Theria DUPLICATION Theria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263710 ENSGT00940000177252 ENSGT00940000155574.C ENSGT00940000156148 ENSGT00940000153845.a.b ENSGT00390000009163 ENSGT00940000153814.a ENSGT00390000010260 ENSGT00950000182942.a.a ENSGT01020000230359.C.b ##18 ENSGT01020000230359.A #18 ENSGT01020000230359.B ##18 ENSGT00550000075117 #20 ENSGT00950000183099.u.a ##22 ENSGT00940000164532 #21 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a #22 ENSGT01050000244942.b.a.b ENSGT00950000183099.v ##22 ENSGT00950000183138.a.a.b #24 ENSGT00940000160239 #25 ENSGT00390000003571 #34 ENSGT00940000155697.A #33 ENSGT00940000156541 #31 ENSGT00940000155471.d.h #30 ENSGT00390000001296 ENSGT00940000156463 ENSGT00390000012690 ENSGT01050000244939.b ENSGT00940000155721 ENSGT00950000183130.C ENSGT00950000183186.B.b Eutheria DUPLICATION Eutheria ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000160677 #8 ENSGT00940000161691 #9 ENSGT01030000235089 ENSGT00940000154992.b #10 ENSGT00940000161553 #11 ENSGT00920000149157 #13 ENSGT00390000008686.c #14 ENSGT00390000005979.a #15 ENSGT00950000183072.a #16 ENSGT00530000063779.B #17 ENSGT01020000230359.A #18 ENSGT01020000230359.B ##18 ENSGT00550000075117 #20 ENSGT00950000183099.u.a ##22 ENSGT00940000164532 #21 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b #22 ENSGT00950000183099.u.b.a.b ##22 ENSGT00950000183138.a.a.a #23 ENSGT00950000183138.a.a.b #24 ENSGT00940000160239 #25 Boreoeutheria DUPLICATION Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT01030000235089 ENSGT00940000161691 #9 ENSGT00940000154992.b #10 ENSGT01030000235508 ENSGT00940000161553 #11 ENSGT00920000149157 #13 ENSGT00390000008686.c #14 ENSGT00390000005979.a #15 ENSGT00950000183072.a #16 ENSGT00530000063779.B #17 ENSGT01020000230359.A #18 ENSGT01020000230359.B ##18 ENSGT00550000075117 #20 ENSGT00950000183099.u.a.e ##22 ENSGT00940000164532 #21 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a #23 ENSGT00950000183138.a.a.b #24 ENSGT00940000160239 #25 ENSGT01100000263542.A #26 ENSGT00390000007888.d #27 ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 #29 ENSGT00940000155471.d.h #30 ENSGT00940000156541 #31 ENSGT00940000155697.A #33 ENSGT00390000003571 #34 ENSGT00940000162293 #35 ENSGT00940000156402.B #36 ENSGT00940000159338 #37 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000160677 #8 ENSGT01030000235089 ENSGT00940000161691 #9 ENSGT00940000154992.b #10 ENSGT01030000235508 ENSGT00940000161553 #11 ENSGT00920000149157 #13 ENSGT00390000008686.c #14 ENSGT00390000005979.a #15 ENSGT00950000183072.a #16 ENSGT00530000063779.B #17 ENSGT01020000230359.A #18 ENSGT01020000230359.B ##18 ENSGT00550000075117 #20 ENSGT00940000164532 #21 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a #23 ENSGT00950000183138.a.a.b #24 ENSGT00940000160239 #25 ENSGT01100000263542.A #26 ENSGT00390000007888.d #27 ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 #29 ENSGT00940000155471.d.h #30 ENSGT00940000156541 #31 ENSGT00940000155697.A #33 ENSGT00390000003571 #34 ENSGT00940000162293 #35 ENSGT00940000156402.B #36 ENSGT00940000159338 #37 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000160677 #8 ENSGT01030000235089 ENSGT00940000161691 #9 ENSGT00940000154992.b #10 ENSGT01030000235508 ENSGT00940000161553 #11 ENSGT00920000149157 #13 ENSGT00390000008686.c #14 ENSGT00390000005979.a #15 ENSGT00950000183072.a #16 ENSGT00530000063779.B #17 ENSGT01020000230359.A #18 ENSGT01020000230359.B ##18 ENSGT00550000075117 #20 ENSGT00940000164532 #21 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a #23 ENSGT00950000183138.a.a.b #24 ENSGT00940000160239 #25 ENSGT01100000263542.A #26 ENSGT00390000007888.d #27 ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 #29 ENSGT00940000155471.d.h #30 ENSGT00940000156541 #31 ENSGT00940000155697.A #33 ENSGT00390000003571 #34 ENSGT00940000162293 #35 ENSGT00940000156402.B #36 ENSGT00940000159338 #37 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000160677 #8 ENSGT00940000161691 #9 ENSGT01030000235089 ENSGT00940000154992.b #10 ENSGT01030000235508 ENSGT00940000161553 #11 ENSGT00920000149157 #13 ENSGT00390000008686.c #14 ENSGT00390000005979.a #15 ENSGT00950000183072.a #16 ENSGT00530000063779.B #17 ENSGT01020000230359.A #18 ENSGT01020000230359.B ##18 ENSGT00550000075117 #20 ENSGT00940000164532 #21 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a #23 ENSGT00950000183138.a.a.b #24 ENSGT00940000160239 #25 ENSGT01100000263542.A #26 ENSGT00390000007888.d #27 ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 #29 ENSGT00940000155471.d.h #30 ENSGT00940000156541 #31 ENSGT00940000155697.A #33 ENSGT00390000003571 #34 ENSGT00940000162293 #35 ENSGT00940000156402.B #36 ENSGT00940000159338 #37 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000160677 #8 ENSGT00940000161691 #9 ENSGT01030000235089 ENSGT00940000154992.b #10 ENSGT01030000235508 ENSGT00940000161553 #11 ENSGT00920000149157 #13 ENSGT00390000008686.c #14 ENSGT00390000005979.a #15 ENSGT00950000183072.a #16 ENSGT00530000063779.B #17 ENSGT01020000230359.A #18 ENSGT01020000230359.B ##18 ENSGT00550000075117 #20 ENSGT00940000164532 #21 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a #23 ENSGT00950000183138.a.a.b #24 ENSGT00940000160239 #25 ENSGT01100000263542.A #26 ENSGT00390000007888.d #27 ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 #29 ENSGT00940000155471.d.h #30 ENSGT00940000156541 #31 ENSGT00940000155697.A #33 ENSGT00390000003571 #34 ENSGT00940000162293 #35 ENSGT00940000156402.B #36 ENSGT00940000159338 #37 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000161691 #9 ENSGT01030000235089 ENSGT00940000154992.b #10 ENSGT01030000235508 ENSGT00940000161553 #11 ENSGT00920000149157 #13 ENSGT00390000008686.c #14 ENSGT00390000005979.a #15 ENSGT00950000183072.a #16 ENSGT00530000063779.B #17 ENSGT01020000230359.A #18 ENSGT01020000230359.B ##18 ENSGT00910000146711 #19 ENSGT00550000075117 #20 ENSGT00940000164532 #21 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a #23 ENSGT00950000183138.a.a.b #24 ENSGT00940000160239 #25 ENSGT01100000263542.A #26 ENSGT00390000007888.d #27 ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 #29 ENSGT00940000155471.d.h #30 ENSGT00940000156541 #31 ENSGT00940000155697.A #33 ENSGT00390000003571 #34 ENSGT00940000162293 #35 ENSGT00940000156402.B #36 ENSGT00940000159338 #37 Pecora ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000160677 #8 ENSGT00940000161691 #9 ENSGT00940000154992.b #10 ENSGT01030000235508 ENSGT00940000161553 #11 ENSGT00920000149157 #13 ENSGT00390000008686.c #14 ENSGT00390000005979.a #15 ENSGT00950000183072.a #16 ENSGT00530000063779.B #17 ENSGT01020000230359.A #18 ENSGT01020000230359.B ##18 ENSGT00910000146711 #19 ENSGT00550000075117 #20 ENSGT00940000164532 #21 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a #23 ENSGT00950000183138.a.a.b #24 ENSGT00940000160239 #25 ENSGT01100000263542.A #26 ENSGT00390000007888.d #27 ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163271.k.b #28 ENSGT00940000163271.k.a #29 ENSGT00940000155471.d.h #30 ENSGT00940000156541 #31 ENSGT00940000155697.A #33 ENSGT00390000003571 #34 ENSGT00940000162293 #35 ENSGT00940000156402.B #36 ENSGT00940000159338 #37 Percora_a ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000156210 #7 ENSGT00940000160677 #8 ENSGT00940000161691 #9 ENSGT00940000154992.b #10 ENSGT01030000235508 ENSGT00940000161553 #11 ENSGT00920000149157 #13 ENSGT00390000008686.c #14 ENSGT00390000005979.a #15 ENSGT00950000183072.a #16 ENSGT00530000063779.B #17 ENSGT01020000230359.A #18 ENSGT00910000146711 #19 ENSGT00550000075117 #20 ENSGT00940000164532 #21 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a #23 ENSGT00950000183138.a.a.b #24 ENSGT00940000160239 #25 ENSGT01100000263542.A #26 ENSGT00390000007888.d.c.b #27 ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163271.k.b #28 ENSGT00940000163271.k.a #29 ENSGT00940000155471.d.h #30 ENSGT00940000156541 #31 ENSGT00940000155697.A #33 ENSGT00390000003571 #34 ENSGT00940000162293 #35 ENSGT00940000156402.B #36 ENSGT00940000159338 #37 Bovidae ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000160677 #8 ENSGT00940000161691 #9 ENSGT00940000154992.b #10 ENSGT01030000235508 ENSGT00940000161553 #11 ENSGT00920000149157 #13 ENSGT00390000008686.c #14 ENSGT00390000005979.a #15 ENSGT00950000183072.a #16 ENSGT00530000063779.B #17 ENSGT01020000230359.A #18 ENSGT01020000230359.B ##18 ENSGT00910000146711 #19 ENSGT00550000075117 #20 ENSGT00940000164532 #21 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a #23 ENSGT00950000183138.a.a.b #24 ENSGT00940000160239 #25 ENSGT01100000263542.A #26 ENSGT00390000007888.d.c.b #27 ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163271.k.b #28 ENSGT00940000163271.k.a #29 ENSGT00940000155471.d.h #30 ENSGT00940000156541 #31 ENSGT00940000155697.A #33 ENSGT00390000003571 #34 ENSGT00940000162293 #35 ENSGT00940000156402.B #36 ENSGT00940000159338 #37 Caprinae DUPLICATION Caprinae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000156210 #7 ENSGT00940000160677 #8 ENSGT00940000161691 #9 ENSGT00940000154992.b #10 ENSGT00940000161553 #11 ENSGT00390000003022.h #12 ENSGT00920000149157 #13 ENSGT00390000008686.c #14 ENSGT00390000005979.a #15 ENSGT00950000183072.a #16 ENSGT00530000063779.B #17 ENSGT01020000230359.A #18 ENSGT01020000230359.B ##18 ENSGT00550000075117 #20 ENSGT00940000164532 #21 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a #23 ENSGT00950000183138.a.a.b #24 ENSGT00940000160239 #25 ENSGT01100000263542.A #26 ENSGT00390000007888.d.c.b #27 ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163271.k.a #29 ENSGT00940000155471.d.h #30 ENSGT00940000156541 #31 ENSGT00940000155697.A #33 ENSGT00390000003571 #34 ENSGT00940000162293 #35 ENSGT00940000156402.B #36 ENSGT00940000159338 #37 ENSGT00940000160407.e.a.b Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 10 ACVR2B (ENSOARG00020010379) #7 EXOG (ENSOARG00020010558) #8 SCN5A (ENSOARG00020010796) #9 SCN10A (ENSOARG00020016009) #10 SCN11A (ENSOARG00020016401) #11 ENSOARG00020017210 #12 WDR48 (ENSOARG00020017277) #13 GORASP1 (ENSOARG00020017397) #14 TTC21A (ENSOARG00020017528) #15 CSRNP1 (ENSOARG00020017752) #16 ENSOARG00020017791 #17 CX3CR1 (ENSOARG00020017818) #18 ENSOARG00020017853 #19 SLC25A38 (ENSOARG00020017915) #20 ENSOARG00020018132 #21 RPSA (ENSOARG00020018166) #22 MOBP (ENSOARG00020018246) #23 MYRIP (ENSOARG00020018291) #24 EIF1B (ENSOARG00020018597) #25 ENTPD3 (ENSOARG00020018647) #26 RPL14 (ENSOARG00020018769) #27 ENSOARG00020018919 #28 ENSOARG00020018961 #29 CTNNB1 (ENSOARG00020019145) #30 ULK4 (ENSOARG00020019556) #31 ENSOARG00020019793 #32 TRAK1 (ENSOARG00020019973) #33 CCK (ENSOARG00020021710) #34 LYZL4 (ENSOARG00020021737) #35 VIPR1 (ENSOARG00020021791) #36 SEC22C (ENSOARG00020022269) #37 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.a ##22 Goat MODERN SPECIES 14 ACVR2B (ENSCHIG00000013125) #7 EXOG (ENSCHIG00000013450) #8 SCN5A (ENSCHIG00000015851) #9 SCN10A (ENSCHIG00000009678) #10 SCN11A (ENSCHIG00000021823) #11 ENSCHIG00000024599 #12 WDR48 (ENSCHIG00000009086) #13 GORASP1 (ENSCHIG00000013463) #14 TTC21A (ENSCHIG00000018055) #15 CSRNP1 (ENSCHIG00000021961) #16 XIRP1 (ENSCHIG00000012180) #17 CX3CR1 (ENSCHIG00000007770) #18 CCR8 (ENSCHIG00000006778) ##18 SLC25A38 (ENSCHIG00000022960) #20 ENSCHIG00000019656 #21 RPSA (ENSCHIG00000011924) ##22 MOBP (ENSCHIG00000011974) #23 MYRIP (ENSCHIG00000020641) #24 EIF1B (ENSCHIG00000022430) #25 ENSCHIG00000011303 ENTPD3 (ENSCHIG00000023900) #26 ENSCHIG00000019403 #27 ENSCHIG00000015104 ZNF621 (ENSCHIG00000025599) #29 CTNNB1 (ENSCHIG00000025557) #30 ULK4 (ENSCHIG00000013341) #31 TRAK1 (ENSCHIG00000010986) #33 CCK (ENSCHIG00000018036) #34 LYZL4 (ENSCHIG00000015680) #35 VIPR1 (ENSCHIG00000021318) #36 SEC22C (ENSCHIG00000009698) #37 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 15 SS18 (ENSOARG00020025456) ZNF521 (ENSOARG00020025499) HRH4 (ENSOARG00020025511) ENSOARG00020025524 OSBPL1A (ENSOARG00020025534) CABYR (ENSOARG00020025548) TTC39C (ENSOARG00020025558) LAMA3 (ENSOARG00020025616) ANKRD29 (ENSOARG00020025754) ENSOARG00020025767 RMC1 (ENSOARG00020025860) RIOK3 (ENSOARG00020025882) TMEM241 (ENSOARG00020025890) CABLES1 (ENSOARG00020025896) ENSOARG00020025903 ENSOARG00020025909 ##22 GATA6 (ENSOARG00020025920) MIB1 (ENSOARG00020025946) ABHD3 (ENSOARG00020006344) SNRPD1 (ENSOARG00020006388) ESCO1 (ENSOARG00020006426) GREB1L (ENSOARG00020006670) ENSOARG00020007128 ROCK1 (ENSOARG00020007167) ENSOARG00020007491 USP14 (ENSOARG00020007526) THOC1 (ENSOARG00020007727) ENSOARG00020008122 COLEC12 (ENSOARG00020008142) CETN1 (ENSOARG00020008212) CLUL1 (ENSOARG00020008252) Bovinae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000156210 #7 ENSGT00940000160677 #8 ENSGT00940000161691 #9 ENSGT00940000154992.b #10 ENSGT01030000235508 ENSGT00940000161553 #11 ENSGT00920000149157 #13 ENSGT00390000008686.c #14 ENSGT00390000005979.a #15 ENSGT00950000183072.a #16 ENSGT00530000063779.B.f #17 ENSGT01020000230359.A #18 ENSGT00910000146711 #19 ENSGT00550000075117 #20 ENSGT00940000164532 #21 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a #23 ENSGT00950000183138.a.a.b #24 ENSGT00940000160239 #25 ENSGT01100000263542.A #26 ENSGT00390000007888.d.c.b #27 ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163271.k.b #28 ENSGT00940000163271.k.a #29 ENSGT00940000155471.d.h #30 ENSGT00940000156541 #31 ENSGT00940000155697.A #33 ENSGT00390000003571 #34 ENSGT00940000162293 #35 ENSGT00940000156402.B #36 ENSGT00940000159338 #37 Bos ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT01100000263480.a.a.b.b.b.a.a.a.a.a.b.b.a.a.b.a.b ENSGT00940000160677 #8 ENSGT00940000161691 #9 ENSGT00940000154992.b #10 ENSGT01030000235508 ENSGT00940000161553 #11 ENSGT00920000149157 #13 ENSGT00390000008686.c #14 ENSGT00390000005979.a #15 ENSGT00950000183072.a #16 ENSGT00530000063779.B.f #17 ENSGT01020000230359.A #18 ENSGT00910000146711 #19 ENSGT00550000075117 #20 ENSGT00940000164532 #21 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a #23 ENSGT00950000183138.a.a.b #24 ENSGT00940000160239 #25 ENSGT01100000263542.A #26 ENSGT00390000007888.d.c.b #27 ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163271.k.b #28 ENSGT00940000163271.k.a #29 ENSGT00940000155471.d.h #30 ENSGT00940000156541 #31 ENSGT00940000155697.A #33 ENSGT00390000003571 #34 ENSGT00940000162293 #35 ENSGT00940000156402.B #36 ENSGT00940000159338 #37 Bos_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT01100000263480.a.a.b.b.b.a.a.a.a.a.b.b.a.a.b.a.b ENSGT00940000160677 #8 ENSGT00940000161691 #9 ENSGT00940000154992.b #10 ENSGT01030000235508 ENSGT00940000161553 #11 ENSGT00920000149157 #13 ENSGT00390000008686.c #14 ENSGT00390000005979.a #15 ENSGT00950000183072.a #16 ENSGT00530000063779.B.e #17 ENSGT01020000230359.A #18 ENSGT00910000146711 #19 ENSGT00550000075117 #20 ENSGT00940000164532 #21 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a #23 ENSGT00950000183138.a.a.b #24 ENSGT00940000160239 #25 ENSGT01100000263542.A #26 ENSGT00390000007888.d.c.b #27 ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163271.k.b #28 ENSGT00940000163271.k.a #29 ENSGT00940000155471.d.h #30 ENSGT00940000156541 #31 ENSGT00940000155697.A #33 ENSGT00390000003571 #34 ENSGT00940000162293 #35 ENSGT00940000156402.B #36 ENSGT00940000159338 #37 Wild yak MODERN SPECIES 2473 CX3CR1 (ENSBMUG00000024370) #18 ENSBMUG00000024360 #19 SLC25A38 (ENSBMUG00000024350) #20 ENSBMUG00000024316 #21 ENSBMUG00000024306 #22 ENSBMUG00000024295 #23 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT01100000263480.a.a.b.b.b.a.a.a.a.a.b.b.a.a.b.a.b ENSGT00940000160677 #8 ENSGT00940000161691 #9 ENSGT00940000154992.b #10 ENSGT00940000161553 #11 ENSGT00920000149157 #13 ENSGT00390000008686.c #14 ENSGT00390000005979.a.e #15 ENSGT00950000183072.a #16 ENSGT00530000063779.B.f #17 ENSGT01020000230359.A #18 ENSGT01020000230359.B ##18 ENSGT00910000146711 #19 ENSGT00550000075117 #20 ENSGT00940000164532 #21 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a #23 ENSGT00950000183138.a.a.b #24 ENSGT00940000160239 #25 ENSGT01100000263542.A #26 ENSGT00390000007888.d.c.b #27 ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163271.k.b #28 ENSGT00940000163271.k.a #29 ENSGT00390000005727.a.b.b.b ENSGT00940000155471.d.h #30 ENSGT00940000156541 #31 ENSGT00940000155697.A #33 ENSGT00390000003571 #34 ENSGT00940000162293 #35 ENSGT00940000156402.B #36 Cow MODERN SPECIES 14 SCN5A (ENSBTAG00000009155) #9 SCN10A (ENSBTAG00000046911) #10 ENSBTAG00000054304 SCN11A (ENSBTAG00000017174) #11 WDR48 (ENSBTAG00000003745) #13 GORASP1 (ENSBTAG00000047135) #14 ENSBTAG00000050991 #15 TTC21A (ENSBTAG00000010477) #15 CSRNP1 (ENSBTAG00000003845) #16 XIRP1 (ENSBTAG00000046512) #17 CX3CR1 (ENSBTAG00000002923) #18 CCR8 (ENSBTAG00000015483) ##18 ENSBTAG00000015493 SLC25A38 (ENSBTAG00000022721) #20 ENSBTAG00000009760 #21 RPSA (ENSBTAG00000009757) #22 MOBP (ENSBTAG00000009774) #23 MYRIP (ENSBTAG00000009430) #24 EIF1B (ENSBTAG00000019106) #25 ENTPD3 (ENSBTAG00000011702) #26 RPL14 (ENSBTAG00000002038) #27 ZNF619 (ENSBTAG00000053485) ZNF621 (ENSBTAG00000018057) #28 ENSBTAG00000051328 #29 ENSBTAG00000047441 CTNNB1 (ENSBTAG00000016420) #30 ULK4 (ENSBTAG00000051466) #31 TRAK1 (ENSBTAG00000016076) #33 CCK (ENSBTAG00000013027) #34 LYZL4 (ENSBTAG00000018601) #35 VIPR1 (ENSBTAG00000006567) #36 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 14 EXOG (ENSBIXG00005003960) #8 ENSBIXG00005023201 SCN5A (ENSBIXG00005023463) #9 SCN10A (ENSBIXG00005023600) #10 SCN11A (ENSBIXG00005023635) #11 ENSBIXG00005023676 WDR48 (ENSBIXG00005007700) #13 GORASP1 (ENSBIXG00005004080) #14 TTC21A (ENSBIXG00005023872) #15 CSRNP1 (ENSBIXG00005023914) #16 XIRP1 (ENSBIXG00005023938) #17 CX3CR1 (ENSBIXG00005023956) #18 ENSBIXG00005023987 #19 SLC25A38 (ENSBIXG00005024059) #20 ENSBIXG00005024087 #21 ENSBIXG00005006843 #22 ENSBIXG00005024218 #23 MYRIP (ENSBIXG00005024486) #24 EIF1B (ENSBIXG00005024534) #25 ENTPD3 (ENSBIXG00005004196) #26 RPL14 (ENSBIXG00005024687) #27 ZNF619 (ENSBIXG00005024710) ENSBIXG00005024722 #28 ENSBIXG00005024746 #29 ENSBIXG00005007703 CTNNB1 (ENSBIXG00005025197) #30 ULK4 (ENSBIXG00005006069) #31 TRAK1 (ENSBIXG00005025603) #33 CCK (ENSBIXG00005025665) #34 LYZL4 (ENSBIXG00005025686) #35 VIPR1 (ENSBIXG00005007738) #36 Siberian musk deer MODERN SPECIES 1219 XYLB (ENSMMSG00000023705) ACVR2B (ENSMMSG00000023695) #7 EXOG (ENSMMSG00000023688) #8 SCN5A (ENSMMSG00000022741) #9 SCN10A (ENSMMSG00000022570) #10 SCN11A (ENSMMSG00000022412) #11 WDR48 (ENSMMSG00000022352) #13 GORASP1 (ENSMMSG00000022272) #14 TTC21A (ENSMMSG00000022208) #15 CSRNP1 (ENSMMSG00000022195) #16 XIRP1 (ENSMMSG00000022179) #17 CX3CR1 (ENSMMSG00000022172) #18 ENSMMSG00000022155 #19 SLC25A38 (ENSMMSG00000022102) #20 ENSMMSG00000022074 #21 ENSMMSG00000022052 #22 ENSMMSG00000022042 #23 ENSMMSG00000022029 ENSMMSG00000022023 ENSMMSG00000022014 #24 ENSMMSG00000022000 Yarkand deer MODERN SPECIES 16 XYLB (ENSCHYG00000014630) EXOG (ENSCHYG00000014555) #8 SCN5A (ENSCHYG00000013862) #9 SCN10A (ENSCHYG00000026482) #10 SCN11A (ENSCHYG00000026462) #11 WDR48 (ENSCHYG00000026426) #13 GORASP1 (ENSCHYG00000026389) #14 TTC21A (ENSCHYG00000026333) #15 CSRNP1 (ENSCHYG00000026309) #16 XIRP1 (ENSCHYG00000026300) #17 CX3CR1 (ENSCHYG00000026290) #18 CCR8 (ENSCHYG00000026277) ##18 ENSCHYG00000026258 SLC25A38 (ENSCHYG00000026225) #20 ENSCHYG00000026190 #21 ENSCHYG00000026170 #22 ENSCHYG00000026157 #23 MYRIP (ENSCHYG00000026071) #24 EIF1B (ENSCHYG00000026039) #25 ENTPD3 (ENSCHYG00000026021) #26 ENSCHYG00000025964 #27 ZNF619 (ENSCHYG00000025932) CTNNB1 (ENSCHYG00000025881) #30 ENSCHYG00000025864 ULK4 (ENSCHYG00000025599) #31 TRAK1 (ENSCHYG00000025016) #33 CCK (ENSCHYG00000024972) #34 LYZL4 (ENSCHYG00000024963) #35 VIPR1 (ENSCHYG00000024690) #36 SEC22C (ENSCHYG00000024628) #37 ENSCHYG00000024603 Cetacea ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000153877.h.d ENSGT00390000012690 ENSGT00940000161691 #9 ENSGT01030000235089 ENSGT00940000154992.b #10 ENSGT00940000161553 #11 ENSGT00920000149157 #13 ENSGT00390000008686.c #14 ENSGT00390000005979.a #15 ENSGT00950000183072.a #16 ENSGT00530000063779.B #17 ENSGT01020000230359.A #18 ENSGT00910000146711 #19 ENSGT00550000075117 #20 ENSGT00940000164532 #21 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00950000183099.u.b.a.b ##22 ENSGT00950000183138.a.a.a #23 ENSGT00950000183138.a.a.b #24 ENSGT00940000160239 #25 ENSGT01100000263542.A #26 ENSGT00390000007888.d.i.b #27 ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 #29 ENSGT00940000155471.d.h #30 ENSGT00940000156541 #31 ENSGT00940000155697.A #33 ENSGT00390000003571 #34 ENSGT00940000162293 #35 ENSGT00940000156402.B #36 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000012690 ENSGT00940000161691 #9 ENSGT01030000235089 ENSGT00940000154992.b #10 ENSGT00940000161553 #11 ENSGT00920000149157 #13 ENSGT00390000008686.c #14 ENSGT00390000005979.a #15 ENSGT00950000183072.a #16 ENSGT00530000063779.B #17 ENSGT01020000230359.A #18 ENSGT00910000146711 #19 ENSGT01020000230359.B ##18 ENSGT00550000075117 #20 ENSGT00940000164532 #21 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00950000183099.u.b.a.b ##22 ENSGT00950000183138.a.a.a #23 ENSGT00950000183138.a.a.b #24 ENSGT00940000160239 #25 ENSGT01100000263542.A #26 ENSGT00390000007888.d.i.b #27 ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 #29 ENSGT00940000155471.d.h #30 ENSGT00940000156541 #31 ENSGT00940000155697.A #33 ENSGT00390000003571 #34 ENSGT00940000162293 #35 ENSGT00940000156402.B #36 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b #22 Odontoceti_b DUPLICATION Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000183128.C ENSGT00940000157848.e.a ENSGT00940000157848.f ENSGT00940000160477 ENSGT00390000011163.b ENSGT00940000158908.b ENSGT00940000156521.b ENSGT00390000012412 ENSGT00940000154813 ENSGT00940000157501 ENSGT00940000159887 ENSGT00390000019941 ENSGT00940000154746 ENSGT00390000012924.b ENSGT00940000156116.C ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.c #22 ENSGT00940000154656 ENSGT00940000158836 ENSGT00390000006996 ENSGT01030000234620.a.b.a ENSGT00730000111179.b ENSGT00940000159098 ENSGT00940000156540 ENSGT00530000063876.b ENSGT00940000159673 ENSGT00390000014353.r ENSGT00390000018691 ENSGT00940000156774 ENSGT00940000158220 ENSGT00390000004660.C.a.b ENSGT00940000162029.a Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00950000183128.C ENSGT00940000157848.f ENSGT00940000160477 ENSGT00390000011163.b ENSGT00390000000263.bb.a ENSGT00940000158908.b ENSGT00940000156521.b ENSGT00390000012412 ENSGT00940000154813 ENSGT00940000157501 ENSGT00940000159887 ENSGT00390000019941 ENSGT00940000154746 ENSGT00390000012924.b ENSGT00940000156116.C ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.c #22 ENSGT00940000154656 ENSGT00940000158836 ENSGT00390000006996 ENSGT01030000234620.a.b.a ENSGT00730000111179.b ENSGT00940000159098 ENSGT00940000156540 ENSGT00530000063876.b ENSGT00940000159673 ENSGT00390000014353.r ENSGT00390000018691 ENSGT00940000156774 ENSGT00940000158220 ENSGT00390000004660.C.a.b ENSGT00940000162029.a Beluga whale MODERN SPECIES 44 RAB15 (ENSDLEG00000012424) CHURC1 (ENSDLEG00000012447) ENSDLEG00000012452 SPTB (ENSDLEG00000012460) PLEKHG3 (ENSDLEG00000012540) PPP1R36 (ENSDLEG00000012637) HSPA2 (ENSDLEG00000012696) ZBTB1 (ENSDLEG00000012703) ZBTB25 (ENSDLEG00000012707) AKAP5 (ENSDLEG00000012713) MTHFD1 (ENSDLEG00000012725) ENSDLEG00000012778 ENSDLEG00000012832 ESR2 (ENSDLEG00000012898) SYNE2 (ENSDLEG00000014018) ENSDLEG00000018973 #22 ENSDLEG00000018986 SGPP1 (ENSDLEG00000018992) WDR89 (ENSDLEG00000019003) PPP2R5E (ENSDLEG00000019013) GPHB5 (ENSDLEG00000019078) RHOJ (ENSDLEG00000019097) KCNH5 (ENSDLEG00000019130) ENSDLEG00000019162 SYT16 (ENSDLEG00000006055) ENSDLEG00000006062 SNAPC1 (ENSDLEG00000006071) HIF1A (ENSDLEG00000006082) PRKCH (ENSDLEG00000006106) TMEM30B (ENSDLEG00000006124) MNAT1 (ENSDLEG00000006132) Vaquita MODERN SPECIES 11 FUT8 (ENSPSNG00000006781) MAX (ENSPSNG00000006586) FNTB (ENSPSNG00000006463) ENSPSNG00000006411 CHURC1 (ENSPSNG00000006344) ENSPSNG00000020417 PLEKHG3 (ENSPSNG00000014982) PPP1R36 (ENSPSNG00000014651) HSPA2 (ENSPSNG00000014566) ZBTB1 (ENSPSNG00000014501) ZBTB25 (ENSPSNG00000014448) AKAP5 (ENSPSNG00000014406) MTHFD1 (ENSPSNG00000014216) ENSPSNG00000014056 ESR2 (ENSPSNG00000013759) ENSPSNG00000013644 #22 SYNE2 (ENSPSNG00000013154) SGPP1 (ENSPSNG00000012953) WDR89 (ENSPSNG00000012922) PPP2R5E (ENSPSNG00000012853) GPHB5 (ENSPSNG00000012813) RHOJ (ENSPSNG00000012762) KCNH5 (ENSPSNG00000012407) ENSPSNG00000012344 SYT16 (ENSPSNG00000012248) ENSPSNG00000012202 SNAPC1 (ENSPSNG00000012156) HIF1A (ENSPSNG00000011918) PRKCH (ENSPSNG00000011826) TMEM30B (ENSPSNG00000011798) ENSPSNG00000011751 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.d #22 Vaquita MODERN SPECIES AXDND1 (ENSPSNG00000001188) SOAT1 (ENSPSNG00000001097) ENSPSNG00000001039 ABL2 (ENSPSNG00000000760) TOR3A (ENSPSNG00000000525) FAM20B (ENSPSNG00000000489) ANGPTL1 (ENSPSNG00000000465) RALGPS2 (ENSPSNG00000000423) ENSPSNG00000000387 RASAL2 (ENSPSNG00000000312) ENSPSNG00000000237 SEC16B (ENSPSNG00000000203) BRINP2 (ENSPSNG00000000181) ASTN1 (ENSPSNG00000000154) PAPPA2 (ENSPSNG00000019270) ENSPSNG00000019219 #22 COP1 (ENSPSNG00000019070) TNR (ENSPSNG00000018880) ENSPSNG00000018824 KIAA0040 (ENSPSNG00000018811) TNN (ENSPSNG00000018514) MRPS14 (ENSPSNG00000018472) CACYBP (ENSPSNG00000018413) ENSPSNG00000018370 RABGAP1L (ENSPSNG00000017901) ENSPSNG00000017787 RC3H1 (ENSPSNG00000017743) SERPINC1 (ENSPSNG00000017655) ZBTB37 (ENSPSNG00000017618) ENSPSNG00000017489 DARS2 (ENSPSNG00000017390) Sperm whale DUPLICATION Sperm whale MODERN SPECIES 9 CLEC3B (ENSPCTG00005011612) EXOSC7 (ENSPCTG00005011659) ZDHHC3 (ENSPCTG00005011704) TMEM42 (ENSPCTG00005011823) SCN5A (ENSPCTG00005011952) #9 ENSPCTG00005014664 SCN10A (ENSPCTG00005014713) #10 SCN11A (ENSPCTG00005016043) #11 WDR48 (ENSPCTG00005016928) #13 GORASP1 (ENSPCTG00005017015) #14 ENSPCTG00005017131 #15 CX3CR1 (ENSPCTG00005017212) #18 ENSPCTG00005017228 #19 SLC25A38 (ENSPCTG00005017289) #20 CASP14 (ENSPCTG00005017435) #21 RPSA (ENSPCTG00005017461) #22 MOBP (ENSPCTG00005017539) #23 MYRIP (ENSPCTG00005017591) #24 EIF1B (ENSPCTG00005018172) #25 ENTPD3 (ENSPCTG00005018201) #26 RPL14 (ENSPCTG00005018278) #27 ZNF619 (ENSPCTG00005018444) ZNF621 (ENSPCTG00005018557) #29 CTNNB1 (ENSPCTG00005018743) #30 ULK4 (ENSPCTG00005018938) #31 ENSPCTG00005019370 #33 VIPR1 (ENSPCTG00005019463) #36 LYZL4 (ENSPCTG00005019857) #35 CCK (ENSPCTG00005019893) #34 ENSPCTG00005019923 #33 NKTR (ENSPCTG00005019966) Sperm whale MODERN SPECIES 16 TMEM60 (ENSPCTG00005001230) PHTF2 (ENSPCTG00005001124) ENSPCTG00005001073 MAGI2 (ENSPCTG00005000500) GNAI1 (ENSPCTG00005000350) ENSPCTG00005000233 ENSPCTG00005005883 ENSPCTG00005005841 ENSPCTG00005004895 SEMA3C (ENSPCTG00005004733) ENSPCTG00005004706 HGF (ENSPCTG00005004562) ENSPCTG00005004525 CACNA2D1 (ENSPCTG00005004410) ENSPCTG00005004334 ENSPCTG00005004324 #22 PCLO (ENSPCTG00005004143) SEMA3E (ENSPCTG00005004045) SEMA3A (ENSPCTG00005004017) SEMA3D (ENSPCTG00005003987) GRM3 (ENSPCTG00005003962) KIAA1324L (ENSPCTG00005003874) DMTF1 (ENSPCTG00005003809) TMEM243 (ENSPCTG00005003771) CROT (ENSPCTG00005003742) ABCB4 (ENSPCTG00005003687) ABCB1 (ENSPCTG00005003552) ENSPCTG00005003512 RUNDC3B (ENSPCTG00005003383) SLC25A40 (ENSPCTG00005003323) DBF4 (ENSPCTG00005003288) Suina ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000156210 #7 ENSGT00940000160677 #8 ENSGT00940000161691 #9 ENSGT00940000154992.b #10 ENSGT00940000161553 #11 ENSGT00920000149157 #13 ENSGT00390000008686.c #14 ENSGT00390000005979.a #15 ENSGT00950000183072.a #16 ENSGT00530000063779.B #17 ENSGT01020000230359.A #18 ENSGT01020000230359.B ##18 ENSGT00550000075117 #20 ENSGT00940000164532 #21 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a #23 ENSGT00950000183138.a.a.b #24 ENSGT00940000160239 #25 ENSGT01100000263542.A #26 ENSGT00390000007888.d #27 ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163271 #29 ENSGT00940000155471.d.h #30 ENSGT00940000156541 #31 ENSGT00940000155697.A #33 ENSGT00390000003571 #34 ENSGT00940000162293 #35 ENSGT00940000156402.B #36 ENSGT00940000159338 #37 ENSGT00940000160407 Pig MODERN SPECIES 4 SLC22A14 (ENSSSCG00000011255) XYLB (ENSSSCG00000011254) ACVR2B (ENSSSCG00000011257) #7 EXOG (ENSSSCG00000011258) #8 SCN5A (ENSSSCG00000011259) #9 SCN10A (ENSSSCG00000011260) #10 SCN11A (ENSSSCG00000029419) #11 WDR48 (ENSSSCG00000011261) #13 GORASP1 (ENSSSCG00000034916) #14 TTC21A (ENSSSCG00000011263) #15 CSRNP1 (ENSSSCG00000011264) #16 CX3CR1 (ENSSSCG00000024024) #18 CCR8 (ENSSSCG00000052616) ##18 SLC25A38 (ENSSSCG00000029708) #20 ENSSSCG00000022773 #21 RPSA (ENSSSCG00000037236) #22 ENSSSCG00000061137 #23 ENSSSCG00000055206 MYRIP (ENSSSCG00000011269) #24 EIF1B (ENSSSCG00000011270) #25 ENTPD3 (ENSSSCG00000025783) #26 ENSSSCG00000011272 #27 ZNF619 (ENSSSCG00000056224) ZNF621 (ENSSSCG00000026550) #29 ENSSSCG00000034115 CTNNB1 (ENSSSCG00000011274) #30 ULK4 (ENSSSCG00000025408) #31 ENSSSCG00000060697 TRAK1 (ENSSSCG00000011278) #33 CCK (ENSSSCG00000011277) #34 LYZL4 (ENSSSCG00000011279) #35 Chacoan peccary MODERN SPECIES 950 ACVR2B (ENSCWAG00000021280) #7 EXOG (ENSCWAG00000021295) #8 SCN5A (ENSCWAG00000021403) #9 ENSCWAG00000021757 SCN10A (ENSCWAG00000021776) #10 SCN11A (ENSCWAG00000021830) #11 WDR48 (ENSCWAG00000021866) #13 GORASP1 (ENSCWAG00000021874) #14 TTC21A (ENSCWAG00000021887) #15 CSRNP1 (ENSCWAG00000021893) #16 XIRP1 (ENSCWAG00000011797) #17 CX3CR1 (ENSCWAG00000011841) #18 ENSCWAG00000011860 #19 SLC25A38 (ENSCWAG00000011913) #20 ENSCWAG00000012044 #21 ENSCWAG00000012084 #22 ENSCWAG00000012140 #23 MYRIP (ENSCWAG00000012203) #24 EIF1B (ENSCWAG00000013114) #25 ENTPD3 (ENSCWAG00000013162) #26 RPL14 (ENSCWAG00000013347) #27 ZNF619 (ENSCWAG00000013468) ZNF621 (ENSCWAG00000013577) #29 CTNNB1 (ENSCWAG00000013651) #30 ULK4 (ENSCWAG00000013817) #31 TRAK1 (ENSCWAG00000013964) #33 CCK (ENSCWAG00000014439) #34 LYZL4 (ENSCWAG00000014483) #35 VIPR1 (ENSCWAG00000014539) #36 SEC22C (ENSCWAG00000015009) #37 SS18L2 (ENSCWAG00000015052) Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000156210 #7 ENSGT00940000160677 #8 ENSGT01030000235089 ENSGT00940000161691 #9 ENSGT00940000154992.b #10 ENSGT00940000161553 #11 ENSGT00920000149157 #13 ENSGT00390000008686.c #14 ENSGT00390000005979.a #15 ENSGT00950000183072.a #16 ENSGT00530000063779.B #17 ENSGT01020000230359.A #18 ENSGT01020000230359.B ##18 ENSGT00550000075117 #20 ENSGT00940000164532 #21 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a #23 ENSGT00950000183138.a.a.b #24 ENSGT00940000160239 #25 ENSGT01100000263542.A #26 ENSGT00390000007888.d #27 ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 #29 ENSGT00940000155471.d.h #30 ENSGT00940000156541 #31 ENSGT00940000155697.A #33 ENSGT00390000003571 #34 ENSGT00940000162293 #35 ENSGT00940000156402.B #36 ENSGT00940000159338 #37 Carnivora ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000156210 #7 ENSGT00940000160677 #8 ENSGT00940000161691 #9 ENSGT01030000235089 ENSGT00940000154992.b #10 ENSGT00940000161553 #11 ENSGT00920000149157 #13 ENSGT00390000008686.c #14 ENSGT00390000005979.a #15 ENSGT00950000183072.a #16 ENSGT00530000063779.B #17 ENSGT01020000230359.A #18 ENSGT01020000230359.B ##18 ENSGT00550000075117 #20 ENSGT00940000164532 #21 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a #23 ENSGT00950000183138.a.a.b #24 ENSGT00940000160239 #25 ENSGT01100000263542.A #26 ENSGT00390000007888.d #27 ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 #29 ENSGT00940000155471.d.h #30 ENSGT00940000156541 #31 ENSGT00940000155697.A #33 ENSGT00390000003571 #34 ENSGT00940000162293 #35 ENSGT00940000156402.B #36 ENSGT00940000159338 #37 Felidae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000156210 #7 ENSGT00940000160677 #8 ENSGT00940000161691 #9 ENSGT01030000235089 ENSGT00940000154992.b #10 ENSGT00940000161553 #11 ENSGT00920000149157 #13 ENSGT00390000008686.c #14 ENSGT00390000005979.a #15 ENSGT00950000183072.a #16 ENSGT00530000063779.B #17 ENSGT01020000230359.A #18 ENSGT01020000230359.B ##18 ENSGT00550000075117 #20 ENSGT00940000164532 #21 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a #23 ENSGT00950000183138.a.a.b #24 ENSGT00940000160239 #25 ENSGT01100000263542.A #26 ENSGT00390000007888.d #27 ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 #29 ENSGT00940000155471.d.h #30 ENSGT00940000156541 #31 ENSGT00940000155697.A #33 ENSGT00390000003571 #34 ENSGT00940000162293 #35 ENSGT00940000156402.B #36 ENSGT00940000159338 #37 Panthera ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000160677 #8 ENSGT00940000161691 #9 ENSGT01030000235089 ENSGT00940000154992.b #10 ENSGT00940000161553 #11 ENSGT00920000149157 #13 ENSGT00390000008686.c #14 ENSGT00390000005979.a #15 ENSGT00950000183072.a #16 ENSGT00530000063779.B #17 ENSGT01020000230359.A #18 ENSGT01020000230359.B ##18 ENSGT00910000146711 #19 ENSGT00550000075117 #20 ENSGT00940000164532 #21 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a #23 ENSGT00950000183138.a.a.b #24 ENSGT00940000160239 #25 ENSGT01100000263542.A #26 ENSGT00390000007888.d #27 ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 #29 ENSGT00940000155471.d.h #30 ENSGT00940000156541 #31 ENSGT00940000155697.A #33 ENSGT00390000003571 #34 ENSGT00940000162293 #35 ENSGT00940000156402.B #36 ENSGT00940000159338 #37 Tiger MODERN SPECIES 154 SLC22A13 (ENSPTIG00000009287) SLC22A14 (ENSPTIG00000007241) XYLB (ENSPTIG00000005521) ACVR2B (ENSPTIG00000021345) #7 EXOG (ENSPTIG00000020710) #8 SCN5A (ENSPTIG00000021528) #9 SCN10A (ENSPTIG00000017282) #10 SCN11A (ENSPTIG00000020843) #11 WDR48 (ENSPTIG00000018512) #13 GORASP1 (ENSPTIG00000016523) #14 TTC21A (ENSPTIG00000012101) #15 CSRNP1 (ENSPTIG00000009070) #16 CX3CR1 (ENSPTIG00000000914) #18 ENSPTIG00000005887 #19 SLC25A38 (ENSPTIG00000003672) #20 ENSPTIG00000021559 #22 ENSPTIG00000020535 #23 MYRIP (ENSPTIG00000014970) #24 EIF1B (ENSPTIG00000013646) #25 ENTPD3 (ENSPTIG00000009762) #26 ENSPTIG00000005357 #27 ZNF620 (ENSPTIG00000000580) ZNF621 (ENSPTIG00000019358) #29 CTNNB1 (ENSPTIG00000018503) #30 ULK4 (ENSPTIG00000014770) #31 TRAK1 (ENSPTIG00000007626) #33 CCK (ENSPTIG00000005556) #34 LYZL4 (ENSPTIG00000003873) #35 VIPR1 (ENSPTIG00000018417) #36 SEC22C (ENSPTIG00000016459) #37 SS18L2 (ENSPTIG00000015760) Panthera_a ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000156210 #7 ENSGT00940000160677 #8 ENSGT00940000161691 #9 ENSGT01030000235089 ENSGT00940000154992.b #10 ENSGT00940000161553 #11 ENSGT00920000149157 #13 ENSGT00390000008686.c #14 ENSGT00390000005979.a #15 ENSGT00950000183072.a #16 ENSGT00530000063779.B #17 ENSGT01020000230359.A #18 ENSGT01020000230359.B ##18 ENSGT00550000075117 #20 ENSGT00940000164532 #21 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a #23 ENSGT00950000183138.a.a.b #24 ENSGT00940000160239 #25 ENSGT01100000263542.A #26 ENSGT00390000007888.d #27 ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 #29 ENSGT00940000155471.d.h #30 ENSGT00940000156541 #31 ENSGT00940000155697.A #33 ENSGT00390000003571 #34 ENSGT00940000162293 #35 ENSGT00940000156402.B #36 ENSGT00940000159338 #37 leopard MODERN SPECIES 75 XYLB (ENSPPRG00000019938) ACVR2B (ENSPPRG00000016504) #7 EXOG (ENSPPRG00000015275) #8 SCN5A (ENSPPRG00000013452) #9 SCN10A (ENSPPRG00000023044) #10 SCN11A (ENSPPRG00000023579) #11 WDR48 (ENSPPRG00000017067) #13 GORASP1 (ENSPPRG00000016191) #14 TTC21A (ENSPPRG00000012924) #15 CSRNP1 (ENSPPRG00000009370) #16 XIRP1 (ENSPPRG00000007282) #17 CX3CR1 (ENSPPRG00000021982) #18 ENSPPRG00000007218 #19 SLC25A38 (ENSPPRG00000006911) #20 ENSPPRG00000006587 #21 ENSPPRG00000005148 #22 ENSPPRG00000004754 #23 MYRIP (ENSPPRG00000004669) #24 EIF1B (ENSPPRG00000003963) #25 ENTPD3 (ENSPPRG00000003881) #26 ENSPPRG00000002588 #27 ZNF619 (ENSPPRG00000002147) ZNF620 (ENSPPRG00000021674) ZNF621 (ENSPPRG00000000848) #29 CTNNB1 (ENSPPRG00000000534) #30 ULK4 (ENSPPRG00000023886) #31 TRAK1 (ENSPPRG00000024585) #33 CCK (ENSPPRG00000010250) #34 LYZL4 (ENSPPRG00000010056) #35 VIPR1 (ENSPPRG00000009848) #36 SEC22C (ENSPPRG00000008407) #37 lion MODERN SPECIES 9 ACVR2B (ENSPLOG00000009922) #7 EXOG (ENSPLOG00000009981) #8 SCN5A (ENSPLOG00000010263) #9 ENSPLOG00000011727 SCN10A (ENSPLOG00000011876) #10 SCN11A (ENSPLOG00000012788) #11 WDR48 (ENSPLOG00000012879) #13 GORASP1 (ENSPLOG00000012960) #14 TTC21A (ENSPLOG00000013190) #15 CSRNP1 (ENSPLOG00000013578) #16 XIRP1 (ENSPLOG00000013656) #17 CX3CR1 (ENSPLOG00000013678) #18 CCR8 (ENSPLOG00000013691) ##18 SLC25A38 (ENSPLOG00000013717) #20 ENSPLOG00000013810 #21 ENSPLOG00000013841 #22 ENSPLOG00000013900 #23 ENSPLOG00000013959 MYRIP (ENSPLOG00000014044) #24 EIF1B (ENSPLOG00000014530) #25 ENTPD3 (ENSPLOG00000014579) #26 ENSPLOG00000014830 #27 ENSPLOG00000014963 ZNF620 (ENSPLOG00000014977) ZNF621 (ENSPLOG00000015003) #29 CTNNB1 (ENSPLOG00000015104) #30 ULK4 (ENSPLOG00000015315) #31 TRAK1 (ENSPLOG00000015537) #33 CCK (ENSPLOG00000016437) #34 LYZL4 (ENSPLOG00000016462) #35 VIPR1 (ENSPLOG00000016526) #36 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156210 #7 ENSGT00940000160677 #8 ENSGT01030000235089 ENSGT00940000161691 #9 ENSGT00940000154992.b #10 ENSGT00940000161553 #11 ENSGT00920000149157 #13 ENSGT00390000008686.c #14 ENSGT00390000005979.a #15 ENSGT00950000183072.a #16 ENSGT00530000063779.B #17 ENSGT01020000230359.A #18 ENSGT01020000230359.B ##18 ENSGT00550000075117 #20 ENSGT00940000164532 #21 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a #23 ENSGT00950000183138.a.a.b #24 ENSGT00940000160239 #25 ENSGT01100000263542.A #26 ENSGT00390000007888.d #27 ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 #29 ENSGT00940000155471.d.h #30 ENSGT00940000156541 #31 ENSGT00940000155697.A #33 ENSGT00390000003571 #34 ENSGT00940000162293 #35 ENSGT00940000156402.B #36 ENSGT00940000159338 #37 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b #22 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES 121 ENSGT00940000156210 #7 ENSGT00940000160677 #8 ENSGT01030000235089 ENSGT00940000161691 #9 ENSGT00940000154992.b #10 ENSGT00940000161553 #11 ENSGT00920000149157 #13 ENSGT00390000008686.c #14 ENSGT00390000005979.a #15 ENSGT00950000183072.a #16 ENSGT00530000063779.B #17 ENSGT01020000230359.A #18 ENSGT01020000230359.B ##18 ENSGT00550000075117 #20 ENSGT00940000164532 #21 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b #22 American mink MODERN SPECIES 727 ENSNVIG00000001588 #19 SLC25A38 (ENSNVIG00000001549) #20 ENSNVIG00000001526 #21 ENSNVIG00000001506 #22 Ursidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b #22 Giant Panda MODERN SPECIES ENSAMEG00000030171 IQCJ (ENSAMEG00000013634) ENSAMEG00000014596 ENSAMEG00000003144 ENSAMEG00000031019 C3orf80 (ENSAMEG00000030959) IFT80 (ENSAMEG00000002218) SMC4 (ENSAMEG00000002220) TRIM59 (ENSAMEG00000018682) KPNA4 (ENSAMEG00000017556) ENSAMEG00000019243 ARL14 (ENSAMEG00000019231) ENSAMEG00000011027 PPM1L (ENSAMEG00000017554) B3GALNT1 (ENSAMEG00000023599) ENSAMEG00000030249 #22 NMD3 (ENSAMEG00000001584) SPTSSB (ENSAMEG00000019073) OTOL1 (ENSAMEG00000027620) SI (ENSAMEG00000007629) SLITRK3 (ENSAMEG00000028681) ENSAMEG00000027782 BCHE (ENSAMEG00000007861) ENSAMEG00000025426 ZBBX (ENSAMEG00000006885) SERPINI2 (ENSAMEG00000002206) WDR49 (ENSAMEG00000002198) PDCD10 (ENSAMEG00000002181) SERPINI1 (ENSAMEG00000002160) GOLIM4 (ENSAMEG00000002129) MECOM (ENSAMEG00000002052) Ursus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b #22 American black bear MODERN SPECIES 7895 ENSUAMG00000009060 #22 ENSUAMG00000009059 MOBP (ENSUAMG00000009058) #23 Canidae ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000156210 #7 ENSGT00940000160677 #8 ENSGT00940000161691 #9 ENSGT00940000154992.b #10 ENSGT00940000161553 #11 ENSGT00920000149157 #13 ENSGT00390000008686.c #14 ENSGT00390000005979.a #15 ENSGT00950000183072.a #16 ENSGT00530000063779.B #17 ENSGT01020000230359.A #18 ENSGT01020000230359.B ##18 ENSGT00550000075117 #20 ENSGT00940000164532 #21 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a #23 ENSGT00950000183138.a.a.b #24 ENSGT00940000160239 #25 ENSGT01100000263542.A #26 ENSGT00390000007888.d #27 ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 #29 ENSGT00940000155471.d.h #30 ENSGT00390000014309.db ENSGT00940000156541 #31 ENSGT00940000155697.A #33 ENSGT00390000003571 #34 ENSGT00940000162293 #35 ENSGT00940000156402.B #36 Red fox MODERN SPECIES 207 SLC9A9 (ENSVVUG00000008631) CUNH3orf58 (ENSVVUG00000008585) ENSVVUG00000008573 #22 ENSVVUG00000008547 PLOD2 (ENSVVUG00000008510) PLSCR4 (ENSVVUG00000008506) Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000156210 #7 ENSGT00940000160677.a #8 ENSGT00940000161691 #9 ENSGT00940000154992.b #10 ENSGT00940000161553 #11 ENSGT00920000149157 #13 ENSGT00940000168257 ENSGT00390000005979.a #15 ENSGT00950000183072.a #16 ENSGT00530000063779.B #17 ENSGT01020000230359.A #18 ENSGT01020000230359.B ##18 ENSGT00550000075117 #20 ENSGT00940000164532 #21 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a #23 ENSGT00950000183138.a.a.b #24 ENSGT00940000160239 #25 ENSGT01100000263542.A #26 ENSGT00390000007888.d #27 ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 #29 ENSGT00940000155471.d.h #30 ENSGT00390000014309.db ENSGT00940000156541 #31 ENSGT00940000155697.A #33 ENSGT00390000003571 #34 ENSGT00940000162293 #35 ENSGT00940000156402.B #36 Dingo MODERN SPECIES 80 GRK7 (ENSCAFG00020008625) ATP1B3 (ENSCAFG00020008628) TFDP2 (ENSCAFG00020008640) GK5 (ENSCAFG00020008666) XRN1 (ENSCAFG00020009120) ATR (ENSCAFG00020009248) ENSCAFG00020009852 PLS1 (ENSCAFG00020009887) TRPC1 (ENSCAFG00020010411) PCOLCE2 (ENSCAFG00020010443) PAQR9 (ENSCAFG00020010463) U2SURP (ENSCAFG00020010497) CHST2 (ENSCAFG00020011451) SLC9A9 (ENSCAFG00020011470) DIPK2A (ENSCAFG00020011532) ENSCAFG00020011537 #22 ENSCAFG00020011539 PLOD2 (ENSCAFG00020011739) PLSCR4 (ENSCAFG00020018835) ENSCAFG00020018841 PLSCR1 (ENSCAFG00020018849) PLSCR5 (ENSCAFG00020018852) ENSCAFG00020018869 ZIC4 (ENSCAFG00020018878) ZIC1 (ENSCAFG00020018881) AGTR1 (ENSCAFG00020018902) CPB1 (ENSCAFG00020018903) CPA3 (ENSCAFG00020018916) GYG1 (ENSCAFG00020018942) HLTF (ENSCAFG00020018945) HPS3 (ENSCAFG00020018969) Dog DUPLICATION Dog MODERN SPECIES 15 ATP1B3 (ENSCAFG00845028285) TFDP2 (ENSCAFG00845028411) GK5 (ENSCAFG00845028559) XRN1 (ENSCAFG00845028618) ATR (ENSCAFG00845028753) ENSCAFG00845028887 PLS1 (ENSCAFG00845028912) TRPC1 (ENSCAFG00845028972) PCOLCE2 (ENSCAFG00845029069) PAQR9 (ENSCAFG00845029107) U2SURP (ENSCAFG00845029146) CHST2 (ENSCAFG00845029239) SLC9A9 (ENSCAFG00845029260) DIPK2A (ENSCAFG00845019923) ENSCAFG00845019990 ENSCAFG00845020135 #22 ENSCAFG00845020319 PLOD2 (ENSCAFG00845020429) PLSCR4 (ENSCAFG00845020987) ENSCAFG00845021095 PLSCR1 (ENSCAFG00845021201) PLSCR5 (ENSCAFG00845021401) ENSCAFG00845021640 ZIC4 (ENSCAFG00845021719) ZIC1 (ENSCAFG00845021895) AGTR1 (ENSCAFG00845022234) CPB1 (ENSCAFG00845022322) GYG1 (ENSCAFG00845022687) HLTF (ENSCAFG00845022829) HPS3 (ENSCAFG00845023096) CP (ENSCAFG00845023529) Dog MODERN SPECIES 15 XYLB (ENSCAFG00845030016) ACVR2B (ENSCAFG00845030040) #7 ENSCAFG00845030066 #8 SCN5A (ENSCAFG00845030126) #9 SCN10A (ENSCAFG00845030217) #10 SCN11A (ENSCAFG00845030314) #11 WDR48 (ENSCAFG00845030481) #13 GORASP1 (ENSCAFG00845030523) TTC21A (ENSCAFG00845030584) #15 CSRNP1 (ENSCAFG00845030607) #16 XIRP1 (ENSCAFG00845030624) #17 CX3CR1 (ENSCAFG00845015921) #18 ENSCAFG00845015968 #19 SLC25A38 (ENSCAFG00845016032) #20 ENSCAFG00845016104 #21 RPSA (ENSCAFG00845016169) #22 MOBP (ENSCAFG00845016306) #23 ENSCAFG00845016370 MYRIP (ENSCAFG00845016543) #24 EIF1B (ENSCAFG00845016850) #25 ENTPD3 (ENSCAFG00845017017) #26 RPL14 (ENSCAFG00845017115) #27 ZNF619 (ENSCAFG00845017162) ENSCAFG00845017197 #29 ZNF621 (ENSCAFG00845017292) #29 CTNNB1 (ENSCAFG00845017609) #30 ULK4 (ENSCAFG00845018029) #31 ENSCAFG00845018652 TRAK1 (ENSCAFG00845018816) #33 CCK (ENSCAFG00845019239) #34 LYZL4 (ENSCAFG00845019314) #35 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000156210 #7 ENSGT00940000160677 #8 ENSGT01030000235089 ENSGT00940000161691 #9 ENSGT00940000154992.b #10 ENSGT00940000161553 #11 ENSGT00920000149157 #13 ENSGT00390000008686.c #14 ENSGT00390000005979.a #15 ENSGT00950000183072.a #16 ENSGT00530000063779.B #17 ENSGT01020000230359.A #18 ENSGT01020000230359.B ##18 ENSGT00550000075117 #20 ENSGT00940000164532 #21 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a #23 ENSGT00950000183138.a.a.b #24 ENSGT00940000160239 #25 ENSGT01100000263542.A #26 ENSGT00390000007888.d #27 ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 #29 ENSGT00940000155471.d.h #30 ENSGT00940000156541 #31 ENSGT00940000155697.A #33 ENSGT00390000003571 #34 ENSGT00940000162293 #35 ENSGT00940000156402.B #36 ENSGT00940000159338 #37 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000160677 #8 ENSGT01030000235089 ENSGT00940000161691 #9 ENSGT00940000154992.b #10 ENSGT00940000161553 #11 ENSGT00920000149157 #13 ENSGT00390000008686.c #14 ENSGT00390000005979.a #15 ENSGT00950000183072.a #16 ENSGT00530000063779.B #17 ENSGT01020000230359.A #18 ENSGT01020000230359.B ##18 ENSGT00550000075117 #20 ENSGT00950000183099.u.b.a.b ##22 ENSGT00940000164532 #21 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a #23 ENSGT00950000183138.a.a.b #24 ENSGT00940000160239 #25 ENSGT01100000263542.A #26 ENSGT00390000007888.d #27 ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163271 #29 ENSGT00940000155471.d.h #30 ENSGT00940000156541 #31 ENSGT00940000155697.A #33 ENSGT00390000003571 #34 ENSGT00940000162293 #35 ENSGT00940000156402.B #36 ENSGT00940000159338 #37 ENSGT00940000160407 Megabat MODERN SPECIES 143 ENSPVAG00000004567 #22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000156210 #7 ENSGT00940000160677 #8 ENSGT01030000235089 ENSGT00940000161691 #9 ENSGT00940000154992.b #10 ENSGT00940000161553 #11 ENSGT00920000149157 #13 ENSGT00390000008686.c #14 ENSGT00390000005979.a #15 ENSGT00950000183072.a #16 ENSGT00530000063779.B #17 ENSGT01020000230359.A #18 ENSGT01020000230359.B ##18 ENSGT00550000075117 #20 ENSGT00940000164532 #21 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a #23 ENSGT00950000183138.a.a.b #24 ENSGT00940000160239 #25 ENSGT01100000263542.A #26 ENSGT00390000007888.d #27 ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163271 #29 ENSGT00940000155471.d.h #30 ENSGT00940000156541 #31 ENSGT00940000155697.A #33 ENSGT00390000003571 #34 ENSGT00940000162293 #35 ENSGT00940000156402.B #36 ENSGT00940000159338 #37 ENSGT00940000160407 Microbat DUPLICATION Microbat DUPLICATION Microbat MODERN SPECIES 1396 ENSMLUG00000025508 #22 OR2Z1 (ENSMLUG00000014700) ENSMLUG00000029044 Microbat MODERN SPECIES 1355 SGPP1 (ENSMLUG00000025924) ENSMLUG00000028382 SYNE2 (ENSMLUG00000011730) ESR2 (ENSMLUG00000011894) ENSMLUG00000028260 #22 ENSMLUG00000024131 MTHFD1 (ENSMLUG00000016539) AKAP5 (ENSMLUG00000016552) ZBTB25 (ENSMLUG00000016556) ZBTB1 (ENSMLUG00000016560) PPP1R36 (ENSMLUG00000016570) ENSMLUG00000004268 Microbat DUPLICATION Microbat DUPLICATION Microbat DUPLICATION Microbat DUPLICATION Microbat MODERN SPECIES 1089 RNGTT (ENSMLUG00000003302) CNR1 (ENSMLUG00000014970) ENSMLUG00000023151 #22 SPACA1 (ENSMLUG00000014969) AKIRIN2 (ENSMLUG00000006200) ORC3 (ENSMLUG00000006187) RARS2 (ENSMLUG00000006165) SLC35A1 (ENSMLUG00000026341) CFAP206 (ENSMLUG00000008829) C6orf163 (ENSMLUG00000001851) SMIM8 (ENSMLUG00000002679) ZNF292 (ENSMLUG00000002535) CGA (ENSMLUG00000004278) HTR1E (ENSMLUG00000004277) ENSMLUG00000028760 SYNCRIP (ENSMLUG00000006919) SNX14 (ENSMLUG00000010890) NT5E (ENSMLUG00000009581) Microbat MODERN SPECIES 1257 TM9SF2 (ENSMLUG00000005464) UBAC2 (ENSMLUG00000001242) GPR183 (ENSMLUG00000001245) GPR18 (ENSMLUG00000017014) ENSMLUG00000029636 ENSMLUG00000024254 DOCK9 (ENSMLUG00000014111) SLC15A1 (ENSMLUG00000000006) ENSMLUG00000023148 #22 STK24 (ENSMLUG00000012880) FARP1 (ENSMLUG00000012869) Microbat MODERN SPECIES 978 CPLX3 (ENSMLUG00000022853) ULK3 (ENSMLUG00000013660) SCAMP2 (ENSMLUG00000013668) MPI (ENSMLUG00000013679) FAM219B (ENSMLUG00000013688) ENSMLUG00000013702 RPP25 (ENSMLUG00000004989) SCAMP5 (ENSMLUG00000022507) PPCDC (ENSMLUG00000004993) C15orf39 (ENSMLUG00000006010) COMMD4 (ENSMLUG00000012239) NEIL1 (ENSMLUG00000009589) SIN3A (ENSMLUG00000009694) PTPN9 (ENSMLUG00000009762) ENSMLUG00000027889 ENSMLUG00000022982 #22 ENSMLUG00000000038 IMP3 (ENSMLUG00000014032) SNX33 (ENSMLUG00000010647) CSPG4 (ENSMLUG00000014982) ODF3L1 (ENSMLUG00000015002) LINGO1 (ENSMLUG00000006372) HMG20A (ENSMLUG00000011648) PEAK1 (ENSMLUG00000015713) TSPAN3 (ENSMLUG00000001844) PSTPIP1 (ENSMLUG00000010432) Microbat MODERN SPECIES 1220 XYLB (ENSMLUG00000023159) ACVR2B (ENSMLUG00000022627) #7 EXOG (ENSMLUG00000002789) #8 ENSMLUG00000002798 #9 SCN10A (ENSMLUG00000002821) #10 SCN11A (ENSMLUG00000005563) #11 WDR48 (ENSMLUG00000005608) #13 GORASP1 (ENSMLUG00000005614) #14 TTC21A (ENSMLUG00000005619) #15 CSRNP1 (ENSMLUG00000005636) #16 XIRP1 (ENSMLUG00000005639) #17 CX3CR1 (ENSMLUG00000005650) #18 CCR8 (ENSMLUG00000005654) ##18 SLC25A38 (ENSMLUG00000029709) #20 ENSMLUG00000023110 #21 ENSMLUG00000003276 #22 ENSMLUG00000027526 #23 MYRIP (ENSMLUG00000014419) #24 EIF1B (ENSMLUG00000014425) #25 ENTPD3 (ENSMLUG00000028733) #26 RPL14 (ENSMLUG00000014429) #27 ZNF621 (ENSMLUG00000015023) #29 CTNNB1 (ENSMLUG00000008771) #30 Microbat MODERN SPECIES 1046 B2M (ENSMLUG00000005388) SPG11 (ENSMLUG00000005361) EIF3J (ENSMLUG00000023600) CTDSPL2 (ENSMLUG00000011720) GOLM2 (ENSMLUG00000009503) ENSMLUG00000026881 #22 FRMD5 (ENSMLUG00000004791) ENSMLUG00000002196 WDR76 (ENSMLUG00000004781) MFAP1 (ENSMLUG00000013000) HYPK (ENSMLUG00000009424) SERINC4 (ENSMLUG00000009433) SERF2 (ENSMLUG00000024894) ENSMLUG00000025872 ELL3 (ENSMLUG00000009401) PDIA3 (ENSMLUG00000009380) CATSPER2 (ENSMLUG00000009375) STRC (ENSMLUG00000014042) ENSMLUG00000014035 PPIP5K1 (ENSMLUG00000014016) MAP1A (ENSMLUG00000014007) Equus ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000156210 #7 ENSGT00940000160677 #8 ENSGT00940000161691 #9 ENSGT00940000154992.b #10 ENSGT00940000161553 #11 ENSGT00920000149157 #13 ENSGT00390000008686.c #14 ENSGT00390000005979.a #15 ENSGT00950000183072.a #16 ENSGT00530000063779.B #17 ENSGT01020000230359.A #18 ENSGT01020000230359.B ##18 ENSGT00550000075117 #20 ENSGT00940000164532 #21 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a #23 ENSGT00910000147527 ENSGT00390000012078.b.x ENSGT00950000183138.a.a.b #24 ENSGT00940000160239 #25 ENSGT01100000263542.A #26 ENSGT00390000007888.d #27 ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 #29 ENSGT00940000155471.d.h #30 ENSGT00940000156541 #31 ENSGT00940000155697.A #33 ENSGT00390000003571 #34 ENSGT00940000162293 #35 Donkey MODERN SPECIES 13 ACVR2B (ENSEASG00005007540) #7 EXOG (ENSEASG00005024860) #8 SCN5A (ENSEASG00005007552) #9 SCN10A (ENSEASG00005007571) #10 SCN11A (ENSEASG00005007578) #11 WDR48 (ENSEASG00005007582) #13 ENSEASG00005007585 TTC21A (ENSEASG00005007589) #15 CSRNP1 (ENSEASG00005038354) #16 ENSEASG00005025143 #17 CX3CR1 (ENSEASG00005032119) #18 CCR8 (ENSEASG00005036988) ##18 ENSEASG00005007595 SLC25A38 (ENSEASG00005007597) #20 ENSEASG00005007598 #21 ENSEASG00005007599 #22 ENSEASG00005038158 #23 ENSEASG00005007603 ENSEASG00005007604 MYRIP (ENSEASG00005007606) #24 EIF1B (ENSEASG00005036643) #25 ENTPD3 (ENSEASG00005007614) #26 RPL14 (ENSEASG00005007625) #27 ZNF619 (ENSEASG00005007626) ZNF620 (ENSEASG00005037445) ZNF621 (ENSEASG00005024873) #29 CTNNB1 (ENSEASG00005007634) #30 ULK4 (ENSEASG00005007678) #31 TRAK1 (ENSEASG00005007734) #33 ENSEASG00005028679 #34 LYZL4 (ENSEASG00005007902) #35 Horse DUPLICATION Horse MODERN SPECIES 25 ENSECAG00000055291 TOMM7 (ENSECAG00000021807) RAPGEF5 (ENSECAG00000000395) CDCA7L (ENSECAG00000022400) DNAH11 (ENSECAG00000004819) SP4 (ENSECAG00000023324) ENSECAG00000043394 SP8 (ENSECAG00000040341) ENSECAG00000054779 ABCB5 (ENSECAG00000011338) ENSECAG00000048959 ITGB8 (ENSECAG00000019215) MACC1 (ENSECAG00000017364) TMEM196 (ENSECAG00000015956) POLR1F (ENSECAG00000014563) ENSECAG00000029412 #22 ENSECAG00000059503 TWIST1 (ENSECAG00000033207) ENSECAG00000018100 ENSECAG00000002478 HDAC9 (ENSECAG00000018816) SNX13 (ENSECAG00000021498) AHR (ENSECAG00000013393) AGR3 (ENSECAG00000012283) AGR2 (ENSECAG00000043283) TSPAN13 (ENSECAG00000010623) BZW2 (ENSECAG00000022038) ANKMY2 (ENSECAG00000014046) LRRC72 (ENSECAG00000013150) SOSTDC1 (ENSECAG00000012109) CRPPA (ENSECAG00000036217) Horse MODERN SPECIES 7 ACVR2B (ENSECAG00000019616) #7 EXOG (ENSECAG00000015682) #8 SCN5A (ENSECAG00000000813) #9 SCN10A (ENSECAG00000017790) #10 GORASP1 (ENSECAG00000016287) #11 WDR48 (ENSECAG00000018492) #13 GORASP1 (ENSECAG00000049721) #14 CSRNP1 (ENSECAG00000000763) #16 TTC21A (ENSECAG00000006305) #15 XIRP1 (ENSECAG00000004725) #17 CX3CR1 (ENSECAG00000004442) #18 CCR8 (ENSECAG00000004303) ##18 ENSECAG00000000681 SLC25A38 (ENSECAG00000020785) #20 ENSECAG00000020548 #21 RPSA (ENSECAG00000013062) #22 ENSECAG00000030326 ENSECAG00000050107 #23 ENSECAG00000012893 MYRIP (ENSECAG00000005794) #24 EIF1B (ENSECAG00000005758) #25 ENTPD3 (ENSECAG00000017628) #26 RPL14 (ENSECAG00000026813) #27 ZNF619 (ENSECAG00000015232) ZNF620 (ENSECAG00000033227) ZNF621 (ENSECAG00000014679) #29 ENSECAG00000035130 CTNNB1 (ENSECAG00000006949) #30 ULK4 (ENSECAG00000021560) #31 TRAK1 (ENSECAG00000014600) #33 CCK (ENSECAG00000014143) #34 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b #22 Hedgehog MODERN SPECIES 6298 ENSEEUG00000005292 #22 Common shrew MODERN SPECIES 4903 ENSSARG00000014402 #22 Euarchontoglires DUPLICATION Euarchontoglires DUPLICATION Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.m.a #22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.m.a #22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.m.a #22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.m.a #22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.m.a #22 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.m.a #22 Eurasian red squirrel DUPLICATION Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 16 NQO2 (ENSSVLG00005007475) SERPINB6 (ENSSVLG00005007395) ENSSVLG00005007366 ENSSVLG00005006719 ENSSVLG00005006449 SERPINB1 (ENSSVLG00005006417) WRNIP1 (ENSSVLG00005006348) ENSSVLG00005006323 MYLK4 (ENSSVLG00005006200) ENSSVLG00005006132 GMDS (ENSSVLG00005014861) FOXC1 (ENSSVLG00005014837) FOXF2 (ENSSVLG00005014790) FOXQ1 (ENSSVLG00005014773) ENSSVLG00005014724 ENSSVLG00005014698 #22 ENSSVLG00005014684 HUS1B (ENSSVLG00005014653) EXOC2 (ENSSVLG00005014600) IRF4 (ENSSVLG00005014508) ENSSVLG00005014463 ENSSVLG00005014442 ENSSVLG00005014389 ENSSVLG00005014343 ENSSVLG00005014308 ENSSVLG00005014265 ENSSVLG00005014208 ENSSVLG00005014088 ENSSVLG00005013996 ENSSVLG00005013958 ZSCAN16 (ENSSVLG00005013915) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES SDR16C5 (ENSSVLG00005010895) ENSSVLG00005010860 CHCHD7 (ENSSVLG00005010790) PLAG1 (ENSSVLG00005010731) MOS (ENSSVLG00005010710) RPS20 (ENSSVLG00005010588) LYN (ENSSVLG00005010475) TGS1 (ENSSVLG00005010446) ENSSVLG00005010412 ENSSVLG00005010285 XKR4 (ENSSVLG00005010234) RP1 (ENSSVLG00005009858) SOX17 (ENSSVLG00005009789) MRPL15 (ENSSVLG00005009764) ENSSVLG00005009666 ENSSVLG00005009646 #22 TCEA1 (ENSSVLG00005009501) RGS20 (ENSSVLG00005009394) ENSSVLG00005009360 ATP6V1H (ENSSVLG00005009299) ENSSVLG00005009270 OPRK1 (ENSSVLG00005009227) ENSSVLG00005009204 ENSSVLG00005009187 NPBWR1 (ENSSVLG00005009175) ENSSVLG00005009157 RB1CC1 (ENSSVLG00005009081) ALKAL1 (ENSSVLG00005009002) ENSSVLG00005008883 ENSSVLG00005008837 PCMTD1 (ENSSVLG00005008801) Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.m.a #22 Rabbit MODERN SPECIES 5 ENSOCUG00000030799 ENSOCUG00000026258 RBMS3 (ENSOCUG00000004840) ENSOCUG00000036953 ZCWPW2 (ENSOCUG00000017720) ENSOCUG00000014956 CMC1 (ENSOCUG00000012793) EOMES (ENSOCUG00000000451) ENSOCUG00000004133 SLC4A7 (ENSOCUG00000013596) NEK10 (ENSOCUG00000007846) ENSOCUG00000029906 LRRC3B (ENSOCUG00000015216) OXSM (ENSOCUG00000015384) NGLY1 (ENSOCUG00000015362) ENSOCUG00000027075 #22 TOP2B (ENSOCUG00000000717) RARB (ENSOCUG00000000714) THRB (ENSOCUG00000004532) NR1D2 (ENSOCUG00000009329) ENSOCUG00000010961 NKIRAS1 (ENSOCUG00000002483) ENSOCUG00000006026 ENSOCUG00000039156 ENSOCUG00000031633 ZNF385D (ENSOCUG00000029070) ENSOCUG00000033619 SGO1 (ENSOCUG00000006050) ENSOCUG00000006039 PP2D1 (ENSOCUG00000017225) RAB5A (ENSOCUG00000012200) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.m.b #22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.m.b #22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.m.b #22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.m.b #22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.m.b #22 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.m.b #22 Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.m.b #22 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.m.b #22 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 23 ARPC4 (ENSUPAG00010022930) TADA3 (ENSUPAG00010022928) CAMK1 (ENSUPAG00010022925) BRPF1 (ENSUPAG00010022889) CPNE9 (ENSUPAG00010022882) MTMR14 (ENSUPAG00010022881) LHFPL4 (ENSUPAG00010022879) SETD5 (ENSUPAG00010022873) THUMPD3 (ENSUPAG00010022869) SRGAP3 (ENSUPAG00010022863) RAD18 (ENSUPAG00010022854) OXTR (ENSUPAG00010022853) CAV3 (ENSUPAG00010022852) SSUH2 (ENSUPAG00010022850) LMCD1 (ENSUPAG00010022849) ENSUPAG00010022848 #22 GRM7 (ENSUPAG00010022847) EDEM1 (ENSUPAG00010022843) ARL8B (ENSUPAG00010022842) BHLHE40 (ENSUPAG00010022838) ITPR1 (ENSUPAG00010022789) SUMF1 (ENSUPAG00010022782) ENSUPAG00010022780 LRRN1 (ENSUPAG00010022779) CRBN (ENSUPAG00010022777) TRNT1 (ENSUPAG00010022775) IL5RA (ENSUPAG00010022771) CNTN4 (ENSUPAG00010022747) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 12 MCM6 (ENSSVLG00005002280) DARS1 (ENSSVLG00005002326) CXCR4 (ENSSVLG00005002352) THSD7B (ENSSVLG00005002439) HNMT (ENSSVLG00005002599) SPOPL (ENSSVLG00005002616) NXPH2 (ENSSVLG00005002646) LRP1B (ENSSVLG00005002708) ENSSVLG00005002904 KYNU (ENSSVLG00005002948) ARHGAP15 (ENSSVLG00005003035) GTDC1 (ENSSVLG00005003107) ENSSVLG00005003174 ENSSVLG00005003208 ENSSVLG00005003222 ENSSVLG00005003233 #22 ACVR2A (ENSSVLG00005003270) ORC4 (ENSSVLG00005003298) MBD5 (ENSSVLG00005003333) EPC2 (ENSSVLG00005003372) KIF5C (ENSSVLG00005003411) LYPD6B (ENSSVLG00005003456) LYPD6 (ENSSVLG00005003472) MMADHC (ENSSVLG00005003507) ENSSVLG00005003548 RND3 (ENSSVLG00005003560) ENSSVLG00005003570 RBM43 (ENSSVLG00005003593) ENSSVLG00005003611 ENSSVLG00005003622 TNFAIP6 (ENSSVLG00005003640) Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.m.b #22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.m.b #22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.m.b #22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.m.b #22 Mas night monkey MODERN SPECIES 406 ENSANAG00000032954 ENSANAG00000037450 CXCL13 (ENSANAG00000037253) CNOT6L (ENSANAG00000023917) ENSANAG00000026675 ENSANAG00000035463 ENSANAG00000028297 FRAS1 (ENSANAG00000026061) ANXA3 (ENSANAG00000025473) ENSANAG00000011900 BMP2K (ENSANAG00000032256) PAQR3 (ENSANAG00000032440) ANTXR2 (ENSANAG00000020620) ENSANAG00000038151 PRDM8 (ENSANAG00000027638) ENSANAG00000018328 #22 FGF5 (ENSANAG00000029794) CFAP299 (ENSANAG00000029362) BMP3 (ENSANAG00000038265) PRKG2 (ENSANAG00000033813) ENSANAG00000019728 ENSANAG00000035812 ENSANAG00000032331 RASGEF1B (ENSANAG00000021844) ENSANAG00000034721 HNRNPD (ENSANAG00000035221) ENSANAG00000029054 ENOPH1 (ENSANAG00000025974) TMEM150C (ENSANAG00000000048) ENSANAG00000033681 SCD5 (ENSANAG00000031198) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000160677 #8 ENSGT01030000235089 ENSGT00940000161691 #9 ENSGT00940000154992.b #10 ENSGT01030000235508 ENSGT00940000161553 #11 ENSGT00920000149157 #13 ENSGT00390000008686.c #14 ENSGT00390000005979.a #15 ENSGT00950000183072.a #16 ENSGT00530000063779.B #17 ENSGT01020000230359.A #18 ENSGT01020000230359.B ##18 ENSGT00550000075117 #20 ENSGT00950000183099.u.a.e ##22 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.n #22 ENSGT00950000183138.a.a.a #23 ENSGT00950000183138.a.a.b #24 ENSGT00940000160239 #25 ENSGT01090000263454 ENSGT01100000263542.A #26 ENSGT00390000007888.c.a ##27 ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 #29 ENSGT00940000155471.d.h #30 ENSGT00940000156541 #31 ENSGT00940000155697.A #33 ENSGT00390000003571 #34 ENSGT00940000162293 #35 ENSGT00940000156402.B #36 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000160677 #8 ENSGT01030000235089 ENSGT00940000161691 #9 ENSGT00940000154992.b #10 ENSGT01030000235508 ENSGT00940000161553 #11 ENSGT00920000149157 #13 ENSGT00390000008686.c #14 ENSGT00390000005979.a #15 ENSGT00950000183072.a #16 ENSGT00530000063779.B #17 ENSGT01020000230359.A #18 ENSGT01020000230359.B ##18 ENSGT00550000075117 #20 ENSGT00950000183099.u.a.e ##22 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.n #22 ENSGT00950000183138.a.a.a #23 ENSGT00950000183138.a.a.b #24 ENSGT00940000160239 #25 ENSGT01090000263454 ENSGT01100000263542.A #26 ENSGT00390000007888.c.a ##27 ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163271 #29 ENSGT00940000155471.d.h #30 ENSGT00940000156541 #31 ENSGT00940000155697.A #33 ENSGT00390000003571 #34 ENSGT00940000162293 #35 ENSGT00940000156402.B #36 ENSGT00940000159338 #37 Tree shrew MODERN SPECIES 2199 SLC25A38 (ENSTBEG00000015842) #20 ENSTBEG00000015946 #22 Glires ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000160677 #8 ENSGT01030000235089.b ENSGT00940000161691 #9 ENSGT00940000154992.b #10 ENSGT01030000235508 ENSGT00940000161553 #11 ENSGT00920000149157 #13 ENSGT00390000008686.c #14 ENSGT00390000005979.a #15 ENSGT00950000183072.a #16 ENSGT00530000063779.B #17 ENSGT01020000230359.A #18 ENSGT01020000230359.B ##18 ENSGT00550000075117 #20 ENSGT00950000183099.u.a.e ##22 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.n #22 ENSGT00950000183138.a.a.a #23 ENSGT00950000183138.a.a.b #24 ENSGT00940000160239 #25 ENSGT01090000263454 ENSGT01100000263542.A #26 ENSGT00390000007888.c.a ##27 ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163271 #29 ENSGT00940000155471.d.h #30 ENSGT00940000156541 #31 ENSGT00940000155697.A #33 ENSGT00390000003571 #34 ENSGT00940000162293 #35 ENSGT00940000156402.B #36 ENSGT00940000159338 #37 Rodentia ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000160677 #8 ENSGT01030000235089.b ENSGT00940000161691 #9 ENSGT00940000154992.b #10 ENSGT01030000235508 ENSGT00940000161553 #11 ENSGT00920000149157 #13 ENSGT00390000008686.c #14 ENSGT00390000005979.a #15 ENSGT00950000183072.a #16 ENSGT00530000063779.B #17 ENSGT01020000230359.A #18 ENSGT01020000230359.B ##18 ENSGT00550000075117 #20 ENSGT00950000183099.u.a.e ##22 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.n #22 ENSGT00950000183138.a.a.a #23 ENSGT00950000183138.a.a.b #24 ENSGT00940000160239 #25 ENSGT01090000263454 ENSGT01100000263542.A #26 ENSGT00390000007888.c.a ##27 ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163271 #29 ENSGT00940000155471.d.h #30 ENSGT00940000156541 #31 ENSGT00940000155697.A #33 ENSGT00390000003571 #34 ENSGT00940000162293 #35 ENSGT00940000156402.B #36 ENSGT00940000159338 #37 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.n #22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.n #22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.n #22 Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1787 Kctd12 (ENSNGAG00000009455) Acod1 (ENSNGAG00000011932) Cln5 (ENSNGAG00000018989) Fbxl3 (ENSNGAG00000017483) Mycbp2 (ENSNGAG00000021068) Sap130 (ENSNGAG00000022842) ENSNGAG00000017129 #22 Ammecr1l (ENSNGAG00000015443) Polr2d (ENSNGAG00000014862) Wdr33 (ENSNGAG00000023927) Gpr17 (ENSNGAG00000022752) Lims2 (ENSNGAG00000022419) Myo7b (ENSNGAG00000019990) Kangaroo rat MODERN SPECIES 447 Dlec1 (ENSDORG00000001553) ENSDORG00000004811 Oxsr1 (ENSDORG00000011949) Myd88 (ENSDORG00000005070) Xylb (ENSDORG00000029080) Acvr2b (ENSDORG00000008630) #7 Exog (ENSDORG00000004332) #8 Scn5a (ENSDORG00000010830) #9 Scn10a (ENSDORG00000002823) #10 Scn11a (ENSDORG00000025723) #11 Wdr48 (ENSDORG00000011630) #13 Gorasp1 (ENSDORG00000006460) #14 Ttc21a (ENSDORG00000027538) #15 Csrnp1 (ENSDORG00000006461) #16 Cx3cr1 (ENSDORG00000015095) #18 ENSDORG00000008267 #22 Mobp (ENSDORG00000005778) #23 Eif1b (ENSDORG00000025252) #25 Entpd3 (ENSDORG00000023903) #26 ENSDORG00000026117 #30 ENSDORG00000027315 #31 ENSDORG00000008172 #33 Lyzl4 (ENSDORG00000027391) #35 ENSDORG00000023631 #36 Ss18l2 (ENSDORG00000027512) ENSDORG00000023865 Zfp651 (ENSDORG00000027109) Klhl40 (ENSDORG00000029540) Hhatl (ENSDORG00000023899) Ccdc13 (ENSDORG00000028309) ENSDORG00000026058 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000156210 #7 ENSGT00940000160677 #8 ENSGT01030000235089.b ENSGT00940000161691 #9 ENSGT00940000154992.b #10 ENSGT00940000161553 #11 ENSGT00920000149157 #13 ENSGT00390000008686.c #14 ENSGT00390000005979.a #15 ENSGT00950000183072.a #16 ENSGT00530000063779.B #17 ENSGT01020000230359.A #18 ENSGT01020000230359.B ##18 ENSGT00550000075117 #20 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.n #22 ENSGT00950000183138.a.a.a #23 ENSGT00950000183138.a.a.b #24 ENSGT00940000160239 #25 ENSGT01100000263542.A #26 ENSGT00390000007888.c.a ##27 ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163271 #29 ENSGT00940000155471.d.h #30 ENSGT00940000156541 #31 ENSGT00940000155697.A #33 ENSGT00390000003571 #34 ENSGT00940000162293 #35 ENSGT00940000156402.B #36 ENSGT00940000159338 #37 ENSGT00940000160407 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.n #22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.n #22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.n #22 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 147 SPOPL (ENSCLAG00000001710) NXPH2 (ENSCLAG00000017455) LRP1B (ENSCLAG00000002036) KYNU (ENSCLAG00000005935) ARHGAP15 (ENSCLAG00000006756) GTDC1 (ENSCLAG00000007819) ZEB2 (ENSCLAG00000002230) ACVR2A (ENSCLAG00000002708) ORC4 (ENSCLAG00000002811) MBD5 (ENSCLAG00000001690) EPC2 (ENSCLAG00000001768) KIF5C (ENSCLAG00000001868) LYPD6B (ENSCLAG00000002017) LYPD6 (ENSCLAG00000001952) MMADHC (ENSCLAG00000002129) ENSCLAG00000002537 #22 ENSCLAG00000002555 RBM43 (ENSCLAG00000002635) NMI (ENSCLAG00000002759) TNFAIP6 (ENSCLAG00000002857) RIF1 (ENSCLAG00000001517) NEB (ENSCLAG00000002157) ENSCLAG00000005398 CACNB4 (ENSCLAG00000005759) STAM2 (ENSCLAG00000001380) FMNL2 (ENSCLAG00000001515) PRPF40A (ENSCLAG00000001774) GALNT13 (ENSCLAG00000004217) KCNJ3 (ENSCLAG00000004537) Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000156210 #7 ENSGT00940000160677 #8 ENSGT01030000235089.b ENSGT00940000161691 #9 ENSGT00940000154992.b #10 ENSGT00940000161553 #11 ENSGT00920000149157 #13 ENSGT00390000008686.c #14 ENSGT00390000005979.a #15 ENSGT00950000183072.a #16 ENSGT00530000063779.B #17 ENSGT01020000230359.A #18 ENSGT01020000230359.B ##18 ENSGT00550000075117 #20 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.n #22 ENSGT00950000183138.a.a.a #23 ENSGT00950000183138.a.a.b #24 ENSGT00940000160239 #25 ENSGT01100000263542.A #26 ENSGT00390000007888.c.a ##27 ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163271 #29 ENSGT00940000155471.d.h #30 ENSGT00940000156541 #31 ENSGT00940000155697.A #33 ENSGT00390000003571 #34 ENSGT00940000162293 #35 ENSGT00940000156402.B #36 ENSGT00940000159338 #37 ENSGT00940000160407.s.b Marmotini ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT01030000234626.C.e.b ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000156210 #7 ENSGT00940000160677 #8 ENSGT00940000161691 #9 ENSGT00940000154992.b #10 ENSGT00940000161553 #11 ENSGT00920000149157 #13 ENSGT00390000008686.c #14 ENSGT00390000005979.a #15 ENSGT00950000183072.a #16 ENSGT00530000063779.B #17 ENSGT01020000230359.A #18 ENSGT01020000230359.B ##18 ENSGT00550000075117 #20 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.n #22 ENSGT00950000183138.a.a.a #23 ENSGT00950000183138.a.a.b #24 ENSGT00940000160239 #25 ENSGT01100000263542.A #26 ENSGT00390000007888.c.a ##27 ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163271 #29 ENSGT00940000155471.d.h #30 ENSGT00940000156541 #31 ENSGT00940000155697.A #33 ENSGT00390000003571 #34 ENSGT00940000162293 #35 ENSGT00940000156402.B #36 ENSGT00940000159338 #37 ENSGT00940000160407.s.b Alpin marmot MODERN SPECIES 24 ENSMMMG00000010769 XYLB (ENSMMMG00000010614) ACVR2B (ENSMMMG00000010587) #7 ENSMMMG00000010573 #8 SCN5A (ENSMMMG00000010442) #9 SCN10A (ENSMMMG00000010349) #10 SCN11A (ENSMMMG00000010245) #11 WDR48 (ENSMMMG00000010175) #13 ENSMMMG00000010145 TTC21A (ENSMMMG00000010082) #15 CSRNP1 (ENSMMMG00000010046) #16 XIRP1 (ENSMMMG00000010043) #17 CX3CR1 (ENSMMMG00000010040) #18 CCR8 (ENSMMMG00000010034) ##18 SLC25A38 (ENSMMMG00000009978) #20 ENSMMMG00000009931 #22 ENSMMMG00000009874 #23 ENSMMMG00000009844 #24 EIF1B (ENSMMMG00000009817) #25 ENTPD3 (ENSMMMG00000009806) #26 ENSMMMG00000009798 ##27 ZNF619 (ENSMMMG00000009793) ENSMMMG00000009789 ZNF621 (ENSMMMG00000009736) #29 CTNNB1 (ENSMMMG00000009709) #30 ULK4 (ENSMMMG00000009644) #31 TRAK1 (ENSMMMG00000009424) #33 CCK (ENSMMMG00000009393) #34 LYZL4 (ENSMMMG00000009375) #35 VIPR1 (ENSMMMG00000009346) #36 SEC22C (ENSMMMG00000009311) #37 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT01030000234626.C.e.b ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000156210 #7 ENSGT00940000160677 #8 ENSGT00940000161691 #9 ENSGT00940000154992.b #10 ENSGT00940000161553 #11 ENSGT00920000149157 #13 ENSGT00390000008686.c #14 ENSGT00390000005979.a #15 ENSGT00950000183072.a #16 ENSGT00530000063779.B #17 ENSGT01020000230359.A #18 ENSGT01020000230359.B ##18 ENSGT00550000075117 #20 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.n #22 ENSGT00950000183138.a.a.a #23 ENSGT00950000183138.a.a.b #24 ENSGT00940000160239 #25 ENSGT01100000263542.A #26 ENSGT00390000007888.c.a ##27 ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163271 #29 ENSGT00940000155471.d.h #30 ENSGT00940000156541 #31 Squirrel MODERN SPECIES 73 ENSSTOG00000006356 XYLB (ENSSTOG00000014855) ACVR2B (ENSSTOG00000014862) #7 EXOG (ENSSTOG00000031572) #8 SCN5A (ENSSTOG00000011601) #9 SCN10A (ENSSTOG00000021843) #10 SCN11A (ENSSTOG00000026394) #11 WDR48 (ENSSTOG00000011459) #13 GORASP1 (ENSSTOG00000022044) #14 TTC21A (ENSSTOG00000011477) #15 CSRNP1 (ENSSTOG00000026227) #16 XIRP1 (ENSSTOG00000029242) #17 CX3CR1 (ENSSTOG00000022978) #18 CCR8 (ENSSTOG00000014102) ##18 SLC25A38 (ENSSTOG00000020267) #20 ENSSTOG00000014070 #22 MOBP (ENSSTOG00000020929) #23 MYRIP (ENSSTOG00000012159) #24 EIF1B (ENSSTOG00000012168) #25 ENTPD3 (ENSSTOG00000009720) #26 RPL14 (ENSSTOG00000021460) ##27 ZNF619 (ENSSTOG00000029300) CTNNB1 (ENSSTOG00000016129) #30 ULK4 (ENSSTOG00000012095) #31 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 251 ENSUPAG00010010383 ENSUPAG00010010402 XYLB (ENSUPAG00010010422) ACVR2B (ENSUPAG00010010442) #7 EXOG (ENSUPAG00010010465) #8 SCN5A (ENSUPAG00010010481) #9 SCN10A (ENSUPAG00010010549) #10 SCN11A (ENSUPAG00010010615) #11 WDR48 (ENSUPAG00010010707) #13 GORASP1 (ENSUPAG00010010776) #14 TTC21A (ENSUPAG00010010809) #15 CSRNP1 (ENSUPAG00010010921) #16 CX3CR1 (ENSUPAG00010010933) #18 CCR8 (ENSUPAG00010010938) ##18 SLC25A38 (ENSUPAG00010010942) #20 ENSUPAG00010010947 #22 ENSUPAG00010010964 #23 MYRIP (ENSUPAG00010010972) #24 EIF1B (ENSUPAG00010010987) #25 ENTPD3 (ENSUPAG00010010992) #26 RPL14 (ENSUPAG00010011004) ##27 ZNF619 (ENSUPAG00010011027) ZNF621 (ENSUPAG00010011035) #29 ENSUPAG00010011038 CTNNB1 (ENSUPAG00010011046) #30 ULK4 (ENSUPAG00010011069) #31 Eurasian red squirrel DUPLICATION Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 2 ENSSVLG00005018542 ENSSVLG00005018577 ENSSVLG00005018628 ENSSVLG00005018662 ENSSVLG00005018759 PATE1 (ENSSVLG00005018811) PATE2 (ENSSVLG00005018933) PATE3 (ENSSVLG00005019015) PUS3 (ENSSVLG00005019054) HYLS1 (ENSSVLG00005019099) DDX25 (ENSSVLG00005019148) ENSSVLG00005019300 ENSSVLG00005019361 VSIG10L2 (ENSSVLG00005019476) CDON (ENSSVLG00005019551) ENSSVLG00005019624 #22 RPUSD4 (ENSSVLG00005019658) FAM118B (ENSSVLG00005019758) SRPRA (ENSSVLG00005019885) FOXRED1 (ENSSVLG00005020162) TIRAP (ENSSVLG00005020272) DCPS (ENSSVLG00005020312) ST3GAL4 (ENSSVLG00005020349) KIRREL3 (ENSSVLG00005020503) ETS1 (ENSSVLG00005020912) FLI1 (ENSSVLG00005021096) KCNJ1 (ENSSVLG00005021312) KCNJ5 (ENSSVLG00005021346) ARHGAP32 (ENSSVLG00005021394) ENSSVLG00005021615 BARX2 (ENSSVLG00005021654) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES ENSSVLG00005000190 TMED5 (ENSSVLG00005000211) CCDC18 (ENSSVLG00005000256) DR1 (ENSSVLG00005000282) FNBP1L (ENSSVLG00005000352) ENSSVLG00005000405 BCAR3 (ENSSVLG00005000445) DNTTIP2 (ENSSVLG00005000490) GCLM (ENSSVLG00005000523) ABCA4 (ENSSVLG00005000757) ARHGAP29 (ENSSVLG00005001033) ABCD3 (ENSSVLG00005001081) F3 (ENSSVLG00005001139) SLC44A3 (ENSSVLG00005001228) CNN3 (ENSSVLG00005001336) ENSSVLG00005001359 #22 ENSSVLG00005001370 ALG14 (ENSSVLG00005001385) TLCD4 (ENSSVLG00005001401) RWDD3 (ENSSVLG00005001426) ENSSVLG00005001437 PTBP2 (ENSSVLG00005001449) DPYD (ENSSVLG00005001470) SNX7 (ENSSVLG00005001512) PLPPR5 (ENSSVLG00005001555) PLPPR4 (ENSSVLG00005001606) PALMD (ENSSVLG00005001662) FRRS1 (ENSSVLG00005001689) AGL (ENSSVLG00005001738) ENSSVLG00005001793 ENSSVLG00005001824 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 7 EXOG (ENSSVLG00005024674) #8 ENSSVLG00005024654 SCN5A (ENSSVLG00005023875) #9 SCN10A (ENSSVLG00005023368) #10 SCN11A (ENSSVLG00005022915) #11 WDR48 (ENSSVLG00005022801) #13 GORASP1 (ENSSVLG00005022690) #14 TTC21A (ENSSVLG00005022643) #15 CSRNP1 (ENSSVLG00005022609) #16 XIRP1 (ENSSVLG00005022577) #17 ENSSVLG00005022561 CX3CR1 (ENSSVLG00005022515) #18 ENSSVLG00005022488 #19 ENSSVLG00005022470 SLC25A38 (ENSSVLG00005022356) #20 ENSSVLG00005022288 #22 ENSSVLG00005022262 #23 ENSSVLG00005022240 MYRIP (ENSSVLG00005021784) #24 EIF1B (ENSSVLG00005021694) #25 ENTPD3 (ENSSVLG00005021557) #26 RPL14 (ENSSVLG00005021436) ##27 ZNF619 (ENSSVLG00005021377) ZNF621 (ENSSVLG00005021120) #29 ENSSVLG00005021100 CTNNB1 (ENSSVLG00005020963) #30 ULK4 (ENSSVLG00005020909) #31 ENSSVLG00005020856 TRAK1 (ENSSVLG00005020155) #33 CCK (ENSSVLG00005019991) #34 ENSSVLG00005019940 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 117 ENSGT00920000149157 #13 ENSGT00390000008686.c #14 ENSGT00390000005979.a #15 ENSGT00950000183072.a #16 ENSGT00530000063779.B #17 ENSGT01020000230359.A #18 ENSGT01020000230359.B ##18 ENSGT00550000075117 #20 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.n #22 ENSGT00950000183138.a.a.a #23 ENSGT00950000183138.a.a.b #24 ENSGT00940000160239 #25 ENSGT01100000263542.A #26 ENSGT00390000007888.d #27 ENSGT00940000163271 #29 ENSGT00940000155471.d.h #30 ENSGT00940000156541 #31 ENSGT00940000155697.A #33 ENSGT00390000003571 #34 ENSGT00940000162293 #35 ENSGT00940000156402.B #36 ENSGT00940000159338 #37 ENSGT00940000158548 ENSGT00940000160089 Pika MODERN SPECIES 1900 ENSOPRG00000004489 #20 ENSOPRG00000004505 #22 Rabbit DUPLICATION Rabbit DUPLICATION Rabbit MODERN SPECIES 1401 ARHGAP36 (ENSOCUG00000015299) IGSF1 (ENSOCUG00000009769) ENSOCUG00000031494 ENSOCUG00000023391 OR13H1 (ENSOCUG00000011316) ENSOCUG00000034662 ENSOCUG00000039484 STK26 (ENSOCUG00000007358) FRMD7 (ENSOCUG00000025878) RAP2C (ENSOCUG00000010321) MBNL3 (ENSOCUG00000014979) HS6ST2 (ENSOCUG00000008183) ENSOCUG00000025094 GPC4 (ENSOCUG00000015005) GPC3 (ENSOCUG00000001752) ENSOCUG00000017157 #22 CCDC160 (ENSOCUG00000016626) PHF6 (ENSOCUG00000007022) HPRT1 (ENSOCUG00000003186) PLAC1 (ENSOCUG00000003197) ENSOCUG00000010038 ENSOCUG00000035074 ENSOCUG00000029737 MOSPD1 (ENSOCUG00000010049) ENSOCUG00000021358 ENSOCUG00000010787 ENSOCUG00000027632 ENSOCUG00000029479 ENSOCUG00000023130 ENSOCUG00000024717 ENSOCUG00000025652 Rabbit MODERN SPECIES 5 ENSOCUG00000011302 NRIP1 (ENSOCUG00000005265) ENSOCUG00000032284 ENSOCUG00000025403 SAMSN1 (ENSOCUG00000015833) ENSOCUG00000028230 HSPA13 (ENSOCUG00000013031) ENSOCUG00000012802 ENSOCUG00000039494 ENSOCUG00000010409 LIPI (ENSOCUG00000013984) ENSOCUG00000038110 ROBO2 (ENSOCUG00000004278) ENSOCUG00000021998 ROBO1 (ENSOCUG00000002537) ENSOCUG00000037368 #22 GBE1 (ENSOCUG00000005912) ENSOCUG00000026853 ENSOCUG00000024114 ENSOCUG00000022949 ENSOCUG00000037817 CADM2 (ENSOCUG00000001739) ENSOCUG00000038220 VGLL3 (ENSOCUG00000020895) CHMP2B (ENSOCUG00000003985) POU1F1 (ENSOCUG00000017779) HTR1F (ENSOCUG00000027917) ENSOCUG00000025046 ENSOCUG00000007037 ZNF654 (ENSOCUG00000004967) C3orf38 (ENSOCUG00000014034) Rabbit MODERN SPECIES 7 PROX1 (ENSOCUG00000008274) SMYD2 (ENSOCUG00000015379) PTPN14 (ENSOCUG00000015400) KCNK2 (ENSOCUG00000008629) KCTD3 (ENSOCUG00000001943) ENSOCUG00000014710 ESRRG (ENSOCUG00000000984) ENSOCUG00000033147 GPATCH2 (ENSOCUG00000014512) SPATA17 (ENSOCUG00000014523) RRP15 (ENSOCUG00000017863) TGFB2 (ENSOCUG00000005279) LYPLAL1 (ENSOCUG00000000388) ENSOCUG00000007393 ENSOCUG00000038407 ENSOCUG00000022661 #22 SLC30A10 (ENSOCUG00000003407) ENSOCUG00000038973 EPRS1 (ENSOCUG00000012039) BPNT1 (ENSOCUG00000010408) IARS2 (ENSOCUG00000010419) ENSOCUG00000034802 RAB3GAP2 (ENSOCUG00000010431) ENSOCUG00000035769 MARK1 (ENSOCUG00000013143) C1orf115 (ENSOCUG00000026893) MTARC1 (ENSOCUG00000013162) HLX (ENSOCUG00000006015) DUSP10 (ENSOCUG00000007533) ENSOCUG00000032919 ENSOCUG00000000250 Rabbit MODERN SPECIES 19 RIMKLB (ENSOCUG00000013997) ENSOCUG00000035657 MFAP5 (ENSOCUG00000002407) AICDA (ENSOCUG00000023739) APOBEC1 (ENSOCUG00000025736) GDF3 (ENSOCUG00000013747) ENSOCUG00000022961 ##22 ENSOCUG00000013783 ENSOCUG00000008575 FOXJ2 (ENSOCUG00000004313) C3AR1 (ENSOCUG00000007438) NECAP1 (ENSOCUG00000004309) CLEC4A (ENSOCUG00000010935) CLEC4D (ENSOCUG00000012312) CLEC4E (ENSOCUG00000009195) ENSOCUG00000022788 #22 CD163 (ENSOCUG00000003958) ENSOCUG00000027440 ENSOCUG00000039239 PEX5 (ENSOCUG00000005856) CLSTN3 (ENSOCUG00000014499) RBP5 (ENSOCUG00000023679) C1R (ENSOCUG00000014480) C1S (ENSOCUG00000014468) LPCAT3 (ENSOCUG00000014461) EMG1 (ENSOCUG00000003603) PHB2 (ENSOCUG00000026538) PTPN6 (ENSOCUG00000003599) C12orf57 (ENSOCUG00000013275) ATN1 (ENSOCUG00000003592) ENO2 (ENSOCUG00000003589) Rabbit MODERN SPECIES 20 ENSOCUG00000030059 ENSOCUG00000037996 IQSEC1 (ENSOCUG00000001343) NUP210 (ENSOCUG00000014236) HDAC11 (ENSOCUG00000009839) FBLN2 (ENSOCUG00000005900) WNT7A (ENSOCUG00000013432) WDR48 (ENSOCUG00000005460) #13 GORASP1 (ENSOCUG00000005467) #14 TTC21A (ENSOCUG00000005473) #15 CSRNP1 (ENSOCUG00000022080) #16 XIRP1 (ENSOCUG00000011396) #17 CX3CR1 (ENSOCUG00000027509) #18 CCR8 (ENSOCUG00000011958) ##18 SLC25A38 (ENSOCUG00000013998) #20 ENSOCUG00000007018 #22 ENSOCUG00000031611 #23 ENSOCUG00000030913 ENSOCUG00000029704 MYRIP (ENSOCUG00000004332) #24 ENTPD3 (ENSOCUG00000010306) #26 RPL14 (ENSOCUG00000010309) #27 ZNF621 (ENSOCUG00000028987) #29 ENSOCUG00000022043 ENSOCUG00000034871 CTNNB1 (ENSOCUG00000001468) #30 ULK4 (ENSOCUG00000013497) #31 ENSOCUG00000015654 #33 ENSOCUG00000015676 #34 ENSOCUG00000035357 #33 LYZL4 (ENSOCUG00000013102) #35 Primates ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000160677 #8 ENSGT01030000235089 ENSGT00940000161691 #9 ENSGT00940000154992.b #10 ENSGT00940000161553 #11 ENSGT00920000149157 #13 ENSGT00910000148110 ENSGT00390000008686.c #14 ENSGT00390000005979.a #15 ENSGT00950000183072.a #16 ENSGT00530000063779.B #17 ENSGT01020000230359.A #18 ENSGT01020000230359.B ##18 ENSGT00550000075117 #20 ENSGT00950000183099.u.a.e ##22 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.n #22 ENSGT00950000183138.a.a.a #23 ENSGT00910000147527 ENSGT00950000183138.a.a.b #24 ENSGT00940000160239 #25 ENSGT01090000263454 ENSGT01100000263542.A #26 ENSGT00390000007888.c.a.l ##27 ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 #29 ENSGT00940000155471.d.h #30 ENSGT00940000156541 #31 ENSGT00940000155697.A #33 ENSGT00390000003571 #34 ENSGT00940000162293 #35 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.n #22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.n #22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.n #22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.n #22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.n #22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.n #22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.n #22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.n #22 Sooty mangabey MODERN SPECIES 215 RAB2B (ENSCATG00000044849) CHD8 (ENSCATG00000004861) SUPT16H (ENSCATG00000036660) RPGRIP1 (ENSCATG00000043832) ENSCATG00000030828 ENSCATG00000028025 TMEM253 (ENSCATG00000030179) ZNF219 (ENSCATG00000014440) ARHGEF40 (ENSCATG00000033702) TPPP2 (ENSCATG00000032548) NDRG2 (ENSCATG00000044168) SLC39A2 (ENSCATG00000036547) METTL17 (ENSCATG00000040494) RNASE3 (ENSCATG00000021993) ENSCATG00000035792 ENSCATG00000044410 #22 EDDM3B (ENSCATG00000022830) RNASE4 (ENSCATG00000022633) RNASE9 (ENSCATG00000039688) ENSCATG00000044417 PNP (ENSCATG00000032993) PIP4P1 (ENSCATG00000028882) APEX1 (ENSCATG00000015580) OSGEP (ENSCATG00000029762) KLHL33 (ENSCATG00000039062) TEP1 (ENSCATG00000039214) PARP2 (ENSCATG00000006864) CCNB1IP1 (ENSCATG00000043288) TTC5 (ENSCATG00000033166) OR11H4 (ENSCATG00000017720) OR11H6 (ENSCATG00000007970) Tarsier DUPLICATION Tarsier MODERN SPECIES 5048 ENSTSYG00000029538 #22 ENSTSYG00000032033 Tarsier MODERN SPECIES 4975 SLC25A38 (ENSTSYG00000026864) #20 ENSTSYG00000032853 RPSA (ENSTSYG00000004458) #22 MOBP (ENSTSYG00000025898) #23 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000156210 #7 ENSGT00940000160677 #8 ENSGT01030000235089 ENSGT00940000161691 #9 ENSGT00940000154992.b #10 ENSGT00940000161553 #11 ENSGT00920000149157 #13 ENSGT00910000148110 ENSGT00390000008686.c #14 ENSGT00390000005979.a #15 ENSGT00950000183072.a #16 ENSGT00530000063779.B #17 ENSGT01020000230359.A #18 ENSGT01020000230359.B ##18 ENSGT00550000075117 #20 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.n #22 ENSGT00950000183138.a.a.a #23 ENSGT00910000147527 ENSGT00950000183138.a.a.b #24 ENSGT00940000160239 #25 ENSGT01100000263542.A #26 ENSGT00390000007888.c.a.l ##27 ENSGT00390000007888.d #27 ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 #29 ENSGT00940000155471.d.h #30 ENSGT00940000156541 #31 ENSGT00940000155697.A #33 ENSGT00390000003571 #34 ENSGT00940000162293 #35 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000156210 #7 ENSGT00940000160677 #8 ENSGT01030000235089 ENSGT00940000161691 #9 ENSGT00940000154992.b #10 ENSGT00940000161553 #11 ENSGT00920000149157 #13 ENSGT00910000148110 ENSGT00390000008686.c #14 ENSGT00390000005979.a #15 ENSGT00950000183072.a #16 ENSGT00530000063779.B #17 ENSGT01020000230359.A #18 ENSGT01020000230359.B ##18 ENSGT00550000075117 #20 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.n #22 ENSGT00950000183138.a.a.a #23 ENSGT00910000147527 ENSGT00950000183138.a.a.b #24 ENSGT00940000160239 #25 ENSGT01100000263542.A #26 ENSGT00390000007888.c.a.l ##27 ENSGT00390000007888.d #27 ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 #29 ENSGT00940000155471.d.h #30 ENSGT00940000156541 #31 ENSGT00940000155697.A #33 ENSGT00390000003571 #34 ENSGT00940000162293 #35 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000156210 #7 ENSGT00940000160677 #8 ENSGT00940000161691 #9 ENSGT00940000154992.b #10 ENSGT00940000161553 #11 ENSGT00920000149157 #13 ENSGT00910000148110 ENSGT00390000008686.c #14 ENSGT00390000005979.a #15 ENSGT00950000183072.a #16 ENSGT00530000063779.B #17 ENSGT01020000230359.A #18 ENSGT00910000146711 #19 ENSGT00550000075117 #20 ENSGT00950000183099.u.b.a.b ##22 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.n #22 ENSGT00950000183138.a.a.a #23 ENSGT00950000183138.a.a.b #24 ENSGT00940000160239 #25 ENSGT01100000263542.A #26 ENSGT00390000007888.d #27 ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 #29 ENSGT00940000155471.d.h #30 ENSGT00940000156541 #31 ENSGT00940000155697.A #33 ENSGT00390000003571 #34 ENSGT00940000162293 #35 ENSGT00940000156402.B #36 ENSGT00940000159338 #37 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 1147 ENSPSMG00000022746 #22 ENSPSMG00000022736 #23 MYRIP (ENSPSMG00000022722) #24 EIF1B (ENSPSMG00000022669) #25 ENTPD3 (ENSPSMG00000022655) #26 RPL14 (ENSPSMG00000022611) ##27 ZNF620 (ENSPSMG00000022601) ZNF621 (ENSPSMG00000022598) #29 CTNNB1 (ENSPSMG00000022324) #30 ULK4 (ENSPSMG00000022017) #31 TRAK1 (ENSPSMG00000021676) #33 CCK (ENSPSMG00000021441) #34 LYZL4 (ENSPSMG00000021439) #35 VIPR1 (ENSPSMG00000021404) #36 SEC22C (ENSPSMG00000021333) #37 Mouse lemur MODERN SPECIES EXOG (ENSMICG00000049024) #8 ENSMICG00000048864 SCN5A (ENSMICG00000049061) #9 SCN10A (ENSMICG00000048891) #10 SCN11A (ENSMICG00000049555) #11 ENSMICG00000048876 #13 ENSMICG00000048955 GORASP1 (ENSMICG00000049376) #14 TTC21A (ENSMICG00000049173) #15 CSRNP1 (ENSMICG00000048986) #16 XIRP1 (ENSMICG00000049415) #17 CX3CR1 (ENSMICG00000049523) #18 ENSMICG00000049285 CCR8 (ENSMICG00000049430) ##18 SLC25A38 (ENSMICG00000049549) #20 ENSMICG00000049135 #22 ENSMICG00000048889 ENSMICG00000049047 #23 ENSMICG00000049587 MYRIP (ENSMICG00000049537) #24 EIF1B (ENSMICG00000049308) #25 ENTPD3 (ENSMICG00000049281) #26 RPL14 (ENSMICG00000048910) ##27 ZNF619 (ENSMICG00000049056) ZNF620 (ENSMICG00000049038) ZNF621 (ENSMICG00000049385) #29 CTNNB1 (ENSMICG00000049020) #30 ULK4 (ENSMICG00000049370) #31 TRAK1 (ENSMICG00000049328) #33 CCK (ENSMICG00000049534) #34 LYZL4 (ENSMICG00000049515) #35 Bushbaby DUPLICATION Bushbaby MODERN SPECIES 197 ENSOGAG00000003887 XYLB (ENSOGAG00000011874) ACVR2B (ENSOGAG00000032563) #7 EXOG (ENSOGAG00000011881) #8 SCN5A (ENSOGAG00000011885) #9 SCN10A (ENSOGAG00000014637) #10 SCN11A (ENSOGAG00000009240) #11 WDR48 (ENSOGAG00000004748) #13 GORASP1 (ENSOGAG00000004753) #14 TTC21A (ENSOGAG00000004755) #15 CSRNP1 (ENSOGAG00000004762) #16 ENSOGAG00000033419 CX3CR1 (ENSOGAG00000004235) #18 CCR8 (ENSOGAG00000004237) ##18 SLC25A38 (ENSOGAG00000004238) #20 ENSOGAG00000028830 #22 ENSOGAG00000029435 MOBP (ENSOGAG00000004240) #23 ENSOGAG00000025359 MYRIP (ENSOGAG00000011346) #24 EIF1B (ENSOGAG00000025224) #25 ENTPD3 (ENSOGAG00000002266) #26 ZNF621 (ENSOGAG00000024167) #29 CTNNB1 (ENSOGAG00000016157) #30 ULK4 (ENSOGAG00000016170) #31 TRAK1 (ENSOGAG00000014035) #33 CCK (ENSOGAG00000015476) #34 LYZL4 (ENSOGAG00000032320) #35 VIPR1 (ENSOGAG00000003824) #36 SEC22C (ENSOGAG00000003826) #37 SS18L2 (ENSOGAG00000003829) Bushbaby DUPLICATION Bushbaby DUPLICATION Bushbaby MODERN SPECIES 372 ENSOGAG00000028425 #22 PLA2G10 (ENSOGAG00000014638) BFAR (ENSOGAG00000014635) PARN (ENSOGAG00000014626) MRTFB (ENSOGAG00000014617) ERCC4 (ENSOGAG00000011235) ENSOGAG00000030314 Bushbaby MODERN SPECIES 120 DNAJC2 (ENSOGAG00000005159) PSMC2 (ENSOGAG00000005164) SLC26A5 (ENSOGAG00000008630) ENSOGAG00000010675 ENSOGAG00000029174 ORC5 (ENSOGAG00000008494) LHFPL3 (ENSOGAG00000024635) ENSOGAG00000028256 KMT2E (ENSOGAG00000002831) SRPK2 (ENSOGAG00000002836) PUS7 (ENSOGAG00000000450) RINT1 (ENSOGAG00000000453) EFCAB10 (ENSOGAG00000000454) ATXN7L1 (ENSOGAG00000000456) CDHR3 (ENSOGAG00000002589) ENSOGAG00000024806 #22 SYPL1 (ENSOGAG00000008079) NAMPT (ENSOGAG00000009361) CCDC71L (ENSOGAG00000025989) PIK3CG (ENSOGAG00000013097) PRKAR2B (ENSOGAG00000013100) HBP1 (ENSOGAG00000013102) ENSOGAG00000024472 COG5 (ENSOGAG00000013105) DUS4L (ENSOGAG00000013113) BCAP29 (ENSOGAG00000013116) ENSOGAG00000024960 SLC26A4 (ENSOGAG00000007081) CBLL1 (ENSOGAG00000007082) SLC26A3 (ENSOGAG00000007084) DLD (ENSOGAG00000003753) Bushbaby MODERN SPECIES 140 ENSOGAG00000011112 SPAG4 (ENSOGAG00000000805) ENSOGAG00000030487 ERGIC3 (ENSOGAG00000026774) ENSOGAG00000026840 ENSOGAG00000000342 CEP250 (ENSOGAG00000034414) ENSOGAG00000000333 GDF5 (ENSOGAG00000029192) UQCC1 (ENSOGAG00000001840) FAM83C (ENSOGAG00000001833) EIF6 (ENSOGAG00000001831) MMP24 (ENSOGAG00000008970) PROCR (ENSOGAG00000001829) EDEM2 (ENSOGAG00000001826) ENSOGAG00000026955 #22 ENSOGAG00000029126 TRPC4AP (ENSOGAG00000001822) MYH7B (ENSOGAG00000001809) GSS (ENSOGAG00000001806) ACSS2 (ENSOGAG00000001803) GGT7 (ENSOGAG00000012970) NCOA6 (ENSOGAG00000006333) TP53INP2 (ENSOGAG00000006332) PIGU (ENSOGAG00000003518) MAP1LC3A (ENSOGAG00000027682) ENSOGAG00000016802 ITCH (ENSOGAG00000016792) AHCY (ENSOGAG00000016787) ENSOGAG00000001417 RALY (ENSOGAG00000032337) Boreoeutheria DUPLICATION Boreoeutheria DUPLICATION Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.a.a ##22 Euarchontoglires DUPLICATION Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.a.a.a ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.a.a.a ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.a.a.a ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.a.a.a ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.a.a.a ##22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.a.a.a ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.a.a.a ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.a.a.a ##22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.a.a.a ##22 Pan ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.a.a.a ##22 Bonobo MODERN SPECIES 11 BPIFA1 (ENSPPAG00000034693) BPIFB1 (ENSPPAG00000029535) CDK5RAP1 (ENSPPAG00000008989) SNTA1 (ENSPPAG00000029137) CBFA2T2 (ENSPPAG00000042396) NECAB3 (ENSPPAG00000039394) C20orf144 (ENSPPAG00000042847) ACTL10 (ENSPPAG00000026624) E2F1 (ENSPPAG00000025868) PXMP4 (ENSPPAG00000028570) ZNF341 (ENSPPAG00000037384) ENSPPAG00000037596 CHMP4B (ENSPPAG00000028496) RALY (ENSPPAG00000034951) ENSPPAG00000043449 ENSPPAG00000041611 ##22 ENSPPAG00000041601 ENSPPAG00000043799 ASIP (ENSPPAG00000031015) AHCY (ENSPPAG00000037325) ITCH (ENSPPAG00000043454) ENSPPAG00000035927 ENSPPAG00000027765 ENSPPAG00000030059 MAP1LC3A (ENSPPAG00000037098) PIGU (ENSPPAG00000037046) TP53INP2 (ENSPPAG00000000861) NCOA6 (ENSPPAG00000034298) GGT7 (ENSPPAG00000035145) ACSS2 (ENSPPAG00000043497) GSS (ENSPPAG00000029155) Tarsier MODERN SPECIES 5266 HUS1 (ENSTSYG00000003812) SUN3 (ENSTSYG00000011150) C7orf57 (ENSTSYG00000010332) ENSTSYG00000036281 ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.a.a.a ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.a.a.a ##22 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.a.a.a ##22 Rabbit MODERN SPECIES 9 LIPN (ENSOCUG00000012495) LIPM (ENSOCUG00000012505) ANKRD22 (ENSOCUG00000004617) STAMBPL1 (ENSOCUG00000008174) ACTA2 (ENSOCUG00000008193) ENSOCUG00000008202 CH25H (ENSOCUG00000000545) LIPA (ENSOCUG00000001553) IFIT2 (ENSOCUG00000024939) IFIT3 (ENSOCUG00000032132) ENSOCUG00000005445 SLC16A12 (ENSOCUG00000014498) PANK1 (ENSOCUG00000002780) ENSOCUG00000031325 KIF20B (ENSOCUG00000002468) ENSOCUG00000025563 ##22 ENSOCUG00000030702 HTR7 (ENSOCUG00000016103) RPP30 (ENSOCUG00000006896) ANKRD1 (ENSOCUG00000006901) PCGF5 (ENSOCUG00000012993) HECTD2 (ENSOCUG00000015035) PPP1R3C (ENSOCUG00000015051) TNKS2 (ENSOCUG00000012010) BTAF1 (ENSOCUG00000010433) CPEB3 (ENSOCUG00000010454) MARCHF5 (ENSOCUG00000005719) IDE (ENSOCUG00000002827) ENSOCUG00000037602 KIF11 (ENSOCUG00000016706) ENSOCUG00000016719 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.a.a.b ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.a.a.b ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.a.a.b ##22 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.a.a.b ##22 Rabbit MODERN SPECIES 19 ENSOCUG00000027871 ENSOCUG00000000313 ENSOCUG00000029599 ENSOCUG00000026970 CD69 (ENSOCUG00000009055) KLRG1 (ENSOCUG00000017827) M6PR (ENSOCUG00000017823) PHC1 (ENSOCUG00000003600) A2ML1 (ENSOCUG00000014012) RIMKLB (ENSOCUG00000013997) ENSOCUG00000035657 MFAP5 (ENSOCUG00000002407) AICDA (ENSOCUG00000023739) APOBEC1 (ENSOCUG00000025736) GDF3 (ENSOCUG00000013747) ENSOCUG00000022961 ##22 ENSOCUG00000013783 ENSOCUG00000008575 FOXJ2 (ENSOCUG00000004313) C3AR1 (ENSOCUG00000007438) NECAP1 (ENSOCUG00000004309) CLEC4A (ENSOCUG00000010935) CLEC4D (ENSOCUG00000012312) CLEC4E (ENSOCUG00000009195) ENSOCUG00000022788 #22 CD163 (ENSOCUG00000003958) ENSOCUG00000027440 ENSOCUG00000039239 PEX5 (ENSOCUG00000005856) CLSTN3 (ENSOCUG00000014499) RBP5 (ENSOCUG00000023679) Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.a.a ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.a.a ##22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.a.a ##22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.a.a ##22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.a.a ##22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.a.a ##22 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.a.a ##22 American mink MODERN SPECIES 22 TMTC3 (ENSNVIG00000000330) ENSNVIG00000000305 DUSP6 (ENSNVIG00000000281) POC1B (ENSNVIG00000000231) ATP2B1 (ENSNVIG00000000007) ENSNVIG00000023933 CCER1 (ENSNVIG00000023927) EPYC (ENSNVIG00000023926) KERA (ENSNVIG00000023924) LUM (ENSNVIG00000023923) DCN (ENSNVIG00000023917) BTG1 (ENSNVIG00000023913) EEA1 (ENSNVIG00000023904) ENSNVIG00000023902 ENSNVIG00000023900 ENSNVIG00000023897 ##22 ENSNVIG00000023894 SOCS2 (ENSNVIG00000023891) Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.a.b ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.a.b ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.a.b ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.a.b ##22 Tarsier DUPLICATION Tarsier MODERN SPECIES 4673 DHX15 (ENSTSYG00000011430) CCDC149 (ENSTSYG00000013722) LGI2 (ENSTSYG00000030089) SEPSECS (ENSTSYG00000005545) ENSTSYG00000011791 ##22 PI4K2B (ENSTSYG00000000482) ZCCHC4 (ENSTSYG00000000364) ANAPC4 (ENSTSYG00000001298) Tarsier MODERN SPECIES 3313 RFX4 (ENSTSYG00000008562) RIC8B (ENSTSYG00000008570) TMEM263 (ENSTSYG00000026451) CRY1 (ENSTSYG00000010048) ENSTSYG00000036747 ##22 Boreoeutheria DUPLICATION Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.b.a ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.b.a ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.b.a ##22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.b.a ##22 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.b.a ##22 Mouse lemur DUPLICATION Mouse lemur MODERN SPECIES 4 KLF5 (ENSMICG00000014481) PIBF1 (ENSMICG00000011928) DIS3 (ENSMICG00000004703) BORA (ENSMICG00000008756) ENSMICG00000042445 ENSMICG00000037073 DACH1 (ENSMICG00000031012) ENSMICG00000046198 KLHL1 (ENSMICG00000005245) ENSMICG00000026328 PCDH9 (ENSMICG00000002338) ENSMICG00000045460 ENSMICG00000038136 PCDH20 (ENSMICG00000032560) TDRD3 (ENSMICG00000009982) ENSMICG00000043260 ##22 DIAPH3 (ENSMICG00000011388) PCDH17 (ENSMICG00000008032) ENSMICG00000028372 OLFM4 (ENSMICG00000001798) ENSMICG00000036582 PCDH8 (ENSMICG00000014653) CNMD (ENSMICG00000038059) SUGT1 (ENSMICG00000014614) ELF1 (ENSMICG00000035688) WBP4 (ENSMICG00000047481) KBTBD7 (ENSMICG00000014566) MTRF1 (ENSMICG00000033131) NAA16 (ENSMICG00000017489) RGCC (ENSMICG00000027653) VWA8 (ENSMICG00000017491) Mouse lemur MODERN SPECIES 169 CDK16 (ENSMICG00000016965) USP11 (ENSMICG00000016972) ZNF157 (ENSMICG00000017445) ENSMICG00000017670 ZNF41 (ENSMICG00000008558) ARAF (ENSMICG00000016177) SYN1 (ENSMICG00000016204) TIMP1 (ENSMICG00000029917) CFP (ENSMICG00000047059) ELK1 (ENSMICG00000016244) UXT (ENSMICG00000016263) ENSMICG00000001433 ZNF81 (ENSMICG00000037260) ENSMICG00000032436 ZNF182 (ENSMICG00000037147) ENSMICG00000042910 ##22 ENSMICG00000044570 ENSMICG00000034553 ENSMICG00000045282 SLC38A5 (ENSMICG00000013083) PORCN (ENSMICG00000013105) EBP (ENSMICG00000037008) TBC1D25 (ENSMICG00000013126) ENSMICG00000030860 ENSMICG00000047440 WDR13 (ENSMICG00000012548) WAS (ENSMICG00000035528) SUV39H1 (ENSMICG00000014379) BPIFA3 (ENSMICG00000045437) GLOD5 (ENSMICG00000029182) ENSMICG00000046068 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##22 Camelidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##22 Alpaca MODERN SPECIES 4271 ENSVPAG00000011530 ##22 Suina ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##22 Pig MODERN SPECIES 17 ACAT1 (ENSSSCG00000026153) CUL5 (ENSSSCG00000029198) ENSSSCG00000035345 RAB39A (ENSSSCG00000031723) SLC35F2 (ENSSSCG00000015001) ENSSSCG00000058217 SLN (ENSSSCG00000029651) ELMOD1 (ENSSSCG00000015002) ALKBH8 (ENSSSCG00000024628) ENSSSCG00000056752 CWF19L2 (ENSSSCG00000028201) KBTBD3 (ENSSSCG00000014999) AASDHPPT (ENSSSCG00000014998) MSANTD4 (ENSSSCG00000026833) GRIA4 (ENSSSCG00000030565) ENSSSCG00000037097 ##22 CASP1 (ENSSSCG00000028711) ENSSSCG00000014997 ENSSSCG00000014996 ENSSSCG00000032358 DDI1 (ENSSSCG00000014995) PDGFD (ENSSSCG00000014994) DYNC2H1 (ENSSSCG00000033937) DCUN1D5 (ENSSSCG00000014989) ENSSSCG00000035427 MMP13 (ENSSSCG00000014988) MMP12 (ENSSSCG00000014987) MMP3 (ENSSSCG00000059078) MMP1 (ENSSSCG00000014985) MMP8 (ENSSSCG00000029675) MMP27 (ENSSSCG00000014984) Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##22 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##22 Ferret MODERN SPECIES 370 PALMD (ENSMPUG00000012296) FRRS1 (ENSMPUG00000012289) AGL (ENSMPUG00000012276) SLC35A3 (ENSMPUG00000012271) MFSD14A (ENSMPUG00000012186) SASS6 (ENSMPUG00000012172) ENSMPUG00000012169 LRRC39 (ENSMPUG00000012163) DBT (ENSMPUG00000012125) RTCA (ENSMPUG00000012119) CDC14A (ENSMPUG00000012099) ENSMPUG00000012086 ##22 VCAM1 (ENSMPUG00000012080) EXTL2 (ENSMPUG00000012075) SLC30A7 (ENSMPUG00000012069) DPH5 (ENSMPUG00000012063) S1PR1 (ENSMPUG00000018549) OLFM3 (ENSMPUG00000012056) ENSMPUG00000018544 COL11A1 (ENSMPUG00000012034) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##22 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.b.b ##22 Mouse lemur MODERN SPECIES 22 DLGAP5 (ENSMICG00000016289) ENSMICG00000042184 ENSMICG00000041981 ATG14 (ENSMICG00000000939) TBPL2 (ENSMICG00000000943) KTN1 (ENSMICG00000032329) EAPP (ENSMICG00000044807) SPTSSA (ENSMICG00000046623) ENSMICG00000032213 ENSMICG00000047011 EGLN3 (ENSMICG00000000618) NPAS3 (ENSMICG00000031841) AKAP6 (ENSMICG00000027865) ARHGAP5 (ENSMICG00000007275) NUBPL (ENSMICG00000034340) ENSMICG00000027167 ##22 DTD2 (ENSMICG00000030584) HEATR5A (ENSMICG00000007619) HECTD1 (ENSMICG00000034057) AP4S1 (ENSMICG00000003359) STRN3 (ENSMICG00000026845) COCH (ENSMICG00000003344) SCFD1 (ENSMICG00000004149) G2E3 (ENSMICG00000014597) PRKD1 (ENSMICG00000001016) NOVA1 (ENSMICG00000034677) STXBP6 (ENSMICG00000035834) ENSMICG00000017194 ENSMICG00000027192 ENSMICG00000010090 DHRS2 (ENSMICG00000044785) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b #22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b #22 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b #22 Hyrax MODERN SPECIES 5152 ENSPCAG00000011437 #22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b #22 Sloth MODERN SPECIES 9077 ENSCHOG00000001021 #22 Armadillo MODERN SPECIES 1451 ZCCHC7 (ENSDNOG00000004148) GRHPR (ENSDNOG00000037952) ZBTB5 (ENSDNOG00000010253) POLR1E (ENSDNOG00000010257) FBXO10 (ENSDNOG00000010283) ENSDNOG00000035680 FRMPD1 (ENSDNOG00000042812) TRMT10B (ENSDNOG00000024558) EXOSC3 (ENSDNOG00000049791) ENSDNOG00000004272 DCAF10 (ENSDNOG00000042170) ENSDNOG00000017360 ENSDNOG00000035979 IGFBPL1 (ENSDNOG00000047361) ALDH1B1 (ENSDNOG00000014481) ENSDNOG00000044795 #22 SHB (ENSDNOG00000033867) Eutheria DUPLICATION Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.a.a ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.a.a ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.a.a ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.a.a ##22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.a.a ##22 Bushbaby DUPLICATION Bushbaby DUPLICATION Bushbaby MODERN SPECIES 120 DDX4 (ENSOGAG00000007588) SLC38A9 (ENSOGAG00000007583) ENSOGAG00000030919 PLPP1 (ENSOGAG00000002887) MTREX (ENSOGAG00000002886) DHX29 (ENSOGAG00000002880) CCNO (ENSOGAG00000007131) MCIDAS (ENSOGAG00000034851) GPX8 (ENSOGAG00000007129) CDC20B (ENSOGAG00000007120) GZMA (ENSOGAG00000007119) GZMK (ENSOGAG00000007116) ESM1 (ENSOGAG00000026369) ENSOGAG00000026791 ENSOGAG00000031260 ENSOGAG00000028955 ##22 SNX18 (ENSOGAG00000028588) HSPB3 (ENSOGAG00000000802) ENSOGAG00000033282 ARL15 (ENSOGAG00000016980) FST (ENSOGAG00000002121) MOCS2 (ENSOGAG00000011108) ITGA2 (ENSOGAG00000006905) ITGA1 (ENSOGAG00000017181) PELO (ENSOGAG00000027940) ISL1 (ENSOGAG00000034378) ENSOGAG00000011763 ENSOGAG00000029580 PARP8 (ENSOGAG00000005203) EMB (ENSOGAG00000005369) ENSOGAG00000029863 Bushbaby MODERN SPECIES 130 ENSOGAG00000024973 LRRN1 (ENSOGAG00000027599) ENSOGAG00000030861 ENSOGAG00000033945 CRBN (ENSOGAG00000007077) IL5RA (ENSOGAG00000007069) CNTN4 (ENSOGAG00000007059) CNTN6 (ENSOGAG00000002731) CHL1 (ENSOGAG00000012057) CNTN3 (ENSOGAG00000017171) PDZRN3 (ENSOGAG00000031641) PPP4R2 (ENSOGAG00000011001) GXYLT2 (ENSOGAG00000006647) SHQ1 (ENSOGAG00000003898) ENSOGAG00000030955 ENSOGAG00000033425 ##22 PROK2 (ENSOGAG00000014593) GPR27 (ENSOGAG00000032511) EIF4E3 (ENSOGAG00000014590) ENSOGAG00000027936 FOXP1 (ENSOGAG00000008367) MDFIC2 (ENSOGAG00000030030) MITF (ENSOGAG00000000043) FRMD4B (ENSOGAG00000002705) LMOD3 (ENSOGAG00000002704) ARL6IP5 (ENSOGAG00000007773) UBA3 (ENSOGAG00000007771) TMF1 (ENSOGAG00000007764) EOGT (ENSOGAG00000012093) TAFA4 (ENSOGAG00000012090) ENSOGAG00000028255 Bushbaby MODERN SPECIES 116 ENSOGAG00000003220 TUB (ENSOGAG00000013158) RIC3 (ENSOGAG00000013162) LMO1 (ENSOGAG00000013163) STK33 (ENSOGAG00000013164) TRIM66 (ENSOGAG00000011436) DENND2B (ENSOGAG00000012354) AKIP1 (ENSOGAG00000014006) C11orf16 (ENSOGAG00000014010) ASCL3 (ENSOGAG00000014012) TMEM9B (ENSOGAG00000014013) NRIP3 (ENSOGAG00000014016) SCUBE2 (ENSOGAG00000014018) DENND5A (ENSOGAG00000003407) TMEM41B (ENSOGAG00000003415) ENSOGAG00000026487 ##22 IPO7 (ENSOGAG00000011507) ZNF143 (ENSOGAG00000011518) WEE1 (ENSOGAG00000011523) SWAP70 (ENSOGAG00000010842) SBF2 (ENSOGAG00000010845) ADM (ENSOGAG00000016830) AMPD3 (ENSOGAG00000001761) RNF141 (ENSOGAG00000001765) LYVE1 (ENSOGAG00000001766) IRAG1 (ENSOGAG00000001768) CTR9 (ENSOGAG00000013884) ENSOGAG00000027912 GALNT18 (ENSOGAG00000013801) USP47 (ENSOGAG00000005261) DKK3 (ENSOGAG00000005265) Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.a.b ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.a.b ##22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.a.b ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.a.b ##22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.a.b ##22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.a.b ##22 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.a.b ##22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.a.b ##22 Microbat MODERN SPECIES 1000 ENSMLUG00000024011 ENSMLUG00000008375 TM2D1 (ENSMLUG00000028750) PATJ (ENSMLUG00000006861) KANK4 (ENSMLUG00000006932) USP1 (ENSMLUG00000012439) DOCK7 (ENSMLUG00000012444) ANGPTL3 (ENSMLUG00000015497) ATG4C (ENSMLUG00000029040) ENSMLUG00000028331 ##22 FOXD3 (ENSMLUG00000006018) ALG6 (ENSMLUG00000004045) ITGB3BP (ENSMLUG00000004057) EFCAB7 (ENSMLUG00000011542) ENSMLUG00000023512 PGM1 (ENSMLUG00000012744) ROR1 (ENSMLUG00000010560) ENSMLUG00000010579 CACHD1 (ENSMLUG00000007663) ENSMLUG00000028943 RAVER2 (ENSMLUG00000007699) JAK1 (ENSMLUG00000007723) ENSMLUG00000009622 DNAJC6 (ENSMLUG00000009642) LEPROT (ENSMLUG00000028850) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.a.b ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.a.b ##22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.a.b ##22 Bushbaby MODERN SPECIES 131 PRDX6 (ENSOGAG00000006282) SLC9C2 (ENSOGAG00000006284) ANKRD45 (ENSOGAG00000006288) KLHL20 (ENSOGAG00000004033) CENPL (ENSOGAG00000004038) DARS2 (ENSOGAG00000004039) ZBTB37 (ENSOGAG00000027115) SERPINC1 (ENSOGAG00000005083) RC3H1 (ENSOGAG00000004044) ENSOGAG00000005371 ENSOGAG00000034865 ENSOGAG00000005375 MRPS14 (ENSOGAG00000007741) TNN (ENSOGAG00000014283) TNR (ENSOGAG00000014296) ENSOGAG00000033363 ##22 COP1 (ENSOGAG00000015465) ENSOGAG00000025909 PAPPA2 (ENSOGAG00000008537) ASTN1 (ENSOGAG00000010659) BRINP2 (ENSOGAG00000003550) ENSOGAG00000030409 SEC16B (ENSOGAG00000012395) ENSOGAG00000029135 RASAL2 (ENSOGAG00000012400) TEX35 (ENSOGAG00000001062) ANGPTL1 (ENSOGAG00000014804) RALGPS2 (ENSOGAG00000014797) FAM20B (ENSOGAG00000012751) TOR3A (ENSOGAG00000012754) ABL2 (ENSOGAG00000012757) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.a.b ##22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.a.b ##22 Tenrec MODERN SPECIES 13870 ENSETEG00000006564 ##22 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00550000075032 ENSGT00390000004541 ENSGT00940000163856 ENSGT00730000111097.g.b ENSGT00940000157957 ENSGT00390000013973.A.a.d.d ENSGT00390000013973.A.a.d.c ENSGT00390000009163 ENSGT00940000153814.a ENSGT00950000182942.a.a ENSGT01020000230359.C.b ##18 ENSGT01020000230359.A #18 ENSGT01020000230359.B ##18 ENSGT00550000075117 #20 ENSGT00940000164532 #21 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a #22 ENSGT01050000244942.b.a.b ENSGT00950000183138.a.a.b #24 ENSGT00940000160239 #25 ENSGT00390000003571 #34 ENSGT00940000155697.A #33 ENSGT00940000156541 #31 ENSGT00940000155471.d.h #30 ENSGT00390000001296 ENSGT00940000156463 ENSGT00390000012690 ENSGT00940000155721 ENSGT00950000183130.C ENSGT00950000183186.B.b ENSGT00390000010209 ENSGT00390000009719 Opossum MODERN SPECIES 7 SUSD5 (ENSMODG00000025477) CRTAP (ENSMODG00000010792) ENSMODG00000039172 GLB1 (ENSMODG00000010812) CCR4 (ENSMODG00000010830) ##18 CX3CR1 (ENSMODG00000010797) #18 ENSMODG00000037704 ENSMODG00000010836 ##18 ENSMODG00000010840 ##18 ENSMODG00000010847 ENSMODG00000049076 ENSMODG00000037587 ENSMODG00000010857 SLC25A38 (ENSMODG00000046685) #20 ENSMODG00000010882 #21 ENSMODG00000010967 #22 TMC2 (ENSMODG00000010987) ENSMODG00000044548 ENSMODG00000024045 ENSMODG00000024043 ENSMODG00000048255 MYRIP (ENSMODG00000011047) #24 ENSMODG00000043014 EIF1B (ENSMODG00000002449) #25 CCK (ENSMODG00000011062) #34 TRAK1 (ENSMODG00000011111) #33 ULK4 (ENSMODG00000011134) #31 CTNNB1 (ENSMODG00000011192) #30 KIAA1143 (ENSMODG00000011201) KIF15 (ENSMODG00000011228) ENSMODG00000029706 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00550000075032 ENSGT00390000004541 ENSGT00940000163856 ENSGT00730000111097.g.b ENSGT00940000157957 ENSGT00390000013973.A.a.d.d ENSGT00390000013973.A.a.d.c ENSGT00390000009163 ENSGT00940000153814.a ENSGT00950000182942.a.a ENSGT01020000230359.C.b ##18 ENSGT01020000230359.A #18 ENSGT01020000230359.B ##18 ENSGT00550000075117 #20 ENSGT00940000164532 #21 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a #22 ENSGT01050000244942.b.a.b ENSGT00950000183138.a.a.b #24 ENSGT00940000160239 #25 ENSGT00390000003571 #34 ENSGT00940000155697.A #33 ENSGT00940000156541 #31 ENSGT00940000155471.d.h #30 ENSGT00390000001296 ENSGT00940000156463 ENSGT00390000012690 ENSGT00940000155721 ENSGT00950000183130.C ENSGT00950000183186.B.b ENSGT00390000010209 ENSGT00390000009719 Tasmanian devil MODERN SPECIES 4 GATAD1 (ENSSHAG00000025051) PEX1 (ENSSHAG00000018923) RBM48 (ENSSHAG00000018931) ENSSHAG00000024561 CDK6 (ENSSHAG00000003381) ENSSHAG00000009644 ENSSHAG00000009876 ENSSHAG00000023203 CRTAP (ENSSHAG00000021795) GLB1 (ENSSHAG00000022301) ENSSHAG00000001777 ##18 ENSSHAG00000028196 #18 ENSSHAG00000023944 ##18 ENSSHAG00000027456 #20 ENSSHAG00000006567 #21 ENSSHAG00000006896 #22 ENSSHAG00000007320 ENSSHAG00000023622 ENSSHAG00000012895 #23 ENSSHAG00000013510 #25 ENSSHAG00000014658 #34 TRAK1 (ENSSHAG00000014783) #33 ULK4 (ENSSHAG00000001220) #31 ENSSHAG00000008460 #30 ENSSHAG00000022754 ENSSHAG00000031700 KIF15 (ENSSHAG00000032000) ZDHHC3 (ENSSHAG00000026264) EXOSC7 (ENSSHAG00000003370) CLEC3B (ENSSHAG00000004709) CDCP1 (ENSSHAG00000005403) Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00550000075032 ENSGT00390000004541 ENSGT00940000163856 ENSGT00730000111097.g.b ENSGT00940000157957 ENSGT00390000013973.A.a.d.d ENSGT00390000013973.A.a.d.c ENSGT00390000009163 ENSGT00940000153814.a ENSGT00950000182942.a.a ENSGT01020000230359.C.b ##18 ENSGT01020000230359.A #18 ENSGT01020000230359.B ##18 ENSGT00550000075117 #20 ENSGT00940000164532 #21 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a #22 ENSGT01050000244942.b.a.b ENSGT00950000183138.a.a.b #24 ENSGT00940000160239 #25 ENSGT00390000003571 #34 ENSGT00940000155697.A #33 ENSGT00940000156541 #31 ENSGT00940000155471.d.h #30 ENSGT00390000001296 ENSGT00940000156463 ENSGT00390000012690 ENSGT00940000155721 ENSGT00950000183130.C ENSGT00950000183186.B.b ENSGT00390000010209 ENSGT00390000009719 Wallaby MODERN SPECIES 5210 ENSMEUG00000008169 #22 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000004541 ENSGT00940000163856 ENSGT00730000111097.g.b ENSGT00940000157957 ENSGT00390000013973.A.a.d.d ENSGT00390000013973.A.a.d.c ENSGT00390000009163 ENSGT00940000153814.a ENSGT00950000182942.a.a ENSGT01020000230359.C.b ##18 ENSGT01020000230359.A #18 ENSGT01020000230359.B ##18 ENSGT00550000075117 #20 ENSGT00940000164532.d #21 ENSGT00940000164532.c #21 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a #22 ENSGT01050000244942.b.a.b ENSGT00950000183138.a.a.b #24 ENSGT00940000160239 #25 ENSGT00390000003571 #34 ENSGT00940000155697.A #33 ENSGT00940000156541 #31 ENSGT00940000155471.d.h #30 ENSGT00390000001296 ENSGT00940000156463 ENSGT00390000012690 ENSGT00940000155721 ENSGT00950000183130.C ENSGT00950000183186.B.b ENSGT00390000010209 ENSGT00390000009719 koala DUPLICATION koala MODERN SPECIES 27 ENSPCIG00000004656 ENSPCIG00000026738 TAAR5 (ENSPCIG00000026740) ENSPCIG00000036119 ENSPCIG00000026745 ENSPCIG00000031817 ENSPCIG00000032195 ENSPCIG00000030801 ENSPCIG00000034198 ENSPCIG00000034672 TAAR9 (ENSPCIG00000033886) ENSPCIG00000031635 STX7 (ENSPCIG00000029100) ENSPCIG00000034276 MOXD1 (ENSPCIG00000029101) ENSPCIG00000014914 #22 CCN2 (ENSPCIG00000009440) ENPP1 (ENSPCIG00000010328) ENSPCIG00000035631 ENPP3 (ENSPCIG00000008801) MED23 (ENSPCIG00000016019) ARG1 (ENSPCIG00000016352) ENSPCIG00000020677 EPB41L2 (ENSPCIG00000020678) SAMD3 (ENSPCIG00000010285) L3MBTL3 (ENSPCIG00000031927) ARHGAP18 (ENSPCIG00000005065) LAMA2 (ENSPCIG00000013422) PTPRK (ENSPCIG00000019692) THEMIS (ENSPCIG00000024955) ENSPCIG00000033967 koala MODERN SPECIES 28 ENSPCIG00000034934 ENSPCIG00000026017 CDK6 (ENSPCIG00000030740) ENSPCIG00000002108 ENSPCIG00000002097 SUSD5 (ENSPCIG00000003505) CRTAP (ENSPCIG00000010418) GLB1 (ENSPCIG00000010406) CCR4 (ENSPCIG00000010402) ##18 CX3CR1 (ENSPCIG00000010400) #18 CCR8 (ENSPCIG00000036945) ##18 ENSPCIG00000032234 SLC25A38 (ENSPCIG00000007860) #20 ENSPCIG00000036695 #21 ENSPCIG00000012582 #21 ENSPCIG00000012575 #22 TMC2 (ENSPCIG00000012572) ENSPCIG00000014355 ENSPCIG00000034043 ENSPCIG00000003822 ENSPCIG00000005018 ENSPCIG00000005026 ENSPCIG00000004556 ENSPCIG00000037453 #24 ENSPCIG00000036948 #23 EIF1B (ENSPCIG00000016375) #25 CCK (ENSPCIG00000022691) #34 TRAK1 (ENSPCIG00000016370) #33 ULK4 (ENSPCIG00000014784) #31 CTNNB1 (ENSPCIG00000014703) #30 ENSPCIG00000035837 Theria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b ##22 Eutheria DUPLICATION Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a ##22 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a ##22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a ##22 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a ##22 Elephant MODERN SPECIES 472 ENSLAFG00000007786 ENSLAFG00000022756 UHRF2 (ENSLAFG00000000669) GLDC (ENSLAFG00000000430) KDM4C (ENSLAFG00000013829) DMAC1 (ENSLAFG00000012977) PTPRD (ENSLAFG00000017308) ENSLAFG00000027855 TYRP1 (ENSLAFG00000001901) LURAP1L (ENSLAFG00000001902) MPDZ (ENSLAFG00000018210) NFIB (ENSLAFG00000000868) ZDHHC21 (ENSLAFG00000008950) CER1 (ENSLAFG00000014736) FREM1 (ENSLAFG00000008954) ENSLAFG00000028826 ##22 TTC39B (ENSLAFG00000013786) SNAPC3 (ENSLAFG00000013869) PSIP1 (ENSLAFG00000013878) CCDC171 (ENSLAFG00000013490) BNC2 (ENSLAFG00000000476) ENSLAFG00000021349 ENSLAFG00000027513 CNTLN (ENSLAFG00000007075) SH3GL2 (ENSLAFG00000005475) ADAMTSL1 (ENSLAFG00000011076) SAXO1 (ENSLAFG00000011081) RRAGA (ENSLAFG00000011082) HAUS6 (ENSLAFG00000011084) PLIN2 (ENSLAFG00000011091) DENND4C (ENSLAFG00000010751) Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a ##22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a ##22 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a ##22 Hedgehog MODERN SPECIES 9988 ENSEEUG00000010552 ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a ##22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a ##22 Suina ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a ##22 Pig MODERN SPECIES 14 ENSSSCG00000053348 MAPRE2 (ENSSSCG00000003738) ZNF397 (ENSSSCG00000039052) ZSCAN30 (ENSSSCG00000003740) ENSSSCG00000003741 ZNF24 (ENSSSCG00000023276) ZNF396 (ENSSSCG00000030018) INO80C (ENSSSCG00000038859) GALNT1 (ENSSSCG00000003743) C18orf21 (ENSSSCG00000030002) RPRD1A (ENSSSCG00000027700) SLC39A6 (ENSSSCG00000027455) ELP2 (ENSSSCG00000020898) MOCOS (ENSSSCG00000003744) FHOD3 (ENSSSCG00000027935) ENSSSCG00000003746 ##22 TPGS2 (ENSSSCG00000026953) KIAA1328 (ENSSSCG00000003747) ENSSSCG00000047288 ENSSSCG00000045019 CELF4 (ENSSSCG00000003748) PIK3C3 (ENSSSCG00000003749) ENSSSCG00000037233 SYT4 (ENSSSCG00000037079) KCNG2 (ENSSSCG00000005780) SLC66A2 (ENSSSCG00000023171) HSBP1L1 (ENSSSCG00000005778) TXNL4A (ENSSSCG00000005777) ENSSSCG00000038475 ADNP2 (ENSSSCG00000038632) PARD6G (ENSSSCG00000023376) Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a ##22 Camelidae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000156210 #7 ENSGT00940000160677 #8 ENSGT00940000161691 #9 ENSGT01030000235089 ENSGT00940000154992.b #10 ENSGT00940000161553 #11 ENSGT00920000149157 #13 ENSGT00390000008686.c #14 ENSGT00390000005979.a #15 ENSGT00950000183072.a #16 ENSGT00530000063779.B #17 ENSGT01020000230359.A #18 ENSGT00910000146711 #19 ENSGT01020000230359.B ##18 ENSGT00550000075117 #20 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a ##22 ENSGT00940000164532 #21 ENSGT00950000183138.a.a.a #23 ENSGT00950000183138.a.a.b #24 ENSGT00940000160239 #25 ENSGT01100000263542.A #26 ENSGT00390000007888.d #27 ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000155471.d.h #30 ENSGT00940000156541 #31 ENSGT00940000155697.A #33 ENSGT00390000003571 #34 ENSGT00940000162293 #35 ENSGT00940000156402.B #36 ENSGT00940000159338 #37 Alpaca MODERN SPECIES 2272 CCR8 (ENSVPAG00000012303) ##18 SLC25A38 (ENSVPAG00000012305) #20 ENSVPAG00000012307 ##22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a ##22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a ##22 Felidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a ##22 Cat MODERN SPECIES 249 NECAB1 (ENSFCAG00000003667) TMEM64 (ENSFCAG00000025477) CALB1 (ENSFCAG00000005505) DECR1 (ENSFCAG00000005501) NBN (ENSFCAG00000030357) OSGIN2 (ENSFCAG00000023415) RIPK2 (ENSFCAG00000018768) MMP16 (ENSFCAG00000027771) CNBD1 (ENSFCAG00000026138) CNGB3 (ENSFCAG00000013632) ENSFCAG00000052793 CPNE3 (ENSFCAG00000027515) ENSFCAG00000049116 RMDN1 (ENSFCAG00000011637) WWP1 (ENSFCAG00000025184) ENSFCAG00000018604 ##22 ATP6V0D2 (ENSFCAG00000007936) PSKH2 (ENSFCAG00000024665) CA2 (ENSFCAG00000005137) CA3 (ENSFCAG00000031511) CA1 (ENSFCAG00000022214) RBIS (ENSFCAG00000026366) CA13 (ENSFCAG00000008686) LRRCC1 (ENSFCAG00000018992) ENSFCAG00000026605 RALYL (ENSFCAG00000030707) SNX16 (ENSFCAG00000010012) CHMP4C (ENSFCAG00000027266) ZFAND1 (ENSFCAG00000023384) IMPA1 (ENSFCAG00000031340) FABP12 (ENSFCAG00000033501) Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a ##22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a ##22 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a ##22 Ferret DUPLICATION Ferret MODERN SPECIES 195 ASXL3 (ENSMPUG00000001206) NOL4 (ENSMPUG00000001205) DTNA (ENSMPUG00000001203) MAPRE2 (ENSMPUG00000001185) ZNF397 (ENSMPUG00000001181) ZSCAN30 (ENSMPUG00000001177) ENSMPUG00000001175 ENSMPUG00000001159 ##22 ZNF24 (ENSMPUG00000001157) ZNF396 (ENSMPUG00000001156) ENSMPUG00000001155 INO80C (ENSMPUG00000001144) GALNT1 (ENSMPUG00000001141) C18orf21 (ENSMPUG00000001139) RPRD1A (ENSMPUG00000001133) SLC39A6 (ENSMPUG00000001131) ELP2 (ENSMPUG00000001125) ENSMPUG00000001121 ENSMPUG00000001116 FHOD3 (ENSMPUG00000001110) TPGS2 (ENSMPUG00000001097) KIAA1328 (ENSMPUG00000001094) CELF4 (ENSMPUG00000001027) Ferret MODERN SPECIES 378 ENSMPUG00000012027 ENSMPUG00000012036 ENSMPUG00000012041 GPM6A (ENSMPUG00000012044) WDR17 (ENSMPUG00000012048) SPATA4 (ENSMPUG00000012057) ASB5 (ENSMPUG00000012088) VEGFC (ENSMPUG00000012093) ENSMPUG00000012133 ##22 NEIL3 (ENSMPUG00000012143) AGA (ENSMPUG00000012147) Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a ##22 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000160169 ENSGT00920000149143 ENSGT00940000161505 ENSGT00940000158191 ENSGT00950000183192.a.a.b ENSGT00950000183195.b.a ENSGT00390000011890 ENSGT00940000159456 ENSGT00390000010899.a.a ENSGT00940000157229 ENSGT00390000007015 ENSGT00390000010770 ENSGT00940000156087 ENSGT00940000161537 ENSGT00390000016577 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a ##22 ENSGT00390000007937 ENSGT00530000063737 ENSGT00530000064011 ENSGT00950000183128.C ENSGT00940000157848.f ENSGT00940000160477 ENSGT00390000011163.b ENSGT00940000158908 ENSGT00940000156521.b ENSGT00390000012412 ENSGT00940000154813 ENSGT00940000157501 ENSGT00940000159887 ENSGT00390000019941 ENSGT00940000154746.e.b Dog MODERN SPECIES 36 ZFYVE26 (ENSCAFG00845003602) RDH12 (ENSCAFG00845003571) RDH11 (ENSCAFG00845003551) VTI1B (ENSCAFG00845003511) ARG2 (ENSCAFG00845003478) PIGH (ENSCAFG00845003443) PLEKHH1 (ENSCAFG00845003414) TMEM229B (ENSCAFG00845003381) PLEK2 (ENSCAFG00845003328) EIF2S1 (ENSCAFG00845003308) ATP6V1D (ENSCAFG00845003279) PALS1 (ENSCAFG00845003252) GARIN2 (ENSCAFG00845003237) ENSCAFG00845003227 ENSCAFG00845003219 ENSCAFG00845003201 ##22 GPHN (ENSCAFG00845003022) CCDC196 (ENSCAFG00845002927) ENSCAFG00845002877 ENSCAFG00845002859 ENSCAFG00845002840 ENSCAFG00845002829 FUT8 (ENSCAFG00845002810) MAX (ENSCAFG00845002666) FNTB (ENSCAFG00845002568) ENSCAFG00845002535 GPX2 (ENSCAFG00845002511) ENSCAFG00845002489 SPTB (ENSCAFG00845002451) PLEKHG3 (ENSCAFG00845002267) PPP1R36 (ENSCAFG00845002212) Dingo MODERN SPECIES 161 RDH11 (ENSCAFG00020006316) VTI1B (ENSCAFG00020006324) ARG2 (ENSCAFG00020006329) PIGH (ENSCAFG00020006335) PLEKHH1 (ENSCAFG00020006366) TMEM229B (ENSCAFG00020006534) PLEK2 (ENSCAFG00020006535) EIF2S1 (ENSCAFG00020006539) ATP6V1D (ENSCAFG00020006543) PALS1 (ENSCAFG00020006548) GARIN2 (ENSCAFG00020006693) GPHN (ENSCAFG00020006734) ENSCAFG00020006739 ENSCAFG00020006742 ENSCAFG00020006743 ENSCAFG00020006753 ##22 CCDC196 (ENSCAFG00020006761) FUT8 (ENSCAFG00020006786) ENSCAFG00020006817 ENSCAFG00020006820 ENSCAFG00020006824 MAX (ENSCAFG00020006853) FNTB (ENSCAFG00020006858) RAB15 (ENSCAFG00020006867) GPX2 (ENSCAFG00020006873) ENSCAFG00020006879 SPTB (ENSCAFG00020006916) PLEKHG3 (ENSCAFG00020007103) PPP1R36 (ENSCAFG00020007140) HSPA2 (ENSCAFG00020007157) ZBTB1 (ENSCAFG00020007170) Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a ##22 Equus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a ##22 Donkey MODERN SPECIES 11 TBCE (ENSEASG00005001261) B3GALNT2 (ENSEASG00005001274) GNG4 (ENSEASG00005031442) ENSEASG00005004854 LYST (ENSEASG00005001718) NID1 (ENSEASG00005003319) GPR137B (ENSEASG00005003328) ERO1B (ENSEASG00005003339) EDARADD (ENSEASG00005035726) LGALS8 (ENSEASG00005003376) HEATR1 (ENSEASG00005003385) ACTN2 (ENSEASG00005003395) MTR (ENSEASG00005003419) RYR2 (ENSEASG00005004008) ENSEASG00005006867 ENSEASG00005038575 ##22 ENSEASG00005029888 ENSEASG00005006874 ENSEASG00005024885 ENSEASG00005006878 ENSEASG00005035011 ENSEASG00005006886 ENSEASG00005006887 ENSEASG00005027928 ENSEASG00005034379 ENSEASG00005006894 RET (ENSEASG00005006900) CSGALNACT2 (ENSEASG00005006901) RASGEF1A (ENSEASG00005006902) ENSEASG00005026024 FXYD4 (ENSEASG00005028773) Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a ##22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a ##22 Microbat DUPLICATION Microbat MODERN SPECIES 937 ENSMLUG00000029686 ISOC1 (ENSMLUG00000023846) SLC27A6 (ENSMLUG00000011142) FBN2 (ENSMLUG00000008374) SLC12A2 (ENSMLUG00000008327) CTXN3 (ENSMLUG00000009416) PRRC1 (ENSMLUG00000010866) MEGF10 (ENSMLUG00000010818) C5orf63 (ENSMLUG00000002467) MARCHF3 (ENSMLUG00000009747) LMNB1 (ENSMLUG00000009721) ENSMLUG00000000184 ALDH7A1 (ENSMLUG00000002944) GRAMD2B (ENSMLUG00000002933) ENSMLUG00000028224 ENSMLUG00000023257 ##22 ZNF608 (ENSMLUG00000008677) CSNK1G3 (ENSMLUG00000013708) CEP120 (ENSMLUG00000015490) PRDM6 (ENSMLUG00000010064) PPIC (ENSMLUG00000024456) SNX24 (ENSMLUG00000009392) SNX2 (ENSMLUG00000007851) SNCAIP (ENSMLUG00000012563) ENSMLUG00000012560 LOX (ENSMLUG00000026720) SRFBP1 (ENSMLUG00000009984) ENSMLUG00000030652 PRR16 (ENSMLUG00000016069) ENSMLUG00000022953 ENSMLUG00000023391 Microbat DUPLICATION Microbat MODERN SPECIES 1158 FOCAD (ENSMLUG00000003955) HACD4 (ENSMLUG00000003980) IFNB1 (ENSMLUG00000008021) KLHL9 (ENSMLUG00000007175) ENSMLUG00000026947 ENSMLUG00000027734 ENSMLUG00000023736 ENSMLUG00000030465 ENSMLUG00000027612 ENSMLUG00000028931 ENSMLUG00000024850 ENSMLUG00000027376 IFNE (ENSMLUG00000010970) MTAP (ENSMLUG00000014410) ENSMLUG00000030508 ENSMLUG00000024291 ##22 CDKN2A (ENSMLUG00000029865) CDKN2B (ENSMLUG00000007025) ENSMLUG00000030162 Microbat MODERN SPECIES 983 FLNC (ENSMLUG00000001339) ENSMLUG00000001392 ATP6V1FNB (ENSMLUG00000027620) KCP (ENSMLUG00000001394) IRF5 (ENSMLUG00000001406) ENSMLUG00000026557 TNPO3 (ENSMLUG00000000947) ENSMLUG00000030322 TSPAN33 (ENSMLUG00000000974) SMO (ENSMLUG00000000966) ENSMLUG00000029505 ENSMLUG00000023124 ENSMLUG00000023097 AHCYL2 (ENSMLUG00000017565) STRIP2 (ENSMLUG00000007265) ENSMLUG00000023935 ##22 SMKR1 (ENSMLUG00000027572) ENSMLUG00000028002 ENSMLUG00000003100 UBE2H (ENSMLUG00000000102) ENSMLUG00000000063 KLHDC10 (ENSMLUG00000025634) TMEM209 (ENSMLUG00000015369) SSMEM1 (ENSMLUG00000015383) CPA2 (ENSMLUG00000015389) CPA4 (ENSMLUG00000015399) ENSMLUG00000015407 CPA1 (ENSMLUG00000015415) CEP41 (ENSMLUG00000015427) MEST (ENSMLUG00000015437) COPG2 (ENSMLUG00000027742) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a ##22 Primates DUPLICATION Primates DUPLICATION Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a.e.a ##22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a.e.a ##22 Bushbaby MODERN SPECIES 194 IL1RL2 (ENSOGAG00000008050) IL1R1 (ENSOGAG00000008049) IL1R2 (ENSOGAG00000012491) MAP4K4 (ENSOGAG00000012488) RFX8 (ENSOGAG00000033445) CREG2 (ENSOGAG00000003495) RNF149 (ENSOGAG00000034221) CNOT11 (ENSOGAG00000014506) TBC1D8 (ENSOGAG00000014498) ENSOGAG00000014494 NPAS2 (ENSOGAG00000014490) ENSOGAG00000026729 PDCL3 (ENSOGAG00000015138) NMS (ENSOGAG00000015135) CHST10 (ENSOGAG00000008178) ENSOGAG00000027230 ##22 LONRF2 (ENSOGAG00000003794) AFF3 (ENSOGAG00000013262) REV1 (ENSOGAG00000013247) EIF5B (ENSOGAG00000013238) TXNDC9 (ENSOGAG00000013234) LYG1 (ENSOGAG00000013231) LYG2 (ENSOGAG00000002242) ENSOGAG00000002241 MITD1 (ENSOGAG00000002240) LIPT1 (ENSOGAG00000002238) ENSOGAG00000002233 CRACDL (ENSOGAG00000002228) MGAT4A (ENSOGAG00000011487) UNC50 (ENSOGAG00000011484) COA5 (ENSOGAG00000011481) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a.e.a ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a.e.a ##22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a.e.a ##22 Mas night monkey MODERN SPECIES 1078 TMEM108 (ENSANAG00000022953) BFSP2 (ENSANAG00000021646) ENSANAG00000037850 TOPBP1 (ENSANAG00000029863) TF (ENSANAG00000011189) SRPRB (ENSANAG00000028236) RAB6B (ENSANAG00000017472) ENSANAG00000026314 SLCO2A1 (ENSANAG00000034598) RYK (ENSANAG00000019307) AMOTL2 (ENSANAG00000032616) ANAPC13 (ENSANAG00000024542) CEP63 (ENSANAG00000021086) KY (ENSANAG00000029898) EPHB1 (ENSANAG00000029295) ENSANAG00000035115 ##22 PPP2R3A (ENSANAG00000033386) MSL2 (ENSANAG00000033232) PCCB (ENSANAG00000025980) STAG1 (ENSANAG00000026680) SLC35G2 (ENSANAG00000019929) NCK1 (ENSANAG00000004151) IL20RB (ENSANAG00000024924) SOX14 (ENSANAG00000013249) CLDN18 (ENSANAG00000032746) ENSANAG00000036905 DZIP1L (ENSANAG00000028445) A4GNT (ENSANAG00000009800) DBR1 (ENSANAG00000028952) ARMC8 (ENSANAG00000023313) NME9 (ENSANAG00000021464) Tarsier MODERN SPECIES 5951 ENSTSYG00000030190 ##22 ENSTSYG00000026363 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a.e.b ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a.e.b ##22 Tarsier MODERN SPECIES 3033 ENSTSYG00000030034 ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a.f ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a.f ##22 Tarsier MODERN SPECIES 4702 ENSTSYG00000035318 ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a.f ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a.f ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a.f ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a.f ##22 Vervet Monkey MODERN SPECIES 25 CCNE1 (ENSCSAG00000004850) C19orf12 (ENSCSAG00000004862) PLEKHF1 (ENSCSAG00000018508) POP4 (ENSCSAG00000004868) VSTM2B (ENSCSAG00000004872) UQCRFS1 (ENSCSAG00000004876) ENSCSAG00000004890 ENSCSAG00000004895 ENSCSAG00000004898 ZNF726 (ENSCSAG00000004902) ZNF681 (ENSCSAG00000004903) ENSCSAG00000004906 ENSCSAG00000018506 ENSCSAG00000004910 ZNF724 (ENSCSAG00000004914) ENSCSAG00000004919 ##22 ENSCSAG00000004924 ENSCSAG00000004928 ENSCSAG00000004935 ENSCSAG00000018504 ENSCSAG00000004945 ENSCSAG00000004956 ENSCSAG00000004964 ENSCSAG00000004967 ZNF43 (ENSCSAG00000004971) ENSCSAG00000018502 ENSCSAG00000004974 ENSCSAG00000004976 ENSCSAG00000004980 ENSCSAG00000004984 ENSCSAG00000004989 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a.f ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a.f ##22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a.f ##22 Drill MODERN SPECIES 1422 ENSMLEG00000003862 CACNA1E (ENSMLEG00000033118) ENSMLEG00000042627 ##22 MR1 (ENSMLEG00000044129) STX6 (ENSMLEG00000037024) KIAA1614 (ENSMLEG00000031704) XPR1 (ENSMLEG00000040363) ENSMLEG00000043837 ACBD6 (ENSMLEG00000000612) LHX4 (ENSMLEG00000038342) Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a.f ##22 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 113 LAMC2 (ENSMNEG00000034941) LAMC1 (ENSMNEG00000043245) ENSMNEG00000018461 SHCBP1L (ENSMNEG00000007697) DHX9 (ENSMNEG00000041195) NPL (ENSMNEG00000037920) RGS8 (ENSMNEG00000005442) RGS16 (ENSMNEG00000037294) RNASEL (ENSMNEG00000032732) RGSL1 (ENSMNEG00000043113) TEDDM1 (ENSMNEG00000023492) GLUL (ENSMNEG00000028425) ENSMNEG00000027953 CACNA1E (ENSMNEG00000036541) ENSMNEG00000035832 ENSMNEG00000030971 ##22 IER5 (ENSMNEG00000026967) MR1 (ENSMNEG00000036147) STX6 (ENSMNEG00000036076) KIAA1614 (ENSMNEG00000035828) XPR1 (ENSMNEG00000033221) ACBD6 (ENSMNEG00000032228) LHX4 (ENSMNEG00000040868) QSOX1 (ENSMNEG00000032745) CEP350 (ENSMNEG00000042448) TOR1AIP1 (ENSMNEG00000029059) TOR1AIP2 (ENSMNEG00000032323) FAM163A (ENSMNEG00000041258) ENSMNEG00000036108 TDRD5 (ENSMNEG00000030554) NPHS2 (ENSMNEG00000035745) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a.f ##22 Gibbon MODERN SPECIES 6 CRISPLD1 (ENSNLEG00000001758) HNF4G (ENSNLEG00000001920) ENSNLEG00000033520 ZFHX4 (ENSNLEG00000001972) PEX2 (ENSNLEG00000002007) PKIA (ENSNLEG00000002025) ZC2HC1A (ENSNLEG00000002029) IL7 (ENSNLEG00000002086) STMN2 (ENSNLEG00000002114) HEY1 (ENSNLEG00000030175) ENSNLEG00000034481 ENSNLEG00000002256 ENSNLEG00000034160 ENSNLEG00000035176 ZBTB10 (ENSNLEG00000002387) ENSNLEG00000032396 ##22 ZNF704 (ENSNLEG00000002414) PAG1 (ENSNLEG00000002436) ENSNLEG00000035421 PMP2 (ENSNLEG00000002468) FABP9 (ENSNLEG00000002486) FABP4 (ENSNLEG00000002499) ENSNLEG00000031941 FABP12 (ENSNLEG00000002515) ENSNLEG00000035358 ENSNLEG00000033082 IMPA1 (ENSNLEG00000002540) SLC10A5 (ENSNLEG00000018239) ZFAND1 (ENSNLEG00000031659) CHMP4C (ENSNLEG00000002649) SNX16 (ENSNLEG00000002659) Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a.f ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a.f ##22 Gorilla MODERN SPECIES 21 HNF4G (ENSGGOG00000008488) ENSGGOG00000038569 ZFHX4 (ENSGGOG00000024837) PEX2 (ENSGGOG00000038623) PKIA (ENSGGOG00000024164) ZC2HC1A (ENSGGOG00000014981) ENSGGOG00000043346 IL7 (ENSGGOG00000000476) ENSGGOG00000038719 STMN2 (ENSGGOG00000004781) HEY1 (ENSGGOG00000009960) ENSGGOG00000036769 ENSGGOG00000022057 ENSGGOG00000025551 ZBTB10 (ENSGGOG00000015527) ENSGGOG00000025836 ##22 ENSGGOG00000040617 ENSGGOG00000043203 ZNF704 (ENSGGOG00000008615) PAG1 (ENSGGOG00000010323) FABP5 (ENSGGOG00000040215) ENSGGOG00000037273 ENSGGOG00000038245 ENSGGOG00000025372 ENSGGOG00000036256 FABP4 (ENSGGOG00000007338) FABP12 (ENSGGOG00000016835) ENSGGOG00000039385 IMPA1 (ENSGGOG00000009176) SLC10A5 (ENSGGOG00000022257) ZFAND1 (ENSGGOG00000023665) Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a.f ##22 Pan ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000160054 ENSGT00940000160631 ENSGT00940000158280 ENSGT00390000016493.b.a ENSGT00550000074952 ENSGT00940000154351.k.a ENSGT00390000017491.s.a.b.b ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.b.a ENSGT01000000214413.a ENSGT00940000157971 ENSGT00910000147188 ENSGT00940000155347.a.b ENSGT00940000154555.b.cb ENSGT00940000157573 ENSGT00950000183103.c ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a.f ##22 ENSGT00940000160298 ENSGT00940000155174 ENSGT00950000183105.B.a.a.b ENSGT00940000156218 ENSGT00760000120436 ENSGT00950000183090.A ENSGT00940000160497 ENSGT00940000154745.b ENSGT00390000004930 ENSGT00940000160047.t ENSGT00530000063948.b ENSGT00940000155943.a ENSGT00940000158905 ENSGT00940000157298.b ENSGT01050000244970.b Bonobo MODERN SPECIES 6 ENSPPAG00000040680 TMOD2 (ENSPPAG00000030814) TMOD3 (ENSPPAG00000029067) ENSPPAG00000016895 LEO1 (ENSPPAG00000040132) MAPK6 (ENSPPAG00000026917) ENSPPAG00000034401 BCL2L10 (ENSPPAG00000036717) GNB5 (ENSPPAG00000039567) MYO5C (ENSPPAG00000038522) ENSPPAG00000004057 MYO5A (ENSPPAG00000028091) ARPP19 (ENSPPAG00000035761) ATOSA (ENSPPAG00000036434) ONECUT1 (ENSPPAG00000036491) ENSPPAG00000004218 ##22 WDR72 (ENSPPAG00000043364) ENSPPAG00000028747 ENSPPAG00000012061 RAB27A (ENSPPAG00000030622) PIGBOS1 (ENSPPAG00000023425) PIGB (ENSPPAG00000042876) CCPG1 (ENSPPAG00000041408) PIERCE2 (ENSPPAG00000042984) DNAAF4 (ENSPPAG00000013865) ENSPPAG00000031216 PYGO1 (ENSPPAG00000031145) PRTG (ENSPPAG00000034279) ENSPPAG00000016223 ENSPPAG00000036985 ENSPPAG00000034242 Chimpanzee MODERN SPECIES 6 LYSMD2 (ENSPTRG00000007078) TMOD2 (ENSPTRG00000044713) TMOD3 (ENSPTRG00000007080) ENSPTRG00000044798 LEO1 (ENSPTRG00000007081) MAPK6 (ENSPTRG00000020224) ENSPTRG00000043753 BCL2L10 (ENSPTRG00000007083) GNB5 (ENSPTRG00000007084) MYO5C (ENSPTRG00000007085) ENSPTRG00000043417 MYO5A (ENSPTRG00000023562) ARPP19 (ENSPTRG00000051653) ATOSA (ENSPTRG00000007089) ONECUT1 (ENSPTRG00000007090) ENSPTRG00000048408 ##22 WDR72 (ENSPTRG00000007092) UNC13C (ENSPTRG00000007093) RSL24D1 (ENSPTRG00000007094) RAB27A (ENSPTRG00000007095) PIGBOS1 (ENSPTRG00000044984) PIGB (ENSPTRG00000007096) CCPG1 (ENSPTRG00000034458) PIERCE2 (ENSPTRG00000052094) DNAAF4 (ENSPTRG00000007098) PYGO1 (ENSPTRG00000042720) PRTG (ENSPTRG00000007101) NEDD4 (ENSPTRG00000007102) ENSPTRG00000045291 RFX7 (ENSPTRG00000007104) TEX9 (ENSPTRG00000007105) Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a ##22 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a ##22 Rabbit DUPLICATION Rabbit MODERN SPECIES ENSOCUG00000029631 ENSOCUG00000030222 ENSOCUG00000009135 ENSOCUG00000035956 ENSOCUG00000033013 GRIN3A (ENSOCUG00000016738) RNF20 (ENSOCUG00000012019) ALDOB (ENSOCUG00000014944) ZNF189 (ENSOCUG00000014941) MRPL50 (ENSOCUG00000006340) ENSOCUG00000039388 ENSOCUG00000009723 ENSOCUG00000038477 ENSOCUG00000026800 PLPPR1 (ENSOCUG00000013668) ENSOCUG00000022518 ##22 ENSOCUG00000030214 ENSOCUG00000025109 CAVIN4 (ENSOCUG00000022294) ENSOCUG00000006373 TEX10 (ENSOCUG00000004242) INVS (ENSOCUG00000004233) ERP44 (ENSOCUG00000004220) STX17 (ENSOCUG00000004217) NR4A3 (ENSOCUG00000000737) ENSOCUG00000039058 ALG2 (ENSOCUG00000005676) TGFBR1 (ENSOCUG00000016292) COL15A1 (ENSOCUG00000016236) GALNT12 (ENSOCUG00000016221) ANKS6 (ENSOCUG00000016201) Rabbit MODERN SPECIES 3 ENSOCUG00000031523 ENSOCUG00000030296 ENSOCUG00000033653 AKAP7 (ENSOCUG00000013991) ENSOCUG00000039380 ENSOCUG00000032736 EPB41L2 (ENSOCUG00000001799) ENSOCUG00000022399 TMEM200A (ENSOCUG00000008357) ENSOCUG00000030950 SAMD3 (ENSOCUG00000016249) L3MBTL3 (ENSOCUG00000016226) ENSOCUG00000022997 TMEM244 (ENSOCUG00000029600) ARHGAP18 (ENSOCUG00000009450) ENSOCUG00000024589 ##22 ENSOCUG00000037260 LAMA2 (ENSOCUG00000009427) PTPRK (ENSOCUG00000001697) THEMIS (ENSOCUG00000006061) ENSOCUG00000037431 ENSOCUG00000031668 ENSOCUG00000033497 ENSOCUG00000033422 ENSOCUG00000037603 ENSOCUG00000008917 ENSOCUG00000000036 KIAA0408 (ENSOCUG00000027883) ENSOCUG00000030946 ENSOCUG00000036596 ECHDC1 (ENSOCUG00000006548) Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a ##22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a ##22 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 192 Smpx (ENSJJAG00000015249) Cnksr2 (ENSJJAG00000016115) ENSJJAG00000011807 ENSJJAG00000016309 ENSJJAG00000016365 ##22 ENSJJAG00000016502 ENSJJAG00000011798 Rps6ka3 (ENSJJAG00000016899) Eif1ax (ENSJJAG00000016949) Map7d2 (ENSJJAG00000017202) Tmem47 (ENSJJAG00000017721) ENSJJAG00000018035 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a ##22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a ##22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a ##22 Prairie vole MODERN SPECIES 13 ENSMOCG00000009835 Tle3 (ENSMOCG00000007663) ENSMOCG00000008158 Kif23 (ENSMOCG00000008773) Paqr5 (ENSMOCG00000009266) Glce (ENSMOCG00000019169) Spesp1 (ENSMOCG00000016907) ENSMOCG00000014776 ENSMOCG00000004428 Coro2b (ENSMOCG00000011097) Itga11 (ENSMOCG00000003119) Fem1b (ENSMOCG00000005442) Cln6 (ENSMOCG00000021992) Calml4 (ENSMOCG00000018493) Pias1 (ENSMOCG00000022074) ENSMOCG00000019235 ##22 Skor1 (ENSMOCG00000018261) Map2k5 (ENSMOCG00000022058) 2300009A05Rik (ENSMOCG00000013991) Iqch (ENSMOCG00000016873) Aagab (ENSMOCG00000021340) Smad3 (ENSMOCG00000018490) Smad6 (ENSMOCG00000014458) Lctl (ENSMOCG00000004744) Zwilch (ENSMOCG00000017159) ENSMOCG00000021901 Snapc5 (ENSMOCG00000015348) Map2k1 (ENSMOCG00000013072) Tipin (ENSMOCG00000010343) Dis3l (ENSMOCG00000005278) Megf11 (ENSMOCG00000003573) Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a ##22 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 76 Lrit2 (ENSCGRG00001017784) ENSCGRG00001016916 Cdhr1 (ENSCGRG00001012932) Gpr15lg (ENSCGRG00001000757) Ghitm (ENSCGRG00001023033) Nrg3 (ENSCGRG00001024148) Sh2d4b (ENSCGRG00001015755) Tspan14 (ENSCGRG00001013610) Prxl2a (ENSCGRG00001006989) Dydc2 (ENSCGRG00001005256) Dydc1 (ENSCGRG00001000992) Mat1a (ENSCGRG00001018656) Sftpa1 (ENSCGRG00001017978) Mbl1 (ENSCGRG00001017391) Sftpd (ENSCGRG00001016517) ENSCGRG00001014762 ##22 ENSCGRG00001012384 Ube2e2 (ENSCGRG00001007796) Ube2e1 (ENSCGRG00001002657) Nkiras1 (ENSCGRG00001001506) Rpl15 (ENSCGRG00001021972) Nr1d2 (ENSCGRG00001007315) Thrb (ENSCGRG00001007517) Rarb (ENSCGRG00001000228) Top2b (ENSCGRG00001020296) Ngly1 (ENSCGRG00001015315) Oxsm (ENSCGRG00001010895) Lrrc3b (ENSCGRG00001010343) Nek10 (ENSCGRG00001023436) Slc4a7 (ENSCGRG00001019823) ENSCGRG00001011398 Golden Hamster DUPLICATION Golden Hamster DUPLICATION Golden Hamster MODERN SPECIES 964 ENSMAUG00000011886 ##22 Golden Hamster MODERN SPECIES 641 ENSMAUG00000014771 Cdk1 (ENSMAUG00000020301) Rhobtb1 (ENSMAUG00000021113) Tmem26 (ENSMAUG00000021815) Cabcoco1 (ENSMAUG00000021961) Arid5b (ENSMAUG00000009016) Rtkn2 (ENSMAUG00000003167) Zfp365 (ENSMAUG00000020138) Egr2 (ENSMAUG00000021143) Nrbf2 (ENSMAUG00000021159) ENSMAUG00000002201 Reep3 (ENSMAUG00000021449) ENSMAUG00000021521 Ctnna3 (ENSMAUG00000012953) Lrrtm3 (ENSMAUG00000021553) ENSMAUG00000021196 ##22 Dnajc12 (ENSMAUG00000021444) Sirt1 (ENSMAUG00000008395) Herc4 (ENSMAUG00000009776) Mypn (ENSMAUG00000021985) Atoh7 (ENSMAUG00000010517) Pbld1 (ENSMAUG00000022220) Pbld2 (ENSMAUG00000022266) Hnrnph3 (ENSMAUG00000022233) Rufy2 (ENSMAUG00000005119) Dna2 (ENSMAUG00000002986) Slc25a16 (ENSMAUG00000009526) Tet1 (ENSMAUG00000007644) ENSMAUG00000022270 ENSMAUG00000002239 ENSMAUG00000022192 Golden Hamster MODERN SPECIES 627 Derl2 (ENSMAUG00000013807) Mis12 (ENSMAUG00000012935) 6330403K07Rik (ENSMAUG00000021541) ENSMAUG00000019662 Wscd1 (ENSMAUG00000014219) Aipl1 (ENSMAUG00000012023) Pimreg (ENSMAUG00000010744) Pitpnm3 (ENSMAUG00000010515) ENSMAUG00000011942 4930563E22Rik (ENSMAUG00000009173) Slc13a5 (ENSMAUG00000009167) Fbxo39 (ENSMAUG00000017927) Mybbp1a (ENSMAUG00000021236) Spns2 (ENSMAUG00000006810) Spns3 (ENSMAUG00000001547) ENSMAUG00000014587 ##22 Ube2g1 (ENSMAUG00000017142) Ankfy1 (ENSMAUG00000021325) Atp2a3 (ENSMAUG00000005976) P2rx1 (ENSMAUG00000010044) ENSMAUG00000008683 Emc6 (ENSMAUG00000006733) Tax1bp3 (ENSMAUG00000011911) Ctns (ENSMAUG00000003764) Shpk (ENSMAUG00000021496) Trpv1 (ENSMAUG00000008181) Trpv3 (ENSMAUG00000019522) Aspa (ENSMAUG00000016472) Spata22 (ENSMAUG00000017890) Or1e1c (ENSMAUG00000004137) Or1e16 (ENSMAUG00000020111) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a ##22 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a ##22 Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a ##22 Alpin marmot MODERN SPECIES 476 ENSMMMG00000011254 ##22 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00390000005639.a.a ENSGT00960000191062 ENSGT00390000010628 ENSGT00530000063586.b ENSGT00940000154372.a.b ENSGT00390000017291.a ENSGT00390000017291.b ENSGT00390000006172 ENSGT00940000155482 ENSGT01030000235096 ENSGT00940000159588 ENSGT00940000160357 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000161843 ENSGT00940000164241 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a ##22 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000161846 ENSGT00940000160595.b ENSGT00390000009416 ENSGT00940000159192 ENSGT00940000157037.a ENSGT00940000159350 ENSGT00390000012901 ENSGT00390000003477 ENSGT00940000158750 ENSGT00390000000483.b ENSGT00390000014853 ENSGT00940000161623 ENSGT00390000016221 ENSGT00940000160490 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 9 ENSUPAG00010017287 TAPT1 (ENSUPAG00010017269) PROM1 (ENSUPAG00010017205) FGFBP1 (ENSUPAG00010017197) CD38 (ENSUPAG00010017184) BST1 (ENSUPAG00010017165) FBXL5 (ENSUPAG00010017123) CC2D2A (ENSUPAG00010017099) ENSUPAG00010017096 C1QTNF7 (ENSUPAG00010017088) CPEB2 (ENSUPAG00010017042) ENSUPAG00010017031 ENSUPAG00010017005 NKX3-2 (ENSUPAG00010016996) ENSUPAG00010016979 ENSUPAG00010016971 ##22 HS3ST1 (ENSUPAG00010016961) CLNK (ENSUPAG00010016897) ZNF518B (ENSUPAG00010016890) WDR1 (ENSUPAG00010016882) SLC2A9 (ENSUPAG00010016627) DRD5 (ENSUPAG00010016614) OTOP1 (ENSUPAG00010016596) TMEM128 (ENSUPAG00010016576) LYAR (ENSUPAG00010016569) ZBTB49 (ENSUPAG00010016556) NSG1 (ENSUPAG00010016542) STX18 (ENSUPAG00010016466) Squirrel MODERN SPECIES 77 QDPR (ENSSTOG00000009916) ENSSTOG00000034519 LDB2 (ENSSTOG00000002035) TAPT1 (ENSSTOG00000025519) PROM1 (ENSSTOG00000020690) CD38 (ENSSTOG00000005495) BST1 (ENSSTOG00000023011) FBXL5 (ENSSTOG00000022023) CC2D2A (ENSSTOG00000005160) C1QTNF7 (ENSSTOG00000011103) ENSSTOG00000030843 ENSSTOG00000002388 BOD1L1 (ENSSTOG00000026900) NKX3-2 (ENSSTOG00000021803) ENSSTOG00000004135 ENSSTOG00000021226 ##22 HS3ST1 (ENSSTOG00000005820) CLNK (ENSSTOG00000014009) ZNF518B (ENSSTOG00000014006) WDR1 (ENSSTOG00000004366) SLC2A9 (ENSSTOG00000023633) DRD5 (ENSSTOG00000024357) OTOP1 (ENSSTOG00000025465) TMEM128 (ENSSTOG00000000546) ENSSTOG00000000548 ZBTB49 (ENSSTOG00000000550) NSG1 (ENSSTOG00000014987) STX18 (ENSSTOG00000014992) MSX1 (ENSSTOG00000020201) CYTL1 (ENSSTOG00000000183) STK32B (ENSSTOG00000004994) Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a ##22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a ##22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a ##22 Degu MODERN SPECIES 111 FAM181A (ENSODEG00000011589) ASB2 (ENSODEG00000007460) OTUB2 (ENSODEG00000008797) ENSODEG00000007700 ENSODEG00000008703 PPP4R4 (ENSODEG00000008810) SERPINA10 (ENSODEG00000008574) SERPINA6 (ENSODEG00000008142) FBLN5 (ENSODEG00000008614) TC2N (ENSODEG00000008900) PPP4R3A (ENSODEG00000008219) CCDC88C (ENSODEG00000007311) GPR68 (ENSODEG00000019499) RPS6KA5 (ENSODEG00000007384) TTC7B (ENSODEG00000008126) ENSODEG00000007733 ##22 NRDE2 (ENSODEG00000012422) ENSODEG00000007323 ENSODEG00000008355 KCNK13 (ENSODEG00000008807) TDP1 (ENSODEG00000009548) EFCAB11 (ENSODEG00000010563) ENSODEG00000009019 ENSODEG00000019584 ENSODEG00000008461 FOXN3 (ENSODEG00000008087) TTC8 (ENSODEG00000006816) EML5 (ENSODEG00000006936) ENSODEG00000008995 ENSODEG00000008476 ENSODEG00000006567 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 127 ENSCLAG00000016657 SLC25A38 (ENSCLAG00000015393) #20 ENSCLAG00000015318 ##22 ENSCLAG00000014655 #23 MYRIP (ENSCLAG00000016112) #24 EIF1B (ENSCLAG00000016040) #25 ENTPD3 (ENSCLAG00000016343) #26 RPL14 (ENSCLAG00000016120) ##27 ZNF621 (ENSCLAG00000016834) #29 CTNNB1 (ENSCLAG00000016464) #30 ULK4 (ENSCLAG00000015979) #31 TRAK1 (ENSCLAG00000014205) #33 CCK (ENSCLAG00000017113) #34 LYZL4 (ENSCLAG00000016944) #35 VIPR1 (ENSCLAG00000016513) #36 SEC22C (ENSCLAG00000016050) #37 SS18L2 (ENSCLAG00000015815) NKTR (ENSCLAG00000014179) Eutheria DUPLICATION Eutheria DUPLICATION Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.a.a ##22 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.a.a ##22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.a.a ##22 Armadillo MODERN SPECIES 2193 AKAP4 (ENSDNOG00000032581) ENSDNOG00000030597 CLCN5 (ENSDNOG00000033098) USP27X (ENSDNOG00000001002) ENSDNOG00000003715 ENSDNOG00000007200 PPP1R3F (ENSDNOG00000019332) FOXP3 (ENSDNOG00000012826) CCDC22 (ENSDNOG00000044674) CACNA1F (ENSDNOG00000006166) SYP (ENSDNOG00000032408) ENSDNOG00000045007 ENSDNOG00000031352 PLP2 (ENSDNOG00000002320) MAGIX (ENSDNOG00000036078) ENSDNOG00000039101 ##22 GPKOW (ENSDNOG00000016647) WDR45 (ENSDNOG00000046908) PRAF2 (ENSDNOG00000031883) CCDC120 (ENSDNOG00000017059) TFE3 (ENSDNOG00000039173) GRIPAP1 (ENSDNOG00000038321) KCND1 (ENSDNOG00000033902) OTUD5 (ENSDNOG00000032210) PIM2 (ENSDNOG00000015644) SLC35A2 (ENSDNOG00000015641) PQBP1 (ENSDNOG00000015637) TIMM17B (ENSDNOG00000047305) PCSK1N (ENSDNOG00000045077) ERAS (ENSDNOG00000014657) HDAC6 (ENSDNOG00000002754) Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.a.a ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.a.a ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.a.a ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.a.a ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.a.a ##22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.a.a ##22 Hystricomorpha DUPLICATION Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.a.a.a ##22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.a.a.a ##22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.a.a.a ##22 Degu MODERN SPECIES 51 CACUL1 (ENSODEG00000017578) NANOS1 (ENSODEG00000017556) EIF3A (ENSODEG00000017775) ENSODEG00000017551 ENSODEG00000017739 GRK5 (ENSODEG00000017760) RGS10 (ENSODEG00000017673) TIAL1 (ENSODEG00000017741) ENSODEG00000020474 BAG3 (ENSODEG00000017665) INPP5F (ENSODEG00000017771) MCMBP (ENSODEG00000017666) ENSODEG00000017627 ENSODEG00000017568 ENSODEG00000020513 ENSODEG00000017620 ##22 ENSODEG00000017622 PLPP4 (ENSODEG00000017787) ENSODEG00000017528 WDR11 (ENSODEG00000017999) ENSODEG00000017729 ENSODEG00000017521 FGFR2 (ENSODEG00000017727) ENSODEG00000017613 ATE1 (ENSODEG00000017714) NSMCE4A (ENSODEG00000017586) ENSODEG00000017758 BTBD16 (ENSODEG00000017181) ENSODEG00000017646 ENSODEG00000017854 HTRA1 (ENSODEG00000017523) Naked mole-rat female MODERN SPECIES 14 ENSHGLG00000038577 PAMR1 (ENSHGLG00000007733) SLC1A2 (ENSHGLG00000010072) CD44 (ENSHGLG00000011767) ENSHGLG00000047526 ENSHGLG00000040571 ENSHGLG00000010978 APIP (ENSHGLG00000011839) EHF (ENSHGLG00000009758) ELF5 (ENSHGLG00000011019) CAT (ENSHGLG00000011741) ENSHGLG00000016446 NAT10 (ENSHGLG00000016891) ENSHGLG00000018658 ENSHGLG00000009842 ENSHGLG00000006506 ##22 ENSHGLG00000035097 ENSHGLG00000048933 ENSHGLG00000013910 ENSHGLG00000044243 HIPK3 (ENSHGLG00000018314) ENSHGLG00000040843 CSTF3 (ENSHGLG00000017834) TCP11L1 (ENSHGLG00000018599) ENSHGLG00000018618 ENSHGLG00000044852 ENSHGLG00000046320 QSER1 (ENSHGLG00000015709) ENSHGLG00000043439 ENSHGLG00000041603 ENSHGLG00000014399 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.a.a.b ##22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.a.a.b ##22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.a.a.b ##22 Degu DUPLICATION Degu MODERN SPECIES 218 ENSODEG00000002220 HEXB (ENSODEG00000002081) GFM2 (ENSODEG00000002193) ENSODEG00000002883 FAM169A (ENSODEG00000002906) ENSODEG00000002941 GCNT4 (ENSODEG00000018869) ANKRD31 (ENSODEG00000003017) HMGCR (ENSODEG00000003319) CERT1 (ENSODEG00000002483) POLK (ENSODEG00000002687) ANKDD1B (ENSODEG00000003019) POC5 (ENSODEG00000003014) SV2C (ENSODEG00000003155) IQGAP2 (ENSODEG00000003459) ENSODEG00000003730 ##22 F2RL1 (ENSODEG00000002463) S100Z (ENSODEG00000002505) CRHBP (ENSODEG00000002524) ENSODEG00000002814 Degu MODERN SPECIES 44 ENSODEG00000018444 ENSODEG00000018441 ENSODEG00000018384 C18orf32 (ENSODEG00000018385) ENSODEG00000020491 ENSODEG00000018460 ENSODEG00000018365 ENSODEG00000018393 DYM (ENSODEG00000018486) SMAD7 (ENSODEG00000018424) CTIF (ENSODEG00000018390) ZBTB7C (ENSODEG00000018417) SMAD2 (ENSODEG00000018373) ENSODEG00000018377 ENSODEG00000018340 ENSODEG00000018367 ##22 SKOR2 (ENSODEG00000018363) IER3IP1 (ENSODEG00000018375) HDHD2 (ENSODEG00000018388) KATNAL2 (ENSODEG00000018481) ENSODEG00000018457 ENSODEG00000020536 ENSODEG00000018432 ST8SIA5 (ENSODEG00000018352) ENSODEG00000020498 LOXHD1 (ENSODEG00000018482) RNF165 (ENSODEG00000018412) C18orf25 (ENSODEG00000018458) ENSODEG00000018366 ATP5F1A (ENSODEG00000018359) ENSODEG00000020534 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.a.a ##22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.a.a ##22 Bushbaby MODERN SPECIES 297 INTS6 (ENSOGAG00000005794) SERPINE3 (ENSOGAG00000025738) FAM124A (ENSOGAG00000005790) ENSOGAG00000016491 RNASEH2B (ENSOGAG00000016486) ENSOGAG00000029384 DLEU7 (ENSOGAG00000009127) ENSOGAG00000030664 ##22 TRIM13 (ENSOGAG00000013692) SPRYD7 (ENSOGAG00000013140) KPNA3 (ENSOGAG00000002349) FLCN (ENSOGAG00000008179) PLD6 (ENSOGAG00000030239) MPRIP (ENSOGAG00000028979) TNFRSF13B (ENSOGAG00000027463) USP22 (ENSOGAG00000015801) DHRS7B (ENSOGAG00000004465) TMEM11 (ENSOGAG00000004467) NATD1 (ENSOGAG00000004469) MAP2K3 (ENSOGAG00000004471) ENSOGAG00000000051 POSTN (ENSOGAG00000013376) Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.a.b ##22 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.a.b ##22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.a.b ##22 Armadillo MODERN SPECIES 1316 CMYA5 (ENSDNOG00000040392) MTX3 (ENSDNOG00000043463) THBS4 (ENSDNOG00000010496) ENSDNOG00000019622 ENSDNOG00000046018 ##22 ENSDNOG00000009003 ENSDNOG00000007096 FAM151B (ENSDNOG00000043373) ANKRD34B (ENSDNOG00000001607) ENSDNOG00000043623 ENSDNOG00000038425 MSH3 (ENSDNOG00000005942) RASGRF2 (ENSDNOG00000002801) CKMT2 (ENSDNOG00000016705) ZCCHC9 (ENSDNOG00000016708) ACOT12 (ENSDNOG00000009900) SSBP2 (ENSDNOG00000009927) ENSDNOG00000032637 ENSDNOG00000049021 SERPINA12 (ENSDNOG00000014643) Eutheria DUPLICATION Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.b.a ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.b.a ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.b.a ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.b.a ##22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.b.a ##22 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.b.a ##22 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.b.a ##22 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 376 ENSPCOG00000021547 USP25 (ENSPCOG00000021493) ENSPCOG00000003664 ENSPCOG00000007739 ##22 ENSPCOG00000019299 SAMSN1 (ENSPCOG00000016595) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.b.a ##22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.b.a ##22 Armadillo MODERN SPECIES 3917 ENSDNOG00000038857 AADAC (ENSDNOG00000016245) SUCNR1 (ENSDNOG00000042451) ENSDNOG00000036321 ENSDNOG00000040040 MBNL1 (ENSDNOG00000044505) ENSDNOG00000045832 ##22 P2RY1 (ENSDNOG00000034630) RAP2B (ENSDNOG00000003783) ENSDNOG00000035352 ARHGEF26 (ENSDNOG00000001679) DHX36 (ENSDNOG00000001682) Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.b.b ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.b.b ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.b.b ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.b.b ##22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.b.b ##22 Bushbaby MODERN SPECIES 316 ENSOGAG00000030690 ENSOGAG00000034365 ENSOGAG00000027246 ##22 AMOT (ENSOGAG00000011561) LHFPL1 (ENSOGAG00000011559) RTL4 (ENSOGAG00000032419) ENSOGAG00000025522 TRPC5 (ENSOGAG00000005962) ENSOGAG00000007568 ENSOGAG00000031713 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.b.b ##22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.b.b ##22 Armadillo MODERN SPECIES 1257 ENSDNOG00000031730 ##22 ENSDNOG00000030940 Eutheria DUPLICATION Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.c.a ##22 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.c.a ##22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.c.a ##22 Armadillo MODERN SPECIES 624 BRD7 (ENSDNOG00000010716) ADCY7 (ENSDNOG00000001042) ENSDNOG00000033734 ##22 TENT4B (ENSDNOG00000001039) HEATR3 (ENSDNOG00000013116) CNEP1R1 (ENSDNOG00000044447) ENSDNOG00000036118 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.c.a ##22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.c.a ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.c.a ##22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.c.a ##22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.c.a ##22 Camelidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.c.a ##22 Alpaca MODERN SPECIES 2196 MYOZ1 (ENSVPAG00000008022) ENSVPAG00000008023 FUT11 (ENSVPAG00000008026) CHCHD1 (ENSVPAG00000008027) ENSVPAG00000008029 VCL (ENSVPAG00000008030) AP3M1 (ENSVPAG00000008035) ADK (ENSVPAG00000008036) ENSVPAG00000008037 ##22 KAT6B (ENSVPAG00000008038) ENSVPAG00000008039 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.c.b ##22 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.c.b ##22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.c.b ##22 Armadillo DUPLICATION Armadillo DUPLICATION Armadillo DUPLICATION Armadillo MODERN SPECIES 2632 ENSDNOG00000042322 ##22 ENSDNOG00000019040 ENSDNOG00000042069 ENSDNOG00000035877 ##22 Armadillo MODERN SPECIES 305 ENSDNOG00000048782 ENSDNOG00000035845 ##22 Armadillo MODERN SPECIES 2632 ENSDNOG00000035877 ##22 ENSDNOG00000042069 ENSDNOG00000019040 ENSDNOG00000042322 ##22 Armadillo DUPLICATION Armadillo DUPLICATION Armadillo DUPLICATION Armadillo DUPLICATION Armadillo MODERN SPECIES 134 ENSDNOG00000041327 ##22 Armadillo MODERN SPECIES 1443 ENSDNOG00000043345 ##22 Armadillo MODERN SPECIES 387 ENSDNOG00000036828 ##22 Armadillo MODERN SPECIES 2420 ENSDNOG00000040697 ##22 UCP2 (ENSDNOG00000031735) DNAJB13 (ENSDNOG00000000529) PAAF1 (ENSDNOG00000045529) COA4 (ENSDNOG00000008154) MRPL48 (ENSDNOG00000002177) ENSDNOG00000008487 Armadillo MODERN SPECIES 3438 ENSDNOG00000034233 ##22 Eutheria DUPLICATION Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.d.a ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.d.a ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.d.a ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.d.a ##22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.d.a ##22 Bushbaby MODERN SPECIES 344 RPS6KC1 (ENSOGAG00000013193) ENSOGAG00000024451 ##22 ENSOGAG00000000449 PROX1 (ENSOGAG00000017025) SMYD2 (ENSOGAG00000017028) ENSOGAG00000033159 PTPN14 (ENSOGAG00000017030) CENPF (ENSOGAG00000001123) ENSOGAG00000033696 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.d.a ##22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.d.a ##22 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.d.a ##22 Elephant MODERN SPECIES 95 ENSLAFG00000021420 ENPEP (ENSLAFG00000008127) ELOVL6 (ENSLAFG00000021532) EGF (ENSLAFG00000013803) LRIT3 (ENSLAFG00000009373) RRH (ENSLAFG00000009369) CFI (ENSLAFG00000011698) PLA2G12A (ENSLAFG00000000852) CASP6 (ENSLAFG00000002727) MCUB (ENSLAFG00000002726) SEC24B (ENSLAFG00000013688) ENSLAFG00000008674 ETNPPL (ENSLAFG00000008666) OSTC (ENSLAFG00000026381) RPL34 (ENSLAFG00000032615) ENSLAFG00000025607 ##22 LEF1 (ENSLAFG00000016434) HADH (ENSLAFG00000016430) CYP2U1 (ENSLAFG00000016424) SGMS2 (ENSLAFG00000016422) PAPSS1 (ENSLAFG00000018426) DKK2 (ENSLAFG00000007133) GIMD1 (ENSLAFG00000027733) AIMP1 (ENSLAFG00000012639) TBCK (ENSLAFG00000018410) NPNT (ENSLAFG00000005763) GSTCD (ENSLAFG00000021544) INTS12 (ENSLAFG00000010076) ENSLAFG00000031287 ENSLAFG00000012329 ENSLAFG00000026913 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.d.b ##22 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.d.b ##22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.d.b ##22 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.d.b ##22 Elephant MODERN SPECIES 71 UBE2T (ENSLAFG00000015069) PPP1R12B (ENSLAFG00000012724) SYT2 (ENSLAFG00000018343) KDM5B (ENSLAFG00000005104) ENSLAFG00000018012 RABIF (ENSLAFG00000031433) KLHL12 (ENSLAFG00000003515) ADIPOR1 (ENSLAFG00000003520) CYB5R1 (ENSLAFG00000003522) ENSLAFG00000030999 ENSLAFG00000026325 ENSLAFG00000030427 TMEM183A (ENSLAFG00000018443) PPFIA4 (ENSLAFG00000018446) MYOG (ENSLAFG00000013113) ENSLAFG00000023356 ##22 ADORA1 (ENSLAFG00000001262) MYBPH (ENSLAFG00000001264) CHI3L1 (ENSLAFG00000003983) CHIT1 (ENSLAFG00000017125) BTG2 (ENSLAFG00000031964) FMOD (ENSLAFG00000003588) PRELP (ENSLAFG00000027913) ATP2B4 (ENSLAFG00000012442) LAX1 (ENSLAFG00000010336) ZBED6 (ENSLAFG00000029775) ENSLAFG00000031207 ENSLAFG00000010344 SNRPE (ENSLAFG00000009349) SOX13 (ENSLAFG00000015918) ETNK2 (ENSLAFG00000015937) Marsupialia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b ##22 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b ##22 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b ##22 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b ##22 Common wonbat MODERN SPECIES 1066 ENSVURG00010016697 ENSVURG00010016686 ENSVURG00010016646 ENSVURG00010016612 ENSVURG00010016577 ENSVURG00010016561 ENSVURG00010016551 ENSVURG00010016491 ENSVURG00010016470 ENSVURG00010016447 ENSVURG00010016387 ENSVURG00010016375 ENSVURG00010016303 ENSVURG00010016243 ENSVURG00010016210 ENSVURG00010016194 ##22 ENSVURG00010016176 ENSVURG00010015787 ENSVURG00010015728 ENSVURG00010015703 ENSVURG00010015680 ENSVURG00010015676 ENSVURG00010015650 ENSVURG00010015628 ENSVURG00010015615 ENSVURG00010015601 ENSVURG00010015588 ENSVURG00010015566 ENSVURG00010015530 ENSVURG00010015506 ENSVURG00010015471