Platyrrhini	DUPLICATION
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000154723.b.k #13	ENSGT00940000154993.n	ENSGT00940000162892.a.a.c ##12	ENSGT00940000154723.b.l.a.b #11	ENSGT00940000162892.a.a.d ##12	ENSGT00940000154723.b.l.b ##13	ENSGT00940000162353	ENSGT00940000160499 #14	ENSGT00940000157293 #15	ENSGT00940000159023 #16	ENSGT00940000159897 #17	ENSGT00390000004757.`b.a #18	ENSGT00940000160381 #19	ENSGT00940000161157 #20	ENSGT00860000136081 #21	ENSGT00940000153385.b.a.b.lc #22	ENSGT00940000162112 #23	ENSGT00940000162498 #26	ENSGT00940000162390	ENSGT00940000159762	ENSGT00940000159208.B	ENSGT00940000160076	ENSGT00940000160668	ENSGT00940000161022.b	ENSGT00390000008815	ENSGT00390000012691.c.b	ENSGT00940000161798	ENSGT00390000007075	ENSGT00390000010512	ENSGT00940000161403	ENSGT00940000159200
Mas night monkey	MODERN SPECIES	1006				ENSANAG00000025439 #10	ENSANAG00000023444 #11	HLA-DQA2 (ENSANAG00000023973) #12	HLA-DQB2 (ENSANAG00000025105) #13	TAP2 (ENSANAG00000023266) #14	PSMB8 (ENSANAG00000023214) #15	TAP1 (ENSANAG00000025374) #16	PSMB9 (ENSANAG00000018195) #17	ENSANAG00000029686 #18	HLA-DMB (ENSANAG00000031322) #19	HLA-DMA (ENSANAG00000024515) #20	ENSANAG00000022510 #21	BRD2 (ENSANAG00000025054) #22	HLA-DOA (ENSANAG00000023738) #23	ENSANAG00000020251 #24	ENSANAG00000021916 #25	HLA-DPA1 (ENSANAG00000025586) #26
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES	5			ENSGT00940000154993.n.a	ENSGT00940000162892.a.a.c ##12	ENSGT00940000154723.b.l.a.b #11	ENSGT00940000162892.a.a.d ##12	ENSGT00940000154723.b.l.b ##13	ENSGT00940000162353	ENSGT00940000160499 #14	ENSGT00940000157293 #15	ENSGT00940000159023 #16	ENSGT00940000159897 #17	ENSGT00940000160381 #19	ENSGT00940000161157 #20	ENSGT00860000136081 #21	ENSGT00940000153385.b.a.b.lc #22	ENSGT00940000162112 #23	ENSGT00940000162498 #26	ENSGT00940000162390	ENSGT00940000159762	ENSGT00940000159208.B	ENSGT00940000160076	ENSGT00940000160668	ENSGT00940000161022.b	ENSGT00390000008815	ENSGT00390000012691.c.b	ENSGT00940000161798	ENSGT00390000007075	ENSGT00390000010512	ENSGT00940000161403	ENSGT00940000159200
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES	25			ENSGT00940000154993.n.a.b	ENSGT00940000162892.a.a.c ##12	ENSGT00940000154723.b.l.a.b #11	ENSGT00940000162892.a.a.d ##12	ENSGT00940000154723.b.l.b ##13	ENSGT00940000162353	ENSGT00940000160499 #14	ENSGT00940000157293 #15	ENSGT00940000159023 #16	ENSGT00940000159897 #17	ENSGT00940000160381 #19	ENSGT00940000161157 #20	ENSGT00860000136081 #21	ENSGT00940000153385.b.a.b.lc #22	ENSGT00940000162112 #23	ENSGT00940000162498 #26	ENSGT00940000162390	ENSGT00940000159762	ENSGT00940000159208.B	ENSGT00940000160076	ENSGT00940000160668	ENSGT00940000161022.b	ENSGT00390000008815	ENSGT00390000012691.c.b	ENSGT00390000007075	ENSGT00390000010512	ENSGT00940000161403	ENSGT00940000159200	ENSGT00940000160991
Capuchin	MODERN SPECIES	24	HLA-DRA (ENSCCAG00000027271)	ENSCCAG00000033580	ENSCCAG00000024284	HLA-DRB1 (ENSCCAG00000025004)	HLA-DQA2 (ENSCCAG00000023549) #12	ENSCCAG00000025088 ##13	ENSCCAG00000023824 ##12	ENSCCAG00000028168 ##13	HLA-DOB (ENSCCAG00000034021)	TAP2 (ENSCCAG00000035497) #14	PSMB8 (ENSCCAG00000026335) #15	TAP1 (ENSCCAG00000024218) #16	PSMB9 (ENSCCAG00000036808) #17	HLA-DMB (ENSCCAG00000030904) #19	HLA-DMA (ENSCCAG00000031122) #20	ENSCCAG00000016930 #22	HLA-DOA (ENSCCAG00000024211) #23	HLA-DPA1 (ENSCCAG00000035048) #26	HLA-DPB1 (ENSCCAG00000036491)	COL11A2 (ENSCCAG00000021086)	RXRB (ENSCCAG00000015878)	SLC39A7 (ENSCCAG00000021481)	HSD17B8 (ENSCCAG00000034063)	RING1 (ENSCCAG00000020672)	VPS52 (ENSCCAG00000029806)	RPS18 (ENSCCAG00000023639)	WDR46 (ENSCCAG00000029352)	PFDN6 (ENSCCAG00000027108)	RGL2 (ENSCCAG00000036457)	TAPBP (ENSCCAG00000030579)	ZBTB22 (ENSCCAG00000019414)
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	49	DEFB110 (ENSSBOG00000019583)	DEFB112 (ENSSBOG00000031354)	TFAP2D (ENSSBOG00000033191)	TFAP2B (ENSSBOG00000021734)	ENSSBOG00000033280	PKHD1 (ENSSBOG00000026830)	IL17A (ENSSBOG00000031117)	IL17F (ENSSBOG00000022387)	MCM3 (ENSSBOG00000019946)	PAQR8 (ENSSBOG00000008561)	EFHC1 (ENSSBOG00000023512)	TRAM2 (ENSSBOG00000033153)	HLA-DMB (ENSSBOG00000028499) #19	HLA-DMA (ENSSBOG00000020585) #20	ENSSBOG00000034712 #21	ENSSBOG00000033070 #22	HLA-DOA (ENSSBOG00000022957) #23	HLA-DPA1 (ENSSBOG00000026139) #26	HLA-DPB1 (ENSSBOG00000023374)	COL11A2 (ENSSBOG00000030814)	RXRB (ENSSBOG00000028234)	SLC39A7 (ENSSBOG00000027575)	HSD17B8 (ENSSBOG00000033905)	ENSSBOG00000021715	VPS52 (ENSSBOG00000034931)	ENSSBOG00000034369	WDR46 (ENSSBOG00000032568)	PFDN6 (ENSSBOG00000034801)	RGL2 (ENSSBOG00000031644)	TAPBP (ENSSBOG00000031122)	ZBTB22 (ENSSBOG00000018285)
Marmoset	MODERN SPECIES	16	ENSCJAG00000072632	ENSCJAG00000042232	ENSCJAG00000044447	ENSCJAG00000046350	ENSCJAG00000082318	ENSCJAG00000073641	ENSCJAG00000043141	ENSCJAG00000072040	ENSCJAG00000021548 ##13	ENSCJAG00000045515 ##12	HLA-DOB (ENSCJAG00000035217)	TAP2 (ENSCJAG00000021550) #14	TAP1 (ENSCJAG00000021552) #16	PSMB9 (ENSCJAG00000021553) #17	HLA-DMA (ENSCJAG00000021558) #20	ENSCJAG00000021566 #22	HLA-DOA (ENSCJAG00000021571) #23	HLA-DPA1 (ENSCJAG00000057301) #26	HLA-DPB1 (ENSCJAG00000021575)	COL11A2 (ENSCJAG00000021577)	RXRB (ENSCJAG00000021619)	SLC39A7 (ENSCJAG00000021622)	ENSCJAG00000021632	RING1 (ENSCJAG00000081691)	VPS52 (ENSCJAG00000021644)	ENSCJAG00000021650	B3GALT4 (ENSCJAG00000043225)	WDR46 (ENSCJAG00000021659)	PFDN6 (ENSCJAG00000021665)	RGL2 (ENSCJAG00000021668)	TAPBP (ENSCJAG00000021675)
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153385.b.a.b.mc ##22
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00510000049371.a	ENSGT00390000007658.h	ENSGT00390000015471	ENSGT00390000008338	ENSGT00390000007464	ENSGT00390000008549	ENSGT00490000043472	ENSGT00940000159474	ENSGT00940000154674.i.b	ENSGT00940000156450	ENSGT00940000156945	ENSGT00530000063460.A.a	ENSGT00940000160126	ENSGT00940000160247	ENSGT00940000158038	ENSGT00940000153385.b.a.b.mc ##22	ENSGT00390000007027	ENSGT00390000018245.d	ENSGT00940000157721	ENSGT01000000214434.F	ENSGT00940000159251	ENSGT00940000155417	ENSGT00390000008678	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.a	ENSGT00910000147158	ENSGT00940000157668.e	ENSGT00940000155136	ENSGT00940000158468	ENSGT00910000144243.e	ENSGT00940000156746	ENSGT00940000155661
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00510000049371.a	ENSGT00390000007658.h	ENSGT00390000015471	ENSGT00390000008338.i	ENSGT00390000007464	ENSGT00390000008549	ENSGT00490000043472	ENSGT00940000159474	ENSGT00940000154674.i.b	ENSGT00940000156450	ENSGT00940000156945	ENSGT00530000063460.A.a	ENSGT00940000160126	ENSGT00940000160247	ENSGT00940000158038	ENSGT00940000153385.b.a.b.mc ##22	ENSGT00390000007027	ENSGT00390000018245.d	ENSGT00940000157721	ENSGT01000000214434.F	ENSGT00940000159251	ENSGT00940000155417	ENSGT00390000008678	ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.a	ENSGT00910000147158	ENSGT00940000157668.e	ENSGT00940000155136	ENSGT00940000158468	ENSGT00910000144243.e.a	ENSGT00940000156746	ENSGT00940000155661
Capuchin	MODERN SPECIES	163	TTC22 (ENSCCAG00000033419)	LEXM (ENSCCAG00000027952)	ENSCCAG00000028192	TMEM61 (ENSCCAG00000024822)	BSND (ENSCCAG00000021350)	ENSCCAG00000030255	PCSK9 (ENSCCAG00000036131)	USP24 (ENSCCAG00000027655)	ENSCCAG00000022168	PLPP3 (ENSCCAG00000001330)	PRKAA2 (ENSCCAG00000035336)	FYB2 (ENSCCAG00000027589)	C8A (ENSCCAG00000024662)	C8B (ENSCCAG00000031384)	DAB1 (ENSCCAG00000024787)	ENSCCAG00000022246 ##22	OMA1 (ENSCCAG00000022811)	TACSTD2 (ENSCCAG00000032228)	MYSM1 (ENSCCAG00000029058)	FGGY (ENSCCAG00000033989)	ENSCCAG00000025106	HOOK1 (ENSCCAG00000006471)	CYP2J2 (ENSCCAG00000027549)	C1orf87 (ENSCCAG00000027605)
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	45	TTC4 (ENSSBOG00000032224)	TTC22 (ENSSBOG00000026280)	LEXM (ENSSBOG00000006931)	DHCR24 (ENSSBOG00000025550)	TMEM61 (ENSSBOG00000013875)	BSND (ENSSBOG00000035713)	PCSK9 (ENSSBOG00000029957)	USP24 (ENSSBOG00000022906)	ENSSBOG00000031773	PLPP3 (ENSSBOG00000021254)	PRKAA2 (ENSSBOG00000036202)	FYB2 (ENSSBOG00000024468)	C8A (ENSSBOG00000023783)	C8B (ENSSBOG00000034357)	DAB1 (ENSSBOG00000030885)	ENSSBOG00000024749 ##22	OMA1 (ENSSBOG00000023199)	TACSTD2 (ENSSBOG00000024148)	MYSM1 (ENSSBOG00000031552)	ENSSBOG00000029734	FGGY (ENSSBOG00000031213)	HOOK1 (ENSSBOG00000032069)	CYP2J2 (ENSSBOG00000033096)	C1orf87 (ENSSBOG00000033425)	ENSSBOG00000024205	NFIA (ENSSBOG00000030190)	ENSSBOG00000028260	ENSSBOG00000028010	PATJ (ENSSBOG00000022857)	KANK4 (ENSSBOG00000020644)	USP1 (ENSSBOG00000020735)
Marmoset	MODERN SPECIES	19	TTC4 (ENSCJAG00000015611)	TTC22 (ENSCJAG00000015639)	LEXM (ENSCJAG00000015646)	DHCR24 (ENSCJAG00000015653)	TMEM61 (ENSCJAG00000015669)	BSND (ENSCJAG00000042101)	PCSK9 (ENSCJAG00000015682)	USP24 (ENSCJAG00000015739)	PLPP3 (ENSCJAG00000015880)	ENSCJAG00000054878	PRKAA2 (ENSCJAG00000015889)	FYB2 (ENSCJAG00000015907)	C8A (ENSCJAG00000015926)	C8B (ENSCJAG00000015932)	DAB1 (ENSCJAG00000015941)	ENSCJAG00000022997 ##22	ENSCJAG00000070548	ENSCJAG00000084546	OMA1 (ENSCJAG00000016000)	ENSCJAG00000074487	TACSTD2 (ENSCJAG00000016017)	MYSM1 (ENSCJAG00000016020)	FGGY (ENSCJAG00000016043)	ENSCJAG00000022957	HOOK1 (ENSCJAG00000016077)	CYP2J2 (ENSCJAG00000016130)	C1orf87 (ENSCJAG00000016137)	ENSCJAG00000053189	ENSCJAG00000022998	NFIA (ENSCJAG00000016165)	ENSCJAG00000078946