Eutheria DUPLICATION Eutheria DUPLICATION Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.a #22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.a #22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.a #22 Primates ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00530000063777.b ENSGT00940000158611 ENSGT00940000158258 ENSGT00550000074822 ENSGT00550000075011 ENSGT00530000063861.b.b ENSGT00940000154549.a #7 ENSGT00940000156233 #9 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.a #12 ENSGT00940000154382.a.b #15 ENSGT00390000008285 #16 ENSGT00390000018446 #17 ENSGT00390000017965 #18 ENSGT00940000156166.a #19 ENSGT00940000153846.a.a #20 ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.a #22 ENSGT00390000006452.b.b #23 ENSGT00950000183180.b #26 ENSGT00940000155468 #27 ENSGT00940000153190.A #28 ENSGT00550000075010 #29 ENSGT00950000183047.c.b #30 ENSGT00940000154130.a.a.b #31 ENSGT00510000048142 #32 ENSGT00510000047658 #34 ENSGT00940000155624.b #35 ENSGT00950000183110.b.b #36 ENSGT00950000182955.a.a.a ENSGT00390000012668 ENSGT00940000160336 ENSGT00940000154539.b Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00530000063777.b ENSGT00940000158611 ENSGT00940000158258 ENSGT00550000074822 ENSGT00550000075011 ENSGT00530000063861.b.b ENSGT00940000154549.a #7 ENSGT00940000156233 #9 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.a #12 ENSGT00940000154382.a.b #15 ENSGT00390000008285 #16 ENSGT00390000018446 #17 ENSGT00390000017965 #18 ENSGT00940000156166.a #19 ENSGT00940000153846.a.a #20 ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.a #22 ENSGT00390000006452.b.b #23 ENSGT00950000183180.b #26 ENSGT00940000155468 #27 ENSGT00940000153190.A #28 ENSGT00550000075010 #29 ENSGT00950000183047.c.b #30 ENSGT00940000154130.a.a.b #31 ENSGT00510000048142 #32 ENSGT00510000047658 #34 ENSGT00940000155624.b #35 ENSGT00950000183110.b.b #36 ENSGT00950000182955.a.a.a ENSGT00390000012668 ENSGT00940000160336 ENSGT00940000154539.b Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00530000063777.b ENSGT00940000158611 ENSGT00940000158258 ENSGT00550000074822 ENSGT00550000075011 ENSGT00530000063861.b.b ENSGT00940000154549.a #7 ENSGT00940000156233 #9 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.a #12 ENSGT00940000154382.a.b #15 ENSGT00390000008285 #16 ENSGT00390000018446 #17 ENSGT00390000017965 #18 ENSGT00940000156166.a #19 ENSGT00940000153846.a.a #20 ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.a #22 ENSGT00390000006452.b.b #23 ENSGT00950000183180.b #26 ENSGT00940000155468 #27 ENSGT00940000153190.A #28 ENSGT00550000075010 #29 ENSGT00950000183047.c.b #30 ENSGT00940000154130.a.a.b #31 ENSGT00510000048142 #32 ENSGT00510000047658 #34 ENSGT00940000155624.b #35 ENSGT00950000183110.b.b #36 ENSGT00950000182955.a.a.a ENSGT00390000012668 ENSGT00940000160336 ENSGT00940000154539.b Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00530000063777.b ENSGT00940000158611 ENSGT00940000158258 ENSGT00550000074822 ENSGT00550000075011 ENSGT00530000063861.b.b ENSGT00940000154549.a #7 ENSGT00940000156233 #9 ENSGT00940000154382.a.b #15 ENSGT00390000008285 #16 ENSGT00390000018446 #17 ENSGT00390000017965 #18 ENSGT00940000156166.a #19 ENSGT00940000153846.a.a #20 ENSGT00950000182965.a.b.b.b.g.b.a.a #21 ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.a #22 ENSGT00390000006452.b.b #23 ENSGT00950000183180.b #26 ENSGT00940000155468 #27 ENSGT00940000153190.A.f #28 ENSGT00550000075010 #29 ENSGT00950000183047.c.b #30 ENSGT00940000154130.a.a.b #31 ENSGT00510000048142 #32 ENSGT00510000047658 #34 ENSGT00940000155624.b #35 ENSGT00950000183110.b.b #36 ENSGT00950000182955.a.a.a ENSGT00390000012668 ENSGT00940000160336 ENSGT00940000154539.b.db Cebidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00530000063777.b ENSGT00940000158611 ENSGT00940000158258 ENSGT00550000074822 ENSGT00550000075011 ENSGT00530000063861.b.b ENSGT00940000154549.a #7 ENSGT00940000156233 #9 ENSGT00940000154382.a.b #15 ENSGT00390000008285 #16 ENSGT00390000018446 #17 ENSGT00390000017965 #18 ENSGT00940000156166.a #19 ENSGT00940000153846.a.a #20 ENSGT00950000182965.a.b.b.b.g.b.a.a #21 ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.a #22 ENSGT00390000006452.b.b #23 ENSGT00950000183180.b #26 ENSGT00940000155468 #27 ENSGT00940000153190.A.f #28 ENSGT00550000075010 #29 ENSGT00950000183047.c.b #30 ENSGT00940000154130.a.a.b #31 ENSGT00510000048142 #32 ENSGT00510000047658 #34 ENSGT00940000155624.b #35 ENSGT00950000183110.b.b #36 ENSGT00950000182955.a.a.a ENSGT00390000012668 ENSGT00940000160336 ENSGT00940000154539.b.db Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 81 ENSGT00530000063777.b ENSGT00940000158611 ENSGT00940000158258 ENSGT00550000074822 ENSGT00550000075011 ENSGT00530000063861.b.b ENSGT00940000154549.a #7 ENSGT00940000156233 #9 ENSGT00940000154382.a.b #15 ENSGT00390000008285 #16 ENSGT00390000018446 #17 ENSGT00390000017965 #18 ENSGT00940000156166.a #19 ENSGT00940000153846.a.a #20 ENSGT00950000182965.a.b.b.b.g.b.a.a #21 ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.a #22 ENSGT00390000006452.b.b #23 ENSGT00950000183180.b #26 ENSGT00940000155468 #27 ENSGT00940000153190.A.f #28 ENSGT00550000075010 #29 ENSGT00950000183047.c.b #30 ENSGT00940000154130.a.a.b #31 ENSGT00510000048142 #32 ENSGT00510000047658 #34 ENSGT00940000155624.b #35 ENSGT00950000183110.b.b #36 ENSGT00950000182955.a.a.a ENSGT00390000012668 ENSGT00940000160336 ENSGT00940000154539.b.db Capuchin MODERN SPECIES 166 BRDT (ENSCCAG00000031906) #7 ENSCCAG00000025258 #8 EPHX4 (ENSCCAG00000029678) #9 ENSCCAG00000038015 #10 ENSCCAG00000027791 #11 ENSCCAG00000033925 #12 ENSCCAG00000036616 #13 ENSCCAG00000029619 #14 BTBD8 (ENSCCAG00000031364) #15 C1orf146 (ENSCCAG00000032973) #16 GLMN (ENSCCAG00000038123) #17 RPAP2 (ENSCCAG00000024859) #18 GFI1 (ENSCCAG00000036072) #19 EVI5 (ENSCCAG00000034070) #20 ENSCCAG00000021472 #21 RPL5 (ENSCCAG00000024885) #22 DIPK1A (ENSCCAG00000033496) #23 ENSCCAG00000031400 #24 ENSCCAG00000026616 #25 MTF2 (ENSCCAG00000037974) #26 TMED5 (ENSCCAG00000036284) #27 CCDC18 (ENSCCAG00000030645) #28 DR1 (ENSCCAG00000030021) #29 FNBP1L (ENSCCAG00000034576) #30 BCAR3 (ENSCCAG00000036151) #31 DNTTIP2 (ENSCCAG00000025785) #32 ENSCCAG00000019911 #33 GCLM (ENSCCAG00000017215) #34 ABCA4 (ENSCCAG00000033955) #35 ARHGAP29 (ENSCCAG00000024973) #36 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 80 FBXO33 (ENSSBOG00000027477) ENSSBOG00000031800 ENSSBOG00000021770 ENSSBOG00000035727 LRFN5 (ENSSBOG00000029859) ENSSBOG00000002303 #22 FSCB (ENSSBOG00000023329) ENSSBOG00000019589 C14orf28 (ENSSBOG00000022243) KLHL28 (ENSSBOG00000026587) TOGARAM1 (ENSSBOG00000023110) PRPF39 (ENSSBOG00000029641) FKBP3 (ENSSBOG00000033978) FANCM (ENSSBOG00000030882) MIS18BP1 (ENSSBOG00000025159) ENSSBOG00000034100 RPL10L (ENSSBOG00000018952) MDGA2 (ENSSBOG00000033263) ENSSBOG00000029350 ENSSBOG00000022302 ENSSBOG00000034651 Marmoset DUPLICATION Marmoset DUPLICATION Marmoset MODERN SPECIES 3 MYOZ1 (ENSCJAG00000067787) USP54 (ENSCJAG00000001615) PPP3CB (ENSCJAG00000001651) MSS51 (ENSCJAG00000001711) ENSCJAG00000001720 ENSCJAG00000082584 CFAP70 (ENSCJAG00000001756) ENSCJAG00000072911 MRPS16 (ENSCJAG00000007538) DNAJC9 (ENSCJAG00000007535) FAM149B1 (ENSCJAG00000007526) ECD (ENSCJAG00000007511) NUDT13 (ENSCJAG00000007475) ENSCJAG00000044852 P4HA1 (ENSCJAG00000007429) ENSCJAG00000023337 #22 PLA2G12B (ENSCJAG00000007420) OIT3 (ENSCJAG00000007405) MCU (ENSCJAG00000007351) MICU1 (ENSCJAG00000007320) ENSCJAG00000074108 ENSCJAG00000007303 DDIT4 (ENSCJAG00000069599) ASCC1 (ENSCJAG00000007273) ANAPC16 (ENSCJAG00000086671) ENSCJAG00000075810 SPOCK2 (ENSCJAG00000007252) ENSCJAG00000007248 PSAP (ENSCJAG00000012992) CDH23 (ENSCJAG00000034339) ENSCJAG00000007203 Marmoset MODERN SPECIES 9 TNFSF4 (ENSCJAG00000048673) ENSCJAG00000043129 ENSCJAG00000069740 TEX50 (ENSCJAG00000041421) ANKRD45 (ENSCJAG00000051615) KLHL20 (ENSCJAG00000009306) CENPL (ENSCJAG00000009304) DARS2 (ENSCJAG00000009241) ZBTB37 (ENSCJAG00000009215) SERPINC1 (ENSCJAG00000009182) RC3H1 (ENSCJAG00000009106) ENSCJAG00000063911 RABGAP1L (ENSCJAG00000009018) ENSCJAG00000001398 ENSCJAG00000008986 ENSCJAG00000011973 #22 TNN (ENSCJAG00000008930) KIAA0040 (ENSCJAG00000044275) ENSCJAG00000082477 TNR (ENSCJAG00000008829) ENSCJAG00000086955 COP1 (ENSCJAG00000008662) ENSCJAG00000086420 ENSCJAG00000081200 PAPPA2 (ENSCJAG00000008617) ENSCJAG00000081137 ASTN1 (ENSCJAG00000008558) BRINP2 (ENSCJAG00000085990) SEC16B (ENSCJAG00000008493) ENSCJAG00000066036 RASAL2 (ENSCJAG00000008458) Marmoset MODERN SPECIES 19 CDC7 (ENSCJAG00000045959) TGFBR3 (ENSCJAG00000001778) ENSCJAG00000010406 BRDT (ENSCJAG00000017507) #7 BTBD8 (ENSCJAG00000017540) #15 C1orf146 (ENSCJAG00000017547) #16 GLMN (ENSCJAG00000017552) #17 RPAP2 (ENSCJAG00000017591) #18 ENSCJAG00000022354 GFI1 (ENSCJAG00000017609) #19 EVI5 (ENSCJAG00000017619) #20 ENSCJAG00000073420 ENSCJAG00000079907 ##21 ENSCJAG00000014949 ENSCJAG00000076513 ENSCJAG00000017673 #22 DIPK1A (ENSCJAG00000017678) #23 ENSCJAG00000022564 ##24 MTF2 (ENSCJAG00000017687) #26 TMED5 (ENSCJAG00000017759) #27 CCDC18 (ENSCJAG00000017774) #28 FNBP1L (ENSCJAG00000017821) #30 BCAR3 (ENSCJAG00000017873) #31 DNTTIP2 (ENSCJAG00000017896) #32 GCLM (ENSCJAG00000017899) #34 ABCA4 (ENSCJAG00000017910) #35 ARHGAP29 (ENSCJAG00000018008) #36 ENSCJAG00000081033 ABCD3 (ENSCJAG00000018054) ENSCJAG00000018108 ENSCJAG00000081383 Mas night monkey MODERN SPECIES 366 BTBD8 (ENSANAG00000027755) #15 C1orf146 (ENSANAG00000025057) #16 GLMN (ENSANAG00000021000) #17 RPAP2 (ENSANAG00000027517) #18 GFI1 (ENSANAG00000019656) #19 EVI5 (ENSANAG00000022148) #20 ENSANAG00000030407 #21 RPL5 (ENSANAG00000030599) #22 DIPK1A (ENSANAG00000030882) #23 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000158258 ENSGT00550000074822 ENSGT00550000075011 ENSGT00530000063965.o.a ENSGT01020000230401.b.a.m.b ENSGT00530000063861.b.b ENSGT00940000154549.a #7 ENSGT00940000156233 #9 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.a #12 ENSGT00940000154382.a.b #15 ENSGT00390000008285 #16 ENSGT00390000018446 #17 ENSGT00390000017965 #18 ENSGT00940000156166.a #19 ENSGT00940000153846.a.a #20 ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.a #22 ENSGT00390000006452.b.b #23 ENSGT00950000183180.b #26 ENSGT00940000155468 #27 ENSGT00940000153190.A #28 ENSGT00550000075010 #29 ENSGT00950000183047.c.b #30 ENSGT00940000154130.a.a.b #31 ENSGT00510000048142.j #32 ENSGT00510000048142.i #32 ENSGT00510000047658 #34 ENSGT00940000155624.b #35 ENSGT00950000183110.b.b #36 ENSGT00950000182955.a.a.a ENSGT00390000012668 ENSGT00940000160336 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000158258 ENSGT00550000074822 ENSGT00550000075011 ENSGT00530000063965.o.a ENSGT01020000230401.b.a.m.b ENSGT00530000063861.b.b ENSGT00940000154549.a #7 ENSGT00940000156233 #9 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.a #12 ENSGT00940000154382.a.b #15 ENSGT00390000008285 #16 ENSGT00390000018446 #17 ENSGT00390000017965 #18 ENSGT00940000156166.a #19 ENSGT00940000153846.a.a #20 ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.a #22 ENSGT00390000006452.b.b #23 ENSGT00950000183180.b #26 ENSGT00940000155468 #27 ENSGT00940000153190.A #28 ENSGT00550000075010 #29 ENSGT00950000183047.c.b #30 ENSGT00940000154130.a.a.b #31 ENSGT00510000048142.j #32 ENSGT00510000047658 #34 ENSGT00940000155624.b #35 ENSGT00950000183110.b.b #36 ENSGT00950000182955.a.a.a ENSGT00390000012668 ENSGT00940000160336 ENSGT00940000154539.b Gibbon MODERN SPECIES 2 CDC7 (ENSNLEG00000010319) ENSNLEG00000033782 ENSNLEG00000029575 #33 ENSNLEG00000030279 TGFBR3 (ENSNLEG00000010335) BRDT (ENSNLEG00000010376) #7 EPHX4 (ENSNLEG00000010405) #9 ENSNLEG00000028497 #14 ENSNLEG00000010412 #12 ENSNLEG00000010418 #15 C1orf146 (ENSNLEG00000010426) #16 GLMN (ENSNLEG00000010431) #17 RPAP2 (ENSNLEG00000010446) #18 GFI1 (ENSNLEG00000010470) #19 EVI5 (ENSNLEG00000010486) #20 RPL5 (ENSNLEG00000010500) #22 DIPK1A (ENSNLEG00000010507) #23 ENSNLEG00000032162 MTF2 (ENSNLEG00000010513) #26 TMED5 (ENSNLEG00000010590) #27 CCDC18 (ENSNLEG00000010606) #28 DR1 (ENSNLEG00000010667) #29 FNBP1L (ENSNLEG00000010681) #30 BCAR3 (ENSNLEG00000010748) #31 DNTTIP2 (ENSNLEG00000010816) #32 GCLM (ENSNLEG00000010871) #34 ABCA4 (ENSNLEG00000010897) #35 ARHGAP29 (ENSNLEG00000010961) #36 ABCD3 (ENSNLEG00000011044) F3 (ENSNLEG00000011112) SLC44A3 (ENSNLEG00000011128) Hominidae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000158258 ENSGT00550000074822 ENSGT00550000075011 ENSGT00530000063965.o.a ENSGT01020000230401.b.a.m.b ENSGT00530000063861.b.b ENSGT00940000154549.a #7 ENSGT00940000156233 #9 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.a #12 ENSGT00940000154382.a.b #15 ENSGT00390000008285 #16 ENSGT00390000018446 #17 ENSGT00390000017965 #18 ENSGT00940000156166.a #19 ENSGT00940000153846.a.a #20 ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.a #22 ENSGT00390000006452.b.b #23 ENSGT00950000183180.b #26 ENSGT00940000155468 #27 ENSGT00940000153190.A #28 ENSGT00550000075010 #29 ENSGT00950000183047.c.b #30 ENSGT00940000154130.a.a.b #31 ENSGT00510000048142.j #32 ENSGT00510000047658 #34 ENSGT00940000155624.b #35 ENSGT00950000183110.b.b #36 ENSGT00950000182955.a.a.a ENSGT00390000012668 ENSGT00940000160336 ENSGT00940000154539.b Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00550000074822 ENSGT00940000155807.a.b ENSGT00550000075011 ENSGT00530000063965.o.a ENSGT01020000230401.b.a.m.b ENSGT00530000063861.b.b ENSGT00940000154549.a #7 ENSGT00940000156233 #9 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.a #12 ENSGT00940000154382.a.b #15 ENSGT00390000008285 #16 ENSGT00390000018446 #17 ENSGT00390000017965 #18 ENSGT00940000156166.a #19 ENSGT00940000153846.a.a #20 ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.a #22 ENSGT00390000006452.b.b #23 ENSGT00950000183180.b #26 ENSGT00940000155468 #27 ENSGT00940000153190.A #28 ENSGT00550000075010 #29 ENSGT00950000183047.c.b #30 ENSGT00940000154130.a.a.b #31 ENSGT00510000048142.j #32 ENSGT00510000047658 #34 ENSGT00940000155624.b #35 ENSGT00950000183110.b.b #36 ENSGT00950000182955.a.a.a ENSGT00390000012668 ENSGT00940000160336 ENSGT00940000154539.b Gorilla MODERN SPECIES HFM1 (ENSGGOG00000038524) FEN1 (ENSGGOG00000022237) CDC7 (ENSGGOG00000007545) ENSGGOG00000041760 ENSGGOG00000003216 TGFBR3 (ENSGGOG00000000922) BRDT (ENSGGOG00000022996) #7 EPHX4 (ENSGGOG00000000116) #9 ENSGGOG00000013288 #12 ENSGGOG00000000596 #15 C1orf146 (ENSGGOG00000006653) #16 GLMN (ENSGGOG00000006658) #17 RPAP2 (ENSGGOG00000006674) #18 GFI1 (ENSGGOG00000005320) #19 EVI5 (ENSGGOG00000024347) #20 RPL5 (ENSGGOG00000002699) #22 DIPK1A (ENSGGOG00000000881) #23 ENSGGOG00000043223 ##22 MTF2 (ENSGGOG00000001308) #26 TMED5 (ENSGGOG00000016111) #27 CCDC18 (ENSGGOG00000016744) #28 DR1 (ENSGGOG00000028511) #29 FNBP1L (ENSGGOG00000015943) #30 BCAR3 (ENSGGOG00000001635) #31 DNTTIP2 (ENSGGOG00000000575) #32 GCLM (ENSGGOG00000016426) #34 ABCA4 (ENSGGOG00000008804) #35 ARHGAP29 (ENSGGOG00000002269) #36 ABCD3 (ENSGGOG00000009815) F3 (ENSGGOG00000014683) SLC44A3 (ENSGGOG00000013852) Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000158258 ENSGT00550000074822 ENSGT00940000155807.a.b ENSGT00550000075011 ENSGT01020000230401.b.a.m.b ENSGT00530000063861.b.b ENSGT00940000154549.a #7 ENSGT00940000156233 #9 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.a #12 ENSGT00940000154382.a.b #15 ENSGT00390000008285 #16 ENSGT00390000018446 #17 ENSGT00390000017965 #18 ENSGT00940000156166.a #19 ENSGT00940000153846.a.a #20 ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.a #22 ENSGT00390000006452.b.b #23 ENSGT00950000183180.b #26 ENSGT00940000155468 #27 ENSGT00940000153190.A #28 ENSGT00550000075010 #29 ENSGT00950000183047.c.b #30 ENSGT00940000154130.a.a.b #31 ENSGT00510000048142.j #32 ENSGT00510000047658 #34 ENSGT00940000155624.b #35 ENSGT00950000183110.b.b #36 ENSGT00950000182955.a.a.a ENSGT00390000012668 ENSGT00940000160336 ENSGT00940000154539.b Human MODERN SPECIES ZNF326 (ENSG00000162664) BARHL2 (ENSG00000143032) ZNF644 (ENSG00000122482) HFM1 (ENSG00000162669) CDC7 (ENSG00000097046) TGFBR3 (ENSG00000069702) BRDT (ENSG00000137948) #7 EPHX4 (ENSG00000172031) #9 SETSIP (ENSG00000230667) BTBD8 (ENSG00000189195) #15 C1orf146 (ENSG00000203910) #16 GLMN (ENSG00000174842) #17 RPAP2 (ENSG00000122484) #18 GFI1 (ENSG00000162676) #19 EVI5 (ENSG00000067208) #20 RPL5 (ENSG00000122406) #22 DIPK1A (ENSG00000154511) #23 MTF2 (ENSG00000143033) #26 TMED5 (ENSG00000117500) #27 CCDC18 (ENSG00000122483) #28 DR1 (ENSG00000117505) #29 FNBP1L (ENSG00000137942) #30 BCAR3 (ENSG00000137936) #31 DNTTIP2 (ENSG00000067334) #32 GCLM (ENSG00000023909) #34 ABCA4 (ENSG00000198691) #35 ARHGAP29 (ENSG00000137962) #36 ABCD3 (ENSG00000117528) F3 (ENSG00000117525) SLC44A3 (ENSG00000143036) CNN3 (ENSG00000117519) Pan ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158258 ENSGT00550000074822 ENSGT00940000155807.a.b ENSGT00550000075011 ENSGT01020000230401.b.a.m.b ENSGT00530000063861.b.b ENSGT00940000154549.a #7 ENSGT00940000156233 #9 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.a #12 ENSGT00940000154382.a.b #15 ENSGT00390000008285 #16 ENSGT00390000018446 #17 ENSGT00390000017965 #18 ENSGT00940000156166.a #19 ENSGT00940000153846.a.a #20 ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.a #22 ENSGT00390000006452.b.b #23 ENSGT00950000183180.b #26 ENSGT00940000155468 #27 ENSGT00940000153190.A #28 ENSGT00550000075010 #29 ENSGT00950000183047.c.b #30 ENSGT00940000154130.a.a.b #31 ENSGT00510000048142.j #32 ENSGT00510000047658 #34 ENSGT00940000155624.b #35 ENSGT00950000183110.b.b #36 ENSGT00950000182955.a.a.a ENSGT00390000012668 ENSGT00940000160336 ENSGT00940000154539.b Chimpanzee MODERN SPECIES HFM1 (ENSPTRG00000000948) ENSPTRG00000046089 CDC7 (ENSPTRG00000043247) ENSPTRG00000046708 TGFBR3 (ENSPTRG00000000952) BRDT (ENSPTRG00000000954) #7 EPHX4 (ENSPTRG00000000955) #9 SETSIP (ENSPTRG00000052188) BTBD8 (ENSPTRG00000000956) #12 KIAA1107 (ENSPTRG00000000958) #15 C1H1orf146 (ENSPTRG00000030530) #16 GLMN (ENSPTRG00000000959) #17 RPAP2 (ENSPTRG00000000960) #18 GFI1 (ENSPTRG00000043053) #19 EVI5 (ENSPTRG00000000962) #20 RPL5 (ENSPTRG00000000963) #22 DIPK1A (ENSPTRG00000000964) #23 MTF2 (ENSPTRG00000000965) #26 TMED5 (ENSPTRG00000000966) #27 CCDC18 (ENSPTRG00000000967) #28 DR1 (ENSPTRG00000000969) #29 FNBP1L (ENSPTRG00000000970) #30 BCAR3 (ENSPTRG00000000971) #31 DNTTIP2 (ENSPTRG00000000972) #32 GCLM (ENSPTRG00000000973) #34 ABCA4 (ENSPTRG00000023377) #35 ARHGAP29 (ENSPTRG00000000975) #36 ABCD3 (ENSPTRG00000000976) F3 (ENSPTRG00000000977) SLC44A3 (ENSPTRG00000000978) CNN3 (ENSPTRG00000000979) Bonobo DUPLICATION Bonobo MODERN SPECIES 13 PARVB (ENSPPAG00000031463) SAMM50 (ENSPPAG00000029169) PNPLA3 (ENSPPAG00000028654) PNPLA5 (ENSPPAG00000027928) SULT4A1 (ENSPPAG00000011850) EFCAB6 (ENSPPAG00000041490) MPPED1 (ENSPPAG00000025568) SCUBE1 (ENSPPAG00000043522) TTLL12 (ENSPPAG00000036439) TSPO (ENSPPAG00000013888) MCAT (ENSPPAG00000039856) BIK (ENSPPAG00000028049) TTLL1 (ENSPPAG00000039915) PACSIN2 (ENSPPAG00000036909) ARFGAP3 (ENSPPAG00000039620) ENSPPAG00000040595 #22 A4GALT (ENSPPAG00000007549) CYB5R3 (ENSPPAG00000033956) POLDIP3 (ENSPPAG00000036619) ENSPPAG00000029825 SERHL2 (ENSPPAG00000037657) NFAM1 (ENSPPAG00000022085) TCF20 (ENSPPAG00000032271) ENSPPAG00000036828 ENSPPAG00000037463 NDUFA6 (ENSPPAG00000037220) SMDT1 (ENSPPAG00000036299) PHETA2 (ENSPPAG00000000902) NAGA (ENSPPAG00000034278) ENSPPAG00000040953 WBP2NL (ENSPPAG00000038703) Bonobo MODERN SPECIES ZNF644 (ENSPPAG00000039400) HFM1 (ENSPPAG00000024582) ENSPPAG00000042415 CDC7 (ENSPPAG00000024798) ENSPPAG00000035448 TGFBR3 (ENSPPAG00000027020) BRDT (ENSPPAG00000033868) #7 EPHX4 (ENSPPAG00000040443) #9 ENSPPAG00000025213 #12 ENSPPAG00000004959 #15 C1orf146 (ENSPPAG00000034258) #16 GLMN (ENSPPAG00000039704) #17 RPAP2 (ENSPPAG00000035306) #18 GFI1 (ENSPPAG00000042186) #19 EVI5 (ENSPPAG00000034071) #20 RPL5 (ENSPPAG00000027174) #22 DIPK1A (ENSPPAG00000043970) #23 MTF2 (ENSPPAG00000030002) #26 TMED5 (ENSPPAG00000027553) #27 CCDC18 (ENSPPAG00000029331) #28 DR1 (ENSPPAG00000027265) #29 FNBP1L (ENSPPAG00000029809) #30 BCAR3 (ENSPPAG00000029140) #31 DNTTIP2 (ENSPPAG00000044098) #32 GCLM (ENSPPAG00000042369) #34 ABCA4 (ENSPPAG00000035606) #35 ARHGAP29 (ENSPPAG00000020199) #36 ABCD3 (ENSPPAG00000039827) F3 (ENSPPAG00000033102) SLC44A3 (ENSPPAG00000038864) CNN3 (ENSPPAG00000027625) Orangutan DUPLICATION Orangutan MODERN SPECIES 13 SAMM50 (ENSPPYG00000011918) PNPLA3 (ENSPPYG00000029633) PNPLA5 (ENSPPYG00000011917) SULT4A1 (ENSPPYG00000011916) EFCAB6 (ENSPPYG00000011914) MPPED1 (ENSPPYG00000011913) SCUBE1 (ENSPPYG00000011912) TTLL12 (ENSPPYG00000011910) TSPO (ENSPPYG00000011909) MCAT (ENSPPYG00000011908) BIK (ENSPPYG00000011907) ENSPPYG00000011905 ENSPPYG00000040321 PACSIN2 (ENSPPYG00000011904) ARFGAP3 (ENSPPYG00000011903) ENSPPYG00000011902 #22 A4GALT (ENSPPYG00000011901) CYB5R3 (ENSPPYG00000011900) POLDIP3 (ENSPPYG00000011899) ENSPPYG00000032295 ENSPPYG00000011898 RRP7A (ENSPPYG00000011897) SERHL2 (ENSPPYG00000011896) NFAM1 (ENSPPYG00000011895) TCF20 (ENSPPYG00000011894) ENSPPYG00000035323 ENSPPYG00000011892 CYP2D6 (ENSPPYG00000011893) NDUFA6 (ENSPPYG00000011891) SMDT1 (ENSPPYG00000011890) PHETA2 (ENSPPYG00000011889) Orangutan MODERN SPECIES ZNF644 (ENSPPYG00000001164) ENSPPYG00000034790 ##22 HFM1 (ENSPPYG00000001163) CDC7 (ENSPPYG00000001162) ENSPPYG00000039807 ENSPPYG00000001161 TGFBR3 (ENSPPYG00000001160) BRDT (ENSPPYG00000001159) #7 EPHX4 (ENSPPYG00000001158) #9 BTBD8 (ENSPPYG00000029907) #15 C1orf146 (ENSPPYG00000001156) #16 GLMN (ENSPPYG00000001155) #17 RPAP2 (ENSPPYG00000001154) #18 GFI1 (ENSPPYG00000029385) #19 EVI5 (ENSPPYG00000001153) #20 RPL5 (ENSPPYG00000001152) #22 DIPK1A (ENSPPYG00000001151) #23 MTF2 (ENSPPYG00000001150) #26 TMED5 (ENSPPYG00000030133) #27 CCDC18 (ENSPPYG00000001148) #28 DR1 (ENSPPYG00000001147) #29 FNBP1L (ENSPPYG00000001146) #30 BCAR3 (ENSPPYG00000001145) #31 DNTTIP2 (ENSPPYG00000030204) #32 GCLM (ENSPPYG00000032580) #34 ABCA4 (ENSPPYG00000001142) #35 ARHGAP29 (ENSPPYG00000001141) #36 ABCD3 (ENSPPYG00000001140) F3 (ENSPPYG00000001139) SLC44A3 (ENSPPYG00000001138) CNN3 (ENSPPYG00000001137) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00550000074822 ENSGT00550000075011.c ENSGT00530000063965.o.a ENSGT01020000230401.b.a.m.b ENSGT00530000063861.b.b ENSGT00940000154549.a #7 ENSGT00940000156233 #9 ENSGT00940000164497 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.a #12 ENSGT00940000154382.a.b #15 ENSGT00390000008285 #16 ENSGT00390000018446 #17 ENSGT00390000017965 #18 ENSGT00940000156166.a #19 ENSGT00940000153846.a.a #20 ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.a #22 ENSGT00390000006452.b.b #23 ENSGT00950000183180.b #26 ENSGT00940000155468 #27 ENSGT00940000153190.A #28 ENSGT00550000075010 #29 ENSGT00950000183047.c.b #30 ENSGT00940000154130.a.a.b #31 ENSGT00510000048142.i #32 ENSGT00510000047658 #34 ENSGT00940000155624.b #35 ENSGT00950000183110.b.b #36 ENSGT00950000182955.a.a.a ENSGT00390000012668 ENSGT00940000160336 ENSGT00940000154539.b Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 212 ENSGT00940000153846.a.a #20 ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.a #22 ENSGT00390000006452.b.b #23 ENSGT00940000165912.a ENSGT00950000183180.b #26 ENSGT00940000155468 #27 ENSGT00940000153190.A #28 ENSGT00550000075010 #29 ENSGT00950000183047.c.b #30 ENSGT00940000154130.a.a.b #31 ENSGT00510000048142.i #32 ENSGT00510000047658 #34 ENSGT00940000155624.b #35 ENSGT00950000183110.b.b #36 ENSGT00950000182955.a.a.a ENSGT00390000012668 ENSGT00940000153503.a.b Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1883 ENSRBIG00000032832 #20 RPL5 (ENSRBIG00000022584) #22 DIPK1A (ENSRBIG00000035798) #23 ENSRBIG00000041027 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2514 ENSRROG00000040463 #20 RPL5 (ENSRROG00000002878) #22 DIPK1A (ENSRROG00000029635) #23 ENSRROG00000035510 MTF2 (ENSRROG00000031267) #26 TMED5 (ENSRROG00000043857) #27 CCDC18 (ENSRROG00000035898) #28 DR1 (ENSRROG00000035147) #29 FNBP1L (ENSRROG00000034278) #30 BCAR3 (ENSRROG00000039810) #31 ENSRROG00000026979 #32 GCLM (ENSRROG00000042983) #34 ABCA4 (ENSRROG00000034688) #35 ARHGAP29 (ENSRROG00000040986) #36 ABCD3 (ENSRROG00000040711) F3 (ENSRROG00000028240) SLC44A3 (ENSRROG00000043718) Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158258 ENSGT00550000074822 ENSGT00550000075011.c ENSGT00530000063965.o.a ENSGT01020000230401.b.a.m.b ENSGT00530000063861.b.b ENSGT00940000154549.a #7 ENSGT00940000156233 #9 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.a #12 ENSGT00940000154382.a.b #15 ENSGT00390000008285 #16 ENSGT00390000018446 #17 ENSGT00390000017965 #18 ENSGT00940000156166.a #19 ENSGT00940000153846.a.a #20 ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.a #22 ENSGT00390000006452.b.b #23 ENSGT00950000183180.b #26 ENSGT00940000155468 #27 ENSGT00940000153190.A #28 ENSGT00550000075010 #29 ENSGT00950000183047.c.b #30 ENSGT00940000154130.a.a.b #31 ENSGT00510000048142.i #32 ENSGT00510000047658 #34 ENSGT00940000155624.b #35 ENSGT00950000183110.b.b #36 ENSGT00950000182955.a.a.a ENSGT00390000012668 ENSGT00940000160336 ENSGT00940000154539.b Vervet Monkey MODERN SPECIES 4 NMBR (ENSCSAG00000017049) VTA1 (ENSCSAG00000017053) ADGRG6 (ENSCSAG00000017057) HIVEP2 (ENSCSAG00000017065) AIG1 (ENSCSAG00000017070) ADAT2 (ENSCSAG00000017080) PEX3 (ENSCSAG00000017084) FUCA2 (ENSCSAG00000017087) PHACTR2 (ENSCSAG00000017091) LTV1 (ENSCSAG00000017092) ZC2HC1B (ENSCSAG00000017095) PLAGL1 (ENSCSAG00000017096) SF3B5 (ENSCSAG00000000187) STX11 (ENSCSAG00000000188) UTRN (ENSCSAG00000017106) ENSCSAG00000000189 #22 EPM2A (ENSCSAG00000017119) FBXO30 (ENSCSAG00000017120) SHPRH (ENSCSAG00000017126) ENSCSAG00000017129 ENSCSAG00000017140 ENSCSAG00000017145 ADGB (ENSCSAG00000017175) STXBP5 (ENSCSAG00000017192) SAMD5 (ENSCSAG00000000190) SASH1 (ENSCSAG00000017197) UST (ENSCSAG00000017203) ENSCSAG00000017207 TAB2 (ENSCSAG00000017214) ZC3H12D (ENSCSAG00000017217) PPIL4 (ENSCSAG00000017219) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158258 ENSGT00550000074822 ENSGT00550000075011.c ENSGT00530000063965.o.a ENSGT01020000230401.b.a.m.b ENSGT00530000063861.b.b ENSGT00940000154549.a #7 ENSGT00940000156233 #9 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.a #12 ENSGT00940000154382.a.b #15 ENSGT00390000008285 #16 ENSGT00390000018446 #17 ENSGT00390000017965 #18 ENSGT00940000156166.a #19 ENSGT00940000153846.a.a #20 ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.a #22 ENSGT00390000006452.b.b #23 ENSGT00950000183180.b #26 ENSGT00940000155468 #27 ENSGT00940000153190.A #28 ENSGT00550000075010 #29 ENSGT00950000183047.c.b #30 ENSGT00940000154130.a.a.b #31 ENSGT00510000048142.i.a #32 ENSGT00510000047658 #34 ENSGT00940000155624.b #35 ENSGT00950000183110.b.b #36 ENSGT00950000182955.a.a.a ENSGT00390000012668 ENSGT00940000160336 ENSGT00940000154539.b Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158258 ENSGT00420000029746.e.a.b.a.b ENSGT00550000074822 ENSGT00550000075011.c ENSGT01020000230401.b.a.m.b ENSGT00530000063861.b.b ENSGT00940000154549.a #7 ENSGT00940000156233 #9 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.a #12 ENSGT00940000154382.a.b #15 ENSGT00390000008285 #16 ENSGT00390000018446 #17 ENSGT00390000017965 #18 ENSGT00940000156166.a #19 ENSGT00940000153846.a.a #20 ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.a #22 ENSGT00390000006452.b.b #23 ENSGT00950000183180.b #26 ENSGT00940000155468 #27 ENSGT00940000153190.A #28 ENSGT00550000075010 #29 ENSGT00950000183047.c.b #30 ENSGT00940000154130.a.a.b #31 ENSGT00510000048142.i.a #32 ENSGT00510000047658 #34 ENSGT00940000155624.b #35 ENSGT00950000183110.b.b #36 ENSGT00950000182955.a.a.a ENSGT00390000012668 ENSGT00940000160336 ENSGT00940000154539.b Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000161627.a.a.b.a.b ENSGT01100000263539.b.a.a.a.b.b.b.a.a.a.a.a ENSGT00940000158258 ENSGT00420000029746.e.a.b.a.b ENSGT00550000074822 ENSGT00550000075011.c ENSGT01020000230401.b.a.m.b ENSGT00530000063861.b.b ENSGT00940000154549.a #7 ENSGT00940000156233 #9 ENSGT00940000154382.a.b #15 ENSGT00390000018446 #17 ENSGT00390000017965 #18 ENSGT00940000156166.a #19 ENSGT00940000153846.a.a #20 ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.a #22 ENSGT00390000006452.b.b #23 ENSGT00510000047505.c.b ENSGT00950000183180.b #26 ENSGT00940000155468 #27 ENSGT00940000153190.A #28 ENSGT00550000075010 #29 ENSGT00950000183047.c.b #30 ENSGT00940000154130.a.a.b #31 ENSGT00510000048142.i.a #32 ENSGT00510000047658 #34 ENSGT01100000264112.a.b ENSGT00940000155624.b #35 ENSGT00950000183110.b.b #36 ENSGT00950000182955.a.a.a ENSGT00390000012668 Rhesus MODERN SPECIES ENSMMUG00000055740 HFM1 (ENSMMUG00000006819) CDC7 (ENSMMUG00000056970) ENSMMUG00000039930 TGFBR3 (ENSMMUG00000001742) BRDT (ENSMMUG00000014018) #7 SETSIP (ENSMMUG00000019986) BTBD8 (ENSMMUG00000007180) #15 GLMN (ENSMMUG00000010095) #17 RPAP2 (ENSMMUG00000010096) #18 ENSMMUG00000054856 GFI1 (ENSMMUG00000005068) #19 ENSMMUG00000029649 ENSMMUG00000055525 EVI5 (ENSMMUG00000005070) #20 RPL5 (ENSMMUG00000005072) #22 ENSMMUG00000051009 DIPK1A (ENSMMUG00000005073) #23 ENSMMUG00000040115 MTF2 (ENSMMUG00000016808) #26 TMED5 (ENSMMUG00000045421) #27 ENSMMUG00000061598 CCDC18 (ENSMMUG00000016812) #28 FNBP1L (ENSMMUG00000015922) #30 BCAR3 (ENSMMUG00000015924) #31 ENSMMUG00000057430 ENSMMUG00000045959 ##22 ENSMMUG00000058244 DNTTIP2 (ENSMMUG00000008435) #32 GCLM (ENSMMUG00000013857) #34 ENSMMUG00000062580 Crab-eating macaque MODERN SPECIES ENSMFAG00000060879 ENSMFAG00000048501 ENSMFAG00000003649 ENSMFAG00000000474 TGFBR3 (ENSMFAG00000002239) ENSMFAG00000047645 BRDT (ENSMFAG00000044939) #7 EPHX4 (ENSMFAG00000035355) #9 BTBD8 (ENSMFAG00000003189) #15 GLMN (ENSMFAG00000035560) #17 RPAP2 (ENSMFAG00000031837) #18 GFI1 (ENSMFAG00000045801) #19 ENSMFAG00000061073 ENSMFAG00000044701 EVI5 (ENSMFAG00000003592) #20 RPL5 (ENSMFAG00000033619) #22 ENSMFAG00000049451 DIPK1A (ENSMFAG00000000290) #23 ENSMFAG00000030382 MTF2 (ENSMFAG00000037684) #26 TMED5 (ENSMFAG00000039021) #27 CCDC18 (ENSMFAG00000033283) #28 ENSMFAG00000048042 DR1 (ENSMFAG00000036672) #29 FNBP1L (ENSMFAG00000007905) #30 BCAR3 (ENSMFAG00000045481) #31 ENSMFAG00000042490 ##22 ENSMFAG00000003472 #32 GCLM (ENSMFAG00000036066) #34 ENSMFAG00000054460 ABCA4 (ENSMFAG00000032139) #35 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00550000074822 ENSGT00550000075011.c ENSGT00530000063965.o.a ENSGT01020000230401.b.a.m.b ENSGT00530000063861.b.b ENSGT00940000154549.a #7 ENSGT00940000156233 #9 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.a #12 ENSGT00940000154891.g.a.a ENSGT00940000154382.a.b #15 ENSGT00390000008285 #16 ENSGT00390000018446 #17 ENSGT00390000017965 #18 ENSGT00940000156166.a #19 ENSGT00940000153846.a.a #20 ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.a #22 ENSGT00390000006452.b.b #23 ENSGT00950000183180.b #26 ENSGT00940000155468 #27 ENSGT00940000153190.A #28 ENSGT00550000075010 #29 ENSGT00950000183047.c.b #30 ENSGT00940000154130.a.a.b #31 ENSGT00510000048142.i.a #32 ENSGT00510000047658 #34 ENSGT00940000155624.b #35 ENSGT00950000183110.b.b #36 ENSGT00950000182955.a.a.a ENSGT00390000012668 ENSGT00940000160336 ENSGT00940000154539.b Olive baboon MODERN SPECIES CDC7 (ENSPANG00000010804) ENSPANG00000042933 TGFBR3 (ENSPANG00000016898) BRDT (ENSPANG00000007564) #7 ENSPANG00000038317 ENSPANG00000042609 EPHX4 (ENSPANG00000011776) #9 SETSIP (ENSPANG00000047435) BTBD8 (ENSPANG00000005230) #15 C1orf146 (ENSPANG00000020895) #16 GLMN (ENSPANG00000024286) #17 RPAP2 (ENSPANG00000016897) #18 GFI1 (ENSPANG00000016433) #19 EVI5 (ENSPANG00000012749) #20 ENSPANG00000045670 RPL5 (ENSPANG00000017672) #22 DIPK1A (ENSPANG00000020946) #23 ENSPANG00000043375 ENSPANG00000007198 MTF2 (ENSPANG00000021262) #26 TMED5 (ENSPANG00000009369) #27 CCDC18 (ENSPANG00000000782) #28 ENSPANG00000050304 DR1 (ENSPANG00000030741) #29 FNBP1L (ENSPANG00000021911) #30 BCAR3 (ENSPANG00000003121) #31 ENSPANG00000016856 ##22 ENSPANG00000013362 #32 GCLM (ENSPANG00000018022) #34 ABCA4 (ENSPANG00000005744) #35 ARHGAP29 (ENSPANG00000018247) #36 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 127 ENSGT00910000147262 ENSGT00940000158258 ENSGT00550000074822 ENSGT00550000075011.c ENSGT00530000063965.o.a ENSGT01020000230401.b.a.m.b ENSGT00530000063861.b.b ENSGT00940000154549.a #7 ENSGT00940000156233 #9 ENSGT00940000154382.a.b #15 ENSGT00390000008285 #16 ENSGT00390000018446 #17 ENSGT00390000017965 #18 ENSGT00940000156166.a #19 ENSGT00940000153846.a.a #20 ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.a #22 ENSGT00390000006452.b.b #23 ENSGT00950000183180.b #26 ENSGT00940000155468 #27 ENSGT00940000153190.A #28 ENSGT00550000075010 #29 ENSGT00950000183047.c.b #30 ENSGT00940000154130.a.a.b #31 ENSGT00510000048142.i.a #32 ENSGT00510000047658 #34 ENSGT00940000155624.b #35 ENSGT00950000183110.b.b #36 ENSGT00950000182955.a.a.a ENSGT00390000012668 ENSGT00940000153503.a.b ENSGT00940000160336 Drill MODERN SPECIES 1674 EVI5 (ENSMLEG00000033138) #20 RPL5 (ENSMLEG00000009228) #22 DIPK1A (ENSMLEG00000035934) #23 ENSMLEG00000035272 ENSMLEG00000029736 Sooty mangabey DUPLICATION Sooty mangabey MODERN SPECIES 542 WDR35 (ENSCATG00000043847) TTC32 (ENSCATG00000043877) ENSCATG00000035517 ENSCATG00000035076 OSR1 (ENSCATG00000041386) NT5C1B (ENSCATG00000030226) RDH14 (ENSCATG00000040055) KCNS3 (ENSCATG00000019098) MSGN1 (ENSCATG00000020832) GEN1 (ENSCATG00000002261) SMC6 (ENSCATG00000007538) VSNL1 (ENSCATG00000043748) RAD51AP2 (ENSCATG00000035523) ENSCATG00000043417 CYRIA (ENSCATG00000004720) ENSCATG00000003592 #22 MYCN (ENSCATG00000041172) ENSCATG00000019609 ENSCATG00000014658 DDX1 (ENSCATG00000033924) NBAS (ENSCATG00000042904) LRATD1 (ENSCATG00000021787) ENSCATG00000020884 TRIB2 (ENSCATG00000017155) LPIN1 (ENSCATG00000039834) NTSR2 (ENSCATG00000042424) GREB1 (ENSCATG00000041583) E2F6 (ENSCATG00000018212) ROCK2 (ENSCATG00000043380) SLC66A3 (ENSCATG00000005712) C2orf50 (ENSCATG00000029297) Sooty mangabey MODERN SPECIES 146 ENSCATG00000023058 ZNF644 (ENSCATG00000044807) HFM1 (ENSCATG00000030987) ENSCATG00000032234 ENSCATG00000023185 TGFBR3 (ENSCATG00000036600) BRDT (ENSCATG00000036412) #7 EPHX4 (ENSCATG00000029859) #9 BTBD8 (ENSCATG00000039374) #15 C1orf146 (ENSCATG00000007878) #16 GLMN (ENSCATG00000007386) #17 RPAP2 (ENSCATG00000032941) #18 GFI1 (ENSCATG00000037873) #19 ENSCATG00000041152 EVI5 (ENSCATG00000038124) #20 RPL5 (ENSCATG00000040807) #22 DIPK1A (ENSCATG00000042332) #23 MTF2 (ENSCATG00000042583) #26 TMED5 (ENSCATG00000045099) #27 CCDC18 (ENSCATG00000007601) #28 DR1 (ENSCATG00000032935) #29 FNBP1L (ENSCATG00000022281) #30 BCAR3 (ENSCATG00000035554) #31 ENSCATG00000036773 #32 GCLM (ENSCATG00000044922) #34 ENSCATG00000045214 ABCA4 (ENSCATG00000012953) #35 ARHGAP29 (ENSCATG00000037934) #36 ABCD3 (ENSCATG00000036231) F3 (ENSCATG00000035768) ENSCATG00000029532 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.a #22 Bushbaby MODERN SPECIES 125 ENSOGAG00000034533 CDC7 (ENSOGAG00000029298) TGFBR3 (ENSOGAG00000016364) ENSOGAG00000029718 BRDT (ENSOGAG00000001001) #7 EPHX4 (ENSOGAG00000001002) #9 ENSOGAG00000034632 ENSOGAG00000029908 #25 ENSOGAG00000001005 #12 BTBD8 (ENSOGAG00000028985) #15 C1orf146 (ENSOGAG00000001007) #16 ENSOGAG00000001008 #17 ENSOGAG00000001009 #18 GFI1 (ENSOGAG00000027913) #19 EVI5 (ENSOGAG00000013240) #20 RPL5 (ENSOGAG00000013246) #22 DIPK1A (ENSOGAG00000013249) #23 ENSOGAG00000030106 MTF2 (ENSOGAG00000002432) #26 TMED5 (ENSOGAG00000015057) #27 CCDC18 (ENSOGAG00000006059) #28 DR1 (ENSOGAG00000005967) #29 FNBP1L (ENSOGAG00000011225) #30 BCAR3 (ENSOGAG00000011230) #31 DNTTIP2 (ENSOGAG00000027537) #32 GCLM (ENSOGAG00000014630) #34 ABCA4 (ENSOGAG00000014632) #35 ARHGAP29 (ENSOGAG00000014656) #36 ABCD3 (ENSOGAG00000009581) F3 (ENSOGAG00000009588) ENSOGAG00000031078 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.a #22 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES 2110 ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.a #22 ENSGT00390000006452.b.b #23 Hedgehog DUPLICATION Hedgehog MODERN SPECIES 2245 ENSEEUG00000002852 #22 DIPK1A (ENSEEUG00000002906) #23 Hedgehog MODERN SPECIES 8775 ENSEEUG00000010093 #22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.a #22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.a #22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.a #22 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.a #22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.a #22 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 21 SIM1 (ENSRFEG00010002901) MCHR2 (ENSRFEG00010002876) PRDM13 (ENSRFEG00010002847) CCNC (ENSRFEG00010002800) ENSRFEG00010002763 USP45 (ENSRFEG00010002705) ENSRFEG00010002660 PNISR (ENSRFEG00010002631) COQ3 (ENSRFEG00010002591) FAXC (ENSRFEG00010002564) FBXL4 (ENSRFEG00010002537) POU3F2 (ENSRFEG00010002524) ENSRFEG00010002515 ENSRFEG00010002509 MMS22L (ENSRFEG00010002485) ENSRFEG00010002452 #22 KLHL32 (ENSRFEG00010002386) NDUFAF4 (ENSRFEG00010002322) GPR63 (ENSRFEG00010002311) FHL5 (ENSRFEG00010002299) UFL1 (ENSRFEG00010002220) FUT9 (ENSRFEG00010002196) MANEA (ENSRFEG00010002169) EPHA7 (ENSRFEG00010002115) MAP3K7 (ENSRFEG00010002027) BACH2 (ENSRFEG00010001974) CASP8AP2 (ENSRFEG00010001895) MDN1 (ENSRFEG00010001745) LYRM2 (ENSRFEG00010001660) ANKRD6 (ENSRFEG00010001567) RRAGD (ENSRFEG00010001517) Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.a #22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.a #22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.a #22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.a #22 Yarkand deer MODERN SPECIES 20 RIMS1 (ENSCHYG00000019435) ENSCHYG00000019200 ENSCHYG00000019157 B3GAT2 (ENSCHYG00000019057) ENSCHYG00000018878 ENSCHYG00000018786 FAM135A (ENSCHYG00000017966) COL9A1 (ENSCHYG00000016409) COL19A1 (ENSCHYG00000016043) LMBRD1 (ENSCHYG00000015877) ENSCHYG00000015821 ADGRB3 (ENSCHYG00000015451) ENSCHYG00000015367 ENSCHYG00000015342 ENSCHYG00000015309 ENSCHYG00000015264 #22 ENSCHYG00000015235 ENSCHYG00000015197 ENSCHYG00000015089 ENSCHYG00000015040 PHF3 (ENSCHYG00000014550) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.a #22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 376 ENSGT00530000063861.b.b ENSGT00940000154549.a #7 ENSGT00940000156233 #9 ENSGT01010000226765 ENSGT00940000154382.a.b #15 ENSGT00390000008285 #16 ENSGT00390000018446 #17 ENSGT00390000017965 #18 ENSGT00940000156166.a #19 ENSGT00940000153846.a.a #20 ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.a #22 ENSGT00390000006452.b.b #23 Armadillo DUPLICATION Armadillo MODERN SPECIES 1282 TGFBR3 (ENSDNOG00000008351) BRDT (ENSDNOG00000013324) #7 EPHX4 (ENSDNOG00000013211) #9 ENSDNOG00000041274 BTBD8 (ENSDNOG00000041212) #15 C1orf146 (ENSDNOG00000003007) #16 GLMN (ENSDNOG00000017766) #17 RPAP2 (ENSDNOG00000017468) #18 GFI1 (ENSDNOG00000000782) #19 EVI5 (ENSDNOG00000040115) #20 ENSDNOG00000006251 #22 DIPK1A (ENSDNOG00000006049) #23 Armadillo MODERN SPECIES 355 CAMKMT (ENSDNOG00000044307) SIX2 (ENSDNOG00000018725) SRBD1 (ENSDNOG00000018686) ENSDNOG00000038824 PRKCE (ENSDNOG00000048651) EPAS1 (ENSDNOG00000005938) TMEM247 (ENSDNOG00000042102) ATP6V1E2 (ENSDNOG00000007277) RHOQ (ENSDNOG00000047538) PIGF (ENSDNOG00000041519) CRIPT (ENSDNOG00000035515) SOCS5 (ENSDNOG00000020011) MCFD2 (ENSDNOG00000032663) TTC7A (ENSDNOG00000045960) STPG4 (ENSDNOG00000039454) ENSDNOG00000039220 #22 ENSDNOG00000004645 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.b ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.b ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.b ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.b ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.b ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.b ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.b ##22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.b ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.b ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.b ##22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.b ##22 Pan ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000013550 ENSGT00940000157779 ENSGT00940000156788 ENSGT00940000156380 ENSGT00390000007160.a.b ENSGT00390000011228.b.b ENSGT01020000230354.A.b ENSGT00390000015073 ENSGT00940000162606 ENSGT00390000000950.c.b.d.a ENSGT00390000001775.B ENSGT00390000011492 ENSGT00390000007134 ENSGT00530000063808.b ENSGT00510000046985.h.a ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.b ##22 ENSGT00910000147659 ENSGT00390000014429.b ENSGT00940000156776 ENSGT00390000003057 ENSGT00940000154045.a.i ENSGT00390000003721.d.b ENSGT00950000183125.a ENSGT00530000064318 ENSGT00940000154315.b ENSGT00940000157926 ENSGT00940000156715 ENSGT00910000147516 ENSGT00910000147064 ENSGT00940000155461.E ENSGT00730000111085.A.s.b Bonobo MODERN SPECIES 1 HSPA14 (ENSPPAG00000013447) CDNF (ENSPPAG00000027133) ENSPPAG00000037904 ENSPPAG00000035652 ENSPPAG00000034588 FRMD4A (ENSPPAG00000038126) PRPF18 (ENSPPAG00000041959) ENSPPAG00000038510 SEPHS1 (ENSPPAG00000039256) PHYH (ENSPPAG00000042110) UCMA (ENSPPAG00000029216) MCM10 (ENSPPAG00000028191) ENSPPAG00000027069 ENSPPAG00000043268 OPTN (ENSPPAG00000038517) ENSPPAG00000032893 ##22 ENSPPAG00000035264 CCDC3 (ENSPPAG00000033219) CAMK1D (ENSPPAG00000042814) CDC123 (ENSPPAG00000039516) NUDT5 (ENSPPAG00000035132) SEC61A2 (ENSPPAG00000037803) DHTKD1 (ENSPPAG00000036813) UPF2 (ENSPPAG00000037953) ENSPPAG00000043303 ENSPPAG00000019724 USP6NL (ENSPPAG00000036030) ENSPPAG00000043069 CELF2 (ENSPPAG00000029170) ENSPPAG00000030308 ENSPPAG00000033867 Chimpanzee MODERN SPECIES 1 SUV39H2 (ENSPTRG00000002313) HSPA14 (ENSPTRG00000002311) CDNF (ENSPTRG00000002310) FAM107B (ENSPTRG00000002309) FRMD4A (ENSPTRG00000002308) PRPF18 (ENSPTRG00000002306) ENSPTRG00000044945 BEND7 (ENSPTRG00000002304) SEPHS1 (ENSPTRG00000002303) PHYH (ENSPTRG00000002302) UCMA (ENSPTRG00000002301) MCM10 (ENSPTRG00000023150) ENSPTRG00000048693 ENSPTRG00000041856 OPTN (ENSPTRG00000002298) ENSPTRG00000049589 ##22 ENSPTRG00000046267 CCDC3 (ENSPTRG00000002297) CAMK1D (ENSPTRG00000002296) CDC123 (ENSPTRG00000002295) NUDT5 (ENSPTRG00000002294) SEC61A2 (ENSPTRG00000002293) DHTKD1 (ENSPTRG00000002292) UPF2 (ENSPTRG00000002291) PROSER2 (ENSPTRG00000002289) ECHDC3 (ENSPTRG00000002288) USP6NL (ENSPTRG00000002286) ENSPTRG00000044492 ENSPTRG00000045911 CELF2 (ENSPTRG00000002284) ENSPTRG00000050223 Gorilla MODERN SPECIES 6 ENSGGOG00000012146 APBA2 (ENSGGOG00000005676) ENSGGOG00000027053 ENSGGOG00000026476 HERC2 (ENSGGOG00000012785) ENSGGOG00000039106 OCA2 (ENSGGOG00000005900) GABRG3 (ENSGGOG00000036478) GABRA5 (ENSGGOG00000036809) GABRB3 (ENSGGOG00000011207) ENSGGOG00000037903 ATP10A (ENSGGOG00000001775) UBE3A (ENSGGOG00000003955) SNRPN (ENSGGOG00000003988) SNURF (ENSGGOG00000042638) ENSGGOG00000039674 ##22 NPAP1 (ENSGGOG00000023549) ENSGGOG00000041536 ENSGGOG00000024364 ENSGGOG00000043626 ENSGGOG00000025127 NIPA1 (ENSGGOG00000012394) NIPA2 (ENSGGOG00000002147) CYFIP1 (ENSGGOG00000002142) TUBGCP5 (ENSGGOG00000015241) ENSGGOG00000026858 ENSGGOG00000042770 ENSGGOG00000038570 IGHV1-2 (ENSGGOG00000038726) ENSGGOG00000042537 ENSGGOG00000037322 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.b ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.b ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.b ##22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.b ##22 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.b ##22 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 2 ZNF385A (ENSMFAG00000042192) ITGA5 (ENSMFAG00000036877) ENSMFAG00000047951 GTSF1 (ENSMFAG00000041178) NCKAP1L (ENSMFAG00000001155) PDE1B (ENSMFAG00000033293) PPP1R1A (ENSMFAG00000037982) LACRT (ENSMFAG00000063533) DCD (ENSMFAG00000040810) MUCL1 (ENSMFAG00000051719) TESPA1 (ENSMFAG00000040218) NEUROD4 (ENSMFAG00000030073) ENSMFAG00000065363 ENSMFAG00000063829 ENSMFAG00000065221 ENSMFAG00000003915 ##22 OR10A7 (ENSMFAG00000036855) OR6C74 (ENSMFAG00000054196) OR6C1 (ENSMFAG00000054015) OR6C75 (ENSMFAG00000059604) ENSMFAG00000055470 OR6C2 (ENSMFAG00000028782) ENSMFAG00000055540 ENSMFAG00000064214 ENSMFAG00000062892 OR6C4 (ENSMFAG00000052186) OR2AP1 (ENSMFAG00000056876) OR10P1 (ENSMFAG00000030027) METTL7B (ENSMFAG00000041138) ITGA7 (ENSMFAG00000022956) BLOC1S1 (ENSMFAG00000057152) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.b ##22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.b ##22 Drill MODERN SPECIES 1667 ENSMLEG00000043278 TESPA1 (ENSMLEG00000039181) NEUROD4 (ENSMLEG00000027380) ENSMLEG00000003880 OR9K2 (ENSMLEG00000027603) ENSMLEG00000027776 ##22 OR10A7 (ENSMLEG00000043713) OR6C74 (ENSMLEG00000017829) OR6C3 (ENSMLEG00000036806) OR6C75 (ENSMLEG00000022612) ENSMLEG00000043588 OR6C65 (ENSMLEG00000036650) OR6C2 (ENSMLEG00000027980) OR6C4 (ENSMLEG00000021441) OR10P1 (ENSMLEG00000021983) ENSMLEG00000032453 ENSMLEG00000031889 METTL7B (ENSMLEG00000033453) ITGA7 (ENSMLEG00000002509) RDH5 (ENSMLEG00000028776) CD63 (ENSMLEG00000037224) Vervet Monkey MODERN SPECIES 12 ZNF644 (ENSCSAG00000001458) HFM1 (ENSCSAG00000001459) CDC7 (ENSCSAG00000001460) TGFBR3 (ENSCSAG00000001461) BRDT (ENSCSAG00000001462) #7 EPHX4 (ENSCSAG00000001463) #9 ENSCSAG00000000155 ENSCSAG00000001464 #12 BTBD8 (ENSCSAG00000001465) #15 C1orf146 (ENSCSAG00000001466) #16 GLMN (ENSCSAG00000001467) #17 RPAP2 (ENSCSAG00000001468) #18 GFI1 (ENSCSAG00000001469) #19 ENSCSAG00000000156 EVI5 (ENSCSAG00000001470) #20 ENSCSAG00000001471 ##22 DIPK1A (ENSCSAG00000001472) #23 MTF2 (ENSCSAG00000001474) #26 TMED5 (ENSCSAG00000001475) #27 CCDC18 (ENSCSAG00000001476) #28 DR1 (ENSCSAG00000001477) #29 FNBP1L (ENSCSAG00000001478) #30 BCAR3 (ENSCSAG00000001479) #31 ENSCSAG00000000157 ##22 ENSCSAG00000001480 #32 GCLM (ENSCSAG00000001481) #34 ABCA4 (ENSCSAG00000001482) #35 ARHGAP29 (ENSCSAG00000001483) #36 ABCD3 (ENSCSAG00000001484) F3 (ENSCSAG00000001485) SLC44A3 (ENSCSAG00000001486) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158629 ENSGT00940000155705.b ENSGT00910000147102 ENSGT00940000156259.b ENSGT00700000106049 ENSGT00940000158851 ENSGT00530000063632.A ENSGT00530000063790.a ENSGT00940000156897 ENSGT00390000015908 ENSGT00390000003860 ENSGT00940000153665.b.a.b ENSGT00940000161237 ENSGT00940000163316 ENSGT00940000155505.a ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.b ##22 ENSGT00400000024146 ENSGT00940000162886 ENSGT01050000244898.a.a.b ENSGT00390000012765 ENSGT00390000016446 ENSGT00390000011196 ENSGT00940000161441 ENSGT00940000163504 ENSGT00940000160927.e ENSGT00940000160927.f ENSGT00940000154660.b ENSGT00940000159889 ENSGT00390000007310 ENSGT00940000160589 ENSGT00940000163987 Mas night monkey MODERN SPECIES 679 ENSANAG00000025655 ENSANAG00000025021 ENSANAG00000001572 MAST2 (ENSANAG00000026216) PIK3R3 (ENSANAG00000037471) P3R3URF (ENSANAG00000036310) TSPAN1 (ENSANAG00000031824) POMGNT1 (ENSANAG00000026631) LURAP1 (ENSANAG00000037106) RAD54L (ENSANAG00000035439) LRRC41 (ENSANAG00000029615) ENSANAG00000027102 NSUN4 (ENSANAG00000022673) FAAH (ENSANAG00000012697) DMBX1 (ENSANAG00000036763) ENSANAG00000029807 ##22 KNCN (ENSANAG00000036447) MKNK1 (ENSANAG00000022817) MOB3C (ENSANAG00000036313) ATPAF1 (ENSANAG00000033472) TEX38 (ENSANAG00000022553) EFCAB14 (ENSANAG00000023693) CYP4A11 (ENSANAG00000019404) ENSANAG00000035850 CYP4X1 (ENSANAG00000034247) CYP4Z1 (ENSANAG00000032825) PDZK1IP1 (ENSANAG00000037310) TAL1 (ENSANAG00000018338) STIL (ENSANAG00000025280) CMPK1 (ENSANAG00000033187) FOXE3 (ENSANAG00000019840) Cebidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000158629 ENSGT00940000155705.b ENSGT00910000147102 ENSGT00940000156259.b ENSGT00700000106049 ENSGT00940000158851 ENSGT00530000063632.A ENSGT00530000063790.a ENSGT00940000156897 ENSGT00390000015908 ENSGT00390000003860 ENSGT00940000153665.b.a.b ENSGT00940000161237 ENSGT00940000163316 ENSGT00940000155505.a ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.b ##22 ENSGT00400000024146 ENSGT00940000162886 ENSGT00940000154587.a.a ENSGT01050000244898.a.a.b ENSGT00390000012765 ENSGT00390000016446 ENSGT00390000011196 ENSGT00940000161441 ENSGT00940000163504 ENSGT00940000160927.e ENSGT00940000160927.f ENSGT00940000154660.b ENSGT00940000159889 ENSGT00390000007310 ENSGT00940000160589 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158629 ENSGT00940000155705.b ENSGT00910000147102 ENSGT00940000156259.b ENSGT00700000106049 ENSGT00940000158851 ENSGT00530000063632.A ENSGT00530000063790.a ENSGT00940000156897 ENSGT00390000015908 ENSGT00390000003860 ENSGT00940000153665.b.a.b ENSGT00940000161237 ENSGT00940000163316 ENSGT00940000155505.a ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.b ##22 ENSGT00400000024146 ENSGT00940000162886 ENSGT00940000154587.a.a ENSGT01050000244898.a.a.b ENSGT00390000012765 ENSGT00390000016446 ENSGT00390000011196 ENSGT00940000161441 ENSGT00940000163504 ENSGT00940000160927.e ENSGT00940000160927.f ENSGT00940000154660.b ENSGT00940000159889 ENSGT00390000007310 ENSGT00940000160589 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 130 ENSSBOG00000025173 MAST2 (ENSSBOG00000026992) ENSSBOG00000035141 PIK3R3 (ENSSBOG00000024946) P3R3URF (ENSSBOG00000025347) TSPAN1 (ENSSBOG00000035428) POMGNT1 (ENSSBOG00000022467) LURAP1 (ENSSBOG00000032879) RAD54L (ENSSBOG00000024672) LRRC41 (ENSSBOG00000026644) ENSSBOG00000033788 NSUN4 (ENSSBOG00000021418) FAAH (ENSSBOG00000014904) ENSSBOG00000033590 DMBX1 (ENSSBOG00000032738) ENSSBOG00000034928 ##22 KNCN (ENSSBOG00000034951) MKNK1 (ENSSBOG00000025387) ATPAF1 (ENSSBOG00000036018) TEX38 (ENSSBOG00000024302) EFCAB14 (ENSSBOG00000034890) ENSSBOG00000030826 CYP4A11 (ENSSBOG00000015955) CYP4X1 (ENSSBOG00000029052) Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.b ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.b ##22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.b ##22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.b ##22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.b ##22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.b ##22 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.b ##22 Ferret MODERN SPECIES 226 ENSMPUG00000019084 FAT1 (ENSMPUG00000010348) MTNR1A (ENSMPUG00000010329) ENSMPUG00000010319 ##22 ENSMPUG00000010311 F11 (ENSMPUG00000010306) KLKB1 (ENSMPUG00000010297) GSR (ENSMPUG00000010242) ENSMPUG00000010236 PPP2CB (ENSMPUG00000010230) TEX15 (ENSMPUG00000010224) PURG (ENSMPUG00000010218) WRN (ENSMPUG00000010201) ENSMPUG00000019082 ENSMPUG00000019081 NRG1 (ENSMPUG00000010197) ENSMPUG00000010193 FUT10 (ENSMPUG00000010189) MAK16 (ENSMPUG00000010181) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.b ##22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.a.b ##22 Armadillo MODERN SPECIES 2549 ENSDNOG00000047475 ##22 FIG4 (ENSDNOG00000001610) AK9 (ENSDNOG00000038218) ZBTB24 (ENSDNOG00000038726) MICAL1 (ENSDNOG00000003962) SMPD2 (ENSDNOG00000003948) ENSDNOG00000034075 ENSDNOG00000047626 ENSDNOG00000003743 CEP57L1 (ENSDNOG00000025700) ENSDNOG00000044166 SESN1 (ENSDNOG00000040263) ARMC2 (ENSDNOG00000006058) ENSDNOG00000005257 AFG1L (ENSDNOG00000018390) SNX3 (ENSDNOG00000041063) Eutheria DUPLICATION Eutheria DUPLICATION Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.a ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.a ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.a ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.a ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.a ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.a ##22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.a ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.a ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.a ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.a ##22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.a ##22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.a ##22 Chinese hamster chok1gshd DUPLICATION Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 382 Cct8 (ENSCGRG00001001310) USP16 (ENSCGRG00001022078) Rwdd2b (ENSCGRG00001003027) Ltn1 (ENSCGRG00001022871) N6amt1 (ENSCGRG00001012196) Adamts5 (ENSCGRG00001000759) Adamts1 (ENSCGRG00001019788) Cyyr1 (ENSCGRG00001013581) App (ENSCGRG00001018223) Gabpa (ENSCGRG00001024235) Atp5j (ENSCGRG00001020499) Jam2 (ENSCGRG00001013844) Mrpl39 (ENSCGRG00001016147) Ncam2 (ENSCGRG00001016596) ENSCGRG00001006367 ENSCGRG00001013358 ##22 ENSCGRG00001005582 Tmprss15 (ENSCGRG00001003890) Chodl (ENSCGRG00001012911) D16Ertd472e (ENSCGRG00001025031) Btg3 (ENSCGRG00001022748) Cxadr (ENSCGRG00001022335) ENSCGRG00001004206 ##22 Usp25 (ENSCGRG00001019136) Nrip1 (ENSCGRG00001017624) Samsn1 (ENSCGRG00001011901) Hspa13 (ENSCGRG00001006769) Rbm11 (ENSCGRG00001013426) Lipi (ENSCGRG00001004574) Robo2 (ENSCGRG00001016343) Robo1 (ENSCGRG00001016390) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 382 ENSCGRG00001022071 Pou1f1 (ENSCGRG00001011471) Chmp2b (ENSCGRG00001022834) Vgll3 (ENSCGRG00001015980) Cadm2 (ENSCGRG00001010982) Gbe1 (ENSCGRG00001024765) ENSCGRG00001011950 Robo1 (ENSCGRG00001016390) Robo2 (ENSCGRG00001016343) Lipi (ENSCGRG00001004574) Rbm11 (ENSCGRG00001013426) Hspa13 (ENSCGRG00001006769) Samsn1 (ENSCGRG00001011901) Nrip1 (ENSCGRG00001017624) Usp25 (ENSCGRG00001019136) ENSCGRG00001004206 ##22 Cxadr (ENSCGRG00001022335) Btg3 (ENSCGRG00001022748) D16Ertd472e (ENSCGRG00001025031) Chodl (ENSCGRG00001012911) Tmprss15 (ENSCGRG00001003890) ENSCGRG00001005582 ENSCGRG00001013358 ##22 ENSCGRG00001006367 Ncam2 (ENSCGRG00001016596) Mrpl39 (ENSCGRG00001016147) Jam2 (ENSCGRG00001013844) Atp5j (ENSCGRG00001020499) Gabpa (ENSCGRG00001024235) App (ENSCGRG00001018223) Cyyr1 (ENSCGRG00001013581) Golden Hamster MODERN SPECIES 643 Mitf (ENSMAUG00000004545) Frmd4b (ENSMAUG00000007225) Lmod3 (ENSMAUG00000010204) Arl6ip5 (ENSMAUG00000009657) Uba3 (ENSMAUG00000017525) Tmf1 (ENSMAUG00000021427) Eogt (ENSMAUG00000017534) ENSMAUG00000020979 #25 Tafa4 (ENSMAUG00000019968) Tafa1 (ENSMAUG00000019067) Suclg2 (ENSMAUG00000021321) ENSMAUG00000009672 Kbtbd8 (ENSMAUG00000017081) Lrig1 (ENSMAUG00000007470) Slc25a26 (ENSMAUG00000021604) ENSMAUG00000004998 ##22 Magi1 (ENSMAUG00000021226) ENSMAUG00000010107 Adamts9 (ENSMAUG00000021440) Prickle2 (ENSMAUG00000013569) Trh (ENSMAUG00000016316) Rbsn (ENSMAUG00000010240) Nr2c2 (ENSMAUG00000016840) Fgd5 (ENSMAUG00000015411) 4930590J08Rik (ENSMAUG00000015114) Ccdc174 (ENSMAUG00000010944) Grip2 (ENSMAUG00000013630) Xpc (ENSMAUG00000019920) Tmem43 (ENSMAUG00000021795) Chchd4 (ENSMAUG00000021415) Wnt7a (ENSMAUG00000016536) Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 787 Pik3c3 (ENSNGAG00000019352) ENSNGAG00000011529 ##22 Celf4 (ENSNGAG00000000761) AW554918 (ENSNGAG00000021362) Tpgs2 (ENSNGAG00000019653) ENSNGAG00000011113 Mocos (ENSNGAG00000003254) Elp2 (ENSNGAG00000016542) Slc39a6 (ENSNGAG00000000918) Rprd1a (ENSNGAG00000021082) 2700062C07Rik (ENSNGAG00000000796) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.a ##22 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.a ##22 Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.a ##22 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.a ##22 Squirrel MODERN SPECIES 231 ENSSTOG00000034608 PLEKHM3 (ENSSTOG00000016489) FZD5 (ENSSTOG00000028314) CCNYL1 (ENSSTOG00000016484) ENSSTOG00000021511 ##22 METTL21A (ENSSTOG00000016483) CREB1 (ENSSTOG00000016482) KLF7 (ENSSTOG00000011069) CPO (ENSSTOG00000013351) FASTKD2 (ENSSTOG00000022821) MDH1B (ENSSTOG00000003194) DYTN (ENSSTOG00000019822) ADAM23 (ENSSTOG00000024094) ZDBF2 (ENSSTOG00000001663) CMKLR2 (ENSSTOG00000005452) EEF1B2 (ENSSTOG00000005437) NDUFS1 (ENSSTOG00000010255) INO80D (ENSSTOG00000028419) NRP2 (ENSSTOG00000010229) PARD3B (ENSSTOG00000010207) Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.a ##22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.a ##22 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.a ##22 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.a ##22 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 892 MAP2K6 (ENSPCOG00000025057) ABCA5 (ENSPCOG00000027371) ABCA10 (ENSPCOG00000017146) ENSPCOG00000015952 ABCA8 (ENSPCOG00000012672) FAM20A (ENSPCOG00000026345) PRKAR1A (ENSPCOG00000003090) #14 WIPI1 (ENSPCOG00000025198) ARSG (ENSPCOG00000024836) SLC16A6 (ENSPCOG00000014725) AMZ2 (ENSPCOG00000017376) GNA13 (ENSPCOG00000024544) RGS9 (ENSPCOG00000015804) AXIN2 (ENSPCOG00000015119) ENSPCOG00000017737 ENSPCOG00000017290 ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.a ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.a ##22 Catarrhini DUPLICATION Catarrhini DUPLICATION Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.a.c.a ##22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT01030000234556.b.a ENSGT01030000234556.b.b.d ENSGT01030000234556.a.a.b ENSGT01030000234556.a.a.a ENSGT00940000153312.B ENSGT00940000153312.A.a.a ENSGT00940000153312.A.a.b ENSGT00390000009300.b ENSGT00390000009724.l.v ENSGT00900000143681 ENSGT00390000009724.l.u.b ENSGT00940000160099 ENSGT00390000007968 ENSGT01080000257333.B ENSGT00390000005544 ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.a.c.a ##22 ENSGT00390000017207 ENSGT00940000155231.b ENSGT00390000006949 ENSGT00900000141067.f ENSGT01050000244848.B.a.a ENSGT00730000110915.a ENSGT00390000006115 ENSGT00940000162579 ENSGT00390000007799 ENSGT00390000004856.w.a.a.b.a.b ENSGT00940000153761.B ENSGT00730000111086 ENSGT00940000157686 ENSGT00940000153635.A ENSGT00390000009083 Hominidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT01030000234556.b.a ENSGT01030000234556.b.b.d ENSGT01030000234556.a.a.b ENSGT01030000234556.a.a.a ENSGT00940000153312.B ENSGT00940000153312.A.a.a ENSGT00940000153312.A.a.b ENSGT00390000009300.b ENSGT00390000009724.l.v ENSGT00900000143681 ENSGT00390000009724.l.u.b ENSGT00940000160099 ENSGT00390000007968 ENSGT01080000257333.B ENSGT00390000005544 ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.a.c.a ##22 ENSGT00390000017207 ENSGT00940000155231.b ENSGT00390000006949 ENSGT00900000141067.f ENSGT01050000244848.B.a.a ENSGT00730000110915.a ENSGT00390000006115 ENSGT00940000162579 ENSGT00390000007799 ENSGT00390000004856.w.a.a.b.a.b ENSGT00940000153761.B ENSGT00730000111086 ENSGT00940000157686 ENSGT00940000153635.A ENSGT00390000009083 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT01030000234556.b.a ENSGT00910000147175 ENSGT01030000234556.b.b.d ENSGT01030000234556.a.a.b ENSGT01030000234556.a.a.a ENSGT00940000153312.B ENSGT00940000153312.A.a.a ENSGT00940000153312.A.a.b ENSGT00390000009300.b ENSGT00900000143681 ENSGT00390000009724.l.u.b ENSGT00940000160099 ENSGT00390000007968 ENSGT01080000257333.B ENSGT00390000005544 ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.a.c.a ##22 ENSGT00390000017207 ENSGT00940000155231.b ENSGT00390000006949 ENSGT00900000141067.f ENSGT01050000244848.B.a.a ENSGT00730000110915.a ENSGT00390000006115 ENSGT00940000162579 ENSGT00390000007799 ENSGT00390000004856.w.a.a.b.a.b ENSGT00940000153761.B ENSGT00730000111086 ENSGT00940000157686 ENSGT00940000153635.A ENSGT00390000009083 Gorilla MODERN SPECIES 2 SCN4B (ENSGGOG00000002093) SCN2B (ENSGGOG00000002096) ENSGGOG00000042491 JAML (ENSGGOG00000005931) MPZL3 (ENSGGOG00000004232) MPZL2 (ENSGGOG00000023009) CD3E (ENSGGOG00000006694) CD3D (ENSGGOG00000008009) CD3G (ENSGGOG00000023885) UBE4A (ENSGGOG00000011416) ENSGGOG00000041429 KMT2A (ENSGGOG00000000946) TTC36 (ENSGGOG00000000952) TMEM25 (ENSGGOG00000000953) IFT46 (ENSGGOG00000027999) ENSGGOG00000039048 ##22 ARCN1 (ENSGGOG00000006162) PHLDB1 (ENSGGOG00000015323) TREH (ENSGGOG00000015335) DDX6 (ENSGGOG00000016751) CXCR5 (ENSGGOG00000014078) BCL9L (ENSGGOG00000008144) ENSGGOG00000038631 FOXR1 (ENSGGOG00000001177) CENATAC (ENSGGOG00000023065) ENSGGOG00000025540 ENSGGOG00000002646 SLC37A4 (ENSGGOG00000002650) HYOU1 (ENSGGOG00000008022) VPS11 (ENSGGOG00000008041) HMBS (ENSGGOG00000008055) Orangutan MODERN SPECIES 2 ENSPPYG00000003922 SCN4B (ENSPPYG00000003923) SCN2B (ENSPPYG00000032928) JAML (ENSPPYG00000003926) MPZL3 (ENSPPYG00000003927) MPZL2 (ENSPPYG00000003928) CD3E (ENSPPYG00000003929) CD3G (ENSPPYG00000003931) ENSPPYG00000003930 UBE4A (ENSPPYG00000003932) ATP5MG (ENSPPYG00000003933) KMT2A (ENSPPYG00000003935) TTC36 (ENSPPYG00000003936) TMEM25 (ENSPPYG00000003937) IFT46 (ENSPPYG00000034963) ENSPPYG00000039656 ##22 ARCN1 (ENSPPYG00000003939) PHLDB1 (ENSPPYG00000003940) TREH (ENSPPYG00000003941) DDX6 (ENSPPYG00000003942) CXCR5 (ENSPPYG00000003943) BCL9L (ENSPPYG00000003944) UPK2 (ENSPPYG00000003946) FOXR1 (ENSPPYG00000003947) CENATAC (ENSPPYG00000003948) ENSPPYG00000025915 TRAPPC4 (ENSPPYG00000033246) SLC37A4 (ENSPPYG00000003950) HYOU1 (ENSPPYG00000003951) ENSPPYG00000035053 VPS11 (ENSPPYG00000003952) Gibbon MODERN SPECIES 5 SCN4B (ENSNLEG00000007352) ENSNLEG00000034025 SCN2B (ENSNLEG00000027768) JAML (ENSNLEG00000007354) MPZL3 (ENSNLEG00000007355) MPZL2 (ENSNLEG00000007356) CD3E (ENSNLEG00000007357) CD3D (ENSNLEG00000007358) CD3G (ENSNLEG00000007359) ENSNLEG00000034846 UBE4A (ENSNLEG00000007360) ATP5MG (ENSNLEG00000007362) KMT2A (ENSNLEG00000007365) TTC36 (ENSNLEG00000007366) TMEM25 (ENSNLEG00000007367) ENSNLEG00000033311 ##22 IFT46 (ENSNLEG00000007368) ARCN1 (ENSNLEG00000007369) PHLDB1 (ENSNLEG00000007370) TREH (ENSNLEG00000007371) DDX6 (ENSNLEG00000007372) CXCR5 (ENSNLEG00000030725) BCL9L (ENSNLEG00000007375) ENSNLEG00000007376 CENATAC (ENSNLEG00000007378) ENSNLEG00000029209 SLC37A4 (ENSNLEG00000007380) HYOU1 (ENSNLEG00000007381) VPS11 (ENSNLEG00000007382) HMBS (ENSNLEG00000007383) H2AX (ENSNLEG00000028254) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.a.c.a ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.a.c.a ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.a.c.a ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.a.c.a ##22 Olive baboon MODERN SPECIES RPAP2 (ENSPANG00000016897) #18 GFI1 (ENSPANG00000016433) #19 EVI5 (ENSPANG00000012749) #20 ENSPANG00000045670 RPL5 (ENSPANG00000017672) #22 DIPK1A (ENSPANG00000020946) #23 ENSPANG00000043375 ENSPANG00000007198 MTF2 (ENSPANG00000021262) #26 TMED5 (ENSPANG00000009369) #27 CCDC18 (ENSPANG00000000782) #28 ENSPANG00000050304 DR1 (ENSPANG00000030741) #29 FNBP1L (ENSPANG00000021911) #30 BCAR3 (ENSPANG00000003121) #31 ENSPANG00000016856 ##22 ENSPANG00000013362 #32 GCLM (ENSPANG00000018022) #34 ABCA4 (ENSPANG00000005744) #35 ARHGAP29 (ENSPANG00000018247) #36 F3 (ENSPANG00000012475) ABCD3 (ENSPANG00000008108) ENSPANG00000032578 SLC44A3 (ENSPANG00000015206) CNN3 (ENSPANG00000013361) TLCD4 (ENSPANG00000001040) ENSPANG00000048456 RWDD3 (ENSPANG00000014369) ENSPANG00000048578 PTBP2 (ENSPANG00000001229) DPYD (ENSPANG00000001230) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.a.c.b ##22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.a.c.b ##22 Gibbon MODERN SPECIES 22 NPY1R (ENSNLEG00000006463) ENSNLEG00000006459 FSTL5 (ENSNLEG00000006442) RAPGEF2 (ENSNLEG00000006434) C4orf45 (ENSNLEG00000006432) FNIP2 (ENSNLEG00000006415) PPID (ENSNLEG00000006403) ETFDH (ENSNLEG00000006389) C4orf46 (ENSNLEG00000030196) RXFP1 (ENSNLEG00000006346) TMEM144 (ENSNLEG00000006335) GASK1B (ENSNLEG00000030864) GRIA2 (ENSNLEG00000006306) GLRB (ENSNLEG00000006297) PDGFC (ENSNLEG00000031412) ENSNLEG00000029463 ##22 CTSO (ENSNLEG00000031045) TDO2 (ENSNLEG00000006259) ASIC5 (ENSNLEG00000006255) GUCY1B1 (ENSNLEG00000006234) ENSNLEG00000032005 GUCY1A1 (ENSNLEG00000006208) MAP9 (ENSNLEG00000006192) NPY2R (ENSNLEG00000035895) RBM46 (ENSNLEG00000006184) LRAT (ENSNLEG00000031736) FGG (ENSNLEG00000006132) ENSNLEG00000006118 FGB (ENSNLEG00000006050) PLRG1 (ENSNLEG00000006023) ENSNLEG00000026943 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.a.d ##22 Hominoidea DUPLICATION Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.a.d.a ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.a.d.a ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.a.d.a ##22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.a.d.a ##22 Pan ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000006922.m.b.a.c.b.a ENSGT00390000008107.c.b ENSGT00940000154201.a.b ENSGT00950000183129.b.b ENSGT00390000008859.b.d.k.b ENSGT00940000159572 ENSGT00390000014038 ENSGT00390000003738.a.b.g.b ENSGT00940000154905 ENSGT00910000147731 ENSGT00910000147546 ENSGT00940000156926 ENSGT00940000156594 ENSGT00950000183120.e.b.a.b ENSGT00560000078515 ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.a.d.a ##22 ENSGT00940000157011 ENSGT00510000050001 ENSGT00940000159103 ENSGT00940000157475 ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00550000074698.k.b.b ENSGT00940000160452.n ENSGT00940000155837 ENSGT00940000158844 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000162591 ENSGT00390000005362 ENSGT00390000011417.l ENSGT00950000182907.a.b.b.b.ub ENSGT00940000158689 Chimpanzee MODERN SPECIES 6 ENSPTRG00000047854 HEXA (ENSPTRG00000007249) CELF6 (ENSPTRG00000034360) PARP6 (ENSPTRG00000007247) PKM (ENSPTRG00000007246) GRAMD2A (ENSPTRG00000007245) SENP8 (ENSPTRG00000043107) ENSPTRG00000045341 MYO9A (ENSPTRG00000007243) ENSPTRG00000042780 NR2E3 (ENSPTRG00000007242) ENSPTRG00000046782 ENSPTRG00000047359 THSD4 (ENSPTRG00000007240) CT62 (ENSPTRG00000039639) ENSPTRG00000046296 ##22 THAP10 (ENSPTRG00000007235) LRRC49 (ENSPTRG00000007236) LARP6 (ENSPTRG00000007234) UACA (ENSPTRG00000007232) TLE3 (ENSPTRG00000007231) RPLP1 (ENSPTRG00000007228) ENSPTRG00000043652 KIF23 (ENSPTRG00000007227) PAQR5 (ENSPTRG00000040959) GLCE (ENSPTRG00000007224) NOX5 (ENSPTRG00000007222) SPESP1 (ENSPTRG00000007221) ENSPTRG00000050341 ANP32A (ENSPTRG00000007219) CORO2B (ENSPTRG00000007218) Bonobo MODERN SPECIES 6 HEXA (ENSPPAG00000037219) CELF6 (ENSPPAG00000042321) PARP6 (ENSPPAG00000042901) PKM (ENSPPAG00000041061) GRAMD2A (ENSPPAG00000034526) SENP8 (ENSPPAG00000003990) ENSPPAG00000041256 MYO9A (ENSPPAG00000036622) ENSPPAG00000013619 ENSPPAG00000021142 NR2E3 (ENSPPAG00000042596) ENSPPAG00000034547 ENSPPAG00000039433 THSD4 (ENSPPAG00000038184) ENSPPAG00000031013 ENSPPAG00000042838 ##22 THAP10 (ENSPPAG00000009534) LRRC49 (ENSPPAG00000042602) LARP6 (ENSPPAG00000031247) UACA (ENSPPAG00000027889) TLE3 (ENSPPAG00000027158) ENSPPAG00000039263 ENSPPAG00000041698 KIF23 (ENSPPAG00000038174) PAQR5 (ENSPPAG00000043450) GLCE (ENSPPAG00000034026) NOX5 (ENSPPAG00000038195) SPESP1 (ENSPPAG00000040777) ENSPPAG00000020890 ENSPPAG00000034193 CORO2B (ENSPPAG00000030458) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.a.d.b ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.a.d.b ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.a.d.b ##22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.a.d.b ##22 Pan ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158520 ENSGT00940000157316 ENSGT00940000161004 ENSGT00390000015089.c.d ENSGT00940000161034 ENSGT00940000156099 ENSGT00900000141074.e.a.b.a.a.a ENSGT01030000234606.b ENSGT00390000010743.a ENSGT00940000156236.g ENSGT00390000012568 ENSGT00730000111014 ENSGT00530000063751.a ENSGT00940000154614 ENSGT00940000155635 ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.a.d.b ##22 ENSGT00390000001254 ENSGT00530000063646.a ENSGT00940000154499.g ENSGT00940000154149.b.a ENSGT00940000159391 ENSGT00910000147655 ENSGT00390000014594 ENSGT00390000014781.g.b ENSGT01030000234558.C ENSGT00940000156012 ENSGT00390000014243 ENSGT00940000154654 ENSGT00530000063843.b ENSGT00940000158333 ENSGT00950000183179.a Chimpanzee MODERN SPECIES RGS13 (ENSPTRG00000001791) RGS1 (ENSPTRG00000049668) RGS21 (ENSPTRG00000034440) ENSPTRG00000048862 RGS18 (ENSPTRG00000001789) BRINP3 (ENSPTRG00000001788) ENSPTRG00000048502 PLA2G4A (ENSPTRG00000001787) PTGS2 (ENSPTRG00000001786) PDC (ENSPTRG00000001785) ODR4 (ENSPTRG00000001784) TPR (ENSPTRG00000001783) ENSPTRG00000046189 HMCN1 (ENSPTRG00000001780) IVNS1ABP (ENSPTRG00000001779) ENSPTRG00000043376 ##22 SWT1 (ENSPTRG00000001777) TRMT1L (ENSPTRG00000001776) RNF2 (ENSPTRG00000001775) NIBAN1 (ENSPTRG00000001774) EDEM3 (ENSPTRG00000001773) ENSPTRG00000052341 C1H1orf21 (ENSPTRG00000052438) TSEN15 (ENSPTRG00000023202) COLGALT2 (ENSPTRG00000022688) RGL1 (ENSPTRG00000001768) APOBEC4 (ENSPTRG00000047181) ARPC5 (ENSPTRG00000001767) NCF2 (ENSPTRG00000001766) SMG7 (ENSPTRG00000001764) NMNAT2 (ENSPTRG00000001763) Bonobo MODERN SPECIES RGS13 (ENSPPAG00000043188) RGS1 (ENSPPAG00000027449) RGS21 (ENSPPAG00000039319) ENSPPAG00000035369 RGS18 (ENSPPAG00000030843) BRINP3 (ENSPPAG00000043588) ENSPPAG00000043151 PLA2G4A (ENSPPAG00000043190) PTGS2 (ENSPPAG00000043085) PDC (ENSPPAG00000043149) ODR4 (ENSPPAG00000043114) TPR (ENSPPAG00000040829) ENSPPAG00000035348 HMCN1 (ENSPPAG00000020154) IVNS1ABP (ENSPPAG00000033318) ENSPPAG00000028826 ##22 SWT1 (ENSPPAG00000021400) TRMT1L (ENSPPAG00000029141) RNF2 (ENSPPAG00000027651) NIBAN1 (ENSPPAG00000030414) EDEM3 (ENSPPAG00000037330) ENSPPAG00000040672 C1orf21 (ENSPPAG00000027383) TSEN15 (ENSPPAG00000030953) COLGALT2 (ENSPPAG00000025172) RGL1 (ENSPPAG00000034529) APOBEC4 (ENSPPAG00000038272) ARPC5 (ENSPPAG00000038421) NCF2 (ENSPPAG00000038471) SMG7 (ENSPPAG00000031619) NMNAT2 (ENSPPAG00000025642) Gorilla MODERN SPECIES RGS13 (ENSGGOG00000001657) RGS1 (ENSGGOG00000001068) RGS21 (ENSGGOG00000036554) ENSGGOG00000039113 RGS18 (ENSGGOG00000017035) BRINP3 (ENSGGOG00000008499) PLA2G4A (ENSGGOG00000012337) PTGS2 (ENSGGOG00000027916) PDC (ENSGGOG00000024688) ENSGGOG00000002257 ODR4 (ENSGGOG00000012686) TPR (ENSGGOG00000003533) ENSGGOG00000022953 HMCN1 (ENSGGOG00000001656) IVNS1ABP (ENSGGOG00000003025) ENSGGOG00000039875 ##22 ENSGGOG00000026001 ENSGGOG00000041167 TRMT1L (ENSGGOG00000011778) RNF2 (ENSGGOG00000014400) NIBAN1 (ENSGGOG00000011625) EDEM3 (ENSGGOG00000002852) ENSGGOG00000037027 C1orf21 (ENSGGOG00000042024) TSEN15 (ENSGGOG00000015804) COLGALT2 (ENSGGOG00000013352) RGL1 (ENSGGOG00000012659) APOBEC4 (ENSGGOG00000042217) ARPC5 (ENSGGOG00000007894) NCF2 (ENSGGOG00000001013) ENSGGOG00000041494 Gibbon MODERN SPECIES 24 RGS1 (ENSNLEG00000018044) RGS21 (ENSNLEG00000028569) RGS18 (ENSNLEG00000029336) BRINP3 (ENSNLEG00000018041) ENSNLEG00000030681 ENSNLEG00000031579 PLA2G4A (ENSNLEG00000018040) PTGS2 (ENSNLEG00000018039) PDC (ENSNLEG00000018038) ODR4 (ENSNLEG00000018037) TPR (ENSNLEG00000018036) ENSNLEG00000018035 HMCN1 (ENSNLEG00000018033) IVNS1ABP (ENSNLEG00000018032) SWT1 (ENSNLEG00000018031) ENSNLEG00000033604 ##22 TRMT1L (ENSNLEG00000018030) RNF2 (ENSNLEG00000018029) NIBAN1 (ENSNLEG00000018028) EDEM3 (ENSNLEG00000018027) ENSNLEG00000028244 C1orf21 (ENSNLEG00000032562) ENSNLEG00000028607 TSEN15 (ENSNLEG00000018024) COLGALT2 (ENSNLEG00000018023) RGL1 (ENSNLEG00000018022) APOBEC4 (ENSNLEG00000035610) ARPC5 (ENSNLEG00000018020) NCF2 (ENSNLEG00000018019) SMG7 (ENSNLEG00000018018) NMNAT2 (ENSNLEG00000018017) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.a.d ##22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.a.d ##22 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2322 ENSRROG00000033991 ENSRROG00000045526 SHANK2 (ENSRROG00000031929) DHCR7 (ENSRROG00000041957) NADSYN1 (ENSRROG00000026981) ENSRROG00000034233 ENSRROG00000028333 OSBPL5 (ENSRROG00000042257) CARS1 (ENSRROG00000041623) ENSRROG00000031711 NAP1L4 (ENSRROG00000041303) ENSRROG00000044553 SLC22A18 (ENSRROG00000042171) ENSRROG00000043104 CDKN1C (ENSRROG00000019036) ENSRROG00000028793 ##22 KCNQ1 (ENSRROG00000042831) TRPM5 (ENSRROG00000038513) TSSC4 (ENSRROG00000028278) CD81 (ENSRROG00000043618) TSPAN32 (ENSRROG00000036475) C11orf21 (ENSRROG00000029654) TH (ENSRROG00000043900) INS (ENSRROG00000040762) IGF2 (ENSRROG00000029481) ENSRROG00000004661 TNNT3 (ENSRROG00000033149) LSP1 (ENSRROG00000038367) TNNI2 (ENSRROG00000028395) SYT8 (ENSRROG00000004592) CTSD (ENSRROG00000035117) Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.a.d ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.a.d ##22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.a.d ##22 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 433 ENSMNEG00000032531 DHCR7 (ENSMNEG00000043442) NADSYN1 (ENSMNEG00000032850) ENSMNEG00000028295 ENSMNEG00000031331 KRTAP5-10 (ENSMNEG00000034949) ENSMNEG00000037654 OSBPL5 (ENSMNEG00000043826) CARS1 (ENSMNEG00000034229) NAP1L4 (ENSMNEG00000039481) SLC22A18 (ENSMNEG00000037203) ENSMNEG00000016035 ENSMNEG00000030432 ENSMNEG00000036178 KCNQ1 (ENSMNEG00000043384) ENSMNEG00000045079 ##22 TRPM5 (ENSMNEG00000031765) TSSC4 (ENSMNEG00000039665) CD81 (ENSMNEG00000005402) TSPAN32 (ENSMNEG00000031055) C11orf21 (ENSMNEG00000041841) ASCL2 (ENSMNEG00000010750) TH (ENSMNEG00000037259) INS (ENSMNEG00000036460) IGF2 (ENSMNEG00000036468) ENSMNEG00000036665 ENSMNEG00000036690 TNNT3 (ENSMNEG00000007168) LSP1 (ENSMNEG00000045357) TNNI2 (ENSMNEG00000027439) SYT8 (ENSMNEG00000031561) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.a ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.a ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.a ##22 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 45 GNG12 (ENSSBOG00000023413) WLS (ENSSBOG00000029071) ENSSBOG00000017047 RPE65 (ENSSBOG00000020711) DEPDC1 (ENSSBOG00000032526) ENSSBOG00000024654 LRRC7 (ENSSBOG00000023202) LRRC40 (ENSSBOG00000033042) SRSF11 (ENSSBOG00000033461) ANKRD13C (ENSSBOG00000035265) ENSSBOG00000033163 CTH (ENSSBOG00000004834) PTGER3 (ENSSBOG00000032109) ENSSBOG00000013268 ENSSBOG00000036028 ENSSBOG00000022428 ##22 NEGR1 (ENSSBOG00000033521) ENSSBOG00000022738 LRRIQ3 (ENSSBOG00000023453) FPGT (ENSSBOG00000031862) LRRC53 (ENSSBOG00000031388) TNNI3K (ENSSBOG00000027342) ERICH3 (ENSSBOG00000030083) CRYZ (ENSSBOG00000027623) TYW3 (ENSSBOG00000022917) LHX8 (ENSSBOG00000031302) SLC44A5 (ENSSBOG00000025792) ACADM (ENSSBOG00000032362) RABGGTB (ENSSBOG00000030418) MSH4 (ENSSBOG00000020272) ASB17 (ENSSBOG00000036206) Capuchin MODERN SPECIES 22 RBIS (ENSCCAG00000012834) E2F5 (ENSCCAG00000027971) LRRCC1 (ENSCCAG00000037716) RALYL (ENSCCAG00000025003) ENSCCAG00000022816 ENSCCAG00000022591 CHMP4C (ENSCCAG00000025330) ZFAND1 (ENSCCAG00000017281) IMPA1 (ENSCCAG00000004352) ENSCCAG00000022643 FABP12 (ENSCCAG00000029659) FABP4 (ENSCCAG00000037151) FABP9 (ENSCCAG00000034511) PMP2 (ENSCCAG00000027113) FABP5 (ENSCCAG00000034226) ENSCCAG00000033845 ##22 PAG1 (ENSCCAG00000032193) ZNF704 (ENSCCAG00000028960) ENSCCAG00000021608 ZBTB10 (ENSCCAG00000035024) TPD52 (ENSCCAG00000028562) MRPS28 (ENSCCAG00000022534) HEY1 (ENSCCAG00000028786) STMN2 (ENSCCAG00000031143) EIF3K (ENSCCAG00000029206) ENSCCAG00000029483 IL7 (ENSCCAG00000032867) ZC2HC1A (ENSCCAG00000022919) PKIA (ENSCCAG00000018464) ENSCCAG00000000493 ZFHX4 (ENSCCAG00000026493) Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b ##22 Euarchontoglires DUPLICATION Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b.a ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b.a ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b.a ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b.a ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000162735 ENSGT00390000017672 ENSGT01030000234513.A.a.a.a.b.b ENSGT01030000234513.A.a.a.a.b.a ENSGT01030000234513.A.a.a.a.a ENSGT01090000260070.B ENSGT00390000002480 ENSGT00390000009435 ENSGT00910000147888 ENSGT00940000159513 ENSGT00650000093733 ENSGT00940000154325.b ENSGT00940000162386 ENSGT00940000157337 ENSGT00940000156221 ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b.a ##22 ENSGT00940000159550 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00390000012030.a ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000161580 ENSGT00940000159768 ENSGT00940000162735 ENSGT00390000017672 ENSGT01030000234513.A.a.a.a.b.b ENSGT01030000234513.A.a.a.a.b.a ENSGT01030000234513.A.a.a.a.a ENSGT01090000260070.B ENSGT00390000009435 ENSGT00940000159513 ENSGT00650000093733 ENSGT00940000154325.b ENSGT00940000162386 ENSGT00940000157337 ENSGT00940000156221 ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b.a ##22 ENSGT00940000159550 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00390000012030.a ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a Gibbon MODERN SPECIES 2 ZSCAN20 (ENSNLEG00000003289) CSMD2 (ENSNLEG00000003311) HMGB4 (ENSNLEG00000018198) C1orf94 (ENSNLEG00000003476) GJB5 (ENSNLEG00000003498) GJB4 (ENSNLEG00000018199) ENSNLEG00000018200 SMIM12 (ENSNLEG00000018201) DLGAP3 (ENSNLEG00000003515) ENSNLEG00000003521 TMEM35B (ENSNLEG00000003522) ZMYM6 (ENSNLEG00000003530) ZMYM1 (ENSNLEG00000003575) ENSNLEG00000035521 ZMYM4 (ENSNLEG00000010891) ENSNLEG00000018998 ##22 ENSNLEG00000031618 KIAA0319L (ENSNLEG00000011001) NCDN (ENSNLEG00000011043) TFAP2E (ENSNLEG00000011088) PSMB2 (ENSNLEG00000034792) C1orf216 (ENSNLEG00000035826) CLSPN (ENSNLEG00000011110) AGO4 (ENSNLEG00000011125) AGO1 (ENSNLEG00000011181) AGO3 (ENSNLEG00000027092) TEKT2 (ENSNLEG00000011235) ADPRS (ENSNLEG00000011265) ENSNLEG00000011300 TRAPPC3 (ENSNLEG00000031818) ENSNLEG00000011317 Hominidae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000161580 ENSGT00940000159768 ENSGT00940000162735 ENSGT00390000017672 ENSGT01030000234513.A.a.a.a.b.b ENSGT01030000234513.A.a.a.a.b.a ENSGT01030000234513.A.a.a.a.a ENSGT01090000260070.B ENSGT00390000009435 ENSGT00940000159513 ENSGT00650000093733 ENSGT00940000154325.b ENSGT00940000162386 ENSGT00940000157337 ENSGT00940000156221 ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b.a ##22 ENSGT00940000159550 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00390000012030.a ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a Orangutan MODERN SPECIES PHC2 (ENSPPYG00000001573) ZSCAN20 (ENSPPYG00000001572) HMGB4 (ENSPPYG00000001571) CSMD2 (ENSPPYG00000001570) C1orf94 (ENSPPYG00000001569) GJB5 (ENSPPYG00000001568) GJB4 (ENSPPYG00000001567) GJB3 (ENSPPYG00000001566) GJA4 (ENSPPYG00000001565) ENSPPYG00000040242 DLGAP3 (ENSPPYG00000001564) ENSPPYG00000001563 ZMYM6 (ENSPPYG00000001562) ZMYM1 (ENSPPYG00000001561) SFPQ (ENSPPYG00000001560) ENSPPYG00000035382 ##22 ZMYM4 (ENSPPYG00000001559) KIAA0319L (ENSPPYG00000001558) NCDN (ENSPPYG00000001557) TFAP2E (ENSPPYG00000001556) PSMB2 (ENSPPYG00000001555) C1orf216 (ENSPPYG00000001554) CLSPN (ENSPPYG00000001553) AGO4 (ENSPPYG00000001552) AGO1 (ENSPPYG00000001551) AGO3 (ENSPPYG00000001550) ENSPPYG00000040273 TEKT2 (ENSPPYG00000001549) ADPRS (ENSPPYG00000001548) COL8A2 (ENSPPYG00000001547) TRAPPC3 (ENSPPYG00000001546) Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000161580 ENSGT00940000159768 ENSGT00940000162735 ENSGT00390000017672 ENSGT01030000234513.A.a.a.a.b.b ENSGT01030000234513.A.a.a.a.b.a ENSGT01030000234513.A.a.a.a.a ENSGT01090000260070.B ENSGT00390000009435 ENSGT00940000159513 ENSGT00650000093733 ENSGT00940000154325.b ENSGT00940000162386 ENSGT00940000157337 ENSGT00940000156221 ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b.a ##22 ENSGT00940000159550 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00390000012030.a ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a Gorilla MODERN SPECIES PHC2 (ENSGGOG00000003599) ZSCAN20 (ENSGGOG00000005694) CSMD2 (ENSGGOG00000017177) C1orf94 (ENSGGOG00000002112) GJB5 (ENSGGOG00000008954) GJB4 (ENSGGOG00000008958) ENSGGOG00000040481 SMIM12 (ENSGGOG00000043837) DLGAP3 (ENSGGOG00000013343) ENSGGOG00000043198 TMEM35B (ENSGGOG00000026101) ZMYM6 (ENSGGOG00000009644) ZMYM1 (ENSGGOG00000028505) SFPQ (ENSGGOG00000026354) ZMYM4 (ENSGGOG00000012150) ENSGGOG00000023775 ##22 KIAA0319L (ENSGGOG00000012068) NCDN (ENSGGOG00000009754) TFAP2E (ENSGGOG00000009762) PSMB2 (ENSGGOG00000009771) C1orf216 (ENSGGOG00000043887) CLSPN (ENSGGOG00000005981) AGO4 (ENSGGOG00000036532) AGO1 (ENSGGOG00000003316) AGO3 (ENSGGOG00000036711) ENSGGOG00000043836 TEKT2 (ENSGGOG00000003766) ADPRS (ENSGGOG00000003770) COL8A2 (ENSGGOG00000003772) TRAPPC3 (ENSGGOG00000004752) MAP7D1 (ENSGGOG00000003219) Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000161580 ENSGT00940000159768 ENSGT00940000162735 ENSGT00390000017672 ENSGT01030000234513.A.a.a.a.b.b ENSGT01030000234513.A.a.a.a.b.a ENSGT01030000234513.A.a.a.a.a ENSGT01090000260070.B ENSGT00390000009435 ENSGT00940000159513 ENSGT00650000093733 ENSGT00940000154325.b ENSGT00940000162386 ENSGT00940000157337 ENSGT00940000156221 ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b.a ##22 ENSGT00940000159550 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b Pan ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182858.C ENSGT00940000160840 ENSGT00940000161580 ENSGT00940000159768 ENSGT00390000017672 ENSGT01030000234513.A.a.a.a.b.b ENSGT01030000234513.A.a.a.a.b.a ENSGT00390000002480 ENSGT00390000009435 ENSGT00940000159513 ENSGT00650000093733 ENSGT00940000154325.b ENSGT00940000162386 ENSGT00940000157337 ENSGT00940000156221 ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b.a ##22 ENSGT00940000159550 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a ENSGT00950000182941.a.a.b Chimpanzee MODERN SPECIES 6 ENSPTRG00000043911 ENSPTRG00000030350 ENSPTRG00000006850 ENSPTRG00000046635 ENSPTRG00000050016 OCA2 (ENSPTRG00000006834) GABRG3 (ENSPTRG00000052476) GABRA5 (ENSPTRG00000006832) GABRB3 (ENSPTRG00000006831) ENSPTRG00000047058 ATP10A (ENSPTRG00000030356) UBE3A (ENSPTRG00000006829) ENSPTRG00000046808 SNURF (ENSPTRG00000034046) SNRPN (ENSPTRG00000006826) ENSPTRG00000044022 ##22 NPAP1 (ENSPTRG00000030358) ENSPTRG00000042825 MAGEL2 (ENSPTRG00000032582) MKRN3 (ENSPTRG00000051959) ENSPTRG00000051938 ENSPTRG00000052123 ENSPTRG00000029928 NIPA1 (ENSPTRG00000051453) NIPA2 (ENSPTRG00000052089) CYFIP1 (ENSPTRG00000006818) TUBGCP5 (ENSPTRG00000006817) ENSPTRG00000046381 ENSPTRG00000006815 ENSPTRG00000024048 ENSPTRG00000045652 Bonobo DUPLICATION Bonobo MODERN SPECIES PHC2 (ENSPPAG00000023196) ZSCAN20 (ENSPPAG00000013288) CSMD2 (ENSPPAG00000043765) C1orf94 (ENSPPAG00000040160) GJB5 (ENSPPAG00000019245) GJB4 (ENSPPAG00000012554) ENSPPAG00000008621 SMIM12 (ENSPPAG00000005985) DLGAP3 (ENSPPAG00000039097) ENSPPAG00000043640 TMEM35B (ENSPPAG00000012633) ZMYM6 (ENSPPAG00000032166) ZMYM1 (ENSPPAG00000038162) SFPQ (ENSPPAG00000030078) ZMYM4 (ENSPPAG00000031498) ENSPPAG00000043691 ##22 KIAA0319L (ENSPPAG00000033357) NCDN (ENSPPAG00000040334) TFAP2E (ENSPPAG00000039587) PSMB2 (ENSPPAG00000043554) C1orf216 (ENSPPAG00000004841) CLSPN (ENSPPAG00000029163) AGO4 (ENSPPAG00000031752) AGO1 (ENSPPAG00000034838) AGO3 (ENSPPAG00000031959) TEKT2 (ENSPPAG00000032256) ADPRS (ENSPPAG00000041931) COL8A2 (ENSPPAG00000031750) TRAPPC3 (ENSPPAG00000041117) MAP7D1 (ENSPPAG00000039211) THRAP3 (ENSPPAG00000028961) Bonobo MODERN SPECIES 6 ENSPPAG00000011211 ENSPPAG00000037540 ENSPPAG00000032441 HERC2 (ENSPPAG00000031770) OCA2 (ENSPPAG00000036995) GABRG3 (ENSPPAG00000036643) GABRA5 (ENSPPAG00000037305) GABRB3 (ENSPPAG00000039754) ENSPPAG00000037400 ATP10A (ENSPPAG00000007479) UBE3A (ENSPPAG00000037743) ENSPPAG00000043325 ENSPPAG00000035186 SNURF (ENSPPAG00000030924) SNRPN (ENSPPAG00000027650) ENSPPAG00000027823 ##22 ENSPPAG00000010428 MAGEL2 (ENSPPAG00000036442) ENSPPAG00000033415 ENSPPAG00000037386 NIPA1 (ENSPPAG00000035632) NIPA2 (ENSPPAG00000031169) CYFIP1 (ENSPPAG00000027494) TUBGCP5 (ENSPPAG00000028817) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000162735 ENSGT00390000017672 ENSGT01030000234513.A.a.a.a.b.b ENSGT01030000234513.A.a.a.a.b.a ENSGT01030000234513.A.a.a.a.a ENSGT01090000260070.B ENSGT00390000002480 ENSGT00390000009435 ENSGT00910000147888 ENSGT00940000159513 ENSGT00650000093733 ENSGT00940000154325.b ENSGT00940000162386 ENSGT00940000157337 ENSGT00940000156221 ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b.a ##22 ENSGT00940000159550 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00390000012030.a ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162735 ENSGT00390000017672 ENSGT01030000234513.A.a.a.a.b.b ENSGT01030000234513.A.a.a.a.b.a ENSGT01030000234513.A.a.a.a.a ENSGT01090000260070.B ENSGT00390000002480 ENSGT00390000009435 ENSGT00910000147888 ENSGT00940000159513 ENSGT00650000093733 ENSGT00940000154325.b ENSGT00940000162386 ENSGT00940000157337 ENSGT00940000156221 ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b.a ##22 ENSGT00940000159550 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00390000012030.a ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a Vervet Monkey MODERN SPECIES 12 BTBD8 (ENSCSAG00000001465) #15 C1orf146 (ENSCSAG00000001466) #16 GLMN (ENSCSAG00000001467) #17 RPAP2 (ENSCSAG00000001468) #18 GFI1 (ENSCSAG00000001469) #19 ENSCSAG00000000156 EVI5 (ENSCSAG00000001470) #20 ENSCSAG00000001471 ##22 DIPK1A (ENSCSAG00000001472) #23 MTF2 (ENSCSAG00000001474) #26 TMED5 (ENSCSAG00000001475) #27 CCDC18 (ENSCSAG00000001476) #28 DR1 (ENSCSAG00000001477) #29 FNBP1L (ENSCSAG00000001478) #30 BCAR3 (ENSCSAG00000001479) #31 ENSCSAG00000000157 ##22 ENSCSAG00000001480 #32 GCLM (ENSCSAG00000001481) #34 ABCA4 (ENSCSAG00000001482) #35 ARHGAP29 (ENSCSAG00000001483) #36 ABCD3 (ENSCSAG00000001484) F3 (ENSCSAG00000001485) SLC44A3 (ENSCSAG00000001486) CNN3 (ENSCSAG00000001487) ALG14 (ENSCSAG00000001488) ENSCSAG00000001489 TLCD4 (ENSCSAG00000001490) RWDD3 (ENSCSAG00000001491) ENSCSAG00000001493 PTBP2 (ENSCSAG00000001494) DPYD (ENSCSAG00000001495) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162735 ENSGT00390000017672 ENSGT01030000234513.A.a.a.a.b.b ENSGT01030000234513.A.a.a.a.b.a ENSGT01030000234513.A.a.a.a.a ENSGT01090000260070.B ENSGT00390000002480 ENSGT00390000009435 ENSGT00910000147888 ENSGT00940000159513 ENSGT00650000093733 ENSGT00940000154325.b ENSGT00940000162386 ENSGT00940000157337 ENSGT00940000156221 ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b.a ##22 ENSGT00940000159550 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729.d ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00390000012030.a ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000159768 ENSGT00940000162735 ENSGT00390000017672 ENSGT01030000234513.A.a.a.a.b.b ENSGT01030000234513.A.a.a.a.b.a ENSGT01030000234513.A.a.a.a.a ENSGT01090000260070.B ENSGT00390000009435 ENSGT00910000147888 ENSGT00940000159513 ENSGT00650000093733 ENSGT00940000154325.b ENSGT00940000162386 ENSGT00940000157337 ENSGT00940000156221.d ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b.a ##22 ENSGT00940000156221.c.b ENSGT00940000159550 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729.d ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00390000012030.a ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000159768 ENSGT00940000162735 ENSGT00390000017672 ENSGT01030000234513.A.a.a.a.b.b ENSGT01030000234513.A.a.a.a.b.a ENSGT01030000234513.A.a.a.a.a ENSGT00390000002480 ENSGT00390000009435 ENSGT00910000147888 ENSGT00940000159513 ENSGT00650000093733 ENSGT00940000154325.b ENSGT00940000162386 ENSGT00940000157337 ENSGT00940000156221.d ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b.a ##22 ENSGT00940000159550 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729.d ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00390000012030.a ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a ENSGT00390000003880.b.a Drill MODERN SPECIES 1182 C1orf94 (ENSMLEG00000036052) GJB5 (ENSMLEG00000027533) GJB4 (ENSMLEG00000018745) ENSMLEG00000009138 SMIM12 (ENSMLEG00000028333) ENSMLEG00000001304 DLGAP3 (ENSMLEG00000036514) ENSMLEG00000033529 TMEM35B (ENSMLEG00000000079) ZMYM6 (ENSMLEG00000041873) ZMYM1 (ENSMLEG00000040094) ENSMLEG00000010643 ZMYM4 (ENSMLEG00000043391) ENSMLEG00000009523 ##22 KIAA0319L (ENSMLEG00000028497) NCDN (ENSMLEG00000032151) TFAP2E (ENSMLEG00000041305) PSMB2 (ENSMLEG00000041248) C1orf216 (ENSMLEG00000024398) CLSPN (ENSMLEG00000028042) Sooty mangabey MODERN SPECIES 227 HMGB4 (ENSCATG00000006414) CSMD2 (ENSCATG00000029554) C1orf94 (ENSCATG00000042668) ENSCATG00000002279 GJB5 (ENSCATG00000003985) GJB4 (ENSCATG00000004245) GJB3 (ENSCATG00000006471) ENSCATG00000006495 SMIM12 (ENSCATG00000004268) DLGAP3 (ENSCATG00000021045) ENSCATG00000043216 TMEM35B (ENSCATG00000022162) ZMYM6 (ENSCATG00000033137) ZMYM1 (ENSCATG00000043393) ENSCATG00000032664 ENSCATG00000043711 ##22 ZMYM4 (ENSCATG00000034945) ENSCATG00000042306 KIAA0319L (ENSCATG00000043672) NCDN (ENSCATG00000043234) TFAP2E (ENSCATG00000032602) PSMB2 (ENSCATG00000038881) C1orf216 (ENSCATG00000006919) CLSPN (ENSCATG00000044080) AGO4 (ENSCATG00000043421) AGO1 (ENSCATG00000031521) AGO3 (ENSCATG00000029748) ENSCATG00000005617 TEKT2 (ENSCATG00000042764) ADPRS (ENSCATG00000042745) COL8A2 (ENSCATG00000032341) Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b.a ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b.a ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b.a ##22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b.a ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b.a ##22 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 144 Ttf2 (ENSJJAG00000015225) Trim45 (ENSJJAG00000007227) Vtcn1 (ENSJJAG00000019207) ENSJJAG00000018170 Man1a2 (ENSJJAG00000017865) Tent5c (ENSJJAG00000013174) ENSJJAG00000017333 ENSJJAG00000014767 ENSJJAG00000013768 ENSJJAG00000013505 Wdr3 (ENSJJAG00000013861) Spag17 (ENSJJAG00000008428) Tbx15 (ENSJJAG00000013591) ENSJJAG00000013379 Wars2 (ENSJJAG00000000897) ENSJJAG00000022645 ##22 Hao2 (ENSJJAG00000021719) ENSJJAG00000018205 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b.a ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b.a ##22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b.a ##22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b.a ##22 Prairie vole MODERN SPECIES 353 Thumpd2 (ENSMOCG00000018094) ENSMOCG00000000636 Slc8a1 (ENSMOCG00000017983) Pkdcc (ENSMOCG00000002662) Eml4 (ENSMOCG00000020764) Cox7a2l (ENSMOCG00000012418) Kcng3 (ENSMOCG00000011778) Mta3 (ENSMOCG00000017936) Haao (ENSMOCG00000015453) Zfp36l2 (ENSMOCG00000011066) ENSMOCG00000021185 ENSMOCG00000014683 ENSMOCG00000011429 ENSMOCG00000011467 ENSMOCG00000007015 ENSMOCG00000021154 ##22 ENSMOCG00000020687 ENSMOCG00000017805 2610008E11Rik (ENSMOCG00000008949) ENSMOCG00000008222 Or7a36 (ENSMOCG00000002619) Slc1a6 (ENSMOCG00000020405) Ccdc105 (ENSMOCG00000013529) Casp14 (ENSMOCG00000013844) Syde1 (ENSMOCG00000010233) Ilvbl (ENSMOCG00000007265) Notch3 (ENSMOCG00000001344) Ephx3 (ENSMOCG00000016735) Brd4 (ENSMOCG00000019710) ##7 Akap8 (ENSMOCG00000001588) Akap8l (ENSMOCG00000017098) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b.a ##22 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b.a ##22 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 156 KIF4A (ENSSVLG00005017359) ENSSVLG00005017695 ARR3 (ENSSVLG00005017806) P2RY4 (ENSSVLG00005018235) AWAT1 (ENSSVLG00005018253) DGAT2L6 (ENSSVLG00005018323) ENSSVLG00005018402 OTUD6A (ENSSVLG00005018462) AWAT2 (ENSSVLG00005018479) EDA (ENSSVLG00005018551) ENSSVLG00005018578 NALF2 (ENSSVLG00005018605) PJA1 (ENSSVLG00005018646) EFNB1 (ENSSVLG00005018688) STARD8 (ENSSVLG00005018732) ENSSVLG00005018990 ##22 YIPF6 (ENSSVLG00005019022) OPHN1 (ENSSVLG00005019135) AR (ENSSVLG00005019210) ENSSVLG00005019287 EDA2R (ENSSVLG00005019344) ENSSVLG00005019406 ENSSVLG00005019524 ENSSVLG00005019595 ENSSVLG00005019660 HEPH (ENSSVLG00005019774) VSIG4 (ENSSVLG00005020025) ENSSVLG00005020115 ENSSVLG00005020160 MSN (ENSSVLG00005020199) ENSSVLG00005020269 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b.b ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b.b ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b.b ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b.b ##22 Platyrrhini DUPLICATION Platyrrhini DUPLICATION Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b.b.a.a ##22 Mas night monkey MODERN SPECIES 576 ENSANAG00000020883 ENSANAG00000003962 CDH9 (ENSANAG00000023798) CDH6 (ENSANAG00000022677) DROSHA (ENSANAG00000020506) ENSANAG00000033792 ENSANAG00000037458 ##22 C5orf22 (ENSANAG00000032676) ENSANAG00000032486 PDZD2 (ENSANAG00000009047) ENSANAG00000006555 GOLPH3 (ENSANAG00000004528) MTMR12 (ENSANAG00000028689) ZFR (ENSANAG00000023333) ENSANAG00000011651 NPR3 (ENSANAG00000030984) ENSANAG00000031027 TARS1 (ENSANAG00000020786) ADAMTS12 (ENSANAG00000025930) SLC45A2 (ENSANAG00000033766) AMACR (ENSANAG00000031501) C1QTNF3 (ENSANAG00000037935) Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b.b.a.a ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b.b.a.a ##22 Capuchin MODERN SPECIES 75 IBA57 (ENSCCAG00000019844) ENSCCAG00000023630 OBSCN (ENSCCAG00000032571) ENSCCAG00000016195 TRIM11 (ENSCCAG00000036943) TRIM17 (ENSCCAG00000025121) ENSCCAG00000036407 H2AW (ENSCCAG00000012315) H2BU1 (ENSCCAG00000015023) ENSCCAG00000012567 RNF187 (ENSCCAG00000028705) ENSCCAG00000025344 ENSCCAG00000018435 ##33 AHCTF1 (ENSCCAG00000023436) SCCPDH (ENSCCAG00000022176) ENSCCAG00000020404 ##22 CNST (ENSCCAG00000038009) TFB2M (ENSCCAG00000028811) SMYD3 (ENSCCAG00000021189) ENSCCAG00000021180 KIF26B (ENSCCAG00000031008) ENSCCAG00000032757 ENSCCAG00000037859 ENSCCAG00000035009 ENSCCAG00000029940 DESI2 (ENSCCAG00000032727) CATSPERE (ENSCCAG00000024353) ADSS (ENSCCAG00000019985) C1orf100 (ENSCCAG00000026529) ENSCCAG00000034313 ENSCCAG00000012153 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00950000183058.A.a ENSGT00950000185149 ENSGT00390000011644 ENSGT00440000039028 ENSGT00390000018059.b ENSGT01020000230412.A.c.b.d ENSGT00390000002659 ENSGT00940000163309 ENSGT00940000162687 ENSGT00390000008608 ENSGT00940000156906 ENSGT00940000161269 ENSGT00940000157774 ENSGT00940000154374.b ENSGT00940000154205.h.bb ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b.b.a.b ##22 ENSGT00390000004199 ENSGT00940000157380 ENSGT00940000159036 ENSGT00390000014067 ENSGT00390000013340 ENSGT00940000154842.a.b ENSGT00940000153464.A.b ENSGT00940000157769 ENSGT00940000163577 ENSGT00510000046975.b.t ENSGT00390000007598 ENSGT00510000046975.b.u ENSGT00940000157757 ENSGT00940000159221 ENSGT00930000151041 Mas night monkey MODERN SPECIES 893 UCK2 (ENSANAG00000031914) TMCO1 (ENSANAG00000021952) ALDH9A1 (ENSANAG00000029992) MGST3 (ENSANAG00000022897) LRRC52 (ENSANAG00000029215) RXRG (ENSANAG00000031942) LMX1A (ENSANAG00000020495) PBX1 (ENSANAG00000026588) ENSANAG00000027656 ENSANAG00000013627 ENSANAG00000027887 ##22 NUF2 (ENSANAG00000027298) RGS5 (ENSANAG00000026600) RGS4 (ENSANAG00000019849) CCDC190 (ENSANAG00000023182) HSD17B7 (ENSANAG00000023761) DDR2 (ENSANAG00000022647) UAP1 (ENSANAG00000027960) UHMK1 (ENSANAG00000022526) ENSANAG00000030813 ENSANAG00000028318 SH2D1B (ENSANAG00000001807) SPATA46 (ENSANAG00000000057) ENSANAG00000037585 OLFML2B (ENSANAG00000023374) ENSANAG00000025221 Cebidae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00950000183058.A.a ENSGT00950000185149 ENSGT00390000011644 ENSGT00440000039028 ENSGT00390000018059.b ENSGT01020000230412.A.c.b.d ENSGT00390000002659 ENSGT00940000163309 ENSGT00940000162687 ENSGT00390000008608 ENSGT00940000156906 ENSGT00940000161269 ENSGT00940000157774 ENSGT00940000154374.b ENSGT00940000154205.h.bb ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b.b.a.b ##22 ENSGT00390000004199 ENSGT00940000157380 ENSGT00940000159036 ENSGT00390000014067 ENSGT00390000013340 ENSGT00940000154842.a.b ENSGT00940000153464.A.b ENSGT00940000157769 ENSGT00940000163577 ENSGT00510000046975.b.t ENSGT00390000007598 ENSGT00510000046975.b.u ENSGT00940000157757 ENSGT00940000159221 ENSGT00930000151041 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000003645 ENSGT00950000183058.A.a ENSGT00390000011644 ENSGT00440000039028 ENSGT00390000018059.b ENSGT01020000230412.A.c.b.d ENSGT00390000002659 ENSGT00940000163309 ENSGT00940000162687 ENSGT00390000008608 ENSGT00940000156906 ENSGT00940000161269 ENSGT00940000157774 ENSGT00940000154374.b ENSGT00940000154205.h.bb.a ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b.b.a.b ##22 ENSGT00390000004199 ENSGT00940000157380 ENSGT00940000159036 ENSGT00390000014067 ENSGT00390000013340 ENSGT00940000154842.a.b ENSGT00940000153464.A.b ENSGT00940000157769 ENSGT00940000163577 ENSGT00510000046975.b.t ENSGT00390000007598 ENSGT00510000046975.b.u ENSGT00940000157757 ENSGT00940000159221 ENSGT00930000151041 Capuchin MODERN SPECIES 84 ILDR2 (ENSCCAG00000000050) TADA1 (ENSCCAG00000033176) POGK (ENSCCAG00000021290) FAM78B (ENSCCAG00000029557) UCK2 (ENSCCAG00000017279) ENSCCAG00000003454 TMCO1 (ENSCCAG00000026618) ENSCCAG00000035062 AK2 (ENSCCAG00000034083) ENSCCAG00000036520 LRRC52 (ENSCCAG00000034298) RXRG (ENSCCAG00000035383) LMX1A (ENSCCAG00000023901) PBX1 (ENSCCAG00000020895) ENSCCAG00000026512 ENSCCAG00000034086 ##22 NUF2 (ENSCCAG00000036193) RGS5 (ENSCCAG00000023580) RGS4 (ENSCCAG00000029323) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b.b.b ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b.b.b ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b.b.b ##22 Capuchin MODERN SPECIES 65 SLC35D3 (ENSCCAG00000034349) ENSCCAG00000024812 IL20RA (ENSCCAG00000028945) IL22RA2 (ENSCCAG00000028239) IFNGR1 (ENSCCAG00000028495) OLIG3 (ENSCCAG00000032329) ENSCCAG00000022443 TNFAIP3 (ENSCCAG00000026453) PERP (ENSCCAG00000024325) ARFGEF3 (ENSCCAG00000022363) SMIM28 (ENSCCAG00000022535) HEBP2 (ENSCCAG00000022742) NHSL1 (ENSCCAG00000021733) ENSCCAG00000023318 CCDC28A (ENSCCAG00000035861) ENSCCAG00000035560 ##22 ECT2L (ENSCCAG00000037523) ENSCCAG00000036662 REPS1 (ENSCCAG00000034433) ABRACL (ENSCCAG00000028305) HECA (ENSCCAG00000020918) TXLNB (ENSCCAG00000034584) CITED2 (ENSCCAG00000019744) NMBR (ENSCCAG00000033189) VTA1 (ENSCCAG00000032828) ADGRG6 (ENSCCAG00000027957) HIVEP2 (ENSCCAG00000035347) AIG1 (ENSCCAG00000033986) ADAT2 (ENSCCAG00000027091) PEX3 (ENSCCAG00000035697) FUCA2 (ENSCCAG00000035432) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT01030000234527.A.a.b.a.a ENSGT00940000159105 ENSGT01030000234597.a.b.a ENSGT00940000160868 ENSGT00940000157269.a.a ENSGT00940000158299 ENSGT00940000158614 ENSGT00530000063668.B ENSGT00940000158238 ENSGT00390000004380.m.a.b ENSGT00940000158598 ENSGT00720000108839 ENSGT00950000183074.B.a.a ENSGT00390000007091 ENSGT00390000013141 ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b.b ##22 ENSGT00950000183149.C ENSGT00940000157136 ENSGT00940000159021 ENSGT00940000156491.a ENSGT00940000156692 ENSGT00910000147307 ENSGT00390000001445 ENSGT00940000154928.c.a ENSGT00940000155500 ENSGT00940000159066 ENSGT00940000153487.b.b.i.b ENSGT00390000013419 ENSGT00390000006503.b ENSGT01030000234564.a.a.b.b ENSGT00390000017890 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT01030000234527.A.a.b.a.a ENSGT00940000159105 ENSGT01030000234597.a.b.a ENSGT00940000160868 ENSGT00940000157269.a.a ENSGT00940000158299 ENSGT00940000158614 ENSGT00530000063668.B ENSGT00940000158238 ENSGT00390000004380.m.a.b ENSGT00940000158598 ENSGT00720000108839 ENSGT00950000183074.B.a.a ENSGT00390000007091 ENSGT00390000013141 ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b.b ##22 ENSGT00950000183149.C ENSGT00940000157136 ENSGT00940000159021 ENSGT00940000156491.a ENSGT00940000156692 ENSGT00390000001445 ENSGT00940000154928.c.a ENSGT00940000155500 ENSGT00940000159066 ENSGT00940000153487.b.b.i.b ENSGT00390000013419 ENSGT00390000006503.b ENSGT01030000234564.a.a.b.b ENSGT00390000017890 ENSGT00940000165777 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT01030000234527.A.a.b.a.a ENSGT00940000159105 ENSGT01030000234597.a.b.a ENSGT00940000160868 ENSGT00940000157269.a.a ENSGT00940000158299 ENSGT00940000158614 ENSGT00530000063668.B ENSGT00940000158238 ENSGT00390000004380.m.a.b ENSGT00940000158598 ENSGT00720000108839 ENSGT00950000183074.B.a.a ENSGT00390000007091 ENSGT00390000013141 ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b.b ##22 ENSGT00950000183149.C ENSGT00940000157136 ENSGT00940000159021 ENSGT00940000156491.a ENSGT00940000156692 ENSGT00390000001445 ENSGT00940000154928.c.a ENSGT00940000155500 ENSGT00940000159066 ENSGT00940000153487.b.b.i.b ENSGT00390000013419 ENSGT00390000006503.b ENSGT01030000234564.a.a.b.b ENSGT00390000017890 ENSGT00940000165777 Cercopithecinae_a DUPLICATION Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT01030000234527.A.a.b.a.a ENSGT00940000159105 ENSGT01030000234597.a.b.a ENSGT00940000160868 ENSGT00940000157269.a.a ENSGT00940000158299 ENSGT00940000158614 ENSGT00530000063668.B ENSGT00940000158238 ENSGT00390000004380.m.a.b ENSGT00940000158598 ENSGT00720000108839 ENSGT00950000183074.B.a.a ENSGT00390000007091 ENSGT00390000013141 ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b.b.c ##22 ENSGT00950000183149.C ENSGT00940000157136 ENSGT00940000159021 ENSGT00940000156491.a ENSGT00940000156692 ENSGT00390000001445 ENSGT00940000154928.c.a ENSGT00940000155500 ENSGT00940000159066 ENSGT00940000153487.b.b.i.b ENSGT00390000013419 ENSGT00390000006503.b ENSGT01030000234564.a.a.b.b ENSGT00390000017890 ENSGT00940000165777 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT01030000234527.A.a.b.a.a ENSGT00940000159105 ENSGT01030000234597.a.b.a ENSGT00940000160868 ENSGT00940000157269.a.a ENSGT00940000158299 ENSGT00940000158614 ENSGT00530000063668.B ENSGT00940000158238 ENSGT00390000004380.m.a.b ENSGT00940000158598 ENSGT00720000108839 ENSGT00950000183074.B.a.a ENSGT00390000007091 ENSGT00390000013141 ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b.b.c ##22 ENSGT00950000183149.C ENSGT00940000157136 ENSGT00940000159021 ENSGT00940000156491.a ENSGT00940000156692 ENSGT00390000001445 ENSGT00940000154928.c.a ENSGT00940000155500 ENSGT00940000159066 ENSGT00940000153487.b.b.i.b ENSGT00390000013419 ENSGT00390000006503.b ENSGT01030000234564.a.a.b.b ENSGT00390000017890 ENSGT00940000165777 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 50 ENSGT01030000234527.A.a.b.a.a ENSGT00940000159105 ENSGT01030000234597.a.b.a ENSGT00940000160868 ENSGT00940000157269.a.a ENSGT00940000158299 ENSGT00940000158614 ENSGT00530000063668.B ENSGT00940000158238 ENSGT00390000004380.m.a.b ENSGT00940000158598 ENSGT00720000108839 ENSGT00950000183074.B.a.a ENSGT00390000007091 ENSGT00390000013141 ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b.b.c ##22 ENSGT00950000183149.C ENSGT00940000157136 ENSGT00940000159021 ENSGT00940000156491.a ENSGT00940000156692 ENSGT00390000001445 ENSGT00940000154928.c.a ENSGT00940000155500 ENSGT00940000159066 ENSGT00940000153487.b.b.i.b ENSGT00390000013419 ENSGT00390000006503.b ENSGT01030000234564.a.a.b.b ENSGT00390000017890 ENSGT00940000165777 Sooty mangabey MODERN SPECIES 555 DPYSL2 (ENSCATG00000034654) ADRA1A (ENSCATG00000045125) STMN4 (ENSCATG00000022939) TRIM35 (ENSCATG00000032262) PTK2B (ENSCATG00000032885) CHRNA2 (ENSCATG00000031746) EPHX2 (ENSCATG00000029846) CLU (ENSCATG00000009271) SCARA3 (ENSCATG00000037167) ENSCATG00000033671 ESCO2 (ENSCATG00000032436) PBK (ENSCATG00000023001) SCARA5 (ENSCATG00000032773) NUGGC (ENSCATG00000011556) ELP3 (ENSCATG00000034665) ENSCATG00000035437 ##22 PNOC (ENSCATG00000034393) ZNF395 (ENSCATG00000032647) FBXO16 (ENSCATG00000040856) FZD3 (ENSCATG00000044589) EXTL3 (ENSCATG00000029453) INTS9 (ENSCATG00000042463) HMBOX1 (ENSCATG00000037589) KIF13B (ENSCATG00000008274) DUSP4 (ENSCATG00000031537) ENSCATG00000041532 SARAF (ENSCATG00000044043) LEPROTL1 (ENSCATG00000037168) MBOAT4 (ENSCATG00000029389) DCTN6 (ENSCATG00000038873) ENSCATG00000038571 Drill MODERN SPECIES 879 DPYSL2 (ENSMLEG00000042022) ADRA1A (ENSMLEG00000043053) STMN4 (ENSMLEG00000037742) TRIM35 (ENSMLEG00000030731) PTK2B (ENSMLEG00000030832) CHRNA2 (ENSMLEG00000029000) EPHX2 (ENSMLEG00000029411) CLU (ENSMLEG00000035141) SCARA3 (ENSMLEG00000035030) ENSMLEG00000029491 ESCO2 (ENSMLEG00000033287) PBK (ENSMLEG00000031460) SCARA5 (ENSMLEG00000041455) NUGGC (ENSMLEG00000042548) ELP3 (ENSMLEG00000040984) ENSMLEG00000015003 ##22 PNOC (ENSMLEG00000031812) ZNF395 (ENSMLEG00000005455) FBXO16 (ENSMLEG00000007596) FZD3 (ENSMLEG00000040352) EXTL3 (ENSMLEG00000040065) INTS9 (ENSMLEG00000027845) ENSMLEG00000043883 Macaca ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT01030000234527.A.a.b.a.a ENSGT00940000159105 ENSGT01030000234597.a.b.a ENSGT00940000160868 ENSGT00940000157269.a.a ENSGT00940000158299 ENSGT00940000158614 ENSGT00530000063668.B ENSGT00940000158238 ENSGT00390000004380.m.a.b ENSGT00940000158598 ENSGT00720000108839 ENSGT00950000183074.B.a.a ENSGT00390000007091 ENSGT00390000013141 ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b.b.c ##22 ENSGT00950000183149.C ENSGT00940000157136 ENSGT00940000159021 ENSGT00940000156491.a ENSGT00940000156692 ENSGT00390000001445 ENSGT00940000154928.c.a ENSGT00940000155500 ENSGT00940000159066 ENSGT00940000153487.b.b.i.b ENSGT00390000013419 ENSGT00390000006503.b ENSGT01030000234564.a.a.b.b ENSGT00390000017890 ENSGT00940000165777 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 579 ADRA1A (ENSMNEG00000032467) STMN4 (ENSMNEG00000042099) TRIM35 (ENSMNEG00000033062) PTK2B (ENSMNEG00000032809) CHRNA2 (ENSMNEG00000036009) EPHX2 (ENSMNEG00000031898) CLU (ENSMNEG00000043022) SCARA3 (ENSMNEG00000037952) ENSMNEG00000036331 ESCO2 (ENSMNEG00000038253) ENSMNEG00000007575 PBK (ENSMNEG00000043731) SCARA5 (ENSMNEG00000043810) NUGGC (ENSMNEG00000045452) ELP3 (ENSMNEG00000024316) ENSMNEG00000021099 ##22 PNOC (ENSMNEG00000032474) ZNF395 (ENSMNEG00000011767) FBXO16 (ENSMNEG00000045209) FZD3 (ENSMNEG00000040320) EXTL3 (ENSMNEG00000038935) INTS9 (ENSMNEG00000035204) HMBOX1 (ENSMNEG00000036228) KIF13B (ENSMNEG00000002442) DUSP4 (ENSMNEG00000039817) ENSMNEG00000037297 SARAF (ENSMNEG00000010730) LEPROTL1 (ENSMNEG00000045245) MBOAT4 (ENSMNEG00000029602) DCTN6 (ENSMNEG00000042347) ENSMNEG00000043824 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b.b.d ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b.b.d ##22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b.b.d ##22 Sooty mangabey MODERN SPECIES 166 GCC2 (ENSCATG00000030941) ENSCATG00000042415 ENSCATG00000034954 RANBP2 (ENSCATG00000032597) CCDC138 (ENSCATG00000031159) EDAR (ENSCATG00000028773) ENSCATG00000000492 SH3RF3 (ENSCATG00000037742) SEPTIN10 (ENSCATG00000041210) ENSCATG00000030164 MALL (ENSCATG00000034828) NPHP1 (ENSCATG00000041514) ENSCATG00000031652 BUB1 (ENSCATG00000000312) ENSCATG00000004527 ENSCATG00000032241 ##22 ACOXL (ENSCATG00000043108) BCL2L11 (ENSCATG00000043052) ANAPC1 (ENSCATG00000028722) ENSCATG00000030840 MERTK (ENSCATG00000035216) TMEM87B (ENSCATG00000030327) FBLN7 (ENSCATG00000028759) ZC3H8 (ENSCATG00000031295) ZC3H6 (ENSCATG00000036595) TTL (ENSCATG00000037532) POLR1B (ENSCATG00000037382) CHCHD5 (ENSCATG00000041625) ENSCATG00000021927 SLC20A1 (ENSCATG00000034278) NT5DC4 (ENSCATG00000036107) Drill MODERN SPECIES 791 GCC2 (ENSMLEG00000022604) ENSMLEG00000038422 ENSMLEG00000042041 RANBP2 (ENSMLEG00000037350) CCDC138 (ENSMLEG00000036676) EDAR (ENSMLEG00000041806) ENSMLEG00000036207 SH3RF3 (ENSMLEG00000005632) SEPTIN10 (ENSMLEG00000035646) ENSMLEG00000041930 ENSMLEG00000029495 ENSMLEG00000038678 MALL (ENSMLEG00000031303) NPHP1 (ENSMLEG00000036809) BUB1 (ENSMLEG00000027284) ENSMLEG00000029292 ##22 ACOXL (ENSMLEG00000032455) BCL2L11 (ENSMLEG00000036122) ENSMLEG00000033924 ANAPC1 (ENSMLEG00000037245) ENSMLEG00000020241 MERTK (ENSMLEG00000040439) TMEM87B (ENSMLEG00000042458) FBLN7 (ENSMLEG00000039015) ZC3H8 (ENSMLEG00000029980) ZC3H6 (ENSMLEG00000038821) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT01030000234527.A.a.b.a.a ENSGT00940000159105 ENSGT01030000234597.a.b.a ENSGT00940000160868 ENSGT00940000157269.a.a ENSGT00940000158299 ENSGT00940000158614 ENSGT00530000063668.B ENSGT00940000158238 ENSGT00390000004380.m.b.a ENSGT00940000158598 ENSGT00720000108839 ENSGT00950000183074.B.a.a ENSGT00390000007091 ENSGT00390000013141 ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b.b ##22 ENSGT00950000183149.C ENSGT00940000157136 ENSGT00940000159021 ENSGT00940000156491.a ENSGT00940000156692 ENSGT00910000147307 ENSGT00390000001445 ENSGT00940000154928.c.a ENSGT00940000155500 ENSGT00940000159066 ENSGT00940000153487.b.b.i.b ENSGT00390000013419 ENSGT00390000006503.b ENSGT01030000234564.a.a.b.b ENSGT00390000017890 Hominidae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT01030000234527.A.a.b.a.a ENSGT00940000159105 ENSGT01030000234597.a.b.a ENSGT00940000160868 ENSGT00940000157269.a.a ENSGT00940000158299 ENSGT00940000158614 ENSGT00530000063668.B ENSGT00940000158238 ENSGT00390000004380.m.b.a ENSGT00940000158598 ENSGT00720000108839 ENSGT00950000183074.B.a.a ENSGT00390000007091 ENSGT00390000013141 ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b.b ##22 ENSGT00950000183149.C ENSGT00940000157136 ENSGT00940000159021 ENSGT00940000156491.a ENSGT00940000156692 ENSGT00910000147307 ENSGT00390000001445 ENSGT00940000154928.c.a ENSGT00940000155500 ENSGT00940000159066 ENSGT00940000153487.b.b.i.b ENSGT00390000013419 ENSGT00390000006503.b ENSGT01030000234564.a.a.b.b ENSGT00390000017890 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT01030000234527.A.a.b.a.a ENSGT00940000159105 ENSGT01030000234597.a.b.a ENSGT00940000160868 ENSGT00940000157269.a.a ENSGT00940000158299 ENSGT00940000158614 ENSGT00530000063668.B ENSGT00940000158238 ENSGT00390000004380.m.b.a ENSGT00940000158598 ENSGT00720000108839 ENSGT00950000183074.B.a.a ENSGT00390000007091 ENSGT00390000013141 ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b.b ##22 ENSGT00950000183149.C ENSGT00940000157136 ENSGT00940000159021 ENSGT00940000156491.a ENSGT00940000156692 ENSGT00910000147307 ENSGT00390000001445 ENSGT00940000154928.c.a ENSGT00910000147585 ENSGT00940000155500 ENSGT00940000159066 ENSGT00940000153487.b.b.i.b ENSGT00390000013419 ENSGT00390000006503.b ENSGT00950000183198.c.a.a.a.a.l.a.a Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT01030000234527.A.a.b.a.a ENSGT00940000159105 ENSGT01030000234597.a.b.a ENSGT00940000160868 ENSGT00940000157269.a.a ENSGT00940000158299 ENSGT00940000158614 ENSGT00530000063668.B ENSGT00940000158238 ENSGT00390000004380.m.b.a ENSGT00940000158598 ENSGT00720000108839 ENSGT00950000183074.B.a.a ENSGT00390000007091 ENSGT00390000013141 ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b.b ##22 ENSGT00950000183149.C ENSGT00940000157136 ENSGT00940000159021 ENSGT00940000156491.a ENSGT00940000156692 ENSGT00910000147307 ENSGT00390000001445 ENSGT00940000154928.c.a ENSGT00910000147585 ENSGT00940000155500 ENSGT00940000159066 ENSGT00940000153487.b.b.i.b ENSGT00390000013419 ENSGT00390000006503.b ENSGT00950000183198.c.a.a.a.a.l.a.a Pan ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT01030000234527.A.a.b.a.a ENSGT00940000159105 ENSGT01030000234597.a.b.a ENSGT00940000160868 ENSGT00940000157269.a.a ENSGT00940000158299 ENSGT00940000158614 ENSGT00530000063668.B ENSGT00940000158238 ENSGT00390000004380.m.b.a ENSGT00940000158598 ENSGT00720000108839 ENSGT00950000183074.B.a.a ENSGT00390000007091 ENSGT00390000013141 ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b.b ##22 ENSGT00950000183149.C ENSGT00940000157136 ENSGT00940000159021 ENSGT00940000156491.a ENSGT00940000156692 ENSGT00910000147307 ENSGT00390000001445 ENSGT00940000154928.c.a ENSGT00910000147585 ENSGT00940000155500 ENSGT00940000159066 ENSGT00940000153487.b.b.i.b ENSGT00390000013419 ENSGT00390000006503.b ENSGT00950000183198.c.a.a.a.a.l.a.a Chimpanzee MODERN SPECIES 21 ADRA1A (ENSPTRG00000020100) ENSPTRG00000045362 STMN4 (ENSPTRG00000020102) TRIM35 (ENSPTRG00000020103) PTK2B (ENSPTRG00000020104) CHRNA2 (ENSPTRG00000020105) EPHX2 (ENSPTRG00000020106) CLU (ENSPTRG00000020107) SCARA3 (ENSPTRG00000020108) CCDC25 (ENSPTRG00000020109) ESCO2 (ENSPTRG00000020110) PBK (ENSPTRG00000020112) SCARA5 (ENSPTRG00000020113) NUGGC (ENSPTRG00000020114) ELP3 (ENSPTRG00000020115) ENSPTRG00000043531 ##22 PNOC (ENSPTRG00000020116) ZNF395 (ENSPTRG00000020119) FBXO16 (ENSPTRG00000034416) FZD3 (ENSPTRG00000020122) EXTL3 (ENSPTRG00000020124) INTS9 (ENSPTRG00000020125) HMBOX1 (ENSPTRG00000020127) KIF13B (ENSPTRG00000023437) ENSPTRG00000051054 DUSP4 (ENSPTRG00000020129) ENSPTRG00000043672 SARAF (ENSPTRG00000020131) LEPROTL1 (ENSPTRG00000039951) MBOAT4 (ENSPTRG00000020133) DCTN6 (ENSPTRG00000020134) Bonobo MODERN SPECIES 21 DPYSL2 (ENSPPAG00000035831) ADRA1A (ENSPPAG00000043804) ENSPPAG00000043385 TRIM35 (ENSPPAG00000038841) PTK2B (ENSPPAG00000037974) CHRNA2 (ENSPPAG00000042024) EPHX2 (ENSPPAG00000034443) CLU (ENSPPAG00000030389) SCARA3 (ENSPPAG00000031092) CCDC25 (ENSPPAG00000035057) ESCO2 (ENSPPAG00000037825) PBK (ENSPPAG00000036956) SCARA5 (ENSPPAG00000032372) NUGGC (ENSPPAG00000033912) ELP3 (ENSPPAG00000003473) ENSPPAG00000042684 ##22 PNOC (ENSPPAG00000031795) ZNF395 (ENSPPAG00000029300) FBXO16 (ENSPPAG00000030694) FZD3 (ENSPPAG00000032462) EXTL3 (ENSPPAG00000033582) ENSPPAG00000027198 INTS9 (ENSPPAG00000041473) HMBOX1 (ENSPPAG00000026235) ENSPPAG00000036843 KIF13B (ENSPPAG00000042259) DUSP4 (ENSPPAG00000036541) ENSPPAG00000043687 SARAF (ENSPPAG00000032572) ENSPPAG00000036229 ENSPPAG00000010617 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b ##22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b ##22 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.a.b ##22 Elephant MODERN SPECIES 375 EPB41L3 (ENSLAFG00000006036) ENSLAFG00000013989 ARHGAP28 (ENSLAFG00000008729) MC2R (ENSLAFG00000011821) ENSLAFG00000014904 CETN1 (ENSLAFG00000026433) COLEC12 (ENSLAFG00000009593) THOC1 (ENSLAFG00000009585) USP14 (ENSLAFG00000009582) ROCK1 (ENSLAFG00000015369) GREB1L (ENSLAFG00000028717) ESCO1 (ENSLAFG00000025897) SNRPD1 (ENSLAFG00000005819) ABHD3 (ENSLAFG00000008414) MIB1 (ENSLAFG00000003082) ENSLAFG00000027151 ##22 ENSLAFG00000007931 ENSLAFG00000032532 ENSLAFG00000032309 ENSLAFG00000016433 CABLES1 (ENSLAFG00000017513) TMEM241 (ENSLAFG00000017889) RIOK3 (ENSLAFG00000001380) RMC1 (ENSLAFG00000001383) NPC1 (ENSLAFG00000023357) ANKRD29 (ENSLAFG00000015310) LAMA3 (ENSLAFG00000008275) TTC39C (ENSLAFG00000008293) ENSLAFG00000014928 OSBPL1A (ENSLAFG00000014931) IMPACT (ENSLAFG00000003990) Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b ##22 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b ##22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b ##22 Tenrec MODERN SPECIES 10839 ENSETEG00000014541 ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b ##22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b ##22 Laurasiatheria_a DUPLICATION Laurasiatheria_a DUPLICATION Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b.a.a ##22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b.a.a ##22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b.a.a ##22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b.a.a ##22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b.a.a ##22 Yarkand deer MODERN SPECIES 9 TMEM229A (ENSCHYG00000026977) ENSCHYG00000026962 ENSCHYG00000026956 HYAL4 (ENSCHYG00000026955) LMOD2 (ENSCHYG00000026950) WASL (ENSCHYG00000026946) ASB15 (ENSCHYG00000026941) ENSCHYG00000026937 IQUB (ENSCHYG00000026931) SLC13A1 (ENSCHYG00000026920) TAS2R16 (ENSCHYG00000026914) ENSCHYG00000026909 CADPS2 (ENSCHYG00000026611) FEZF1 (ENSCHYG00000026487) AASS (ENSCHYG00000026446) ENSCHYG00000024383 ##22 FAM3C (ENSCHYG00000024340) WNT16 (ENSCHYG00000024300) CPED1 (ENSCHYG00000024149) ING3 (ENSCHYG00000023988) TSPAN12 (ENSCHYG00000023924) KCND2 (ENSCHYG00000023858) ENSCHYG00000023821 ENSCHYG00000023772 ENSCHYG00000023745 ENSCHYG00000023709 ENSCHYG00000023676 ENSCHYG00000023641 ENSCHYG00000023578 TRGV9 (ENSCHYG00000023546) ENSCHYG00000023515 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b.a.a ##22 Siberian musk deer DUPLICATION Siberian musk deer MODERN SPECIES 1227 ZNF25 (ENSMMSG00000020000) ZNF248 (ENSMMSG00000020031) BMS1 (ENSMMSG00000020053) RET (ENSMMSG00000020162) CSGALNACT2 (ENSMMSG00000020322) ENSMMSG00000020349 RASGEF1A (ENSMMSG00000020374) FXYD4 (ENSMMSG00000020441) HNRNPF (ENSMMSG00000020460) BICC1 (ENSMMSG00000020487) ENSMMSG00000020576 ENSMMSG00000020596 PHYHIPL (ENSMMSG00000020629) FAM13C (ENSMMSG00000020700) ENSMMSG00000020876 ENSMMSG00000020895 ##22 SLC16A9 (ENSMMSG00000020920) ENSMMSG00000020942 CCDC6 (ENSMMSG00000020954) ANK3 (ENSMMSG00000021092) CDK1 (ENSMMSG00000022254) ENSMMSG00000022277 RHOBTB1 (ENSMMSG00000022296) TMEM26 (ENSMMSG00000022321) CABCOCO1 (ENSMMSG00000022331) ENSMMSG00000022340 ARID5B (ENSMMSG00000022357) RTKN2 (ENSMMSG00000022387) ZNF365 (ENSMMSG00000022399) ENSMMSG00000022407 ADO (ENSMMSG00000022422) Siberian musk deer MODERN SPECIES 58 THEMIS (ENSMMSG00000012746) PTPRK (ENSMMSG00000012835) LAMA2 (ENSMMSG00000013155) ARHGAP18 (ENSMMSG00000014166) ENSMMSG00000014241 L3MBTL3 (ENSMMSG00000014260) ENSMMSG00000014363 TMEM200A (ENSMMSG00000014384) EPB41L2 (ENSMMSG00000014492) AKAP7 (ENSMMSG00000017436) ARG1 (ENSMMSG00000017520) MED23 (ENSMMSG00000017570) ENPP3 (ENSMMSG00000017912) ENPP1 (ENSMMSG00000018194) CCN2 (ENSMMSG00000018245) ENSMMSG00000018265 ##22 MOXD1 (ENSMMSG00000018291) STX7 (ENSMMSG00000018401) TAAR9 (ENSMMSG00000018520) ENSMMSG00000018544 ENSMMSG00000018561 ENSMMSG00000018569 ENSMMSG00000018595 ENSMMSG00000018682 ENSMMSG00000018696 TAAR5 (ENSMMSG00000018747) ENSMMSG00000018755 ENSMMSG00000018760 TAAR2 (ENSMMSG00000018770) TAAR1 (ENSMMSG00000018786) VNN1 (ENSMMSG00000018799) Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b.a.a ##22 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b.a.a ##22 Rambouillet Sheep DUPLICATION Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 10 ENSOARG00020025997 IQCF3 (ENSOARG00020026001) ENSOARG00020026003 IQCF6 (ENSOARG00020026006) GRM2 (ENSOARG00020026015) TEX264 (ENSOARG00020026021) RAD54L2 (ENSOARG00020026027) ENSOARG00020026033 ENSOARG00020026035 DCAF1 (ENSOARG00020026039) ENSOARG00020026049 ENSOARG00020026054 ENSOARG00020026057 MANF (ENSOARG00020026059) DOCK3 (ENSOARG00020026066) ENSOARG00020026081 ##22 MAPKAPK3 (ENSOARG00020026087) CISH (ENSOARG00020026090) HEMK1 (ENSOARG00020010204) C3orf18 (ENSOARG00020010332) CACNA2D2 (ENSOARG00020010511) TMEM115 (ENSOARG00020013169) CYB561D2 (ENSOARG00020013203) NPRL2 (ENSOARG00020013263) ZMYND10 (ENSOARG00020013376) RASSF1 (ENSOARG00020013580) TUSC2 (ENSOARG00020013772) HYAL2 (ENSOARG00020013831) HYAL1 (ENSOARG00020013897) HYAL3 (ENSOARG00020013993) IFRD2 (ENSOARG00020014132) Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 7 SNX18 (ENSOARG00020013467) HSPB3 (ENSOARG00020013509) ARL15 (ENSOARG00020003211) NDUFS4 (ENSOARG00020003246) FST (ENSOARG00020003280) RPS12 (ENSOARG00020003307) MOCS2 (ENSOARG00020003333) ITGA2 (ENSOARG00020003443) ITGA1 (ENSOARG00020003919) PELO (ENSOARG00020004089) ISL1 (ENSOARG00020004124) PARP8 (ENSOARG00020004290) HCN1 (ENSOARG00020005457) MRPS30 (ENSOARG00020005537) FGF10 (ENSOARG00020005559) ENSOARG00020005588 ##22 NNT (ENSOARG00020005629) ENSOARG00020005767 C5orf34 (ENSOARG00020005897) TMEM267 (ENSOARG00020005959) CCL28 (ENSOARG00020005973) HMGCS1 (ENSOARG00020005999) NIM1K (ENSOARG00020006035) ZNF131 (ENSOARG00020006056) ENSOARG00020006096 CCDC152 (ENSOARG00020006118) GHR (ENSOARG00020006196) FBXO4 (ENSOARG00020006423) ENSOARG00020006604 OXCT1 (ENSOARG00020006708) PLCXD3 (ENSOARG00020006984) Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b.a.a ##22 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b.a.a ##22 Sperm whale MODERN SPECIES 10 ENSPCTG00005010650 TRAFD1 (ENSPCTG00005010690) HECTD4 (ENSPCTG00005010900) ENSPCTG00005012366 PTPN11 (ENSPCTG00005012444) RPH3A (ENSPCTG00005012552) OAS1 (ENSPCTG00005013310) OAS2 (ENSPCTG00005013711) ENSPCTG00005013793 ENSPCTG00005013862 DDX54 (ENSPCTG00005014018) PLBD2 (ENSPCTG00005014206) SDS (ENSPCTG00005014792) SDSL (ENSPCTG00005014914) LHX5 (ENSPCTG00005015110) ENSPCTG00005015203 ##22 RBM19 (ENSPCTG00005015269) TBX5 (ENSPCTG00005015404) MED13L (ENSPCTG00005015494) SPRING1 (ENSPCTG00005015625) RNFT2 (ENSPCTG00005015785) ENSPCTG00005015842 HRK (ENSPCTG00005015872) FBXW8 (ENSPCTG00005015909) FBXO21 (ENSPCTG00005016205) ENSPCTG00005016289 NOS1 (ENSPCTG00005016440) KSR2 (ENSPCTG00005017639) RFC5 (ENSPCTG00005018019) WSB2 (ENSPCTG00005018129) ENSPCTG00005018187 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b.a.b ##22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b.a.b ##22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b.a.b ##22 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b.a.b ##22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b.a.b ##22 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 2 ENSRFEG00010012377 ENSRFEG00010013545 CCDC179 (ENSRFEG00010013578) SVIP (ENSRFEG00010013685) GAS2 (ENSRFEG00010013744) FANCF (ENSRFEG00010013824) SLC17A6 (ENSRFEG00010013848) ANO5 (ENSRFEG00010014078) NELL1 (ENSRFEG00010014187) ENSRFEG00010014613 SLC6A5 (ENSRFEG00010014721) PRMT3 (ENSRFEG00010014971) HTATIP2 (ENSRFEG00010015296) DBX1 (ENSRFEG00010015442) NAV2 (ENSRFEG00010015693) ENSRFEG00010018702 ##22 E2F8 (ENSRFEG00010018740) CSRP3 (ENSRFEG00010018867) ZDHHC13 (ENSRFEG00010018909) ENSRFEG00010018972 ENSRFEG00010019036 ENSRFEG00010019099 ENSRFEG00010019112 PTPN5 (ENSRFEG00010019203) IGSF22 (ENSRFEG00010019473) TMEM86A (ENSRFEG00010019663) SPTY2D1 (ENSRFEG00010019685) ENSRFEG00010019723 ENSRFEG00010019776 ENSRFEG00010019955 LDHC (ENSRFEG00010020017) Microbat MODERN SPECIES 937 TRIM23 (ENSMLUG00000006070) PPWD1 (ENSMLUG00000006058) CENPK (ENSMLUG00000002148) ADAMTS6 (ENSMLUG00000003570) CWC27 (ENSMLUG00000003562) SREK1IP1 (ENSMLUG00000003557) SHISAL2B (ENSMLUG00000003556) ENSMLUG00000026469 RGS7BP (ENSMLUG00000003548) RNF180 (ENSMLUG00000006224) IPO11 (ENSMLUG00000011760) DIMT1 (ENSMLUG00000011740) KIF2A (ENSMLUG00000011705) ZSWIM6 (ENSMLUG00000008485) PPDPF (ENSMLUG00000014566) ENSMLUG00000024228 ##22 SMIM15 (ENSMLUG00000008614) ENSMLUG00000023631 ENSMLUG00000026273 ENSMLUG00000007245 ERCC8 (ENSMLUG00000007222) ENSMLUG00000024960 ELOVL7 (ENSMLUG00000011604) DEPDC1B (ENSMLUG00000014865) ENSMLUG00000016936 PDE4D (ENSMLUG00000016574) PLEKHG4B (ENSMLUG00000016985) LRRC14B (ENSMLUG00000016995) CCDC127 (ENSMLUG00000027087) SDHA (ENSMLUG00000017004) AHRR (ENSMLUG00000012589) Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b.a.b ##22 Suina ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b.a.b ##22 Pig MODERN SPECIES 1 RNPEP (ENSSSCG00000034151) ELF3 (ENSSSCG00000010922) GPR37L1 (ENSSSCG00000038768) ARL8A (ENSSSCG00000036967) PTPN7 (ENSSSCG00000037669) ENSSSCG00000049544 LGR6 (ENSSSCG00000044583) ENSSSCG00000037298 UBE2T (ENSSSCG00000010923) PPP1R12B (ENSSSCG00000010925) SYT2 (ENSSSCG00000010926) KDM5B (ENSSSCG00000010928) ENSSSCG00000021179 RABIF (ENSSSCG00000053080) KLHL12 (ENSSSCG00000022787) ENSSSCG00000034258 ##22 ADIPOR1 (ENSSSCG00000010931) CYB5R1 (ENSSSCG00000010929) FAM240B (ENSSSCG00000032993) CTSV (ENSSSCG00000011171) ENSSSCG00000031186 ZNF782 (ENSSSCG00000011167) ZNF510 (ENSSSCG00000011168) PRXL2C (ENSSSCG00000011169) ENSSSCG00000027557 HABP4 (ENSSSCG00000035956) ENSSSCG00000039643 ZNF367 (ENSSSCG00000028981) SLC35D2 (ENSSSCG00000039368) ENSSSCG00000010936 HSD17B3 (ENSSSCG00000010937) Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b.a.b ##22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b.a.b ##22 Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b.a.b ##22 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b.a.b ##22 Sperm whale MODERN SPECIES 14 ENSPCTG00005003775 CLSTN1 (ENSPCTG00005003738) CTNNBIP1 (ENSPCTG00005003716) LZIC (ENSPCTG00005003704) NMNAT1 (ENSPCTG00005003693) ENSPCTG00005003684 RBP7 (ENSPCTG00005003675) UBE4B (ENSPCTG00005003542) CORT (ENSPCTG00005003509) DFFA (ENSPCTG00005003495) CENPS (ENSPCTG00005003473) PGD (ENSPCTG00005003448) KIF1B (ENSPCTG00005003146) ENSPCTG00005003079 CASZ1 (ENSPCTG00005003063) ENSPCTG00005003050 ##22 TARDBP (ENSPCTG00005003037) ENSPCTG00005003029 ENSPCTG00005003020 SRM (ENSPCTG00005003004) EXOSC10 (ENSPCTG00005002919) ANGPTL7 (ENSPCTG00005002900) MTOR (ENSPCTG00005002783) UBIAD1 (ENSPCTG00005002748) CLCN6 (ENSPCTG00005002723) NPPA (ENSPCTG00005002703) NPPB (ENSPCTG00005002689) ENSPCTG00005002645 ENSPCTG00005002627 FBXO6 (ENSPCTG00005002612) MAD2L2 (ENSPCTG00005002600) Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b.a.b ##22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b.a.b ##22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b.a.b ##22 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b.a.b ##22 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 9 PNN (ENSOARG00020014264) TRAPPC6B (ENSOARG00020014162) GEMIN2 (ENSOARG00020013653) SEC23A (ENSOARG00020011878) CLEC14A (ENSOARG00020011752) SSTR1 (ENSOARG00020011703) ENSOARG00020011587 ENSOARG00020011571 FOXA1 (ENSOARG00020011508) MIPOL1 (ENSOARG00020011197) SLC25A21 (ENSOARG00020010778) PAX9 (ENSOARG00020010673) NKX2-8 (ENSOARG00020010624) NKX2-1 (ENSOARG00020010481) MBIP (ENSOARG00020010152) ENSOARG00020010080 ##22 BRMS1L (ENSOARG00020009991) RALGAPA1 (ENSOARG00020007640) INSM2 (ENSOARG00020007546) ENSOARG00020007449 NFKBIA (ENSOARG00020007336) PSMA6 (ENSOARG00020006992) PPP2R3C (ENSOARG00020006825) FAM177A1 (ENSOARG00020006769) SRP54 (ENSOARG00020006524) ENSOARG00020006421 BAZ1A (ENSOARG00020006340) CFL2 (ENSOARG00020006245) SNX6 (ENSOARG00020005948) ENSOARG00020005839 ENSOARG00020005825 Yarkand deer DUPLICATION Yarkand deer MODERN SPECIES 22 ENSCHYG00000001619 ENSCHYG00000001601 ENSCHYG00000001575 USP44 (ENSCHYG00000001550) ENSCHYG00000001416 ENSCHYG00000001380 VEZT (ENSCHYG00000001339) FGD6 (ENSCHYG00000001259) NR2C1 (ENSCHYG00000001219) NDUFA12 (ENSCHYG00000001181) TMCC3 (ENSCHYG00000001134) CEP83 (ENSCHYG00000001094) PLXNC1 (ENSCHYG00000000862) CRADD (ENSCHYG00000000817) ENSCHYG00000000799 ENSCHYG00000000783 ##22 ENSCHYG00000000768 UBE2N (ENSCHYG00000000745) ENSCHYG00000000720 EEA1 (ENSCHYG00000000516) PLEKHG7 (ENSCHYG00000000447) BTG1 (ENSCHYG00000000427) DCN (ENSCHYG00000000364) LUM (ENSCHYG00000000293) KERA (ENSCHYG00000000274) EPYC (ENSCHYG00000000260) CCER1 (ENSCHYG00000000252) ATP2B1 (ENSCHYG00000000182) POC1B (ENSCHYG00000000134) DUSP6 (ENSCHYG00000000104) ENSCHYG00000000077 Yarkand deer MODERN SPECIES 29 ENSCHYG00000009381 GPAT3 (ENSCHYG00000009277) ABRAXAS1 (ENSCHYG00000009158) ENSCHYG00000009068 HELQ (ENSCHYG00000008723) HPSE (ENSCHYG00000008412) COQ2 (ENSCHYG00000008350) ENSCHYG00000008321 ENSCHYG00000008307 PLAC8 (ENSCHYG00000008274) COPS4 (ENSCHYG00000008113) LIN54 (ENSCHYG00000007987) THAP9 (ENSCHYG00000007939) SEC31A (ENSCHYG00000006863) SCD5 (ENSCHYG00000006645) ENSCHYG00000006619 ##22 TMEM150C (ENSCHYG00000006495) ENSCHYG00000006449 HNRNPDL (ENSCHYG00000006411) HNRNPD (ENSCHYG00000006262) ENSCHYG00000006163 ENSCHYG00000006116 RASGEF1B (ENSCHYG00000005923) PRKG2 (ENSCHYG00000005786) BMP3 (ENSCHYG00000005757) CFAP299 (ENSCHYG00000005738) FGF5 (ENSCHYG00000005708) ENSCHYG00000005672 ANTXR2 (ENSCHYG00000004118) GK2 (ENSCHYG00000004107) NAA11 (ENSCHYG00000004102) Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b.b ##22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b.b ##22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b.b ##22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b.b ##22 Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b.b ##22 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00940000155150.a ENSGT00940000155279.C ENSGT00940000154949.b ENSGT00940000162642 ENSGT00940000162335 ENSGT00940000162895 ENSGT00940000159753 ENSGT00940000154589.b ENSGT00390000002219 ENSGT00940000154340.A ENSGT00390000004322.a.b.j.b.a ENSGT00940000162789 ENSGT00940000164617 ENSGT00940000156946 ENSGT01050000244965.b ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b.b ##22 ENSGT00940000158366 ENSGT00940000156627 ENSGT01100000263524.I ENSGT00730000111223 ENSGT00930000151042 ENSGT00390000008798.c ENSGT00940000155140 ENSGT00940000158059 ENSGT00950000182924.B.a.a ENSGT00940000159823 ENSGT00940000157910 ENSGT00390000015789.c.b ENSGT00940000159660 ENSGT00940000159984 ENSGT00940000157714 Dog MODERN SPECIES 25 ARSJ (ENSCAFG00845028819) CAMK2D (ENSCAFG00845028435) ANK2 (ENSCAFG00845020611) LARP7 (ENSCAFG00845017248) ZGRF1 (ENSCAFG00845017018) NEUROG2 (ENSCAFG00845016784) ENSCAFG00845016756 ALPK1 (ENSCAFG00845016654) TIFA (ENSCAFG00845016552) AP1AR (ENSCAFG00845016400) FAM241A (ENSCAFG00845016273) ENSCAFG00845016089 PITX2 (ENSCAFG00845016014) ENSCAFG00845015951 ENPEP (ENSCAFG00845015843) ENSCAFG00845015801 ##22 ELOVL6 (ENSCAFG00845030224) EGF (ENSCAFG00845030111) LRIT3 (ENSCAFG00845030077) GAR1 (ENSCAFG00845030039) CFI (ENSCAFG00845029982) PLA2G12A (ENSCAFG00845029955) CASP6 (ENSCAFG00845029938) MCUB (ENSCAFG00845029908) SEC24B (ENSCAFG00845029793) COL25A1 (ENSCAFG00845029602) ETNPPL (ENSCAFG00845029485) OSTC (ENSCAFG00845029437) RPL34 (ENSCAFG00845029396) ENSCAFG00845029318 LEF1 (ENSCAFG00845029249) Dingo MODERN SPECIES 308 ENSCAFG00020017243 LARP7 (ENSCAFG00020017225) ENSCAFG00020017220 ENSCAFG00020017208 NEUROG2 (ENSCAFG00020017205) ALPK1 (ENSCAFG00020017196) TIFA (ENSCAFG00020017192) AP1AR (ENSCAFG00020017172) FAM241A (ENSCAFG00020017167) ENSCAFG00020017152 ENSCAFG00020017149 ENSCAFG00020017147 ENPEP (ENSCAFG00020015734) ENSCAFG00020015727 ELOVL6 (ENSCAFG00020015726) ENSCAFG00020015724 ##22 EGF (ENSCAFG00020015579) LRIT3 (ENSCAFG00020015570) RRH (ENSCAFG00020015567) GAR1 (ENSCAFG00020015566) CFI (ENSCAFG00020015559) PLA2G12A (ENSCAFG00020015557) CASP6 (ENSCAFG00020015552) MCUB (ENSCAFG00020015544) SEC24B (ENSCAFG00020010198) ENSCAFG00020010068 ENSCAFG00020010062 ENSCAFG00020010061 ENSCAFG00020010057 LEF1 (ENSCAFG00020010052) HADH (ENSCAFG00020010045) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b ##22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b ##22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b ##22 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 3 DNAJC25 (ENSHGLG00000049164) PTGR1 (ENSHGLG00000037971) ZNF483 (ENSHGLG00000048135) ECPAS (ENSHGLG00000014272) ENSHGLG00000008537 LPAR1 (ENSHGLG00000004534) MUSK (ENSHGLG00000009128) SVEP1 (ENSHGLG00000010868) TXNDC8 (ENSHGLG00000011464) ENSHGLG00000014576 ENSHGLG00000042778 C9orf152 (ENSHGLG00000032111) ENSHGLG00000006234 ENSHGLG00000047658 PTPN3 (ENSHGLG00000004892) ENSHGLG00000043831 ##22 ENSHGLG00000008130 #23 EPB41L4B (ENSHGLG00000013577) FRRS1L (ENSHGLG00000005022) TMEM245 (ENSHGLG00000005520) CTNNAL1 (ENSHGLG00000017742) ABITRAM (ENSHGLG00000032426) ELP1 (ENSHGLG00000005246) ACTL7A (ENSHGLG00000020244) ENSHGLG00000020431 ENSHGLG00000045183 ENSHGLG00000050898 ENSHGLG00000048617 ENSHGLG00000004266 RAD23B (ENSHGLG00000050281) ENSHGLG00000012147 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b ##22 Haplorrhini DUPLICATION Haplorrhini DUPLICATION Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b.c.a ##22 Tarsier DUPLICATION Tarsier DUPLICATION Tarsier MODERN SPECIES 1559 ENSTSYG00000014038 ##22 FAM69A (ENSTSYG00000029638) #23 Tarsier MODERN SPECIES 6196 ATG4C (ENSTSYG00000009586) ENSTSYG00000033863 ##22 ANGPTL3 (ENSTSYG00000009716) ENSTSYG00000033273 Tarsier DUPLICATION Tarsier MODERN SPECIES 370 ENSTSYG00000031405 ##22 Tarsier MODERN SPECIES 4964 ENSTSYG00000034018 ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b.c.b ##22 Tarsier DUPLICATION Tarsier MODERN SPECIES 6900 ENSTSYG00000031206 ENSTSYG00000037394 SCPEP1 (ENSTSYG00000004525) COIL (ENSTSYG00000005348) TRIM25 (ENSTSYG00000034953) DGKE (ENSTSYG00000007536) CUNH17orf67 (ENSTSYG00000003268) NOG (ENSTSYG00000003115) ANKFN1 (ENSTSYG00000003762) ENSTSYG00000028821 ##22 Tarsier MODERN SPECIES 6525 ENSTSYG00000036453 ##22 DMD (ENSTSYG00000026026) ENSTSYG00000027512 TTBK2 (ENSTSYG00000007729) ENSTSYG00000011824 UBR1 (ENSTSYG00000008751) TMEM62 (ENSTSYG00000000219) CCNDBP1 (ENSTSYG00000012417) ENSTSYG00000007617 EPB42 (ENSTSYG00000012424) TGM5 (ENSTSYG00000000233) ENSTSYG00000034420 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b.c.b ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b.c.b ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b.c.b ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b.c.b ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b.c.b ##22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b.c.b ##22 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b.c.b ##22 Rhesus MODERN SPECIES GFI1 (ENSMMUG00000005068) #19 ENSMMUG00000029649 ENSMMUG00000055525 EVI5 (ENSMMUG00000005070) #20 RPL5 (ENSMMUG00000005072) #22 ENSMMUG00000051009 DIPK1A (ENSMMUG00000005073) #23 ENSMMUG00000040115 MTF2 (ENSMMUG00000016808) #26 TMED5 (ENSMMUG00000045421) #27 ENSMMUG00000061598 CCDC18 (ENSMMUG00000016812) #28 FNBP1L (ENSMMUG00000015922) #30 BCAR3 (ENSMMUG00000015924) #31 ENSMMUG00000057430 ENSMMUG00000045959 ##22 ENSMMUG00000058244 DNTTIP2 (ENSMMUG00000008435) #32 GCLM (ENSMMUG00000013857) #34 ENSMMUG00000062580 ABCA4 (ENSMMUG00000013858) #35 ARHGAP29 (ENSMMUG00000006369) #36 ENSMMUG00000053915 ABCD3 (ENSMMUG00000014013) F3 (ENSMMUG00000056548) ENSMMUG00000053221 SLC44A3 (ENSMMUG00000001686) CNN3 (ENSMMUG00000001690) TLCD4 (ENSMMUG00000004758) PTBP2 (ENSMMUG00000016130) ENSMMUG00000054681 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b.d ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b.d ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b.d ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b.d ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b.d ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b.d ##22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b.d ##22 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b.d ##22 Crab-eating macaque MODERN SPECIES GFI1 (ENSMFAG00000045801) #19 ENSMFAG00000061073 ENSMFAG00000044701 EVI5 (ENSMFAG00000003592) #20 RPL5 (ENSMFAG00000033619) #22 ENSMFAG00000049451 DIPK1A (ENSMFAG00000000290) #23 ENSMFAG00000030382 MTF2 (ENSMFAG00000037684) #26 TMED5 (ENSMFAG00000039021) #27 CCDC18 (ENSMFAG00000033283) #28 ENSMFAG00000048042 DR1 (ENSMFAG00000036672) #29 FNBP1L (ENSMFAG00000007905) #30 BCAR3 (ENSMFAG00000045481) #31 ENSMFAG00000042490 ##22 ENSMFAG00000003472 #32 GCLM (ENSMFAG00000036066) #34 ENSMFAG00000054460 ABCA4 (ENSMFAG00000032139) #35 ARHGAP29 (ENSMFAG00000043826) #36 ABCD3 (ENSMFAG00000044222) F3 (ENSMFAG00000041937) ENSMFAG00000060667 ENSMFAG00000064541 SLC44A3 (ENSMFAG00000030266) TLCD4 (ENSMFAG00000037599) CNN3 (ENSMFAG00000043860) RWDD3 (ENSMFAG00000013715) PTBP2 (ENSMFAG00000008183) ENSMFAG00000048003 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 119 ENSMNEG00000043710 ENSMNEG00000039833 ENSMNEG00000026624 ENSMNEG00000009729 TGFBR3 (ENSMNEG00000035095) BRDT (ENSMNEG00000036582) #7 EPHX4 (ENSMNEG00000034540) #9 ENSMNEG00000034427 #12 BTBD8 (ENSMNEG00000038289) #15 C1orf146 (ENSMNEG00000045551) #16 GLMN (ENSMNEG00000037105) #17 RPAP2 (ENSMNEG00000037979) #18 GFI1 (ENSMNEG00000036338) #19 EVI5 (ENSMNEG00000015327) #20 DIPK1A (ENSMNEG00000030760) #23 ENSMNEG00000044138 ##22 ENSMNEG00000030641 MTF2 (ENSMNEG00000007161) #26 TMED5 (ENSMNEG00000035141) #27 CCDC18 (ENSMNEG00000038359) #28 DR1 (ENSMNEG00000028696) #29 FNBP1L (ENSMNEG00000043720) #30 BCAR3 (ENSMNEG00000039069) #31 ENSMNEG00000015935 ##22 ENSMNEG00000041699 #32 GCLM (ENSMNEG00000044117) #34 ABCA4 (ENSMNEG00000032250) #35 ARHGAP29 (ENSMNEG00000032154) #36 ABCD3 (ENSMNEG00000032671) F3 (ENSMNEG00000032837) ENSMNEG00000016707 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b.d ##22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 86 ENSGT00550000074836 ENSGT00940000162459.c.a ENSGT00940000154811.A ENSGT00940000153498.B.a.b ENSGT00940000156105 ENSGT00940000157951 ENSGT00940000155939 ENSGT00940000155918 ENSGT00940000161144 ENSGT00940000153866.A ENSGT00940000162225 ENSGT00940000155406 ENSGT00900000143744 ENSGT00940000156098 ENSGT00390000001795 ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b.d ##22 ENSGT00510000049635 ENSGT00390000003836 ENSGT00940000161000 ENSGT00900000143156.a.c ENSGT00940000161673 ENSGT00940000157476 ENSGT00940000156508 ENSGT00900000141099 ENSGT00940000156042 ENSGT00390000015971 ENSGT00490000044176.b.a.a ENSGT00940000156678 ENSGT00940000157711 ENSGT00940000153451.a.b ENSGT00410000028443 Drill MODERN SPECIES 1064 ARHGAP21 (ENSMLEG00000039286) ENSMLEG00000032112 ENSMLEG00000010994 KIAA1217 (ENSMLEG00000028803) ENSMLEG00000036161 ENSMLEG00000005038 ##22 C10orf67 (ENSMLEG00000042075) ENSMLEG00000032940 MSRB2 (ENSMLEG00000035948) ARMC3 (ENSMLEG00000026122) PIP4K2A (ENSMLEG00000003335) SPAG6 (ENSMLEG00000043377) BMI1 (ENSMLEG00000033981) COMMD3 (ENSMLEG00000039725) EBLN1 (ENSMLEG00000037862) DNAJC1 (ENSMLEG00000032634) MLLT10 (ENSMLEG00000010870) Sooty mangabey MODERN SPECIES 625 MASTL (ENSCATG00000040493) YME1L1 (ENSCATG00000041095) ANKRD26 (ENSCATG00000036433) ABI1 (ENSCATG00000044966) PDSS1 (ENSCATG00000037833) APBB1IP (ENSCATG00000041001) GAD2 (ENSCATG00000043640) MYO3A (ENSCATG00000021307) GPR158 (ENSCATG00000031425) ENKUR (ENSCATG00000037199) THNSL1 (ENSCATG00000015727) PRTFDC1 (ENSCATG00000006747) ARHGAP21 (ENSCATG00000037108) KIAA1217 (ENSCATG00000017140) ENSCATG00000001282 ENSCATG00000033411 ##22 OTUD1 (ENSCATG00000020303) C10orf67 (ENSCATG00000040730) PTF1A (ENSCATG00000041385) ENSCATG00000029358 MSRB2 (ENSCATG00000038606) ARMC3 (ENSCATG00000042725) PIP4K2A (ENSCATG00000035002) SPAG6 (ENSCATG00000041688) BMI1 (ENSCATG00000031546) COMMD3 (ENSCATG00000043929) EBLN1 (ENSCATG00000043664) DNAJC1 (ENSCATG00000040679) MLLT10 (ENSCATG00000034793) ENSCATG00000034759 ENSCATG00000021039 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b.d ##22 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2383 NEGR1 (ENSRBIG00000037635) ENSRBIG00000032200 ENSRBIG00000027411 ##22 KIAA1217 (ENSRBIG00000043005) Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 928 ENSRROG00000045363 ##22 ENSRROG00000005955 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b.d ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.b.b.b.d ##22 Marmoset MODERN SPECIES 1 RIPK3 (ENSCJAG00000006467) ADCY4 (ENSCJAG00000006470) LTB4R (ENSCJAG00000064331) LTB4R2 (ENSCJAG00000035653) CIDEB (ENSCJAG00000006658) NOP9 (ENSCJAG00000006675) DHRS1 (ENSCJAG00000006700) RABGGTA (ENSCJAG00000006726) TGM1 (ENSCJAG00000006740) TINF2 (ENSCJAG00000006774) GMPR2 (ENSCJAG00000006792) ENSCJAG00000084293 MDP1 (ENSCJAG00000043983) CHMP4A (ENSCJAG00000054333) TSSK4 (ENSCJAG00000006901) ENSCJAG00000070139 ##22 TM9SF1 (ENSCJAG00000006911) IPO4 (ENSCJAG00000006937) REC8 (ENSCJAG00000007023) IRF9 (ENSCJAG00000007065) RNF31 (ENSCJAG00000007073) ENSCJAG00000007207 PSME1 (ENSCJAG00000012692) FITM1 (ENSCJAG00000007211) ENSCJAG00000007167 DCAF11 (ENSCJAG00000007214) PCK2 (ENSCJAG00000007267) NRL (ENSCJAG00000023219) CPNE6 (ENSCJAG00000007314) CARMIL3 (ENSCJAG00000007382) ENSCJAG00000007452