Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00390000011295.a	ENSGT00390000015228 #8	ENSGT00390000003590 #9	ENSGT00940000153189.B #10	ENSGT00940000159722 #11	ENSGT00390000012561.b #13	ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b #14	ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a #15	ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b #16	ENSGT00940000154107.b	ENSGT00530000064234 #17	ENSGT00390000001138.b #18	ENSGT00390000004145 #19	ENSGT00940000158493 #20	ENSGT00390000005550 #21	ENSGT00390000008096.B #22	ENSGT00940000158407 #23	ENSGT00530000063480.a #24	ENSGT00550000075136	ENSGT00530000063609.a #25	ENSGT01050000244956.b.d #26	ENSGT00390000006350.m.a.c.b.b.a.b ##28	ENSGT00390000005727.a.b.a.b #29	ENSGT00940000155367 #30	ENSGT00390000018393 #31	ENSGT00950000182908.D #33	ENSGT00390000016484 #36	ENSGT00390000016929 #37	ENSGT00390000005285	ENSGT00940000155466	ENSGT00940000154014.b.b
Degu	MODERN SPECIES	66	ENSODEG00000007860 #7	ORC2 (ENSODEG00000008853) #8	NIF3L1 (ENSODEG00000008894) #9	PPIL3 (ENSODEG00000007592) #10	CLK1 (ENSODEG00000009021) #11	ENSODEG00000019563 #12	ENSODEG00000008411 #13	ENSODEG00000008135 #14	ENSODEG00000011138 #15	AOX1 (ENSODEG00000012914) #16	ENSODEG00000009211 #17	SPATS2L (ENSODEG00000009851) #18	MAIP1 (ENSODEG00000008914) #19	TYW5 (ENSODEG00000009836) #20	C2orf69 (ENSODEG00000008700) #21	SATB2 (ENSODEG00000008383) #22	PLCL1 (ENSODEG00000008918) #23	BOLL (ENSODEG00000008471) #24	RFTN2 (ENSODEG00000008704) #25	MOB4 (ENSODEG00000009609) #26	ENSODEG00000019874 #27	ENSODEG00000011397 #28	ENSODEG00000009026 #29	COQ10B (ENSODEG00000008396) #30	ENSODEG00000011153 #31	ENSODEG00000019820 #32	ENSODEG00000008898 #33	ENSODEG00000008698 #34	ENSODEG00000009525 #35	PGAP1 (ENSODEG00000009932) #36	ENSODEG00000009843 #37
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	110	HYCC2 (ENSCLAG00000011177)	ORC2 (ENSCLAG00000013209) #8	NIF3L1 (ENSCLAG00000013524) #9	PPIL3 (ENSCLAG00000014050) #10	CLK1 (ENSCLAG00000011455) #11	BZW1 (ENSCLAG00000012079) #13	ENSCLAG00000011199 #14	ENSCLAG00000014402 #15	AOX1 (ENSCLAG00000011481) #16	ENSCLAG00000012456	ENSCLAG00000014377 #17	SPATS2L (ENSCLAG00000013167) #18	MAIP1 (ENSCLAG00000011913) #19	TYW5 (ENSCLAG00000012009) #20	C2orf69 (ENSCLAG00000012813) #21	SATB2 (ENSCLAG00000016994) #22	PLCL1 (ENSCLAG00000016098) #23	BOLL (ENSCLAG00000017375) #24	MARS2 (ENSCLAG00000010386)	RFTN2 (ENSCLAG00000009821) #25	MOB4 (ENSCLAG00000010086) #26	ENSCLAG00000010686 ##28	HSPD1 (ENSCLAG00000011541) #29	COQ10B (ENSCLAG00000017377) #30	SF3B1 (ENSCLAG00000014767) #31	ANKRD44 (ENSCLAG00000015396) #33	PGAP1 (ENSCLAG00000011838) #36	GTF3C3 (ENSCLAG00000009827) #37	CCDC150 (ENSCLAG00000012365)	HECW2 (ENSCLAG00000011628)	STK17B (ENSCLAG00000012520)