Caprinae	DUPLICATION
Caprinae	DUPLICATION
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES	46	ENSGT00910000144179.b.a #8	ENSGT00530000064238 #9	ENSGT00390000007662 #10	ENSGT00940000155463 #11	ENSGT00940000154748.C #12	ENSGT00940000158080 #13	ENSGT00950000182963.b.a #14	ENSGT00940000164165	ENSGT00940000154164.d #15	ENSGT00940000157355 #16	ENSGT00940000161181 #17	ENSGT00940000159830	ENSGT00950000183118.A.c.a.r #19	ENSGT00940000156341 #20	ENSGT00940000160347.a #33	ENSGT00530000063174.a.i.u.b #22	ENSGT00940000159562 #23	ENSGT00940000155886 #24	ENSGT00950000183163.b	ENSGT00950000182941.b.b #26	ENSGT00390000008256 #27	ENSGT00940000159370 #28	ENSGT00940000156832.p.b #29	ENSGT00940000156709 #35	ENSGT00940000162424 #36	ENSGT00390000017542 #37	ENSGT00510000048066	ENSGT00870000136506	ENSGT00940000157313	ENSGT00940000164183	ENSGT00940000157080
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	205	ENSOARG00020009586 #7	CTPS2 (ENSOARG00020009621) #8	S100G (ENSOARG00020009888) #9	SYAP1 (ENSOARG00020009929) #10	TXLNG (ENSOARG00020010154) #11	RBBP7 (ENSOARG00020010350) #12	REPS2 (ENSOARG00020010562) #13	NHS (ENSOARG00020011266) #14	RAI2 (ENSOARG00020011877) #15	CDKL5 (ENSOARG00020012130) #16	RS1 (ENSOARG00020012237) #17	ENSOARG00020012454 #18	PHKA2 (ENSOARG00020012486) #19	ADGRG2 (ENSOARG00020013283) #20	ENSOARG00020014052 #21	PDHA1 (ENSOARG00020014126) #22	MAP3K15 (ENSOARG00020014315) #23	SH3KBP1 (ENSOARG00020014389) #24	ENSOARG00020014649 #25	MAP7D2 (ENSOARG00020014919) #26	EIF1AX (ENSOARG00020015967) #27	RPS6KA3 (ENSOARG00020016195) #28	ENSOARG00020016638 #29	ENSOARG00020016661 #30	ENSOARG00020016684 #31	ENSOARG00020016703 #32	ENSOARG00020016721 #33	ENSOARG00020016730 #34	CNKSR2 (ENSOARG00020016850) #35	KLHL34 (ENSOARG00020022568) #36	SMPX (ENSOARG00020022580) #37
Goat	MODERN SPECIES	130																ENSCHIG00000000162 #22	ENSCHIG00000000233 #23
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00530000063174.a.i.u.a ##22
Goat	MODERN SPECIES		ENSCHIG00000021084	MECOM (ENSCHIG00000015174)	ENSCHIG00000001263	GOLIM4 (ENSCHIG00000024949)	ENSCHIG00000014733	ENSCHIG00000000612	ENSCHIG00000021309	WDR49 (ENSCHIG00000013106)	SERPINI2 (ENSCHIG00000018550)	ZBBX (ENSCHIG00000025980)	BCHE (ENSCHIG00000026772)	SLITRK3 (ENSCHIG00000006438)	ENSCHIG00000016725	SI (ENSCHIG00000010240)	ENSCHIG00000011051	ENSCHIG00000023820 ##22	OTOL1 (ENSCHIG00000012937)	SPTSSB (ENSCHIG00000009108)	NMD3 (ENSCHIG00000016015)	ENSCHIG00000026689	ENSCHIG00000020415	ENSCHIG00000014679	PPM1L (ENSCHIG00000003416)	ENSCHIG00000022304	ARL14 (ENSCHIG00000006468)	KPNA4 (ENSCHIG00000027240)	TRIM59 (ENSCHIG00000013800)	SMC4 (ENSCHIG00000018909)	IFT80 (ENSCHIG00000024872)	C3orf80 (ENSCHIG00000010005)	ENSCHIG00000021362
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES		LRRC34 (ENSOARG00020001962)	MYNN (ENSOARG00020002108)	ACTRT3 (ENSOARG00020002123)	MECOM (ENSOARG00020002184)	ENSOARG00020002458	ENSOARG00020002481	GOLIM4 (ENSOARG00020002523)	SERPINI1 (ENSOARG00020002561)	PDCD10 (ENSOARG00020002590)	SERPINI2 (ENSOARG00020002638)	BCHE (ENSOARG00020002687)	SLITRK3 (ENSOARG00020002710)	SI (ENSOARG00020002809)	ENSOARG00020004705	ENSOARG00020004716	ENSOARG00020004733 ##22	NMD3 (ENSOARG00020004805)	SPTSSB (ENSOARG00020004978)	ENSOARG00020004989	ENSOARG00020005007	ENSOARG00020005029	PPM1L (ENSOARG00020005069)	ENSOARG00020005147	ARL14 (ENSOARG00020005166)	KPNA4 (ENSOARG00020005180)	ENSOARG00020005281	SMC4 (ENSOARG00020005306)	IFT80 (ENSOARG00020005544)	ENSOARG00020005593	C3orf80 (ENSOARG00020005601)	IL12A (ENSOARG00020005615)
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00530000063174.a.i.v ##22
Goat	MODERN SPECIES	43												TMEM185A (ENSCHIG00000004747)	ENSCHIG00000000434	ENSCHIG00000019036	ENSCHIG00000018828	ENSCHIG00000026446 ##22	ENSCHIG00000010772	ENSCHIG00000022330	ENSCHIG00000010608