Strepsirrhini	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000162450	ENSGT00940000162079	ENSGT00940000162484	ENSGT00940000160997	ENSGT00940000154993	ENSGT00940000161821	ENSGT00940000154723.b	ENSGT00940000162353	ENSGT00940000160499	ENSGT00940000157293	ENSGT00940000159023	ENSGT00940000159897	ENSGT00940000160381 #20	ENSGT00940000161157 #21	ENSGT00860000136081	ENSGT00940000153385.b.a.b #22	ENSGT00940000162112 #23	ENSGT00940000162498 #24	ENSGT00940000162390 #25	ENSGT00940000159762 #27	ENSGT00940000159208.B #28	ENSGT00940000160076 #29	ENSGT00940000160668 #30	ENSGT00940000161022 #31	ENSGT00390000008815 #32	ENSGT00390000012691.c.b #33	ENSGT00940000161798	ENSGT00390000007075 #34	ENSGT00390000010512 #35	ENSGT00940000161403 #36	ENSGT00940000159200 #37
Lemuriformes	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000162079	ENSGT00940000162484	ENSGT00940000160997	ENSGT00940000154993	ENSGT00940000161821	ENSGT00940000162892	ENSGT00940000154723.b	ENSGT00940000162353	ENSGT00940000160499	ENSGT00940000157293	ENSGT00940000159023	ENSGT00940000159897	ENSGT00940000160381 #20	ENSGT00940000161157 #21	ENSGT00860000136081	ENSGT00940000153385.b.a.b #22	ENSGT00940000162112 #23	ENSGT00940000162498 #24	ENSGT00940000162390 #25	ENSGT00940000159762 #27	ENSGT00940000159208.B #28	ENSGT00940000160076 #29	ENSGT00940000160668 #30	ENSGT00940000161022 #31	ENSGT00390000008815 #32	ENSGT00390000012691.c.b #33	ENSGT00390000007075 #34	ENSGT00390000010512 #35	ENSGT00940000161403 #36	ENSGT00940000159200 #37	ENSGT00940000160991
Mouse lemur	MODERN SPECIES	28	CYP21A2 (ENSMICG00000016652) #7	ENSMICG00000046247 #8	ENSMICG00000016667 #9	ATF6B (ENSMICG00000047519) #10	PRRT1 (ENSMICG00000032288) #11	PPT2 (ENSMICG00000001807) #12	EGFL8 (ENSMICG00000042415) #13	AGPAT1 (ENSMICG00000001813) #14	RNF5 (ENSMICG00000048108) #15	AGER (ENSMICG00000001823) #16	PBX2 (ENSMICG00000001829) #17	GPSM3 (ENSMICG00000026321) #18	NOTCH4 (ENSMICG00000001835) #19	HLA-DMB (ENSMICG00000043729) #20	HLA-DMA (ENSMICG00000010132) #21	BRD2 (ENSMICG00000003693) #22	HLA-DOA (ENSMICG00000047683) #23	HLA-DPA1 (ENSMICG00000003711) #24	HLA-DPB1 (ENSMICG00000030867) #25	ENSMICG00000001373 #26	COL11A2 (ENSMICG00000000879) #27	RXRB (ENSMICG00000000899) #28	SLC39A7 (ENSMICG00000000905) #29	HSD17B8 (ENSMICG00000000908) #30	RING1 (ENSMICG00000030050) #31	VPS52 (ENSMICG00000027900) #32	ENSMICG00000035485 #33	WDR46 (ENSMICG00000000916) #34	PFDN6 (ENSMICG00000000922) #35	RGL2 (ENSMICG00000000926) #36	TAPBP (ENSMICG00000042293) #37
Lemuriformes_a	ANCESTRAL SPECIES	76	ENSGT00940000163287 #19	ENSGT00940000162079	ENSGT00940000162484	ENSGT00940000160997	ENSGT00940000154993	ENSGT00940000162892	ENSGT00940000154723.b	ENSGT00940000162353	ENSGT00940000160499	ENSGT00940000157293	ENSGT00940000159023	ENSGT00940000159897	ENSGT00940000160381 #20	ENSGT00940000161157 #21	ENSGT00860000136081	ENSGT00940000153385.b.a.b #22	ENSGT00940000162112 #23	ENSGT00940000162498 #24	ENSGT00940000162390 #25
Coquerels sifaka	DUPLICATION
Coquerels sifaka	MODERN SPECIES	872							HLA-DQB1 (ENSPCOG00000014494)	HLA-DOB (ENSPCOG00000022286)	TAP2 (ENSPCOG00000014799)	PSMB8 (ENSPCOG00000028091)	TAP1 (ENSPCOG00000019389)	PSMB9 (ENSPCOG00000017686)	HLA-DMB (ENSPCOG00000018934) #20	HLA-DMA (ENSPCOG00000022072) #21	ENSPCOG00000016191	ENSPCOG00000018456 #22	ENSPCOG00000018880	HLA-DOA (ENSPCOG00000014372) #23	HLA-DPA1 (ENSPCOG00000015236) #24
Coquerels sifaka	MODERN SPECIES	611	CPZ (ENSPCOG00000018885)	TRMT44 (ENSPCOG00000028809)	ACOX3 (ENSPCOG00000015967)	HTRA3 (ENSPCOG00000015549)	NANP (ENSPCOG00000022703)	ENSPCOG00000014381	NINL (ENSPCOG00000019338)	GINS1 (ENSPCOG00000016034)	ABHD12 (ENSPCOG00000022073)	PYGB (ENSPCOG00000021348)	ENTPD6 (ENSPCOG00000022862)	VSX1 (ENSPCOG00000013919)	ACSS1 (ENSPCOG00000018745)	APMAP (ENSPCOG00000023592)	CST7 (ENSPCOG00000019725)	ENSPCOG00000023905 #22	SYNDIG1 (ENSPCOG00000003880)	ENSPCOG00000021349
Greater bamboo lemur	MODERN SPECIES	650			ENSPSMG00000007220	ENSPSMG00000007226	HLA-DRA (ENSPSMG00000007272)	ENSPSMG00000007912	ENSPSMG00000008349	HLA-DQB1 (ENSPSMG00000008743)	HLA-DOB (ENSPSMG00000008851)	TAP2 (ENSPSMG00000008940)	PSMB8 (ENSPSMG00000009083)	TAP1 (ENSPSMG00000009102)	PSMB9 (ENSPSMG00000009117)	HLA-DMB (ENSPSMG00000009134) #20	HLA-DMA (ENSPSMG00000009171) #21	BRD2 (ENSPSMG00000009223) #22	ENSPSMG00000009252	HLA-DOA (ENSPSMG00000009261) #23	HLA-DPA1 (ENSPSMG00000009402) #24	HLA-DPB1 (ENSPSMG00000009639) #25	ENSPSMG00000009792 #24
Bushbaby	DUPLICATION
Bushbaby	MODERN SPECIES	220	ENSOGAG00000015917	ENSOGAG00000033148	CYP4F115 (ENSOGAG00000011748)	CYP4F113 (ENSOGAG00000007410)	ENSOGAG00000028565	CYP4F112 (ENSOGAG00000031204)	CYP4F111 (ENSOGAG00000002017)	CYP4F3 (ENSOGAG00000032860)	CYP4F22 (ENSOGAG00000030936)	ENSOGAG00000024112	PGLYRP2 (ENSOGAG00000026199)	RASAL3 (ENSOGAG00000033656)	WIZ (ENSOGAG00000010952)	AKAP8L (ENSOGAG00000010943)	AKAP8 (ENSOGAG00000029564)	ENSOGAG00000000840 #22	EPHX3 (ENSOGAG00000006687)	NOTCH3 (ENSOGAG00000006680)	ENSOGAG00000024942	ILVBL (ENSOGAG00000014020)	SYDE1 (ENSOGAG00000014015)	OR1I1 (ENSOGAG00000003203)	CASP14 (ENSOGAG00000024750)	CCDC105 (ENSOGAG00000011860)	SLC1A6 (ENSOGAG00000029166)	ENSOGAG00000033292	OR7C2 (ENSOGAG00000031212)	ENSOGAG00000025389	ENSOGAG00000028478	ENSOGAG00000026639
Bushbaby	MODERN SPECIES	146	ENSOGAG00000013069	ENSOGAG00000025050	BTNL2 (ENSOGAG00000008396)	HLA-DRA (ENSOGAG00000008398)	ENSOGAG00000009732	ENSOGAG00000030012	ENSOGAG00000008401	HLA-DQB1 (ENSOGAG00000005662)	ENSOGAG00000031343	PSMB8 (ENSOGAG00000013830)	TAP1 (ENSOGAG00000013836)	PSMB9 (ENSOGAG00000013846)	ENSOGAG00000013823	HLA-DMB (ENSOGAG00000032749) #20	HLA-DMA (ENSOGAG00000006029) #21	BRD2 (ENSOGAG00000006473) #22	HLA-DOA (ENSOGAG00000014685) #23	HLA-DPA1 (ENSOGAG00000006476) #24	ENSOGAG00000016138 #25	ENSOGAG00000034269	COL11A2 (ENSOGAG00000025975) #27	RXRB (ENSOGAG00000011689) #28	SLC39A7 (ENSOGAG00000030006) #29	HSD17B8 (ENSOGAG00000006214) #30	RING1 (ENSOGAG00000006220) #31	VPS52 (ENSOGAG00000006222) #32	RPS18 (ENSOGAG00000006225) #33	B3GALT4 (ENSOGAG00000006228)	WDR46 (ENSOGAG00000006230) #34	ENSOGAG00000028341 #35	RGL2 (ENSOGAG00000003996) #36