00390000008610.a.b.a.b ENSGT00390000010029 ENSGT00940000159188 ENSGT00940000157683 ENSGT00910000146930 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 13 ENSMFAG00000034889 ENSMFAG00000061167 ENSMFAG00000001668 VWDE (ENSMFAG00000040971) TMEM106B (ENSMFAG00000037023) ENSMFAG00000056213 THSD7A (ENSMFAG00000042978) ENSMFAG00000063959 PHF14 (ENSMFAG00000002668) ENSMFAG00000061241 ENSMFAG00000052316 NDUFA4 (ENSMFAG00000043193) ENSMFAG00000057376 ENSMFAG00000053842 ENSMFAG00000050405 ENSMFAG00000040646 ##22 NXPH1 (ENSMFAG00000032515) ICA1 (ENSMFAG00000046093) GLCCI1 (ENSMFAG00000038435) UMAD1 (ENSMFAG00000052878) ENSMFAG00000042056 MIOS (ENSMFAG00000034560) COL28A1 (ENSMFAG00000000186) ENSMFAG00000053535 C1GALT1 (ENSMFAG00000031532) ENSMFAG00000055818 ASNS (ENSMFAG00000041092) TAC1 (ENSMFAG00000000287) ENSMFAG00000057765 ENSMFAG00000046006 ENSMFAG00000030531 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 534 DGKB (ENSMNEG00000032853) ETV1 (ENSMNEG00000032710) ENSMNEG00000027845 SCIN (ENSMNEG00000041934) ENSMNEG00000042009 ENSMNEG00000044560 ENSMNEG00000017088 ENSMNEG00000026112 VWDE (ENSMNEG00000026368) TMEM106B (ENSMNEG00000030547) THSD7A (ENSMNEG00000044846) ENSMNEG00000033652 ENSMNEG00000041084 PHF14 (ENSMNEG00000031850) ENSMNEG00000030955 ENSMNEG00000029668 ##22 NXPH1 (ENSMNEG00000039744) ICA1 (ENSMNEG00000044278) GLCCI1 (ENSMNEG00000040369) ENSMNEG00000032658 UMAD1 (ENSMNEG00000044071) RPA3 (ENSMNEG00000044584) MIOS (ENSMNEG00000036023) COL28A1 (ENSMNEG00000035662) C1GALT1 (ENSMNEG00000029681) ENSMNEG00000031471 ASNS (ENSMNEG00000043217) TAC1 (ENSMNEG00000040665) ENSMNEG00000030799 ENSMNEG00000031425 DLX5 (ENSMNEG00000021136) Vervet Monkey MODERN SPECIES 26 PRSS12 (ENSCSAG00000003767) METTL14 (ENSCSAG00000003762) SEC24D (ENSCSAG00000003757) SYNPO2 (ENSCSAG00000003754) MYOZ2 (ENSCSAG00000003751) ENSCSAG00000003749 USP53 (ENSCSAG00000003748) ENSCSAG00000003745 FABP2 (ENSCSAG00000003744) PDE5A (ENSCSAG00000003739) ENSCSAG00000003731 PRDM5 (ENSCSAG00000003729) NDNF (ENSCSAG00000003726) TNIP3 (ENSCSAG00000003720) QRFPR (ENSCSAG00000003717) ENSCSAG00000003716 ##22 ANXA5 (ENSCSAG00000003714) ENSCSAG00000003708 EXOSC9 (ENSCSAG00000003705) CCNA2 (ENSCSAG00000003701) BBS7 (ENSCSAG00000003698) TRPC3 (ENSCSAG00000003692) BLTP1 (ENSCSAG00000003688) ADAD1 (ENSCSAG00000003673) IL2 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ENSGT00390000014856.c ENSGT00940000155728 ENSGT00510000048519 Macaca ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00530000063707.a ENSGT00530000063509.A ENSGT00940000153434.a.b.a.b ENSGT00940000155955.C ENSGT00940000153118.db.a.a.a ENSGT01090000260146 ENSGT00390000013440 ENSGT00390000003800 ENSGT01030000234601.c.a.b ENSGT00390000003753.b ENSGT00910000147724 ENSGT00930000151058 ENSGT00390000006233.c.a.b ENSGT00390000013260.C ENSGT00940000159750 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000154814.b ENSGT00940000156403.b ENSGT00940000155197.s.a ENSGT00390000007878 ENSGT00940000158916 ENSGT00390000011980.a ENSGT00950000183082.a.db.b ENSGT00940000153908.a ENSGT00940000161146 ENSGT00940000159982 ENSGT00940000159950 ENSGT00950000183119.b ENSGT00390000014856.c ENSGT00940000155728 ENSGT00510000048519 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 105 ATF7IP (ENSMNEG00000040929) PLBD1 (ENSMNEG00000029651) ENSMNEG00000030513 GUCY2C (ENSMNEG00000033572) ENSMNEG00000037937 H2AJ (ENSMNEG00000026208) WBP11 (ENSMNEG00000037537) SMCO3 (ENSMNEG00000012628) ART4 (ENSMNEG00000037221) MGP (ENSMNEG00000033574) ENSMNEG00000013508 ERP27 (ENSMNEG00000039931) ARHGDIB (ENSMNEG00000031899) PDE6H (ENSMNEG00000043774) RERG (ENSMNEG00000042410) ENSMNEG00000035069 ##22 PTPRO (ENSMNEG00000045297) EPS8 (ENSMNEG00000034734) STRAP (ENSMNEG00000035858) DERA (ENSMNEG00000045517) SLC15A5 (ENSMNEG00000034657) MGST1 (ENSMNEG00000042830) ENSMNEG00000028350 LMO3 (ENSMNEG00000039417) ENSMNEG00000024827 ENSMNEG00000043868 ENSMNEG00000035675 ENSMNEG00000001015 RERGL (ENSMNEG00000043478) ENSMNEG00000028776 ENSMNEG00000032243 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000155964 ENSGT00530000063707.a ENSGT00530000063509.A ENSGT00940000155955.C ENSGT00940000153118.db.a.a.a ENSGT01090000260146 ENSGT00390000013440 ENSGT00390000003800 ENSGT01030000234601.c.a.b ENSGT00390000003753.b ENSGT00910000147724 ENSGT00930000151058 ENSGT00390000006233.c.a.b ENSGT00390000013260.C ENSGT00940000159750 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000154814.b ENSGT00940000156403.b ENSGT00940000155197.s.a ENSGT00390000007878 ENSGT00940000158916 ENSGT00390000011980.a ENSGT00940000153908.a ENSGT00940000161146 ENSGT00940000159982 ENSGT00940000159950 ENSGT00950000183119.b ENSGT00390000014856.c ENSGT00940000155728 ENSGT00510000048519 ENSGT00550000074878.`b.a.b Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 55 ENSGT00530000063707.a ENSGT00530000063509.A ENSGT00910000148366 ENSGT00940000155955.C ENSGT01060000248528.b.kh.yb.b.a.mb ENSGT00940000153118.db.a.a.a ENSGT01090000260146 ENSGT00390000013440 ENSGT01030000234601.c.a.b ENSGT00390000003753.b ENSGT00910000147724 ENSGT00930000151058 ENSGT00390000006233.c.a.b ENSGT00390000013260.C ENSGT00940000159750 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000154814.b ENSGT00940000156403.b ENSGT00940000155197.s.a ENSGT00390000007878 ENSGT00940000158916 ENSGT00390000011980.a ENSGT00940000153908.a ENSGT00390000012652.ab.a.m ENSGT00390000017780.e.e.b ENSGT00940000161146 ENSGT00940000159982 ENSGT00940000159950 ENSGT00950000183119.b ENSGT00390000014856.c ENSGT00940000155728 Drill MODERN SPECIES 1050 ATF7IP (ENSMLEG00000041674) PLBD1 (ENSMLEG00000033091) ENSMLEG00000041606 GUCY2C (ENSMLEG00000044128) ENSMLEG00000027901 H2AJ (ENSMLEG00000027492) WBP11 (ENSMLEG00000038428) SMCO3 (ENSMLEG00000011189) ART4 (ENSMLEG00000041014) MGP (ENSMLEG00000031247) ERP27 (ENSMLEG00000033015) ARHGDIB (ENSMLEG00000037360) PDE6H (ENSMLEG00000034852) RERG (ENSMLEG00000043731) PTPRO (ENSMLEG00000042633) ENSMLEG00000039087 ##22 EPS8 (ENSMLEG00000030972) STRAP (ENSMLEG00000042689) DERA (ENSMLEG00000028470) SLC15A5 (ENSMLEG00000005044) MGST1 (ENSMLEG00000027340) Sooty mangabey MODERN SPECIES 643 PLBD1 (ENSCATG00000026976) ENSCATG00000033862 ENSCATG00000031310 GUCY2C (ENSCATG00000033226) ENSCATG00000014478 H2AJ (ENSCATG00000014186) WBP11 (ENSCATG00000032001) SMCO3 (ENSCATG00000020998) ART4 (ENSCATG00000030685) MGP (ENSCATG00000034575) ENSCATG00000018215 ERP27 (ENSCATG00000033894) ARHGDIB (ENSCATG00000043892) PDE6H (ENSCATG00000035887) RERG (ENSCATG00000030178) ENSCATG00000037648 ##22 PTPRO (ENSCATG00000042544) EPS8 (ENSCATG00000036330) STRAP (ENSCATG00000016528) DERA (ENSCATG00000034687) ENSCATG00000043986 SLC15A5 (ENSCATG00000030181) MGST1 (ENSCATG00000039704) LMO3 (ENSCATG00000029301) ENSCATG00000042361 ENSCATG00000033741 ENSCATG00000032755 RERGL (ENSCATG00000041702) ENSCATG00000032980 ENSCATG00000043013 PIK3C2G (ENSCATG00000043954) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.a.b ##22 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2048 ENSRROG00000038066 CDH6 (ENSRROG00000030053) DROSHA (ENSRROG00000028199) C5orf22 (ENSRROG00000029177) ENSRROG00000001212 ENSRROG00000023013 PDZD2 (ENSRROG00000041533) GOLPH3 (ENSRROG00000036602) ENSRROG00000022682 MTMR12 (ENSRROG00000043907) ZFR (ENSRROG00000044008) ENSRROG00000035319 SUB1 (ENSRROG00000040438) NPR3 (ENSRROG00000037597) ENSRROG00000021565 ##22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.a ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.a ##22 Homo/Pan/Gorilla group DUPLICATION Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.a.c ##22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.a.c ##22 Pan ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.a.c ##22 Chimpanzee MODERN SPECIES 17 ENSPTRG00000046350 MMAA (ENSPTRG00000016486) SMAD1 (ENSPTRG00000016485) ENSPTRG00000041132 OTUD4 (ENSPTRG00000016482) ABCE1 (ENSPTRG00000016481) ANAPC10 (ENSPTRG00000016480) HHIP (ENSPTRG00000016479) GYPA (ENSPTRG00000016478) ENSPTRG00000047026 ENSPTRG00000034083 ENSPTRG00000046937 ENSPTRG00000038865 FREM3 (ENSPTRG00000016474) SMARCA5 (ENSPTRG00000016472) ENSPTRG00000044130 ##22 GAB1 (ENSPTRG00000016471) USP38 (ENSPTRG00000016470) INPP4B (ENSPTRG00000016469) IL15 (ENSPTRG00000016467) ZNF330 (ENSPTRG00000016466) RNF150 (ENSPTRG00000016465) TBC1D9 (ENSPTRG00000016464) UCP1 (ENSPTRG00000016463) ELMOD2 (ENSPTRG00000016462) MGAT4D (ENSPTRG00000031089) CLGN (ENSPTRG00000049174) ENSPTRG00000045152 SCOC (ENSPTRG00000016460) MAML3 (ENSPTRG00000016459) MGST2 (ENSPTRG00000016457) Gorilla MODERN SPECIES ENSGGOG00000009886 PRPF38A (ENSGGOG00000003940) ORC1 (ENSGGOG00000003931) CC2D1B (ENSGGOG00000000187) ENSGGOG00000043641 ENSGGOG00000036930 ZFYVE9 (ENSGGOG00000012676) ENSGGOG00000038230 BTF3L4 (ENSGGOG00000010677) TXNDC12 (ENSGGOG00000010208) RAB3B (ENSGGOG00000001562) NRDC (ENSGGOG00000004793) OSBPL9 (ENSGGOG00000004787) EPS15 (ENSGGOG00000006160) TTC39A (ENSGGOG00000012965) ENSGGOG00000025934 ##22 RNF11 (ENSGGOG00000004919) ENSGGOG00000040829 C1orf185 (ENSGGOG00000015902) CDKN2C (ENSGGOG00000017023) FAF1 (ENSGGOG00000013273) ENSGGOG00000013269 ENSGGOG00000024575 ELAVL4 (ENSGGOG00000000634) BEND5 (ENSGGOG00000003566) AGBL4 (ENSGGOG00000043434) SPATA6 (ENSGGOG00000001284) ENSGGOG00000028320 SLC5A9 (ENSGGOG00000012140) ENSGGOG00000044020 TRABD2B (ENSGGOG00000037702) Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.a.d ##22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.a.d ##22 Pan ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000008714.a ENSGT00390000008196.g.b.a ENSGT00940000155545.a ENSGT00390000008744 ENSGT00940000158549 ENSGT00940000160966 ENSGT00390000009529 ENSGT00390000003894 ENSGT00390000003306 ENSGT00390000003308.b ENSGT00940000160641 ENSGT00530000064299 ENSGT01030000234556.a.b.b ENSGT00390000000566.q.b.b ENSGT00390000001092 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.a.d ##22 ENSGT00390000018369.hb.a ENSGT01050000244808.A.b.a.a.a.a.j ENSGT00940000163722 ENSGT01050000244808.A.b.a.a.a.b ENSGT01050000244808.A.b.a.a.a.a.i ENSGT00950000183030.m.b.b.m.a ENSGT01050000244808.A.b.a.a.b ENSGT01050000244808.D.fb.a ENSGT00930000151041 ENSGT00940000159221 ENSGT00940000157757 ENSGT00510000046975.b.u ENSGT00390000007598 ENSGT00940000164616 ENSGT00940000163577 Bonobo MODERN SPECIES DEDD (ENSPPAG00000028161) UFC1 (ENSPPAG00000037913) USP21 (ENSPPAG00000043245) 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ENSGGOG00000042027 ENSGGOG00000003859 ENSGGOG00000023508 FCRLA (ENSGGOG00000001288) FCRLB (ENSGGOG00000028059) DUSP12 (ENSGGOG00000004596) ATF6 (ENSGGOG00000013807) OLFML2B (ENSGGOG00000008860) NOS1AP (ENSGGOG00000013747) C1orf226 (ENSGGOG00000013762) SPATA46 (ENSGGOG00000013760) SH2D1B (ENSGGOG00000014121) ENSGGOG00000037180 Gibbon DUPLICATION Gibbon MODERN SPECIES ZNF69 (ENSNLEG00000012656) ENSNLEG00000012654 ZNF700 (ENSNLEG00000012661) ZNF763 (ENSNLEG00000012662) ZNF433 (ENSNLEG00000012664) ZNF878 (ENSNLEG00000032244) ENSNLEG00000035209 ENSNLEG00000030852 ENSNLEG00000033292 ENSNLEG00000027169 ENSNLEG00000012670 ZNF625 (ENSNLEG00000019141) ZNF20 (ENSNLEG00000033064) ZNF136 (ENSNLEG00000033491) ENSNLEG00000029689 ENSNLEG00000031557 ##22 ZNF44 (ENSNLEG00000036219) ZNF563 (ENSNLEG00000035842) ZNF799 (ENSNLEG00000034475) ZNF443 (ENSNLEG00000026561) ZNF709 (ENSNLEG00000036256) ZNF564 (ENSNLEG00000012688) ZNF490 (ENSNLEG00000012691) ZNF791 (ENSNLEG00000012694) MAN2B1 (ENSNLEG00000012695) WDR83OS (ENSNLEG00000012705) WDR83 (ENSNLEG00000012710) DHPS (ENSNLEG00000012722) FBXW9 (ENSNLEG00000012752) TNPO2 (ENSNLEG00000012758) TRIR (ENSNLEG00000033688) Gibbon MODERN SPECIES 19 ENSNLEG00000008863 SERPINB11 (ENSNLEG00000008871) SERPINB7 (ENSNLEG00000008896) SERPINB10 (ENSNLEG00000008933) SERPINB8 (ENSNLEG00000008988) CDH7 (ENSNLEG00000009005) CDH19 (ENSNLEG00000009030) DSEL (ENSNLEG00000018457) ENSNLEG00000009059 TMX3 (ENSNLEG00000009060) CCDC102B (ENSNLEG00000009091) DOK6 (ENSNLEG00000009106) CD226 (ENSNLEG00000009116) RTTN (ENSNLEG00000009131) SOCS6 (ENSNLEG00000018458) ENSNLEG00000035138 ##22 ENSNLEG00000033807 CBLN2 (ENSNLEG00000009198) NETO1 (ENSNLEG00000009204) FBXO15 (ENSNLEG00000009214) TIMM21 (ENSNLEG00000029495) ENSNLEG00000029763 CYB5A (ENSNLEG00000009232) C18orf63 (ENSNLEG00000009238) DIPK1C (ENSNLEG00000009259) CNDP2 (ENSNLEG00000009264) CNDP1 (ENSNLEG00000009273) ENSNLEG00000009303 TSHZ1 (ENSNLEG00000018459) ENSNLEG00000009315 ENSNLEG00000035372 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.a ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.a ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.a ##22 Capuchin MODERN SPECIES 826 ENSCCAG00000015679 ##22 NUDT11 (ENSCCAG00000026292) EZHIP (ENSCCAG00000023059) Mas night monkey MODERN SPECIES 416 PSMD11 (ENSANAG00000021703) CDK5R1 (ENSANAG00000012728) MYO1D (ENSANAG00000036261) ENSANAG00000037868 TMEM98 (ENSANAG00000038126) SPACA3 (ENSANAG00000035068) ASIC2 (ENSANAG00000001281) CCL2 (ENSANAG00000037893) CCL7 (ENSANAG00000022972) CCL11 (ENSANAG00000025265) CCL8 (ENSANAG00000023316) ENSANAG00000034079 CCL1 (ENSANAG00000023858) TMEM132E (ENSANAG00000029169) ENSANAG00000006396 ENSANAG00000034074 ##22 CCT6B (ENSANAG00000036626) Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.a ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.a ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.a ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.a ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.a ##22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.a ##22 Cebidae DUPLICATION Cebidae DUPLICATION Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.a.a.a ##22 Marmoset DUPLICATION Marmoset MODERN SPECIES 7 ENSCJAG00000074515 KCNV1 (ENSCJAG00000006183) SYBU (ENSCJAG00000006204) EBAG9 (ENSCJAG00000006248) PKHD1L1 (ENSCJAG00000006282) ENSCJAG00000006389 NUDCD1 (ENSCJAG00000006407) TRHR (ENSCJAG00000006433) TMEM74 (ENSCJAG00000023212) ENSCJAG00000079594 EMC2 (ENSCJAG00000006437) EIF3E (ENSCJAG00000006458) ENSCJAG00000072384 RSPO2 (ENSCJAG00000006515) ANGPT1 (ENSCJAG00000006522) ENSCJAG00000073345 ##22 ENSCJAG00000023213 ABRA (ENSCJAG00000040325) OXR1 (ENSCJAG00000006571) ENSCJAG00000006636 ZFPM2 (ENSCJAG00000006642) LRP12 (ENSCJAG00000038802) DPYS (ENSCJAG00000006703) DCSTAMP (ENSCJAG00000006716) RIMS2 (ENSCJAG00000016212) DCAF13 (ENSCJAG00000016181) ENSCJAG00000043411 CTHRC1 (ENSCJAG00000016167) FZD6 (ENSCJAG00000016150) ENSCJAG00000041230 BAALC (ENSCJAG00000043716) Marmoset MODERN SPECIES 7 DSCC1 (ENSCJAG00000005518) DEPTOR (ENSCJAG00000005497) COL14A1 (ENSCJAG00000005370) ENSCJAG00000005359 MTBP (ENSCJAG00000005324) SNTB1 (ENSCJAG00000005315) ENSCJAG00000070598 ENSCJAG00000081290 HAS2 (ENSCJAG00000055536) ENSCJAG00000085475 ZHX2 (ENSCJAG00000022247) DERL1 (ENSCJAG00000038870) TBC1D31 (ENSCJAG00000000953) FAM83A (ENSCJAG00000074548) C8orf76 (ENSCJAG00000035957) ENSCJAG00000082897 ##22 ATAD2 (ENSCJAG00000000868) NTAQ1 (ENSCJAG00000000865) FBXO32 (ENSCJAG00000000844) KLHL38 (ENSCJAG00000000837) ANXA13 (ENSCJAG00000000819) FAM91A1 (ENSCJAG00000000803) FER1L6 (ENSCJAG00000082085) ENSCJAG00000073926 TMEM65 (ENSCJAG00000000756) TRMT12 (ENSCJAG00000022174) RNF139 (ENSCJAG00000038974) TATDN1 (ENSCJAG00000012826) NDUFB9 (ENSCJAG00000012818) MTSS1 (ENSCJAG00000012784) ZNF572 (ENSCJAG00000060682) Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.a.a.b ##22 Marmoset MODERN SPECIES 5 ENSCJAG00000072474 ENSCJAG00000043277 ALMS1 (ENSCJAG00000004144) EGR4 (ENSCJAG00000052100) FBXO41 (ENSCJAG00000004115) CCT7 (ENSCJAG00000003978) PRADC1 (ENSCJAG00000003970) SMYD5 (ENSCJAG00000003966) NOTO (ENSCJAG00000043188) RAB11FIP5 (ENSCJAG00000003950) SFXN5 (ENSCJAG00000003886) EMX1 (ENSCJAG00000039703) SPR (ENSCJAG00000073980) EXOC6B (ENSCJAG00000003846) CYP26B1 (ENSCJAG00000072683) ENSCJAG00000074990 ##22 DYSF (ENSCJAG00000003605) ENSCJAG00000082822 ENSCJAG00000075497 ENSCJAG00000011364 STAMBP (ENSCJAG00000017897) ACTG2 (ENSCJAG00000017882) DGUOK (ENSCJAG00000017868) TET3 (ENSCJAG00000017853) ENSCJAG00000017844 MOB1A (ENSCJAG00000043659) ENSCJAG00000017810 SLC4A5 (ENSCJAG00000017747) DCTN1 (ENSCJAG00000017578) C2orf81 (ENSCJAG00000017577) WDR54 (ENSCJAG00000017568) Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.a.a.b ##22 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 86 SLC6A4 (ENSSBOG00000034594) NSRP1 (ENSSBOG00000022240) EFCAB5 (ENSSBOG00000031421) SSH2 (ENSSBOG00000020442) CORO6 (ENSSBOG00000036164) ANKRD13B (ENSSBOG00000024740) GIT1 (ENSSBOG00000030183) TP53I13 (ENSSBOG00000023431) ABHD15 (ENSSBOG00000035181) TAOK1 (ENSSBOG00000028880) ENSSBOG00000036071 CRYBA1 (ENSSBOG00000026676) MYO18A (ENSSBOG00000024287) ENSSBOG00000032228 PIPOX (ENSSBOG00000024576) ENSSBOG00000021425 ##22 SEZ6 (ENSSBOG00000027912) PHF12 (ENSSBOG00000023620) DHRS13 (ENSSBOG00000029359) FLOT2 (ENSSBOG00000023540) ERAL1 (ENSSBOG00000021352) FAM222B (ENSSBOG00000028693) TRAF4 (ENSSBOG00000023500) NEK8 (ENSSBOG00000024136) TLCD1 (ENSSBOG00000025114) ENSSBOG00000035649 RAB34 (ENSSBOG00000029883) PROCA1 (ENSSBOG00000035969) SUPT6H (ENSSBOG00000028535) SDF2 (ENSSBOG00000034484) ENSSBOG00000033310 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.a.b ##22 Marmoset DUPLICATION Marmoset MODERN SPECIES 18 ENSCJAG00000038833 HERC2 (ENSCJAG00000011798) OCA2 (ENSCJAG00000011780) ENSCJAG00000078802 ENSCJAG00000073185 GABRG3 (ENSCJAG00000009977) GABRA5 (ENSCJAG00000001665) GABRB3 (ENSCJAG00000003857) ENSCJAG00000071099 ENSCJAG00000077228 ATP10A (ENSCJAG00000074536) UBE3A (ENSCJAG00000003764) SNRPN (ENSCJAG00000003759) ENSCJAG00000003753 ENSCJAG00000048599 ENSCJAG00000076943 ##22 ENSCJAG00000069790 NDN (ENSCJAG00000003738) MAGEL2 (ENSCJAG00000085421) ENSCJAG00000045017 ENSCJAG00000076248 CHRNA7 (ENSCJAG00000021542) ENSCJAG00000070281 ENSCJAG00000069970 OTUD7A (ENSCJAG00000017621) KLF13 (ENSCJAG00000017617) TRPM1 (ENSCJAG00000017565) MTMR10 (ENSCJAG00000017528) ENSCJAG00000017520 APBA2 (ENSCJAG00000017493) ENTREP2 (ENSCJAG00000082089) Marmoset MODERN SPECIES 19 TNFRSF25 (ENSCJAG00000000177) PLEKHG5 (ENSCJAG00000000180) NOL9 (ENSCJAG00000042175) TAS1R1 (ENSCJAG00000000215) ZBTB48 (ENSCJAG00000000225) KLHL21 (ENSCJAG00000047266) PHF13 (ENSCJAG00000063633) THAP3 (ENSCJAG00000000237) DNAJC11 (ENSCJAG00000000242) CAMTA1 (ENSCJAG00000000258) VAMP3 (ENSCJAG00000047745) ENSCJAG00000058235 ENSCJAG00000000288 UTS2 (ENSCJAG00000000294) ERRFI1 (ENSCJAG00000040332) ENSCJAG00000044987 ##22 TNFRSF9 (ENSCJAG00000000317) ENSCJAG00000000319 SLC45A1 (ENSCJAG00000000330) RERE (ENSCJAG00000000334) ENSCJAG00000083203 ENSCJAG00000000359 CA6 (ENSCJAG00000000376) SLC2A7 (ENSCJAG00000000382) SLC2A5 (ENSCJAG00000000405) GPR157 (ENSCJAG00000074232) H6PD (ENSCJAG00000042326) SPSB1 (ENSCJAG00000000422) ##32 ENSCJAG00000083144 SLC25A33 (ENSCJAG00000000424) TMEM201 (ENSCJAG00000000432) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.a ##22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.a ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.a ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.a ##22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.a ##22 Pan ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.a ##22 Bonobo MODERN SPECIES 7 ENSPPAG00000028801 #7 BRICD5 (ENSPPAG00000001919) #8 MLST8 (ENSPPAG00000033345) #9 ENSPPAG00000028011 TRAF7 (ENSPPAG00000035191) #10 ENSPPAG00000042887 #11 TSC2 (ENSPPAG00000033353) #12 NTHL1 (ENSPPAG00000003626) #13 NHERF2 (ENSPPAG00000029803) #14 ZNF598 (ENSPPAG00000043798) #16 ENSPPAG00000040928 #17 GFER (ENSPPAG00000019230) #18 ENSPPAG00000030899 #19 TBL3 (ENSPPAG00000041939) #20 RNF151 (ENSPPAG00000035993) #21 ENSPPAG00000028366 ##22 NDUFB10 (ENSPPAG00000040038) #23 RPL3L (ENSPPAG00000039317) #24 ENSPPAG00000031640 #25 HS3ST6 (ENSPPAG00000029952) #26 ENSPPAG00000032337 #27 IGFALS (ENSPPAG00000025910) #30 ENSPPAG00000029613 #31 SPSB3 (ENSPPAG00000023101) #32 EME2 (ENSPPAG00000035754) #33 MRPS34 (ENSPPAG00000033749) #34 NME3 (ENSPPAG00000030073) #35 MAPK8IP3 (ENSPPAG00000034790) #36 JPT2 (ENSPPAG00000034952) #37 CRAMP1 (ENSPPAG00000036103) TMEM204 (ENSPPAG00000033773) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000156556 ENSGT00940000157784 ENSGT00390000007133 ENSGT00390000004601 ENSGT00910000147904 ENSGT00390000007467 ENSGT00390000016696 ENSGT00940000161696.c.a.c ENSGT00950000182906.b.b ENSGT00940000158694 ENSGT00730000111572.a.a ENSGT00950000183204.a ENSGT00910000148071 ENSGT00940000158997 ENSGT00730000111007.a.a ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.a ##22 ENSGT00390000002188 ENSGT00390000017724.a.b ENSGT00940000156507 ENSGT00950000183058.A.b ENSGT00940000161500 ENSGT00940000157596 ENSGT00940000155717 ENSGT00390000011053.f ENSGT00640000091497.a ENSGT00940000154143.f ENSGT01050000244950.a.a.a ENSGT00940000158837 ENSGT00940000154578.A.d ENSGT00940000163672 ENSGT00940000154311.a.b Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 99 ENSGT00940000159755 ENSGT00940000156556 ENSGT00940000157784 ENSGT00390000007133 ENSGT00390000004601 ENSGT00390000007467 ENSGT00390000016696 ENSGT00940000161696.c.a.c ENSGT00950000182906.b.b ENSGT00940000158694 ENSGT00730000111572.a.a.a ENSGT00950000183204.a ENSGT00910000148071 ENSGT00940000158997 ENSGT00730000111007.a.a ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.a ##22 ENSGT00390000002188 ENSGT00390000017724.a.b ENSGT00940000156507 ENSGT00950000183058.A.b ENSGT00940000161500 ENSGT00940000157596 ENSGT00940000155717 ENSGT00390000011053.f ENSGT00640000091497.a ENSGT00940000154143.f ENSGT01050000244950.a.a.a ENSGT00940000158837 ENSGT00940000154578.A.d ENSGT00940000163672 ENSGT00940000153336.e.b.a.a.b Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 116 ENSRBIG00000036153 LRRC58 (ENSRBIG00000001268) FSTL1 (ENSRBIG00000035867) NDUFB4 (ENSRBIG00000042955) HGD (ENSRBIG00000041495) RABL3 (ENSRBIG00000040941) GTF2E1 (ENSRBIG00000038747) ENSRBIG00000043061 STXBP5L (ENSRBIG00000040973) POLQ (ENSRBIG00000023391) ENSRBIG00000038038 FBXO40 (ENSRBIG00000040355) ENSRBIG00000036098 HCLS1 (ENSRBIG00000015356) GOLGB1 (ENSRBIG00000037187) ENSRBIG00000037400 ##22 IQCB1 (ENSRBIG00000040113) EAF2 (ENSRBIG00000043640) SLC15A2 (ENSRBIG00000027861) ILDR1 (ENSRBIG00000040069) CD86 (ENSRBIG00000032849) CASR (ENSRBIG00000027082) Golden snub-nosed monkey DUPLICATION Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2536 EIF3K (ENSRROG00000029130) MAP4K1 (ENSRROG00000039227) RYR1 (ENSRROG00000038134) RASGRP4 (ENSRROG00000032546) FAM98C (ENSRROG00000017020) SPRED3 (ENSRROG00000043863) GGN (ENSRROG00000034881) PSMD8 (ENSRROG00000015820) CATSPERG (ENSRROG00000034937) KCNK6 (ENSRROG00000042639) YIF1B (ENSRROG00000038450) C19orf33 (ENSRROG00000038967) SPINT2 (ENSRROG00000037295) PPP1R14A (ENSRROG00000000043) DPF1 (ENSRROG00000042921) ENSRROG00000037709 ##22 ENSRROG00000035604 SIPA1L3 (ENSRROG00000041601) WDR87 (ENSRROG00000035495) ZNF573 (ENSRROG00000043105) ZNF607 (ENSRROG00000040754) ENSRROG00000031507 ENSRROG00000034457 ZFP30 (ENSRROG00000039306) ZNF540 (ENSRROG00000002447) ZNF571 (ENSRROG00000004328) ZNF793 (ENSRROG00000035042) ZNF570 (ENSRROG00000043128) ZNF569 (ENSRROG00000033596) ZNF527 (ENSRROG00000045552) ZNF875 (ENSRROG00000044808) Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1108 ENSRROG00000039679 ENSRROG00000032363 LRRC8B (ENSRROG00000015799) LRRC8C (ENSRROG00000040604) LRRC8D (ENSRROG00000025435) ENSRROG00000031124 ZNF326 (ENSRROG00000032091) ENSRROG00000042660 ##22 BARHL2 (ENSRROG00000044232) Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000156556 ENSGT00940000157784 ENSGT00390000007133 ENSGT00390000004601 ENSGT00910000147904 ENSGT00390000007467 ENSGT00390000016696 ENSGT00940000161696.c.a.c ENSGT00950000182906.b.b ENSGT00940000158694 ENSGT00730000111572.a.a ENSGT00950000183204.a ENSGT00910000148071 ENSGT00940000158997 ENSGT00730000111007.a.a ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.a ##22 ENSGT00390000002188 ENSGT00390000017724.a.b ENSGT00940000156507 ENSGT00950000183058.A.b ENSGT00940000161500 ENSGT00940000157596 ENSGT00940000155717 ENSGT00390000011053.f ENSGT00640000091497.a ENSGT00940000154143.f ENSGT01050000244950.a.a.a ENSGT00940000158837 ENSGT00940000154578.A.d ENSGT00940000163672 ENSGT00940000154311.a.b Vervet Monkey MODERN SPECIES 14 NR1I2 (ENSCSAG00000007092) ENSCSAG00000007102 GSK3B (ENSCSAG00000007111) GPR156 (ENSCSAG00000007128) LRRC58 (ENSCSAG00000007132) FSTL1 (ENSCSAG00000007135) ENSCSAG00000007142 HGD (ENSCSAG00000007149) RABL3 (ENSCSAG00000007155) GTF2E1 (ENSCSAG00000007159) STXBP5L (ENSCSAG00000007174) POLQ (ENSCSAG00000007239) FBXO40 (ENSCSAG00000007268) HCLS1 (ENSCSAG00000007278) GOLGB1 (ENSCSAG00000007292) ENSCSAG00000018717 ##22 IQCB1 (ENSCSAG00000007306) EAF2 (ENSCSAG00000007313) SLC15A2 (ENSCSAG00000007326) ILDR1 (ENSCSAG00000007351) CD86 (ENSCSAG00000007366) CASR (ENSCSAG00000007371) CSTA (ENSCSAG00000007377) MIX23 (ENSCSAG00000007385) FAM162A (ENSCSAG00000007388) WDR5B (ENSCSAG00000018716) KPNA1 (ENSCSAG00000007394) PARP9 (ENSCSAG00000007401) DTX3L (ENSCSAG00000007418) PARP15 (ENSCSAG00000007452) PARP14 (ENSCSAG00000007464) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.a ##22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.a ##22 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.a ##22 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 12 E4F1 (ENSMFAG00000038250) PGP (ENSMFAG00000045182) #7 BRICD5 (ENSMFAG00000039405) #8 MLST8 (ENSMFAG00000045584) #9 TRAF7 (ENSMFAG00000045280) #10 RAB26 (ENSMFAG00000045162) #11 TSC2 (ENSMFAG00000032166) #12 NTHL1 (ENSMFAG00000032174) #13 NHERF2 (ENSMFAG00000044443) #14 ZNF598 (ENSMFAG00000001763) #16 ENSMFAG00000038081 #17 GFER (ENSMFAG00000039787) #18 NOXO1 (ENSMFAG00000037791) #19 TBL3 (ENSMFAG00000030302) #20 RNF151 (ENSMFAG00000035160) #21 ENSMFAG00000002939 ##22 NDUFB10 (ENSMFAG00000000484) #23 RPL3L (ENSMFAG00000039775) #24 HS3ST6 (ENSMFAG00000054823) #26 ENSMFAG00000054955 ENSMFAG00000000726 #27 FAHD1 (ENSMFAG00000037024) #28 HAGH (ENSMFAG00000004030) #29 IGFALS (ENSMFAG00000042039) #30 SPSB3 (ENSMFAG00000031888) #32 NUBP2 (ENSMFAG00000037059) #31 EME2 (ENSMFAG00000026250) #33 MRPS34 (ENSMFAG00000046146) #34 MAPK8IP3 (ENSMFAG00000037276) #36 ENSMFAG00000060156 JPT2 (ENSMFAG00000033861) #37 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 423 RAB6A (ENSMNEG00000029216) MRPL48 (ENSMNEG00000043715) PAAF1 (ENSMNEG00000031366) ENSMNEG00000027405 DNAJB13 (ENSMNEG00000033658) UCP2 (ENSMNEG00000037621) UCP3 (ENSMNEG00000038430) C2CD3 (ENSMNEG00000043159) PPME1 (ENSMNEG00000031477) P4HA3 (ENSMNEG00000034504) ENSMNEG00000003571 ENSMNEG00000025468 PGM2L1 (ENSMNEG00000030625) KCNE3 (ENSMNEG00000026796) LIPT2 (ENSMNEG00000029656) ENSMNEG00000035237 ##22 ENSMNEG00000036818 ENSMNEG00000043787 CHRDL2 (ENSMNEG00000033501) RNF169 (ENSMNEG00000011250) XRRA1 (ENSMNEG00000041388) ENSMNEG00000040433 NEU3 (ENSMNEG00000036089) ENSMNEG00000031819 OR2AT4 (ENSMNEG00000004250) ENSMNEG00000043807 ENSMNEG00000030448 SLCO2B1 (ENSMNEG00000042734) TPBGL (ENSMNEG00000021296) ARRB1 (ENSMNEG00000040641) ENSMNEG00000032069 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.a ##22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 149 ENSGT00940000160532 ENSGT00940000164023 ENSGT00940000153568.B ENSGT00390000011515.d ENSGT00390000014818.g.b.a.b ENSGT00940000153294.m.b.s.e.b ENSGT00940000154817.b.b.b ENSGT00940000159158 ENSGT00940000159213 ENSGT00940000159862 ENSGT00910000147009 ENSGT00940000155984 ENSGT00940000163000 ENSGT00940000156332 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.a ##22 ENSGT00940000157211 ENSGT00910000146971 ENSGT00390000010354 ENSGT00390000006925 ENSGT00940000160618 ENSGT00390000006225 ENSGT00940000154846.b.k.a.b ENSGT00390000015352 ENSGT00390000008042.A.b ENSGT00940000156913.b ENSGT00950000183074.C ENSGT00940000160811 ENSGT00580000081600.c.b ENSGT00390000011294 ENSGT01010000222287.B.a.b.b Drill MODERN SPECIES 871 CNTNAP5 (ENSMLEG00000030564) ENSMLEG00000005825 TSN (ENSMLEG00000038656) NIFK (ENSMLEG00000043516) ENSMLEG00000017424 CLASP1 (ENSMLEG00000044177) TFCP2L1 (ENSMLEG00000019949) GLI2 (ENSMLEG00000000952) ENSMLEG00000042162 RALB (ENSMLEG00000008823) ENSMLEG00000027991 EPB41L5 (ENSMLEG00000032344) ENSMLEG00000039838 ##22 PTPN4 (ENSMLEG00000040178) ENSMLEG00000041704 CFAP221 (ENSMLEG00000042134) SCTR (ENSMLEG00000029227) TMEM37 (ENSMLEG00000033060) DBI (ENSMLEG00000001896) C2orf76 (ENSMLEG00000039378) STEAP3 (ENSMLEG00000037794) C1QL2 (ENSMLEG00000033421) MARCO (ENSMLEG00000034132) ENSMLEG00000035636 INSIG2 (ENSMLEG00000031649) CCDC93 (ENSMLEG00000029873) ENSMLEG00000035866 DDX18 (ENSMLEG00000038065) Sooty mangabey MODERN SPECIES 129 ENSCATG00000032734 TSN (ENSCATG00000032155) NIFK (ENSCATG00000015239) ENSCATG00000043436 ENSCATG00000043420 CLASP1 (ENSCATG00000039063) TFCP2L1 (ENSCATG00000044361) GLI2 (ENSCATG00000034671) INHBB (ENSCATG00000010576) ENSCATG00000006617 RALB (ENSCATG00000039216) ENSCATG00000036400 EPB41L5 (ENSCATG00000040081) ENSCATG00000035581 ##22 PTPN4 (ENSCATG00000030920) ENSCATG00000012333 ENSCATG00000014934 CFAP221 (ENSCATG00000020702) ENSCATG00000032201 SCTR (ENSCATG00000035610) TMEM37 (ENSCATG00000029551) ENSCATG00000041961 C2orf76 (ENSCATG00000031880) STEAP3 (ENSCATG00000039809) C1QL2 (ENSCATG00000041576) MARCO (ENSCATG00000008042) EN1 (ENSCATG00000040038) INSIG2 (ENSCATG00000040525) CCDC93 (ENSCATG00000041614) Olive baboon MODERN SPECIES 5 ENSPANG00000039323 C2orf74 (ENSPANG00000035894) ENSPANG00000016913 USP34 (ENSPANG00000025375) XPO1 (ENSPANG00000006892) FAM161A (ENSPANG00000010259) CCT4 (ENSPANG00000019105) COMMD1 (ENSPANG00000006093) B3GNT2 (ENSPANG00000007808) ENSPANG00000051251 TMEM17 (ENSPANG00000042367) EHBP1 (ENSPANG00000016912) OTX1 (ENSPANG00000038245) WDPCP (ENSPANG00000019775) ENSPANG00000044221 ENSPANG00000006332 ##22 MDH1 (ENSPANG00000014437) UGP2 (ENSPANG00000020689) VPS54 (ENSPANG00000022299) PELI1 (ENSPANG00000008630) LGALSL (ENSPANG00000007113) AFTPH (ENSPANG00000019355) ENSPANG00000033862 SERTAD2 (ENSPANG00000021214) SLC1A4 (ENSPANG00000025917) CEP68 (ENSPANG00000009710) RAB1A (ENSPANG00000010485) ACTR2 (ENSPANG00000007073) SPRED2 (ENSPANG00000015698) ENSPANG00000049032 MEIS1 (ENSPANG00000008059) Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.a ##22 Bushbaby MODERN SPECIES 154 PKD2 (ENSOGAG00000011193) SPP1 (ENSOGAG00000011188) MEPE (ENSOGAG00000011187) IBSP (ENSOGAG00000011181) DMP1 (ENSOGAG00000032756) DSPP (ENSOGAG00000030776) SPARCL1 (ENSOGAG00000009645) NUDT9 (ENSOGAG00000009642) HSD17B11 (ENSOGAG00000009636) HSD17B13 (ENSOGAG00000009634) KLHL8 (ENSOGAG00000009630) ENSOGAG00000031299 ENSOGAG00000009622 SLC10A6 (ENSOGAG00000004425) ENSOGAG00000030382 ENSOGAG00000027610 ##22 MAPK10 (ENSOGAG00000014897) ARHGAP24 (ENSOGAG00000014895) ENSOGAG00000015396 CDS1 (ENSOGAG00000032846) NKX6-1 (ENSOGAG00000000028) GPAT3 (ENSOGAG00000003516) ABRAXAS1 (ENSOGAG00000014197) HELQ (ENSOGAG00000014188) HPSE (ENSOGAG00000017234) COQ2 (ENSOGAG00000002235) ENSOGAG00000032382 PLAC8 (ENSOGAG00000017232) COPS4 (ENSOGAG00000027198) LIN54 (ENSOGAG00000002512) THAP9 (ENSOGAG00000002510) Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000158025.a.a.b ENSGT00940000157022 #10 ENSGT00940000172381 ENSGT00940000158558 #11 ENSGT00940000158702 ENSGT00950000183139.C #12 ENSGT00510000047513 #13 ENSGT00950000182849.B.c.a #14 ENSGT00940000158204.b #15 ENSGT00390000014178 #16 ENSGT00950000182935.B.b.d ENSGT00390000001979 #18 ENSGT00940000158812 #19 ENSGT00940000157651 #20 ENSGT00530000063647.A.a #21 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b ##22 ENSGT00390000006348 #23 ENSGT00940000153095.g.a.b ##22 ENSGT00390000017606.a.b #24 ENSGT00510000047678 #25 ENSGT00940000154768.B #26 ENSGT00390000001723 #27 ENSGT00940000160452 #28 ENSGT00940000159176 #29 ENSGT00940000160824 #30 ENSGT00950000183193.A.c.b #31 ENSGT01030000234629.E.a.b #32 ENSGT00530000063937.b #33 ENSGT00390000008964 #34 ENSGT00940000161283 #35 ENSGT00940000153496.a.a #36 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000014795 #9 ENSGT00940000158025.a.a.b ENSGT00940000157022 #10 ENSGT00940000158558 #11 ENSGT00940000158702 ENSGT00950000183139.C #12 ENSGT00510000047513 #13 ENSGT00950000182849.B.c.a #14 ENSGT00940000158204.b #15 ENSGT00390000014178 #16 ENSGT00950000182935.B.b.d ENSGT00390000001979 #18 ENSGT00940000158812 #19 ENSGT00940000157651 #20 ENSGT00530000063647.A.a #21 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b ##22 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.a #22 ENSGT00390000006348 #23 ENSGT00390000017606.a.b #24 ENSGT00510000047678 #25 ENSGT00940000154768.B #26 ENSGT00390000001723 #27 ENSGT00940000160452 #28 ENSGT00940000159176 #29 ENSGT00940000160824 #30 ENSGT00950000183193.A.c.b #31 ENSGT01030000234629.E.a.b #32 ENSGT00530000063937.b #33 ENSGT00390000008964 #34 ENSGT00940000161283 #35 ENSGT00940000153496.a.a #36 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000014795 #9 ENSGT00940000158025.a.a.b ENSGT00940000157022 #10 ENSGT00940000158558 #11 ENSGT00940000158702 ENSGT00950000183139.C #12 ENSGT00510000047513 #13 ENSGT00950000182849.B.c.a #14 ENSGT00940000158204.b #15 ENSGT00390000014178 #16 ENSGT00950000182935.B.b.d ENSGT00390000001979 #18 ENSGT00940000158812 #19 ENSGT00940000157651 #20 ENSGT00530000063647.A.a #21 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b ##22 ENSGT00390000006348 #23 ENSGT00390000017606.a.b #24 ENSGT00510000047678 #25 ENSGT00940000154768.B #26 ENSGT00390000001723 #27 ENSGT00940000160452 #28 ENSGT00940000159176 #29 ENSGT00940000160824 #30 ENSGT00950000183193.A.c.b #31 ENSGT01030000234629.E.a.b #32 ENSGT00530000063937.b #33 ENSGT00390000008964 #34 ENSGT00940000161283 #35 ENSGT00940000153496.a.a #36 ENSGT00390000007652 #37 Glires ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000014795 #9 ENSGT00940000158025.a.a.b ENSGT00940000157022 #10 ENSGT00940000158558 #11 ENSGT00940000158702 ENSGT00950000183139.C #12 ENSGT00510000047513 #13 ENSGT00950000182849.B.c.a #14 ENSGT00940000158204.b #15 ENSGT00390000014178 #16 ENSGT00950000182935.B.b.d ENSGT00390000001979 #18 ENSGT00940000158812 #19 ENSGT00940000157651 #20 ENSGT00530000063647.A.a #21 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b ##22 ENSGT00390000006348 #23 ENSGT00390000017606.a.b #24 ENSGT00510000047678 #25 ENSGT00940000154768.B #26 ENSGT00390000001723 #27 ENSGT00940000160452 #28 ENSGT00940000159176 #29 ENSGT00940000160824 #30 ENSGT00950000183193.A.c.b #31 ENSGT01030000234629.E.a.b #32 ENSGT00530000063937.b #33 ENSGT00390000008964 #34 ENSGT00940000161283 #35 ENSGT00940000153496.a.a #36 ENSGT00390000007652 #37 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b ##22 Rabbit MODERN SPECIES 1 ENSOCUG00000006182 ASNS (ENSOCUG00000022945) ENSOCUG00000026002 COL28A1 (ENSOCUG00000024805) ENSOCUG00000000464 MIOS (ENSOCUG00000000466) RPA3 (ENSOCUG00000000467) ENSOCUG00000034765 UMAD1 (ENSOCUG00000035573) ENSOCUG00000016806 ICA1 (ENSOCUG00000016815) ENSOCUG00000027084 NXPH1 (ENSOCUG00000012983) ENSOCUG00000035586 ENSOCUG00000030563 ENSOCUG00000009140 ##22 ENSOCUG00000029372 PHF14 (ENSOCUG00000004678) ENSOCUG00000034975 ENSOCUG00000031107 THSD7A (ENSOCUG00000008865) TMEM106B (ENSOCUG00000010288) ENSOCUG00000029201 ENSOCUG00000033293 ENSOCUG00000029493 SCIN (ENSOCUG00000006986) ENSOCUG00000008172 BLVRA (ENSOCUG00000006916) STK17A (ENSOCUG00000015953) HECW1 (ENSOCUG00000007994) ENSOCUG00000012098 Rodentia DUPLICATION Rodentia DUPLICATION Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b.a.a ##22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b.a.a ##22 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b.a.a ##22 Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b.a.a ##22 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b.a.a ##22 Squirrel MODERN SPECIES 409 TEX28 (ENSSTOG00000022078) ENSSTOG00000024701 MECP2 (ENSSTOG00000006094) IRAK1 (ENSSTOG00000007991) HCFC1 (ENSSTOG00000029220) RENBP (ENSSTOG00000010247) NAA10 (ENSSTOG00000010237) ARHGAP4 (ENSSTOG00000022503) AVPR2 (ENSSTOG00000008352) L1CAM (ENSSTOG00000008316) PDZD4 (ENSSTOG00000021423) SSR4 (ENSSTOG00000008278) IDH3G (ENSSTOG00000008261) SRPK3 (ENSSTOG00000008233) PLXNB3 (ENSSTOG00000008197) ENSSTOG00000008188 ##22 ABCD1 (ENSSTOG00000008153) BCAP31 (ENSSTOG00000008138) ENSSTOG00000026886 PNCK (ENSSTOG00000008119) DUSP9 (ENSSTOG00000008115) CCNQ (ENSSTOG00000008103) ATP2B3 (ENSSTOG00000008068) BGN (ENSSTOG00000008058) HAUS7 (ENSSTOG00000022988) TREX2 (ENSSTOG00000027213) ZFP92 (ENSSTOG00000009126) ENSSTOG00000029369 ENSSTOG00000033034 ZNF275 (ENSSTOG00000022633) ENSSTOG00000032558 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b.a.a ##22 Kangaroo rat MODERN SPECIES 333 Bricd5 (ENSDORG00000001747) #8 ENSDORG00000023869 #9 Caskin1 (ENSDORG00000001740) Traf7 (ENSDORG00000001727) #10 Rab26 (ENSDORG00000001722) #11 Pkd1 (ENSDORG00000013708) Tsc2 (ENSDORG00000013702) #12 Nthl1 (ENSDORG00000013701) #13 Nherf2 (ENSDORG00000013700) #14 Zfp598 (ENSDORG00000007907) #16 Syngr3 (ENSDORG00000024759) Gfer (ENSDORG00000025553) #18 Noxo1 (ENSDORG00000007379) #19 Tbl3 (ENSDORG00000007377) #20 ENSDORG00000007376 #21 ENSDORG00000007375 ##22 Ndufb10 (ENSDORG00000007374) #23 Rpl3l (ENSDORG00000007373) #24 Msrb1 (ENSDORG00000025189) #25 Hs3st6 (ENSDORG00000023206) #26 Meiob (ENSDORG00000012742) #27 Hagh (ENSDORG00000009673) #29 Igfals (ENSDORG00000009672) #30 Nubp2 (ENSDORG00000009670) #31 Spsb3 (ENSDORG00000009668) #32 ENSDORG00000027160 #33 ENSDORG00000009659 #36 ENSDORG00000026402 #36 Jpt2 (ENSDORG00000025742) #37 Cramp1 (ENSDORG00000013715) Ift140 (ENSDORG00000004166) Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b.a.a ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b.a.a ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b.a.a ##22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b.a.a ##22 Rat MODERN SPECIES 19 Tcte1 (ENSRNOG00000065569) Tmem151b (ENSRNOG00000019961) Slc35b2 (ENSRNOG00000019900) Nfkbie (ENSRNOG00000019907) Hsp90ab1 (ENSRNOG00000019834) Slc29a1 (ENSRNOG00000019752) Mymx (ENSRNOG00000042497) Capn11 (ENSRNOG00000026025) Tmem63b (ENSRNOG00000019743) Mrpl14 (ENSRNOG00000019734) Aars2 (ENSRNOG00000025808) Vegfa (ENSRNOG00000019598) Mrps18a (ENSRNOG00000019511) Rsph9 (ENSRNOG00000019474) Mad2l1bp (ENSRNOG00000019463) Rps2-ps6 (ENSRNOG00000022934) ##22 Gtpbp2 (ENSRNOG00000019332) Polh (ENSRNOG00000019195) Xpo5 (ENSRNOG00000019085) Polr1c (ENSRNOG00000019079) Yipf3 (ENSRNOG00000018998) Lrrc73 (ENSRNOG00000039856) Tjap1 (ENSRNOG00000018980) Dlk2 (ENSRNOG00000018949) Abcc10 (ENSRNOG00000018863) Zfp318 (ENSRNOG00000018741) Crip3 (ENSRNOG00000018613) Slc22a7 (ENSRNOG00000018420) Ttbk1 (ENSRNOG00000018416) Dnph1 (ENSRNOG00000018397) Cul9 (ENSRNOG00000018372) Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b.a.a ##22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b.a.a ##22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b.a.a ##22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b.a.a ##22 Steppe mouse MODERN SPECIES 3428 Sh3pxd2a (ENSMSIG00000031465) Stn1 (ENSMSIG00000031463) Slk (ENSMSIG00000031453) Col17a1 (ENSMSIG00000031440) Sfr1 (ENSMSIG00000031436) Cfap43 (ENSMSIG00000031434) Gsto1 (ENSMSIG00000031433) Gsto2 (ENSMSIG00000031431) Itprip (ENSMSIG00000031430) Cfap58 (ENSMSIG00000031428) Sorcs3 (ENSMSIG00000031425) ENSMSIG00000031421 Sorcs1 (ENSMSIG00000031372) Ins1 (ENSMSIG00000031363) Xpnpep1 (ENSMSIG00000031347) ENSMSIG00000031344 ##22 Add3 (ENSMSIG00000031321) ENSMSIG00000031317 Mxi1 (ENSMSIG00000031315) Smndc1 (ENSMSIG00000031313) ENSMSIG00000031310 Smc3 (ENSMSIG00000031304) ENSMSIG00000031302 Rbm20 (ENSMSIG00000031299) Pdcd4 (ENSMSIG00000031298) Bbip1 (ENSMSIG00000031297) Shoc2 (ENSMSIG00000031294) Adra2a (ENSMSIG00000031292) Gpam (ENSMSIG00000031285) ENSMSIG00000031283 Tectb (ENSMSIG00000031277) Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b.a.a ##22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b.a.a ##22 Prairie vole DUPLICATION Prairie vole MODERN SPECIES 4 ENSMOCG00000011275 Gpr18 (ENSMOCG00000020200) Gpr183 (ENSMOCG00000009630) Timm8a2 (ENSMOCG00000009723) Tm9sf2 (ENSMOCG00000014829) Clybl (ENSMOCG00000019786) ENSMOCG00000002020 Zic5 (ENSMOCG00000003890) Zic2 (ENSMOCG00000005659) Pcca (ENSMOCG00000015156) Ggact (ENSMOCG00000014337) Tmtc4 (ENSMOCG00000020795) Nalcn (ENSMOCG00000000639) Itgbl1 (ENSMOCG00000018260) Fgf14 (ENSMOCG00000020489) ENSMOCG00000009968 ##22 Prairie vole MODERN SPECIES 7 Paxbp1 (ENSMOCG00000010187) ENSMOCG00000002691 Usp25 (ENSMOCG00000011288) Nrip1 (ENSMOCG00000006385) Samsn1 (ENSMOCG00000008536) Hspa13 (ENSMOCG00000019276) Rbm11 (ENSMOCG00000004302) Lipi (ENSMOCG00000021917) Robo2 (ENSMOCG00000016777) ENSMOCG00000021594 Robo1 (ENSMOCG00000012004) ENSMOCG00000002617 Gbe1 (ENSMOCG00000014132) ENSMOCG00000002638 Cadm2 (ENSMOCG00000005664) ENSMOCG00000001418 ##22 Vgll3 (ENSMOCG00000002854) Chmp2b (ENSMOCG00000017221) Pou1f1 (ENSMOCG00000021592) Htr1f (ENSMOCG00000001706) Cggbp1 (ENSMOCG00000008622) Zfp654 (ENSMOCG00000015545) 4930453N24Rik (ENSMOCG00000017673) ENSMOCG00000020136 Csnka2ip (ENSMOCG00000021636) Epha3 (ENSMOCG00000001171) Pros1 (ENSMOCG00000007118) Arl13b (ENSMOCG00000015922) Stx19 (ENSMOCG00000016404) Nsun3 (ENSMOCG00000017349) Epha6 (ENSMOCG00000002313) Rodentia ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000014795 #9 ENSGT00940000158025.a.a.b ENSGT00940000157022 #10 ENSGT00940000158558 #11 ENSGT00940000158702 ENSGT00950000183139.C #12 ENSGT00510000047513 #13 ENSGT00950000182849.B.c.a #14 ENSGT00940000158204.b #15 ENSGT00390000014178 #16 ENSGT00950000182935.B.b.d ENSGT00390000001979 #18 ENSGT00940000158812 #19 ENSGT00940000157651 #20 ENSGT00530000063647.A.a #21 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00390000006348 #23 ENSGT00390000017606.a.b #24 ENSGT00510000047678 #25 ENSGT00940000154768.B #26 ENSGT00390000001723 #27 ENSGT00940000160452 #28 ENSGT00940000159176 #29 ENSGT00940000160824 #30 ENSGT00950000183193.A.c.b #31 ENSGT01030000234629.E.a.b #32 ENSGT00530000063937.b #33 ENSGT00390000008964 #34 ENSGT00940000161283 #35 ENSGT00940000153496.a.a #36 ENSGT00390000007652 #37 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000014795 #9 ENSGT00940000158025.a.a.b ENSGT00940000157022 #10 ENSGT00940000158558 #11 ENSGT00940000158702 ENSGT00950000183139.C #12 ENSGT00510000047513 #13 ENSGT00950000182849.B.c.a #14 ENSGT00940000158204.b #15 ENSGT00390000014178 #16 ENSGT00950000182935.B.b.d ENSGT00390000001979 #18 ENSGT00940000158812 #19 ENSGT00940000157651 #20 ENSGT00530000063647.A.a #21 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00390000006348 #23 ENSGT00390000017606.a.b #24 ENSGT00510000047678 #25 ENSGT00940000154768.B #26 ENSGT00390000001723 #27 ENSGT00940000160452 #28 ENSGT00940000159176 #29 ENSGT00940000160824 #30 ENSGT00950000183193.A.c.b #31 ENSGT01030000234629.E.a.b #32 ENSGT00530000063937.b #33 ENSGT00390000008964 #34 ENSGT00940000161283 #35 ENSGT00940000153496.a.a #36 ENSGT00390000007652 #37 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000014795 #9 ENSGT00940000158025.a.a.b ENSGT00940000157022 #10 ENSGT00940000158558 #11 ENSGT00940000158702 ENSGT00950000183139.C #12 ENSGT00510000047513 #13 ENSGT00950000182849.B.c.a #14 ENSGT00940000158204.b #15 ENSGT00390000014178 #16 ENSGT00950000182935.B.b.d ENSGT00390000001979 #18 ENSGT00940000158812 #19 ENSGT00940000157651 #20 ENSGT00530000063647.A.a #21 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00390000006348 #23 ENSGT00390000017606.a.b #24 ENSGT00510000047678 #25 ENSGT00940000154768.B #26 ENSGT00390000001723 #27 ENSGT00940000160452 #28 ENSGT00940000159176 #29 ENSGT00940000160824 #30 ENSGT00950000183193.A.c.b #31 ENSGT01030000234629.E.a.b #32 ENSGT00530000063937.b #33 ENSGT00390000008964 #34 ENSGT00940000161283 #35 ENSGT00940000153496.a.a #36 ENSGT00390000007652 #37 Muroidea ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000014795 #9 ENSGT00940000158025.a.a.b ENSGT00940000157022 #10 ENSGT00940000158558 #11 ENSGT00940000158702 ENSGT00950000183139.C #12 ENSGT00510000047513 #13 ENSGT00950000182849.B.c.a #14 ENSGT00940000158204.b #15 ENSGT00390000014178 #16 ENSGT00950000182935.B.b.d ENSGT00390000001979 #18 ENSGT00940000158812 #19 ENSGT00940000157651 #20 ENSGT00530000063647.A.a #21 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00390000006348 #23 ENSGT00390000017606.a.b #24 ENSGT00510000047678 #25 ENSGT00940000154768.B #26 ENSGT00390000001723 #27 ENSGT00940000160452 #28 ENSGT00940000159176 #29 ENSGT00940000160824 #30 ENSGT00950000183193.A.c.b #31 ENSGT01030000234629.E.a.b #32 ENSGT00530000063937.b #33 ENSGT00390000008964 #34 ENSGT00940000161283 #35 ENSGT00940000153496.a.a #36 ENSGT00390000007652 #37 Muroidea_A DUPLICATION Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b.a.b.a ##22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b.a.b.a ##22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b.a.b.a ##22 Prairie vole MODERN SPECIES 15 Mlst8 (ENSMOCG00000022227) #9 Caskin1 (ENSMOCG00000020610) Traf7 (ENSMOCG00000017636) #10 Rab26 (ENSMOCG00000014524) #11 Pkd1 (ENSMOCG00000018861) Tsc2 (ENSMOCG00000014270) #12 Nthl1 (ENSMOCG00000022584) #13 Nherf2 (ENSMOCG00000022945) #14 Npw (ENSMOCG00000007567) #15 Zfp598 (ENSMOCG00000015693) #16 Syngr3 (ENSMOCG00000010060) Gfer (ENSMOCG00000003379) #18 Noxo1 (ENSMOCG00000022179) #19 Tbl3 (ENSMOCG00000019634) #20 Rnf151 (ENSMOCG00000021816) #21 ENSMOCG00000014200 ##22 Ndufb10 (ENSMOCG00000011750) #23 Rpl3l (ENSMOCG00000020012) #24 Msrb1 (ENSMOCG00000013864) #25 Hs3st6 (ENSMOCG00000022877) #26 Meiob (ENSMOCG00000020796) #27 Fahd1 (ENSMOCG00000001032) #28 Hagh (ENSMOCG00000020674) #29 Igfals (ENSMOCG00000013702) #30 Nubp2 (ENSMOCG00000003091) #31 Spsb3 (ENSMOCG00000000734) #32 Eme2 (ENSMOCG00000019621) #33 Mrps34 (ENSMOCG00000004274) #34 ENSMOCG00000003271 #35 Mapk8ip3 (ENSMOCG00000018334) #36 Jpt2 (ENSMOCG00000022903) #37 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b.a.b.a ##22 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b.a.b.a ##22 Shrew mouse MODERN SPECIES 13 Mlst8 (MGP_PahariEiJ_G0023503) #9 MGP_PahariEiJ_G0023504 #8 Caskin1 (MGP_PahariEiJ_G0023505) Traf7 (MGP_PahariEiJ_G0023506) #10 Rab26 (MGP_PahariEiJ_G0023507) #11 Pkd1 (MGP_PahariEiJ_G0023508) Nthl1 (MGP_PahariEiJ_G0023509) #13 Nherf2 (MGP_PahariEiJ_G0023510) #14 Npw (MGP_PahariEiJ_G0023511) #15 Zfp598 (MGP_PahariEiJ_G0023512) #16 Syngr3 (MGP_PahariEiJ_G0023513) Gfer (MGP_PahariEiJ_G0023514) #18 Noxo1 (MGP_PahariEiJ_G0023515) #19 Tbl3 (MGP_PahariEiJ_G0023516) #20 Rnf151 (MGP_PahariEiJ_G0023517) #21 MGP_PahariEiJ_G0023518 ##22 Ndufb10 (MGP_PahariEiJ_G0023519) #23 Rpl3l (MGP_PahariEiJ_G0023520) #24 Msrb1 (MGP_PahariEiJ_G0023521) #25 Hs3st6 (MGP_PahariEiJ_G0023522) #26 Meiob (MGP_PahariEiJ_G0023523) #27 Hagh (MGP_PahariEiJ_G0023524) #29 Fahd1 (MGP_PahariEiJ_G0023525) #28 Igfals (MGP_PahariEiJ_G0023526) #30 Nubp2 (MGP_PahariEiJ_G0023527) #31 MGP_PahariEiJ_G0023528 #32 Eme2 (MGP_PahariEiJ_G0023529) #33 Mapk8ip3 (MGP_PahariEiJ_G0023530) #36 Mrps34 (MGP_PahariEiJ_G0023531) #34 Nme3 (MGP_PahariEiJ_G0023532) #35 MGP_PahariEiJ_G0023533 #37 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000014795 #9 ENSGT00940000158025.a.a.b ENSGT00940000157022 #10 ENSGT00940000158558 #11 ENSGT00940000158702 ENSGT00950000183139.C #12 ENSGT00510000047513 #13 ENSGT00950000182849.B.c.a #14 ENSGT00940000158204.b #15 ENSGT00390000014178 #16 ENSGT00950000182935.B.b.d ENSGT00390000001979 #18 ENSGT00940000158812 #19 ENSGT00940000157651 #20 ENSGT00530000063647.A.a #21 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b.a.b.b ##22 ENSGT00390000006348 #23 ENSGT00390000017606.a.b #24 ENSGT00510000047678 #25 ENSGT00940000154768.B #26 ENSGT00390000001723 #27 ENSGT00940000160452 #28 ENSGT00940000159176 #29 ENSGT00940000160824 #30 ENSGT00950000183193.A.c.b #31 ENSGT01030000234629.E.a.b #32 ENSGT00530000063937.b #33 ENSGT00390000008964 #34 ENSGT00940000161283 #35 ENSGT00940000153496.a.a #36 ENSGT00390000007652 #37 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000014795 #9 ENSGT00940000158025.a.a.b ENSGT00940000157022 #10 ENSGT00940000158558 #11 ENSGT00940000158702 ENSGT00950000183139.C #12 ENSGT00510000047513 #13 ENSGT00950000182849.B.c.a #14 ENSGT00940000158204.b #15 ENSGT00390000014178 #16 ENSGT00950000182935.B.b.d ENSGT00390000001979 #18 ENSGT00940000158812 #19 ENSGT00940000157651 #20 ENSGT00530000063647.A.a #21 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b.a.b.b ##22 ENSGT00390000006348 #23 ENSGT00390000017606.a.b #24 ENSGT00510000047678 #25 ENSGT00940000154768.B #26 ENSGT00390000001723 #27 ENSGT00940000160452 #28 ENSGT00940000159176 #29 ENSGT00940000160824 #30 ENSGT00950000183193.A.c.b #31 ENSGT01030000234629.E.a.b #32 ENSGT00530000063937.b #33 ENSGT00390000008964 #34 ENSGT00940000161283 #35 ENSGT00940000153496.a.a #36 ENSGT00390000007652 #37 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000014795 #9 ENSGT00940000158025.a.a.b ENSGT00940000157022 #10 ENSGT00940000158558 #11 ENSGT00940000158702 ENSGT00950000183139.C #12 ENSGT00510000047513 #13 ENSGT00950000182849.B.c.a #14 ENSGT00940000158204.b #15 ENSGT00390000014178 #16 ENSGT00950000182935.B.b.d ENSGT00390000001979 #18 ENSGT00940000158812 #19 ENSGT00940000157651 #20 ENSGT00530000063647.A.a #21 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b.a.b.b ##22 ENSGT00390000006348 #23 ENSGT00390000017606.a.b #24 ENSGT00510000047678 #25 ENSGT00940000154768.B #26 ENSGT00390000001723 #27 ENSGT00940000160452 #28 ENSGT00940000159176 #29 ENSGT00940000160824 #30 ENSGT00950000183193.A.c.b #31 ENSGT01030000234629.E.a.b #32 ENSGT00530000063937.b #33 ENSGT00390000008964 #34 ENSGT00940000161283 #35 ENSGT00940000153496.a.a #36 ENSGT00390000007652 #37 Prairie vole MODERN SPECIES 9 Prcp (ENSMOCG00000012404) ENSMOCG00000009821 Pcf11 (ENSMOCG00000001560) Ankrd42 (ENSMOCG00000000292) Ccdc90b (ENSMOCG00000020349) ENSMOCG00000020913 ENSMOCG00000019058 Ccdc89 (ENSMOCG00000008424) ENSMOCG00000014020 Picalm (ENSMOCG00000010921) Eed (ENSMOCG00000000447) ENSMOCG00000019586 Ccdc81 (ENSMOCG00000007045) Me3 (ENSMOCG00000005796) Prss23 (ENSMOCG00000022033) ENSMOCG00000007773 ##22 Tenm4 (ENSMOCG00000007967) Nars2 (ENSMOCG00000004938) Gab2 (ENSMOCG00000016973) Usp35 (ENSMOCG00000015178) Kctd21 (ENSMOCG00000009332) Alg8 (ENSMOCG00000018035) Ndufc2 (ENSMOCG00000014768) Thrsp (ENSMOCG00000014398) Ints4 (ENSMOCG00000015641) Aamdc (ENSMOCG00000013242) Rsf1 (ENSMOCG00000018606) ENSMOCG00000015937 Aqp11 (ENSMOCG00000015165) Pak1 (ENSMOCG00000012909) Gdpd4 (ENSMOCG00000019089) Northern American deer mouse MODERN SPECIES 21 Caskin1 (ENSPEMG00000010610) Traf7 (ENSPEMG00000018136) #10 Rab26 (ENSPEMG00000016748) #11 ENSPEMG00000027366 ENSPEMG00000026802 Tsc2 (ENSPEMG00000017951) #12 Nthl1 (ENSPEMG00000015321) #13 Nherf2 (ENSPEMG00000008746) #14 Npw (ENSPEMG00000013065) #15 Zfp598 (ENSPEMG00000013518) #16 Syngr3 (ENSPEMG00000025114) Gfer (ENSPEMG00000024300) #18 Noxo1 (ENSPEMG00000018859) #19 Tbl3 (ENSPEMG00000009768) #20 Rnf151 (ENSPEMG00000010081) #21 ENSPEMG00000012503 ##22 Ndufb10 (ENSPEMG00000018512) #23 Rpl3l (ENSPEMG00000010667) #24 Msrb1 (ENSPEMG00000018902) #25 Hs3st6 (ENSPEMG00000016998) #26 ENSPEMG00000025436 #27 Spdl1 (ENSPEMG00000009912) Dock2 (ENSPEMG00000015007) Insyn2b (ENSPEMG00000015788) Foxi1 (ENSPEMG00000015123) 4930469K13Rik (ENSPEMG00000029094) Lcp2 (ENSPEMG00000011935) Kcnmb1 (ENSPEMG00000025688) Kcnip1 (ENSPEMG00000007681) Gabrp (ENSPEMG00000008255) Ranbp17 (ENSPEMG00000013086) Murinae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000014795 #9 ENSGT00940000158025.a.a.b ENSGT00940000157022 #10 ENSGT00940000158558 #11 ENSGT00940000158702 ENSGT00950000183139.C #12 ENSGT00510000047513 #13 ENSGT00950000182849.B.c.a #14 ENSGT00940000158204.b #15 ENSGT00390000014178 #16 ENSGT00950000182935.B.b.d ENSGT00390000001979 #18 ENSGT00940000158812 #19 ENSGT00940000157651 #20 ENSGT00530000063647.A.a #21 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b.a.b.b ##22 ENSGT00940000153095.g.a.b ##22 ENSGT00390000006348 #23 ENSGT00390000017606.a.b #24 ENSGT00510000047678 #25 ENSGT00940000154768.B #26 ENSGT00390000001723 #27 ENSGT00940000160452 #28 ENSGT00940000159176 #29 ENSGT00940000160824 #30 ENSGT00950000183193.A.c.b #31 ENSGT01030000234629.E.a.b #32 ENSGT00530000063937.b #33 ENSGT00390000008964 #34 ENSGT00940000161283 #35 ENSGT00940000153496.a.a #36 Rat MODERN SPECIES 1 Mlst8 (ENSRNOG00000009667) #9 Caskin1 (ENSRNOG00000003195) Traf7 (ENSRNOG00000003131) #10 Rab26 (ENSRNOG00000042086) #11 Pkd1 (ENSRNOG00000010771) Tsc2 (ENSRNOG00000011375) #12 Nthl1 (ENSRNOG00000012213) #13 Nherf2 (ENSRNOG00000002997) #14 Npw (ENSRNOG00000012390) #15 Zfp598 (ENSRNOG00000012434) #16 Syngr3 (ENSRNOG00000012620) Gfer (ENSRNOG00000013370) #18 Noxo1 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ENSGT00940000153496.a.a #36 ENSGT00390000007652 #37 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000014795.d #9 ENSGT00940000158025.a.a.b ENSGT00940000157022.h #10 ENSGT00940000158558 #11 ENSGT00940000158702 ENSGT00950000183139.C #12 ENSGT00510000047513 #13 ENSGT00950000182849.B.c.a #14 ENSGT00940000158204.b #15 ENSGT00390000014178 #16 ENSGT00950000182935.B.b.d ENSGT00390000001979 #18 ENSGT00940000158812 #19 ENSGT00940000157651 #20 ENSGT00530000063647.A.a #21 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00390000006348 #23 ENSGT00390000017606.a.b #24 ENSGT00510000047678 #25 ENSGT00940000154768.B #26 ENSGT00390000001723 #27 ENSGT00940000160452 #28 ENSGT00940000159176 #29 ENSGT00940000160824 #30 ENSGT00950000183193.A.c.b #31 ENSGT01030000234629.E.a.b #32 ENSGT00530000063937.b #33 ENSGT00390000008964 #34 ENSGT00940000161283 #35 ENSGT00940000153496.a.a #36 ENSGT00390000007652 #37 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 37 BRICD5 (ENSUPAG00010017707) #8 MLST8 (ENSUPAG00010017694) #9 ENSUPAG00010017594 #10 RAB26 (ENSUPAG00010017565) #11 ENSUPAG00010017562 TSC2 (ENSUPAG00010017065) #12 NTHL1 (ENSUPAG00010017055) #13 NHERF2 (ENSUPAG00010017024) #14 ENSUPAG00010017018 #15 ZNF598 (ENSUPAG00010016990) #16 SYNGR3 (ENSUPAG00010016982) GFER (ENSUPAG00010016968) #18 NOXO1 (ENSUPAG00010016951) #19 TBL3 (ENSUPAG00010016941) #20 RNF151 (ENSUPAG00010016927) #21 RPS2 (ENSUPAG00010016573) ##22 NDUFB10 (ENSUPAG00010016562) #23 RPL3L (ENSUPAG00010016544) #24 MSRB1 (ENSUPAG00010016532) #25 HS3ST6 (ENSUPAG00010016522) #26 ENSUPAG00010016481 #27 FAHD1 (ENSUPAG00010016476) #28 HAGH (ENSUPAG00010016451) #29 ENSUPAG00010016447 #30 NUBP2 (ENSUPAG00010016409) #31 SPSB3 (ENSUPAG00010016383) #32 EME2 (ENSUPAG00010016365) #33 ENSUPAG00010016348 #34 NME3 (ENSUPAG00010016324) #35 MAPK8IP3 (ENSUPAG00010015185) #36 JPT2 (ENSUPAG00010015162) #37 Squirrel MODERN SPECIES 294 BRICD5 (ENSSTOG00000013137) #8 CASKIN1 (ENSSTOG00000027782) ENSSTOG00000013083 #10 RAB26 (ENSSTOG00000013081) #11 PKD1 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ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b.b ##22 Guinea pig MODERN SPECIES 8 GRK7 (ENSCPOG00000013262) ENSCPOG00000003739 TFDP2 (ENSCPOG00000013203) GK5 (ENSCPOG00000004732) ENSCPOG00000003458 ENSCPOG00000035199 ATR (ENSCPOG00000007001) PLS1 (ENSCPOG00000003196) TRPC1 (ENSCPOG00000003198) PCOLCE2 (ENSCPOG00000009999) PAQR9 (ENSCPOG00000021386) U2SURP (ENSCPOG00000011656) CHST2 (ENSCPOG00000026369) SLC9A9 (ENSCPOG00000000663) DIPK2A (ENSCPOG00000009308) ENSCPOG00000026394 ##22 PLOD2 (ENSCPOG00000014514) PLSCR4 (ENSCPOG00000009496) ENSCPOG00000007099 ENSCPOG00000030970 ENSCPOG00000030500 ENSCPOG00000030198 PLSCR5 (ENSCPOG00000015238) ZIC4 (ENSCPOG00000010981) AGTR1 (ENSCPOG00000007610) CPB1 (ENSCPOG00000001475) CPA3 (ENSCPOG00000001479) GYG1 (ENSCPOG00000001482) HLTF (ENSCPOG00000001238) HPS3 (ENSCPOG00000013007) CP (ENSCPOG00000013015) Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b.b ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b.b ##22 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 108 ENSJJAG00000021982 ENSJJAG00000023095 ENSJJAG00000000497 Lrrc39 (ENSJJAG00000015686) Trmt13 (ENSJJAG00000018012) Sass6 (ENSJJAG00000021079) ENSJJAG00000006236 ##22 Mfsd14a (ENSJJAG00000009694) Slc35a3 (ENSJJAG00000017210) Agl (ENSJJAG00000019943) Frrs1 (ENSJJAG00000022287) Palmd (ENSJJAG00000014018) ENSJJAG00000014146 Plppr4 (ENSJJAG00000018478) Plppr5 (ENSJJAG00000019001) Snx7 (ENSJJAG00000020217) ENSJJAG00000021559 ENSJJAG00000021970 Dpyd (ENSJJAG00000023195) Ptbp2 (ENSJJAG00000023985) ENSJJAG00000011561 Tlcd4 (ENSJJAG00000012418) Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b.b ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b.b ##22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b.b ##22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000014795 #9 ENSGT00940000158025.a.a.b ENSGT00940000157022 #10 ENSGT00940000158558 #11 ENSGT00940000158702 ENSGT00950000183139.C #12 ENSGT00510000047513 #13 ENSGT00950000182849.B.c.a #14 ENSGT00940000158204.b #15 ENSGT00390000014178 #16 ENSGT00950000182935.B.b.d ENSGT00390000001979 #18 ENSGT00940000158812 #19 ENSGT00940000157651 #20 ENSGT00530000063647.A.a #21 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b.b ##22 ENSGT00390000006348 #23 ENSGT00390000017606.a.b #24 ENSGT00510000047678 #25 ENSGT00940000154768.B #26 ENSGT00390000001723 #27 ENSGT00940000160452 #28 ENSGT00940000159176 #29 ENSGT00940000160824 #30 ENSGT00950000183193.A.c.b #31 ENSGT01030000234629.E.a.b #32 ENSGT00530000063937.b #33 ENSGT00390000008964 #34 ENSGT00940000161283 #35 ENSGT00940000153496.a.a #36 ENSGT00390000007652 #37 Chinese hamster chok1gshd DUPLICATION Chinese hamster chok1gshd DUPLICATION Chinese hamster chok1gshd DUPLICATION Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 16 Gm4779 (ENSCGRG00001010077) 8030474K03Rik (ENSCGRG00001022034) Ogt (ENSCGRG00001011594) ENSCGRG00001014167 Cxcr3 (ENSCGRG00001013701) ENSCGRG00001012656 ##22 Rtl5 (ENSCGRG00001010452) Nhsl2 (ENSCGRG00001018292) Pin4 (ENSCGRG00001023057) Ercc6l (ENSCGRG00001016668) Rps4x (ENSCGRG00001018159) Cited1 (ENSCGRG00001022122) Hdac8 (ENSCGRG00001022455) Phka1 (ENSCGRG00001020129) ENSCGRG00001024855 Dmrtc1a (ENSCGRG00001018624) ENSCGRG00001023387 Nap1l2 (ENSCGRG00001003632) Eif2s3y (ENSCGRG00001016219) ENSCGRG00001015812 ENSCGRG00001007129 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 101 Alg8 (ENSCGRG00001012346) Ndufc2 (ENSCGRG00001017125) Thrsp (ENSCGRG00001006063) ENSCGRG00001018658 Ints4 (ENSCGRG00001017981) ENSCGRG00001012029 Aamdc (ENSCGRG00001016432) Rsf1 (ENSCGRG00001008301) Clns1a (ENSCGRG00001015805) Aqp11 (ENSCGRG00001017793) Pak1 (ENSCGRG00001022975) Myo7a (ENSCGRG00001014824) Capn5 (ENSCGRG00001021666) B3gnt6 (ENSCGRG00001000647) Acer3 (ENSCGRG00001013571) ENSCGRG00001024060 ##22 Tsku (ENSCGRG00001012773) Gucy2d (ENSCGRG00001012034) Lrrc32 (ENSCGRG00001007026) ENSCGRG00001019331 Thap12 (ENSCGRG00001021774) Wnt11 (ENSCGRG00001022788) Uvrag (ENSCGRG00001006874) Dgat2 (ENSCGRG00001020895) Mogat2 (ENSCGRG00001004764) Map6 (ENSCGRG00001012636) Serpinh1 (ENSCGRG00001024167) Gdpd5 (ENSCGRG00001018824) Klhl35 (ENSCGRG00001005839) ENSCGRG00001013667 Arrb1 (ENSCGRG00001007148) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 335 Antxr1 (ENSCGRG00001019000) Gkn1 (ENSCGRG00001016533) ##8 Gkn2 (ENSCGRG00001016083) ##8 ENSCGRG00001015594 ##22 Gkn3 (ENSCGRG00001015053) ##8 Bmp10 (ENSCGRG00001014783) Arhgap25 (ENSCGRG00001014196) Prokr1 (ENSCGRG00001013215) Aplf (ENSCGRG00001011911) Efcc1 (ENSCGRG00001009634) Gp9 (ENSCGRG00001015172) Rab43 (ENSCGRG00001009520) Isy1 (ENSCGRG00001003415) ENSCGRG00001000923 Copg1 (ENSCGRG00001023044) Hmces (ENSCGRG00001021867) H1f10 (ENSCGRG00001016043) Rab7 (ENSCGRG00001021807) Rpn1 (ENSCGRG00001020104) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 229 Mlst8 (ENSCGRG00001012587) #9 Caskin1 (ENSCGRG00001019914) ENSCGRG00001013600 #10 Rab26 (ENSCGRG00001024291) #11 Pkd1 (ENSCGRG00001020324) Tsc2 (ENSCGRG00001012289) #12 NTHL1 (ENSCGRG00001012482) #13 Nherf2 (ENSCGRG00001015951) #14 Npw (ENSCGRG00001017678) #15 Zfp598 (ENSCGRG00001021070) #16 Syngr3 (ENSCGRG00001014491) Gfer (ENSCGRG00001023595) #18 Noxo1 (ENSCGRG00001020009) #19 Tbl3 (ENSCGRG00001021817) #20 Rnf151 (ENSCGRG00001023396) #21 Rps2 (ENSCGRG00001023670) ##22 Ndufb10 (ENSCGRG00001013121) #23 Rpl3l (ENSCGRG00001016900) #24 Msrb1 (ENSCGRG00001023043) #25 Hs3st6 (ENSCGRG00001024254) #26 Meiob (ENSCGRG00001024640) #27 Fahd1 (ENSCGRG00001013933) #28 Hagh (ENSCGRG00001014522) #29 Igfals (ENSCGRG00001023230) #30 Nubp2 (ENSCGRG00001024233) #31 Spsb3 (ENSCGRG00001017880) #32 Eme2 (ENSCGRG00001014405) #33 Mrps34 (ENSCGRG00001023318) #34 Nme3 (ENSCGRG00001024438) #35 Mapk8ip3 (ENSCGRG00001009625) #36 Jpt2 (ENSCGRG00001023398) #37 Golden Hamster MODERN SPECIES 711 ENSMAUG00000017530 ##22 Dpp10 (ENSMAUG00000002914) ENSMAUG00000014128 Slc35f5 (ENSMAUG00000011137) Gpr39 (ENSMAUG00000013127) Nckap5 (ENSMAUG00000014045) Mgat5 (ENSMAUG00000016950) Tmem163 (ENSMAUG00000012260) Acmsd (ENSMAUG00000011487) Ccnt2 (ENSMAUG00000009688) Map3k19 (ENSMAUG00000010654) ENSMAUG00000016085 Rab3gap1 (ENSMAUG00000004952) Zranb3 (ENSMAUG00000002029) R3hdm1 (ENSMAUG00000010315) Ubxn4 (ENSMAUG00000002324) Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b.b ##22 Rat DUPLICATION Rat MODERN SPECIES 19 Gm47791 (ENSRNOG00000067340) Tm4sf20 (ENSRNOG00000015460) Mff (ENSRNOG00000015428) Col4a3 (ENSRNOG00000015365) Col4a4 (ENSRNOG00000014851) Rhbdd1 (ENSRNOG00000054963) Irs1 (ENSRNOG00000014597) Nyap2 (ENSRNOG00000023765) Rnf11l2 (ENSRNOG00000048819) Dock10 (ENSRNOG00000053200) AABR07068154.1 (ENSRNOG00000027719) ENSRNOG00000068281 Cul3 (ENSRNOG00000015633) Fam124b (ENSRNOG00000054416) Serpine2 (ENSRNOG00000015461) AABR07039648.1 (ENSRNOG00000002789) ##22 Mrpl44 (ENSRNOG00000015231) Wdfy1 (ENSRNOG00000015080) Ap1s3 (ENSRNOG00000049873) Scg2 (ENSRNOG00000015055) ENSRNOG00000067739 Hdac1l (ENSRNOG00000013695) Kcne4 (ENSRNOG00000071002) Acsl3 (ENSRNOG00000014718) LOC102551819 (ENSRNOG00000063437) Mogat1 (ENSRNOG00000014692) Farsb (ENSRNOG00000014119) Sgpp2 (ENSRNOG00000069992) ENSRNOG00000064675 Pax3 (ENSRNOG00000013670) Epha4 (ENSRNOG00000013213) Rat MODERN SPECIES 19 Ppil3 (ENSRNOG00000013636) Nif3l1 (ENSRNOG00000013446) Orc2 (ENSRNOG00000012558) Hycc2 (ENSRNOG00000025079) Ndufb3 (ENSRNOG00000011825) Cflar (ENSRNOG00000012473) Casp8 (ENSRNOG00000012331) Flacc1 (ENSRNOG00000024917) Trak2 (ENSRNOG00000010881) Stradb (ENSRNOG00000010728) C2cd6 (ENSRNOG00000012637) Tmem237 (ENSRNOG00000024085) Mpp4 (ENSRNOG00000010486) LOC120094797 (ENSRNOG00000032860) Als2 (ENSRNOG00000023280) AABR07067814.1 (ENSRNOG00000032289) ##22 Cdk15 (ENSRNOG00000022899) Fzd7 (ENSRNOG00000016119) RGD1562029 (ENSRNOG00000022723) Sumo1 (ENSRNOG00000016133) Nop58 (ENSRNOG00000016486) Bmpr2 (ENSRNOG00000022196) ENSRNOG00000066953 LOC301444 (ENSRNOG00000019107) Fam117b (ENSRNOG00000022066) Ica1l (ENSRNOG00000017258) Wdr12 (ENSRNOG00000017340) Carf (ENSRNOG00000017491) Nbeal1 (ENSRNOG00000021525) Cyp20a1 (ENSRNOG00000017631) Abi2 (ENSRNOG00000017707) Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b ##22 Tarsier MODERN SPECIES 3677 ENSTSYG00000037352 ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b ##22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b ##22 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 126 ENSSBOG00000025682 L3MBTL1 (ENSSBOG00000033395) SGK2 (ENSSBOG00000007475) IFT52 (ENSSBOG00000023314) MYBL2 (ENSSBOG00000030823) GTSF1L (ENSSBOG00000033121) ENSSBOG00000024901 ENSSBOG00000012043 TOX2 (ENSSBOG00000024054) ENSSBOG00000019105 ENSSBOG00000023742 GDAP1L1 (ENSSBOG00000030352) FITM2 (ENSSBOG00000019193) HNF4A (ENSSBOG00000035054) ENSSBOG00000025294 ENSSBOG00000025754 ##22 TTPAL (ENSSBOG00000030193) SERINC3 (ENSSBOG00000033016) PKIG (ENSSBOG00000022071) ADA (ENSSBOG00000031670) CCN5 (ENSSBOG00000024221) RIMS4 (ENSSBOG00000032430) YWHAB (ENSSBOG00000024289) PABPC1L (ENSSBOG00000009532) TOMM34 (ENSSBOG00000030705) STK4 (ENSSBOG00000029255) KCNS1 (ENSSBOG00000031287) WFDC5 (ENSSBOG00000034340) WFDC12 (ENSSBOG00000024796) PI3 (ENSSBOG00000019375) ENSSBOG00000025821 Mas night monkey DUPLICATION Mas night monkey MODERN SPECIES 258 ENSANAG00000021152 ENSANAG00000018844 ##22 ENSANAG00000026060 Mas night monkey MODERN SPECIES 587 SLCO1B3 (ENSANAG00000022655) SLCO1C1 (ENSANAG00000032786) PDE3A (ENSANAG00000027732) ENSANAG00000031657 AEBP2 (ENSANAG00000031619) ENSANAG00000017339 ENSANAG00000027541 ENSANAG00000031585 ##22 ENSANAG00000022609 CAPZA3 (ENSANAG00000033265) PLCZ1 (ENSANAG00000000135) ENSANAG00000029606 PIK3C2G (ENSANAG00000033635) RERGL (ENSANAG00000027823) LMO3 (ENSANAG00000028763) MGST1 (ENSANAG00000029604) SLC15A5 (ENSANAG00000030097) DERA (ENSANAG00000016986) STRAP (ENSANAG00000024138) EPS8 (ENSANAG00000027076) PTPRO (ENSANAG00000036264) RERG (ENSANAG00000034086) PDE6H (ENSANAG00000024740) Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b ##22 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b ##22 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b ##22 Coquerels sifaka DUPLICATION Coquerels sifaka MODERN SPECIES 481 ASAP3 (ENSPCOG00000021852) TCEA3 (ENSPCOG00000001782) ZNF436 (ENSPCOG00000024806) ENSPCOG00000014665 HTR1D (ENSPCOG00000010862) LUZP1 (ENSPCOG00000020802) KDM1A (ENSPCOG00000022311) TEX46 (ENSPCOG00000021993) LACTBL1 (ENSPCOG00000024643) EPHB2 (ENSPCOG00000001598) C1QB (ENSPCOG00000028706) C1QC (ENSPCOG00000018070) C1QA (ENSPCOG00000024922) EPHA8 (ENSPCOG00000020705) ZBTB40 (ENSPCOG00000006905) ENSPCOG00000012183 ##22 WNT4 (ENSPCOG00000022822) CDC42 (ENSPCOG00000023240) ENSPCOG00000020873 ENSPCOG00000023883 HSPG2 (ENSPCOG00000014813) LDLRAD2 (ENSPCOG00000013173) USP48 (ENSPCOG00000018309) RAP1GAP (ENSPCOG00000014202) ALPL (ENSPCOG00000017888) Coquerels sifaka MODERN SPECIES 745 ENSPCOG00000019779 ##22 PARG (ENSPCOG00000019574) ENSPCOG00000025914 NCOA4 (ENSPCOG00000009035) MSMB (ENSPCOG00000015834) ENSPCOG00000018845 ENSPCOG00000007066 MARCHF8 (ENSPCOG00000021062) ALOX5 (ENSPCOG00000019495) Greater bamboo lemur DUPLICATION Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 327 DUXA (ENSPSMG00000017449) ENSPSMG00000017443 ENSPSMG00000017437 PEG3 (ENSPSMG00000017412) ENSPSMG00000017402 ENSPSMG00000017395 ENSPSMG00000017388 ENSPSMG00000017384 ENSPSMG00000017356 ENSPSMG00000017315 SMIM17 (ENSPSMG00000017310) ZNF71 (ENSPSMG00000017305) ZNF470 (ENSPSMG00000017298) ENSPSMG00000017294 ZFP28 (ENSPSMG00000017280) ENSPSMG00000017247 ##22 ENSPSMG00000017244 ZNF582 (ENSPSMG00000017234) ZNF583 (ENSPSMG00000017227) ZNF667 (ENSPSMG00000017221) Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 1233 ENSPSMG00000007661 ##22 CHD9NB (ENSPSMG00000007669) Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000158025.a.a.b ENSGT00940000157022 #10 ENSGT00940000172381 ENSGT00940000158558 #11 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ENSGT00950000182935.B.b.d ENSGT00390000001979 #18 ENSGT00940000158812 #19 ENSGT00940000157651 #20 ENSGT00530000063647.A.a #21 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b ##22 ENSGT00390000006348 #23 ENSGT00940000153095.g.a.b ##22 ENSGT00390000017606.a.b #24 ENSGT00510000047678 #25 ENSGT00940000154768.B #26 ENSGT00390000001723 #27 ENSGT00940000160452 #28 ENSGT00940000159176 #29 ENSGT00940000160824 #30 ENSGT00950000183193.A.c.b #31 ENSGT01030000234629.E.a.b #32 ENSGT00530000063937.b #33 ENSGT00390000008964 #34 ENSGT00940000161283 #35 ENSGT00940000153496.a.a #36 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000158025.a.a.b ENSGT00940000157022 #10 ENSGT00940000172381 ENSGT00940000158558 #11 ENSGT00940000158702 ENSGT00950000183139.C #12 ENSGT00510000047513 #13 ENSGT00950000182849.B.c.a #14 ENSGT00940000158204.b #15 ENSGT00390000014178 #16 ENSGT00950000182935.B.b.d ENSGT00390000001979 #18 ENSGT00940000158812 #19 ENSGT00940000157651 #20 ENSGT00530000063647.A.a #21 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b ##22 ENSGT00390000006348 #23 ENSGT00940000153095.g.a.b ##22 ENSGT00390000017606.a.b #24 ENSGT00510000047678 #25 ENSGT00940000154768.B #26 ENSGT00390000001723 #27 ENSGT00940000160452 #28 ENSGT00940000159176 #29 ENSGT00940000160824 #30 ENSGT00950000183193.A.c.b #31 ENSGT01030000234629.E.a.b #32 ENSGT00530000063937.b #33 ENSGT00390000008964 #34 ENSGT00940000161283 #35 ENSGT00940000153496.a.a #36 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000014795 #9 ENSGT00940000158025.a.a.b ENSGT00940000157022 #10 ENSGT00940000158558 #11 ENSGT00940000158702 ENSGT00950000183139.C #12 ENSGT00510000047513 #13 ENSGT00950000182849.B.c.a #14 ENSGT00940000158204.b #15 ENSGT00390000014178 #16 ENSGT00950000182935.B.b.d ENSGT00390000001979 #18 ENSGT00940000158812 #19 ENSGT00940000157651 #20 ENSGT00530000063647.A.a #21 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b ##22 ENSGT00390000006348 #23 ENSGT00390000017606.a.b #24 ENSGT00510000047678 #25 ENSGT00940000154768.B #26 ENSGT00390000001723 #27 ENSGT00940000160452 #28 ENSGT00940000159176 #29 ENSGT00940000160824 #30 ENSGT00950000183193.A.c.b #31 ENSGT01030000234629.E.a.b #32 ENSGT00530000063937.b #33 ENSGT00390000008964 #34 ENSGT00940000161283 #35 ENSGT00940000153496.a.a #36 ENSGT00390000007652 #37 Equus ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00390000014795 #9 ENSGT00940000158025.a.a.b ENSGT00940000157022 #10 ENSGT00940000158558 #11 ENSGT00940000158702 ENSGT00950000183139.C #12 ENSGT00510000047513 #13 ENSGT00950000182849.B.c.a #14 ENSGT00940000158204.b #15 ENSGT00390000014178 #16 ENSGT00950000182935.B.b.d ENSGT00390000001979 #18 ENSGT00940000158812 #19 ENSGT00940000157651 #20 ENSGT00530000063647.A.a #21 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b ##22 ENSGT00390000006348 #23 ENSGT00390000017606.a.b #24 ENSGT00940000154768.B #26 ENSGT00390000001723 #27 ENSGT00940000160452 #28 ENSGT00940000159176 #29 ENSGT00940000160824 #30 ENSGT00950000183193.A.c.b #31 ENSGT01030000234629.E.a.b #32 ENSGT00530000063937.b #33 ENSGT00390000008964 #34 ENSGT00940000161283 #35 ENSGT00940000153496.a.a #36 ENSGT00390000007652 #37 ENSGT00390000003337 Donkey MODERN SPECIES 5 BRICD5 (ENSEASG00005031461) #8 MLST8 (ENSEASG00005004839) #9 CASKIN1 (ENSEASG00005004831) TRAF7 (ENSEASG00005004810) #10 RAB26 (ENSEASG00005025128) #11 TSC2 (ENSEASG00005004724) #12 NTHL1 (ENSEASG00005004702) #13 NHERF2 (ENSEASG00005004685) #14 ENSEASG00005004672 #15 ZNF598 (ENSEASG00005004666) #16 SYNGR3 (ENSEASG00005004661) ENSEASG00005004659 #18 NOXO1 (ENSEASG00005004653) #19 TBL3 (ENSEASG00005004649) #20 ENSEASG00005025509 #21 RPS2 (ENSEASG00005004630) ##22 NDUFB10 (ENSEASG00005028164) #23 ENSEASG00005033190 RPL3L (ENSEASG00005009140) #24 HS3ST6 (ENSEASG00005004607) #26 ENSEASG00005015561 ENSEASG00005004600 #27 FAHD1 (ENSEASG00005030060) #28 HAGH (ENSEASG00005004592) #29 IGFALS (ENSEASG00005004586) #30 NUBP2 (ENSEASG00005035230) #31 SPSB3 (ENSEASG00005026398) #32 ENSEASG00005025437 #33 ENSEASG00005025961 #34 NME3 (ENSEASG00005035536) #35 ENSEASG00005001955 #36 Horse MODERN SPECIES 4 MLST8 (ENSECAG00000010350) #9 CASKIN1 (ENSECAG00000013075) TRAF7 (ENSECAG00000017744) #10 PKD1 (ENSECAG00000006899) RAB26 (ENSECAG00000020903) #11 TSC2 (ENSECAG00000021222) #12 NTHL1 (ENSECAG00000012595) #13 NHERF2 (ENSECAG00000013367) #14 NPW (ENSECAG00000030307) #15 ZNF598 (ENSECAG00000014058) #16 SYNGR3 (ENSECAG00000015298) GFER (ENSECAG00000036054) #18 NOXO1 (ENSECAG00000017619) #19 TBL3 (ENSECAG00000019299) #20 RNF151 (ENSECAG00000008953) #21 RPS2 (ENSECAG00000009065) ##22 NDUFB10 (ENSECAG00000020610) #23 RPL3L (ENSECAG00000020632) #24 HS3ST6 (ENSECAG00000000862) #26 MEIOB (ENSECAG00000001005) #27 ENSECAG00000057961 FAHD1 (ENSECAG00000004353) #28 HAGH (ENSECAG00000005471) #29 IGFALS (ENSECAG00000039211) #30 NUBP2 (ENSECAG00000012545) #31 SPSB3 (ENSECAG00000013413) #32 EME2 (ENSECAG00000016045) #33 MRPS34 (ENSECAG00000016370) #34 NME3 (ENSECAG00000038477) #35 MAPK8IP3 (ENSECAG00000016379) #36 JPT2 (ENSECAG00000026941) #37 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000014795 #9 ENSGT00940000158025.a.a.b 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ENSGT00940000160452 #28 ENSGT00940000159176 #29 ENSGT00940000160824 #30 ENSGT00950000183193.A.c.b #31 ENSGT01030000234629.E.a.b #32 ENSGT00530000063937.b #33 ENSGT00390000008964 #34 ENSGT00940000161283 #35 ENSGT00940000153496.a.a #36 ENSGT00390000007652 #37 Microbat MODERN SPECIES 1269 PGP (ENSMLUG00000025280) #7 BRICD5 (ENSMLUG00000003946) #8 MLST8 (ENSMLUG00000003950) #9 CASKIN1 (ENSMLUG00000004298) TRAF7 (ENSMLUG00000004287) #10 PKD1 (ENSMLUG00000004260) TSC2 (ENSMLUG00000004241) #12 NTHL1 (ENSMLUG00000004234) #13 NHERF2 (ENSMLUG00000005825) #14 ZNF598 (ENSMLUG00000004224) #16 ENSMLUG00000028770 GFER (ENSMLUG00000030630) #18 NOXO1 (ENSMLUG00000011725) #19 TBL3 (ENSMLUG00000011684) #20 RNF151 (ENSMLUG00000011679) #21 ENSMLUG00000011660 ##22 ENSMLUG00000011655 #23 RPL3L (ENSMLUG00000011638) #24 MSRB1 (ENSMLUG00000011634) #25 HS3ST6 (ENSMLUG00000011625) #26 ENSMLUG00000000791 #27 FAHD1 (ENSMLUG00000000789) #28 HAGH (ENSMLUG00000000782) #29 IGFALS (ENSMLUG00000000776) #30 NUBP2 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ENSGT00950000183139.C #12 ENSGT00510000047513 #13 ENSGT00950000182849.B.c.a #14 ENSGT00940000158204.b #15 ENSGT00390000014178 #16 ENSGT00950000182935.B.b.d ENSGT00390000001979 #18 ENSGT00940000158812 #19 ENSGT00940000157651 #20 ENSGT00530000063647.A.a #21 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b ##22 ENSGT00390000006348.a #23 ENSGT00390000017606.a.b #24 ENSGT00510000047678 #25 ENSGT00940000154768.B #26 ENSGT00390000001723 #27 ENSGT00940000160452 #28 ENSGT00940000159176 #29 ENSGT00940000160824 #30 ENSGT00950000183193.A.c.b #31 ENSGT01030000234629.E.a.b #32 ENSGT00530000063937.b #33 ENSGT00390000008964 #34 ENSGT00940000161283 #35 ENSGT00940000153496.a.a #36 ENSGT00390000007652 #37 Panthera_a ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00930000150969.B #8 ENSGT00390000014795 #9 ENSGT00940000158025.a.a.b ENSGT00940000157022 #10 ENSGT00940000158558 #11 ENSGT00950000183139.C #12 ENSGT00510000047513 #13 ENSGT00950000182849.B.c.a #14 ENSGT00940000158204.b #15 ENSGT00390000014178 #16 ENSGT00950000182935.B.b.d 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ENSGT00390000001723 #27 ENSGT00940000160452 #28 ENSGT00940000159176 #29 ENSGT00940000160824 #30 ENSGT00950000183193.A.c.b #31 ENSGT01030000234629.E.a.b #32 ENSGT00530000063937.b #33 ENSGT00390000008964 #34 ENSGT00940000161283 #35 ENSGT00940000153496.a.a #36 Canidae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000014795 #9 ENSGT00940000158025.a.a.b.a ENSGT00940000157022 #10 ENSGT00940000158558 #11 ENSGT00940000158702 ENSGT00950000183139.C #12 ENSGT00510000047513 #13 ENSGT00950000182849.B.c.a #14 ENSGT00940000158204.b #15 ENSGT00390000014178 #16 ENSGT00950000182935.B.b.d ENSGT00390000001979 #18 ENSGT00940000158812 #19 ENSGT00940000157651 #20 ENSGT00530000063647.A.a #21 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b ##22 ENSGT00390000006348 #23 ENSGT00940000153095.g.a.b ##22 ENSGT00390000017606.a.b #24 ENSGT00510000047678.e #25 ENSGT00940000154768.B #26 ENSGT00390000001723 #27 ENSGT00940000160452 #28 ENSGT00940000159176 #29 ENSGT00940000160824 #30 ENSGT00950000183193.A.c.b #31 ENSGT01030000234629.E.a.b #32 ENSGT00530000063937.b #33 ENSGT00390000008964 #34 ENSGT00940000153496.a.a #36 ENSGT00390000007652 #37 Red fox DUPLICATION Red fox MODERN SPECIES 200 MLST8 (ENSVVUG00000009311) #9 ENSVVUG00000009320 ENSVVUG00000009330 TRAF7 (ENSVVUG00000009335) #10 RAB26 (ENSVVUG00000009402) #11 PKD1 (ENSVVUG00000009411) TSC2 (ENSVVUG00000009475) #12 NTHL1 (ENSVVUG00000009512) #13 SLC9A3R2 (ENSVVUG00000009515) #14 ZNF598 (ENSVVUG00000009523) #16 SYNGR3 (ENSVVUG00000009541) GFER (ENSVVUG00000009553) #18 ENSVVUG00000009559 #19 TBL3 (ENSVVUG00000009589) #20 RNF151 (ENSVVUG00000009605) #21 ENSVVUG00000009633 ##22 NDUFB10 (ENSVVUG00000009798) #23 RPL3L (ENSVVUG00000009805) #24 MSRB1 (ENSVVUG00000009825) #25 HS3ST6 (ENSVVUG00000009829) #26 MEIOB (ENSVVUG00000009837) #27 FAHD1 (ENSVVUG00000009934) #28 HAGH (ENSVVUG00000009937) #29 IGFALS (ENSVVUG00000009953) #30 NUBP2 (ENSVVUG00000009958) #31 SPSB3 (ENSVVUG00000009994) #32 MRPS34 (ENSVVUG00000010000) #34 MAPK8IP3 (ENSVVUG00000010026) #36 JPT2 (ENSVVUG00000010820) IFT140 (ENSVVUG00000010908) TMEM204 (ENSVVUG00000010997) Red fox MODERN SPECIES 12 ANKRD49 (ENSVVUG00000011561) ENSVVUG00000011564 ENSVVUG00000011567 FUT4 (ENSVVUG00000011573) PIWIL4 (ENSVVUG00000011577) AMOTL1 (ENSVVUG00000011602) ENSVVUG00000011644 ENSVVUG00000011648 KDM4D (ENSVVUG00000011656) ENDOD1 (ENSVVUG00000011659) SESN3 (ENSVVUG00000011684) FAM76B (ENSVVUG00000011705) ENSVVUG00000011726 MTMR2 (ENSVVUG00000011747) ENSVVUG00000011770 ENSVVUG00000011774 ##22 ENSVVUG00000011776 CCDC82 (ENSVVUG00000011778) JRKL (ENSVVUG00000011782) ENSVVUG00000011800 CNTN5 (ENSVVUG00000011837) ENSVVUG00000011935 ARHGAP42 (ENSVVUG00000011940) ENSVVUG00000012768 ENSVVUG00000012771 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000014795 #9 ENSGT00940000158025.a.a.b ENSGT00940000157022 #10 ENSGT00940000158558 #11 ENSGT00940000158702 ENSGT00950000183139.C #12 ENSGT00510000047513 #13 ENSGT00950000182849.B.c.a #14 ENSGT00940000158204.b #15 ENSGT00390000014178 #16 ENSGT00950000182935.B.b.d ENSGT00390000001979 #18 ENSGT00940000158812 #19 ENSGT00940000157651 #20 ENSGT00530000063647.A.a #21 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b ##22 ENSGT00390000006348 #23 ENSGT00390000017606.a.b #24 ENSGT00510000047678.e #25 ENSGT00940000154768.B #26 ENSGT00390000001723 #27 ENSGT00940000160452 #28 ENSGT00940000159176 #29 ENSGT00940000160824 #30 ENSGT00950000183193.A.c.b #31 ENSGT01030000234629.E.a.b #32 ENSGT00530000063937.b #33 ENSGT00390000008964 #34 ENSGT00940000161283 #35 ENSGT00940000153496.a.a #36 ENSGT00390000007652 #37 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000014795 #9 ENSGT00940000158025.a.a.b ENSGT00940000157022 #10 ENSGT00940000158558 #11 ENSGT00940000158702 ENSGT00950000183139.C #12 ENSGT00510000047513 #13 ENSGT00950000182849.B.c.a #14 ENSGT00940000158204.b #15 ENSGT00390000014178 #16 ENSGT00950000182935.B.b.d ENSGT00390000001979 #18 ENSGT00940000158812 #19 ENSGT00940000157651 #20 ENSGT00530000063647.A.a #21 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b ##22 ENSGT00390000006348 #23 ENSGT00390000017606.a.b #24 ENSGT00510000047678.e #25 ENSGT00940000154768.B #26 ENSGT00390000001723 #27 ENSGT00940000160452 #28 ENSGT00940000159176 #29 ENSGT00940000160824 #30 ENSGT00950000183193.A.c.b #31 ENSGT01030000234629.E.a.b #32 ENSGT00530000063937.b #33 ENSGT00390000008964 #34 ENSGT00940000161283 #35 ENSGT00940000153496.a.a #36 ENSGT00390000007652 #37 Ferret MODERN SPECIES 189 E4F1 (ENSMPUG00000015378) MLST8 (ENSMPUG00000015397) #9 TRAF7 (ENSMPUG00000015411) #10 RAB26 (ENSMPUG00000015412) #11 PKD1 (ENSMPUG00000015425) ENSMPUG00000020060 TSC2 (ENSMPUG00000015487) #12 NTHL1 (ENSMPUG00000015492) #13 NHERF2 (ENSMPUG00000015496) #14 ZNF598 (ENSMPUG00000015523) #16 SYNGR3 (ENSMPUG00000015525) GFER (ENSMPUG00000015534) #18 NOXO1 (ENSMPUG00000015539) #19 TBL3 (ENSMPUG00000015545) #20 RNF151 (ENSMPUG00000015546) #21 RPS2 (ENSMPUG00000015547) ##22 NDUFB10 (ENSMPUG00000015557) #23 RPL3L (ENSMPUG00000015565) #24 HS3ST6 (ENSMPUG00000015567) #26 ENSMPUG00000015569 #27 FAHD1 (ENSMPUG00000020061) #28 HAGH (ENSMPUG00000015572) #29 IGFALS (ENSMPUG00000015594) #30 NUBP2 (ENSMPUG00000015596) #31 SPSB3 (ENSMPUG00000015597) #32 EME2 (ENSMPUG00000015605) #33 MRPS34 (ENSMPUG00000015607) #34 MAPK8IP3 (ENSMPUG00000015614) #36 CRAMP1 (ENSMPUG00000015618) ENSMPUG00000020062 IFT140 (ENSMPUG00000015620) Ursidae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000014795 #9 ENSGT00940000158025.a.a.b ENSGT00940000157022 #10 ENSGT00940000158558 #11 ENSGT00940000158702 ENSGT00950000183139.C #12 ENSGT00510000047513 #13 ENSGT00950000182849.B.c.a #14 ENSGT00940000158204.b #15 ENSGT00390000014178 #16 ENSGT00950000182935.B.b.d ENSGT00390000001979 #18 ENSGT00940000158812.c #19 ENSGT00940000157651 #20 ENSGT00530000063647.A.a #21 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b ##22 ENSGT00390000006348.f #23 ENSGT00390000017606.a.b #24 ENSGT00510000047678.e #25 ENSGT00940000154768.B #26 ENSGT00390000001723 #27 ENSGT00940000160452 #28 ENSGT00940000159176 #29 ENSGT00940000160824 #30 ENSGT00950000183193.A.c.b #31 ENSGT01030000234629.E.a.b #32 ENSGT00530000063937.b #33 ENSGT00390000008964 #34 ENSGT00940000161283 #35 ENSGT00940000153496.a.a #36 ENSGT00390000007652 #37 Giant Panda MODERN SPECIES 1 CASKIN1 (ENSAMEG00000030569) TRAF7 (ENSAMEG00000017804) #10 RAB26 (ENSAMEG00000017794) #11 PKD1 (ENSAMEG00000017756) TSC2 (ENSAMEG00000017702) #12 ENSAMEG00000024310 NHERF2 (ENSAMEG00000017688) #14 NPW (ENSAMEG00000017686) #15 ZNF598 (ENSAMEG00000017681) #16 ENSAMEG00000029661 ENSAMEG00000026689 #18 ENSAMEG00000017671 #19 ENSAMEG00000031000 #19 TBL3 (ENSAMEG00000017654) #20 RNF151 (ENSAMEG00000017653) #21 RPS2 (ENSAMEG00000007366) ##22 NDUFB10 (ENSAMEG00000008522) #23 RPL3L (ENSAMEG00000008489) #24 MSRB1 (ENSAMEG00000008487) #25 ENSAMEG00000025433 #26 ENSAMEG00000008475 #27 FAHD1 (ENSAMEG00000018730) #28 IGFALS (ENSAMEG00000008445) #30 NUBP2 (ENSAMEG00000008409) #31 SPSB3 (ENSAMEG00000008400) #32 EME2 (ENSAMEG00000008393) #33 MRPS34 (ENSAMEG00000031331) #34 ENSAMEG00000024318 #35 MAPK8IP3 (ENSAMEG00000008238) #36 JPT2 (ENSAMEG00000008232) #37 CRAMP1 (ENSAMEG00000008213) Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000158025.a.a.b ENSGT00940000157022 #10 ENSGT00940000172381 ENSGT00940000158558 #11 ENSGT00940000158702 ENSGT00950000183139.C #12 ENSGT00510000047513 #13 ENSGT00950000182849.B.c.a #14 ENSGT00940000158204.b #15 ENSGT00390000014178 #16 ENSGT00950000182935.B.b.d ENSGT00390000001979 #18 ENSGT00940000158812 #19 ENSGT00940000157651 #20 ENSGT00530000063647.A.a #21 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b ##22 ENSGT00390000006348 #23 ENSGT00390000017606.a.b #24 ENSGT00510000047678 #25 ENSGT00940000154768.B #26 ENSGT00390000001723 #27 ENSGT00940000160452 #28 ENSGT00940000159176 #29 ENSGT00940000160824 #30 ENSGT00950000183193.A.c.b #31 ENSGT01030000234629.E.a.b #32 ENSGT00530000063937.b #33 ENSGT00390000008964 #34 ENSGT00940000161283 #35 ENSGT00940000153496.a.a #36 ENSGT00390000007652 #37 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000158025.a.a.b ENSGT00940000157022 #10 ENSGT00940000172381 ENSGT00940000158558 #11 ENSGT00940000158702 ENSGT00950000183139.C #12 ENSGT00510000047513 #13 ENSGT00950000182849.B.c.a #14 ENSGT00940000158204.b #15 ENSGT00390000014178 #16 ENSGT00950000182935.B.b.d ENSGT00390000001979 #18 ENSGT00940000158812 #19 ENSGT00940000157651 #20 ENSGT00530000063647.A.a #21 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b ##22 ENSGT00390000006348 #23 ENSGT00390000017606.a.b #24 ENSGT00510000047678 #25 ENSGT00940000154768.B #26 ENSGT00390000001723 #27 ENSGT00940000160452 #28 ENSGT00940000159176 #29 ENSGT00940000160824 #30 ENSGT00950000183193.A.c.b #31 ENSGT01030000234629.E.a.b #32 ENSGT00530000063937.b #33 ENSGT00390000008964 #34 ENSGT00940000161283 #35 ENSGT00940000153496.a.a #36 ENSGT00390000007652 #37 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000158025.a.a.b ENSGT00940000157022 #10 ENSGT00940000172381 ENSGT00940000158558 #11 ENSGT00940000158702 ENSGT00950000183139.C #12 ENSGT00510000047513 #13 ENSGT00950000182849.B.c.a #14 ENSGT00940000158204.b #15 ENSGT00390000014178 #16 ENSGT00950000182935.B.b.d ENSGT00390000001979 #18 ENSGT00940000158812 #19 ENSGT00940000157651 #20 ENSGT00530000063647.A.a #21 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b ##22 ENSGT00390000006348 #23 ENSGT00390000017606.a.b #24 ENSGT00510000047678 #25 ENSGT00940000154768.B #26 ENSGT00390000001723 #27 ENSGT00940000160452 #28 ENSGT00940000159176 #29 ENSGT00940000160824 #30 ENSGT00950000183193.A.c.b #31 ENSGT01030000234629.E.a.b #32 ENSGT00530000063937.b #33 ENSGT00390000008964 #34 ENSGT00940000161283 #35 ENSGT00940000153496.a.a #36 ENSGT00390000007652 #37 Cetacea ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000014795 #9 ENSGT00940000158025.a.a.b ENSGT00940000157022 #10 ENSGT00940000158558 #11 ENSGT00940000158702 ENSGT00950000183139.C #12 ENSGT00510000047513 #13 ENSGT00950000182849.B.c.a #14 ENSGT00940000158204.b #15 ENSGT00390000014178 #16 ENSGT00950000182935.B.b.d ENSGT00390000001979 #18 ENSGT00940000158812 #19 ENSGT00940000157651 #20 ENSGT00530000063647.A.a #21 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b ##22 ENSGT00390000006348 #23 ENSGT00390000017606.a.b #24 ENSGT00510000047678 #25 ENSGT00940000154768.B #26 ENSGT00390000001723 #27 ENSGT00940000160452 #28 ENSGT00940000159176 #29 ENSGT00940000160824 #30 ENSGT00950000183193.A.c.b #31 ENSGT01030000234629.E.a.b #32 ENSGT00530000063937.b #33 ENSGT00390000008964 #34 ENSGT00940000161283 #35 ENSGT00940000153496.a.a #36 ENSGT00390000007652 #37 Odontoceti DUPLICATION Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b.k ##22 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b.k ##22 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b.k ##22 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000182894.A.b.a ENSGT00950000182696.A.b ENSGT00530000063707.b ENSGT00430000032546 ENSGT00940000156222.b ENSGT00390000002886.b.a ENSGT00390000018613.b.s.b ENSGT00940000156053 ENSGT00390000000022.a ENSGT00390000002918.a.a.j ENSGT00390000000087 ENSGT00550000074885 ENSGT00510000048539 ENSGT00390000007560.p ENSGT00390000011615.B ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b.k ##22 ENSGT00940000160685 ENSGT00940000163876 ENSGT00510000047003 ENSGT00390000008647 ENSGT01030000234566.e.a ENSGT00940000160832 ENSGT00940000153578.B ENSGT00940000158857 ENSGT00940000156435 ENSGT00390000007164 ENSGT00770000120884 ENSGT00940000158310 ENSGT00940000154531.l ENSGT00940000154740.a.b.b ENSGT00390000015381 Beluga whale MODERN SPECIES 48 ENSDLEG00000005027 ENSDLEG00000005019 ENSDLEG00000016392 GRIN2A (ENSDLEG00000016261) HAPSTR1 (ENSDLEG00000016238) ENSDLEG00000016222 USP7 (ENSDLEG00000016126) CARHSP1 (ENSDLEG00000016118) PMM2 (ENSDLEG00000016108) TMEM186 (ENSDLEG00000016105) ABAT (ENSDLEG00000016058) METTL22 (ENSDLEG00000016014) ENSDLEG00000016004 TMEM114 (ENSDLEG00000015996) ENSDLEG00000015979 ENSDLEG00000015968 ##22 RBFOX1 (ENSDLEG00000015877) ENSDLEG00000015860 ENSDLEG00000015842 EEF2KMT (ENSDLEG00000015825) ALG1 (ENSDLEG00000015810) NAGPA (ENSDLEG00000015799) SEC14L5 (ENSDLEG00000015744) PPL (ENSDLEG00000015662) UBN1 (ENSDLEG00000015636) GLYR1 (ENSDLEG00000015608) ROGDI (ENSDLEG00000015583) SEPTIN12 (ENSDLEG00000015556) ENSDLEG00000015548 ZNF500 (ENSDLEG00000015538) ENSDLEG00000015530 Narwhal MODERN SPECIES 299 NUBP1 (ENSMMNG00015005412) ##31 TEKT5 (ENSMMNG00015005389) EMP2 (ENSMMNG00015005378) ATF7IP2 (ENSMMNG00015005359) GRIN2A (ENSMMNG00015005303) HAPSTR1 (ENSMMNG00015005278) ENSMMNG00015005254 USP7 (ENSMMNG00015005173) CARHSP1 (ENSMMNG00015005147) PMM2 (ENSMMNG00015005128) TMEM186 (ENSMMNG00015005110) ABAT (ENSMMNG00015005079) METTL22 (ENSMMNG00015005044) ENSMMNG00015005035 TMEM114 (ENSMMNG00015005026) ENSMMNG00015005013 ##22 RBFOX1 (ENSMMNG00015004838) ENSMMNG00015004798 ENSMMNG00015004793 ENSMMNG00015004785 NAGPA (ENSMMNG00015004776) SEC14L5 (ENSMMNG00015004764) PPL (ENSMMNG00015004753) UBN1 (ENSMMNG00015004730) GLYR1 (ENSMMNG00015004666) ROGDI (ENSMMNG00015004646) SMIM22 (ENSMMNG00015004640) SEPTIN12 (ENSMMNG00015004634) ENSMMNG00015004624 ZNF500 (ENSMMNG00015004613) DNAAF8 (ENSMMNG00015004600) Sperm whale MODERN SPECIES 17 RERG (ENSPCTG00005011021) PDE6H (ENSPCTG00005010968) ARHGDIB (ENSPCTG00005010929) ERP27 (ENSPCTG00005010792) ENSPCTG00005010757 MGP (ENSPCTG00005010698) ART4 (ENSPCTG00005010669) C12orf60 (ENSPCTG00005010636) SMCO3 (ENSPCTG00005010614) WBP11 (ENSPCTG00005010576) H2AJ (ENSPCTG00005010560) ENSPCTG00005010547 GUCY2C (ENSPCTG00005010472) PLBD1 (ENSPCTG00005010317) ATF7IP (ENSPCTG00005010023) ENSPCTG00005009984 ##22 GRIN2B (ENSPCTG00005009861) EMP1 (ENSPCTG00005009790) FAM234B (ENSPCTG00005009747) HEBP1 (ENSPCTG00005009670) GPRC5D (ENSPCTG00005009609) GPRC5A (ENSPCTG00005009555) DDX47 (ENSPCTG00005009471) APOLD1 (ENSPCTG00005009428) GPR19 (ENSPCTG00005009412) CREBL2 (ENSPCTG00005009380) DUSP16 (ENSPCTG00005009327) BORCS5 (ENSPCTG00005009215) ENSPCTG00005009180 MANSC1 (ENSPCTG00005009081) LRP6 (ENSPCTG00005008896) Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000014795 #9 ENSGT00940000158025.a.a.b ENSGT00940000157022 #10 ENSGT00940000158558 #11 ENSGT00940000158702 ENSGT00950000183139.C #12 ENSGT00510000047513 #13 ENSGT00950000182849.B.c.a #14 ENSGT00940000158204.b #15 ENSGT00390000014178 #16 ENSGT00950000182935.B.b.d ENSGT00390000001979 #18 ENSGT00940000158812 #19 ENSGT00940000157651 #20 ENSGT00530000063647.A.a #21 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b.l ##22 ENSGT00390000006348 #23 ENSGT00390000017606.a.b #24 ENSGT00510000047678 #25 ENSGT00940000154768.B #26 ENSGT00390000001723 #27 ENSGT00940000160452 #28 ENSGT00940000159176 #29 ENSGT00940000160824 #30 ENSGT00950000183193.A.c.b #31 ENSGT01030000234629.E.a.b #32 ENSGT00530000063937.b #33 ENSGT00390000008964 #34 ENSGT00940000161283 #35 ENSGT00940000153496.a.a #36 ENSGT00390000007652 #37 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000014795 #9 ENSGT00940000158025.a.a.b ENSGT00940000157022 #10 ENSGT00940000158558 #11 ENSGT00940000158702 ENSGT00950000183139.C #12 ENSGT00510000047513 #13 ENSGT00950000182849.B.c.a #14 ENSGT00940000158204.b #15 ENSGT00390000014178 #16 ENSGT00950000182935.B.b.d 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ENSGT00390000017606.a.b #24 ENSGT00510000047678 #25 ENSGT00940000154768.B #26 ENSGT00390000001723 #27 ENSGT00940000160452 #28 ENSGT00940000159176 #29 ENSGT00940000160824 #30 ENSGT00950000183193.A.c.b #31 ENSGT01030000234629.E.a.b #32 ENSGT00390000008964 #34 ENSGT00940000161283 #35 ENSGT00940000153496.a.a #36 ENSGT00390000007652 #37 ENSGT00390000003337 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00930000150969.B #8 ENSGT00390000014795 #9 ENSGT00940000158025.a.a.b ENSGT00940000157022 #10 ENSGT00940000158558 #11 ENSGT00950000183139.C #12 ENSGT00510000047513 #13 ENSGT00950000182849.B.c.a #14 ENSGT00940000158204.b #15 ENSGT00390000014178 #16 ENSGT00950000182935.B.b.d ENSGT00390000001979 #18 ENSGT00940000158812 #19 ENSGT00940000157651 #20 ENSGT00530000063647.A.a #21 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b.l ##22 ENSGT00390000006348 #23 ENSGT00390000017606.a.b #24 ENSGT00510000047678 #25 ENSGT00940000154768.B #26 ENSGT00390000001723 #27 ENSGT00940000160452 #28 ENSGT00940000159176 #29 ENSGT00940000160824 #30 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(ENSPSNG00000010221) #36 JPT2 (ENSPSNG00000010117) #37 CRAMP1 (ENSPSNG00000009750) Dolphin MODERN SPECIES 2804 ZNF598 (ENSTTRG00000011402) #16 SYNGR3 (ENSTTRG00000011401) GFER (ENSTTRG00000011400) #18 NOXO1 (ENSTTRG00000011396) #19 TBL3 (ENSTTRG00000011395) #20 RNF151 (ENSTTRG00000011394) #21 RPS2 (ENSTTRG00000011393) ##22 NDUFB10 (ENSTTRG00000011392) #23 RPL3L (ENSTTRG00000011391) #24 ENSTTRG00000011390 #25 HS3ST6 (ENSTTRG00000011389) #26 ENSTTRG00000011388 #27 FAHD1 (ENSTTRG00000011387) #28 HAGH (ENSTTRG00000011386) #29 IGFALS (ENSTTRG00000011385) #30 NUBP2 (ENSTTRG00000011384) #31 SPSB3 (ENSTTRG00000011383) #32 EME2 (ENSTTRG00000011382) #33 MRPS34 (ENSTTRG00000011381) #34 NME3 (ENSTTRG00000011380) #35 MAPK8IP3 (ENSTTRG00000011379) #36 HN1L (ENSTTRG00000011377) #37 Sperm whale MODERN SPECIES 13 ENSPCTG00005017259 TMEM185A (ENSPCTG00005017095) ENSPCTG00005017037 AFF2 (ENSPCTG00005016855) ENSPCTG00005016784 FMR1 (ENSPCTG00005016358) ENSPCTG00005016250 SLITRK2 (ENSPCTG00005016146) ENSPCTG00005016093 ENSPCTG00005016060 SLITRK4 (ENSPCTG00005016051) LDOC1 (ENSPCTG00005016029) ENSPCTG00005015949 ENSPCTG00005015868 ENSPCTG00005015851 ENSPCTG00005015765 ##22 SOX3 (ENSPCTG00005015742) ENSPCTG00005015719 ENSPCTG00005015642 ENSPCTG00005015600 ATP11C (ENSPCTG00005015323) MCF2 (ENSPCTG00005012755) F9 (ENSPCTG00005012484) ENSPCTG00005012405 ENSPCTG00005021103 ENSPCTG00005021096 ENSPCTG00005021091 FGF13 (ENSPCTG00005021010) ENSPCTG00005020982 ZIC3 (ENSPCTG00005020946) ENSPCTG00005020935 Blue whale MODERN SPECIES 40 SASH3 (ENSBMSG00010018297) ZDHHC9 (ENSBMSG00010018334) ENSBMSG00010018357 ENSBMSG00010018374 ENSBMSG00010018423 BCORL1 (ENSBMSG00010018594) ELF4 (ENSBMSG00010018646) AIFM1 (ENSBMSG00010018761) RAB33A (ENSBMSG00010018950) ZNF280C (ENSBMSG00010018974) SLC25A14 (ENSBMSG00010019050) GPR119 (ENSBMSG00010019214) ENSBMSG00010019230 ENOX2 (ENSBMSG00010019269) ARHGAP36 (ENSBMSG00010019383) ENSBMSG00010019464 ##22 ENSBMSG00010019479 ENSBMSG00010019501 IGSF1 (ENSBMSG00010019583) STK26 (ENSBMSG00010019951) FRMD7 (ENSBMSG00010020071) RAP2C (ENSBMSG00010020115) MBNL3 (ENSBMSG00010020141) HS6ST2 (ENSBMSG00010020202) ENSBMSG00010020245 ENSBMSG00010020254 GPC4 (ENSBMSG00010020282) GPC3 (ENSBMSG00010020313) ENSBMSG00010020361 CCDC160 (ENSBMSG00010020402) PHF6 (ENSBMSG00010020419) Pecora ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000158025.a.a.b ENSGT00940000157022 #10 ENSGT00940000172381 ENSGT00940000158558 #11 ENSGT00940000158702 ENSGT00950000183139.C #12 ENSGT00510000047513 #13 ENSGT00950000182849.B.c.a #14 ENSGT00940000158204.b #15 ENSGT00390000014178 #16 ENSGT00950000182935.B.b.d ENSGT00390000001979 #18 ENSGT00940000158812 #19 ENSGT00940000157651 #20 ENSGT00530000063647.A.a #21 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b ##22 ENSGT00940000153095.g.b.b ##22 ENSGT00390000006348 #23 ENSGT00390000017606.a.b #24 ENSGT00510000047678 #25 ENSGT00940000154768.B #26 ENSGT00390000001723 #27 ENSGT00940000160452 #28 ENSGT00940000159176 #29 ENSGT00940000160824 #30 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ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000158025.a.a.b ENSGT00940000157022 #10 ENSGT00940000172381 ENSGT00940000158558 #11 ENSGT00940000158702 ENSGT00950000183139.C #12 ENSGT00510000047513 #13 ENSGT00950000182849.B.c.a #14 ENSGT00940000158204.b #15 ENSGT00390000014178 #16 ENSGT00950000182935.B.b.d ENSGT00390000001979 #18 ENSGT00940000158812 #19 ENSGT00940000157651 #20 ENSGT00530000063647.A.a #21 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b ##22 ENSGT00940000153095.g.b.b ##22 ENSGT00390000006348 #23 ENSGT00390000017606.a.b #24 ENSGT00510000047678 #25 ENSGT00940000154768.B #26 ENSGT00390000001723 #27 ENSGT00940000160452 #28 ENSGT00940000159176 #29 ENSGT00940000160824 #30 ENSGT00950000183193.A.c.b #31 ENSGT01030000234629.E.a.b #32 ENSGT00530000063937.b #33 ENSGT00390000008964 #34 ENSGT00940000161283 #35 ENSGT00940000153496.a.a #36 Caprinae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000014795 #9 ENSGT00940000158025.a.a.b ENSGT00940000157022 #10 ENSGT00940000158558 #11 ENSGT00940000158702 ENSGT00950000183139.C #12 ENSGT00510000047513 #13 ENSGT00950000182849.B.c.a #14 ENSGT00940000158204.b #15 ENSGT00390000014178 #16 ENSGT00950000182935.B.b.d ENSGT00390000001979 #18 ENSGT00940000158812 #19 ENSGT00940000157651 #20 ENSGT00530000063647.A.a #21 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b ##22 ENSGT00390000006348 #23 ENSGT00390000017606.a.b #24 ENSGT00510000047678 #25 ENSGT00940000154768.B #26 ENSGT00390000001723 #27 ENSGT00940000160452 #28 ENSGT00940000159176 #29 ENSGT00940000160824 #30 ENSGT00950000183193.A.c.b #31 ENSGT01030000234629.E.a.b #32 ENSGT00530000063937.b #33 ENSGT00390000008964 #34 ENSGT00940000161283 #35 ENSGT00940000153496.a.a #36 ENSGT00390000007652 #37 Goat DUPLICATION Goat MODERN SPECIES 17 BRICD5 (ENSCHIG00000019414) #8 MLST8 (ENSCHIG00000004991) #9 CASKIN1 (ENSCHIG00000019389) TRAF7 (ENSCHIG00000011495) #10 RAB26 (ENSCHIG00000017901) #11 PKD1 (ENSCHIG00000016351) TSC2 (ENSCHIG00000014230) #12 NTHL1 (ENSCHIG00000014718) #13 NHERF2 (ENSCHIG00000016518) #14 ZNF598 (ENSCHIG00000013018) #16 SYNGR3 (ENSCHIG00000016715) GFER (ENSCHIG00000006049) #18 NOXO1 (ENSCHIG00000019635) #19 TBL3 (ENSCHIG00000007747) #20 RNF151 (ENSCHIG00000015860) #21 ENSCHIG00000022194 ##22 NDUFB10 (ENSCHIG00000017852) #23 MSRB1 (ENSCHIG00000018373) #25 RPL3L (ENSCHIG00000020352) #24 HS3ST6 (ENSCHIG00000019888) #26 ENSCHIG00000013357 #27 FAHD1 (ENSCHIG00000007917) #28 HAGH (ENSCHIG00000022722) #29 IGFALS (ENSCHIG00000005524) #30 NUBP2 (ENSCHIG00000024194) #31 SPSB3 (ENSCHIG00000024292) #32 MRPS34 (ENSCHIG00000026940) #34 NME3 (ENSCHIG00000020916) #35 MAPK8IP3 (ENSCHIG00000020649) #36 JPT2 (ENSCHIG00000009778) #37 CRAMP1 (ENSCHIG00000001484) Goat MODERN SPECIES 21 ENSCHIG00000009317 MS4A15 (ENSCHIG00000025121) ENSCHIG00000012875 MS4A8 (ENSCHIG00000022843) SNX19 (ENSCHIG00000022949) ADAMTS15 (ENSCHIG00000021724) ENSCHIG00000010113 ZBTB44 (ENSCHIG00000026404) ST14 (ENSCHIG00000026619) APLP2 (ENSCHIG00000011105) PRDM10 (ENSCHIG00000026530) NFRKB (ENSCHIG00000020816) TMEM45B (ENSCHIG00000020404) NTM (ENSCHIG00000012273) OPCML (ENSCHIG00000014525) ENSCHIG00000010903 ##22 SPATA19 (ENSCHIG00000022538) IGSF9B (ENSCHIG00000020701) JAM3 (ENSCHIG00000010160) BARX2 (ENSCHIG00000021956) ARHGAP32 (ENSCHIG00000018341) ENSCHIG00000021366 KCNJ5 (ENSCHIG00000012884) KCNJ1 (ENSCHIG00000016247) FLI1 (ENSCHIG00000015640) ETS1 (ENSCHIG00000015805) KIRREL3 (ENSCHIG00000003900) ST3GAL4 (ENSCHIG00000012632) DCPS (ENSCHIG00000023271) TIRAP (ENSCHIG00000025937) FOXRED1 (ENSCHIG00000017154) Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 12 ENSOARG00020020898 ENSOARG00020020938 GSTA4 (ENSOARG00020021007) CILK1 (ENSOARG00020021095) FBXO9 (ENSOARG00020021181) GCM1 (ENSOARG00020021293) ELOVL5 (ENSOARG00020021349) ENSOARG00020021487 ENSOARG00020022019 ENSOARG00020022099 Ovar-DRA (ENSOARG00020022159) BTNL2 (ENSOARG00020022234) ENSOARG00020022352 ENSOARG00020022392 ENSOARG00020022450 ENSOARG00020022770 ##22 ENSOARG00020022798 ENSOARG00020022846 ENSOARG00020023063 ENSOARG00020023082 ENSOARG00020023119 ENSOARG00020023458 ENSOARG00020023472 ENSOARG00020023491 ENSOARG00020023656 ENSOARG00020024061 NOTCH4 (ENSOARG00020024075) ENSOARG00020024106 GPSM3 (ENSOARG00020024120) ENSOARG00020024137 AGER (ENSOARG00020024168) Bovinae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000157022 #10 ENSGT00940000172381 ENSGT00940000158558 #11 ENSGT00940000158702 ENSGT00950000183139.C #12 ENSGT00510000047513 #13 ENSGT00950000182849.B.c.a #14 ENSGT00940000158204.b #15 ENSGT00390000014178 #16 ENSGT00950000182935.B.b.d ENSGT00990000213154 ENSGT00390000001979 #18 ENSGT00940000158812 #19 ENSGT00940000157651 #20 ENSGT00530000063647.A.a #21 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b ##22 ENSGT00940000153095.g.b.b.e ##22 ENSGT00390000006348 #23 ENSGT00390000017606.a.b #24 ENSGT00510000047678 #25 ENSGT00940000154768.B #26 ENSGT00390000001723 #27 ENSGT00940000160452 #28 ENSGT00940000159176 #29 ENSGT00940000160824 #30 ENSGT00950000183193.A.c.b #31 ENSGT01030000234629.E.a.b #32 ENSGT00530000063937.b #33 ENSGT00390000008964 #34 ENSGT00940000161283 #35 ENSGT00940000153496.a.a #36 Bos ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000158025.a.a.b ENSGT00940000157022 #10 ENSGT00940000172381 ENSGT00940000158558 #11 ENSGT00940000158702 ENSGT00950000183139.C #12 ENSGT00510000047513 #13 ENSGT00950000182849.B.c.a #14 ENSGT00940000158204.b #15 ENSGT00390000014178 #16 ENSGT00950000182935.B.b.d ENSGT00390000001979 #18 ENSGT00940000158812 #19 ENSGT00940000157651 #20 ENSGT00530000063647.A.a #21 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b ##22 ENSGT00940000153095.g.b.b.e ##22 ENSGT00390000006348 #23 ENSGT00390000017606.a.b #24 ENSGT00510000047678 #25 ENSGT00940000154768.B #26 ENSGT00390000001723 #27 ENSGT00940000160452 #28 ENSGT00940000159176 #29 ENSGT00940000160824 #30 ENSGT00950000183193.A.c.b #31 ENSGT01030000234629.E.a.b #32 ENSGT00530000063937.b #33 ENSGT00390000008964 #34 ENSGT00940000161283 #35 ENSGT00940000153496.a.a #36 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000014795 #9 ENSGT00940000158025.a.a.b ENSGT00940000157022 #10 ENSGT00940000158558 #11 ENSGT00940000158702 ENSGT00950000183139.C #12 ENSGT00510000047513 #13 ENSGT00950000182849.B.c.a #14 ENSGT00940000158204.b #15 ENSGT00390000014178 #16 ENSGT00950000182935.B.b.d ENSGT00390000001979 #18 ENSGT00940000158812 #19 ENSGT00940000157651 #20 ENSGT00530000063647.A.a #21 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b ##22 ENSGT00390000006348 #23 ENSGT00390000017606.a.b #24 ENSGT00510000047678 #25 ENSGT00940000154768.B #26 ENSGT00390000001723 #27 ENSGT00940000160452 #28 ENSGT00940000159176 #29 ENSGT00940000160824 #30 ENSGT00950000183193.A.c.b #31 ENSGT01030000234629.E.a.b #32 ENSGT00530000063937.b #33 ENSGT00390000008964 #34 ENSGT00940000161283 #35 ENSGT00940000153496.a.a #36 ENSGT00390000007652 #37 Cow MODERN SPECIES 17 BRICD5 (ENSBTAG00000009945) #8 MLST8 (ENSBTAG00000009928) #9 CASKIN1 (ENSBTAG00000037945) TRAF7 (ENSBTAG00000019073) #10 RAB26 (ENSBTAG00000000279) #11 TSC2 (ENSBTAG00000020617) #12 NTHL1 (ENSBTAG00000006272) #13 NHERF2 (ENSBTAG00000013479) #14 ENSBTAG00000054368 #15 ZNF598 (ENSBTAG00000001023) #16 SYNGR3 (ENSBTAG00000008504) GFER (ENSBTAG00000017631) #18 NOXO1 (ENSBTAG00000020369) #19 TBL3 (ENSBTAG00000020366) #20 RNF151 (ENSBTAG00000009536) #21 RPS2 (ENSBTAG00000009535) ##22 NDUFB10 (ENSBTAG00000009534) #23 RPL3L (ENSBTAG00000009533) #24 MSRB1 (ENSBTAG00000049306) #25 HS3ST6 (ENSBTAG00000019249) #26 MEIOB (ENSBTAG00000020001) #27 FAHD1 (ENSBTAG00000033015) #28 HAGH (ENSBTAG00000019998) #29 IGFALS (ENSBTAG00000033299) #30 NUBP2 (ENSBTAG00000016561) #31 SPSB3 (ENSBTAG00000016558) #32 EME2 (ENSBTAG00000016553) #33 MRPS34 (ENSBTAG00000026415) #34 NME3 (ENSBTAG00000016552) #35 ENSBTAG00000052060 MAPK8IP3 (ENSBTAG00000002211) #36 Yarkand deer MODERN SPECIES 5 PRRC2C (ENSCHYG00000018041) ENSCHYG00000020108 MYOC (ENSCHYG00000020117) VAMP4 (ENSCHYG00000020162) METTL13 (ENSCHYG00000020262) DNM3 (ENSCHYG00000020411) C1orf105 (ENSCHYG00000021065) PIGC (ENSCHYG00000021156) SUCO (ENSCHYG00000021243) FASLG (ENSCHYG00000022297) TNFSF18 (ENSCHYG00000022342) TNFSF4 (ENSCHYG00000022372) ENSCHYG00000022436 DHRS3 (ENSCHYG00000022549) VPS13D (ENSCHYG00000022820) ENSCHYG00000022959 ##22 TNFRSF1B (ENSCHYG00000022986) TNFRSF8 (ENSCHYG00000023087) MIIP (ENSCHYG00000023152) MFN2 (ENSCHYG00000023199) PLOD1 (ENSCHYG00000023285) KIAA2013 (ENSCHYG00000023400) NPPB (ENSCHYG00000023446) NPPA (ENSCHYG00000023469) CLCN6 (ENSCHYG00000023540) MTHFR (ENSCHYG00000023684) ENSCHYG00000023805 DRAXIN (ENSCHYG00000023992) MAD2L2 (ENSCHYG00000024028) FBXO6 (ENSCHYG00000024087) FBXO44 (ENSCHYG00000024107) Camelidae ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00390000014795 #9 ENSGT00940000158025.a.a.b ENSGT00940000157022 #10 ENSGT00940000158558 #11 ENSGT00940000158702 ENSGT00950000183139.C #12 ENSGT00510000047513 #13 ENSGT00950000182849.B.c.a #14 ENSGT00940000158204.b #15 ENSGT00390000014178 #16 ENSGT00950000182935.B.b.d ENSGT00390000001979 #18 ENSGT00940000158812 #19 ENSGT00940000157651 #20 ENSGT00530000063647.A.a #21 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b ##22 ENSGT00390000006348 #23 ENSGT00390000017606.a.b #24 ENSGT00510000047678 #25 ENSGT00940000154768.B #26 ENSGT00390000001723 #27 ENSGT00940000160452 #28 ENSGT00940000159176 #29 ENSGT00940000160824 #30 ENSGT00950000183193.A.c.b #31 ENSGT01030000234629.E.a.b #32 ENSGT00530000063937.b #33 ENSGT00390000008964 #34 ENSGT00940000161283 #35 ENSGT00940000153496.a.a #36 ENSGT00390000007652 #37 Alpaca MODERN SPECIES 791 RNF151 (ENSVPAG00000006868) #21 RPS2 (ENSVPAG00000006867) ##22 NDUFB10 (ENSVPAG00000006866) #23 Arabian camel MODERN SPECIES 41 MLST8 (ENSCDRG00005015274) #9 CASKIN1 (ENSCDRG00005015185) TRAF7 (ENSCDRG00005015066) #10 RAB26 (ENSCDRG00005014973) #11 PKD1 (ENSCDRG00005014572) TSC2 (ENSCDRG00005013847) #12 NTHL1 (ENSCDRG00005013746) #13 NHERF2 (ENSCDRG00005013637) #14 NPW (ENSCDRG00005013571) #15 ZNF598 (ENSCDRG00005013508) #16 SYNGR3 (ENSCDRG00005013426) GFER (ENSCDRG00005013367) #18 NOXO1 (ENSCDRG00005013253) #19 TBL3 (ENSCDRG00005013168) #20 RNF151 (ENSCDRG00005013092) #21 RPS2 (ENSCDRG00005012917) ##22 NDUFB10 (ENSCDRG00005012823) #23 RPL3L (ENSCDRG00005012772) #24 MSRB1 (ENSCDRG00005012709) #25 HS3ST6 (ENSCDRG00005012599) #26 ENSCDRG00005012343 #27 FAHD1 (ENSCDRG00005012307) #28 HAGH (ENSCDRG00005012164) #29 IGFALS (ENSCDRG00005012131) #30 NUBP2 (ENSCDRG00005012000) #31 SPSB3 (ENSCDRG00005011937) #32 EME2 (ENSCDRG00005011861) #33 MRPS34 (ENSCDRG00005011817) #34 NME3 (ENSCDRG00005011755) #35 MAPK8IP3 (ENSCDRG00005011576) #36 JPT2 (ENSCDRG00005011470) #37 Suina ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00390000014795 #9 ENSGT00940000158025.a.a.b ENSGT00940000157022 #10 ENSGT00940000158558 #11 ENSGT00940000158702 ENSGT00950000183139.C #12 ENSGT00510000047513 #13 ENSGT00950000182849.B.c.a #14 ENSGT00940000158204.b #15 ENSGT00390000014178 #16 ENSGT00950000182935.B.b.d ENSGT00390000001979 #18 ENSGT00940000158812 #19 ENSGT00940000157651 #20 ENSGT00530000063647.A.a #21 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.b ##22 ENSGT00390000006348 #23 ENSGT00390000017606.a.b #24 ENSGT00510000047678 #25 ENSGT00940000154768.B #26 ENSGT00390000001723 #27 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AARSD1 (ENSSSCG00000037979) G6PC1 (ENSSSCG00000036449) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00390000014795 #9 ENSGT00940000158025.a.a.b ENSGT00940000157022 #10 ENSGT00940000158558 #11 ENSGT00940000158702 ENSGT00950000183139.C #12 ENSGT00510000047513 #13 ENSGT00950000182849.B.c.a #14 ENSGT00940000167821 ENSGT00390000014178 #16 ENSGT00950000182935.B.b.d ENSGT00390000001979 #18 ENSGT00940000158812 #19 ENSGT00940000157651 #20 ENSGT00530000063647.A.a #21 ENSGT00940000153095.g.b.a.a #22 ENSGT00390000006348 #23 ENSGT00390000017606.a.b #24 ENSGT00510000047678 #25 ENSGT00940000154768.B #26 ENSGT00390000001723 #27 ENSGT00940000160452 #28 ENSGT00940000159176 #29 ENSGT00940000160824 #30 ENSGT00950000183193.A.c.b #31 ENSGT01030000234629.E.a.b #32 ENSGT00530000063937.b #33 ENSGT00390000008964 #34 ENSGT00940000161283 #35 ENSGT00940000153496.a.a #36 ENSGT00390000007652 #37 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153095.g.b.a.a #22 Armadillo MODERN SPECIES 4499 FDPS (ENSDNOG00000041417) PKLR 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ENSGT00940000154768.B #26 ENSGT00390000001723 #27 ENSGT00940000160452 #28 ENSGT00940000159176 #29 ENSGT00940000160824 #30 ENSGT00950000183193.A.c.b #31 ENSGT01030000234629.E.a.b #32 ENSGT00530000063937.b #33 ENSGT00390000008964 #34 ENSGT00940000161283 #35 ENSGT00940000153496.a.a #36 ENSGT00390000007652 #37 Tenrec MODERN SPECIES 3719 ENSETEG00000017157 #22 NDUFB10 (ENSETEG00000017154) #23 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00390000014795 #9 ENSGT00940000158025.a.a.b ENSGT00940000157022 #10 ENSGT00940000158558 #11 ENSGT00940000158702 ENSGT00950000183139.C #12 ENSGT00510000047513 #13 ENSGT00950000182849.B.c.a #14 ENSGT00940000167821 ENSGT00390000014178 #16 ENSGT00950000182935.B.b.d ENSGT00390000001979 #18 ENSGT00940000158812 #19 ENSGT00940000157651 #20 ENSGT00530000063647.A.a #21 ENSGT00940000153095.g.b.a.a #22 ENSGT00390000006348 #23 ENSGT00390000017606.a.b #24 ENSGT00510000047678 #25 ENSGT00940000154768.B #26 ENSGT00390000001723 #27 ENSGT00940000160452 #28 ENSGT00940000159176 #29 ENSGT00940000160824 #30 ENSGT00950000183193.A.c.b #31 ENSGT01030000234629.E.a.b #32 ENSGT00530000063937.b #33 ENSGT00390000008964 #34 ENSGT00940000161283 #35 ENSGT00940000153496.a.a #36 ENSGT00390000007652 #37 Hyrax MODERN SPECIES 6996 ENSPCAG00000002388 #16 SYNGR3 (ENSPCAG00000002354) GFER (ENSPCAG00000002339) #18 ENSPCAG00000002250 #19 TBL3 (ENSPCAG00000002157) #20 RNF151 (ENSPCAG00000002119) #21 RPS2 (ENSPCAG00000002090) #22 NDUFB10 (ENSPCAG00000002050) #23 RPL3L (ENSPCAG00000002019) #24 ENSPCAG00000001968 #25 Elephant DUPLICATION Elephant MODERN SPECIES 442 MLST8 (ENSLAFG00000004310) #9 CASKIN1 (ENSLAFG00000015465) TRAF7 (ENSLAFG00000015455) #10 RAB26 (ENSLAFG00000021466) #11 PKD1 (ENSLAFG00000015438) TSC2 (ENSLAFG00000015424) #12 NTHL1 (ENSLAFG00000015421) #13 NHERF2 (ENSLAFG00000004276) #14 ENSLAFG00000022592 ZNF598 (ENSLAFG00000026781) #16 SYNGR3 (ENSLAFG00000026399) GFER (ENSLAFG00000028685) #18 ENSLAFG00000004707 #19 TBL3 (ENSLAFG00000004699) #20 RNF151 (ENSLAFG00000030860) 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