Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000162484	ENSGT00940000160997	ENSGT00940000154993.k.b #7	ENSGT00940000154993.k.a #8	ENSGT00940000161821.k ##9	ENSGT00940000154723.b #13	ENSGT00940000161821.l.a #9	ENSGT00940000162353.i #15	ENSGT00860000136204	ENSGT00940000160499 #16	ENSGT00940000157293 #17	ENSGT00940000159023 #18	ENSGT00940000159897 #19	ENSGT00940000160381 #20	ENSGT00940000161157 #21	ENSGT00940000153385.b.a.b #22	ENSGT00940000162112 #23	ENSGT00940000162498 #24	ENSGT00940000162390 #25	ENSGT00940000159762 #26	ENSGT00940000159208.B #27	ENSGT00940000160076 #28	ENSGT00940000160668 #29	ENSGT00940000161022 #30	ENSGT00390000008815 #31	ENSGT00390000012691.d #32	ENSGT00940000161798 #33	ENSGT00390000007075 #34	ENSGT00390000010512 #35	ENSGT00940000161403 #36	ENSGT00940000159200 #37
Alpin marmot	DUPLICATION
Alpin marmot	MODERN SPECIES	20	ENSMMMG00000018777 #7	ENSMMMG00000018780 #8	ENSMMMG00000018785 #9	ENSMMMG00000018797 #10	ENSMMMG00000018808 #11	ENSMMMG00000020395 #12	ENSMMMG00000024056 #13	ENSMMMG00000024215 #14	HLA-DOB (ENSMMMG00000024217) #15	TAP2 (ENSMMMG00000024218) #16	PSMB8 (ENSMMMG00000024220) #17	TAP1 (ENSMMMG00000024221) #18	PSMB9 (ENSMMMG00000024222) #19	HLA-DMB (ENSMMMG00000024223) #20	HLA-DMA (ENSMMMG00000024224) #21	BRD2 (ENSMMMG00000024225) #22	HLA-DOA (ENSMMMG00000024226) #23	HLA-DPA1 (ENSMMMG00000024227) #24	HLA-DPB1 (ENSMMMG00000024228) #25	COL11A2 (ENSMMMG00000024229) #26	RXRB (ENSMMMG00000024230) #27	SLC39A7 (ENSMMMG00000024231) #28	HSD17B8 (ENSMMMG00000024232) #29	RING1 (ENSMMMG00000024233) #30	VPS52 (ENSMMMG00000024234) #31	ENSMMMG00000024235 #32	B3GALT4 (ENSMMMG00000024236) #33	WDR46 (ENSMMMG00000024237) #34	PFDN6 (ENSMMMG00000024238) #35	RGL2 (ENSMMMG00000024239) #36	TAPBP (ENSMMMG00000024240) #37
Alpin marmot	MODERN SPECIES	24	ENSMMMG00000023121	RAB8A (ENSMMMG00000023118)	TPM4 (ENSMMMG00000022621)	ENSMMMG00000022612	ENSMMMG00000022610	ENSMMMG00000022564	ENSMMMG00000022557	CYP4F2 (ENSMMMG00000022533)	CYP4F8 (ENSMMMG00000022511)	CYP4F22 (ENSMMMG00000022504)	PGLYRP2 (ENSMMMG00000022496)	RASAL3 (ENSMMMG00000022474)	ENSMMMG00000022459	AKAP8L (ENSMMMG00000022438)	AKAP8 (ENSMMMG00000022416)	ENSMMMG00000022411 ##22	ENSMMMG00000022407	EPHX3 (ENSMMMG00000022401)	NOTCH3 (ENSMMMG00000022356)	ENSMMMG00000022351	ILVBL (ENSMMMG00000022300)	SYDE1 (ENSMMMG00000022294)	OR1I1 (ENSMMMG00000022293)	CASP14 (ENSMMMG00000022289)	CCDC105 (ENSMMMG00000022286)	SLC1A6 (ENSMMMG00000022279)	ENSMMMG00000022278	ENSMMMG00000022277	ENSMMMG00000022259	ENSMMMG00000022258	ENSMMMG00000022253
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	8								ENSGT00940000162353.i #15	ENSGT00860000136204	ENSGT00940000160499 #16	ENSGT00940000157293 #17	ENSGT00940000159023 #18	ENSGT00940000159897 #19	ENSGT00940000160381 #20	ENSGT00940000161157 #21	ENSGT00940000153385.b.a.b #22	ENSGT00940000162112 #23	ENSGT00940000162498 #24	ENSGT00940000162390 #25	ENSGT00940000159762 #26	ENSGT00940000159208.B #27	ENSGT00940000160076 #28	ENSGT00940000160668 #29	ENSGT00940000161022 #30	ENSGT00390000008815 #31	ENSGT00390000012691.d #32	ENSGT00940000161798 #33	ENSGT00390000007075 #34	ENSGT00390000010512 #35	ENSGT00940000161403 #36	ENSGT00940000159200 #37
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	25														HLA-DMB (ENSUPAG00010005014) #20	HLA-DMA (ENSUPAG00010005022) #21	BRD2 (ENSUPAG00010005033) #22	HLA-DOA (ENSUPAG00010005068) #23	HLA-DPB1 (ENSUPAG00010005123) #25	HLA-DPA1 (ENSUPAG00010012558) #24	COL11A2 (ENSUPAG00010012591) #26	RXRB (ENSUPAG00010013376) #27	SLC39A7 (ENSUPAG00010013405) #28	HSD17B8 (ENSUPAG00010013412) #29	RING1 (ENSUPAG00010013424) #30	VPS52 (ENSUPAG00010013433) #31	ENSUPAG00010013506 #32	B3GALT4 (ENSUPAG00010013513) #33	WDR46 (ENSUPAG00010013516) #34	PFDN6 (ENSUPAG00010013562) #35	RGL2 (ENSUPAG00010013583) #36	TAPBP (ENSUPAG00010013596) #37
Squirrel	MODERN SPECIES	76							ENSSTOG00000028098 ##14	HLA-DOB (ENSSTOG00000003405) #15	ENSSTOG00000030715	TAP2 (ENSSTOG00000003413) #16	PSMB8 (ENSSTOG00000019724) #17	TAP1 (ENSSTOG00000003451) #18	PSMB9 (ENSSTOG00000003475) #19	HLA-DMB (ENSSTOG00000019821) #20	HLA-DMA (ENSSTOG00000009246) #21	BRD2 (ENSSTOG00000010807) #22	HLA-DOA (ENSSTOG00000010820) #23	HLA-DPA1 (ENSSTOG00000003558) #24	HLA-DPB1 (ENSSTOG00000003567) #25	COL11A2 (ENSSTOG00000003578) #26	RXRB (ENSSTOG00000027099) #27	SLC39A7 (ENSSTOG00000014304) #28	HSD17B8 (ENSSTOG00000020853) #29	RING1 (ENSSTOG00000026166) #30	VPS52 (ENSSTOG00000002397) #31	ENSSTOG00000002417 #32	B3GALT4 (ENSSTOG00000024877) #33	WDR46 (ENSSTOG00000002433) #34	PFDN6 (ENSSTOG00000027428) #35	RGL2 (ENSSTOG00000024728) #36	TAPBP (ENSSTOG00000025004) #37