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hamster chok1gshd MODERN SPECIES 229 Barhl2 (ENSCGRG00001015439) Zfp644 (ENSCGRG00001019117) #7 Hfm1 (ENSCGRG00001016995) #8 Cdc7 (ENSCGRG00001010556) #9 Tgfbr3 (ENSCGRG00001014911) #10 Brdt (ENSCGRG00001024776) #11 Ephx4 (ENSCGRG00001001386) #12 Lpcat2b (ENSCGRG00001005519) #13 Btbd8 (ENSCGRG00001022491) #14 1700028K03Rik (ENSCGRG00001012792) #16 Glmn (ENSCGRG00001001035) #17 Rpap2 (ENSCGRG00001024341) #18 Gfi1 (ENSCGRG00001015432) #19 Evi5 (ENSCGRG00001022415) #20 Ube2d2b (ENSCGRG00001003528) #21 ENSCGRG00001025004 #22 Dipk1a (ENSCGRG00001004793) #23 ENSCGRG00001004002 Mtf2 (ENSCGRG00001009422) #24 Tmed5 (ENSCGRG00001024936) #25 Ccdc18 (ENSCGRG00001018990) #26 ENSCGRG00001017631 ENSCGRG00001014204 #27 Pigg (ENSCGRG00001017797) #28 Pde6b (ENSCGRG00001015377) #30 Atp5k (ENSCGRG00001009513) #31 Mfsd7a (ENSCGRG00001015734) #32 Pcgf3 (ENSCGRG00001011904) #33 Cplx1 (ENSCGRG00001018247) #34 Gak (ENSCGRG00001015406) #35 Tmem175 (ENSCGRG00001024209) #36 Chinese hamster chok1gshd MODERN 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Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000158611 ENSGT00940000158258 #7 ENSGT00550000074822 #8 ENSGT00550000075011 #9 ENSGT00530000063861.b.b #10 ENSGT00940000154549.a #11 ENSGT00940000156233 #12 ENSGT01030000234574.A.b.a.b #13 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.a ENSGT00940000154382.a.b #14 ENSGT00390000008285 #16 ENSGT00390000018446 #17 ENSGT00390000017965 #18 ENSGT00940000156166.a #19 ENSGT00940000153846.a.a #20 ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b.w.a.b #22 ENSGT00390000006452.b.b #23 ENSGT00950000183180.b #24 ENSGT00940000155468.l.b.b #25 ENSGT00940000155468.l.b.a.a #25 ENSGT00940000153190.A #26 ENSGT00550000075010 #27 ENSGT00950000183047.c.b ENSGT00940000154130.a.a.b ENSGT00510000048142 ENSGT00510000047658 ENSGT00940000155624.b ENSGT00950000183110.b.b ENSGT00950000182955.a.a.a ENSGT00390000012668 ENSGT00940000160336 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000158611 ENSGT00940000158258 #7 ENSGT00550000074822 #8 ENSGT00550000075011 #9 ENSGT00530000063861.b.b #10 ENSGT00940000154549.a #11 ENSGT00940000156233 #12 ENSGT01030000234574.A.b.a.b #13 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.a ENSGT00940000154382.a.b #14 ENSGT00390000008285 #16 ENSGT00390000018446 #17 ENSGT00390000017965 #18 ENSGT00940000156166.a #19 ENSGT00940000153846.a.a #20 ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b.w.a.b #22 ENSGT00390000006452.b.b #23 ENSGT00950000183180.b #24 ENSGT00940000155468.l.b.b #25 ENSGT00940000153190.A #26 ENSGT00550000075010 #27 ENSGT00950000183047.c.b ENSGT00940000154130.a.a.b ENSGT00510000048142 ENSGT00510000047658 ENSGT00940000155624.b ENSGT00950000183110.b.b ENSGT00950000182955.a.a.a ENSGT00390000012668 ENSGT00940000160336 ENSGT00940000154539.b Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 130 ZNF326 (ENSCLAG00000004446) BARHL2 (ENSCLAG00000004382) ZNF644 (ENSCLAG00000006797) #7 HFM1 (ENSCLAG00000005173) #8 CDC7 (ENSCLAG00000007469) #9 TGFBR3 (ENSCLAG00000007233) #10 BRDT (ENSCLAG00000006404) #11 EPHX4 (ENSCLAG00000006155) #12 ENSCLAG00000006057 #13 BTBD8 (ENSCLAG00000005766) #14 C1orf146 (ENSCLAG00000008485) #16 GLMN (ENSCLAG00000006922) #17 RPAP2 (ENSCLAG00000006291) #18 GFI1 (ENSCLAG00000005915) #19 EVI5 (ENSCLAG00000008558) #20 ENSCLAG00000008425 #22 DIPK1A (ENSCLAG00000008376) #23 ENSCLAG00000017681 ENSCLAG00000008285 MTF2 (ENSCLAG00000007846) #24 TMED5 (ENSCLAG00000007030) #25 CCDC18 (ENSCLAG00000004649) #26 DR1 (ENSCLAG00000009918) #27 FNBP1L (ENSCLAG00000008001) BCAR3 (ENSCLAG00000007644) DNTTIP2 (ENSCLAG00000006829) GCLM (ENSCLAG00000005983) ABCA4 (ENSCLAG00000005461) ARHGAP29 (ENSCLAG00000004627) ABCD3 (ENSCLAG00000007070) F3 (ENSCLAG00000006707) Guinea pig MODERN SPECIES 2 ZNF326 (ENSCPOG00000007332) BARHL2 (ENSCPOG00000019619) ZNF644 (ENSCPOG00000035010) #7 HFM1 (ENSCPOG00000007421) #8 CDC7 (ENSCPOG00000012756) #9 TGFBR3 (ENSCPOG00000007217) #10 ENSCPOG00000003841 #11 EPHX4 (ENSCPOG00000001758) #12 ENSCPOG00000012159 BTBD8 (ENSCPOG00000008296) #14 C1orf146 (ENSCPOG00000007147) #16 GLMN (ENSCPOG00000007152) #17 RPAP2 (ENSCPOG00000007163) #18 GFI1 (ENSCPOG00000011727) #19 EVI5 (ENSCPOG00000006917) #20 ENSCPOG00000032453 #22 DIPK1A (ENSCPOG00000000700) #23 MTF2 (ENSCPOG00000012184) #24 ENSCPOG00000032129 #25 CCDC18 (ENSCPOG00000037069) #26 DR1 (ENSCPOG00000033199) #27 FNBP1L (ENSCPOG00000005155) BCAR3 (ENSCPOG00000005604) ENSCPOG00000031630 ENSCPOG00000037468 ABCA4 (ENSCPOG00000015461) ARHGAP29 (ENSCPOG00000015466) ABCD3 (ENSCPOG00000002087) F3 (ENSCPOG00000002092) SLC44A3 (ENSCPOG00000006860) CNN3 (ENSCPOG00000006865) Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b.w.b #22 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 21 PIAS4 (ENSHGLG00000006172) ZBTB7A (ENSHGLG00000011811) MAP2K2 (ENSHGLG00000009089) CREB3L3 (ENSHGLG00000050546) SIRT6 (ENSHGLG00000006696) ANKRD24 (ENSHGLG00000010865) ENSHGLG00000005526 YJU2 (ENSHGLG00000008096) SHD (ENSHGLG00000007108) TMIGD2 (ENSHGLG00000036449) FSD1 (ENSHGLG00000006238) STAP2 (ENSHGLG00000008727) MPND (ENSHGLG00000006669) SH3GL1 (ENSHGLG00000005623) CHAF1A (ENSHGLG00000005439) ENSHGLG00000035324 #22 UBXN6 (ENSHGLG00000011971) HDGFL2 (ENSHGLG00000010821) PLIN4 (ENSHGLG00000035695) PLIN5 (ENSHGLG00000009083) LRG1 (ENSHGLG00000008746) SEMA6B (ENSHGLG00000008078) TNFAIP8L1 (ENSHGLG00000040405) MYDGF (ENSHGLG00000006727) DPP9 (ENSHGLG00000006649) FEM1A (ENSHGLG00000041190) PLIN3 (ENSHGLG00000050405) ARRDC5 (ENSHGLG00000014076) UHRF1 (ENSHGLG00000015739) KDM4B (ENSHGLG00000013802) ENSHGLG00000037010 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b.x #22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b.x #22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b.x #22 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 113 CRB1 (ENSCLAG00000013182) ZBTB41 (ENSCLAG00000010852) ASPM (ENSCLAG00000009548) F13B (ENSCLAG00000014527) ENSCLAG00000014293 KCNT2 (ENSCLAG00000010650) B3GALT2 (ENSCLAG00000010521) CDC73 (ENSCLAG00000011107) GLRX2 (ENSCLAG00000010009) RO60 (ENSCLAG00000016391) ENSCLAG00000014784 RGS2 (ENSCLAG00000013377) ENSCLAG00000011055 RGS13 (ENSCLAG00000010047) RGS1 (ENSCLAG00000009691) ENSCLAG00000009249 #22 RGS21 (ENSCLAG00000011554) RGS18 (ENSCLAG00000010916) BRINP3 (ENSCLAG00000009361) PLA2G4A (ENSCLAG00000013091) PTGS2 (ENSCLAG00000010309) PDC (ENSCLAG00000009883) ODR4 (ENSCLAG00000011867) TPR (ENSCLAG00000014758) ENSCLAG00000009204 HMCN1 (ENSCLAG00000012763) IVNS1ABP (ENSCLAG00000010322) SWT1 (ENSCLAG00000013959) ENSCLAG00000010801 ENSCLAG00000015137 ENSCLAG00000015421 Naked mole-rat female DUPLICATION Naked mole-rat female MODERN SPECIES 10 ENSHGLG00000046123 BRDT (ENSHGLG00000004317) #11 ENSHGLG00000010230 #12 ENSHGLG00000033060 ENSHGLG00000046149 BTBD8 (ENSHGLG00000008571) #14 ENSHGLG00000012851 ENSHGLG00000012510 #16 ENSHGLG00000011940 #17 RPAP2 (ENSHGLG00000009983) #18 ENSHGLG00000046873 GFI1 (ENSHGLG00000008020) #19 ENSHGLG00000047533 EVI5 (ENSHGLG00000005267) #20 ENSHGLG00000006656 ##22 ENSHGLG00000004717 #22 ENSHGLG00000004684 #23 ENSHGLG00000045561 ENSHGLG00000049269 ENSHGLG00000007932 #24 ENSHGLG00000006551 #25 ENSHGLG00000032551 CCDC18 (ENSHGLG00000004402) #26 ENSHGLG00000004219 #27 FNBP1L (ENSHGLG00000033036) BCAR3 (ENSHGLG00000009405) ENSHGLG00000016483 GCLM (ENSHGLG00000049623) ABCA4 (ENSHGLG00000016293) ENSHGLG00000037982 ARHGAP29 (ENSHGLG00000013186) Naked mole-rat female MODERN SPECIES 17 PSMD1 (ENSHGLG00000003111) C2orf72 (ENSHGLG00000002913) SPATA3 (ENSHGLG00000002652) GPR55 (ENSHGLG00000002371) ITM2C (ENSHGLG00000003561) CAB39 (ENSHGLG00000035528) SP100 (ENSHGLG00000003347) ENSHGLG00000032383 SLC16A14 (ENSHGLG00000002999) FBXO36 (ENSHGLG00000002884) TRIP12 (ENSHGLG00000008889) ENSHGLG00000020453 ENSHGLG00000006168 PID1 (ENSHGLG00000040359) ENSHGLG00000042790 ENSHGLG00000040313 #22 ENSHGLG00000004506 ENSHGLG00000003340 DAW1 (ENSHGLG00000002663) CCL20 (ENSHGLG00000034678) SLC19A3 (ENSHGLG00000001984) ENSHGLG00000050104 AGFG1 (ENSHGLG00000003021) TM4SF20 (ENSHGLG00000033179) ENSHGLG00000002424 COL4A3 (ENSHGLG00000041167) COL4A4 (ENSHGLG00000019184) RHBDD1 (ENSHGLG00000018854) IRS1 (ENSHGLG00000019521) ENSHGLG00000050954 NYAP2 (ENSHGLG00000018926) Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00530000063777.b ENSGT00940000158611 ENSGT00940000158258 #7 ENSGT00550000074822 #8 ENSGT00550000075011 #9 ENSGT00530000063861.b.b #10 ENSGT00940000154549.a #11 ENSGT00940000156233 #12 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.a ENSGT00940000154382.a.b #14 ENSGT00390000008285 #16 ENSGT00390000018446 #17 ENSGT00390000017965 #18 ENSGT00940000156166.a #19 ENSGT00940000153846.a.a #20 ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b #22 ENSGT00390000006452.b.b #23 ENSGT00950000183180.b #24 ENSGT00940000155468.l.a #25 ENSGT00940000153190.A #26 ENSGT00550000075010 #27 ENSGT00950000183047.c.b ENSGT00940000154130.a.a.b ENSGT00510000048142 ENSGT00510000047658 ENSGT00940000155624.b ENSGT00950000183110.b.b ENSGT00950000182955.a.a.a ENSGT00390000012668 ENSGT00940000160336 ENSGT00940000154539.b Eurasian red squirrel MODERN SPECIES ZNF644 (ENSSVLG00005003587) #7 ENSSVLG00005003646 ENSSVLG00005003666 #8 ENSSVLG00005003691 CDC7 (ENSSVLG00005003704) #9 TGFBR3 (ENSSVLG00005003738) #10 BRDT (ENSSVLG00005003821) #11 EPHX4 (ENSSVLG00005003946) #12 BTBD8 (ENSSVLG00005003975) #14 C1orf146 (ENSSVLG00005004047) #16 GLMN (ENSSVLG00005004063) #17 RPAP2 (ENSSVLG00005004082) #18 ENSSVLG00005004104 GFI1 (ENSSVLG00005004132) #19 EVI5 (ENSSVLG00005004175) #20 ENSSVLG00005004298 #22 DIPK1A (ENSSVLG00005004374) #23 ENSSVLG00005000089 ENSSVLG00005000125 MTF2 (ENSSVLG00005000167) #24 ENSSVLG00005000190 TMED5 (ENSSVLG00005000211) #25 CCDC18 (ENSSVLG00005000256) #26 DR1 (ENSSVLG00005000282) #27 FNBP1L (ENSSVLG00005000352) ENSSVLG00005000405 BCAR3 (ENSSVLG00005000445) DNTTIP2 (ENSSVLG00005000490) GCLM (ENSSVLG00005000523) ABCA4 (ENSSVLG00005000757) ARHGAP29 (ENSSVLG00005001033) Marmotini ANCESTRAL SPECIES 77 ENSGT00530000063777.b ENSGT00940000158611 ENSGT00940000158258 #7 ENSGT00550000074822 #8 ENSGT00550000075011 #9 ENSGT00530000063861.b.b #10 ENSGT00940000154549.a #11 ENSGT00940000156233 #12 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.a ENSGT00940000154382.a.b #14 ENSGT00390000008285 #16 ENSGT00390000018446 #17 ENSGT00390000017965 #18 ENSGT00940000156166.a #19 ENSGT00940000153846.a.a #20 ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b #22 ENSGT00390000006452.b.b #23 ENSGT00390000016988.a.a.a.a.a.a.b ENSGT00950000183180.b #24 ENSGT00940000155468.l.a #25 ENSGT00940000153190.A #26 ENSGT00550000075010 #27 ENSGT00950000183047.c.b ENSGT00940000154130.a.a.b ENSGT00510000048142 ENSGT00510000047658 ENSGT00940000155624.b ENSGT00950000183110.b.b.h.a ENSGT00950000183110.b.b.g ENSGT00950000182955.a.a.a ENSGT00390000012668 Alpin marmot DUPLICATION Alpin marmot MODERN SPECIES 6 MSH6 (ENSMMMG00000009374) MSH2 (ENSMMMG00000009438) EPCAM (ENSMMMG00000009917) CALM2 (ENSMMMG00000009965) STPG4 (ENSMMMG00000009975) TTC7A (ENSMMMG00000010016) ENSMMMG00000010047 SOCS5 (ENSMMMG00000010100) CRIPT (ENSMMMG00000010107) PIGF (ENSMMMG00000010120) RHOQ (ENSMMMG00000010128) ATP6V1E2 (ENSMMMG00000010180) TMEM247 (ENSMMMG00000010182) EPAS1 (ENSMMMG00000010195) PRKCE (ENSMMMG00000010291) ENSMMMG00000010335 #22 ENSMMMG00000010346 SRBD1 (ENSMMMG00000010355) SIX2 (ENSMMMG00000010951) CAMKMT (ENSMMMG00000011017) PREPL (ENSMMMG00000011046) SLC3A1 (ENSMMMG00000011092) ENSMMMG00000011105 PPM1B (ENSMMMG00000011109) LRPPRC (ENSMMMG00000011188) ABCG8 (ENSMMMG00000016223) ABCG5 (ENSMMMG00000016251) DYNC2LI1 (ENSMMMG00000016271) PLEKHH2 (ENSMMMG00000016277) THADA (ENSMMMG00000016308) HAAO (ENSMMMG00000016431) Alpin marmot MODERN SPECIES 70 ZNF644 (ENSMMMG00000024044) #7 HFM1 (ENSMMMG00000024043) #8 CDC7 (ENSMMMG00000024042) #9 TGFBR3 (ENSMMMG00000024040) #10 ENSMMMG00000024037 #11 ENSMMMG00000024036 ENSMMMG00000024035 #11 EPHX4 (ENSMMMG00000024034) #12 ENSMMMG00000024033 BTBD8 (ENSMMMG00000024032) #14 C1orf146 (ENSMMMG00000024030) #16 GLMN (ENSMMMG00000024029) #17 RPAP2 (ENSMMMG00000024024) #18 GFI1 (ENSMMMG00000024023) #19 EVI5 (ENSMMMG00000024020) #20 ENSMMMG00000024016 #22 DIPK1A (ENSMMMG00000024014) #23 ENSMMMG00000024013 ENSMMMG00000024011 #24 TMED5 (ENSMMMG00000024010) #25 CCDC18 (ENSMMMG00000024006) #26 ENSMMMG00000024004 DR1 (ENSMMMG00000024003) #27 FNBP1L (ENSMMMG00000024001) BCAR3 (ENSMMMG00000024000) ENSMMMG00000023999 DNTTIP2 (ENSMMMG00000023998) GCLM (ENSMMMG00000023997) ENSMMMG00000023996 ENSMMMG00000023995 ENSMMMG00000023994 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 116 ENSGT00530000063777.b ENSGT00940000158611 ENSGT00940000158258 #7 ENSGT00550000074822 #8 ENSGT00550000075011 #9 ENSGT00530000063861.b.b #10 ENSGT00940000154549.a #11 ENSGT00940000156233 #12 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.a ENSGT00940000154382.a.b #14 ENSGT00390000008285 #16 ENSGT00390000018446 #17 ENSGT00390000017965 #18 ENSGT00940000156166.a #19 ENSGT00940000153846.a.a #20 ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b #22 ENSGT00390000006452.b.b #23 ENSGT00390000016988.a.a.a.a.a.a.b ENSGT00950000183180.b #24 ENSGT00940000155468.l.a #25 ENSGT00940000153190.A #26 ENSGT00550000075010 #27 ENSGT00950000183047.c.b ENSGT00940000154130.a.a.b ENSGT00510000048142 ENSGT00510000047658 ENSGT00940000155624.b ENSGT00950000183110.b.b.h.a ENSGT00950000183110.b.b.g ENSGT00950000182955.a.a.a ENSGT00390000012668 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 283 HFM1 (ENSUPAG00010007727) #8 CDC7 (ENSUPAG00010007656) #9 TGFBR3 (ENSUPAG00010007630) #10 ENSUPAG00010007622 #11 ENSUPAG00010007618 ENSUPAG00010007607 #11 EPHX4 (ENSUPAG00010007597) #12 BTBD8 (ENSUPAG00010007564) #14 C1orf146 (ENSUPAG00010007546) #16 GLMN (ENSUPAG00010007467) #17 RPAP2 (ENSUPAG00010007445) #18 GFI1 (ENSUPAG00010007431) #19 EVI5 (ENSUPAG00010007304) #20 ENSUPAG00010007265 #22 DIPK1A (ENSUPAG00010007249) #23 ENSUPAG00010007245 MTF2 (ENSUPAG00010007198) #24 TMED5 (ENSUPAG00010007183) #25 CCDC18 (ENSUPAG00010007139) #26 DR1 (ENSUPAG00010007132) #27 FNBP1L (ENSUPAG00010007070) BCAR3 (ENSUPAG00010007024) DNTTIP2 (ENSUPAG00010007018) GCLM (ENSUPAG00010007006) ENSUPAG00010006957 Squirrel DUPLICATION Squirrel MODERN SPECIES 137 ZNF326 (ENSSTOG00000005176) BARHL2 (ENSSTOG00000025888) ZNF644 (ENSSTOG00000027631) #7 ENSSTOG00000008477 #8 CDC7 (ENSSTOG00000002130) #9 TGFBR3 (ENSSTOG00000011061) #10 ENSSTOG00000003060 #11 EPHX4 (ENSSTOG00000022582) #12 ENSSTOG00000012470 BTBD8 (ENSSTOG00000027118) #14 C1orf146 (ENSSTOG00000012506) #16 GLMN (ENSSTOG00000022944) #17 ENSSTOG00000030075 #18 GFI1 (ENSSTOG00000014583) #19 EVI5 (ENSSTOG00000015190) #20 ENSSTOG00000010256 #22 DIPK1A (ENSSTOG00000023846) #23 MTF2 (ENSSTOG00000000231) #24 TMED5 (ENSSTOG00000028196) #25 CCDC18 (ENSSTOG00000000234) #26 DR1 (ENSSTOG00000014720) #27 FNBP1L (ENSSTOG00000014723) ENSSTOG00000014735 DNTTIP2 (ENSSTOG00000027499) ENSSTOG00000030847 ABCA4 (ENSSTOG00000000294) ENSSTOG00000034098 ENSSTOG00000033918 ENSSTOG00000000308 ABCD3 (ENSSTOG00000004520) F3 (ENSSTOG00000004566) Squirrel MODERN SPECIES 322 EFS (ENSSTOG00000002556) IL25 (ENSSTOG00000002561) CMTM5 (ENSSTOG00000002567) MYH7 (ENSSTOG00000002580) NGDN (ENSSTOG00000002637) ZFHX2 (ENSSTOG00000002657) THTPA 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#19 ENSGT00940000153846.a.a #20 ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b #22 ENSGT00390000006452.b.b #23 ENSGT00950000183180.b #24 ENSGT00940000155468 #25 ENSGT00940000153190.A #26 ENSGT00550000075010 #27 ENSGT00950000183047.c.b ENSGT00940000154130.a.a.b ENSGT00510000048142 ENSGT00510000047658 ENSGT00940000155624.b ENSGT00950000183110.b.b ENSGT00950000182955.a.a.a ENSGT00390000012668 ENSGT00940000160336 ENSGT00940000154539.b Rabbit DUPLICATION Rabbit DUPLICATION Rabbit MODERN SPECIES 11 ENSOCUG00000007951 TMEM150A (ENSOCUG00000007956) ENSOCUG00000010066 USP39 (ENSOCUG00000010070) ENSOCUG00000020733 ATOH8 (ENSOCUG00000003528) ST3GAL5 (ENSOCUG00000010126) POLR1A (ENSOCUG00000010138) ENSOCUG00000010161 IMMT (ENSOCUG00000010178) ENSOCUG00000010188 MRPL35 (ENSOCUG00000010193) REEP1 (ENSOCUG00000010196) ENSOCUG00000034180 KDM3A (ENSOCUG00000010324) ENSOCUG00000010342 #22 RNF103 (ENSOCUG00000029277) RMND5A (ENSOCUG00000009371) ENSOCUG00000029173 ENSOCUG00000009384 KRCC1 (ENSOCUG00000016946) SMYD1 (ENSOCUG00000016949) ENSOCUG00000016960 THNSL2 (ENSOCUG00000028091) ENSOCUG00000024020 TEX37 (ENSOCUG00000012447) EIF2AK3 (ENSOCUG00000012451) ENSOCUG00000006530 ENSOCUG00000025374 ENSOCUG00000036440 ENSOCUG00000031913 Rabbit MODERN SPECIES 9 ENSOCUG00000024476 ENSOCUG00000023411 ENSOCUG00000012472 POLR3A (ENSOCUG00000012450) DLG5 (ENSOCUG00000002180) KCNMA1 (ENSOCUG00000009543) LRMDA (ENSOCUG00000008123) ZNF503 (ENSOCUG00000000028) COMTD1 (ENSOCUG00000009095) VDAC2 (ENSOCUG00000009082) SAMD8 (ENSOCUG00000009076) ENSOCUG00000009072 DUSP29 (ENSOCUG00000026189) KAT6B (ENSOCUG00000017344) ADK (ENSOCUG00000009950) ENSOCUG00000010613 #22 ENSOCUG00000023858 AP3M1 (ENSOCUG00000009946) VCL (ENSOCUG00000003163) PLAU (ENSOCUG00000003155) ENSOCUG00000030476 CAMK2G (ENSOCUG00000012578) NDST2 (ENSOCUG00000012569) ZSWIM8 (ENSOCUG00000020924) CHCHD1 (ENSOCUG00000037036) FUT11 (ENSOCUG00000012565) ENSOCUG00000023881 SYNPO2L (ENSOCUG00000025335) MYOZ1 (ENSOCUG00000012560) USP54 (ENSOCUG00000012547) PPP3CB (ENSOCUG00000012543) Rabbit DUPLICATION Rabbit MODERN SPECIES ENSOCUG00000032593 ENSOCUG00000037441 ENSOCUG00000035824 ENSOCUG00000025608 ENSOCUG00000032260 ENSOCUG00000034368 ENSOCUG00000025737 ENSOCUG00000026626 ENSOCUG00000025337 ENSOCUG00000024594 ENSOCUG00000034316 ENSOCUG00000035367 ENSOCUG00000020903 ENSOCUG00000002687 ZNF202 (ENSOCUG00000014264) ENSOCUG00000010504 #22 SCN3B (ENSOCUG00000010502) GRAMD1B (ENSOCUG00000010493) ENSOCUG00000015533 ENSOCUG00000037082 BSX (ENSOCUG00000002684) JHY (ENSOCUG00000015523) CRTAM (ENSOCUG00000013086) UBASH3B (ENSOCUG00000013072) SORL1 (ENSOCUG00000011346) SC5D (ENSOCUG00000011339) ENSOCUG00000031744 TECTA (ENSOCUG00000001263) TBCEL (ENSOCUG00000002876) GRIK4 (ENSOCUG00000002692) ARHGEF12 (ENSOCUG00000005196) Rabbit MODERN SPECIES 4 ENSOCUG00000005209 #7 ENSOCUG00000036391 HFM1 (ENSOCUG00000029252) #8 ENSOCUG00000024863 CDC7 (ENSOCUG00000026347) #9 TGFBR3 (ENSOCUG00000016083) #10 BRDT (ENSOCUG00000017466) #11 EPHX4 (ENSOCUG00000017476) #12 BTBD8 (ENSOCUG00000011062) #14 ENSOCUG00000021982 C1orf146 (ENSOCUG00000003953) #16 ENSOCUG00000001803 #17 RPAP2 (ENSOCUG00000001804) #18 GFI1 (ENSOCUG00000023553) #19 EVI5 (ENSOCUG00000001807) #20 ENSOCUG00000010089 #22 DIPK1A (ENSOCUG00000027778) #23 MTF2 (ENSOCUG00000013736) #24 TMED5 (ENSOCUG00000012427) #25 CCDC18 (ENSOCUG00000012434) #26 DR1 (ENSOCUG00000007398) #27 ENSOCUG00000038039 ENSOCUG00000028085 FNBP1L (ENSOCUG00000008277) BCAR3 (ENSOCUG00000015440) DNTTIP2 (ENSOCUG00000008212) GCLM (ENSOCUG00000013796) ABCA4 (ENSOCUG00000009797) ARHGAP29 (ENSOCUG00000009819) ENSOCUG00000007917 ABCD3 (ENSOCUG00000004820) Tree shrew DUPLICATION Tree shrew MODERN SPECIES 5420 EVI5 (ENSTBEG00000009391) #20 ENSTBEG00000010560 #22 DIPK1A (ENSTBEG00000010948) #23 Tree shrew MODERN SPECIES 6543 ENSTBEG00000010069 #22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b #22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158611 ENSGT00940000158258 #7 ENSGT00550000074822 #8 ENSGT00550000075011 #9 ENSGT00530000063861.b.b #10 ENSGT00940000154549.a #11 ENSGT00940000156233 #12 ENSGT01030000234574.A.b.a.b #13 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.a ENSGT00940000154382.a.b #14 ENSGT00390000008285 #16 ENSGT00390000018446 #17 ENSGT00390000017965 #18 ENSGT00940000156166.a #19 ENSGT00940000153846.a.a #20 ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b #22 ENSGT00390000006452.b.b #23 ENSGT00950000183180.b #24 ENSGT00940000155468 #25 ENSGT00940000153190.A #26 ENSGT00550000075010 #27 ENSGT00950000183047.c.b ENSGT00940000154130.a.a.b ENSGT00510000048142 ENSGT00510000047658 ENSGT00940000155624.b ENSGT00950000183110.b.b ENSGT00950000182955.a.a.a ENSGT00390000012668 ENSGT00940000160336 ENSGT00940000154539.b Bushbaby DUPLICATION Bushbaby DUPLICATION Bushbaby MODERN SPECIES 138 PKIG (ENSOGAG00000030592) ADA (ENSOGAG00000016280) CCN5 (ENSOGAG00000012555) KCNK15 (ENSOGAG00000012557) RIMS4 (ENSOGAG00000011045) ENSOGAG00000008909 PABPC1L (ENSOGAG00000032999) TOMM34 (ENSOGAG00000008911) STK4 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Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b #22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b #22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b #22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b #22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b #22 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 221 PBX1 (ENSSBOG00000019425) ENSSBOG00000023056 ENSSBOG00000022242 #22 NUF2 (ENSSBOG00000020393) RGS5 (ENSSBOG00000019112) RGS4 (ENSSBOG00000023788) CCDC190 (ENSSBOG00000003369) HSD17B7 (ENSSBOG00000003536) DDR2 (ENSSBOG00000014912) UAP1 (ENSSBOG00000018996) UHMK1 (ENSSBOG00000028187) ENSSBOG00000027882 SH2D1B (ENSSBOG00000023916) SPATA46 (ENSSBOG00000003135) ENSSBOG00000019874 ENSSBOG00000028748 OLFML2B (ENSSBOG00000021662) ATF6 (ENSSBOG00000029816) Capuchin MODERN SPECIES 62 PRDX6 (ENSCCAG00000029030) SLC9C2 (ENSCCAG00000034956) TEX50 (ENSCCAG00000023777) ANKRD45 (ENSCCAG00000030031) ENSCCAG00000007951 KLHL20 (ENSCCAG00000035987) CENPL (ENSCCAG00000032255) DARS2 (ENSCCAG00000029862) ZBTB37 (ENSCCAG00000030297) SERPINC1 (ENSCCAG00000019906) RC3H1 (ENSCCAG00000025652) ENSCCAG00000036604 RABGAP1L (ENSCCAG00000031099) ENSCCAG00000037602 MRPS14 (ENSCCAG00000023517) ENSCCAG00000036403 #22 TNN (ENSCCAG00000035362) TNR (ENSCCAG00000027440) ENSCCAG00000016991 ENSCCAG00000009273 B4GALT5 (ENSCCAG00000033096) SLC9A8 (ENSCCAG00000030260) SPATA2 (ENSCCAG00000024428) RNF114 (ENSCCAG00000004234) SNAI1 (ENSCCAG00000029550) ENSCCAG00000033814 PEDS1 (ENSCCAG00000024997) CEBPB (ENSCCAG00000018941) ENSCCAG00000027818 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b #22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b #22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b #22 Orangutan DUPLICATION Orangutan MODERN SPECIES 17 TIGD2 (ENSPPYG00000014930) GPRIN3 (ENSPPYG00000014931) SNCA (ENSPPYG00000014932) MMRN1 (ENSPPYG00000014933) CCSER1 (ENSPPYG00000033690) GRID2 (ENSPPYG00000014934) ATOH1 (ENSPPYG00000015283) SMARCAD1 (ENSPPYG00000014935) HPGDS (ENSPPYG00000014936) ENSPPYG00000014937 BMPR1B (ENSPPYG00000014938) UNC5C (ENSPPYG00000014939) PDHA2 (ENSPPYG00000014940) ENSPPYG00000029937 STPG2 (ENSPPYG00000014941) ENSPPYG00000032768 #22 RAP1GDS1 (ENSPPYG00000014942) TSPAN5 (ENSPPYG00000014943) EIF4E (ENSPPYG00000031353) METAP1 (ENSPPYG00000014945) ADH5 (ENSPPYG00000014946) ADH4 (ENSPPYG00000014947) ADH6 (ENSPPYG00000014948) ADH1A (ENSPPYG00000014949) ADH1C (ENSPPYG00000037917) ADH7 (ENSPPYG00000014950) C4orf17 (ENSPPYG00000014951) TRMT10A (ENSPPYG00000014952) MTTP (ENSPPYG00000014953) DAPP1 (ENSPPYG00000014954) LAMTOR3 (ENSPPYG00000041127) Orangutan MODERN SPECIES 6 MRPS11 (ENSPPYG00000006751) MRPL46 (ENSPPYG00000006750) NTRK3 (ENSPPYG00000006749) AGBL1 (ENSPPYG00000006747) ENSPPYG00000037873 KLHL25 (ENSPPYG00000006746) AKAP13 (ENSPPYG00000006745) ENSPPYG00000006873 ZSCAN2 (ENSPPYG00000006877) ENSPPYG00000039060 WDR73 (ENSPPYG00000006879) ENSPPYG00000036271 SEC11A (ENSPPYG00000006881) ZNF592 (ENSPPYG00000035797) ENSPPYG00000031798 ENSPPYG00000029615 #22 SLC28A1 (ENSPPYG00000006884) PDE8A (ENSPPYG00000006885) ENSPPYG00000030954 ENSPPYG00000006888 CPEB1 (ENSPPYG00000006889) AP3B2 (ENSPPYG00000006890) FSD2 (ENSPPYG00000006733) HOMER2 (ENSPPYG00000006735) RAMAC (ENSPPYG00000006736) ENSPPYG00000006737 ENSPPYG00000018203 BTBD1 (ENSPPYG00000006738) TM6SF1 (ENSPPYG00000041172) HDGFL3 (ENSPPYG00000006739) BNC1 (ENSPPYG00000040401) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b #22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b #22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b #22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000162273 ENSGT00570000079168.b.b.b ENSGT00950000183175.B.b ENSGT01030000234633.C.b ENSGT00940000153912.B ENSGT00940000155192 ENSGT00940000160064.b ENSGT00390000010721.a.a.a.a.c.b ENSGT00910000144252 ENSGT00940000160278 ENSGT00940000155292 ENSGT00940000155919 ENSGT00950000182815.a.a.a.a.a ENSGT00530000063174.a.j ENSGT00390000001063 ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b #22 ENSGT00940000153168.C.a.b ENSGT00940000161041 ENSGT00940000159219 ENSGT00940000157110 ENSGT00940000161360 ENSGT00390000014963 ENSGT00390000008346 ENSGT00390000011368 ENSGT00940000159958 ENSGT00950000183159.a ENSGT00940000157306 ENSGT00390000000002.a.a.a ENSGT00940000157352 ENSGT00390000018052.l.a ENSGT00390000018145.cb.a.a.b.b Olive baboon DUPLICATION Olive baboon MODERN SPECIES 6 ENSPANG00000042731 ENSPANG00000002589 ENSPANG00000037622 PCDH20 (ENSPANG00000009662) ENSPANG00000049074 TDRD3 (ENSPANG00000019138) DIAPH3 (ENSPANG00000005861) PCDH17 (ENSPANG00000004614) ENSPANG00000043978 ENSPANG00000041871 ENSPANG00000047132 ENSPANG00000043724 ENSPANG00000047232 ENSPANG00000048590 OLFM4 (ENSPANG00000024154) ENSPANG00000028839 #22 ENSPANG00000043462 PCDH8 (ENSPANG00000007570) ENSPANG00000041440 CNMD (ENSPANG00000012752) SUGT1 (ENSPANG00000025937) ENSPANG00000044868 NEK3 (ENSPANG00000007571) NEK5 (ENSPANG00000005102) UTP14C (ENSPANG00000004998) ALG11 (ENSPANG00000023959) ATP7B (ENSPANG00000025938) ENSPANG00000021861 CCDC70 (ENSPANG00000045858) TMEM272 (ENSPANG00000029825) DHRS12 (ENSPANG00000031113) Olive baboon MODERN SPECIES 13 ENSPANG00000051085 GRID2 (ENSPANG00000009186) ENSPANG00000046446 ENSPANG00000051321 ENSPANG00000030511 ENSPANG00000045919 SMARCAD1 (ENSPANG00000019757) HPGDS (ENSPANG00000017690) ENSPANG00000037029 ENSPANG00000004585 ENSPANG00000044230 BMPR1B (ENSPANG00000008235) UNC5C (ENSPANG00000000905) PDHA2 (ENSPANG00000026247) STPG2 (ENSPANG00000009976) ENSPANG00000038256 #22 YIPF7 (ENSPANG00000016828) KCTD8 (ENSPANG00000017025) ENSPANG00000047071 ENSPANG00000034872 GRXCR1 (ENSPANG00000021591) ENSPANG00000037932 ATP8A1 (ENSPANG00000011786) SHISA3 (ENSPANG00000025579) ENSPANG00000041009 ENSPANG00000048230 BEND4 (ENSPANG00000016087) SLC30A9 (ENSPANG00000024558) ENSPANG00000017113 DCAF4L1 (ENSPANG00000013516) TMEM33 (ENSPANG00000031907) Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158611 ENSGT00940000158258 #7 ENSGT00550000074822 #8 ENSGT00550000075011 #9 ENSGT00530000063861.b.b #10 ENSGT00940000154549.a #11 ENSGT00940000156233 #12 ENSGT01030000234574.A.b.a.b #13 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.a ENSGT00940000154382.a.b #14 ENSGT00390000008285 #16 ENSGT00390000018446 #17 ENSGT00390000017965 #18 ENSGT00940000156166.a #19 ENSGT00940000153846.a.a #20 ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b #22 ENSGT00390000006452.b.b #23 ENSGT00950000183180.b #24 ENSGT00940000155468 #25 ENSGT00940000153190.A #26 ENSGT00550000075010 #27 ENSGT00950000183047.c.b ENSGT00940000154130.a.a.b ENSGT00740000117159 ENSGT00510000048142 ENSGT00510000047658 ENSGT00940000155624.b ENSGT00950000183110.b.b ENSGT00950000182955.a.a.a ENSGT00390000012668 ENSGT00940000160336 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158611 ENSGT00940000158258 #7 ENSGT00550000074822 #8 ENSGT00550000075011 #9 ENSGT00530000063861.b.b #10 ENSGT00940000154549.a #11 ENSGT00940000156233 #12 ENSGT01030000234574.A.b.a.b #13 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.a ENSGT00940000154382.a.b #14 ENSGT00390000008285 #16 ENSGT00390000018446 #17 ENSGT00390000017965 #18 ENSGT00940000156166.a #19 ENSGT00940000153846.a.a #20 ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b #22 ENSGT00390000006452.b.b #23 ENSGT00950000183180.b #24 ENSGT00940000155468 #25 ENSGT00940000153190.A #26 ENSGT00550000075010 #27 ENSGT00950000183047.c.b ENSGT00940000154130.a.a.b ENSGT00740000117159 ENSGT00510000048142 ENSGT00510000047658 ENSGT00940000155624.b ENSGT00950000183110.b.b ENSGT00950000182955.a.a.a ENSGT00390000012668 ENSGT00940000160336 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158611 ENSGT00940000158258 #7 ENSGT00550000074822 #8 ENSGT00550000075011 #9 ENSGT00530000063861.b.b #10 ENSGT00940000154549.a #11 ENSGT00940000156233 #12 ENSGT01030000234574.A.b.a.b #13 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.a ENSGT00940000154382.a.b #14 ENSGT00390000008285 #16 ENSGT00390000018446 #17 ENSGT00390000017965 #18 ENSGT00940000156166.a #19 ENSGT00940000153846.a.a #20 ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b #22 ENSGT00390000006452.b.b #23 ENSGT00950000183180.b #24 ENSGT00940000155468 #25 ENSGT00940000153190.A #26 ENSGT00550000075010 #27 ENSGT00950000183047.c.b ENSGT00940000154130.a.a.b ENSGT00740000117159 ENSGT00510000048142 ENSGT00510000047658 ENSGT00940000155624.b ENSGT00950000183110.b.b ENSGT00950000182955.a.a.a ENSGT00390000012668 ENSGT00940000160336 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158611 ENSGT00940000158258 #7 ENSGT00550000074822 #8 ENSGT00550000075011 #9 ENSGT00530000063861.b.b #10 ENSGT00940000154549.a #11 ENSGT00940000156233 #12 ENSGT01030000234574.A.b.a.b #13 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.a ENSGT00940000154382.a.b #14 ENSGT00390000008285 #16 ENSGT00390000018446 #17 ENSGT00390000017965 #18 ENSGT00940000156166.a #19 ENSGT00940000153846.a.a #20 ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b #22 ENSGT00390000006452.b.b #23 ENSGT00950000183180.b #24 ENSGT00940000155468 #25 ENSGT00940000153190.A #26 ENSGT00550000075010 #27 ENSGT00950000183047.c.b ENSGT00940000154130.a.a.b ENSGT00510000048142 ENSGT00510000047658 ENSGT00940000155624.b ENSGT00950000183110.b.b ENSGT00950000182955.a.a.a ENSGT00390000012668 ENSGT00940000160336 ENSGT00940000154539.b Equus ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000158611 ENSGT00940000158258 #7 ENSGT00550000074822 #8 ENSGT00550000075011 #9 ENSGT00530000063861.b.b.i #10 ENSGT00940000154549.a #11 ENSGT00940000156233 #12 ENSGT01030000234574.A.b.a.b #13 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.a ENSGT00940000154382.a.b #14 ENSGT00390000008285 #16 ENSGT00390000018446 #17 ENSGT00390000017965 #18 ENSGT00940000156166.a #19 ENSGT00940000153846.a.a #20 ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b #22 ENSGT00390000006452.b.b #23 ENSGT00950000183180.b #24 ENSGT00940000155468 #25 ENSGT00940000153190.A #26 ENSGT00940000154802.fb ENSGT00550000075010 #27 ENSGT00950000183047.c.b ENSGT00940000154130.a.a.b ENSGT00510000048142 ENSGT00510000047658 ENSGT00940000155624.b ENSGT00950000183110.b.b ENSGT00950000182955.a.a.a ENSGT00390000012668 ENSGT00940000160336 Horse MODERN SPECIES 26 ZNF644 (ENSECAG00000010304) #7 HFM1 (ENSECAG00000024039) #8 CDC7 (ENSECAG00000022964) #9 TGFBR3 (ENSECAG00000019700) #10 ENSECAG00000053770 #10 BRDT (ENSECAG00000015661) #11 ENSECAG00000052882 EPHX4 (ENSECAG00000015114) #12 ENSECAG00000015105 #13 BTBD8 (ENSECAG00000014416) #14 GLMN (ENSECAG00000010564) #17 RPAP2 (ENSECAG00000007411) #18 GFI1 (ENSECAG00000006647) #19 ENSECAG00000058307 EVI5 (ENSECAG00000023646) #20 RPL5 (ENSECAG00000021065) #22 DIPK1A (ENSECAG00000020711) #23 ENSECAG00000051377 MTF2 (ENSECAG00000017368) #24 TMED5 (ENSECAG00000016426) #25 ENSECAG00000057950 ENSECAG00000046837 CCDC18 (ENSECAG00000014091) #26 ENSECAG00000031491 DR1 (ENSECAG00000010209) #27 FNBP1L (ENSECAG00000004536) BCAR3 (ENSECAG00000022721) DNTTIP2 (ENSECAG00000022045) GCLM (ENSECAG00000021993) ABCA4 (ENSECAG00000013379) ARHGAP29 (ENSECAG00000009393) Donkey MODERN SPECIES 7 ZNF644 (ENSEASG00005015423) #7 HFM1 (ENSEASG00005015424) #8 CDC7 (ENSEASG00005015434) #9 TGFBR3 (ENSEASG00005015486) #10 BRDT (ENSEASG00005026111) #11 EPHX4 (ENSEASG00005015495) #12 ENSEASG00005015497 #13 ENSEASG00005015501 ENSEASG00005037362 #14 ENSEASG00005032361 #14 C1orf146 (ENSEASG00005037463) #16 GLMN (ENSEASG00005015506) #17 RPAP2 (ENSEASG00005015507) #18 GFI1 (ENSEASG00005015509) #19 EVI5 (ENSEASG00005015514) #20 ENSEASG00005015515 #22 DIPK1A (ENSEASG00005030243) #23 MTF2 (ENSEASG00005015530) #24 TMED5 (ENSEASG00005034283) #25 CCDC18 (ENSEASG00005015570) #26 ENSEASG00005015583 DR1 (ENSEASG00005025520) #27 ENSEASG00005015589 FNBP1L (ENSEASG00005015587) BCAR3 (ENSEASG00005015591) DNTTIP2 (ENSEASG00005015594) GCLM (ENSEASG00005015597) ABCA4 (ENSEASG00005015609) ARHGAP29 (ENSEASG00005015647) ABCD3 (ENSEASG00005015685) F3 (ENSEASG00005015695) Chiroptera DUPLICATION Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b.a #22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b.a #22 Microbat MODERN SPECIES 1047 ZNF644 (ENSMLUG00000010460) #7 HFM1 (ENSMLUG00000010200) #8 ENSMLUG00000023375 CDC7 (ENSMLUG00000015065) #9 TGFBR3 (ENSMLUG00000010405) #10 ENSMLUG00000006232 #11 EPHX4 (ENSMLUG00000028235) #12 ENSMLUG00000017219 #13 ENSMLUG00000002075 BTBD8 (ENSMLUG00000002081) #14 C1orf146 (ENSMLUG00000016984) #16 GLMN (ENSMLUG00000016988) #17 ENSMLUG00000001016 #18 GFI1 (ENSMLUG00000015191) #19 EVI5 (ENSMLUG00000015748) #20 ENSMLUG00000008956 #22 DIPK1A (ENSMLUG00000008976) #23 MTF2 (ENSMLUG00000005839) #24 TMED5 (ENSMLUG00000005855) #25 CCDC18 (ENSMLUG00000005862) #26 DR1 (ENSMLUG00000010684) #27 FNBP1L (ENSMLUG00000000113) BCAR3 (ENSMLUG00000001713) Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158611 ENSGT00940000158258 #7 ENSGT00550000074822 #8 ENSGT00550000075011 #9 ENSGT00530000063861.b.b #10 ENSGT00940000154549.a #11 ENSGT00940000156233 #12 ENSGT01030000234574.A.b.a.b #13 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.a ENSGT00940000154382.a.b #14 ENSGT00390000008285 #16 ENSGT00390000018446 #17 ENSGT00390000017965 #18 ENSGT00940000156166.a #19 ENSGT00940000153846.a.a #20 ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b.b #22 ENSGT00390000006452.b.b #23 ENSGT00950000183180.b #24 ENSGT00940000155468 #25 ENSGT00940000153190.A #26 ENSGT00550000075010 #27 ENSGT00950000183047.c.b ENSGT00940000154130.a.a.b ENSGT00510000048142 ENSGT00510000047658 ENSGT00940000155624.b ENSGT00950000183110.b.b ENSGT00950000182955.a.a.a ENSGT00390000012668 Megabat MODERN SPECIES 6509 ENSPVAG00000015117 #22 DIPK1A (ENSPVAG00000015116) #23 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00530000063777.b ENSGT00940000158611 ENSGT00940000158258 #7 ENSGT00550000074822 #8 ENSGT00550000075011 #9 ENSGT00530000063861.b.b #10 ENSGT00940000154549.a #11 ENSGT00940000156233 #12 ENSGT01030000234574.A.b.a.b #13 ENSGT00940000154382.a.b #14 ENSGT00390000008285 #16 ENSGT00390000018446 #17 ENSGT00390000017965 #18 ENSGT00940000156166.a #19 ENSGT00940000153846.a.a #20 ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b.b #22 ENSGT00390000006452.b.b #23 ENSGT00950000183180.b #24 ENSGT00940000155468 #25 ENSGT00940000153190.A #26 ENSGT00550000075010 #27 ENSGT00950000183047.c.b ENSGT00940000154130.a.a.b ENSGT00510000048142 ENSGT00510000047658 ENSGT00940000155624.b ENSGT00950000183110.b.b ENSGT00950000182955.a.a.a ENSGT00390000012668 ENSGT00940000159377 ENSGT00530000063877.b Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 27 BARHL2 (ENSRFEG00010011903) ZNF644 (ENSRFEG00010011971) #7 HFM1 (ENSRFEG00010012083) #8 CDC7 (ENSRFEG00010012591) #9 TGFBR3 (ENSRFEG00010012639) #10 BRDT (ENSRFEG00010012762) #11 EPHX4 (ENSRFEG00010013304) #12 ENSRFEG00010013353 #13 BTBD8 (ENSRFEG00010006736) #14 ENSRFEG00010006892 C1orf146 (ENSRFEG00010006926) #16 GLMN (ENSRFEG00010006990) #17 RPAP2 (ENSRFEG00010007051) #18 GFI1 (ENSRFEG00010007082) #19 EVI5 (ENSRFEG00010007148) #20 ENSRFEG00010007432 #22 DIPK1A (ENSRFEG00010007529) #23 MTF2 (ENSRFEG00010007651) #24 TMED5 (ENSRFEG00010007758) #25 CCDC18 (ENSRFEG00010007835) #26 DR1 (ENSRFEG00010008311) #27 FNBP1L 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ENSGT00530000063777.b ENSGT00940000158611 ENSGT00940000158258 #7 ENSGT00550000074822.h #8 ENSGT00550000075011 #9 ENSGT00530000063861.b.b #10 ENSGT00940000154549.a #11 ENSGT00940000156233 #12 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.a ENSGT00940000154382.a.b #14 ENSGT00390000008285 #16 ENSGT00390000018446 #17 ENSGT00390000017965 #18 ENSGT00940000156166.a #19 ENSGT00940000153846.a.a #20 ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b #22 ENSGT00390000006452.b.b #23 ENSGT00950000183180.b #24 ENSGT00940000155468 #25 ENSGT00940000153190.A #26 ENSGT00550000075010 #27 ENSGT00950000183047.c.b ENSGT00940000154130.a.a.b ENSGT00740000117159 ENSGT00510000048142 ENSGT00510000047658 ENSGT00940000155624.b ENSGT00950000183110.b.b ENSGT00950000182955.a.a.a ENSGT00390000012668 ENSGT00940000160336 Felidae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00530000063777.b ENSGT00940000158611 ENSGT00940000158258 #7 ENSGT00550000074822.h #8 ENSGT00550000075011 #9 ENSGT00530000063861.b.b #10 ENSGT00940000154549.a #11 ENSGT00940000156233 #12 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.a ENSGT00940000154382.a.b #14 ENSGT00390000008285 #16 ENSGT00390000018446 #17 ENSGT00390000017965 #18 ENSGT00940000156166.a #19 ENSGT00940000153846.a.a #20 ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b #22 ENSGT00390000006452.b.b #23 ENSGT00950000183180.b #24 ENSGT00940000155468 #25 ENSGT00940000153190.A #26 ENSGT00550000075010 #27 ENSGT00950000183047.c.b ENSGT00940000154130.a.a.b ENSGT00510000048142 ENSGT00510000047658 ENSGT00940000155624.b ENSGT00950000183110.b.b ENSGT00950000182955.a.a.a ENSGT00390000012668 ENSGT00940000160336 ENSGT00940000154539.b Panthera ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00530000063777.b ENSGT00940000158611 ENSGT00940000158258 #7 ENSGT00550000074822.h #8 ENSGT00550000075011 #9 ENSGT00530000063861.b.b #10 ENSGT00940000154549.a #11 ENSGT00940000156233 #12 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.a ENSGT00940000154382.a.b #14 ENSGT00390000008285 #16 ENSGT00390000018446 #17 ENSGT00390000017965 #18 ENSGT00940000156166.a #19 ENSGT00940000153846.a.a #20 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ENSGT00510000047658 ENSGT00940000155624.b ENSGT00950000186000 ENSGT00950000183110.b.b ENSGT00950000182955.a.a.a ENSGT00390000012668 ENSGT00940000160336 ENSGT00940000154539.b Polar bear MODERN SPECIES 208 BRDT (ENSUMAG00000011290) #11 EPHX4 (ENSUMAG00000011286) #12 BTBD8 (ENSUMAG00000011276) #14 C1orf146 (ENSUMAG00000011273) #16 GLMN (ENSUMAG00000011266) #17 RPAP2 (ENSUMAG00000011257) #18 ENSUMAG00000011251 #19 EVI5 (ENSUMAG00000011159) #20 ENSUMAG00000011129 #22 DIPK1A (ENSUMAG00000011127) #23 MTF2 (ENSUMAG00000011102) #24 TMED5 (ENSUMAG00000011101) #25 CCDC18 (ENSUMAG00000011014) #26 FNBP1L (ENSUMAG00000010351) BCAR3 (ENSUMAG00000010214) DNTTIP2 (ENSUMAG00000010202) GCLM (ENSUMAG00000010195) ABCA4 (ENSUMAG00000010104) ENSUMAG00000010069 ARHGAP29 (ENSUMAG00000009961) ABCD3 (ENSUMAG00000009085) F3 (ENSUMAG00000008977) SLC44A3 (ENSUMAG00000008956) CNN3 (ENSUMAG00000008950) Mustelinae ANCESTRAL SPECIES 60 ENSGT00940000154043.B ENSGT00530000063777.b ENSGT00940000158611 ENSGT00940000158258 #7 ENSGT00550000074822.h #8 ENSGT00550000075011 #9 ENSGT00530000063861.b.b #10 ENSGT00940000154549.a #11 ENSGT00940000156233 #12 ENSGT00940000154382.a.b #14 ENSGT00390000008285 #16 ENSGT00390000018446 #17 ENSGT00390000017965 #18 ENSGT00940000156166.a #19 ENSGT00940000153846.a.a #20 ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b #22 ENSGT00390000006452.b.b #23 ENSGT00950000183180.b #24 ENSGT00940000155468 #25 ENSGT00940000153190.A #26 ENSGT00550000075010 #27 ENSGT00950000183047.c.b ENSGT00940000154130.a.a.b ENSGT00740000117159 ENSGT00510000048142 ENSGT00510000047658 ENSGT00940000155624.b ENSGT00950000186000 ENSGT00950000183110.b.b ENSGT00950000182955.a.a.a ENSGT00390000012668 Ferret MODERN SPECIES 197 BARHL2 (ENSMPUG00000004626) ENSMPUG00000004621 ZNF644 (ENSMPUG00000004615) #7 HFM1 (ENSMPUG00000004594) #8 CDC7 (ENSMPUG00000004504) #9 TGFBR3 (ENSMPUG00000004481) #10 BRDT (ENSMPUG00000004311) #11 EPHX4 (ENSMPUG00000004299) #12 BTBD8 (ENSMPUG00000004264) #14 C1orf146 (ENSMPUG00000004257) #16 GLMN (ENSMPUG00000004239) #17 RPAP2 (ENSMPUG00000004227) #18 GFI1 (ENSMPUG00000004178) #19 ENSMPUG00000004168 #20 ENSMPUG00000004157 #20 ENSMPUG00000004150 #22 ENSMPUG00000004102 DIPK1A (ENSMPUG00000004095) #23 ENSMPUG00000004091 MTF2 (ENSMPUG00000004081) #24 TMED5 (ENSMPUG00000004079) #25 CCDC18 (ENSMPUG00000004059) #26 ENSMPUG00000004035 DR1 (ENSMPUG00000004025) #27 FNBP1L (ENSMPUG00000004018) BCAR3 (ENSMPUG00000004013) ENSMPUG00000004007 DNTTIP2 (ENSMPUG00000004000) GCLM (ENSMPUG00000003928) ABCA4 (ENSMPUG00000003394) ARHGAP29 (ENSMPUG00000003377) American mink MODERN SPECIES 52 ZNF326 (ENSNVIG00000017707) BARHL2 (ENSNVIG00000017755) ZNF644 (ENSNVIG00000017765) #7 HFM1 (ENSNVIG00000017830) #8 CDC7 (ENSNVIG00000017917) #9 TGFBR3 (ENSNVIG00000017998) #10 BRDT (ENSNVIG00000018157) #11 ENSNVIG00000018269 EPHX4 (ENSNVIG00000018293) #12 BTBD8 (ENSNVIG00000018305) #14 C1orf146 (ENSNVIG00000018342) #16 GLMN (ENSNVIG00000018361) #17 RPAP2 (ENSNVIG00000018390) #18 GFI1 (ENSNVIG00000018414) #19 EVI5 (ENSNVIG00000018444) #20 ENSNVIG00000018477 #22 DIPK1A (ENSNVIG00000018515) #23 MTF2 (ENSNVIG00000018537) #24 TMED5 (ENSNVIG00000018566) #25 CCDC18 (ENSNVIG00000018584) #26 DR1 (ENSNVIG00000018633) #27 ENSNVIG00000018642 FNBP1L (ENSNVIG00000018663) BCAR3 (ENSNVIG00000018770) DNTTIP2 (ENSNVIG00000018818) GSH0 (ENSNVIG00000018834) ABCA4 (ENSNVIG00000018869) ENSNVIG00000018922 ARHGAP29 (ENSNVIG00000018927) ABCD3 (ENSNVIG00000018976) F3 (ENSNVIG00000019055) Canidae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00530000063777.b ENSGT00950000186426 ENSGT00940000158611 ENSGT00940000158258 #7 ENSGT00550000074822.h #8 ENSGT00550000075011 #9 ENSGT00530000063861.b.b #10 ENSGT00940000154549.a #11 ENSGT00940000156233 #12 ENSGT00940000154382.a.b #14 ENSGT00390000008285 #16 ENSGT00390000018446.j #17 ENSGT00390000017965 #18 ENSGT00940000156166.a #19 ENSGT00940000153846.a.a #20 ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b #22 ENSGT00390000006452.b.b #23 ENSGT00950000183180.b #24 ENSGT00940000155468 #25 ENSGT00940000153190.A #26 ENSGT00550000075010 #27 ENSGT00950000183047.c.b ENSGT00940000154130.a.a.b ENSGT00510000048142 ENSGT00510000047658 ENSGT00940000155624.b ENSGT00950000183110.b.b ENSGT00950000182955.a.a.a ENSGT00390000012668 ENSGT00940000160336 ENSGT00940000154539.b Red fox MODERN SPECIES 21 ENSVVUG00000020740 BARHL2 (ENSVVUG00000020741) ZNF644 (ENSVVUG00000020745) #7 ENSVVUG00000020751 ENSVVUG00000020760 #8 CDC7 (ENSVVUG00000020767) #9 TGFBR3 (ENSVVUG00000020783) #10 BRDT (ENSVVUG00000020791) #11 EPHX4 (ENSVVUG00000020796) #12 KIAA1107 (ENSVVUG00000020801) #14 C1orf146 (ENSVVUG00000020806) #16 ENSVVUG00000020810 #17 RPAP2 (ENSVVUG00000020839) #18 ENSVVUG00000020858 #19 EVI5 (ENSVVUG00000020869) #20 ENSVVUG00000020882 #22 FAM69A (ENSVVUG00000020885) #23 MTF2 (ENSVVUG00000020888) #24 TMED5 (ENSVVUG00000021177) #25 CCDC18 (ENSVVUG00000021186) #26 DR1 (ENSVVUG00000021225) #27 FNBP1L (ENSVVUG00000021266) BCAR3 (ENSVVUG00000021837) DNTTIP2 (ENSVVUG00000021840) GCLM (ENSVVUG00000021841) ABCA4 (ENSVVUG00000021843) ARHGAP29 (ENSVVUG00000021844) ABCD3 (ENSVVUG00000021847) F3 (ENSVVUG00000021851) SLC44A3 (ENSVVUG00000021857) CNN3 (ENSVVUG00000021861) Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00530000063777.b ENSGT00950000186426 ENSGT00940000158611 ENSGT00940000158258 #7 ENSGT00550000074822.h #8 ENSGT00550000075011 #9 ENSGT00530000063861.b.b #10 ENSGT00940000154549.a #11 ENSGT00940000156233 #12 ENSGT00940000154382.a.b #14 ENSGT00390000008285 #16 ENSGT00390000018446.j #17 ENSGT00390000017965 #18 ENSGT00940000156166.a #19 ENSGT00940000153846.a.a #20 ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b #22 ENSGT00390000006452.b.b #23 ENSGT00950000183180.b #24 ENSGT00940000155468 #25 ENSGT00940000153190.A #26 ENSGT00550000075010 #27 ENSGT00950000183047.c.b ENSGT00940000154130.a.a.b ENSGT00510000048142 ENSGT00510000047658 ENSGT00940000155624.b ENSGT00950000183110.b.b ENSGT00950000182955.a.a.a ENSGT00390000012668 ENSGT00940000160336 ENSGT00940000154539.b Dingo MODERN SPECIES 172 ZNF326 (ENSCAFG00020013621) 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CDC7 (ENSCAFG00845016428) #9 TGFBR3 (ENSCAFG00845016141) #10 BRDT (ENSCAFG00845015912) #11 EPHX4 (ENSCAFG00845015813) #12 KIAA1107 (ENSCAFG00845015712) #14 C6H1orf146 (ENSCAFG00845015644) #16 GLMN (ENSCAFG00845015585) #17 RPAP2 (ENSCAFG00845015489) #18 GFI1 (ENSCAFG00845015425) #19 EVI5 (ENSCAFG00845015142) #20 RPL5 (ENSCAFG00845014925) #22 DIPK1A (ENSCAFG00845014860) #23 MTF2 (ENSCAFG00845014796) #24 TMED5 (ENSCAFG00845014750) #25 CCDC18 (ENSCAFG00845014633) #26 DR1 (ENSCAFG00845014570) #27 FNBP1L (ENSCAFG00845014505) BCAR3 (ENSCAFG00845015973) DNTTIP2 (ENSCAFG00845015837) GCLM (ENSCAFG00845015741) ABCA4 (ENSCAFG00845015579) ARHGAP29 (ENSCAFG00845015082) ABCD3 (ENSCAFG00845014838) F3 (ENSCAFG00845014757) SLC44A3 (ENSCAFG00845014574) CNN3 (ENSCAFG00845014488) Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158611 ENSGT00940000158258 #7 ENSGT00550000074822 #8 ENSGT00550000075011 #9 ENSGT00530000063861.b.b #10 ENSGT00940000154549.a #11 ENSGT00940000156233 #12 ENSGT01030000234574.A.b.a.b #13 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.a ENSGT00940000154382.a.b #14 ENSGT00390000008285 #16 ENSGT00390000018446 #17 ENSGT00390000017965 #18 ENSGT00940000156166.a #19 ENSGT00940000153846.a.a #20 ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b #22 ENSGT00390000006452.b.b #23 ENSGT00950000183180.b #24 ENSGT00940000155468 #25 ENSGT00940000153190.A #26 ENSGT00550000075010 #27 ENSGT00950000183047.c.b ENSGT00940000154130.a.a.b ENSGT00510000048142 ENSGT00510000047658 ENSGT00940000155624.b ENSGT00950000183110.b.b ENSGT00950000182955.a.a.a ENSGT00390000012668 ENSGT00940000160336 ENSGT00940000154539.b Suina DUPLICATION Suina ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00530000063777.b ENSGT00940000158611 ENSGT00940000158258 #7 ENSGT00550000074822 #8 ENSGT00550000075011 #9 ENSGT00530000063861.b.b #10 ENSGT00940000154549.a #11 ENSGT00940000156233 #12 ENSGT01030000234574.A.b.a.b #13 ENSGT00940000154382.a.b #14 ENSGT00390000008285 #16 ENSGT00390000018446 #17 ENSGT00390000017965 #18 ENSGT00940000156166.a #19 ENSGT00940000153846.a.a #20 ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b.c #22 ENSGT00390000006452.b.b #23 ENSGT00950000183180.b #24 ENSGT00940000155468 #25 ENSGT00940000153190.A #26 ENSGT00550000075010 #27 ENSGT00950000183047.c.b ENSGT00940000154130.a.a.b ENSGT00510000048142 ENSGT00510000047658 ENSGT00940000155624.b ENSGT00950000183110.b.b ENSGT00950000182955.a.a.a ENSGT00390000012668 ENSGT00940000160336 ENSGT00940000154539.b Chacoan peccary MODERN SPECIES 216 ZNF326 (ENSCWAG00000013237) BARHL2 (ENSCWAG00000013191) ZNF644 (ENSCWAG00000013112) #7 HFM1 (ENSCWAG00000013030) #8 CDC7 (ENSCWAG00000012921) #9 TGFBR3 (ENSCWAG00000012734) #10 BRDT (ENSCWAG00000012178) #11 EPHX4 (ENSCWAG00000012061) #12 ENSCWAG00000012040 #13 BTBD8 (ENSCWAG00000011706) #14 C1orf146 (ENSCWAG00000011626) #16 GLMN (ENSCWAG00000011447) #17 RPAP2 (ENSCWAG00000011301) #18 GFI1 (ENSCWAG00000011229) #19 EVI5 (ENSCWAG00000010914) #20 ENSCWAG00000010805 #22 DIPK1A (ENSCWAG00000010717) #23 MTF2 (ENSCWAG00000010620) #24 TMED5 (ENSCWAG00000010568) #25 CCDC18 (ENSCWAG00000010526) #26 DR1 (ENSCWAG00000010484) #27 FNBP1L (ENSCWAG00000010376) ENSCWAG00000010352 BCAR3 (ENSCWAG00000010282) DNTTIP2 (ENSCWAG00000010220) GCLM (ENSCWAG00000010130) ABCA4 (ENSCWAG00000008954) ARHGAP29 (ENSCWAG00000008826) ABCD3 (ENSCWAG00000008698) F3 (ENSCWAG00000008610) SLC44A3 (ENSCWAG00000008028) Pig MODERN SPECIES 12 ZNF644 (ENSSSCG00000022534) #7 HFM1 (ENSSSCG00000006912) #8 CDC7 (ENSSSCG00000027251) #9 TGFBR3 (ENSSSCG00000006911) #10 ENSSSCG00000060249 BRDT (ENSSSCG00000023654) #11 EPHX4 (ENSSSCG00000032057) #12 ENSSSCG00000056240 #13 BTBD8 (ENSSSCG00000035196) #14 C1orf146 (ENSSSCG00000042806) #16 GLMN (ENSSSCG00000006904) #17 ENSSSCG00000057775 RPAP2 (ENSSSCG00000006903) #18 GFI1 (ENSSSCG00000006902) #19 EVI5 (ENSSSCG00000006901) #20 RPL5 (ENSSSCG00000006899) #22 DIPK1A (ENSSSCG00000006900) #23 MTF2 (ENSSSCG00000006898) #24 TMED5 (ENSSSCG00000040439) #25 CCDC18 (ENSSSCG00000006897) #26 DR1 (ENSSSCG00000028310) #27 FNBP1L (ENSSSCG00000006894) BCAR3 (ENSSSCG00000006893) DNTTIP2 (ENSSSCG00000006892) GCLM (ENSSSCG00000037549) ABCA4 (ENSSSCG00000006890) ARHGAP29 (ENSSSCG00000006889) ABCD3 (ENSSSCG00000028620) F3 (ENSSSCG00000022447) SLC44A3 (ENSSSCG00000006888) CNN3 (ENSSSCG00000006887) Suina ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b.d #22 Pig MODERN SPECIES ENSSSCG00000041158 ENSSSCG00000061513 ENSSSCG00000045942 ENSSSCG00000049462 MYO5B (ENSSSCG00000004511) ACAA2 (ENSSSCG00000004510) LIPG (ENSSSCG00000004509) ENSSSCG00000035007 C18orf32 (ENSSSCG00000034415) DYM (ENSSSCG00000004508) SMAD7 (ENSSSCG00000004507) CTIF (ENSSSCG00000004506) ZBTB7C (ENSSSCG00000028076) SMAD2 (ENSSSCG00000004505) SKOR2 (ENSSSCG00000005767) ENSSSCG00000039669 #22 IER3IP1 (ENSSSCG00000060420) HDHD2 (ENSSSCG00000005771) KATNAL2 (ENSSSCG00000022643) PIAS2 (ENSSSCG00000034730) ST8SIA5 (ENSSSCG00000032053) LOXHD1 (ENSSSCG00000004503) RNF165 (ENSSSCG00000004502) C18orf25 (ENSSSCG00000004500) HAUS1 (ENSSSCG00000004498) ATP5F1A (ENSSSCG00000004499) PSTPIP2 (ENSSSCG00000060601) EPG5 (ENSSSCG00000021072) SIGLEC15 (ENSSSCG00000004493) SLC14A1 (ENSSSCG00000004492) ENSSSCG00000004491 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158611 ENSGT00940000158258 #7 ENSGT00550000074822 #8 ENSGT00550000075011 #9 ENSGT00530000063861.b.b #10 ENSGT00940000154549.a #11 ENSGT00940000156233 #12 ENSGT01030000234574.A.b.a.b #13 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.a ENSGT00940000154382.a.b #14 ENSGT00390000008285 #16 ENSGT00390000018446 #17 ENSGT00390000017965 #18 ENSGT00940000156166.a #19 ENSGT00940000153846.a.a #20 ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b #22 ENSGT00390000006452.b.b #23 ENSGT00950000183180.b #24 ENSGT00940000155468 #25 ENSGT00940000153190.A #26 ENSGT00550000075010 #27 ENSGT00950000183047.c.b ENSGT00940000154130.a.a.b ENSGT00510000048142 ENSGT00510000047658 ENSGT00940000155624.b ENSGT00950000183110.b.b ENSGT00950000182955.a.a.a ENSGT00390000012668 ENSGT00940000160336 ENSGT00940000154539.b Camelidae ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00940000158611 ENSGT00940000158258 #7 ENSGT00550000074822 #8 ENSGT00550000075011 #9 ENSGT00530000063861.b.b #10 ENSGT00940000154549.a #11 ENSGT00940000156233 #12 ENSGT01030000234574.A.b.a.b #13 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.a ENSGT00940000154382.a.b #14 ENSGT00390000008285 #16 ENSGT00390000018446 #17 ENSGT00390000017965 #18 ENSGT00940000156166.a #19 ENSGT00940000153846.a.a #20 ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b #22 ENSGT00390000006452.b.b #23 ENSGT00950000183180.b #24 ENSGT00940000155468 #25 ENSGT00940000153190.A #26 ENSGT00550000075010 #27 ENSGT00950000183047.c.b ENSGT00940000154130.a.a.b ENSGT00510000048142 ENSGT00510000047658 ENSGT00940000155624.b ENSGT00950000183110.b.b ENSGT00950000182955.a.a.a ENSGT00390000012668 ENSGT00940000160336 ENSGT00940000154539.b Arabian camel MODERN SPECIES 35 ZNF326 (ENSCDRG00005003095) BARHL2 (ENSCDRG00005003080) ZNF644 (ENSCDRG00005003047) #7 ENSCDRG00005003021 #8 CDC7 (ENSCDRG00005003004) #9 TGFBR3 (ENSCDRG00005002972) #10 BRDT (ENSCDRG00005002936) #11 EPHX4 (ENSCDRG00005002901) #12 ENSCDRG00005002875 #13 BTBD8 (ENSCDRG00005002823) #14 C1orf146 (ENSCDRG00005002798) #16 GLMN (ENSCDRG00005002771) #17 RPAP2 (ENSCDRG00005002720) #18 GFI1 (ENSCDRG00005002667) #19 EVI5 (ENSCDRG00005002514) #20 ENSCDRG00005002404 #22 DIPK1A (ENSCDRG00005002361) #23 MTF2 (ENSCDRG00005002314) #24 ENSCDRG00005002283 TMED5 (ENSCDRG00005002264) #25 CCDC18 (ENSCDRG00005002211) #26 DR1 (ENSCDRG00005002183) #27 FNBP1L (ENSCDRG00005002139) BCAR3 (ENSCDRG00005002103) DNTTIP2 (ENSCDRG00005002089) GCLM (ENSCDRG00005002067) ABCA4 (ENSCDRG00005001970) ENSCDRG00005001919 ENSCDRG00005001902 ABCD3 (ENSCDRG00005001791) F3 (ENSCDRG00005001755) Artiodactyla_b DUPLICATION Artiodactyla_b DUPLICATION Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b.e.a #22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b.e.a #22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b.e.a #22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b.e.a #22 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b.e.a #22 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 15 CCDC178 (ENSOARG00020023866) KLHL14 (ENSOARG00020024440) GAREM1 (ENSOARG00020024468) ENSOARG00020024526 RNF125 (ENSOARG00020024558) TRAPPC8 (ENSOARG00020024583) B4GALT6 (ENSOARG00020024733) TTR (ENSOARG00020024865) DSG2 (ENSOARG00020024912) DSG4 (ENSOARG00020024957) DSG1 (ENSOARG00020024979) DSC1 (ENSOARG00020024999) DSC2 (ENSOARG00020025065) ENSOARG00020025211 CDH2 (ENSOARG00020025259) ENSOARG00020025350 #22 CHST9 (ENSOARG00020025358) AQP4 (ENSOARG00020025374) KCTD1 (ENSOARG00020025395) TAF4B (ENSOARG00020025408) PSMA8 (ENSOARG00020025430) SS18 (ENSOARG00020025456) ZNF521 (ENSOARG00020025499) HRH4 (ENSOARG00020025511) ENSOARG00020025524 OSBPL1A (ENSOARG00020025534) CABYR (ENSOARG00020025548) TTC39C (ENSOARG00020025558) LAMA3 (ENSOARG00020025616) ANKRD29 (ENSOARG00020025754) ENSOARG00020025767 Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b.e.a #22 Blue whale MODERN SPECIES 10 TMEM170A (ENSBMSG00010019285) ENSBMSG00010019324 ENSBMSG00010019356 GABARAPL2 (ENSBMSG00010019521) ADAT1 (ENSBMSG00010019588) ENSBMSG00010019637 TERF2IP (ENSBMSG00010019727) ENSBMSG00010019772 ENSBMSG00010019785 ENSBMSG00010013399 CNTNAP4 (ENSBMSG00010013511) ENSBMSG00010013645 MON1B (ENSBMSG00010013661) SYCE1L (ENSBMSG00010013688) ADAMTS18 (ENSBMSG00010013750) ENSBMSG00010013805 #22 NUDT7 (ENSBMSG00010013822) VAT1L (ENSBMSG00010013861) CLEC3A (ENSBMSG00010013904) WWOX (ENSBMSG00010013976) MAF (ENSBMSG00010014160) DYNLRB2 (ENSBMSG00010014210) CDYL2 (ENSBMSG00010014282) ENSBMSG00010014361 ENSBMSG00010014412 ATMIN (ENSBMSG00010014471) C16orf46 (ENSBMSG00010014516) ENSBMSG00010014571 BCO1 (ENSBMSG00010014729) GAN (ENSBMSG00010014760) ENSBMSG00010014813 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b.e.b #22 Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b.e.b #22 Blue whale MODERN SPECIES ENSBMSG00010012272 BARHL2 (ENSBMSG00010000010) ENSBMSG00010000017 HFM1 (ENSBMSG00010000076) #8 CDC7 (ENSBMSG00010000261) #9 TGFBR3 (ENSBMSG00010000292) #10 BRDT (ENSBMSG00010000373) #11 EPHX4 (ENSBMSG00010000481) #12 ENSBMSG00010000502 BTBD8 (ENSBMSG00010000521) #14 C1orf146 (ENSBMSG00010000562) #16 GLMN (ENSBMSG00010000586) #17 ENSBMSG00010000612 #18 GFI1 (ENSBMSG00010000632) #19 EVI5 (ENSBMSG00010000675) #20 ENSBMSG00010000785 #22 DIPK1A (ENSBMSG00010000829) #23 MTF2 (ENSBMSG00010000876) #24 TMED5 (ENSBMSG00010000894) #25 CCDC18 (ENSBMSG00010000915) #26 DR1 (ENSBMSG00010000938) #27 ENSBMSG00010000952 FNBP1L (ENSBMSG00010000979) BCAR3 (ENSBMSG00010001032) DNTTIP2 (ENSBMSG00010001101) GCLM (ENSBMSG00010001139) ABCA4 (ENSBMSG00010001205) ARHGAP29 (ENSBMSG00010001329) ABCD3 (ENSBMSG00010001367) F3 (ENSBMSG00010001415) ENSBMSG00010001479 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158611 ENSGT00940000158258 #7 ENSGT00550000074822 #8 ENSGT00550000075011 #9 ENSGT00530000063861.b.b #10 ENSGT00940000154549.a #11 ENSGT00940000156233 #12 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ENSGT00940000153846.a.a #20 ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b.f #22 ENSGT00390000006452.b.b #23 ENSGT00950000183180.b #24 ENSGT00940000155468 #25 ENSGT00940000153190.A #26 ENSGT00550000075010 #27 ENSGT00950000183047.c.b ENSGT00940000154130.a.a.b ENSGT00510000048142 ENSGT00510000047658 ENSGT00940000155624.b ENSGT00950000183110.b.b ENSGT00950000182955.a.a.a ENSGT00390000012668 ENSGT00940000160336 ENSGT00940000154539.b Percora_a DUPLICATION Percora_a DUPLICATION Percora_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000158611 ENSGT00940000158258 #7 ENSGT00550000074822 #8 ENSGT00550000075011 #9 ENSGT00530000063861.b.b #10 ENSGT00940000154549.a #11 ENSGT00940000156233 #12 ENSGT01030000234574.A.b.a.b #13 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.a ENSGT00940000154382.a.b #14 ENSGT00390000008285 #16 ENSGT00390000018446 #17 ENSGT00390000017965 #18 ENSGT00940000156166.a #19 ENSGT00940000153846.a.a #20 ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b.f.a.a #22 ENSGT00390000006452.b.b #23 ENSGT00950000183180.b #24 ENSGT00940000155468 #25 ENSGT00940000153190.A #26 ENSGT00550000075010 #27 ENSGT00950000183047.c.b ENSGT00940000154130.a.a.b ENSGT00510000048142 ENSGT00510000047658 ENSGT00940000155624.b ENSGT00950000183110.b.b ENSGT00950000182955.a.a.a ENSGT00390000012668 ENSGT00940000160336 ENSGT00940000154539.b Bovidae DUPLICATION Bovidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000158611 ENSGT00940000158258 #7 ENSGT00550000074822 #8 ENSGT00550000075011 #9 ENSGT00530000063861.b.b #10 ENSGT00940000154549.a #11 ENSGT00940000156233 #12 ENSGT01030000234574.A.b.a.b #13 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.a ENSGT00940000154382.a.b #14 ENSGT00390000008285 #16 ENSGT00390000018446 #17 ENSGT00390000017965 #18 ENSGT00940000156166.a #19 ENSGT00940000153846.a.a #20 ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b.f.a.a.a #22 ENSGT00390000006452.b.b #23 ENSGT00950000183180.b #24 ENSGT00940000155468 #25 ENSGT00940000153190.A #26 ENSGT00550000075010 #27 ENSGT00950000183047.c.b ENSGT00940000154130.a.a.b ENSGT00510000048142 ENSGT00510000047658 ENSGT00940000155624.b ENSGT00950000183110.b.b ENSGT00950000182955.a.a.a ENSGT00390000012668 ENSGT00940000160336 ENSGT00940000154539.b Caprinae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000158258 #7 ENSGT00550000074822 #8 ENSGT00940000157730.h ENSGT00550000075011 #9 ENSGT00530000063861.b.b #10 ENSGT00940000154549.a #11 ENSGT00940000156233 #12 ENSGT01030000234574.A.b.a.b #13 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.a ENSGT00940000154382.a.b #14 ENSGT00390000008285 #16 ENSGT00390000018446 #17 ENSGT00390000017965 #18 ENSGT00940000156166.a #19 ENSGT00940000153846.a.a #20 ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b.f.a.a.a #22 ENSGT00390000006452.b.b #23 ENSGT00950000183180.b #24 ENSGT00940000155468 #25 ENSGT00940000153190.A #26 ENSGT00550000075010 #27 ENSGT00950000183047.c.b ENSGT00940000154130.a.a.b ENSGT00510000048142 ENSGT00510000047658 ENSGT00940000155624.b ENSGT00950000183110.b.b ENSGT00950000182955.a.a.a ENSGT00390000012668 ENSGT00940000160336 ENSGT00940000154539.b Goat DUPLICATION Goat MODERN SPECIES 22 ENSCHIG00000019689 ENSCHIG00000009537 ENSCHIG00000019124 CDC7 (ENSCHIG00000026844) #9 TGFBR3 (ENSCHIG00000015521) #10 BRDT (ENSCHIG00000020014) #11 EPHX4 (ENSCHIG00000017302) #12 ENSCHIG00000009487 #13 ENSCHIG00000022105 BTBD8 (ENSCHIG00000015692) #14 C1orf146 (ENSCHIG00000008745) #16 GLMN (ENSCHIG00000023340) #17 RPAP2 (ENSCHIG00000019522) #18 GFI1 (ENSCHIG00000016135) #19 EVI5 (ENSCHIG00000026426) #20 ENSCHIG00000015380 #22 DIPK1A (ENSCHIG00000020350) #23 MTF2 (ENSCHIG00000024099) #24 TMED5 (ENSCHIG00000016065) #25 CCDC18 (ENSCHIG00000008731) #26 DR1 (ENSCHIG00000020958) #27 FNBP1L (ENSCHIG00000014859) BCAR3 (ENSCHIG00000002020) DNTTIP2 (ENSCHIG00000009770) GCLM (ENSCHIG00000025257) ABCA4 (ENSCHIG00000021104) ARHGAP29 (ENSCHIG00000011428) ABCD3 (ENSCHIG00000023422) F3 (ENSCHIG00000019946) SLC44A3 (ENSCHIG00000025875) CNN3 (ENSCHIG00000022213) Goat MODERN SPECIES 7 TGFB2 (ENSCHIG00000022660) LYPLAL1 (ENSCHIG00000010399) SLC30A10 (ENSCHIG00000022548) ENSCHIG00000012201 EPRS1 (ENSCHIG00000021232) BPNT1 (ENSCHIG00000011274) IARS2 (ENSCHIG00000022986) RAB3GAP2 (ENSCHIG00000012515) MARK1 (ENSCHIG00000018612) ENSCHIG00000025460 C1orf115 (ENSCHIG00000014941) MTARC2 (ENSCHIG00000021377) MTARC1 (ENSCHIG00000001173) HLX (ENSCHIG00000014211) DUSP10 (ENSCHIG00000020432) ENSCHIG00000011464 #22 HHIPL2 (ENSCHIG00000014988) TAF1A (ENSCHIG00000020462) ENSCHIG00000011137 MIA3 (ENSCHIG00000020148) AIDA (ENSCHIG00000007226) BROX (ENSCHIG00000016719) FAM177B (ENSCHIG00000024320) DISP1 (ENSCHIG00000016498) TLR5 (ENSCHIG00000006703) SUSD4 (ENSCHIG00000013995) CCDC185 (ENSCHIG00000010076) CAPN8 (ENSCHIG00000012089) CAPN2 (ENSCHIG00000018229) TP53BP2 (ENSCHIG00000025253) ENSCHIG00000014707 Bovinae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00530000063777.b ENSGT00940000158611 ENSGT00940000158258 #7 ENSGT00550000074822 #8 ENSGT00550000075011 #9 ENSGT00530000063861.b.b #10 ENSGT00940000154549.a #11 ENSGT00940000156233 #12 ENSGT01030000234574.A.b.a.b #13 ENSGT00940000154382.a.b #14 ENSGT00390000008285.i #16 ENSGT00390000018446 #17 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ENSGT00940000155468 #25 ENSGT00940000153190.A #26 ENSGT01100000263480.a.a.b.b.b.a.a.a.a.a.a.a.a.a.a.a.b.a.b.a ENSGT00550000075010 #27 ENSGT00950000183047.c.b ENSGT00940000154130.a.a.b ENSGT00510000048142 ENSGT00510000047658 ENSGT00940000155624.b ENSGT00950000183110.b.b ENSGT00950000182955.a.a.a ENSGT00390000012668 ENSGT01100000263480.a.a.b.b.b.a.a.a.a.b.a.a.a.b.b Bos_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00530000063408.B ENSGT00940000157730 ENSGT00550000074822 #8 ENSGT00550000075011 #9 ENSGT00530000063861.b.b #10 ENSGT00940000154549.a #11 ENSGT00940000156233 #12 ENSGT01030000234574.A.b.a.b #13 ENSGT00940000154382.a.b #14 ENSGT00390000008285.i #16 ENSGT00390000018446 #17 ENSGT00390000017965 #18 ENSGT00940000156166.a #19 ENSGT01100000263480.a.a.a.b.a.b.b.b ENSGT00940000153846.a.a #20 ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b.f.a.a.a #22 ENSGT00390000006452.b.b #23 ENSGT00950000183180.b #24 ENSGT00940000155468 #25 ENSGT00940000153190.A #26 ENSGT01100000263480.a.a.b.b.b.a.a.a.a.a.a.a.a.a.a.a.b.a.b.a ENSGT00550000075010 #27 ENSGT00950000183047.c.b ENSGT00940000154130.a.a.b ENSGT00510000048142 ENSGT00510000047658 ENSGT00940000155624.b ENSGT00950000183110.b.b ENSGT01100000263480.a.b.b.a.b.b.b.b.b.b.b ENSGT00950000182955.a.a.a ENSGT00390000012668 Domestic yak MODERN SPECIES 22 ENSBGRG00000002204 ENSBGRG00000002183 HFM1 (ENSBGRG00000002085) #8 CDC7 (ENSBGRG00000002071) #9 TGFBR3 (ENSBGRG00000001978) #10 BRDT (ENSBGRG00000001903) #11 EPHX4 (ENSBGRG00000001865) #12 ENSBGRG00000001849 #13 BTBD8 (ENSBGRG00000001711) #14 C1orf146 (ENSBGRG00000001658) #16 GLMN (ENSBGRG00000001614) #17 RPAP2 (ENSBGRG00000001422) #18 GFI1 (ENSBGRG00000001385) #19 ENSBGRG00000001368 EVI5 (ENSBGRG00000001254) #20 ENSBGRG00000001137 #22 DIPK1A (ENSBGRG00000001056) #23 MTF2 (ENSBGRG00000000957) #24 TMED5 (ENSBGRG00000000898) #25 ENSBGRG00000000890 CCDC18 (ENSBGRG00000000861) #26 ENSBGRG00000000851 DR1 (ENSBGRG00000000843) #27 FNBP1L (ENSBGRG00000000657) BCAR3 (ENSBGRG00000000591) ENSBGRG00000000572 DNTTIP2 (ENSBGRG00000000534) GCLM (ENSBGRG00000000503) ABCA4 (ENSBGRG00000000369) ARHGAP29 (ENSBGRG00000000321) ENSBGRG00000000295 Wild yak MODERN SPECIES 674 ENSBMUG00000014152 CDC7 (ENSBMUG00000014193) #9 TGFBR3 (ENSBMUG00000014269) #10 BRDT (ENSBMUG00000014377) #11 EPHX4 (ENSBMUG00000014425) #12 ENSBMUG00000014448 #13 BTBD8 (ENSBMUG00000014486) #14 C1orf146 (ENSBMUG00000014519) #16 GLMN (ENSBMUG00000014564) #17 RPAP2 (ENSBMUG00000014599) #18 ENSBMUG00000014615 #19 EVI5 (ENSBMUG00000014711) #20 ENSBMUG00000014768 #22 DIPK1A (ENSBMUG00000014855) #23 MTF2 (ENSBMUG00000014917) #24 TMED5 (ENSBMUG00000014940) #25 CCDC18 (ENSBMUG00000014997) #26 DR1 (ENSBMUG00000015044) #27 FNBP1L (ENSBMUG00000015086) BCAR3 (ENSBMUG00000015164) DNTTIP2 (ENSBMUG00000015209) GCLM (ENSBMUG00000015219) ENSBMUG00000015232 ABCA4 (ENSBMUG00000015263) Bos_b ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00530000063408.B ENSGT00940000157730 ENSGT00550000074822 #8 ENSGT00550000075011 #9 ENSGT00530000063861.b.b #10 ENSGT00940000154549.a #11 ENSGT00940000156233 #12 ENSGT01030000234574.A.b.a.b #13 ENSGT00940000154382.a.b #14 ENSGT00390000008285.i #16 ENSGT00390000018446 #17 ENSGT00390000017965 #18 ENSGT00940000156166.a #19 ENSGT01100000263480.a.a.a.b.a.b.b.b ENSGT00940000153846.a.a #20 ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b.f.a.a.a #22 ENSGT00390000006452.b.b #23 ENSGT00950000183180.b #24 ENSGT00940000155468 #25 ENSGT00940000153190.A #26 ENSGT01100000263480.a.a.b.b.b.a.a.a.a.a.a.a.a.a.a.a.b.a.b.a ENSGT00550000075010 #27 ENSGT00950000183047.c.b ENSGT00940000154130.a.a.b ENSGT00510000048142 ENSGT00510000047658 ENSGT00940000155624.b ENSGT00950000183110.b.b ENSGT00950000182955.a.a.a ENSGT00390000012668 ENSGT01100000263480.a.a.b.b.b.a.a.a.a.b.a.a.a.b.b Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 22 HFM1 (ENSBIXG00005029863) #8 CDC7 (ENSBIXG00005029834) #9 TGFBR3 (ENSBIXG00005029750) #10 BRDT (ENSBIXG00005029609) #11 EPHX4 (ENSBIXG00005029573) #12 ENSBIXG00005029565 #13 ENSBIXG00005029558 ENSBIXG00005029549 BTBD8 (ENSBIXG00005029487) #14 ENSBIXG00005029439 #16 GLMN (ENSBIXG00005029411) #17 RPAP2 (ENSBIXG00005029317) #18 GFI1 (ENSBIXG00005000021) #19 ENSBIXG00005007878 EVI5 (ENSBIXG00005007958) #20 ENSBIXG00005008044 #22 DIPK1A (ENSBIXG00005008068) #23 MTF2 (ENSBIXG00005008140) #24 TMED5 (ENSBIXG00005008194) #25 CCDC18 (ENSBIXG00005008266) #26 ENSBIXG00005000148 ENSBIXG00005008323 DR1 (ENSBIXG00005008340) #27 FNBP1L (ENSBIXG00005008457) BCAR3 (ENSBIXG00005008526) DNTTIP2 (ENSBIXG00005008558) GCLM (ENSBIXG00005008584) ABCA4 (ENSBIXG00005008650) ARHGAP29 (ENSBIXG00005008734) ENSBIXG00005008777 ABCD3 (ENSBIXG00005005684) American bison MODERN SPECIES 3325 BARHL2 (ENSBBBG00000022453) ZNF644 (ENSBBBG00000005923) #7 HFM1 (ENSBBBG00000022392) #8 ENSBBBG00000022354 CDC7 (ENSBBBG00000008125) #9 TGFBR3 (ENSBBBG00000022326) #10 BRDT (ENSBBBG00000007333) #11 EPHX4 (ENSBBBG00000005841) #12 ENSBBBG00000022114 #13 BTBD8 (ENSBBBG00000022104) #14 C1orf146 (ENSBBBG00000007682) #16 GLMN (ENSBBBG00000022033) #17 RPAP2 (ENSBBBG00000022008) #18 ENSBBBG00000021986 #19 EVI5 (ENSBBBG00000021976) #20 ENSBBBG00000021904 #22 DIPK1A (ENSBBBG00000005789) #23 MTF2 (ENSBBBG00000021850) #24 TMED5 (ENSBBBG00000021744) #25 CCDC18 (ENSBBBG00000021695) #26 DR1 (ENSBBBG00000005742) #27 FNBP1L (ENSBBBG00000021576) BCAR3 (ENSBBBG00000021483) DNTTIP2 (ENSBBBG00000021419) GCLM (ENSBBBG00000021400) ABCA4 (ENSBBBG00000021372) ARHGAP29 (ENSBBBG00000005692) ABCD3 (ENSBBBG00000021258) F3 (ENSBBBG00000005677) SLC44A3 (ENSBBBG00000008523) ENSBBBG00000021099 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b.f.a.a.b #22 Caprinae DUPLICATION Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b.f.a.a.b.a #22 Rambouillet Sheep DUPLICATION Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 19 SNRPF (ENSOARG00020008550) CCDC38 (ENSOARG00020008604) AMDHD1 (ENSOARG00020008726) HAL (ENSOARG00020008798) LTA4H (ENSOARG00020009366) ELK3 (ENSOARG00020009713) CDK17 (ENSOARG00020009770) NEDD1 (ENSOARG00020010921) ENSOARG00020011279 SLC25A3 (ENSOARG00020011479) IKBIP (ENSOARG00020011666) ENSOARG00020011775 APAF1 (ENSOARG00020011843) ENSOARG00020012977 ENSOARG00020013011 ENSOARG00020013132 #22 ENSOARG00020013188 ENSOARG00020013303 ENSOARG00020013344 ENSOARG00020013408 ENSOARG00020013498 BLTP3B (ENSOARG00020013541) ENSOARG00020013878 ACTR6 (ENSOARG00020013903) SCYL2 (ENSOARG00020014106) ENSOARG00020014449 SLC17A8 (ENSOARG00020005092) NR1H4 (ENSOARG00020005198) ENSOARG00020005299 ANO4 (ENSOARG00020005350) SLC5A8 (ENSOARG00020005486) Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 19 ORMDL2 (ENSOARG00020005553) SARNP (ENSOARG00020005592) GDF11 (ENSOARG00020005627) CD63 (ENSOARG00020005646) RDH5 (ENSOARG00020005677) ENSOARG00020005711 ITGA7 (ENSOARG00020006660) METTL7B (ENSOARG00020007162) ENSOARG00020007194 ENSOARG00020007218 OR10P1 (ENSOARG00020007245) ENSOARG00020007265 ENSOARG00020007282 ENSOARG00020007304 OR2AP1 (ENSOARG00020007319) ENSOARG00020007344 #22 OR6C4 (ENSOARG00020007368) ENSOARG00020007390 ENSOARG00020007410 ENSOARG00020007433 ENSOARG00020007454 ENSOARG00020007468 ENSOARG00020007483 ENSOARG00020007500 ENSOARG00020007515 ENSOARG00020007536 ENSOARG00020007551 ENSOARG00020007566 ENSOARG00020007576 ENSOARG00020007589 OR6C70 (ENSOARG00020007601) Goat MODERN SPECIES 16 RNF138 (ENSCHIG00000000469) RNF125 (ENSCHIG00000010114) TRAPPC8 (ENSCHIG00000010164) ENSCHIG00000018964 B4GALT6 (ENSCHIG00000000421) TTR (ENSCHIG00000009995) DSG2 (ENSCHIG00000016271) DSG3 (ENSCHIG00000021842) DSG4 (ENSCHIG00000024819) DSG1 (ENSCHIG00000019924) DSC1 (ENSCHIG00000006661) DSC2 (ENSCHIG00000020827) DSC3 (ENSCHIG00000021926) ENSCHIG00000007130 CDH2 (ENSCHIG00000018662) ENSCHIG00000003085 #22 CHST9 (ENSCHIG00000021685) AQP4 (ENSCHIG00000010124) KCTD1 (ENSCHIG00000013103) TAF4B (ENSCHIG00000022055) PSMA8 (ENSCHIG00000018832) ENSCHIG00000000490 SS18 (ENSCHIG00000000067) ZNF521 (ENSCHIG00000000138) HRH4 (ENSCHIG00000000251) IMPACT (ENSCHIG00000000286) OSBPL1A (ENSCHIG00000000386) CABYR (ENSCHIG00000009351) TTC39C (ENSCHIG00000009120) LAMA3 (ENSCHIG00000013633) ENSCHIG00000015951 Caprinae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000011103.A ENSGT00390000011433 ENSGT00390000007723 ENSGT00530000063603.B ENSGT00390000003855.a ENSGT00940000159080 ENSGT00940000154292.a.b ENSGT00900000143213 ENSGT00940000163749 ENSGT00940000158952 ENSGT00940000157364.C ENSGT00940000163055 ENSGT00940000158817 ENSGT00390000006820 ENSGT00940000159118 ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b.f.a.a.b.b #22 ENSGT00530000063425.a.b ENSGT00550000075024 ENSGT00940000161424 ENSGT00550000074867 ENSGT00390000018245.c ENSGT00950000182980.a.b.b.b ENSGT00390000008095 ENSGT00940000158638 ENSGT00940000154141.B.s ENSGT00940000159000 ENSGT00950000183100.C.i.a.b ENSGT00390000016617 ENSGT00940000155970.q ENSGT00390000002730.c.b ENSGT00390000002879 Goat MODERN SPECIES 2 CHAC2 (ENSCHIG00000016681) ASB3 (ENSCHIG00000025413) ENSCHIG00000027041 ENSCHIG00000016778 ENSCHIG00000023901 ENSCHIG00000013329 ENSCHIG00000023509 ENSCHIG00000021404 FSHR (ENSCHIG00000023353) LHCGR (ENSCHIG00000005935) GTF2A1L (ENSCHIG00000019307) STON1 (ENSCHIG00000013272) ENSCHIG00000022262 PPP1R21 (ENSCHIG00000018575) FOXN2 (ENSCHIG00000025720) ENSCHIG00000011530 #22 FBXO11 (ENSCHIG00000024805) MSH6 (ENSCHIG00000014129) KCNK12 (ENSCHIG00000009025) MSH2 (ENSCHIG00000021960) EPCAM (ENSCHIG00000022999) CALM2 (ENSCHIG00000011230) STPG4 (ENSCHIG00000010209) TTC7A (ENSCHIG00000026586) MCFD2 (ENSCHIG00000021334) SOCS5 (ENSCHIG00000002578) ENSCHIG00000024753 PIGF (ENSCHIG00000015763) RHOQ (ENSCHIG00000002963) ATP6V1E2 (ENSCHIG00000002972) TMEM247 (ENSCHIG00000024767) Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 19 CHAC2 (ENSOARG00020001428) ENSOARG00020001440 NRXN1 (ENSOARG00020001627) ENSOARG00020003028 ENSOARG00020003042 ENSOARG00020003060 FSHR (ENSOARG00020003107) ENSOARG00020003239 LHCGR (ENSOARG00020003269) GTF2A1L (ENSOARG00020003448) STON1 (ENSOARG00020003561) PPP1R21 (ENSOARG00020003660) ENSOARG00020004435 FOXN2 (ENSOARG00020004450) ENSOARG00020004540 ENSOARG00020004545 #22 FBXO11 (ENSOARG00020004568) MSH6 (ENSOARG00020004740) KCNK12 (ENSOARG00020004920) MSH2 (ENSOARG00020004936) EPCAM (ENSOARG00020005022) CALM2 (ENSOARG00020005091) STPG4 (ENSOARG00020005136) TTC7A (ENSOARG00020005170) ENSOARG00020005365 SOCS5 (ENSOARG00020005421) PIGF (ENSOARG00020005433) ATP6V1E2 (ENSOARG00020005477) TMEM247 (ENSOARG00020005490) EPAS1 (ENSOARG00020005535) PRKCE (ENSOARG00020005680) Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b.f.a.a.b #22 Bos ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000158577 ENSGT00940000159488.f ENSGT00950000183043.b.b.g.b ENSGT01100000263557.A.b.a.b.a ENSGT01100000263557.A.b.a.b.b ENSGT00420000030504 ENSGT00530000063923.b ENSGT00940000160904 ENSGT00390000016188 ENSGT00390000012082 ENSGT00940000160028 ENSGT00390000016210 ENSGT00390000002564.a ENSGT00940000158864 ENSGT00390000001413 ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b.f.a.a.b #22 ENSGT00940000156436 ENSGT00390000000860.b ENSGT00390000000945 ENSGT00940000161008 ENSGT00390000002416 ENSGT00940000154046.b ENSGT00390000008092.a.k.a ENSGT00940000158028 ENSGT00390000003453.a ENSGT00940000158828 ENSGT00390000018619 ENSGT00940000157242 ENSGT00940000159054 ENSGT00940000156325 ENSGT00550000074817 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000159488.f ENSGT00950000183043.b.b.g.b ENSGT01100000263557.A.b.a.b.a ENSGT01100000264399.b ENSGT01100000263557.A.b.a.b.b ENSGT00420000030504 ENSGT00530000063923.b ENSGT00940000160904 ENSGT00390000016188 ENSGT00390000012082 ENSGT00940000160028 ENSGT00390000016210 ENSGT00390000002564.a ENSGT00940000158864 ENSGT00390000001413 ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b.f.a.a.b #22 ENSGT00940000156436 ENSGT00390000000860.b ENSGT00390000000945 ENSGT00940000161008 ENSGT00390000002416 ENSGT00940000154046.b ENSGT00390000008092.a.k.a ENSGT00940000158028 ENSGT00390000003453.a ENSGT00940000158828 ENSGT00390000018619 ENSGT00940000157242 ENSGT00940000159054 ENSGT00940000156325 ENSGT00550000074817 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 27 ENSBIXG00005020440 ENSBIXG00005020475 ENSBIXG00005020527 CCL21 (ENSBIXG00005020551) ENSBIXG00005020562 CCL19 (ENSBIXG00005003475) ENSBIXG00005020606 CCL27 (ENSBIXG00005020638) ENSBIXG00005020859 SIGMAR1 (ENSBIXG00005020927) ARID3C (ENSBIXG00005020990) DCTN3 (ENSBIXG00005003559) RPP25L (ENSBIXG00005021101) CNTFR (ENSBIXG00005021280) ENHO (ENSBIXG00005021318) ENSBIXG00005006459 #22 DNAI1 (ENSBIXG00005021393) FAM219A (ENSBIXG00005021501) ENSBIXG00005021536 NUDT2 (ENSBIXG00005007216) KIF24 (ENSBIXG00005021827) UBAP1 (ENSBIXG00005021944) DCAF12 (ENSBIXG00005003717) UBAP2 (ENSBIXG00005022184) UBE2R2 (ENSBIXG00005022262) NOL6 (ENSBIXG00005022356) AQP3 (ENSBIXG00005022407) ENSBIXG00005022448 NFX1 (ENSBIXG00005022478) CHMP5 (ENSBIXG00005022511) BAG1 (ENSBIXG00005022572) Cow MODERN SPECIES 27 RASEF (ENSBTAG00000021751) ENSBTAG00000052680 ENSBTAG00000051205 CCL21 (ENSBTAG00000010161) ENSBTAG00000053396 CCL19 (ENSBTAG00000012684) ENSBTAG00000049217 CCL27 (ENSBTAG00000014908) IL11RA (ENSBTAG00000014907) GALT (ENSBTAG00000015807) SIGMAR1 (ENSBTAG00000015804) ARID3C (ENSBTAG00000025792) DCTN3 (ENSBTAG00000018883) RPP25L (ENSBTAG00000016295) CNTFR (ENSBTAG00000015361) ENSBTAG00000005495 #22 DNAI1 (ENSBTAG00000008538) FAM219A (ENSBTAG00000008537) SMRP1 (ENSBTAG00000008376) NUDT2 (ENSBTAG00000031793) KIF24 (ENSBTAG00000012921) UBAP1 (ENSBTAG00000000320) DCAF12 (ENSBTAG00000021573) UBAP2 (ENSBTAG00000000695) UBE2R2 (ENSBTAG00000054773) NOL6 (ENSBTAG00000003323) AQP3 (ENSBTAG00000008493) AQP7 (ENSBTAG00000020105) NFX1 (ENSBTAG00000012385) CHMP5 (ENSBTAG00000012383) BAG1 (ENSBTAG00000017845) Bos_a ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000158577 ENSGT00940000159488.e ENSGT00950000183043.b.b.g.b ENSGT01100000263557.A.b.a.b.a ENSGT01100000263557.A.b.a.b.b ENSGT00420000030504 ENSGT00530000063923.b ENSGT00940000160904 ENSGT00390000016188 ENSGT00390000012082 ENSGT00940000160028 ENSGT00390000016210 ENSGT00390000002564.a ENSGT00940000158864 ENSGT00390000001413 ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b.f.a.a.b #22 ENSGT00940000156436 ENSGT00390000000860.b ENSGT00390000000945 ENSGT00940000161008 ENSGT00390000002416 ENSGT00940000154046.b ENSGT00390000008092.a.k.a ENSGT00940000158028 ENSGT00390000003453.a ENSGT00940000158828 ENSGT00390000018619 ENSGT00940000157242 ENSGT00940000159054 ENSGT00940000156325 ENSGT00550000074817 Wild yak MODERN SPECIES 1486 ENSBMUG00000018347 RASEF (ENSBMUG00000018328) ENSBMUG00000018305 CCL21 (ENSBMUG00000018298) CCL19 (ENSBMUG00000018278) ENSBMUG00000018252 CCL27 (ENSBMUG00000018214) IL11RA (ENSBMUG00000018179) GALT (ENSBMUG00000018148) SIGMAR1 (ENSBMUG00000018090) ARID3C (ENSBMUG00000018059) DCTN3 (ENSBMUG00000018031) RPP25L (ENSBMUG00000017956) CNTFR (ENSBMUG00000017942) ENHO (ENSBMUG00000017920) ENSBMUG00000017912 #22 DNAI1 (ENSBMUG00000017891) FAM219A (ENSBMUG00000017854) ENSBMUG00000017788 MYORG (ENSBMUG00000017758) NUDT2 (ENSBMUG00000017751) KIF24 (ENSBMUG00000017725) UBAP1 (ENSBMUG00000017691) DCAF12 (ENSBMUG00000017641) UBAP2 (ENSBMUG00000017593) UBE2R2 (ENSBMUG00000017513) NOL6 (ENSBMUG00000017498) AQP3 (ENSBMUG00000017453) ENSBMUG00000017436 NFX1 (ENSBMUG00000017416) CHMP5 (ENSBMUG00000017388) Siberian musk deer MODERN SPECIES 338 BTBD8 (ENSMMSG00000020783) #14 C1orf146 (ENSMMSG00000020758) #16 ENSMMSG00000020662 #17 RPAP2 (ENSMMSG00000020475) #18 GFI1 (ENSMMSG00000020411) #19 ENSMMSG00000020392 EVI5 (ENSMMSG00000019942) #20 ENSMMSG00000019811 #22 DIPK1A (ENSMMSG00000019720) #23 ENSMMSG00000019634 #24 TMED5 (ENSMMSG00000019579) #25 CCDC18 (ENSMMSG00000019556) #26 ENSMMSG00000019529 #27 FNBP1L (ENSMMSG00000019419) BCAR3 (ENSMMSG00000019338) DNTTIP2 (ENSMMSG00000019293) GCLM (ENSMMSG00000019242) ABCA4 (ENSMMSG00000018854) ARHGAP29 (ENSMMSG00000018746) ENSMMSG00000018668 ABCD3 (ENSMMSG00000018573) ENSMMSG00000018539 SLC44A3 (ENSMMSG00000018325) Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b.f.a.b #22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b.f.a.b #22 Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b.f.a.b #22 Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b.f.a.b #22 Bos_a ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000159137.d ENSGT00940000153362.a.cb.b.a.a ENSGT00940000159727 ENSGT00940000162247 ENSGT00670000098098 ENSGT00390000010121 ENSGT00950000183139.A ENSGT00940000162552 ENSGT00390000004987 ENSGT00550000074931 ENSGT00550000075046 ENSGT00940000154866.B.d ENSGT00960000190537 ENSGT01030000234532.A.a.a.b ENSGT00940000154327.b.e.b ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b.f.a.b #22 ENSGT00940000153431.b ENSGT00860000134050 ENSGT00390000006916.c ENSGT00390000014861 ENSGT00390000009679 ENSGT00390000000549 ENSGT00940000162260.h.a.b ENSGT00390000001146 ENSGT00940000159359 ENSGT00390000003349 ENSGT00940000154632.db ENSGT00940000162003 ENSGT00940000158015 ENSGT00950000183000.c.a.b ENSGT00390000016976 Domestic yak MODERN SPECIES 3 ENSBGRG00000006824 ENSBGRG00000006808 NKX2-2 (ENSBGRG00000006790) NKX2-4 (ENSBGRG00000006760) XRN2 (ENSBGRG00000006633) KIZ (ENSBGRG00000006486) ENSBGRG00000006333 ENSBGRG00000006247 INSM1 (ENSBGRG00000006219) CFAP61 (ENSBGRG00000006111) CRNKL1 (ENSBGRG00000006006) NAA20 (ENSBGRG00000005893) ENSBGRG00000005870 ENSBGRG00000005832 SLC24A3 (ENSBGRG00000005785) ENSBGRG00000005768 #22 DTD1 (ENSBGRG00000005731) SMIM26 (ENSBGRG00000005700) SEC23B (ENSBGRG00000005623) RBBP9 (ENSBGRG00000005523) POLR3F (ENSBGRG00000005416) DZANK1 (ENSBGRG00000005266) ZNF133 (ENSBGRG00000005240) KAT14 (ENSBGRG00000005198) ENSBGRG00000005155 MGME1 (ENSBGRG00000005078) SNX5 (ENSBGRG00000005032) BANF2 (ENSBGRG00000005004) RRBP1 (ENSBGRG00000004547) DSTN (ENSBGRG00000004466) BFSP1 (ENSBGRG00000004415) Bos_b ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000159137.d ENSGT00940000153362.a.bb.b.a ENSGT00940000159727 ENSGT00940000162247 ENSGT00670000098098 ENSGT00390000010121 ENSGT00950000183139.A ENSGT00940000162552 ENSGT00390000004987 ENSGT00550000074931 ENSGT00550000075046 ENSGT00940000154866.B.d ENSGT00390000001138.a.g.b ENSGT01030000234532.A.a.a.b ENSGT00940000154327.b.e.b ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b.f.a.b #22 ENSGT00940000153431.b ENSGT00860000134050 ENSGT00390000006916.c ENSGT00390000014861 ENSGT00390000009679 ENSGT00390000000549 ENSGT00940000162260.h.a.b ENSGT00940000162260.h.a.a ENSGT00390000001146 ENSGT00520000059926 ENSGT00940000159359 ENSGT00390000003349 ENSGT00940000154632.db ENSGT00940000162003 ENSGT00940000158015 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 4 PAX1 (ENSBIXG00005010606) ENSBIXG00005000694 ENSBIXG00005000714 XRN2 (ENSBIXG00005006105) ENSBIXG00005010385 RALGAPA2 (ENSBIXG00005010322) INSM1 (ENSBIXG00005010299) CFAP61 (ENSBIXG00005010280) CRNKL1 (ENSBIXG00005010247) NAA20 (ENSBIXG00005010224) RIN2 (ENSBIXG00005010179) ENSBIXG00005010143 SLC24A3 (ENSBIXG00005010121) SCP2D1 (ENSBIXG00005000779) DTD1 (ENSBIXG00005010081) ENSBIXG00005010061 #22 SMIM26 (ENSBIXG00005000771) SEC23B (ENSBIXG00005010022) RBBP9 (ENSBIXG00005009978) POLR3F (ENSBIXG00005009958) DZANK1 (ENSBIXG00005009929) ENSBIXG00005009868 ENSBIXG00005006413 KAT14 (ENSBIXG00005009829) OVOL2 (ENSBIXG00005009797) MGME1 (ENSBIXG00005000600) ENSBIXG00005009769 BANF2 (ENSBIXG00005009729) RRBP1 (ENSBIXG00005009648) DSTN (ENSBIXG00005000426) BFSP1 (ENSBIXG00005009213) Cow MODERN SPECIES 4 FOXA2 (ENSBTAG00000012407) PAX1 (ENSBTAG00000006742) ENSBTAG00000035643 NKX2-2 (ENSBTAG00000010277) NKX2-4 (ENSBTAG00000011312) XRN2 (ENSBTAG00000011304) KIZ (ENSBTAG00000020988) RALGAPA2 (ENSBTAG00000014178) CFAP61 (ENSBTAG00000009291) CRNKL1 (ENSBTAG00000008472) NAA20 (ENSBTAG00000001144) RIN2 (ENSBTAG00000020382) ENSBTAG00000032893 SLC24A3 (ENSBTAG00000011882) SCP2D1 (ENSBTAG00000005202) ENSBTAG00000012276 #22 DTD1 (ENSBTAG00000008964) SMIM26 (ENSBTAG00000051249) SEC23B (ENSBTAG00000018295) RBBP9 (ENSBTAG00000008826) POLR3F (ENSBTAG00000008825) ENSBTAG00000052347 DZANK1 (ENSBTAG00000004622) ZNF133 (ENSBTAG00000004620) KAT14 (ENSBTAG00000018978) PET117 (ENSBTAG00000051618) OVOL2 (ENSBTAG00000008410) MGME1 (ENSBTAG00000003425) SNX5 (ENSBTAG00000003422) BANF2 (ENSBTAG00000004474) RRBP1 (ENSBTAG00000015438) Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b.f.a.b #22 Goat MODERN SPECIES 24 MMP19 (ENSCHIG00000020526) ENSCHIG00000010424 DNAJC14 (ENSCHIG00000024690) ORMDL2 (ENSCHIG00000018442) ENSCHIG00000013335 GDF11 (ENSCHIG00000000705) ENSCHIG00000021207 RDH5 (ENSCHIG00000014412) ENSCHIG00000026980 ITGA7 (ENSCHIG00000023587) METTL7B (ENSCHIG00000027137) OR10P1 (ENSCHIG00000003962) ENSCHIG00000021329 ENSCHIG00000006012 OR2AP1 (ENSCHIG00000013176) ENSCHIG00000014481 #22 OR6C4 (ENSCHIG00000013348) ENSCHIG00000010904 ENSCHIG00000016098 ENSCHIG00000004976 ENSCHIG00000005335 ENSCHIG00000013315 ENSCHIG00000009797 ENSCHIG00000008170 ENSCHIG00000004713 ENSCHIG00000006788 ENSCHIG00000011029 ENSCHIG00000005744 ENSCHIG00000016635 ENSCHIG00000004292 OR6C76 (ENSCHIG00000003607) Siberian musk deer MODERN SPECIES 147 ENSMMSG00000011738 #22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b.f.b #22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b.f.b #22 Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b.f.b #22 Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b.f.b #22 Bos_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b.f.b #22 Wild yak MODERN SPECIES 1166 ENSBMUG00000000203 #22 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b.f.b #22 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 2 PLCD3 (ENSOARG00020025632) NMT1 (ENSOARG00020025637) DCAKD (ENSOARG00020025640) C1QL1 (ENSOARG00020025642) KIF18B (ENSOARG00020025650) GFAP (ENSOARG00020025675) FAM187A (ENSOARG00020025687) CCDC103 (ENSOARG00020025694) EFTUD2 (ENSOARG00020025703) HIGD1B (ENSOARG00020025722) GJC1 (ENSOARG00020009974) ADAM11 (ENSOARG00020010020) ENSOARG00020010510 CCDC43 (ENSOARG00020010559) MEIOC (ENSOARG00020010618) ENSOARG00020010735 #22 FZD2 (ENSOARG00020010772) GPATCH8 (ENSOARG00020010815) GPATCH8 (ENSOARG00020010882) FAM171A2 (ENSOARG00020011264) GRN (ENSOARG00020011356) SLC25A39 (ENSOARG00020011552) RUNDC3A (ENSOARG00020011641) SLC4A1 (ENSOARG00020011899) ENSOARG00020015824 UBTF (ENSOARG00020015878) ATXN7L3 (ENSOARG00020016057) ENSOARG00020016217 TMUB2 (ENSOARG00020016242) ASB16 (ENSOARG00020016404) ENSOARG00020016477 Goat DUPLICATION Goat MODERN SPECIES 10 NMT1 (ENSCHIG00000008386) DCAKD (ENSCHIG00000026749) C1QL1 (ENSCHIG00000013856) KIF18B (ENSCHIG00000021036) GFAP (ENSCHIG00000023753) FAM187A (ENSCHIG00000011746) CCDC103 (ENSCHIG00000015314) HIGD1B (ENSCHIG00000024601) EFTUD2 (ENSCHIG00000011603) GJC1 (ENSCHIG00000008800) ADAM11 (ENSCHIG00000026955) ENSCHIG00000016101 CCDC43 (ENSCHIG00000023225) MEIOC (ENSCHIG00000011237) ENSCHIG00000003692 ENSCHIG00000026903 #22 GPATCH8 (ENSCHIG00000008962) ITGA2B (ENSCHIG00000014389) FAM171A2 (ENSCHIG00000018936) GRN (ENSCHIG00000026100) ENSCHIG00000014759 RUNDC3A (ENSCHIG00000023707) SLC4A1 (ENSCHIG00000009610) UBTF (ENSCHIG00000011621) ATXN7L3 (ENSCHIG00000021414) ENSCHIG00000011610 TMUB2 (ENSCHIG00000019662) ENSCHIG00000025089 ASB16 (ENSCHIG00000013508) HROB (ENSCHIG00000009151) HDAC5 (ENSCHIG00000016811) Goat MODERN SPECIES 24 AMDHD1 (ENSCHIG00000023934) HAL (ENSCHIG00000018871) LTA4H (ENSCHIG00000017470) ELK3 (ENSCHIG00000020731) CDK17 (ENSCHIG00000016767) CFAP54 (ENSCHIG00000025886) NEDD1 (ENSCHIG00000024930) ENSCHIG00000007303 ENSCHIG00000011297 SLC25A3 (ENSCHIG00000026853) IKBIP (ENSCHIG00000018224) ENSCHIG00000009665 APAF1 (ENSCHIG00000026050) ENSCHIG00000026522 ENSCHIG00000021672 ENSCHIG00000011860 #22 ENSCHIG00000011894 ENSCHIG00000011002 GARIN6 (ENSCHIG00000026281) ENSCHIG00000020715 ENSCHIG00000014307 BLTP3B (ENSCHIG00000002074) ACTR6 (ENSCHIG00000026128) SCYL2 (ENSCHIG00000022321) SLC17A8 (ENSCHIG00000016996) NR1H4 (ENSCHIG00000020981) GAS2L3 (ENSCHIG00000015539) ANO4 (ENSCHIG00000011611) SLC5A8 (ENSCHIG00000012962) UTP20 (ENSCHIG00000009221) ARL1 (ENSCHIG00000024524) Yarkand deer DUPLICATION Yarkand deer MODERN SPECIES 12 ENSCHYG00000013541 ENSCHYG00000013515 HFM1 (ENSCHYG00000023707) #8 CDC7 (ENSCHYG00000023558) #9 TGFBR3 (ENSCHYG00000023491) #10 BRDT (ENSCHYG00000023233) #11 EPHX4 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ENSCHYG00000012189 ENSCHYG00000012174 ENSCHYG00000012166 ENSCHYG00000012138 #22 HYCC1 (ENSCHYG00000011929) ENSCHYG00000011839 ENSCHYG00000011799 RAPGEF5 (ENSCHYG00000011187) CDCA7L (ENSCHYG00000010925) DNAH11 (ENSCHYG00000010690) SP4 (ENSCHYG00000010584) ENSCHYG00000010564 ENSCHYG00000010545 SP8 (ENSCHYG00000010508) ABCB5 (ENSCHYG00000010073) ITGB8 (ENSCHYG00000009946) MACC1 (ENSCHYG00000009890) ENSCHYG00000009866 TMEM196 (ENSCHYG00000009756) Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158611 ENSGT00940000158258 #7 ENSGT00550000074822 #8 ENSGT00550000075011 #9 ENSGT00530000063861.b.b #10 ENSGT00940000154549.a #11 ENSGT00940000156233 #12 ENSGT00940000164497 ENSGT00950000182892.a.b.a.b.a ENSGT00940000154382.a.b #14 ENSGT00390000008285 #16 ENSGT00390000018446 #17 ENSGT00390000017965 #18 ENSGT00940000156166.a #19 ENSGT00940000153846.a.a #20 ENSGT00950000183210.d.a.c.a.a.b.f #22 ENSGT00390000006452.b.b #23 ENSGT00950000183180.b #24 ENSGT00940000155468 #25 ENSGT00940000153190.A #26 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ENSGT00390000012668 ENSGT00940000155028.q.a.c.a.b.b ENSGT00940000160336 Sperm whale MODERN SPECIES 15 ENSPCTG00005003669 BARHL2 (ENSPCTG00005003661) ZNF644 (ENSPCTG00005003632) #7 HFM1 (ENSPCTG00005003555) #8 CDC7 (ENSPCTG00005003524) #9 TGFBR3 (ENSPCTG00005003508) #10 BRDT (ENSPCTG00005003337) #11 EPHX4 (ENSPCTG00005003314) #12 ENSPCTG00005003303 BTBD8 (ENSPCTG00005003293) #14 C1orf146 (ENSPCTG00005003267) #16 GLMN (ENSPCTG00005003228) #17 RPAP2 (ENSPCTG00005003192) #18 GFI1 (ENSPCTG00005003172) #19 EVI5 (ENSPCTG00005003071) #20 ENSPCTG00005003033 #22 DIPK1A (ENSPCTG00005003008) #23 MTF2 (ENSPCTG00005002966) #24 TMED5 (ENSPCTG00005002942) #25 CCDC18 (ENSPCTG00005002918) #26 DR1 (ENSPCTG00005002905) #27 FNBP1L (ENSPCTG00005002834) DNTTIP2 (ENSPCTG00005002811) GCLM (ENSPCTG00005002786) ENSPCTG00005002771 ABCA4 (ENSPCTG00005002692) ARHGAP29 (ENSPCTG00005002478) ABCD3 (ENSPCTG00005002427) F3 (ENSPCTG00005002402) ENSPCTG00005002390 ENSPCTG00005002380 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 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