Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 455 ENSGT00390000017673.b ENSGT00640000091519 ENSGT00530000064086 #19 ENSGT00940000155632 #20 ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099 #22 ENSGT00940000155858 ENSGT00390000000159 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 445 ENSGT01050000244824.G ENSGT00390000017673.b ENSGT00640000091519 ENSGT00530000064086 #19 ENSGT00940000155632 #20 ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099 #22 ENSGT00940000155858 ENSGT00390000000159 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 402 ENSGT01050000244824.G ENSGT00390000017673.b ENSGT00640000091519 ENSGT00530000064086 #19 ENSGT00940000155632 #20 ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099 #22 ENSGT00390000000159 ENSGT00940000155858 Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 427 ENSGT00530000064086 #19 ENSGT00940000155632 #20 ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099 #22 ENSGT00390000000159 ENSGT00940000155858 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT01040000240732 ENSGT00940000159311.d.a.a #16 ENSGT00940000154912 #17 ENSGT00940000165172.a #18 ENSGT00530000064086 #19 ENSGT00940000155632.o #20 ENSGT00550000075117.m.b #21 ENSGT00950000183099 #22 ENSGT00390000000159 ENSGT00940000155858.f ENSGT00940000155159.C ENSGT00440000038745.a.a.b ENSGT00530000063599.A ENSGT00530000063753.A.b ENSGT00940000178527 ENSGT00440000038745.a.a.a ENSGT00530000063753.A.a ENSGT00530000063753.B ENSGT00940000153882.a.b.a ENSGT00940000158772.b ENSGT00940000154272.B.b ENSGT00940000155738 ENSGT00390000007779 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT01030000234559.a.a.b.a.a.b #8 ENSGT00940000159979.a.a #9 ENSGT00940000158718.a.b #10 ENSGT00390000000976 #11 ENSGT00950000183036.b.f #12 ENSGT00940000168611 ENSGT00940000154990.fb.b #14 ENSGT00530000063861.a ENSGT00940000156166.b.a.a #15 ENSGT00940000159311.d.a.a #16 ENSGT00940000154912.u.b #17 ENSGT00940000165172.a #18 ENSGT00530000064086 #19 ENSGT00940000155632.o #20 ENSGT00550000075117.m.b #21 ENSGT00950000183099 #22 ENSGT00940000155858.e ENSGT00390000012267 ENSGT00940000160152 ENSGT00940000161195.a.a 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ENSGT00410000025739.c.b ENSGT00940000157016 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00390000006387 ENSGT00940000156719 #7 ENSGT01030000234559.a.a.b.a.a.b #8 ENSGT00390000000976.d.b #11 ENSGT00940000168611 ENSGT00940000154990.fb.b #14 ENSGT00940000177829 ENSGT00530000063861.a ENSGT00940000156166.b.a.a #15 ENSGT00940000159311.d.a.a #16 ENSGT00940000154912.u.b #17 ENSGT00940000165172.a #18 ENSGT00530000064086 #19 ENSGT00940000155632.o #20 ENSGT00550000075117.m.b #21 ENSGT00950000183099 #22 ENSGT00940000155858.e ENSGT00390000012267 ENSGT00940000160152 ENSGT00940000161195.a.a ENSGT00950000183144.B ENSGT00940000157700.d ENSGT00530000063000.a.a.b.i ENSGT00940000156887.a ENSGT00940000154819.a.b.c.a ENSGT00390000005605 ENSGT00390000005584 ENSGT01050000244887.A.a.a.a.j ENSGT00940000157140.b.b.b ENSGT00940000165343.c.b ENSGT00390000012436.g Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000158718.a.b #10 ENSGT00390000000976.d.b #11 ENSGT00950000183036.b.f #12 ENSGT00940000168611 ENSGT00940000154990.fb.b #14 ENSGT00940000177829 ENSGT00530000063861.a ENSGT00940000156166.b.a.a #15 ENSGT01040000241154 ENSGT00940000159311.d.a.a #16 ENSGT00940000154912.u.b #17 ENSGT00940000165172.a #18 ENSGT00530000064086 #19 ENSGT00940000155632.o #20 ENSGT00550000075117.m.b #21 ENSGT00950000183099 #22 ENSGT00940000155858.e ENSGT00390000012267 ENSGT00940000160152 ENSGT00940000161195.a.a ENSGT00950000183144.B ENSGT00940000157700.d ENSGT00530000063000.a.a.b.i ENSGT00940000156887.a ENSGT00940000154819.a.b.c.a ENSGT00390000005605 ENSGT00390000005584 ENSGT01050000244887.A.a.a.a.j ENSGT00940000157140.b.b.b ENSGT00940000165343.c.b ENSGT00390000012436.g Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000158718.b ##10 ENSGT00940000159979.b ##9 ENSGT00940000158718.a.b #10 ENSGT00390000000976.d.b #11 ENSGT00950000183036.b.f #12 ENSGT00940000168611 ENSGT00940000154990.fb.b #14 ENSGT00530000063861.a ENSGT00940000156166.b.a.a #15 ENSGT00940000159311.d.a.a #16 ENSGT00940000154912.u.b #17 ENSGT00940000165172.a #18 ENSGT00530000064086 #19 ENSGT00940000155632.o #20 ENSGT00550000075117.m.b #21 ENSGT00950000183099 #22 ENSGT00940000155858.e ENSGT00390000012267 ENSGT00940000160152 ENSGT00940000161195.a.a ENSGT00950000183144.B ENSGT00940000157700.d ENSGT00530000063000.a.a.b.i ENSGT00940000156887.a ENSGT00940000154819.a.b.c.a ENSGT00390000005605 ENSGT00390000005584 ENSGT01050000244887.A.a.a.a.j ENSGT00940000157140.b.b.b ENSGT00940000165343.c.b ENSGT00390000012436.g Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000183036.b.f #12 ENSGT00940000168611 ENSGT00940000177182 ENSGT01100000263705 #13 ENSGT00940000154990.fb.b #14 ENSGT00940000177829 ENSGT00530000063861.a ENSGT00940000156166.b.a.a #15 ENSGT01040000241154 ENSGT00940000159311.d.a.a #16 ENSGT00940000154912.u.b #17 ENSGT00940000165172.a #18 ENSGT00530000064086 #19 ENSGT00940000155632.o #20 ENSGT00550000075117.m.b #21 ENSGT00950000183099 #22 ENSGT00940000155858.e ENSGT00390000012267 ENSGT00940000160152 ENSGT00940000161195.a.a ENSGT00950000183144.B ENSGT00940000157700.d ENSGT00530000063000.a.a.b.i ENSGT00940000156887.a ENSGT00940000154819.a.b.c.a ENSGT00390000005605 ENSGT00390000005584 ENSGT01050000244887.A.a.a.a.j ENSGT00940000157140.b.b.b ENSGT00940000165343.c.b ENSGT00390000012436.g Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183036.b.f #12 ENSGT00940000168611 ENSGT00940000177182 ENSGT01100000263705 #13 ENSGT00940000154990.fb.b #14 ENSGT00940000177829 ENSGT00530000063861.a ENSGT00940000156166.b.a.a #15 ENSGT01040000241154 ENSGT00940000159311.d.a.a #16 ENSGT00940000154912.u.b #17 ENSGT00940000165172.a #18 ENSGT00530000064086 #19 ENSGT00940000155632.o #20 ENSGT00550000075117.m.b #21 ENSGT00950000183099 #22 ENSGT00940000155858.e ENSGT00390000012267 ENSGT00940000160152 ENSGT00940000161195.a.a ENSGT00950000183144.B ENSGT00940000157700.d ENSGT00530000063000.a.a.b.i ENSGT00940000156887.a ENSGT00940000154819.a.b.c.a ENSGT00390000005605 ENSGT00390000005584 ENSGT01050000244887.A.a.a.a.j ENSGT00940000157140.b.b.b ENSGT00940000165343.c.b ENSGT00390000012436.g Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000000976.d.b #11 ENSGT00950000183036.b.f #12 ENSGT00940000168611 ENSGT00940000177182 ENSGT01100000263705 #13 ENSGT00940000154990.fb.b #14 ENSGT00940000177829 ENSGT00530000063861.a ENSGT00940000156166.b.a.a #15 ENSGT00940000159311.d.a.a #16 ENSGT00940000154912.u.b #17 ENSGT00940000165172.a #18 ENSGT00530000064086 #19 ENSGT00940000155632.o #20 ENSGT00550000075117.m.b #21 ENSGT00950000183099 #22 ENSGT00940000155858.e ENSGT00390000012267 ENSGT00940000160152 ENSGT00940000161195.a.a ENSGT00950000183144.B ENSGT00940000157700.d ENSGT00530000063000.a.a.b.i ENSGT00940000156887.a ENSGT00940000154819.a.b.c.a ENSGT00390000005605 ENSGT00390000005584 ENSGT01050000244887.A.a.a.a.j ENSGT00940000157140.b.b.b ENSGT00940000165343.c.b ENSGT00390000012436.g Carangaria ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000158718.a.b #10 ENSGT00390000000976.d.b #11 ENSGT00950000183036.b.f #12 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ENSSLDG00000018052 #32 GPRC5D (ENSSLDG00000018073) #33 ENSSLDG00000018078 #34 mgp (ENSSLDG00000018100) #35 ENSSLDG00000018109 #36 PLEKHF1 (ENSSLDG00000018119) #37 wbp11 (ENSSLDG00000018127) Barramundi perch MODERN SPECIES 138 ptger1b (ENSLCAG00010016503) #8 ENSLCAG00010016504 #9 ENSLCAG00010016508 #9 pglyrp6 (ENSLCAG00010016510) #10 trappc5 (ENSLCAG00010016517) #11 MCOLN1 (ENSLCAG00010016537) #12 ENSLCAG00010016553 pkn1b (ENSLCAG00010016723) #14 ENSLCAG00010017331 #15 ENSLCAG00010017334 DDX39A (ENSLCAG00010017350) #17 ENSLCAG00010017382 #18 txn2 (ENSLCAG00010017386) #19 MYH9 (ENSLCAG00010017682) #20 slc25a38a (ENSLCAG00010019948) #21 rpsa (ENSLCAG00010019953) #22 ubn2b (ENSLCAG00010019976) trir (ENSLCAG00010019994) hook2 (ENSLCAG00010020100) junbb (ENSLCAG00010020403) rtbdn (ENSLCAG00010020407) MAST1 (ENSLCAG00010020419) ATG4D (ENSLCAG00010020427) ENSLCAG00010020430 smarca4a (ENSLCAG00010020479) ldlra (ENSLCAG00010020566) kri1 (ENSLCAG00010020932) spc24 (ENSLCAG00010020940) s1pr5a 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ENSGT00940000155858.e ENSGT00390000012267 ENSGT00940000160152 ENSGT00940000161195.a.a ENSGT00950000183144.B ENSGT00940000157700.d ENSGT00530000063000.a.a.b.i ENSGT00940000156887.a ENSGT00940000154819.a.b.c.a ENSGT00390000005605 ENSGT00390000005584 ENSGT01050000244887.A.a.a.a.j ENSGT00940000157140.b.b.b ENSGT00940000165343.c.b ENSGT00390000012436.g Climbing perch MODERN SPECIES 21 ENSATEG00000012527 #9 ENSATEG00000012515 #11 pglyrp6 (ENSATEG00000012499) #10 ENSATEG00000012430 #12 ENSATEG00000012403 ENSATEG00000029121 #13 pkn1b (ENSATEG00000012314) #14 ENSATEG00000012283 ENSATEG00000012271 #15 ENSATEG00000012098 #16 ENSATEG00000027489 #17 ENSATEG00000012040 #18 ENSATEG00000026238 #19 ENSATEG00000011896 #20 ENSATEG00000011864 #21 ENSATEG00000011829 #22 ubn2b (ENSATEG00000011798) trir (ENSATEG00000011822) hook2 (ENSATEG00000011779) junbb (ENSATEG00000026800) ENSATEG00000028219 MAST1 (ENSATEG00000011656) ENSATEG00000011639 smarca4a (ENSATEG00000011524) ENSATEG00000011473 ldlra 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ENSBSLG00000007547 Zig-zag eel MODERN SPECIES 22 pglyrp6 (ENSMAMG00000010527) #10 ENSMAMG00000010523 #11 ENSMAMG00000010474 #12 ENSMAMG00000010448 pkn1b (ENSMAMG00000010409) #14 ENSMAMG00000026048 ENSMAMG00000010390 ENSMAMG00000026146 ENSMAMG00000027988 ENSMAMG00000024601 ENSMAMG00000009916 #17 ENSMAMG00000009908 #18 ENSMAMG00000009898 #19 ENSMAMG00000009822 #20 ENSMAMG00000009813 #21 ENSMAMG00000009789 #22 trir (ENSMAMG00000009782) ubn2b (ENSMAMG00000009736) hook2 (ENSMAMG00000009671) junbb (ENSMAMG00000025546) rtbdn (ENSMAMG00000009461) MAST1 (ENSMAMG00000009392) ENSMAMG00000009380 ENSMAMG00000009256 ENSMAMG00000009228 fam234b (ENSMAMG00000009213) ENSMAMG00000009151 rrp7a (ENSMAMG00000009125) wbp2nl (ENSMAMG00000009102) #23 ENSMAMG00000009094 #24 ENSMAMG00000028475 #25 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000159979.a.a #9 ENSGT00940000158718.a.b #10 ENSGT00390000000976.d.b #11 ENSGT00950000183036.b.f #12 ENSGT00940000177182 ENSGT00940000168611 ENSGT00940000154990.fb.b #14 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#20 ENSGT00550000075117.m.b #21 ENSGT00950000183099 #22 ENSGT00940000155858.e ENSGT00390000012267 ENSGT00940000160152 ENSGT00940000161195.a.a ENSGT00950000183144.B ENSGT00940000157700.d ENSGT00530000063000.a.a.b.i ENSGT00940000156887.a ENSGT00940000154819.a.b.c.a ENSGT00390000005605 ENSGT00390000005584 ENSGT01050000244887.A.a.a.a.j ENSGT00940000157140.b.b.b ENSGT00940000165343.c.b ENSGT00390000012436.g European seabass MODERN SPECIES 21 ilf3b (ENSDLAG00005017728) #7 ptger1b (ENSDLAG00005017951) #8 ENSDLAG00005017956 #9 pglyrp6 (ENSDLAG00005017983) #10 ENSDLAG00005017994 #11 ENSDLAG00005018028 #12 ENSDLAG00005018854 pkn1b (ENSDLAG00005018963) #14 ENSDLAG00005029706 ENSDLAG00005022163 #15 ENSDLAG00005022168 #16 ENSDLAG00005022175 #17 ENSDLAG00005022196 #18 ENSDLAG00005022198 #19 ENSDLAG00005022268 #20 ENSDLAG00005033984 #22 ubn2b (ENSDLAG00005024137) trir (ENSDLAG00005030948) hook2 (ENSDLAG00005024232) junbb (ENSDLAG00005024718) rtbdn (ENSDLAG00005029809) MAST1 (ENSDLAG00005024754) 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ENSGT00940000154990.fb.b #14 ENSGT00530000063861.a ENSGT00940000156166.b.a.a #15 ENSGT01040000241154 ENSGT00940000159311.d.a.a #16 ENSGT00940000154912.u.b #17 ENSGT00940000165172.a #18 ENSGT00530000064086 #19 ENSGT00940000155632.o #20 ENSGT00550000075117.m.b #21 ENSGT00950000183099 #22 ENSGT00940000155858.e ENSGT00390000012267 ENSGT00940000160152 ENSGT00940000161195.a.a ENSGT00950000183144.B ENSGT00940000157700.d ENSGT00530000063000.a.a.b.i ENSGT00940000156887.a ENSGT00940000177737 ENSGT00940000154819.a.b.c.a ENSGT00390000005605 ENSGT00390000005584 ENSGT01050000244887.A.a.a.a.j ENSGT00940000157140.b.b.b ENSGT00940000165343.c.b Platyfish MODERN SPECIES 7 pglyrp6 (ENSXMAG00000008873) #10 trappc5 (ENSXMAG00000021372) #11 MCOLN1 (ENSXMAG00000027537) #12 ENSXMAG00000025001 ENSXMAG00000022190 ENSXMAG00000025108 pkn1b (ENSXMAG00000008895) #14 ENSXMAG00000008924 ENSXMAG00000028641 #15 ENSXMAG00000021166 #16 DDX39A (ENSXMAG00000008939) #17 ENSXMAG00000008657 #18 txn2 (ENSXMAG00000021471) #19 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#22 ENSGT00390000000159.i.a ENSGT00530000064086.`b #19 ENSGT00550000075117.m.b.c #21 ENSGT00950000183099.a.b #22 ENSGT00950000183099.a.a.a #22 ENSGT00390000000159.i.b ENSGT00940000155858.e ENSGT00390000012267.e.b ENSGT00940000160152.k ENSGT00940000161195.a.a.f ENSGT00940000154277.b.b.b.b ENSGT00950000183144.B.ab ENSGT00940000157700.d.a.b ENSGT00530000063000.a.a.b.i.c.a ENSGT00950000182923.A.ib.a.b ENSGT00940000156887.a.f.a ENSGT00940000157700.d.b ENSGT00530000063000.a.a.b.i.c.b ENSGT00950000182923.A.ib.a.a ENSGT00940000156887.a.e Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000156719.ab #7 ENSGT01030000234559.a.a.b.a.a.b.d #8 ENSGT00940000159979.a.a.a.a #9 ENSGT00940000158718.a.b.i #10 ENSGT00390000000976.d.b.d #11 ENSGT00950000183036.b.f.k #12 ENSGT01100000263820.b ENSGT00940000154990.fb.b.b #14 ENSGT00530000063861.a ENSGT00940000156166.b.a.a #15 ENSGT00940000159311.d.a.a.i.b #16 ENSGT00940000160024.c.a.b ENSGT00940000159311.d.a.a.i.a #16 ENSGT00940000154912.u.a.c ##17 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ENSGT01030000234563.b.a.b.a.b.a.c.b.a ENSGT01030000234563.b.a.b.a.a.c.a.l.a.a ENSGT00990000206076.c.a ENSGT00390000000483.a.b.a.a.b ENSGT00390000000483.a.b.b ENSGT00940000164982.b.a ENSGT00940000159130.i.b ENSGT00940000155632.p.j ##20 ENSGT00550000075117.m.a.a ##21 ENSGT00950000183099.b.b #22 ENSGT00390000000159.j.d ENSGT00940000155858.f.d ENSGT00940000155159.C.bd.b ENSGT00440000038745.a.a.a.b ENSGT00530000063753.A.a.d ENSGT00530000063753.B.c.f ENSGT00940000153882.a.b.a.a.b ENSGT00390000007779.f ENSGT00410000025739.c.b.i ENSGT00940000157016.e.b ENSGT00940000158772.a.a ENSGT00940000154272.B.a.f ENSGT00940000155738.k.a ENSGT00940000157333.a.j ENSGT00950000182895.a.a.a.b Chinook salmon MODERN SPECIES 11 MARF1 (ENSOTSG00005008753) bmerb1 (ENSOTSG00005009695) MPV17L (ENSOTSG00005009696) ENSOTSG00005009697 ENSOTSG00005009698 TOM1 (ENSOTSG00005009699) ENSOTSG00005009700 ##36 ENSOTSG00005009701 ENSOTSG00005014220 ENSOTSG00005014243 caly (ENSOTSG00005014244) ENSOTSG00005014246 PNPLA6 (ENSOTSG00005014252) myh9a (ENSOTSG00005015593) ##20 slc25a38b (ENSOTSG00005022291) ##21 rpsa (ENSOTSG00005022292) #22 ttc26 (ENSOTSG00005022317) ubn2a (ENSOTSG00005022370) ENSOTSG00005022373 ENSOTSG00005023035 ENSOTSG00005023036 PIK3R5 (ENSOTSG00005023037) ntn1a (ENSOTSG00005023521) stx8 (ENSOTSG00005023536) ENSOTSG00005023538 ENSOTSG00005023539 cfap52 (ENSOTSG00005023540) usp43a (ENSOTSG00005023541) MCHR1 (ENSOTSG00005023543) grb2a (ENSOTSG00005023545) gga3a (ENSOTSG00005023547) Rainbow trout MODERN SPECIES 8 stn1 (ENSOMYG00000037658) SH3PXD2A (ENSOMYG00000037704) neurl1aa (ENSOMYG00000037720) ENSOMYG00000038121 ENSOMYG00000054477 ENSOMYG00000069443 ENSOMYG00000040607 ENSOMYG00000040661 ENSOMYG00000040666 ENSOMYG00000076266 caly (ENSOMYG00000040671) ENSOMYG00000043289 ENSOMYG00000040960 myh9a (ENSOMYG00000043468) ##20 slc25a38b (ENSOMYG00000060862) ##21 rpsa (ENSOMYG00000043879) #22 ttc26 (ENSOMYG00000043952) ubn2a (ENSOMYG00000044095) ENSOMYG00000044229 ENSOMYG00000045822 PIK3R6 (ENSOMYG00000045828) PIK3R5 (ENSOMYG00000045841) ntn1a (ENSOMYG00000045858) stx8 (ENSOMYG00000045864) ENSOMYG00000045873 cfap52 (ENSOMYG00000045879) usp43a (ENSOMYG00000045885) ENSOMYG00000076222 grb2a (ENSOMYG00000045892) gga3a (ENSOMYG00000045917) ENSOMYG00000046027 Huchen MODERN SPECIES 1769 PNPLA6 (ENSHHUG00000050775) myh9a (ENSHHUG00000050885) ##20 slc25a38b (ENSHHUG00000051151) ##21 rpsa (ENSHHUG00000051171) #22 ttc26 (ENSHHUG00000051211) ubn2a (ENSHHUG00000051256) ENSHHUG00000051265 ENSHHUG00000051337 ENSHHUG00000051338 Northern pike MODERN SPECIES 8 dtd1 (ENSELUG00000004973) ENSELUG00000004991 slkb (ENSELUG00000005050) stn1 (ENSELUG00000005119) SH3PXD2A (ENSELUG00000005225) neurl1aa (ENSELUG00000005271) ENSELUG00000005412 ENSELUG00000005482 ENSELUG00000005507 caly (ENSELUG00000005544) ENSELUG00000005551 PNPLA6 (ENSELUG00000005570) ENSELUG00000027147 myh9a (ENSELUG00000005629) ##20 slc25a38b (ENSELUG00000000160) ##21 rpsa (ENSELUG00000034180) #22 ttc26 (ENSELUG00000005781) ubn2a (ENSELUG00000005853) ENSELUG00000005911 pik3r6a (ENSELUG00000005950) PIK3R6 (ENSELUG00000005993) PIK3R5 (ENSELUG00000006043) ntn1a (ENSELUG00000006083) stx8 (ENSELUG00000006104) ENSELUG00000006124 cfap52 (ENSELUG00000006165) usp43a (ENSELUG00000000196) MCHR1 (ENSELUG00000006206) grb2a (ENSELUG00000006226) gga3a (ENSELUG00000006269) ENSELUG00000006289 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 276 ENSGT01030000234559.a.a.b.a.a.a ##8 ENSGT00940000154687.A ENSGT00940000153116.C.b ENSGT00940000166067.b ENSGT00940000158116.a.a ENSGT00940000158178.b.b ENSGT01030000234857 ENSGT00940000165438.a.b ENSGT00940000164623.A ENSGT00940000163957.e.b ENSGT00990000204498 ENSGT00990000204330 ENSGT00940000158145.a ENSGT00940000155632.p ##20 ENSGT00550000075117.m.a ##21 ENSGT00950000183099 #22 ENSGT00390000000159 ENSGT00940000155858.f Otophysi ANCESTRAL SPECIES 236 ENSGT00940000158718.a.a ##10 ENSGT00940000165433 ENSGT00940000159979.a.b ##9 ENSGT01030000234559.a.a.b.a.a.a ##8 ENSGT00940000154687.A ENSGT00940000153116.C.b ENSGT00940000165438.a.b ENSGT00940000164623.A ENSGT00940000164108.a.a.f.b ENSGT00940000163957.e.b ENSGT00990000204498 ENSGT00990000204330 ENSGT00940000158145.a ENSGT00940000155632.p ##20 ENSGT00550000075117.m.a ##21 ENSGT00950000183099 #22 ENSGT00390000000159 ENSGT00940000155858.f ENSGT00940000155159.C ENSGT00440000038745.a.a.a Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00390000007773 ENSGT00940000155421.a.a ENSGT00940000165433 ENSGT00940000159979.a.b ##9 ENSGT01030000234559.a.a.b.a.a.a ##8 ENSGT00940000154687.A ENSGT00940000153116.C.b ENSGT00940000165438.a.b ENSGT00940000164623.A ENSGT00940000163957.e.b ENSGT00990000204498 ENSGT00990000204330 ENSGT00940000158145.a ENSGT00940000155632.p ##20 ENSGT00550000075117.m.a ##21 ENSGT00950000183099 #22 ENSGT00390000000159 ENSGT00940000155858.f ENSGT00940000155159.C ENSGT00440000038745.a.a.a ENSGT00530000063753.A.a ENSGT00530000063753.B.c ENSGT00940000153882.a.a ENSGT00390000007779 ENSGT00410000025739.c.b ENSGT00940000157016 ENSGT00940000158772.a ENSGT00940000154272.B.a ENSGT00940000153432.A.a.j ENSGT00940000157333.a ENSGT00940000164904.a Channel catfish MODERN SPECIES 3 ENSIPUG00000004756 myh11 (ENSIPUG00000004649) cep20 (ENSIPUG00000004623) ube2g2 (ENSIPUG00000004591) ENSIPUG00000004578 cavin2b (ENSIPUG00000004565) SLC44A2 (ENSIPUG00000004485) Ccdc151 (ENSIPUG00000004457) ENSIPUG00000004384 nfil3-5 (ENSIPUG00000004371) ENSIPUG00000004363 ENSIPUG00000004326 PLPPR2 (ENSIPUG00000004304) Myh9 (ENSIPUG00000004022) ##20 slc25a38 (ENSIPUG00000003976) ##21 rpsa (ENSIPUG00000003859) #22 ttc26 (ENSIPUG00000003817) ubn2a (ENSIPUG00000003789) MYH10 (ENSIPUG00000003617) PIK3R6 (ENSIPUG00000003564) pik3r5 (ENSIPUG00000003531) NTN1 (ENSIPUG00000003485) ENSIPUG00000022883 ENSIPUG00000022875 cfap52 (ENSIPUG00000022861) grb2a (ENSIPUG00000022848) mif4gda (ENSIPUG00000022839) sumo2a (ENSIPUG00000022827) jpt1a (ENSIPUG00000022822) ENSIPUG00000022814 ENSIPUG00000022807 Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 93 ENSGT00940000155421.a.a 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(ENSEEEG00000020715) PIK3R5 (ENSEEEG00000020717) ntn1a (ENSEEEG00000020719) stx8 (ENSEEEG00000020722) ENSEEEG00000020723 cfap52 (ENSEEEG00000020725) ENSEEEG00000020726 usp43a (ENSEEEG00000020729) grb2a (ENSEEEG00000020731) mif4gda (ENSEEEG00000020735) gga3a (ENSEEEG00000020739) Characoidei ANCESTRAL SPECIES 195 ENSGT00940000165433 ENSGT00940000159979.a.b ##9 ENSGT01030000234559.a.a.b.a.a.a ##8 ENSGT00940000154687.A ENSGT00940000158178.b.b ENSGT00970000193546 ENSGT00940000153116.C.b ENSGT00940000165438.a.b ENSGT00940000164623.A ENSGT00940000163957.e.b ENSGT00940000154739.A ENSGT00990000204330 ENSGT00940000158145.a ENSGT00940000155632.p ##20 ENSGT00550000075117.m.a ##21 ENSGT00950000183099 #22 ENSGT00390000000159 ENSGT00940000155858.f ENSGT00940000155159.C ENSGT00530000063753.A.a ENSGT00530000063753.B.c ENSGT00940000153882.a.a Red-bellied piranha MODERN SPECIES 1166 ENSPNAG00000020615 slc25a38b (ENSPNAG00000020603) ##21 rpsa (ENSPNAG00000020586) #22 Mexicana tetra MODERN SPECIES 4 ilf3a (ENSAMXG00000010109) acp5a (ENSAMXG00000010099) ENSAMXG00000010095 SLC44A2 (ENSAMXG00000010071) ENSAMXG00000041296 odad3 (ENSAMXG00000010060) ENSAMXG00000043155 ENSAMXG00000029931 nfil3-5 (ENSAMXG00000025528) klf1 (ENSAMXG00000030123) ENSAMXG00000030190 ENSAMXG00000036338 PLPPR2 (ENSAMXG00000010013) myh9a (ENSAMXG00000010006) ##20 slc25a38b (ENSAMXG00000043532) ##21 rpsa (ENSAMXG00000033451) #22 ttc26 (ENSAMXG00000009984) ubn2a (ENSAMXG00000009974) MYH10 (ENSAMXG00000009783) PIK3R6 (ENSAMXG00000009718) PIK3R5 (ENSAMXG00000009714) ENSAMXG00000037616 ENSAMXG00000009579 ENSAMXG00000030701 ENSAMXG00000009567 ENSAMXG00000031052 ENSAMXG00000044080 rhbdl3 (ENSAMXG00000034723) znf207b (ENSAMXG00000029197) cd7al (ENSAMXG00000034624) rhot1b (ENSAMXG00000009533) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 58 ENSGT00940000159979.a.b ##9 ENSGT01030000234559.a.a.b.a.a.a ##8 ENSGT00940000154687.A ENSGT00940000153116.C.b ENSGT00940000165438.a.b ENSGT00940000164623.A ENSGT00940000164108.a.a.f.b ENSGT00940000163957.e.b ENSGT00940000154739.A ENSGT00390000009016 ENSGT00990000204498 ENSGT00990000204330 ENSGT00940000158145.a ENSGT00940000155632.p ##20 ENSGT00550000075117.m.a ##21 ENSGT00950000183099 #22 ENSGT00390000000159 ENSGT00940000155858.f ENSGT00940000155159.C ENSGT00940000154281 ENSGT00940000156107.e.b ENSGT00950000183080.a.a.e.b.d.b ENSGT00940000159521 ENSGT00940000153804.B ENSGT00940000156862 ENSGT00390000010308 ENSGT00390000009940 ENSGT00940000164444.b ENSGT00950000182882.A.b.b.f ENSGT00950000183165.b.a.e.a ENSGT00950000183165.b.a.e.b.d.a.a.b.b Zebrafish MODERN SPECIES 21 ilf3a (ENSDARG00000058660) acp5a (ENSDARG00000019763) ENSDARG00000096398 gcdha (ENSDARG00000037057) SLC44A2 (ENSDARG00000037059) odad3 (ENSDARG00000062978) ENSDARG00000071213 nfil3-5 (ENSDARG00000094965) nfil3-3 (ENSDARG00000116941) klf1 (ENSDARG00000017400) ENSDARG00000090793 palm3 (ENSDARG00000071215) PLPPR2 (ENSDARG00000044600) myh9a (ENSDARG00000063295) ##20 slc25a38b (ENSDARG00000074533) ##21 rpsa (ENSDARG00000019181) #22 ttc26 (ENSDARG00000012039) ubn2a (ENSDARG00000063062) MYH10 (ENSDARG00000000103) pa2g4a (ENSDARG00000039578) ERBB3 (ENSDARG00000006202) arf3b (ENSDARG00000036998) fkbp11 (ENSDARG00000037000) ccdc65 (ENSDARG00000032005) sox21a (ENSDARG00000031664) abcc4 (ENSDARG00000058953) cldn10a (ENSDARG00000058937) ENSDARG00000058930 dzip1 (ENSDARG00000000943) ENSDARG00000058906 HS6ST3 (ENSDARG00000071217) Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT01030000234559.a.a.b.a.a.a.n ##8 ENSGT00940000154687.A.b ENSGT00390000016735.jb.a ENSGT00940000158116.a.a.f ENSGT00940000158178.b.b.c ENSGT01030000234857 ENSGT00940000165438.a.b.a ENSGT00940000164623.A.a ENSGT00940000164108.a.a.f.b.b ENSGT00940000163957.e.b.s ENSGT00990000204498 ENSGT00990000204330.a ENSGT00940000158145.a.d.a.a ENSGT00940000155632.p.n ##20 ENSGT00550000075117.m.a.g.b ##21 ENSGT00950000183099 #22 ENSGT00390000000159.g ENSGT00940000155858.f.b ENSGT00940000155159.C.eb ENSGT00940000154281.b ENSGT00940000156107.e.b.p ENSGT00950000183080.a.a.e.b.d.b.a ENSGT00940000159521.o ENSGT00940000153804.B ENSGT00940000160614.q.b ENSGT00940000153931.b.b.b ENSGT00940000155232.t.b.a ENSGT00940000166422 ENSGT00940000155232.t.a.b.b.k ENSGT00940000156862.v ENSGT00940000155232.t.a.b.b.l Goldfish DUPLICATION Goldfish MODERN SPECIES 46 ptger1a (ENSCARG00000039507) ##8 ilf3a (ENSCARG00000039433) acp5a (ENSCARG00000039393) gcdha (ENSCARG00000038375) SLC44A2 (ENSCARG00000038047) ENSCARG00000037954 ENSCARG00000037901 nfil3-5 (ENSCARG00000037881) nfil3-3 (ENSCARG00000037842) klf1 (ENSCARG00000037807) ENSCARG00000037780 ENSCARG00000037740 PLPPR2 (ENSCARG00000037670) myh9a (ENSCARG00000036546) ##20 slc25a38b (ENSCARG00000036476) ##21 rpsa (ENSCARG00000036434) #22 ttc26 (ENSCARG00000036331) ubn2a (ENSCARG00000036196) MYH10 (ENSCARG00000034668) pa2g4a (ENSCARG00000033971) ERBB3 (ENSCARG00000031212) arf3b (ENSCARG00000031131) fkbp11 (ENSCARG00000031119) ccdc65 (ENSCARG00000031079) sox21a (ENSCARG00000031074) ABCC4 (ENSCARG00000028129) ENSCARG00000027999 CLDN10 (ENSCARG00000027987) dzip1 (ENSCARG00000027970) CLDN10 (ENSCARG00000027866) ENSCARG00000027847 Goldfish MODERN SPECIES 24 ENSCARG00000034838 ##9 ptger1a (ENSCARG00000034842) ##8 ilf3a (ENSCARG00000034862) gcdha (ENSCARG00000035063) SLC44A2 (ENSCARG00000035511) odad3 (ENSCARG00000036403) ENSCARG00000036413 nfil3-5 (ENSCARG00000036427) nfil3-3 (ENSCARG00000036435) klf1 (ENSCARG00000036443) ENSCARG00000036458 ENSCARG00000036464 ENSCARG00000036492 myh9a (ENSCARG00000036561) ##20 slc25a38b (ENSCARG00000037394) ##21 ENSCARG00000037452 #22 ttc26 (ENSCARG00000037540) ENSCARG00000038116 pa2g4a (ENSCARG00000040036) ERBB3 (ENSCARG00000040804) arf3b (ENSCARG00000044305) fkbp11 (ENSCARG00000044339) ENSCARG00000044386 sox21a (ENSCARG00000005829) abcc4 (ENSCARG00000005912) cldn10a (ENSCARG00000006817) dzip1 (ENSCARG00000006825) ENSCARG00000006859 ENSCARG00000006929 atg3 (ENSCARG00000008692) ihhb (ENSCARG00000008737) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00940000159979.a.b.b ##9 ENSGT01030000234559.a.a.b.a.a.a.n ##8 ENSGT00940000154687.A.b ENSGT00390000016735.jb.a ENSGT00940000158116.a.a.f ENSGT00940000158178.b.b.c ENSGT00940000165438.a.b.a ENSGT00940000164623.A.a ENSGT00940000164108.a.a.f.b.b ENSGT00940000163957.e.b.s ENSGT00990000204498 ENSGT00990000204330.a ENSGT00940000158145.a.d.a.a ENSGT00940000155632.p.n ##20 ENSGT00550000075117.m.a.g.b ##21 ENSGT00950000183099 #22 ENSGT00390000000159.g ENSGT00940000155858.f.b ENSGT00940000155159.C.eb ENSGT00940000154281.b ENSGT00940000156107.e.b.p ENSGT00950000183080.a.a.e.b.d.b.a ENSGT00940000159521.o ENSGT00940000153804.B ENSGT00940000160614.q.b ENSGT00940000153931.b.b.b ENSGT00940000155232.t.b.a ENSGT00940000166422 ENSGT00940000155232.t.a.b.b.k ENSGT00940000156862.v ENSGT00940000155232.t.a.b.b.l Common carp reference DUPLICATION Common carp reference MODERN SPECIES 10 ptger1a (ENSCCRG00000052369) ##8 ilf3a (ENSCCRG00000052362) acp5a (ENSCCRG00000052357) gcdha (ENSCCRG00000065159) ENSCCRG00000051842 ENSCCRG00000054154 nfil3-5 (ENSCCRG00000062592) nfil3-3 (ENSCCRG00000081641) klf1 (ENSCCRG00000047810) ENSCCRG00000080386 ENSCCRG00000062849 ENSCCRG00000049504 ENSCCRG00000078482 myh9a (ENSCCRG00000033862) ##20 slc25a38b (ENSCCRG00000082786) ##21 rpsa (ENSCCRG00000056785) #22 ttc26 (ENSCCRG00000046966) ubn2a (ENSCCRG00000067831) ENSCCRG00000082075 pa2g4a (ENSCCRG00000072344) ENSCCRG00000034393 arf3b (ENSCCRG00000076456) fkbp11 (ENSCCRG00000048288) ccdc65 (ENSCCRG00000048296) sox21a (ENSCCRG00000074247) abcc4 (ENSCCRG00000048266) ENSCCRG00000048277 ENSCCRG00000049055 dzip1 (ENSCCRG00000049082) ENSCCRG00000049167 ENSCCRG00000049196 Common carp reference MODERN SPECIES 16 ENSCCRG00000005003 ##9 ptger1a (ENSCCRG00000002981) ##8 ilf3a (ENSCCRG00000052351) acp5a (ENSCCRG00000052350) gcdha (ENSCCRG00000059632) ENSCCRG00000047994 odad3 (ENSCCRG00000060904) ENSCCRG00000047833 nfil3-5 (ENSCCRG00000053016) klf1 (ENSCCRG00000064475) ENSCCRG00000047824 palm3 (ENSCCRG00000074472) ENSCCRG00000042453 myh9a (ENSCCRG00000032325) ##20 slc25a38b (ENSCCRG00000049593) ##21 rpsa (ENSCCRG00000033750) #22 ttc26 (ENSCCRG00000049612) ubn2a (ENSCCRG00000049774) ENSCCRG00000068918 pa2g4a (ENSCCRG00000049835) ENSCCRG00000047880 arf3b (ENSCCRG00000073176) fkbp11 (ENSCCRG00000075677) ENSCCRG00000070176 abcc4 (ENSCCRG00000048306) cldn10a (ENSCCRG00000002360) dzip1 (ENSCCRG00000075600) ENSCCRG00000032946 atg3 (ENSCCRG00000012433) nhej1 (ENSCCRG00000012452) ihhb (ENSCCRG00000082819) Golden-line barbel DUPLICATION Golden-line barbel MODERN SPECIES 33 pglyrp2 (ENSSGRG00000049200) ##10 ENSSGRG00000049199 ENSSGRG00000049198 ##9 ptger1a (ENSSGRG00000049197) ##8 ilf3a (ENSSGRG00000049195) acp5a (ENSSGRG00000049193) gcdha (ENSSGRG00000049145) SLC44A2 (ENSSGRG00000049136) nfil3-5 (ENSSGRG00000049133) nfil3-3 (ENSSGRG00000049132) klf1 (ENSSGRG00000049131) ENSSGRG00000049130 ENSSGRG00000049129 PLPPR2 (ENSSGRG00000049128) myh9a (ENSSGRG00000048804) ##20 rpsa (ENSSGRG00000048759) #22 ttc26 (ENSSGRG00000048757) ubn2a (ENSSGRG00000048755) ENSSGRG00000048314 pa2g4a (ENSSGRG00000048017) ENSSGRG00000047981 arf3b (ENSSGRG00000047979) fkbp11 (ENSSGRG00000047978) ENSSGRG00000047977 sox21a (ENSSGRG00000047976) abcc4 (ENSSGRG00000047917) cldn10a (ENSSGRG00000047912) ENSSGRG00000047911 CLDN10 (ENSSGRG00000047908) dzip1 (ENSSGRG00000047907) CLDN10 (ENSSGRG00000047906) Golden-line barbel DUPLICATION Golden-line barbel MODERN SPECIES 2787 slc25a38b (ENSSGRG00000012033) ##21 ENSSGRG00000012027 #22 ENSSGRG00000012026 Golden-line barbel MODERN SPECIES 4845 ENSSGRG00000005112 #22 Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 248 ENSGT00940000165433 ENSGT00940000159979.a.b.c ##9 ENSGT01030000234559.a.a.b.a.a.a ##8 ENSGT00940000154687.A ENSGT00940000158178.b.b ENSGT00940000153116.C.b ENSGT00940000165438.a.b ENSGT00940000164623.A ENSGT00940000164108.a.a.e ENSGT00940000163957.e.b ENSGT00990000204498 ENSGT00990000204330 ENSGT00940000158145.a ENSGT00940000155632.p ##20 ENSGT00550000075117.m.a ##21 ENSGT00950000183099 #22 ENSGT00390000000159 ENSGT00940000155858.f Denticle herring MODERN SPECIES 13 lgsn (ENSDCDG00000005510) myom2a (ENSDCDG00000002544) usp43a (ENSDCDG00000002403) cfap52 (ENSDCDG00000002396) ENSDCDG00000002388 ENSDCDG00000002385 ENSDCDG00000002376 PIK3R5 (ENSDCDG00000002371) PIK3R6 (ENSDCDG00000002359) cbx6a (ENSDCDG00000002355) pla2g6 (ENSDCDG00000002351) baiap2l2b (ENSDCDG00000002350) ncf4 (ENSDCDG00000002348) IFT27 (ENSDCDG00000002346) slc25a38b (ENSDCDG00000002345) ##21 rpsa (ENSDCDG00000002337) #22 ttc26 (ENSDCDG00000002306) ubn2a (ENSDCDG00000002299) ENSDCDG00000002295 nptxrb (ENSDCDG00000002289) ENSDCDG00000002287 ENSDCDG00000002188 atpv0e2 (ENSDCDG00000002173) ENSDCDG00000002170 ENTPD7 (ENSDCDG00000002163) ENSDCDG00000002154 GOT1 (ENSDCDG00000002146) ENSDCDG00000002139 ENSDCDG00000002133 hoga1 (ENSDCDG00000002126) MORN4 (ENSDCDG00000002121) Atlantic herring MODERN SPECIES 18 mif4gda (ENSCHAG00000017014) ENSCHAG00000017096 MCHR1 (ENSCHAG00000017115) ENSCHAG00000017154 CFAP52 (ENSCHAG00000017251) ENSCHAG00000017333 stx8 (ENSCHAG00000017465) ntn1a (ENSCHAG00000017484) PIK3R5 (ENSCHAG00000017547) PIK3R6 (ENSCHAG00000017618) pik3r6a (ENSCHAG00000017633) ENSCHAG00000017807 PLPPR2 (ENSCHAG00000022887) myh9a (ENSCHAG00000022996) ##20 slc25a38b (ENSCHAG00000023197) ##21 rpsa (ENSCHAG00000023209) #22 myh9a (ENSCHAG00000023304) ##20 PLPPR2 (ENSCHAG00000024426) ENSCHAG00000024493 ENSCHAG00000024496 ENSCHAG00000024511 klf1 (ENSCHAG00000024520) ENSCHAG00000024521 nfil3-5 (ENSCHAG00000024524) ENSCHAG00000024532 odad3 (ENSCHAG00000024556) SLC44A2 (ENSCHAG00000024656) ENSCHAG00000025559 gcdha (ENSCHAG00000025568) ENSCHAG00000025681 acp5a (ENSCHAG00000025688) Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 70 ENSGT01030000234559.a.a.b.a.a.a.o ##8 ENSGT00940000159979.a.b ##9 ENSGT00940000165433 ENSGT00940000158718.a.a ##10 ENSGT00950000183036.b.e ##12 ENSGT00940000154382.a.a.a.a ENSGT00390000009916 ENSGT00940000154990.db #14 ENSGT00940000158914 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ENSGT00640000091519 ENSGT00530000064086 #19 ENSGT00940000155632 #20 ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099 #22 ENSGT00940000157534 #32 ENSGT00940000160320 ENSGT00390000012258 #25 ENSGT00940000155858 ENSGT00390000000159 Coelacanth MODERN SPECIES 1368 rpsa (ENSLACG00000003016) #22 ENSLACG00000004264 ENSLACG00000005832 ENSLACG00000007163 ENSLACG00000008179 MYH9 (ENSLACG00000009267) #20 ENSLACG00000012006 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 153 ENSGT01050000244824.G ENSGT00390000017673.b ENSGT00640000091519 ENSGT00530000064086 #19 ENSGT00940000155632 #20 ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099 #22 ENSGT00940000157534 #32 ENSGT00390000012258 #25 ENSGT00940000155858 ENSGT00390000000159 ENSGT00940000155955.C ENSGT00530000063509.A ENSGT00530000063707.a ENSGT00940000155964 #26 ENSGT00390000016992 ENSGT01050000244814.a.a.a.b #28 ENSGT00530000063694.b ENSGT00950000182696.A.a #29 Anura ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000017504 ENSGT00420000030724 ENSGT00940000158004 ENSGT00390000017489 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#32 fmc1 (ENSXETG00000032301) #25 luc7l2 (ENSXETG00000000229) ENSXETG00000044948 poldip3 (ENSXETG00000013412) serhl2 (ENSXETG00000013413) rrp7a (ENSXETG00000013414) serhl (ENSXETG00000013415) ENSXETG00000043526 ENSXETG00000046556 ENSXETG00000041519 tcf20 (ENSXETG00000013417) #27 rasd2 (ENSXETG00000013420) ubn2 (ENSXETG00000013423) shld2 (ENSXETG00000037387) Leishan spiny toad DUPLICATION Leishan spiny toad MODERN SPECIES 11 ENSLLEG00000026348 ENSLLEG00000026366 ENSLLEG00000026384 ENSLLEG00000026415 HMOX1 (ENSLLEG00000026434) ENSLLEG00000026472 MCM5 (ENSLLEG00000026499) NDUFA6 (ENSLLEG00000026689) FOXRED2 (ENSLLEG00000026723) TXN2 (ENSLLEG00000026772) #19 MYH9 (ENSLLEG00000026836) #20 ENSLLEG00000027168 ENSLLEG00000027181 SLC25A38 (ENSLLEG00000027198) #21 ENSLLEG00000027229 ENSLLEG00000027277 #22 RBFOX2 (ENSLLEG00000027568) #32 FMC1 (ENSLLEG00000016147) #25 LUC7L2 (ENSLLEG00000016217) ENSLLEG00000016996 ENSLLEG00000017181 RRP7A (ENSLLEG00000017434) ENSLLEG00000017511 ENSLLEG00000017537 ENSLLEG00000017598 TCF20 (ENSLLEG00000017674) #27 ENSLLEG00000017796 ENSLLEG00000017828 ENSLLEG00000017923 UBN2 (ENSLLEG00000017990) TTC26 (ENSLLEG00000018950) Leishan spiny toad MODERN SPECIES 2 HES2 (ENSLLEG00000024421) ACOT7 (ENSLLEG00000024362) GPR153 (ENSLLEG00000024326) HES3 (ENSLLEG00000024272) ICMT (ENSLLEG00000024232) RNF207 (ENSLLEG00000024109) ENSLLEG00000023898 ENSLLEG00000023820 CHD5 (ENSLLEG00000023197) KCNAB2 (ENSLLEG00000022601) NPHP4 (ENSLLEG00000022153) ENSLLEG00000022124 ENSLLEG00000022107 ENSLLEG00000022076 AJAP1 (ENSLLEG00000021843) ENSLLEG00000021793 #22 ENSLLEG00000021767 ENSLLEG00000021750 ENSLLEG00000021728 ENSLLEG00000021706 C1orf174 (ENSLLEG00000021656) DFFB (ENSLLEG00000021516) CEP104 (ENSLLEG00000021170) ENSLLEG00000021124 LRRC47 (ENSLLEG00000021063) ENSLLEG00000020947 ENSLLEG00000020857 ENSLLEG00000020583 ENSLLEG00000020549 SDHD (ENSLLEG00000020501) ENSLLEG00000020405 Amniota DUPLICATION Amniota DUPLICATION Amniota ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a #22 Mammalia ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000160796 ENSGT00940000163083 ENSGT01100000263710 ENSGT00940000177252 ENSGT00940000155574.C ENSGT00940000156148 ENSGT00940000153845.a.b ENSGT00390000009163 ENSGT00940000153814.a ENSGT00390000010260 ENSGT00950000182942.a.a ENSGT01020000230359.C.b ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.u.a #22 ENSGT00950000183099.u.b.a #22 ENSGT01050000244942.b.a.b ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT00390000003571 ENSGT00940000155697.A ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00390000001296 ENSGT00940000156463 ENSGT00390000012690 ENSGT01050000244939.b ENSGT00940000155721 ENSGT00950000183130.C ENSGT00950000183186.B.b Theria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000160796 ENSGT00940000163083 ENSGT01100000263710 ENSGT00940000177252 ENSGT00940000155574.C ENSGT00940000156148 ENSGT00940000153845.a.b ENSGT00390000009163 ENSGT00940000153814.a ENSGT00390000010260 ENSGT00950000182942.a.a ENSGT01020000230359.C.b ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.u.a #22 ENSGT00940000164532 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a #22 ENSGT01050000244942.b.a.b ENSGT00950000183099.v #22 ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT00390000003571 ENSGT00940000155697.A ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00390000001296 ENSGT00940000156463 ENSGT00390000012690 ENSGT01050000244939.b ENSGT00940000155721 Eutheria ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000161691 ENSGT01030000235089 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.u.a #22 ENSGT00940000164532 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b #22 ENSGT00950000183099.u.b.a.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a #22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a #22 Armadillo DUPLICATION Armadillo MODERN SPECIES 4594 WSCD1 (ENSDNOG00000019657) NLRP1 (ENSDNOG00000018344) ENSDNOG00000032685 MIS12 (ENSDNOG00000010190) DERL2 (ENSDNOG00000047873) DHX33 (ENSDNOG00000016865) C1QBP (ENSDNOG00000008887) RPAIN (ENSDNOG00000008870) NUP88 (ENSDNOG00000008839) RABEP1 (ENSDNOG00000008796) SCIMP (ENSDNOG00000035239) ENSDNOG00000030878 ENSDNOG00000031141 ENSDNOG00000008737 ENSDNOG00000044874 #22 Armadillo MODERN SPECIES 2064 NPAS4 (ENSDNOG00000042408) ENSDNOG00000035632 #22 MRPL11 (ENSDNOG00000037861) PELI3 (ENSDNOG00000010056) DPP3 (ENSDNOG00000010071) BBS1 (ENSDNOG00000025752) ZDHHC24 (ENSDNOG00000042392) ACTN3 (ENSDNOG00000017355) CTSF (ENSDNOG00000009351) CCS (ENSDNOG00000034796) RBM14 (ENSDNOG00000043225) RBM4 (ENSDNOG00000032390) ENSDNOG00000019500 SPTBN2 (ENSDNOG00000012546) Armadillo MODERN SPECIES 1291 WASF2 (ENSDNOG00000034536) AHDC1 (ENSDNOG00000038844) FGR (ENSDNOG00000014797) ENSDNOG00000034433 FAM76A (ENSDNOG00000049213) STX12 (ENSDNOG00000049359) PPP1R8 (ENSDNOG00000033057) THEMIS2 (ENSDNOG00000013968) RPA2 (ENSDNOG00000023660) SMPDL3B (ENSDNOG00000032579) XKR8 (ENSDNOG00000032960) EYA3 (ENSDNOG00000044648) PTAFR (ENSDNOG00000044017) ENSDNOG00000042785 ENSDNOG00000045464 ENSDNOG00000038753 #22 SESN2 (ENSDNOG00000017933) MED18 (ENSDNOG00000012531) ENSDNOG00000035347 PHACTR4 (ENSDNOG00000003784) RCC1 (ENSDNOG00000042718) ENSDNOG00000033009 RAB42 (ENSDNOG00000010079) TAF12 (ENSDNOG00000045864) GMEB1 (ENSDNOG00000025258) YTHDF2 (ENSDNOG00000033903) OPRD1 (ENSDNOG00000046525) EPB41 (ENSDNOG00000019472) TMEM200B (ENSDNOG00000035804) SRSF4 (ENSDNOG00000047961) MECR (ENSDNOG00000048252) Boreoeutheria DUPLICATION Boreoeutheria DUPLICATION Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.a #22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.a #22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.a #22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.a #22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.a #22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.a #22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.a #22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.a #22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.a #22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.a #22 Pan ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00910000148038 ENSGT00550000074847 ENSGT00910000146826 ENSGT00940000164233 ENSGT00940000155018.a.b.b ENSGT00510000047895 ENSGT00940000159462 ENSGT00940000161611 ENSGT00940000154493.a.b ENSGT00940000162010 ENSGT00940000162880 ENSGT00940000161977 ENSGT00940000160877 ENSGT00940000162217 ENSGT00940000154392 ENSGT00950000183099.u.a.d.a #22 ENSGT00940000160635 ENSGT00940000156287 ENSGT00940000159056 ENSGT00440000039367 ENSGT00550000075082 ENSGT00410000027658 ENSGT00910000147014 ENSGT00390000006885.b.b ENSGT00390000006885.b.a ENSGT00550000076216 ENSGT01020000230647 ENSGT00700000106116 ENSGT01030000234534.A.c.b ENSGT01030000234534.A.c.a ENSGT00910000147588 Chimpanzee MODERN SPECIES 5 ENSPTRG00000051422 DDX24 (ENSPTRG00000006673) IFI27L1 (ENSPTRG00000006674) IFI27 (ENSPTRG00000006675) IFI27L2 (ENSPTRG00000030676) PPP4R4 (ENSPTRG00000006676) SERPINA10 (ENSPTRG00000006677) SERPINA6 (ENSPTRG00000006678) SERPINA1 (ENSPTRG00000023666) SERPINA11 (ENSPTRG00000006680) SERPINA9 (ENSPTRG00000006681) SERPINA12 (ENSPTRG00000006682) SERPINA4 (ENSPTRG00000006683) SERPINA5 (ENSPTRG00000032490) SERPINA3 (ENSPTRG00000023582) ENSPTRG00000052261 #22 GSC (ENSPTRG00000006687) DICER1 (ENSPTRG00000023484) CLMN (ENSPTRG00000006689) SYNE3 (ENSPTRG00000006691) GLRX5 (ENSPTRG00000006692) ENSPTRG00000052861 ENSPTRG00000049241 TCL1B (ENSPTRG00000044759) TCL1A (ENSPTRG00000006695) ENSPTRG00000045061 ENSPTRG00000042975 C14H14orf132 (ENSPTRG00000051974) BDKRB2 (ENSPTRG00000047114) ENSPTRG00000049278 BDKRB1 (ENSPTRG00000030674) Bonobo MODERN SPECIES 5 OTUB2 (ENSPPAG00000028381) ENSPPAG00000029706 DDX24 (ENSPPAG00000038713) IFI27 (ENSPPAG00000031690) ENSPPAG00000033412 ENSPPAG00000038318 PPP4R4 (ENSPPAG00000021420) SERPINA10 (ENSPPAG00000036698) SERPINA6 (ENSPPAG00000042823) SERPINA1 (ENSPPAG00000043524) SERPINA11 (ENSPPAG00000036447) SERPINA12 (ENSPPAG00000037137) SERPINA4 (ENSPPAG00000027796) SERPINA5 (ENSPPAG00000033644) SERPINA3 (ENSPPAG00000039184) ENSPPAG00000040434 #22 GSC (ENSPPAG00000040766) DICER1 (ENSPPAG00000035143) CLMN (ENSPPAG00000038455) SYNE3 (ENSPPAG00000031310) ENSPPAG00000021934 ENSPPAG00000033285 ENSPPAG00000034920 TCL1B (ENSPPAG00000035530) TCL1A (ENSPPAG00000040757) ENSPPAG00000010228 ENSPPAG00000035682 ENSPPAG00000027291 BDKRB2 (ENSPPAG00000034180) ENSPPAG00000039062 ENSPPAG00000007555 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.a #22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.a #22 Marmoset MODERN SPECIES 1 ENSCJAG00000015263 ARG2 (ENSCJAG00000015277) PIGH (ENSCJAG00000039073) PLEKHH1 (ENSCJAG00000015298) TMEM229B (ENSCJAG00000015358) PLEK2 (ENSCJAG00000015361) EIF2S1 (ENSCJAG00000015368) ATP6V1D (ENSCJAG00000015396) PALS1 (ENSCJAG00000015428) ENSCJAG00000078005 GARIN2 (ENSCJAG00000015489) ENSCJAG00000081580 GPHN (ENSCJAG00000015520) CCDC196 (ENSCJAG00000041012) ENSCJAG00000070734 ENSCJAG00000080767 #22 ENSCJAG00000070476 FUT8 (ENSCJAG00000003756) ENSCJAG00000059321 MAX (ENSCJAG00000019702) ENSCJAG00000076560 FNTB (ENSCJAG00000019689) RAB15 (ENSCJAG00000019696) GPX2 (ENSCJAG00000043228) CHURC1 (ENSCJAG00000047676) ENSCJAG00000086103 SPTB (ENSCJAG00000019629) PLEKHG3 (ENSCJAG00000019611) PPP1R36 (ENSCJAG00000019603) HSPA2 (ENSCJAG00000042264) ZBTB1 (ENSCJAG00000019591) Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.a #22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.a #22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.a #22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.a #22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.a #22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.a #22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.a #22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.a #22 Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.a #22 Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.a #22 Bos_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.a #22 Domestic yak MODERN SPECIES 14 ACVR2B (ENSBGRG00000011212) ENSBGRG00000011202 ENSBGRG00000011105 SCN5A (ENSBGRG00000010413) SCN10A (ENSBGRG00000009854) SCN11A (ENSBGRG00000009542) WDR48 (ENSBGRG00000009347) GORASP1 (ENSBGRG00000009134) TTC21A (ENSBGRG00000008237) CSRNP1 (ENSBGRG00000008132) CX3CR1 (ENSBGRG00000007861) ENSBGRG00000007811 ENSBGRG00000007745 SLC25A38 (ENSBGRG00000007573) #21 ENSBGRG00000007505 ENSBGRG00000007397 #22 ENSBGRG00000007353 MYRIP (ENSBGRG00000006898) EIF1B (ENSBGRG00000021725) ENTPD3 (ENSBGRG00000021619) RPL14 (ENSBGRG00000021512) ZNF619 (ENSBGRG00000021459) ENSBGRG00000021424 ENSBGRG00000021364 CTNNB1 (ENSBGRG00000021135) ULK4 (ENSBGRG00000020150) TRAK1 (ENSBGRG00000018952) CCK (ENSBGRG00000018878) LYZL4 (ENSBGRG00000018844) VIPR1 (ENSBGRG00000018443) SEC22C (ENSBGRG00000018379) Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.a #22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.a #22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.a #22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.a #22 Ursidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.a #22 Giant Panda MODERN SPECIES 1859 ENSAMEG00000013222 #22 Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.a #22 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.a #22 Dingo MODERN SPECIES 326 ENSCAFG00020025813 ENSCAFG00020025811 SCN5A (ENSCAFG00020025607) SCN10A (ENSCAFG00020025566) SCN11A (ENSCAFG00020025559) WDR48 (ENSCAFG00020025556) ENSCAFG00020025554 TTC21A (ENSCAFG00020025549) CSRNP1 (ENSCAFG00020025547) XIRP1 (ENSCAFG00020025545) ENSCAFG00020025543 CX3CR1 (ENSCAFG00020025541) CCR8 (ENSCAFG00020025540) SLC25A38 (ENSCAFG00020025534) #21 ENSCAFG00020025529 ENSCAFG00020025526 #22 MOBP (ENSCAFG00020025525) ENSCAFG00020025524 ENSCAFG00020025521 MYRIP (ENSCAFG00020025520) EIF1B (ENSCAFG00020025518) ENTPD3 (ENSCAFG00020025514) ENSCAFG00020025513 ENSCAFG00020025512 ZNF619 (ENSCAFG00020025511) ZNF620 (ENSCAFG00020025509) ZNF621 (ENSCAFG00020025507) CTNNB1 (ENSCAFG00020025504) ENSCAFG00020025503 ULK4 (ENSCAFG00020025468) TRAK1 (ENSCAFG00020025297) Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.b #22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.b #22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.b #22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.b #22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00910000148110 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.u.a.d.b #22 ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.a.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00910000147527 ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01090000263454 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a.l ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT00910000146711 ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.a.b #22 ENSGT00950000183099.u.a.d.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a.l ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B ENSGT00940000159338 Cebidae ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT00910000146711 ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.a.b #22 ENSGT00950000183099.u.a.d.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a.l ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B ENSGT00940000159338 Marmoset MODERN SPECIES PDCL (ENSCJAG00000087386) RC3H2 (ENSCJAG00000020050) ZBTB6 (ENSCJAG00000020049) ZBTB26 (ENSCJAG00000021770) RABGAP1 (ENSCJAG00000020027) STRBP (ENSCJAG00000019997) CRB2 (ENSCJAG00000006432) DENND1A (ENSCJAG00000006461) ENSCJAG00000085719 LHX2 (ENSCJAG00000006496) NEK6 (ENSCJAG00000006507) PSMB7 (ENSCJAG00000006541) ADGRD2 (ENSCJAG00000040439) NR5A1 (ENSCJAG00000006624) NR6A1 (ENSCJAG00000006631) ENSCJAG00000078726 #22 OLFML2A (ENSCJAG00000006668) ENSCJAG00000077082 WDR38 (ENSCJAG00000006695) ENSCJAG00000006724 ENSCJAG00000006730 GOLGA1 (ENSCJAG00000006745) SCAI (ENSCJAG00000006789) ENSCJAG00000077976 ENSCJAG00000082314 PPP6C (ENSCJAG00000006827) RABEPK (ENSCJAG00000006849) ENSCJAG00000052894 HSPA5 (ENSCJAG00000006880) GAPVD1 (ENSCJAG00000006913) MAPKAP1 (ENSCJAG00000006963) Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000162395 ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT00910000146711 ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.u.a.d.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a.l ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B ENSGT00940000159338 Capuchin MODERN SPECIES 391 XYLB (ENSCCAG00000022508) ACVR2B (ENSCCAG00000028385) EXOG (ENSCCAG00000022851) SCN5A (ENSCCAG00000023536) SCN10A (ENSCCAG00000037010) SCN11A (ENSCCAG00000025119) ENSCCAG00000037437 WDR48 (ENSCCAG00000035592) GORASP1 (ENSCCAG00000024092) TTC21A (ENSCCAG00000033019) CSRNP1 (ENSCCAG00000031152) XIRP1 (ENSCCAG00000026518) CX3CR1 (ENSCCAG00000031070) ENSCCAG00000015581 SLC25A38 (ENSCCAG00000021248) #21 RPSA (ENSCCAG00000036860) #22 MOBP (ENSCCAG00000030542) ENSCCAG00000020708 ENSCCAG00000019279 MYRIP (ENSCCAG00000031793) EIF1B (ENSCCAG00000031083) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00910000148110 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.u.a.d.b #22 ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.a.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00910000147527 ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01090000263454 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a.l ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 ENSGT00950000182802.B.a.a.a.a.h.a.b.b ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00390000013814.e.a Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.b #22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.b #22 Golden snub-nosed monkey DUPLICATION Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 3046 ENSRROG00000029943 #22 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1530 CYP2J2 (ENSRROG00000034996) C1orf87 (ENSRROG00000040441) NFIA (ENSRROG00000026343) TM2D1 (ENSRROG00000035570) PATJ (ENSRROG00000010773) ENSRROG00000023749 L1TD1 (ENSRROG00000042567) KANK4 (ENSRROG00000007321) USP1 (ENSRROG00000028426) DOCK7 (ENSRROG00000040277) ANGPTL3 (ENSRROG00000017394) ATG4C (ENSRROG00000013654) ENSRROG00000006458 #22 ALG6 (ENSRROG00000035629) ITGB3BP (ENSRROG00000042197) EFCAB7 (ENSRROG00000040009) PGM1 (ENSRROG00000039585) ENSRROG00000029309 ENSRROG00000026656 ROR1 (ENSRROG00000040188) ENSRROG00000022599 UBE2U (ENSRROG00000038838) CACHD1 (ENSRROG00000045428) RAVER2 (ENSRROG00000041867) JAK1 (ENSRROG00000043516) AK4 (ENSRROG00000036638) DNAJC6 (ENSRROG00000032081) LEPROT (ENSRROG00000042854) Hominoidea DUPLICATION Hominoidea DUPLICATION Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000160677 ENSGT00390000015797.c.b.a.a ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00910000148110 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00910000146711 ENSGT00550000075117.g #21 ENSGT00950000183099.u.a.d.b.c.a #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00910000147527 ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01090000263454 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a.l ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 ENSGT00950000182802.B.a.a.a.a.h.a.b.b ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00390000013814.e.a ENSGT00940000155697.A Hominidae DUPLICATION Hominidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000160677 ENSGT00390000015797.c.b.a.a ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00910000148110 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a 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ENSGGOG00000022216 LGALSL (ENSGGOG00000006386) ENSGGOG00000023155 AFTPH (ENSGGOG00000008449) SLC1A4 (ENSGGOG00000011211) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.b.c.b #22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.b.c.b #22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000160341.b ENSGT00530000063675.a.d ENSGT00730000111087 ENSGT00390000002283 ENSGT00940000157358 ENSGT00940000162379 ENSGT00940000157028 ENSGT01050000244864.B.b ENSGT01030000234513.B.b.i ENSGT01030000234513.B.b.j ENSGT00390000007182 ENSGT00390000015473 ENSGT00940000161739 ENSGT00390000016366 ENSGT00940000153139.A ENSGT00950000183099.u.a.d.b.c.b #22 ENSGT00940000159161 ENSGT00390000003152.j ENSGT00500000045005 ENSGT00390000008171 ENSGT00940000153716.A.h ENSGT00940000153716.A.g.a ENSGT00950000183079.A.b.c.b ENSGT00940000160956 ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.a.b.b.d ENSGT00940000155309.e.a ENSGT00950000185108 ENSGT00390000003223.v.b ENSGT01030000235038.a ENSGT00940000159187 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ENSGT00500000045005 ENSGT00390000008171 ENSGT00940000153716.A.h ENSGT00940000158544.f ENSGT00940000153716.A.g.a ENSGT00950000183079.A.b.c.b ENSGT00390000014122.i.b.a.b.w.a ENSGT00940000160956 ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.a.b.b.d ENSGT00940000155309.e.a ENSGT00950000185108 ENSGT00390000003223.v.b ENSGT01030000235038.a Chimpanzee MODERN SPECIES 4 ENSPTRG00000046807 ENSPTRG00000047050 MPHOSPH8 (ENSPTRG00000024080) PSPC1 (ENSPTRG00000005677) ENSPTRG00000046144 ZMYM5 (ENSPTRG00000005679) ZMYM2 (ENSPTRG00000005680) GJA3 (ENSPTRG00000048126) GJB2 (ENSPTRG00000044692) GJB6 (ENSPTRG00000005683) CRYL1 (ENSPTRG00000005684) IFT88 (ENSPTRG00000005685) IL17D (ENSPTRG00000031245) EEF1AKMT1 (ENSPTRG00000005687) XPO4 (ENSPTRG00000005690) ENSPTRG00000044294 #22 LATS2 (ENSPTRG00000005691) SAP18 (ENSPTRG00000005692) SKA3 (ENSPTRG00000005693) MRPL57 (ENSPTRG00000049719) ZDHHC20 (ENSPTRG00000005695) MICU2 (ENSPTRG00000005696) ENSPTRG00000034468 FGF9 (ENSPTRG00000005698) ENSPTRG00000051347 ENSPTRG00000049737 ENSPTRG00000042953 ENSPTRG00000051901 ENSPTRG00000048143 SGCG (ENSPTRG00000005701) SACS (ENSPTRG00000005703) Gibbon MODERN SPECIES 4 C2orf74 (ENSNLEG00000009582) ENSNLEG00000034163 ENSNLEG00000027829 USP34 (ENSNLEG00000009598) XPO1 (ENSNLEG00000009680) FAM161A (ENSNLEG00000009719) CCT4 (ENSNLEG00000009723) COMMD1 (ENSNLEG00000033234) B3GNT2 (ENSNLEG00000035442) TMEM17 (ENSNLEG00000009759) EHBP1 (ENSNLEG00000009764) ENSNLEG00000027460 OTX1 (ENSNLEG00000009808) WDPCP (ENSNLEG00000009810) MDH1 (ENSNLEG00000009823) ENSNLEG00000035245 #22 UGP2 (ENSNLEG00000031494) VPS54 (ENSNLEG00000009859) PELI1 (ENSNLEG00000009891) ENSNLEG00000028443 LGALSL (ENSNLEG00000031680) AFTPH (ENSNLEG00000009902) ENSNLEG00000009923 SERTAD2 (ENSNLEG00000029151) SLC1A4 (ENSNLEG00000009927) ENSNLEG00000009939 RAB1A (ENSNLEG00000009944) ACTR2 (ENSNLEG00000009948) SPRED2 (ENSNLEG00000009959) ENSNLEG00000027615 ENSNLEG00000009963 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.b.d #22 Gibbon MODERN SPECIES 19 SLC22A13 (ENSNLEG00000005376) ENSNLEG00000005389 XYLB (ENSNLEG00000005394) ACVR2B (ENSNLEG00000005401) EXOG (ENSNLEG00000005421) SCN5A (ENSNLEG00000005433) SCN10A (ENSNLEG00000031545) SCN11A (ENSNLEG00000026898) WDR48 (ENSNLEG00000005481) GORASP1 (ENSNLEG00000005538) TTC21A (ENSNLEG00000005562) CSRNP1 (ENSNLEG00000029751) XIRP1 (ENSNLEG00000005609) CX3CR1 (ENSNLEG00000030926) SLC25A38 (ENSNLEG00000005614) #21 ENSNLEG00000005626 #22 ENSNLEG00000029771 MOBP (ENSNLEG00000005636) ENSNLEG00000036175 MYRIP (ENSNLEG00000005641) EIF1B (ENSNLEG00000005660) ENTPD3 (ENSNLEG00000005665) RPL14 (ENSNLEG00000005682) ENSNLEG00000005711 ZNF620 (ENSNLEG00000005719) ENSNLEG00000017152 ENSNLEG00000027409 ZNF621 (ENSNLEG00000005721) CTNNB1 (ENSNLEG00000005726) ENSNLEG00000030260 ULK4 (ENSNLEG00000005778) Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.b #22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.b #22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.b #22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.b #22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.b #22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.b #22 Ursidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.d.b #22 Giant Panda MODERN SPECIES 1780 ENSAMEG00000029097 #22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT01030000235089 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT01030000235508 ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.u.a.e #22 ENSGT00940000164532 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.d ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT01030000235089 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT01030000235508 ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.u.a.e #22 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.n #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01090000263454 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT01030000235089 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT01030000235508 ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.u.a.e #22 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.n #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01090000263454 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B Glires ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT01030000235089.b ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT01030000235508 ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.u.a.e #22 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.n #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01090000263454 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e #22 Rabbit MODERN SPECIES 14 TRMT12 (ENSOCUG00000026379) RNF139 (ENSOCUG00000017399) TATDN1 (ENSOCUG00000017403) NDUFB9 (ENSOCUG00000025074) MTSS1 (ENSOCUG00000008102) ENSOCUG00000030136 ZNF572 (ENSOCUG00000039324) SQLE (ENSOCUG00000015771) WASHC5 (ENSOCUG00000015785) NSMCE2 (ENSOCUG00000008539) ENSOCUG00000030414 TRIB1 (ENSOCUG00000024295) ENSOCUG00000037909 LRATD2 (ENSOCUG00000003500) MYC (ENSOCUG00000014289) ENSOCUG00000000506 #22 ENSOCUG00000025215 ENSOCUG00000038124 ENSOCUG00000024677 ENSOCUG00000021577 ENSOCUG00000013690 ASAP1 (ENSOCUG00000002414) ADCY8 (ENSOCUG00000002685) ENSOCUG00000030310 ENSOCUG00000039078 ENSOCUG00000023866 ENSOCUG00000032952 EFR3A (ENSOCUG00000009294) OC90 (ENSOCUG00000012033) KCNQ3 (ENSOCUG00000012036) ENSOCUG00000034102 Rodentia ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT01030000235089.b ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT01030000235508 ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.u.a.e #22 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.n #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01090000263454 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e #22 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e #22 Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e #22 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e #22 Squirrel DUPLICATION Squirrel MODERN SPECIES 109 DLX2 (ENSSTOG00000019803) DLX1 (ENSSTOG00000012969) METAP1D (ENSSTOG00000012954) HAT1 (ENSSTOG00000012940) SLC25A12 (ENSSTOG00000007698) DYNC1I2 (ENSSTOG00000009040) CYBRD1 (ENSSTOG00000023035) DCAF17 (ENSSTOG00000008475) METTL8 (ENSSTOG00000008451) ENSSTOG00000022641 ENSSTOG00000026404 TLK1 (ENSSTOG00000015694) GORASP2 (ENSSTOG00000003380) GAD1 (ENSSTOG00000003340) ENSSTOG00000031823 ENSSTOG00000027669 #22 ENSSTOG00000008099 ENSSTOG00000021320 MYO3B (ENSSTOG00000007990) ENSSTOG00000019433 UBR3 (ENSSTOG00000025289) METTL5 (ENSSTOG00000008428) SSB (ENSSTOG00000008416) KLHL23 (ENSSTOG00000001133) PHOSPHO2 (ENSSTOG00000024059) CFAP210 (ENSSTOG00000011663) PPIG (ENSSTOG00000011656) FASTKD1 (ENSSTOG00000011651) KLHL41 (ENSSTOG00000034336) BBS5 (ENSSTOG00000009893) Squirrel MODERN SPECIES 88 TTC8 (ENSSTOG00000013253) EML5 (ENSSTOG00000020991) ZC3H14 (ENSSTOG00000013176) PTPN21 (ENSSTOG00000013120) SPATA7 (ENSSTOG00000013095) KCNK10 (ENSSTOG00000011800) GPR65 (ENSSTOG00000026082) GALC (ENSSTOG00000019920) FLRT2 (ENSSTOG00000005138) ENSSTOG00000034685 SEL1L (ENSSTOG00000005942) STON2 (ENSSTOG00000005919) GTF2A1 (ENSSTOG00000005900) TSHR (ENSSTOG00000005868) CEP128 (ENSSTOG00000005824) ENSSTOG00000027978 #22 ENSSTOG00000029585 NRXN3 (ENSSTOG00000015280) ADCK1 (ENSSTOG00000010431) SNW1 (ENSSTOG00000003286) SLIRP (ENSSTOG00000034316) ENSSTOG00000003254 ENSSTOG00000029513 SPTLC2 (ENSSTOG00000003237) ISM2 (ENSSTOG00000003218) AHSA1 (ENSSTOG00000003196) VIPAS39 (ENSSTOG00000003177) NOXRED1 (ENSSTOG00000003169) ENSSTOG00000028225 TMED8 (ENSSTOG00000002808) GSTZ1 (ENSSTOG00000002793) Alpin marmot MODERN SPECIES 26 SPATA48 (ENSMMMG00000015542) ZPBP (ENSMMMG00000015506) VWC2 (ENSMMMG00000015492) ENSMMMG00000015482 ENSMMMG00000015465 ABCA13 (ENSMMMG00000015281) ENSMMMG00000015221 UPP1 (ENSMMMG00000015208) C7orf57 (ENSMMMG00000015182) SUN3 (ENSMMMG00000015174) HUS1 (ENSMMMG00000015160) PKD1L1 (ENSMMMG00000015029) TNS3 (ENSMMMG00000014995) ENSMMMG00000014987 ENSMMMG00000014980 ENSMMMG00000014975 #22 IGFBP3 (ENSMMMG00000014868) IGFBP1 (ENSMMMG00000014859) ADCY1 (ENSMMMG00000014821) RAMP3 (ENSMMMG00000014813) ENSMMMG00000014809 ENSMMMG00000014801 TBRG4 (ENSMMMG00000014785) NACAD (ENSMMMG00000014752) CCM2 (ENSMMMG00000014704) MYO1G (ENSMMMG00000014692) ENSMMMG00000014682 ENSMMMG00000014677 ENSMMMG00000014669 ZMIZ2 (ENSMMMG00000014533) OGDH (ENSMMMG00000014266) Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e #22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e #22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e #22 Long-tailed chinchilla DUPLICATION Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 233 CCN6 (ENSCLAG00000000109) TUBE1 (ENSCLAG00000000067) FAM229B (ENSCLAG00000000365) LAMA4 (ENSCLAG00000000130) ENSCLAG00000000080 ENSCLAG00000000058 ENSCLAG00000017382 ENSCLAG00000000824 HDAC2 (ENSCLAG00000000749) ENSCLAG00000000682 #22 HS3ST5 (ENSCLAG00000000666) FRK (ENSCLAG00000000628) ENSCLAG00000000565 NT5DC1 (ENSCLAG00000000283) DSE (ENSCLAG00000000219) CALHM5 (ENSCLAG00000000210) TRAPPC3L (ENSCLAG00000000221) CALHM4 (ENSCLAG00000000213) ENSCLAG00000000206 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 139 SLC25A40 (ENSCLAG00000005807) DBF4 (ENSCLAG00000006005) ADAM22 (ENSCLAG00000006649) SRI (ENSCLAG00000004619) STEAP4 (ENSCLAG00000004703) ZNF804B (ENSCLAG00000006080) TEX47 (ENSCLAG00000006145) ENSCLAG00000006179 STEAP2 (ENSCLAG00000006262) CFAP69 (ENSCLAG00000006387) GTPBP10 (ENSCLAG00000006695) CLDN12 (ENSCLAG00000006816) ENSCLAG00000007061 FZD1 (ENSCLAG00000017832) ENSCLAG00000007977 ENSCLAG00000008125 #22 AKAP9 (ENSCLAG00000005332) CYP51A1 (ENSCLAG00000007702) LRRD1 (ENSCLAG00000007851) KRIT1 (ENSCLAG00000008236) ANKIB1 (ENSCLAG00000003060) ENSCLAG00000003268 ENSCLAG00000003315 ENSCLAG00000003685 PEX1 (ENSCLAG00000003719) RBM48 (ENSCLAG00000003877) ENSCLAG00000003974 FAM133B (ENSCLAG00000004241) CDK6 (ENSCLAG00000004352) SAMD9 (ENSCLAG00000017583) SAMD9L (ENSCLAG00000017656) Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT01030000235089.b ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT01030000235508 ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.u.a.e #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01090000263454 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B ENSGT00940000159338 ENSGT00940000160407 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT01030000235089.b ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT01030000235508 ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.u.a.e #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01090000263454 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B ENSGT00940000159338 ENSGT00940000160407 Muroidea ANCESTRAL SPECIES 57 ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT01030000235089.b ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT01030000235508 ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.u.a.e #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01090000263454 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B ENSGT00940000159338 ENSGT00940000160407 Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1343 Smim17 (ENSNGAG00000000498) Zfp28 (ENSNGAG00000004441) Zfp78 (ENSNGAG00000013957) Gm3854 (ENSNGAG00000000088) Zfp583 (ENSNGAG00000002021) ENSNGAG00000003567 ENSNGAG00000004669 Epp13 (ENSNGAG00000018368) ENSNGAG00000004867 #22 Galp (ENSNGAG00000010881) Zfp444 (ENSNGAG00000011670) ENSNGAG00000011946 Nlrp5 (ENSNGAG00000017882) ENSNGAG00000000842 ENSNGAG00000017777 ENSNGAG00000019176 ENSNGAG00000000402 Epn1 (ENSNGAG00000019737) U2af2 (ENSNGAG00000020369) ENSNGAG00000014427 ENSNGAG00000014996 Zfp580 (ENSNGAG00000003626) Zfp784 (ENSNGAG00000011802) Zfp865 (ENSNGAG00000016004) Muroidea_A DUPLICATION Muroidea_A DUPLICATION Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.e.a #22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.e.a #22 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.e.a #22 Shrew mouse MODERN SPECIES 1 MGP_PahariEiJ_G0015666 Xylb (MGP_PahariEiJ_G0015667) Acvr2b (MGP_PahariEiJ_G0015668) Exog (MGP_PahariEiJ_G0015669) Scn5a (MGP_PahariEiJ_G0015670) Scn10a (MGP_PahariEiJ_G0015671) Scn11a (MGP_PahariEiJ_G0015672) Wdr48 (MGP_PahariEiJ_G0015673) Cx3cr1 (MGP_PahariEiJ_G0015674) Gorasp1 (MGP_PahariEiJ_G0015675) Ttc21a (MGP_PahariEiJ_G0015676) Csrnp1 (MGP_PahariEiJ_G0015677) MGP_PahariEiJ_G0015678 Ccr8 (MGP_PahariEiJ_G0015679) Slc25a38 (MGP_PahariEiJ_G0015680) #21 MGP_PahariEiJ_G0015681 #22 Mobp (MGP_PahariEiJ_G0015682) Myrip (MGP_PahariEiJ_G0015683) Eif1b (MGP_PahariEiJ_G0015684) Entpd3 (MGP_PahariEiJ_G0015685) Rpl14 (MGP_PahariEiJ_G0015686) Ctnnb1 (MGP_PahariEiJ_G0015687) Ulk4 (MGP_PahariEiJ_G0015688) Trak1 (MGP_PahariEiJ_G0015689) MGP_PahariEiJ_G0015690 Lyzl4 (MGP_PahariEiJ_G0015691) Vipr1 (MGP_PahariEiJ_G0015692) Sec22c (MGP_PahariEiJ_G0015693) MGP_PahariEiJ_G0015694 Nktr (MGP_PahariEiJ_G0015695) Zfp651 (MGP_PahariEiJ_G0015696) Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.e.a #22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.e.a #22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.e.a #22 Steppe mouse MODERN SPECIES 703 ENSMSIG00000000803 #22 Ryukyu mouse MODERN SPECIES 18 MGP_CAROLIEiJ_G0032799 Xylb (MGP_CAROLIEiJ_G0032800) Acvr2b (MGP_CAROLIEiJ_G0032801) Exog (MGP_CAROLIEiJ_G0032802) Scn5a (MGP_CAROLIEiJ_G0032803) Scn10a (MGP_CAROLIEiJ_G0032804) Scn11a (MGP_CAROLIEiJ_G0032805) Wdr48 (MGP_CAROLIEiJ_G0032806) Cx3cr1 (MGP_CAROLIEiJ_G0032807) Gorasp1 (MGP_CAROLIEiJ_G0032808) Ttc21a (MGP_CAROLIEiJ_G0032809) Csrnp1 (MGP_CAROLIEiJ_G0032810) MGP_CAROLIEiJ_G0032811 Ccr8 (MGP_CAROLIEiJ_G0032812) Slc25a38 (MGP_CAROLIEiJ_G0032813) #21 MGP_CAROLIEiJ_G0032814 #22 Mobp (MGP_CAROLIEiJ_G0032815) Myrip (MGP_CAROLIEiJ_G0032816) Eif1b (MGP_CAROLIEiJ_G0032817) Entpd3 (MGP_CAROLIEiJ_G0032818) Rpl14 (MGP_CAROLIEiJ_G0032819) MGP_CAROLIEiJ_G0032820 Ctnnb1 (MGP_CAROLIEiJ_G0032821) Ulk4 (MGP_CAROLIEiJ_G0032822) Trak1 (MGP_CAROLIEiJ_G0032823) MGP_CAROLIEiJ_G0032824 Lyzl4 (MGP_CAROLIEiJ_G0032825) Vipr1 (MGP_CAROLIEiJ_G0032826) Sec22c (MGP_CAROLIEiJ_G0032827) MGP_CAROLIEiJ_G0032828 Nktr (MGP_CAROLIEiJ_G0032829) Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.e.a #22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.e.a #22 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 1 Oxct1 (ENSCGRG00001022982) Rimoc1 (ENSCGRG00001020182) Fbxo4 (ENSCGRG00001019798) Ghr (ENSCGRG00001019428) Ccdc152 (ENSCGRG00001022348) ENSCGRG00001007226 Zfp131 (ENSCGRG00001021210) Nim1k (ENSCGRG00001021680) Hmgcs1 (ENSCGRG00001021007) Ccl28 (ENSCGRG00001020584) Tmem267 (ENSCGRG00001003827) 4833420G17Rik (ENSCGRG00001011989) Paip1 (ENSCGRG00001009535) ENSCGRG00001021827 ENSCGRG00001013713 ENSCGRG00001013480 #22 ENSCGRG00001006400 Fgf10 (ENSCGRG00001005274) Mrps30 (ENSCGRG00001003133) ENSCGRG00001006656 Hcn1 (ENSCGRG00001024192) Emb (ENSCGRG00001023682) ENSCGRG00001006936 Parp8 (ENSCGRG00001019353) ENSCGRG00001024228 Isl1 (ENSCGRG00001000561) ENSCGRG00001024282 ENSCGRG00001000834 Pelo (ENSCGRG00001024665) Itga1 (ENSCGRG00001020614) Itga2 (ENSCGRG00001021951) Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.e.a #22 Northern American deer mouse DUPLICATION Northern American deer mouse MODERN SPECIES 7 Sesn1 (ENSPEMG00000012311) Cep57l1 (ENSPEMG00000011459) ENSPEMG00000010187 ENSPEMG00000025622 Ppil6 (ENSPEMG00000005372) Smpd2 (ENSPEMG00000018109) Mical1 (ENSPEMG00000018317) Zbtb24 (ENSPEMG00000009212) ENSPEMG00000018815 ENSPEMG00000029055 Fig4 (ENSPEMG00000010637) Gpr6 (ENSPEMG00000015024) Wasf1 (ENSPEMG00000014759) Cdc40 (ENSPEMG00000018092) Mettl24 (ENSPEMG00000018932) ENSPEMG00000003728 #22 Ddo (ENSPEMG00000026538) ENSPEMG00000014404 Cdk19 (ENSPEMG00000009095) ENSPEMG00000013613 Gtf3c6 (ENSPEMG00000013420) Rpf2 (ENSPEMG00000011413) Slc16a10 (ENSPEMG00000026594) Mfsd4b1 (ENSPEMG00000019229) Mfsd4b5 (ENSPEMG00000014064) ENSPEMG00000019920 ENSPEMG00000019725 Mfsd4b4 (ENSPEMG00000019580) Rev3l (ENSPEMG00000019856) Traf3ip2 (ENSPEMG00000029352) Fyn (ENSPEMG00000019599) Northern American deer mouse MODERN SPECIES 475 ENSPEMG00000028394 ENSPEMG00000026482 ENSPEMG00000026764 Agtr2 (ENSPEMG00000003517) Slc6a14 (ENSPEMG00000022771) ENSPEMG00000028133 ENSPEMG00000027715 ENSPEMG00000025640 ENSPEMG00000030303 ENSPEMG00000027120 ENSPEMG00000026541 ENSPEMG00000030325 Radx (ENSPEMG00000023178) Rnf128 (ENSPEMG00000003063) Tbc1d8b (ENSPEMG00000018650) ENSPEMG00000017766 #22 Cldn2 (ENSPEMG00000012046) Morc4 (ENSPEMG00000008507) Rbm41 (ENSPEMG00000015991) Nup62cl (ENSPEMG00000009735) ENSPEMG00000000365 Frmpd3 (ENSPEMG00000010595) ENSPEMG00000005120 Tsc22d3 (ENSPEMG00000017138) ENSPEMG00000031129 Mid2 (ENSPEMG00000010307) Tex13b (ENSPEMG00000000693) Vsig1 (ENSPEMG00000000042) Psmd10 (ENSPEMG00000015957) ENSPEMG00000000703 Col4a6 (ENSPEMG00000007750) Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT01030000235089.b ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT01030000235508 ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.u.a.e.e.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01090000263454 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B ENSGT00940000159338 ENSGT00940000160407 Murinae ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT01030000235089.b ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT01030000235508 ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.u.a.e.e.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01090000263454 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B ENSGT00940000159338 ENSGT00940000160407 ENSGT00940000158548 Mus ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT01030000235089.b ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT01030000235508 ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.u.a.e.e.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01090000263454 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B ENSGT00940000159338 ENSGT00940000160407 ENSGT00940000158548 Mus_A ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT01030000235089.b ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT01030000235508 ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.u.a.e.e.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01090000263454 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B ENSGT00940000159338 ENSGT00940000160407 ENSGT00940000158548 Mus_B ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT01030000235089.b ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT01030000235508 ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.u.a.e.e.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01090000263454 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B ENSGT00940000159338 ENSGT00940000160407 ENSGT00940000158548 Mouse MODERN SPECIES 18 Acaa1a (ENSMUSG00000036138) Xylb (ENSMUSG00000035769) Acvr2b (ENSMUSG00000061393) Exog (ENSMUSG00000042787) Scn5a (ENSMUSG00000032511) Scn10a (ENSMUSG00000034533) Scn11a (ENSMUSG00000034115) Wdr48 (ENSMUSG00000032512) Cx3cr1 (ENSMUSG00000052336) Gorasp1 (ENSMUSG00000032513) Ttc21a (ENSMUSG00000032514) Csrnp1 (ENSMUSG00000032515) Xirp1 (ENSMUSG00000079243) Ccr8 (ENSMUSG00000042262) Slc25a38 (ENSMUSG00000032519) #21 Rpsa 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ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B ENSGT00940000159338 ENSGT00940000160407 ENSGT00940000158548 ENSGT00940000160089 spretus MODERN SPECIES 18 MGP_SPRETEiJ_G0033947 Xylb (MGP_SPRETEiJ_G0033948) Acvr2b (MGP_SPRETEiJ_G0033949) Exog (MGP_SPRETEiJ_G0033950) Scn5a (MGP_SPRETEiJ_G0033951) Scn10a (MGP_SPRETEiJ_G0033952) Scn11a (MGP_SPRETEiJ_G0033953) Wdr48 (MGP_SPRETEiJ_G0033954) Cx3cr1 (MGP_SPRETEiJ_G0033955) Gorasp1 (MGP_SPRETEiJ_G0033956) Ttc21a (MGP_SPRETEiJ_G0033957) Csrnp1 (MGP_SPRETEiJ_G0033958) MGP_SPRETEiJ_G0033959 Ccr8 (MGP_SPRETEiJ_G0033960) Slc25a38 (MGP_SPRETEiJ_G0033961) #21 Rpsa (MGP_SPRETEiJ_G0033962) #22 Mobp (MGP_SPRETEiJ_G0033963) Myrip (MGP_SPRETEiJ_G0033964) Eif1b (MGP_SPRETEiJ_G0033965) Entpd3 (MGP_SPRETEiJ_G0033966) Rpl14 (MGP_SPRETEiJ_G0033967) Ctnnb1 (MGP_SPRETEiJ_G0033968) Ulk4 (MGP_SPRETEiJ_G0033969) Trak1 (MGP_SPRETEiJ_G0033970) MGP_SPRETEiJ_G0033971 MGP_SPRETEiJ_G0033972 Lyzl4 (MGP_SPRETEiJ_G0033973) Vipr1 (MGP_SPRETEiJ_G0033974) Sec22c 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Prpf40a (ENSMSIG00000028498) Arl6ip6 (ENSMSIG00000028565) ENSMSIG00000028572 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.f #22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.f #22 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 20 ENSPEMG00000025013 ENSPEMG00000026694 ENSPEMG00000025370 Mrps22 (ENSPEMG00000020399) Copb2 (ENSPEMG00000015558) Rbp2 (ENSPEMG00000016242) Rbp1 (ENSPEMG00000020449) Nmnat3 (ENSPEMG00000020493) Clstn2 (ENSPEMG00000020916) Trim42 (ENSPEMG00000020887) Slc25a36 (ENSPEMG00000029457) Spsb4 (ENSPEMG00000021848) Pxylp1 (ENSPEMG00000027594) ENSPEMG00000001384 Zbtb38 (ENSPEMG00000021180) ENSPEMG00000020968 #22 Rasa2 (ENSPEMG00000020689) Gm28729 (ENSPEMG00000021490) ENSPEMG00000020541 ENSPEMG00000025894 Tfdp2 (ENSPEMG00000020459) Gk5 (ENSPEMG00000021213) ENSPEMG00000028629 Xrn1 (ENSPEMG00000020610) Atr (ENSPEMG00000022407) Pls1 (ENSPEMG00000023583) Trpc1 (ENSPEMG00000021151) Pcolce2 (ENSPEMG00000021235) Paqr9 (ENSPEMG00000021256) U2surp (ENSPEMG00000020825) Chst2 (ENSPEMG00000019658) Prairie vole DUPLICATION Prairie vole MODERN SPECIES 14 ENSMOCG00000003804 Ddx59 (ENSMOCG00000016551) ENSMOCG00000005363 Camsap2 (ENSMOCG00000016651) ENSMOCG00000015576 Mroh3 (ENSMOCG00000021368) Kif21b (ENSMOCG00000019937) Cacna1s (ENSMOCG00000022841) Tmem9 (ENSMOCG00000021738) Pkp1 (ENSMOCG00000016418) Tnnt2 (ENSMOCG00000012562) Lad1 (ENSMOCG00000012808) Tnni1 (ENSMOCG00000013469) Phlda3 (ENSMOCG00000007137) Csrp1 (ENSMOCG00000003621) ENSMOCG00000018588 #22 Rab7b (ENSMOCG00000015192) ENSMOCG00000003765 ENSMOCG00000012209 Nav1 (ENSMOCG00000020147) Ipo9 (ENSMOCG00000022988) Shisa4 (ENSMOCG00000022223) Lmod1 (ENSMOCG00000021948) ENSMOCG00000011417 Rnpep (ENSMOCG00000022091) Elf3 (ENSMOCG00000011101) Gpr37l1 (ENSMOCG00000015010) Arl8a (ENSMOCG00000011687) Ptpn7 (ENSMOCG00000019802) Ptprv (ENSMOCG00000016711) Lgr6 (ENSMOCG00000001284) Prairie vole MODERN SPECIES 7 Itgb5 (ENSMOCG00000021055) Umps (ENSMOCG00000017158) Kalrn (ENSMOCG00000002780) Ropn1 (ENSMOCG00000009990) Ccdc14 (ENSMOCG00000020626) Mylk (ENSMOCG00000020331) Hacd2 (ENSMOCG00000008110) Adcy5 (ENSMOCG00000018853) Sec22a (ENSMOCG00000010833) ENSMOCG00000017023 ENSMOCG00000004499 Pdia5 (ENSMOCG00000015699) Sema5b (ENSMOCG00000001666) Slc49a4 (ENSMOCG00000012213) Hspbap1 (ENSMOCG00000020288) ENSMOCG00000007676 #22 Parp14 (ENSMOCG00000021121) ENSMOCG00000013470 ENSMOCG00000008192 ENSMOCG00000009728 Or5h19 (ENSMOCG00000020001) Or5h17 (ENSMOCG00000016914) ENSMOCG00000009456 ENSMOCG00000012577 Cldnd1 (ENSMOCG00000014045) Gpr15 (ENSMOCG00000009679) Cpox (ENSMOCG00000017490) ENSMOCG00000020849 ENSMOCG00000001290 Dcbld2 (ENSMOCG00000003711) ENSMOCG00000007463 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.f #22 Chinese hamster chok1gshd DUPLICATION Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 1 Paip1 (ENSCGRG00001009535) 4833420G17Rik (ENSCGRG00001011989) Tmem267 (ENSCGRG00001003827) Ccl28 (ENSCGRG00001020584) Hmgcs1 (ENSCGRG00001021007) Nim1k (ENSCGRG00001021680) Zfp131 (ENSCGRG00001021210) ENSCGRG00001007226 Ccdc152 (ENSCGRG00001022348) Ghr (ENSCGRG00001019428) Fbxo4 (ENSCGRG00001019798) Rimoc1 (ENSCGRG00001020182) Oxct1 (ENSCGRG00001022982) Plcxd3 (ENSCGRG00001023897) C6 (ENSCGRG00001024316) ENSCGRG00001002969 #22 Mroh2b (ENSCGRG00001004445) C7 (ENSCGRG00001007548) Card6 (ENSCGRG00001009142) ENSCGRG00001012869 Prkaa1 (ENSCGRG00001001697) Ttc33 (ENSCGRG00001019815) Ptger4 (ENSCGRG00001020213) ENSCGRG00001020504 ENSCGRG00001008646 ENSCGRG00001012741 Dab2 (ENSCGRG00001021141) C9 (ENSCGRG00001021695) Fyb (ENSCGRG00001022410) Rictor (ENSCGRG00001009015) Osmr (ENSCGRG00001017859) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 165 Sult1c1 (ENSCGRG00001019875) Sult1c2 (ENSCGRG00001010992) ENSCGRG00001014459 ENSCGRG00001015875 ENSCGRG00001017629 Slc5a7 (ENSCGRG00001019612) ENSCGRG00001023065 #22 St6gal2 (ENSCGRG00001015136) Uxs1 (ENSCGRG00001022493) Ecrg4 (ENSCGRG00001008420) Nck2 (ENSCGRG00001010470) Fhl2 (ENSCGRG00001019694) AI597479 (ENSCGRG00001000237) Tgfbrap1 (ENSCGRG00001001074) Gpr45 (ENSCGRG00001001563) Mrps9 (ENSCGRG00001012228) Pou3f3 (ENSCGRG00001001262) Tmem182 (ENSCGRG00001013568) Mfsd9 (ENSCGRG00001020127) Slc9a2 (ENSCGRG00001020868) Slc9a4 (ENSCGRG00001013202) Il18rap (ENSCGRG00001020521) Primates ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT01030000235089 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00910000148110 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.u.a.e #22 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.n #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00910000147527 ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01090000263454 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a.l ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e #22 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e #22 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e #22 Coquerels sifaka DUPLICATION Coquerels sifaka MODERN SPECIES 190 ADAMTS5 (ENSPCOG00000016255) ADAMTS1 (ENSPCOG00000021162) ENSPCOG00000023352 APP (ENSPCOG00000017074) ENSPCOG00000027632 ATP5PF (ENSPCOG00000016705) JAM2 (ENSPCOG00000028142) MRPL39 (ENSPCOG00000026820) ENSPCOG00000019852 #22 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 593 GLI3 (ENSPCOG00000002002) INHBA (ENSPCOG00000021472) SUGCT (ENSPCOG00000023610) MPLKIP (ENSPCOG00000007076) CDK13 (ENSPCOG00000020869) ENSPCOG00000028359 #22 RALA (ENSPCOG00000018071) YAE1 (ENSPCOG00000012495) POU6F2 (ENSPCOG00000022128) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00910000148110 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.u.a.e #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00910000147527 ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01090000263454 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a.l ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 Simiiformes DUPLICATION Simiiformes DUPLICATION Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.a #22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.a #22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.a #22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.a #22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.a #22 Macaca ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000157249 ENSGT00940000154453.b.a.b.a ENSGT00940000162639 ENSGT00910000146869 ENSGT00910000147537 ENSGT00940000159743 ENSGT00940000158720.c.b ENSGT00940000158720.c.a ENSGT00940000159232.h.b ENSGT00940000159232.h.a ENSGT00940000156190.h ENSGT00390000004840 ENSGT00390000012547.b.b.b ENSGT00940000156307.b ENSGT00940000159094 ENSGT00950000183099.u.a.e.i.a #22 ENSGT00940000156597.b ENSGT00640000091496 ENSGT00390000001447.p.b ENSGT00910000148013 ENSGT00530000063688.a ENSGT00940000157652 ENSGT01030000234570.d.a ENSGT00530000063186.b.b ENSGT00940000157192 ENSGT00940000154695 ENSGT00940000157137 ENSGT00940000155053 ENSGT00720000108792.B ENSGT00940000156532 ENSGT00940000157295 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000157249 ENSGT00940000154453.b.a.b.a ENSGT00940000162639 ENSGT00910000147537 ENSGT00940000159743 ENSGT00940000158720.c.b ENSGT00940000158720.c.a ENSGT00940000159232.h.b ENSGT00940000159232.h.a ENSGT00940000156190.h ENSGT00390000004840 ENSGT00390000012547.b.b.b ENSGT00940000156307.b ENSGT00940000159094 ENSGT00960000191503.d ENSGT00950000183099.u.a.e.i.a #22 ENSGT00940000156597.b ENSGT00640000091496 ENSGT00390000001447.q ENSGT00530000063688.a ENSGT01030000234570.d.a ENSGT00530000063186.b.b ENSGT00940000157192 ENSGT00940000154695 ENSGT00390000002231.d.b ENSGT00940000157137 ENSGT00940000155053 ENSGT00720000108792.B ENSGT00940000156532 ENSGT00940000157295 ENSGT00390000004553 Rhesus MODERN SPECIES 3 CCNYL1 (ENSMMUG00000020211) FZD5 (ENSMMUG00000057651) PLEKHM3 (ENSMMUG00000008113) ENSMMUG00000060339 ENSMMUG00000059636 ENSMMUG00000045625 CRYGD (ENSMMUG00000052742) CRYGC (ENSMMUG00000056938) CRYGB (ENSMMUG00000010871) CRYGA (ENSMMUG00000049611) C12H2orf80 (ENSMMUG00000014299) IDH1 (ENSMMUG00000016077) PIKFYVE (ENSMMUG00000017524) PTH2R (ENSMMUG00000005295) ENSMMUG00000051180 ENSMMUG00000004941 #22 MAP2 (ENSMMUG00000018741) UNC80 (ENSMMUG00000002809) RPE (ENSMMUG00000010513) KANSL1L (ENSMMUG00000010515) MYL1 (ENSMMUG00000010519) LANCL1 (ENSMMUG00000054937) CPS1 (ENSMMUG00000010508) ERBB4 (ENSMMUG00000001674) ENSMMUG00000058114 ENSMMUG00000061342 IKZF2 (ENSMMUG00000000381) SPAG16 (ENSMMUG00000000382) ENSMMUG00000064880 ENSMMUG00000065281 VWC2L (ENSMMUG00000054519) Crab-eating macaque MODERN SPECIES 3 ENSMFAG00000041805 CREB1 (ENSMFAG00000039629) CCNYL1 (ENSMFAG00000001361) ENSMFAG00000009381 PLEKHM3 (ENSMFAG00000033450) ENSMFAG00000064501 ENSMFAG00000065752 CRYGD (ENSMFAG00000052291) CRYGC (ENSMFAG00000047676) CRYGB (ENSMFAG00000052040) C2orf80 (ENSMFAG00000003892) IDH1 (ENSMFAG00000037839) PIKFYVE (ENSMFAG00000041669) PTH2R (ENSMFAG00000000697) ENSMFAG00000049469 ENSMFAG00000040051 #22 MAP2 (ENSMFAG00000037191) UNC80 (ENSMFAG00000038823) ENSMFAG00000001492 KANSL1L (ENSMFAG00000031878) MYL1 (ENSMFAG00000031549) LANCL1 (ENSMFAG00000041765) CPS1 (ENSMFAG00000044079) ERBB4 (ENSMFAG00000042352) ENSMFAG00000047331 ENSMFAG00000059453 IKZF2 (ENSMFAG00000049387) SPAG16 (ENSMFAG00000036303) ENSMFAG00000056823 VWC2L (ENSMFAG00000004450) BARD1 (ENSMFAG00000032566) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.a #22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.a #22 Drill MODERN SPECIES 1499 ENSMLEG00000017306 #22 ENSMLEG00000038774 MAP2 (ENSMLEG00000031717) UNC80 (ENSMLEG00000030480) ENSMLEG00000033066 KANSL1L (ENSMLEG00000043267) ACADL (ENSMLEG00000040139) MYL1 (ENSMLEG00000041044) ENSMLEG00000012488 LANCL1 (ENSMLEG00000033475) CPS1 (ENSMLEG00000038945) ENSMLEG00000011832 Olive baboon MODERN SPECIES 1 CCNYL1 (ENSPANG00000011206) FZD5 (ENSPANG00000004676) ENSPANG00000050051 ENSPANG00000049745 PLEKHM3 (ENSPANG00000020994) ENSPANG00000041891 ENSPANG00000040505 CRYGD (ENSPANG00000039491) CRYGC (ENSPANG00000051332) CRYGB (ENSPANG00000049951) IDH1 (ENSPANG00000005239) C2orf80 (ENSPANG00000033159) PIKFYVE (ENSPANG00000010442) PTH2R (ENSPANG00000002436) ENSPANG00000039642 ENSPANG00000051073 #22 MAP2 (ENSPANG00000019944) UNC80 (ENSPANG00000024759) ENSPANG00000005182 KANSL1L (ENSPANG00000000746) MYL1 (ENSPANG00000005181) ENSPANG00000050010 LANCL1 (ENSPANG00000043351) CPS1 (ENSPANG00000008478) ERBB4 (ENSPANG00000020599) ENSPANG00000048059 ENSPANG00000050738 IKZF2 (ENSPANG00000016694) SPAG16 (ENSPANG00000011416) ENSPANG00000037591 VWC2L (ENSPANG00000046744) Vervet Monkey MODERN SPECIES 1 CPO (ENSCSAG00000010143) KLF7 (ENSCSAG00000010117) CREB1 (ENSCSAG00000010111) METTL21A (ENSCSAG00000010107) CCNYL1 (ENSCSAG00000010093) FZD5 (ENSCSAG00000018771) PLEKHM3 (ENSCSAG00000010071) CRYGD (ENSCSAG00000010066) CRYGC (ENSCSAG00000010063) CRYGB (ENSCSAG00000010058) CRYGA (ENSCSAG00000010050) C2orf80 (ENSCSAG00000010044) IDH1 (ENSCSAG00000010039) PIKFYVE (ENSCSAG00000010033) PTH2R (ENSCSAG00000010012) ENSCSAG00000018772 #22 ENSCSAG00000009983 MAP2 (ENSCSAG00000009974) UNC80 (ENSCSAG00000009965) ENSCSAG00000009931 KANSL1L (ENSCSAG00000009924) ACADL (ENSCSAG00000009898) MYL1 (ENSCSAG00000009850) LANCL1 (ENSCSAG00000009844) CPS1 (ENSCSAG00000009759) ENSCSAG00000009490 ENSCSAG00000009457 IKZF2 (ENSCSAG00000009405) ENSCSAG00000009388 VWC2L (ENSCSAG00000009346) BARD1 (ENSCSAG00000009338) Hominoidea DUPLICATION Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.a.a #22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.a.a #22 Homo/Pan/Gorilla group DUPLICATION Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.a.a.a #22 Gorilla MODERN SPECIES 5 NOXRED1 (ENSGGOG00000043069) SAMD15 (ENSGGOG00000022049) TMED8 (ENSGGOG00000013168) GSTZ1 (ENSGGOG00000006215) POMT2 (ENSGGOG00000006199) NGB (ENSGGOG00000006195) TMEM63C (ENSGGOG00000006177) ZDHHC22 (ENSGGOG00000010146) CIPC (ENSGGOG00000036224) IRF2BPL (ENSGGOG00000002839) ENSGGOG00000040029 LRRC74A (ENSGGOG00000010758) ANGEL1 (ENSGGOG00000017040) ENSGGOG00000041102 VASH1 (ENSGGOG00000017033) ENSGGOG00000015155 #22 ENSGGOG00000024523 ESRRB (ENSGGOG00000002238) GPATCH2L (ENSGGOG00000005602) ENSGGOG00000042391 IFT43 (ENSGGOG00000001483) TGFB3 (ENSGGOG00000001481) TTLL5 (ENSGGOG00000016703) ERG28 (ENSGGOG00000006493) ENSGGOG00000036834 FLVCR2 (ENSGGOG00000009014) BATF (ENSGGOG00000002267) JDP2 (ENSGGOG00000043596) FOS (ENSGGOG00000000527) TMED10 (ENSGGOG00000007453) NEK9 (ENSGGOG00000027555) Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.a.a.a #22 Pan ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.a.a.a #22 Bonobo MODERN SPECIES 5 SAMD15 (ENSPPAG00000043267) TMED8 (ENSPPAG00000032854) GSTZ1 (ENSPPAG00000041126) POMT2 (ENSPPAG00000029527) NGB (ENSPPAG00000040520) TMEM63C (ENSPPAG00000034996) ZDHHC22 (ENSPPAG00000009773) CIPC (ENSPPAG00000042841) ENSPPAG00000035248 ENSPPAG00000041887 ENSPPAG00000040100 LRRC74A (ENSPPAG00000037806) ANGEL1 (ENSPPAG00000029410) ENSPPAG00000018562 VASH1 (ENSPPAG00000038241) ENSPPAG00000027182 #22 ESRRB (ENSPPAG00000035482) GPATCH2L (ENSPPAG00000036494) ENSPPAG00000040454 IFT43 (ENSPPAG00000035630) TGFB3 (ENSPPAG00000031753) TTLL5 (ENSPPAG00000041206) ERG28 (ENSPPAG00000038048) ENSPPAG00000035673 ENSPPAG00000024550 BATF (ENSPPAG00000038433) JDP2 (ENSPPAG00000039076) FOS (ENSPPAG00000021153) TMED10 (ENSPPAG00000032562) NEK9 (ENSPPAG00000017463) ZC2HC1C (ENSPPAG00000032553) Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.a.a.b #22 Gorilla MODERN SPECIES 523 ENSGGOG00000027167 ENSGGOG00000038151 DIAPH2 (ENSGGOG00000002859) ENSGGOG00000038270 FAM133A (ENSGGOG00000043974) NAP1L3 (ENSGGOG00000016989) ENSGGOG00000025902 ENSGGOG00000039790 ENSGGOG00000025897 ENSGGOG00000042618 ENSGGOG00000008584 PABPC5 (ENSGGOG00000007622) ENSGGOG00000037634 ENSGGOG00000036979 CPXCR1 (ENSGGOG00000026865) RPSA (ENSGGOG00000036643) #22 KLHL4 (ENSGGOG00000002307) DACH2 (ENSGGOG00000007231) ENSGGOG00000040803 CHM (ENSGGOG00000022912) POF1B (ENSGGOG00000016908) ZNF711 (ENSGGOG00000006110) SATL1 (ENSGGOG00000016333) ENSGGOG00000016329 HDX (ENSGGOG00000005551) RPS6KA6 (ENSGGOG00000016474) CYLC1 (ENSGGOG00000001587) POU3F4 (ENSGGOG00000027353) ENSGGOG00000025534 SH3BGRL (ENSGGOG00000009664) HMGN5 (ENSGGOG00000016479) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.a.b #22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.a.b #22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.a.b #22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.a.b #22 Pan ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000001285 ENSGT00530000063626.b ENSGT00940000157998 ENSGT00940000157777 ENSGT00940000155040.b ENSGT00550000074930.ab ENSGT00940000157033 ENSGT00940000155811 ENSGT00940000153832.f ENSGT00730000110905.b ENSGT00940000158580 ENSGT00530000063539.b ENSGT00390000005532.e.b.d ENSGT00730000111164 ENSGT00390000012080 ENSGT00950000183099.u.a.e.i.a.b #22 ENSGT01020000230346.A.cb.b ENSGT00390000004106 ENSGT00510000048550 ENSGT00950000183124.B ENSGT00390000007831 ENSGT01080000257336.b.e.b.a.b.a.e.a ENSGT01080000257336.b.e.b.a.b.a.e.b ENSGT01080000257336.b.e.b.a.b.a.f ENSGT01080000257336.b.e.b.a.b.b ENSGT00510000048671 ENSGT00390000014894 ENSGT00940000157013 ENSGT00390000014507.a ENSGT00390000012501 ENSGT00390000018612.a.b Bonobo MODERN SPECIES 3 RAB3IP 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CPSF6 (ENSPTRG00000005205) CPM (ENSPTRG00000005204) MDM2 (ENSPTRG00000005203) ENSPTRG00000044648 SLC35E3 (ENSPTRG00000005201) NUP107 (ENSPTRG00000005200) ENSPTRG00000044556 RAP1B (ENSPTRG00000005197) ENSPTRG00000042763 #22 ENSPTRG00000045123 MDM1 (ENSPTRG00000005196) IL22 (ENSPTRG00000005195) IL26 (ENSPTRG00000005194) IFNG (ENSPTRG00000005193) SLCO1B3 (ENSPTRG00000044231) ENSPTRG00000004750 SLCO1B1 (ENSPTRG00000004754) SLCO1A2 (ENSPTRG00000004755) IAPP (ENSPTRG00000004756) PYROXD1 (ENSPTRG00000004757) RECQL (ENSPTRG00000004758) GOLT1B (ENSPTRG00000004759) SPX (ENSPTRG00000004760) GYS2 (ENSPTRG00000004761) Gibbon MODERN SPECIES 10 PPARD (ENSNLEG00000008621) DEF6 (ENSNLEG00000008604) ENSNLEG00000008581 SCUBE3 (ENSNLEG00000008527) TCP11 (ENSNLEG00000008486) ANKS1A (ENSNLEG00000008483) TAF11 (ENSNLEG00000008457) BLTP3A (ENSNLEG00000008400) SNRPC (ENSNLEG00000034810) ENSNLEG00000027593 ENSNLEG00000031071 ENSNLEG00000035761 SPDEF (ENSNLEG00000008374) PACSIN1 (ENSNLEG00000008343) ENSNLEG00000008336 ENSNLEG00000033500 #22 NUDT3 (ENSNLEG00000029692) ENSNLEG00000033901 SMIM29 (ENSNLEG00000032266) HMGA1 (ENSNLEG00000031539) ENSNLEG00000034916 GRM4 (ENSNLEG00000008487) MLN (ENSNLEG00000008478) ENSNLEG00000008472 IP6K3 (ENSNLEG00000008448) UQCC2 (ENSNLEG00000035324) ITPR3 (ENSNLEG00000008373) BAK1 (ENSNLEG00000028170) ZBTB9 (ENSNLEG00000008348) ENSNLEG00000033973 PHF1 (ENSNLEG00000008320) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.a #22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.a #22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.a #22 Bolivian squirrel monkey DUPLICATION Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 42 HTATIP2 (ENSSBOG00000019955) DBX1 (ENSSBOG00000028890) ENSSBOG00000034512 NAV2 (ENSSBOG00000031555) E2F8 (ENSSBOG00000014864) CSRP3 (ENSSBOG00000026732) ZDHHC13 (ENSSBOG00000023472) ENSSBOG00000023462 PTPN5 (ENSSBOG00000022094) IGSF22 (ENSSBOG00000035057) TMEM86A (ENSSBOG00000022647) SPTY2D1 (ENSSBOG00000019822) ENSSBOG00000018184 UEVLD (ENSSBOG00000020574) ENSSBOG00000023915 ENSSBOG00000016234 #22 TSG101 (ENSSBOG00000032898) LDHAL6A (ENSSBOG00000032789) LDHC (ENSSBOG00000029573) ENSSBOG00000023979 GTF2H1 (ENSSBOG00000035194) HPS5 (ENSSBOG00000034848) ENSSBOG00000025130 SAA4 (ENSSBOG00000035220) SAAL1 (ENSSBOG00000000873) TPH1 (ENSSBOG00000021704) SERGEF (ENSSBOG00000021636) KCNC1 (ENSSBOG00000032934) MYOD1 (ENSSBOG00000032168) OTOG (ENSSBOG00000031057) USH1C (ENSSBOG00000030041) Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 83 U2SURP (ENSSBOG00000027984) CHST2 (ENSSBOG00000019094) SLC9A9 (ENSSBOG00000029001) DIPK2A (ENSSBOG00000027031) PLOD2 (ENSSBOG00000030460) PLSCR4 (ENSSBOG00000034850) PLSCR2 (ENSSBOG00000021577) PLSCR1 (ENSSBOG00000020555) PLSCR5 (ENSSBOG00000021485) RYK (ENSSBOG00000024795) AMOTL2 (ENSSBOG00000030616) ENSSBOG00000031944 CEP63 (ENSSBOG00000031149) KY (ENSSBOG00000033829) EPHB1 (ENSSBOG00000021552) ENSSBOG00000027208 #22 PPP2R3A (ENSSBOG00000022624) MSL2 (ENSSBOG00000028823) PCCB (ENSSBOG00000033579) STAG1 (ENSSBOG00000025180) ENSSBOG00000010558 SLC35G2 (ENSSBOG00000019732) ENSSBOG00000015996 NCK1 (ENSSBOG00000033794) IL20RB (ENSSBOG00000030039) SOX14 (ENSSBOG00000013214) ENSSBOG00000018267 CLDN18 (ENSSBOG00000029781) DZIP1L (ENSSBOG00000028314) A4GNT (ENSSBOG00000035068) DBR1 (ENSSBOG00000032048) Simiiformes DUPLICATION Simiiformes DUPLICATION Simiiformes DUPLICATION Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.a.a #22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.a.a #22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.a.a #22 Marmoset MODERN SPECIES 16 ENSCJAG00000079274 TINAG (ENSCJAG00000010887) MLIP (ENSCJAG00000010939) LRRC1 (ENSCJAG00000010969) KLHL31 (ENSCJAG00000011053) GCLC (ENSCJAG00000011063) ELOVL5 (ENSCJAG00000011119) GCM1 (ENSCJAG00000079175) FBXO9 (ENSCJAG00000042701) CILK1 (ENSCJAG00000011214) GSTA4 (ENSCJAG00000011268) ENSCJAG00000034823 ENSCJAG00000060605 ENSCJAG00000066217 TMEM14A (ENSCJAG00000011309) ENSCJAG00000082568 #22 TRAM2 (ENSCJAG00000011314) EFHC1 (ENSCJAG00000011346) PAQR8 (ENSCJAG00000011379) ENSCJAG00000080195 ENSCJAG00000080533 ENSCJAG00000011389 IL17F (ENSCJAG00000043579) IL17A (ENSCJAG00000011432) PKHD1 (ENSCJAG00000011434) ENSCJAG00000078173 TFAP2B (ENSCJAG00000011561) TFAP2D (ENSCJAG00000011580) ENSCJAG00000083090 DEFB112 (ENSCJAG00000052292) DEFB110 (ENSCJAG00000076216) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.a.a #22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.a.a #22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.a.a #22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000007266 ENSGT00950000182971.B.b.c.a.b ENSGT00950000182870.a.a.b.j ENSGT00530000063948.a ENSGT00940000162147 ENSGT00390000014801 ENSGT00950000182904.a.a.a ENSGT00940000157243 ENSGT00940000158417.b ENSGT00910000147245 ENSGT00940000160166 ENSGT00390000006620 ENSGT00940000159107 ENSGT00390000014682.u.b ENSGT00940000161919 ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.a.a #22 ENSGT00940000160804 ENSGT00940000162648 ENSGT00390000018324.e ENSGT00390000003453.b.b ENSGT00510000047366 ENSGT00510000048901 ENSGT01030000234542.b.a.a.b.a.b.l ENSGT00390000009491.c ENSGT00950000182891.a.a.b.a.b.a.s.d ENSGT00940000159989 ENSGT00390000016136 ENSGT00940000160806 ENSGT00940000157062 ENSGT00390000010652.B ENSGT00940000160472 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000007266 ENSGT00950000182971.B.b.c.a.b ENSGT00950000182870.a.a.b.j ENSGT00530000063948.a ENSGT00940000162147 ENSGT00390000014801 ENSGT00950000182904.a.a.a ENSGT00940000157243 ENSGT00940000158417.b ENSGT00910000147245 ENSGT00940000160166 ENSGT00390000006620 ENSGT00940000159107 ENSGT00390000014682.u.b ENSGT00940000161919 ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.a.a #22 ENSGT00940000160804 ENSGT00940000162648 ENSGT00390000018324.e ENSGT00390000003453.b.b ENSGT00510000047366 ENSGT00510000048901 ENSGT01030000234542.b.a.a.b.a.b.l ENSGT00390000009491.c ENSGT00950000182891.a.a.b.a.b.a.s.d ENSGT00940000159989 ENSGT00390000016136 ENSGT00940000160806 ENSGT00940000157062 ENSGT00390000010652.B ENSGT00940000160472 Pan ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007266 ENSGT00950000182971.B.b.c.a.b ENSGT00950000182870.a.a.b.j ENSGT00530000063948.a ENSGT00940000162147 ENSGT00390000014801 ENSGT00950000182904.a.a.a ENSGT00940000157243 ENSGT00940000158417.b ENSGT00910000147245 ENSGT00940000160166 ENSGT00390000006620 ENSGT00940000159107 ENSGT00390000014682.u.b ENSGT00940000161919 ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.a.a #22 ENSGT00940000160804 ENSGT00940000162648 ENSGT00390000018324.e ENSGT00390000003453.b.b ENSGT00510000047366 ENSGT00510000048901 ENSGT01030000234542.b.a.a.b.a.b.l ENSGT00390000009491.c ENSGT00950000182891.a.a.b.a.b.a.s.d ENSGT00940000159989 ENSGT00390000016136 ENSGT00940000160806 ENSGT00940000157062 ENSGT00390000010652.B ENSGT00940000160472 Bonobo MODERN SPECIES CKS1B (ENSPPAG00000038950) SHC1 (ENSPPAG00000030626) PYGO2 (ENSPPAG00000043901) 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(ENSPTRG00000001387) TDRD10 (ENSPTRG00000001386) SHE (ENSPTRG00000001385) ENSPTRG00000047720 IL6R (ENSPTRG00000001383) ENSPTRG00000045345 #22 ATP8B2 (ENSPTRG00000001382) AQP10 (ENSPTRG00000001381) HAX1 (ENSPTRG00000001380) UBAP2L (ENSPTRG00000001379) C1H1orf43 (ENSPTRG00000001378) CFAP141 (ENSPTRG00000001377) TPM3 (ENSPTRG00000001375) NUP210L (ENSPTRG00000001372) RPS27 (ENSPTRG00000001371) RAB13 (ENSPTRG00000001370) JTB (ENSPTRG00000001369) CREB3L4 (ENSPTRG00000001368) SLC39A1 (ENSPTRG00000001367) CRTC2 (ENSPTRG00000001366) DENND4B (ENSPTRG00000001365) Gorilla MODERN SPECIES FLAD1 (ENSGGOG00000013423) ENSGGOG00000013419 SHC1 (ENSGGOG00000013413) PYGO2 (ENSGGOG00000012856) PBXIP1 (ENSGGOG00000012847) PMVK (ENSGGOG00000012840) KCNN3 (ENSGGOG00000012827) ADAR (ENSGGOG00000007156) CHRNB2 (ENSGGOG00000007153) ENSGGOG00000037432 UBE2Q1 (ENSGGOG00000005627) TDRD10 (ENSGGOG00000040815) SHE (ENSGGOG00000015778) ENSGGOG00000024279 IL6R (ENSGGOG00000000836) RPSA (ENSGGOG00000024381) #22 ATP8B2 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ENSRBIG00000031276 #22 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 569 FGGY (ENSRBIG00000028365) HOOK1 (ENSRBIG00000004303) CYP2J2 (ENSRBIG00000034286) C1orf87 (ENSRBIG00000026690) ENSRBIG00000019391 NFIA (ENSRBIG00000032076) TM2D1 (ENSRBIG00000032068) ENSRBIG00000034372 PATJ (ENSRBIG00000043813) L1TD1 (ENSRBIG00000005782) ENSRBIG00000035631 USP1 (ENSRBIG00000041920) ANGPTL3 (ENSRBIG00000033798) DOCK7 (ENSRBIG00000036983) ATG4C (ENSRBIG00000027148) ENSRBIG00000026704 #22 ENSRBIG00000026600 ALG6 (ENSRBIG00000035347) ITGB3BP (ENSRBIG00000037404) EFCAB7 (ENSRBIG00000029286) PGM1 (ENSRBIG00000035757) ENSRBIG00000004039 ROR1 (ENSRBIG00000029149) UBE2U (ENSRBIG00000044579) CACHD1 (ENSRBIG00000044274) RAVER2 (ENSRBIG00000044090) JAK1 (ENSRBIG00000010792) AK4 (ENSRBIG00000035967) DNAJC6 (ENSRBIG00000036399) LEPROT (ENSRBIG00000032071) LEPR (ENSRBIG00000038066) Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1973 ITGA9 (ENSRROG00000033427) ENSRROG00000007893 #22 ENSRROG00000037361 GOLGA4 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ENSGT00390000007453.db ENSGT00940000159421 ENSGT00390000005939.b ENSGT00950000182838.B.a.a ENSGT00550000076357 ENSGT00940000159841 Pan ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000162788.a ENSGT00940000159189 ENSGT00390000018141 ENSGT00950000183008.a.b ENSGT00940000153216.a.a.c.b.q.a.c ENSGT00940000153216.a.a.c.b.q.a.d ENSGT00940000161694 ENSGT00940000158705 ENSGT00940000159278 ENSGT00940000157600 ENSGT00390000002142 ENSGT00390000016453 ENSGT00390000008931 ENSGT00390000011262 ENSGT00950000183073.b.o.b ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.a.b.g #22 ENSGT00560000078622 ENSGT00940000156149.B ENSGT00940000167233 ENSGT00390000012700 ENSGT00940000156898 ENSGT00390000010779.a.b.b.f ENSGT00940000159903.g.b.a ENSGT00940000159903.g.a ENSGT00500000044924 ENSGT00550000074846.j ENSGT00390000004380.m.b.b ENSGT00940000162813 ENSGT00390000007453.db ENSGT00940000159421 ENSGT00390000005939.b Bonobo MODERN SPECIES 7 TMEM170A (ENSPPAG00000036751) CFDP1 (ENSPPAG00000035342) BCAR1 (ENSPPAG00000033143) CTRB1 (ENSPPAG00000033758) CTRB2 (ENSPPAG00000036928) ZFP1 (ENSPPAG00000033168) LDHD (ENSPPAG00000000820) ZNRF1 (ENSPPAG00000036635) WDR59 (ENSPPAG00000032813) FA2H (ENSPPAG00000012442) MLKL (ENSPPAG00000042236) ENSPPAG00000043695 RFWD3 (ENSPPAG00000028503) GLG1 (ENSPPAG00000030108) PSMD7 (ENSPPAG00000038728) ENSPPAG00000043562 #22 ENSPPAG00000041056 ENSPPAG00000038682 ZFHX3 (ENSPPAG00000033950) ENSPPAG00000038180 PMFBP1 (ENSPPAG00000037201) DHX38 (ENSPPAG00000042488) TXNL4B (ENSPPAG00000033554) ENSPPAG00000038198 ENSPPAG00000036058 HP (ENSPPAG00000038234) DHODH (ENSPPAG00000039835) ENSPPAG00000027200 ENSPPAG00000000053 PKD1L3 (ENSPPAG00000029013) IST1 (ENSPPAG00000043761) Chimpanzee MODERN SPECIES 7 TMEM170A (ENSPTRG00000050509) CFDP1 (ENSPTRG00000008358) BCAR1 (ENSPTRG00000008357) ENSPTRG00000042741 CTRB2 (ENSPTRG00000008355) ZFP1 (ENSPTRG00000008354) LDHD (ENSPTRG00000008353) ZNRF1 (ENSPTRG00000008352) WDR59 (ENSPTRG00000008351) FA2H (ENSPTRG00000008350) MLKL (ENSPTRG00000008349) ENSPTRG00000045207 RFWD3 (ENSPTRG00000008348) GLG1 (ENSPTRG00000024158) PSMD7 (ENSPTRG00000008343) ENSPTRG00000008341 #22 ENSPTRG00000043039 ZFHX3 (ENSPTRG00000008340) ENSPTRG00000046705 PMFBP1 (ENSPTRG00000008339) DHX38 (ENSPTRG00000008338) TXNL4B (ENSPTRG00000008337) ENSPTRG00000008335 ENSPTRG00000008334 DHODH (ENSPTRG00000008333) ENSPTRG00000048394 ENSPTRG00000048929 PKD1L3 (ENSPTRG00000051796) IST1 (ENSPTRG00000051566) ZNF821 (ENSPTRG00000008328) ATXN1L (ENSPTRG00000039075) Gorilla MODERN SPECIES 7 CHST5 (ENSGGOG00000039386) CHST6 (ENSGGOG00000040714) ENSGGOG00000001336 BCAR1 (ENSGGOG00000010661) CTRB1 (ENSGGOG00000010654) CTRB2 (ENSGGOG00000010642) ZFP1 (ENSGGOG00000006121) LDHD (ENSGGOG00000010634) ENSGGOG00000026748 WDR59 (ENSGGOG00000014559) FA2H (ENSGGOG00000013529) RFWD3 (ENSGGOG00000000160) GLG1 (ENSGGOG00000013215) ENSGGOG00000024401 PSMD7 (ENSGGOG00000009774) ENSGGOG00000028546 #22 ENSGGOG00000042929 ZFHX3 (ENSGGOG00000012083) ENSGGOG00000042749 PMFBP1 (ENSGGOG00000013067) DHX38 (ENSGGOG00000013052) ENSGGOG00000044026 ENSGGOG00000037759 TXNL4B (ENSGGOG00000037830) HPR (ENSGGOG00000040916) HP (ENSGGOG00000013039) DHODH (ENSGGOG00000013030) ENSGGOG00000041291 PKD1L3 (ENSGGOG00000007972) ENSGGOG00000001863 ZNF821 (ENSGGOG00000005863) Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.a.b.h #22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.a.b.h #22 Pan ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.a.b.h #22 Chimpanzee MODERN SPECIES 22 C9H9orf85 (ENSPTRG00000021018) C9H9orf57 (ENSPTRG00000029245) GDA (ENSPTRG00000021020) ZFAND5 (ENSPTRG00000046315) TMC1 (ENSPTRG00000021022) ALDH1A1 (ENSPTRG00000021023) ANXA1 (ENSPTRG00000021024) RORB (ENSPTRG00000021025) TRPM6 (ENSPTRG00000021026) C9H9orf40 (ENSPTRG00000021027) CARNMT1 (ENSPTRG00000021028) NMRK1 (ENSPTRG00000021030) OSTF1 (ENSPTRG00000021031) PCSK5 (ENSPTRG00000021033) RFK (ENSPTRG00000021036) ENSPTRG00000047373 #22 GCNT1 (ENSPTRG00000043705) PRUNE2 (ENSPTRG00000021038) FOXB2 (ENSPTRG00000029242) VPS13A (ENSPTRG00000021041) GNA14 (ENSPTRG00000021042) ENSPTRG00000050740 GNAQ (ENSPTRG00000021043) ENSPTRG00000048739 ENSPTRG00000049362 CEP78 (ENSPTRG00000021044) PSAT1 (ENSPTRG00000021045) TLE4 (ENSPTRG00000021047) TLE1 (ENSPTRG00000021048) ENSPTRG00000043940 ENSPTRG00000050795 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00910000148110 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.a.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a.l ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 ENSGT00950000182802.B.a.a.a.a.h.a.b.b ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00390000013814.e.a ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 414 ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.a.b #22 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1604 ACVR2B (ENSRROG00000037079) EXOG (ENSRROG00000045132) SCN5A (ENSRROG00000029726) SCN10A (ENSRROG00000002301) SCN11A (ENSRROG00000041360) WDR48 (ENSRROG00000029632) GORASP1 (ENSRROG00000045102) TTC21A (ENSRROG00000031487) CSRNP1 (ENSRROG00000004209) XIRP1 (ENSRROG00000040361) CX3CR1 (ENSRROG00000038595) SLC25A38 (ENSRROG00000045100) #21 ENSRROG00000039282 #22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 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ENSCSAG00000000286 #22 ENSCSAG00000000285 ENSCSAG00000007290 SLITRK2 (ENSCSAG00000000284) ENSCSAG00000000283 FMR1 (ENSCSAG00000007281) FMR1NB (ENSCSAG00000007271) AFF2 (ENSCSAG00000007248) IDS (ENSCSAG00000007199) MAGEA11 (ENSCSAG00000007193) TMEM185A (ENSCSAG00000007189) ENSCSAG00000007182 ENSCSAG00000000282 MAGEA8 (ENSCSAG00000000530) ENSCSAG00000007176 MAMLD1 (ENSCSAG00000007173) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00910000148110 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.a.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a.l ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 ENSGT00950000182802.B.a.a.a.a.h.a.b.b ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00390000013814.e.a ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.a.b #22 Olive baboon MODERN SPECIES 387 ENSPANG00000046249 #22 Macaca ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000162395 ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.a.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00860000135889 ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a.l ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00390000013814.e.a ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 563 SLC22A13 (ENSMNEG00000037730) SLC22A14 (ENSMNEG00000042853) XYLB (ENSMNEG00000037396) ACVR2B (ENSMNEG00000033690) EXOG (ENSMNEG00000023586) SCN5A (ENSMNEG00000020729) SCN10A (ENSMNEG00000031508) SCN11A (ENSMNEG00000030032) WDR48 (ENSMNEG00000033674) GORASP1 (ENSMNEG00000027322) TTC21A (ENSMNEG00000015306) CSRNP1 (ENSMNEG00000031549) XIRP1 (ENSMNEG00000042399) CX3CR1 (ENSMNEG00000031389) SLC25A38 (ENSMNEG00000045443) #21 ENSMNEG00000040773 #22 MOBP (ENSMNEG00000035090) ENSMNEG00000029767 MYRIP (ENSMNEG00000038911) EIF1B (ENSMNEG00000032776) ENTPD3 (ENSMNEG00000030360) ENSMNEG00000038053 ZNF619 (ENSMNEG00000040523) ZNF620 (ENSMNEG00000030493) ZNF621 (ENSMNEG00000037343) CTNNB1 (ENSMNEG00000004934) ULK4 (ENSMNEG00000038315) ENSMNEG00000033555 TRAK1 (ENSMNEG00000036297) CCK (ENSMNEG00000040525) LYZL4 (ENSMNEG00000030727) Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000162395 ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.a.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00860000135889 ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a.l ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B Rhesus MODERN SPECIES 11 SLC22A13 (ENSMMUG00000006480) SLC22A14 (ENSMMUG00000004842) XYLB (ENSMMUG00000004847) ACVR2B (ENSMMUG00000018790) EXOG (ENSMMUG00000018792) SCN5A (ENSMMUG00000015825) SCN10A (ENSMMUG00000015827) SCN11A (ENSMMUG00000019962) WDR48 (ENSMMUG00000020138) GORASP1 (ENSMMUG00000020144) TTC21A (ENSMMUG00000020145) CSRNP1 (ENSMMUG00000020147) CX3CR1 (ENSMMUG00000065286) CCR8 (ENSMMUG00000022962) SLC25A38 (ENSMMUG00000022963) #21 RPSA (ENSMMUG00000022965) #22 MOBP (ENSMMUG00000051408) MOBP (ENSMMUG00000009197) MYRIP (ENSMMUG00000017701) EIF1B (ENSMMUG00000058393) ENTPD3 (ENSMMUG00000013330) ENSMMUG00000063637 ZNF619 (ENSMMUG00000009437) ZNF620 (ENSMMUG00000015955) ZNF621 (ENSMMUG00000039060) CTNNB1 (ENSMMUG00000014627) ULK4 (ENSMMUG00000001074) ENSMMUG00000052672 ENSMMUG00000055812 TRAK1 (ENSMMUG00000001075) CCK (ENSMMUG00000001077) Crab-eating macaque MODERN SPECIES 11 XYLB (ENSMFAG00000001309) ACVR2B (ENSMFAG00000041141) EXOG (ENSMFAG00000040794) SCN5A (ENSMFAG00000041381) SCN10A (ENSMFAG00000002008) SCN11A (ENSMFAG00000041137) WDR48 (ENSMFAG00000041723) GORASP1 (ENSMFAG00000000701) TTC21A (ENSMFAG00000045979) CSRNP1 (ENSMFAG00000001132) ENSMFAG00000031636 ENSMFAG00000047665 CX3CR1 (ENSMFAG00000044029) CCR8 (ENSMFAG00000056610) SLC25A38 (ENSMFAG00000003708) #21 ENSMFAG00000001626 #22 ENSMFAG00000002191 ENSMFAG00000032704 ENSMFAG00000051814 MOBP (ENSMFAG00000041121) ENSMFAG00000062648 MYRIP (ENSMFAG00000027633) EIF1B (ENSMFAG00000037264) ENTPD3 (ENSMFAG00000004057) RPL14 (ENSMFAG00000055324) ZNF619 (ENSMFAG00000042383) ZNF620 (ENSMFAG00000055415) ZNF621 (ENSMFAG00000045772) CTNNB1 (ENSMFAG00000034131) ULK4 (ENSMFAG00000029259) TRAK1 (ENSMFAG00000033301) Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.b #22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.b #22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.b #22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.b #22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.b #22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.a.b #22 Olive baboon DUPLICATION Olive baboon MODERN SPECIES 17 ENSPANG00000039025 OR10G3 (ENSPANG00000022541) ENSPANG00000048072 TRAV1-1 (ENSPANG00000033912) OR4E2 (ENSPANG00000007302) OR4E1 (ENSPANG00000029455) TRAV2 (ENSPANG00000020008) TRAV3 (ENSPANG00000035847) TRAV4 (ENSPANG00000039983) TRAV5 (ENSPANG00000042056) ENSPANG00000031341 ENSPANG00000039148 ENSPANG00000033138 ENSPANG00000048988 ENSPANG00000047186 ENSPANG00000024501 #22 ENSPANG00000035324 ENSPANG00000033337 ENSPANG00000047892 ENSPANG00000043634 ENSPANG00000049026 ENSPANG00000035221 ENSPANG00000049883 ENSPANG00000022756 ENSPANG00000005897 TRAV16 (ENSPANG00000021103) TRAV17 (ENSPANG00000020828) ENSPANG00000049015 ENSPANG00000043702 TRAV19 (ENSPANG00000040832) TRAV20 (ENSPANG00000034259) Olive baboon MODERN SPECIES 6 ENSPANG00000040944 GPC6 (ENSPANG00000029836) GPC5 (ENSPANG00000004995) ENSPANG00000038257 ENSPANG00000047478 ENSPANG00000044812 SLITRK5 (ENSPANG00000012750) SLITRK6 (ENSPANG00000013285) ENSPANG00000037928 SLITRK1 (ENSPANG00000006605) ENSPANG00000031941 ENSPANG00000041737 ENSPANG00000038720 ENSPANG00000049415 ENSPANG00000037096 ENSPANG00000049934 #22 SPRY2 (ENSPANG00000024849) NDFIP2 (ENSPANG00000002389) RBM26 (ENSPANG00000012979) ENSPANG00000037860 OBI1 (ENSPANG00000015545) EDNRB (ENSPANG00000009470) SLAIN1 (ENSPANG00000006284) ENSPANG00000038962 SCEL (ENSPANG00000022423) ENSPANG00000042841 MYCBP2 (ENSPANG00000016436) FBXL3 (ENSPANG00000016434) CLN5 (ENSPANG00000009178) ACOD1 (ENSPANG00000010191) ENSPANG00000046308 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.b #22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.b #22 Cercopithecidae DUPLICATION Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.b.a #22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.b.a #22 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 193 ITGA9 (ENSRBIG00000035691) ENSRBIG00000037793 #22 ENSRBIG00000033074 GOLGA4 (ENSRBIG00000044412) LRRFIP2 (ENSRBIG00000044613) MLH1 (ENSRBIG00000027553) EPM2AIP1 (ENSRBIG00000000049) ENSRBIG00000032694 TRANK1 (ENSRBIG00000012281) ENSRBIG00000040212 DCLK3 (ENSRBIG00000040365) AHSG (ENSRBIG00000014111) HRG (ENSRBIG00000003805) DNAJB11 (ENSRBIG00000032036) TBCCD1 (ENSRBIG00000017865) CRYGS (ENSRBIG00000025674) DGKG (ENSRBIG00000033670) Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.b.a #22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.b.a #22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00910000148110 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.v #22 ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.b.a #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a.l ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 ENSGT00950000182802.B.a.a.a.a.h.a.b.b ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00390000013814.e.a ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 52 ENSGT00940000156519.l ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00910000148110 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.v #22 ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.b.a #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00860000135889 ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a.l ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 ENSGT00950000182802.B.a.a.a.a.h.a.a.a.b.c.b ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00390000013814.e.a ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 Sooty mangabey MODERN SPECIES 424 XYLB (ENSCATG00000038970) ENSCATG00000025186 ACVR2B (ENSCATG00000037591) EXOG (ENSCATG00000017315) SCN5A (ENSCATG00000002865) SCN10A (ENSCATG00000032675) SCN11A (ENSCATG00000040001) WDR48 (ENSCATG00000045029) GORASP1 (ENSCATG00000013339) TTC21A (ENSCATG00000034534) CSRNP1 (ENSCATG00000038472) XIRP1 (ENSCATG00000037191) ENSCATG00000033746 CX3CR1 (ENSCATG00000042830) SLC25A38 (ENSCATG00000038468) #21 ENSCATG00000041148 #22 ENSCATG00000038673 MOBP (ENSCATG00000043744) ENSCATG00000045324 MYRIP (ENSCATG00000044732) EIF1B (ENSCATG00000016704) ENTPD3 (ENSCATG00000033407) ENSCATG00000036366 ZNF619 (ENSCATG00000037332) ZNF620 (ENSCATG00000038256) ZNF621 (ENSCATG00000035141) ENSCATG00000030388 CTNNB1 (ENSCATG00000034464) ULK4 (ENSCATG00000040249) ENSCATG00000031373 TRAK1 (ENSCATG00000020319) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.b.b #22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.b.b #22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.b.b #22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.b.b #22 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.b.b #22 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 15 SCARB2 (ENSMFAG00000039184) NUP54 (ENSMFAG00000031205) ART3 (ENSMFAG00000040258) CXCL11 (ENSMFAG00000045313) CXCL10 (ENSMFAG00000064155) CXCL9 (ENSMFAG00000039917) SDAD1 (ENSMFAG00000038793) ENSMFAG00000044646 NAAA (ENSMFAG00000041803) PPEF2 (ENSMFAG00000045101) USO1 (ENSMFAG00000037889) G3BP2 (ENSMFAG00000044717) CDKL2 (ENSMFAG00000043830) THAP6 (ENSMFAG00000045214) RCHY1 (ENSMFAG00000036832) ENSMFAG00000041116 #22 PARM1 (ENSMFAG00000042667) BTC (ENSMFAG00000041065) AREG (ENSMFAG00000039089) EREG (ENSMFAG00000052508) EPGN (ENSMFAG00000033022) MTHFD2L (ENSMFAG00000036503) ENSMFAG00000044905 CXCL5 (ENSMFAG00000002889) PPBP (ENSMFAG00000031461) PF4 (ENSMFAG00000055984) ENSMFAG00000065742 CXCL1 (ENSMFAG00000035439) PF4V1 (ENSMFAG00000003796) CXCL6 (ENSMFAG00000044943) CXCL8 (ENSMFAG00000001622) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.b.b #22 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 339 GPC3 (ENSRBIG00000030549) ENSRBIG00000034442 #22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.b #22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.b #22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.b #22 Gorilla MODERN SPECIES 4 SLC25A15 (ENSGGOG00000025261) MRPS31 (ENSGGOG00000006468) ENSGGOG00000037880 FOXO1 (ENSGGOG00000008104) ENSGGOG00000040044 COG6 (ENSGGOG00000034837) LHFPL6 (ENSGGOG00000011641) ENSGGOG00000022722 ENSGGOG00000043703 PROSER1 (ENSGGOG00000003830) STOML3 (ENSGGOG00000011813) ENSGGOG00000023208 ENSGGOG00000026214 TRPC4 (ENSGGOG00000007142) POSTN (ENSGGOG00000006685) ENSGGOG00000023061 #22 CSNK1A1L (ENSGGOG00000000169) SUPT20H (ENSGGOG00000011916) EXOSC8 (ENSGGOG00000011902) ALG5 (ENSGGOG00000003094) ENSGGOG00000037488 ENSGGOG00000040246 SMAD9 (ENSGGOG00000001017) RFXAP (ENSGGOG00000025564) SERTM1 (ENSGGOG00000040932) CCNA1 (ENSGGOG00000025062) SPART (ENSGGOG00000014695) SOHLH2 (ENSGGOG00000002130) DCLK1 (ENSGGOG00000006447) MAB21L1 (ENSGGOG00000011768) ENSGGOG00000037758 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.b #22 Mas night monkey MODERN SPECIES 536 APOD (ENSANAG00000009862) ENSANAG00000024715 ACAP2 (ENSANAG00000032741) XXYLT1 (ENSANAG00000022628) FAM43A (ENSANAG00000031394) LSG1 (ENSANAG00000021153) TMEM44 (ENSANAG00000032076) ENSANAG00000029062 #22 ENSANAG00000020868 ENSANAG00000025365 ATP13A3 (ENSANAG00000001727) GP5 (ENSANAG00000021224) LRRC15 (ENSANAG00000028624) HES1 (ENSANAG00000019249) ENSANAG00000021266 ENSANAG00000029173 ATP13A4 (ENSANAG00000023937) ATP13A5 (ENSANAG00000026333) PLAAT1 (ENSANAG00000031574) MB21D2 (ENSANAG00000037636) FGF12 (ENSANAG00000019853) ENSANAG00000032688 CCDC50 (ENSANAG00000037574) Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.j #22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.j #22 Mas night monkey MODERN SPECIES 624 AQP8 (ENSANAG00000036284) ZKSCAN2 (ENSANAG00000033908) HS3ST4 (ENSANAG00000030250) KDM8 (ENSANAG00000023269) NSMCE1 (ENSANAG00000030899) IL4R (ENSANAG00000003183) IL21R (ENSANAG00000032742) GTF3C1 (ENSANAG00000037090) KATNIP (ENSANAG00000033504) GSG1L (ENSANAG00000029256) ##28 XPO6 (ENSANAG00000031761) SBK1 (ENSANAG00000024806) LAT (ENSANAG00000022885) SPNS1 (ENSANAG00000030997) NFATC2IP (ENSANAG00000031935) ENSANAG00000027734 #22 CD19 (ENSANAG00000035227) RABEP2 (ENSANAG00000035928) ATP2A1 (ENSANAG00000037955) SH2B1 (ENSANAG00000034202) TUFM (ENSANAG00000022206) ATXN2L (ENSANAG00000026257) ENSANAG00000002300 ENSANAG00000024051 ENSANAG00000020640 CLN3 (ENSANAG00000032278) ENSANAG00000036908 APOBR (ENSANAG00000037115) IL27 (ENSANAG00000034309) NUPR1 (ENSANAG00000036925) ENSANAG00000037641 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.j #22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.j #22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.j #22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.j #22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.j #22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e.j #22 Sooty mangabey MODERN SPECIES 238 SHISAL2A (ENSCATG00000010987) COA7 (ENSCATG00000039378) ZYG11B (ENSCATG00000030211) ZYG11A (ENSCATG00000034674) ECHDC2 (ENSCATG00000033784) SCP2 (ENSCATG00000036529) PODN (ENSCATG00000042739) SLC1A7 (ENSCATG00000036353) CPT2 (ENSCATG00000043875) ENSCATG00000030412 CZIB (ENSCATG00000036818) MAGOH (ENSCATG00000015443) LRP8 (ENSCATG00000021965) DMRTB1 (ENSCATG00000041370) GLIS1 (ENSCATG00000040253) ENSCATG00000044750 #22 NDC1 (ENSCATG00000044757) YIPF1 (ENSCATG00000040553) DIO1 (ENSCATG00000044073) IFT25 (ENSCATG00000040749) ENSCATG00000034850 ENSCATG00000038569 LDLRAD1 (ENSCATG00000019460) TMEM59 (ENSCATG00000031518) ENSCATG00000032208 TCEANC2 (ENSCATG00000042512) CDCP2 (ENSCATG00000039587) CYB5RL (ENSCATG00000038378) MRPL37 (ENSCATG00000044166) SSBP3 (ENSCATG00000038721) ACOT11 (ENSCATG00000044518) Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e #22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e #22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e #22 Suina ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e #22 Pig DUPLICATION Pig MODERN SPECIES 8 ENSSSCG00000007124 ENSSSCG00000007125 CST9L (ENSSSCG00000029289) CST3 (ENSSSCG00000037360) SYNDIG1 (ENSSSCG00000007130) CST7 (ENSSSCG00000007131) APMAP (ENSSSCG00000036286) ACSS1 (ENSSSCG00000007133) VSX1 (ENSSSCG00000023887) ENTPD6 (ENSSSCG00000027070) PYGB (ENSSSCG00000022815) ABHD12 (ENSSSCG00000040449) GINS1 (ENSSSCG00000034913) ENSSSCG00000007135 NANP (ENSSSCG00000053479) ENSSSCG00000035283 #22 ENSSSCG00000063198 ADRA1D (ENSSSCG00000007139) SMOX (ENSSSCG00000007140) RNF24 (ENSSSCG00000059435) PANK2 (ENSSSCG00000007142) ENSSSCG00000007143 AP5S1 (ENSSSCG00000033297) CDC25B (ENSSSCG00000007151) CENPB (ENSSSCG00000053890) SPEF1 (ENSSSCG00000007149) ADISSP (ENSSSCG00000035666) HSPA12B (ENSSSCG00000007147) SIGLEC1 (ENSSSCG00000007146) ADAM33 (ENSSSCG00000007145) GFRA4 (ENSSSCG00000021401) Pig MODERN SPECIES 5 TMEM26 (ENSSSCG00000023525) CABCOCO1 (ENSSSCG00000033268) ARID5B (ENSSSCG00000010219) RTKN2 (ENSSSCG00000039707) ENSSSCG00000010221 ZNF365 (ENSSSCG00000010222) ADO (ENSSSCG00000031360) EGR2 (ENSSSCG00000010224) NRBF2 (ENSSSCG00000024081) JMJD1C (ENSSSCG00000010226) REEP3 (ENSSSCG00000036476) CTNNA3 (ENSSSCG00000036480) LRRTM3 (ENSSSCG00000010232) ENSSSCG00000048396 DNAJC12 (ENSSSCG00000035600) ENSSSCG00000010234 #22 SIRT1 (ENSSSCG00000010235) HERC4 (ENSSSCG00000038913) MYPN (ENSSSCG00000029311) ATOH7 (ENSSSCG00000021995) ENSSSCG00000049861 PBLD (ENSSSCG00000025876) HNRNPH3 (ENSSSCG00000010238) RUFY2 (ENSSSCG00000010239) DNA2 (ENSSSCG00000010240) SLC25A16 (ENSSSCG00000022303) TET1 (ENSSSCG00000010241) CCAR1 (ENSSSCG00000010243) STOX1 (ENSSSCG00000010245) DDX50 (ENSSSCG00000010246) DDX21 (ENSSSCG00000010247) Chacoan peccary MODERN SPECIES 104 ZNF507 (ENSCWAG00000001636) TSHZ3 (ENSCWAG00000001647) ENSCWAG00000001653 ZNF536 (ENSCWAG00000001663) URI1 (ENSCWAG00000001670) CCNE1 (ENSCWAG00000001690) C19orf12 (ENSCWAG00000001799) PLEKHF1 (ENSCWAG00000001825) #37 POP4 (ENSCWAG00000001837) VSTM2B (ENSCWAG00000001853) UQCRFS1 (ENSCWAG00000001869) SHCBP1 (ENSCWAG00000001888) VPS35 (ENSCWAG00000001902) ORC6 (ENSCWAG00000001931) MYLK3 (ENSCWAG00000001954) ENSCWAG00000001992 #22 ENSCWAG00000002014 GPT2 (ENSCWAG00000002047) DNAJA2 (ENSCWAG00000002085) NETO2 (ENSCWAG00000002107) ITFG1 (ENSCWAG00000002149) PHKB (ENSCWAG00000002211) ABCC12 (ENSCWAG00000002352) ABCC11 (ENSCWAG00000002486) ENSCWAG00000002578 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e #22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e #22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e #22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e #22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e #22 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e #22 Goat MODERN SPECIES 15 ENSCHIG00000022199 ENSCHIG00000024848 ENSCHIG00000011124 ENSCHIG00000010317 ENSCHIG00000018594 ENSCHIG00000010145 ENSCHIG00000009125 ENSCHIG00000008906 ENSCHIG00000017891 ENSCHIG00000006779 ENSCHIG00000025786 ENSCHIG00000007444 ZNF311 (ENSCHIG00000010646) ENSCHIG00000010766 TRIM27 (ENSCHIG00000009534) ENSCHIG00000021680 #22 SCAND3 (ENSCHIG00000015015) ENSCHIG00000008544 GPX6 (ENSCHIG00000019401) ENSCHIG00000010922 ZSCAN12 (ENSCHIG00000020036) ZSCAN23 (ENSCHIG00000017885) ZSCAN31 (ENSCHIG00000012646) PGBD1 (ENSCHIG00000013808) ZSCAN26 (ENSCHIG00000013045) ZKSCAN4 (ENSCHIG00000012460) ENSCHIG00000010691 ZKSCAN8 (ENSCHIG00000015751) ZSCAN16 (ENSCHIG00000012295) ENSCHIG00000023679 ZNF165 (ENSCHIG00000010224) Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e #22 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e #22 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e #22 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a.e #22 Vaquita MODERN SPECIES 34 ENSPSNG00000016187 ENSPSNG00000016160 RAB9B (ENSPSNG00000016142) PLP1 (ENSPSNG00000015963) TMEM31 (ENSPSNG00000015906) ENSPSNG00000015772 MORF4L2 (ENSPSNG00000015721) ENSPSNG00000015620 TCEAL1 (ENSPSNG00000015582) ENSPSNG00000015549 ENSPSNG00000015517 ENSPSNG00000015091 ENSPSNG00000014916 ENSPSNG00000014889 ENSPSNG00000014680 ENSPSNG00000014607 #22 BEX4 (ENSPSNG00000014586) TCEAL8 (ENSPSNG00000014535) ENSPSNG00000014506 ENSPSNG00000014458 TCEAL7 (ENSPSNG00000014429) TCEAL9 (ENSPSNG00000014405) ENSPSNG00000014368 ENSPSNG00000014271 ENSPSNG00000014213 GPRASP1 (ENSPSNG00000013972) GPRASP2 (ENSPSNG00000013910) ENSPSNG00000013476 ENSPSNG00000020476 BEX5 (ENSPSNG00000020449) ENSPSNG00000020413 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a #22 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a #22 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a #22 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a #22 koala MODERN SPECIES 358 ENSPCIG00000005588 #22 PFKFB1 (ENSPCIG00000019925) ENSPCIG00000035474 ENSPCIG00000015766 ENSPCIG00000010545 CLCN5 (ENSPCIG00000010553) ENSPCIG00000003946 ENSPCIG00000030723 ENSPCIG00000010572 ENSPCIG00000010580 ENSPCIG00000012986 ENSPCIG00000019707 PHKA1 (ENSPCIG00000019704) ENSPCIG00000026723 NHSL2 (ENSPCIG00000026981) PIN4 (ENSPCIG00000026976) Sauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a #22 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a #22 Episquamata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a #22 Toxicofera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.a #22 Lizard MODERN SPECIES CLVS2 (ENSACAG00000001621) ENSACAG00000041548 ENSACAG00000001672 ENSACAG00000041787 ENSACAG00000038021 ENSACAG00000001690 ENSACAG00000039588 NKAIN2 (ENSACAG00000001686) RNF217 (ENSACAG00000001694) ENSACAG00000036920 TPD52L1 (ENSACAG00000001702) HDDC2 (ENSACAG00000001787) HEY2 (ENSACAG00000001813) ENSACAG00000036959 NCOA7 (ENSACAG00000001865) ENSACAG00000039249 #22 HINT3 (ENSACAG00000035755) TRMT11 (ENSACAG00000002072) ENSACAG00000042446 ENSACAG00000039361 ENSACAG00000002330 ENSACAG00000044713 ENSACAG00000035368 ENSACAG00000041978 ENSACAG00000044068 ENSACAG00000003318 ENSACAG00000035645 ENSACAG00000039522 ENSACAG00000043245 ENSACAG00000042749 ENSACAG00000039050 Amniota ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000160796 ENSGT00940000163083 ENSGT01100000263710 ENSGT00940000177252 ENSGT00940000155574.C ENSGT00940000156148 ENSGT00940000153845.a.b ENSGT00390000009163 ENSGT00940000153814.a ENSGT00390000010260 ENSGT00950000182942.a.a ENSGT01020000230359.C.b ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.u.b #22 ENSGT01050000244942.b.a.b ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT00390000003571 ENSGT00940000155697.A ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00390000001296 ENSGT00940000156463 ENSGT00390000012690 ENSGT01050000244939.b ENSGT00940000155721 ENSGT00950000183130.C ENSGT00950000183186.B.b ENSGT00390000010209 Mammalia DUPLICATION Mammalia ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000163083 ENSGT01100000263710 ENSGT00940000177252 ENSGT00940000155574.C ENSGT00940000156148 ENSGT00940000153845.a.b ENSGT00390000009163 ENSGT00940000153814.a ENSGT00390000010260 ENSGT00950000182942.a.a ENSGT01020000230359.C.b ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.u.a #22 ENSGT00950000183099.u.b.a #22 ENSGT01050000244942.b.a.b ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT00390000003571 ENSGT00940000155697.A ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00390000001296 ENSGT00940000156463 ENSGT00390000012690 ENSGT01050000244939.b ENSGT00940000155721 ENSGT00950000183130.C ENSGT00950000183186.B.b ENSGT00390000010209 Platypus MODERN SPECIES 19 SACM1L (ENSOANG00000006798) LIMD1 (ENSOANG00000006799) LARS2 (ENSOANG00000006800) CDCP1 (ENSOANG00000006804) CLEC3B (ENSOANG00000050797) EXOSC7 (ENSOANG00000049833) ZDHHC3 (ENSOANG00000046871) ENSOANG00000006809 ENSOANG00000045633 KIF15 (ENSOANG00000006810) ENSOANG00000030142 CTNNB1 (ENSOANG00000006811) ULK4 (ENSOANG00000006813) TRAK1 (ENSOANG00000015118) SLC25A38 (ENSOANG00000015119) #21 ENSOANG00000007053 #22 STARD3NL (ENSOANG00000015122) ENSOANG00000044551 ENSOANG00000037005 ENSOANG00000047985 ENSOANG00000041389 ENSOANG00000006575 ENSOANG00000040379 ENSOANG00000028705 ENSOANG00000029497 ENSOANG00000001470 ENSOANG00000048052 ENSOANG00000008474 ENSOANG00000038464 ENSOANG00000005417 VPS41 (ENSOANG00000005418) Theria DUPLICATION Theria DUPLICATION Theria DUPLICATION Theria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263710 ENSGT00940000177252 ENSGT00940000155574.C ENSGT00940000156148 ENSGT00940000153845.a.b ENSGT00390000009163 ENSGT00940000153814.a ENSGT00390000010260 ENSGT00950000182942.a.a ENSGT01020000230359.C.b ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.u.a #22 ENSGT00940000164532 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a #22 ENSGT01050000244942.b.a.b ENSGT00950000183099.v #22 ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT00390000003571 ENSGT00940000155697.A ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00390000001296 ENSGT00940000156463 ENSGT00390000012690 ENSGT01050000244939.b ENSGT00940000155721 ENSGT00950000183130.C ENSGT00950000183186.B.b Eutheria DUPLICATION Eutheria DUPLICATION Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.a.a #22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.a.a #22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.a.a #22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.a.a #22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.a.a #22 Bushbaby DUPLICATION Bushbaby DUPLICATION Bushbaby MODERN SPECIES 120 DDX4 (ENSOGAG00000007588) SLC38A9 (ENSOGAG00000007583) ENSOGAG00000030919 PLPP1 (ENSOGAG00000002887) MTREX (ENSOGAG00000002886) DHX29 (ENSOGAG00000002880) CCNO (ENSOGAG00000007131) MCIDAS (ENSOGAG00000034851) GPX8 (ENSOGAG00000007129) CDC20B (ENSOGAG00000007120) GZMA (ENSOGAG00000007119) GZMK (ENSOGAG00000007116) ESM1 (ENSOGAG00000026369) ENSOGAG00000026791 ENSOGAG00000031260 ENSOGAG00000028955 #22 SNX18 (ENSOGAG00000028588) HSPB3 (ENSOGAG00000000802) ENSOGAG00000033282 ARL15 (ENSOGAG00000016980) FST (ENSOGAG00000002121) MOCS2 (ENSOGAG00000011108) ITGA2 (ENSOGAG00000006905) ITGA1 (ENSOGAG00000017181) PELO (ENSOGAG00000027940) ISL1 (ENSOGAG00000034378) ENSOGAG00000011763 ENSOGAG00000029580 PARP8 (ENSOGAG00000005203) EMB (ENSOGAG00000005369) ENSOGAG00000029863 Bushbaby MODERN SPECIES 130 ENSOGAG00000024973 LRRN1 (ENSOGAG00000027599) ENSOGAG00000030861 ENSOGAG00000033945 CRBN (ENSOGAG00000007077) IL5RA (ENSOGAG00000007069) CNTN4 (ENSOGAG00000007059) CNTN6 (ENSOGAG00000002731) CHL1 (ENSOGAG00000012057) CNTN3 (ENSOGAG00000017171) PDZRN3 (ENSOGAG00000031641) PPP4R2 (ENSOGAG00000011001) GXYLT2 (ENSOGAG00000006647) SHQ1 (ENSOGAG00000003898) ENSOGAG00000030955 ENSOGAG00000033425 #22 PROK2 (ENSOGAG00000014593) GPR27 (ENSOGAG00000032511) EIF4E3 (ENSOGAG00000014590) ENSOGAG00000027936 FOXP1 (ENSOGAG00000008367) MDFIC2 (ENSOGAG00000030030) MITF (ENSOGAG00000000043) FRMD4B (ENSOGAG00000002705) LMOD3 (ENSOGAG00000002704) ARL6IP5 (ENSOGAG00000007773) UBA3 (ENSOGAG00000007771) TMF1 (ENSOGAG00000007764) EOGT (ENSOGAG00000012093) TAFA4 (ENSOGAG00000012090) ENSOGAG00000028255 Bushbaby MODERN SPECIES 116 ENSOGAG00000003220 TUB (ENSOGAG00000013158) RIC3 (ENSOGAG00000013162) LMO1 (ENSOGAG00000013163) STK33 (ENSOGAG00000013164) TRIM66 (ENSOGAG00000011436) DENND2B (ENSOGAG00000012354) AKIP1 (ENSOGAG00000014006) C11orf16 (ENSOGAG00000014010) ASCL3 (ENSOGAG00000014012) TMEM9B (ENSOGAG00000014013) NRIP3 (ENSOGAG00000014016) SCUBE2 (ENSOGAG00000014018) DENND5A (ENSOGAG00000003407) TMEM41B (ENSOGAG00000003415) ENSOGAG00000026487 #22 IPO7 (ENSOGAG00000011507) ZNF143 (ENSOGAG00000011518) WEE1 (ENSOGAG00000011523) SWAP70 (ENSOGAG00000010842) SBF2 (ENSOGAG00000010845) ADM (ENSOGAG00000016830) AMPD3 (ENSOGAG00000001761) RNF141 (ENSOGAG00000001765) LYVE1 (ENSOGAG00000001766) IRAG1 (ENSOGAG00000001768) CTR9 (ENSOGAG00000013884) ENSOGAG00000027912 GALNT18 (ENSOGAG00000013801) USP47 (ENSOGAG00000005261) DKK3 (ENSOGAG00000005265) Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.a.b #22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.a.b #22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.a.b #22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.a.b #22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.a.b #22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.a.b #22 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.a.b #22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.a.b #22 Microbat MODERN SPECIES 1000 ENSMLUG00000024011 ENSMLUG00000008375 TM2D1 (ENSMLUG00000028750) PATJ (ENSMLUG00000006861) KANK4 (ENSMLUG00000006932) USP1 (ENSMLUG00000012439) DOCK7 (ENSMLUG00000012444) ANGPTL3 (ENSMLUG00000015497) ATG4C (ENSMLUG00000029040) ENSMLUG00000028331 #22 FOXD3 (ENSMLUG00000006018) ALG6 (ENSMLUG00000004045) ITGB3BP (ENSMLUG00000004057) EFCAB7 (ENSMLUG00000011542) ENSMLUG00000023512 PGM1 (ENSMLUG00000012744) ROR1 (ENSMLUG00000010560) ENSMLUG00000010579 CACHD1 (ENSMLUG00000007663) ENSMLUG00000028943 RAVER2 (ENSMLUG00000007699) JAK1 (ENSMLUG00000007723) ENSMLUG00000009622 DNAJC6 (ENSMLUG00000009642) LEPROT (ENSMLUG00000028850) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.a.b #22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.a.b #22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.a.b #22 Bushbaby MODERN SPECIES 131 PRDX6 (ENSOGAG00000006282) SLC9C2 (ENSOGAG00000006284) ANKRD45 (ENSOGAG00000006288) KLHL20 (ENSOGAG00000004033) CENPL (ENSOGAG00000004038) DARS2 (ENSOGAG00000004039) ZBTB37 (ENSOGAG00000027115) SERPINC1 (ENSOGAG00000005083) RC3H1 (ENSOGAG00000004044) ENSOGAG00000005371 ENSOGAG00000034865 ENSOGAG00000005375 MRPS14 (ENSOGAG00000007741) TNN (ENSOGAG00000014283) TNR (ENSOGAG00000014296) ENSOGAG00000033363 #22 COP1 (ENSOGAG00000015465) ENSOGAG00000025909 PAPPA2 (ENSOGAG00000008537) ASTN1 (ENSOGAG00000010659) BRINP2 (ENSOGAG00000003550) ENSOGAG00000030409 SEC16B (ENSOGAG00000012395) ENSOGAG00000029135 RASAL2 (ENSOGAG00000012400) TEX35 (ENSOGAG00000001062) ANGPTL1 (ENSOGAG00000014804) RALGPS2 (ENSOGAG00000014797) FAM20B (ENSOGAG00000012751) TOR3A (ENSOGAG00000012754) ABL2 (ENSOGAG00000012757) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.a.b #22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.a.b #22 Tenrec MODERN SPECIES 13870 ENSETEG00000006564 #22 Eutheria ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000161691 ENSGT01030000235089 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.u.a #22 ENSGT00940000164532 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b #22 ENSGT00950000183099.u.b.a.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b #22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b #22 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b #22 Hyrax MODERN SPECIES 5152 ENSPCAG00000011437 #22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b #22 Sloth MODERN SPECIES 9077 ENSCHOG00000001021 #22 Armadillo MODERN SPECIES 1451 ZCCHC7 (ENSDNOG00000004148) GRHPR (ENSDNOG00000037952) ZBTB5 (ENSDNOG00000010253) POLR1E (ENSDNOG00000010257) FBXO10 (ENSDNOG00000010283) ENSDNOG00000035680 FRMPD1 (ENSDNOG00000042812) TRMT10B (ENSDNOG00000024558) EXOSC3 (ENSDNOG00000049791) ENSDNOG00000004272 DCAF10 (ENSDNOG00000042170) ENSDNOG00000017360 ENSDNOG00000035979 IGFBPL1 (ENSDNOG00000047361) ALDH1B1 (ENSDNOG00000014481) ENSDNOG00000044795 #22 SHB (ENSDNOG00000033867) Boreoeutheria DUPLICATION Boreoeutheria DUPLICATION Boreoeutheria DUPLICATION Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.a.a #22 Euarchontoglires DUPLICATION Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.a.a.a #22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.a.a.a #22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.a.a.a #22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.a.a.a #22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.a.a.a #22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.a.a.a #22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.a.a.a #22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.a.a.a #22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.a.a.a #22 Pan ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.a.a.a #22 Bonobo MODERN SPECIES 11 BPIFA1 (ENSPPAG00000034693) BPIFB1 (ENSPPAG00000029535) CDK5RAP1 (ENSPPAG00000008989) SNTA1 (ENSPPAG00000029137) CBFA2T2 (ENSPPAG00000042396) NECAB3 (ENSPPAG00000039394) C20orf144 (ENSPPAG00000042847) ACTL10 (ENSPPAG00000026624) E2F1 (ENSPPAG00000025868) PXMP4 (ENSPPAG00000028570) ZNF341 (ENSPPAG00000037384) ENSPPAG00000037596 CHMP4B (ENSPPAG00000028496) RALY (ENSPPAG00000034951) ENSPPAG00000043449 ENSPPAG00000041611 #22 ENSPPAG00000041601 ENSPPAG00000043799 ASIP (ENSPPAG00000031015) AHCY (ENSPPAG00000037325) ITCH (ENSPPAG00000043454) ENSPPAG00000035927 ENSPPAG00000027765 ENSPPAG00000030059 MAP1LC3A (ENSPPAG00000037098) PIGU (ENSPPAG00000037046) TP53INP2 (ENSPPAG00000000861) NCOA6 (ENSPPAG00000034298) GGT7 (ENSPPAG00000035145) ACSS2 (ENSPPAG00000043497) GSS (ENSPPAG00000029155) Tarsier MODERN SPECIES 5266 HUS1 (ENSTSYG00000003812) SUN3 (ENSTSYG00000011150) C7orf57 (ENSTSYG00000010332) ENSTSYG00000036281 #22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.a.a.a #22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.a.a.a #22 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.a.a.a #22 Rabbit MODERN SPECIES 9 LIPN (ENSOCUG00000012495) LIPM (ENSOCUG00000012505) ANKRD22 (ENSOCUG00000004617) STAMBPL1 (ENSOCUG00000008174) ACTA2 (ENSOCUG00000008193) ENSOCUG00000008202 CH25H (ENSOCUG00000000545) LIPA (ENSOCUG00000001553) IFIT2 (ENSOCUG00000024939) IFIT3 (ENSOCUG00000032132) ENSOCUG00000005445 SLC16A12 (ENSOCUG00000014498) PANK1 (ENSOCUG00000002780) ENSOCUG00000031325 KIF20B (ENSOCUG00000002468) ENSOCUG00000025563 #22 ENSOCUG00000030702 HTR7 (ENSOCUG00000016103) RPP30 (ENSOCUG00000006896) ANKRD1 (ENSOCUG00000006901) PCGF5 (ENSOCUG00000012993) HECTD2 (ENSOCUG00000015035) PPP1R3C (ENSOCUG00000015051) TNKS2 (ENSOCUG00000012010) BTAF1 (ENSOCUG00000010433) CPEB3 (ENSOCUG00000010454) MARCHF5 (ENSOCUG00000005719) IDE (ENSOCUG00000002827) ENSOCUG00000037602 KIF11 (ENSOCUG00000016706) ENSOCUG00000016719 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.a.a.b #22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.a.a.b #22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.a.a.b #22 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.a.a.b #22 Rabbit MODERN SPECIES 19 ENSOCUG00000027871 ENSOCUG00000000313 ENSOCUG00000029599 ENSOCUG00000026970 CD69 (ENSOCUG00000009055) KLRG1 (ENSOCUG00000017827) M6PR (ENSOCUG00000017823) PHC1 (ENSOCUG00000003600) A2ML1 (ENSOCUG00000014012) RIMKLB (ENSOCUG00000013997) ENSOCUG00000035657 MFAP5 (ENSOCUG00000002407) AICDA (ENSOCUG00000023739) APOBEC1 (ENSOCUG00000025736) GDF3 (ENSOCUG00000013747) ENSOCUG00000022961 #22 ENSOCUG00000013783 ENSOCUG00000008575 FOXJ2 (ENSOCUG00000004313) C3AR1 (ENSOCUG00000007438) NECAP1 (ENSOCUG00000004309) CLEC4A (ENSOCUG00000010935) CLEC4D (ENSOCUG00000012312) CLEC4E (ENSOCUG00000009195) ENSOCUG00000022788 #22 CD163 (ENSOCUG00000003958) ENSOCUG00000027440 ENSOCUG00000039239 PEX5 (ENSOCUG00000005856) CLSTN3 (ENSOCUG00000014499) RBP5 (ENSOCUG00000023679) Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.a.a #22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.a.a #22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.a.a #22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.a.a #22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.a.a #22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.a.a #22 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.a.a #22 American mink MODERN SPECIES 22 TMTC3 (ENSNVIG00000000330) ENSNVIG00000000305 DUSP6 (ENSNVIG00000000281) POC1B (ENSNVIG00000000231) ATP2B1 (ENSNVIG00000000007) ENSNVIG00000023933 CCER1 (ENSNVIG00000023927) EPYC (ENSNVIG00000023926) KERA (ENSNVIG00000023924) LUM (ENSNVIG00000023923) DCN (ENSNVIG00000023917) BTG1 (ENSNVIG00000023913) EEA1 (ENSNVIG00000023904) ENSNVIG00000023902 ENSNVIG00000023900 ENSNVIG00000023897 #22 ENSNVIG00000023894 SOCS2 (ENSNVIG00000023891) Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.a.b #22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.a.b #22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.a.b #22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.a.b #22 Tarsier DUPLICATION Tarsier MODERN SPECIES 4673 DHX15 (ENSTSYG00000011430) CCDC149 (ENSTSYG00000013722) LGI2 (ENSTSYG00000030089) SEPSECS (ENSTSYG00000005545) ENSTSYG00000011791 #22 PI4K2B (ENSTSYG00000000482) ZCCHC4 (ENSTSYG00000000364) ANAPC4 (ENSTSYG00000001298) Tarsier MODERN SPECIES 3313 RFX4 (ENSTSYG00000008562) RIC8B (ENSTSYG00000008570) TMEM263 (ENSTSYG00000026451) CRY1 (ENSTSYG00000010048) ENSTSYG00000036747 #22 Boreoeutheria DUPLICATION Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.b.a #22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.b.a #22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.b.a #22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.b.a #22 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.b.a #22 Mouse lemur DUPLICATION Mouse lemur MODERN SPECIES 4 KLF5 (ENSMICG00000014481) PIBF1 (ENSMICG00000011928) DIS3 (ENSMICG00000004703) BORA (ENSMICG00000008756) ENSMICG00000042445 ENSMICG00000037073 DACH1 (ENSMICG00000031012) ENSMICG00000046198 KLHL1 (ENSMICG00000005245) ENSMICG00000026328 PCDH9 (ENSMICG00000002338) ENSMICG00000045460 ENSMICG00000038136 PCDH20 (ENSMICG00000032560) TDRD3 (ENSMICG00000009982) ENSMICG00000043260 #22 DIAPH3 (ENSMICG00000011388) PCDH17 (ENSMICG00000008032) ENSMICG00000028372 OLFM4 (ENSMICG00000001798) ENSMICG00000036582 PCDH8 (ENSMICG00000014653) CNMD (ENSMICG00000038059) SUGT1 (ENSMICG00000014614) ELF1 (ENSMICG00000035688) WBP4 (ENSMICG00000047481) KBTBD7 (ENSMICG00000014566) MTRF1 (ENSMICG00000033131) NAA16 (ENSMICG00000017489) RGCC (ENSMICG00000027653) VWA8 (ENSMICG00000017491) Mouse lemur MODERN SPECIES 169 CDK16 (ENSMICG00000016965) USP11 (ENSMICG00000016972) ZNF157 (ENSMICG00000017445) ENSMICG00000017670 ZNF41 (ENSMICG00000008558) ARAF (ENSMICG00000016177) SYN1 (ENSMICG00000016204) TIMP1 (ENSMICG00000029917) CFP (ENSMICG00000047059) ELK1 (ENSMICG00000016244) UXT (ENSMICG00000016263) ENSMICG00000001433 ZNF81 (ENSMICG00000037260) ENSMICG00000032436 ZNF182 (ENSMICG00000037147) ENSMICG00000042910 #22 ENSMICG00000044570 ENSMICG00000034553 ENSMICG00000045282 SLC38A5 (ENSMICG00000013083) PORCN (ENSMICG00000013105) EBP (ENSMICG00000037008) TBC1D25 (ENSMICG00000013126) ENSMICG00000030860 ENSMICG00000047440 WDR13 (ENSMICG00000012548) WAS (ENSMICG00000035528) SUV39H1 (ENSMICG00000014379) BPIFA3 (ENSMICG00000045437) GLOD5 (ENSMICG00000029182) ENSMICG00000046068 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.b.b #22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.b.b #22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.b.b #22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.b.b #22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.b.b #22 Camelidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.b.b #22 Alpaca MODERN SPECIES 4271 ENSVPAG00000011530 #22 Suina ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.b.b #22 Pig MODERN SPECIES 17 ACAT1 (ENSSSCG00000026153) CUL5 (ENSSSCG00000029198) ENSSSCG00000035345 RAB39A (ENSSSCG00000031723) SLC35F2 (ENSSSCG00000015001) ENSSSCG00000058217 SLN (ENSSSCG00000029651) ELMOD1 (ENSSSCG00000015002) ALKBH8 (ENSSSCG00000024628) ENSSSCG00000056752 CWF19L2 (ENSSSCG00000028201) KBTBD3 (ENSSSCG00000014999) AASDHPPT (ENSSSCG00000014998) MSANTD4 (ENSSSCG00000026833) GRIA4 (ENSSSCG00000030565) ENSSSCG00000037097 #22 CASP1 (ENSSSCG00000028711) ENSSSCG00000014997 ENSSSCG00000014996 ENSSSCG00000032358 DDI1 (ENSSSCG00000014995) PDGFD (ENSSSCG00000014994) DYNC2H1 (ENSSSCG00000033937) DCUN1D5 (ENSSSCG00000014989) ENSSSCG00000035427 MMP13 (ENSSSCG00000014988) MMP12 (ENSSSCG00000014987) MMP3 (ENSSSCG00000059078) MMP1 (ENSSSCG00000014985) MMP8 (ENSSSCG00000029675) MMP27 (ENSSSCG00000014984) Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.b.b #22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.b.b #22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.b.b #22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.b.b #22 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.b.b #22 Ferret MODERN SPECIES 370 PALMD (ENSMPUG00000012296) FRRS1 (ENSMPUG00000012289) AGL (ENSMPUG00000012276) SLC35A3 (ENSMPUG00000012271) MFSD14A (ENSMPUG00000012186) SASS6 (ENSMPUG00000012172) ENSMPUG00000012169 LRRC39 (ENSMPUG00000012163) DBT (ENSMPUG00000012125) RTCA (ENSMPUG00000012119) CDC14A (ENSMPUG00000012099) ENSMPUG00000012086 #22 VCAM1 (ENSMPUG00000012080) EXTL2 (ENSMPUG00000012075) SLC30A7 (ENSMPUG00000012069) DPH5 (ENSMPUG00000012063) S1PR1 (ENSMPUG00000018549) OLFM3 (ENSMPUG00000012056) ENSMPUG00000018544 COL11A1 (ENSMPUG00000012034) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.b.b #22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.b.b #22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.b.b #22 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.a.b.b #22 Mouse lemur MODERN SPECIES 22 DLGAP5 (ENSMICG00000016289) ENSMICG00000042184 ENSMICG00000041981 ATG14 (ENSMICG00000000939) TBPL2 (ENSMICG00000000943) KTN1 (ENSMICG00000032329) EAPP (ENSMICG00000044807) SPTSSA (ENSMICG00000046623) ENSMICG00000032213 ENSMICG00000047011 EGLN3 (ENSMICG00000000618) NPAS3 (ENSMICG00000031841) AKAP6 (ENSMICG00000027865) ARHGAP5 (ENSMICG00000007275) NUBPL (ENSMICG00000034340) ENSMICG00000027167 #22 DTD2 (ENSMICG00000030584) HEATR5A (ENSMICG00000007619) HECTD1 (ENSMICG00000034057) AP4S1 (ENSMICG00000003359) STRN3 (ENSMICG00000026845) COCH (ENSMICG00000003344) SCFD1 (ENSMICG00000004149) G2E3 (ENSMICG00000014597) PRKD1 (ENSMICG00000001016) NOVA1 (ENSMICG00000034677) STXBP6 (ENSMICG00000035834) ENSMICG00000017194 ENSMICG00000027192 ENSMICG00000010090 DHRS2 (ENSMICG00000044785) Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT01030000235089 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT01030000235508 ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.u.a.e #22 ENSGT00940000164532 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.d ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B ENSGT00940000159338 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000160677 ENSGT01030000235089 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT01030000235508 ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00940000164532 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.d ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B ENSGT00940000159338 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000160677 ENSGT01030000235089 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT01030000235508 ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00940000164532 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.d ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B ENSGT00940000159338 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000161691 ENSGT01030000235089 ENSGT00940000154992.b ENSGT01030000235508 ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00940000164532 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.d ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B ENSGT00940000159338 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000161691 ENSGT01030000235089 ENSGT00940000154992.b ENSGT01030000235508 ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00940000164532 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.d ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B ENSGT00940000159338 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000161691 ENSGT01030000235089 ENSGT00940000154992.b ENSGT01030000235508 ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00910000146711 ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00940000164532 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.d ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B ENSGT00940000159338 Pecora ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT01030000235508 ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00910000146711 ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00940000164532 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.d ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163271.k.b ENSGT00940000163271.k.a ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B ENSGT00940000159338 Percora_a ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT01030000235508 ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT00910000146711 ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00940000164532 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.d.c.b ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163271.k.b ENSGT00940000163271.k.a ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B ENSGT00940000159338 Bovidae ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT01030000235508 ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00910000146711 ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00940000164532 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.d.c.b ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163271.k.b ENSGT00940000163271.k.a ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B ENSGT00940000159338 Caprinae DUPLICATION Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.a #22 Goat MODERN SPECIES 14 ACVR2B (ENSCHIG00000013125) EXOG (ENSCHIG00000013450) SCN5A (ENSCHIG00000015851) SCN10A (ENSCHIG00000009678) SCN11A (ENSCHIG00000021823) ENSCHIG00000024599 WDR48 (ENSCHIG00000009086) GORASP1 (ENSCHIG00000013463) TTC21A (ENSCHIG00000018055) CSRNP1 (ENSCHIG00000021961) XIRP1 (ENSCHIG00000012180) CX3CR1 (ENSCHIG00000007770) CCR8 (ENSCHIG00000006778) SLC25A38 (ENSCHIG00000022960) #21 ENSCHIG00000019656 RPSA (ENSCHIG00000011924) #22 MOBP (ENSCHIG00000011974) MYRIP (ENSCHIG00000020641) EIF1B (ENSCHIG00000022430) ENSCHIG00000011303 ENTPD3 (ENSCHIG00000023900) ENSCHIG00000019403 ENSCHIG00000015104 ZNF621 (ENSCHIG00000025599) CTNNB1 (ENSCHIG00000025557) ULK4 (ENSCHIG00000013341) TRAK1 (ENSCHIG00000010986) CCK (ENSCHIG00000018036) LYZL4 (ENSCHIG00000015680) VIPR1 (ENSCHIG00000021318) SEC22C (ENSCHIG00000009698) Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 15 SS18 (ENSOARG00020025456) ZNF521 (ENSOARG00020025499) HRH4 (ENSOARG00020025511) ENSOARG00020025524 OSBPL1A (ENSOARG00020025534) CABYR (ENSOARG00020025548) TTC39C (ENSOARG00020025558) LAMA3 (ENSOARG00020025616) ANKRD29 (ENSOARG00020025754) ENSOARG00020025767 RMC1 (ENSOARG00020025860) RIOK3 (ENSOARG00020025882) TMEM241 (ENSOARG00020025890) CABLES1 (ENSOARG00020025896) ENSOARG00020025903 ENSOARG00020025909 #22 GATA6 (ENSOARG00020025920) MIB1 (ENSOARG00020025946) ABHD3 (ENSOARG00020006344) SNRPD1 (ENSOARG00020006388) ESCO1 (ENSOARG00020006426) GREB1L (ENSOARG00020006670) ENSOARG00020007128 ROCK1 (ENSOARG00020007167) ENSOARG00020007491 USP14 (ENSOARG00020007526) THOC1 (ENSOARG00020007727) ENSOARG00020008122 COLEC12 (ENSOARG00020008142) CETN1 (ENSOARG00020008212) CLUL1 (ENSOARG00020008252) Caprinae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00390000003022.h ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00940000164532 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.d.c.b ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163271.k.a ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B ENSGT00940000159338 ENSGT00940000160407.e.a.b Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 10 ACVR2B (ENSOARG00020010379) EXOG (ENSOARG00020010558) SCN5A (ENSOARG00020010796) SCN10A (ENSOARG00020016009) SCN11A (ENSOARG00020016401) ENSOARG00020017210 WDR48 (ENSOARG00020017277) GORASP1 (ENSOARG00020017397) TTC21A (ENSOARG00020017528) CSRNP1 (ENSOARG00020017752) ENSOARG00020017791 CX3CR1 (ENSOARG00020017818) ENSOARG00020017853 SLC25A38 (ENSOARG00020017915) #21 ENSOARG00020018132 RPSA (ENSOARG00020018166) #22 MOBP (ENSOARG00020018246) MYRIP (ENSOARG00020018291) EIF1B (ENSOARG00020018597) ENTPD3 (ENSOARG00020018647) RPL14 (ENSOARG00020018769) ENSOARG00020018919 ENSOARG00020018961 CTNNB1 (ENSOARG00020019145) ULK4 (ENSOARG00020019556) ENSOARG00020019793 TRAK1 (ENSOARG00020019973) CCK (ENSOARG00020021710) LYZL4 (ENSOARG00020021737) VIPR1 (ENSOARG00020021791) SEC22C (ENSOARG00020022269) Bovinae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT01030000235508 ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B.f ENSGT01020000230359.A ENSGT00910000146711 ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00940000164532 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.d.c.b ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163271.k.b ENSGT00940000163271.k.a ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B ENSGT00940000159338 Bos ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT01100000263480.a.a.b.b.b.a.a.a.a.a.b.b.a.a.b.a.b ENSGT00940000160677 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT01030000235508 ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B.f ENSGT01020000230359.A ENSGT00910000146711 ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00940000164532 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.d.c.b ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163271.k.b ENSGT00940000163271.k.a ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B ENSGT00940000159338 Bos_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT01100000263480.a.a.b.b.b.a.a.a.a.a.b.b.a.a.b.a.b ENSGT00940000160677 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT01030000235508 ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B.e ENSGT01020000230359.A ENSGT00910000146711 ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00940000164532 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.d.c.b ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163271.k.b ENSGT00940000163271.k.a ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B ENSGT00940000159338 Wild yak MODERN SPECIES 2473 CX3CR1 (ENSBMUG00000024370) ENSBMUG00000024360 SLC25A38 (ENSBMUG00000024350) #21 ENSBMUG00000024316 ENSBMUG00000024306 #22 ENSBMUG00000024295 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT01100000263480.a.a.b.b.b.a.a.a.a.a.b.b.a.a.b.a.b ENSGT00940000160677 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a.e ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B.f ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00910000146711 ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00940000164532 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.d.c.b ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163271.k.b ENSGT00940000163271.k.a ENSGT00390000005727.a.b.b.b ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B Cow MODERN SPECIES 14 SCN5A (ENSBTAG00000009155) SCN10A (ENSBTAG00000046911) ENSBTAG00000054304 SCN11A (ENSBTAG00000017174) WDR48 (ENSBTAG00000003745) GORASP1 (ENSBTAG00000047135) ENSBTAG00000050991 TTC21A (ENSBTAG00000010477) CSRNP1 (ENSBTAG00000003845) XIRP1 (ENSBTAG00000046512) CX3CR1 (ENSBTAG00000002923) CCR8 (ENSBTAG00000015483) ENSBTAG00000015493 SLC25A38 (ENSBTAG00000022721) #21 ENSBTAG00000009760 RPSA (ENSBTAG00000009757) #22 MOBP (ENSBTAG00000009774) MYRIP (ENSBTAG00000009430) EIF1B (ENSBTAG00000019106) ENTPD3 (ENSBTAG00000011702) RPL14 (ENSBTAG00000002038) ZNF619 (ENSBTAG00000053485) ZNF621 (ENSBTAG00000018057) ENSBTAG00000051328 ENSBTAG00000047441 CTNNB1 (ENSBTAG00000016420) ULK4 (ENSBTAG00000051466) TRAK1 (ENSBTAG00000016076) CCK (ENSBTAG00000013027) LYZL4 (ENSBTAG00000018601) VIPR1 (ENSBTAG00000006567) Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 14 EXOG 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Vaquita MODERN SPECIES 11 FUT8 (ENSPSNG00000006781) MAX (ENSPSNG00000006586) FNTB (ENSPSNG00000006463) ENSPSNG00000006411 CHURC1 (ENSPSNG00000006344) ENSPSNG00000020417 PLEKHG3 (ENSPSNG00000014982) PPP1R36 (ENSPSNG00000014651) HSPA2 (ENSPSNG00000014566) ZBTB1 (ENSPSNG00000014501) ZBTB25 (ENSPSNG00000014448) AKAP5 (ENSPSNG00000014406) MTHFD1 (ENSPSNG00000014216) ENSPSNG00000014056 ESR2 (ENSPSNG00000013759) ENSPSNG00000013644 #22 SYNE2 (ENSPSNG00000013154) SGPP1 (ENSPSNG00000012953) WDR89 (ENSPSNG00000012922) PPP2R5E (ENSPSNG00000012853) GPHB5 (ENSPSNG00000012813) RHOJ (ENSPSNG00000012762) KCNH5 (ENSPSNG00000012407) ENSPSNG00000012344 SYT16 (ENSPSNG00000012248) ENSPSNG00000012202 SNAPC1 (ENSPSNG00000012156) HIF1A (ENSPSNG00000011918) PRKCH (ENSPSNG00000011826) TMEM30B (ENSPSNG00000011798) ENSPSNG00000011751 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.d #22 Vaquita MODERN SPECIES AXDND1 (ENSPSNG00000001188) SOAT1 (ENSPSNG00000001097) ENSPSNG00000001039 ABL2 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ENSGT00940000160677 ENSGT01030000235089 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00940000164532 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.d ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B ENSGT00940000159338 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b #22 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES 121 ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT01030000235089 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00940000164532 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b #22 American mink MODERN SPECIES 727 ENSNVIG00000001588 SLC25A38 (ENSNVIG00000001549) #21 ENSNVIG00000001526 ENSNVIG00000001506 #22 Ursidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b #22 Giant Panda MODERN SPECIES ENSAMEG00000030171 IQCJ (ENSAMEG00000013634) ENSAMEG00000014596 ENSAMEG00000003144 ENSAMEG00000031019 C3orf80 (ENSAMEG00000030959) IFT80 (ENSAMEG00000002218) SMC4 (ENSAMEG00000002220) TRIM59 (ENSAMEG00000018682) KPNA4 (ENSAMEG00000017556) ENSAMEG00000019243 ARL14 (ENSAMEG00000019231) ENSAMEG00000011027 PPM1L (ENSAMEG00000017554) B3GALNT1 (ENSAMEG00000023599) ENSAMEG00000030249 #22 NMD3 (ENSAMEG00000001584) SPTSSB (ENSAMEG00000019073) OTOL1 (ENSAMEG00000027620) SI (ENSAMEG00000007629) SLITRK3 (ENSAMEG00000028681) ENSAMEG00000027782 BCHE (ENSAMEG00000007861) ENSAMEG00000025426 ZBBX (ENSAMEG00000006885) SERPINI2 (ENSAMEG00000002206) WDR49 (ENSAMEG00000002198) PDCD10 (ENSAMEG00000002181) SERPINI1 (ENSAMEG00000002160) GOLIM4 (ENSAMEG00000002129) MECOM (ENSAMEG00000002052) Ursus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b #22 American black bear MODERN SPECIES 7895 ENSUAMG00000009060 #22 ENSUAMG00000009059 MOBP (ENSUAMG00000009058) Canidae ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00940000164532 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.d ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00390000014309.db ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B Red fox MODERN SPECIES 207 SLC9A9 (ENSVVUG00000008631) CUNH3orf58 (ENSVVUG00000008585) ENSVVUG00000008573 #22 ENSVVUG00000008547 PLOD2 (ENSVVUG00000008510) PLSCR4 (ENSVVUG00000008506) Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677.a ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00940000168257 ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00940000164532 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.d ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00390000014309.db ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B Dingo MODERN SPECIES 80 GRK7 (ENSCAFG00020008625) ATP1B3 (ENSCAFG00020008628) TFDP2 (ENSCAFG00020008640) GK5 (ENSCAFG00020008666) XRN1 (ENSCAFG00020009120) ATR (ENSCAFG00020009248) ENSCAFG00020009852 PLS1 (ENSCAFG00020009887) TRPC1 (ENSCAFG00020010411) PCOLCE2 (ENSCAFG00020010443) PAQR9 (ENSCAFG00020010463) U2SURP (ENSCAFG00020010497) CHST2 (ENSCAFG00020011451) SLC9A9 (ENSCAFG00020011470) DIPK2A (ENSCAFG00020011532) ENSCAFG00020011537 #22 ENSCAFG00020011539 PLOD2 (ENSCAFG00020011739) PLSCR4 (ENSCAFG00020018835) ENSCAFG00020018841 PLSCR1 (ENSCAFG00020018849) PLSCR5 (ENSCAFG00020018852) ENSCAFG00020018869 ZIC4 (ENSCAFG00020018878) ZIC1 (ENSCAFG00020018881) AGTR1 (ENSCAFG00020018902) CPB1 (ENSCAFG00020018903) CPA3 (ENSCAFG00020018916) GYG1 (ENSCAFG00020018942) HLTF (ENSCAFG00020018945) HPS3 (ENSCAFG00020018969) Dog DUPLICATION Dog MODERN SPECIES 15 ATP1B3 (ENSCAFG00845028285) TFDP2 (ENSCAFG00845028411) GK5 (ENSCAFG00845028559) XRN1 (ENSCAFG00845028618) ATR (ENSCAFG00845028753) ENSCAFG00845028887 PLS1 (ENSCAFG00845028912) TRPC1 (ENSCAFG00845028972) PCOLCE2 (ENSCAFG00845029069) PAQR9 (ENSCAFG00845029107) U2SURP (ENSCAFG00845029146) CHST2 (ENSCAFG00845029239) SLC9A9 (ENSCAFG00845029260) DIPK2A (ENSCAFG00845019923) ENSCAFG00845019990 ENSCAFG00845020135 #22 ENSCAFG00845020319 PLOD2 (ENSCAFG00845020429) PLSCR4 (ENSCAFG00845020987) ENSCAFG00845021095 PLSCR1 (ENSCAFG00845021201) PLSCR5 (ENSCAFG00845021401) ENSCAFG00845021640 ZIC4 (ENSCAFG00845021719) ZIC1 (ENSCAFG00845021895) AGTR1 (ENSCAFG00845022234) CPB1 (ENSCAFG00845022322) GYG1 (ENSCAFG00845022687) HLTF (ENSCAFG00845022829) HPS3 (ENSCAFG00845023096) CP (ENSCAFG00845023529) Dog MODERN SPECIES 15 XYLB (ENSCAFG00845030016) ACVR2B (ENSCAFG00845030040) ENSCAFG00845030066 SCN5A (ENSCAFG00845030126) SCN10A (ENSCAFG00845030217) SCN11A (ENSCAFG00845030314) WDR48 (ENSCAFG00845030481) GORASP1 (ENSCAFG00845030523) TTC21A (ENSCAFG00845030584) CSRNP1 (ENSCAFG00845030607) XIRP1 (ENSCAFG00845030624) CX3CR1 (ENSCAFG00845015921) ENSCAFG00845015968 SLC25A38 (ENSCAFG00845016032) #21 ENSCAFG00845016104 RPSA (ENSCAFG00845016169) #22 MOBP (ENSCAFG00845016306) ENSCAFG00845016370 MYRIP (ENSCAFG00845016543) EIF1B (ENSCAFG00845016850) ENTPD3 (ENSCAFG00845017017) RPL14 (ENSCAFG00845017115) ZNF619 (ENSCAFG00845017162) ENSCAFG00845017197 ZNF621 (ENSCAFG00845017292) CTNNB1 (ENSCAFG00845017609) ULK4 (ENSCAFG00845018029) ENSCAFG00845018652 TRAK1 (ENSCAFG00845018816) CCK (ENSCAFG00845019239) LYZL4 (ENSCAFG00845019314) Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT01030000235089 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00940000164532 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.d ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B ENSGT00940000159338 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000160677 ENSGT01030000235089 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.u.b.a.b #22 ENSGT00940000164532 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.d ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B ENSGT00940000159338 ENSGT00940000160407 Megabat MODERN SPECIES 143 ENSPVAG00000004567 #22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT01030000235089 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00940000164532 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.d ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B ENSGT00940000159338 ENSGT00940000160407 Microbat DUPLICATION Microbat DUPLICATION Microbat MODERN SPECIES 1396 ENSMLUG00000025508 #22 OR2Z1 (ENSMLUG00000014700) ENSMLUG00000029044 Microbat MODERN SPECIES 1355 SGPP1 (ENSMLUG00000025924) ENSMLUG00000028382 SYNE2 (ENSMLUG00000011730) ESR2 (ENSMLUG00000011894) ENSMLUG00000028260 #22 ENSMLUG00000024131 MTHFD1 (ENSMLUG00000016539) AKAP5 (ENSMLUG00000016552) ZBTB25 (ENSMLUG00000016556) ZBTB1 (ENSMLUG00000016560) PPP1R36 (ENSMLUG00000016570) ENSMLUG00000004268 Microbat DUPLICATION Microbat DUPLICATION Microbat DUPLICATION Microbat DUPLICATION Microbat MODERN SPECIES 1089 RNGTT (ENSMLUG00000003302) CNR1 (ENSMLUG00000014970) ENSMLUG00000023151 #22 SPACA1 (ENSMLUG00000014969) AKIRIN2 (ENSMLUG00000006200) ORC3 (ENSMLUG00000006187) RARS2 (ENSMLUG00000006165) SLC35A1 (ENSMLUG00000026341) CFAP206 (ENSMLUG00000008829) C6orf163 (ENSMLUG00000001851) SMIM8 (ENSMLUG00000002679) ZNF292 (ENSMLUG00000002535) CGA (ENSMLUG00000004278) HTR1E (ENSMLUG00000004277) ENSMLUG00000028760 SYNCRIP (ENSMLUG00000006919) SNX14 (ENSMLUG00000010890) NT5E (ENSMLUG00000009581) Microbat MODERN SPECIES 1257 TM9SF2 (ENSMLUG00000005464) UBAC2 (ENSMLUG00000001242) GPR183 (ENSMLUG00000001245) GPR18 (ENSMLUG00000017014) ENSMLUG00000029636 ENSMLUG00000024254 DOCK9 (ENSMLUG00000014111) SLC15A1 (ENSMLUG00000000006) ENSMLUG00000023148 #22 STK24 (ENSMLUG00000012880) FARP1 (ENSMLUG00000012869) Microbat MODERN SPECIES 978 CPLX3 (ENSMLUG00000022853) ULK3 (ENSMLUG00000013660) SCAMP2 (ENSMLUG00000013668) MPI (ENSMLUG00000013679) FAM219B (ENSMLUG00000013688) ENSMLUG00000013702 RPP25 (ENSMLUG00000004989) SCAMP5 (ENSMLUG00000022507) PPCDC (ENSMLUG00000004993) C15orf39 (ENSMLUG00000006010) COMMD4 (ENSMLUG00000012239) NEIL1 (ENSMLUG00000009589) SIN3A (ENSMLUG00000009694) PTPN9 (ENSMLUG00000009762) ENSMLUG00000027889 ENSMLUG00000022982 #22 ENSMLUG00000000038 IMP3 (ENSMLUG00000014032) SNX33 (ENSMLUG00000010647) CSPG4 (ENSMLUG00000014982) ODF3L1 (ENSMLUG00000015002) LINGO1 (ENSMLUG00000006372) HMG20A (ENSMLUG00000011648) PEAK1 (ENSMLUG00000015713) TSPAN3 (ENSMLUG00000001844) PSTPIP1 (ENSMLUG00000010432) Microbat MODERN SPECIES 1220 XYLB (ENSMLUG00000023159) ACVR2B (ENSMLUG00000022627) EXOG (ENSMLUG00000002789) ENSMLUG00000002798 SCN10A (ENSMLUG00000002821) SCN11A (ENSMLUG00000005563) WDR48 (ENSMLUG00000005608) GORASP1 (ENSMLUG00000005614) TTC21A (ENSMLUG00000005619) CSRNP1 (ENSMLUG00000005636) XIRP1 (ENSMLUG00000005639) CX3CR1 (ENSMLUG00000005650) CCR8 (ENSMLUG00000005654) SLC25A38 (ENSMLUG00000029709) #21 ENSMLUG00000023110 ENSMLUG00000003276 #22 ENSMLUG00000027526 MYRIP (ENSMLUG00000014419) EIF1B (ENSMLUG00000014425) ENTPD3 (ENSMLUG00000028733) RPL14 (ENSMLUG00000014429) ZNF621 (ENSMLUG00000015023) CTNNB1 (ENSMLUG00000008771) Microbat MODERN SPECIES 1046 B2M (ENSMLUG00000005388) SPG11 (ENSMLUG00000005361) EIF3J (ENSMLUG00000023600) CTDSPL2 (ENSMLUG00000011720) GOLM2 (ENSMLUG00000009503) ENSMLUG00000026881 #22 FRMD5 (ENSMLUG00000004791) ENSMLUG00000002196 WDR76 (ENSMLUG00000004781) MFAP1 (ENSMLUG00000013000) HYPK (ENSMLUG00000009424) SERINC4 (ENSMLUG00000009433) SERF2 (ENSMLUG00000024894) ENSMLUG00000025872 ELL3 (ENSMLUG00000009401) PDIA3 (ENSMLUG00000009380) CATSPER2 (ENSMLUG00000009375) STRC (ENSMLUG00000014042) ENSMLUG00000014035 PPIP5K1 (ENSMLUG00000014016) MAP1A (ENSMLUG00000014007) Equus ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00940000164532 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00910000147527 ENSGT00390000012078.b.x ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.d ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 Donkey MODERN SPECIES 13 ACVR2B (ENSEASG00005007540) EXOG (ENSEASG00005024860) SCN5A (ENSEASG00005007552) SCN10A (ENSEASG00005007571) SCN11A (ENSEASG00005007578) WDR48 (ENSEASG00005007582) ENSEASG00005007585 TTC21A (ENSEASG00005007589) CSRNP1 (ENSEASG00005038354) ENSEASG00005025143 CX3CR1 (ENSEASG00005032119) CCR8 (ENSEASG00005036988) ENSEASG00005007595 SLC25A38 (ENSEASG00005007597) #21 ENSEASG00005007598 ENSEASG00005007599 #22 ENSEASG00005038158 ENSEASG00005007603 ENSEASG00005007604 MYRIP (ENSEASG00005007606) EIF1B (ENSEASG00005036643) ENTPD3 (ENSEASG00005007614) RPL14 (ENSEASG00005007625) ZNF619 (ENSEASG00005007626) ZNF620 (ENSEASG00005037445) ZNF621 (ENSEASG00005024873) CTNNB1 (ENSEASG00005007634) ULK4 (ENSEASG00005007678) TRAK1 (ENSEASG00005007734) ENSEASG00005028679 LYZL4 (ENSEASG00005007902) Horse DUPLICATION Horse MODERN SPECIES 25 ENSECAG00000055291 TOMM7 (ENSECAG00000021807) RAPGEF5 (ENSECAG00000000395) CDCA7L (ENSECAG00000022400) DNAH11 (ENSECAG00000004819) SP4 (ENSECAG00000023324) ENSECAG00000043394 SP8 (ENSECAG00000040341) ENSECAG00000054779 ABCB5 (ENSECAG00000011338) ENSECAG00000048959 ITGB8 (ENSECAG00000019215) MACC1 (ENSECAG00000017364) TMEM196 (ENSECAG00000015956) POLR1F (ENSECAG00000014563) ENSECAG00000029412 #22 ENSECAG00000059503 TWIST1 (ENSECAG00000033207) ENSECAG00000018100 ENSECAG00000002478 HDAC9 (ENSECAG00000018816) SNX13 (ENSECAG00000021498) AHR (ENSECAG00000013393) AGR3 (ENSECAG00000012283) AGR2 (ENSECAG00000043283) TSPAN13 (ENSECAG00000010623) BZW2 (ENSECAG00000022038) ANKMY2 (ENSECAG00000014046) LRRC72 (ENSECAG00000013150) SOSTDC1 (ENSECAG00000012109) CRPPA (ENSECAG00000036217) Horse MODERN SPECIES 7 ACVR2B (ENSECAG00000019616) EXOG (ENSECAG00000015682) SCN5A (ENSECAG00000000813) SCN10A (ENSECAG00000017790) GORASP1 (ENSECAG00000016287) WDR48 (ENSECAG00000018492) GORASP1 (ENSECAG00000049721) CSRNP1 (ENSECAG00000000763) TTC21A (ENSECAG00000006305) XIRP1 (ENSECAG00000004725) CX3CR1 (ENSECAG00000004442) CCR8 (ENSECAG00000004303) ENSECAG00000000681 SLC25A38 (ENSECAG00000020785) #21 ENSECAG00000020548 RPSA (ENSECAG00000013062) #22 ENSECAG00000030326 ENSECAG00000050107 ENSECAG00000012893 MYRIP (ENSECAG00000005794) EIF1B (ENSECAG00000005758) ENTPD3 (ENSECAG00000017628) RPL14 (ENSECAG00000026813) ZNF619 (ENSECAG00000015232) ZNF620 (ENSECAG00000033227) ZNF621 (ENSECAG00000014679) ENSECAG00000035130 CTNNB1 (ENSECAG00000006949) ULK4 (ENSECAG00000021560) TRAK1 (ENSECAG00000014600) CCK (ENSECAG00000014143) Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b #22 Hedgehog MODERN SPECIES 6298 ENSEEUG00000005292 #22 Common shrew MODERN SPECIES 4903 ENSSARG00000014402 #22 Euarchontoglires DUPLICATION Euarchontoglires DUPLICATION Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.m.a #22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.m.a #22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.m.a #22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.m.a #22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.m.a #22 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.m.a #22 Eurasian red squirrel DUPLICATION Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 16 NQO2 (ENSSVLG00005007475) SERPINB6 (ENSSVLG00005007395) ENSSVLG00005007366 ENSSVLG00005006719 ENSSVLG00005006449 SERPINB1 (ENSSVLG00005006417) WRNIP1 (ENSSVLG00005006348) ENSSVLG00005006323 MYLK4 (ENSSVLG00005006200) ENSSVLG00005006132 GMDS (ENSSVLG00005014861) FOXC1 (ENSSVLG00005014837) FOXF2 (ENSSVLG00005014790) FOXQ1 (ENSSVLG00005014773) ENSSVLG00005014724 ENSSVLG00005014698 #22 ENSSVLG00005014684 HUS1B (ENSSVLG00005014653) EXOC2 (ENSSVLG00005014600) IRF4 (ENSSVLG00005014508) ENSSVLG00005014463 ENSSVLG00005014442 ENSSVLG00005014389 ENSSVLG00005014343 ENSSVLG00005014308 ENSSVLG00005014265 ENSSVLG00005014208 ENSSVLG00005014088 ENSSVLG00005013996 ENSSVLG00005013958 ZSCAN16 (ENSSVLG00005013915) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES SDR16C5 (ENSSVLG00005010895) ENSSVLG00005010860 CHCHD7 (ENSSVLG00005010790) PLAG1 (ENSSVLG00005010731) MOS (ENSSVLG00005010710) RPS20 (ENSSVLG00005010588) LYN (ENSSVLG00005010475) TGS1 (ENSSVLG00005010446) ENSSVLG00005010412 ENSSVLG00005010285 XKR4 (ENSSVLG00005010234) RP1 (ENSSVLG00005009858) SOX17 (ENSSVLG00005009789) MRPL15 (ENSSVLG00005009764) ENSSVLG00005009666 ENSSVLG00005009646 #22 TCEA1 (ENSSVLG00005009501) RGS20 (ENSSVLG00005009394) ENSSVLG00005009360 ATP6V1H (ENSSVLG00005009299) ENSSVLG00005009270 OPRK1 (ENSSVLG00005009227) ENSSVLG00005009204 ENSSVLG00005009187 NPBWR1 (ENSSVLG00005009175) ENSSVLG00005009157 RB1CC1 (ENSSVLG00005009081) ALKAL1 (ENSSVLG00005009002) ENSSVLG00005008883 ENSSVLG00005008837 PCMTD1 (ENSSVLG00005008801) Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.m.a #22 Rabbit MODERN SPECIES 5 ENSOCUG00000030799 ENSOCUG00000026258 RBMS3 (ENSOCUG00000004840) ENSOCUG00000036953 ZCWPW2 (ENSOCUG00000017720) ENSOCUG00000014956 CMC1 (ENSOCUG00000012793) EOMES (ENSOCUG00000000451) ENSOCUG00000004133 SLC4A7 (ENSOCUG00000013596) NEK10 (ENSOCUG00000007846) ENSOCUG00000029906 LRRC3B (ENSOCUG00000015216) OXSM (ENSOCUG00000015384) NGLY1 (ENSOCUG00000015362) ENSOCUG00000027075 #22 TOP2B (ENSOCUG00000000717) RARB (ENSOCUG00000000714) THRB (ENSOCUG00000004532) NR1D2 (ENSOCUG00000009329) ENSOCUG00000010961 NKIRAS1 (ENSOCUG00000002483) ENSOCUG00000006026 ENSOCUG00000039156 ENSOCUG00000031633 ZNF385D (ENSOCUG00000029070) ENSOCUG00000033619 SGO1 (ENSOCUG00000006050) ENSOCUG00000006039 PP2D1 (ENSOCUG00000017225) RAB5A (ENSOCUG00000012200) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.m.b #22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.m.b #22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.m.b #22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.m.b #22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.m.b #22 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.m.b #22 Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.m.b #22 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.m.b #22 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 23 ARPC4 (ENSUPAG00010022930) TADA3 (ENSUPAG00010022928) CAMK1 (ENSUPAG00010022925) BRPF1 (ENSUPAG00010022889) CPNE9 (ENSUPAG00010022882) MTMR14 (ENSUPAG00010022881) LHFPL4 (ENSUPAG00010022879) SETD5 (ENSUPAG00010022873) THUMPD3 (ENSUPAG00010022869) SRGAP3 (ENSUPAG00010022863) RAD18 (ENSUPAG00010022854) OXTR (ENSUPAG00010022853) CAV3 (ENSUPAG00010022852) SSUH2 (ENSUPAG00010022850) LMCD1 (ENSUPAG00010022849) ENSUPAG00010022848 #22 GRM7 (ENSUPAG00010022847) EDEM1 (ENSUPAG00010022843) ARL8B (ENSUPAG00010022842) BHLHE40 (ENSUPAG00010022838) ITPR1 (ENSUPAG00010022789) SUMF1 (ENSUPAG00010022782) ENSUPAG00010022780 LRRN1 (ENSUPAG00010022779) CRBN (ENSUPAG00010022777) TRNT1 (ENSUPAG00010022775) IL5RA (ENSUPAG00010022771) CNTN4 (ENSUPAG00010022747) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 12 MCM6 (ENSSVLG00005002280) DARS1 (ENSSVLG00005002326) CXCR4 (ENSSVLG00005002352) THSD7B (ENSSVLG00005002439) HNMT (ENSSVLG00005002599) SPOPL (ENSSVLG00005002616) NXPH2 (ENSSVLG00005002646) LRP1B (ENSSVLG00005002708) ENSSVLG00005002904 KYNU (ENSSVLG00005002948) ARHGAP15 (ENSSVLG00005003035) GTDC1 (ENSSVLG00005003107) ENSSVLG00005003174 ENSSVLG00005003208 ENSSVLG00005003222 ENSSVLG00005003233 #22 ACVR2A (ENSSVLG00005003270) ORC4 (ENSSVLG00005003298) MBD5 (ENSSVLG00005003333) EPC2 (ENSSVLG00005003372) KIF5C (ENSSVLG00005003411) LYPD6B (ENSSVLG00005003456) LYPD6 (ENSSVLG00005003472) MMADHC (ENSSVLG00005003507) ENSSVLG00005003548 RND3 (ENSSVLG00005003560) ENSSVLG00005003570 RBM43 (ENSSVLG00005003593) ENSSVLG00005003611 ENSSVLG00005003622 TNFAIP6 (ENSSVLG00005003640) Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.m.b #22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.m.b #22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.m.b #22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.m.b #22 Mas night monkey MODERN SPECIES 406 ENSANAG00000032954 ENSANAG00000037450 CXCL13 (ENSANAG00000037253) CNOT6L (ENSANAG00000023917) ENSANAG00000026675 ENSANAG00000035463 ENSANAG00000028297 FRAS1 (ENSANAG00000026061) ANXA3 (ENSANAG00000025473) ENSANAG00000011900 BMP2K (ENSANAG00000032256) PAQR3 (ENSANAG00000032440) ANTXR2 (ENSANAG00000020620) ENSANAG00000038151 PRDM8 (ENSANAG00000027638) ENSANAG00000018328 #22 FGF5 (ENSANAG00000029794) CFAP299 (ENSANAG00000029362) BMP3 (ENSANAG00000038265) PRKG2 (ENSANAG00000033813) ENSANAG00000019728 ENSANAG00000035812 ENSANAG00000032331 RASGEF1B (ENSANAG00000021844) ENSANAG00000034721 HNRNPD (ENSANAG00000035221) ENSANAG00000029054 ENOPH1 (ENSANAG00000025974) TMEM150C (ENSANAG00000000048) ENSANAG00000033681 SCD5 (ENSANAG00000031198) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000160677 ENSGT01030000235089 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT01030000235508 ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.u.a.e #22 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.n #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01090000263454 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000160677 ENSGT01030000235089 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT01030000235508 ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.u.a.e #22 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.n #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01090000263454 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B ENSGT00940000159338 Tree shrew MODERN SPECIES 2199 SLC25A38 (ENSTBEG00000015842) #21 ENSTBEG00000015946 #22 Glires ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000160677 ENSGT01030000235089.b ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT01030000235508 ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.u.a.e #22 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.n #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01090000263454 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B ENSGT00940000159338 Rodentia ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000160677 ENSGT01030000235089.b ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT01030000235508 ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.u.a.e #22 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.n #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01090000263454 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B ENSGT00940000159338 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.n #22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.n #22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.n #22 Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1787 Kctd12 (ENSNGAG00000009455) Acod1 (ENSNGAG00000011932) Cln5 (ENSNGAG00000018989) Fbxl3 (ENSNGAG00000017483) Mycbp2 (ENSNGAG00000021068) Sap130 (ENSNGAG00000022842) ENSNGAG00000017129 #22 Ammecr1l (ENSNGAG00000015443) Polr2d (ENSNGAG00000014862) Wdr33 (ENSNGAG00000023927) Gpr17 (ENSNGAG00000022752) Lims2 (ENSNGAG00000022419) Myo7b (ENSNGAG00000019990) Kangaroo rat MODERN SPECIES 447 Dlec1 (ENSDORG00000001553) ENSDORG00000004811 Oxsr1 (ENSDORG00000011949) Myd88 (ENSDORG00000005070) Xylb (ENSDORG00000029080) Acvr2b (ENSDORG00000008630) Exog (ENSDORG00000004332) Scn5a (ENSDORG00000010830) Scn10a (ENSDORG00000002823) Scn11a (ENSDORG00000025723) Wdr48 (ENSDORG00000011630) Gorasp1 (ENSDORG00000006460) Ttc21a (ENSDORG00000027538) Csrnp1 (ENSDORG00000006461) Cx3cr1 (ENSDORG00000015095) ENSDORG00000008267 #22 Mobp (ENSDORG00000005778) Eif1b (ENSDORG00000025252) Entpd3 (ENSDORG00000023903) ENSDORG00000026117 ENSDORG00000027315 ENSDORG00000008172 Lyzl4 (ENSDORG00000027391) ENSDORG00000023631 Ss18l2 (ENSDORG00000027512) ENSDORG00000023865 Zfp651 (ENSDORG00000027109) Klhl40 (ENSDORG00000029540) Hhatl (ENSDORG00000023899) Ccdc13 (ENSDORG00000028309) ENSDORG00000026058 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT01030000235089.b ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.n #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B ENSGT00940000159338 ENSGT00940000160407 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.n #22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.n #22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.n #22 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 147 SPOPL (ENSCLAG00000001710) NXPH2 (ENSCLAG00000017455) LRP1B (ENSCLAG00000002036) KYNU (ENSCLAG00000005935) ARHGAP15 (ENSCLAG00000006756) GTDC1 (ENSCLAG00000007819) ZEB2 (ENSCLAG00000002230) ACVR2A (ENSCLAG00000002708) ORC4 (ENSCLAG00000002811) MBD5 (ENSCLAG00000001690) EPC2 (ENSCLAG00000001768) KIF5C (ENSCLAG00000001868) LYPD6B (ENSCLAG00000002017) LYPD6 (ENSCLAG00000001952) MMADHC (ENSCLAG00000002129) ENSCLAG00000002537 #22 ENSCLAG00000002555 RBM43 (ENSCLAG00000002635) NMI (ENSCLAG00000002759) TNFAIP6 (ENSCLAG00000002857) RIF1 (ENSCLAG00000001517) NEB (ENSCLAG00000002157) ENSCLAG00000005398 CACNB4 (ENSCLAG00000005759) STAM2 (ENSCLAG00000001380) FMNL2 (ENSCLAG00000001515) PRPF40A (ENSCLAG00000001774) GALNT13 (ENSCLAG00000004217) KCNJ3 (ENSCLAG00000004537) Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT01030000235089.b ENSGT00940000161691 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ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B ENSGT00940000159338 ENSGT00940000160407.s.b Alpin marmot MODERN SPECIES 24 ENSMMMG00000010769 XYLB (ENSMMMG00000010614) ACVR2B (ENSMMMG00000010587) ENSMMMG00000010573 SCN5A (ENSMMMG00000010442) SCN10A (ENSMMMG00000010349) SCN11A (ENSMMMG00000010245) WDR48 (ENSMMMG00000010175) ENSMMMG00000010145 TTC21A (ENSMMMG00000010082) CSRNP1 (ENSMMMG00000010046) XIRP1 (ENSMMMG00000010043) CX3CR1 (ENSMMMG00000010040) CCR8 (ENSMMMG00000010034) SLC25A38 (ENSMMMG00000009978) #21 ENSMMMG00000009931 #22 ENSMMMG00000009874 ENSMMMG00000009844 EIF1B (ENSMMMG00000009817) ENTPD3 (ENSMMMG00000009806) ENSMMMG00000009798 ZNF619 (ENSMMMG00000009793) ENSMMMG00000009789 ZNF621 (ENSMMMG00000009736) CTNNB1 (ENSMMMG00000009709) ULK4 (ENSMMMG00000009644) TRAK1 (ENSMMMG00000009424) CCK (ENSMMMG00000009393) LYZL4 (ENSMMMG00000009375) VIPR1 (ENSMMMG00000009346) SEC22C (ENSMMMG00000009311) Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT01030000234626.C.e.b ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.n #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 Squirrel MODERN SPECIES 73 ENSSTOG00000006356 XYLB (ENSSTOG00000014855) ACVR2B (ENSSTOG00000014862) EXOG (ENSSTOG00000031572) SCN5A (ENSSTOG00000011601) SCN10A (ENSSTOG00000021843) SCN11A (ENSSTOG00000026394) WDR48 (ENSSTOG00000011459) GORASP1 (ENSSTOG00000022044) TTC21A (ENSSTOG00000011477) CSRNP1 (ENSSTOG00000026227) XIRP1 (ENSSTOG00000029242) CX3CR1 (ENSSTOG00000022978) CCR8 (ENSSTOG00000014102) SLC25A38 (ENSSTOG00000020267) #21 ENSSTOG00000014070 #22 MOBP (ENSSTOG00000020929) MYRIP (ENSSTOG00000012159) EIF1B (ENSSTOG00000012168) ENTPD3 (ENSSTOG00000009720) RPL14 (ENSSTOG00000021460) ZNF619 (ENSSTOG00000029300) CTNNB1 (ENSSTOG00000016129) ULK4 (ENSSTOG00000012095) Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 251 ENSUPAG00010010383 ENSUPAG00010010402 XYLB (ENSUPAG00010010422) ACVR2B (ENSUPAG00010010442) EXOG (ENSUPAG00010010465) SCN5A (ENSUPAG00010010481) SCN10A (ENSUPAG00010010549) SCN11A (ENSUPAG00010010615) WDR48 (ENSUPAG00010010707) GORASP1 (ENSUPAG00010010776) TTC21A (ENSUPAG00010010809) CSRNP1 (ENSUPAG00010010921) CX3CR1 (ENSUPAG00010010933) CCR8 (ENSUPAG00010010938) SLC25A38 (ENSUPAG00010010942) #21 ENSUPAG00010010947 #22 ENSUPAG00010010964 MYRIP (ENSUPAG00010010972) EIF1B (ENSUPAG00010010987) ENTPD3 (ENSUPAG00010010992) RPL14 (ENSUPAG00010011004) ZNF619 (ENSUPAG00010011027) ZNF621 (ENSUPAG00010011035) ENSUPAG00010011038 CTNNB1 (ENSUPAG00010011046) ULK4 (ENSUPAG00010011069) Eurasian red squirrel DUPLICATION Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 2 ENSSVLG00005018542 ENSSVLG00005018577 ENSSVLG00005018628 ENSSVLG00005018662 ENSSVLG00005018759 PATE1 (ENSSVLG00005018811) PATE2 (ENSSVLG00005018933) PATE3 (ENSSVLG00005019015) PUS3 (ENSSVLG00005019054) HYLS1 (ENSSVLG00005019099) DDX25 (ENSSVLG00005019148) ENSSVLG00005019300 ENSSVLG00005019361 VSIG10L2 (ENSSVLG00005019476) CDON (ENSSVLG00005019551) ENSSVLG00005019624 #22 RPUSD4 (ENSSVLG00005019658) FAM118B (ENSSVLG00005019758) SRPRA (ENSSVLG00005019885) FOXRED1 (ENSSVLG00005020162) TIRAP (ENSSVLG00005020272) DCPS (ENSSVLG00005020312) ST3GAL4 (ENSSVLG00005020349) KIRREL3 (ENSSVLG00005020503) ETS1 (ENSSVLG00005020912) FLI1 (ENSSVLG00005021096) KCNJ1 (ENSSVLG00005021312) KCNJ5 (ENSSVLG00005021346) ARHGAP32 (ENSSVLG00005021394) ENSSVLG00005021615 BARX2 (ENSSVLG00005021654) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES ENSSVLG00005000190 TMED5 (ENSSVLG00005000211) CCDC18 (ENSSVLG00005000256) DR1 (ENSSVLG00005000282) FNBP1L (ENSSVLG00005000352) ENSSVLG00005000405 BCAR3 (ENSSVLG00005000445) DNTTIP2 (ENSSVLG00005000490) GCLM (ENSSVLG00005000523) ABCA4 (ENSSVLG00005000757) ARHGAP29 (ENSSVLG00005001033) ABCD3 (ENSSVLG00005001081) F3 (ENSSVLG00005001139) SLC44A3 (ENSSVLG00005001228) CNN3 (ENSSVLG00005001336) ENSSVLG00005001359 #22 ENSSVLG00005001370 ALG14 (ENSSVLG00005001385) TLCD4 (ENSSVLG00005001401) RWDD3 (ENSSVLG00005001426) ENSSVLG00005001437 PTBP2 (ENSSVLG00005001449) DPYD (ENSSVLG00005001470) SNX7 (ENSSVLG00005001512) PLPPR5 (ENSSVLG00005001555) PLPPR4 (ENSSVLG00005001606) PALMD (ENSSVLG00005001662) FRRS1 (ENSSVLG00005001689) AGL (ENSSVLG00005001738) ENSSVLG00005001793 ENSSVLG00005001824 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 7 EXOG (ENSSVLG00005024674) ENSSVLG00005024654 SCN5A (ENSSVLG00005023875) SCN10A 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ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.d ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B ENSGT00940000159338 ENSGT00940000158548 ENSGT00940000160089 Pika MODERN SPECIES 1900 ENSOPRG00000004489 #21 ENSOPRG00000004505 #22 Rabbit DUPLICATION Rabbit DUPLICATION Rabbit MODERN SPECIES 1401 ARHGAP36 (ENSOCUG00000015299) IGSF1 (ENSOCUG00000009769) ENSOCUG00000031494 ENSOCUG00000023391 OR13H1 (ENSOCUG00000011316) ENSOCUG00000034662 ENSOCUG00000039484 STK26 (ENSOCUG00000007358) FRMD7 (ENSOCUG00000025878) RAP2C (ENSOCUG00000010321) MBNL3 (ENSOCUG00000014979) HS6ST2 (ENSOCUG00000008183) ENSOCUG00000025094 GPC4 (ENSOCUG00000015005) GPC3 (ENSOCUG00000001752) ENSOCUG00000017157 #22 CCDC160 (ENSOCUG00000016626) PHF6 (ENSOCUG00000007022) HPRT1 (ENSOCUG00000003186) PLAC1 (ENSOCUG00000003197) ENSOCUG00000010038 ENSOCUG00000035074 ENSOCUG00000029737 MOSPD1 (ENSOCUG00000010049) 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ENSGT00940000162293 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.n #22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.n #22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.n #22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.n #22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.n #22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.n #22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.n #22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.n #22 Sooty mangabey MODERN SPECIES 215 RAB2B (ENSCATG00000044849) CHD8 (ENSCATG00000004861) SUPT16H (ENSCATG00000036660) RPGRIP1 (ENSCATG00000043832) ENSCATG00000030828 ENSCATG00000028025 TMEM253 (ENSCATG00000030179) ZNF219 (ENSCATG00000014440) ARHGEF40 (ENSCATG00000033702) TPPP2 (ENSCATG00000032548) NDRG2 (ENSCATG00000044168) SLC39A2 (ENSCATG00000036547) METTL17 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ENSGT00940000164532.d ENSGT00940000164532.c ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a #22 ENSGT01050000244942.b.a.b ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT00390000003571 ENSGT00940000155697.A ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00390000001296 ENSGT00940000156463 ENSGT00390000012690 ENSGT00940000155721 ENSGT00950000183130.C ENSGT00950000183186.B.b ENSGT00390000010209 ENSGT00390000009719 koala DUPLICATION koala MODERN SPECIES 27 ENSPCIG00000004656 ENSPCIG00000026738 TAAR5 (ENSPCIG00000026740) ENSPCIG00000036119 ENSPCIG00000026745 ENSPCIG00000031817 ENSPCIG00000032195 ENSPCIG00000030801 ENSPCIG00000034198 ENSPCIG00000034672 TAAR9 (ENSPCIG00000033886) ENSPCIG00000031635 STX7 (ENSPCIG00000029100) ENSPCIG00000034276 MOXD1 (ENSPCIG00000029101) ENSPCIG00000014914 #22 CCN2 (ENSPCIG00000009440) ENPP1 (ENSPCIG00000010328) ENSPCIG00000035631 ENPP3 (ENSPCIG00000008801) MED23 (ENSPCIG00000016019) ARG1 (ENSPCIG00000016352) ENSPCIG00000020677 EPB41L2 (ENSPCIG00000020678) SAMD3 (ENSPCIG00000010285) L3MBTL3 (ENSPCIG00000031927) ARHGAP18 (ENSPCIG00000005065) LAMA2 (ENSPCIG00000013422) PTPRK (ENSPCIG00000019692) THEMIS (ENSPCIG00000024955) ENSPCIG00000033967 koala MODERN SPECIES 28 ENSPCIG00000034934 ENSPCIG00000026017 CDK6 (ENSPCIG00000030740) ENSPCIG00000002108 ENSPCIG00000002097 SUSD5 (ENSPCIG00000003505) CRTAP (ENSPCIG00000010418) GLB1 (ENSPCIG00000010406) CCR4 (ENSPCIG00000010402) CX3CR1 (ENSPCIG00000010400) CCR8 (ENSPCIG00000036945) ENSPCIG00000032234 SLC25A38 (ENSPCIG00000007860) #21 ENSPCIG00000036695 ENSPCIG00000012582 ENSPCIG00000012575 #22 TMC2 (ENSPCIG00000012572) ENSPCIG00000014355 ENSPCIG00000034043 ENSPCIG00000003822 ENSPCIG00000005018 ENSPCIG00000005026 ENSPCIG00000004556 ENSPCIG00000037453 ENSPCIG00000036948 EIF1B (ENSPCIG00000016375) CCK (ENSPCIG00000022691) TRAK1 (ENSPCIG00000016370) ULK4 (ENSPCIG00000014784) CTNNB1 (ENSPCIG00000014703) ENSPCIG00000035837 Theria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b #22 Eutheria DUPLICATION Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a #22 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a #22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a #22 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a #22 Elephant MODERN SPECIES 472 ENSLAFG00000007786 ENSLAFG00000022756 UHRF2 (ENSLAFG00000000669) GLDC (ENSLAFG00000000430) KDM4C (ENSLAFG00000013829) DMAC1 (ENSLAFG00000012977) PTPRD (ENSLAFG00000017308) ENSLAFG00000027855 TYRP1 (ENSLAFG00000001901) LURAP1L (ENSLAFG00000001902) MPDZ (ENSLAFG00000018210) NFIB (ENSLAFG00000000868) ZDHHC21 (ENSLAFG00000008950) CER1 (ENSLAFG00000014736) FREM1 (ENSLAFG00000008954) ENSLAFG00000028826 #22 TTC39B (ENSLAFG00000013786) SNAPC3 (ENSLAFG00000013869) PSIP1 (ENSLAFG00000013878) CCDC171 (ENSLAFG00000013490) BNC2 (ENSLAFG00000000476) ENSLAFG00000021349 ENSLAFG00000027513 CNTLN (ENSLAFG00000007075) SH3GL2 (ENSLAFG00000005475) ADAMTSL1 (ENSLAFG00000011076) SAXO1 (ENSLAFG00000011081) RRAGA (ENSLAFG00000011082) HAUS6 (ENSLAFG00000011084) PLIN2 (ENSLAFG00000011091) DENND4C (ENSLAFG00000010751) Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a #22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a #22 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a #22 Hedgehog MODERN SPECIES 9988 ENSEEUG00000010552 #22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a #22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a #22 Suina ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a #22 Pig MODERN SPECIES 14 ENSSSCG00000053348 MAPRE2 (ENSSSCG00000003738) ZNF397 (ENSSSCG00000039052) ZSCAN30 (ENSSSCG00000003740) ENSSSCG00000003741 ZNF24 (ENSSSCG00000023276) ZNF396 (ENSSSCG00000030018) INO80C (ENSSSCG00000038859) GALNT1 (ENSSSCG00000003743) C18orf21 (ENSSSCG00000030002) RPRD1A (ENSSSCG00000027700) SLC39A6 (ENSSSCG00000027455) ELP2 (ENSSSCG00000020898) MOCOS (ENSSSCG00000003744) FHOD3 (ENSSSCG00000027935) ENSSSCG00000003746 #22 TPGS2 (ENSSSCG00000026953) KIAA1328 (ENSSSCG00000003747) ENSSSCG00000047288 ENSSSCG00000045019 CELF4 (ENSSSCG00000003748) PIK3C3 (ENSSSCG00000003749) ENSSSCG00000037233 SYT4 (ENSSSCG00000037079) KCNG2 (ENSSSCG00000005780) SLC66A2 (ENSSSCG00000023171) HSBP1L1 (ENSSSCG00000005778) TXNL4A (ENSSSCG00000005777) ENSSSCG00000038475 ADNP2 (ENSSSCG00000038632) PARD6G (ENSSSCG00000023376) Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a #22 Camelidae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000161691 ENSGT01030000235089 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT00910000146711 ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a #22 ENSGT00940000164532 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.d ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B ENSGT00940000159338 Alpaca MODERN SPECIES 2272 CCR8 (ENSVPAG00000012303) SLC25A38 (ENSVPAG00000012305) #21 ENSVPAG00000012307 #22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a #22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a #22 Felidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a #22 Cat MODERN SPECIES 249 NECAB1 (ENSFCAG00000003667) TMEM64 (ENSFCAG00000025477) CALB1 (ENSFCAG00000005505) DECR1 (ENSFCAG00000005501) NBN (ENSFCAG00000030357) OSGIN2 (ENSFCAG00000023415) RIPK2 (ENSFCAG00000018768) MMP16 (ENSFCAG00000027771) CNBD1 (ENSFCAG00000026138) CNGB3 (ENSFCAG00000013632) ENSFCAG00000052793 CPNE3 (ENSFCAG00000027515) ENSFCAG00000049116 RMDN1 (ENSFCAG00000011637) WWP1 (ENSFCAG00000025184) ENSFCAG00000018604 #22 ATP6V0D2 (ENSFCAG00000007936) PSKH2 (ENSFCAG00000024665) CA2 (ENSFCAG00000005137) CA3 (ENSFCAG00000031511) CA1 (ENSFCAG00000022214) RBIS (ENSFCAG00000026366) CA13 (ENSFCAG00000008686) LRRCC1 (ENSFCAG00000018992) ENSFCAG00000026605 RALYL (ENSFCAG00000030707) SNX16 (ENSFCAG00000010012) CHMP4C (ENSFCAG00000027266) ZFAND1 (ENSFCAG00000023384) IMPA1 (ENSFCAG00000031340) FABP12 (ENSFCAG00000033501) Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a #22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a #22 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a #22 Ferret DUPLICATION Ferret MODERN SPECIES 195 ASXL3 (ENSMPUG00000001206) NOL4 (ENSMPUG00000001205) DTNA (ENSMPUG00000001203) MAPRE2 (ENSMPUG00000001185) ZNF397 (ENSMPUG00000001181) ZSCAN30 (ENSMPUG00000001177) ENSMPUG00000001175 ENSMPUG00000001159 #22 ZNF24 (ENSMPUG00000001157) ZNF396 (ENSMPUG00000001156) ENSMPUG00000001155 INO80C (ENSMPUG00000001144) GALNT1 (ENSMPUG00000001141) C18orf21 (ENSMPUG00000001139) RPRD1A (ENSMPUG00000001133) SLC39A6 (ENSMPUG00000001131) ELP2 (ENSMPUG00000001125) ENSMPUG00000001121 ENSMPUG00000001116 FHOD3 (ENSMPUG00000001110) TPGS2 (ENSMPUG00000001097) KIAA1328 (ENSMPUG00000001094) CELF4 (ENSMPUG00000001027) Ferret MODERN SPECIES 378 ENSMPUG00000012027 ENSMPUG00000012036 ENSMPUG00000012041 GPM6A (ENSMPUG00000012044) WDR17 (ENSMPUG00000012048) SPATA4 (ENSMPUG00000012057) ASB5 (ENSMPUG00000012088) VEGFC (ENSMPUG00000012093) ENSMPUG00000012133 #22 NEIL3 (ENSMPUG00000012143) AGA (ENSMPUG00000012147) Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a #22 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000160169 ENSGT00920000149143 ENSGT00940000161505 ENSGT00940000158191 ENSGT00950000183192.a.a.b ENSGT00950000183195.b.a ENSGT00390000011890 ENSGT00940000159456 ENSGT00390000010899.a.a ENSGT00940000157229 ENSGT00390000007015 ENSGT00390000010770 ENSGT00940000156087 ENSGT00940000161537 ENSGT00390000016577 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a #22 ENSGT00390000007937 ENSGT00530000063737 ENSGT00530000064011 ENSGT00950000183128.C ENSGT00940000157848.f ENSGT00940000160477 ENSGT00390000011163.b ENSGT00940000158908 ENSGT00940000156521.b ENSGT00390000012412 ENSGT00940000154813 ENSGT00940000157501 ENSGT00940000159887 ENSGT00390000019941 ENSGT00940000154746.e.b Dog MODERN SPECIES 36 ZFYVE26 (ENSCAFG00845003602) RDH12 (ENSCAFG00845003571) RDH11 (ENSCAFG00845003551) VTI1B (ENSCAFG00845003511) ARG2 (ENSCAFG00845003478) PIGH (ENSCAFG00845003443) PLEKHH1 (ENSCAFG00845003414) TMEM229B (ENSCAFG00845003381) PLEK2 (ENSCAFG00845003328) EIF2S1 (ENSCAFG00845003308) ATP6V1D (ENSCAFG00845003279) PALS1 (ENSCAFG00845003252) GARIN2 (ENSCAFG00845003237) ENSCAFG00845003227 ENSCAFG00845003219 ENSCAFG00845003201 #22 GPHN (ENSCAFG00845003022) CCDC196 (ENSCAFG00845002927) ENSCAFG00845002877 ENSCAFG00845002859 ENSCAFG00845002840 ENSCAFG00845002829 FUT8 (ENSCAFG00845002810) MAX (ENSCAFG00845002666) FNTB (ENSCAFG00845002568) ENSCAFG00845002535 GPX2 (ENSCAFG00845002511) ENSCAFG00845002489 SPTB (ENSCAFG00845002451) PLEKHG3 (ENSCAFG00845002267) PPP1R36 (ENSCAFG00845002212) Dingo MODERN SPECIES 161 RDH11 (ENSCAFG00020006316) VTI1B (ENSCAFG00020006324) ARG2 (ENSCAFG00020006329) PIGH (ENSCAFG00020006335) PLEKHH1 (ENSCAFG00020006366) TMEM229B (ENSCAFG00020006534) PLEK2 (ENSCAFG00020006535) EIF2S1 (ENSCAFG00020006539) ATP6V1D (ENSCAFG00020006543) PALS1 (ENSCAFG00020006548) GARIN2 (ENSCAFG00020006693) GPHN (ENSCAFG00020006734) ENSCAFG00020006739 ENSCAFG00020006742 ENSCAFG00020006743 ENSCAFG00020006753 #22 CCDC196 (ENSCAFG00020006761) FUT8 (ENSCAFG00020006786) ENSCAFG00020006817 ENSCAFG00020006820 ENSCAFG00020006824 MAX (ENSCAFG00020006853) FNTB (ENSCAFG00020006858) RAB15 (ENSCAFG00020006867) GPX2 (ENSCAFG00020006873) ENSCAFG00020006879 SPTB (ENSCAFG00020006916) PLEKHG3 (ENSCAFG00020007103) PPP1R36 (ENSCAFG00020007140) HSPA2 (ENSCAFG00020007157) ZBTB1 (ENSCAFG00020007170) Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a #22 Equus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a #22 Donkey MODERN SPECIES 11 TBCE (ENSEASG00005001261) B3GALNT2 (ENSEASG00005001274) GNG4 (ENSEASG00005031442) ENSEASG00005004854 LYST (ENSEASG00005001718) NID1 (ENSEASG00005003319) GPR137B (ENSEASG00005003328) ERO1B (ENSEASG00005003339) EDARADD (ENSEASG00005035726) LGALS8 (ENSEASG00005003376) HEATR1 (ENSEASG00005003385) ACTN2 (ENSEASG00005003395) MTR (ENSEASG00005003419) RYR2 (ENSEASG00005004008) ENSEASG00005006867 ENSEASG00005038575 #22 ENSEASG00005029888 ENSEASG00005006874 ENSEASG00005024885 ENSEASG00005006878 ENSEASG00005035011 ENSEASG00005006886 ENSEASG00005006887 ENSEASG00005027928 ENSEASG00005034379 ENSEASG00005006894 RET (ENSEASG00005006900) CSGALNACT2 (ENSEASG00005006901) RASGEF1A (ENSEASG00005006902) ENSEASG00005026024 FXYD4 (ENSEASG00005028773) Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a #22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a #22 Microbat DUPLICATION Microbat MODERN SPECIES 937 ENSMLUG00000029686 ISOC1 (ENSMLUG00000023846) SLC27A6 (ENSMLUG00000011142) FBN2 (ENSMLUG00000008374) SLC12A2 (ENSMLUG00000008327) CTXN3 (ENSMLUG00000009416) PRRC1 (ENSMLUG00000010866) MEGF10 (ENSMLUG00000010818) C5orf63 (ENSMLUG00000002467) MARCHF3 (ENSMLUG00000009747) LMNB1 (ENSMLUG00000009721) ENSMLUG00000000184 ALDH7A1 (ENSMLUG00000002944) GRAMD2B (ENSMLUG00000002933) ENSMLUG00000028224 ENSMLUG00000023257 #22 ZNF608 (ENSMLUG00000008677) CSNK1G3 (ENSMLUG00000013708) CEP120 (ENSMLUG00000015490) PRDM6 (ENSMLUG00000010064) PPIC (ENSMLUG00000024456) SNX24 (ENSMLUG00000009392) SNX2 (ENSMLUG00000007851) SNCAIP (ENSMLUG00000012563) ENSMLUG00000012560 LOX (ENSMLUG00000026720) SRFBP1 (ENSMLUG00000009984) ENSMLUG00000030652 PRR16 (ENSMLUG00000016069) ENSMLUG00000022953 ENSMLUG00000023391 Microbat DUPLICATION Microbat MODERN SPECIES 1158 FOCAD (ENSMLUG00000003955) HACD4 (ENSMLUG00000003980) IFNB1 (ENSMLUG00000008021) KLHL9 (ENSMLUG00000007175) ENSMLUG00000026947 ENSMLUG00000027734 ENSMLUG00000023736 ENSMLUG00000030465 ENSMLUG00000027612 ENSMLUG00000028931 ENSMLUG00000024850 ENSMLUG00000027376 IFNE (ENSMLUG00000010970) MTAP (ENSMLUG00000014410) ENSMLUG00000030508 ENSMLUG00000024291 #22 CDKN2A (ENSMLUG00000029865) CDKN2B (ENSMLUG00000007025) ENSMLUG00000030162 Microbat MODERN SPECIES 983 FLNC (ENSMLUG00000001339) ENSMLUG00000001392 ATP6V1FNB (ENSMLUG00000027620) KCP (ENSMLUG00000001394) IRF5 (ENSMLUG00000001406) ENSMLUG00000026557 TNPO3 (ENSMLUG00000000947) ENSMLUG00000030322 TSPAN33 (ENSMLUG00000000974) SMO (ENSMLUG00000000966) ENSMLUG00000029505 ENSMLUG00000023124 ENSMLUG00000023097 AHCYL2 (ENSMLUG00000017565) STRIP2 (ENSMLUG00000007265) ENSMLUG00000023935 #22 SMKR1 (ENSMLUG00000027572) ENSMLUG00000028002 ENSMLUG00000003100 UBE2H (ENSMLUG00000000102) ENSMLUG00000000063 KLHDC10 (ENSMLUG00000025634) TMEM209 (ENSMLUG00000015369) SSMEM1 (ENSMLUG00000015383) CPA2 (ENSMLUG00000015389) CPA4 (ENSMLUG00000015399) ENSMLUG00000015407 CPA1 (ENSMLUG00000015415) CEP41 (ENSMLUG00000015427) MEST (ENSMLUG00000015437) COPG2 (ENSMLUG00000027742) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a #22 Primates DUPLICATION Primates DUPLICATION Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a.e.a #22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a.e.a #22 Bushbaby MODERN SPECIES 194 IL1RL2 (ENSOGAG00000008050) IL1R1 (ENSOGAG00000008049) IL1R2 (ENSOGAG00000012491) MAP4K4 (ENSOGAG00000012488) RFX8 (ENSOGAG00000033445) CREG2 (ENSOGAG00000003495) RNF149 (ENSOGAG00000034221) CNOT11 (ENSOGAG00000014506) TBC1D8 (ENSOGAG00000014498) ENSOGAG00000014494 NPAS2 (ENSOGAG00000014490) ENSOGAG00000026729 PDCL3 (ENSOGAG00000015138) NMS (ENSOGAG00000015135) CHST10 (ENSOGAG00000008178) ENSOGAG00000027230 #22 LONRF2 (ENSOGAG00000003794) AFF3 (ENSOGAG00000013262) REV1 (ENSOGAG00000013247) EIF5B (ENSOGAG00000013238) TXNDC9 (ENSOGAG00000013234) LYG1 (ENSOGAG00000013231) LYG2 (ENSOGAG00000002242) ENSOGAG00000002241 MITD1 (ENSOGAG00000002240) LIPT1 (ENSOGAG00000002238) ENSOGAG00000002233 CRACDL (ENSOGAG00000002228) MGAT4A (ENSOGAG00000011487) UNC50 (ENSOGAG00000011484) COA5 (ENSOGAG00000011481) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a.e.a #22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a.e.a #22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a.e.a #22 Mas night monkey MODERN SPECIES 1078 TMEM108 (ENSANAG00000022953) BFSP2 (ENSANAG00000021646) ENSANAG00000037850 TOPBP1 (ENSANAG00000029863) TF (ENSANAG00000011189) SRPRB (ENSANAG00000028236) RAB6B (ENSANAG00000017472) ENSANAG00000026314 SLCO2A1 (ENSANAG00000034598) RYK (ENSANAG00000019307) AMOTL2 (ENSANAG00000032616) ANAPC13 (ENSANAG00000024542) CEP63 (ENSANAG00000021086) KY (ENSANAG00000029898) EPHB1 (ENSANAG00000029295) ENSANAG00000035115 #22 PPP2R3A (ENSANAG00000033386) MSL2 (ENSANAG00000033232) PCCB (ENSANAG00000025980) STAG1 (ENSANAG00000026680) SLC35G2 (ENSANAG00000019929) NCK1 (ENSANAG00000004151) IL20RB (ENSANAG00000024924) SOX14 (ENSANAG00000013249) CLDN18 (ENSANAG00000032746) ENSANAG00000036905 DZIP1L (ENSANAG00000028445) A4GNT (ENSANAG00000009800) DBR1 (ENSANAG00000028952) ARMC8 (ENSANAG00000023313) NME9 (ENSANAG00000021464) Tarsier MODERN SPECIES 5951 ENSTSYG00000030190 #22 ENSTSYG00000026363 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a.e.b #22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a.e.b #22 Tarsier MODERN SPECIES 3033 ENSTSYG00000030034 #22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a.f #22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a.f #22 Tarsier MODERN SPECIES 4702 ENSTSYG00000035318 #22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a.f #22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a.f #22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a.f #22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a.f #22 Vervet Monkey MODERN SPECIES 25 CCNE1 (ENSCSAG00000004850) C19orf12 (ENSCSAG00000004862) PLEKHF1 (ENSCSAG00000018508) #37 POP4 (ENSCSAG00000004868) VSTM2B (ENSCSAG00000004872) UQCRFS1 (ENSCSAG00000004876) ENSCSAG00000004890 ENSCSAG00000004895 ENSCSAG00000004898 ZNF726 (ENSCSAG00000004902) ZNF681 (ENSCSAG00000004903) ENSCSAG00000004906 ENSCSAG00000018506 ENSCSAG00000004910 ZNF724 (ENSCSAG00000004914) ENSCSAG00000004919 #22 ENSCSAG00000004924 ENSCSAG00000004928 ENSCSAG00000004935 ENSCSAG00000018504 ENSCSAG00000004945 ENSCSAG00000004956 ENSCSAG00000004964 ENSCSAG00000004967 ZNF43 (ENSCSAG00000004971) ENSCSAG00000018502 ENSCSAG00000004974 ENSCSAG00000004976 ENSCSAG00000004980 ENSCSAG00000004984 ENSCSAG00000004989 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a.f #22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a.f #22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a.f #22 Drill MODERN SPECIES 1422 ENSMLEG00000003862 CACNA1E (ENSMLEG00000033118) ENSMLEG00000042627 #22 MR1 (ENSMLEG00000044129) STX6 (ENSMLEG00000037024) KIAA1614 (ENSMLEG00000031704) XPR1 (ENSMLEG00000040363) ENSMLEG00000043837 ACBD6 (ENSMLEG00000000612) LHX4 (ENSMLEG00000038342) Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a.f #22 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 113 LAMC2 (ENSMNEG00000034941) LAMC1 (ENSMNEG00000043245) ENSMNEG00000018461 SHCBP1L (ENSMNEG00000007697) DHX9 (ENSMNEG00000041195) NPL (ENSMNEG00000037920) RGS8 (ENSMNEG00000005442) RGS16 (ENSMNEG00000037294) RNASEL (ENSMNEG00000032732) RGSL1 (ENSMNEG00000043113) TEDDM1 (ENSMNEG00000023492) GLUL (ENSMNEG00000028425) ENSMNEG00000027953 CACNA1E (ENSMNEG00000036541) ENSMNEG00000035832 ENSMNEG00000030971 #22 IER5 (ENSMNEG00000026967) MR1 (ENSMNEG00000036147) STX6 (ENSMNEG00000036076) KIAA1614 (ENSMNEG00000035828) XPR1 (ENSMNEG00000033221) ACBD6 (ENSMNEG00000032228) LHX4 (ENSMNEG00000040868) QSOX1 (ENSMNEG00000032745) CEP350 (ENSMNEG00000042448) TOR1AIP1 (ENSMNEG00000029059) TOR1AIP2 (ENSMNEG00000032323) FAM163A (ENSMNEG00000041258) ENSMNEG00000036108 TDRD5 (ENSMNEG00000030554) NPHS2 (ENSMNEG00000035745) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a.f #22 Gibbon MODERN SPECIES 6 CRISPLD1 (ENSNLEG00000001758) HNF4G (ENSNLEG00000001920) ENSNLEG00000033520 ZFHX4 (ENSNLEG00000001972) PEX2 (ENSNLEG00000002007) PKIA (ENSNLEG00000002025) ZC2HC1A (ENSNLEG00000002029) IL7 (ENSNLEG00000002086) STMN2 (ENSNLEG00000002114) HEY1 (ENSNLEG00000030175) ENSNLEG00000034481 ENSNLEG00000002256 ENSNLEG00000034160 ENSNLEG00000035176 ZBTB10 (ENSNLEG00000002387) ENSNLEG00000032396 #22 ZNF704 (ENSNLEG00000002414) PAG1 (ENSNLEG00000002436) ENSNLEG00000035421 PMP2 (ENSNLEG00000002468) FABP9 (ENSNLEG00000002486) FABP4 (ENSNLEG00000002499) ENSNLEG00000031941 FABP12 (ENSNLEG00000002515) ENSNLEG00000035358 ENSNLEG00000033082 IMPA1 (ENSNLEG00000002540) SLC10A5 (ENSNLEG00000018239) ZFAND1 (ENSNLEG00000031659) CHMP4C (ENSNLEG00000002649) SNX16 (ENSNLEG00000002659) Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a.f #22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a.f #22 Gorilla MODERN SPECIES 21 HNF4G (ENSGGOG00000008488) ENSGGOG00000038569 ZFHX4 (ENSGGOG00000024837) PEX2 (ENSGGOG00000038623) PKIA (ENSGGOG00000024164) ZC2HC1A (ENSGGOG00000014981) ENSGGOG00000043346 IL7 (ENSGGOG00000000476) ENSGGOG00000038719 STMN2 (ENSGGOG00000004781) HEY1 (ENSGGOG00000009960) ENSGGOG00000036769 ENSGGOG00000022057 ENSGGOG00000025551 ZBTB10 (ENSGGOG00000015527) ENSGGOG00000025836 #22 ENSGGOG00000040617 ENSGGOG00000043203 ZNF704 (ENSGGOG00000008615) PAG1 (ENSGGOG00000010323) FABP5 (ENSGGOG00000040215) ENSGGOG00000037273 ENSGGOG00000038245 ENSGGOG00000025372 ENSGGOG00000036256 FABP4 (ENSGGOG00000007338) FABP12 (ENSGGOG00000016835) ENSGGOG00000039385 IMPA1 (ENSGGOG00000009176) SLC10A5 (ENSGGOG00000022257) ZFAND1 (ENSGGOG00000023665) Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a.f #22 Pan ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000160054 ENSGT00940000160631 ENSGT00940000158280 ENSGT00390000016493.b.a ENSGT00550000074952 ENSGT00940000154351.k.a ENSGT00390000017491.s.a.b.b ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.b.a ENSGT01000000214413.a ENSGT00940000157971 ENSGT00910000147188 ENSGT00940000155347.a.b ENSGT00940000154555.b.cb ENSGT00940000157573 ENSGT00950000183103.c ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a.f #22 ENSGT00940000160298 ENSGT00940000155174 ENSGT00950000183105.B.a.a.b ENSGT00940000156218 ENSGT00760000120436 ENSGT00950000183090.A ENSGT00940000160497 ENSGT00940000154745.b ENSGT00390000004930 ENSGT00940000160047.t ENSGT00530000063948.b ENSGT00940000155943.a ENSGT00940000158905 ENSGT00940000157298.b ENSGT01050000244970.b Bonobo MODERN SPECIES 6 ENSPPAG00000040680 TMOD2 (ENSPPAG00000030814) TMOD3 (ENSPPAG00000029067) ENSPPAG00000016895 LEO1 (ENSPPAG00000040132) MAPK6 (ENSPPAG00000026917) ENSPPAG00000034401 BCL2L10 (ENSPPAG00000036717) GNB5 (ENSPPAG00000039567) MYO5C (ENSPPAG00000038522) ENSPPAG00000004057 MYO5A (ENSPPAG00000028091) ARPP19 (ENSPPAG00000035761) ATOSA (ENSPPAG00000036434) ONECUT1 (ENSPPAG00000036491) ENSPPAG00000004218 #22 WDR72 (ENSPPAG00000043364) ENSPPAG00000028747 ENSPPAG00000012061 RAB27A (ENSPPAG00000030622) PIGBOS1 (ENSPPAG00000023425) PIGB (ENSPPAG00000042876) CCPG1 (ENSPPAG00000041408) PIERCE2 (ENSPPAG00000042984) DNAAF4 (ENSPPAG00000013865) ENSPPAG00000031216 PYGO1 (ENSPPAG00000031145) PRTG (ENSPPAG00000034279) ENSPPAG00000016223 ENSPPAG00000036985 ENSPPAG00000034242 Chimpanzee MODERN SPECIES 6 LYSMD2 (ENSPTRG00000007078) TMOD2 (ENSPTRG00000044713) TMOD3 (ENSPTRG00000007080) ENSPTRG00000044798 LEO1 (ENSPTRG00000007081) MAPK6 (ENSPTRG00000020224) ENSPTRG00000043753 BCL2L10 (ENSPTRG00000007083) GNB5 (ENSPTRG00000007084) MYO5C (ENSPTRG00000007085) ENSPTRG00000043417 MYO5A (ENSPTRG00000023562) ARPP19 (ENSPTRG00000051653) ATOSA (ENSPTRG00000007089) ONECUT1 (ENSPTRG00000007090) ENSPTRG00000048408 #22 WDR72 (ENSPTRG00000007092) UNC13C (ENSPTRG00000007093) RSL24D1 (ENSPTRG00000007094) RAB27A (ENSPTRG00000007095) PIGBOS1 (ENSPTRG00000044984) PIGB (ENSPTRG00000007096) CCPG1 (ENSPTRG00000034458) PIERCE2 (ENSPTRG00000052094) DNAAF4 (ENSPTRG00000007098) PYGO1 (ENSPTRG00000042720) PRTG (ENSPTRG00000007101) NEDD4 (ENSPTRG00000007102) ENSPTRG00000045291 RFX7 (ENSPTRG00000007104) TEX9 (ENSPTRG00000007105) Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a #22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a #22 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a #22 Rabbit DUPLICATION Rabbit MODERN SPECIES ENSOCUG00000029631 ENSOCUG00000030222 ENSOCUG00000009135 ENSOCUG00000035956 ENSOCUG00000033013 GRIN3A (ENSOCUG00000016738) RNF20 (ENSOCUG00000012019) ALDOB (ENSOCUG00000014944) ZNF189 (ENSOCUG00000014941) MRPL50 (ENSOCUG00000006340) ENSOCUG00000039388 ENSOCUG00000009723 ENSOCUG00000038477 ENSOCUG00000026800 PLPPR1 (ENSOCUG00000013668) ENSOCUG00000022518 #22 ENSOCUG00000030214 ENSOCUG00000025109 CAVIN4 (ENSOCUG00000022294) ENSOCUG00000006373 TEX10 (ENSOCUG00000004242) INVS (ENSOCUG00000004233) ERP44 (ENSOCUG00000004220) STX17 (ENSOCUG00000004217) NR4A3 (ENSOCUG00000000737) ENSOCUG00000039058 ALG2 (ENSOCUG00000005676) TGFBR1 (ENSOCUG00000016292) COL15A1 (ENSOCUG00000016236) GALNT12 (ENSOCUG00000016221) ANKS6 (ENSOCUG00000016201) Rabbit MODERN SPECIES 3 ENSOCUG00000031523 ENSOCUG00000030296 ENSOCUG00000033653 AKAP7 (ENSOCUG00000013991) ENSOCUG00000039380 ENSOCUG00000032736 EPB41L2 (ENSOCUG00000001799) ENSOCUG00000022399 TMEM200A (ENSOCUG00000008357) ENSOCUG00000030950 SAMD3 (ENSOCUG00000016249) L3MBTL3 (ENSOCUG00000016226) ENSOCUG00000022997 TMEM244 (ENSOCUG00000029600) ARHGAP18 (ENSOCUG00000009450) ENSOCUG00000024589 #22 ENSOCUG00000037260 LAMA2 (ENSOCUG00000009427) PTPRK (ENSOCUG00000001697) THEMIS (ENSOCUG00000006061) ENSOCUG00000037431 ENSOCUG00000031668 ENSOCUG00000033497 ENSOCUG00000033422 ENSOCUG00000037603 ENSOCUG00000008917 ENSOCUG00000000036 KIAA0408 (ENSOCUG00000027883) ENSOCUG00000030946 ENSOCUG00000036596 ECHDC1 (ENSOCUG00000006548) Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a #22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a #22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a #22 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 192 Smpx (ENSJJAG00000015249) Cnksr2 (ENSJJAG00000016115) ENSJJAG00000011807 ENSJJAG00000016309 ENSJJAG00000016365 #22 ENSJJAG00000016502 ENSJJAG00000011798 Rps6ka3 (ENSJJAG00000016899) Eif1ax (ENSJJAG00000016949) Map7d2 (ENSJJAG00000017202) Tmem47 (ENSJJAG00000017721) ENSJJAG00000018035 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a #22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a #22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a #22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a #22 Prairie vole MODERN SPECIES 13 ENSMOCG00000009835 Tle3 (ENSMOCG00000007663) ENSMOCG00000008158 Kif23 (ENSMOCG00000008773) Paqr5 (ENSMOCG00000009266) Glce (ENSMOCG00000019169) Spesp1 (ENSMOCG00000016907) ENSMOCG00000014776 ENSMOCG00000004428 Coro2b (ENSMOCG00000011097) Itga11 (ENSMOCG00000003119) Fem1b (ENSMOCG00000005442) Cln6 (ENSMOCG00000021992) Calml4 (ENSMOCG00000018493) Pias1 (ENSMOCG00000022074) ENSMOCG00000019235 #22 Skor1 (ENSMOCG00000018261) Map2k5 (ENSMOCG00000022058) 2300009A05Rik (ENSMOCG00000013991) Iqch (ENSMOCG00000016873) Aagab (ENSMOCG00000021340) Smad3 (ENSMOCG00000018490) Smad6 (ENSMOCG00000014458) Lctl (ENSMOCG00000004744) Zwilch (ENSMOCG00000017159) ENSMOCG00000021901 Snapc5 (ENSMOCG00000015348) Map2k1 (ENSMOCG00000013072) Tipin (ENSMOCG00000010343) Dis3l (ENSMOCG00000005278) Megf11 (ENSMOCG00000003573) Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a #22 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 76 Lrit2 (ENSCGRG00001017784) ENSCGRG00001016916 Cdhr1 (ENSCGRG00001012932) Gpr15lg (ENSCGRG00001000757) Ghitm (ENSCGRG00001023033) Nrg3 (ENSCGRG00001024148) Sh2d4b (ENSCGRG00001015755) Tspan14 (ENSCGRG00001013610) Prxl2a (ENSCGRG00001006989) Dydc2 (ENSCGRG00001005256) Dydc1 (ENSCGRG00001000992) Mat1a (ENSCGRG00001018656) Sftpa1 (ENSCGRG00001017978) Mbl1 (ENSCGRG00001017391) Sftpd (ENSCGRG00001016517) ENSCGRG00001014762 #22 ENSCGRG00001012384 Ube2e2 (ENSCGRG00001007796) Ube2e1 (ENSCGRG00001002657) Nkiras1 (ENSCGRG00001001506) Rpl15 (ENSCGRG00001021972) Nr1d2 (ENSCGRG00001007315) Thrb (ENSCGRG00001007517) Rarb (ENSCGRG00001000228) Top2b (ENSCGRG00001020296) Ngly1 (ENSCGRG00001015315) Oxsm (ENSCGRG00001010895) Lrrc3b (ENSCGRG00001010343) Nek10 (ENSCGRG00001023436) Slc4a7 (ENSCGRG00001019823) ENSCGRG00001011398 Golden Hamster DUPLICATION Golden Hamster DUPLICATION Golden Hamster MODERN SPECIES 964 ENSMAUG00000011886 #22 Golden Hamster MODERN SPECIES 641 ENSMAUG00000014771 Cdk1 (ENSMAUG00000020301) Rhobtb1 (ENSMAUG00000021113) Tmem26 (ENSMAUG00000021815) Cabcoco1 (ENSMAUG00000021961) Arid5b (ENSMAUG00000009016) Rtkn2 (ENSMAUG00000003167) Zfp365 (ENSMAUG00000020138) Egr2 (ENSMAUG00000021143) Nrbf2 (ENSMAUG00000021159) ENSMAUG00000002201 Reep3 (ENSMAUG00000021449) ENSMAUG00000021521 Ctnna3 (ENSMAUG00000012953) Lrrtm3 (ENSMAUG00000021553) ENSMAUG00000021196 #22 Dnajc12 (ENSMAUG00000021444) Sirt1 (ENSMAUG00000008395) Herc4 (ENSMAUG00000009776) Mypn (ENSMAUG00000021985) Atoh7 (ENSMAUG00000010517) Pbld1 (ENSMAUG00000022220) Pbld2 (ENSMAUG00000022266) Hnrnph3 (ENSMAUG00000022233) Rufy2 (ENSMAUG00000005119) Dna2 (ENSMAUG00000002986) Slc25a16 (ENSMAUG00000009526) Tet1 (ENSMAUG00000007644) ENSMAUG00000022270 ENSMAUG00000002239 ENSMAUG00000022192 Golden Hamster MODERN SPECIES 627 Derl2 (ENSMAUG00000013807) Mis12 (ENSMAUG00000012935) 6330403K07Rik (ENSMAUG00000021541) ENSMAUG00000019662 Wscd1 (ENSMAUG00000014219) Aipl1 (ENSMAUG00000012023) Pimreg (ENSMAUG00000010744) Pitpnm3 (ENSMAUG00000010515) ENSMAUG00000011942 4930563E22Rik (ENSMAUG00000009173) Slc13a5 (ENSMAUG00000009167) Fbxo39 (ENSMAUG00000017927) Mybbp1a (ENSMAUG00000021236) Spns2 (ENSMAUG00000006810) Spns3 (ENSMAUG00000001547) ENSMAUG00000014587 #22 Ube2g1 (ENSMAUG00000017142) Ankfy1 (ENSMAUG00000021325) Atp2a3 (ENSMAUG00000005976) P2rx1 (ENSMAUG00000010044) ENSMAUG00000008683 Emc6 (ENSMAUG00000006733) Tax1bp3 (ENSMAUG00000011911) Ctns (ENSMAUG00000003764) Shpk (ENSMAUG00000021496) Trpv1 (ENSMAUG00000008181) Trpv3 (ENSMAUG00000019522) Aspa (ENSMAUG00000016472) Spata22 (ENSMAUG00000017890) Or1e1c (ENSMAUG00000004137) Or1e16 (ENSMAUG00000020111) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a #22 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a #22 Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a #22 Alpin marmot MODERN SPECIES 476 ENSMMMG00000011254 #22 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00390000005639.a.a ENSGT00960000191062 ENSGT00390000010628 ENSGT00530000063586.b ENSGT00940000154372.a.b ENSGT00390000017291.a ENSGT00390000017291.b ENSGT00390000006172 ENSGT00940000155482 ENSGT01030000235096 ENSGT00940000159588 ENSGT00940000160357 ENSGT00940000156198.c.a ENSGT00940000161843 ENSGT00940000164241 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a #22 ENSGT00940000160449 ENSGT00940000161846 ENSGT00940000160595.b ENSGT00390000009416 ENSGT00940000159192 ENSGT00940000157037.a ENSGT00940000159350 ENSGT00390000012901 ENSGT00390000003477 ENSGT00940000158750 ENSGT00390000000483.b ENSGT00390000014853 ENSGT00940000161623 ENSGT00390000016221 ENSGT00940000160490 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 9 ENSUPAG00010017287 TAPT1 (ENSUPAG00010017269) PROM1 (ENSUPAG00010017205) FGFBP1 (ENSUPAG00010017197) CD38 (ENSUPAG00010017184) BST1 (ENSUPAG00010017165) FBXL5 (ENSUPAG00010017123) CC2D2A (ENSUPAG00010017099) ENSUPAG00010017096 C1QTNF7 (ENSUPAG00010017088) CPEB2 (ENSUPAG00010017042) ENSUPAG00010017031 ENSUPAG00010017005 NKX3-2 (ENSUPAG00010016996) ENSUPAG00010016979 ENSUPAG00010016971 #22 HS3ST1 (ENSUPAG00010016961) CLNK (ENSUPAG00010016897) ZNF518B (ENSUPAG00010016890) WDR1 (ENSUPAG00010016882) SLC2A9 (ENSUPAG00010016627) DRD5 (ENSUPAG00010016614) OTOP1 (ENSUPAG00010016596) TMEM128 (ENSUPAG00010016576) LYAR (ENSUPAG00010016569) ZBTB49 (ENSUPAG00010016556) NSG1 (ENSUPAG00010016542) STX18 (ENSUPAG00010016466) Squirrel MODERN SPECIES 77 QDPR (ENSSTOG00000009916) ENSSTOG00000034519 LDB2 (ENSSTOG00000002035) TAPT1 (ENSSTOG00000025519) PROM1 (ENSSTOG00000020690) CD38 (ENSSTOG00000005495) BST1 (ENSSTOG00000023011) FBXL5 (ENSSTOG00000022023) CC2D2A (ENSSTOG00000005160) C1QTNF7 (ENSSTOG00000011103) ENSSTOG00000030843 ENSSTOG00000002388 BOD1L1 (ENSSTOG00000026900) NKX3-2 (ENSSTOG00000021803) ENSSTOG00000004135 ENSSTOG00000021226 #22 HS3ST1 (ENSSTOG00000005820) CLNK (ENSSTOG00000014009) ZNF518B (ENSSTOG00000014006) WDR1 (ENSSTOG00000004366) SLC2A9 (ENSSTOG00000023633) DRD5 (ENSSTOG00000024357) OTOP1 (ENSSTOG00000025465) TMEM128 (ENSSTOG00000000546) ENSSTOG00000000548 ZBTB49 (ENSSTOG00000000550) NSG1 (ENSSTOG00000014987) STX18 (ENSSTOG00000014992) MSX1 (ENSSTOG00000020201) CYTL1 (ENSSTOG00000000183) STK32B (ENSSTOG00000004994) Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a #22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a #22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.a #22 Degu MODERN SPECIES 111 FAM181A (ENSODEG00000011589) ASB2 (ENSODEG00000007460) OTUB2 (ENSODEG00000008797) ENSODEG00000007700 ENSODEG00000008703 PPP4R4 (ENSODEG00000008810) SERPINA10 (ENSODEG00000008574) SERPINA6 (ENSODEG00000008142) FBLN5 (ENSODEG00000008614) TC2N (ENSODEG00000008900) PPP4R3A (ENSODEG00000008219) CCDC88C (ENSODEG00000007311) GPR68 (ENSODEG00000019499) RPS6KA5 (ENSODEG00000007384) TTC7B (ENSODEG00000008126) ENSODEG00000007733 #22 NRDE2 (ENSODEG00000012422) ENSODEG00000007323 ENSODEG00000008355 KCNK13 (ENSODEG00000008807) TDP1 (ENSODEG00000009548) EFCAB11 (ENSODEG00000010563) ENSODEG00000009019 ENSODEG00000019584 ENSODEG00000008461 FOXN3 (ENSODEG00000008087) TTC8 (ENSODEG00000006816) EML5 (ENSODEG00000006936) ENSODEG00000008995 ENSODEG00000008476 ENSODEG00000006567 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 127 ENSCLAG00000016657 SLC25A38 (ENSCLAG00000015393) #21 ENSCLAG00000015318 #22 ENSCLAG00000014655 MYRIP (ENSCLAG00000016112) EIF1B (ENSCLAG00000016040) ENTPD3 (ENSCLAG00000016343) RPL14 (ENSCLAG00000016120) ZNF621 (ENSCLAG00000016834) CTNNB1 (ENSCLAG00000016464) ULK4 (ENSCLAG00000015979) TRAK1 (ENSCLAG00000014205) CCK (ENSCLAG00000017113) LYZL4 (ENSCLAG00000016944) VIPR1 (ENSCLAG00000016513) SEC22C (ENSCLAG00000016050) SS18L2 (ENSCLAG00000015815) NKTR (ENSCLAG00000014179) Eutheria DUPLICATION Eutheria DUPLICATION Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.a.a #22 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.a.a #22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.a.a #22 Armadillo MODERN SPECIES 2193 AKAP4 (ENSDNOG00000032581) ENSDNOG00000030597 CLCN5 (ENSDNOG00000033098) USP27X (ENSDNOG00000001002) ENSDNOG00000003715 ENSDNOG00000007200 PPP1R3F (ENSDNOG00000019332) FOXP3 (ENSDNOG00000012826) CCDC22 (ENSDNOG00000044674) CACNA1F (ENSDNOG00000006166) SYP (ENSDNOG00000032408) ENSDNOG00000045007 ENSDNOG00000031352 PLP2 (ENSDNOG00000002320) MAGIX (ENSDNOG00000036078) ENSDNOG00000039101 #22 GPKOW (ENSDNOG00000016647) WDR45 (ENSDNOG00000046908) PRAF2 (ENSDNOG00000031883) CCDC120 (ENSDNOG00000017059) TFE3 (ENSDNOG00000039173) GRIPAP1 (ENSDNOG00000038321) KCND1 (ENSDNOG00000033902) OTUD5 (ENSDNOG00000032210) PIM2 (ENSDNOG00000015644) SLC35A2 (ENSDNOG00000015641) PQBP1 (ENSDNOG00000015637) TIMM17B (ENSDNOG00000047305) PCSK1N (ENSDNOG00000045077) ERAS (ENSDNOG00000014657) HDAC6 (ENSDNOG00000002754) Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.a.a #22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.a.a #22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.a.a #22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.a.a #22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.a.a #22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.a.a #22 Hystricomorpha DUPLICATION Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.a.a.a #22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.a.a.a #22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.a.a.a #22 Degu MODERN SPECIES 51 CACUL1 (ENSODEG00000017578) NANOS1 (ENSODEG00000017556) EIF3A (ENSODEG00000017775) ENSODEG00000017551 ENSODEG00000017739 GRK5 (ENSODEG00000017760) RGS10 (ENSODEG00000017673) TIAL1 (ENSODEG00000017741) ENSODEG00000020474 BAG3 (ENSODEG00000017665) INPP5F (ENSODEG00000017771) MCMBP (ENSODEG00000017666) ENSODEG00000017627 ENSODEG00000017568 ENSODEG00000020513 ENSODEG00000017620 #22 ENSODEG00000017622 PLPP4 (ENSODEG00000017787) ENSODEG00000017528 WDR11 (ENSODEG00000017999) ENSODEG00000017729 ENSODEG00000017521 FGFR2 (ENSODEG00000017727) ENSODEG00000017613 ATE1 (ENSODEG00000017714) NSMCE4A (ENSODEG00000017586) ENSODEG00000017758 BTBD16 (ENSODEG00000017181) ENSODEG00000017646 ENSODEG00000017854 HTRA1 (ENSODEG00000017523) Naked mole-rat female MODERN SPECIES 14 ENSHGLG00000038577 PAMR1 (ENSHGLG00000007733) SLC1A2 (ENSHGLG00000010072) CD44 (ENSHGLG00000011767) ENSHGLG00000047526 ENSHGLG00000040571 ENSHGLG00000010978 APIP (ENSHGLG00000011839) EHF (ENSHGLG00000009758) ELF5 (ENSHGLG00000011019) CAT (ENSHGLG00000011741) ENSHGLG00000016446 NAT10 (ENSHGLG00000016891) ENSHGLG00000018658 ENSHGLG00000009842 ENSHGLG00000006506 #22 ENSHGLG00000035097 ENSHGLG00000048933 ENSHGLG00000013910 ENSHGLG00000044243 HIPK3 (ENSHGLG00000018314) ENSHGLG00000040843 CSTF3 (ENSHGLG00000017834) TCP11L1 (ENSHGLG00000018599) ENSHGLG00000018618 ENSHGLG00000044852 ENSHGLG00000046320 QSER1 (ENSHGLG00000015709) ENSHGLG00000043439 ENSHGLG00000041603 ENSHGLG00000014399 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.a.a.b #22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.a.a.b #22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.a.a.b #22 Degu DUPLICATION Degu MODERN SPECIES 218 ENSODEG00000002220 HEXB (ENSODEG00000002081) GFM2 (ENSODEG00000002193) ENSODEG00000002883 FAM169A (ENSODEG00000002906) ENSODEG00000002941 GCNT4 (ENSODEG00000018869) ANKRD31 (ENSODEG00000003017) HMGCR (ENSODEG00000003319) CERT1 (ENSODEG00000002483) POLK (ENSODEG00000002687) ANKDD1B (ENSODEG00000003019) POC5 (ENSODEG00000003014) SV2C (ENSODEG00000003155) IQGAP2 (ENSODEG00000003459) ENSODEG00000003730 #22 F2RL1 (ENSODEG00000002463) S100Z (ENSODEG00000002505) CRHBP (ENSODEG00000002524) ENSODEG00000002814 Degu MODERN SPECIES 44 ENSODEG00000018444 ENSODEG00000018441 ENSODEG00000018384 C18orf32 (ENSODEG00000018385) ENSODEG00000020491 ENSODEG00000018460 ENSODEG00000018365 ENSODEG00000018393 DYM (ENSODEG00000018486) SMAD7 (ENSODEG00000018424) CTIF (ENSODEG00000018390) ZBTB7C (ENSODEG00000018417) SMAD2 (ENSODEG00000018373) ENSODEG00000018377 ENSODEG00000018340 ENSODEG00000018367 #22 SKOR2 (ENSODEG00000018363) IER3IP1 (ENSODEG00000018375) HDHD2 (ENSODEG00000018388) KATNAL2 (ENSODEG00000018481) ENSODEG00000018457 ENSODEG00000020536 ENSODEG00000018432 ST8SIA5 (ENSODEG00000018352) ENSODEG00000020498 LOXHD1 (ENSODEG00000018482) RNF165 (ENSODEG00000018412) C18orf25 (ENSODEG00000018458) ENSODEG00000018366 ATP5F1A (ENSODEG00000018359) ENSODEG00000020534 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.a.a #22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.a.a #22 Bushbaby MODERN SPECIES 297 INTS6 (ENSOGAG00000005794) SERPINE3 (ENSOGAG00000025738) FAM124A (ENSOGAG00000005790) ENSOGAG00000016491 RNASEH2B (ENSOGAG00000016486) ENSOGAG00000029384 DLEU7 (ENSOGAG00000009127) ENSOGAG00000030664 #22 TRIM13 (ENSOGAG00000013692) SPRYD7 (ENSOGAG00000013140) KPNA3 (ENSOGAG00000002349) FLCN (ENSOGAG00000008179) PLD6 (ENSOGAG00000030239) MPRIP (ENSOGAG00000028979) TNFRSF13B (ENSOGAG00000027463) USP22 (ENSOGAG00000015801) DHRS7B (ENSOGAG00000004465) TMEM11 (ENSOGAG00000004467) NATD1 (ENSOGAG00000004469) MAP2K3 (ENSOGAG00000004471) ENSOGAG00000000051 POSTN (ENSOGAG00000013376) Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.a.b #22 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.a.b #22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.a.b #22 Armadillo MODERN SPECIES 1316 CMYA5 (ENSDNOG00000040392) MTX3 (ENSDNOG00000043463) THBS4 (ENSDNOG00000010496) ENSDNOG00000019622 ENSDNOG00000046018 #22 ENSDNOG00000009003 ENSDNOG00000007096 FAM151B (ENSDNOG00000043373) ANKRD34B (ENSDNOG00000001607) ENSDNOG00000043623 ENSDNOG00000038425 MSH3 (ENSDNOG00000005942) RASGRF2 (ENSDNOG00000002801) CKMT2 (ENSDNOG00000016705) ZCCHC9 (ENSDNOG00000016708) ACOT12 (ENSDNOG00000009900) SSBP2 (ENSDNOG00000009927) ENSDNOG00000032637 ENSDNOG00000049021 SERPINA12 (ENSDNOG00000014643) Eutheria DUPLICATION Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.b.a #22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.b.a #22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.b.a #22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.b.a #22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.b.a #22 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.b.a #22 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.b.a #22 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 376 ENSPCOG00000021547 USP25 (ENSPCOG00000021493) ENSPCOG00000003664 ENSPCOG00000007739 #22 ENSPCOG00000019299 SAMSN1 (ENSPCOG00000016595) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.b.a #22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.b.a #22 Armadillo MODERN SPECIES 3917 ENSDNOG00000038857 AADAC (ENSDNOG00000016245) SUCNR1 (ENSDNOG00000042451) ENSDNOG00000036321 ENSDNOG00000040040 MBNL1 (ENSDNOG00000044505) ENSDNOG00000045832 #22 P2RY1 (ENSDNOG00000034630) RAP2B (ENSDNOG00000003783) ENSDNOG00000035352 ARHGEF26 (ENSDNOG00000001679) DHX36 (ENSDNOG00000001682) Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.b.b #22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.b.b #22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.b.b #22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.b.b #22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.b.b #22 Bushbaby MODERN SPECIES 316 ENSOGAG00000030690 ENSOGAG00000034365 ENSOGAG00000027246 #22 AMOT (ENSOGAG00000011561) LHFPL1 (ENSOGAG00000011559) RTL4 (ENSOGAG00000032419) ENSOGAG00000025522 TRPC5 (ENSOGAG00000005962) ENSOGAG00000007568 ENSOGAG00000031713 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.b.b #22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.b.b #22 Armadillo MODERN SPECIES 1257 ENSDNOG00000031730 #22 ENSDNOG00000030940 Eutheria DUPLICATION Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.c.a #22 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.c.a #22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.c.a #22 Armadillo MODERN SPECIES 624 BRD7 (ENSDNOG00000010716) ADCY7 (ENSDNOG00000001042) ENSDNOG00000033734 #22 TENT4B (ENSDNOG00000001039) HEATR3 (ENSDNOG00000013116) CNEP1R1 (ENSDNOG00000044447) ENSDNOG00000036118 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.c.a #22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.c.a #22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.c.a #22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.c.a #22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.c.a #22 Camelidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.c.a #22 Alpaca MODERN SPECIES 2196 MYOZ1 (ENSVPAG00000008022) ENSVPAG00000008023 FUT11 (ENSVPAG00000008026) CHCHD1 (ENSVPAG00000008027) ENSVPAG00000008029 VCL (ENSVPAG00000008030) AP3M1 (ENSVPAG00000008035) ADK (ENSVPAG00000008036) ENSVPAG00000008037 #22 KAT6B (ENSVPAG00000008038) ENSVPAG00000008039 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.c.b #22 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.c.b #22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.c.b #22 Armadillo DUPLICATION Armadillo DUPLICATION Armadillo DUPLICATION Armadillo MODERN SPECIES 2632 ENSDNOG00000042322 #22 ENSDNOG00000019040 ENSDNOG00000042069 ENSDNOG00000035877 #22 Armadillo MODERN SPECIES 305 ENSDNOG00000048782 ENSDNOG00000035845 #22 Armadillo MODERN SPECIES 2632 ENSDNOG00000035877 #22 ENSDNOG00000042069 ENSDNOG00000019040 ENSDNOG00000042322 #22 Armadillo DUPLICATION Armadillo DUPLICATION Armadillo DUPLICATION Armadillo DUPLICATION Armadillo MODERN SPECIES 134 ENSDNOG00000041327 #22 Armadillo MODERN SPECIES 1443 ENSDNOG00000043345 #22 Armadillo MODERN SPECIES 387 ENSDNOG00000036828 #22 Armadillo MODERN SPECIES 2420 ENSDNOG00000040697 #22 UCP2 (ENSDNOG00000031735) DNAJB13 (ENSDNOG00000000529) PAAF1 (ENSDNOG00000045529) COA4 (ENSDNOG00000008154) MRPL48 (ENSDNOG00000002177) ENSDNOG00000008487 Armadillo MODERN SPECIES 3438 ENSDNOG00000034233 #22 Eutheria DUPLICATION Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.d.a #22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.d.a #22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.d.a #22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.d.a #22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.d.a #22 Bushbaby MODERN SPECIES 344 RPS6KC1 (ENSOGAG00000013193) ENSOGAG00000024451 #22 ENSOGAG00000000449 PROX1 (ENSOGAG00000017025) SMYD2 (ENSOGAG00000017028) ENSOGAG00000033159 PTPN14 (ENSOGAG00000017030) CENPF (ENSOGAG00000001123) ENSOGAG00000033696 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.d.a #22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.d.a #22 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.d.a #22 Elephant MODERN SPECIES 95 ENSLAFG00000021420 ENPEP (ENSLAFG00000008127) ELOVL6 (ENSLAFG00000021532) EGF (ENSLAFG00000013803) LRIT3 (ENSLAFG00000009373) RRH (ENSLAFG00000009369) CFI (ENSLAFG00000011698) PLA2G12A (ENSLAFG00000000852) CASP6 (ENSLAFG00000002727) MCUB (ENSLAFG00000002726) SEC24B (ENSLAFG00000013688) ENSLAFG00000008674 ETNPPL (ENSLAFG00000008666) OSTC (ENSLAFG00000026381) RPL34 (ENSLAFG00000032615) ENSLAFG00000025607 #22 LEF1 (ENSLAFG00000016434) HADH (ENSLAFG00000016430) CYP2U1 (ENSLAFG00000016424) SGMS2 (ENSLAFG00000016422) PAPSS1 (ENSLAFG00000018426) DKK2 (ENSLAFG00000007133) GIMD1 (ENSLAFG00000027733) AIMP1 (ENSLAFG00000012639) TBCK (ENSLAFG00000018410) NPNT (ENSLAFG00000005763) GSTCD (ENSLAFG00000021544) INTS12 (ENSLAFG00000010076) ENSLAFG00000031287 ENSLAFG00000012329 ENSLAFG00000026913 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.d.b #22 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.d.b #22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.d.b #22 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b.b.d.b #22 Elephant MODERN SPECIES 71 UBE2T (ENSLAFG00000015069) PPP1R12B (ENSLAFG00000012724) SYT2 (ENSLAFG00000018343) KDM5B (ENSLAFG00000005104) ENSLAFG00000018012 RABIF (ENSLAFG00000031433) KLHL12 (ENSLAFG00000003515) ADIPOR1 (ENSLAFG00000003520) CYB5R1 (ENSLAFG00000003522) ENSLAFG00000030999 ENSLAFG00000026325 ENSLAFG00000030427 TMEM183A (ENSLAFG00000018443) PPFIA4 (ENSLAFG00000018446) MYOG (ENSLAFG00000013113) ENSLAFG00000023356 #22 ADORA1 (ENSLAFG00000001262) MYBPH (ENSLAFG00000001264) CHI3L1 (ENSLAFG00000003983) CHIT1 (ENSLAFG00000017125) BTG2 (ENSLAFG00000031964) FMOD (ENSLAFG00000003588) PRELP (ENSLAFG00000027913) ATP2B4 (ENSLAFG00000012442) LAX1 (ENSLAFG00000010336) ZBED6 (ENSLAFG00000029775) ENSLAFG00000031207 ENSLAFG00000010344 SNRPE (ENSLAFG00000009349) SOX13 (ENSLAFG00000015918) ETNK2 (ENSLAFG00000015937) Marsupialia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b #22 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b #22 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b #22 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.b #22 Common wonbat MODERN SPECIES 1066 ENSVURG00010016697 ENSVURG00010016686 ENSVURG00010016646 ENSVURG00010016612 ENSVURG00010016577 ENSVURG00010016561 ENSVURG00010016551 ENSVURG00010016491 ENSVURG00010016470 ENSVURG00010016447 ENSVURG00010016387 ENSVURG00010016375 ENSVURG00010016303 ENSVURG00010016243 ENSVURG00010016210 ENSVURG00010016194 #22 ENSVURG00010016176 ENSVURG00010015787 ENSVURG00010015728 ENSVURG00010015703 ENSVURG00010015680 ENSVURG00010015676 ENSVURG00010015650 ENSVURG00010015628 ENSVURG00010015615 ENSVURG00010015601 ENSVURG00010015588 ENSVURG00010015566 ENSVURG00010015530 ENSVURG00010015506 ENSVURG00010015471 Theria DUPLICATION Theria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.b.a #22 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.b.a #22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.b.a #22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.b.a #22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.b.a #22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.b.a #22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.b.a #22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.b.a #22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.b.a #22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.b.a #22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.b.a #22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.b.a #22 Olive baboon MODERN SPECIES 2 ENSPANG00000046687 ENSPANG00000021527 ENSPANG00000030497 CYP2C8 (ENSPANG00000021476) ENSPANG00000031836 CYP2C8 (ENSPANG00000016602) CYP2C76v2 (ENSPANG00000021950) PDLIM1 (ENSPANG00000021477) SORBS1 (ENSPANG00000021480) ALDH18A1 (ENSPANG00000021474) TCTN3 (ENSPANG00000021457) ENSPANG00000039768 ENTPD1 (ENSPANG00000021459) CC2D2B (ENSPANG00000021446) CCNJ (ENSPANG00000021449) ENSPANG00000043364 #22 ZNF518A (ENSPANG00000021450) BLNK (ENSPANG00000021417) DNTT (ENSPANG00000021421) OPALIN (ENSPANG00000041066) TLL2 (ENSPANG00000021427) TM9SF3 (ENSPANG00000021412) PIK3AP1 (ENSPANG00000021373) LCOR (ENSPANG00000021376) SLIT1 (ENSPANG00000021383) ARHGAP19 (ENSPANG00000021365) FRAT1 (ENSPANG00000021367) FRAT2 (ENSPANG00000021368) RRP12 (ENSPANG00000021360) PGAM1 (ENSPANG00000021321) EXOSC1 (ENSPANG00000021324) Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.b.a #22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.b.a #22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.b.a #22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.b.a #22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.b.a #22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.b.a #22 Ursidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.b.a #22 Ursus ANCESTRAL SPECIES 56 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000161691 ENSGT01030000235089 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT00940000164959 ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00940000164532 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.b.a #22 ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.d ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541.h ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B ENSGT00940000159338 ENSGT00940000160407 Polar bear MODERN SPECIES 112 ACVR2B (ENSUMAG00000005381) EXOG (ENSUMAG00000005378) SCN5A (ENSUMAG00000004974) SCN10A (ENSUMAG00000004889) SCN11A (ENSUMAG00000004844) WDR48 (ENSUMAG00000004825) GORASP1 (ENSUMAG00000004816) TTC21A (ENSUMAG00000004706) CSRNP1 (ENSUMAG00000004684) XIRP1 (ENSUMAG00000004681) ENSUMAG00000004676 CX3CR1 (ENSUMAG00000004673) CCR8 (ENSUMAG00000004669) SLC25A38 (ENSUMAG00000004652) #21 ENSUMAG00000004629 ENSUMAG00000004598 #22 ENSUMAG00000004595 ENSUMAG00000004585 EIF1B (ENSUMAG00000004559) ENTPD3 (ENSUMAG00000004544) RPL14 (ENSUMAG00000004540) ZNF619 (ENSUMAG00000004539) ZNF620 (ENSUMAG00000004535) ZNF621 (ENSUMAG00000004531) CTNNB1 (ENSUMAG00000003005) ULK4 (ENSUMAG00000002453) TRAK1 (ENSUMAG00000002251) CCK (ENSUMAG00000002192) LYZL4 (ENSUMAG00000002180) VIPR1 (ENSUMAG00000002082) SEC22C (ENSUMAG00000002057) Marsupialia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.b.a #22 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.b.a #22 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.b.a #22 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.b.a #22 Common wonbat MODERN SPECIES 329 PEX1 (ENSVURG00010022614) RBM48 (ENSVURG00010022603) ENSVURG00010022599 ENSVURG00010022595 CDK6 (ENSVURG00010022586) ENSVURG00010022581 ENSVURG00010022579 SUSD5 (ENSVURG00010022578) ENSVURG00010022574 GLB1 (ENSVURG00010022569) CCR4 (ENSVURG00010022567) CX3CR1 (ENSVURG00010022564) CCR8 (ENSVURG00010022562) ENSVURG00010022560 #21 ENSVURG00010022556 ENSVURG00010022548 #22 TMC2 (ENSVURG00010022544) ENSVURG00010022541 ENSVURG00010022540 Theria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.b.b #22 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.b.b #22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.b.b #22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.b.b #22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.b.b #22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.b.b #22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.b.b #22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.b.b #22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.b.b #22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.b.b #22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.b.b #22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.a.b.b #22 Olive baboon DUPLICATION Olive baboon MODERN SPECIES 11 XYLB (ENSPANG00000008387) ACVR2B (ENSPANG00000004182) EXOG (ENSPANG00000004803) SCN5A (ENSPANG00000017810) ENSPANG00000042266 SCN10A (ENSPANG00000011203) SCN11A (ENSPANG00000024754) ENSPANG00000038413 GORASP1 (ENSPANG00000019845) TTC21A (ENSPANG00000015970) CSRNP1 (ENSPANG00000020433) XIRP1 (ENSPANG00000011204) CX3CR1 (ENSPANG00000020831) CCR8 (ENSPANG00000037317) SLC25A38 (ENSPANG00000010067) #21 ENSPANG00000016823 #22 MOBP (ENSPANG00000015170) MYRIP (ENSPANG00000009062) EIF1B (ENSPANG00000033825) ENTPD3 (ENSPANG00000009668) ENSPANG00000034352 ZNF621 (ENSPANG00000005826) ENSPANG00000039995 CTNNB1 (ENSPANG00000011019) ENSPANG00000047760 ULK4 (ENSPANG00000019567) TRAK1 (ENSPANG00000014636) CCK (ENSPANG00000012767) LYZL4 (ENSPANG00000025941) VIPR1 (ENSPANG00000019185) SEC22C (ENSPANG00000007134) Olive baboon MODERN SPECIES 109 ENSPANG00000047734 ENSPANG00000050976 ENSPANG00000042475 ENSPANG00000039873 ENSPANG00000039724 #22 ENSPANG00000040018 ENSPANG00000041286 ENSPANG00000049235 ENSPANG00000038700 ENSPANG00000038777 ENSPANG00000049174 ENSPANG00000048351 ENSPANG00000044029 Theria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.b #22 Eutheria ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000161691 ENSGT01030000235089 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.u.a #22 ENSGT00940000164532 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b #22 ENSGT00950000183099.u.b.a.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.b #22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.b #22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.b #22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.b #22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.b #22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.b #22 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.b #22 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 1 ENSSVLG00005021379 IP6K1 (ENSSVLG00005021336) GMPPB (ENSSVLG00005021153) AMIGO3 (ENSSVLG00005021129) RNF123 (ENSSVLG00005020644) MST1 (ENSSVLG00005020451) APEH (ENSSVLG00005020366) BSN (ENSSVLG00005020232) ENSSVLG00005020188 DAG1 (ENSSVLG00005020152) NICN1 (ENSSVLG00005020072) AMT (ENSSVLG00005019729) TCTA (ENSSVLG00005019277) RHOA (ENSSVLG00005019199) GPX1 (ENSSVLG00005019095) ENSSVLG00005019055 #22 USP4 (ENSSVLG00005018952) C3orf62 (ENSSVLG00005018903) IHO1 (ENSSVLG00005018854) C3orf84 (ENSSVLG00005018760) KLHDC8B (ENSSVLG00005018723) CCDC71 (ENSSVLG00005018689) USP19 (ENSSVLG00005018580) QARS1 (ENSSVLG00005017939) ENSSVLG00005017903 QRICH1 (ENSSVLG00005017854) IMPDH2 (ENSSVLG00005017627) NDUFAF3 (ENSSVLG00005017494) DALRD3 (ENSSVLG00005017322) WDR6 (ENSSVLG00005017130) P4HTM (ENSSVLG00005017043) Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.b #22 Alpin marmot MODERN SPECIES 46 MCIDAS (ENSMMMG00000009257) CCNO (ENSMMMG00000009246) DHX29 (ENSMMMG00000009209) MTREX (ENSMMMG00000009158) PLPP1 (ENSMMMG00000009061) SLC38A9 (ENSMMMG00000009039) DDX4 (ENSMMMG00000008971) IL31RA (ENSMMMG00000008944) IL6ST (ENSMMMG00000008666) ANKRD55 (ENSMMMG00000008634) MAP3K1 (ENSMMMG00000008498) SETD9 (ENSMMMG00000008494) MIER3 (ENSMMMG00000008455) GPBP1 (ENSMMMG00000008405) ACTBL2 (ENSMMMG00000008397) ENSMMMG00000008389 #22 ENSMMMG00000008369 PLK2 (ENSMMMG00000008351) GAPT (ENSMMMG00000008343) RAB3C (ENSMMMG00000008316) ENSMMMG00000008308 PDE4D (ENSMMMG00000008188) DEPDC1B (ENSMMMG00000008101) ELOVL7 (ENSMMMG00000008082) ERCC8 (ENSMMMG00000008052) NDUFAF2 (ENSMMMG00000008039) ENSMMMG00000008025 ENSMMMG00000008016 ZSWIM6 (ENSMMMG00000007892) ENSMMMG00000007877 ENSMMMG00000007830 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.u.b.a.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B ENSGT00940000159338 ENSGT00940000160407 ENSGT00940000158548 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 30 TOM1 (ENSHGLG00000015296) HMGXB4 (ENSHGLG00000037083) ENSHGLG00000015276 ENSHGLG00000043321 ENSHGLG00000000234 ENSHGLG00000004774 ENSHGLG00000005865 ENSHGLG00000002041 ENSHGLG00000048867 ENSHGLG00000001115 ENSHGLG00000003076 ENSHGLG00000046568 ENSHGLG00000041141 ENSHGLG00000045286 ENSHGLG00000013283 #21 ENSHGLG00000012945 #22 ENSHGLG00000015915 ENSHGLG00000039683 ENSHGLG00000015869 ENSHGLG00000046086 MYRIP (ENSHGLG00000033941) EIF1B (ENSHGLG00000049723) ENTPD3 (ENSHGLG00000015750) RPL14 (ENSHGLG00000048756) ENSHGLG00000034341 ENSHGLG00000014689 ENSHGLG00000000673 ENSHGLG00000000693 ENSHGLG00000006868 ACOT12 (ENSHGLG00000006134) ZCCHC9 (ENSHGLG00000041209) Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.u.b.a.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B ENSGT00940000159338 ENSGT00940000160407 ENSGT00940000158548 Guinea pig MODERN SPECIES 7 MAP9 (ENSCPOG00000027185) NPY2R (ENSCPOG00000030180) ENSCPOG00000010284 SMARCA5 (ENSCPOG00000002259) ETFDH (ENSCPOG00000004569) PPID (ENSCPOG00000001046) FNIP2 (ENSCPOG00000009597) C4orf45 (ENSCPOG00000005069) ENSCPOG00000031894 ENSCPOG00000005417 ENSCPOG00000004563 ENSCPOG00000027005 FSTL5 (ENSCPOG00000009103) OR2Y1 (ENSCPOG00000008609) SLC25A38 (ENSCPOG00000032289) #21 ENSCPOG00000008715 #22 ENSCPOG00000021902 MYRIP (ENSCPOG00000000818) EIF1B (ENSCPOG00000035400) ENTPD3 (ENSCPOG00000026506) RPL14 (ENSCPOG00000030681) CTNNB1 (ENSCPOG00000002921) ENSCPOG00000039909 TRAK1 (ENSCPOG00000008015) CCK (ENSCPOG00000014533) LYZL4 (ENSCPOG00000023148) VIPR1 (ENSCPOG00000039610) SEC22C (ENSCPOG00000037465) SS18L2 (ENSCPOG00000030688) NKTR (ENSCPOG00000012260) ZBTB47 (ENSCPOG00000025338) Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.u.b.a.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B ENSGT00940000159338 ENSGT00940000160407 ENSGT00940000158548 Long-tailed chinchilla DUPLICATION Long-tailed chinchilla DUPLICATION Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 119 NCAPD3 (ENSCLAG00000015357) JAM3 (ENSCLAG00000017320) IGSF9B (ENSCLAG00000016078) SPATA19 (ENSCLAG00000015533) OPCML (ENSCLAG00000016384) NTM (ENSCLAG00000017213) SNX19 (ENSCLAG00000015600) ADAMTS15 (ENSCLAG00000015866) ADAMTS8 (ENSCLAG00000016322) ZBTB44 (ENSCLAG00000015087) ST14 (ENSCLAG00000014149) APLP2 (ENSCLAG00000014734) PRDM10 (ENSCLAG00000014605) NFRKB (ENSCLAG00000015352) TMEM45B (ENSCLAG00000015305) ENSCLAG00000015289 #22 BARX2 (ENSCLAG00000014233) ENSCLAG00000015045 ARHGAP32 (ENSCLAG00000017036) KCNJ5 (ENSCLAG00000014061) KCNJ1 (ENSCLAG00000016305) FLI1 (ENSCLAG00000013613) ETS1 (ENSCLAG00000016564) ENSCLAG00000015617 KIRREL3 (ENSCLAG00000016134) ST3GAL4 (ENSCLAG00000016327) DCPS (ENSCLAG00000015708) TIRAP (ENSCLAG00000014439) ENSCLAG00000014019 ENSCLAG00000013314 SRPRA (ENSCLAG00000016839) Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 131 ADD2 (ENSCLAG00000007925) ENSCLAG00000005728 CLEC4F (ENSCLAG00000010446) CD207 (ENSCLAG00000009303) VAX2 (ENSCLAG00000007615) ATP6V1B1 (ENSCLAG00000007116) ANKRD53 (ENSCLAG00000006293) TEX261 (ENSCLAG00000008662) NAGK (ENSCLAG00000007916) PAIP2B 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(ENSODEG00000011359) CDK3 (ENSODEG00000012120) ACOX1 (ENSODEG00000010668) MRPL38 (ENSODEG00000014002) TRIM47 (ENSODEG00000011870) WBP2 (ENSODEG00000012205) ##23 UNC13D (ENSODEG00000011143) UNK (ENSODEG00000010183) GALK1 (ENSODEG00000010024) ITGB4 (ENSODEG00000010119) ENSODEG00000011032 ENSODEG00000009654 #22 SAP30BP (ENSODEG00000012944) ENSODEG00000011703 ENSODEG00000009885 LLGL2 (ENSODEG00000009892) ENSODEG00000010059 CASKIN2 (ENSODEG00000011820) TMEM94 (ENSODEG00000010291) ENSODEG00000019702 ENSODEG00000010113 SLC25A19 (ENSODEG00000011447) MIF4GD (ENSODEG00000010307) ENSODEG00000011018 GGA3 (ENSODEG00000010399) ENSODEG00000019901 NUP85 (ENSODEG00000011190) Degu MODERN SPECIES 189 Azin1 (ENSODEG00000000999) ENSODEG00000000974 FZD6 (ENSODEG00000000950) ENSODEG00000000941 SLC25A32 (ENSODEG00000000912) DCAF13 (ENSODEG00000000870) ENSODEG00000000845 ENSODEG00000018633 ENSODEG00000000823 RIMS2 (ENSODEG00000001405) DCSTAMP (ENSODEG00000001297) DPYS (ENSODEG00000001258) LRP12 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(ENSJJAG00000018539) Bcar1 (ENSJJAG00000024316) Zfp1 (ENSJJAG00000019878) Ldhd (ENSJJAG00000015365) Znrf1 (ENSJJAG00000000892) Wdr59 (ENSJJAG00000018356) Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.b #22 Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1492 ENSNGAG00000023550 Ccr8 (ENSNGAG00000001261) Slc25a38 (ENSNGAG00000015299) #21 ENSNGAG00000011176 #22 Mobp (ENSNGAG00000012190) Myrip (ENSNGAG00000017523) ENSNGAG00000019291 Eif1b (ENSNGAG00000006534) Entpd3 (ENSNGAG00000010485) Rpl14 (ENSNGAG00000010949) Ctnnb1 (ENSNGAG00000014575) Ulk4 (ENSNGAG00000010866) Trak1 (ENSNGAG00000013571) ENSNGAG00000021398 Lyzl4 (ENSNGAG00000021999) Vipr1 (ENSNGAG00000005571) Sec22c (ENSNGAG00000016202) Ss18l2 (ENSNGAG00000017640) ENSNGAG00000023656 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.b #22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.b #22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.b #22 Golden Hamster MODERN SPECIES 617 Dusp8 (ENSMAUG00000019035) Gm29735 (ENSMAUG00000003401) ENSMAUG00000018707 Ifitm10 (ENSMAUG00000018748) Ctsd (ENSMAUG00000020349) Syt8 (ENSMAUG00000019436) Tnni2 (ENSMAUG00000019059) Lsp1 (ENSMAUG00000018358) Tnnt3 (ENSMAUG00000008239) Mrpl23 (ENSMAUG00000018693) ENSMAUG00000020374 Igf2 (ENSMAUG00000019587) ENSMAUG00000018376 Th (ENSMAUG00000018721) Ascl2 (ENSMAUG00000019079) ENSMAUG00000001826 #22 Tspan32 (ENSMAUG00000019837) Cd81 (ENSMAUG00000018204) Tssc4 (ENSMAUG00000018732) Trpm5 (ENSMAUG00000018047) Kcnq1 (ENSMAUG00000020417) Cdkn1c (ENSMAUG00000017979) Slc22a18 (ENSMAUG00000019948) Phlda2 (ENSMAUG00000019087) Nap1l4 (ENSMAUG00000019725) Cars (ENSMAUG00000019542) Tnfrsf26 (ENSMAUG00000020091) ENSMAUG00000017790 Osbpl5 (ENSMAUG00000018579) Mrgprg (ENSMAUG00000002319) Mrgpre (ENSMAUG00000019867) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 382 Fetub (ENSCGRG00001015930) Hrg (ENSCGRG00001000289) ENSCGRG00001018793 Eif4a2 (ENSCGRG00001022442) Rfc4 (ENSCGRG00001003704) Adipoq (ENSCGRG00001004804) St6gal1 (ENSCGRG00001012276) ENSCGRG00001012307 Rtp1 (ENSCGRG00001015248) Masp1 (ENSCGRG00001024632) ENSCGRG00001013991 Sst (ENSCGRG00001017689) Rtp2 (ENSCGRG00001023610) Bcl6 (ENSCGRG00001013589) Gm37419 (ENSCGRG00001011798) ENSCGRG00001019717 #22 Tprg (ENSCGRG00001021582) Trp63 (ENSCGRG00001009778) P3h2 (ENSCGRG00001021764) Cldn1 (ENSCGRG00001024994) Cldn16 (ENSCGRG00001002709) Tmem207 (ENSCGRG00001007696) ENSCGRG00001009646 Il1rap (ENSCGRG00001017518) Gmnc (ENSCGRG00001014744) Ostn (ENSCGRG00001021571) Uts2b (ENSCGRG00001017532) Ccdc50 (ENSCGRG00001021357) Fgf12 (ENSCGRG00001012908) Mb21d2 (ENSCGRG00001021085) Plaat1 (ENSCGRG00001000460) Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.b #22 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.b #22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.b #22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.b #22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.b #22 Steppe mouse MODERN SPECIES 3299 Phlda3 (ENSMSIG00000016346) Tnni1 (ENSMSIG00000016248) Lad1 (ENSMSIG00000016232) Tnnt2 (ENSMSIG00000013795) Pkp1 (ENSMSIG00000013746) Igfn1 (ENSMSIG00000013674) ENSMSIG00000013605 Ascl5 (ENSMSIG00000013596) Cacna1s (ENSMSIG00000013188) Kif21b (ENSMSIG00000012992) Mroh3 (ENSMSIG00000012959) Inava (ENSMSIG00000012900) ENSMSIG00000012897 Gpr25 (ENSMSIG00000012892) Camsap2 (ENSMSIG00000012647) ENSMSIG00000012627 #22 Ddx59 (ENSMSIG00000012596) ENSMSIG00000012582 Kif14 (ENSMSIG00000012445) Zfp281 (ENSMSIG00000012430) ENSMSIG00000012410 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.b #22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.b #22 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.b #22 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00910000148110 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT00910000146711 ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.u.b.a.b #22 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a.b.b.n #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.d ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B Coquerels sifaka MODERN SPECIES 50 XYLB (ENSPCOG00000025871) ENSPCOG00000018444 ACVR2B (ENSPCOG00000014529) EXOG (ENSPCOG00000019058) SCN5A (ENSPCOG00000014260) SCN10A (ENSPCOG00000028369) SCN11A (ENSPCOG00000013185) ENSPCOG00000027832 WDR48 (ENSPCOG00000018608) GORASP1 (ENSPCOG00000028402) TTC21A (ENSPCOG00000019544) CSRNP1 (ENSPCOG00000022348) XIRP1 (ENSPCOG00000027825) CX3CR1 (ENSPCOG00000020439) SLC25A38 (ENSPCOG00000020003) #21 ENSPCOG00000010464 #22 MOBP (ENSPCOG00000019506) MYRIP (ENSPCOG00000015074) EIF1B (ENSPCOG00000020355) ENTPD3 (ENSPCOG00000013333) ENSPCOG00000020291 ZNF619 (ENSPCOG00000028021) ZNF620 (ENSPCOG00000021269) ZNF621 (ENSPCOG00000023394) CTNNB1 (ENSPCOG00000023496) ENSPCOG00000023608 ENSPCOG00000012243 ULK4 (ENSPCOG00000001332) TRAK1 (ENSPCOG00000026497) CCK (ENSPCOG00000013205) LYZL4 (ENSPCOG00000018727) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.b #22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.b #22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.b #22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.b #22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.b #22 Orangutan MODERN SPECIES 22 C9orf57 (ENSPPYG00000037311) GDA (ENSPPYG00000019289) ZFAND5 (ENSPPYG00000034270) TMC1 (ENSPPYG00000019291) ALDH1A1 (ENSPPYG00000019292) ANXA1 (ENSPPYG00000019293) RORB (ENSPPYG00000019294) TRPM6 (ENSPPYG00000019295) C9orf40 (ENSPPYG00000036469) CARNMT1 (ENSPPYG00000019298) NMRK1 (ENSPPYG00000019299) ENSPPYG00000032582 OSTF1 (ENSPPYG00000035050) PCSK5 (ENSPPYG00000019301) RFK (ENSPPYG00000019302) ENSPPYG00000019303 #22 GCNT1 (ENSPPYG00000019304) PRUNE2 (ENSPPYG00000019305) VPS13A (ENSPPYG00000019309) GNA14 (ENSPPYG00000019310) GNAQ (ENSPPYG00000019311) CEP78 (ENSPPYG00000019312) PSAT1 (ENSPPYG00000019313) ENSPPYG00000019314 TLE4 (ENSPPYG00000019315) TLE1 (ENSPPYG00000019316) ENSPPYG00000037427 ENSPPYG00000031794 RASEF (ENSPPYG00000019320) FRMD3 (ENSPPYG00000019321) IDNK (ENSPPYG00000033310) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.b #22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.b #22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.b #22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.b #22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.b #22 Sooty mangabey MODERN SPECIES 143 ENSCATG00000040628 ENSCATG00000041919 ENSCATG00000043415 ENSCATG00000033482 #22 LMBRD1 (ENSCATG00000036208) COL19A1 (ENSCATG00000042450) COL9A1 (ENSCATG00000028556) FAM135A (ENSCATG00000032192) SDHAF4 (ENSCATG00000032791) SMAP1 (ENSCATG00000002544) B3GAT2 (ENSCATG00000041104) OGFRL1 (ENSCATG00000044369) ENSCATG00000044513 RIMS1 (ENSCATG00000015586) ENSCATG00000023513 KCNQ5 (ENSCATG00000024600) ENSCATG00000003513 ENSCATG00000009252 ENSCATG00000008489 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.b #22 Cebidae DUPLICATION Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.b.e #22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.b.e #22 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 43 ENSSBOG00000032179 PHAX (ENSSBOG00000019981) TEX43 (ENSSBOG00000023843) LMNB1 (ENSSBOG00000026468) MARCHF3 (ENSSBOG00000023895) C5orf63 (ENSSBOG00000000968) ENSSBOG00000035116 ENSSBOG00000030929 MEGF10 (ENSSBOG00000019175) ENSSBOG00000005225 PRRC1 (ENSSBOG00000020636) CTXN3 (ENSSBOG00000018099) CCDC192 (ENSSBOG00000003863) SLC12A2 (ENSSBOG00000025766) FBN2 (ENSSBOG00000033761) ENSSBOG00000035024 #22 SLC27A6 (ENSSBOG00000027463) ISOC1 (ENSSBOG00000012430) ADAMTS19 (ENSSBOG00000033328) MINAR2 (ENSSBOG00000035242) CHSY3 (ENSSBOG00000034041) ENSSBOG00000023813 ENSSBOG00000019209 ENSSBOG00000035688 LYRM7 (ENSSBOG00000027841) CDC42SE2 (ENSSBOG00000013031) RAPGEF6 (ENSSBOG00000030625) FNIP1 (ENSSBOG00000034580) MEIKIN (ENSSBOG00000029771) ACSL6 (ENSSBOG00000006212) IL3 (ENSSBOG00000020935) Marmoset MODERN SPECIES 1 SNW1 (ENSCJAG00000016947) ENSCJAG00000038681 ADCK1 (ENSCJAG00000017038) NRXN3 (ENSCJAG00000017061) ENSCJAG00000076512 ENSCJAG00000039244 CEP128 (ENSCJAG00000017088) ENSCJAG00000086407 TSHR (ENSCJAG00000017144) GTF2A1 (ENSCJAG00000017169) STON2 (ENSCJAG00000017200) ENSCJAG00000081737 ENSCJAG00000079097 ENSCJAG00000081074 SEL1L (ENSCJAG00000017220) ENSCJAG00000039894 #22 ENSCJAG00000061776 ENSCJAG00000073240 ENSCJAG00000078584 ENSCJAG00000070455 GALC (ENSCJAG00000017259) GPR65 (ENSCJAG00000017275) KCNK10 (ENSCJAG00000017280) SPATA7 (ENSCJAG00000017294) PTPN21 (ENSCJAG00000017324) ZC3H14 (ENSCJAG00000017345) EML5 (ENSCJAG00000017438) ENSCJAG00000021920 TTC8 (ENSCJAG00000017543) ENSCJAG00000084353 ENSCJAG00000081280 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.b.f #22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.b.f #22 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 184 NADSYN1 (ENSSBOG00000019773) DHCR7 (ENSSBOG00000034440) SHANK2 (ENSSBOG00000033655) CTTN (ENSSBOG00000021638) PPFIA1 (ENSSBOG00000020432) FADD (ENSSBOG00000022673) ANO1 (ENSSBOG00000025783) FGF3 (ENSSBOG00000028072) FGF4 (ENSSBOG00000020328) FGF19 (ENSSBOG00000032296) LTO1 (ENSSBOG00000030139) CCND1 (ENSSBOG00000031704) ENSSBOG00000023740 #22 TPCN2 (ENSSBOG00000036110) MRGPRF (ENSSBOG00000022916) IGHMBP2 (ENSSBOG00000021342) MRPL21 (ENSSBOG00000021429) CPT1A (ENSSBOG00000027234) ENSSBOG00000033953 GAL (ENSSBOG00000018976) PPP6R3 (ENSSBOG00000024673) LRP5 (ENSSBOG00000011522) C11orf24 (ENSSBOG00000021901) ENSSBOG00000017297 KMT5B (ENSSBOG00000018620) ENSSBOG00000014251 CHKA (ENSSBOG00000029779) TCIRG1 (ENSSBOG00000029778) Mas night monkey MODERN SPECIES 575 ENSANAG00000028391 RAB30 (ENSANAG00000029292) DDIAS (ENSANAG00000027765) PRCP (ENSANAG00000022970) ENSANAG00000025100 FAM181B (ENSANAG00000024917) ENSANAG00000020939 TENM4 (ENSANAG00000018618) ENSANAG00000027040 ENSANAG00000023487 NARS2 (ENSANAG00000022061) GAB2 (ENSANAG00000033147) USP35 (ENSANAG00000023780) KCTD21 (ENSANAG00000008887) ALG8 (ENSANAG00000028151) ENSANAG00000035549 #22 NDUFC2 (ENSANAG00000032706) KCTD14 (ENSANAG00000032585) ENSANAG00000037311 INTS4 (ENSANAG00000005253) AAMDC (ENSANAG00000031884) RSF1 (ENSANAG00000024984) ENSANAG00000010001 AQP11 (ENSANAG00000032006) ENSANAG00000031650 ENSANAG00000029802 PAK1 (ENSANAG00000019562) GDPD4 (ENSANAG00000030211) MYO7A (ENSANAG00000023144) CAPN5 (ENSANAG00000032657) ACER3 (ENSANAG00000031758) Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.b #22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.b #22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.b #22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 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21 MCM4 (ENSCAFG00845028253) UBE2V2 (ENSCAFG00845028369) ENSCAFG00845028412 ENSCAFG00845028428 EFCAB1 (ENSCAFG00845028482) SNAI2 (ENSCAFG00845028533) PPDPFL (ENSCAFG00845028586) SNTG1 (ENSCAFG00845028965) ENSCAFG00845029197 PXDNL (ENSCAFG00845029236) PCMTD1 (ENSCAFG00845029271) ST18 (ENSCAFG00845029327) ENSCAFG00845024001 RB1CC1 (ENSCAFG00845024092) ENSCAFG00845024539 RPSA (ENSCAFG00845024673) #22 NPBWR1 (ENSCAFG00845024737) OPRK1 (ENSCAFG00845024764) ENSCAFG00845024824 ATP6V1H (ENSCAFG00845024911) RGS20 (ENSCAFG00845025319) TCEA1 (ENSCAFG00845025526) MRPL15 (ENSCAFG00845026048) SOX17 (ENSCAFG00845026119) RP1 (ENSCAFG00845026159) XKR4 (ENSCAFG00845026228) ENSCAFG00845026256 ENSCAFG00845026276 ENSCAFG00845026296 TMEM68 (ENSCAFG00845026349) TGS1 (ENSCAFG00845026551) Dingo DUPLICATION Dingo MODERN SPECIES 327 DPM2 (ENSCAFG00020015802) PIP5KL1 (ENSCAFG00020015801) ST6GALNAC4 (ENSCAFG00020015799) ST6GALNAC6 (ENSCAFG00020015798) AK1 (ENSCAFG00020015797) ENG (ENSCAFG00020015796) FPGS 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FOXG1 (ENSPCTG00005006210) ENSPCTG00005006193 NOVA1 (ENSPCTG00005006112) STXBP6 (ENSPCTG00005006076) GZMB (ENSPCTG00005006025) ENSPCTG00005005984 GZMH (ENSPCTG00005005924) ENSPCTG00005005891 ENSPCTG00005005862 ENSPCTG00005005847 CMA1 (ENSPCTG00005005810) SDR39U1 (ENSPCTG00005005749) KHNYN (ENSPCTG00005005691) CBLN3 (ENSPCTG00005005645) Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000155721 ENSGT00940000153877.h.d ENSGT00390000012690 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00940000164532 ENSGT00950000183099.u.b.a.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.d.i.b ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B ENSGT00940000159338 Dolphin MODERN SPECIES 5304 RPSA (ENSTTRG00000014496) #22 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000153877.h.d ENSGT00390000012690 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00910000146711 ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00940000164532 ENSGT00950000183099.u.b.a.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.d.i.b ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B ENSGT00940000159338 ENSGT00940000160407.h Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000155721 ENSGT00940000153877.h.d.f.a ENSGT00390000012690 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00940000164532 ENSGT00950000183099.u.b.a.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.d.i.b ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00940000165319 ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B ENSGT00940000159338 Beluga whale MODERN SPECIES 56 BICC1 (ENSDLEG00000006916) ENSDLEG00000006926 HNRNPF (ENSDLEG00000006928) SCN5A (ENSDLEG00000006948) SCN10A (ENSDLEG00000007074) SCN11A (ENSDLEG00000007273) WDR48 (ENSDLEG00000007687) GORASP1 (ENSDLEG00000007913) TTC21A (ENSDLEG00000008333) CSRNP1 (ENSDLEG00000009935) XIRP1 (ENSDLEG00000009960) CX3CR1 (ENSDLEG00000009990) CCR8 (ENSDLEG00000009995) SLC25A38 (ENSDLEG00000010007) #21 CASP14 (ENSDLEG00000010036) 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(ENSMMNG00015018771) ENSMMNG00015018735 CTNNB1 (ENSMMNG00015018600) ULK4 (ENSMMNG00015018193) ENSMMNG00015018043 TRAK1 (ENSMMNG00015017624) CCK (ENSMMNG00015017490) LYZL4 (ENSMMNG00015017456) VIPR1 (ENSMMNG00015017323) Vaquita MODERN SPECIES 2 EXOSC7 (ENSPSNG00000013693) ZDHHC3 (ENSPSNG00000013788) TMEM42 (ENSPSNG00000006647) SCN5A (ENSPSNG00000007326) SCN10A (ENSPSNG00000008847) SCN11A (ENSPSNG00000009431) WDR48 (ENSPSNG00000010194) GORASP1 (ENSPSNG00000010277) TTC21A (ENSPSNG00000010388) CSRNP1 (ENSPSNG00000010484) XIRP1 (ENSPSNG00000010563) CX3CR1 (ENSPSNG00000010604) ENSPSNG00000010627 SLC25A38 (ENSPSNG00000010710) #21 ENSPSNG00000010839 ENSPSNG00000010886 #22 ENSPSNG00000010959 MYRIP (ENSPSNG00000011046) EIF1B (ENSPSNG00000011323) ENTPD3 (ENSPSNG00000011390) RPL14 (ENSPSNG00000011475) ZNF619 (ENSPSNG00000011654) ENSPSNG00000011732 ZNF621 (ENSPSNG00000011936) ENSPSNG00000012021 CTNNB1 (ENSPSNG00000012159) ULK4 (ENSPSNG00000012448) TRAK1 (ENSPSNG00000012728) ENSPSNG00000013852 CCK (ENSPSNG00000013917) LYZL4 (ENSPSNG00000013986) Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.b #22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.a.b #22 Siberian musk deer DUPLICATION Siberian musk deer MODERN SPECIES 1210 SGCA (ENSMMSG00000024448) ENSMMSG00000024449 PPP1R9B (ENSMMSG00000024450) SAMD14 (ENSMMSG00000024451) PDK2 (ENSMMSG00000024453) ITGA3 (ENSMMSG00000024456) DLX3 (ENSMMSG00000024461) DLX4 (ENSMMSG00000024462) TAC4 (ENSMMSG00000024465) KAT7 (ENSMMSG00000024468) FAM117A (ENSMMSG00000024473) SLC35B1 (ENSMMSG00000024476) ENSMMSG00000024479 NXPH3 (ENSMMSG00000024480) NGFR (ENSMMSG00000024482) ENSMMSG00000024484 #22 PHB1 (ENSMMSG00000024486) ZNF652 (ENSMMSG00000024488) PHOSPHO1 (ENSMMSG00000024489) ABI3 (ENSMMSG00000024491) GNGT2 (ENSMMSG00000024493) ENSMMSG00000024495 B4GALNT2 (ENSMMSG00000024496) ENSMMSG00000024500 IGF2BP1 (ENSMMSG00000024501) GIP (ENSMMSG00000024503) ENSMMSG00000024504 UBE2Z (ENSMMSG00000024505) ATP5MC1 (ENSMMSG00000024506) CALCOCO2 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(ENSMMSG00000004788) FBXO5 (ENSMMSG00000004752) VIP (ENSMMSG00000004730) MYCT1 (ENSMMSG00000004698) SYNE1 (ENSMMSG00000004396) ESR1 (ENSMMSG00000004298) ENSMMSG00000004280 CCDC170 (ENSMMSG00000004253) ARMT1 (ENSMMSG00000004226) RMND1 (ENSMMSG00000004210) ZBTB2 (ENSMMSG00000004198) AKAP12 (ENSMMSG00000004153) MTHFD1L (ENSMMSG00000004101) ENSMMSG00000004073 #22 PLEKHG1 (ENSMMSG00000004000) IYD (ENSMMSG00000003954) PPP1R14C (ENSMMSG00000003908) ENSMMSG00000003903 ENSMMSG00000003897 ENSMMSG00000003889 ENSMMSG00000003875 ENSMMSG00000003858 ENSMMSG00000003839 LRP11 (ENSMMSG00000003820) PCMT1 (ENSMMSG00000003758) NUP43 (ENSMMSG00000003704) LATS1 (ENSMMSG00000003677) KATNA1 (ENSMMSG00000003646) GINM1 (ENSMMSG00000003620) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 58 ENSGT00940000162395 ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.u.b.a.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 2009 ENSGT00940000164532 ENSGT00950000183099.u.b.a.b #22 Armadillo MODERN SPECIES 261 ENSDNOG00000037881 ENSDNOG00000004048 #22 ENSDNOG00000042639 MYRIP (ENSDNOG00000033417) Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 70 ENSGT00510000048324 ENSGT00940000154621.a.b ENSGT00940000154607.b.a ENSGT00940000162395 ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000154992.b ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.u.b.a.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 Tenrec MODERN SPECIES 16007 ENSETEG00000018160 #22 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 67 ENSGT00510000048324 ENSGT00940000154621.a.b ENSGT00940000154607.b.a ENSGT00940000162395 ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000154992.b ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.u.b.a.b #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 Elephant MODERN SPECIES 348 ENSLAFG00000017679 SLC22A13 (ENSLAFG00000001883) SLC22A14 (ENSLAFG00000012847) XYLB (ENSLAFG00000008743) ACVR2B (ENSLAFG00000001488) EXOG (ENSLAFG00000018139) SCN10A (ENSLAFG00000003408) WDR48 (ENSLAFG00000014800) GORASP1 (ENSLAFG00000031872) ENSLAFG00000017984 CSRNP1 (ENSLAFG00000017990) CX3CR1 (ENSLAFG00000004804) CCR8 (ENSLAFG00000006343) ENSLAFG00000026074 SLC25A38 (ENSLAFG00000011203) #21 ENSLAFG00000032009 #22 MOBP (ENSLAFG00000029042) MYRIP (ENSLAFG00000001139) EIF1B (ENSLAFG00000001140) Mammalia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b #22 Theria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b #22 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b #22 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b #22 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b #22 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b #22 Common wonbat DUPLICATION Common wonbat MODERN SPECIES 1035 ENSVURG00010007529 ENSVURG00010007516 ENSVURG00010007423 ENSVURG00010007372 ENSVURG00010007345 ENSVURG00010007331 ENSVURG00010007185 ENSVURG00010007138 ENSVURG00010007131 ENSVURG00010007108 ENSVURG00010007091 ENSVURG00010007070 ENSVURG00010007049 ENSVURG00010006995 ENSVURG00010006018 ENSVURG00010005657 #22 ENSVURG00010005583 ENSVURG00010005507 ENSVURG00010005441 ENSVURG00010005388 ENSVURG00010005374 ENSVURG00010004350 ENSVURG00010004255 ENSVURG00010004209 ENSVURG00010004159 ENSVURG00010004143 ENSVURG00010004059 ENSVURG00010004029 ENSVURG00010003951 ENSVURG00010003943 ENSVURG00010003935 Common wonbat MODERN SPECIES 1035 ENSVURG00010015571 ENSVURG00010015550 ENSVURG00010015501 ENSVURG00010015486 ENSVURG00010015474 ENSVURG00010015455 ENSVURG00010015445 ENSVURG00010015280 ENSVURG00010015242 ENSVURG00010015237 ENSVURG00010015215 ENSVURG00010015157 ENSVURG00010015117 ENSVURG00010015062 ENSVURG00010014008 ENSVURG00010013876 #22 ENSVURG00010013814 ENSVURG00010006357 ENSVURG00010006012 ENSVURG00010005999 ENSVURG00010005985 ENSVURG00010004924 ENSVURG00010004845 ENSVURG00010004793 ENSVURG00010004057 ENSVURG00010003872 ENSVURG00010003841 ENSVURG00010003768 ENSVURG00010003749 ENSVURG00010003743 ENSVURG00010003528 koala MODERN SPECIES 203 MMADHC (ENSPCIG00000031048) ENSPCIG00000033780 RND3 (ENSPCIG00000016721) ENSPCIG00000020142 ENSPCIG00000020144 TNFAIP6 (ENSPCIG00000009192) RIF1 (ENSPCIG00000009185) NEB (ENSPCIG00000005793) ARL5A (ENSPCIG00000005040) CACNB4 (ENSPCIG00000011289) STAM2 (ENSPCIG00000001302) ENSPCIG00000028317 #22 FMNL2 (ENSPCIG00000004973) PRPF40A (ENSPCIG00000004943) ARL6IP6 (ENSPCIG00000004934) ENSPCIG00000035350 ENSPCIG00000012281 ENSPCIG00000020793 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b #22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b #22 Euarchontoglires DUPLICATION Euarchontoglires DUPLICATION Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.c.a #22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.c.a #22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.c.a #22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.c.a #22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.c.a #22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.c.a #22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.c.a #22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.c.a #22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.c.a #22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.c.a #22 Sooty mangabey MODERN SPECIES 397 SLC26A7 (ENSCATG00000031442) ENSCATG00000029754 ENSCATG00000035867 PIP4P2 (ENSCATG00000008201) C8orf88 (ENSCATG00000044291) ENSCATG00000019588 NECAB1 (ENSCATG00000039853) TMEM64 (ENSCATG00000034749) CALB1 (ENSCATG00000041675) DECR1 (ENSCATG00000029838) NBN (ENSCATG00000033051) OSGIN2 (ENSCATG00000036811) RIPK2 (ENSCATG00000042899) ENSCATG00000034840 #22 MMP16 (ENSCATG00000039014) CNBD1 (ENSCATG00000034178) CNGB3 (ENSCATG00000030165) CPNE3 (ENSCATG00000038568) RMDN1 (ENSCATG00000015442) WWP1 (ENSCATG00000031449) SLC7A13 (ENSCATG00000041991) ATP6V0D2 (ENSCATG00000032520) PSKH2 (ENSCATG00000035667) ENSCATG00000037505 CA2 (ENSCATG00000031921) CA3 (ENSCATG00000035345) CA1 (ENSCATG00000044678) CA13 (ENSCATG00000044249) RBIS (ENSCATG00000028244) Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.c.a #22 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.c.a #22 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 17 CALML4 (ENSMFAG00000036145) FEM1B (ENSMFAG00000064469) ITGA11 (ENSMFAG00000001090) CORO2B (ENSMFAG00000030894) ANP32A (ENSMFAG00000043083) ENSMFAG00000050608 SPESP1 (ENSMFAG00000043000) NOX5 (ENSMFAG00000000728) ENSMFAG00000063916 GLCE (ENSMFAG00000045812) ENSMFAG00000059741 PAQR5 (ENSMFAG00000040350) KIF23 (ENSMFAG00000041684) RPLP1 (ENSMFAG00000000366) TLE3 (ENSMFAG00000003282) ENSMFAG00000035945 #22 UACA (ENSMFAG00000035966) ENSMFAG00000063290 LARP6 (ENSMFAG00000035507) LRRC49 (ENSMFAG00000035613) THAP10 (ENSMFAG00000035940) ENSMFAG00000035955 THSD4 (ENSMFAG00000004078) NR2E3 (ENSMFAG00000035959) MYO9A (ENSMFAG00000023157) ENSMFAG00000040220 SENP8 (ENSMFAG00000004993) GRAMD2A (ENSMFAG00000034562) ENSMFAG00000044507 PARP6 (ENSMFAG00000000225) CELF6 (ENSMFAG00000002682) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.c.a #22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.c.a #22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.c.a #22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.c.a #22 Pan ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.c.a #22 Chimpanzee MODERN SPECIES 16 SLC22A14 (ENSPTRG00000014757) XYLB (ENSPTRG00000014758) ACVR2B (ENSPTRG00000014760) EXOG (ENSPTRG00000014761) ENSPTRG00000048292 SCN5A (ENSPTRG00000014762) SCN10A (ENSPTRG00000014763) SCN11A (ENSPTRG00000014764) WDR48 (ENSPTRG00000014765) GORASP1 (ENSPTRG00000014766) TTC21A (ENSPTRG00000014767) CSRNP1 (ENSPTRG00000014768) XIRP1 (ENSPTRG00000014770) CX3CR1 (ENSPTRG00000014771) SLC25A38 (ENSPTRG00000014772) #21 ENSPTRG00000022841 #22 MOBP (ENSPTRG00000034021) ENSPTRG00000048405 MYRIP (ENSPTRG00000014775) EIF1B (ENSPTRG00000014776) ENTPD3 (ENSPTRG00000014777) RPL14 (ENSPTRG00000011963) ZNF619 (ENSPTRG00000014779) ZNF620 (ENSPTRG00000014780) ZNF621 (ENSPTRG00000044761) ENSPTRG00000048833 CTNNB1 (ENSPTRG00000023062) ULK4 (ENSPTRG00000014788) ENSPTRG00000045569 ENSPTRG00000045455 TRAK1 (ENSPTRG00000014789) Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.c.a #22 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.c.a #22 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.c.a #22 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 359 ENSPSMG00000015648 DCT (ENSPSMG00000015638) TGDS (ENSPSMG00000015614) GPR180 (ENSPSMG00000015581) SOX21 (ENSPSMG00000015568) ABCC4 (ENSPSMG00000015535) ENSPSMG00000015361 #22 CLDN10 (ENSPSMG00000015350) DZIP1 (ENSPSMG00000015335) DNAJC3 (ENSPSMG00000015262) UGGT2 (ENSPSMG00000015174) HS6ST3 (ENSPSMG00000015011) ENSPSMG00000015005 OXGR1 (ENSPSMG00000015004) ENSPSMG00000015001 MBNL2 (ENSPSMG00000014968) RAP2A (ENSPSMG00000014873) IPO5 (ENSPSMG00000014841) FARP1 (ENSPSMG00000014582) STK24 (ENSPSMG00000014388) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.c.b #22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.c.b #22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.c.b #22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.c.b #22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.c.b #22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.c.b #22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.c.b #22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.c.b #22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.c.b #22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.c.b #22 Sooty mangabey MODERN SPECIES 570 PPIG (ENSCATG00000032109) CFAP210 (ENSCATG00000035489) PHOSPHO2 (ENSCATG00000003608) KLHL23 (ENSCATG00000031017) SSB (ENSCATG00000036701) METTL5 (ENSCATG00000030294) UBR3 (ENSCATG00000016590) MYO3B (ENSCATG00000039840) SP5 (ENSCATG00000041697) ENSCATG00000021621 GAD1 (ENSCATG00000021159) GORASP2 (ENSCATG00000041815) ENSCATG00000030565 METTL8 (ENSCATG00000041402) DCAF17 (ENSCATG00000033362) ENSCATG00000041682 #22 CYBRD1 (ENSCATG00000035346) DYNC1I2 (ENSCATG00000029930) SLC25A12 (ENSCATG00000036790) HAT1 (ENSCATG00000044185) METAP1D (ENSCATG00000044416) DLX1 (ENSCATG00000037027) DLX2 (ENSCATG00000024031) ITGA6 (ENSCATG00000037277) PDK1 (ENSCATG00000035483) RAPGEF4 (ENSCATG00000033510) ENSCATG00000036110 MAP3K20 (ENSCATG00000038986) CDCA7 (ENSCATG00000035553) ENSCATG00000036945 SP3 (ENSCATG00000028784) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.c.b #22 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2527 ENSRBIG00000041746 #22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.c.b #22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.c.b #22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.c.b #22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.c.b #22 Pan ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.c.b #22 Chimpanzee MODERN SPECIES 14 ENSPTRG00000051789 PAPOLG (ENSPTRG00000011948) REL (ENSPTRG00000011949) ENSPTRG00000048311 PUS10 (ENSPTRG00000011951) PEX13 (ENSPTRG00000011952) SANBR (ENSPTRG00000011954) C2AH2orf74 (ENSPTRG00000033941) ENSPTRG00000023268 ENSPTRG00000050629 USP34 (ENSPTRG00000011959) XPO1 (ENSPTRG00000011962) FAM161A (ENSPTRG00000011964) CCT4 (ENSPTRG00000011965) COMMD1 (ENSPTRG00000011966) ENSPTRG00000045695 #22 B3GNT2 (ENSPTRG00000051560) TMEM17 (ENSPTRG00000011968) EHBP1 (ENSPTRG00000011969) OTX1 (ENSPTRG00000011972) WDPCP (ENSPTRG00000024270) MDH1 (ENSPTRG00000011974) ENSPTRG00000046466 ENSPTRG00000048626 UGP2 (ENSPTRG00000011976) VPS54 (ENSPTRG00000011978) PELI1 (ENSPTRG00000023869) LGALSL (ENSPTRG00000047293) AFTPH (ENSPTRG00000011983) ENSPTRG00000045952 SERTAD2 (ENSPTRG00000030469) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.c.b #22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.c.b #22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.c.b #22 Capuchin MODERN SPECIES 50 CCDC125 (ENSCCAG00000025219) AK6 (ENSCCAG00000021405) RAD17 (ENSCCAG00000037823) MARVELD2 (ENSCCAG00000029566) ENSCCAG00000031439 ENSCCAG00000019925 OCLN (ENSCCAG00000021176) ENSCCAG00000031800 ENSCCAG00000018127 SERF1B (ENSCCAG00000031324) BDP1 (ENSCCAG00000033596) MCCC2 (ENSCCAG00000033706) ENSCCAG00000020273 CARTPT (ENSCCAG00000021730) ENSCCAG00000026040 ENSCCAG00000033067 #22 MAP1B (ENSCCAG00000025393) MRPS27 (ENSCCAG00000030550) ENSCCAG00000029389 ZNF366 (ENSCCAG00000021177) TNPO1 (ENSCCAG00000026472) FCHO2 (ENSCCAG00000020869) TMEM171 (ENSCCAG00000032407) TMEM174 (ENSCCAG00000026904) FOXD1 (ENSCCAG00000006678) ENSCCAG00000033236 ANKRA2 (ENSCCAG00000033227) UTP15 (ENSCCAG00000033397) ARHGEF28 (ENSCCAG00000030516) ENC1 (ENSCCAG00000017658) HEXB (ENSCCAG00000025903) Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.c.b #22 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.c.b #22 Mouse lemur DUPLICATION Mouse lemur MODERN SPECIES 28 UBE3D (ENSMICG00000006683) TPBG (ENSMICG00000046765) IBTK (ENSMICG00000005321) TENT5A (ENSMICG00000006596) ENSMICG00000033445 BCKDHB (ENSMICG00000003277) TTK (ENSMICG00000003271) LCA5 (ENSMICG00000014607) ELOVL4 (ENSMICG00000026958) SH3BGRL2 (ENSMICG00000037578) HMGN3 (ENSMICG00000012580) PHIP (ENSMICG00000000134) IRAK1BP1 (ENSMICG00000044942) MEI4 (ENSMICG00000038415) HTR1B (ENSMICG00000012414) ENSMICG00000029528 #22 IMPG1 (ENSMICG00000012422) MYO6 (ENSMICG00000012391) SENP6 (ENSMICG00000005250) FILIP1 (ENSMICG00000031943) TMEM30A (ENSMICG00000015757) COX7A2 (ENSMICG00000015747) COL12A1 (ENSMICG00000015681) CD109 (ENSMICG00000009612) SLC17A5 (ENSMICG00000016403) ENSMICG00000037627 MTO1 (ENSMICG00000032161) CGAS (ENSMICG00000046397) DDX43 (ENSMICG00000017145) OOEP (ENSMICG00000035829) KHDC3L (ENSMICG00000045560) Mouse lemur MODERN SPECIES 24 ENSMICG00000029978 CHODL (ENSMICG00000001940) TMPRSS15 (ENSMICG00000001943) NCAM2 (ENSMICG00000001626) ENSMICG00000000112 MRPL39 (ENSMICG00000006324) JAM2 (ENSMICG00000006332) ATP5PF (ENSMICG00000006338) GABPA (ENSMICG00000006341) ENSMICG00000032468 APP (ENSMICG00000001468) CYYR1 (ENSMICG00000032849) ADAMTS1 (ENSMICG00000038550) ADAMTS5 (ENSMICG00000012538) ENSMICG00000034032 ENSMICG00000041622 #22 N6AMT1 (ENSMICG00000045182) LTN1 (ENSMICG00000002822) RWDD2B (ENSMICG00000034054) USP16 (ENSMICG00000031747) CCT8 (ENSMICG00000002601) MAP3K7CL (ENSMICG00000038209) BACH1 (ENSMICG00000030387) GRIK1 (ENSMICG00000000648) ENSMICG00000000669 ENSMICG00000047432 ENSMICG00000000670 KRTAP19-7 (ENSMICG00000031600) KRTAP6-2 (ENSMICG00000034660) KRTAP6-1 (ENSMICG00000034583) KRTAP11-1 (ENSMICG00000010543) Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.c.b #22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.c.b #22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.c.b #22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.c.b #22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.c.b #22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.c.b #22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.c.b #22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.c.b #22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.c.b #22 Northern American deer mouse MODERN SPECIES ENSPEMG00000026788 ENSPEMG00000019774 ENSPEMG00000026755 ENSPEMG00000014034 1600014C10Rik (ENSPEMG00000030733) Ccne1 (ENSPEMG00000020299) Uri1 (ENSPEMG00000021114) Zfp536 (ENSPEMG00000014198) Tshz3 (ENSPEMG00000024219) Zfp507 (ENSPEMG00000023579) Dpy19l3 (ENSPEMG00000020636) Pdcd5 (ENSPEMG00000005766) Ankrd27 (ENSPEMG00000020526) Rgs9bp (ENSPEMG00000001852) Nudt19 (ENSPEMG00000020519) ENSPEMG00000022578 #22 Tdrd12 (ENSPEMG00000009233) Slc7a9 (ENSPEMG00000020346) Cep89 (ENSPEMG00000020557) Faap24 (ENSPEMG00000021083) Rhpn2 (ENSPEMG00000020482) Gpatch1 (ENSPEMG00000000636) ENSPEMG00000024856 Lrp3 (ENSPEMG00000000320) Slc7a10 (ENSPEMG00000007269) ENSPEMG00000020956 Cebpg (ENSPEMG00000002139) Pepd (ENSPEMG00000021596) Chst8 (ENSPEMG00000020376) Kctd15 (ENSPEMG00000007336) Lsm14a (ENSPEMG00000013718) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.d #22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.d #22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.d #22 Tarsier MODERN SPECIES 5239 ENSTSYG00000012713 PREX2 (ENSTSYG00000012893) ENSTSYG00000025673 #22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.d #22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.d #22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.d #22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.d #22 Golden snub-nosed monkey DUPLICATION Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1246 ENSRROG00000029143 #22 Golden snub-nosed monkey DUPLICATION Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1983 ENSRROG00000043349 KLRB1 (ENSRROG00000040177) ENSRROG00000039611 DDX11 (ENSRROG00000042965) ENSRROG00000040071 PZP (ENSRROG00000036968) KLRG1 (ENSRROG00000042899) M6PR (ENSRROG00000040189) PHC1 (ENSRROG00000038246) A2ML1 (ENSRROG00000036769) ENSRROG00000032902 MFAP5 (ENSRROG00000008374) ENSRROG00000032310 AICDA (ENSRROG00000032866) ENSRROG00000039525 ENSRROG00000027291 #22 CLEC4E (ENSRROG00000037092) CLEC4D (ENSRROG00000043601) ENSRROG00000043127 CLEC6A (ENSRROG00000033999) CLEC4A (ENSRROG00000029248) NECAP1 (ENSRROG00000043387) FOXJ2 (ENSRROG00000032303) SLC2A3 (ENSRROG00000045454) ENSRROG00000013447 ENSRROG00000026127 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2348 ENSRROG00000017773 ZCRB1 (ENSRROG00000033546) ENSRROG00000038454 PRICKLE1 (ENSRROG00000040297) ENSRROG00000029864 ADAMTS20 (ENSRROG00000040368) ENSRROG00000042321 ENSRROG00000036827 ENSRROG00000037198 PUS7L (ENSRROG00000042069) ENSRROG00000039276 #22 IRAK4 (ENSRROG00000036588) TWF1 (ENSRROG00000038875) Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.d #22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.d #22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.d #22 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 77 CALML4 (ENSMNEG00000033193) CLN6 (ENSMNEG00000034743) FEM1B (ENSMNEG00000033491) ITGA11 (ENSMNEG00000031314) CORO2B (ENSMNEG00000028626) ANP32A (ENSMNEG00000043179) ENSMNEG00000038547 SPESP1 (ENSMNEG00000024286) NOX5 (ENSMNEG00000032218) ENSMNEG00000024626 GLCE (ENSMNEG00000039663) PAQR5 (ENSMNEG00000008177) KIF23 (ENSMNEG00000028825) ENSMNEG00000003053 TLE3 (ENSMNEG00000036112) ENSMNEG00000043028 #22 UACA (ENSMNEG00000035153) LARP6 (ENSMNEG00000045335) THAP10 (ENSMNEG00000005916) LRRC49 (ENSMNEG00000042140) ENSMNEG00000037018 THSD4 (ENSMNEG00000043215) NR2E3 (ENSMNEG00000033560) ENSMNEG00000013743 ENSMNEG00000008553 ENSMNEG00000021812 MYO9A (ENSMNEG00000028084) SENP8 (ENSMNEG00000020528) GRAMD2A (ENSMNEG00000044002) ENSMNEG00000037155 PARP6 (ENSMNEG00000038479) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.d #22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 103 ENSGT00950000182925.D.a.b.a.b ENSGT00940000155148.b.u ENSGT00940000154103.b ENSGT00530000063529.B ENSGT00940000153902.b ENSGT00950000183099.u.b.b.d #22 ENSGT00940000162717 ENSGT00950000182870.a.a.b.i.b ENSGT00390000018389 ENSGT00940000159316 ENSGT00390000014785 ENSGT01090000260082.d.a.a.a.a ENSGT00390000009004.bb ENSGT00390000001432 ENSGT00910000147166 ENSGT00940000164579.i.a ENSGT00940000153336.e.a.a.a.b.a.b ENSGT00940000158517 ENSGT00940000154370.pc.u.a ENSGT00940000153259.a.a.a.b ENSGT00940000155516 Drill MODERN SPECIES 1445 ARHGEF9 (ENSMLEG00000027738) AMER1 (ENSMLEG00000036881) ASB12 (ENSMLEG00000038058) ENSMLEG00000029787 #22 MTMR8 (ENSMLEG00000042315) ENSMLEG00000037922 Sooty mangabey DUPLICATION Sooty mangabey MODERN SPECIES 653 SPIN4 (ENSCATG00000015150) ENSCATG00000035493 ARHGEF9 (ENSCATG00000041317) AMER1 (ENSCATG00000011589) ASB12 (ENSCATG00000003007) ENSCATG00000016014 #22 MTMR8 (ENSCATG00000006159) ENSCATG00000022049 ZC4H2 (ENSCATG00000036449) ZC3H12B (ENSCATG00000044845) LAS1L (ENSCATG00000033406) MSN (ENSCATG00000034907) ENSCATG00000029533 VSIG4 (ENSCATG00000039768) ENSCATG00000027914 ENSCATG00000039029 HEPH (ENSCATG00000037485) ENSCATG00000012427 EDA2R (ENSCATG00000026223) ENSCATG00000034497 AR (ENSCATG00000030680) Sooty mangabey MODERN SPECIES 129 ENSCATG00000043436 ENSCATG00000043420 CLASP1 (ENSCATG00000039063) TFCP2L1 (ENSCATG00000044361) GLI2 (ENSCATG00000034671) INHBB (ENSCATG00000010576) ENSCATG00000006617 RALB (ENSCATG00000039216) ENSCATG00000036400 EPB41L5 (ENSCATG00000040081) ENSCATG00000035581 PTPN4 (ENSCATG00000030920) ENSCATG00000012333 ENSCATG00000014934 CFAP221 (ENSCATG00000020702) ENSCATG00000032201 #22 SCTR (ENSCATG00000035610) TMEM37 (ENSCATG00000029551) ENSCATG00000041961 C2orf76 (ENSCATG00000031880) STEAP3 (ENSCATG00000039809) C1QL2 (ENSCATG00000041576) MARCO (ENSCATG00000008042) EN1 (ENSCATG00000040038) INSIG2 (ENSCATG00000040525) CCDC93 (ENSCATG00000041614) ENSCATG00000036756 DDX18 (ENSCATG00000036838) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.d #22 Gibbon MODERN SPECIES 11 CCDC112 (ENSNLEG00000011753) ENSNLEG00000034911 FEM1C (ENSNLEG00000011770) TICAM2 (ENSNLEG00000011774) ENSNLEG00000034479 CDO1 (ENSNLEG00000027852) ENSNLEG00000031512 AP3S1 (ENSNLEG00000027249) LVRN (ENSNLEG00000034383) ARL14EPL (ENSNLEG00000035776) COMMD10 (ENSNLEG00000026562) ENSNLEG00000033349 SEMA6A (ENSNLEG00000011779) ENSNLEG00000035368 ENSNLEG00000031042 ENSNLEG00000030536 #22 DTWD2 (ENSNLEG00000011825) DMXL1 (ENSNLEG00000011838) TNFAIP8 (ENSNLEG00000011925) HSD17B4 (ENSNLEG00000011926) FAM170A (ENSNLEG00000011943) ENSNLEG00000034199 PRR16 (ENSNLEG00000011947) ENSNLEG00000031918 ENSNLEG00000027706 FTMT (ENSNLEG00000018895) ENSNLEG00000032909 SRFBP1 (ENSNLEG00000011949) LOX (ENSNLEG00000011966) ENSNLEG00000011997 SNCAIP (ENSNLEG00000011998) Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.d #22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.d #22 Gorilla MODERN SPECIES 5 ENSGGOG00000036646 IFI27 (ENSGGOG00000006752) IFI27L2 (ENSGGOG00000007541) PPP4R4 (ENSGGOG00000008944) SERPINA10 (ENSGGOG00000002795) SERPINA6 (ENSGGOG00000007882) ENSGGOG00000007886 SERPINA1 (ENSGGOG00000007890) SERPINA11 (ENSGGOG00000004055) SERPINA9 (ENSGGOG00000008775) SERPINA12 (ENSGGOG00000006345) SERPINA4 (ENSGGOG00000016990) SERPINA5 (ENSGGOG00000001864) SERPINA3 (ENSGGOG00000000680) ENSGGOG00000041740 ENSGGOG00000042527 #22 GSC (ENSGGOG00000007819) DICER1 (ENSGGOG00000003760) CLMN (ENSGGOG00000011499) SYNE3 (ENSGGOG00000013332) GLRX5 (ENSGGOG00000007566) ENSGGOG00000023624 ENSGGOG00000041856 TCL1B (ENSGGOG00000013671) TCL1A (ENSGGOG00000004037) ENSGGOG00000026178 ENSGGOG00000038509 ENSGGOG00000042465 BDKRB2 (ENSGGOG00000013467) ENSGGOG00000039063 ENSGGOG00000013472 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.d #22 Pan ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000013163 ENSGT00530000064312 ENSGT00940000161876 ENSGT00400000023784 ENSGT00740000116871 ENSGT00530000064225 ENSGT00940000162856 ENSGT00510000048608 ENSGT00390000011484 ENSGT00420000029848.B ENSGT00530000064228 ENSGT00940000153713.B.d ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a ENSGT00940000158185 ENSGT00950000182864.a.b.b.a.b.a.b ENSGT00950000183099.u.b.b.d #22 ENSGT01030000234518.A.a.b ENSGT00940000157770 ENSGT00940000160880 ENSGT00510000046929.b ENSGT00390000012163 ENSGT00940000160864 ENSGT00530000063666.a.m.b ENSGT00940000160067 ENSGT00940000158849 ENSGT00950000182810.A.b ENSGT00390000004524.c.a.a.b.a.b ENSGT00940000156071 ENSGT00940000153168.C.a.a ENSGT00390000009781 ENSGT00910000147098 Chimpanzee MODERN SPECIES 18 FBXO38 (ENSPTRG00000017388) SPINK9 (ENSPTRG00000028533) SPINK7 (ENSPTRG00000017387) SPINK13 (ENSPTRG00000034142) MARCOL (ENSPTRG00000051181) SPINK6 (ENSPTRG00000017386) SPINK14 (ENSPTRG00000022988) SPINK5 (ENSPTRG00000043281) C5H5orf46 (ENSPTRG00000017384) SCGB3A2 (ENSPTRG00000017383) SPINK1 (ENSPTRG00000017382) JAKMIP2 (ENSPTRG00000017381) DPYSL3 (ENSPTRG00000017380) STK32A (ENSPTRG00000017379) PPP2R2B (ENSPTRG00000017377) ENSPTRG00000028538 #22 GPR151 (ENSPTRG00000017376) TCERG1 (ENSPTRG00000017375) POU4F3 (ENSPTRG00000017374) RBM27 (ENSPTRG00000017373) LARS1 (ENSPTRG00000017372) PLAC8L1 (ENSPTRG00000017370) ENSPTRG00000049462 SH3RF2 (ENSPTRG00000017369) GRXCR2 (ENSPTRG00000028540) PRELID2 (ENSPTRG00000017368) KCTD16 (ENSPTRG00000017366) YIPF5 (ENSPTRG00000017365) HMHB1 (ENSPTRG00000048752) ENSPTRG00000049901 NR3C1 (ENSPTRG00000017363) Bonobo DUPLICATION Bonobo MODERN SPECIES 18 ADRB2 (ENSPPAG00000036592) HTR4 (ENSPPAG00000040790) FBXO38 (ENSPPAG00000016960) ENSPPAG00000039891 SPINK7 (ENSPPAG00000037231) SPINK13 (ENSPPAG00000026789) SPINK6 (ENSPPAG00000037222) SPINK14 (ENSPPAG00000043145) SPINK5 (ENSPPAG00000040944) C5orf46 (ENSPPAG00000041880) SCGB3A2 (ENSPPAG00000036296) JAKMIP2 (ENSPPAG00000041169) DPYSL3 (ENSPPAG00000035370) STK32A (ENSPPAG00000028058) PPP2R2B (ENSPPAG00000042867) ENSPPAG00000037880 #22 GPR151 (ENSPPAG00000016556) TCERG1 (ENSPPAG00000033605) POU4F3 (ENSPPAG00000043642) RBM27 (ENSPPAG00000039646) LARS1 (ENSPPAG00000027964) PLAC8L1 (ENSPPAG00000036320) ENSPPAG00000013764 SH3RF2 (ENSPPAG00000042408) GRXCR2 (ENSPPAG00000020105) PRELID2 (ENSPPAG00000030896) ENSPPAG00000043741 KCTD16 (ENSPPAG00000039008) YIPF5 (ENSPPAG00000041251) ENSPPAG00000038465 NR3C1 (ENSPPAG00000039198) Bonobo MODERN SPECIES 12 KRTAP7-1 (ENSPPAG00000032653) KRTAP8-1 (ENSPPAG00000032139) KRTAP21-1 (ENSPPAG00000030330) KRTAP6-1 (ENSPPAG00000032430) KRTAP22-1 (ENSPPAG00000032266) KRTAP6-2 (ENSPPAG00000032330) ENSPPAG00000030209 KRTAP22-2 (ENSPPAG00000030023) KRTAP19-5 (ENSPPAG00000032202) KRTAP19-3 (ENSPPAG00000032888) KRTAP13-1 (ENSPPAG00000032574) KRTAP27-1 (ENSPPAG00000032584) KRTAP26-1 (ENSPPAG00000032463) KRTAP24-1 (ENSPPAG00000032425) CLDN8 (ENSPPAG00000032826) ENSPPAG00000027944 #22 CLDN17 (ENSPPAG00000032609) GRIK1 (ENSPPAG00000032151) BACH1 (ENSPPAG00000028985) ENSPPAG00000028382 CCT8 (ENSPPAG00000025556) USP16 (ENSPPAG00000018521) RWDD2B (ENSPPAG00000016990) ENSPPAG00000013965 LTN1 (ENSPPAG00000006486) ENSPPAG00000001653 N6AMT1 (ENSPPAG00000034453) ENSPPAG00000020443 ENSPPAG00000040910 ADAMTS5 (ENSPPAG00000037965) ADAMTS1 (ENSPPAG00000002375) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.d #22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.d #22 Marmoset MODERN SPECIES 1 PSTPIP1 (ENSCJAG00000011058) TSPAN3 (ENSCJAG00000011087) PEAK1 (ENSCJAG00000011124) ENSCJAG00000075009 HMG20A (ENSCJAG00000011131) LINGO1 (ENSCJAG00000011159) ENSCJAG00000043801 ENSCJAG00000049802 ENSCJAG00000066491 ENSCJAG00000038494 ENSCJAG00000067731 ENSCJAG00000084101 ODF3L1 (ENSCJAG00000079718) CSPG4 (ENSCJAG00000046088) SNX33 (ENSCJAG00000004860) ENSCJAG00000083757 #22 IMP3 (ENSCJAG00000044585) ENSCJAG00000077991 ENSCJAG00000011168 ENSCJAG00000070278 ENSCJAG00000015481 SIN3A (ENSCJAG00000015537) PTPN9 (ENSCJAG00000015619) C15orf39 (ENSCJAG00000044594) ENSCJAG00000086377 ENSCJAG00000015648 SCAMP5 (ENSCJAG00000015635) ENSCJAG00000081759 RPP25 (ENSCJAG00000043872) ENSCJAG00000015613 FAM219B (ENSCJAG00000015600) Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.d #22 Capuchin MODERN SPECIES 266 TEAD2 (ENSCCAG00000030155) ENSCCAG00000022912 KASH5 (ENSCCAG00000029552) PTH2 (ENSCCAG00000026177) GFY (ENSCCAG00000030107) SLC17A7 (ENSCCAG00000026447) PIH1D1 (ENSCCAG00000027317) ALDH16A1 (ENSCCAG00000012874) FLT3LG (ENSCCAG00000001876) RPL13A (ENSCCAG00000022898) RPS11 (ENSCCAG00000037559) FCGRT (ENSCCAG00000030152) RCN3 (ENSCCAG00000035673) NOSIP (ENSCCAG00000038048) ENSCCAG00000024935 ENSCCAG00000036590 #22 ENSCCAG00000007585 ENSCCAG00000024034 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.d #22 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.d #22 Mouse lemur MODERN SPECIES 27 ENSMICG00000044564 ENSMICG00000044796 ENSMICG00000033487 ENSMICG00000008357 PTPRJ (ENSMICG00000005145) ENSMICG00000036331 ENSMICG00000032012 ENSMICG00000003903 ENSMICG00000008279 ENSMICG00000048041 ENSMICG00000002840 ENSMICG00000045888 NUP160 (ENSMICG00000011344) FNBP4 (ENSMICG00000011329) AGBL2 (ENSMICG00000011310) ENSMICG00000034382 #22 ENSMICG00000005314 MTCH2 (ENSMICG00000027810) FAM180B (ENSMICG00000001091) NDUFS3 (ENSMICG00000045989) KBTBD4 (ENSMICG00000001087) PTPMT1 (ENSMICG00000028273) CELF1 (ENSMICG00000045113) ENSMICG00000043341 RAPSN (ENSMICG00000007148) PSMC3 (ENSMICG00000007138) SLC39A13 (ENSMICG00000007125) SPI1 (ENSMICG00000007120) MYBPC3 (ENSMICG00000007096) MADD (ENSMICG00000007074) NR1H3 (ENSMICG00000007066) Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.d #22 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 1730 ENSPSMG00000010303 #22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.d #22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.d #22 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.d #22 Rabbit MODERN SPECIES 5 FZR1 (ENSOCUG00000014987) ENSOCUG00000025967 ENSOCUG00000023181 GOLIM4 (ENSOCUG00000005409) ENSOCUG00000029708 SERPINI1 (ENSOCUG00000017509) PDCD10 (ENSOCUG00000015413) WDR49 (ENSOCUG00000009788) SERPINI2 (ENSOCUG00000009783) ZBBX (ENSOCUG00000016778) ENSOCUG00000028097 BCHE (ENSOCUG00000008068) SLITRK3 (ENSOCUG00000003087) SI (ENSOCUG00000003878) ENSOCUG00000027574 ENSOCUG00000032782 #22 ENSOCUG00000037303 OTOL1 (ENSOCUG00000027063) ENSOCUG00000021142 SPTSSB (ENSOCUG00000024536) NMD3 (ENSOCUG00000017454) ENSOCUG00000022150 ENSOCUG00000031531 ENSOCUG00000031137 PPM1L (ENSOCUG00000001173) ENSOCUG00000011861 ARL14 (ENSOCUG00000021985) KPNA4 (ENSOCUG00000001818) TRIM59 (ENSOCUG00000031294) SMC4 (ENSOCUG00000014835) IFT80 (ENSOCUG00000014825) Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.d #22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.d #22 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.d #22 Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.d #22 Alpin marmot MODERN SPECIES 57 RBP3 (ENSMMMG00000019450) ENSMMMG00000019465 ENSMMMG00000019475 ALOX5 (ENSMMMG00000019477) OR13A1 (ENSMMMG00000019515) ENSMMMG00000019520 ENSMMMG00000019527 ZNF22 (ENSMMMG00000019530) RASSF4 (ENSMMMG00000019532) DEPP1 (ENSMMMG00000019540) TMEM72 (ENSMMMG00000019544) CXCL12 (ENSMMMG00000019552) ZNF32 (ENSMMMG00000019596) ENSMMMG00000019599 ENSMMMG00000019600 ENSMMMG00000019603 #22 RASGEF1A (ENSMMMG00000019611) CSGALNACT2 (ENSMMMG00000019628) RET (ENSMMMG00000019644) BMS1 (ENSMMMG00000019669) ZNF248 (ENSMMMG00000020218) ZNF25 (ENSMMMG00000020237) ENSMMMG00000020268 ENSMMMG00000020282 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.d #22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.d #22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.d #22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.d #22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.d #22 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.d #22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.d #22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.d #22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b.d #22 Steppe mouse MODERN SPECIES 3147 ENSMSIG00000013549 Spsb1 (ENSMSIG00000013485) Slc25a33 (ENSMSIG00000013468) Tmem201 (ENSMSIG00000013447) Pik3cd (ENSMSIG00000013088) Clstn1 (ENSMSIG00000012878) Ctnnbip1 (ENSMSIG00000012852) Lzic (ENSMSIG00000012830) Tmem274 (ENSMSIG00000012805) Nmnat1 (ENSMSIG00000012784) Rbp7 (ENSMSIG00000012768) Ube4b (ENSMSIG00000012736) Kif1b (ENSMSIG00000012365) Pgd (ENSMSIG00000012333) ENSMSIG00000012320 #22 ENSMSIG00000012268 Cort (ENSMSIG00000012256) Dffa (ENSMSIG00000012239) Pex14 (ENSMSIG00000012138) Casz1 (ENSMSIG00000012072) ENSMSIG00000012065 Gm572 (ENSMSIG00000012030) Tardbp (ENSMSIG00000011917) Masp2 (ENSMSIG00000011900) Srm (ENSMSIG00000011893) Exosc10 (ENSMSIG00000011825) Angptl7 (ENSMSIG00000011805) Mtor (ENSMSIG00000011592) Ubiad1 (ENSMSIG00000011575) Disp3 (ENSMSIG00000011555) Rat DUPLICATION Rat MODERN SPECIES 18 Xylb (ENSRNOG00000014168) Acvr2b (ENSRNOG00000014477) Exog (ENSRNOG00000014801) Scn5a (ENSRNOG00000015049) Scn10a (ENSRNOG00000032473) Scn11a (ENSRNOG00000032884) Wdr48 (ENSRNOG00000016942) Gorasp1 (ENSRNOG00000018047) Ttc21a (ENSRNOG00000034089) Csrnp1 (ENSRNOG00000033433) Xirp1 (ENSRNOG00000037085) Cx3cr1 (ENSRNOG00000018509) Ccr8 (ENSRNOG00000026759) Slc25a38 (ENSRNOG00000018552) #21 ENSRNOG00000068525 Rpsa (ENSRNOG00000018645) #22 Mobp (ENSRNOG00000018700) AABR07071746.1 (ENSRNOG00000018786) Myrip (ENSRNOG00000018797) Eif1b (ENSRNOG00000018848) Entpd3 (ENSRNOG00000018982) Rpl14 (ENSRNOG00000019007) Snrpel1 (ENSRNOG00000031127) Ctnnb1 (ENSRNOG00000054172) Ulk4 (ENSRNOG00000019271) Trak1 (ENSRNOG00000019262) Cck (ENSRNOG00000019321) ENSRNOG00000062699 Lyzl4 (ENSRNOG00000019350) Vipr1 (ENSRNOG00000047457) ENSRNOG00000068512 Rat MODERN SPECIES 46 AABR07042323.1 (ENSRNOG00000005681) Gabra3 (ENSRNOG00000056558) Magea10 (ENSRNOG00000052773) Gabre (ENSRNOG00000061182) Magea4 (ENSRNOG00000068983) LOC108348053 (ENSRNOG00000030119) ENSRNOG00000066670 Tuba1c (ENSRNOG00000015544) ENSRNOG00000069761 Prrg3 (ENSRNOG00000066176) Pasd1 (ENSRNOG00000061428) RGD1308750 (ENSRNOG00000048356) RGD1561481 (ENSRNOG00000064535) Vma21 (ENSRNOG00000048606) Gpr50 (ENSRNOG00000011335) Rpsa-ps4 (ENSRNOG00000022882) #22 Hmgb3 (ENSRNOG00000011096) Tmem185a (ENSRNOG00000011047) LOC120099181 (ENSRNOG00000050915) Eola2 (ENSRNOG00000063254) Ids (ENSRNOG00000001465) LOC689600 (ENSRNOG00000064273) LOC100360413 (ENSRNOG00000051885) Aff2 (ENSRNOG00000052572) LOC689600 (ENSRNOG00000067249) Fmr1nb (ENSRNOG00000053397) Fmr1 (ENSRNOG00000057464) AABR07042418.1 (ENSRNOG00000051726) ENSRNOG00000069396 Fam9c (ENSRNOG00000069253) LOC100912196 (ENSRNOG00000062315) Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b #22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b #22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b #22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b #22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b #22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b #22 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b #22 American mink MODERN SPECIES 76 OS9 (ENSNVIG00000002785) AGAP2 (ENSNVIG00000003143) TSPAN31 (ENSNVIG00000003248) CDK4 (ENSNVIG00000003287) ENSNVIG00000003332 CYP27B1 (ENSNVIG00000003343) METTL1 (ENSNVIG00000003365) EEF1AKMT3 (ENSNVIG00000003404) EFTS (ENSNVIG00000003421) AVIL (ENSNVIG00000003479) CTDS2 (ENSNVIG00000003498) ATP23 (ENSNVIG00000003528) LRIG3 (ENSNVIG00000003547) ENSNVIG00000003587 MOT2 (ENSNVIG00000003620) ENSNVIG00000003659 #22 F19A2 (ENSNVIG00000003692) ENSNVIG00000003727 USP15 (ENSNVIG00000003758) MON2 (ENSNVIG00000003868) ENSNVIG00000004270 PPM1H (ENSNVIG00000004277) ENSNVIG00000004289 ENSNVIG00000004299 ENSNVIG00000004301 ENSNVIG00000004303 V1AR (ENSNVIG00000004306) ENSNVIG00000004314 Ferret MODERN SPECIES 233 SCN5A (ENSMPUG00000002582) SCN10A (ENSMPUG00000002519) ENSMPUG00000002516 ENSMPUG00000002510 ENSMPUG00000002507 ENSMPUG00000019021 WDR48 (ENSMPUG00000002501) GORASP1 (ENSMPUG00000002496) TTC21A (ENSMPUG00000002487) CSRNP1 (ENSMPUG00000002480) ENSMPUG00000002476 CX3CR1 (ENSMPUG00000019020) CCR8 (ENSMPUG00000019018) SLC25A38 (ENSMPUG00000002474) #21 ENSMPUG00000002467 ENSMPUG00000002463 #22 Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b #22 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b #22 Dingo MODERN SPECIES 98 PCDHB7 (ENSCAFG00020021245) PCDHB6 (ENSCAFG00020021249) PCDHB5 (ENSCAFG00020021250) ENSCAFG00020021253 ENSCAFG00020021256 ENSCAFG00020021257 ENSCAFG00020021260 PCDHB1 (ENSCAFG00020021262) PCDHAC2 (ENSCAFG00020021264) PCDHA13 (ENSCAFG00020021274) ENSCAFG00020021277 PCDHA12 (ENSCAFG00020000159) ENSCAFG00020000172 PCDHA11 (ENSCAFG00020000182) ENSCAFG00020000211 ENSCAFG00020000225 #22 PCDHA10 (ENSCAFG00020000259) ENSCAFG00020000298 ENSCAFG00020000303 ENSCAFG00020000307 ENSCAFG00020000315 ENSCAFG00020000320 ENSCAFG00020000334 ENSCAFG00020000341 PCDHA4 (ENSCAFG00020000345) ENSCAFG00020000356 PCDHA3 (ENSCAFG00020000363) ENSCAFG00020000366 PCDHA1 (ENSCAFG00020000370) ENSCAFG00020000385 ENSCAFG00020000400 Red fox MODERN SPECIES 34 EXOG (ENSVVUG00000005960) ENSVVUG00000005954 ENSVVUG00000005949 SCN5A (ENSVVUG00000005938) SCN10A (ENSVVUG00000005872) SCN11A (ENSVVUG00000005852) WDR48 (ENSVVUG00000005829) GORASP1 (ENSVVUG00000005825) TTC21A (ENSVVUG00000005803) CSRNP1 (ENSVVUG00000005798) XIRP1 (ENSVVUG00000005793) CX3CR1 (ENSVVUG00000005777) CCR8 (ENSVVUG00000005769) SLC25A38 (ENSVVUG00000005755) #21 ENSVVUG00000005748 RPSA (ENSVVUG00000005729) #22 MOBP (ENSVVUG00000005726) MYRIP (ENSVVUG00000005600) EIF1B (ENSVVUG00000005565) ENTPD3 (ENSVVUG00000005553) ENSVVUG00000005464 ZNF620 (ENSVVUG00000005458) ENSVVUG00000005456 ZNF621 (ENSVVUG00000005454) CTNNB1 (ENSVVUG00000005420) ENSVVUG00000005415 ULK4 (ENSVVUG00000005345) TRAK1 (ENSVVUG00000005298) CCK (ENSVVUG00000005286) LYZL4 (ENSVVUG00000005270) VIPR1 (ENSVVUG00000005250) Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b #22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b #22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b #22 Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b #22 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b #22 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b #22 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b #22 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b #22 Narwhal MODERN SPECIES 295 TUBB6 (ENSMMNG00015001161) IMPA2 (ENSMMNG00015001107) MPPE1 (ENSMMNG00015001054) GNAL (ENSMMNG00015000995) PIEZO2 (ENSMMNG00015000613) NAPG (ENSMMNG00015000347) APCDD1 (ENSMMNG00015000313) VAPA (ENSMMNG00015000281) ENSMMNG00015000248 RAB31 (ENSMMNG00015000217) PPP4R1 (ENSMMNG00015000106) RALBP1 (ENSMMNG00015000051) TWSG1 (ENSMMNG00015000024) ANKRD12 (ENSMMNG00015004552) ENSMMNG00015004540 ENSMMNG00015004533 #22 ENSMMNG00015004524 ENSMMNG00015004519 MTCL1 (ENSMMNG00015004489) RAB12 (ENSMMNG00015004463) PTPRM (ENSMMNG00015004419) LRRC30 (ENSMMNG00015004392) ENSMMNG00015004377 LAMA1 (ENSMMNG00015004339) ARHGAP28 (ENSMMNG00015004258) L3MBTL4 (ENSMMNG00015004217) TMEM200C (ENSMMNG00015004206) EPB41L3 (ENSMMNG00015004048) ZBTB14 (ENSMMNG00015003972) ENSMMNG00015003965 ENSMMNG00015003955 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b #22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b #22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b #22 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b #22 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 12 ENSOARG00020006355 GPX6 (ENSOARG00020006321) GPX5 (ENSOARG00020019395) SCAND3 (ENSOARG00020019345) TRIM27 (ENSOARG00020019206) ENSOARG00020019184 ENSOARG00020019045 ENSOARG00020019025 ENSOARG00020018996 ENSOARG00020018977 ENSOARG00020018951 ENSOARG00020018931 ENSOARG00020018911 ENSOARG00020018886 ENSOARG00020018869 ENSOARG00020018797 #22 ENSOARG00020018760 ENSOARG00020018741 ENSOARG00020018728 ENSOARG00020018702 OR2B3 (ENSOARG00020018680) ENSOARG00020018624 ENSOARG00020018599 ENSOARG00020018555 ENSOARG00020018533 ENSOARG00020018488 ENSOARG00020018475 ENSOARG00020018467 ENSOARG00020018453 ENSOARG00020018430 ENSOARG00020018401 Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b #22 American bison MODERN SPECIES 2981 EXOG (ENSBBBG00000020249) SCN5A (ENSBBBG00000005566) SCN10A (ENSBBBG00000020758) SCN11A (ENSBBBG00000020919) WDR48 (ENSBBBG00000020975) GORASP1 (ENSBBBG00000021030) TTC21A (ENSBBBG00000005665) CSRNP1 (ENSBBBG00000021178) ENSBBBG00000021184 ENSBBBG00000021188 CX3CR1 (ENSBBBG00000008524) ENSBBBG00000021197 ENSBBBG00000021207 SLC25A38 (ENSBBBG00000021241) #21 ENSBBBG00000021260 ENSBBBG00000007679 #22 ENSBBBG00000021315 ENSBBBG00000021333 MYRIP (ENSBBBG00000007107) EIF1B (ENSBBBG00000021518) ENTPD3 (ENSBBBG00000021580) RPL14 (ENSBBBG00000021617) ENSBBBG00000021630 ENSBBBG00000008405 CTNNB1 (ENSBBBG00000022253) ULK4 (ENSBBBG00000007239) TRAK1 (ENSBBBG00000022590) CCK (ENSBBBG00000022612) LYZL4 (ENSBBBG00000022628) VIPR1 (ENSBBBG00000022728) SEC22C (ENSBBBG00000022775) Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b #22 Bos_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b.b #22 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 20 OR5D14 (ENSBIXG00005026152) ENSBIXG00005026134 ENSBIXG00005026116 ENSBIXG00005026103 RHOU (ENSBIXG00005026085) ENSBIXG00005026045 CCSAP (ENSBIXG00005007404) ENSBIXG00005025928 #22 ACTA1 (ENSBIXG00005025901) NUP133 (ENSBIXG00005004411) ABCB10 (ENSBIXG00005025809) ENSBIXG00005004402 URB2 (ENSBIXG00005025710) ENSBIXG00005025674 ENSBIXG00005025667 GALNT2 (ENSBIXG00005025642) ENSBIXG00005025591 ENSBIXG00005025584 PGBD5 (ENSBIXG00005025562) ENSBIXG00005025487 FMN2 (ENSBIXG00005006011) ENSBIXG00005025286 ENSBIXG00005025280 Sauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b #22 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b #22 Episquamata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b #22 Toxicofera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b #22 Lizard MODERN SPECIES 4 ENSACAG00000036556 ENSACAG00000044332 ENSACAG00000036682 ENSACAG00000045211 PCDH18 (ENSACAG00000013347) ENSACAG00000036169 ENSACAG00000042372 SLC7A11 (ENSACAG00000001704) NOCT (ENSACAG00000001961) ELF2 (ENSACAG00000001979) ENSACAG00000036630 NAA15 (ENSACAG00000002092) RAB33B (ENSACAG00000002227) ENSACAG00000028951 SETD7 (ENSACAG00000002249) ENSACAG00000041429 #22 ENSACAG00000043280 MAML3 (ENSACAG00000002268) SCOC (ENSACAG00000040074) CLGN (ENSACAG00000002293) MGAT4D (ENSACAG00000002396) ENSACAG00000043952 ENSACAG00000036219 ELMOD2 (ENSACAG00000037737) TBC1D9 (ENSACAG00000002504) RNF150 (ENSACAG00000002648) ZNF330 (ENSACAG00000002683) ENSACAG00000042416 ENSACAG00000034681 INPP4B (ENSACAG00000002735) USP38 (ENSACAG00000002889) Elapidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b #22 Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b #22 Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b #22 Mainland tiger snake MODERN SPECIES 111 ENSNSUG00000005494 MYC (ENSNSUG00000005493) ENSNSUG00000005491 #22 ENSNSUG00000005489 TRIB1 (ENSNSUG00000005488) ENSNSUG00000005487 WASHC5 (ENSNSUG00000003752) SQLE (ENSNSUG00000003716) BBS10 (ENSNSUG00000003708) MTSS1 (ENSNSUG00000003187) NDUFB9 (ENSNSUG00000003184) TATDN1 (ENSNSUG00000003174) RNF139 (ENSNSUG00000003171) ENSNSUG00000003168 FER1L6 (ENSNSUG00000003164) FAM91A1 (ENSNSUG00000001952) KLHL38 (ENSNSUG00000001942) FBXO32 (ENSNSUG00000001935) Archelosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b #22 Archosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b #22 Aves ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b #22 Neognathae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b #22 Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b #22 Passeriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b #22 Passeriformes_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000159820 ENSGT00390000000805 ENSGT00940000157001 ENSGT01020000230359.C.a.e ENSGT01020000230359.C.a.f ENSGT01020000230359.B.d ENSGT01090000260052.a.b ENSGT00940000154044.a.a ENSGT01030000234667.a.a.b ENSGT00390000010260 ENSGT00950000182942.a.a ENSGT01020000230359.C.b ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B.c ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.u.b #22 ENSGT00950000183099.v #22 ENSGT01050000244942.b.a.b ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00390000005489.b ENSGT00940000160239 ENSGT00390000003571 ENSGT00940000155697.A ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00390000001296 ENSGT00940000156463 ENSGT00390000012690 ENSGT01050000244939.b ENSGT00940000155721 ENSGT00950000183130.C Flycatcher MODERN SPECIES 11 CDV3 (ENSFALG00000025337) TOPBP1 (ENSFALG00000012393) ENSFALG00000014351 ENSFALG00000014349 ENSFALG00000012390 XCR1 (ENSFALG00000014345) ENSFALG00000025318 ENSFALG00000026788 CCR9 (ENSFALG00000014342) TMPPE (ENSFALG00000014337) ENSFALG00000012384 CCR4 (ENSFALG00000014333) ENSFALG00000014329 ENSFALG00000012372 SLC25A38 (ENSFALG00000012376) #21 ENSFALG00000012358 #22 ENSFALG00000012327 ENSFALG00000025823 ENSFALG00000012308 ENSFALG00000012297 EIF1B (ENSFALG00000012290) CCK (ENSFALG00000012283) TRAK1 (ENSFALG00000012274) ULK4 (ENSFALG00000012261) CTNNB1 (ENSFALG00000012237) KIAA1143 (ENSFALG00000024044) KIF15 (ENSFALG00000007867) TMEM42 (ENSFALG00000024551) TGM4 (ENSFALG00000002575) ZDHHC3 (ENSFALG00000002595) EXOSC7 (ENSFALG00000002600) Passeriformes_g ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b #22 Passeroidea ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000159820 ENSGT00390000000805 ENSGT00940000157001 ENSGT01020000230359.C.a.e ENSGT01020000230359.C.a.f ENSGT01020000230359.B.d ENSGT01090000260052.a.b ENSGT00940000154044.a.a ENSGT01030000234667.a.a.b ENSGT00390000010260 ENSGT00950000182942.a.a ENSGT01020000230359.C.b ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B.c ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.u.b #22 ENSGT00950000183099.v #22 ENSGT01050000244942.b.a.b ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00390000005489.b ENSGT00940000160239 ENSGT00390000003571 ENSGT00940000155697.A ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00390000001296 ENSGT00940000156463 ENSGT00390000012690 ENSGT01050000244939.b ENSGT00940000155721 ENSGT00950000183130.C Zebra finch MODERN SPECIES 12 TMEM108 (ENSTGUG00000004466) BFSP2 (ENSTGUG00000004473) CDV3 (ENSTGUG00000024740) TOPBP1 (ENSTGUG00000004502) ENSTGUG00000026299 ENSTGUG00000020581 XCR1 (ENSTGUG00000004516) FYCO1 (ENSTGUG00000004520) CCR9 (ENSTGUG00000004525) GLB1 (ENSTGUG00000004528) TMPPE (ENSTGUG00000029066) CCR4 (ENSTGUG00000018201) CX3CR1 (ENSTGUG00000018365) ENSTGUG00000004574 SLC25A38 (ENSTGUG00000004577) #21 RPSA (ENSTGUG00000004584) #22 MYRIP (ENSTGUG00000004660) TMC2 (ENSTGUG00000004612) ENSTGUG00000021668 EIF1B (ENSTGUG00000023395) CCK (ENSTGUG00000004682) TRAK1 (ENSTGUG00000004685) ULK4 (ENSTGUG00000004756) CTNNB1 (ENSTGUG00000004786) KIAA1143 (ENSTGUG00000028446) KIF15 (ENSTGUG00000004823) TGM4 (ENSTGUG00000004894) ZDHHC3 (ENSTGUG00000004952) EXOSC7 (ENSTGUG00000026879) CLEC3B (ENSTGUG00000022367) CDCP1 (ENSTGUG00000004994) Galloanserae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.u.b #22 Anatidae ANCESTRAL SPECIES 92 ENSGT00390000017432 ENSGT00950000183170.b.a ENSGT00940000153875.c ENSGT01100000263710 ENSGT00940000155574.C ENSGT00940000156148 ENSGT00940000153845.a.b ENSGT00390000009163 ENSGT00940000153814.a ENSGT00390000010260 ENSGT00950000182942.a.a ENSGT01020000230359.C.b ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B.c ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.u.b #22 ENSGT01050000244942.b.a.b ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00390000005489.b ENSGT00940000160239 ENSGT00390000003571 Duck MODERN SPECIES 10 ENSAPLG00000021686 GFOD1 (ENSAPLG00000012346) ENSAPLG00000021178 ENSAPLG00000021403 ENSAPLG00000026132 ENSAPLG00000031106 EDN1 (ENSAPLG00000031009) HIVEP1 (ENSAPLG00000012713) ADTRP (ENSAPLG00000012899) ENSAPLG00000029535 ENSAPLG00000025772 CCK (ENSAPLG00000001188) CX3CR1 (ENSAPLG00000001393) ENSAPLG00000020928 SLC25A38 (ENSAPLG00000015901) #21 ENSAPLG00000015724 #22 ENSAPLG00000016788 MYRIP (ENSAPLG00000016281) ENSAPLG00000023148 EIF1B (ENSAPLG00000001143) CCR4 (ENSAPLG00000001205) GLB1 (ENSAPLG00000001019) TMPPE (ENSAPLG00000001209) CRTAP (ENSAPLG00000001236) SUSD5 (ENSAPLG00000001335) ENSAPLG00000020944 FBXL2 (ENSAPLG00000001346) UBP1 (ENSAPLG00000001472) CLASP2 (ENSAPLG00000001903) ENSAPLG00000017452 TPPP (ENSAPLG00000009901) Amniota ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.v #22 Sauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00960000192712 ENSGT00940000160796 ENSGT00940000163083 ENSGT00940000155574.C ENSGT00940000156148 ENSGT00940000153845.a.b ENSGT00390000009163 ENSGT00940000153814.a ENSGT00390000010260 ENSGT00950000182942.a.a ENSGT01020000230359.C.b ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00940000164532 ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.v #22 ENSGT01050000244942.b.a.b ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00390000005489.b ENSGT00940000160239 ENSGT00390000003571 ENSGT00940000155697.A ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00390000001296 ENSGT00940000156463 ENSGT00390000012690 ENSGT01050000244939.b ENSGT00940000155721 ENSGT00950000183130.C ENSGT00950000183186.B.b Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000159476 ENSGT00950000183092.b.b ENSGT00960000192712 ENSGT00940000160796 ENSGT00940000163083 ENSGT00940000155574.C ENSGT00940000156148 ENSGT00940000153845.a.b ENSGT00390000009163 ENSGT00940000153814.a ENSGT00390000010260 ENSGT00950000182942.a.a ENSGT01020000230359.C.b ENSGT01020000230359.A ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.v #22 ENSGT01050000244942.b.a.b ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00390000005489.b ENSGT00940000160239 ENSGT00390000003571 ENSGT00940000155697.A ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00390000001296 ENSGT00940000156463 ENSGT00390000012690 ENSGT01050000244939.b ENSGT00940000155721 ENSGT00950000183130.C ENSGT00950000183186.B.b tuatara MODERN SPECIES 1865 ENSSPUG00000018837 SLC25A38 (ENSSPUG00000018840) #21 ENSSPUG00000018850 #22 TMC2 (ENSSPUG00000018862) Episquamata ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000153370.b ENSGT00940000159476 ENSGT00950000183092.b.b ENSGT00940000160796 ENSGT00940000163083 ENSGT00940000155574.C ENSGT00940000156148 ENSGT00940000153845.a.b ENSGT00390000009163 ENSGT00940000153814.a ENSGT00390000010260 ENSGT00950000182942.a.a ENSGT01020000230359.C.b ENSGT01020000230359.A ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.v #22 ENSGT01050000244942.b.a.b ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00390000005489.b ENSGT00940000160239 ENSGT00390000003571 ENSGT00940000155697.A ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000155471.d.g.b ENSGT00390000001296 ENSGT00940000156463 ENSGT00390000012690 ENSGT01050000244939.b ENSGT00940000155721 ENSGT00950000183130.C Toxicofera ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000153370.b ENSGT00940000159476 ENSGT00950000183092.b.b ENSGT00940000160796 ENSGT00940000163083 ENSGT00940000155574.C ENSGT00940000156148 ENSGT00940000153845.a.b ENSGT00990000210357 ENSGT00940000153814.a ENSGT00950000182942.a.a ENSGT01020000230359.C.b ENSGT01020000230359.A ENSGT00940000164532 ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.v #22 ENSGT01050000244942.b.a.b ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00390000005489.b ENSGT00940000160239 ENSGT00390000003571 ENSGT00940000155697.A ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000155471.d.g.b ENSGT00390000001296 ENSGT00940000156463 ENSGT00390000012690 ENSGT00940000155721 ENSGT00950000183130.C ENSGT00950000183186.B.b Elapidae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000155331.A ENSGT00940000159827 ENSGT00940000156503 ENSGT00730000111139.q ENSGT00530000063564.a ENSGT00800000124177 ENSGT00950000183092.b.b ENSGT00940000163083 ENSGT00940000155574.C.v.b ENSGT01100000263710 ENSGT00940000155574.C.v.a ENSGT00940000156148 ENSGT00940000153814.a ENSGT00950000182942.a.a ENSGT01020000230359.C.b ENSGT00950000183099.v #22 ENSGT01050000244942.b.a.b ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT00390000003571 ENSGT00940000155697.A ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155471.d.g.b ENSGT00390000001296 ENSGT00390000012690 ENSGT00940000155721 ENSGT00950000183130.C ENSGT00950000183186.B.b ENSGT00390000010209 ENSGT00390000009719 ENSGT00390000015114 Indian cobra MODERN SPECIES 337 ENSNNAG00000014819 ITGA9 (ENSNNAG00000014539) GOLGA4 (ENSNNAG00000014484) LRRFIP2 (ENSNNAG00000014146) ENSNNAG00000014092 ENSNNAG00000014062 STAC (ENSNNAG00000014003) ENSNNAG00000013988 ENSNNAG00000013837 ENSNNAG00000013814 CLASP2 (ENSNNAG00000011260) UBP1 (ENSNNAG00000011011) CRTAP (ENSNNAG00000010978) GLB1 (ENSNNAG00000010897) CCR4 (ENSNNAG00000010865) ENSNNAG00000010810 #22 ENSNNAG00000010776 ENSNNAG00000010756 EIF1B (ENSNNAG00000010727) ENSNNAG00000010695 CCK (ENSNNAG00000010680) TRAK1 (ENSNNAG00000009926) ENSNNAG00000009877 ENSNNAG00000009783 KIAA1143 (ENSNNAG00000009751) ENSNNAG00000009720 ZDHHC3 (ENSNNAG00000009686) EXOSC7 (ENSNNAG00000009663) CLEC3B (ENSNNAG00000009614) CDCP1 (ENSNNAG00000009191) TMEM158 (ENSNNAG00000009153) Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES 84 ENSGT01100000263710 ENSGT00940000155574.C.v.a ENSGT00940000156148 ENSGT00940000153814.a ENSGT00950000182942.a.a ENSGT00950000183099.v #22 ENSGT01050000244942.b.a.b ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00390000003571 ENSGT00940000155697.A ENSGT00940000155471.d.g.b ENSGT00390000001296 ENSGT00390000012690 ENSGT00940000155721 ENSGT00950000183130.C ENSGT00950000183186.B.b ENSGT00390000010209 ENSGT00390000009719 ENSGT00390000015114 ENSGT00940000159019 ENSGT00940000155579 Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES 79 ENSGT01100000263710 ENSGT00940000155574.C.v.a ENSGT00940000156148 ENSGT00940000153814.a ENSGT00950000182942.a.a ENSGT00950000183099.v #22 ENSGT01050000244942.b.a.b ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00390000003571 ENSGT00940000155697.A ENSGT00940000155471.d.g.b ENSGT00390000001296 ENSGT00390000012690 ENSGT00940000155721 ENSGT00950000183130.C ENSGT00950000183186.B.b ENSGT00390000010209 ENSGT00390000009719 ENSGT00390000015114 ENSGT00940000159019 ENSGT00940000155579 Eastern brown snake MODERN SPECIES 1025 ENSPTXG00000016116 #22 Mainland tiger snake DUPLICATION Mainland tiger snake MODERN SPECIES 102 ENSNSUG00000006417 UBP1 (ENSNSUG00000006421) CRTAP (ENSNSUG00000006671) ENSNSUG00000006673 GLB1 (ENSNSUG00000006674) ENSNSUG00000006676 #22 ENSNSUG00000006683 ENSNSUG00000006684 CCK (ENSNSUG00000006685) TRAK1 (ENSNSUG00000006690) ENSNSUG00000006691 ENSNSUG00000006692 KIAA1143 (ENSNSUG00000006693) TMEM42 (ENSNSUG00000006694) ZDHHC3 (ENSNSUG00000006695) EXOSC7 (ENSNSUG00000006697) ENSNSUG00000006707 CLEC3B (ENSNSUG00000006708) CDCP1 (ENSNSUG00000006710) TMEM158 (ENSNSUG00000006784) ENSNSUG00000006785 Mainland tiger snake MODERN SPECIES 58 ENSNSUG00000007464 CBS (ENSNSUG00000007469) U2AF1 (ENSNSUG00000007472) CRYAA (ENSNSUG00000007474) SIK1 (ENSNSUG00000007481) HSF2BP (ENSNSUG00000007482) ENSNSUG00000007484 PDXK (ENSNSUG00000007485) AGPAT3 (ENSNSUG00000007488) ENSNSUG00000007510 TRAPPC10 (ENSNSUG00000007511) PWP2 (ENSNSUG00000007518) GATD3 (ENSNSUG00000007886) ENSNSUG00000007887 DNMT3L (ENSNSUG00000007894) ENSNSUG00000007895 #22 DIPK2B (ENSNSUG00000007910) ENSNSUG00000007952 ENSNSUG00000019302 FUNDC1 (ENSNSUG00000019303) EFHC2 (ENSNSUG00000019304) ENSNSUG00000019305 ENSNSUG00000019306 MAOA (ENSNSUG00000019311) ENSNSUG00000019313 ENSNSUG00000019315 ENSNSUG00000019316 ENSNSUG00000019317 ENSNSUG00000019318 NYX (ENSNSUG00000019319) ENSNSUG00000019320 Blue-lipped sea krait DUPLICATION Blue-lipped sea krait MODERN SPECIES 1918 ENSLLTG00000012954 #22 Blue-lipped sea krait MODERN SPECIES 7866 ENSLLTG00000004975 #22 Lizard DUPLICATION Lizard MODERN SPECIES 838 TMEM108 (ENSACAG00000004468) BFSP2 (ENSACAG00000004403) ENSACAG00000044674 CDV3 (ENSACAG00000040828) TOPBP1 (ENSACAG00000004246) ENSACAG00000004183 #22 ENSACAG00000004125 ENSACAG00000035170 ENSACAG00000028904 ENSACAG00000004434 ENSACAG00000022856 ENSACAG00000039423 CCK (ENSACAG00000004398) TRAK1 (ENSACAG00000004124) ENSACAG00000043968 ULK4 (ENSACAG00000004565) CTNNB1 (ENSACAG00000004408) ENSACAG00000037707 ENSACAG00000035688 ENSACAG00000044768 ENSACAG00000036535 Lizard MODERN SPECIES 3 TAFA3 (ENSACAG00000035727) PPM1J (ENSACAG00000017942) ENSACAG00000041408 ENSACAG00000037551 MOV10 (ENSACAG00000017938) CAPZA1 (ENSACAG00000017934) ST7L (ENSACAG00000017929) WNT2B (ENSACAG00000017925) CTTNBP2NL (ENSACAG00000042030) ENSACAG00000040196 ENSACAG00000036320 ENSACAG00000039132 DDX20 (ENSACAG00000006235) INKA2 (ENSACAG00000035327) ENSACAG00000029082 ENSACAG00000006188 #22 ENSACAG00000028340 ADORA3 (ENSACAG00000006155) ATP5PB (ENSACAG00000036967) WDR77 (ENSACAG00000037494) C6orf132 (ENSACAG00000039371) GUCA1ANB (ENSACAG00000006037) GUCA1A (ENSACAG00000006019) GUCA1B (ENSACAG00000037847) ENSACAG00000005931 C1orf74 (ENSACAG00000005927) ENSACAG00000005896 HSD11B1 (ENSACAG00000005823) G0S2 (ENSACAG00000005822) ENSACAG00000045440 LAMB3 (ENSACAG00000005756) Lizard MODERN SPECIES 4 PACSIN2 (ENSACAG00000015928) TTLL1 (ENSACAG00000015904) ENSACAG00000039930 MCAT (ENSACAG00000015897) TSPO (ENSACAG00000015880) ENSACAG00000034698 SCUBE1 (ENSACAG00000015808) MPPED1 (ENSACAG00000029062) ENSACAG00000015689 SULT4A1 (ENSACAG00000016231) PNPLA3 (ENSACAG00000015959) SAMM50 (ENSACAG00000015889) PARVB (ENSACAG00000027642) PARVG (ENSACAG00000015831) SHISAL1 (ENSACAG00000015829) ENSACAG00000041942 #22 ENSACAG00000034857 PRR5 (ENSACAG00000026925) ARHGAP8 (ENSACAG00000015730) PHF21B (ENSACAG00000015718) ENSACAG00000041865 KIAA0930 (ENSACAG00000015647) ENSACAG00000042236 NUP50 (ENSACAG00000015683) UPK3A (ENSACAG00000011766) FAM118A (ENSACAG00000014996) SMC1B (ENSACAG00000014741) RIBC2 (ENSACAG00000014672) ENSACAG00000039128 FBLN1 (ENSACAG00000014456) ENSACAG00000014385 Laterata ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00940000153370.b ENSGT00940000159476 ENSGT00950000183092.b.b ENSGT00940000160796 ENSGT00940000163083 ENSGT00940000155574.C ENSGT00940000156148 ENSGT00940000153845.a.b ENSGT00390000009163 ENSGT00940000153814.a ENSGT00390000010260 ENSGT00950000182942.a.a ENSGT01020000230359.C.b ENSGT01020000230359.A ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.v #22 ENSGT01050000244942.b.a.b Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 198 CRTAP (ENSSMRG00000001192) CDK10 (ENSSMRG00000001172) GLB1 (ENSSMRG00000001163) CCR4 (ENSSMRG00000001152) CX3CR1 (ENSSMRG00000001149) SLC25A38 (ENSSMRG00000001135) #21 ENSSMRG00000001121 #22 TMC2 (ENSSMRG00000001024) Common wall lizard MODERN SPECIES 3 SEPTIN7 (ENSPMRG00000015182) HERPUD2 (ENSPMRG00000015168) TBX20 (ENSPMRG00000015160) ENSPMRG00000015149 NPSR1 (ENSPMRG00000015136) ENSPMRG00000015129 ENSPMRG00000015126 BMPER (ENSPMRG00000015120) BBS9 (ENSPMRG00000015093) NT5C3A (ENSPMRG00000015066) FKBP9 (ENSPMRG00000015053) ENSPMRG00000015047 ENSPMRG00000015046 CX3CR1 (ENSPMRG00000015041) ENSPMRG00000015026 #21 ENSPMRG00000015020 #22 ENSPMRG00000019277 #21 ENSPMRG00000019270 TMPPE (ENSPMRG00000019263) GLB1 (ENSPMRG00000019238) CRTAP (ENSPMRG00000019235) SUSD5 (ENSPMRG00000019231) FBXL2 (ENSPMRG00000019221) UBP1 (ENSPMRG00000019202) CLASP2 (ENSPMRG00000018710) ENSPMRG00000018622 ENSPMRG00000018608 ENSPMRG00000018600 ARPP21 (ENSPMRG00000018567) STAC (ENSPMRG00000018550) ENSPMRG00000018544 Archelosauria ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00960000192712 ENSGT00940000160796 ENSGT00940000163083 ENSGT00940000155574.C ENSGT00940000156148 ENSGT00940000153845.a.b ENSGT00390000009163 ENSGT00940000153814.a ENSGT00390000010260 ENSGT00950000182942.a.a ENSGT01020000230359.C.b ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B.c ENSGT00940000164532 ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.v #22 ENSGT01050000244942.b.a.b ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00390000005489.b ENSGT00940000160239 ENSGT00390000003571 ENSGT00940000155697.A ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00390000001296 ENSGT00940000156463 ENSGT00940000164896 ENSGT00390000012690 ENSGT01050000244939.b ENSGT00940000155721 ENSGT00950000183130.C Archosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00960000192712 ENSGT00940000160796 ENSGT00940000163083 ENSGT00940000155574.C ENSGT00940000156148 ENSGT00940000153845.a.b ENSGT00390000009163 ENSGT00940000153814.a ENSGT00390000010260 ENSGT00950000182942.a.a ENSGT01020000230359.C.b ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B.c ENSGT00940000164532 ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.v #22 ENSGT01050000244942.b.a.b ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00390000005489.b ENSGT00940000160239 ENSGT00390000003571 ENSGT00940000155697.A ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00390000001296 ENSGT00940000156463 ENSGT00390000012690 ENSGT01050000244939.b ENSGT00940000155721 ENSGT00950000183130.C ENSGT00950000183186.B.b Aves ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000159476 ENSGT00950000183092.b.b ENSGT00940000160796 ENSGT00940000163083 ENSGT00940000155574.C ENSGT00940000156148 ENSGT00940000153845.a.b ENSGT00390000009163 ENSGT00940000153814.a ENSGT00390000010260 ENSGT00950000182942.a.a ENSGT01020000230359.C.b ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B.c ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.v #22 ENSGT01050000244942.b.a.b ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00390000005489.b ENSGT00940000160239 ENSGT00390000003571 ENSGT00940000155697.A ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00390000001296 ENSGT00940000156463 ENSGT00390000012690 ENSGT01050000244939.b ENSGT00940000155721 ENSGT00950000183130.C ENSGT00950000183186.B.b African ostrich MODERN SPECIES 1064 CDCP1 (ENSSCUG00000014076) CLEC3B (ENSSCUG00000014072) EXOSC7 (ENSSCUG00000014069) ZDHHC3 (ENSSCUG00000014066) TGM4 (ENSSCUG00000014056) KIF15 (ENSSCUG00000014019) KIAA1143 (ENSSCUG00000013993) CTNNB1 (ENSSCUG00000013988) ULK4 (ENSSCUG00000013981) TRAK1 (ENSSCUG00000013975) CCK (ENSSCUG00000013967) EIF1B (ENSSCUG00000013965) ENSSCUG00000013962 MYRIP (ENSSCUG00000013953) TMC2 (ENSSCUG00000013948) RPSA (ENSSCUG00000013942) #22 SLC25A38 (ENSSCUG00000013939) #21 Neognathae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183092.b.b ENSGT00940000160796 ENSGT00940000163083 ENSGT00940000177252 ENSGT00940000155574.C ENSGT00940000156148 ENSGT00940000153845.a.b ENSGT00390000009163 ENSGT00940000153814.a ENSGT00390000010260 ENSGT00950000182942.a.a ENSGT01020000230359.C.b ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B.c ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.v #22 ENSGT01050000244942.b.a.b ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00390000005489.b ENSGT00940000160239 ENSGT00390000003571 ENSGT00940000155697.A ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00390000001296 ENSGT00940000156463 ENSGT00390000012690 ENSGT01050000244939.b ENSGT00940000155721 ENSGT00950000183130.C ENSGT00950000183186.B.b Galloanserae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000159476 ENSGT00950000183092.b.b ENSGT00940000160796 ENSGT00940000163083 ENSGT00940000155574.C ENSGT00940000156148 ENSGT00940000153845.a.b ENSGT00390000009163 ENSGT00940000153814.a ENSGT00390000010260 ENSGT00950000182942.a.a ENSGT01020000230359.C.b ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B.c ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.v #22 ENSGT01050000244942.b.a.b ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00390000005489.b ENSGT00940000160239 ENSGT00390000003571 ENSGT00940000155697.A ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00390000001296 ENSGT00940000156463 ENSGT00390000012690 ENSGT01050000244939.b ENSGT00940000155721 ENSGT00950000183130.C ENSGT00950000183186.B.b Phasianidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000159476 ENSGT00950000183092.b.b ENSGT00940000160796 ENSGT00940000163083 ENSGT00940000155574.C ENSGT00940000156148 ENSGT00940000153845.a.b ENSGT00390000009163 ENSGT00940000153814.a ENSGT00390000010260 ENSGT00950000182942.a.a ENSGT01020000230359.C.b ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B.c ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.v #22 ENSGT01050000244942.b.a.b ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00390000005489.b ENSGT00940000160239 ENSGT00390000003571 ENSGT00940000155697.A ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00390000001296 ENSGT00940000156463 ENSGT00390000012690 ENSGT01050000244939.b ENSGT00940000155721 ENSGT00950000183130.C ENSGT00950000183186.B.b Japanese quail MODERN SPECIES 11 DCLK3 (ENSCJPG00005014771) STAC (ENSCJPG00005014768) ARPP21 (ENSCJPG00005014766) ENSCJPG00005014758 CLASP2 (ENSCJPG00005005763) UBP1 (ENSCJPG00005005738) FBXL2 (ENSCJPG00005005598) SUSD5 (ENSCJPG00005005569) CRTAP (ENSCJPG00005005564) TMPPE (ENSCJPG00005005561) GLB1 (ENSCJPG00005004538) CCR4 (ENSCJPG00005004537) CX3CR1 (ENSCJPG00005004535) ENSCJPG00005004532 SLC25A38 (ENSCJPG00005004530) #21 ENSCJPG00005004526 #22 TMC2 (ENSCJPG00005004506) ENSCJPG00005004481 ENSCJPG00005004480 ENSCJPG00005004479 EIF1B (ENSCJPG00005004478) CCK (ENSCJPG00005004461) TRAK1 (ENSCJPG00005004453) ULK4 (ENSCJPG00005004437) CTNNB1 (ENSCJPG00005004427) KIAA1143 (ENSCJPG00005004416) KIF15 (ENSCJPG00005004382) TMEM42 (ENSCJPG00005004379) TGM4 (ENSCJPG00005004373) ZDHHC3 (ENSCJPG00005004367) EXOSC7 (ENSCJPG00005004358) Phasianidae_b ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000159476 ENSGT00950000183092.b.b ENSGT00940000160796 ENSGT00940000163083 ENSGT00940000155574.C ENSGT00940000156148 ENSGT00940000153845.a.b ENSGT00390000009163 ENSGT00940000153814.a ENSGT00390000010260 ENSGT00950000182942.a.a ENSGT01020000230359.C.b ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B.c ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.v #22 ENSGT01050000244942.b.a.b ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00390000005489.b ENSGT00940000160239 ENSGT00390000003571 ENSGT00940000155697.A ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00390000001296 ENSGT00940000156463 ENSGT00390000012690 ENSGT01050000244939.b ENSGT00940000155721 ENSGT00950000183130.C ENSGT00950000183186.B.b Turkey MODERN SPECIES 26 TRANK1 (ENSMGAG00000011934) DCLK3 (ENSMGAG00000011929) STAC (ENSMGAG00000011923) ARPP21 (ENSMGAG00000011901) ENSMGAG00000011875 CLASP2 (ENSMGAG00000011838) UBP1 (ENSMGAG00000011814) FBXL2 (ENSMGAG00000011795) SUSD5 (ENSMGAG00000011793) CRTAP (ENSMGAG00000011787) GLB1 (ENSMGAG00000011775) CCR4 (ENSMGAG00000016137) ENSMGAG00000016133 ENSMGAG00000011774 SLC25A38 (ENSMGAG00000011769) #21 ENSMGAG00000011754 #22 ENSMGAG00000011747 MYRIP (ENSMGAG00000011737) ENSMGAG00000011736 ENSMGAG00000016130 EIF1B (ENSMGAG00000011733) CCK (ENSMGAG00000022911) TRAK1 (ENSMGAG00000011719) ULK4 (ENSMGAG00000011715) CTNNB1 (ENSMGAG00000011705) KIAA1143 (ENSMGAG00000011704) KIF15 (ENSMGAG00000011676) TGM4 (ENSMGAG00000011669) ZDHHC3 (ENSMGAG00000011663) EXOSC7 (ENSMGAG00000011656) CLEC3B (ENSMGAG00000011653) Chicken MODERN SPECIES 11 STAC (ENSGALG00010018391) ARPP21 (ENSGALG00010018378) ENSGALG00010019691 PDCD6IP (ENSGALG00010018338) CLASP2 (ENSGALG00010018315) UBP1 (ENSGALG00010018188) FBXL2 (ENSGALG00010018157) SUSD5 (ENSGALG00010017100) CRTAP (ENSGALG00010017089) TMPPE (ENSGALG00010017063) GLB1 (ENSGALG00010017045) CCR4 (ENSGALG00010017022) CX3CR1 (ENSGALG00010017004) CCR8 (ENSGALG00010016948) SLC25A38 (ENSGALG00010016934) #21 RPSAP58 (ENSGALG00010016040) #22 TMC2 (ENSGALG00010015934) MYRIP (ENSGALG00010015919) ENSGALG00010015863 EIF1B (ENSGALG00010016526) CCK (ENSGALG00010016489) TRAK1 (ENSGALG00010016410) ULK4 (ENSGALG00010016286) CTNNB1 (ENSGALG00010016258) KIAA1143 (ENSGALG00010016622) KIF15 (ENSGALG00010020101) TMEM42 (ENSGALG00010016518) TGM4 (ENSGALG00010016030) ZDHHC3 (ENSGALG00010016015) EXOSC7 (ENSGALG00010015980) CLEC3B (ENSGALG00010020094) Anatidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.v #22 Pink-footed goose MODERN SPECIES 514 TMC2 (ENSABRG00000021510) ENSABRG00000021514 #22 Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000010260 ENSGT00950000182942.a.a ENSGT01020000230359.C.b ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B.c ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.v #22 ENSGT01050000244942.b.a.b ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00390000005489.b ENSGT00940000160239 ENSGT00390000003571 ENSGT00940000155697.A ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00390000001296 ENSGT00940000156463 ENSGT00390000012690 ENSGT01050000244939.b ENSGT00940000155721 ENSGT00950000183130.C ENSGT00950000183186.B.b Passeriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000159820 ENSGT00390000000805 ENSGT00940000157001 ENSGT01020000230359.C.a.e ENSGT01020000230359.C.a.f ENSGT01020000230359.B.d ENSGT01090000260052.a.b ENSGT00940000154044.a.a ENSGT01030000234667.a.a.b ENSGT00390000010260 ENSGT00950000182942.a.a ENSGT01020000230359.C.b ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B.c ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.v #22 ENSGT01050000244942.b.a.b ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00390000005489.b ENSGT00940000160239 ENSGT00390000003571 ENSGT00940000155697.A ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00390000001296 ENSGT00940000156463 ENSGT00390000012690 ENSGT01050000244939.b ENSGT00940000155721 ENSGT00950000183130.C ENSGT00950000183186.B.b Great tit MODERN SPECIES 11 UBA5 (ENSPMJG00000010091) NPHP3 (ENSPMJG00000010130) TMEM108 (ENSPMJG00000010176) BFSP2 (ENSPMJG00000010177) 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ENSGT00940000155697.A ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00390000001296 ENSGT00940000156463 ENSGT00390000012690 ENSGT01050000244939.b ENSGT00940000155721 ENSGT00950000183130.C ENSGT00950000183186.B.b Passeroidea ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000000805 ENSGT00940000157001 ENSGT01020000230359.C.a.e ENSGT01020000230359.C.a.f ENSGT01020000230359.B.d ENSGT01090000260052.a.b ENSGT00940000154044.a.a ENSGT01030000234667.a.a.b ENSGT00390000010260 ENSGT00950000182942.a.a ENSGT01020000230359.C.b ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B.c ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.u.b #22 ENSGT00950000183099.v #22 ENSGT01050000244942.b.a.b ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00390000005489.b ENSGT00940000160239 ENSGT00390000003571 ENSGT00940000155697.A ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00390000001296 ENSGT00940000156463 ENSGT00390000012690 ENSGT01050000244939.b ENSGT00940000155721 ENSGT00950000183130.C ENSGT00950000183186.B.b Common canary MODERN SPECIES 5 TMEM108 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ENSGT00390000010260 ENSGT00950000182942.a.a ENSGT01020000230359.C.b ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.u.a #22 ENSGT00940000164532 ENSGT00950000183099.u.b.a.a.a.a #22 ENSGT01050000244942.b.a.b ENSGT00950000183099.v #22 ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT00390000003571 ENSGT00940000155697.A ENSGT00940000156541 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00390000001296 ENSGT00940000156463 ENSGT00390000012690 ENSGT01050000244939.b ENSGT00940000155721 ENSGT00950000183130.C ENSGT00950000183186.B.b ENSGT00390000010209 ENSGT00390000009719 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.v #22 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.v #22 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.v #22 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.v #22 Common wonbat DUPLICATION Common wonbat MODERN SPECIES 426 ENSVURG00010023380 ENSVURG00010023378 ENSVURG00010023377 ENSVURG00010023374 ENSVURG00010023373 #22 ENSVURG00010023372 ENSVURG00010023368 ENSVURG00010023367 ENSVURG00010023359 ENSVURG00010023353 MED23 (ENSVURG00010023338) ARG1 (ENSVURG00010023332) ENSVURG00010023329 AKAP7 (ENSVURG00010023327) EPB41L2 (ENSVURG00010023305) TMEM200A (ENSVURG00010023294) SAMD3 (ENSVURG00010023291) L3MBTL3 (ENSVURG00010023285) ARHGAP18 (ENSVURG00010023275) LAMA2 (ENSVURG00010023248) Common wonbat MODERN SPECIES 1124 ENSVURG00010023670 ENSVURG00010023671 ENSVURG00010023672 ENSVURG00010023673 ENSVURG00010023675 ENSVURG00010023676 #22 ENSVURG00010023678 ENSVURG00010023681 ENSVURG00010023682 ENSVURG00010023697 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.v #22 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.v #22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.v #22 Armadillo MODERN SPECIES 4628 ROR1 (ENSDNOG00000033892) UBE2U (ENSDNOG00000042797) ENSDNOG00000044951 #22 CACHD1 (ENSDNOG00000012097) RAVER2 (ENSDNOG00000012130) JAK1 (ENSDNOG00000012151) ENSDNOG00000006630 DNAJC6 (ENSDNOG00000004371) LEPROT (ENSDNOG00000024822) LEPR (ENSDNOG00000004616) ENSDNOG00000044101 ENSDNOG00000033832 PDE4B (ENSDNOG00000034108) SGIP1 (ENSDNOG00000015078) DYNLT5 (ENSDNOG00000039350) INSL5 (ENSDNOG00000045210) DNAI4 (ENSDNOG00000015107) ENSDNOG00000013550 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.v #22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.v #22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.v #22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.v #22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.v #22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.v #22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.v #22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.v #22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.v #22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.v #22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.v #22 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 16 ENSCGRG00001022856 Nup62cl (ENSCGRG00001019365) Rbm41 (ENSCGRG00001012295) Morc4 (ENSCGRG00001013404) Cldn2 (ENSCGRG00001004501) Ripply1 (ENSCGRG00001015609) Tbc1d8b (ENSCGRG00001012417) Rnf128 (ENSCGRG00001017934) Radx (ENSCGRG00001005170) Pwwp3b (ENSCGRG00001011900) 4933428M09Rik (ENSCGRG00001002804) Serpina7 (ENSCGRG00001010792) ENSCGRG00001007752 Il1rapl2 (ENSCGRG00001005612) Tex13a (ENSCGRG00001019415) ENSCGRG00001022478 #22 ENSCGRG00001002989 ENSCGRG00001013669 ENSCGRG00001008812 Fam199x (ENSCGRG00001017003) Slc25a53 (ENSCGRG00001021648) Zcchc18 (ENSCGRG00001009301) ENSCGRG00001009656 ENSCGRG00001011108 Rab9b (ENSCGRG00001001220) Plp1 (ENSCGRG00001018498) Glra4 (ENSCGRG00001014581) ENSCGRG00001010901 Tceal1 (ENSCGRG00001010984) Bex3 (ENSCGRG00001004282) Tceal9 (ENSCGRG00001005062) Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.v #22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.v #22 Bushbaby MODERN SPECIES 117 ENSOGAG00000015488 ENSOGAG00000015479 SESN1 (ENSOGAG00000015235) ARMC2 (ENSOGAG00000010324) ENSOGAG00000027196 ENSOGAG00000004119 SNX3 (ENSOGAG00000012282) NR2E1 (ENSOGAG00000011992) OSTM1 (ENSOGAG00000015357) SEC63 (ENSOGAG00000015346) SCML4 (ENSOGAG00000006345) SOBP (ENSOGAG00000006342) PDSS2 (ENSOGAG00000006339) BEND3 (ENSOGAG00000027957) MTRES1 (ENSOGAG00000008839) ENSOGAG00000024102 #22 QRSL1 (ENSOGAG00000012707) RTN4IP1 (ENSOGAG00000012703) ENSOGAG00000012697 ENSOGAG00000032847 ATG5 (ENSOGAG00000004787) PRDM1 (ENSOGAG00000014036) PREP (ENSOGAG00000015233) POPDC3 (ENSOGAG00000011048) BVES (ENSOGAG00000011044) ENSOGAG00000029797 LIN28B (ENSOGAG00000011042) HACE1 (ENSOGAG00000011034) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.v #22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.v #22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.v #22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.v #22 Gibbon MODERN SPECIES ENSNLEG00000028691 ENSNLEG00000000122 ENSNLEG00000018647 ZNF493 (ENSNLEG00000032017) ENSNLEG00000029698 ENSNLEG00000031200 ZNF708 (ENSNLEG00000030286) ENSNLEG00000032806 ENSNLEG00000028474 ENSNLEG00000030900 ZNF430 (ENSNLEG00000034805) ZNF85 (ENSNLEG00000000114) ENSNLEG00000036010 ENSNLEG00000032089 ENSNLEG00000032517 ENSNLEG00000005405 #22 ENSNLEG00000034289 ENSNLEG00000031068 ZNF682 (ENSNLEG00000006354) ENSNLEG00000031573 ENSNLEG00000029893 ENSNLEG00000031307 ZNF506 (ENSNLEG00000006340) ZNF14 (ENSNLEG00000006339) ZNF101 (ENSNLEG00000006338) ATP13A1 (ENSNLEG00000006315) ENSNLEG00000006312 PBX4 (ENSNLEG00000006307) ENSNLEG00000034918 ENSNLEG00000018526 CILP2 (ENSNLEG00000006302) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.v #22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.v #22 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 194 SLC34A2 (ENSRBIG00000020575) ANAPC4 (ENSRBIG00000043872) ZCCHC4 (ENSRBIG00000034117) ENSRBIG00000038457 PI4K2B (ENSRBIG00000033543) SEPSECS (ENSRBIG00000030491) LGI2 (ENSRBIG00000027385) CCDC149 (ENSRBIG00000029170) DHX15 (ENSRBIG00000037326) PPARGC1A (ENSRBIG00000032333) ENSRBIG00000026496 #22 GBA3 (ENSRBIG00000036546) ENSRBIG00000026616 ADGRA3 (ENSRBIG00000029625) KCNIP4 (ENSRBIG00000028034) PACRGL (ENSRBIG00000037932) SLIT2 (ENSRBIG00000031606) TRPV6 (ENSRBIG00000040293) EPHB6 (ENSRBIG00000044488) ENSRBIG00000026887 ENSRBIG00000042167 ENSRBIG00000026151 ENSRBIG00000008812 ENSRBIG00000013946 ENSRBIG00000019362 ENSRBIG00000033911 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.v #22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.v #22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.v #22 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.v #22 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 14 PKHD1 (ENSMFAG00000031421) IL17A (ENSMFAG00000059281) IL17F (ENSMFAG00000044851) MCM3 (ENSMFAG00000001888) PAQR8 (ENSMFAG00000004629) EFHC1 (ENSMFAG00000036082) TRAM2 (ENSMFAG00000042433) ENSMFAG00000059971 PTP4A1 (ENSMFAG00000046284) PHF3 (ENSMFAG00000046395) ENSMFAG00000064522 ENSMFAG00000064767 EYS (ENSMFAG00000032080) ENSMFAG00000052667 ADGRB3 (ENSMFAG00000003819) ENSMFAG00000050203 #22 LMBRD1 (ENSMFAG00000028262) COL19A1 (ENSMFAG00000031633) COL9A1 (ENSMFAG00000031890) FAM135A (ENSMFAG00000002013) SDHAF4 (ENSMFAG00000044658) SMAP1 (ENSMFAG00000032465) B3GAT2 (ENSMFAG00000064443) OGFRL1 (ENSMFAG00000031290) ENSMFAG00000047850 RIMS1 (ENSMFAG00000038905) ENSMFAG00000059993 ENSMFAG00000061169 KCNQ5 (ENSMFAG00000036978) ENSMFAG00000047354 ENSMFAG00000062492 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00910000148110 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.v #22 ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.b.a #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a.l ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 ENSGT00950000182802.B.a.a.a.a.h.a.b.b ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00390000013814.e.a ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 52 ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000156519.l ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000161691 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00910000148110 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00950000183099.v #22 ENSGT00950000183099.u.a.e.i.b.b.a #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00860000135889 ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.c.a.l ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 ENSGT00950000182802.B.a.a.a.a.h.a.a.a.b.c.b ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541 ENSGT00390000013814.e.a ENSGT00940000155697.A Drill MODERN SPECIES 1303 ENSMLEG00000029103 ACVR2B (ENSMLEG00000029381) EXOG (ENSMLEG00000041016) SCN5A (ENSMLEG00000037189) SCN10A (ENSMLEG00000029306) SCN11A (ENSMLEG00000038031) WDR48 (ENSMLEG00000040913) ENSMLEG00000020344 GORASP1 (ENSMLEG00000029840) TTC21A (ENSMLEG00000041611) CSRNP1 (ENSMLEG00000033203) XIRP1 (ENSMLEG00000042773) CX3CR1 (ENSMLEG00000044125) ENSMLEG00000029769 SLC25A38 (ENSMLEG00000036995) #21 ENSMLEG00000032661 #22 Olive baboon DUPLICATION Olive baboon MODERN SPECIES 792 ENSPANG00000051403 UBQLN2 (ENSPANG00000003144) ENSPANG00000006802 SPIN3 (ENSPANG00000034200) ENSPANG00000033717 ENSPANG00000043590 FAAH2 (ENSPANG00000005116) ENSPANG00000042476 SPIN4 (ENSPANG00000003298) ENSPANG00000037603 ENSPANG00000045467 ENSPANG00000013981 ENSPANG00000049119 ENSPANG00000039711 ENSPANG00000041942 ENSPANG00000010496 #22 MTMR8 (ENSPANG00000010718) ENSPANG00000048128 ASB12 (ENSPANG00000015255) AMER1 (ENSPANG00000008040) ARHGEF9 (ENSPANG00000009684) ZC3H12B (ENSPANG00000007944) LAS1L (ENSPANG00000005318) ENSPANG00000001268 VSIG4 (ENSPANG00000017533) HEPH (ENSPANG00000018534) ENSPANG00000033128 ENSPANG00000042224 ENSPANG00000042220 EDA2R (ENSPANG00000002242) ENSPANG00000042553 Olive baboon MODERN SPECIES 3 FAT3 (ENSPANG00000018585) ENSPANG00000040125 ENSPANG00000038934 ENSPANG00000045071 ENSPANG00000047081 ENSPANG00000049769 ENSPANG00000022721 ENSPANG00000012860 TRIM77 (ENSPANG00000031543) FOLH1 (ENSPANG00000034012) ENSPANG00000037841 NOX4 (ENSPANG00000011635) TYR (ENSPANG00000050970) ENSPANG00000042320 GRM5 (ENSPANG00000010013) ENSPANG00000041846 #22 CTSC (ENSPANG00000006475) ENSPANG00000040539 RAB38 (ENSPANG00000007862) TMEM135 (ENSPANG00000016447) FZD4 (ENSPANG00000007432) PRSS23 (ENSPANG00000001585) ME3 (ENSPANG00000019664) ENSPANG00000038398 CCDC81 (ENSPANG00000011943) HIKESHI (ENSPANG00000006476) EED (ENSPANG00000023331) PICALM (ENSPANG00000019177) CCDC83 (ENSPANG00000019126) SYTL2 (ENSPANG00000010114) CCDC89 (ENSPANG00000048782) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.v #22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.v #22 Marmoset DUPLICATION Marmoset MODERN SPECIES 15 ENSCJAG00000073748 NEUROG2 (ENSCJAG00000003772) ENSCJAG00000056186 ALPK1 (ENSCJAG00000003780) ENSCJAG00000042606 TIFA (ENSCJAG00000038735) AP1AR (ENSCJAG00000043368) ENSCJAG00000083097 ENSCJAG00000077926 ENSCJAG00000083735 ENSCJAG00000003822 ENSCJAG00000060028 PITX2 (ENSCJAG00000003830) ENPEP (ENSCJAG00000003856) ENSCJAG00000074022 ENSCJAG00000071394 #22 ELOVL6 (ENSCJAG00000038180) ENSCJAG00000063162 ENSCJAG00000078793 EGF (ENSCJAG00000003982) LRIT3 (ENSCJAG00000004015) RRH (ENSCJAG00000004028) GAR1 (ENSCJAG00000082261) CFI (ENSCJAG00000004249) PLA2G12A (ENSCJAG00000085363) CASP6 (ENSCJAG00000016170) MCUB (ENSCJAG00000016158) SEC24B (ENSCJAG00000016082) COL25A1 (ENSCJAG00000016026) ENSCJAG00000066361 ETNPPL (ENSCJAG00000016009) Marmoset MODERN SPECIES 1 DMXL2 (ENSCJAG00000001038) SCG3 (ENSCJAG00000001016) LYSMD2 (ENSCJAG00000059165) TMOD3 (ENSCJAG00000048246) ENSCJAG00000083944 LEO1 (ENSCJAG00000000966) MAPK6 (ENSCJAG00000000962) ENSCJAG00000000960 GNB5 (ENSCJAG00000000947) MYO5C (ENSCJAG00000000926) MYO5A (ENSCJAG00000000894) ENSCJAG00000000923 ARPP19 (ENSCJAG00000078368) ATOSA (ENSCJAG00000000854) ONECUT1 (ENSCJAG00000046644) ENSCJAG00000071404 #22 WDR72 (ENSCJAG00000000823) UNC13C (ENSCJAG00000000796) ENSCJAG00000048377 RAB27A (ENSCJAG00000039845) PIGBOS1 (ENSCJAG00000040034) PIGB (ENSCJAG00000002283) CCPG1 (ENSCJAG00000002275) DNAAF4 (ENSCJAG00000046693) ENSCJAG00000036990 PYGO1 (ENSCJAG00000002242) ENSCJAG00000068292 PRTG (ENSCJAG00000002222) ENSCJAG00000080656 NEDD4 (ENSCJAG00000002183) ENSCJAG00000082814 Mas night monkey DUPLICATION Mas night monkey MODERN SPECIES 768 GARNL3 (ENSANAG00000029515) ANGPTL2 (ENSANAG00000030911) RALGPS1 (ENSANAG00000023735) ENSANAG00000033431 ZBTB34 (ENSANAG00000037523) ZBTB43 (ENSANAG00000038335) LMX1B (ENSANAG00000037425) MVB12B (ENSANAG00000021467) PBX3 (ENSANAG00000026691) MAPKAP1 (ENSANAG00000038007) ENSANAG00000006107 GAPVD1 (ENSANAG00000026547) ENSANAG00000002903 HSPA5 (ENSANAG00000038513) ENSANAG00000029634 ENSANAG00000002363 #22 PPP6C (ENSANAG00000033545) ENSANAG00000035375 ENSANAG00000005773 SCAI (ENSANAG00000024288) GOLGA1 (ENSANAG00000020513) ENSANAG00000021654 RPL35 (ENSANAG00000032849) WDR38 (ENSANAG00000033407) OLFML2A (ENSANAG00000028567) NR6A1 (ENSANAG00000036986) NR5A1 (ENSANAG00000027136) ADGRD2 (ENSANAG00000036641) PSMB7 (ENSANAG00000030640) NEK6 (ENSANAG00000029360) LHX2 (ENSANAG00000018858) Mas night monkey MODERN SPECIES 1075 ENSANAG00000024945 #22 ENSANAG00000005707 MOBP (ENSANAG00000022691) MYRIP (ENSANAG00000022468) EIF1B (ENSANAG00000026979) ENTPD3 (ENSANAG00000008467) ENSANAG00000027465 ZNF619 (ENSANAG00000036106) ZNF620 (ENSANAG00000033621) ZNF621 (ENSANAG00000025534) CTNNB1 (ENSANAG00000033807) ULK4 (ENSANAG00000032735) TRAK1 (ENSANAG00000032745) CCK (ENSANAG00000030129) LYZL4 (ENSANAG00000000908) VIPR1 (ENSANAG00000033723) Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.v #22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.v #22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.v #22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.v #22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.v #22 Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.v #22 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.v #22 Dog MODERN SPECIES 12 PLPPR2 (ENSCAFG00845019575) ENSCAFG00845019513 EPOR (ENSCAFG00845019440) TMEM205 (ENSCAFG00845019365) ENSCAFG00845019079 CCDC151 (ENSCAFG00845018852) PRKCSH (ENSCAFG00845018673) ELAVL3 (ENSCAFG00845018564) ZNF653 (ENSCAFG00845018498) ECSIT (ENSCAFG00845018379) CNN1 (ENSCAFG00845018227) ELOF1 (ENSCAFG00845018147) ACP5 (ENSCAFG00845018081) ENSCAFG00845018039 ENSCAFG00845017993 ENSCAFG00845017811 #22 ENSCAFG00845017723 ENSCAFG00845017657 ENSCAFG00845017174 WDR83OS (ENSCAFG00845016928) WDR83 (ENSCAFG00845016879) DHPS (ENSCAFG00845016832) GNG14 (ENSCAFG00845016787) FBXW9 (ENSCAFG00845016738) TNPO2 (ENSCAFG00845016346) TRIR (ENSCAFG00845016276) GET3 (ENSCAFG00845016222) BEST2 (ENSCAFG00845016163) HOOK2 (ENSCAFG00845016033) JUNB (ENSCAFG00845015989) PRDX2 (ENSCAFG00845015946) Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156210 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000161691 ENSGT01030000235089 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00940000164532 ENSGT00950000183099.v #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.d ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541.h ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B ENSGT00940000159338 Ursidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000161691 ENSGT01030000235089 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161553 ENSGT00920000149157 ENSGT00390000008686.c ENSGT00390000005979.a ENSGT00950000183072.a ENSGT00530000063779.B ENSGT00940000164959 ENSGT01020000230359.A ENSGT01020000230359.B ENSGT00550000075117 #21 ENSGT00940000164532 ENSGT00950000183099.v #22 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b ENSGT00940000160239 ENSGT01100000263542.A ENSGT00390000007888.d ENSGT00940000163750 ENSGT00940000163769 ENSGT00940000163271 ENSGT00940000155471.d.h ENSGT00940000156541.h ENSGT00940000155697.A ENSGT00390000003571 ENSGT00940000162293 ENSGT00940000156402.B ENSGT00940000159338 Giant Panda DUPLICATION Giant Panda MODERN SPECIES 677 ENSAMEG00000026759 #22 Giant Panda MODERN SPECIES 1835 ENSAMEG00000029803 #22 Giant Panda MODERN SPECIES 16 ACVR2B (ENSAMEG00000017697) EXOG (ENSAMEG00000017693) SCN5A (ENSAMEG00000017650) SCN10A (ENSAMEG00000017646) SCN11A (ENSAMEG00000004951) WDR48 (ENSAMEG00000001138) GORASP1 (ENSAMEG00000001177) TTC21A (ENSAMEG00000001196) CSRNP1 (ENSAMEG00000001247) XIRP1 (ENSAMEG00000019975) ENSAMEG00000027021 CX3CR1 (ENSAMEG00000008939) ENSAMEG00000024573 SLC25A38 (ENSAMEG00000008941) #21 ENSAMEG00000008952 ENSAMEG00000008962 #22 ENSAMEG00000008986 MYRIP (ENSAMEG00000001633) EIF1B (ENSAMEG00000028200) ENTPD3 (ENSAMEG00000001681) RPL14 (ENSAMEG00000001709) ZNF619 (ENSAMEG00000001720) ZNF620 (ENSAMEG00000001722) ZNF621 (ENSAMEG00000001723) CTNNB1 (ENSAMEG00000011615) ENSAMEG00000011614 ULK4 (ENSAMEG00000011574) TRAK1 (ENSAMEG00000011514) CCK (ENSAMEG00000028731) LYZL4 (ENSAMEG00000001538) VIPR1 (ENSAMEG00000012541) Giant Panda MODERN SPECIES 1781 ENSAMEG00000027001 #22 Felidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.v #22 Cat MODERN SPECIES 240 ACVR2B (ENSFCAG00000003157) EXOG (ENSFCAG00000003159) SCN5A (ENSFCAG00000003161) ENSFCAG00000039897 SCN10A (ENSFCAG00000003166) SCN11A (ENSFCAG00000000236) WDR48 (ENSFCAG00000025123) GORASP1 (ENSFCAG00000022655) TTC21A (ENSFCAG00000013530) CSRNP1 (ENSFCAG00000022981) XIRP1 (ENSFCAG00000013533) CX3CR1 (ENSFCAG00000002736) CCR8 (ENSFCAG00000002737) SLC25A38 (ENSFCAG00000002738) #21 ENSFCAG00000024410 ENSFCAG00000002739 #22 MYRIP (ENSFCAG00000001785) EIF1B (ENSFCAG00000003255) ENTPD3 (ENSFCAG00000001786) ENSFCAG00000046373 ENSFCAG00000046150 ZNF620 (ENSFCAG00000038065) ZNF621 (ENSFCAG00000027308) CTNNB1 (ENSFCAG00000003470) ULK4 (ENSFCAG00000006141) TRAK1 (ENSFCAG00000006142) CCK (ENSFCAG00000006143) LYZL4 (ENSFCAG00000008933) VIPR1 (ENSFCAG00000009040) SEC22C (ENSFCAG00000031763) SS18L2 (ENSFCAG00000003170) Panthera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.v #22 Panthera_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.v #22 leopard MODERN SPECIES 55 ENSPPRG00000002685 ENSPPRG00000002809 ENSPPRG00000002848 SCTR (ENSPPRG00000003047) TMEM37 (ENSPPRG00000003592) DBI (ENSPPRG00000003735) ENSPPRG00000004196 STEAP3 (ENSPPRG00000005387) C1QL2 (ENSPPRG00000005475) MARCO (ENSPPRG00000005610) EN1 (ENSPPRG00000005782) INSIG2 (ENSPPRG00000005907) CCDC93 (ENSPPRG00000006293) ENSPPRG00000006313 DDX18 (ENSPPRG00000006406) ENSPPRG00000006423 #22 ENSPPRG00000006541 DPP10 (ENSPPRG00000007698) Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.v #22 Equus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.v #22 Horse MODERN SPECIES 7 DYNC1LI1 (ENSECAG00000010584) CNOT10 (ENSECAG00000021306) TRIM71 (ENSECAG00000020845) CCR4 (ENSECAG00000005023) ENSECAG00000049408 GLB1 (ENSECAG00000011942) CRTAP (ENSECAG00000008409) SUSD5 (ENSECAG00000007972) FBXL2 (ENSECAG00000024909) UBP1 (ENSECAG00000018555) CLASP2 (ENSECAG00000015474) PDCD6IP (ENSECAG00000004691) ARPP21 (ENSECAG00000022872) STAC (ENSECAG00000021165) DCLK3 (ENSECAG00000020294) ENSECAG00000020152 #22 TRANK1 (ENSECAG00000018264) EPM2AIP1 (ENSECAG00000004874) MLH1 (ENSECAG00000000690) LRRFIP2 (ENSECAG00000021270) ENSECAG00000055774 GOLGA4 (ENSECAG00000013495) ITGA9 (ENSECAG00000007848) VILL (ENSECAG00000012325) PLCD1 (ENSECAG00000023703) DLEC1 (ENSECAG00000019602) ACAA1 (ENSECAG00000008613) MYD88 (ENSECAG00000001774) ENSECAG00000046064 OXSR1 (ENSECAG00000019157) SLC22A13 (ENSECAG00000014100) Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.v #22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.v #22 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 4 NOL10 (ENSRFEG00010008527) ODC1 (ENSRFEG00010008653) HPCAL1 (ENSRFEG00010008686) ENSRFEG00010008723 CYS1 (ENSRFEG00010008838) KLF11 (ENSRFEG00010008867) GRHL1 (ENSRFEG00010008922) ENSRFEG00010009191 TAF1B (ENSRFEG00010009242) YWHAQ (ENSRFEG00010009419) ADAM17 (ENSRFEG00010009462) IAH1 (ENSRFEG00010009506) CPSF3 (ENSRFEG00010009573) ITGB1BP1 (ENSRFEG00010009640) ASAP2 (ENSRFEG00010009716) ENSRFEG00010009824 #22 ENSRFEG00010009833 MBOAT2 (ENSRFEG00010009854) KIDINS220 (ENSRFEG00010009917) ENSRFEG00010010062 RNF144A (ENSRFEG00010010097) RSAD2 (ENSRFEG00010010140) CMPK2 (ENSRFEG00010010183) ENSRFEG00010010195 SOX11 (ENSRFEG00010010241) DCDC2C (ENSRFEG00010010389) ALLC (ENSRFEG00010010543) COLEC11 (ENSRFEG00010010705) RPS7 (ENSRFEG00010010903) RNASEH1 (ENSRFEG00010010966) ADI1 (ENSRFEG00010010993) Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.v #22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.v #22 Camelidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.v #22 Arabian camel MODERN SPECIES 22 ELL2 (ENSCDRG00005011641) ENSCDRG00005011746 RHOBTB3 (ENSCDRG00005011775) SPATA9 (ENSCDRG00005011904) RFESD (ENSCDRG00005011979) SKIC3 (ENSCDRG00005012080) GPR150 (ENSCDRG00005012479) ARSK (ENSCDRG00005012503) FAM81B (ENSCDRG00005012550) MCTP1 (ENSCDRG00005012739) SLF1 (ENSCDRG00005013652) KIAA0825 (ENSCDRG00005013715) FAM172A (ENSCDRG00005013822) POU5F2 (ENSCDRG00005013944) NR2F1 (ENSCDRG00005014004) ENSCDRG00005014036 #22 ARRDC3 (ENSCDRG00005014088) ADGRV1 (ENSCDRG00005014220) LYSMD3 (ENSCDRG00005014481) ENSCDRG00005014536 MBLAC2 (ENSCDRG00005014578) CETN3 (ENSCDRG00005014609) MEF2C (ENSCDRG00005014686) TMEM161B (ENSCDRG00005015359) CCNH (ENSCDRG00005015934) RASA1 (ENSCDRG00005016008) ENSCDRG00005016325 EDIL3 (ENSCDRG00005016390) ENSCDRG00005016462 HAPLN1 (ENSCDRG00005016491) VCAN (ENSCDRG00005016571) Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.v #22 Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.v #22 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.v #22 Sperm whale MODERN SPECIES 6 ENSPCTG00005006300 MTDH (ENSPCTG00005006348) TSPYL5 (ENSPCTG00005006480) CPQ (ENSPCTG00005006492) ENSPCTG00005006521 SDC2 (ENSPCTG00005006539) PTDSS1 (ENSPCTG00005006587) MTERF3 (ENSPCTG00005006724) ENSPCTG00005006779 GDF6 (ENSPCTG00005006818) ENSPCTG00005006830 C15H8orf37 (ENSPCTG00005006841) PLEKHF2 (ENSPCTG00005006872) NDUFAF6 (ENSPCTG00005006899) TP53INP1 (ENSPCTG00005006971) ENSPCTG00005007014 #22 CCNE2 (ENSPCTG00005007033) INTS8 (ENSPCTG00005007091) DPY19L4 (ENSPCTG00005007336) ESRP1 (ENSPCTG00005007404) VIRMA (ENSPCTG00005007475) ENSPCTG00005007598 RAD54B (ENSPCTG00005007630) GEM (ENSPCTG00005007759) CDH17 (ENSPCTG00005007812) ENSPCTG00005007923 PDP1 (ENSPCTG00005007940) TMEM67 (ENSPCTG00005007975) ENSPCTG00005008073 RBM12B (ENSPCTG00005008096) ENSPCTG00005008101 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.v #22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.v #22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.v #22 Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.v #22 Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.v #22 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000014316.c.b ENSGT00940000154507 ENSGT00940000160403 ENSGT00390000002137 ENSGT00940000155521 ENSGT00940000158869 ENSGT00510000046732.B ENSGT00940000160541 ENSGT00940000160487 ENSGT00940000159910 ENSGT00970000196845 ENSGT00940000165041 ENSGT01030000234870 ENSGT00940000160861 ENSGT00940000163424 ENSGT00950000183099.v #22 ENSGT00940000163433 ENSGT00940000161185 ENSGT00900000143298 ENSGT00960000186917 ENSGT00940000162745 ENSGT00940000160554 ENSGT00940000165479 ENSGT00390000008200.f.c.b.a.a.a.b ENSGT00390000008200.f.c.b.a.a.a.a.a.a.a.a ENSGT00390000008200.f.c.b.b ENSGT00390000008200.f.c.b.a.a.a.a.a.b ENSGT00390000008200.f.c.b.a.a.a.a.b.a ENSGT00390000008200.f.c.a ENSGT00940000163903 ENSGT00390000008200.f.c.b.a.b.a Cow MODERN SPECIES 26 PCDH1 (ENSBTAG00000012518) ARAP3 (ENSBTAG00000015938) FCHSD1 (ENSBTAG00000049248) RELL2 (ENSBTAG00000017371) HDAC3 (ENSBTAG00000017360) ENSBTAG00000030499 PCDHGC4 (ENSBTAG00000054197) ENSBTAG00000055200 ENSBTAG00000054576 ENSBTAG00000053294 PCDHGC3 (ENSBTAG00000017349) PCDHGA5 (ENSBTAG00000045683) ENSBTAG00000048645 PCDHGA3 (ENSBTAG00000040473) SLC25A2 (ENSBTAG00000011938) ENSBTAG00000049316 #22 ENSBTAG00000050840 ENSBTAG00000030474 ENSBTAG00000049493 ENSBTAG00000053160 PCDHB1 (ENSBTAG00000037885) ENSBTAG00000053988 PCDHAC2 (ENSBTAG00000053546) PCDHA13 (ENSBTAG00000030227) ENSBTAG00000051344 ENSBTAG00000048510 ENSBTAG00000052605 ENSBTAG00000054506 ENSBTAG00000054587 ENSBTAG00000049214 ENSBTAG00000015439 American bison MODERN SPECIES 3206 DELE1 (ENSBBBG00000010411) PCDH1 (ENSBBBG00000010418) ARAP3 (ENSBBBG00000010532) FCHSD1 (ENSBBBG00000010579) RELL2 (ENSBBBG00000010596) HDAC3 (ENSBBBG00000010603) DIAPH1 (ENSBBBG00000010855) PCDHGC5 (ENSBBBG00000010882) ENSBBBG00000010884 PCDHGA10 (ENSBBBG00000006979) PCDHGB5 (ENSBBBG00000010891) ENSBBBG00000001920 PCDHGA4 (ENSBBBG00000006830) TAF7 (ENSBBBG00000011039) SLC25A2 (ENSBBBG00000011041) ENSBBBG00000011045 #22 PCDHB15 (ENSBBBG00000011049) ENSBBBG00000011053 PCDHB13 (ENSBBBG00000002046) PCDHB4 (ENSBBBG00000011262) ENSBBBG00000011267 ENSBBBG00000002052 PCDHB1 (ENSBBBG00000011281) ENSBBBG00000011287 ENSBBBG00000011293 ENSBBBG00000011295 ENSBBBG00000006835 ENSBBBG00000002112 PCDHA5 (ENSBBBG00000011520) PCDHA4 (ENSBBBG00000011524) PCDHAC2 (ENSBBBG00000011644) Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183099.v #22 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES SAG (ENSOARG00020008029) ENSOARG00020008004 DGKD (ENSOARG00020007641) USP40 (ENSOARG00020007173) ENSOARG00020007139 ENSOARG00020007114 UGT1A1 (ENSOARG00020006230) MROH2A (ENSOARG00020005342) HJURP (ENSOARG00020005263) TRPM8 (ENSOARG00020005009) SPP2 (ENSOARG00020004890) ARL4C (ENSOARG00020004841) SH3BP4 (ENSOARG00020004812) ENSOARG00020004783 AGAP1 (ENSOARG00020004474) ENSOARG00020004419 #22 GBX2 (ENSOARG00020004399) ASB18 (ENSOARG00020004373) IQCA1 (ENSOARG00020004312) ACKR3 (ENSOARG00020004297) COPS8 (ENSOARG00020004238) COL6A3 (ENSOARG00020002421) MLPH (ENSOARG00020002225) PRLH (ENSOARG00020002190) RAB17 (ENSOARG00020002174) ENSOARG00020002080 RBM44 (ENSOARG00020001964) RAMP1 (ENSOARG00020001939) UBE2F (ENSOARG00020001897) SCLY (ENSOARG00020001794) KLHL30 (ENSOARG00020001740) Goat DUPLICATION Goat MODERN SPECIES 404 ENSCHIG00000018596 ENSCHIG00000009985 #22 Goat MODERN SPECIES CHMP2B (ENSCHIG00000014003) POU1F1 (ENSCHIG00000026743) ENSCHIG00000003029 CGGBP1 (ENSCHIG00000013576) ZNF654 (ENSCHIG00000014626) C3orf38 (ENSCHIG00000011989) ENSCHIG00000025993 EPHA3 (ENSCHIG00000015544) PROS1 (ENSCHIG00000010494) ARL13B (ENSCHIG00000015560) STX19 (ENSCHIG00000002872) NSUN3 (ENSCHIG00000012629) ENSCHIG00000007885 ENSCHIG00000007969 EPHA6 (ENSCHIG00000022528) ENSCHIG00000017327 #22 ARL6 (ENSCHIG00000017792) ENSCHIG00000004089 ENSCHIG00000016450 RCAN1 (ENSCHIG00000021307) ENSCHIG00000023335 KCNE1 (ENSCHIG00000011448) ENSCHIG00000010330 SMIM11 (ENSCHIG00000002425) KCNE2 (ENSCHIG00000006429) MRPS6 (ENSCHIG00000020464) CRYBG3 (ENSCHIG00000016280) RIOX2 (ENSCHIG00000018223) GABRR3 (ENSCHIG00000009260) ENSCHIG00000008031 ENSCHIG00000006803 Elephant shark MODERN SPECIES 1776 ENSCMIG00000016697 ENSCMIG00000016705 foxred2 (ENSCMIG00000016708) ENSCMIG00000016709 txn2 (ENSCMIG00000016710) #19 myh9a (ENSCMIG00000016824) #20 ENSCMIG00000017063 #21 rpsa (ENSCMIG00000000217) #22 UBN2 (ENSCMIG00000000392) ttc26 (ENSCMIG00000000489) ppox (ENSCMIG00000000637) ENSCMIG00000000644 ENSCMIG00000000655 ENSCMIG00000000667