Amniota ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000010316 ENSGT00390000011295.a ENSGT00390000015228 ENSGT00390000003590 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B #22 ENSGT00940000158407 ENSGT01030000235401 ENSGT00530000063480.a ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.m.a ENSGT00940000167249 ENSGT00390000006350.n ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 Mammalia ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000011295.a ENSGT00390000015228 ENSGT00390000003590 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 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ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B #22 ENSGT00940000158407 ENSGT01030000235401 ENSGT00530000063480.a ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b.d ENSGT00390000006350.m.a.c.b.b ENSGT01050000244956.b.c.a ENSGT00390000006350.m.b ENSGT00940000167249 ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D Primates ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000015228 ENSGT00390000003590 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B #22 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b.c.a ENSGT00390000006350.m.b ENSGT00940000167249 ENSGT00390000006350.m.a.c.a 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(ENSTSYG00000033216) #25 EIF5B (ENSTSYG00000011850) #26 REV1 (ENSTSYG00000011917) #27 AFF3 (ENSTSYG00000029683) #28 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000015228 ENSGT00390000003590 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B #22 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b.c.a ENSGT00390000006350.m.a.c.a.mb ENSGT00390000005727.a.b.a.b.c.a.a ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000003590 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b 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Gorilla MODERN SPECIES 15 HYCC2 (ENSGGOG00000039554) ORC2 (ENSGGOG00000014070) NIF3L1 (ENSGGOG00000014060) PPIL3 (ENSGGOG00000022268) CLK1 (ENSGGOG00000016192) BZW1 (ENSGGOG00000016296) AOX1 (ENSGGOG00000006140) SGO2 (ENSGGOG00000038921) KCTD18 (ENSGGOG00000014079) SPATS2L (ENSGGOG00000005917) MAIP1 (ENSGGOG00000005661) TYW5 (ENSGGOG00000041719) C2orf69 (ENSGGOG00000005649) FTCDNL1 (ENSGGOG00000040488) ENSGGOG00000044011 SATB2 (ENSGGOG00000014123) #22 PLCL1 (ENSGGOG00000001959) BOLL (ENSGGOG00000013594) MARS2 (ENSGGOG00000034895) RFTN2 (ENSGGOG00000009318) MOB4 (ENSGGOG00000036779) HSPE1 (ENSGGOG00000027944) HSPD1 (ENSGGOG00000008267) COQ10B (ENSGGOG00000039158) SF3B1 (ENSGGOG00000009264) ENSGGOG00000038007 ANKRD44 (ENSGGOG00000014558) PGAP1 (ENSGGOG00000001785) C2orf66 (ENSGGOG00000038009) GTF3C3 (ENSGGOG00000011787) CCDC150 (ENSGGOG00000010004) Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000015228 ENSGT00390000003590 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b 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ENSGT00390000018393 ENSGT00940000157455.i.b ENSGT00950000182908.D ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 Chimpanzee MODERN SPECIES 15 ORC2 (ENSPTRG00000012795) NIF3L1 (ENSPTRG00000012794) PPIL3 (ENSPTRG00000012793) CLK1 (ENSPTRG00000012792) BZW1 (ENSPTRG00000012791) ENSPTRG00000044647 AOX1 (ENSPTRG00000012790) SGO2 (ENSPTRG00000022953) KCTD18 (ENSPTRG00000012787) SPATS2L (ENSPTRG00000012785) MAIP1 (ENSPTRG00000012784) TYW5 (ENSPTRG00000012783) C2orf69 (ENSPTRG00000012782) FTCDNL1 (ENSPTRG00000047502) ENSPTRG00000050460 SATB2 (ENSPTRG00000012779) #22 PLCL1 (ENSPTRG00000012778) BOLL (ENSPTRG00000012777) MARS2 (ENSPTRG00000047853) RFTN2 (ENSPTRG00000012776) MOB4 (ENSPTRG00000012775) HSPE1 (ENSPTRG00000012774) HSPD1 (ENSPTRG00000044665) COQ10B (ENSPTRG00000012772) SF3B1 (ENSPTRG00000012771) ENSPTRG00000049270 ANKRD44 (ENSPTRG00000012770) PGAP1 (ENSPTRG00000012769) C2BH2orf66 (ENSPTRG00000012768) GTF3C3 (ENSPTRG00000012767) CCDC150 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ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ENSGT00550000075136 ENSGT00390000000854.c.b.k.a.a.b ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b.c.a.a ENSGT00390000006350.m.a.c.b.a.b ENSGT00390000006350.m.a.c.a.mb ENSGT00390000005727.a.b.a.b.c.a.a ENSGT00940000155367.w ENSGT00390000018393 ENSGT00940000153941.a.a.h ENSGT00940000157455.i.b ENSGT00950000182908.D ENSGT00390000016484 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00950000183743 ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000000950.c.b.d.b ENSGT00390000008096.B #22 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ENSGT00550000075136 ENSGT00390000000854.c.b.k.a.a.b ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b.c.a.a ENSGT00390000006350.m.a.c.b.a.b.a ENSGT00390000005727.a.b.a.b.c.a.a ENSGT00940000155367.w ENSGT00390000018393 ENSGT00940000153941.a.a.h ENSGT00940000157455.i.b ENSGT00950000182908.D ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 Vervet Monkey MODERN SPECIES 1 HYCC2 (ENSCSAG00000010815) ORC2 (ENSCSAG00000010834) NIF3L1 (ENSCSAG00000010842) PPIL3 (ENSCSAG00000010852) CLK1 (ENSCSAG00000010924) BZW1 (ENSCSAG00000010957) ENSCSAG00000011187 AOX1 (ENSCSAG00000011276) SGO2 (ENSCSAG00000011303) KCTD18 (ENSCSAG00000011318) SPATS2L (ENSCSAG00000011326) MAIP1 (ENSCSAG00000011334) TYW5 (ENSCSAG00000011351) C2orf69 (ENSCSAG00000011358) FTCDNL1 (ENSCSAG00000011372) SATB2 (ENSCSAG00000011380) #22 PLCL1 (ENSCSAG00000011391) BOLL (ENSCSAG00000011399) MARS2 (ENSCSAG00000018765) RFTN2 (ENSCSAG00000011411) MOB4 (ENSCSAG00000011421) ENSCSAG00000011427 HSPD1 (ENSCSAG00000011463) COQ10B (ENSCSAG00000011483) SF3B1 (ENSCSAG00000011505) ENSCSAG00000011517 ANKRD44 (ENSCSAG00000011536) PGAP1 (ENSCSAG00000011561) C2orf66 (ENSCSAG00000011573) GTF3C3 (ENSCSAG00000011582) CCDC150 (ENSCSAG00000011637) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00950000183743 ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000000950.c.b.d.b ENSGT00390000008096.B #22 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ENSGT00550000075136 ENSGT00390000000854.c.b.k.a.a.b ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b.c.a.a ENSGT00390000006350.m.a.c.b.a.b.a ENSGT00390000005727.a.b.a.b.c.a.a ENSGT00940000155367.w ENSGT00390000018393 ENSGT00940000153941.a.a.h ENSGT00940000157455.i.b ENSGT00950000182908.D ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 Macaca ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000003590 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000000950.c.b.d.b ENSGT00390000008096.B #22 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ENSGT00550000075136 ENSGT00390000000854.c.b.k.a.a.b ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b.d ENSGT01050000244956.b.c.a.a ENSGT00390000006350.m.a.c.b.a.b.a ENSGT00390000005727.a.b.a.b.c.a.a ENSGT00940000155367.w ENSGT00390000018393 ENSGT00940000153941.a.a.h ENSGT00940000157455.i.b ENSGT00950000182908.D ENSGT00390000016484 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 409 NIF3L1 (ENSMNEG00000040987) PPIL3 (ENSMNEG00000032202) CLK1 (ENSMNEG00000031266) BZW1 (ENSMNEG00000043638) ENSMNEG00000045434 ENSMNEG00000034841 AOX1 (ENSMNEG00000024714) SGO2 (ENSMNEG00000035682) KCTD18 (ENSMNEG00000038609) SPATS2L (ENSMNEG00000016309) MAIP1 (ENSMNEG00000028494) TYW5 (ENSMNEG00000030303) C2orf69 (ENSMNEG00000035266) FTCDNL1 (ENSMNEG00000037918) ENSMNEG00000040066 SATB2 (ENSMNEG00000043012) #22 PLCL1 (ENSMNEG00000019208) BOLL (ENSMNEG00000033015) MARS2 (ENSMNEG00000019593) RFTN2 (ENSMNEG00000033769) ENSMNEG00000033689 MOB4 (ENSMNEG00000033188) ENSMNEG00000039279 ENSMNEG00000043358 COQ10B (ENSMNEG00000032409) SF3B1 (ENSMNEG00000042333) ENSMNEG00000036998 ANKRD44 (ENSMNEG00000043273) ENSMNEG00000045145 PGAP1 (ENSMNEG00000033082) C2orf66 (ENSMNEG00000038376) Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000015228 ENSGT00390000003590 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B #22 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ENSGT00550000075136 ENSGT00390000000854.c.b.k.a.a.b ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b.d ENSGT01050000244956.b.c.a.a ENSGT00390000006350.m.a.c.b.a.b.a ENSGT00390000005727.a.b.a.b.c.a.a.e ENSGT00940000155367.w ENSGT00390000018393 ENSGT00940000153941.a.a.h ENSGT00950000182908.D ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 3 HYCC2 (ENSMFAG00000032144) ORC2 (ENSMFAG00000040620) NIF3L1 (ENSMFAG00000003012) PPIL3 (ENSMFAG00000038708) CLK1 (ENSMFAG00000030719) BZW1 (ENSMFAG00000020809) ENSMFAG00000034555 AOX1 (ENSMFAG00000036889) SGO2 (ENSMFAG00000041855) KCTD18 (ENSMFAG00000037300) SPATS2L (ENSMFAG00000003450) MAIP1 (ENSMFAG00000045074) TYW5 (ENSMFAG00000004016) C2orf69 (ENSMFAG00000032268) ENSMFAG00000038094 SATB2 (ENSMFAG00000035983) #22 PLCL1 (ENSMFAG00000038838) BOLL (ENSMFAG00000030962) MARS2 (ENSMFAG00000012275) ENSMFAG00000003051 RFTN2 (ENSMFAG00000003082) ENSMFAG00000035530 ENSMFAG00000045023 ENSMFAG00000033000 COQ10B (ENSMFAG00000017910) ENSMFAG00000045829 SF3B1 (ENSMFAG00000036680) ENSMFAG00000057968 ENSMFAG00000057322 ANKRD44 (ENSMFAG00000032694) PGAP1 (ENSMFAG00000029122) Rhesus MODERN SPECIES 3 ORC2 (ENSMMUG00000014460) NIF3L1 (ENSMMUG00000006639) PPIL3 (ENSMMUG00000006638) CLK1 (ENSMMUG00000006640) BZW1 (ENSMMUG00000022202) AOX2 (ENSMMUG00000005835) AOX4 (ENSMMUG00000047974) AOX1 (ENSMMUG00000021931) SGO2 (ENSMMUG00000052913) KCTD18 (ENSMMUG00000008102) SPATS2L (ENSMMUG00000008101) MAIP1 (ENSMMUG00000023168) TYW5 (ENSMMUG00000023167) C12H2orf69 (ENSMMUG00000041535) FTCDNL1 (ENSMMUG00000031310) SATB2 (ENSMMUG00000046254) #22 ENSMMUG00000059853 PLCL1 (ENSMMUG00000012822) BOLL (ENSMMUG00000023811) MARS2 (ENSMMUG00000023810) RFTN2 (ENSMMUG00000023809) HSPE1 (ENSMMUG00000016547) HSPD1 (ENSMMUG00000010489) COQ10B (ENSMMUG00000056418) ENSMMUG00000058328 SF3B1 (ENSMMUG00000022430) ANKRD44 (ENSMMUG00000022425) PGAP1 (ENSMMUG00000043369) C2H2orf66 (ENSMMUG00000054516) GTF3C3 (ENSMMUG00000008643) CCDC150 (ENSMMUG00000015970) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000153189.B 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KCTD18 (ENSPANG00000021439) SPATS2L (ENSPANG00000008482) TYW5 (ENSPANG00000009235) C2orf69 (ENSPANG00000040521) ENSPANG00000044612 ENSPANG00000031615 SATB2 (ENSPANG00000011212) #22 ENSPANG00000050725 PLCL1 (ENSPANG00000000848) BOLL (ENSPANG00000009570) ENSPANG00000042310 MARS2 (ENSPANG00000016544) RFTN2 (ENSPANG00000009899) MOB4 (ENSPANG00000016215) ENSPANG00000046137 ENSPANG00000029555 COQ10B (ENSPANG00000006879) ENSPANG00000037062 SF3B1 (ENSPANG00000013417) ENSPANG00000016748 ENSPANG00000037191 ENSPANG00000048684 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00950000183743 ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000000950.c.b.d.b ENSGT00390000008096.B #22 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ENSGT00550000075136 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(ENSRROG00000044735) #22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000011295.a ENSGT00390000015228 ENSGT00390000003590 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234.c ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B #22 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b.c.a ENSGT00390000006350.m.b.b ENSGT00390000005727.a.b.a.b.c.a.a ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 Cebidae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000011295.a ENSGT00390000015228 ENSGT00390000003590 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b 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ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B #22 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b.c.a ENSGT00940000167249 ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00390000005727.a.b.a.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 Bushbaby MODERN SPECIES 128 HYCC2 (ENSOGAG00000012336) ORC2 (ENSOGAG00000012329) NIF3L1 (ENSOGAG00000025311) PPIL3 (ENSOGAG00000007087) CLK1 (ENSOGAG00000012328) BZW1 (ENSOGAG00000012326) AOX2 (ENSOGAG00000025249) AOX4 (ENSOGAG00000030158) AOX1 (ENSOGAG00000006066) SGO2 (ENSOGAG00000006064) KCTD18 (ENSOGAG00000012335) SPATS2L (ENSOGAG00000012331) MAIP1 (ENSOGAG00000006965) C2orf69 (ENSOGAG00000028317) ENSOGAG00000027028 SATB2 (ENSOGAG00000006949) #22 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000015228 ENSGT00390000003590 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B #22 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b.c.b ENSGT00390000006350.m.a.c.b.a.b ENSGT01050000244956.b.c.a ENSGT00940000167249 ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.a.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 Mouse lemur MODERN SPECIES 30 ENSMICG00000003372 PPIL3 (ENSMICG00000003367) CLK1 (ENSMICG00000003361) BZW1 (ENSMICG00000003355) ENSMICG00000033651 ENSMICG00000027664 AOX1 (ENSMICG00000005718) SGO2 (ENSMICG00000033463) ENSMICG00000003963 SPATS2L (ENSMICG00000003956) MAIP1 (ENSMICG00000044985) TYW5 (ENSMICG00000046098) C2orf69 (ENSMICG00000035511) ENSMICG00000026608 ENSMICG00000037134 SATB2 (ENSMICG00000009378) #22 PLCL1 (ENSMICG00000011854) BOLL (ENSMICG00000011845) RFTN2 (ENSMICG00000028117) ENSMICG00000037985 HSPD1 (ENSMICG00000028600) HSPE1 (ENSMICG00000046768) COQ10B (ENSMICG00000013910) SF3B1 (ENSMICG00000013879) ANKRD44 (ENSMICG00000013853) PGAP1 (ENSMICG00000013824) C2orf66 (ENSMICG00000043136) GTF3C3 (ENSMICG00000013800) CCDC150 (ENSMICG00000013761) HECW2 (ENSMICG00000013727) STK17B (ENSMICG00000013716) Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000015228 ENSGT00390000003590 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B #22 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b.c.a ENSGT00940000167249 ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.a.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ENSGT00390000016484 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 94 NDUFB3 (ENSPCOG00000020529) HYCC2 (ENSPCOG00000014611) ORC2 (ENSPCOG00000021783) NIF3L1 (ENSPCOG00000018022) PPIL3 (ENSPCOG00000028235) CLK1 (ENSPCOG00000018180) ENSPCOG00000015831 ENSPCOG00000015215 ENSPCOG00000027597 AOX1 (ENSPCOG00000021840) ENSPCOG00000024135 SPATS2L (ENSPCOG00000015945) MAIP1 (ENSPCOG00000008943) C2orf69 (ENSPCOG00000006950) FTCDNL1 (ENSPCOG00000019867) ENSPCOG00000014379 #22 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 225 MAK (ENSPSMG00000025468) TMEM14C (ENSPSMG00000025455) C6orf52 (ENSPSMG00000025442) ENSPSMG00000025433 GCNT2 (ENSPSMG00000025432) HNRNPA1L3 (ENSPSMG00000025423) AOX1 (ENSPSMG00000025393) SGO2 (ENSPSMG00000025322) KCTD18 (ENSPSMG00000025316) SPATS2L (ENSPSMG00000025292) MAIP1 (ENSPSMG00000025245) TYW5 (ENSPSMG00000025236) C2orf69 (ENSPSMG00000025231) FTCDNL1 (ENSPSMG00000025226) SATB2 (ENSPSMG00000025213) #22 PLCL1 (ENSPSMG00000025179) BOLL (ENSPSMG00000025166) MARS2 (ENSPSMG00000025148) RFTN2 (ENSPSMG00000025142) ENSPSMG00000025134 ENSPSMG00000025114 ENSPSMG00000025102 COQ10B (ENSPSMG00000025082) SF3B1 (ENSPSMG00000025061) ANKRD44 (ENSPSMG00000025023) PGAP1 (ENSPSMG00000024985) GTF3C3 (ENSPSMG00000024937) CCDC150 (ENSPSMG00000024921) HECW2 (ENSPSMG00000024894) STK17B (ENSPSMG00000024880) Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000015228 ENSGT00390000003590 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B #22 ENSGT00940000158407 ENSGT01030000235401 ENSGT00530000063480.a ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b.d ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 Tree shrew MODERN SPECIES 795 SATB2 (ENSTBEG00000002443) #22 Glires ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000015228 ENSGT00390000003590 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B #22 ENSGT00940000158407 ENSGT01030000235401 ENSGT00530000063480.a ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b.d ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000011295.a ENSGT00390000015228 ENSGT00390000003590 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000008096.B #22 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b.d ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.a.b ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 Rabbit MODERN SPECIES 18 PPIL3 (ENSOCUG00000010661) CLK1 (ENSOCUG00000010653) ENSOCUG00000010647 ENSOCUG00000026480 ENSOCUG00000024593 ENSOCUG00000035654 AOX1 (ENSOCUG00000013971) ENSOCUG00000000547 ENSOCUG00000037416 KCTD18 (ENSOCUG00000011556) SPATS2L (ENSOCUG00000011549) ENSOCUG00000017946 ENSOCUG00000035705 ENSOCUG00000016464 C2orf69 (ENSOCUG00000016473) SATB2 (ENSOCUG00000009700) #22 PLCL1 (ENSOCUG00000013978) BOLL (ENSOCUG00000013979) MARS2 (ENSOCUG00000017798) RFTN2 (ENSOCUG00000003993) ENSOCUG00000005712 HSPE1 (ENSOCUG00000010360) HSPD1 (ENSOCUG00000012736) COQ10B (ENSOCUG00000012735) ENSOCUG00000000205 ENSOCUG00000029492 ENSOCUG00000012722 ANKRD44 (ENSOCUG00000009183) PGAP1 (ENSOCUG00000002192) C2orf66 (ENSOCUG00000028999) GTF3C3 (ENSOCUG00000000463) Pika MODERN SPECIES 573 MAIP1 (ENSOPRG00000004142) TYW5 (ENSOPRG00000004133) C2orf69 (ENSOPRG00000004115) SATB2 (ENSOPRG00000003979) #22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000015228 ENSGT00390000003590 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B #22 ENSGT00940000158407 ENSGT01030000235401 ENSGT00530000063480.a ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b.d ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000011295.a ENSGT00390000015228 ENSGT00390000003590 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000008096.B #22 ENSGT00940000158407 ENSGT01030000235401 ENSGT00530000063480.a ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b.d ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 Kangaroo rat MODERN SPECIES 320 ENSDORG00000024018 Hycc2 (ENSDORG00000029531) Orc2 (ENSDORG00000007391) Nif3l1 (ENSDORG00000007390) Ppil3 (ENSDORG00000007389) Clk1 (ENSDORG00000007388) Bzw1 (ENSDORG00000029865) Aox2 (ENSDORG00000026718) Aox4 (ENSDORG00000026668) Aox3 (ENSDORG00000025305) Aox1 (ENSDORG00000004358) Kctd18 (ENSDORG00000007817) Spats2l (ENSDORG00000007816) Maip1 (ENSDORG00000012569) Tyw5 (ENSDORG00000012567) Satb2 (ENSDORG00000001292) #22 Plcl1 (ENSDORG00000000485) Boll (ENSDORG00000010791) Mars2 (ENSDORG00000010789) Rftn2 (ENSDORG00000008999) Mob4 (ENSDORG00000023241) ENSDORG00000011071 Hspd1 (ENSDORG00000011069) Coq10b (ENSDORG00000025804) Sf3b1 (ENSDORG00000002399) ENSDORG00000029693 ENSDORG00000024945 Pgap1 (ENSDORG00000000406) Gtf3c3 (ENSDORG00000000403) Hecw2 (ENSDORG00000014759) Stk17b (ENSDORG00000029601) Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000011295.a ENSGT00390000015228 ENSGT00390000003590 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000008096.B #22 ENSGT00940000158407 ENSGT01030000235401 ENSGT00530000063480.a ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b.d ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 52 ENSJJAG00000013473 Clk1 (ENSJJAG00000024354) Bzw1 (ENSJJAG00000022065) Aox2 (ENSJJAG00000011668) Aox4 (ENSJJAG00000017799) Aox1 (ENSJJAG00000019598) ENSJJAG00000015058 Kctd18 (ENSJJAG00000016069) Spats2l (ENSJJAG00000019268) ENSJJAG00000010933 ENSJJAG00000012063 Maip1 (ENSJJAG00000023816) Tyw5 (ENSJJAG00000019361) 1700066M21Rik (ENSJJAG00000019976) ENSJJAG00000023987 Satb2 (ENSJJAG00000019883) #22 ENSJJAG00000012932 Plcl1 (ENSJJAG00000024297) Boll (ENSJJAG00000015508) Mars2 (ENSJJAG00000023940) Rftn2 (ENSJJAG00000002223) ENSJJAG00000009865 ENSJJAG00000012025 ENSJJAG00000016713 Coq10b (ENSJJAG00000020646) Sf3b1 (ENSJJAG00000010903) ENSJJAG00000018305 Ankrd44 (ENSJJAG00000016107) Pgap1 (ENSJJAG00000009924) Gtf3c3 (ENSJJAG00000004649) Hecw2 (ENSJJAG00000022806) Muroidea ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000011295.a ENSGT00390000015228 ENSGT00390000003590 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000008096.B #22 ENSGT00940000158407 ENSGT01030000235401 ENSGT00530000063480.a ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b.d ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 417 ENSNGAG00000023509 ENSNGAG00000022183 Ppil3 (ENSNGAG00000014999) ENSNGAG00000010384 Bzw1 (ENSNGAG00000014200) Aox2 (ENSNGAG00000021935) Aox4 (ENSNGAG00000001220) Aox3 (ENSNGAG00000019159) Aox1 (ENSNGAG00000018103) ENSNGAG00000017175 Kctd18 (ENSNGAG00000011886) Spats2l (ENSNGAG00000009131) Maip1 (ENSNGAG00000013388) Tyw5 (ENSNGAG00000022701) 1700066M21Rik (ENSNGAG00000015731) Satb2 (ENSNGAG00000023604) #22 Plcl1 (ENSNGAG00000017912) ENSNGAG00000014596 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000011295.a ENSGT00390000015228 ENSGT00390000003590 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000008096.B #22 ENSGT00940000157452 ENSGT00940000158407 ENSGT01030000235401 ENSGT00530000063480.a ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b.d ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 Murinae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000011295.a ENSGT00390000015228 ENSGT00390000003590 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b 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ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000011295.a ENSGT00390000015228 ENSGT00390000003590 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000008096.B #22 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b.d ENSGT00390000006350.m.b ENSGT00390000005727.a.b.b.w.a ENSGT00390000005727.a.b.b.w.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ENSGT00390000016484 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 1 Orc2 (ENSCGRG00001016911) ENSCGRG00001018137 Ppil3 (ENSCGRG00001021470) Clk1 (ENSCGRG00001018410) Bzw1 (ENSCGRG00001017178) Aox2 (ENSCGRG00001017735) Aox4 (ENSCGRG00001016089) Aox3 (ENSCGRG00001016559) Aox1 (ENSCGRG00001018485) 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(ENSMAUG00000010644) Sf3b1 (ENSMAUG00000009071) Ankrd44 (ENSMAUG00000019633) Pgap1 (ENSMAUG00000018155) Gtf3c3 (ENSMAUG00000018770) Ccdc150 (ENSMAUG00000015624) Hecw2 (ENSMAUG00000011882) Stk17b (ENSMAUG00000018862) ENSMAUG00000020218 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000011295.a ENSGT00390000015228 ENSGT00390000003590 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000008096.B #22 ENSGT00940000157452 ENSGT00940000158407 ENSGT01030000235401 ENSGT00530000063480.a ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT00390000006350.m.a.c.a.`b ENSGT01050000244956.b.d ENSGT00390000006350.m.a.c.a.ab ENSGT00390000005727.a.b.b.w.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ENSGT00390000016484 ENSGT00390000016929 Prairie vole MODERN SPECIES 91 Hycc2 (ENSMOCG00000012367) Orc2 (ENSMOCG00000016158) Nif3l1 (ENSMOCG00000012327) ENSMOCG00000013096 ENSMOCG00000005608 Bzw1 (ENSMOCG00000008375) Aox2 (ENSMOCG00000018237) Aox4 (ENSMOCG00000015766) Aox1 (ENSMOCG00000001195) ENSMOCG00000012099 Kctd18 (ENSMOCG00000018835) Spats2l (ENSMOCG00000006136) Maip1 (ENSMOCG00000008182) Tyw5 (ENSMOCG00000018540) 1700066M21Rik (ENSMOCG00000018970) ENSMOCG00000005756 #22 Hsfy2 (ENSMOCG00000013974) Plcl1 (ENSMOCG00000014862) Boll (ENSMOCG00000022824) Mars2 (ENSMOCG00000006676) Rftn2 (ENSMOCG00000020060) ENSMOCG00000000253 Mob4 (ENSMOCG00000020652) ENSMOCG00000002787 Coq10b (ENSMOCG00000012636) Sf3b1 (ENSMOCG00000000455) ENSMOCG00000021330 Pgap1 (ENSMOCG00000013936) Gtf3c3 (ENSMOCG00000019654) Ccdc150 (ENSMOCG00000001399) Hecw2 (ENSMOCG00000012140) Northern American deer mouse MODERN SPECIES 4 Hycc2 (ENSPEMG00000014604) Orc2 (ENSPEMG00000010035) Nif3l1 (ENSPEMG00000023040) Ppil3 (ENSPEMG00000011585) Clk1 (ENSPEMG00000022508) 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SPECIES 18 ENSGT00390000015228 ENSGT00390000003590 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B #22 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000167666 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000015228 ENSGT00390000003590 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B #22 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.m.b ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367.r ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D.f ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 Megabat MODERN SPECIES 173 SATB2 (ENSPVAG00000012029) #22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000015228 ENSGT00390000003590 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B #22 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.m.a.d ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367.r ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D.f ENSGT00390000016484 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 26 ORC2 (ENSRFEG00010017722) NIF3L1 (ENSRFEG00010017775) PPIL3 (ENSRFEG00010017851) CLK1 (ENSRFEG00010017933) BZW1 (ENSRFEG00010018183) ENSRFEG00010018448 ENSRFEG00010019480 AOX1 (ENSRFEG00010021989) SGO2 (ENSRFEG00010022000) KCTD18 (ENSRFEG00010022002) SPATS2L (ENSRFEG00010022016) MAIP1 (ENSRFEG00010022032) TYW5 (ENSRFEG00010022036) C2orf69 (ENSRFEG00010022039) FTCDNL1 (ENSRFEG00010022040) SATB2 (ENSRFEG00010022046) #22 PLCL1 (ENSRFEG00010022056) BOLL (ENSRFEG00010022065) MARS2 (ENSRFEG00010022069) RFTN2 (ENSRFEG00010022072) ENSRFEG00010022073 MOB4 (ENSRFEG00010022077) ENSRFEG00010022080 HSPD1 (ENSRFEG00010022083) ENSRFEG00010022086 SF3B1 (ENSRFEG00010022087) ANKRD44 (ENSRFEG00010022091) PGAP1 (ENSRFEG00010022103) GTF3C3 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28 ENSGT00390000011295.a ENSGT00390000015228 ENSGT00390000003590 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B #22 Sloth MODERN SPECIES 1727 SATB2 (ENSCHOG00000012005) #22 Armadillo MODERN SPECIES 1606 ENSDNOG00000007984 ORC2 (ENSDNOG00000001397) NIF3L1 (ENSDNOG00000042985) PPIL3 (ENSDNOG00000039120) CLK1 (ENSDNOG00000007543) ENSDNOG00000044684 ENSDNOG00000045945 AOX1 (ENSDNOG00000017910) SGO2 (ENSDNOG00000041594) KCTD18 (ENSDNOG00000033036) SPATS2L (ENSDNOG00000011539) MAIP1 (ENSDNOG00000031166) TYW5 (ENSDNOG00000016467) C2orf69 (ENSDNOG00000031567) ENSDNOG00000031405 SATB2 (ENSDNOG00000001292) #22 ENSDNOG00000039662 EGLN2 (ENSDNOG00000044897) RAB4B (ENSDNOG00000035069) MIA (ENSDNOG00000025220) ENSDNOG00000018717 ACTMAP 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ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B #22 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 Elephant MODERN SPECIES 301 ORC2 (ENSLAFG00000022430) NIF3L1 (ENSLAFG00000009897) ENSLAFG00000009894 CLK1 (ENSLAFG00000009891) BZW1 (ENSLAFG00000009883) ENSLAFG00000026161 ENSLAFG00000028503 AOX1 (ENSLAFG00000007070) SGO2 (ENSLAFG00000028451) KCTD18 (ENSLAFG00000003281) SPATS2L (ENSLAFG00000001437) MAIP1 (ENSLAFG00000011639) TYW5 (ENSLAFG00000018708) C2orf69 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ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B #22 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.m.a ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT01050000244869.a.a.a.b.a.a.a.a.a ENSGT01050000244869.a.a.a.b.a.a.a.b.a ENSGT00940000162662 ENSGT01050000244869.a.a.a.b.a.b.d ENSGT01050000244869.a.a.a.b.a.b.c ENSGT01050000244869.a.a.a.b.a.a.b.c ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B #22 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.m.a 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ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B #22 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.m.a.b ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00390000015052.j.b koala MODERN SPECIES 52 SATB2 (ENSPCIG00000011693) #22 ENSPCIG00000014254 PLCL1 (ENSPCIG00000015570) ENSPCIG00000010605 MARS2 (ENSPCIG00000010610) RFTN2 (ENSPCIG00000010611) ENSPCIG00000010617 ENSPCIG00000010634 HSPD1 (ENSPCIG00000010636) COQ10B (ENSPCIG00000010639) ENSPCIG00000032633 SF3B1 (ENSPCIG00000010642) ANKRD44 (ENSPCIG00000010651) PGAP1 (ENSPCIG00000010659) GTF3C3 (ENSPCIG00000010674) ENSPCIG00000010684 Common wonbat MODERN SPECIES 1018 ENSVURG00010015914 ENSVURG00010015949 ENSVURG00010016231 ENSVURG00010016251 ENSVURG00010016261 ENSVURG00010016266 ENSVURG00010016286 ENSVURG00010016392 ENSVURG00010016490 KCTD18 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(ENSSHAG00000011077) #22 PLCL1 (ENSSHAG00000018454) BOLL (ENSSHAG00000018057) RFTN2 (ENSSHAG00000017876) MARS2 (ENSSHAG00000017980) MOB4 (ENSSHAG00000017821) HSPE1 (ENSSHAG00000017770) HSPD1 (ENSSHAG00000017750) COQ10B (ENSSHAG00000017719) SF3B1 (ENSSHAG00000017564) ANKRD44 (ENSSHAG00000016824) PGAP1 (ENSSHAG00000016631) C2orf66 (ENSSHAG00000029653) GTF3C3 (ENSSHAG00000016483) CCDC150 (ENSSHAG00000016389) HECW2 (ENSSHAG00000015049) Opossum MODERN SPECIES 3 ENSMODG00000045687 ENSMODG00000037855 ENSMODG00000048837 ENSMODG00000024581 ENSMODG00000051203 AOX4 (ENSMODG00000028424) ENSMODG00000041712 AOX1 (ENSMODG00000012485) ENSMODG00000012421 KCTD18 (ENSMODG00000012419) SPATS2L (ENSMODG00000012413) MAIP1 (ENSMODG00000012389) TYW5 (ENSMODG00000012381) C2orf69 (ENSMODG00000012380) ENSMODG00000024601 SATB2 (ENSMODG00000012352) #22 PLCL1 (ENSMODG00000012331) BOLL (ENSMODG00000012323) MARS2 (ENSMODG00000024604) RFTN2 (ENSMODG00000012311) MOB4 (ENSMODG00000012305) HSPE1 (ENSMODG00000012295) 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(ENSOANG00000047876) Sauria ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00390000011295.a ENSGT00390000015228 ENSGT00390000003590 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.c.b ENSGT00950000183114.a.b.b.c.a ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B #22 ENSGT00940000158407 ENSGT01030000235401 ENSGT00530000063480.a ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.n ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000167666 Archelosauria ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000011295.a ENSGT00390000015228 ENSGT00390000003590 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.c.b ENSGT00950000183114.a.b.b.c.a ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B #22 ENSGT00940000158407 ENSGT01030000235401 ENSGT00530000063480.a ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.n ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 Cryptodira ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000011295.a ENSGT00390000015228 ENSGT00390000003590 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.c.b ENSGT00950000183114.a.b.b.c.a ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B #22 ENSGT00940000158407 ENSGT01030000235401 ENSGT00530000063480.a ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.n ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367 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ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.c.b ENSGT00950000183114.a.b.b.c.a ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B #22 ENSGT00940000158407 ENSGT01030000235401 ENSGT00530000063480.a.q ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.n ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ENSGT00390000016484 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b Three-toed box turtle MODERN SPECIES 25 NDUFB3 (ENSTMTG00000009826) HYCC2 (ENSTMTG00000009797) ORC2 (ENSTMTG00000009760) NIF3L1 (ENSTMTG00000009742) PPIL3 (ENSTMTG00000009721) CLK1 (ENSTMTG00000009691) BZW1 (ENSTMTG00000009663) ENSTMTG00000009541 ENSTMTG00000009481 KCTD18 (ENSTMTG00000009452) SPATS2L (ENSTMTG00000009400) MAIP1 (ENSTMTG00000009374) TYW5 (ENSTMTG00000009344) C2orf69 (ENSTMTG00000009340) FTCDNL1 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KCTD18 (ENSPSIG00000018125) ENSPSIG00000018117 TYW5 (ENSPSIG00000018111) C2orf69 (ENSPSIG00000001193) SATB2 (ENSPSIG00000018044) #22 PLCL1 (ENSPSIG00000018022) BOLL (ENSPSIG00000018004) RFTN2 (ENSPSIG00000017989) MOB4 (ENSPSIG00000017978) HSPE1 (ENSPSIG00000017974) HSPD1 (ENSPSIG00000017889) COQ10B (ENSPSIG00000017692) SF3B1 (ENSPSIG00000017222) ANKRD44 (ENSPSIG00000015936) C2orf66 (ENSPSIG00000015930) GTF3C3 (ENSPSIG00000015691) CCDC150 (ENSPSIG00000015196) HECW2 (ENSPSIG00000013756) STK17B (ENSPSIG00000013683) ENSPSIG00000013666 Archosauria ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000011295.a ENSGT00390000015228 ENSGT00390000003590 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.c.b ENSGT00950000183114.a.b.b.c.a ENSGT00940000154107.b.j.a ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B #22 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.n ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b Aves ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000010316 ENSGT00390000011295.a ENSGT00390000015228 ENSGT00390000003590 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.c.b ENSGT00950000183114.a.b.b.c.a ENSGT00940000154107.b.j.a ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000008096.B #22 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.n ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b Neognathae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000010316 ENSGT00390000011295.a ENSGT00390000015228 ENSGT00390000003590 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.c.b ENSGT00950000183114.a.b.b.c.a ENSGT00940000154107.b.j.a ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000008096.B #22 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.n ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000010316 ENSGT00390000011295.a ENSGT00390000015228 ENSGT00390000003590 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.c.b ENSGT00950000183114.a.b.b.c.a ENSGT00940000154107.b.j.a ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b 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ALS2 (ENSPMRG00000006747) Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 12 ORC2 (ENSSMRG00000020017) NIF3L1 (ENSSMRG00000020018) PPIL3 (ENSSMRG00000020020) MKS1 (ENSSMRG00000020026) ENSSMRG00000020027 CLK1 (ENSSMRG00000020029) BZW1 (ENSSMRG00000020030) ENSSMRG00000020046 ENSSMRG00000020241 KCTD18 (ENSSMRG00000020242) SPATS2L (ENSSMRG00000020243) MAIP1 (ENSSMRG00000020245) TYW5 (ENSSMRG00000020247) C2orf69 (ENSSMRG00000020249) FTCDNL1 (ENSSMRG00000020252) SATB2 (ENSSMRG00000020256) #22 ENSSMRG00000020259 PLCL1 (ENSSMRG00000020260) ENSSMRG00000020262 ENSSMRG00000020263 RFTN2 (ENSSMRG00000020265) MOB4 (ENSSMRG00000020267) HSPE1 (ENSSMRG00000020269) HSPD1 (ENSSMRG00000020273) COQ10B (ENSSMRG00000020275) SF3B1 (ENSSMRG00000020276) ANKRD44 (ENSSMRG00000020279) PGAP1 (ENSSMRG00000020281) CFLAR (ENSSMRG00000020283) ENSSMRG00000020284 TRAK2 (ENSSMRG00000020286) Toxicofera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000010316 ENSGT00390000011295.a ENSGT00390000015228 ENSGT00390000003590 ENSGT00940000163579 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Blue-lipped sea krait MODERN SPECIES 579 SATB2 (ENSLLTG00000006991) #22 Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00530000064199.k ENSGT00530000064199.l ENSGT00390000010316 ENSGT00390000011295.a ENSGT00390000015228 ENSGT00390000003590 ENSGT00940000163579 ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b ENSGT00950000183114.a.b.b.c.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000008096.B #22 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.n ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393.e ENSGT00950000182908.D ENSGT00390000016484 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000167666 ENSGT00940000155466.g ENSGT00940000154014.b.b Eastern brown snake MODERN SPECIES 7 ENSPTXG00000002638 ENSPTXG00000002639 NDUFB3 (ENSPTXG00000002643) HYCC2 (ENSPTXG00000002649) ORC2 (ENSPTXG00000002651) NIF3L1 (ENSPTXG00000002654) ENSPTXG00000002657 CLK1 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