Mammalia ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000160796 ENSGT00940000163083 ENSGT01100000263710 ENSGT00940000177252 ENSGT00940000155574.C ENSGT00940000156148 ENSGT00940000153845.a.b ENSGT00390000009163 ENSGT00940000153814.a ENSGT00390000010260 ENSGT00950000182942.a.a ENSGT01020000230359.C.b ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 ENSGT00950000183099.u.a #22 ENSGT00950000183099.u.b.a ##22 ENSGT01050000244942.b.a.b ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT00390000003571 ENSGT00940000155697.A ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00390000001296 ENSGT00940000156463 ENSGT00390000012690 ENSGT01050000244939.b ENSGT00940000155721 ENSGT00950000183130.C ENSGT00950000183186.B.b Theria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000160796 ENSGT00940000163083 ENSGT01100000263710 ENSGT00940000177252 ENSGT00940000155574.C ENSGT00940000156148 ENSGT00940000153845.a.b ENSGT00390000009163 ENSGT00940000153814.a ENSGT00390000010260 ENSGT00950000182942.a.a ENSGT01020000230359.C.b ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 ENSGT00950000183099.u.a #22 ENSGT00940000164532 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a ##22 ENSGT01050000244942.b.a.b ENSGT00950000183099.v ##22 ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT00390000003571 ENSGT00940000155697.A ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00390000001296 ENSGT00940000156463 ENSGT00390000012690 ENSGT01050000244939.b ENSGT00940000155721 Eutheria ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000161691 ENSGT01030000235089 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 ENSGT00950000183099.u.a #22 ENSGT00940000164532 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b ##22 ENSGT00950000183099.u.b.a.b ##22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 Boreoeutheria DUPLICATION Boreoeutheria DUPLICATION Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.b #22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.b #22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.b #22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.b #22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00910000148110 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 ENSGT00950000183099.u.a.d.b #22 ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.a.b ##22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00910000147527 ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01090000263454 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a.l ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00910000148110 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 ENSGT00950000183099.u.a.d.b #22 ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.a.b ##22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00910000147527 ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01090000263454 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a.l ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 ENSGT00950000182802.B.a.a.a.a.h.a.b.b ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00390000013814.e.a Hominoidea DUPLICATION Hominoidea DUPLICATION Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000160677 ENSGT00390000015797.c.b.a.a ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00910000148110 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00910000146711 ENSGT00550000075117.g ENSGT00950000183099.u.a.d.b.c.a #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00910000147527 ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01090000263454 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a.l ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 ENSGT00950000182802.B.a.a.a.a.h.a.b.b ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00390000013814.e.a ENSGT00940000155697.A Hominidae DUPLICATION Hominidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000160677 ENSGT00390000015797.c.b.a.a ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00910000148110 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00910000146711 ENSGT00550000075117.g ENSGT00950000183099.u.a.d.b.c.a.a #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00910000147527 ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01090000263454 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a.l ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 ENSGT00950000182802.B.a.a.a.a.h.a.b.b ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00390000013814.e.a ENSGT00940000155697.A Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000015797.c.b.a.a ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00910000148110 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT00950000183000.c.a.b.r.a.a ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00910000146711 ENSGT00550000075117.g ENSGT00950000183099.u.a.d.b.c.a.a #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00910000147527 ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01090000263454 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a.l ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 ENSGT00950000182802.B.a.a.a.a.h.a.b.b ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00910000146860.b.a.b ENSGT00940000156541 ENSGT00390000013814.e.a Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT00390000015797.c.b.a.a ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117.g ENSGT00950000183099.u.a.d.b.c.a.a #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00910000147527 ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01090000263454 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a.l ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 ENSGT00950000182802.B.a.a.a.a.h.a.b.b ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00910000146860.b.a.b ENSGT00940000156541 ENSGT00390000013814.e.a Human DUPLICATION Human MODERN SPECIES 10 ZNF208 (ENSG00000160321) #7 ZNF257 (ENSG00000197134) #8 ZNF676 (ENSG00000196109) #9 ZNF729 (ENSG00000196350) #10 ZNF98 (ENSG00000197360) #11 ZNF492 (ENSG00000229676) #12 ZNF99 (ENSG00000213973) #13 ZNF723 (ENSG00000268696) #14 ZNF728 (ENSG00000269067) #15 ZNF730 (ENSG00000183850) #16 ZNF724 (ENSG00000196081) #17 ENSG00000283201 #18 ZNF91 (ENSG00000167232) #19 ZNF675 (ENSG00000197372) #20 ZNF681 (ENSG00000196172) #21 RPSA2 (ENSG00000288920) #22 ZNF726 (ENSG00000213967) #23 ZNF254 (ENSG00000213096) #24 UQCRFS1 (ENSG00000169021) #25 VSTM2B (ENSG00000187135) #26 POP4 (ENSG00000105171) #27 PLEKHF1 (ENSG00000166289) #28 C19orf12 (ENSG00000131943) #29 CCNE1 (ENSG00000105173) #30 URI1 (ENSG00000105176) #31 ZNF536 (ENSG00000198597) #32 TSHZ3 (ENSG00000121297) #33 ZNF507 (ENSG00000168813) #34 DPY19L3 (ENSG00000178904) #35 PDCD5 (ENSG00000105185) #36 ANKRD27 (ENSG00000105186) #37 Human MODERN SPECIES 15 SLC22A14 (ENSG00000144671) XYLB (ENSG00000093217) ACVR2B (ENSG00000114739) EXOG (ENSG00000157036) SCN5A (ENSG00000183873) SCN10A (ENSG00000185313) SCN11A (ENSG00000168356) WDR48 (ENSG00000114742) GORASP1 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ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.b.c.a.b.a ##22 Pan ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000155600.b ENSGT00990000203619.A.a ENSGT00940000164483 ENSGT00940000154156.d.m.b ENSGT00670000098076.i.b ENSGT00940000160514 ENSGT00940000161545 ENSGT00390000004304 ENSGT00940000154468.hb.a ENSGT00530000063528.B ENSGT00940000154517.f ENSGT00390000013305.a.a.w.b ENSGT00900000141074.e.a.b.a.b ENSGT00940000154517.e.b ENSGT00650000093476.a ENSGT00950000183099.u.a.d.b.c.a.b.a ##22 ENSGT00940000163638 ENSGT00940000155202.i.b ENSGT00520000055625.a ENSGT00390000004965.db.b ENSGT00390000006931.r ENSGT00940000153112.D.n.a.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000162233.u.b ENSGT00940000162233.u.a ENSGT00940000162231 ENSGT00940000153460.c.a.a ENSGT00550000074817.e.a.b ENSGT00940000158262 ENSGT00940000158722 ENSGT00390000014995 ENSGT00390000003022 Bonobo MODERN SPECIES 369 ENSPPAG00000032293 CASK (ENSPPAG00000039799) GPR82 (ENSPPAG00000032725) PPP1R2C (ENSPPAG00000026223) ENSPPAG00000043152 ENSPPAG00000036386 MAOA 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HTR6 (ENSPPYG00000001785) TMCO4 (ENSPPYG00000001784) RNF186 (ENSPPYG00000001783) OTUD3 (ENSPPYG00000001782) PLA2G2E (ENSPPYG00000001781) PLA2G2A (ENSPPYG00000001780) PLA2G5 (ENSPPYG00000001779) PLA2G2D (ENSPPYG00000001778) PLA2G2F (ENSPPYG00000001777) PLA2G2C (ENSPPYG00000001776) ENSPPYG00000037941 VWA5B1 (ENSPPYG00000010627) CAMK2N1 (ENSPPYG00000040483) MUL1 (ENSPPYG00000001773) FAM43B (ENSPPYG00000001772) Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000156983.a.a ENSGT01030000234579.A.b.x.b ENSGT00940000156467 ENSGT00940000158732 ENSGT00390000018318.u.b.a.b.a.a.a ENSGT00390000007529 ENSGT00390000016883 ENSGT00390000008178 ENSGT00390000004911 ENSGT00940000157344 ENSGT00940000158659 ENSGT00940000153408.B ENSGT00940000157824 ENSGT00550000074956 ENSGT00390000012029 ENSGT00950000183099.u.a.d.b.c.a.b.b ##22 ENSGT00940000155345 ENSGT00940000153899.b.b ENSGT00940000157597 ENSGT00940000161234 ENSGT00390000016551 ENSGT00530000063410.a.h ENSGT00390000010721.a.a.a.b ENSGT00940000153464.B ENSGT00390000000583 ENSGT00950000183050.b.b.a ENSGT00950000182901.a.a.a.b.b ENSGT00940000155337 ENSGT00940000154186.a ENSGT00390000001858 ENSGT00530000063867.b Gorilla MODERN SPECIES 14 BCL11A (ENSGGOG00000007337) ENSGGOG00000024123 PAPOLG (ENSGGOG00000006083) REL (ENSGGOG00000024826) PUS10 (ENSGGOG00000026131) PEX13 (ENSGGOG00000006620) SANBR (ENSGGOG00000024214) C2orf74 (ENSGGOG00000023058) ENSGGOG00000014565 ENSGGOG00000037807 USP34 (ENSGGOG00000014575) XPO1 (ENSGGOG00000034878) FAM161A (ENSGGOG00000013942) CCT4 (ENSGGOG00000007003) COMMD1 (ENSGGOG00000007602) RPSA (ENSGGOG00000026707) ##22 B3GNT2 (ENSGGOG00000025266) ENSGGOG00000038261 EHBP1 (ENSGGOG00000034917) OTX1 (ENSGGOG00000015410) WDPCP (ENSGGOG00000011930) MDH1 (ENSGGOG00000007085) ENSGGOG00000036456 UGP2 (ENSGGOG00000006283) VPS54 (ENSGGOG00000006294) PELI1 (ENSGGOG00000013460) ENSGGOG00000022216 LGALSL (ENSGGOG00000006386) ENSGGOG00000023155 AFTPH (ENSGGOG00000008449) SLC1A4 (ENSGGOG00000011211) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.b.c.b ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.b.c.b ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000160341.b ENSGT00530000063675.a.d ENSGT00730000111087 ENSGT00390000002283 ENSGT00940000157358 ENSGT00940000162379 ENSGT00940000157028 ENSGT01050000244864.B.b ENSGT01030000234513.B.b.i ENSGT01030000234513.B.b.j ENSGT00390000007182 ENSGT00390000015473 ENSGT00940000161739 ENSGT00390000016366 ENSGT00940000153139.A ENSGT00950000183099.u.a.d.b.c.b ##22 ENSGT00940000159161 ENSGT00390000003152.j ENSGT00500000045005 ENSGT00390000008171 ENSGT00940000153716.A.h ENSGT00940000153716.A.g.a ENSGT00950000183079.A.b.c.b ENSGT00940000160956 ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.a.b.b.d ENSGT00940000155309.e.a ENSGT00950000185108 ENSGT00390000003223.v.b ENSGT01030000235038.a ENSGT00940000159187 ENSGT00390000016695 Gorilla MODERN SPECIES 4 ENSGGOG00000040199 ENSGGOG00000040743 ENSGGOG00000041409 MPHOSPH8 (ENSGGOG00000005909) PSPC1 (ENSGGOG00000003414) ENSGGOG00000028351 ZMYM5 (ENSGGOG00000022435) ZMYM2 (ENSGGOG00000007409) GJA3 (ENSGGOG00000001764) GJB2 (ENSGGOG00000016693) GJB6 (ENSGGOG00000004712) CRYL1 (ENSGGOG00000011053) IFT88 (ENSGGOG00000015507) EEF1AKMT1 (ENSGGOG00000016930) XPO4 (ENSGGOG00000000890) ENSGGOG00000028385 ##22 LATS2 (ENSGGOG00000011480) SAP18 (ENSGGOG00000014535) SKA3 (ENSGGOG00000014494) MRPL57 (ENSGGOG00000014501) ZDHHC20 (ENSGGOG00000000435) MICU2 (ENSGGOG00000013255) FGF9 (ENSGGOG00000004983) ENSGGOG00000041965 ENSGGOG00000027144 ENSGGOG00000027350 ENSGGOG00000040234 ENSGGOG00000037344 SGCG (ENSGGOG00000014274) SACS (ENSGGOG00000016425) TNFRSF19 (ENSGGOG00000009252) Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000160341.b ENSGT00530000063675.a.d ENSGT00730000111087 ENSGT00390000002283 ENSGT00940000157358 ENSGT00940000162379 ENSGT00940000157028 ENSGT01050000244864.B.b ENSGT01030000234513.B.b.i ENSGT01030000234513.B.b.j ENSGT00390000007182 ENSGT00390000015473 ENSGT00940000161739 ENSGT00390000016366 ENSGT00940000153139.A ENSGT00950000183099.u.a.d.b.c.b ##22 ENSGT00940000159161 ENSGT00390000003152.j ENSGT00500000045005 ENSGT00390000008171 ENSGT00940000153716.A.h ENSGT00940000153716.A.g.a ENSGT00950000183079.A.b.c.b ENSGT00940000160956 ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.a.b.b.d ENSGT00940000155309.e.a ENSGT00950000185108 ENSGT00390000003223.v.b ENSGT01030000235038.a ENSGT00940000159187 ENSGT00390000016695 Pan ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000160341.b ENSGT00530000063675.a.d ENSGT00730000111087 ENSGT00390000002283 ENSGT00940000157358 ENSGT00940000162379 ENSGT00940000157028 ENSGT01050000244864.B.b ENSGT01030000234513.B.b.i ENSGT01030000234513.B.b.j ENSGT00390000007182 ENSGT00390000015473 ENSGT00940000161739 ENSGT00390000016366 ENSGT00940000153139.A ENSGT00950000183099.u.a.d.b.c.b ##22 ENSGT00940000159161 ENSGT00390000003152.j ENSGT00500000045005 ENSGT00390000008171 ENSGT00940000153716.A.h ENSGT00940000158544.f ENSGT00940000153716.A.g.a ENSGT00950000183079.A.b.c.b ENSGT00390000014122.i.b.a.b.w.a ENSGT00940000160956 ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.a.b.b.d ENSGT00940000155309.e.a ENSGT00950000185108 ENSGT00390000003223.v.b ENSGT01030000235038.a Chimpanzee MODERN SPECIES 4 ENSPTRG00000046807 ENSPTRG00000047050 MPHOSPH8 (ENSPTRG00000024080) PSPC1 (ENSPTRG00000005677) ENSPTRG00000046144 ZMYM5 (ENSPTRG00000005679) ZMYM2 (ENSPTRG00000005680) GJA3 (ENSPTRG00000048126) GJB2 (ENSPTRG00000044692) GJB6 (ENSPTRG00000005683) CRYL1 (ENSPTRG00000005684) IFT88 (ENSPTRG00000005685) IL17D (ENSPTRG00000031245) EEF1AKMT1 (ENSPTRG00000005687) XPO4 (ENSPTRG00000005690) ENSPTRG00000044294 ##22 LATS2 (ENSPTRG00000005691) SAP18 (ENSPTRG00000005692) SKA3 (ENSPTRG00000005693) MRPL57 (ENSPTRG00000049719) ZDHHC20 (ENSPTRG00000005695) MICU2 (ENSPTRG00000005696) ENSPTRG00000034468 FGF9 (ENSPTRG00000005698) ENSPTRG00000051347 ENSPTRG00000049737 ENSPTRG00000042953 ENSPTRG00000051901 ENSPTRG00000048143 SGCG (ENSPTRG00000005701) SACS (ENSPTRG00000005703) Gibbon MODERN SPECIES 4 C2orf74 (ENSNLEG00000009582) ENSNLEG00000034163 ENSNLEG00000027829 USP34 (ENSNLEG00000009598) XPO1 (ENSNLEG00000009680) FAM161A (ENSNLEG00000009719) CCT4 (ENSNLEG00000009723) COMMD1 (ENSNLEG00000033234) B3GNT2 (ENSNLEG00000035442) TMEM17 (ENSNLEG00000009759) EHBP1 (ENSNLEG00000009764) ENSNLEG00000027460 OTX1 (ENSNLEG00000009808) WDPCP (ENSNLEG00000009810) MDH1 (ENSNLEG00000009823) ENSNLEG00000035245 ##22 UGP2 (ENSNLEG00000031494) VPS54 (ENSNLEG00000009859) PELI1 (ENSNLEG00000009891) ENSNLEG00000028443 LGALSL (ENSNLEG00000031680) AFTPH (ENSNLEG00000009902) ENSNLEG00000009923 SERTAD2 (ENSNLEG00000029151) SLC1A4 (ENSNLEG00000009927) ENSNLEG00000009939 RAB1A (ENSNLEG00000009944) ACTR2 (ENSNLEG00000009948) SPRED2 (ENSNLEG00000009959) ENSNLEG00000027615 ENSNLEG00000009963 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.b.d ##22 Gibbon MODERN SPECIES 19 SLC22A13 (ENSNLEG00000005376) ENSNLEG00000005389 XYLB (ENSNLEG00000005394) ACVR2B (ENSNLEG00000005401) EXOG (ENSNLEG00000005421) SCN5A (ENSNLEG00000005433) SCN10A (ENSNLEG00000031545) SCN11A (ENSNLEG00000026898) WDR48 (ENSNLEG00000005481) GORASP1 (ENSNLEG00000005538) TTC21A (ENSNLEG00000005562) CSRNP1 (ENSNLEG00000029751) XIRP1 (ENSNLEG00000005609) CX3CR1 (ENSNLEG00000030926) SLC25A38 (ENSNLEG00000005614) ENSNLEG00000005626 ##22 ENSNLEG00000029771 MOBP (ENSNLEG00000005636) ENSNLEG00000036175 MYRIP (ENSNLEG00000005641) EIF1B (ENSNLEG00000005660) ENTPD3 (ENSNLEG00000005665) RPL14 (ENSNLEG00000005682) ENSNLEG00000005711 ZNF620 (ENSNLEG00000005719) ENSNLEG00000017152 ENSNLEG00000027409 ZNF621 (ENSNLEG00000005721) CTNNB1 (ENSNLEG00000005726) ENSNLEG00000030260 ULK4 (ENSNLEG00000005778) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.b #22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.b #22 Golden snub-nosed monkey DUPLICATION Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 3046 ENSRROG00000029943 #22 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1530 CYP2J2 (ENSRROG00000034996) C1orf87 (ENSRROG00000040441) NFIA (ENSRROG00000026343) TM2D1 (ENSRROG00000035570) PATJ (ENSRROG00000010773) ENSRROG00000023749 L1TD1 (ENSRROG00000042567) KANK4 (ENSRROG00000007321) USP1 (ENSRROG00000028426) DOCK7 (ENSRROG00000040277) ANGPTL3 (ENSRROG00000017394) ATG4C (ENSRROG00000013654) ENSRROG00000006458 #22 ALG6 (ENSRROG00000035629) ITGB3BP (ENSRROG00000042197) EFCAB7 (ENSRROG00000040009) PGM1 (ENSRROG00000039585) ENSRROG00000029309 ENSRROG00000026656 #25 ROR1 (ENSRROG00000040188) ENSRROG00000022599 UBE2U (ENSRROG00000038838) CACHD1 (ENSRROG00000045428) RAVER2 (ENSRROG00000041867) JAK1 (ENSRROG00000043516) AK4 (ENSRROG00000036638) DNAJC6 (ENSRROG00000032081) LEPROT (ENSRROG00000042854) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT00910000146711 ENSGT00550000075117 ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.a.b ##22 ENSGT00950000183099.u.a.d.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a.l ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B ENSGT00940000159338 Cebidae ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT00910000146711 ENSGT00550000075117 ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.a.b ##22 ENSGT00950000183099.u.a.d.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a.l ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B ENSGT00940000159338 Marmoset MODERN SPECIES PDCL (ENSCJAG00000087386) RC3H2 (ENSCJAG00000020050) ZBTB6 (ENSCJAG00000020049) ZBTB26 (ENSCJAG00000021770) RABGAP1 (ENSCJAG00000020027) STRBP (ENSCJAG00000019997) CRB2 (ENSCJAG00000006432) DENND1A (ENSCJAG00000006461) ENSCJAG00000085719 LHX2 (ENSCJAG00000006496) NEK6 (ENSCJAG00000006507) PSMB7 (ENSCJAG00000006541) ADGRD2 (ENSCJAG00000040439) NR5A1 (ENSCJAG00000006624) NR6A1 (ENSCJAG00000006631) ENSCJAG00000078726 #22 OLFML2A (ENSCJAG00000006668) ENSCJAG00000077082 WDR38 (ENSCJAG00000006695) ENSCJAG00000006724 ENSCJAG00000006730 GOLGA1 (ENSCJAG00000006745) SCAI (ENSCJAG00000006789) ENSCJAG00000077976 ENSCJAG00000082314 PPP6C (ENSCJAG00000006827) RABEPK (ENSCJAG00000006849) ENSCJAG00000052894 HSPA5 (ENSCJAG00000006880) GAPVD1 (ENSCJAG00000006913) MAPKAP1 (ENSCJAG00000006963) Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000162395 ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT00910000146711 ENSGT00550000075117 ENSGT00950000183099.u.a.d.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a.l ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B ENSGT00940000159338 Capuchin MODERN SPECIES 391 XYLB (ENSCCAG00000022508) ACVR2B (ENSCCAG00000028385) EXOG (ENSCCAG00000022851) SCN5A (ENSCCAG00000023536) SCN10A (ENSCCAG00000037010) SCN11A (ENSCCAG00000025119) ENSCCAG00000037437 WDR48 (ENSCCAG00000035592) GORASP1 (ENSCCAG00000024092) TTC21A (ENSCCAG00000033019) CSRNP1 (ENSCCAG00000031152) XIRP1 (ENSCCAG00000026518) CX3CR1 (ENSCCAG00000031070) ENSCCAG00000015581 SLC25A38 (ENSCCAG00000021248) RPSA (ENSCCAG00000036860) #22 MOBP (ENSCCAG00000030542) ENSCCAG00000020708 ENSCCAG00000019279 MYRIP (ENSCCAG00000031793) EIF1B (ENSCCAG00000031083) Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.b #22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.b #22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.b #22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.b #22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.b #22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.b #22 Ursidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.b #22 Giant Panda MODERN SPECIES 1780 ENSAMEG00000029097 #22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.a ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.a ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.a ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.a ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.a ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.a ##22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.a ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.a ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.a ##22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.a ##22 Pan ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00910000148038 ENSGT00550000074847 ENSGT00910000146826 ENSGT00940000164233 ENSGT00940000155018.a.b.b ENSGT00510000047895 ENSGT00940000159462 ENSGT00940000161611 ENSGT00940000154493.a.b ENSGT00940000162010 ENSGT00940000162880 ENSGT00940000161977 ENSGT00940000160877 ENSGT00940000162217 ENSGT00940000154392 ENSGT00950000183099.u.a.d.a ##22 ENSGT00940000160635 ENSGT00940000156287 ENSGT00940000159056 ENSGT00440000039367 ENSGT00550000075082 ENSGT00410000027658 ENSGT00910000147014 ENSGT00390000006885.b.b ENSGT00390000006885.b.a ENSGT00550000076216 ENSGT01020000230647 ENSGT00700000106116 ENSGT01030000234534.A.c.b ENSGT01030000234534.A.c.a ENSGT00910000147588 Chimpanzee MODERN SPECIES 5 ENSPTRG00000051422 DDX24 (ENSPTRG00000006673) IFI27L1 (ENSPTRG00000006674) IFI27 (ENSPTRG00000006675) IFI27L2 (ENSPTRG00000030676) PPP4R4 (ENSPTRG00000006676) SERPINA10 (ENSPTRG00000006677) SERPINA6 (ENSPTRG00000006678) SERPINA1 (ENSPTRG00000023666) SERPINA11 (ENSPTRG00000006680) SERPINA9 (ENSPTRG00000006681) SERPINA12 (ENSPTRG00000006682) SERPINA4 (ENSPTRG00000006683) SERPINA5 (ENSPTRG00000032490) SERPINA3 (ENSPTRG00000023582) ENSPTRG00000052261 ##22 GSC (ENSPTRG00000006687) DICER1 (ENSPTRG00000023484) CLMN (ENSPTRG00000006689) SYNE3 (ENSPTRG00000006691) GLRX5 (ENSPTRG00000006692) ENSPTRG00000052861 ENSPTRG00000049241 TCL1B (ENSPTRG00000044759) TCL1A (ENSPTRG00000006695) ENSPTRG00000045061 ENSPTRG00000042975 C14H14orf132 (ENSPTRG00000051974) BDKRB2 (ENSPTRG00000047114) ENSPTRG00000049278 BDKRB1 (ENSPTRG00000030674) Bonobo MODERN SPECIES 5 OTUB2 (ENSPPAG00000028381) ENSPPAG00000029706 DDX24 (ENSPPAG00000038713) IFI27 (ENSPPAG00000031690) ENSPPAG00000033412 ENSPPAG00000038318 PPP4R4 (ENSPPAG00000021420) SERPINA10 (ENSPPAG00000036698) SERPINA6 (ENSPPAG00000042823) SERPINA1 (ENSPPAG00000043524) SERPINA11 (ENSPPAG00000036447) SERPINA12 (ENSPPAG00000037137) SERPINA4 (ENSPPAG00000027796) SERPINA5 (ENSPPAG00000033644) SERPINA3 (ENSPPAG00000039184) ENSPPAG00000040434 ##22 GSC (ENSPPAG00000040766) DICER1 (ENSPPAG00000035143) CLMN (ENSPPAG00000038455) SYNE3 (ENSPPAG00000031310) ENSPPAG00000021934 ENSPPAG00000033285 ENSPPAG00000034920 TCL1B (ENSPPAG00000035530) TCL1A (ENSPPAG00000040757) ENSPPAG00000010228 ENSPPAG00000035682 ENSPPAG00000027291 BDKRB2 (ENSPPAG00000034180) ENSPPAG00000039062 ENSPPAG00000007555 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.a ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.a ##22 Marmoset MODERN SPECIES 1 ENSCJAG00000015263 ARG2 (ENSCJAG00000015277) PIGH (ENSCJAG00000039073) PLEKHH1 (ENSCJAG00000015298) TMEM229B (ENSCJAG00000015358) PLEK2 (ENSCJAG00000015361) EIF2S1 (ENSCJAG00000015368) ATP6V1D (ENSCJAG00000015396) PALS1 (ENSCJAG00000015428) ENSCJAG00000078005 GARIN2 (ENSCJAG00000015489) ENSCJAG00000081580 GPHN (ENSCJAG00000015520) CCDC196 (ENSCJAG00000041012) ENSCJAG00000070734 ENSCJAG00000080767 ##22 ENSCJAG00000070476 FUT8 (ENSCJAG00000003756) ENSCJAG00000059321 MAX (ENSCJAG00000019702) ENSCJAG00000076560 FNTB (ENSCJAG00000019689) RAB15 (ENSCJAG00000019696) GPX2 (ENSCJAG00000043228) CHURC1 (ENSCJAG00000047676) ENSCJAG00000086103 SPTB (ENSCJAG00000019629) PLEKHG3 (ENSCJAG00000019611) PPP1R36 (ENSCJAG00000019603) HSPA2 (ENSCJAG00000042264) ZBTB1 (ENSCJAG00000019591) Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.a ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.a ##22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.a ##22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.a ##22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.a ##22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.a ##22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.a ##22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.a ##22 Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.a ##22 Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.a ##22 Bos_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.a ##22 Domestic yak MODERN SPECIES 14 ACVR2B (ENSBGRG00000011212) ENSBGRG00000011202 ENSBGRG00000011105 SCN5A (ENSBGRG00000010413) SCN10A (ENSBGRG00000009854) SCN11A (ENSBGRG00000009542) WDR48 (ENSBGRG00000009347) GORASP1 (ENSBGRG00000009134) TTC21A (ENSBGRG00000008237) CSRNP1 (ENSBGRG00000008132) CX3CR1 (ENSBGRG00000007861) ENSBGRG00000007811 ENSBGRG00000007745 SLC25A38 (ENSBGRG00000007573) ENSBGRG00000007505 ENSBGRG00000007397 ##22 ENSBGRG00000007353 MYRIP (ENSBGRG00000006898) EIF1B (ENSBGRG00000021725) ENTPD3 (ENSBGRG00000021619) RPL14 (ENSBGRG00000021512) ZNF619 (ENSBGRG00000021459) ENSBGRG00000021424 ENSBGRG00000021364 CTNNB1 (ENSBGRG00000021135) ULK4 (ENSBGRG00000020150) TRAK1 (ENSBGRG00000018952) CCK (ENSBGRG00000018878) LYZL4 (ENSBGRG00000018844) VIPR1 (ENSBGRG00000018443) SEC22C (ENSBGRG00000018379) Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.a ##22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.a ##22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.a ##22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.a ##22 Ursidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.a ##22 Giant Panda MODERN SPECIES 1859 ENSAMEG00000013222 ##22 Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.a ##22 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.a ##22 Dingo MODERN SPECIES 326 ENSCAFG00020025813 ENSCAFG00020025811 SCN5A (ENSCAFG00020025607) SCN10A (ENSCAFG00020025566) SCN11A (ENSCAFG00020025559) WDR48 (ENSCAFG00020025556) ENSCAFG00020025554 TTC21A (ENSCAFG00020025549) CSRNP1 (ENSCAFG00020025547) XIRP1 (ENSCAFG00020025545) ENSCAFG00020025543 CX3CR1 (ENSCAFG00020025541) CCR8 (ENSCAFG00020025540) SLC25A38 (ENSCAFG00020025534) ENSCAFG00020025529 ENSCAFG00020025526 ##22 MOBP (ENSCAFG00020025525) ENSCAFG00020025524 ENSCAFG00020025521 MYRIP (ENSCAFG00020025520) EIF1B (ENSCAFG00020025518) ENTPD3 (ENSCAFG00020025514) ENSCAFG00020025513 ENSCAFG00020025512 ZNF619 (ENSCAFG00020025511) ZNF620 (ENSCAFG00020025509) ZNF621 (ENSCAFG00020025507) CTNNB1 (ENSCAFG00020025504) ENSCAFG00020025503 ULK4 (ENSCAFG00020025468) TRAK1 (ENSCAFG00020025297) Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT01030000235089 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT01030000235508 ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 ENSGT00950000183099.u.a.e ##22 ENSGT00940000164532 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b ##22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.d ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT01030000235089 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT01030000235508 ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 ENSGT00950000183099.u.a.e ##22 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.n ##22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01090000263454 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT01030000235089 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT01030000235508 ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 ENSGT00950000183099.u.a.e ##22 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.n ##22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01090000263454 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B Glires ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT01030000235089.b ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT01030000235508 ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 ENSGT00950000183099.u.a.e ##22 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.n ##22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01090000263454 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e ##22 Rabbit MODERN SPECIES 14 TRMT12 (ENSOCUG00000026379) RNF139 (ENSOCUG00000017399) TATDN1 (ENSOCUG00000017403) NDUFB9 (ENSOCUG00000025074) MTSS1 (ENSOCUG00000008102) ENSOCUG00000030136 ZNF572 (ENSOCUG00000039324) SQLE (ENSOCUG00000015771) WASHC5 (ENSOCUG00000015785) NSMCE2 (ENSOCUG00000008539) ENSOCUG00000030414 TRIB1 (ENSOCUG00000024295) ENSOCUG00000037909 LRATD2 (ENSOCUG00000003500) MYC (ENSOCUG00000014289) ENSOCUG00000000506 ##22 ENSOCUG00000025215 ENSOCUG00000038124 ENSOCUG00000024677 ENSOCUG00000021577 ENSOCUG00000013690 ASAP1 (ENSOCUG00000002414) ADCY8 (ENSOCUG00000002685) ENSOCUG00000030310 ENSOCUG00000039078 ENSOCUG00000023866 ENSOCUG00000032952 EFR3A (ENSOCUG00000009294) OC90 (ENSOCUG00000012033) KCNQ3 (ENSOCUG00000012036) ENSOCUG00000034102 Rodentia ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT01030000235089.b ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT01030000235508 ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 ENSGT00950000183099.u.a.e ##22 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.n ##22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01090000263454 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e ##22 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e ##22 Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e ##22 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e ##22 Squirrel DUPLICATION Squirrel MODERN SPECIES 109 DLX2 (ENSSTOG00000019803) DLX1 (ENSSTOG00000012969) METAP1D (ENSSTOG00000012954) HAT1 (ENSSTOG00000012940) SLC25A12 (ENSSTOG00000007698) DYNC1I2 (ENSSTOG00000009040) CYBRD1 (ENSSTOG00000023035) DCAF17 (ENSSTOG00000008475) METTL8 (ENSSTOG00000008451) ENSSTOG00000022641 ENSSTOG00000026404 TLK1 (ENSSTOG00000015694) GORASP2 (ENSSTOG00000003380) GAD1 (ENSSTOG00000003340) ENSSTOG00000031823 ENSSTOG00000027669 ##22 ENSSTOG00000008099 ENSSTOG00000021320 MYO3B (ENSSTOG00000007990) ENSSTOG00000019433 UBR3 (ENSSTOG00000025289) METTL5 (ENSSTOG00000008428) SSB (ENSSTOG00000008416) KLHL23 (ENSSTOG00000001133) PHOSPHO2 (ENSSTOG00000024059) CFAP210 (ENSSTOG00000011663) PPIG (ENSSTOG00000011656) FASTKD1 (ENSSTOG00000011651) KLHL41 (ENSSTOG00000034336) BBS5 (ENSSTOG00000009893) Squirrel MODERN SPECIES 88 TTC8 (ENSSTOG00000013253) EML5 (ENSSTOG00000020991) ZC3H14 (ENSSTOG00000013176) PTPN21 (ENSSTOG00000013120) SPATA7 (ENSSTOG00000013095) KCNK10 (ENSSTOG00000011800) GPR65 (ENSSTOG00000026082) GALC (ENSSTOG00000019920) FLRT2 (ENSSTOG00000005138) ENSSTOG00000034685 SEL1L (ENSSTOG00000005942) STON2 (ENSSTOG00000005919) GTF2A1 (ENSSTOG00000005900) TSHR (ENSSTOG00000005868) CEP128 (ENSSTOG00000005824) ENSSTOG00000027978 ##22 ENSSTOG00000029585 NRXN3 (ENSSTOG00000015280) ADCK1 (ENSSTOG00000010431) SNW1 (ENSSTOG00000003286) SLIRP (ENSSTOG00000034316) ENSSTOG00000003254 ENSSTOG00000029513 SPTLC2 (ENSSTOG00000003237) ISM2 (ENSSTOG00000003218) AHSA1 (ENSSTOG00000003196) VIPAS39 (ENSSTOG00000003177) NOXRED1 (ENSSTOG00000003169) ENSSTOG00000028225 TMED8 (ENSSTOG00000002808) GSTZ1 (ENSSTOG00000002793) Alpin marmot MODERN SPECIES 26 SPATA48 (ENSMMMG00000015542) ZPBP (ENSMMMG00000015506) VWC2 (ENSMMMG00000015492) ENSMMMG00000015482 ENSMMMG00000015465 ABCA13 (ENSMMMG00000015281) ENSMMMG00000015221 UPP1 (ENSMMMG00000015208) C7orf57 (ENSMMMG00000015182) SUN3 (ENSMMMG00000015174) HUS1 (ENSMMMG00000015160) PKD1L1 (ENSMMMG00000015029) TNS3 (ENSMMMG00000014995) ENSMMMG00000014987 ENSMMMG00000014980 ENSMMMG00000014975 ##22 IGFBP3 (ENSMMMG00000014868) IGFBP1 (ENSMMMG00000014859) ADCY1 (ENSMMMG00000014821) RAMP3 (ENSMMMG00000014813) ENSMMMG00000014809 ENSMMMG00000014801 TBRG4 (ENSMMMG00000014785) NACAD (ENSMMMG00000014752) CCM2 (ENSMMMG00000014704) MYO1G (ENSMMMG00000014692) ENSMMMG00000014682 ENSMMMG00000014677 ENSMMMG00000014669 ZMIZ2 (ENSMMMG00000014533) OGDH (ENSMMMG00000014266) Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e ##22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e ##22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e ##22 Long-tailed chinchilla DUPLICATION Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 233 CCN6 (ENSCLAG00000000109) TUBE1 (ENSCLAG00000000067) FAM229B (ENSCLAG00000000365) LAMA4 (ENSCLAG00000000130) ENSCLAG00000000080 ENSCLAG00000000058 ENSCLAG00000017382 ENSCLAG00000000824 HDAC2 (ENSCLAG00000000749) ENSCLAG00000000682 ##22 HS3ST5 (ENSCLAG00000000666) FRK (ENSCLAG00000000628) ENSCLAG00000000565 NT5DC1 (ENSCLAG00000000283) DSE (ENSCLAG00000000219) CALHM5 (ENSCLAG00000000210) TRAPPC3L (ENSCLAG00000000221) CALHM4 (ENSCLAG00000000213) ENSCLAG00000000206 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 139 SLC25A40 (ENSCLAG00000005807) DBF4 (ENSCLAG00000006005) ADAM22 (ENSCLAG00000006649) SRI (ENSCLAG00000004619) STEAP4 (ENSCLAG00000004703) ZNF804B (ENSCLAG00000006080) TEX47 (ENSCLAG00000006145) ENSCLAG00000006179 STEAP2 (ENSCLAG00000006262) CFAP69 (ENSCLAG00000006387) GTPBP10 (ENSCLAG00000006695) CLDN12 (ENSCLAG00000006816) ENSCLAG00000007061 FZD1 (ENSCLAG00000017832) ENSCLAG00000007977 ENSCLAG00000008125 ##22 AKAP9 (ENSCLAG00000005332) CYP51A1 (ENSCLAG00000007702) LRRD1 (ENSCLAG00000007851) KRIT1 (ENSCLAG00000008236) ANKIB1 (ENSCLAG00000003060) ENSCLAG00000003268 ENSCLAG00000003315 ENSCLAG00000003685 PEX1 (ENSCLAG00000003719) RBM48 (ENSCLAG00000003877) ENSCLAG00000003974 FAM133B (ENSCLAG00000004241) CDK6 (ENSCLAG00000004352) SAMD9 (ENSCLAG00000017583) SAMD9L (ENSCLAG00000017656) Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT01030000235089.b ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT01030000235508 ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 ENSGT00950000183099.u.a.e ##22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01090000263454 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B ENSGT00940000159338 ENSGT00940000160407 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT01030000235089.b ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT01030000235508 ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 ENSGT00950000183099.u.a.e ##22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01090000263454 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B ENSGT00940000159338 ENSGT00940000160407 Muroidea ANCESTRAL SPECIES 57 ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT01030000235089.b ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT01030000235508 ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 ENSGT00950000183099.u.a.e ##22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01090000263454 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B ENSGT00940000159338 ENSGT00940000160407 Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1343 Smim17 (ENSNGAG00000000498) Zfp28 (ENSNGAG00000004441) Zfp78 (ENSNGAG00000013957) Gm3854 (ENSNGAG00000000088) Zfp583 (ENSNGAG00000002021) ENSNGAG00000003567 ENSNGAG00000004669 Epp13 (ENSNGAG00000018368) ENSNGAG00000004867 ##22 Galp (ENSNGAG00000010881) Zfp444 (ENSNGAG00000011670) ENSNGAG00000011946 Nlrp5 (ENSNGAG00000017882) ENSNGAG00000000842 ENSNGAG00000017777 ENSNGAG00000019176 ENSNGAG00000000402 Epn1 (ENSNGAG00000019737) U2af2 (ENSNGAG00000020369) ENSNGAG00000014427 ENSNGAG00000014996 Zfp580 (ENSNGAG00000003626) Zfp784 (ENSNGAG00000011802) Zfp865 (ENSNGAG00000016004) Muroidea_A DUPLICATION Muroidea_A DUPLICATION Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.e.a ##22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.e.a ##22 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.e.a ##22 Shrew mouse MODERN SPECIES 1 MGP_PahariEiJ_G0015666 Xylb (MGP_PahariEiJ_G0015667) Acvr2b (MGP_PahariEiJ_G0015668) Exog (MGP_PahariEiJ_G0015669) Scn5a (MGP_PahariEiJ_G0015670) Scn10a (MGP_PahariEiJ_G0015671) Scn11a (MGP_PahariEiJ_G0015672) Wdr48 (MGP_PahariEiJ_G0015673) Cx3cr1 (MGP_PahariEiJ_G0015674) Gorasp1 (MGP_PahariEiJ_G0015675) Ttc21a (MGP_PahariEiJ_G0015676) Csrnp1 (MGP_PahariEiJ_G0015677) MGP_PahariEiJ_G0015678 Ccr8 (MGP_PahariEiJ_G0015679) Slc25a38 (MGP_PahariEiJ_G0015680) MGP_PahariEiJ_G0015681 ##22 Mobp (MGP_PahariEiJ_G0015682) Myrip (MGP_PahariEiJ_G0015683) Eif1b (MGP_PahariEiJ_G0015684) Entpd3 (MGP_PahariEiJ_G0015685) Rpl14 (MGP_PahariEiJ_G0015686) Ctnnb1 (MGP_PahariEiJ_G0015687) Ulk4 (MGP_PahariEiJ_G0015688) Trak1 (MGP_PahariEiJ_G0015689) MGP_PahariEiJ_G0015690 Lyzl4 (MGP_PahariEiJ_G0015691) Vipr1 (MGP_PahariEiJ_G0015692) Sec22c (MGP_PahariEiJ_G0015693) MGP_PahariEiJ_G0015694 Nktr (MGP_PahariEiJ_G0015695) Zfp651 (MGP_PahariEiJ_G0015696) Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.e.a ##22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.e.a ##22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.e.a ##22 Steppe mouse MODERN SPECIES 703 ENSMSIG00000000803 ##22 Ryukyu mouse MODERN SPECIES 18 MGP_CAROLIEiJ_G0032799 Xylb (MGP_CAROLIEiJ_G0032800) Acvr2b (MGP_CAROLIEiJ_G0032801) Exog (MGP_CAROLIEiJ_G0032802) Scn5a (MGP_CAROLIEiJ_G0032803) Scn10a (MGP_CAROLIEiJ_G0032804) Scn11a (MGP_CAROLIEiJ_G0032805) Wdr48 (MGP_CAROLIEiJ_G0032806) Cx3cr1 (MGP_CAROLIEiJ_G0032807) Gorasp1 (MGP_CAROLIEiJ_G0032808) Ttc21a (MGP_CAROLIEiJ_G0032809) Csrnp1 (MGP_CAROLIEiJ_G0032810) MGP_CAROLIEiJ_G0032811 Ccr8 (MGP_CAROLIEiJ_G0032812) Slc25a38 (MGP_CAROLIEiJ_G0032813) MGP_CAROLIEiJ_G0032814 ##22 Mobp (MGP_CAROLIEiJ_G0032815) Myrip (MGP_CAROLIEiJ_G0032816) Eif1b (MGP_CAROLIEiJ_G0032817) Entpd3 (MGP_CAROLIEiJ_G0032818) Rpl14 (MGP_CAROLIEiJ_G0032819) MGP_CAROLIEiJ_G0032820 Ctnnb1 (MGP_CAROLIEiJ_G0032821) Ulk4 (MGP_CAROLIEiJ_G0032822) Trak1 (MGP_CAROLIEiJ_G0032823) MGP_CAROLIEiJ_G0032824 Lyzl4 (MGP_CAROLIEiJ_G0032825) Vipr1 (MGP_CAROLIEiJ_G0032826) Sec22c (MGP_CAROLIEiJ_G0032827) MGP_CAROLIEiJ_G0032828 Nktr (MGP_CAROLIEiJ_G0032829) Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.e.a ##22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.e.a ##22 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 1 Oxct1 (ENSCGRG00001022982) Rimoc1 (ENSCGRG00001020182) Fbxo4 (ENSCGRG00001019798) Ghr (ENSCGRG00001019428) Ccdc152 (ENSCGRG00001022348) ENSCGRG00001007226 Zfp131 (ENSCGRG00001021210) Nim1k (ENSCGRG00001021680) Hmgcs1 (ENSCGRG00001021007) Ccl28 (ENSCGRG00001020584) Tmem267 (ENSCGRG00001003827) 4833420G17Rik (ENSCGRG00001011989) Paip1 (ENSCGRG00001009535) ENSCGRG00001021827 ENSCGRG00001013713 ENSCGRG00001013480 ##22 ENSCGRG00001006400 Fgf10 (ENSCGRG00001005274) Mrps30 (ENSCGRG00001003133) ENSCGRG00001006656 Hcn1 (ENSCGRG00001024192) Emb (ENSCGRG00001023682) ENSCGRG00001006936 Parp8 (ENSCGRG00001019353) ENSCGRG00001024228 Isl1 (ENSCGRG00001000561) ENSCGRG00001024282 ENSCGRG00001000834 Pelo (ENSCGRG00001024665) Itga1 (ENSCGRG00001020614) Itga2 (ENSCGRG00001021951) Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.e.a ##22 Northern American deer mouse DUPLICATION Northern American deer mouse MODERN SPECIES 7 Sesn1 (ENSPEMG00000012311) Cep57l1 (ENSPEMG00000011459) ENSPEMG00000010187 ENSPEMG00000025622 Ppil6 (ENSPEMG00000005372) Smpd2 (ENSPEMG00000018109) Mical1 (ENSPEMG00000018317) Zbtb24 (ENSPEMG00000009212) ENSPEMG00000018815 ENSPEMG00000029055 Fig4 (ENSPEMG00000010637) Gpr6 (ENSPEMG00000015024) Wasf1 (ENSPEMG00000014759) Cdc40 (ENSPEMG00000018092) Mettl24 (ENSPEMG00000018932) ENSPEMG00000003728 ##22 Ddo (ENSPEMG00000026538) ENSPEMG00000014404 Cdk19 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(ENSPEMG00000000693) Vsig1 (ENSPEMG00000000042) Psmd10 (ENSPEMG00000015957) ENSPEMG00000000703 Col4a6 (ENSPEMG00000007750) Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT01030000235089.b ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT01030000235508 ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 ENSGT00950000183099.u.a.e.e.b ##22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01090000263454 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B ENSGT00940000159338 ENSGT00940000160407 Murinae ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT01030000235089.b ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT01030000235508 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Ss18l2 (ENSMSIG00000023200) Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT01030000235089.b ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 ENSGT00950000183099.u.a.e.e.b ##22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a.d ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B ENSGT00940000159338 ENSGT00940000160407 ENSGT00940000158548 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 ENSGT00950000183099.u.a.e.e.b ##22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a.d ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B ENSGT00940000159338 ENSGT00940000160407 ENSGT00940000158548 ENSGT00940000160089 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 284 ENSCGRG00001023781 Xylb (ENSCGRG00001017291) Acvr2b (ENSCGRG00001000835) Exog (ENSCGRG00001016541) Scn5a (ENSCGRG00001008045) Scn10a (ENSCGRG00001022121) Scn11a (ENSCGRG00001017254) Wdr48 (ENSCGRG00001016747) Gorasp1 (ENSCGRG00001009858) Ttc21a (ENSCGRG00001020151) Csrnp1 (ENSCGRG00001003977) Xirp1 (ENSCGRG00001000077) Cx3cr1 (ENSCGRG00001002880) Ccr8 (ENSCGRG00001003503) Slc25a38 (ENSCGRG00001010665) Rpsa (ENSCGRG00001006680) ##22 Mobp (ENSCGRG00001000266) Myrip (ENSCGRG00001014033) Eif1b (ENSCGRG00001004908) Entpd3 (ENSCGRG00001016813) Rpl14 (ENSCGRG00001000137) ENSCGRG00001020439 ENSCGRG00001001335 Ctnnb1 (ENSCGRG00001015665) Ulk4 (ENSCGRG00001021339) Trak1 (ENSCGRG00001000246) Cck (ENSCGRG00001024077) Lyzl4 (ENSCGRG00001018786) Vipr1 (ENSCGRG00001011817) Sec22c (ENSCGRG00001019463) Ss18l2 (ENSCGRG00001018261) Golden Hamster MODERN SPECIES 742 ENSMAUG00000019971 Xylb (ENSMAUG00000021136) Acvr2b (ENSMAUG00000020481) Exog (ENSMAUG00000013540) Scn5a (ENSMAUG00000015120) Scn10a (ENSMAUG00000014414) Scn11a (ENSMAUG00000007489) Wdr48 (ENSMAUG00000017329) Gorasp1 (ENSMAUG00000004125) Ttc21a (ENSMAUG00000008403) Csrnp1 (ENSMAUG00000003691) Xirp1 (ENSMAUG00000015987) Cx3cr1 (ENSMAUG00000008446) ENSMAUG00000005362 Slc25a38 (ENSMAUG00000016265) Rpsa (ENSMAUG00000018437) ##22 ENSMAUG00000012669 Myrip (ENSMAUG00000012297) Eif1b (ENSMAUG00000016815) Entpd3 (ENSMAUG00000021114) ENSMAUG00000014583 Ctnnb1 (ENSMAUG00000001076) Ulk4 (ENSMAUG00000016164) Trak1 (ENSMAUG00000018480) Cck (ENSMAUG00000016999) Lyzl4 (ENSMAUG00000015844) Vipr1 (ENSMAUG00000008883) Sec22c (ENSMAUG00000000375) Ss18l2 (ENSMAUG00000018546) ENSMAUG00000009582 Zfp651 (ENSMAUG00000017968) Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 53 ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT01030000235089.b ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 ENSGT00950000183099.u.a.e.e.b ##22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a.d ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B ENSGT00940000159338 ENSGT00940000160407 ENSGT00940000158548 Prairie vole MODERN SPECIES 13 ENSMOCG00000021760 Xylb (ENSMOCG00000006242) Acvr2b (ENSMOCG00000019420) Exog (ENSMOCG00000020900) Scn5a (ENSMOCG00000018512) Scn10a (ENSMOCG00000000976) Scn11a (ENSMOCG00000009302) Wdr48 (ENSMOCG00000004571) Gorasp1 (ENSMOCG00000015556) Ttc21a (ENSMOCG00000015037) Csrnp1 (ENSMOCG00000019828) Xirp1 (ENSMOCG00000020560) Cx3cr1 (ENSMOCG00000021085) Ccr8 (ENSMOCG00000009909) Slc25a38 (ENSMOCG00000010985) Rpsa (ENSMOCG00000000679) ##22 ENSMOCG00000009810 Myrip (ENSMOCG00000020944) Eif1b (ENSMOCG00000000649) Entpd3 (ENSMOCG00000022184) ENSMOCG00000004837 Ctnnb1 (ENSMOCG00000010494) Ulk4 (ENSMOCG00000013053) ENSMOCG00000021784 Trak1 (ENSMOCG00000011744) Cck (ENSMOCG00000014234) Lyzl4 (ENSMOCG00000013188) Vipr1 (ENSMOCG00000019542) Sec22c (ENSMOCG00000011685) Ss18l2 (ENSMOCG00000019547) ENSMOCG00000021715 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 20 Xylb (ENSPEMG00000019632) Acvr2b (ENSPEMG00000012381) Exog (ENSPEMG00000019449) ENSPEMG00000029689 Scn5a (ENSPEMG00000020279) Scn10a (ENSPEMG00000020122) Scn11a (ENSPEMG00000018380) Wdr48 (ENSPEMG00000017529) Gorasp1 (ENSPEMG00000017359) Ttc21a (ENSPEMG00000010809) Csrnp1 (ENSPEMG00000010839) Xirp1 (ENSPEMG00000000423) Cx3cr1 (ENSPEMG00000014105) Ccr8 (ENSPEMG00000009173) Slc25a38 (ENSPEMG00000013151) Rpsa (ENSPEMG00000017406) ##22 ENSPEMG00000017828 Myrip (ENSPEMG00000016089) Eif1b (ENSPEMG00000016270) Entpd3 (ENSPEMG00000002333) Rpl14 (ENSPEMG00000016182) ENSPEMG00000027565 Ctnnb1 (ENSPEMG00000006501) Ulk4 (ENSPEMG00000020231) ENSPEMG00000027702 ENSPEMG00000026732 Cck (ENSPEMG00000027198) Lyzl4 (ENSPEMG00000020074) Vipr1 (ENSPEMG00000028877) Sec22c (ENSPEMG00000018908) Ss18l2 (ENSPEMG00000027266) Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.f ##22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.f ##22 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.f ##22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.f ##22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.f ##22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.f ##22 Steppe mouse MODERN SPECIES 3393 Stam2 (ENSMSIG00000028044) ENSMSIG00000028061 ENSMSIG00000028063 ENSMSIG00000028065 ##22 ENSMSIG00000028067 Fmnl2 (ENSMSIG00000028071) Prpf40a (ENSMSIG00000028498) Arl6ip6 (ENSMSIG00000028565) ENSMSIG00000028572 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.f ##22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.f ##22 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 20 ENSPEMG00000025013 ENSPEMG00000026694 ENSPEMG00000025370 Mrps22 (ENSPEMG00000020399) Copb2 (ENSPEMG00000015558) Rbp2 (ENSPEMG00000016242) Rbp1 (ENSPEMG00000020449) Nmnat3 (ENSPEMG00000020493) Clstn2 (ENSPEMG00000020916) Trim42 (ENSPEMG00000020887) Slc25a36 (ENSPEMG00000029457) Spsb4 (ENSPEMG00000021848) Pxylp1 (ENSPEMG00000027594) ENSPEMG00000001384 Zbtb38 (ENSPEMG00000021180) ENSPEMG00000020968 ##22 Rasa2 (ENSPEMG00000020689) Gm28729 (ENSPEMG00000021490) ENSPEMG00000020541 ENSPEMG00000025894 Tfdp2 (ENSPEMG00000020459) Gk5 (ENSPEMG00000021213) ENSPEMG00000028629 Xrn1 (ENSPEMG00000020610) Atr (ENSPEMG00000022407) Pls1 (ENSPEMG00000023583) Trpc1 (ENSPEMG00000021151) Pcolce2 (ENSPEMG00000021235) Paqr9 (ENSPEMG00000021256) U2surp (ENSPEMG00000020825) Chst2 (ENSPEMG00000019658) Prairie vole DUPLICATION Prairie vole MODERN SPECIES 14 ENSMOCG00000003804 Ddx59 (ENSMOCG00000016551) ENSMOCG00000005363 Camsap2 (ENSMOCG00000016651) ENSMOCG00000015576 Mroh3 (ENSMOCG00000021368) Kif21b (ENSMOCG00000019937) Cacna1s (ENSMOCG00000022841) Tmem9 (ENSMOCG00000021738) Pkp1 (ENSMOCG00000016418) Tnnt2 (ENSMOCG00000012562) Lad1 (ENSMOCG00000012808) Tnni1 (ENSMOCG00000013469) Phlda3 (ENSMOCG00000007137) Csrp1 (ENSMOCG00000003621) ENSMOCG00000018588 ##22 Rab7b (ENSMOCG00000015192) ENSMOCG00000003765 ENSMOCG00000012209 Nav1 (ENSMOCG00000020147) Ipo9 (ENSMOCG00000022988) Shisa4 (ENSMOCG00000022223) Lmod1 (ENSMOCG00000021948) ENSMOCG00000011417 Rnpep (ENSMOCG00000022091) Elf3 (ENSMOCG00000011101) Gpr37l1 (ENSMOCG00000015010) Arl8a (ENSMOCG00000011687) Ptpn7 (ENSMOCG00000019802) Ptprv (ENSMOCG00000016711) Lgr6 (ENSMOCG00000001284) Prairie vole MODERN SPECIES 7 Itgb5 (ENSMOCG00000021055) Umps (ENSMOCG00000017158) Kalrn (ENSMOCG00000002780) Ropn1 (ENSMOCG00000009990) Ccdc14 (ENSMOCG00000020626) Mylk (ENSMOCG00000020331) Hacd2 (ENSMOCG00000008110) Adcy5 (ENSMOCG00000018853) Sec22a (ENSMOCG00000010833) ENSMOCG00000017023 ENSMOCG00000004499 Pdia5 (ENSMOCG00000015699) Sema5b (ENSMOCG00000001666) Slc49a4 (ENSMOCG00000012213) Hspbap1 (ENSMOCG00000020288) ENSMOCG00000007676 ##22 Parp14 (ENSMOCG00000021121) ENSMOCG00000013470 ENSMOCG00000008192 ENSMOCG00000009728 Or5h19 (ENSMOCG00000020001) Or5h17 (ENSMOCG00000016914) ENSMOCG00000009456 ENSMOCG00000012577 Cldnd1 (ENSMOCG00000014045) Gpr15 (ENSMOCG00000009679) Cpox (ENSMOCG00000017490) ENSMOCG00000020849 ENSMOCG00000001290 Dcbld2 (ENSMOCG00000003711) ENSMOCG00000007463 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.f ##22 Chinese hamster chok1gshd DUPLICATION Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 1 Paip1 (ENSCGRG00001009535) 4833420G17Rik (ENSCGRG00001011989) Tmem267 (ENSCGRG00001003827) Ccl28 (ENSCGRG00001020584) Hmgcs1 (ENSCGRG00001021007) Nim1k (ENSCGRG00001021680) Zfp131 (ENSCGRG00001021210) ENSCGRG00001007226 Ccdc152 (ENSCGRG00001022348) Ghr (ENSCGRG00001019428) Fbxo4 (ENSCGRG00001019798) Rimoc1 (ENSCGRG00001020182) Oxct1 (ENSCGRG00001022982) Plcxd3 (ENSCGRG00001023897) C6 (ENSCGRG00001024316) ENSCGRG00001002969 ##22 Mroh2b (ENSCGRG00001004445) C7 (ENSCGRG00001007548) Card6 (ENSCGRG00001009142) ENSCGRG00001012869 Prkaa1 (ENSCGRG00001001697) Ttc33 (ENSCGRG00001019815) Ptger4 (ENSCGRG00001020213) ENSCGRG00001020504 ENSCGRG00001008646 ENSCGRG00001012741 Dab2 (ENSCGRG00001021141) C9 (ENSCGRG00001021695) Fyb (ENSCGRG00001022410) Rictor (ENSCGRG00001009015) Osmr (ENSCGRG00001017859) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 165 Sult1c1 (ENSCGRG00001019875) Sult1c2 (ENSCGRG00001010992) ENSCGRG00001014459 ENSCGRG00001015875 ENSCGRG00001017629 Slc5a7 (ENSCGRG00001019612) ENSCGRG00001023065 ##22 St6gal2 (ENSCGRG00001015136) Uxs1 (ENSCGRG00001022493) Ecrg4 (ENSCGRG00001008420) Nck2 (ENSCGRG00001010470) Fhl2 (ENSCGRG00001019694) AI597479 (ENSCGRG00001000237) Tgfbrap1 (ENSCGRG00001001074) Gpr45 (ENSCGRG00001001563) Mrps9 (ENSCGRG00001012228) Pou3f3 (ENSCGRG00001001262) Tmem182 (ENSCGRG00001013568) Mfsd9 (ENSCGRG00001020127) Slc9a2 (ENSCGRG00001020868) Slc9a4 (ENSCGRG00001013202) Il18rap (ENSCGRG00001020521) Primates ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT01030000235089 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00910000148110 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 ENSGT00950000183099.u.a.e ##22 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.n ##22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00910000147527 ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01090000263454 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a.l ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e ##22 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e ##22 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e ##22 Coquerels sifaka DUPLICATION Coquerels sifaka MODERN SPECIES 190 ADAMTS5 (ENSPCOG00000016255) ADAMTS1 (ENSPCOG00000021162) ENSPCOG00000023352 APP (ENSPCOG00000017074) ENSPCOG00000027632 ATP5PF (ENSPCOG00000016705) JAM2 (ENSPCOG00000028142) MRPL39 (ENSPCOG00000026820) ENSPCOG00000019852 ##22 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 593 GLI3 (ENSPCOG00000002002) INHBA (ENSPCOG00000021472) SUGCT (ENSPCOG00000023610) MPLKIP (ENSPCOG00000007076) CDK13 (ENSPCOG00000020869) ENSPCOG00000028359 ##22 RALA (ENSPCOG00000018071) YAE1 (ENSPCOG00000012495) POU6F2 (ENSPCOG00000022128) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00910000148110 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 ENSGT00950000183099.u.a.e ##22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00910000147527 ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01090000263454 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a.l ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 Simiiformes DUPLICATION Simiiformes DUPLICATION Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.a ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.a ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.a ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.a ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.a ##22 Macaca ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000157249 ENSGT00940000154453.b.a.b.a ENSGT00940000162639 ENSGT00910000146869 ENSGT00910000147537 ENSGT00940000159743 ENSGT00940000158720.c.b ENSGT00940000158720.c.a ENSGT00940000159232.h.b ENSGT00940000159232.h.a ENSGT00940000156190.h ENSGT00390000004840 ENSGT00390000012547.b.b.b ENSGT00940000156307.b ENSGT00940000159094 ENSGT00950000183099.u.a.e.i.a ##22 ENSGT00940000156597.b ENSGT00640000091496 ENSGT00390000001447.p.b ENSGT00910000148013 ENSGT00530000063688.a ENSGT00940000157652 ENSGT01030000234570.d.a ENSGT00530000063186.b.b ENSGT00940000157192 ENSGT00940000154695 ENSGT00940000157137 ENSGT00940000155053 ENSGT00720000108792.B ENSGT00940000156532 ENSGT00940000157295 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000157249 ENSGT00940000154453.b.a.b.a ENSGT00940000162639 ENSGT00910000147537 ENSGT00940000159743 ENSGT00940000158720.c.b ENSGT00940000158720.c.a ENSGT00940000159232.h.b ENSGT00940000159232.h.a ENSGT00940000156190.h ENSGT00390000004840 ENSGT00390000012547.b.b.b ENSGT00940000156307.b ENSGT00940000159094 ENSGT00960000191503.d ENSGT00950000183099.u.a.e.i.a ##22 ENSGT00940000156597.b ENSGT00640000091496 ENSGT00390000001447.q ENSGT00530000063688.a ENSGT01030000234570.d.a ENSGT00530000063186.b.b ENSGT00940000157192 ENSGT00940000154695 ENSGT00390000002231.d.b ENSGT00940000157137 ENSGT00940000155053 ENSGT00720000108792.B ENSGT00940000156532 ENSGT00940000157295 ENSGT00390000004553 Rhesus MODERN SPECIES 3 CCNYL1 (ENSMMUG00000020211) FZD5 (ENSMMUG00000057651) PLEKHM3 (ENSMMUG00000008113) ENSMMUG00000060339 ENSMMUG00000059636 ENSMMUG00000045625 CRYGD (ENSMMUG00000052742) CRYGC (ENSMMUG00000056938) CRYGB (ENSMMUG00000010871) CRYGA (ENSMMUG00000049611) C12H2orf80 (ENSMMUG00000014299) IDH1 (ENSMMUG00000016077) PIKFYVE (ENSMMUG00000017524) PTH2R (ENSMMUG00000005295) ENSMMUG00000051180 ENSMMUG00000004941 ##22 MAP2 (ENSMMUG00000018741) UNC80 (ENSMMUG00000002809) RPE (ENSMMUG00000010513) KANSL1L (ENSMMUG00000010515) MYL1 (ENSMMUG00000010519) LANCL1 (ENSMMUG00000054937) CPS1 (ENSMMUG00000010508) ERBB4 (ENSMMUG00000001674) ENSMMUG00000058114 ENSMMUG00000061342 IKZF2 (ENSMMUG00000000381) SPAG16 (ENSMMUG00000000382) ENSMMUG00000064880 ENSMMUG00000065281 VWC2L (ENSMMUG00000054519) Crab-eating macaque MODERN SPECIES 3 ENSMFAG00000041805 CREB1 (ENSMFAG00000039629) CCNYL1 (ENSMFAG00000001361) ENSMFAG00000009381 PLEKHM3 (ENSMFAG00000033450) ENSMFAG00000064501 ENSMFAG00000065752 CRYGD (ENSMFAG00000052291) CRYGC (ENSMFAG00000047676) CRYGB (ENSMFAG00000052040) C2orf80 (ENSMFAG00000003892) IDH1 (ENSMFAG00000037839) PIKFYVE (ENSMFAG00000041669) PTH2R (ENSMFAG00000000697) ENSMFAG00000049469 ENSMFAG00000040051 ##22 MAP2 (ENSMFAG00000037191) UNC80 (ENSMFAG00000038823) ENSMFAG00000001492 KANSL1L (ENSMFAG00000031878) MYL1 (ENSMFAG00000031549) LANCL1 (ENSMFAG00000041765) CPS1 (ENSMFAG00000044079) ERBB4 (ENSMFAG00000042352) ENSMFAG00000047331 ENSMFAG00000059453 IKZF2 (ENSMFAG00000049387) SPAG16 (ENSMFAG00000036303) ENSMFAG00000056823 VWC2L (ENSMFAG00000004450) BARD1 (ENSMFAG00000032566) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.a ##22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.a ##22 Drill MODERN SPECIES 1499 ENSMLEG00000017306 ##22 ENSMLEG00000038774 MAP2 (ENSMLEG00000031717) UNC80 (ENSMLEG00000030480) ENSMLEG00000033066 KANSL1L (ENSMLEG00000043267) ACADL (ENSMLEG00000040139) MYL1 (ENSMLEG00000041044) ENSMLEG00000012488 LANCL1 (ENSMLEG00000033475) CPS1 (ENSMLEG00000038945) ENSMLEG00000011832 Olive baboon MODERN SPECIES 1 CCNYL1 (ENSPANG00000011206) FZD5 (ENSPANG00000004676) ENSPANG00000050051 ENSPANG00000049745 PLEKHM3 (ENSPANG00000020994) ENSPANG00000041891 ENSPANG00000040505 CRYGD (ENSPANG00000039491) CRYGC (ENSPANG00000051332) CRYGB (ENSPANG00000049951) IDH1 (ENSPANG00000005239) C2orf80 (ENSPANG00000033159) PIKFYVE (ENSPANG00000010442) PTH2R (ENSPANG00000002436) ENSPANG00000039642 ENSPANG00000051073 ##22 MAP2 (ENSPANG00000019944) UNC80 (ENSPANG00000024759) ENSPANG00000005182 KANSL1L (ENSPANG00000000746) MYL1 (ENSPANG00000005181) ENSPANG00000050010 LANCL1 (ENSPANG00000043351) CPS1 (ENSPANG00000008478) ERBB4 (ENSPANG00000020599) ENSPANG00000048059 ENSPANG00000050738 IKZF2 (ENSPANG00000016694) SPAG16 (ENSPANG00000011416) ENSPANG00000037591 VWC2L (ENSPANG00000046744) Vervet Monkey MODERN SPECIES 1 CPO (ENSCSAG00000010143) KLF7 (ENSCSAG00000010117) CREB1 (ENSCSAG00000010111) METTL21A (ENSCSAG00000010107) CCNYL1 (ENSCSAG00000010093) FZD5 (ENSCSAG00000018771) PLEKHM3 (ENSCSAG00000010071) CRYGD (ENSCSAG00000010066) CRYGC (ENSCSAG00000010063) CRYGB (ENSCSAG00000010058) CRYGA (ENSCSAG00000010050) C2orf80 (ENSCSAG00000010044) IDH1 (ENSCSAG00000010039) PIKFYVE (ENSCSAG00000010033) PTH2R (ENSCSAG00000010012) ENSCSAG00000018772 ##22 ENSCSAG00000009983 MAP2 (ENSCSAG00000009974) UNC80 (ENSCSAG00000009965) ENSCSAG00000009931 KANSL1L (ENSCSAG00000009924) ACADL (ENSCSAG00000009898) MYL1 (ENSCSAG00000009850) LANCL1 (ENSCSAG00000009844) CPS1 (ENSCSAG00000009759) ENSCSAG00000009490 ENSCSAG00000009457 IKZF2 (ENSCSAG00000009405) ENSCSAG00000009388 VWC2L (ENSCSAG00000009346) BARD1 (ENSCSAG00000009338) Hominoidea DUPLICATION Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.a.a ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.a.a ##22 Homo/Pan/Gorilla group DUPLICATION Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.a.a.a ##22 Gorilla MODERN SPECIES 5 NOXRED1 (ENSGGOG00000043069) SAMD15 (ENSGGOG00000022049) TMED8 (ENSGGOG00000013168) GSTZ1 (ENSGGOG00000006215) POMT2 (ENSGGOG00000006199) NGB (ENSGGOG00000006195) TMEM63C (ENSGGOG00000006177) ZDHHC22 (ENSGGOG00000010146) CIPC (ENSGGOG00000036224) IRF2BPL (ENSGGOG00000002839) ENSGGOG00000040029 LRRC74A (ENSGGOG00000010758) ANGEL1 (ENSGGOG00000017040) ENSGGOG00000041102 VASH1 (ENSGGOG00000017033) ENSGGOG00000015155 ##22 ENSGGOG00000024523 ESRRB (ENSGGOG00000002238) GPATCH2L (ENSGGOG00000005602) ENSGGOG00000042391 IFT43 (ENSGGOG00000001483) TGFB3 (ENSGGOG00000001481) TTLL5 (ENSGGOG00000016703) ERG28 (ENSGGOG00000006493) ENSGGOG00000036834 FLVCR2 (ENSGGOG00000009014) BATF (ENSGGOG00000002267) JDP2 (ENSGGOG00000043596) FOS (ENSGGOG00000000527) TMED10 (ENSGGOG00000007453) NEK9 (ENSGGOG00000027555) Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.a.a.a ##22 Pan ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.a.a.a ##22 Bonobo MODERN SPECIES 5 SAMD15 (ENSPPAG00000043267) TMED8 (ENSPPAG00000032854) GSTZ1 (ENSPPAG00000041126) POMT2 (ENSPPAG00000029527) NGB (ENSPPAG00000040520) TMEM63C (ENSPPAG00000034996) ZDHHC22 (ENSPPAG00000009773) CIPC (ENSPPAG00000042841) ENSPPAG00000035248 ENSPPAG00000041887 ENSPPAG00000040100 LRRC74A (ENSPPAG00000037806) ANGEL1 (ENSPPAG00000029410) ENSPPAG00000018562 VASH1 (ENSPPAG00000038241) ENSPPAG00000027182 ##22 ESRRB (ENSPPAG00000035482) GPATCH2L (ENSPPAG00000036494) ENSPPAG00000040454 IFT43 (ENSPPAG00000035630) TGFB3 (ENSPPAG00000031753) TTLL5 (ENSPPAG00000041206) ERG28 (ENSPPAG00000038048) ENSPPAG00000035673 ENSPPAG00000024550 BATF (ENSPPAG00000038433) JDP2 (ENSPPAG00000039076) FOS (ENSPPAG00000021153) TMED10 (ENSPPAG00000032562) NEK9 (ENSPPAG00000017463) ZC2HC1C (ENSPPAG00000032553) Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.a.a.b ##22 Gorilla MODERN SPECIES 523 ENSGGOG00000027167 ENSGGOG00000038151 DIAPH2 (ENSGGOG00000002859) ENSGGOG00000038270 FAM133A (ENSGGOG00000043974) NAP1L3 (ENSGGOG00000016989) ENSGGOG00000025902 ENSGGOG00000039790 ENSGGOG00000025897 ENSGGOG00000042618 ENSGGOG00000008584 PABPC5 (ENSGGOG00000007622) ENSGGOG00000037634 ENSGGOG00000036979 CPXCR1 (ENSGGOG00000026865) RPSA (ENSGGOG00000036643) ##22 KLHL4 (ENSGGOG00000002307) DACH2 (ENSGGOG00000007231) ENSGGOG00000040803 CHM (ENSGGOG00000022912) POF1B (ENSGGOG00000016908) ZNF711 (ENSGGOG00000006110) SATL1 (ENSGGOG00000016333) ENSGGOG00000016329 HDX (ENSGGOG00000005551) RPS6KA6 (ENSGGOG00000016474) CYLC1 (ENSGGOG00000001587) POU3F4 (ENSGGOG00000027353) ENSGGOG00000025534 SH3BGRL (ENSGGOG00000009664) HMGN5 (ENSGGOG00000016479) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.a.b ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.a.b ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.a.b ##22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.a.b ##22 Pan ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000001285 ENSGT00530000063626.b ENSGT00940000157998 ENSGT00940000157777 ENSGT00940000155040.b ENSGT00550000074930.ab ENSGT00940000157033 ENSGT00940000155811 ENSGT00940000153832.f ENSGT00730000110905.b ENSGT00940000158580 ENSGT00530000063539.b ENSGT00390000005532.e.b.d ENSGT00730000111164 ENSGT00390000012080 ENSGT00950000183099.u.a.e.i.a.b ##22 ENSGT01020000230346.A.cb.b ENSGT00390000004106 ENSGT00510000048550 ENSGT00950000183124.B ENSGT00390000007831 ENSGT01080000257336.b.e.b.a.b.a.e.a ENSGT01080000257336.b.e.b.a.b.a.e.b ENSGT01080000257336.b.e.b.a.b.a.f ENSGT01080000257336.b.e.b.a.b.b ENSGT00510000048671 ENSGT00390000014894 ENSGT00940000157013 ENSGT00390000014507.a ENSGT00390000012501 ENSGT00390000018612.a.b Bonobo MODERN SPECIES 3 RAB3IP (ENSPPAG00000038298) ENSPPAG00000034849 LRRC10 (ENSPPAG00000025591) CCT2 (ENSPPAG00000012594) FRS2 (ENSPPAG00000028068) YEATS4 (ENSPPAG00000032289) LYZ (ENSPPAG00000038937) CPSF6 (ENSPPAG00000005301) CPM (ENSPPAG00000003532) MDM2 (ENSPPAG00000032775) ENSPPAG00000029554 SLC35E3 (ENSPPAG00000039610) NUP107 (ENSPPAG00000030661) RAP1B (ENSPPAG00000039946) ENSPPAG00000043670 ENSPPAG00000034222 ##22 ENSPPAG00000000159 MDM1 (ENSPPAG00000031903) IL22 (ENSPPAG00000027135) IL26 (ENSPPAG00000030617) IFNG (ENSPPAG00000042020) ENSPPAG00000014485 SLCO1B1 (ENSPPAG00000031308) SLCO1A2 (ENSPPAG00000028197) IAPP (ENSPPAG00000033571) PYROXD1 (ENSPPAG00000030785) RECQL (ENSPPAG00000030306) GOLT1B (ENSPPAG00000031613) SPX (ENSPPAG00000029701) GYS2 (ENSPPAG00000042144) LDHB (ENSPPAG00000033626) Chimpanzee MODERN SPECIES 3 RAB3IP (ENSPTRG00000005212) BEST3 (ENSPTRG00000005208) LRRC10 (ENSPTRG00000022651) CCT2 (ENSPTRG00000005210) FRS2 (ENSPTRG00000005207) YEATS4 (ENSPTRG00000005206) LYZ (ENSPTRG00000029654) CPSF6 (ENSPTRG00000005205) CPM (ENSPTRG00000005204) MDM2 (ENSPTRG00000005203) ENSPTRG00000044648 SLC35E3 (ENSPTRG00000005201) NUP107 (ENSPTRG00000005200) ENSPTRG00000044556 RAP1B (ENSPTRG00000005197) ENSPTRG00000042763 ##22 ENSPTRG00000045123 MDM1 (ENSPTRG00000005196) IL22 (ENSPTRG00000005195) IL26 (ENSPTRG00000005194) IFNG (ENSPTRG00000005193) SLCO1B3 (ENSPTRG00000044231) ENSPTRG00000004750 SLCO1B1 (ENSPTRG00000004754) SLCO1A2 (ENSPTRG00000004755) IAPP (ENSPTRG00000004756) PYROXD1 (ENSPTRG00000004757) RECQL (ENSPTRG00000004758) GOLT1B (ENSPTRG00000004759) SPX (ENSPTRG00000004760) GYS2 (ENSPTRG00000004761) Gibbon MODERN SPECIES 10 PPARD (ENSNLEG00000008621) DEF6 (ENSNLEG00000008604) ENSNLEG00000008581 SCUBE3 (ENSNLEG00000008527) TCP11 (ENSNLEG00000008486) ANKS1A (ENSNLEG00000008483) TAF11 (ENSNLEG00000008457) BLTP3A (ENSNLEG00000008400) SNRPC (ENSNLEG00000034810) ENSNLEG00000027593 ENSNLEG00000031071 ENSNLEG00000035761 SPDEF (ENSNLEG00000008374) PACSIN1 (ENSNLEG00000008343) ENSNLEG00000008336 ENSNLEG00000033500 ##22 NUDT3 (ENSNLEG00000029692) ENSNLEG00000033901 SMIM29 (ENSNLEG00000032266) HMGA1 (ENSNLEG00000031539) ENSNLEG00000034916 GRM4 (ENSNLEG00000008487) MLN (ENSNLEG00000008478) ENSNLEG00000008472 IP6K3 (ENSNLEG00000008448) UQCC2 (ENSNLEG00000035324) ITPR3 (ENSNLEG00000008373) BAK1 (ENSNLEG00000028170) ZBTB9 (ENSNLEG00000008348) ENSNLEG00000033973 PHF1 (ENSNLEG00000008320) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.a ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.a ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.a ##22 Bolivian squirrel monkey DUPLICATION Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 42 HTATIP2 (ENSSBOG00000019955) DBX1 (ENSSBOG00000028890) ENSSBOG00000034512 NAV2 (ENSSBOG00000031555) E2F8 (ENSSBOG00000014864) CSRP3 (ENSSBOG00000026732) ZDHHC13 (ENSSBOG00000023472) ENSSBOG00000023462 PTPN5 (ENSSBOG00000022094) IGSF22 (ENSSBOG00000035057) TMEM86A (ENSSBOG00000022647) SPTY2D1 (ENSSBOG00000019822) ENSSBOG00000018184 UEVLD (ENSSBOG00000020574) ENSSBOG00000023915 ENSSBOG00000016234 ##22 TSG101 (ENSSBOG00000032898) LDHAL6A (ENSSBOG00000032789) LDHC (ENSSBOG00000029573) ENSSBOG00000023979 GTF2H1 (ENSSBOG00000035194) HPS5 (ENSSBOG00000034848) ENSSBOG00000025130 SAA4 (ENSSBOG00000035220) SAAL1 (ENSSBOG00000000873) TPH1 (ENSSBOG00000021704) SERGEF (ENSSBOG00000021636) KCNC1 (ENSSBOG00000032934) MYOD1 (ENSSBOG00000032168) OTOG (ENSSBOG00000031057) USH1C (ENSSBOG00000030041) Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 83 U2SURP (ENSSBOG00000027984) CHST2 (ENSSBOG00000019094) SLC9A9 (ENSSBOG00000029001) DIPK2A (ENSSBOG00000027031) PLOD2 (ENSSBOG00000030460) PLSCR4 (ENSSBOG00000034850) PLSCR2 (ENSSBOG00000021577) PLSCR1 (ENSSBOG00000020555) PLSCR5 (ENSSBOG00000021485) RYK (ENSSBOG00000024795) AMOTL2 (ENSSBOG00000030616) ENSSBOG00000031944 CEP63 (ENSSBOG00000031149) KY (ENSSBOG00000033829) EPHB1 (ENSSBOG00000021552) ENSSBOG00000027208 ##22 PPP2R3A (ENSSBOG00000022624) MSL2 (ENSSBOG00000028823) PCCB (ENSSBOG00000033579) STAG1 (ENSSBOG00000025180) ENSSBOG00000010558 SLC35G2 (ENSSBOG00000019732) ENSSBOG00000015996 NCK1 (ENSSBOG00000033794) IL20RB (ENSSBOG00000030039) SOX14 (ENSSBOG00000013214) ENSSBOG00000018267 CLDN18 (ENSSBOG00000029781) DZIP1L (ENSSBOG00000028314) A4GNT (ENSSBOG00000035068) DBR1 (ENSSBOG00000032048) Simiiformes DUPLICATION Simiiformes DUPLICATION Simiiformes DUPLICATION Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.a.a ##22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.a.a ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.a.a ##22 Marmoset MODERN SPECIES 16 ENSCJAG00000079274 TINAG (ENSCJAG00000010887) MLIP (ENSCJAG00000010939) LRRC1 (ENSCJAG00000010969) KLHL31 (ENSCJAG00000011053) GCLC (ENSCJAG00000011063) ELOVL5 (ENSCJAG00000011119) GCM1 (ENSCJAG00000079175) FBXO9 (ENSCJAG00000042701) CILK1 (ENSCJAG00000011214) GSTA4 (ENSCJAG00000011268) ENSCJAG00000034823 ENSCJAG00000060605 ENSCJAG00000066217 TMEM14A (ENSCJAG00000011309) ENSCJAG00000082568 ##22 TRAM2 (ENSCJAG00000011314) EFHC1 (ENSCJAG00000011346) PAQR8 (ENSCJAG00000011379) ENSCJAG00000080195 ENSCJAG00000080533 ENSCJAG00000011389 IL17F (ENSCJAG00000043579) IL17A (ENSCJAG00000011432) PKHD1 (ENSCJAG00000011434) ENSCJAG00000078173 TFAP2B (ENSCJAG00000011561) TFAP2D (ENSCJAG00000011580) ENSCJAG00000083090 DEFB112 (ENSCJAG00000052292) DEFB110 (ENSCJAG00000076216) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.a.a ##22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.a.a ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.a.a ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000007266 ENSGT00950000182971.B.b.c.a.b ENSGT00950000182870.a.a.b.j ENSGT00530000063948.a ENSGT00940000162147 ENSGT00390000014801 ENSGT00950000182904.a.a.a ENSGT00940000157243 ENSGT00940000158417.b ENSGT00910000147245 ENSGT00940000160166 ENSGT00390000006620 ENSGT00940000159107 ENSGT00390000014682.u.b ENSGT00940000161919 ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.a.a ##22 ENSGT00940000160804 ENSGT00940000162648 ENSGT00390000018324.e ENSGT00390000003453.b.b ENSGT00510000047366 ENSGT00510000048901 ENSGT01030000234542.b.a.a.b.a.b.l ENSGT00390000009491.c ENSGT00950000182891.a.a.b.a.b.a.s.d ENSGT00940000159989 ENSGT00390000016136 ENSGT00940000160806 ENSGT00940000157062 ENSGT00390000010652.B ENSGT00940000160472 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000007266 ENSGT00950000182971.B.b.c.a.b ENSGT00950000182870.a.a.b.j ENSGT00530000063948.a ENSGT00940000162147 ENSGT00390000014801 ENSGT00950000182904.a.a.a ENSGT00940000157243 ENSGT00940000158417.b ENSGT00910000147245 ENSGT00940000160166 ENSGT00390000006620 ENSGT00940000159107 ENSGT00390000014682.u.b ENSGT00940000161919 ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.a.a ##22 ENSGT00940000160804 ENSGT00940000162648 ENSGT00390000018324.e ENSGT00390000003453.b.b ENSGT00510000047366 ENSGT00510000048901 ENSGT01030000234542.b.a.a.b.a.b.l ENSGT00390000009491.c ENSGT00950000182891.a.a.b.a.b.a.s.d ENSGT00940000159989 ENSGT00390000016136 ENSGT00940000160806 ENSGT00940000157062 ENSGT00390000010652.B ENSGT00940000160472 Pan ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007266 ENSGT00950000182971.B.b.c.a.b ENSGT00950000182870.a.a.b.j ENSGT00530000063948.a ENSGT00940000162147 ENSGT00390000014801 ENSGT00950000182904.a.a.a ENSGT00940000157243 ENSGT00940000158417.b ENSGT00910000147245 ENSGT00940000160166 ENSGT00390000006620 ENSGT00940000159107 ENSGT00390000014682.u.b ENSGT00940000161919 ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.a.a ##22 ENSGT00940000160804 ENSGT00940000162648 ENSGT00390000018324.e ENSGT00390000003453.b.b ENSGT00510000047366 ENSGT00510000048901 ENSGT01030000234542.b.a.a.b.a.b.l ENSGT00390000009491.c ENSGT00950000182891.a.a.b.a.b.a.s.d ENSGT00940000159989 ENSGT00390000016136 ENSGT00940000160806 ENSGT00940000157062 ENSGT00390000010652.B ENSGT00940000160472 Bonobo MODERN SPECIES CKS1B (ENSPPAG00000038950) SHC1 (ENSPPAG00000030626) PYGO2 (ENSPPAG00000043901) ENSPPAG00000041947 ENSPPAG00000034265 PMVK (ENSPPAG00000041579) KCNN3 (ENSPPAG00000039456) ENSPPAG00000032031 CHRNB2 (ENSPPAG00000031821) ENSPPAG00000027726 UBE2Q1 (ENSPPAG00000031407) TDRD10 (ENSPPAG00000025622) SHE (ENSPPAG00000030773) ENSPPAG00000028410 IL6R (ENSPPAG00000029063) ENSPPAG00000030902 ##22 ATP8B2 (ENSPPAG00000034141) AQP10 (ENSPPAG00000034579) HAX1 (ENSPPAG00000028539) UBAP2L (ENSPPAG00000013173) ENSPPAG00000037317 CFAP141 (ENSPPAG00000035012) ENSPPAG00000034824 NUP210L (ENSPPAG00000024740) RPS27 (ENSPPAG00000042044) RAB13 (ENSPPAG00000028435) JTB (ENSPPAG00000028370) CREB3L4 (ENSPPAG00000021279) SLC39A1 (ENSPPAG00000042626) CRTC2 (ENSPPAG00000031646) DENND4B (ENSPPAG00000005709) Chimpanzee MODERN SPECIES FLAD1 (ENSPTRG00000001399) CKS1B (ENSPTRG00000001398) SHC1 (ENSPTRG00000001397) PYGO2 (ENSPTRG00000001395) PBXIP1 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(ENSGGOG00000005627) TDRD10 (ENSGGOG00000040815) SHE (ENSGGOG00000015778) ENSGGOG00000024279 IL6R (ENSGGOG00000000836) RPSA (ENSGGOG00000024381) ##22 ATP8B2 (ENSGGOG00000011901) AQP10 (ENSGGOG00000011888) HAX1 (ENSGGOG00000016771) UBAP2L (ENSGGOG00000016753) C1orf43 (ENSGGOG00000024361) CFAP141 (ENSGGOG00000005688) ENSGGOG00000000472 NUP210L (ENSGGOG00000014209) ENSGGOG00000024810 RAB13 (ENSGGOG00000023693) JTB (ENSGGOG00000005608) CREB3L4 (ENSGGOG00000005601) SLC39A1 (ENSGGOG00000038266) CRTC2 (ENSGGOG00000023553) DENND4B (ENSGGOG00000003845) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.a.a ##22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.a.a ##22 Black snub-nosed monkey DUPLICATION Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1473 ACVR2B (ENSRBIG00000038341) EXOG (ENSRBIG00000029194) ENSRBIG00000014824 SCN5A (ENSRBIG00000029316) SCN10A (ENSRBIG00000038186) SCN11A (ENSRBIG00000008648) WDR48 (ENSRBIG00000032906) GORASP1 (ENSRBIG00000036324) TTC21A 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(ENSRBIG00000038066) Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1973 ITGA9 (ENSRROG00000033427) ENSRROG00000007893 ##22 ENSRROG00000037361 GOLGA4 (ENSRROG00000038625) LRRFIP2 (ENSRROG00000032750) MLH1 (ENSRROG00000036305) EPM2AIP1 (ENSRROG00000018391) TRANK1 (ENSRROG00000044487) DCLK3 (ENSRROG00000017374) HRG (ENSRROG00000033205) FETUB (ENSRROG00000030382) AHSG (ENSRROG00000035859) DNAJB11 (ENSRROG00000037900) TBCCD1 (ENSRROG00000043062) CRYGS (ENSRROG00000030522) DGKG (ENSRROG00000033932) ETV5 (ENSRROG00000016280) Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00910000148110 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 ENSGT00950000183099.u.a.d.b #22 ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.a.b ##22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00910000147527 ENSGT00950000183138.a.a.b 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MODERN SPECIES 335 ENSANAG00000037784 CTNND1 (ENSANAG00000028735) BTBD18 (ENSANAG00000026507) SELENOH (ENSANAG00000033344) ENSANAG00000027444 MED19 (ENSANAG00000037721) ZDHHC5 (ENSANAG00000025624) CLP1 (ENSANAG00000034935) YPEL4 (ENSANAG00000016132) ENSANAG00000024778 ##22 SERPING1 (ENSANAG00000026312) UBE2L6 (ENSANAG00000032291) SMTNL1 (ENSANAG00000001637) TIMM10 (ENSANAG00000027477) SLC43A1 (ENSANAG00000029105) RTN4RL2 (ENSANAG00000037630) SLC43A3 (ENSANAG00000038258) PRG2 (ENSANAG00000026586) PRG3 (ENSANAG00000026629) P2RX3 (ENSANAG00000034918) SSRP1 (ENSANAG00000037729) TNKS1BP1 (ENSANAG00000025236) APLNR (ENSANAG00000008918) LRRC55 (ENSANAG00000019996) Cebidae ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000162395 ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT00910000146711 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#15 ENSCJAG00000058916 ENSCJAG00000034336 #11 ENSCJAG00000080502 #15 ENSCJAG00000067367 #19 Marmoset MODERN SPECIES 8 XYLB (ENSCJAG00000010114) ACVR2B (ENSCJAG00000010067) EXOG (ENSCJAG00000010063) SCN5A (ENSCJAG00000009878) SCN10A (ENSCJAG00000031394) ENSCJAG00000064984 SCN11A (ENSCJAG00000009856) WDR48 (ENSCJAG00000009759) GORASP1 (ENSCJAG00000009752) CSRNP1 (ENSCJAG00000009708) XIRP1 (ENSCJAG00000009706) CX3CR1 (ENSCJAG00000009704) ENSCJAG00000042291 ENSCJAG00000075556 SLC25A38 (ENSCJAG00000009692) ENSCJAG00000009675 ##22 ENSCJAG00000085057 MYRIP (ENSCJAG00000009611) ENSCJAG00000075301 ENSCJAG00000069643 EIF1B (ENSCJAG00000046513) ENTPD3 (ENSCJAG00000017875) RPL14 (ENSCJAG00000017884) ZNF620 (ENSCJAG00000017904) ZNF621 (ENSCJAG00000039127) ENSCJAG00000070388 ENSCJAG00000079403 ENSCJAG00000079266 CTNNB1 (ENSCJAG00000017918) ULK4 (ENSCJAG00000017964) TRAK1 (ENSCJAG00000017993) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000161691 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ENSGT00550000074846.j ENSGT00390000004380.m.b.b ENSGT00940000162813 ENSGT00390000007453.db ENSGT00940000159421 ENSGT00390000005939.b Bonobo MODERN SPECIES 7 TMEM170A (ENSPPAG00000036751) CFDP1 (ENSPPAG00000035342) BCAR1 (ENSPPAG00000033143) CTRB1 (ENSPPAG00000033758) CTRB2 (ENSPPAG00000036928) ZFP1 (ENSPPAG00000033168) LDHD (ENSPPAG00000000820) ZNRF1 (ENSPPAG00000036635) WDR59 (ENSPPAG00000032813) FA2H (ENSPPAG00000012442) MLKL (ENSPPAG00000042236) ENSPPAG00000043695 RFWD3 (ENSPPAG00000028503) GLG1 (ENSPPAG00000030108) PSMD7 (ENSPPAG00000038728) ENSPPAG00000043562 ##22 ENSPPAG00000041056 ENSPPAG00000038682 ZFHX3 (ENSPPAG00000033950) ENSPPAG00000038180 PMFBP1 (ENSPPAG00000037201) DHX38 (ENSPPAG00000042488) TXNL4B (ENSPPAG00000033554) ENSPPAG00000038198 ENSPPAG00000036058 HP (ENSPPAG00000038234) DHODH (ENSPPAG00000039835) ENSPPAG00000027200 ENSPPAG00000000053 PKD1L3 (ENSPPAG00000029013) IST1 (ENSPPAG00000043761) Chimpanzee MODERN SPECIES 7 TMEM170A (ENSPTRG00000050509) CFDP1 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(ENSGGOG00000014559) FA2H (ENSGGOG00000013529) RFWD3 (ENSGGOG00000000160) GLG1 (ENSGGOG00000013215) ENSGGOG00000024401 PSMD7 (ENSGGOG00000009774) ENSGGOG00000028546 ##22 ENSGGOG00000042929 ZFHX3 (ENSGGOG00000012083) ENSGGOG00000042749 PMFBP1 (ENSGGOG00000013067) DHX38 (ENSGGOG00000013052) ENSGGOG00000044026 ENSGGOG00000037759 TXNL4B (ENSGGOG00000037830) HPR (ENSGGOG00000040916) HP (ENSGGOG00000013039) DHODH (ENSGGOG00000013030) ENSGGOG00000041291 PKD1L3 (ENSGGOG00000007972) ENSGGOG00000001863 ZNF821 (ENSGGOG00000005863) Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.a.b.h ##22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.a.b.h ##22 Pan ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.a.b.h ##22 Chimpanzee MODERN SPECIES 22 C9H9orf85 (ENSPTRG00000021018) C9H9orf57 (ENSPTRG00000029245) GDA (ENSPTRG00000021020) ZFAND5 (ENSPTRG00000046315) TMC1 (ENSPTRG00000021022) ALDH1A1 (ENSPTRG00000021023) ANXA1 (ENSPTRG00000021024) RORB (ENSPTRG00000021025) TRPM6 (ENSPTRG00000021026) C9H9orf40 (ENSPTRG00000021027) CARNMT1 (ENSPTRG00000021028) NMRK1 (ENSPTRG00000021030) OSTF1 (ENSPTRG00000021031) PCSK5 (ENSPTRG00000021033) RFK (ENSPTRG00000021036) ENSPTRG00000047373 ##22 GCNT1 (ENSPTRG00000043705) PRUNE2 (ENSPTRG00000021038) FOXB2 (ENSPTRG00000029242) VPS13A (ENSPTRG00000021041) GNA14 (ENSPTRG00000021042) ENSPTRG00000050740 GNAQ (ENSPTRG00000021043) ENSPTRG00000048739 ENSPTRG00000049362 CEP78 (ENSPTRG00000021044) PSAT1 (ENSPTRG00000021045) TLE4 (ENSPTRG00000021047) TLE1 (ENSPTRG00000021048) ENSPTRG00000043940 ENSPTRG00000050795 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00910000148110 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.a.b ##22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a.l ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 ENSGT00950000182802.B.a.a.a.a.h.a.b.b ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00390000013814.e.a ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 414 ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT00550000075117 ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.a.b ##22 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1604 ACVR2B (ENSRROG00000037079) EXOG (ENSRROG00000045132) SCN5A (ENSRROG00000029726) SCN10A (ENSRROG00000002301) SCN11A (ENSRROG00000041360) WDR48 (ENSRROG00000029632) GORASP1 (ENSRROG00000045102) TTC21A (ENSRROG00000031487) CSRNP1 (ENSRROG00000004209) XIRP1 (ENSRROG00000040361) CX3CR1 (ENSRROG00000038595) SLC25A38 (ENSRROG00000045100) ENSRROG00000039282 ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00910000148110 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.a.b ##22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a.l ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 ENSGT00950000182802.B.a.a.a.a.h.a.b.b ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00390000013814.e.a ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 Vervet Monkey MODERN SPECIES 203 F9 (ENSCSAG00000007436) MCF2 (ENSCSAG00000007411) ATP11C (ENSCSAG00000007354) CXorf66 (ENSCSAG00000007334) SOX3 (ENSCSAG00000000291) ENSCSAG00000000290 LDOC1 (ENSCSAG00000000289) ENSCSAG00000007328 MAGEC1 (ENSCSAG00000007324) ENSCSAG00000007320 MAGEC2 (ENSCSAG00000000288) SPANXN4 (ENSCSAG00000007309) ENSCSAG00000007303 SLITRK4 (ENSCSAG00000000287) ENSCSAG00000007297 ENSCSAG00000000286 ##22 ENSCSAG00000000285 ENSCSAG00000007290 SLITRK2 (ENSCSAG00000000284) ENSCSAG00000000283 FMR1 (ENSCSAG00000007281) FMR1NB (ENSCSAG00000007271) AFF2 (ENSCSAG00000007248) IDS (ENSCSAG00000007199) MAGEA11 (ENSCSAG00000007193) TMEM185A (ENSCSAG00000007189) ENSCSAG00000007182 ENSCSAG00000000282 MAGEA8 (ENSCSAG00000000530) ENSCSAG00000007176 MAMLD1 (ENSCSAG00000007173) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00910000148110 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.a.b ##22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a.l ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 ENSGT00950000182802.B.a.a.a.a.h.a.b.b ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00390000013814.e.a ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.a.b ##22 Olive baboon MODERN SPECIES 387 ENSPANG00000046249 ##22 Macaca ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000162395 ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.a.b ##22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00860000135889 ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a.l ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00390000013814.e.a ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 563 SLC22A13 (ENSMNEG00000037730) SLC22A14 (ENSMNEG00000042853) XYLB (ENSMNEG00000037396) ACVR2B (ENSMNEG00000033690) EXOG (ENSMNEG00000023586) SCN5A (ENSMNEG00000020729) SCN10A (ENSMNEG00000031508) SCN11A (ENSMNEG00000030032) WDR48 (ENSMNEG00000033674) GORASP1 (ENSMNEG00000027322) TTC21A (ENSMNEG00000015306) CSRNP1 (ENSMNEG00000031549) XIRP1 (ENSMNEG00000042399) CX3CR1 (ENSMNEG00000031389) SLC25A38 (ENSMNEG00000045443) ENSMNEG00000040773 ##22 MOBP (ENSMNEG00000035090) ENSMNEG00000029767 MYRIP (ENSMNEG00000038911) EIF1B (ENSMNEG00000032776) ENTPD3 (ENSMNEG00000030360) ENSMNEG00000038053 ZNF619 (ENSMNEG00000040523) ZNF620 (ENSMNEG00000030493) ZNF621 (ENSMNEG00000037343) CTNNB1 (ENSMNEG00000004934) ULK4 (ENSMNEG00000038315) ENSMNEG00000033555 TRAK1 (ENSMNEG00000036297) CCK (ENSMNEG00000040525) LYZL4 (ENSMNEG00000030727) Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000162395 ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.a.b ##22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00860000135889 ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a.l ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B Rhesus MODERN SPECIES 11 SLC22A13 (ENSMMUG00000006480) SLC22A14 (ENSMMUG00000004842) XYLB (ENSMMUG00000004847) ACVR2B (ENSMMUG00000018790) EXOG (ENSMMUG00000018792) SCN5A (ENSMMUG00000015825) SCN10A (ENSMMUG00000015827) SCN11A (ENSMMUG00000019962) WDR48 (ENSMMUG00000020138) GORASP1 (ENSMMUG00000020144) TTC21A (ENSMMUG00000020145) CSRNP1 (ENSMMUG00000020147) CX3CR1 (ENSMMUG00000065286) CCR8 (ENSMMUG00000022962) SLC25A38 (ENSMMUG00000022963) RPSA (ENSMMUG00000022965) ##22 MOBP (ENSMMUG00000051408) MOBP (ENSMMUG00000009197) MYRIP (ENSMMUG00000017701) EIF1B (ENSMMUG00000058393) ENTPD3 (ENSMMUG00000013330) ENSMMUG00000063637 ZNF619 (ENSMMUG00000009437) ZNF620 (ENSMMUG00000015955) ZNF621 (ENSMMUG00000039060) CTNNB1 (ENSMMUG00000014627) ULK4 (ENSMMUG00000001074) ENSMMUG00000052672 ENSMMUG00000055812 TRAK1 (ENSMMUG00000001075) CCK (ENSMMUG00000001077) Crab-eating macaque MODERN SPECIES 11 XYLB (ENSMFAG00000001309) ACVR2B (ENSMFAG00000041141) EXOG (ENSMFAG00000040794) SCN5A (ENSMFAG00000041381) SCN10A (ENSMFAG00000002008) SCN11A (ENSMFAG00000041137) WDR48 (ENSMFAG00000041723) GORASP1 (ENSMFAG00000000701) TTC21A (ENSMFAG00000045979) CSRNP1 (ENSMFAG00000001132) ENSMFAG00000031636 ENSMFAG00000047665 CX3CR1 (ENSMFAG00000044029) CCR8 (ENSMFAG00000056610) SLC25A38 (ENSMFAG00000003708) ENSMFAG00000001626 ##22 ENSMFAG00000002191 ENSMFAG00000032704 ENSMFAG00000051814 MOBP (ENSMFAG00000041121) ENSMFAG00000062648 MYRIP (ENSMFAG00000027633) EIF1B (ENSMFAG00000037264) ENTPD3 (ENSMFAG00000004057) RPL14 (ENSMFAG00000055324) ZNF619 (ENSMFAG00000042383) ZNF620 (ENSMFAG00000055415) ZNF621 (ENSMFAG00000045772) CTNNB1 (ENSMFAG00000034131) ULK4 (ENSMFAG00000029259) TRAK1 (ENSMFAG00000033301) Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.b ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.b ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.b ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.b ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.b ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.b ##22 Olive baboon DUPLICATION Olive baboon MODERN SPECIES 17 ENSPANG00000039025 OR10G3 (ENSPANG00000022541) ENSPANG00000048072 TRAV1-1 (ENSPANG00000033912) OR4E2 (ENSPANG00000007302) OR4E1 (ENSPANG00000029455) TRAV2 (ENSPANG00000020008) TRAV3 (ENSPANG00000035847) TRAV4 (ENSPANG00000039983) TRAV5 (ENSPANG00000042056) ENSPANG00000031341 ENSPANG00000039148 ENSPANG00000033138 ENSPANG00000048988 ENSPANG00000047186 ENSPANG00000024501 ##22 ENSPANG00000035324 ENSPANG00000033337 ENSPANG00000047892 ENSPANG00000043634 ENSPANG00000049026 ENSPANG00000035221 ENSPANG00000049883 ENSPANG00000022756 ENSPANG00000005897 TRAV16 (ENSPANG00000021103) TRAV17 (ENSPANG00000020828) ENSPANG00000049015 ENSPANG00000043702 TRAV19 (ENSPANG00000040832) TRAV20 (ENSPANG00000034259) Olive baboon MODERN SPECIES 6 ENSPANG00000040944 GPC6 (ENSPANG00000029836) GPC5 (ENSPANG00000004995) ENSPANG00000038257 ENSPANG00000047478 ENSPANG00000044812 SLITRK5 (ENSPANG00000012750) SLITRK6 (ENSPANG00000013285) ENSPANG00000037928 SLITRK1 (ENSPANG00000006605) ENSPANG00000031941 ENSPANG00000041737 ENSPANG00000038720 ENSPANG00000049415 ENSPANG00000037096 ENSPANG00000049934 ##22 SPRY2 (ENSPANG00000024849) NDFIP2 (ENSPANG00000002389) RBM26 (ENSPANG00000012979) ENSPANG00000037860 OBI1 (ENSPANG00000015545) EDNRB (ENSPANG00000009470) SLAIN1 (ENSPANG00000006284) ENSPANG00000038962 SCEL (ENSPANG00000022423) ENSPANG00000042841 MYCBP2 (ENSPANG00000016436) FBXL3 (ENSPANG00000016434) CLN5 (ENSPANG00000009178) ACOD1 (ENSPANG00000010191) ENSPANG00000046308 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.b ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.b ##22 Cercopithecidae DUPLICATION Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.b.a ##22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.b.a ##22 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 193 ITGA9 (ENSRBIG00000035691) ENSRBIG00000037793 ##22 ENSRBIG00000033074 GOLGA4 (ENSRBIG00000044412) LRRFIP2 (ENSRBIG00000044613) MLH1 (ENSRBIG00000027553) EPM2AIP1 (ENSRBIG00000000049) ENSRBIG00000032694 TRANK1 (ENSRBIG00000012281) ENSRBIG00000040212 DCLK3 (ENSRBIG00000040365) AHSG (ENSRBIG00000014111) HRG (ENSRBIG00000003805) DNAJB11 (ENSRBIG00000032036) TBCCD1 (ENSRBIG00000017865) CRYGS (ENSRBIG00000025674) DGKG (ENSRBIG00000033670) Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.b.a ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.b.a ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00910000148110 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 ENSGT00950000183099.v ##22 ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.b.a ##22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a.l ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 ENSGT00950000182802.B.a.a.a.a.h.a.b.b ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00390000013814.e.a ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 52 ENSGT00940000156519.l ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00910000148110 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT00550000075117 ENSGT00950000183099.v ##22 ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.b.a ##22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00860000135889 ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a.l ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 ENSGT00950000182802.B.a.a.a.a.h.a.a.a.b.c.b ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00390000013814.e.a ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 Sooty mangabey MODERN SPECIES 424 XYLB (ENSCATG00000038970) ENSCATG00000025186 ACVR2B (ENSCATG00000037591) EXOG (ENSCATG00000017315) SCN5A (ENSCATG00000002865) SCN10A (ENSCATG00000032675) SCN11A (ENSCATG00000040001) WDR48 (ENSCATG00000045029) GORASP1 (ENSCATG00000013339) TTC21A (ENSCATG00000034534) CSRNP1 (ENSCATG00000038472) XIRP1 (ENSCATG00000037191) ENSCATG00000033746 CX3CR1 (ENSCATG00000042830) SLC25A38 (ENSCATG00000038468) ENSCATG00000041148 ##22 ENSCATG00000038673 MOBP (ENSCATG00000043744) ENSCATG00000045324 MYRIP (ENSCATG00000044732) EIF1B (ENSCATG00000016704) ENTPD3 (ENSCATG00000033407) ENSCATG00000036366 ZNF619 (ENSCATG00000037332) ZNF620 (ENSCATG00000038256) ZNF621 (ENSCATG00000035141) ENSCATG00000030388 CTNNB1 (ENSCATG00000034464) ULK4 (ENSCATG00000040249) ENSCATG00000031373 TRAK1 (ENSCATG00000020319) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.b.b ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.b.b ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.b.b ##22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.b.b ##22 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.b.b ##22 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 15 SCARB2 (ENSMFAG00000039184) NUP54 (ENSMFAG00000031205) ART3 (ENSMFAG00000040258) CXCL11 (ENSMFAG00000045313) CXCL10 (ENSMFAG00000064155) CXCL9 (ENSMFAG00000039917) SDAD1 (ENSMFAG00000038793) ENSMFAG00000044646 NAAA (ENSMFAG00000041803) PPEF2 (ENSMFAG00000045101) USO1 (ENSMFAG00000037889) G3BP2 (ENSMFAG00000044717) CDKL2 (ENSMFAG00000043830) THAP6 (ENSMFAG00000045214) RCHY1 (ENSMFAG00000036832) ENSMFAG00000041116 ##22 PARM1 (ENSMFAG00000042667) BTC (ENSMFAG00000041065) AREG (ENSMFAG00000039089) EREG (ENSMFAG00000052508) EPGN (ENSMFAG00000033022) MTHFD2L (ENSMFAG00000036503) ENSMFAG00000044905 CXCL5 (ENSMFAG00000002889) PPBP (ENSMFAG00000031461) PF4 (ENSMFAG00000055984) ENSMFAG00000065742 CXCL1 (ENSMFAG00000035439) PF4V1 (ENSMFAG00000003796) CXCL6 (ENSMFAG00000044943) CXCL8 (ENSMFAG00000001622) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.b.b ##22 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 339 GPC3 (ENSRBIG00000030549) ENSRBIG00000034442 ##22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.b ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.b ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.b ##22 Gorilla MODERN SPECIES 4 SLC25A15 (ENSGGOG00000025261) MRPS31 (ENSGGOG00000006468) ENSGGOG00000037880 FOXO1 (ENSGGOG00000008104) ENSGGOG00000040044 COG6 (ENSGGOG00000034837) LHFPL6 (ENSGGOG00000011641) ENSGGOG00000022722 ENSGGOG00000043703 PROSER1 (ENSGGOG00000003830) STOML3 (ENSGGOG00000011813) ENSGGOG00000023208 ENSGGOG00000026214 TRPC4 (ENSGGOG00000007142) POSTN (ENSGGOG00000006685) ENSGGOG00000023061 ##22 CSNK1A1L (ENSGGOG00000000169) SUPT20H (ENSGGOG00000011916) EXOSC8 (ENSGGOG00000011902) ALG5 (ENSGGOG00000003094) ENSGGOG00000037488 ENSGGOG00000040246 SMAD9 (ENSGGOG00000001017) RFXAP (ENSGGOG00000025564) SERTM1 (ENSGGOG00000040932) CCNA1 (ENSGGOG00000025062) SPART (ENSGGOG00000014695) SOHLH2 (ENSGGOG00000002130) DCLK1 (ENSGGOG00000006447) MAB21L1 (ENSGGOG00000011768) ENSGGOG00000037758 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.b ##22 Mas night monkey MODERN SPECIES 536 APOD (ENSANAG00000009862) ENSANAG00000024715 ACAP2 (ENSANAG00000032741) XXYLT1 (ENSANAG00000022628) FAM43A (ENSANAG00000031394) LSG1 (ENSANAG00000021153) TMEM44 (ENSANAG00000032076) ENSANAG00000029062 ##22 ENSANAG00000020868 ENSANAG00000025365 ATP13A3 (ENSANAG00000001727) GP5 (ENSANAG00000021224) LRRC15 (ENSANAG00000028624) HES1 (ENSANAG00000019249) ENSANAG00000021266 ENSANAG00000029173 ATP13A4 (ENSANAG00000023937) ATP13A5 (ENSANAG00000026333) PLAAT1 (ENSANAG00000031574) MB21D2 (ENSANAG00000037636) FGF12 (ENSANAG00000019853) ENSANAG00000032688 CCDC50 (ENSANAG00000037574) Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.j ##22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.j ##22 Mas night monkey MODERN SPECIES 624 AQP8 (ENSANAG00000036284) ZKSCAN2 (ENSANAG00000033908) HS3ST4 (ENSANAG00000030250) KDM8 (ENSANAG00000023269) NSMCE1 (ENSANAG00000030899) IL4R (ENSANAG00000003183) IL21R (ENSANAG00000032742) GTF3C1 (ENSANAG00000037090) KATNIP (ENSANAG00000033504) GSG1L (ENSANAG00000029256) XPO6 (ENSANAG00000031761) SBK1 (ENSANAG00000024806) LAT (ENSANAG00000022885) SPNS1 (ENSANAG00000030997) NFATC2IP (ENSANAG00000031935) ENSANAG00000027734 ##22 CD19 (ENSANAG00000035227) RABEP2 (ENSANAG00000035928) ATP2A1 (ENSANAG00000037955) SH2B1 (ENSANAG00000034202) TUFM (ENSANAG00000022206) ATXN2L (ENSANAG00000026257) ENSANAG00000002300 ENSANAG00000024051 #36 ENSANAG00000020640 CLN3 (ENSANAG00000032278) ENSANAG00000036908 APOBR (ENSANAG00000037115) IL27 (ENSANAG00000034309) NUPR1 (ENSANAG00000036925) ENSANAG00000037641 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.j ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.j ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.j ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.j ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.j ##22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.j ##22 Sooty mangabey MODERN SPECIES 238 SHISAL2A (ENSCATG00000010987) COA7 (ENSCATG00000039378) ZYG11B (ENSCATG00000030211) ZYG11A (ENSCATG00000034674) ECHDC2 (ENSCATG00000033784) SCP2 (ENSCATG00000036529) PODN (ENSCATG00000042739) SLC1A7 (ENSCATG00000036353) CPT2 (ENSCATG00000043875) ENSCATG00000030412 CZIB (ENSCATG00000036818) MAGOH (ENSCATG00000015443) LRP8 (ENSCATG00000021965) DMRTB1 (ENSCATG00000041370) GLIS1 (ENSCATG00000040253) ENSCATG00000044750 ##22 NDC1 (ENSCATG00000044757) YIPF1 (ENSCATG00000040553) DIO1 (ENSCATG00000044073) IFT25 (ENSCATG00000040749) ENSCATG00000034850 ENSCATG00000038569 LDLRAD1 (ENSCATG00000019460) TMEM59 (ENSCATG00000031518) ENSCATG00000032208 TCEANC2 (ENSCATG00000042512) CDCP2 (ENSCATG00000039587) CYB5RL (ENSCATG00000038378) MRPL37 (ENSCATG00000044166) SSBP3 (ENSCATG00000038721) ACOT11 (ENSCATG00000044518) Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e ##22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e ##22 Suina ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e ##22 Pig DUPLICATION Pig MODERN SPECIES 8 ENSSSCG00000007124 ENSSSCG00000007125 CST9L (ENSSSCG00000029289) CST3 (ENSSSCG00000037360) SYNDIG1 (ENSSSCG00000007130) CST7 (ENSSSCG00000007131) APMAP (ENSSSCG00000036286) ACSS1 (ENSSSCG00000007133) VSX1 (ENSSSCG00000023887) ENTPD6 (ENSSSCG00000027070) PYGB (ENSSSCG00000022815) ABHD12 (ENSSSCG00000040449) GINS1 (ENSSSCG00000034913) ENSSSCG00000007135 NANP (ENSSSCG00000053479) ENSSSCG00000035283 ##22 ENSSSCG00000063198 ADRA1D (ENSSSCG00000007139) SMOX (ENSSSCG00000007140) RNF24 (ENSSSCG00000059435) PANK2 (ENSSSCG00000007142) ENSSSCG00000007143 AP5S1 (ENSSSCG00000033297) CDC25B (ENSSSCG00000007151) CENPB (ENSSSCG00000053890) SPEF1 (ENSSSCG00000007149) ADISSP (ENSSSCG00000035666) HSPA12B (ENSSSCG00000007147) SIGLEC1 (ENSSSCG00000007146) ADAM33 (ENSSSCG00000007145) GFRA4 (ENSSSCG00000021401) Pig MODERN SPECIES 5 TMEM26 (ENSSSCG00000023525) CABCOCO1 (ENSSSCG00000033268) ARID5B (ENSSSCG00000010219) RTKN2 (ENSSSCG00000039707) ENSSSCG00000010221 ZNF365 (ENSSSCG00000010222) ADO (ENSSSCG00000031360) EGR2 (ENSSSCG00000010224) NRBF2 (ENSSSCG00000024081) JMJD1C (ENSSSCG00000010226) REEP3 (ENSSSCG00000036476) CTNNA3 (ENSSSCG00000036480) LRRTM3 (ENSSSCG00000010232) ENSSSCG00000048396 DNAJC12 (ENSSSCG00000035600) ENSSSCG00000010234 ##22 SIRT1 (ENSSSCG00000010235) HERC4 (ENSSSCG00000038913) MYPN (ENSSSCG00000029311) ATOH7 (ENSSSCG00000021995) ENSSSCG00000049861 PBLD (ENSSSCG00000025876) HNRNPH3 (ENSSSCG00000010238) RUFY2 (ENSSSCG00000010239) DNA2 (ENSSSCG00000010240) SLC25A16 (ENSSSCG00000022303) TET1 (ENSSSCG00000010241) CCAR1 (ENSSSCG00000010243) STOX1 (ENSSSCG00000010245) DDX50 (ENSSSCG00000010246) DDX21 (ENSSSCG00000010247) Chacoan peccary MODERN SPECIES 104 ZNF507 (ENSCWAG00000001636) #34 TSHZ3 (ENSCWAG00000001647) #33 ENSCWAG00000001653 ZNF536 (ENSCWAG00000001663) #32 URI1 (ENSCWAG00000001670) #31 CCNE1 (ENSCWAG00000001690) #30 C19orf12 (ENSCWAG00000001799) #29 PLEKHF1 (ENSCWAG00000001825) #28 POP4 (ENSCWAG00000001837) #27 VSTM2B (ENSCWAG00000001853) #26 UQCRFS1 (ENSCWAG00000001869) #25 SHCBP1 (ENSCWAG00000001888) VPS35 (ENSCWAG00000001902) ORC6 (ENSCWAG00000001931) MYLK3 (ENSCWAG00000001954) ENSCWAG00000001992 ##22 ENSCWAG00000002014 GPT2 (ENSCWAG00000002047) DNAJA2 (ENSCWAG00000002085) NETO2 (ENSCWAG00000002107) ITFG1 (ENSCWAG00000002149) PHKB (ENSCWAG00000002211) ABCC12 (ENSCWAG00000002352) ABCC11 (ENSCWAG00000002486) ENSCWAG00000002578 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e ##22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e ##22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e ##22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e ##22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e ##22 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e ##22 Goat MODERN SPECIES 15 ENSCHIG00000022199 ENSCHIG00000024848 ENSCHIG00000011124 ENSCHIG00000010317 ENSCHIG00000018594 ENSCHIG00000010145 ENSCHIG00000009125 ENSCHIG00000008906 ENSCHIG00000017891 ENSCHIG00000006779 ENSCHIG00000025786 ENSCHIG00000007444 ZNF311 (ENSCHIG00000010646) ENSCHIG00000010766 TRIM27 (ENSCHIG00000009534) ENSCHIG00000021680 ##22 SCAND3 (ENSCHIG00000015015) ENSCHIG00000008544 GPX6 (ENSCHIG00000019401) ENSCHIG00000010922 ZSCAN12 (ENSCHIG00000020036) ZSCAN23 (ENSCHIG00000017885) ZSCAN31 (ENSCHIG00000012646) PGBD1 (ENSCHIG00000013808) ZSCAN26 (ENSCHIG00000013045) ZKSCAN4 (ENSCHIG00000012460) ENSCHIG00000010691 ZKSCAN8 (ENSCHIG00000015751) ZSCAN16 (ENSCHIG00000012295) ENSCHIG00000023679 ZNF165 (ENSCHIG00000010224) Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e ##22 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e ##22 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e ##22 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e ##22 Vaquita MODERN SPECIES 34 ENSPSNG00000016187 ENSPSNG00000016160 RAB9B (ENSPSNG00000016142) PLP1 (ENSPSNG00000015963) TMEM31 (ENSPSNG00000015906) ENSPSNG00000015772 MORF4L2 (ENSPSNG00000015721) ENSPSNG00000015620 TCEAL1 (ENSPSNG00000015582) ENSPSNG00000015549 ENSPSNG00000015517 ENSPSNG00000015091 ENSPSNG00000014916 ENSPSNG00000014889 ENSPSNG00000014680 ENSPSNG00000014607 ##22 BEX4 (ENSPSNG00000014586) TCEAL8 (ENSPSNG00000014535) ENSPSNG00000014506 ENSPSNG00000014458 TCEAL7 (ENSPSNG00000014429) TCEAL9 (ENSPSNG00000014405) ENSPSNG00000014368 ENSPSNG00000014271 ENSPSNG00000014213 GPRASP1 (ENSPSNG00000013972) GPRASP2 (ENSPSNG00000013910) ENSPSNG00000013476 ENSPSNG00000020476 BEX5 (ENSPSNG00000020449) ENSPSNG00000020413 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a #22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a #22 Armadillo DUPLICATION Armadillo MODERN SPECIES 4594 WSCD1 (ENSDNOG00000019657) NLRP1 (ENSDNOG00000018344) ENSDNOG00000032685 MIS12 (ENSDNOG00000010190) DERL2 (ENSDNOG00000047873) DHX33 (ENSDNOG00000016865) C1QBP (ENSDNOG00000008887) RPAIN (ENSDNOG00000008870) NUP88 (ENSDNOG00000008839) RABEP1 (ENSDNOG00000008796) SCIMP (ENSDNOG00000035239) ENSDNOG00000030878 ENSDNOG00000031141 ENSDNOG00000008737 ENSDNOG00000044874 #22 Armadillo MODERN SPECIES 2064 NPAS4 (ENSDNOG00000042408) ENSDNOG00000035632 #22 MRPL11 (ENSDNOG00000037861) PELI3 (ENSDNOG00000010056) DPP3 (ENSDNOG00000010071) BBS1 (ENSDNOG00000025752) ZDHHC24 (ENSDNOG00000042392) ACTN3 (ENSDNOG00000017355) CTSF (ENSDNOG00000009351) CCS (ENSDNOG00000034796) RBM14 (ENSDNOG00000043225) RBM4 (ENSDNOG00000032390) ENSDNOG00000019500 SPTBN2 (ENSDNOG00000012546) Armadillo MODERN SPECIES 1291 WASF2 (ENSDNOG00000034536) AHDC1 (ENSDNOG00000038844) FGR (ENSDNOG00000014797) ENSDNOG00000034433 FAM76A (ENSDNOG00000049213) STX12 (ENSDNOG00000049359) PPP1R8 (ENSDNOG00000033057) THEMIS2 (ENSDNOG00000013968) RPA2 (ENSDNOG00000023660) SMPDL3B (ENSDNOG00000032579) XKR8 (ENSDNOG00000032960) EYA3 (ENSDNOG00000044648) PTAFR (ENSDNOG00000044017) ENSDNOG00000042785 ENSDNOG00000045464 ENSDNOG00000038753 #22 SESN2 (ENSDNOG00000017933) MED18 (ENSDNOG00000012531) ENSDNOG00000035347 PHACTR4 (ENSDNOG00000003784) RCC1 (ENSDNOG00000042718) ENSDNOG00000033009 RAB42 (ENSDNOG00000010079) TAF12 (ENSDNOG00000045864) GMEB1 (ENSDNOG00000025258) YTHDF2 (ENSDNOG00000033903) OPRD1 (ENSDNOG00000046525) EPB41 (ENSDNOG00000019472) TMEM200B (ENSDNOG00000035804) SRSF4 (ENSDNOG00000047961) MECR (ENSDNOG00000048252) Marsupialia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a #22 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a #22 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a #22 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a #22 koala MODERN SPECIES 358 ENSPCIG00000005588 #22 PFKFB1 (ENSPCIG00000019925) ENSPCIG00000035474 ENSPCIG00000015766 ENSPCIG00000010545 CLCN5 (ENSPCIG00000010553) ENSPCIG00000003946 ENSPCIG00000030723 ENSPCIG00000010572 ENSPCIG00000010580 ENSPCIG00000012986 ENSPCIG00000019707 PHKA1 (ENSPCIG00000019704) ENSPCIG00000026723 NHSL2 (ENSPCIG00000026981) PIN4 (ENSPCIG00000026976)