Vertebrata DUPLICATION Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003420.a.b #22 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156200.A ENSGT00940000156600 ENSGT00940000158429 #10 ENSGT00950000183128.B #9 ENSGT00550000074897 ENSGT00940000159735 #11 ENSGT00940000157634 #14 ENSGT00940000156273 #15 ENSGT00940000155917 ENSGT00390000005307 #16 ENSGT00940000157311 #17 ENSGT00390000008565.b #18 ENSGT00730000111176 ENSGT00940000160043 #19 ENSGT00940000156826 #21 ENSGT00390000003420.a.b #22 ENSGT01030000234559.a.b ENSGT00940000163581 ENSGT00940000160560 ENSGT00940000158252 ENSGT00940000156348.C ENSGT00940000159078 ENSGT00390000004692.d.b ENSGT00390000004692.d.a ENSGT00940000163111.a.b ENSGT00530000063936.b ENSGT00940000153229.B ENSGT00390000002634.b ENSGT00940000153231.B ENSGT00390000003298 ENSGT00390000012891 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00950000183128.B #9 ENSGT00550000074897 ENSGT00390000018077 ENSGT00940000159735 #11 ENSGT00940000157634 #14 ENSGT00940000156273 #15 ENSGT00940000155917 ENSGT00940000158325 ENSGT00530000063861.b.a ENSGT00390000005307 #16 ENSGT00940000157311 #17 ENSGT00390000008565.b #18 ENSGT00730000111176 ENSGT00940000160043 #19 ENSGT00940000156826 #21 ENSGT00390000003420.a.b #22 ENSGT01030000234559.a.b ENSGT00940000163581 ENSGT00940000160560 ENSGT00530000064273.a.a ENSGT00940000158252 ENSGT00940000156348.C ENSGT00940000159078 ENSGT00390000004692.d.b ENSGT00940000163111.a.b ENSGT00530000063936.b ENSGT00940000153229.B ENSGT00390000002634.b ENSGT00940000153231.B ENSGT01100000263525.a.b.b ENSGT00390000003298 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 107 ENSGT00940000159923 ENSGT00940000158429 #10 ENSGT00950000183128.B #9 ENSGT00390000018077 ENSGT00940000159735 #11 ENSGT00940000157634.d #14 ENSGT00940000156273 #15 ENSGT00940000155917 ENSGT00390000005307 #16 ENSGT00940000157311 #17 ENSGT00390000008565.b #18 ENSGT00940000160043 #19 ENSGT00940000157207.b #20 ENSGT00940000156826 #21 ENSGT00940000177713 ENSGT00390000003420.a.b #22 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Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 484 ENSGT00940000159923 ENSGT00390000012433.b #7 ENSGT00940000165774 #8 ENSGT00950000183128.B.i.a #9 ENSGT00940000158429 #10 ENSGT00950000183128.B.j ##9 ENSGT00940000159735 #11 ENSGT00940000157634.d.h #14 ENSGT00940000156273 #15 ENSGT00390000005307.t #16 ENSGT00940000157311.n #17 ENSGT00390000008565.b #18 ENSGT00940000160043.e.a #19 ENSGT00940000157207.b #20 ENSGT00940000156826.d.a #21 ENSGT00390000003420.a.b.a.b #22 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00390000014590 ENSGT00940000160852 ENSGT00940000159923 ENSGT00390000012433.b.b #7 ENSGT00940000158429 #10 ENSGT00950000183128.B.j ##9 ENSGT00940000159735 #11 ENSGT00940000157634.d.h #14 ENSGT00940000156273 #15 ENSGT00390000005307.t #16 ENSGT00940000157311.n #17 ENSGT00390000008565.b #18 ENSGT00940000160043.e.a.b #19 ENSGT00940000157207.b #20 ENSGT00940000156826.d.a.b #21 ENSGT00390000003420.a.b.a.b #22 ENSGT00940000154296.b.a.c.a #23 ENSGT00940000154290.a.e.c #24 ENSGT00390000005182.k #25 ENSGT00530000063825.A.c.e #26 ENSGT00390000001263 #27 ENSGT00940000154772.a.a #28 ENSGT00940000155271.lb.sc.e.b ##29 ENSGT00390000013236.l.a #30 ENSGT00940000155569.a.b #31 ENSGT00940000154456.hb.a.h.a.a #32 ENSGT00940000159325.e #33 ENSGT00950000182982.A.b.s.a.a ENSGT00940000166845.c.b.b #34 ENSGT00390000017580.e.a #35 ENSGT00940000154742.a.`b #36 Salmo ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000012433.b.b #7 ENSGT00940000165774 #8 ENSGT00950000183128.B.i.a #9 ENSGT00940000158429 #10 ENSGT00940000159735 #11 ENSGT00940000157634.d.h.a #12 ENSGT00940000156273.eb #13 ENSGT00940000157634.d.h.b #14 ENSGT00940000156273.db #15 ENSGT00390000005307.t #16 ENSGT00940000157311.n #17 ENSGT00390000008565.b.w #18 ENSGT00940000160043.e.a.b #19 ENSGT00940000157207.b #20 ENSGT00940000156826.d.a.b #21 ENSGT00390000003420.a.b.a.b #22 ENSGT00940000154296.b.a.c.a #23 ENSGT00940000154290.a.e.c #24 ENSGT00390000005182.k #25 ENSGT00530000063825.A.c.e #26 ENSGT00390000001263 #27 ENSGT00940000154772.a.a #28 ENSGT00940000155271.lb.rc.a #29 ENSGT00390000013236.l.a #30 ENSGT00940000155569.a.b #31 ENSGT00940000154456.hb.a.h.a.a #32 ENSGT00940000159325.e #33 ENSGT00940000166845.c.b.b #34 ENSGT00390000017580.e.a #35 ENSGT00940000154742.a.`b #36 ENSGT00390000007058.q.b #37 Atlantic salmon MODERN SPECIES 5 ENSSSAG00000102794 vath (ENSSSAG00000115585) bag1 (ENSSSAG00000095448) ENSSSAG00000012543 oprk1 (ENSSSAG00000089257) ST6GALNAC5 (ENSSSAG00000093729) #14 pigk (ENSSSAG00000115850) #15 zzz3 (ENSSSAG00000094968) #16 ENSSSAG00000116330 usp33 (ENSSSAG00000101623) #17 ENSSSAG00000101262 fubp1 (ENSSSAG00000032861) #19 slc25a24l (ENSSSAG00000043252) #20 ENSSSAG00000087565 ENSSSAG00000097128 #21 gipc2 (ENSSSAG00000118160) #22 ENSSSAG00000007619 #24 ENSSSAG00000004608 #25 ENSSSAG00000004590 #26 ENSSSAG00000004575 #27 ENSSSAG00000092889 ENSSSAG00000066060 ENSSSAG00000099904 ##29 ENSSSAG00000052122 #30 ENSSSAG00000005903 #31 ENSSSAG00000091592 #32 ENSSSAG00000094189 ENSSSAG00000105984 ENSSSAG00000119948 ENSSSAG00000112810 ENSSSAG00000099894 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00390000014590 ENSGT00940000160852 ENSGT00940000159923 ENSGT00390000012433.b.b #7 ENSGT00940000158429 #10 ENSGT00950000183128.B.j ##9 ENSGT00940000159735 #11 ENSGT00940000157634.d.h #14 ENSGT00940000156273 #15 ENSGT00390000005307.t #16 ENSGT00940000157311.n #17 ENSGT00390000008565.b #18 ENSGT00940000160043.e.a.b #19 ENSGT00940000157207.b #20 ENSGT00940000156826.d.a.b #21 ENSGT00390000003420.a.b.a.b #22 ENSGT00940000154290.a.e.c #24 ENSGT00390000005182.k #25 ENSGT00530000063825.A.c.e #26 ENSGT00390000001263 #27 ENSGT00940000154772.a.a #28 ENSGT00940000155271.lb.sc.e.b ##29 ENSGT00390000013236.l.a #30 ENSGT00940000155569.a.b #31 ENSGT00940000154456.hb.a.h.a.a #32 ENSGT00940000159325.e #33 ENSGT00950000182982.A.b.s.a.a ENSGT00940000166845.c.b.b #34 ENSGT00390000017580.e.a #35 ENSGT00940000154742.a.`b #36 ENSGT00390000007058.q.b #37 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 172 ENSGT00390000005307.t #16 ENSGT00940000157311.n #17 ENSGT00390000008565.b #18 ENSGT00940000160043.e.a.b #19 ENSGT00940000157207.b #20 ENSGT00940000156826.d.a.b #21 ENSGT00390000003420.a.b.a.b #22 ENSGT00940000154290.a.e.c #24 ENSGT00390000005182.k #25 ENSGT00530000063825.A.c.e #26 ENSGT00390000001263 #27 ENSGT00940000154772.a.a #28 ENSGT00940000155271.lb.sc.e.b ##29 ENSGT00390000013236.l.a #30 ENSGT00940000155569.a.b #31 ENSGT00940000154456.hb.a.h.a.a #32 ENSGT00950000182982.A.b.s.a.a Coho salmon MODERN SPECIES 23 ENSOKIG00005048254 ENSOKIG00005048262 ENSOKIG00005048266 tmem236 (ENSOKIG00005048269) stam (ENSOKIG00005048283) ENSOKIG00005048345 ENSOKIG00005025793 ENSOKIG00005025967 clul1 (ENSOKIG00005025970) zzz3 (ENSOKIG00005025988) #16 usp33 (ENSOKIG00005026075) #17 miga1 (ENSOKIG00005026205) #18 fubp1 (ENSOKIG00005026463) #19 slc25a24l (ENSOKIG00005027441) #20 DNAJB4 (ENSOKIG00005027494) #21 gipc2 (ENSOKIG00005027522) #22 ENSOKIG00005027552 ENSOKIG00005027580 #24 si:dkey-222f8.3 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ENSGT00940000157649.j.a ENSGT00950000183097.a.b.a ENSGT00940000161292.v.b ENSGT00520000055625.b.k.b ENSGT00940000160043.a #19 ENSGT00390000008565.b.n #18 ENSGT00940000157311.l #17 ENSGT00390000005307.r #16 ENSGT00940000155917.db.b ENSGT00940000156273.w #15 ENSGT00940000157634.d.d #14 ENSGT00940000159735.a #11 ENSGT00390000003478.o ENSGT00940000157207.b.d #20 ENSGT00940000156826.e #21 ENSGT00390000003420.a.b.i.a #22 ENSGT00530000063273.a.c ENSGT00390000016906.a.e ENSGT00390000011127.d.b ENSGT00940000155265.a.g.a ENSGT00940000161639.f.a ENSGT00390000006960.a ENSGT00940000157532.b.b ENSGT00940000155450.c.a ENSGT00940000156182.b ENSGT00400000022086.a.k.a ENSGT00940000160814.e.b ENSGT00940000156781.m.b ENSGT00550000074836.o.a ENSGT00940000157325.jb.a ENSGT00940000156227.e.b Common carp reference MODERN SPECIES 21 si:ch211-71m22.1 (ENSCCRG00000062185) ENSCCRG00000069951 si:ch211-71m22.3 (ENSCCRG00000018664) ENSCCRG00000075732 miga1 (ENSCCRG00000047790) #18 usp33 (ENSCCRG00000048309) #17 zzz3 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ST6GALNAC5 (ENSSGRG00000012365) #14 st6galnac3 (ENSSGRG00000012366) #11 cope (ENSSGRG00000012371) slc25a24l (ENSSGRG00000012565) #20 dnajb4 (ENSSGRG00000012566) #21 ENSSGRG00000012567 #22 gipc2 (ENSSGRG00000012568) #22 txndc12 (ENSSGRG00000012569) ENSSGRG00000012572 zgc:153615 (ENSSGRG00000012577) selenot1a (ENSSGRG00000012586) SERP1 (ENSSGRG00000012589) SERP1 (ENSSGRG00000012594) gpt (ENSSGRG00000012625) c1ql3b (ENSSGRG00000013234) pter (ENSSGRG00000013235) Zebrafish MODERN SPECIES 11 si:ch211-71m22.1 (ENSDARG00000058638) ENSDARG00000091266 si:ch211-71m22.3 (ENSDARG00000079075) fubp1 (ENSDARG00000029248) #19 miga1 (ENSDARG00000020596) #18 usp33 (ENSDARG00000016163) #17 zzz3 (ENSDARG00000077581) #16 ak5 (ENSDARG00000012555) pigk (ENSDARG00000024479) #15 ST6GALNAC5 (ENSDARG00000039220) #14 st6galnac3 (ENSDARG00000058473) #11 cope (ENSDARG00000018562) slc25a24l (ENSDARG00000038977) #20 ENSDARG00000115192 dnajb4 (ENSDARG00000038978) #21 gipc2 (ENSDARG00000009488) #22 txndc12 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ENSGT00390000003420.a.b.i.b.a #22 ENSGT00530000063273.a.d ENSGT00390000016906.a.f ENSGT00390000011127.d.a ENSGT00940000153655.A.b ENSGT00390000011725.d.`b ENSGT00940000161729.n ENSGT00390000010727 ENSGT00940000155265.a.g.b ENSGT00940000161639.f.b ENSGT00390000006960.b ENSGT00940000157532.b.a ENSGT00940000155450.c.b ENSGT00940000156182.a ENSGT00400000022086.a.k.b Golden-line barbel DUPLICATION Golden-line barbel MODERN SPECIES 1074 cope (ENSSGRG00000023374) slc25a24l (ENSSGRG00000023375) #20 dnajb4 (ENSSGRG00000023376) #21 ENSSGRG00000023377 #22 txndc12 (ENSSGRG00000023378) ENSSGRG00000023402 selenot1a (ENSSGRG00000023407) SERP1 (ENSSGRG00000023408) ENSSGRG00000023410 c1ql3b (ENSSGRG00000023412) pter (ENSSGRG00000023414) MMP16 (ENSSGRG00000023426) egfra (ENSSGRG00000023458) Golden-line barbel MODERN SPECIES 272 dipk2aa (ENSSGRG00000008728) si:ch211-71m22.1 (ENSSGRG00000008730) ENSSGRG00000008731 si:ch211-71m22.3 (ENSSGRG00000008732) fubp1 (ENSSGRG00000008750) #19 miga1 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#22 ENSGT01030000234559.a.b ENSGT00530000064273.a.a ENSGT00940000158252 ENSGT00960000189609 ENSGT00940000156348.C ENSGT00940000159078 ENSGT00940000163111.a.b.b ENSGT00530000063936.b ENSGT00940000153229.B ENSGT00390000002634.b ENSGT00940000153231.B ENSGT01100000263525.a.b.b ENSGT00940000165410 ENSGT00390000003298 ENSGT00390000012891 Turkey MODERN SPECIES 1 ENSMGAG00000009334 ENSMGAG00000009357 ENSMGAG00000009401 ENSMGAG00000009407 #22 ENSMGAG00000020030 ENSMGAG00000009417 #21 ENSMGAG00000009424 #19 ENSMGAG00000020233 ENSMGAG00000009489 ENSMGAG00000009506 #18 ENSMGAG00000018767 #18 ENSMGAG00000009520 #17 ENSMGAG00000019032 ENSMGAG00000009582 #16 ENSMGAG00000009597 ENSMGAG00000009634 #15 ENSMGAG00000009631 #14 ENSMGAG00000009653 #11 ENSMGAG00000009667 Chicken MODERN SPECIES 37 CFAP57 (ENSGALG00010022534) EBNA1BP2 (ENSGALG00010022506) FAM183A (ENSGALG00010022486) PIF1 (ENSGALG00010022480) ST6GALNAC3 (ENSGALG00010024554) #11 ST6GALNAC5 (ENSGALG00010022471) #14 PIGK (ENSGALG00010022435) #15 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ENSGT01030000235381 ENSGT00530000063936.b ENSGT00940000163788 ENSGT00940000153229.B ENSGT00390000002634.b ENSGT00940000153231.B ENSGT01100000263525.a.b.b ENSGT00390000003298 Common wall lizard MODERN SPECIES 14 ENSPMRG00000010171 ACADM (ENSPMRG00000010163) #10 RABGGTB (ENSPMRG00000010149) #9 ENSPMRG00000010145 ENSPMRG00000010140 ST6GALNAC3 (ENSPMRG00000010135) #11 ST6GALNAC5 (ENSPMRG00000010133) #14 PIGK (ENSPMRG00000010127) #15 AK5 (ENSPMRG00000010119) ZZZ3 (ENSPMRG00000010113) #16 USP33 (ENSPMRG00000010102) #17 MIGA1 (ENSPMRG00000010093) #18 NEXN (ENSPMRG00000010075) FUBP1 (ENSPMRG00000010036) #19 DNAJB4 (ENSPMRG00000010025) #21 GIPC2 (ENSPMRG00000010015) #22 PTGFR (ENSPMRG00000010012) ENSPMRG00000009971 ENSPMRG00000009940 ADGRL4 (ENSPMRG00000009916) ENSPMRG00000008563 ENSPMRG00000008560 ENSPMRG00000008553 ENSPMRG00000008549 ADGRL2 (ENSPMRG00000008455) ENSPMRG00000008439 TTLL7 (ENSPMRG00000008385) ENSPMRG00000008345 ENSPMRG00000008328 SAMD13 (ENSPMRG00000008309) ENSPMRG00000008278 Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 31 RABGGTB (ENSSMRG00000020172) #9 MSH4 (ENSSMRG00000020179) ST6GALNAC3 (ENSSMRG00000020182) #11 ENSSMRG00000020184 ST6GALNAC5 (ENSSMRG00000020188) #14 PIGK (ENSSMRG00000020189) #15 ENSSMRG00000020190 ENSSMRG00000020191 ZZZ3 (ENSSMRG00000020192) #16 USP33 (ENSSMRG00000020193) #17 MIGA1 (ENSSMRG00000020194) #18 NEXN (ENSSMRG00000020195) FUBP1 (ENSSMRG00000020196) #19 DNAJB4 (ENSSMRG00000020197) #21 ENSSMRG00000020198 GIPC2 (ENSSMRG00000020199) #22 PTGFR (ENSSMRG00000020200) ENSSMRG00000020201 ADGRL4 (ENSSMRG00000020202) ENSSMRG00000020203 ENSSMRG00000020205 ADGRL2 (ENSSMRG00000020209) TTLL7 (ENSSMRG00000020211) ENSSMRG00000020212 SAMD13 (ENSSMRG00000020213) ENSSMRG00000020214 ENSSMRG00000020215 DNASE2B (ENSSMRG00000020396) RPF1 (ENSSMRG00000020397) ENSSMRG00000020398 SPATA1 (ENSSMRG00000020399) Toxicofera ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000156200.A ENSGT00940000156600 ENSGT00940000158429 #10 ENSGT00950000183128.B #9 ENSGT00550000074897.g 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(ENSOANG00000049080) ENSOANG00000014419 RPF1 (ENSOANG00000043157) ENSOANG00000021004 ENSOANG00000044361 CTBS (ENSOANG00000036257) ENSOANG00000021944 SSX2IP (ENSOANG00000003514) Theria ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000156600 ENSGT00940000158429 #10 ENSGT00950000183128.B #9 ENSGT00550000074897 ENSGT00390000018077 ENSGT00940000159735 #11 ENSGT00940000157634 #14 ENSGT00940000156273 #15 ENSGT00940000155917 ENSGT00390000005307 #16 ENSGT00940000157311 #17 ENSGT00390000008565.b #18 ENSGT00730000111176 ENSGT00940000160043 #19 ENSGT00940000156826 #21 ENSGT00390000003420.a.b #22 ENSGT01030000234559.a.b ENSGT00940000158252 ENSGT00940000156348.C ENSGT00940000166568 ENSGT00940000159078 ENSGT00940000161169 ENSGT00530000063936.b ENSGT00940000163788 ENSGT00940000153229.B ENSGT00390000002634.b ENSGT01100000263525.a.b.b ENSGT00940000153231.B ENSGT00940000165410 ENSGT00390000003298 ENSGT00390000012891 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000156600 ENSGT00940000158429 #10 ENSGT00950000183128.B #9 ENSGT00550000074897 ENSGT00390000018077 ENSGT00940000159735 #11 ENSGT00940000157634 #14 ENSGT00940000156273 #15 ENSGT00940000155917 ENSGT00390000005307 #16 ENSGT00940000157311 #17 ENSGT00390000008565.b #18 ENSGT00730000111176 ENSGT00940000160043 #19 ENSGT00940000156826 #21 ENSGT00390000003420.a.b #22 ENSGT01030000234559.a.b Opossum MODERN SPECIES 317 MIGA1 (ENSMODG00000020799) #18 NEXN (ENSMODG00000020802) FUBP1 (ENSMODG00000020804) #19 DNAJB4 (ENSMODG00000020806) #21 ENSMODG00000020801 #22 ENSMODG00000022843 ENSMODG00000022842 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000158429 #10 ENSGT00950000183128.B #9 ENSGT00550000074897 ENSGT00390000018077.a ENSGT00940000159735 #11 ENSGT00940000157634 #14 ENSGT00940000156273 #15 ENSGT00940000155917 ENSGT00390000005307 #16 ENSGT00940000157311 #17 ENSGT00390000008565.b #18 ENSGT00730000111176 ENSGT00940000160043 #19 ENSGT00940000156826 #21 ENSGT01020000234420 ENSGT00390000003420.a.b #22 ENSGT01030000234559.a.b Tasmanian devil MODERN SPECIES 3 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ENSDNOG00000037553 SUCLA2 (ENSDNOG00000016140) ENSDNOG00000037163 HTR2A (ENSDNOG00000008954) Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000156600 ENSGT00940000158429 #10 ENSGT00950000183128.B #9 ENSGT00550000074897 ENSGT00390000018077 ENSGT00940000159735 #11 ENSGT00940000157634 #14 ENSGT00940000156273 #15 ENSGT00940000155917 ENSGT00390000005307 #16 ENSGT00940000157311 #17 ENSGT00390000008565.b #18 ENSGT00730000111176 ENSGT00940000160043 #19 ENSGT00940000156826 #21 ENSGT00390000003420.a.b #22 ENSGT01030000234559.a.b ENSGT00940000163189 ENSGT00940000162964 ENSGT00940000158252 ENSGT00940000156348.C ENSGT00940000159078 ENSGT00940000161169 ENSGT00940000163788 ENSGT00940000153229.B ENSGT00390000002634.b ENSGT00940000153231.B ENSGT01100000263525.a.b.b ENSGT00390000003298 ENSGT00390000012891 ENSGT00390000007688 Tenrec MODERN SPECIES 3403 GIPC2 (ENSETEG00000003271) #22 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000156600 ENSGT00940000158429 #10 ENSGT00950000183128.B #9 ENSGT00550000074897 ENSGT00390000018077 ENSGT00940000159735 #11 ENSGT00940000157634 #14 ENSGT00940000156273 #15 ENSGT00940000155917 ENSGT00390000005307 #16 ENSGT00940000157311 #17 ENSGT00390000008565.b #18 ENSGT00730000111176 ENSGT00940000160043 #19 ENSGT00940000156826 #21 ENSGT00390000003420.a.b #22 ENSGT01030000234559.a.b ENSGT00940000163189 ENSGT00940000162964 ENSGT00940000158252 ENSGT00940000156348.C ENSGT00940000159078 ENSGT00940000161169 ENSGT00940000163788 ENSGT00940000153229.B ENSGT00390000002634.b ENSGT00940000153231.B ENSGT01100000263525.a.b.b ENSGT00390000003298 ENSGT00390000012891 ENSGT00390000007688 Hyrax MODERN SPECIES 2793 ENSPCAG00000004365 #22 Elephant MODERN SPECIES 145 SLC44A5 (ENSLAFG00000015047) ACADM (ENSLAFG00000003112) #10 RABGGTB (ENSLAFG00000003111) #9 MSH4 (ENSLAFG00000015327) ASB17 (ENSLAFG00000015332) ENSLAFG00000003495 #11 ST6GALNAC5 (ENSLAFG00000001461) #14 PIGK (ENSLAFG00000021632) #15 AK5 (ENSLAFG00000011392) ZZZ3 (ENSLAFG00000011398) #16 USP33 (ENSLAFG00000016986) #17 MIGA1 (ENSLAFG00000003262) #18 NEXN (ENSLAFG00000003267) FUBP1 (ENSLAFG00000003273) #19 DNAJB4 (ENSLAFG00000021392) #21 GIPC2 (ENSLAFG00000004720) #22 PTGFR (ENSLAFG00000005183) IFI44L (ENSLAFG00000018293) IFI44 (ENSLAFG00000015093) ADGRL4 (ENSLAFG00000014692) ENSLAFG00000022545 ADGRL2 (ENSLAFG00000013215) TTLL7 (ENSLAFG00000022500) PRKACB (ENSLAFG00000006544) ENSLAFG00000031962 ENSLAFG00000026431 DNASE2B (ENSLAFG00000031438) RPF1 (ENSLAFG00000007031) ENSLAFG00000007034 SPATA1 (ENSLAFG00000013256) CTBS (ENSLAFG00000011739) Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183128.B #9 ENSGT00550000074897 ENSGT00390000018077 ENSGT00940000159735 #11 ENSGT00940000157634 #14 ENSGT00910000147361 ENSGT00940000156273 #15 ENSGT00940000155917 ENSGT00390000005307 #16 ENSGT00940000157311 #17 ENSGT00390000008565.b #18 ENSGT00730000111176 ENSGT00940000160043 #19 ENSGT00940000156826 #21 ENSGT00950000185225 ENSGT00390000003420.a.b #22 ENSGT01030000234559.a.b ENSGT00940000163189 ENSGT00940000162964 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SPECIES 12 ENSGT00940000158429 #10 ENSGT00950000183128.B #9 ENSGT00550000074897 ENSGT00390000018077 ENSGT00940000159735 #11 ENSGT00940000157634 #14 ENSGT00940000156273 #15 ENSGT00940000155917 ENSGT00390000005307 #16 ENSGT00940000157311 #17 ENSGT00390000008565.b #18 ENSGT00730000111176 ENSGT00940000160043 #19 ENSGT00940000156826 #21 ENSGT00950000185225 ENSGT00390000003420.a.b #22 ENSGT01030000234559.a.b ENSGT00940000163189 ENSGT00940000162964 ENSGT00940000158252 ENSGT00910000147767 ENSGT00940000156348.C ENSGT00940000159078 ENSGT00940000161169 ENSGT00940000163788 ENSGT00530000063936.b ENSGT00940000153229.B ENSGT00390000002634.b ENSGT00940000153231.B.w ENSGT01100000263525.a.b.b.c.b ENSGT00390000003298 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 52 Lhx8 (ENSJJAG00000018516) Slc44a5 (ENSJJAG00000003214) Acadm (ENSJJAG00000015548) #10 Rabggtb (ENSJJAG00000022754) #9 Msh4 (ENSJJAG00000020666) Asb17 (ENSJJAG00000004726) St6galnac3 (ENSJJAG00000001065) #11 St6galnac5 (ENSJJAG00000017065) #14 Pigk 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ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000158429 #10 ENSGT00950000183128.B #9 ENSGT00550000074897 ENSGT00390000018077 ENSGT00940000159735 #11 ENSGT00940000157634 #14 ENSGT00940000156273 #15 ENSGT00940000155917 ENSGT00390000005307 #16 ENSGT00940000157311 #17 ENSGT00390000008565.b #18 ENSGT00730000111176 ENSGT00940000160043 #19 ENSGT00940000156826 #21 ENSGT00950000185225 ENSGT00390000003420.a.b #22 ENSGT01030000234559.a.b ENSGT00940000163189 ENSGT00940000162964 ENSGT00940000158252 ENSGT00940000156348.C ENSGT00940000159078 ENSGT00940000161169 ENSGT00940000163788 ENSGT00530000063936.b ENSGT00940000153229.B ENSGT00390000002634.b ENSGT00940000153231.B.w ENSGT01100000263525.a.b.b.c.b ENSGT00390000003298 ENSGT00390000012891 spretus MODERN SPECIES 12 Slc44a5 (MGP_SPRETEiJ_G0026706) MGP_SPRETEiJ_G0026705 #10 Rabggtb (MGP_SPRETEiJ_G0026704) #9 Msh4 (MGP_SPRETEiJ_G0026703) Asb17 (MGP_SPRETEiJ_G0026702) St6galnac3 (MGP_SPRETEiJ_G0026701) #11 St6galnac5 (MGP_SPRETEiJ_G0026700) #14 Pigk (MGP_SPRETEiJ_G0026699) #15 Ak5 (MGP_SPRETEiJ_G0026698) Zzz3 (MGP_SPRETEiJ_G0026697) #16 Usp33 (MGP_SPRETEiJ_G0026696) #17 Miga1 (MGP_SPRETEiJ_G0026695) #18 Nexn (MGP_SPRETEiJ_G0026694) Fubp1 (MGP_SPRETEiJ_G0026693) #19 MGP_SPRETEiJ_G0026692 Gipc2 (MGP_SPRETEiJ_G0026691) #22 Ptgfr (MGP_SPRETEiJ_G0026690) Ifi44l (MGP_SPRETEiJ_G0026689) Ifi44 (MGP_SPRETEiJ_G0026688) Adgrl4 (MGP_SPRETEiJ_G0026687) Adgrl2 (MGP_SPRETEiJ_G0026686) Ttll7 (MGP_SPRETEiJ_G0026685) Prkacb (MGP_SPRETEiJ_G0026684) Samd13 (MGP_SPRETEiJ_G0026683) 4930503B20Rik (MGP_SPRETEiJ_G0026682) Dnase2b (MGP_SPRETEiJ_G0026681) Uox (MGP_SPRETEiJ_G0026680) Rpf1 (MGP_SPRETEiJ_G0026679) MGP_SPRETEiJ_G0026678 Spata1 (MGP_SPRETEiJ_G0026677) Ctbs (MGP_SPRETEiJ_G0026676) Steppe mouse MODERN SPECIES 2102 Miga1 (ENSMSIG00000023995) #18 Nexn (ENSMSIG00000024045) Fubp1 (ENSMSIG00000024180) #19 Dnajb4 (ENSMSIG00000024374) #21 ENSMSIG00000024386 Gipc2 (ENSMSIG00000024388) #22 Ryukyu mouse MODERN SPECIES 12 Slc44a5 (MGP_CAROLIEiJ_G0025753) Acadm (MGP_CAROLIEiJ_G0025752) #10 Rabggtb (MGP_CAROLIEiJ_G0025751) #9 Msh4 (MGP_CAROLIEiJ_G0025750) Asb17 (MGP_CAROLIEiJ_G0025749) St6galnac3 (MGP_CAROLIEiJ_G0025748) #11 St6galnac5 (MGP_CAROLIEiJ_G0025747) #14 MGP_CAROLIEiJ_G0025746 #15 Ak5 (MGP_CAROLIEiJ_G0025745) Zzz3 (MGP_CAROLIEiJ_G0025744) #16 Usp33 (MGP_CAROLIEiJ_G0025743) #17 Miga1 (MGP_CAROLIEiJ_G0025742) #18 Nexn (MGP_CAROLIEiJ_G0025741) Fubp1 (MGP_CAROLIEiJ_G0025740) #19 Dnajb4 (MGP_CAROLIEiJ_G0025739) #21 Gipc2 (MGP_CAROLIEiJ_G0025738) #22 Ptgfr (MGP_CAROLIEiJ_G0025737) Ifi44l (MGP_CAROLIEiJ_G0025736) Ifi44 (MGP_CAROLIEiJ_G0025735) Adgrl4 (MGP_CAROLIEiJ_G0025734) Adgrl2 (MGP_CAROLIEiJ_G0025733) Ttll7 (MGP_CAROLIEiJ_G0025732) Prkacb (MGP_CAROLIEiJ_G0025731) Samd13 (MGP_CAROLIEiJ_G0025730) 4930503B20Rik (MGP_CAROLIEiJ_G0025729) Dnase2b (MGP_CAROLIEiJ_G0025728) Uox (MGP_CAROLIEiJ_G0025727) Rpf1 (MGP_CAROLIEiJ_G0025726) MGP_CAROLIEiJ_G0025725 Spata1 (MGP_CAROLIEiJ_G0025724) Ctbs (MGP_CAROLIEiJ_G0025723) Shrew mouse MODERN SPECIES 17 Slc44a5 (MGP_PahariEiJ_G0027204) Acadm (MGP_PahariEiJ_G0027203) #10 Rabggtb (MGP_PahariEiJ_G0027202) #9 Msh4 (MGP_PahariEiJ_G0027201) Asb17 (MGP_PahariEiJ_G0027200) St6galnac3 (MGP_PahariEiJ_G0027199) #11 St6galnac5 (MGP_PahariEiJ_G0027198) #14 Pigk (MGP_PahariEiJ_G0027197) #15 Ak5 (MGP_PahariEiJ_G0027196) Zzz3 (MGP_PahariEiJ_G0027195) #16 Usp33 (MGP_PahariEiJ_G0027194) #17 Miga1 (MGP_PahariEiJ_G0027193) #18 Nexn (MGP_PahariEiJ_G0027192) Fubp1 (MGP_PahariEiJ_G0027191) #19 Dnajb4 (MGP_PahariEiJ_G0027190) #21 Gipc2 (MGP_PahariEiJ_G0027189) #22 Ptgfr (MGP_PahariEiJ_G0027188) Ifi44l (MGP_PahariEiJ_G0027187) Ifi44 (MGP_PahariEiJ_G0027186) Adgrl4 (MGP_PahariEiJ_G0027185) Adgrl2 (MGP_PahariEiJ_G0027184) Ttll7 (MGP_PahariEiJ_G0027183) Prkacb (MGP_PahariEiJ_G0027182) Samd13 (MGP_PahariEiJ_G0027181) 4930503B20Rik (MGP_PahariEiJ_G0027180) Dnase2b (MGP_PahariEiJ_G0027179) Uox (MGP_PahariEiJ_G0027178) MGP_PahariEiJ_G0027177 MGP_PahariEiJ_G0027176 Spata1 (MGP_PahariEiJ_G0027175) Ctbs (MGP_PahariEiJ_G0027174) Rat MODERN SPECIES 11 Slc44a5 (ENSRNOG00000042332) Acadm (ENSRNOG00000009845) #10 Rabggtb (ENSRNOG00000009992) #9 Msh4 (ENSRNOG00000010431) Asb17 (ENSRNOG00000048832) St6galnac3 (ENSRNOG00000056894) #11 St6galnac5 (ENSRNOG00000049676) #14 Pigk (ENSRNOG00000042359) #15 Ak5 (ENSRNOG00000046947) Zzz3 (ENSRNOG00000050321) #16 Usp33 (ENSRNOG00000011294) #17 Miga1 (ENSRNOG00000056332) #18 Nexn (ENSRNOG00000012512) Fubp1 (ENSRNOG00000043370) #19 Dnajb4 (ENSRNOG00000013011) #21 Gipc2 (ENSRNOG00000042152) #22 Ptgfr (ENSRNOG00000046468) Ifi44l (ENSRNOG00000049994) Ifi44 (ENSRNOG00000022218) Adgrl4 (ENSRNOG00000033940) AABR07013776.1 (ENSRNOG00000048082) ENSRNOG00000067115 Adgrl2 (ENSRNOG00000063253) Adgrl2 (ENSRNOG00000065347) Ttll7 (ENSRNOG00000031997) Prkacb (ENSRNOG00000004978) Samd13 (ENSRNOG00000016432) Dnase2b (ENSRNOG00000016262) Uox (ENSRNOG00000016339) Rpf1 (ENSRNOG00000015969) ENSRNOG00000068715 Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1449 Acadm 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ENSGT00940000159078 ENSGT00940000161169 ENSGT00940000163788 ENSGT00530000063936.b ENSGT00910000147804 ENSGT00940000153229.B ENSGT00390000002634.b ENSGT00940000153231.B.w ENSGT01100000263525.a.b.b.c.b Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183128.B #9 ENSGT00550000074897 ENSGT00390000018077 ENSGT00940000159735 #11 ENSGT00910000147361 ENSGT00940000157634 #14 ENSGT00940000156273 #15 ENSGT00940000155917 ENSGT00390000005307 #16 ENSGT00940000157311 #17 ENSGT00390000008565.b #18 ENSGT00730000111176 ENSGT00940000160043 #19 ENSGT00940000156826 #21 ENSGT00950000185225 ENSGT00390000003420.a.b #22 ENSGT01030000234559.a.b ENSGT00940000163189 ENSGT00910000147246 ENSGT00940000162964 ENSGT00940000158252 ENSGT00940000156348.C ENSGT00940000159078 ENSGT00940000161169 ENSGT00530000063936.b ENSGT00910000147804 ENSGT00940000153229.B ENSGT00390000002634.b ENSGT00940000153231.B.w ENSGT01100000263525.a.b.b.c.a ENSGT00390000003298 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183128.B #9 ENSGT00550000074897 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Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000183128.B #9 ENSGT00550000074897 ENSGT00390000018077 ENSGT00940000159735 #11 ENSGT00910000147361 ENSGT00940000157634 #14 ENSGT00940000156273 #15 ENSGT00940000155917 ENSGT00390000005307 #16 ENSGT00940000157311 #17 ENSGT00390000008565.b #18 ENSGT00940000167496 ENSGT00730000111176 ENSGT00940000160043 #19 ENSGT00940000156826 #21 ENSGT00390000003420.a.b #22 ENSGT01030000234559.a.b ENSGT00940000158252 ENSGT00940000156348.C ENSGT00940000159078 ENSGT00940000161169 ENSGT00940000163788 ENSGT00530000063936.b ENSGT00940000153229.B ENSGT00390000002634.b ENSGT00940000153231.B.w ENSGT01100000263525.a.b.b.c.b ENSGT00390000003298 ENSGT00390000012891 ENSGT00390000007688 ENSGT01050000244941.B.d Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000183128.B #9 ENSGT00550000074897 ENSGT00390000018077 ENSGT00940000159735 #11 ENSGT00910000147361 ENSGT00940000157634 #14 ENSGT00940000156273 #15 ENSGT00940000155917 ENSGT00390000005307 #16 ENSGT00940000157311 #17 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ENSGT00940000162964 ENSGT00940000158252 ENSGT00940000156348.C ENSGT00940000159078 ENSGT00940000161169 ENSGT00530000063936.b ENSGT00940000153229.B ENSGT00390000002634.b ENSGT00940000153231.B.w ENSGT01100000263525.a.b.b.c.b ENSGT00390000003298 ENSGT00390000012891 ENSGT00390000007688 Olive baboon MODERN SPECIES ENSPANG00000050680 ST6GALNAC3 (ENSPANG00000020337) #11 ENSPANG00000045108 ENSPANG00000049325 ST6GALNAC5 (ENSPANG00000035428) #14 ENSPANG00000032143 PIGK (ENSPANG00000010054) #15 AK5 (ENSPANG00000017674) ENSPANG00000041316 ZZZ3 (ENSPANG00000005101) #16 USP33 (ENSPANG00000018416) #17 MIGA1 (ENSPANG00000022967) #18 ENSPANG00000016164 FUBP1 (ENSPANG00000004797) #19 DNAJB4 (ENSPANG00000014124) #21 GIPC2 (ENSPANG00000006389) #22 PTGFR (ENSPANG00000007569) IFI44L (ENSPANG00000009471) IFI44 (ENSPANG00000006003) ADGRL4 (ENSPANG00000006130) ADGRL2 (ENSPANG00000007567) TTLL7 (ENSPANG00000015224) ENSPANG00000046699 PRKACB (ENSPANG00000001346) SAMD13 (ENSPANG00000001347) ENSPANG00000011777 ENSPANG00000047198 DNASE2B (ENSPANG00000016899) RPF1 (ENSPANG00000010052) GNG5 (ENSPANG00000031198) SPATA1 (ENSPANG00000010807) Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00550000074897 ENSGT00390000018077 ENSGT00940000159735 #11 ENSGT00950000183113.a.b.p ENSGT00910000147361 ENSGT00940000157634 #14 ENSGT00940000156273 #15 ENSGT00940000155917 ENSGT00390000005307 #16 ENSGT00940000157311 #17 ENSGT00390000008565.b #18 ENSGT00730000111176 ENSGT00940000160043 #19 ENSGT00940000156826 #21 ENSGT00390000000970.b.t.a ENSGT00390000003420.a.b #22 ENSGT01030000234559.a.b ENSGT00940000163189 ENSGT00940000162964 ENSGT00940000158252 ENSGT00940000153241.A.k.a.b ENSGT00910000148845 ENSGT00940000156348.C ENSGT01050000245180.a.d ENSGT00910000147474 ENSGT00940000159078 ENSGT00940000161169 ENSGT00530000063936.b ENSGT00940000153229.B ENSGT00390000002634.b ENSGT00940000153231.B.w Sooty mangabey MODERN SPECIES 238 ASB17 (ENSCATG00000033818) ST6GALNAC3 (ENSCATG00000032996) #11 ENSCATG00000040985 ENSCATG00000032492 ST6GALNAC5 (ENSCATG00000030623) #14 PIGK (ENSCATG00000035025) #15 AK5 (ENSCATG00000032005) ZZZ3 (ENSCATG00000044640) #16 USP33 (ENSCATG00000043367) #17 ENSCATG00000031727 MIGA1 (ENSCATG00000040301) #18 NEXN (ENSCATG00000044536) FUBP1 (ENSCATG00000042126) #19 DNAJB4 (ENSCATG00000031058) #21 ENSCATG00000039650 GIPC2 (ENSCATG00000038384) #22 PTGFR (ENSCATG00000037227) IFI44L (ENSCATG00000030541) IFI44 (ENSCATG00000020674) ENSCATG00000031313 ADGRL4 (ENSCATG00000041347) ENSCATG00000041086 HELT (ENSCATG00000038980) Drill MODERN SPECIES 1235 ENSMLEG00000008825 ZZZ3 (ENSMLEG00000038008) #16 USP33 (ENSMLEG00000040903) #17 MIGA1 (ENSMLEG00000041339) #18 NEXN (ENSMLEG00000042491) ENSMLEG00000032973 DNAJB4 (ENSMLEG00000042129) #21 GIPC2 (ENSMLEG00000035777) #22 ENSMLEG00000034101 PTGFR (ENSMLEG00000031242) ENSMLEG00000023136 IFI44L (ENSMLEG00000025798) IFI44 (ENSMLEG00000043176) Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183128.B #9 ENSGT00550000074897 ENSGT00390000018077 ENSGT00940000159735 #11 ENSGT00950000183113.a.b.p ENSGT00940000157634 #14 ENSGT00940000156273 #15 ENSGT00940000155917 ENSGT00390000005307 #16 ENSGT00940000157311 #17 ENSGT00390000008565.b #18 ENSGT00940000167496 ENSGT00730000111176 ENSGT00940000160043 #19 ENSGT00940000156826 #21 ENSGT00390000003420.a.b #22 ENSGT00390000000970.b.t.a ENSGT01030000234559.a.b ENSGT00940000163189 ENSGT00910000147246 ENSGT00940000162964 ENSGT00940000158252 ENSGT00940000153241.A.k.a.b.a ENSGT00940000155196.q.b.b ENSGT00910000148845 ENSGT00940000156348.C ENSGT01050000245180.a.d ENSGT00910000147474 ENSGT00940000159078 ENSGT00940000161169 ENSGT00530000063936.b Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 582 ACADM (ENSMNEG00000041060) #10 RABGGTB (ENSMNEG00000035246) #9 MSH4 (ENSMNEG00000044418) ASB17 (ENSMNEG00000037040) ST6GALNAC3 (ENSMNEG00000017236) #11 ST6GALNAC5 (ENSMNEG00000035310) #14 PIGK (ENSMNEG00000042529) #15 AK5 (ENSMNEG00000022141) ZZZ3 (ENSMNEG00000039203) #16 USP33 (ENSMNEG00000034242) #17 MIGA1 (ENSMNEG00000039340) #18 ENSMNEG00000028884 NEXN (ENSMNEG00000040010) FUBP1 (ENSMNEG00000045212) #19 DNAJB4 (ENSMNEG00000032625) #21 GIPC2 (ENSMNEG00000032547) #22 ENSMNEG00000033150 PTGFR (ENSMNEG00000045057) IFI44L (ENSMNEG00000010138) ENSMNEG00000041066 IFI44 (ENSMNEG00000033036) ADGRL4 (ENSMNEG00000035199) ENSMNEG00000042387 ENSMNEG00000032630 ENSMNEG00000001649 ENSMNEG00000025085 ADGRL2 (ENSMNEG00000040134) ENSMNEG00000039866 ENSMNEG00000003918 TTLL7 (ENSMNEG00000040306) PRKACB (ENSMNEG00000039211) Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183128.B #9 ENSGT00550000074897 ENSGT00390000018077 ENSGT00940000159735 #11 ENSGT00950000183113.a.b.p ENSGT00940000157634 #14 ENSGT00940000156273 #15 ENSGT00940000155917 ENSGT00390000005307 #16 ENSGT00940000157311 #17 ENSGT00390000008565.b #18 ENSGT00940000164709.a.b.b.a.a.b.a.a.a.a.a.a.b ENSGT00730000111176 ENSGT00940000160043 #19 ENSGT00940000156826 #21 ENSGT00390000003420.a.b #22 ENSGT01030000234559.a.b ENSGT00940000163189 ENSGT00940000162964 ENSGT00940000158252 ENSGT00940000153241.A.k.a.b.a ENSGT00940000156348.C ENSGT01050000245180.a.d ENSGT00940000159078 ENSGT00940000161169 ENSGT00530000063936.b ENSGT00940000153229.B ENSGT00390000002634.b ENSGT00940000153231.B.w ENSGT01100000263525.a.b.b.c.b ENSGT00390000003298 Crab-eating macaque MODERN SPECIES MSH4 (ENSMFAG00000038806) ASB17 (ENSMFAG00000044899) ENSMFAG00000060954 ST6GALNAC3 (ENSMFAG00000038282) #11 ENSMFAG00000039614 ST6GALNAC5 (ENSMFAG00000041884) #14 PIGK (ENSMFAG00000033601) #15 AK5 (ENSMFAG00000043368) ZZZ3 (ENSMFAG00000043408) #16 USP33 (ENSMFAG00000046123) #17 MIGA1 (ENSMFAG00000042126) #18 ENSMFAG00000060505 NEXN (ENSMFAG00000002199) FUBP1 (ENSMFAG00000031825) #19 DNAJB4 (ENSMFAG00000039494) #21 GIPC2 (ENSMFAG00000059582) #22 PTGFR (ENSMFAG00000041229) IFI44L (ENSMFAG00000035946) IFI44 (ENSMFAG00000037846) ADGRL4 (ENSMFAG00000032806) ENSMFAG00000007031 ADGRL2 (ENSMFAG00000035421) ENSMFAG00000043283 TTLL7 (ENSMFAG00000042407) PRKACB (ENSMFAG00000044118) SAMD13 (ENSMFAG00000058168) ENSMFAG00000000740 DNASE2B (ENSMFAG00000039951) RPF1 (ENSMFAG00000003788) GNG5 (ENSMFAG00000002373) SPATA1 (ENSMFAG00000038889) Rhesus MODERN SPECIES ASB17 (ENSMMUG00000018695) ST6GALNAC3 (ENSMMUG00000005990) #11 ENSMMUG00000047939 ST6GALNAC5 (ENSMMUG00000005994) #14 PIGK (ENSMMUG00000020217) #15 ENSMMUG00000020200 ENSMMUG00000053069 AK5 (ENSMMUG00000020218) ZZZ3 (ENSMMUG00000063855) #16 USP33 (ENSMMUG00000018326) #17 MIGA1 (ENSMMUG00000011987) #18 ENSMMUG00000062662 NEXN (ENSMMUG00000010352) FUBP1 (ENSMMUG00000002899) #19 DNAJB4 (ENSMMUG00000050425) #21 GIPC2 (ENSMMUG00000049326) #22 PTGFR (ENSMMUG00000010594) IFI44L (ENSMMUG00000001569) IFI44 (ENSMMUG00000002350) ADGRL4 (ENSMMUG00000023345) ENSMMUG00000018263 ENSMMUG00000060674 ADGRL2 (ENSMMUG00000002516) ENSMMUG00000057772 ENSMMUG00000057763 TTLL7 (ENSMMUG00000016591) PRKACB (ENSMMUG00000003457) SAMD13 (ENSMMUG00000000402) UOX (ENSMMUG00000000404) DNASE2B (ENSMMUG00000000406) GNG5 (ENSMMUG00000022182) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 363 ENSGT00950000183113.a.b.p ENSGT00910000147361 ENSGT00940000157634 #14 ENSGT00940000156273 #15 ENSGT00940000155917 ENSGT00390000005307 #16 ENSGT00940000157311 #17 ENSGT00940000167496 ENSGT00390000008565.b #18 ENSGT00730000111176 ENSGT00940000160043 #19 ENSGT00940000156826 #21 ENSGT00390000000970.b.q ENSGT00390000003420.a.b #22 ENSGT01030000234559.a.b Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 633 ENSRBIG00000041515 #21 ENSRBIG00000020134 GIPC2 (ENSRBIG00000029174) #22 PTGFR (ENSRBIG00000006942) IFI44 (ENSRBIG00000005429) ENSRBIG00000034515 IFI44L (ENSRBIG00000028526) Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2235 ENSRROG00000045374 ZZZ3 (ENSRROG00000037949) #16 USP33 (ENSRROG00000011982) #17 ENSRROG00000037383 MIGA1 (ENSRROG00000035901) #18 NEXN (ENSRROG00000039278) FUBP1 (ENSRROG00000043534) #19 DNAJB4 (ENSRROG00000041610) #21 ENSRROG00000039598 GIPC2 (ENSRROG00000033704) #22 PTGFR (ENSRROG00000031592) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158429 #10 ENSGT00950000183128.B #9 ENSGT00550000074897 ENSGT00390000018077 ENSGT00940000159735 #11 ENSGT00940000157634 #14 ENSGT00940000156273 #15 ENSGT00940000155917 ENSGT00940000154296.jb.b.a.b #23 ENSGT00390000005307 #16 ENSGT00940000157311 #17 ENSGT00390000008565.b #18 ENSGT00730000111176 ENSGT00940000160043 #19 ENSGT00940000156826 #21 ENSGT00390000003420.a.b #22 ENSGT01030000234559.a.b ENSGT00940000163189 ENSGT00940000162964 ENSGT00940000158252 ENSGT00390000001347.wb ENSGT00910000146844 ENSGT00940000156348.C ENSGT00940000159078 ENSGT00530000064086.j ENSGT00940000161169 ENSGT00530000063936.b ENSGT00910000147804 ENSGT00940000153229.B ENSGT00390000002634.b ENSGT00940000153231.B.w Cebidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000158429 #10 ENSGT00950000183128.B #9 ENSGT00550000074897 ENSGT00390000018077 ENSGT00940000159735 #11 ENSGT00940000157634 #14 ENSGT00940000156273 #15 ENSGT00940000155917 ENSGT00940000154296.jb.b.a.b #23 ENSGT00390000005307 #16 ENSGT00940000157311 #17 ENSGT00390000008565.b #18 ENSGT00730000111176 ENSGT00940000160043 #19 ENSGT00940000156826 #21 ENSGT00390000003420.a.b #22 ENSGT01030000234559.a.b ENSGT00940000163189 ENSGT00940000162964 ENSGT00940000158252 ENSGT00390000001347.wb ENSGT00910000146844 ENSGT00940000156348.C ENSGT00940000159078 ENSGT00530000064086.j ENSGT00940000161169 ENSGT00530000063936.b ENSGT00910000147804 ENSGT00940000153229.B ENSGT00390000002634.b ENSGT00940000153231.B.w Marmoset MODERN SPECIES 19 ACADM (ENSCJAG00000006692) #10 MSH4 (ENSCJAG00000006791) ASB17 (ENSCJAG00000006817) ST6GALNAC3 (ENSCJAG00000006823) #11 ENSCJAG00000087327 ST6GALNAC5 (ENSCJAG00000081117) #14 PIGK (ENSCJAG00000048297) #15 ENSCJAG00000084117 AK5 (ENSCJAG00000006856) ENSCJAG00000054142 #23 ZZZ3 (ENSCJAG00000006894) #16 USP33 (ENSCJAG00000006932) #17 NEXN (ENSCJAG00000006981) FUBP1 (ENSCJAG00000007062) #19 DNAJB4 (ENSCJAG00000045975) #21 GIPC2 (ENSCJAG00000059871) #22 ENSCJAG00000023449 PTGFR (ENSCJAG00000007162) ADGRL4 (ENSCJAG00000007171) ENSCJAG00000084751 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monkey MODERN SPECIES 45 RABGGTB (ENSSBOG00000030418) #9 MSH4 (ENSSBOG00000020272) ASB17 (ENSSBOG00000036206) ENSSBOG00000033796 ST6GALNAC3 (ENSSBOG00000034145) #11 ST6GALNAC5 (ENSSBOG00000031638) #14 PIGK (ENSSBOG00000028435) #15 ENSSBOG00000031945 #23 AK5 (ENSSBOG00000031653) ENSSBOG00000022561 #16 USP33 (ENSSBOG00000022851) #17 MIGA1 (ENSSBOG00000023052) #18 NEXN (ENSSBOG00000032826) FUBP1 (ENSSBOG00000027299) #19 DNAJB4 (ENSSBOG00000029922) #21 GIPC2 (ENSSBOG00000026116) #22 PTGFR (ENSSBOG00000023342) IFI44L (ENSSBOG00000005268) IFI44 (ENSSBOG00000027429) ADGRL4 (ENSSBOG00000023665) ENSSBOG00000021965 ENSSBOG00000035750 ADGRL2 (ENSSBOG00000032564) TTLL7 (ENSSBOG00000022154) PRKACB (ENSSBOG00000032735) ENSSBOG00000026089 SAMD13 (ENSSBOG00000035540) ENSSBOG00000023319 DNASE2B (ENSSBOG00000036044) ENSSBOG00000029709 RPF1 (ENSSBOG00000020439) Capuchin MODERN SPECIES 3 ENSCCAG00000018853 ENSCCAG00000027183 ST6GALNAC5 (ENSCCAG00000022527) #14 PIGK (ENSCCAG00000033215) #15 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ENSANAG00000036937 DNAJB4 (ENSANAG00000038333) #21 GIPC2 (ENSANAG00000002242) #22 PTGFR (ENSANAG00000032906) IFI44L (ENSANAG00000025193) IFI44 (ENSANAG00000037840) ADGRL4 (ENSANAG00000033541) ENSANAG00000026461 ENSANAG00000014411 ENSANAG00000032415 ENSANAG00000026509 ADGRL2 (ENSANAG00000036995) TTLL7 (ENSANAG00000024884) PRKACB (ENSANAG00000024480) ENSANAG00000020653 SAMD13 (ENSANAG00000035857) ENSANAG00000033696 ENSANAG00000025747 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183128.B #9 ENSGT00550000074897 ENSGT00390000018077 ENSGT00940000159735 #11 ENSGT00940000157634 #14 ENSGT00910000147361 ENSGT00940000156273 #15 ENSGT00940000155917 ENSGT00390000005307 #16 ENSGT00940000157311 #17 ENSGT00390000008565.b.b #18 ENSGT00730000111176 ENSGT00940000160043 #19 ENSGT00940000156826 #21 ENSGT00950000185225 ENSGT00390000003420.a.b #22 ENSGT01030000234559.a.b ENSGT00940000163189 ENSGT00940000162964 ENSGT00940000158252 ENSGT00910000147767 ENSGT00940000156348.C ENSGT01030000235287 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ENSGT00910000147804 ENSGT00940000163788 ENSGT00940000153229.B ENSGT00390000002634.b Camelidae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00550000074897 ENSGT00390000018077 ENSGT00940000159735 #11 ENSGT00940000157634 #14 ENSGT00940000156273 #15 ENSGT00940000155917 ENSGT00390000005307 #16 ENSGT00940000157311 #17 ENSGT00390000008565.b.b #18 ENSGT00730000111176 ENSGT00940000163693 ENSGT00940000156051 ENSGT00940000162419 ENSGT00940000160043 #19 ENSGT00940000156826 #21 ENSGT00390000003420.a.b #22 ENSGT01030000234559.a.b ENSGT00940000163189 ENSGT00940000162964 ENSGT00940000158252 ENSGT00940000156348.C ENSGT00940000159078 ENSGT00940000161169 ENSGT00530000063936.b ENSGT00910000147804 ENSGT00940000153229.B ENSGT00390000002634.b ENSGT00940000153231.B ENSGT01100000263525.a.b.b.c.b ENSGT01100000263525.a.b.b.d ENSGT00390000003298 Alpaca MODERN SPECIES 678 ENSVPAG00000010860 #22 Arabian camel MODERN SPECIES 4 ACADM (ENSCDRG00005011717) #10 RABGGTB (ENSCDRG00005012036) #9 MSH4 (ENSCDRG00005012261) ASB17 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ENSGT00390000008565.b.b #18 ENSGT00730000111176 ENSGT00940000160043 #19 ENSGT00940000156826 #21 ENSGT00950000185225 ENSGT00390000003420.a.b #22 ENSGT01030000234559.a.b ENSGT00940000163189 ENSGT00940000162964 ENSGT00940000158252 ENSGT00910000147767 ENSGT00940000156348.C ENSGT01030000235287 ENSGT00940000159078 ENSGT00940000161169 ENSGT00940000163788 ENSGT00530000063936.b ENSGT00910000147804 ENSGT00940000153229.B ENSGT00390000002634.b ENSGT00940000153231.B Pecora ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000158429 #10 ENSGT00950000183128.B #9 ENSGT00550000074897 ENSGT00390000018077 ENSGT00940000159735 #11 ENSGT00940000157634 #14 ENSGT00940000156273 #15 ENSGT00940000155917 ENSGT00390000005307 #16 ENSGT00940000157311 #17 ENSGT00390000008565.b.b #18 ENSGT00730000111176 ENSGT00940000160043 #19 ENSGT00940000156826 #21 ENSGT00950000185225 ENSGT00390000003420.a.b #22 ENSGT01030000234559.a.b ENSGT00940000163189 ENSGT00940000162964 ENSGT00940000158252 ENSGT00390000015470.m.a ENSGT00940000156348.C 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ENSCHYG00000024821 Percora_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000158429 #10 ENSGT00950000183128.B #9 ENSGT00550000074897 ENSGT00390000018077 ENSGT00940000159735 #11 ENSGT00940000157634 #14 ENSGT00940000156273 #15 ENSGT00940000155917 ENSGT00390000005307 #16 ENSGT00940000157311 #17 ENSGT00390000008565.b.b #18 ENSGT00730000111176 ENSGT00940000160043 #19 ENSGT00940000156826 #21 ENSGT00950000185225 ENSGT00390000003420.a.b #22 ENSGT01030000234559.a.b ENSGT00940000163189 ENSGT00940000162964 ENSGT00940000158252 ENSGT00390000015470.m.a ENSGT00940000156348.C ENSGT00940000159078 ENSGT00940000161169 ENSGT00940000163788 ENSGT00530000063936.b ENSGT00910000147804 ENSGT00940000153229.B ENSGT00390000002634.b ENSGT00940000153231.B ENSGT01100000263525.a.b.b.c.b Siberian musk deer MODERN SPECIES 339 SLC44A5 (ENSMMSG00000012388) ACADM (ENSMMSG00000012146) #10 RABGGTB (ENSMMSG00000012035) #9 MSH4 (ENSMMSG00000011952) ASB17 (ENSMMSG00000011928) ST6GALNAC3 (ENSMMSG00000011892) #11 ST6GALNAC5 (ENSMMSG00000011878) 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ENSGT00940000153229.B ENSGT00390000002634.b ENSGT00940000153231.B Goat MODERN SPECIES 22 ENSCHIG00000001515 ENSCHIG00000012888 #10 ENSCHIG00000013246 #9 MSH4 (ENSCHIG00000026340) ASB17 (ENSCHIG00000001766) ENSCHIG00000001204 #11 ST6GALNAC5 (ENSCHIG00000016530) #14 PIGK (ENSCHIG00000002739) #15 AK5 (ENSCHIG00000025470) ZZZ3 (ENSCHIG00000016803) #16 ENSCHIG00000016989 #17 MIGA1 (ENSCHIG00000009076) #18 NEXN (ENSCHIG00000016598) ENSCHIG00000013418 DNAJB4 (ENSCHIG00000015815) #21 GIPC2 (ENSCHIG00000023418) #22 PTGFR (ENSCHIG00000012516) IFI44L (ENSCHIG00000018536) IFI44 (ENSCHIG00000012676) ADGRL4 (ENSCHIG00000020032) ENSCHIG00000011439 ENSCHIG00000001046 ADGRL2 (ENSCHIG00000018750) TTLL7 (ENSCHIG00000017102) PRKACB (ENSCHIG00000024391) ENSCHIG00000014514 ENSCHIG00000025541 DNASE2B (ENSCHIG00000018531) ENSCHIG00000012566 GNG5 (ENSCHIG00000016183) SPATA1 (ENSCHIG00000004028) Rambouillet Sheep MODERN SPECIES LHX8 (ENSOARG00020015425) SLC44A5 (ENSOARG00020015606) ENSOARG00020016546 RABGGTB 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#17 ENSGT00390000008565.b.b #18 ENSGT00730000111176 ENSGT00940000160043 #19 ENSGT00940000156826 #21 ENSGT00950000185225 ENSGT00390000003420.a.b #22 ENSGT00390000016972.a.b.a.a ENSGT01030000234559.a.b ENSGT00940000163189 ENSGT00940000162964 ENSGT00940000158252 ENSGT00390000015470.m.a ENSGT00910000147767 ENSGT00940000156348.C ENSGT00940000159078 ENSGT00940000161169 ENSGT00940000163788 ENSGT00530000063936.b ENSGT00910000147804 ENSGT00940000153229.B ENSGT00390000002634.b American bison MODERN SPECIES 3296 ENSBBBG00000002226 #9 MSH4 (ENSBBBG00000002231) ASB17 (ENSBBBG00000011953) ST6GALNAC3 (ENSBBBG00000002234) #11 ST6GALNAC5 (ENSBBBG00000011963) #14 PIGK (ENSBBBG00000002238) #15 ENSBBBG00000011981 AK5 (ENSBBBG00000011995) ZZZ3 (ENSBBBG00000012017) #16 USP33 (ENSBBBG00000012079) #17 MIGA1 (ENSBBBG00000012185) #18 NEXN (ENSBBBG00000012212) FUBP1 (ENSBBBG00000012252) #19 DNAJB4 (ENSBBBG00000012260) #21 GIPC2 (ENSBBBG00000012262) #22 ENSBBBG00000008283 PTGFR (ENSBBBG00000012278) IFI44L (ENSBBBG00000006936) IFI44 (ENSBBBG00000001932) ADGRL4 (ENSBBBG00000012299) ENSBBBG00000012301 ENSBBBG00000012310 ENSBBBG00000012317 ENSBBBG00000012318 ADGRL2 (ENSBBBG00000012915) Bos DUPLICATION Bos DUPLICATION Bos ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000155079.b.yb.b ENSGT00940000160425 ENSGT00390000001134.a.a ENSGT00390000005954 ENSGT00390000013790 ENSGT00530000063106.C ENSGT00390000015293 ENSGT00940000156711 ENSGT00940000158108 ENSGT01100000263481.n.a.b.a.a.a.b.b.a.a.b.b.b.a.b.a ENSGT00940000158486 ENSGT00390000018369 ENSGT00940000154925.j ENSGT00950000183159.b ENSGT00940000161074.a ENSGT00390000003420.a.b.v.a #22 ENSGT00390000015700.a ENSGT00390000010065 ENSGT00940000159395 ENSGT00940000155756 ENSGT00530000063872.B ENSGT00390000017860.a.b ENSGT01100000263512.a.a.a.b ENSGT00940000162154 ENSGT00390000013512 ENSGT00510000046929.a ENSGT00390000012721.b ENSGT00950000183055.a.a ENSGT00950000183183.b.b.n ENSGT00950000183375 ENSGT00940000153362.a.cb.a.b.b Bos_b ANCESTRAL SPECIES 33 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(ENSCHAG00000025317) FUT9 (ENSCHAG00000025166) Denticle herring MODERN SPECIES 17 btr02 (ENSDCDG00000009685) cldnk (ENSDCDG00000009694) hgs (ENSDCDG00000009752) ENSDCDG00000009816 mrpl12 (ENSDCDG00000009828) SLC25A10 (ENSDCDG00000009850) ENSDCDG00000009888 ENSDCDG00000009892 tubb4bl (ENSDCDG00000009901) crb3a (ENSDCDG00000009917) asf1ba (ENSDCDG00000009922) prkacaa (ENSDCDG00000009970) ENSDCDG00000014885 TECR (ENSDCDG00000014892) dnajb1a (ENSDCDG00000015033) gipc1 (ENSDCDG00000015035) ##22 ENSDCDG00000015038 ENSDCDG00000015039 ENSDCDG00000015041 ENSDCDG00000015044 ENSDCDG00000015047 ENSDCDG00000015136 qtrt1 (ENSDCDG00000017457) dnm2a (ENSDCDG00000017561) tmed1a (ENSDCDG00000018258) tnfsf14 (ENSDCDG00000018314) ppap2d (ENSDCDG00000018320) ADGRL1 (ENSDCDG00000018528) ENSDCDG00000026351 ENSDCDG00000026353 ptger1c (ENSDCDG00000026357) Otophysi ANCESTRAL SPECIES 66 ENSGT00940000166596 ENSGT00940000164791.a.a ENSGT00940000158297 ENSGT00390000010750.b ENSGT00390000000190 ENSGT00940000156783.l 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ENSGT00940000164566.b ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT00970000193390.c.b.b.b.a ENSGT00940000166524 ENSGT00940000166551.d ENSGT00530000063679.B ENSGT00940000155764.A.a ENSGT00940000158445.f ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a.f.d ENSGT01030000237053 ENSGT00940000164486.f ENSGT00940000175509 ENSGT00940000159684 ENSGT00940000155095.i.b.a ENSGT00390000005730.b ENSGT00390000017103 ENSGT00530000063870.a.a.n Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000166596 ENSGT00940000164791.a.a ENSGT00940000158297 ENSGT00390000010750.b ENSGT00390000000190 ENSGT00940000156783.l ENSGT00940000165036.a ENSGT00970000193390.c.b.b.a ENSGT00940000154394.b.a.a.b.a.a.b ENSGT00950000183101.a.b.b.b ENSGT00390000004692.d.a.n ENSGT00940000163111.a.a ENSGT00530000063936.a.b ENSGT00950000182886.a.a.b.t ENSGT00940000164566.b ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT00970000193390.c.b.b.b.a ENSGT00940000166524 ENSGT00940000166551.d ENSGT00530000063679.B ENSGT00940000155764.A.a ENSGT00940000158445.f 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(ENSAMXG00000000289) Electric eel MODERN SPECIES 600 ENSEEEG00000013827 hgs (ENSEEEG00000013851) mrpl12 (ENSEEEG00000014709) SLC25A10 (ENSEEEG00000014710) ENSEEEG00000014711 ENSEEEG00000014714 ENSEEEG00000014716 ENSEEEG00000014735 crb3a (ENSEEEG00000014737) asf1ba (ENSEEEG00000014739) ENSEEEG00000014757 ENSEEEG00000015296 ENSEEEG00000015297 TECR (ENSEEEG00000015298) dnajb1a (ENSEEEG00000015299) gipc1 (ENSEEEG00000015301) ##22 Channel catfish MODERN SPECIES 16 ENSIPUG00000007290 btr02 (ENSIPUG00000007245) CLDN6 (ENSIPUG00000007299) hgs (ENSIPUG00000007313) Mrpl12 (ENSIPUG00000007392) gcgr (ENSIPUG00000007429) ENSIPUG00000007472 ENSIPUG00000007491 ENSIPUG00000007521 asf1ba (ENSIPUG00000007531) prkacaa (ENSIPUG00000007588) ENSIPUG00000007676 TECR (ENSIPUG00000007700) ENSIPUG00000007744 dnajb1a (ENSIPUG00000007751) Gipc1 (ENSIPUG00000007766) ##22 ENSIPUG00000007784 ENSIPUG00000007843 qtrt1 (ENSIPUG00000008090) dnm2 (ENSIPUG00000008156) tnfsf14 (ENSIPUG00000008253) ENSIPUG00000008258 ppap2d (ENSIPUG00000008277) ENSIPUG00000008294 ENSIPUG00000008312 ADGRL1 (ENSIPUG00000008335) ENSIPUG00000008391 FUT9 (ENSIPUG00000008419) fn3krp (ENSIPUG00000008472) TBCD (ENSIPUG00000008518) znf750 (ENSIPUG00000008767) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00940000164791.a.a ENSGT00940000158297 ENSGT00390000010750.b ENSGT00390000000190 ENSGT00940000156783.l ENSGT00940000165036.a ENSGT00970000193390.c.b.b.a ENSGT00940000154394.b.a.a.b.a.a.b ENSGT00940000154394.b.a.b ENSGT00980000199397 ENSGT00390000004692.d.a.n ENSGT00940000163111.a.a ENSGT00940000162952.d.a ENSGT00950000182886.a.a.b.t ENSGT00940000164566.b ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT00970000193390.c.b.b.b.a ENSGT00940000166524.d ENSGT00940000166524.c ENSGT00940000166551.d ENSGT00530000063679.B ENSGT00940000155764.A.a ENSGT00940000158445.f ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a.f.d ENSGT00970000194260 ENSGT00940000164486.f ENSGT00940000159684 ENSGT00940000175509 ENSGT00390000005730.b ENSGT00390000017103 ENSGT00530000063870.a.a.n Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 194 ENSGT00940000159039.a.c.b ENSGT00950000182983.A.a.a.a.e ENSGT01030000234586.B.a.a.b.d ENSGT00940000166596.i ENSGT00940000164791.a.a.b ENSGT00940000158297.k ENSGT00940000156783.l ENSGT00940000165036.a.a ENSGT00970000193390.c.b.b.a.f.b ENSGT00940000154394.b.a.a.b.a.a.b ENSGT00390000004692.d.a.n.e ENSGT00940000163111.a.a.d ENSGT00940000162952.d.a.b ENSGT00950000182886.a.a.b.t.a ENSGT00940000164566.b.b ENSGT00390000003420.a.a.c ##22 ENSGT00970000193390.c.b.b.b.a.cb.b ENSGT00940000166524.d.b ENSGT00940000166524.c.b ENSGT00940000166551.d.a ENSGT00530000063679.B.e.a ENSGT00940000155764.A.a.c ENSGT00940000158445.f.b ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a.f.d.a ENSGT00970000194260.f ENSGT00940000164486.f.a ENSGT00940000159684.p.b ENSGT00390000017103.h ENSGT00530000063870.a.a.n.b ENSGT00390000001390.a.a.a.a ENSGT00390000003582.d.a Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00950000182983.A.a.a.a.e ENSGT01030000234586.B.a.a.b.d ENSGT00940000166596.i ENSGT00940000164791.a.a.b ENSGT00940000158297.k ENSGT00390000000190.p ENSGT00940000156783.l ENSGT00940000165036.a.a ENSGT00970000193390.c.b.b.a.f.b ENSGT00940000154394.b.a.a.b.a.a.b ENSGT00390000004692.d.a.n.e ENSGT00940000163111.a.a.d ENSGT00940000162952.d.a.b ENSGT00950000182886.a.a.b.t.a ENSGT00940000164566.b.b ENSGT00390000003420.a.a.c ##22 ENSGT00970000193390.c.b.b.b.a.cb.b ENSGT00940000166524.d.b ENSGT00940000166524.c.a.a ENSGT00940000166524.c.b ENSGT00940000166551.d.a ENSGT00530000063679.B.e.a ENSGT00940000155764.A.a.c ENSGT00940000158445.f.b ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a.f.d.a ENSGT00970000194260.f ENSGT00940000164486.f.a ENSGT00940000159684.p.b ENSGT00390000017103.h ENSGT00530000063870.a.a.n.b ENSGT00390000001390.a.a.a.a Golden-line barbel MODERN SPECIES 332 ENSSGRG00000029568 ENSSGRG00000029569 btr02 (ENSSGRG00000029570) cldnk (ENSSGRG00000029571) hgs (ENSSGRG00000029592) SLC25A10 (ENSSGRG00000030040) ENSSGRG00000030041 ENSSGRG00000030043 ENSSGRG00000030044 crb3a (ENSSGRG00000030045) asf1ba 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Salmoninae_a DUPLICATION Salmoninae_a DUPLICATION Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 589 ENSGT00940000164566.b.c.a ENSGT00390000003420.a.a.h.a ##22 Salmo ANCESTRAL SPECIES 221 ENSGT00390000001488.o ENSGT00940000154394.b.a.a.b.a.b.c.b.b.b ENSGT00940000154394.b.a.a.b.a.b.c.b.a ENSGT00940000154394.b.a.a.b.a.b.d.a.b ENSGT00940000154394.b.a.b.q ENSGT00980000199397.a.b ENSGT00390000004692.d.a.n.d ENSGT00940000163111.a.a.f ENSGT00530000063936.a.b.c ENSGT00950000182886.a.a.b.t.g ENSGT00940000164566.b.c.a ENSGT00390000003420.a.a.h.a ##22 Atlantic salmon MODERN SPECIES 25 ubtf (ENSSSAG00000038540) atxn7l3a (ENSSSAG00000037421) tmub2 (ENSSSAG00000038052) asb16 (ENSSSAG00000052261) ENSSSAG00000052248 ENSSSAG00000053729 ENSSSAG00000053720 ENSSSAG00000053633 ENSSSAG00000001403 ENSSSAG00000104943 asf1ba (ENSSSAG00000083521) prkacaa (ENSSSAG00000005614) ENSSSAG00000120183 TECR (ENSSSAG00000108803) dnajb1a (ENSSSAG00000049965) gipc1 (ENSSSAG00000049951) ##22 ENSSSAG00000007746 ENSSSAG00000092379 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ENSSTUG00000043696 FUT9 (ENSSTUG00000043705) ENSSTUG00000043716 ptger1c (ENSSTUG00000043742) slc27a1a (ENSSTUG00000043757) Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 176 ENSGT00940000154394.b.a.a.b.a.b.d.a.b ENSGT00940000154394.b.a.b.q ENSGT00980000199397.a.b ENSGT00390000004692.d.a.n.d ENSGT00940000163111.a.a.g ENSGT00530000063936.a.b.a ENSGT00950000182886.a.a.b.t.e.a ENSGT00940000164566.b.d ENSGT00390000003420.a.a.h.a ##22 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 637 ENSGT00940000164566.b.d ENSGT00390000003420.a.a.h.a ##22 Coho salmon MODERN SPECIES 1 asb16 (ENSOKIG00005032194) ENSOKIG00005032219 ENSOKIG00005032227 ENSOKIG00005032232 ASIC2 (ENSOKIG00005032249) RRN3 (ENSOKIG00005032420) ENSOKIG00005032477 ENSOKIG00005032487 ENSOKIG00005032496 crb3a (ENSOKIG00005032512) asf1ba (ENSOKIG00005032519) prkacaa (ENSOKIG00005032568) ENSOKIG00005033077 TECR (ENSOKIG00005033082) dnajb1a (ENSOKIG00005033089) gipc1 (ENSOKIG00005033108) ##22 ENSOKIG00005033134 ENSOKIG00005033155 ENSOKIG00005033192 qtrt1 (ENSOKIG00005033522) dnm2a (ENSOKIG00005033711) tmed1a (ENSOKIG00005033944) tnfsf14 (ENSOKIG00005033955) tnfsf18 (ENSOKIG00005033968) ppap2d (ENSOKIG00005033977) ENSOKIG00005033987 ADGRL1 (ENSOKIG00005034014) FUT9 (ENSOKIG00005034857) ENSOKIG00005034875 ptger1c (ENSOKIG00005034905) slc27a1a (ENSOKIG00005034938) Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00400000022305.g.b ENSGT00940000160773.f.b ENSGT00400000022305.g.a ENSGT00940000154991.a.b ENSGT00940000154991.a.a ENSGT00940000158693.A.f ENSGT00390000001488 ENSGT00940000154394.b.a.a.b.a.b.c.b.b.b ENSGT00940000154394.b.a.a.b.a.b.c.b.a ENSGT00980000199397.a.b ENSGT00390000004692.d.a.n.d ENSGT00940000163111.a.a ENSGT00530000063936.a.b ENSGT00950000182886.a.a.b.t ENSGT00940000164566.b.c.b ENSGT00390000003420.a.a.h.b ##22 ENSGT00970000193390.c.b.b.b.a.u.a ENSGT00940000166524.g ENSGT00940000166551.c.a.b ENSGT00530000063679.B ENSGT00940000155764.A.a.e ENSGT00940000158445.f.c ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a.f ENSGT00970000194260 ENSGT00940000164486.e.a ENSGT00940000175509.b ENSGT00940000159684 ENSGT00940000175509.a ENSGT00940000155095.i.b.a.d ENSGT00940000160578 ENSGT01030000234559.a.a.b.b Salmo ANCESTRAL SPECIES 115 ENSGT00980000199397.a.a ENSGT00390000004692.d.a.n.c ENSGT00940000163111.a.a.e ENSGT00530000063936.a.b.d ENSGT00950000182886.a.a.b.t.h ENSGT00940000164566.b.c.b ENSGT00390000003420.a.a.h.b ##22 ENSGT00970000193390.c.b.b.b.a.u.a ENSGT00940000166524.g ENSGT00970000193390.c.b.b.b.a.u.b ENSGT00940000166524.h ENSGT00940000166551.c.a.a ENSGT00530000063679.B.i ENSGT00940000155764.A.a.e.a ENSGT00940000158445.f.c ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a.f.j ENSGT00970000194260.a ENSGT00940000164486.e.a ENSGT00940000175509.b ENSGT00940000159684.y ENSGT00940000155095.i.b.a.c ENSGT00940000160578.i.a Atlantic salmon MODERN SPECIES 22 tmub2 (ENSSSAG00000092439) asb16 (ENSSSAG00000003381) ENSSSAG00000001752 ENSSSAG00000001986 ENSSSAG00000001964 ENSSSAG00000115856 ENSSSAG00000001933 ENSSSAG00000108890 ENSSSAG00000119563 ENSSSAG00000109863 ENSSSAG00000106784 prkacaa (ENSSSAG00000091909) ENSSSAG00000117051 TECR (ENSSSAG00000100684) dnajb1a (ENSSSAG00000091177) gipc1 (ENSSSAG00000091843) ##22 ENSSSAG00000049938 ENSSSAG00000083999 ENSSSAG00000049922 ENSSSAG00000116863 qtrt1 (ENSSSAG00000049826) dnm2a (ENSSSAG00000000660) tmed1a (ENSSSAG00000098686) tnfsf14 (ENSSSAG00000082171) tnfsf18 (ENSSSAG00000115218) ENSSSAG00000111995 ENSSSAG00000086686 ENSSSAG00000053918 ENSSSAG00000059836 ENSSSAG00000119455 ENSSSAG00000049760 River trout MODERN SPECIES asic2 (ENSSTUG00000000790) trpm4a (ENSSTUG00000000814) RRN3 (ENSSTUG00000000879) ENSSTUG00000001387 ENSSTUG00000001392 ENSSTUG00000001395 ENSSTUG00000001399 ENSSTUG00000001405 crb3a (ENSSTUG00000001408) asf1ba (ENSSTUG00000001414) prkacaa (ENSSTUG00000001450) ENSSTUG00000001644 ENSSTUG00000001651 TECR (ENSSTUG00000001653) dnajb1a (ENSSTUG00000001664) gipc1 (ENSSTUG00000001678) ##22 ENSSTUG00000001685 ENSSTUG00000001692 ENSSTUG00000001773 qtrt1 (ENSSTUG00000002310) dnm2a (ENSSTUG00000002473) tmed1a (ENSSTUG00000002597) tnfsf14 (ENSSTUG00000002609) tnfsf18 (ENSSTUG00000002625) ppap2d (ENSSTUG00000002651) ENSSTUG00000002796 ENSSTUG00000005149 FUT9 (ENSSTUG00000005174) ENSSTUG00000005180 ptger1c (ENSSTUG00000005257) slc27a1a (ENSSTUG00000005503) Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 150 ENSGT00980000199397.a.a ENSGT00390000004692.d.a.n.c ENSGT00940000163111.a.a.h ENSGT00530000063936.a.b.b ENSGT00950000182886.a.a.b.t.f ENSGT00940000164566.b.c.a ENSGT00950000182886.a.a.b.t.e.b ENSGT00940000164566.b.c.b ENSGT00390000003420.a.a.h.b ##22 ENSGT00970000193390.c.b.b.b.a.u.a ENSGT00940000166524.h ENSGT00940000166551.c.a.a Rainbow trout DUPLICATION Rainbow trout MODERN SPECIES 3 ENSOMYG00000075912 ENSOMYG00000071360 ENSOMYG00000009033 ENSOMYG00000009127 ENSOMYG00000009362 ENSOMYG00000009543 ENSOMYG00000058131 ENSOMYG00000072635 ENSOMYG00000066848 crb3a (ENSOMYG00000070256) asf1ba (ENSOMYG00000009640) prkacaa (ENSOMYG00000010010) ENSOMYG00000011261 TECR (ENSOMYG00000011285) dnajb1a (ENSOMYG00000011298) gipc1 (ENSOMYG00000011305) ##22 ENSOMYG00000011321 ENSOMYG00000011331 ENSOMYG00000011373 qtrt1 (ENSOMYG00000011442) dnm2a (ENSOMYG00000011765) tmed1a (ENSOMYG00000017255) light (ENSOMYG00000017259) ppap2d (ENSOMYG00000017283) ENSOMYG00000059385 ENSOMYG00000017339 ENSOMYG00000055898 ENSOMYG00000017599 ENSOMYG00000017632 ptger1c (ENSOMYG00000017665) slc27a1a (ENSOMYG00000017709) Rainbow trout MODERN SPECIES 4 tmub2 (ENSOMYG00000007616) asb16 (ENSOMYG00000007634) ENSOMYG00000007658 ENSOMYG00000065520 ENSOMYG00000007815 ENSOMYG00000008272 ENSOMYG00000008416 ENSOMYG00000017359 ENSOMYG00000065234 ENSOMYG00000077206 asf1ba (ENSOMYG00000008551) prkacaa (ENSOMYG00000009245) ENSOMYG00000010631 TECR (ENSOMYG00000010643) dnajb1a (ENSOMYG00000010659) gipc1 (ENSOMYG00000010678) ##22 ENSOMYG00000010687 ENSOMYG00000010693 ENSOMYG00000010755 qtrt1 (ENSOMYG00000011296) dnm2a (ENSOMYG00000011549) tmed1a (ENSOMYG00000011904) tnfsf14 (ENSOMYG00000011929) ENSOMYG00000061018 ENSOMYG00000050901 ENSOMYG00000063758 ppap2d (ENSOMYG00000011943) ENSOMYG00000011973 ENSOMYG00000048038 ENSOMYG00000012030 ENSOMYG00000012055 Northern pike MODERN SPECIES 10 asb16 (ENSELUG00000022103) ENSELUG00000022131 ENSELUG00000022146 asic2 (ENSELUG00000022180) RRN3 (ENSELUG00000022239) ENSELUG00000022251 ENSELUG00000026953 ENSELUG00000031082 ENSELUG00000022300 ENSELUG00000032997 asf1ba (ENSELUG00000022338) prkacaa (ENSELUG00000022350) ENSELUG00000022357 TECR (ENSELUG00000022407) dnajb1a (ENSELUG00000022433) gipc1 (ENSELUG00000022496) ##22 ENSELUG00000022510 ENSELUG00000022671 qtrt1 (ENSELUG00000022711) dnm2a (ENSELUG00000022776) tmed1a (ENSELUG00000022785) tnfsf14 (ENSELUG00000022789) tnfsf18 (ENSELUG00000022795) ppap2d (ENSELUG00000022841) ENSELUG00000022847 ADGRL1 (ENSELUG00000023073) ENSELUG00000023271 slc27a1a (ENSELUG00000023399) ENSELUG00000023426 si:dkeyp-72e1.6 (ENSELUG00000023435) ENSELUG00000023480 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 2 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(ENSONIG00000001958) ##22 ENSONIG00000001952 ENSONIG00000001946 qtrt1 (ENSONIG00000001945) dnm2a (ENSONIG00000001933) tmed1a (ENSONIG00000001931) tnfsf14 (ENSONIG00000001930) ppap2d (ENSONIG00000001926) ADGRL1 (ENSONIG00000001920) ENSONIG00000001914 ptger1c (ENSONIG00000030932) slc27a1a (ENSONIG00000001905) ENSONIG00000001904 vac14 (ENSONIG00000020939) ENSONIG00000043067 ENSONIG00000037003 Midas cichlid MODERN SPECIES 260 gipc1 (ENSACIG00000017555) ##22 ENSACIG00000017517 ENSACIG00000017473 qtrt1 (ENSACIG00000017448) dnm2a (ENSACIG00000017413) tmed1a (ENSACIG00000017369) tnfsf14 (ENSACIG00000017363) ppap2d (ENSACIG00000017340) ADGRL1 (ENSACIG00000017287) ENSACIG00000017264 ENSACIG00000017234 ptger1c (ENSACIG00000017222) slc27a1a (ENSACIG00000017199) ENSACIG00000017176 vac14 (ENSACIG00000017169) ENSACIG00000017166 Pomacentridae DUPLICATION Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003420.a.a.k ##22 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003420.a.a.k ##22 Clown anemonefish MODERN SPECIES 2791 GIPC1 (ENSAOCG00000021880) ##22 txndc12 (ENSAOCG00000021831) btf3l4 (ENSAOCG00000021792) #23 ENSAOCG00000021770 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00940000164791.a.a ENSGT00940000158297 ENSGT00390000010750.b ENSGT00390000000190 ENSGT00950000183165.b.b.b.b ENSGT00940000156783.l ENSGT00940000165036.a ENSGT00970000193390.c.b.b.a ENSGT00940000154394.b.a.a.b.a.a ENSGT00940000169071 ENSGT00390000004692.d.a.m.a ENSGT00940000163111.a.a ENSGT00530000063936.a.b ENSGT00950000182886.a.a.b.t ENSGT00940000164566.b ENSGT00390000003420.a.a.l ##22 ENSGT00970000193390.c.b.b.b.a ENSGT00940000166551.d ENSGT00530000063679.B ENSGT00940000155764.A.a ENSGT00940000158445.f ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a.f ENSGT00940000164486.e.a ENSGT00940000159684 ENSGT00940000160578 ENSGT01030000234559.a.a.b.b ENSGT00940000159323.a ENSGT01030000234583.a.a.c.a.b.a.b ENSGT00390000008385 ENSGT01100000263491.a.b.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000167469 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000164791.a.a ENSGT00940000158297 ENSGT00390000010750.b ENSGT00390000000190 ENSGT00950000183165.b.b.b.b ENSGT00940000156783.l ENSGT00940000165036.a ENSGT00970000193390.c.b.b.a ENSGT00940000154394.b.a.a.b.a.a ENSGT00940000169071 ENSGT00390000004692.d.a.m.a ENSGT00940000163111.a.a ENSGT00530000063936.a.b ENSGT00950000182886.a.a.b.t ENSGT00940000164566.b ENSGT00390000003420.a.a.l ##22 ENSGT00970000193390.c.b.b.b.a ENSGT00940000166551.d ENSGT00530000063679.B ENSGT00940000155764.A.a ENSGT00940000158445.f ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a.f ENSGT00940000164486.e.a ENSGT00940000159684 ENSGT00940000160578 ENSGT01030000234559.a.a.b.b ENSGT00940000159323.a ENSGT01030000234583.a.a.c.a.b.a.b ENSGT00390000008385 ENSGT01100000263491.a.b.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000167469 Clown anemonefish MODERN SPECIES 1373 cldnk (ENSAOCG00000003826) hgs (ENSAOCG00000003843) zgc:103625 (ENSAOCG00000003856) mrpl12 (ENSAOCG00000003859) ENSAOCG00000003868 SLC25A10 (ENSAOCG00000003897) ENSAOCG00000000106 ENSAOCG00000002743 tubb4bl (ENSAOCG00000003937) ENSAOCG00000000111 asf1bb (ENSAOCG00000003954) prkacaa (ENSAOCG00000003975) ENSAOCG00000003983 TECR (ENSAOCG00000003991) dnajb1a (ENSAOCG00000003998) gipc1 (ENSAOCG00000004000) ##22 ENSAOCG00000004006 ENSAOCG00000004022 ENSAOCG00000000135 qtrt1 (ENSAOCG00000004036) dnm2a (ENSAOCG00000004078) tmed1a (ENSAOCG00000004103) tnfsf14 (ENSAOCG00000004116) ppap2d (ENSAOCG00000004123) ENSAOCG00000004135 ADGRL1 (ENSAOCG00000004222) ENSAOCG00000004252 ptger1c (ENSAOCG00000004263) slc27a1a (ENSAOCG00000004284) ENSAOCG00000004293 vac14 (ENSAOCG00000004299) Bicolor damselfish MODERN SPECIES 1248 ENSSPAG00000001065 ENSSPAG00000001135 tubb4bl (ENSSPAG00000001143) ENSSPAG00000001168 asf1bb (ENSSPAG00000001174) prkacaa (ENSSPAG00000001194) samd1a (ENSSPAG00000001282) TECR (ENSSPAG00000001289) dnajb1a (ENSSPAG00000001355) gipc1 (ENSSPAG00000001371) ##22 ENSSPAG00000001403 ENSSPAG00000001431 ENSSPAG00000001492 qtrt1 (ENSSPAG00000001536) dnm2a (ENSSPAG00000001584) tmed1a (ENSSPAG00000001738) tnfsf14 (ENSSPAG00000001753) Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000166596 ENSGT00940000164791.a.a ENSGT00940000158297 ENSGT00390000010750.b ENSGT00390000000190 ENSGT00940000156783.l ENSGT00940000165036.a ENSGT00970000193390.c.b.b.a ENSGT00940000154394.b.a.a.b.a.a ENSGT00940000169071 ENSGT00390000004692.d.a.m.a ENSGT00940000163111.a.a ENSGT00940000162952.d.a ENSGT00950000182886.a.a.b.t ENSGT00940000164566.b ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT00970000193390.c.b.b.b.a ENSGT00940000166524 ENSGT00940000166551.d ENSGT00530000063679.B ENSGT00940000155764.A.a ENSGT00940000158445.f ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a.f ENSGT00940000178338 ENSGT00940000176155 ENSGT00940000164486.e.a ENSGT00940000177597 ENSGT00940000159684 ENSGT00940000175509 ENSGT00940000160578 ENSGT01030000234559.a.a.b.b Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000167682 ENSGT00940000166596 ENSGT00940000164791.a.a ENSGT00940000158297 ENSGT00390000010750.b ENSGT00390000000190 ENSGT00940000165036.a ENSGT00970000193390.c.b.b.a ENSGT00940000154394.b.a.a.b.a.a ENSGT00940000169071 ENSGT00390000004692.d.a.m.a ENSGT00940000163111.a.a ENSGT00940000162952.d.a ENSGT00950000182886.a.a.b.t ENSGT00940000164566.b ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT00970000193390.c.b.b.b.a ENSGT00940000166524 ENSGT00940000166551.d ENSGT00530000063679.B ENSGT00940000155764.A.a ENSGT00940000158445.f ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a.f ENSGT00940000178338 ENSGT00940000176155 ENSGT00940000164486.e.a ENSGT00940000177597 ENSGT00940000159684 ENSGT00940000175509 ENSGT00940000160578 ENSGT01030000234559.a.a.b.b Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000167682 ENSGT00940000166596 ENSGT00940000164791.a.a ENSGT00940000158297 ENSGT00390000010750.b ENSGT00390000000190 ENSGT00940000165036.a ENSGT00970000193390.c.b.b.a ENSGT00940000154394.b.a.b ENSGT00940000169071 ENSGT00390000004692.d.a.m.a ENSGT00940000163111.a.a ENSGT00530000063936.a.b ENSGT00950000182886.a.a.b.t ENSGT00940000164566.b ENSGT00390000003420.a.a ##22 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ENSGT00940000160578 ENSGT01030000234559.a.a.b.b ENSGT00940000159323.a ENSGT01030000234583.a.a.c.a.b.a.b ENSGT00390000008385 Climbing perch MODERN SPECIES 21 ENSATEG00000023960 btr02 (ENSATEG00000023957) cldnk (ENSATEG00000023956) hgs (ENSATEG00000023951) zgc:103625 (ENSATEG00000023949) mrpl12 (ENSATEG00000023948) ENSATEG00000023942 ENSATEG00000023937 ENSATEG00000030059 ENSATEG00000027441 ENSATEG00000023930 prkacaa (ENSATEG00000028218) ENSATEG00000023916 TECR (ENSATEG00000023911) dnajb1a (ENSATEG00000023907) gipc1 (ENSATEG00000023902) ##22 ENSATEG00000023898 zgc:92161 (ENSATEG00000023900) ENSATEG00000023891 qtrt1 (ENSATEG00000023885) dnm2a (ENSATEG00000023871) tmed1a (ENSATEG00000023858) ENSATEG00000023854 ppap2d (ENSATEG00000023849) ENSATEG00000025749 ENSATEG00000023845 ENSATEG00000023837 ENSATEG00000023826 ENSATEG00000023800 ptger1c (ENSATEG00000023793) slc27a1a (ENSATEG00000023786) Siamese fighting fish MODERN SPECIES 19 btr02 (ENSBSLG00000006600) cldnk (ENSBSLG00000006628) hgs 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ENSGT00530000063679.B ENSGT00940000155764.A.a ENSGT00940000158445.f ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a.f ENSGT00940000178338 ENSGT00940000164486.e.a ENSGT00940000159684 ENSGT00940000175509 ENSGT00940000160578 ENSGT01030000234559.a.a.b.b ENSGT00940000159323.a ENSGT01030000234583.a.a.c.a.b.a.b Barramundi perch MODERN SPECIES 132 ENSLCAG00010026415 ENSLCAG00010026414 cldnk (ENSLCAG00010026413) hgs (ENSLCAG00010026288) mrpl12 (ENSLCAG00010026244) zgc:103625 (ENSLCAG00010026242) ENSLCAG00010026240 ENSLCAG00010026237 tubb4bl (ENSLCAG00010026234) ENSLCAG00010026231 asf1bb (ENSLCAG00010026228) prkacaa (ENSLCAG00010026209) samd1a (ENSLCAG00010026204) TECR (ENSLCAG00010026202) dnajb1a (ENSLCAG00010026200) gipc1 (ENSLCAG00010026197) ##22 ENSLCAG00010026194 ENSLCAG00010026192 zgc:92161 (ENSLCAG00010026191) ENSLCAG00010026032 qtrt1 (ENSLCAG00010025997) tmed1a (ENSLCAG00010025995) dnm2a (ENSLCAG00010025540) tnfsf14 (ENSLCAG00010025208) ppap2d (ENSLCAG00010025203) ADGRL1 (ENSLCAG00010025067) 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hgs (ENSSMAG00000001648) zgc:103625 (ENSSMAG00000001685) mrpl12 (ENSSMAG00000001700) ENSSMAG00000001723 ENSSMAG00000001790 tubb4bl (ENSSMAG00000001809) ENSSMAG00000001826 ENSSMAG00000001833 prkacaa (ENSSMAG00000001856) samd1a (ENSSMAG00000001915) TECR (ENSSMAG00000001938) dnajb1a (ENSSMAG00000001980) gipc1 (ENSSMAG00000001996) ##22 ENSSMAG00000002010 ENSSMAG00000002025 qtrt1 (ENSSMAG00000002142) dnm2a (ENSSMAG00000002198) tmed1a (ENSSMAG00000002319) tnfsf14 (ENSSMAG00000002338) ppap2d (ENSSMAG00000002369) ENSSMAG00000002405 ENSSMAG00000002458 ENSSMAG00000002479 ptger1c (ENSSMAG00000002532) slc27a1a (ENSSMAG00000002560) ENSSMAG00000002583 ENSSMAG00000002595 ENSSMAG00000033691 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000166596 ENSGT00940000164791.a.a ENSGT00940000158297 ENSGT00390000010750.b ENSGT00390000000190 ENSGT00940000156783.l ENSGT00940000165036.a ENSGT00970000193390.c.b.b.a ENSGT00940000154394.b.a.a.b.a.a ENSGT00940000169071 ENSGT00390000004692.d.a.m.a ENSGT00940000163111.a.a 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ENSGT00940000155764.A.a ENSGT00940000158445.f ENSGT00940000164486.e.a ENSGT00940000177597 ENSGT00940000159684 ENSGT00940000160578 ENSGT00940000159323.a ENSGT01030000234583.a.a.c.a.b.a.b ENSGT00390000008385 ENSGT01100000263505.b.b.a.a.a.b.e.a ENSGT01100000263491.a.b.a.a.a.a.a.b Tetraodon MODERN SPECIES 18 rasd2a (ENSTNIG00000010434) rsad1 (ENSTNIG00000010435) btr02 (ENSTNIG00000010436) cldnk (ENSTNIG00000000769) hgs (ENSTNIG00000010437) zgc:103625 (ENSTNIG00000000145) mrpl12 (ENSTNIG00000010438) ENSTNIG00000010439 ENSTNIG00000010440 ENSTNIG00000010441 asf1bb (ENSTNIG00000010442) prkacaa (ENSTNIG00000010443) ENSTNIG00000010444 TECR (ENSTNIG00000010445) dnajb1a (ENSTNIG00000010446) gipc1 (ENSTNIG00000010447) ##22 ENSTNIG00000010448 zgc:92161 (ENSTNIG00000010449) ENSTNIG00000010450 qtrt1 (ENSTNIG00000010451) dnm2a (ENSTNIG00000010452) tmed1a (ENSTNIG00000006194) ppap2d (ENSTNIG00000006193) ENSTNIG00000000755 ENSTNIG00000006192 ENSTNIG00000006191 ENSTNIG00000004114 ENSTNIG00000018545 slc27a1a (ENSTNIG00000018546) ENSTNIG00000018547 vac14 (ENSTNIG00000018548) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000166596 ENSGT00940000164791.a.a ENSGT00940000158297 ENSGT00390000010750.b ENSGT00390000000190 ENSGT00940000156783.l ENSGT00940000165036.a ENSGT00970000193390.c.b.b.a ENSGT00940000154394.b.a.a.b.a.a ENSGT00940000169071 ENSGT00390000004692.d.a.m.a ENSGT00940000163111.a.a ENSGT00940000162952.d.a ENSGT00950000182886.a.a.b.t ENSGT00940000164566.b ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT00970000193390.c.b.b.b.a ENSGT00940000166524 ENSGT00940000166551.d ENSGT00530000063679.B ENSGT00940000155764.A.a ENSGT00940000158445.f ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a.f ENSGT00940000164486.e.a ENSGT00940000175509 ENSGT00940000159684 ENSGT00940000160578 ENSGT01030000234559.a.a.b.b ENSGT00940000159323.a ENSGT01030000234583.a.a.c.a.b.a.b ENSGT00390000008385 Ballan wrasse MODERN SPECIES 154 btr02 (ENSLBEG00000024739) cldnk (ENSLBEG00000024712) hgs (ENSLBEG00000024659) zgc:103625 (ENSLBEG00000024626) 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ENSGT00940000163111.a.a ENSGT00940000162952.d.a ENSGT00950000182886.a.a.b.t ENSGT00940000164566.b ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT00970000193390.c.b.b.b.a ENSGT00940000166524 ENSGT00940000166551.d ENSGT00530000063679.B ENSGT00940000155764.A.a ENSGT00940000158445.f ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a.f ENSGT00940000164486.e.a ENSGT00940000175509 ENSGT00940000159684 ENSGT00940000160578 ENSGT01030000234559.a.a.b.b ENSGT00940000159323.a ENSGT01030000234583.a.a.c.a.b.a.b ENSGT00390000008385 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000166596 ENSGT00940000164791.a.a ENSGT00940000158297 ENSGT00390000010750.b ENSGT00390000000190 ENSGT00940000156783.l ENSGT00940000165036.a ENSGT00970000193390.c.b.b.a ENSGT00940000154394.b.a.a.b.a.a ENSGT00940000169071 ENSGT00390000004692.d.a.m.a ENSGT00940000163111.a.a ENSGT00940000162952.d.a ENSGT00950000182886.a.a.b.t ENSGT00940000164566.b ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT00970000193390.c.b.b.b.a ENSGT00940000166524 ENSGT00940000166551.d ENSGT00530000063679.B ENSGT00940000155764.A.a ENSGT00940000158445.f ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a.f ENSGT00940000164486.e.a ENSGT00940000175509 ENSGT00940000159684 ENSGT00940000160578 ENSGT01030000234559.a.a.b.b ENSGT00940000159323.a ENSGT01030000234583.a.a.c.a.b.a.b ENSGT00390000008385 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000166596 ENSGT00940000164791.a.a ENSGT00940000158297 ENSGT00390000010750.b ENSGT00390000000190 ENSGT00940000156783.l ENSGT00940000165036.a ENSGT00970000193390.c.b.b.a ENSGT00940000154394.b.a.a.b.a.a ENSGT00940000169071 ENSGT00390000004692.d.a.m.a ENSGT00940000163111.a.a ENSGT00530000063936.a.b ENSGT00950000182886.a.a.b.t ENSGT00940000164566.b ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT00970000193390.c.b.b.b.a ENSGT00940000166524 ENSGT00940000166551.d ENSGT00530000063679.B ENSGT00940000155764.A.a ENSGT00940000158445.f ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a.f ENSGT00940000164486.e.a ENSGT00940000175509 ENSGT00940000159684 ENSGT00940000160578 ENSGT01030000234559.a.a.b.b ENSGT00940000159323.a 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ENSGT00940000164791.a.a ENSGT00940000158297 ENSGT00390000010750.b ENSGT00390000000190 ENSGT00940000156783.l ENSGT00940000165036.a ENSGT01030000234583.a.a.c.a.b.a.a ENSGT00940000154394.b.a.a.b.a.a ENSGT00940000169071 ENSGT00390000004692.d.a.m.a ENSGT00940000163111.a.a ENSGT00530000063936.a.b ENSGT00950000182886.a.a.b.t ENSGT00940000164566.b ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT00970000193390.c.b.b.b.a ENSGT00940000166524 ENSGT00940000166551.d ENSGT00530000063679.B ENSGT00940000155764.A.a ENSGT00940000158445.f ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a.f ENSGT00940000164486.e.a ENSGT00940000159684 ENSGT00940000175509 ENSGT00940000160578 ENSGT01030000234559.a.a.b.b ENSGT00940000159323.a ENSGT01030000234583.a.a.c.a.b.a.b ENSGT00390000008385 Large yellow croaker MODERN SPECIES 483 btr02 (ENSLCRG00005011173) cldnk (ENSLCRG00005011171) hgs (ENSLCRG00005009610) zgc:103625 (ENSLCRG00005009605) mrpl12 (ENSLCRG00005009604) SLC25A10 (ENSLCRG00005009589) ENSLCRG00005009584 ENSLCRG00005009582 tubb4bl 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ENSOANG00000001915 SNRPE (ENSOANG00000003101) ENSOANG00000049128 NDUFB7 (ENSOANG00000050858) TECR (ENSOANG00000003868) DNAJB1 (ENSOANG00000042741) GIPC1 (ENSOANG00000003638) ##22 PKN1 (ENSOANG00000007494) PTGER1 (ENSOANG00000015204) ENSOANG00000022449 ADGRL1 (ENSOANG00000014440) ENSOANG00000041175 ASF1B (ENSOANG00000041328) ENSOANG00000006300 ENSOANG00000042058 ENSOANG00000037527 ENSOANG00000002994 ENSOANG00000049909 ENSOANG00000041876 SOX13 (ENSOANG00000014941) ETNK2 (ENSOANG00000015187) REN (ENSOANG00000003299) Theria ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00940000160234 ENSGT00940000155021.n ENSGT00940000162906.c.a ENSGT01100000263561.C ENSGT00940000158035 ENSGT01030000234635.a.a.a.b ENSGT00940000162852.a ENSGT00940000162117 ENSGT00390000003207 ENSGT00940000159972 ENSGT00940000163037 ENSGT00940000163153 ENSGT00390000018759 ENSGT00950000182886.a.a.b ENSGT00940000160312 ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT01030000234559.a.a.b.a ENSGT00940000154990 ENSGT00940000154912 ENSGT00940000160578 ENSGT00940000159684 ENSGT00520000059915 ENSGT00390000004692.d.a ENSGT00940000162186 ENSGT00940000162952 ENSGT00940000163111.a.b.a ENSGT00530000063936.a ENSGT00390000009916 ENSGT00940000154739.A ENSGT00390000009016 ENSGT00700000104610 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a ENSGT00940000154063.C.a.b ENSGT00940000165414 ENSGT00940000160446 ENSGT00950000183047.c.a ENSGT00940000154130.a.a.a ENSGT00940000159125 ENSGT00940000161354 ENSGT00940000162163 ENSGT00940000163334 ENSGT00940000163037 ENSGT00940000163153 ENSGT00390000018759 ENSGT00950000182886.a.a.b ENSGT00940000160312 ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT01030000234559.a.a.b.a ENSGT00940000154990 ENSGT00940000154912 ENSGT00940000160578 ENSGT00940000159684 ENSGT00520000059915 ENSGT00390000004692.d.a ENSGT00940000162186 ENSGT00940000162952 ENSGT00530000063936.a ENSGT00390000009916 ENSGT00940000154739.A ENSGT00390000009016 ENSGT00700000104610 ENSGT00940000154396.b.a Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a ENSGT00940000154063.C.a.b ENSGT00940000165414 ENSGT00940000160446 ENSGT00950000183047.c.a ENSGT00940000154130.a.a.a ENSGT00940000159125 ENSGT00940000161354 ENSGT00940000162163 ENSGT00940000163334 ENSGT00940000163037 ENSGT00940000163153 ENSGT00390000018759 ENSGT00950000182886.a.a.b ENSGT00940000160312 ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT01030000234559.a.a.b.a ENSGT00940000154990 ENSGT00940000154912 ENSGT00940000160578 ENSGT00940000159684 ENSGT00390000004692.d.a ENSGT00940000163111.a.b.a ENSGT00530000063936.a ENSGT00390000009916 ENSGT00940000154739.A ENSGT00390000009016 ENSGT00700000104610 ENSGT00940000154396.b.a ENSGT01050000244879.a.b ENSGT00390000011987 Tasmanian devil MODERN SPECIES ENSSHAG00000003735 GPR108 (ENSSHAG00000003841) TRIP10 (ENSSHAG00000004338) SH2D3A (ENSSHAG00000004505) VAV1 (ENSSHAG00000004661) ENSSHAG00000006305 ENSSHAG00000006472 ENSSHAG00000023408 ENSSHAG00000005806 ENSSHAG00000003996 ENSSHAG00000001861 ENSSHAG00000021297 NDUFB7 (ENSSHAG00000025469) TECR (ENSSHAG00000001027) DNAJB1 (ENSSHAG00000003951) GIPC1 (ENSSHAG00000004295) ##22 PTGER1 (ENSSHAG00000029759) PKN1 (ENSSHAG00000004829) DDX39A (ENSSHAG00000005494) ADGRE5 (ENSSHAG00000005642) ADGRL1 (ENSSHAG00000008368) ASF1B (ENSSHAG00000009083) ENSSHAG00000009246 ENSSHAG00000024156 C19orf67 (ENSSHAG00000027453) ENSSHAG00000023995 ENSSHAG00000009514 ENSSHAG00000009701 ENSSHAG00000025486 RFX1 (ENSSHAG00000009998) DCAF15 (ENSSHAG00000010157) Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000006744 ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a ENSGT00940000154063.C.a.b ENSGT00940000165414 ENSGT00940000160446 ENSGT00950000183047.c.a ENSGT00940000154130.a.a.a ENSGT00940000159125 ENSGT00940000161354 ENSGT00940000162163 ENSGT00940000163037 ENSGT00940000163153 ENSGT00390000018759 ENSGT00950000182886.a.a.b ENSGT00940000160312 ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT01030000234559.a.a.b.a ENSGT00940000154990 ENSGT00940000154912 ENSGT00940000160578 ENSGT00940000159684 ENSGT00390000004692.d.a ENSGT00940000163111.a.b.a ENSGT00530000063936.a ENSGT00390000009916 ENSGT01050000246822 ENSGT00390000009016 ENSGT00700000104610 ENSGT00940000154396.b.a ENSGT01050000244879.a.b ENSGT00390000011987 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000006744 ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a ENSGT00940000154063.C.a.b ENSGT00940000165414 ENSGT00940000160446 ENSGT00950000183047.c.a ENSGT00940000154130.a.a.a ENSGT00940000159125 ENSGT00940000161354 ENSGT00940000162163 ENSGT00940000163037 ENSGT00940000163153 ENSGT00390000018759 ENSGT00950000182886.a.a.b.q ENSGT00940000160312 ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT01030000234559.a.a.b.a ENSGT00940000154990 ENSGT00940000154912 ENSGT00940000160578 ENSGT00940000159684 ENSGT00390000004692.d.a ENSGT00940000163111.a.b.a ENSGT00530000063936.a ENSGT00390000009916 ENSGT01050000246822 ENSGT00390000009016 ENSGT00700000104610 ENSGT00940000154396.b.a ENSGT01050000244879.a.b ENSGT00390000011987 koala MODERN SPECIES 407 ENSPCIG00000013826 ENSPCIG00000013823 ENSPCIG00000029816 ENSPCIG00000029809 NDUFB7 (ENSPCIG00000029804) ENSPCIG00000029799 DNAJB1 (ENSPCIG00000029796) GIPC1 (ENSPCIG00000029795) ##22 PTGER1 (ENSPCIG00000029793) PKN1 (ENSPCIG00000029789) DDX39A (ENSPCIG00000029788) ENSPCIG00000029783 ENSPCIG00000029782 Common wonbat MODERN SPECIES 580 ENSVURG00010024356 ENSVURG00010024351 TNFSF14 (ENSVURG00010024348) C3 (ENSVURG00010024341) ENSVURG00010024336 GPR108 (ENSVURG00010024334) TRIP10 (ENSVURG00010024332) SH2D3A (ENSVURG00010024329) VAV1 (ENSVURG00010024310) ENSVURG00010024303 ENSVURG00010024299 ENSVURG00010024296 ENSVURG00010024295 ENSVURG00010024291 DNAJB1 (ENSVURG00010024288) GIPC1 (ENSVURG00010024287) ##22 PTGER1 (ENSVURG00010024284) PKN1 (ENSVURG00010024275) DDX39A (ENSVURG00010024264) ENSVURG00010024260 ADGRL1 (ENSVURG00010024253) ASF1B (ENSVURG00010024248) ENSVURG00010024240 SAMD1 (ENSVURG00010024236) C19orf67 (ENSVURG00010024230) ENSVURG00010024229 ENSVURG00010024226 ENSVURG00010024222 RLN3 (ENSVURG00010024221) RFX1 (ENSVURG00010024218) DCAF15 (ENSVURG00010024215) Eutheria ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000163037 ENSGT00940000163153 ENSGT00390000018759 ENSGT00950000182886.a.a.b ENSGT00940000160312 ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT01030000234559.a.a.b.a ENSGT00940000154990 ENSGT00940000154912 ENSGT00940000160578 ENSGT00940000159684 ENSGT00520000059915 ENSGT00390000004692.d.a ENSGT00940000162186 ENSGT00940000162952 ENSGT00940000163111.a.b.a ENSGT00530000063936.a ENSGT00390000009916 ENSGT00940000154739.A ENSGT00390000009016 ENSGT00700000104610 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT01030000234635.a.a.a.b ENSGT00940000162852.a ENSGT00940000162117 ENSGT00390000003207 ENSGT00940000159972 ENSGT00940000162084 ENSGT00940000153523 ENSGT00950000183216.d ENSGT00940000162597 ENSGT00940000163161 ENSGT00940000163037 ENSGT00940000163153 ENSGT00390000018759 ENSGT00950000182886.a.a.b ENSGT00940000160312 ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT01030000234559.a.a.b.a ENSGT00940000154990 ENSGT00940000154912 ENSGT00940000160578 ENSGT00940000159684 ENSGT00520000059915 ENSGT00390000004692.d.a ENSGT00940000162186 ENSGT00530000063936.a ENSGT00390000009916 ENSGT00940000154739.A ENSGT00390000009016 ENSGT00700000104610 ENSGT00940000154396.b.a ENSGT01050000244879.a.b Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000159972 ENSGT00950000183216.d.a.a.a.a ENSGT00940000162084 ENSGT00950000183216.d.a.a.a.b ENSGT00940000153523 ENSGT00950000183216.d.a.a.b ENSGT00940000164424 ENSGT00940000162597 ENSGT00940000163161 ENSGT00940000163037 ENSGT00940000163153 ENSGT00940000168162 ENSGT00390000018759 ENSGT00950000182886.a.a.b ENSGT00940000160312 ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT01030000234559.a.a.b.a ENSGT00940000154990 ENSGT00940000154912 ENSGT00940000160578 ENSGT00940000159684 ENSGT00520000059915 ENSGT00390000004692.d.a ENSGT00940000162186 ENSGT00530000063936.a ENSGT00390000009916 ENSGT00940000154739.A ENSGT00390000009016 ENSGT00700000104610 ENSGT00940000154396.b.a ENSGT01050000244879.a.b Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES 1855 ENSGT00940000160312 ENSGT00390000003420.a.a ##22 Common shrew MODERN SPECIES 1681 ENSSARG00000000897 ENSSARG00000000891 ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00950000183216.d.a.a.a.b ENSGT00940000153523.m.a.a.b ENSGT00950000183216.d.a.b.b.b ENSGT00940000153523.m.a.b ENSGT00940000162084 ENSGT00940000153523.m.a.a.a.a.a.b ENSGT00950000183216.d.a.a.b.a.a ENSGT00940000164113 ENSGT00940000162597 ENSGT00940000163161 ENSGT00940000163037 ENSGT00940000163153 ENSGT00390000018759 ENSGT00950000182886.a.a.b ENSGT00940000160312 ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT01030000234559.a.a.b.a ENSGT00940000154990 ENSGT00940000154912 ENSGT00940000160578 ENSGT00940000159684 ENSGT00520000059915 ENSGT00390000004692.d.a ENSGT00940000162186 ENSGT00530000063936.a ENSGT00390000009916 ENSGT00940000154739.A ENSGT00390000009016 ENSGT00700000104610 ENSGT00940000154396.b.a ENSGT01050000244879.a.b Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000162084 ENSGT00950000183216.d.a.a.b.a.a.a.a ENSGT00950000183216.d.a.a.b.a.a.a.b.b ENSGT00950000183216.d.a.a.b.a.a.b.b ENSGT00950000183216.d.a.b.b.a ENSGT00950000183216.d.a.a.b.a.b.a ENSGT00950000183216.d.a.b.b.b ENSGT00940000164113 ENSGT00940000162597.f.a ENSGT00940000163161 ENSGT00940000163037 ENSGT00940000163153 ENSGT00390000018759 ENSGT00950000182886.a.a.b ENSGT00940000160312 ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT01030000234559.a.a.b.a ENSGT00940000154990 ENSGT00940000154912 ENSGT00940000160578 ENSGT00940000159684 ENSGT00520000059915 ENSGT00390000004692.d.a ENSGT00940000162186 ENSGT00530000063936.a ENSGT00390000009916 ENSGT00940000154739.A ENSGT00390000009016 ENSGT00700000104610 ENSGT00940000154396.b.a ENSGT01050000244879.a.b Suina ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000162852.a ENSGT00940000162117 ENSGT00390000003207 ENSGT00940000159972 ENSGT00940000162084.cb.b ENSGT00940000163967.a ENSGT00950000183216.d.a.b.b.a.e ENSGT00950000183216.d.a.a.b.a.b.a ENSGT00950000183216.d.a.b.b.b ENSGT00940000163161 ENSGT00940000163037 ENSGT00940000163153 ENSGT00390000018759 ENSGT00950000182886.a.a.b ENSGT00940000160312 ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT01030000234559.a.a.b.a ENSGT00940000154990 ENSGT00940000154912 ENSGT00940000160578 ENSGT00940000159684 ENSGT00390000004692.d.a ENSGT00940000162186 ENSGT00530000063936.a ENSGT00390000009916 ENSGT00940000154739.A ENSGT00390000009016 ENSGT00700000104610 ENSGT00940000154396.b.a ENSGT01050000244879.a.b ENSGT00390000011987 Pig MODERN SPECIES 10 ENSSSCG00000054799 ENSSSCG00000013788 ENSSSCG00000052059 ENSSSCG00000053632 ENSSSCG00000038517 ENSSSCG00000049285 ENSSSCG00000036342 ENSSSCG00000056006 ENSSSCG00000021675 ZNF333 (ENSSSCG00000013786) ADGRE3 (ENSSSCG00000013787) CLEC17A (ENSSSCG00000013777) NDUFB7 (ENSSSCG00000013778) ENSSSCG00000031299 DNAJB1 (ENSSSCG00000013784) GIPC1 (ENSSSCG00000032842) ##22 PTGER1 (ENSSSCG00000013782) PKN1 (ENSSSCG00000013779) DDX39A (ENSSSCG00000013776) ADGRE5 (ENSSSCG00000013775) ADGRL1 (ENSSSCG00000013773) ASF1B (ENSSSCG00000013772) PRKACA (ENSSSCG00000013771) ENSSSCG00000033298 C19orf67 (ENSSSCG00000013769) ENSSSCG00000013768 PALM3 (ENSSSCG00000013767) IL27RA (ENSSSCG00000013766) RLN3 (ENSSSCG00000013765) ENSSSCG00000045290 RFX1 (ENSSSCG00000013764) Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT01030000234635.a.a.a.b ENSGT00940000162852.a ENSGT00940000162117 ENSGT00390000003207 ENSGT00940000159972 ENSGT00940000164424 ENSGT00950000183216.d.a.a.b.a.b.b.a.a ENSGT00940000162597.f.b ENSGT00940000163161 ENSGT01010000228731 ENSGT00940000163037 ENSGT00940000163153 ENSGT00390000018759 ENSGT00950000182886.a.a.b ENSGT00940000160312 ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT01030000234559.a.a.b.a ENSGT00940000154990 ENSGT00940000154912 ENSGT00940000160578 ENSGT00940000159684 ENSGT00520000059915 ENSGT00390000004692.d.a ENSGT00940000162186 ENSGT00530000063936.a ENSGT00390000009916 ENSGT00940000154739.A ENSGT00390000009016 ENSGT00700000104610 ENSGT00940000154396.b.a ENSGT01050000244879.a.b Cetacea ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00510000047770.c.a ENSGT00940000160389 ENSGT00940000160257 ENSGT00390000005147 ENSGT00940000159680 ENSGT00390000000053 ENSGT00390000016735 ENSGT00940000162597.f.b ENSGT00940000163161 ENSGT01010000228731 ENSGT00940000163037 ENSGT00940000163153 ENSGT00390000018759 ENSGT00950000182886.a.a.b ENSGT00940000160312 ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT01030000234559.a.a.b.a ENSGT00940000154990 ENSGT00940000154912 ENSGT00940000160578 ENSGT00940000159684 ENSGT00520000059915 ENSGT00390000004692.d.a ENSGT00940000162186 ENSGT00940000162952 ENSGT00390000009916 ENSGT00940000154739.A ENSGT00390000009016 ENSGT00700000104610 ENSGT00940000154396.b.a ENSGT01050000244879.a.b Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000153116.C.b ENSGT00510000047770.c.a ENSGT00940000160389 ENSGT00940000160257 ENSGT00390000005147 ENSGT00940000159680 ENSGT00390000000053 ENSGT00390000016735 ENSGT00940000162597.f.b ENSGT00940000163161 ENSGT00940000163037 ENSGT00940000163153 ENSGT00390000018759 ENSGT00950000182886.a.a.b ENSGT00940000160312 ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT01030000234559.a.a.b.a ENSGT00940000154990 ENSGT00940000154912 ENSGT00940000160578 ENSGT00940000159684 ENSGT00520000059915 ENSGT00390000004692.d.a ENSGT00940000162186 ENSGT00940000162952 ENSGT00390000009916 ENSGT00940000154739.A ENSGT00390000009016 ENSGT00700000104610 ENSGT00940000154396.b.a ENSGT01050000244879.a.b Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000153116.C.b ENSGT00510000047770.c.a ENSGT00940000160389 ENSGT00940000160257 ENSGT00390000005147 ENSGT00940000159680 ENSGT00390000000053 ENSGT00390000016735 ENSGT00940000162597.f.b ENSGT00940000163161 ENSGT00940000163037 ENSGT00940000163153 ENSGT00390000018759 ENSGT00950000182886.a.a.b ENSGT00940000160312 ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT01030000234559.a.a.b.a ENSGT00940000154990 ENSGT00940000154912 ENSGT00940000160578 ENSGT00940000159684 ENSGT00520000059915 ENSGT00390000004692.d.a ENSGT00940000162186 ENSGT00940000162952 ENSGT00390000009916 ENSGT00940000154739.A ENSGT00390000009016 ENSGT00700000104610 ENSGT00940000154396.b.a ENSGT01050000244879.a.b Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000153116.C.b ENSGT00510000047770.c.a ENSGT00940000160389 ENSGT00940000160257 ENSGT00390000005147 ENSGT00940000159680 ENSGT00390000000053 ENSGT00390000016735 ENSGT00940000162597.f.b ENSGT00940000163161 ENSGT00940000163037 ENSGT00940000163153 ENSGT00390000018759 ENSGT00950000182886.a.a.b ENSGT00940000160312 ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT01030000234559.a.a.b.a ENSGT00940000154990 ENSGT00940000154912 ENSGT00940000160578 ENSGT00940000159684 ENSGT00520000059915 ENSGT00390000004692.d.a ENSGT00940000162186 ENSGT00940000162952 ENSGT00390000009916 ENSGT00940000154739.A ENSGT00390000009016 ENSGT00700000104610 ENSGT00940000154396.b.a ENSGT01050000244879.a.b Narwhal MODERN SPECIES 298 PRKCSH (ENSMMNG00015003159) ELAVL3 (ENSMMNG00015003200) ZNF653 (ENSMMNG00015003234) ECSIT (ENSMMNG00015003280) CNN1 (ENSMMNG00015003334) ELOF1 (ENSMMNG00015003361) ACP5 (ENSMMNG00015003380) 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(ENSPSNG00000002687) PALM3 (ENSPSNG00000002710) IL27RA (ENSPSNG00000002738) RLN3 (ENSPSNG00000002774) RFX1 (ENSPSNG00000002816) Dolphin MODERN SPECIES 130 ADGRE3 (ENSTTRG00000007950) ENSTTRG00000007948 ENSTTRG00000007947 TECR (ENSTTRG00000007946) DNAJB1 (ENSTTRG00000007944) GIPC1 (ENSTTRG00000007940) ##22 PTGER1 (ENSTTRG00000007938) PKN1 (ENSTTRG00000007934) DDX39A (ENSTTRG00000007931) ADGRE5 (ENSTTRG00000007927) Sperm whale MODERN SPECIES 159 GIPC1 (ENSPCTG00005022556) ##22 PTGER1 (ENSPCTG00005022554) PKN1 (ENSPCTG00005022553) DDX39A (ENSPCTG00005022549) ADGRE5 (ENSPCTG00005022546) Blue whale MODERN SPECIES 14 RGL3 (ENSBMSG00010010241) ODAD3 (ENSBMSG00010010100) PRKCSH (ENSBMSG00010010013) ELAVL3 (ENSBMSG00010009973) ZNF653 (ENSBMSG00010009937) ECSIT (ENSBMSG00010009916) CNN1 (ENSBMSG00010011852) ACP5 (ENSBMSG00010011821) ENSBMSG00010011792 ZNF333 (ENSBMSG00010011781) ADGRE3 (ENSBMSG00010011759) ENSBMSG00010011745 NDUFB7 (ENSBMSG00010011737) TECR (ENSBMSG00010011712) DNAJB1 (ENSBMSG00010011696) GIPC1 (ENSBMSG00010011689) ##22 PTGER1 (ENSBMSG00010011682) PKN1 (ENSBMSG00010011639) DDX39A (ENSBMSG00010011608) ADGRE5 (ENSBMSG00010011593) ENSBMSG00010011582 ADGRL1 (ENSBMSG00010011541) ASF1B (ENSBMSG00010011510) PRKACA (ENSBMSG00010011474) ENSBMSG00010011456 C19orf67 (ENSBMSG00010011438) ENSBMSG00010011429 PALM3 (ENSBMSG00010011405) IL27RA (ENSBMSG00010011379) RLN3 (ENSBMSG00010011363) RFX1 (ENSBMSG00010011328) Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164217.b ENSGT00950000183216.d.a.a.b.a.a.b.b.a.a ENSGT00950000183216.d.a.b.b.a.c.b ENSGT00950000183216.d.a.a.b.a.b.b.a.b ENSGT00950000183216.d.a.b.b.b ENSGT00940000164113 ENSGT00940000162597.f.a ENSGT00940000163161 ENSGT01010000228731 ENSGT00940000163037 ENSGT00940000163153 ENSGT00390000018759 ENSGT00950000182886.a.a.b ENSGT00940000161793.`b.b ENSGT00940000160312 ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT01030000234559.a.a.b.a ENSGT00940000154990 ENSGT00940000154912 ENSGT00940000160578 ENSGT00940000159684 ENSGT00390000004692.d.a ENSGT00940000162186 ENSGT00530000063936.a ENSGT00390000009916 ENSGT00940000154739.A ENSGT00390000009016 ENSGT00700000104610 ENSGT00390000010799.u.b.a.a.b ENSGT00940000154396.b.a ENSGT01050000244879.a.b Yarkand deer MODERN SPECIES 32 ENSCHYG00000005854 ENSCHYG00000005864 ENSCHYG00000005908 ENSCHYG00000005933 ENSCHYG00000005948 ENSCHYG00000005985 ENSCHYG00000006025 ENSCHYG00000006052 ENSCHYG00000006076 ADGRE3 (ENSCHYG00000006098) CLEC17A (ENSCHYG00000006193) NDUFB7 (ENSCHYG00000006236) TECR (ENSCHYG00000006278) DNAJB1 (ENSCHYG00000006441) ENSCHYG00000006485 GIPC1 (ENSCHYG00000006503) ##22 PTGER1 (ENSCHYG00000006535) PKN1 (ENSCHYG00000006584) DDX39A (ENSCHYG00000006844) ADGRE5 (ENSCHYG00000006893) ADGRL1 (ENSCHYG00000007185) ASF1B (ENSCHYG00000007484) PRKACA (ENSCHYG00000007558) ENSCHYG00000007646 C19orf67 (ENSCHYG00000007667) MISP3 (ENSCHYG00000007695) IL27RA (ENSCHYG00000007720) PALM3 (ENSCHYG00000007837) ENSCHYG00000007859 RLN3 (ENSCHYG00000007881) RFX1 (ENSCHYG00000007922) Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183216.d.a.a.b.a.a.a.a ENSGT00950000183216.d.a.a.b.a.a.a.b.a.a.a.b ENSGT00950000183216.d.a.a.b.a.a.b.b.a.a ENSGT00950000183216.d.a.b.b.a.c.b ENSGT00950000183216.d.a.a.b.a.b.b.a.b ENSGT00950000183216.d.a.b.b.b ENSGT00940000164113 ENSGT00940000162597.f.a ENSGT00940000163161 ENSGT00940000163037 ENSGT00940000163153 ENSGT00390000018759 ENSGT00950000182886.a.a.b ENSGT00940000161793.`b.b ENSGT00940000160312 ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT01030000234559.a.a.b.a ENSGT00940000154990 ENSGT00940000154912 ENSGT00940000160578 ENSGT00940000159684 ENSGT00390000004692.d.a ENSGT00940000162186 ENSGT00530000063936.a ENSGT00390000009916 ENSGT00940000154739.A ENSGT00390000009016 ENSGT00700000104610 ENSGT00390000010799.u.b.a.a.b ENSGT00940000154396.b.a ENSGT01050000244879.a.b Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163967.a ENSGT00950000183216.d.a.a.b.a.a.b.b.a.b ENSGT00950000183216.d.a.a.b.a.a.b.b.a.a ENSGT00950000183216.d.a.b.b.a.c.b ENSGT00950000183216.d.a.a.b.a.b.b.a.b ENSGT00950000183216.d.a.b.b.b ENSGT00940000164113 ENSGT00940000162597.f.a ENSGT00940000163161 ENSGT00940000163037 ENSGT00940000163153 ENSGT00390000018759 ENSGT00950000182886.a.a.b ENSGT00940000161793.`b.b ENSGT00940000160312 ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT01030000234559.a.a.b.a ENSGT00940000154990 ENSGT00940000154912 ENSGT00940000160578 ENSGT00940000159684 ENSGT00390000004692.d.a ENSGT00940000162186 ENSGT00530000063936.a ENSGT00390000009916 ENSGT00940000154739.A ENSGT00390000009016 ENSGT00700000104610 ENSGT00390000010799.u.b.a.a.b ENSGT00940000154396.b.a ENSGT01050000244879.a.b Caprinae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000162597.f.a ENSGT00940000163161 ENSGT00940000163037 ENSGT00390000018759 ENSGT00950000182886.a.a.b ENSGT00940000161793.`b.b ENSGT00940000160312 ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT01030000234559.a.a.b.a ENSGT00940000154990 ENSGT00940000154912 ENSGT00940000160578 ENSGT00940000159684 ENSGT00390000004692.d.a.e ENSGT00940000162186 ENSGT00530000063936.a ENSGT00390000009916 ENSGT00940000154739.A ENSGT00390000009016 ENSGT00700000104610 ENSGT00390000010799.u.b.a.a.b ENSGT00940000154396.b.a ENSGT01050000244879.a.b Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 21 ENSOARG00020000301 ENSOARG00020000315 ENSOARG00020000328 ENSOARG00020000355 ENSOARG00020000417 ENSOARG00020000429 ENSOARG00020000434 ENSOARG00020000443 ENSOARG00020000456 ZNF333 (ENSOARG00020000475) ENSOARG00020000495 NDUFB7 (ENSOARG00020000517) TECR (ENSOARG00020000551) ENSOARG00020000617 DNAJB1 (ENSOARG00020000632) GIPC1 (ENSOARG00020000647) ##22 PTGER1 (ENSOARG00020000667) PKN1 (ENSOARG00020000687) DDX39A (ENSOARG00020000763) ADGRE5 (ENSOARG00020000826) ADGRL1 (ENSOARG00020000968) ASF1B (ENSOARG00020001159) PRKACA (ENSOARG00020001194) ENSOARG00020001257 C19orf67 (ENSOARG00020001274) MISP3 (ENSOARG00020001288) PALM3 (ENSOARG00020001298) IL27RA (ENSOARG00020001311) ENSOARG00020001327 RFX1 (ENSOARG00020001351) DCAF15 (ENSOARG00020001424) Bovinae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000183216.d.a.a.b.a.b.a.a.a ENSGT00950000183216.d.a.b.b.b ENSGT00940000164113 ENSGT00940000162597.f.a.f ENSGT00940000162597.f.a.e ENSGT00940000163161 ENSGT00940000163037 ENSGT00940000163153 ENSGT00390000018759 ENSGT00950000182886.a.a.b ENSGT00940000161793.`b.b ENSGT00940000160312 ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT01030000234559.a.a.b.a ENSGT00940000154990 ENSGT00940000154912 ENSGT00940000160578 ENSGT00940000159684 ENSGT00390000004692.d.a ENSGT00940000162186 ENSGT00530000063936.a ENSGT00390000009916 ENSGT00940000154739.A ENSGT00390000009016 ENSGT00700000104610 ENSGT00390000010799.u.b.a.a.b ENSGT00940000154396.b.a ENSGT01050000244879.a.b Bos ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000183216.d.a.a.b.a.b.a.a.a ENSGT00950000183216.d.a.b.b.b ENSGT00940000164113 ENSGT00940000162597.f.a.f.a ENSGT00940000162597.f.a.e ENSGT00940000163161 ENSGT00940000163037 ENSGT00940000163153 ENSGT00390000018759 ENSGT00950000182886.a.a.b ENSGT00940000161793.`b.b ENSGT00940000160312 ENSGT00390000003420.a.a ##22 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(ENSBMUG00000017778) NDUFB7 (ENSBMUG00000017796) TECR (ENSBMUG00000017825) ENSBMUG00000017844 DNAJB1 (ENSBMUG00000017852) GIPC1 (ENSBMUG00000017872) ##22 PKN1 (ENSBMUG00000017913) DDX39A (ENSBMUG00000018158) ADGRE5 (ENSBMUG00000018450) ADGRL1 (ENSBMUG00000018535) ASF1B (ENSBMUG00000018603) PRKACA (ENSBMUG00000018657) ENSBMUG00000018679 C19orf67 (ENSBMUG00000018686) MISP3 (ENSBMUG00000018697) PALM3 (ENSBMUG00000018718) IL27RA (ENSBMUG00000018770) ENSBMUG00000018788 RLN3 (ENSBMUG00000018814) RFX1 (ENSBMUG00000000093) DCAF15 (ENSBMUG00000000150) Domestic yak MODERN SPECIES 27 ENSBGRG00000001334 ENSBGRG00000001325 ENSBGRG00000001319 ENSBGRG00000001311 ENSBGRG00000001294 ENSBGRG00000001285 ENSBGRG00000001282 ENSBGRG00000001274 ZNF333 (ENSBGRG00000001260) ADGRE3 (ENSBGRG00000001242) CLEC17A (ENSBGRG00000001160) NDUFB7 (ENSBGRG00000001125) TECR (ENSBGRG00000001005) ENSBGRG00000000966 ENSBGRG00000000944 GIPC1 (ENSBGRG00000000915) ##22 PTGER1 (ENSBGRG00000000899) DDX39A (ENSBGRG00000000785) ADGRE5 (ENSBGRG00000000526) ADGRL1 (ENSBGRG00000000453) ENSBGRG00000000445 ASF1B (ENSBGRG00000000398) PRKACA (ENSBGRG00000023559) ENSBGRG00000023541 C19orf67 (ENSBGRG00000023503) MISP3 (ENSBGRG00000023479) PALM3 (ENSBGRG00000023457) IL27RA (ENSBGRG00000023291) RLN3 (ENSBGRG00000023271) RFX1 (ENSBGRG00000023159) DCAF15 (ENSBGRG00000023126) Bos_b ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000183216.d.a.a.b.a.b.a.a.a ENSGT00950000183216.d.a.b.b.b ENSGT00940000164113 ENSGT00940000162597.f.a.f.a ENSGT00940000162597.f.a.e ENSGT00940000163161 ENSGT00940000163037 ENSGT00940000163153 ENSGT00390000018759 ENSGT00950000182886.a.a.b ENSGT00940000161793.`b.b ENSGT00940000160312 ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT01030000234559.a.a.b.a ENSGT00940000154990 ENSGT00940000154912 ENSGT00940000160578 ENSGT00940000159684 ENSGT00390000004692.d.a ENSGT00940000162186 ENSGT00530000063936.a ENSGT00390000009916 ENSGT00940000154739.A ENSGT00390000009016 ENSGT00700000104610 ENSGT00940000154396.b.a ENSGT01050000244879.a.b ENSGT00390000011987 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 26 ENSBIXG00005019141 ENSBIXG00005019180 ENSBIXG00005019221 ENSBIXG00005019259 ENSBIXG00005019337 ENSBIXG00005003154 ENSBIXG00005019468 ZNF333 (ENSBIXG00005005523) ADGRE3 (ENSBIXG00005019585) ENSBIXG00005003194 ENSBIXG00005019616 NDUFB7 (ENSBIXG00005003201) TECR (ENSBIXG00005006594) ENSBIXG00005000030 DNAJB1 (ENSBIXG00005003246) GIPC1 (ENSBIXG00005019893) ##22 PTGER1 (ENSBIXG00005005530) PKN1 (ENSBIXG00005019962) DDX39A (ENSBIXG00005020009) ADGRE5 (ENSBIXG00005020089) ADGRL1 (ENSBIXG00005003365) ASF1B (ENSBIXG00005003397) PRKACA (ENSBIXG00005003422) ENSBIXG00005020339 C19orf67 (ENSBIXG00005007724) PALM3 (ENSBIXG00005020377) IL27RA (ENSBIXG00005020455) RLN3 (ENSBIXG00005020471) RFX1 (ENSBIXG00005003471) DCAF15 (ENSBIXG00005003473) PODNL1 (ENSBIXG00005020725) Cow MODERN SPECIES 26 OR7A10B (ENSBTAG00000053515) OR7A91 (ENSBTAG00000050870) OR7A96 (ENSBTAG00000051893) ENSBTAG00000049961 ENSBTAG00000003528 ENSBTAG00000026148 ENSBTAG00000025908 ENSBTAG00000014365 ENSBTAG00000048788 ADGRE3 (ENSBTAG00000002937) ENSBTAG00000053318 NDUFB7 (ENSBTAG00000012634) TECR (ENSBTAG00000012632) ENSBTAG00000048525 DNAJB1 (ENSBTAG00000016874) GIPC1 (ENSBTAG00000000764) ##22 PTGER1 (ENSBTAG00000017041) PKN1 (ENSBTAG00000017037) DDX39A (ENSBTAG00000021820) ADGRE5 (ENSBTAG00000021818) ADGRL1 (ENSBTAG00000003675) ASF1B (ENSBTAG00000004085) PRKACA (ENSBTAG00000006642) C7H19orf67 (ENSBTAG00000016937) MISP3 (ENSBTAG00000016936) PALM3 (ENSBTAG00000046744) IL27RA (ENSBTAG00000016933) RLN3 (ENSBTAG00000038437) RFX1 (ENSBTAG00000008854) DCAF15 (ENSBTAG00000008841) PODNL1 (ENSBTAG00000006073) American bison MODERN SPECIES 3279 ZNF333 (ENSBBBG00000020316) ADGRE3 (ENSBBBG00000020293) ENSBBBG00000005460 TECR (ENSBBBG00000020228) ENSBBBG00000020221 DNAJB1 (ENSBBBG00000020214) GIPC1 (ENSBBBG00000020208) ##22 PTGER1 (ENSBBBG00000020190) PKN1 (ENSBBBG00000020183) DDX39A (ENSBBBG00000005075) ADGRE5 (ENSBBBG00000020124) ADGRL1 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ENSMLUG00000028398 ENSMLUG00000025927 ENSMLUG00000010883 ENSMLUG00000022362 ADGRE3 (ENSMLUG00000010862) CLEC17A (ENSMLUG00000008456) ENSMLUG00000008446 TECR (ENSMLUG00000008415) DNAJB1 (ENSMLUG00000012065) GIPC1 (ENSMLUG00000008387) ##22 PTGER1 (ENSMLUG00000008382) PKN1 (ENSMLUG00000008347) ENSMLUG00000009280 ADGRE5 (ENSMLUG00000009235) ADGRL1 (ENSMLUG00000000503) ASF1B (ENSMLUG00000000537) PRKACA (ENSMLUG00000008255) C19orf67 (ENSMLUG00000024756) MISP3 (ENSMLUG00000017771) PALM3 (ENSMLUG00000013023) IL27RA (ENSMLUG00000013014) RLN3 (ENSMLUG00000013013) RFX1 (ENSMLUG00000013002) DCAF15 (ENSMLUG00000012992) PODNL1 (ENSMLUG00000012982) Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 9 ENSRFEG00010015880 ENSRFEG00010015901 ENSRFEG00010007174 ENSRFEG00010007195 TLL1 (ENSRFEG00010007269) ENSRFEG00010007312 ENSRFEG00010007357 ENSRFEG00010007884 ENSRFEG00010008341 ENSRFEG00010008480 ADGRE3 (ENSRFEG00010008585) CLEC17A (ENSRFEG00010009003) NDUFB7 (ENSRFEG00010009032) TECR (ENSRFEG00010009075) DNAJB1 (ENSRFEG00010009149) GIPC1 (ENSRFEG00010009204) ##22 PTGER1 (ENSRFEG00010009300) PKN1 (ENSRFEG00010009333) DDX39A (ENSRFEG00010009438) ADGRE5 (ENSRFEG00010009510) ADGRL1 (ENSRFEG00010009604) ASF1B (ENSRFEG00010009782) PRKACA (ENSRFEG00010009863) ENSRFEG00010009981 C19orf67 (ENSRFEG00010010158) MISP3 (ENSRFEG00010010210) PALM3 (ENSRFEG00010010244) IL27RA (ENSRFEG00010010284) RLN3 (ENSRFEG00010010382) RFX1 (ENSRFEG00010010442) DCAF15 (ENSRFEG00010010497) Equus ANCESTRAL SPECIES 55 ENSGT00940000162597.h.b.b ENSGT00940000164113.n ENSGT00940000163161 ENSGT00940000163037 ENSGT00940000163153 ENSGT00390000018759 ENSGT00950000182886.a.a.b ENSGT00940000160312 ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT01030000234559.a.a.b.a ENSGT00940000154990 ENSGT00940000154912 ENSGT00940000160578 ENSGT00960000191218 ENSGT00940000159684 ENSGT00520000059915 ENSGT00390000004692.d.a ENSGT00940000162186 ENSGT00530000063936.a ENSGT00390000009916 ENSGT00940000154739.A ENSGT00390000009016 ENSGT00700000104610 ENSGT00940000154396.b.a Donkey MODERN SPECIES 12 ENSEASG00005029787 ENSEASG00005024278 ENSEASG00005036476 ENSEASG00005028200 ENSEASG00005000255 ENSEASG00005012859 ENSEASG00005033242 ENSEASG00005037011 ENSEASG00005029275 ZNF333 (ENSEASG00005024676) ADGRE3 (ENSEASG00005015230) CLEC17A (ENSEASG00005032054) ENSEASG00005015233 TECR (ENSEASG00005015236) DNAJB1 (ENSEASG00005015239) GIPC1 (ENSEASG00005015241) ##22 PTGER1 (ENSEASG00005035659) PKN1 (ENSEASG00005015248) DDX39A (ENSEASG00005015272) ADGRE5 (ENSEASG00005023556) ENSEASG00005015277 ADGRL1 (ENSEASG00005015282) ENSEASG00005015284 ASF1B (ENSEASG00005015285) PRKACA (ENSEASG00005015286) ENSEASG00005015288 C19orf67 (ENSEASG00005015293) MISP3 (ENSEASG00005015296) PALM3 (ENSEASG00005015298) IL27RA (ENSEASG00005015299) RLN3 (ENSEASG00005038338) Carnivora ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT01030000234635.a.a.a.b ENSGT00940000162852.a ENSGT00940000162117 ENSGT00390000003207 ENSGT00940000159972 ENSGT00940000164424 ENSGT00940000153523.m.b ENSGT00950000183216.d.a.a.a.a ENSGT00940000153523.m.a.a.a.b ENSGT00940000163161 ENSGT00940000163037 ENSGT00940000163153 ENSGT00390000018759 ENSGT00950000182886.a.a.b ENSGT00940000160312 ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT01030000234559.a.a.b.a ENSGT00940000154990 ENSGT00940000154912 ENSGT00940000160578 ENSGT00940000159684 ENSGT00520000059915 ENSGT00390000004692.d.a ENSGT00940000162186 ENSGT00530000063936.a ENSGT00390000009916 ENSGT00940000154739.A ENSGT00390000009016 ENSGT00700000104610 ENSGT00940000154396.b.a ENSGT01050000244879.a.b Caniformia ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000158035 ENSGT01030000234635.a.a.a.b ENSGT00940000162852.a ENSGT00940000162117 ENSGT00390000003207 ENSGT00940000159972 ENSGT00940000164424 ENSGT00940000153523.m.b.c.a.a.a ENSGT00940000164217.d.b ENSGT00940000163161 ENSGT00940000163037 ENSGT00940000163153 ENSGT00390000018759 ENSGT00950000182886.a.a.b ENSGT00940000160312 ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT01030000234559.a.a.b.a ENSGT00940000154990 ENSGT00940000154912 ENSGT00940000160578 ENSGT00940000159684 ENSGT00520000059915 ENSGT00390000004692.d.a ENSGT00940000162186 ENSGT00530000063936.a ENSGT00390000009916 ENSGT00940000154739.A ENSGT00390000009016 ENSGT00700000104610 ENSGT00940000154396.b.a ENSGT01050000244879.a.b Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000161134.B ENSGT00940000161134.C ENSGT00940000162597 ENSGT00940000163161 ENSGT00940000163037 ENSGT00940000163153 ENSGT00390000018759 ENSGT00950000182886.a.a.b ENSGT00940000160312 ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT01030000234559.a.a.b.a ENSGT00940000154990 ENSGT00940000154912 ENSGT00940000160578 ENSGT00940000159684 ENSGT00520000059915 ENSGT00390000004692.d.a ENSGT00940000162186 ENSGT00940000162952.b ENSGT00390000009916 ENSGT00940000154739.A ENSGT00390000009016 ENSGT00700000104610 ENSGT00940000154396.b.a ENSGT01050000244879.a.b Ferret MODERN SPECIES 185 ENSMPUG00000002909 ENSMPUG00000018701 ENSMPUG00000018702 ENSMPUG00000002913 ENSMPUG00000002919 ZNF333 (ENSMPUG00000002929) ADGRE3 (ENSMPUG00000002932) ENSMPUG00000002943 TECR (ENSMPUG00000002949) NDUFB7 (ENSMPUG00000002959) ENSMPUG00000018704 DNAJB1 (ENSMPUG00000002977) GIPC1 (ENSMPUG00000002983) ##22 PTGER1 (ENSMPUG00000003008) PKN1 (ENSMPUG00000003038) DDX39A (ENSMPUG00000003051) ADGRE5 (ENSMPUG00000003059) ADGRL1 (ENSMPUG00000003065) ASF1B (ENSMPUG00000003072) PRKACA (ENSMPUG00000003076) ENSMPUG00000003082 C19orf67 (ENSMPUG00000003089) MISP3 (ENSMPUG00000003110) PALM3 (ENSMPUG00000003113) IL27RA (ENSMPUG00000003119) RLN3 (ENSMPUG00000003123) DCAF15 (ENSMPUG00000003126) RFX1 (ENSMPUG00000003132) American black bear MODERN SPECIES 2685 ENSUAMG00000017526 ADGRE3 (ENSUAMG00000017524) ENSUAMG00000017523 NDUFB7 (ENSUAMG00000017522) TECR (ENSUAMG00000017521) DNAJB1 (ENSUAMG00000017520) GIPC1 (ENSUAMG00000017519) ##22 ENSUAMG00000017518 Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153523.m.a.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000164217.d.a.a.b ENSGT00940000153523.m.a.a.a.b.a.a.a ENSGT00950000183216.d.a.a.a.a.e.b ENSGT00940000153523.m.a.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000161134.C ENSGT00940000164113.e ENSGT00940000162597 ENSGT00940000164113.f ENSGT00940000163161 ENSGT00940000163037 ENSGT00940000163153 ENSGT00390000018759 ENSGT00950000182886.a.a.b ENSGT00940000160312 ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT01030000234559.a.a.b.a ENSGT00940000154990 ENSGT00940000154912 ENSGT00940000160578 ENSGT00520000059915 ENSGT00940000159684 ENSGT00390000004692.d.a.d ENSGT00940000162186 ENSGT00530000063936.a ENSGT00390000009916 ENSGT00940000154739.A ENSGT00390000009016 ENSGT00700000104610 ENSGT00940000154396.b.a ENSGT01050000244879.a.b Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000153523.m.a.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000164217.d.a.a.b ENSGT00940000153523.m.a.a.a.b.a.a.a ENSGT00950000183216.d.a.a.a.a.e.b ENSGT00940000153523.m.a.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000161134.C ENSGT00940000164113.e ENSGT00940000162597 ENSGT00940000164113.f.a ENSGT00940000163161 ENSGT00940000163037 ENSGT00940000163153 ENSGT00390000018759 ENSGT00950000182886.a.a.b ENSGT00940000160312 ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT01030000234559.a.a.b.a ENSGT00940000154990 ENSGT00940000154912 ENSGT00940000160578 ENSGT00940000159684 ENSGT00520000059915 ENSGT00390000004692.d.a.d ENSGT00940000162186 ENSGT00530000063936.a ENSGT00390000009916 ENSGT00940000154739.A ENSGT00390000009016 ENSGT00700000104610 ENSGT00940000154396.b.a ENSGT01050000244879.a.b Dog MODERN SPECIES 12 OR7A55 (ENSCAFG00845020018) OR7A60 (ENSCAFG00845020037) ENSCAFG00845020055 ENSCAFG00845020091 ENSCAFG00845020110 ENSCAFG00845020137 OR7A73 (ENSCAFG00845020159) ENSCAFG00845020230 ADGRE2 (ENSCAFG00845020704) ZNF333 (ENSCAFG00845021377) ADGRE3 (ENSCAFG00845021455) CLEC17A (ENSCAFG00845021648) NDUFB7 (ENSCAFG00845021755) TECR (ENSCAFG00845021824) DNAJB1 (ENSCAFG00845022007) GIPC1 (ENSCAFG00845022090) ##22 PKN1 (ENSCAFG00845022295) DDX39A (ENSCAFG00845022719) ADGRE5 (ENSCAFG00845022971) ADGRL1 (ENSCAFG00845023599) ENSCAFG00845024540 ASF1B (ENSCAFG00845024582) PRKACA (ENSCAFG00845024723) 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ENSGT00940000153523.m.a.a.a.a.a.b.a.a.a.b ENSGT00940000153523.m.b.b ENSGT00940000153523.m.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a ENSGT00940000161134.B ENSGT00940000161134.C.c.a.a ENSGT00940000164113.j.a ENSGT00940000164113.j.b ENSGT00940000163161 ENSGT00940000163037 ENSGT00940000163153 ENSGT00390000018759 ENSGT00950000182886.a.a.b ENSGT00940000160312 ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT01030000234559.a.a.b.a ENSGT00940000154990 ENSGT00940000154912 ENSGT00940000160578 ENSGT00940000159684 ENSGT00520000059915 ENSGT00390000004692.d.a ENSGT00940000162186 ENSGT00530000063936.a ENSGT00390000009916 ENSGT00940000154739.A ENSGT00390000009016 ENSGT00700000104610 ENSGT00940000154396.b.a ENSGT01050000244879.a.b Panthera_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153523.m.a.a.b ENSGT00950000183216.d.a.a.a.b ENSGT00940000162084 ENSGT00950000183216.d.a.a.a.a.c ENSGT00950000183216.d.a.b.b.a.a ENSGT00940000163881.h ENSGT00390000009265.a.b ENSGT00940000164113.j.a ENSGT00940000164113.j.b ENSGT00940000163161 ENSGT00940000163037 ENSGT00940000163153 ENSGT00390000018759 ENSGT00950000182886.a.a.b ENSGT00940000160312 ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT01030000234559.a.a.b.a ENSGT00940000154990 ENSGT00940000154912 ENSGT00940000160578 ENSGT00940000159684 ENSGT00520000059915 ENSGT00390000004692.d.a ENSGT00940000162186 ENSGT00530000063936.a ENSGT00390000009916 ENSGT00940000154739.A ENSGT00390000009016 ENSGT00700000104610 ENSGT00940000154396.b.a ENSGT01050000244879.a.b leopard MODERN SPECIES 110 ENSPPRG00000000773 ENSPPRG00000023230 ENSPPRG00000023332 ENSPPRG00000015255 ZNF333 (ENSPPRG00000012398) ADGRE3 (ENSPPRG00000011690) CLEC17A (ENSPPRG00000009530) NDUFB7 (ENSPPRG00000009394) ENSPPRG00000008632 DNAJB1 (ENSPPRG00000008135) GIPC1 (ENSPPRG00000006660) ##22 PTGER1 (ENSPPRG00000006114) PKN1 (ENSPPRG00000005767) DDX39A (ENSPPRG00000003506) ADGRE5 (ENSPPRG00000002663) ADGRL1 (ENSPPRG00000000803) ENSPPRG00000023219 ASF1B (ENSPPRG00000023372) PRKACA (ENSPPRG00000023771) SAMD1 (ENSPPRG00000021562) C19orf67 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ENSPTIG00000013151 ENSPTIG00000013276 ENSPTIG00000013395 ENSPTIG00000013434 ENSPTIG00000014492 ZNF333 (ENSPTIG00000016059) ADGRE3 (ENSPTIG00000016203) CLEC17A (ENSPTIG00000016638) ENSPTIG00000016780 DNAJB1 (ENSPTIG00000016803) GIPC1 (ENSPTIG00000016866) ##22 DDX39A (ENSPTIG00000017287) ADGRE5 (ENSPTIG00000017854) ADGRL1 (ENSPTIG00000018453) ENSPTIG00000020966 ASF1B (ENSPTIG00000021042) PRKACA (ENSPTIG00000021292) C19orf67 (ENSPTIG00000021323) ENSPTIG00000021368 RLN3 (ENSPTIG00000021464) CC2D1A (ENSPTIG00000021588) ENSPTIG00000000031 NANOS3 (ENSPTIG00000000325) ZSWIM4 (ENSPTIG00000001122) C19orf53 (ENSPTIG00000004139) MRI1 (ENSPTIG00000005216) Cat MODERN SPECIES 1 ENSFCAG00000043404 ENSFCAG00000051711 ENSFCAG00000036671 ENSFCAG00000041503 ENSFCAG00000050682 ENSFCAG00000043754 ENSFCAG00000045149 ENSFCAG00000005648 ENSFCAG00000028637 ZNF333 (ENSFCAG00000032193) ADGRE3 (ENSFCAG00000015628) CLEC17A (ENSFCAG00000013497) NDUFB7 (ENSFCAG00000013496) TECR (ENSFCAG00000032565) DNAJB1 (ENSFCAG00000033551) GIPC1 (ENSFCAG00000013495) ##22 PTGER1 (ENSFCAG00000044590) PKN1 (ENSFCAG00000013492) DDX39A (ENSFCAG00000013488) ADGRE5 (ENSFCAG00000013486) ENSFCAG00000035484 ADGRL1 (ENSFCAG00000003727) ASF1B (ENSFCAG00000023314) PRKACA (ENSFCAG00000025137) ENSFCAG00000026810 CA2H19orf67 (ENSFCAG00000009466) MISP3 (ENSFCAG00000040950) IL27RA (ENSFCAG00000003723) PALM3 (ENSFCAG00000041444) RLN3 (ENSFCAG00000027164) RFX1 (ENSFCAG00000003721) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT01030000234635.a.a.a.b ENSGT00940000162852.a ENSGT00940000162117 ENSGT00390000003207 ENSGT00940000159972 ENSGT00940000162084 ENSGT00940000153523 ENSGT00950000183216.d ENSGT00940000162597 ENSGT00940000163161 ENSGT00940000163037 ENSGT00940000163153 ENSGT00390000018759 ENSGT00950000182886.a.a.b ENSGT00940000160312 ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT01030000234559.a.a.b.a ENSGT00940000154990 ENSGT00940000154912 ENSGT00940000160578 ENSGT00940000159684 ENSGT00520000059915 ENSGT00390000004692.d.a ENSGT00940000162186 ENSGT00940000162952 ENSGT00390000009916 ENSGT00940000154739.A ENSGT00390000009016 ENSGT00700000104610 ENSGT00940000154396.b.a ENSGT01050000244879.a.b Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162852.a ENSGT00940000162117 ENSGT00390000003207 ENSGT00940000159972 ENSGT00940000162084 ENSGT00940000153523.i.a.a.a ENSGT00950000183216.d ENSGT00940000153523.i.a.b ENSGT00940000162597 ENSGT00940000163161 ENSGT00940000163037 ENSGT00940000163153 ENSGT00390000018759 ENSGT00950000182886.a.a.b.p ENSGT00940000160312.e ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT01030000234559.a.a.b.a ENSGT00940000154990 ENSGT00940000154912 ENSGT00940000160578 ENSGT00940000159684 ENSGT00390000004692.d.a ENSGT00940000162186 ENSGT00940000162952 ENSGT00390000009916 ENSGT00940000154739.A ENSGT00390000009016 ENSGT00700000104610 ENSGT00940000154396.b.a ENSGT01050000244879.a.b ENSGT00390000011987 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003207 ENSGT00940000159972 ENSGT00940000162084 ENSGT00940000153523.i.a.a.a.a.a ENSGT00940000153523.i.a.a.b ENSGT00940000153523.i.a.a.a.b ENSGT00940000153523.i.a.b ENSGT00940000153523.j ENSGT00940000162597 ENSGT00940000163161 ENSGT00940000163037 ENSGT00940000163153 ENSGT00390000018759 ENSGT00950000182886.a.a.b.o.b ENSGT00940000160312.e ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT01030000234559.a.a.b.a ENSGT00940000154990 ENSGT00940000154912 ENSGT00940000160578 ENSGT00940000159684 ENSGT00390000004692.d.a ENSGT00940000162186 ENSGT00940000162952 ENSGT00390000009916 ENSGT00940000154739.A ENSGT00390000009016 ENSGT00700000104610 ENSGT00940000154396.b.a ENSGT01050000244879.a.b ENSGT00390000011987 Gorilla MODERN SPECIES 10 CCDC105 (ENSGGOG00000006376) SLC1A6 (ENSGGOG00000013450) OR7C2 (ENSGGOG00000042035) OR7A17 (ENSGGOG00000042940) ENSGGOG00000044137 ENSGGOG00000015948 OR7A10 (ENSGGOG00000015049) OR7A5 (ENSGGOG00000009845) OR7C1 (ENSGGOG00000042495) ADGRE2 (ENSGGOG00000013156) ZNF333 (ENSGGOG00000006355) ADGRE3 (ENSGGOG00000027289) CLEC17A (ENSGGOG00000013092) ENSGGOG00000037664 DNAJB1 (ENSGGOG00000024610) GIPC1 (ENSGGOG00000012043) ##22 PTGER1 (ENSGGOG00000023671) PKN1 (ENSGGOG00000015787) DDX39A (ENSGGOG00000005414) ADGRE5 (ENSGGOG00000005405) ADGRL1 (ENSGGOG00000015214) ASF1B (ENSGGOG00000013302) PRKACA (ENSGGOG00000013294) C19orf67 (ENSGGOG00000002339) ENSGGOG00000002337 PALM3 (ENSGGOG00000023236) IL27RA (ENSGGOG00000011506) RLN3 (ENSGGOG00000042442) RFX1 (ENSGGOG00000000385) DCAF15 (ENSGGOG00000000384) PODNL1 (ENSGGOG00000004407) Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003207 ENSGT00940000159972 ENSGT00940000162084 ENSGT00940000153523.i.a.a.a.a.a ENSGT00940000153523.i.a.a.b ENSGT00940000153523.i.a.a.a.b ENSGT00940000153523.i.a.b ENSGT00940000153523.j ENSGT00940000162597 ENSGT00940000163161 ENSGT00940000163037 ENSGT00940000163153 ENSGT00390000018759 ENSGT00950000182886.a.a.b.o.b ENSGT00940000160312.e ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT01030000234559.a.a.b.a ENSGT00940000154990 ENSGT00940000154912 ENSGT00940000160578 ENSGT00940000159684 ENSGT00390000004692.d.a ENSGT00940000162186 ENSGT00940000162952 ENSGT00390000009916 ENSGT00940000154739.A ENSGT00390000009016 ENSGT00700000104610 ENSGT00940000154396.b.a ENSGT01050000244879.a.b ENSGT00390000011987 Pan ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000003207 ENSGT00940000159972 ENSGT00940000162084 ENSGT00940000153523.i.a.a.a.a.a ENSGT00940000153523.i.a.a.b ENSGT00940000153523.i.a.a.a.b ENSGT00940000153523.i.a.b ENSGT00940000153523.j ENSGT00940000162597 ENSGT00940000163161 ENSGT00940000163037 ENSGT00940000163153 ENSGT00390000018759 ENSGT00950000182886.a.a.b.o.b ENSGT00940000160312.e ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT01030000234559.a.a.b.a ENSGT00940000154990 ENSGT00940000154912 ENSGT00940000160578 ENSGT00940000159684 ENSGT00390000004692.d.a ENSGT00940000162186 ENSGT00940000162952 ENSGT00390000009916 ENSGT00940000154739.A ENSGT00390000009016 ENSGT00700000104610 ENSGT00940000154396.b.a ENSGT01050000244879.a.b ENSGT00390000011987 Bonobo MODERN SPECIES 10 SLC1A6 (ENSPPAG00000042819) OR7C2 (ENSPPAG00000016589) OR7A17 (ENSPPAG00000019424) ENSPPAG00000012540 ENSPPAG00000031313 OR7A10 (ENSPPAG00000008015) OR7A5 (ENSPPAG00000009243) OR7C1 (ENSPPAG00000023546) ADGRE2 (ENSPPAG00000044011) ZNF333 (ENSPPAG00000028875) ADGRE3 (ENSPPAG00000033302) CLEC17A (ENSPPAG00000035812) NDUFB7 (ENSPPAG00000043940) TECR (ENSPPAG00000031488) DNAJB1 (ENSPPAG00000030563) GIPC1 (ENSPPAG00000041834) ##22 PKN1 (ENSPPAG00000039292) DDX39A (ENSPPAG00000040065) ADGRE5 (ENSPPAG00000043912) ADGRL1 (ENSPPAG00000024209) ASF1B (ENSPPAG00000024377) PRKACA (ENSPPAG00000014020) ENSPPAG00000029269 C19orf67 (ENSPPAG00000038468) ENSPPAG00000021210 PALM3 (ENSPPAG00000039534) IL27RA (ENSPPAG00000037229) RLN3 (ENSPPAG00000022669) RFX1 (ENSPPAG00000029817) DCAF15 (ENSPPAG00000042487) PODNL1 (ENSPPAG00000017952) Human MODERN SPECIES 10 CASP14 (ENSG00000105141) CCDC105 (ENSG00000160994) SLC1A6 (ENSG00000105143) OR7C2 (ENSG00000127529) OR7A17 (ENSG00000185385) OR7A10 (ENSG00000127515) OR7A5 (ENSG00000188269) OR7C1 (ENSG00000127530) ADGRE2 (ENSG00000127507) ZNF333 (ENSG00000160961) ADGRE3 (ENSG00000131355) CLEC17A (ENSG00000187912) NDUFB7 (ENSG00000099795) TECR (ENSG00000099797) DNAJB1 (ENSG00000132002) GIPC1 (ENSG00000123159) ##22 PTGER1 (ENSG00000160951) PKN1 (ENSG00000123143) DDX39A (ENSG00000123136) ADGRE5 (ENSG00000123146) ADGRL1 (ENSG00000072071) ASF1B (ENSG00000105011) SMIM46 (ENSG00000289762) PRKACA (ENSG00000072062) SAMD1 (ENSG00000141858) C19orf67 (ENSG00000188032) MISP3 (ENSG00000141854) PALM3 (ENSG00000187867) IL27RA (ENSG00000104998) RLN3 (ENSG00000171136) RFX1 (ENSG00000132005) Orangutan MODERN SPECIES 10 SLC1A6 (ENSPPYG00000009662) ENSPPYG00000036745 ENSPPYG00000039880 ENSPPYG00000039427 OR7A17 (ENSPPYG00000037032) ENSPPYG00000035025 OR7A10 (ENSPPYG00000009656) ADGRE2 (ENSPPYG00000009654) ZNF333 (ENSPPYG00000009652) ADGRE3 (ENSPPYG00000009651) CLEC17A (ENSPPYG00000009650) NDUFB7 (ENSPPYG00000009649) TECR (ENSPPYG00000009648) DNAJB1 (ENSPPYG00000009647) ENSPPYG00000009646 GIPC1 (ENSPPYG00000009645) ##22 PTGER1 (ENSPPYG00000009644) PKN1 (ENSPPYG00000009643) DDX39A (ENSPPYG00000009642) ENSPPYG00000009641 ENSPPYG00000009640 ENSPPYG00000009639 PRKACA (ENSPPYG00000009638) ENSPPYG00000009637 C19orf67 (ENSPPYG00000009636) ENSPPYG00000009635 PALM3 (ENSPPYG00000009634) IL27RA (ENSPPYG00000009633) ENSPPYG00000009632 RFX1 (ENSPPYG00000009631) DCAF15 (ENSPPYG00000009630) Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000003207 ENSGT00940000159972 ENSGT00940000153523.j ENSGT00950000183216.d ENSGT00940000153523.i.b ENSGT00940000153523.i.a.a.b ENSGT00940000153523.i.a.b ENSGT00940000162084 ENSGT00940000162597 ENSGT00940000163161 ENSGT00940000163037 ENSGT00940000163153 ENSGT00390000018759 ENSGT00950000182886.a.a.b.p ENSGT00940000160312.e ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT01030000234559.a.a.b.a ENSGT00940000154990 ENSGT00940000154912 ENSGT00940000160578 ENSGT00940000159684 ENSGT00520000059915 ENSGT00390000004692.d.a ENSGT00940000162186 ENSGT00530000063936.a ENSGT00390000009916 ENSGT00940000154739.A ENSGT00390000009016 ENSGT00700000104610 ENSGT00940000154396.b.a ENSGT01050000244879.a.b Vervet Monkey MODERN SPECIES 25 CASP14 (ENSCSAG00000006173) CCDC105 (ENSCSAG00000006179) SLC1A6 (ENSCSAG00000006189) OR7C2 (ENSCSAG00000018486) ENSCSAG00000018482 ENSCSAG00000018479 OR7A10 (ENSCSAG00000006193) OR7C1 (ENSCSAG00000018477) ADGRE2 (ENSCSAG00000006232) ZNF333 (ENSCSAG00000006261) ADGRE3 (ENSCSAG00000006290) CLEC17A (ENSCSAG00000006309) NDUFB7 (ENSCSAG00000006318) TECR (ENSCSAG00000006324) DNAJB1 (ENSCSAG00000006329) GIPC1 (ENSCSAG00000006331) ##22 PTGER1 (ENSCSAG00000006336) PKN1 (ENSCSAG00000006339) DDX39A (ENSCSAG00000006342) ADGRE5 (ENSCSAG00000006346) ADGRL1 (ENSCSAG00000006349) ASF1B (ENSCSAG00000006355) SAMD1 (ENSCSAG00000006358) PRKACA (ENSCSAG00000006367) C19orf67 (ENSCSAG00000006372) MISP3 (ENSCSAG00000006375) PALM3 (ENSCSAG00000006381) IL27RA (ENSCSAG00000006388) RLN3 (ENSCSAG00000006390) DCAF15 (ENSCSAG00000006394) PODNL1 (ENSCSAG00000006396) Macaca ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT01030000234635.a.a.a.b ENSGT00940000162852.a ENSGT00940000162117 ENSGT00390000003207 ENSGT00940000159972 ENSGT00940000162084 ENSGT00940000153523.j ENSGT00950000183216.d ENSGT00940000153523.i.b ENSGT00940000162597 ENSGT00940000163161 ENSGT00940000163153 ENSGT00390000018759 ENSGT00950000182886.a.a.b.p ENSGT00940000160312.e ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT01030000234559.a.a.b.a ENSGT00940000154990 ENSGT00940000154912 ENSGT00940000160578 ENSGT00940000159684 ENSGT00520000059915 ENSGT00390000004692.d.a ENSGT00940000162186 ENSGT00530000063936.a ENSGT00390000009916 ENSGT00940000154739.A ENSGT00390000009016 ENSGT00700000104610 ENSGT00940000154396.b.a ENSGT01050000244879.a.b Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 76 NOTCH3 (ENSMNEG00000034126) ILVBL (ENSMNEG00000045029) SYDE1 (ENSMNEG00000043619) CASP14 (ENSMNEG00000036154) CCDC105 (ENSMNEG00000035529) SLC1A6 (ENSMNEG00000038083) OR7A5 (ENSMNEG00000023698) ENSMNEG00000028698 ENSMNEG00000000074 ADGRE2 (ENSMNEG00000044437) ZNF333 (ENSMNEG00000045472) CLEC17A (ENSMNEG00000040251) NDUFB7 (ENSMNEG00000035902) TECR (ENSMNEG00000041758) DNAJB1 (ENSMNEG00000010488) GIPC1 (ENSMNEG00000044957) ##22 PTGER1 (ENSMNEG00000029342) PKN1 (ENSMNEG00000018025) DDX39A (ENSMNEG00000044292) ADGRE5 (ENSMNEG00000027579) ADGRL1 (ENSMNEG00000012530) ENSMNEG00000030430 ASF1B (ENSMNEG00000028854) PRKACA (ENSMNEG00000043476) SAMD1 (ENSMNEG00000014090) C19orf67 (ENSMNEG00000035055) MISP3 (ENSMNEG00000043349) PALM3 (ENSMNEG00000039886) IL27RA (ENSMNEG00000044658) RLN3 (ENSMNEG00000008264) RFX1 (ENSMNEG00000038388) Rhesus MODERN SPECIES 10 SLC1A6 (ENSMMUG00000001735) OR7C2 (ENSMMUG00000059377) ENSMMUG00000058217 ENSMMUG00000064639 ENSMMUG00000063342 OR7A10 (ENSMMUG00000050032) OR7C1 (ENSMMUG00000053889) ENSMMUG00000060289 ZNF333 (ENSMMUG00000020653) ADGRE2 (ENSMMUG00000018932) CLEC17A (ENSMMUG00000021892) NDUFB7 (ENSMMUG00000050251) TECR (ENSMMUG00000021611) ENSMMUG00000055621 DNAJB1 (ENSMMUG00000017906) GIPC1 (ENSMMUG00000005729) ##22 PTGER1 (ENSMMUG00000005728) PKN1 (ENSMMUG00000005727) DDX39A (ENSMMUG00000005723) ADGRE5 (ENSMMUG00000005722) ENSMMUG00000051365 ADGRL1 (ENSMMUG00000014137) ASF1B (ENSMMUG00000014135) PRKACA (ENSMMUG00000014132) ENSMMUG00000058960 C19H19orf67 (ENSMMUG00000045865) MISP3 (ENSMMUG00000059667) ENSMMUG00000061407 PALM3 (ENSMMUG00000013539) IL27RA (ENSMMUG00000013538) RLN3 (ENSMMUG00000060189) Olive baboon MODERN SPECIES 12 CCDC105 (ENSPANG00000010975) SLC1A6 (ENSPANG00000017791) OR7C2 (ENSPANG00000042632) ENSPANG00000046221 ENSPANG00000008166 OR7C1 (ENSPANG00000050573) ADGRE2 (ENSPANG00000011401) ZNF333 (ENSPANG00000029285) ENSPANG00000049867 DDX39A (ENSPANG00000015036) ADGRE3 (ENSPANG00000019561) CLEC17A (ENSPANG00000026252) NDUFB7 (ENSPANG00000011699) TECR (ENSPANG00000004446) DNAJB1 (ENSPANG00000015164) GIPC1 (ENSPANG00000008550) ##22 PTGER1 (ENSPANG00000010976) PKN1 (ENSPANG00000004240) ADGRL1 (ENSPANG00000007386) ASF1B (ENSPANG00000031048) PRKACA (ENSPANG00000018288) ENSPANG00000014189 C19orf67 (ENSPANG00000019962) MISP3 (ENSPANG00000001631) PALM3 (ENSPANG00000005117) IL27RA (ENSPANG00000015627) ENSPANG00000005369 RFX1 (ENSPANG00000009789) DCAF15 (ENSPANG00000011700) PODNL1 (ENSPANG00000017712) CC2D1A (ENSPANG00000019934) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000158035 ENSGT01030000234635.a.a.a.b ENSGT00940000162852.a ENSGT00940000162117 ENSGT00390000003207 ENSGT00940000159972 ENSGT00940000162084 ENSGT00940000153523 ENSGT00950000183216.d ENSGT00940000163161 ENSGT00940000163037 ENSGT00940000163153 ENSGT00390000018759 ENSGT00950000182886.a.a.b ENSGT00940000160312 ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT01030000234559.a.a.b.a ENSGT00940000154990 ENSGT00940000154912.e ENSGT00940000160578 ENSGT00940000159684 ENSGT00390000004692.d.a ENSGT00940000162186 ENSGT00940000162952 ENSGT00390000009916 ENSGT00940000154739.A ENSGT00390000009016 ENSGT00700000104610 ENSGT00940000154396.b.a ENSGT01050000244879.a.b ENSGT00390000011987 Cebidae ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000162852.a ENSGT00940000162117 ENSGT00390000003207 ENSGT00940000159972 ENSGT00940000162084 ENSGT00940000153523 ENSGT00950000183216.d ENSGT00940000163161 ENSGT00940000163037 ENSGT00940000163153 ENSGT00390000018759 ENSGT00950000182886.a.a.b ENSGT00940000160312 ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT01030000234559.a.a.b.a ENSGT00940000154990 ENSGT00940000154912.e ENSGT00940000160578 ENSGT00940000159684 ENSGT00390000004692.d.a ENSGT00940000162186 ENSGT00940000162952 ENSGT00390000009916 ENSGT00940000154739.A ENSGT00390000009016 ENSGT00700000104610 ENSGT00940000154396.b.a ENSGT01050000244879.a.b ENSGT00390000011987 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000162852.a ENSGT00940000162117 ENSGT00390000003207 ENSGT00940000159972 ENSGT00940000162084 ENSGT00940000163161 ENSGT00940000163037 ENSGT00940000163153 ENSGT00390000018759 ENSGT00950000182886.a.a.b ENSGT00940000160312 ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT01030000234559.a.a.b.a ENSGT00940000154990 ENSGT00940000154912.e ENSGT00940000160578 ENSGT00940000159684 ENSGT00390000004692.d.a ENSGT00940000162186 ENSGT00940000162952 ENSGT00390000009916 ENSGT00940000154739.A ENSGT00390000009016 ENSGT00700000104610 ENSGT00940000154396.b.a ENSGT01050000244879.a.b ENSGT00390000011987 Capuchin MODERN SPECIES 234 DNAJB1 (ENSCCAG00000003556) GIPC1 (ENSCCAG00000030796) ##22 PTGER1 (ENSCCAG00000024809) PKN1 (ENSCCAG00000024115) DDX39A (ENSCCAG00000034932) ADGRE5 (ENSCCAG00000037285) ADGRL1 (ENSCCAG00000032871) ASF1B (ENSCCAG00000013180) PRKACA (ENSCCAG00000034581) SAMD1 (ENSCCAG00000036021) C19orf67 (ENSCCAG00000036582) MISP3 (ENSCCAG00000021278) PALM3 (ENSCCAG00000030648) IL27RA (ENSCCAG00000025599) RLN3 (ENSCCAG00000034851) RFX1 (ENSCCAG00000037933) ENSCCAG00000020314 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 192 ENSSBOG00000021706 CASP14 (ENSSBOG00000026627) CCDC105 (ENSSBOG00000027944) SLC1A6 (ENSSBOG00000033066) OR7C2 (ENSSBOG00000025219) ZNF333 (ENSSBOG00000009921) ADGRE3 (ENSSBOG00000023661) CLEC17A (ENSSBOG00000034229) NDUFB7 (ENSSBOG00000027435) ENSSBOG00000029630 DNAJB1 (ENSSBOG00000032537) GIPC1 (ENSSBOG00000021931) ##22 ENSSBOG00000026379 PKN1 (ENSSBOG00000030578) DDX39A (ENSSBOG00000034939) ADGRE5 (ENSSBOG00000000810) ADGRL1 (ENSSBOG00000032464) ASF1B (ENSSBOG00000023101) PRKACA (ENSSBOG00000028189) ENSSBOG00000029114 ENSSBOG00000031891 ENSSBOG00000032680 PALM3 (ENSSBOG00000029866) IL27RA (ENSSBOG00000034131) RLN3 (ENSSBOG00000034704) RFX1 (ENSSBOG00000022420) DCAF15 (ENSSBOG00000028396) Marmoset MODERN SPECIES 14 AKAP8L (ENSCJAG00000002227) RASAL3 (ENSCJAG00000002291) WIZ (ENSCJAG00000002265) CYP4F22 (ENSCJAG00000041905) CASP14 (ENSCJAG00000004476) CCDC105 (ENSCJAG00000004489) SLC1A6 (ENSCJAG00000004498) OR7C2 (ENSCJAG00000046592) ENSCJAG00000054592 ENSCJAG00000004537 ZNF333 (ENSCJAG00000004543) ADGRE3 (ENSCJAG00000004557) NDUFB7 (ENSCJAG00000004611) TECR (ENSCJAG00000004626) DNAJB1 (ENSCJAG00000004666) GIPC1 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(ENSANAG00000033446) ADGRL1 (ENSANAG00000034947) ASF1B (ENSANAG00000034025) PRKACA (ENSANAG00000024197) SAMD1 (ENSANAG00000036958) C19orf67 (ENSANAG00000021995) ENSANAG00000028790 ENSANAG00000027531 IL27RA (ENSANAG00000028857) RLN3 (ENSANAG00000028354) RFX1 (ENSANAG00000022687) DCAF15 (ENSANAG00000026170) Tarsier MODERN SPECIES 4678 ZNF333 (ENSTSYG00000010668) ADGRE3 (ENSTSYG00000011359) CLEC17A (ENSTSYG00000035604) NDUFB7 (ENSTSYG00000006917) TECR (ENSTSYG00000033874) DNAJB1 (ENSTSYG00000030085) GIPC1 (ENSTSYG00000035024) ##22 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00940000162597 ENSGT00940000163161 ENSGT00940000163037 ENSGT00940000163153 ENSGT00390000018759 ENSGT00950000182886.a.a.b ENSGT00940000160312 ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT01030000234559.a.a.b.a ENSGT00940000154990 ENSGT00940000154912 ENSGT00940000160578 ENSGT00940000159684 ENSGT00520000059915 ENSGT00390000004692.d.a ENSGT00940000162186 ENSGT00940000162952 ENSGT00390000009916 ENSGT00940000154739.A ENSGT00390000009016 ENSGT00700000104610 ENSGT00940000154396.b.a ENSGT01050000244879.a.b Mouse lemur MODERN SPECIES 16 MED26 (ENSMICG00000030425) SMIM7 (ENSMICG00000047863) TMEM38A (ENSMICG00000044609) NWD1 (ENSMICG00000003445) SIN3B (ENSMICG00000003468) F2RL3 (ENSMICG00000027121) ENSMICG00000000327 ENSMICG00000042907 ENSMICG00000014240 ZNF333 (ENSMICG00000029549) ADGRE3 (ENSMICG00000011089) CLEC17A (ENSMICG00000011080) NDUFB7 (ENSMICG00000043903) TECR (ENSMICG00000009818) DNAJB1 (ENSMICG00000047161) GIPC1 (ENSMICG00000004336) ##22 PTGER1 (ENSMICG00000045048) PKN1 (ENSMICG00000035009) DDX39A (ENSMICG00000015325) ENSMICG00000046227 ENSMICG00000032629 ADGRL1 (ENSMICG00000027529) ASF1B (ENSMICG00000000574) PRKACA (ENSMICG00000036023) SAMD1 (ENSMICG00000030168) C19orf67 (ENSMICG00000008731) MISP3 (ENSMICG00000046673) IL27RA (ENSMICG00000003469) RLN3 (ENSMICG00000035223) RFX1 (ENSMICG00000012036) DCAF15 (ENSMICG00000012026) Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000160312 ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT01030000234559.a.a.b.a ENSGT00940000154990 ENSGT00940000154912 ENSGT00940000160578 ENSGT00940000159684 ENSGT00520000059915 ENSGT00390000004692.d.a ENSGT00940000162186 ENSGT00940000162952 ENSGT00390000009916 ENSGT00940000154739.A ENSGT00390000009016 ENSGT00700000104610 ENSGT00940000154396.b.a ENSGT01050000244879.a.b Coquerels sifaka MODERN SPECIES 226 DNAJB1 (ENSPCOG00000018620) GIPC1 (ENSPCOG00000019419) ##22 PTGER1 (ENSPCOG00000016929) PKN1 (ENSPCOG00000023124) ENSPCOG00000018928 ENSPCOG00000024047 ADGRE5 (ENSPCOG00000020208) ADGRL1 (ENSPCOG00000025675) ASF1B (ENSPCOG00000001102) PRKACA (ENSPCOG00000027066) SAMD1 (ENSPCOG00000016370) C19orf67 (ENSPCOG00000023801) MISP3 (ENSPCOG00000015918) PALM3 (ENSPCOG00000024665) IL27RA (ENSPCOG00000022860) RLN3 (ENSPCOG00000022698) RFX1 (ENSPCOG00000021114) Bushbaby MODERN SPECIES 242 ZNF333 (ENSOGAG00000028879) ADGRE3 (ENSOGAG00000002255) CLEC17A (ENSOGAG00000004648) NDUFB7 (ENSOGAG00000009615) TECR (ENSOGAG00000024886) DNAJB1 (ENSOGAG00000014022) GIPC1 (ENSOGAG00000014019) ##22 PTGER1 (ENSOGAG00000033700) PKN1 (ENSOGAG00000010285) ENSOGAG00000010280 ADGRE5 (ENSOGAG00000010273) ADGRL1 (ENSOGAG00000005032) ASF1B (ENSOGAG00000005034) PRKACA (ENSOGAG00000011842) SAMD1 (ENSOGAG00000032909) C19orf67 (ENSOGAG00000002463) MISP3 (ENSOGAG00000002460) PALM3 (ENSOGAG00000031926) IL27RA (ENSOGAG00000002458) RLN3 (ENSOGAG00000002457) RFX1 (ENSOGAG00000007203) DCAF15 (ENSOGAG00000026882) Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00950000183216.c.b.a ENSGT00940000164720 ENSGT00940000161354 ENSGT00940000162163 ENSGT00950000183069.b ENSGT00940000164424 ENSGT00940000153523 ENSGT00950000183216.d ENSGT00940000162597 ENSGT00940000163161 ENSGT00940000163037 ENSGT00940000163153 ENSGT00390000018759 ENSGT00950000182886.a.a.b ENSGT00940000160312 ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT01030000234559.a.a.b.a ENSGT00940000154990 ENSGT00940000154912 ENSGT00940000160578 ENSGT00520000059915 ENSGT00940000159684 ENSGT00390000004692.d.a ENSGT00940000162186 ENSGT00530000063936.a ENSGT00390000009916 ENSGT00940000154739.A ENSGT00390000009016 ENSGT00700000104610 ENSGT00940000154396.b.a ENSGT01050000244879.a.b Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 461 ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT01030000234559.a.a.b.a ENSGT00940000154990 Rodentia ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000003207 ENSGT00940000159972 ENSGT00940000162084 ENSGT00950000183216.d.j.b ENSGT00940000153523.b ENSGT00950000183216.d.j.a.a.a ENSGT00940000153523.a ENSGT00950000183216.d.j.a.a.b.a.b ENSGT00950000183216.d.j.a.a.b.a.a ENSGT00940000162597 ENSGT00940000163161.h ENSGT00940000163037 ENSGT00390000018759 ENSGT00950000182886.a.a.b ENSGT00940000160312 ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT01030000234559.a.a.b.a ENSGT00940000154990 ENSGT00940000154912 ENSGT00940000160578 ENSGT00520000059915 ENSGT00940000159684 ENSGT00390000004692.d.a ENSGT00940000162186 ENSGT00530000063936.a ENSGT00390000009916 ENSGT00940000154739.A ENSGT00390000009016 ENSGT00700000104610 ENSGT00940000154396.b.a ENSGT01050000244879.a.b Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00390000018759 ENSGT00950000182886.a.a.b ENSGT00940000160312 ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT01030000234559.a.a.b.a ENSGT00940000154990 ENSGT00940000154912 ENSGT00940000160578 ENSGT00520000059915 ENSGT00940000159684 ENSGT00390000004692.d.a ENSGT00940000162186 ENSGT00940000162952 ENSGT00530000063936.a ENSGT00390000009916 ENSGT00940000154739.A ENSGT00390000009016 ENSGT00700000104610 ENSGT00940000154396.b.a Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 52 ENSGT00390000018759 ENSGT00950000182886.a.a.b ENSGT00940000160312 ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT01030000234559.a.a.b.a ENSGT00940000154990 ENSGT00940000154912 ENSGT00940000160578 ENSGT00520000059915 ENSGT00940000159684 ENSGT00390000004692.d.a ENSGT00940000162186 ENSGT00940000162952 ENSGT00530000063936.a ENSGT00390000009916 ENSGT00940000154739.A ENSGT00390000009016 ENSGT00700000104610 ENSGT00940000154396.b.a Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00960000189829 ENSGT00940000157587 ENSGT00390000016264 ENSGT00390000017043 ENSGT00940000156171 ENSGT00940000157878 ENSGT00940000160382 ENSGT00940000156589 ENSGT00940000161998 ENSGT00950000182915.a.a.b ENSGT00390000008828 ENSGT00940000161377 ENSGT00390000018759 ENSGT00950000182886.a.a.b ENSGT00940000160312 ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT01030000234559.a.a.b.a ENSGT00940000154990 ENSGT00940000154912 ENSGT00940000160578 ENSGT00520000059915 ENSGT00940000159684 ENSGT00390000004692.d.a ENSGT00940000162186 ENSGT00940000162952 ENSGT00390000009916 ENSGT00940000154739.A ENSGT00390000009016 ENSGT00700000104610 ENSGT00940000154396.b.a ENSGT01050000244879.a.b Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000158403 ENSGT00940000157587 ENSGT00390000016264 ENSGT00390000017043 ENSGT00940000156171 ENSGT00940000157878 ENSGT00940000160382 ENSGT00940000156589 ENSGT00940000161998 ENSGT00950000182915.a.a.b ENSGT00390000008828 ENSGT00940000161377 ENSGT00390000018759 ENSGT00950000182886.a.a.b ENSGT00940000160312 ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT01030000234559.a.a.b.a ENSGT00940000154990 ENSGT00940000154912 ENSGT00940000160578 ENSGT00520000059915 ENSGT00940000159684 ENSGT00390000004692.d.a ENSGT00940000162186 ENSGT00940000162952 ENSGT00390000009916 ENSGT00940000154739.A ENSGT00390000009016 ENSGT00700000104610 ENSGT00940000154396.b.a ENSGT01050000244879.a.b Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000158403 ENSGT00940000157587 ENSGT00390000016264 ENSGT00390000017043 ENSGT00940000156171 ENSGT00940000157878 ENSGT00940000160382 ENSGT00940000156589 ENSGT00940000161998 ENSGT00950000182915.a.a.b ENSGT00390000008828 ENSGT00940000161377 ENSGT00390000018759 ENSGT00950000182886.a.a.b ENSGT00940000160312 ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT01030000234559.a.a.b.a ENSGT00940000154990 ENSGT00940000154912 ENSGT00940000160578 ENSGT00940000159684 ENSGT00520000059915 ENSGT00390000004692.d.a ENSGT00940000162186 ENSGT00940000162952 ENSGT00390000009916 ENSGT00940000154739.A ENSGT00390000009016 ENSGT00700000104610 ENSGT00940000154396.b.a ENSGT01050000244879.a.b Northern American deer mouse MODERN SPECIES 18 Rnf150 (ENSPEMG00000008599) ENSPEMG00000030162 ENSPEMG00000026256 Tbc1d9 (ENSPEMG00000024048) ENSPEMG00000024217 Ucp1 (ENSPEMG00000022488) Elmod2 (ENSPEMG00000028361) Mgat4d (ENSPEMG00000022918) Clgn (ENSPEMG00000023114) Scoc (ENSPEMG00000024835) Or10k2 (ENSPEMG00000027328) Prmt9 (ENSPEMG00000029675) Ndufb7 (ENSPEMG00000010565) Tecr (ENSPEMG00000008519) Dnajb1 (ENSPEMG00000007843) Gipc1 (ENSPEMG00000008496) ##22 Ptger1 (ENSPEMG00000027389) Pkn1 (ENSPEMG00000018704) ENSPEMG00000017767 Adgre5 (ENSPEMG00000012912) ENSPEMG00000028964 Adgrl1 (ENSPEMG00000008075) Asf1b (ENSPEMG00000026306) Prkaca (ENSPEMG00000002089) ENSPEMG00000017586 1700067K01Rik (ENSPEMG00000008680) Misp3 (ENSPEMG00000017574) Palm3 (ENSPEMG00000000570) Il27ra (ENSPEMG00000011917) Rln3 (ENSPEMG00000005926) Rfx1 (ENSPEMG00000014245) Prairie vole MODERN SPECIES 173 Ndufb7 (ENSMOCG00000012007) Tecr (ENSMOCG00000018776) ENSMOCG00000016066 ENSMOCG00000017692 Gipc1 (ENSMOCG00000008417) ##22 Ptger1 (ENSMOCG00000012350) Pkn1 (ENSMOCG00000001118) Ddx39a (ENSMOCG00000016890) Adgre5 (ENSMOCG00000015102) Adgrl1 (ENSMOCG00000019230) ENSMOCG00000016743 Asf1b (ENSMOCG00000019691) Prkaca (ENSMOCG00000009319) ENSMOCG00000000409 1700067K01Rik (ENSMOCG00000012915) Misp3 (ENSMOCG00000012756) Palm3 (ENSMOCG00000019944) Il27ra (ENSMOCG00000015066) Rln3 (ENSMOCG00000011994) Rfx1 (ENSMOCG00000009461) Cricetinae ANCESTRAL SPECIES 40 ENSGT00940000156733 ENSGT00940000156801 ENSGT00940000158403 ENSGT00940000157587 ENSGT00390000016264 ENSGT00390000017043 ENSGT00940000157878 ENSGT00940000160382 ENSGT00940000156589 ENSGT00940000161998 ENSGT00950000182915.a.a.b ENSGT00390000008828 ENSGT00390000018759 ENSGT00950000182886.a.a.b ENSGT00940000160312 ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT01030000234559.a.a.b.a ENSGT00940000154990 ENSGT00940000154912 ENSGT00940000160578 ENSGT00520000059915 ENSGT00940000159684 ENSGT00390000004692.d.a ENSGT00940000162186 ENSGT00530000063936.a ENSGT00390000009916 ENSGT00940000154739.A ENSGT00390000009016 ENSGT00700000104610 ENSGT00940000154396.b.a ENSGT01050000244879.a.b Golden Hamster MODERN SPECIES 893 Dnajb1 (ENSMAUG00000005728) ENSMAUG00000009614 ##22 Ptger1 (ENSMAUG00000012479) Pkn1 (ENSMAUG00000012228) Ddx39a (ENSMAUG00000008459) Adgre5 (ENSMAUG00000018404) Adgrl1 (ENSMAUG00000000445) Asf1b (ENSMAUG00000020077) Prkaca (ENSMAUG00000004842) ENSMAUG00000011537 1700067K01Rik (ENSMAUG00000017815) Misp3 (ENSMAUG00000015004) Palm3 (ENSMAUG00000020501) Il27ra (ENSMAUG00000004460) Rln3 (ENSMAUG00000016189) Rfx1 (ENSMAUG00000018885) Dcaf15 (ENSMAUG00000010865) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 347 Ndufb7 (ENSCGRG00001019688) Tecr (ENSCGRG00001016685) Dnajb1 (ENSCGRG00001013728) Gipc1 (ENSCGRG00001013034) ##22 Ptger1 (ENSCGRG00001012182) Pkn1 (ENSCGRG00001009026) Ddx39a (ENSCGRG00001001611) Adgre5 (ENSCGRG00001000548) ENSCGRG00001000091 Adgrl1 (ENSCGRG00001022080) Asf1b (ENSCGRG00001018098) PRKACA (ENSCGRG00001017184) Samd1 (ENSCGRG00001016469) 1700067K01Rik (ENSCGRG00001015825) Misp3 (ENSCGRG00001015443) Palm3 (ENSCGRG00001015020) Il27ra (ENSCGRG00001019895) Rln3 (ENSCGRG00001018325) Rfx1 (ENSCGRG00001011068) Murinae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00960000189829 ENSGT00940000157587 ENSGT00390000016264 ENSGT00390000017043 ENSGT00940000156171 ENSGT00940000157878 ENSGT00940000160382 ENSGT00940000156589 ENSGT00940000161998 ENSGT00950000182915.a.a.b ENSGT00390000008828 ENSGT00940000161377 ENSGT00390000018759 ENSGT00950000182886.a.a.b ENSGT00940000160312 ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT01030000234559.a.a.b.a ENSGT00940000154990 ENSGT00940000154912 ENSGT00940000160578 ENSGT00520000059915 ENSGT00940000159684 ENSGT00390000004692.d.a ENSGT00940000162186 ENSGT00530000063936.a ENSGT00390000009916 ENSGT00940000154739.A ENSGT00390000009016 ENSGT00700000104610 ENSGT00940000154396.b.a ENSGT01050000244879.a.b Mus ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000157587 ENSGT00390000016264 ENSGT00390000017043 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MGP_SPRETEiJ_G0032408 Mouse MODERN SPECIES 17 Usp38 (ENSMUSG00000038250) Inpp4b (ENSMUSG00000037940) Il15 (ENSMUSG00000031712) Zfp330 (ENSMUSG00000031711) Rnf150 (ENSMUSG00000047747) Tbc1d9 (ENSMUSG00000031709) Ucp1 (ENSMUSG00000031710) Elmod2 (ENSMUSG00000035151) Mgat4d (ENSMUSG00000035057) Clgn (ENSMUSG00000002190) Scoc (ENSMUSG00000063253) Or10k2 (ENSMUSG00000047286) Ndufb7 (ENSMUSG00000033938) Tecr (ENSMUSG00000031708) Dnajb1 (ENSMUSG00000005483) Gipc1 (ENSMUSG00000019433) ##22 Pkn1 (ENSMUSG00000057672) Ptger1 (ENSMUSG00000019464) Ddx39a (ENSMUSG00000005481) Adgre5 (ENSMUSG00000002885) Adgrl1 (ENSMUSG00000013033) Asf1b (ENSMUSG00000005470) Prkaca (ENSMUSG00000005469) SMIM46 (ENSMUSG00000121579) Samd1 (ENSMUSG00000079003) 1700067K01Rik (ENSMUSG00000046408) Misp3 (ENSMUSG00000074217) Palm3 (ENSMUSG00000047986) Il27ra (ENSMUSG00000005465) Rln3 (ENSMUSG00000045232) Gm10643 (ENSMUSG00000074215) Shrew mouse MODERN SPECIES 12 Inpp4b (MGP_PahariEiJ_G0022865) Il15 (MGP_PahariEiJ_G0022866) 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Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 55 ENSGT00940000160234 ENSGT01100000263561.C.c ENSGT00940000154227.b ENSGT00940000158035 ENSGT01030000234635.a.a.a.b ENSGT00940000162852.a ENSGT00940000162117 ENSGT00390000003207 ENSGT00940000159972 ENSGT00950000183216.d.j.b ENSGT00940000163952 ENSGT00950000182755.b.a.a.a.a.a.b.d.b ENSGT00390000018759 ENSGT00950000182886.a.a.b ENSGT00940000160312 ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT01030000234559.a.a.b.a ENSGT00940000154990 ENSGT00940000154912 ENSGT00940000160578 ENSGT00940000159684 ENSGT00520000059915 ENSGT00390000004692.d.a ENSGT00940000162186 ENSGT00940000163111.a.b.a ENSGT00530000063936.a ENSGT00390000009916 ENSGT00940000154739.A ENSGT00390000009016 ENSGT00700000104610 ENSGT00940000154396.b.a Naked mole-rat female MODERN SPECIES 21 ENSHGLG00000020442 ENSHGLG00000005565 ENSHGLG00000043939 ENSHGLG00000020237 ENSHGLG00000034158 ENSHGLG00000037347 ENSHGLG00000038574 ENSHGLG00000048956 ENSHGLG00000041413 ENSHGLG00000036859 ENSHGLG00000032390 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RLN3 (ENSODEG00000009268) RFX1 (ENSODEG00000011025) Guinea pig MODERN SPECIES 168 ENSCPOG00000030751 ENSCPOG00000015657 ENSCPOG00000038355 ENSCPOG00000031371 ENSCPOG00000030591 ENSCPOG00000031116 ENSCPOG00000022332 ENSCPOG00000037826 ENSCPOG00000019746 OR4S2 (ENSCPOG00000038628) ENSCPOG00000033916 ENSCPOG00000039546 NDUFB7 (ENSCPOG00000014437) TECR (ENSCPOG00000014436) DNAJB1 (ENSCPOG00000035272) GIPC1 (ENSCPOG00000022424) ##22 PTGER1 (ENSCPOG00000032486) PKN1 (ENSCPOG00000019915) DDX39A (ENSCPOG00000008615) ADGRE5 (ENSCPOG00000006388) ENSCPOG00000036045 ADGRL1 (ENSCPOG00000026254) ASF1B (ENSCPOG00000023872) ENSCPOG00000020078 C19orf67 (ENSCPOG00000013984) MISP3 (ENSCPOG00000025660) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00940000163037 ENSGT00940000163153 ENSGT00390000018759 ENSGT00950000182886.a.a.b ENSGT00940000160312 ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT01030000234559.a.a.b.a ENSGT00940000154990 ENSGT00940000154912 ENSGT00940000160578 ENSGT00940000159684 ENSGT00390000004692.d.a ENSGT00940000162186 ENSGT00940000162952 ENSGT00390000009916 ENSGT00940000154739.A ENSGT00390000009016 ENSGT00700000104610 ENSGT01050000244879.a.b ENSGT00390000011987 ENSGT00940000162059 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00940000162597 ENSGT00940000163037 ENSGT00940000163153 ENSGT00390000018759 ENSGT00950000182886.a.a.b ENSGT00940000160312 ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT01030000234559.a.a.b.a ENSGT00940000154990 ENSGT00940000154912 ENSGT00940000160578 ENSGT00940000159684 ENSGT00390000004692.d.a ENSGT00940000162186 ENSGT00940000162952 ENSGT00390000009916 ENSGT00940000154739.A ENSGT00390000009016 ENSGT00700000104610 ENSGT01050000244879.a.b ENSGT00390000011987 ENSGT00940000162059 Sauria ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00390000011987 ENSGT01050000244879.a.b ENSGT00940000154396.b.a ENSGT00390000009016 ENSGT00940000154739.A ENSGT00390000005830 ENSGT00390000014585 ENSGT00950000182993.B.b ENSGT00440000038032 ENSGT00940000163693 ENSGT00940000156051 ENSGT00940000159428 ENSGT00950000183101.a.b.a 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ENSGT00940000160578 ENSGT00940000159684 ENSGT00390000004692.d.a ENSGT00940000163111.a.b.a ENSGT00530000063936.a ENSGT00940000154382.a.a ENSGT00940000159311.c ENSGT01030000236111 ENSGT00940000158914 ENSGT00940000153846.a.b.k ENSGT01030000234575.c.a.b Eastern brown snake MODERN SPECIES 6 ENSPTXG00000003645 NOTCH3 (ENSPTXG00000003651) CAMSAP3 (ENSPTXG00000003657) XAB2 (ENSPTXG00000003662) ENSPTXG00000003664 PCP2 (ENSPTXG00000003666) STXBP2 (ENSPTXG00000003668) ENSPTXG00000003670 ENSPTXG00000003673 TRAPPC5 (ENSPTXG00000003675) ENSPTXG00000003678 ENSPTXG00000003679 NDUFB7 (ENSPTXG00000003681) TECR (ENSPTXG00000003682) DNAJB1 (ENSPTXG00000003683) GIPC1 (ENSPTXG00000003684) ##22 PTGER1 (ENSPTXG00000003685) ENSPTXG00000003689 PKN1 (ENSPTXG00000003691) C19orf67 (ENSPTXG00000003695) ENSPTXG00000003698 ENSPTXG00000003702 ADGRL1 (ENSPTXG00000003720) ENSPTXG00000005982 ENSPTXG00000005983 ENSPTXG00000005984 ENSPTXG00000005985 ENSPTXG00000005986 ENSPTXG00000005987 ENSPTXG00000005989 ENSPTXG00000005990 Lizard MODERN SPECIES 1 ENSACAG00000017173 ENSACAG00000042266 ENSACAG00000020942 PCP2 (ENSACAG00000017172) ENSACAG00000017105 ENSACAG00000036324 ENSACAG00000029691 ENSACAG00000036875 ENSACAG00000038624 ENSACAG00000038481 ENSACAG00000031954 ENSACAG00000041391 NDUFB7 (ENSACAG00000017055) TECR (ENSACAG00000017027) DNAJB1 (ENSACAG00000034628) GIPC1 (ENSACAG00000017014) ##22 PTGER1 (ENSACAG00000017009) ENSACAG00000016953 ENSACAG00000016849 ENSACAG00000016840 ENSACAG00000043866 ENSACAG00000016808 ENSACAG00000016807 ENSACAG00000016792 TMC8 (ENSACAG00000016750) SYNGR2 (ENSACAG00000016746) tk1 (ENSACAG00000016730) AFMID (ENSACAG00000016716) BIRC5 (ENSACAG00000037931) TMEM235 (ENSACAG00000028438) ENSACAG00000016705 Laterata ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000154549.b ENSGT00940000156233.n ENSGT00940000160234 ENSGT00950000182975.a.b ENSGT00550000075140 ENSGT00390000016884 ENSGT00940000162025 ENSGT00940000160045 ENSGT00390000016177.a.a ENSGT00940000157017.b ENSGT00390000000976 ENSGT00940000162906.c.a ENSGT00390000018759 ENSGT00950000182886.a.a.b ENSGT00940000160312 ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT01030000234559.a.a.b.a ENSGT00940000166147 ENSGT00390000009916 ENSGT00940000154912 ENSGT00940000160578 ENSGT00940000159684 ENSGT00980000199422 ENSGT00390000004692.d.a ENSGT00940000163111.a.b.a ENSGT00530000063936.a ENSGT00940000154382.a.a ENSGT00940000159311.c ENSGT01030000236111 ENSGT00940000158914 ENSGT00530000063861.a Common wall lizard MODERN SPECIES 10 STXBP2 (ENSPMRG00000021082) ENSPMRG00000021107 ENSPMRG00000021116 ENSPMRG00000021125 ENSPMRG00000021134 TRAPPC5 (ENSPMRG00000021136) ENSPMRG00000021143 ENSPMRG00000021150 ENSPMRG00000021156 ENSPMRG00000021158 ENSPMRG00000021163 ENSPMRG00000021170 NDUFB7 (ENSPMRG00000021174) TECR (ENSPMRG00000021182) DNAJB1 (ENSPMRG00000021195) GIPC1 (ENSPMRG00000021205) ##22 PTGER1 (ENSPMRG00000021214) ENSPMRG00000021220 PKN1 (ENSPMRG00000021243) C19orf67 (ENSPMRG00000021272) DDX39A (ENSPMRG00000021292) ADGRE5 (ENSPMRG00000021316) ADGRL1 (ENSPMRG00000021357) ENSPMRG00000021407 ENSPMRG00000021415 ENSPMRG00000021427 ENSPMRG00000021450 ENSPMRG00000021458 ENSPMRG00000021473 LRRC8E (ENSPMRG00000021498) ENSPMRG00000021502 Archelosauria ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00390000009595.b ENSGT00940000162059 ENSGT00390000011987 ENSGT01050000244879.a.b ENSGT00940000154396.b.a ENSGT00390000009016 ENSGT00940000154739.A ENSGT00390000005830 ENSGT00390000014585 ENSGT00950000182993.B.b ENSGT00440000038032 ENSGT00940000163693 ENSGT00940000156051 ENSGT00940000167422 ENSGT00940000160312 ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT01030000234559.a.a.b.a ENSGT00940000166147 ENSGT00390000009916 ENSGT00940000154990 ENSGT00940000154912 ENSGT00940000160578 ENSGT00940000159684 ENSGT00390000004692.d.a ENSGT00940000163111.a.b.a ENSGT00530000063936.a ENSGT00940000154382.a.a ENSGT00940000153877 ENSGT00940000158483 ENSGT00940000156662.d ENSGT00390000012903 Chinese turtle MODERN SPECIES 1773 NDUFB7 (ENSPSIG00000017656) TECR (ENSPSIG00000017736) DNAJB1 (ENSPSIG00000006672) GIPC1 (ENSPSIG00000007039) ##22 PTGER1 (ENSPSIG00000007226) ENSPSIG00000008343 PKN1 (ENSPSIG00000009269) DDX39A (ENSPSIG00000011417) ENSPSIG00000011780 ADGRL1 (ENSPSIG00000011902) ASF1B (ENSPSIG00000013109) ENSPSIG00000013223 ENSPSIG00000014825 ENSPSIG00000014901 ENSPSIG00000014905 ENSPSIG00000014961 LRRC8E (ENSPSIG00000015851) MAP2K7 (ENSPSIG00000016811) EVI5L (ENSPSIG00000017279) Testudinidae ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00940000160666.n ENSGT00390000018759 ENSGT00950000182886.a.a.b ENSGT00940000160312 ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT01030000234559.a.a.b.a ENSGT00940000166147 ENSGT00390000009916 ENSGT00940000154912 ENSGT00940000160578 ENSGT00980000199422 ENSGT00940000159684.jb ENSGT00390000004692.d.a.k ENSGT00940000163111.a.b.a.e.a ENSGT00530000063936.a ENSGT00940000154382.a.a ENSGT00390000017201.j ENSGT00940000155151.b ENSGT00940000157892 ENSGT00940000167202 Goode s thornscrub tortoise MODERN SPECIES 147 ENSGEVG00005020168 ENSGEVG00005020156 ENSGEVG00005020142 ENSGEVG00005020127 ENSGEVG00005020118 ENSGEVG00005020110 ENSGEVG00005020095 ENSGEVG00005020072 TECR (ENSGEVG00005020060) DNAJB1 (ENSGEVG00005020055) GIPC1 (ENSGEVG00005020045) ##22 PTGER1 (ENSGEVG00005020041) ENSGEVG00005020028 C19orf67 (ENSGEVG00005019979) PKN1 (ENSGEVG00005019922) DDX39A (ENSGEVG00005019887) ADGRE5 (ENSGEVG00005019786) ENSGEVG00005019766 ADGRL1 (ENSGEVG00005014814) ENSGEVG00005013574 ENSGEVG00005013464 ENSGEVG00005013360 ENSGEVG00005013324 ENSGEVG00005013180 ENSGEVG00005015253 ENSGEVG00005015231 painted turtle MODERN SPECIES 850 MAP2K7 (ENSCPBG00000010125) ENSCPBG00000010137 EVI5L (ENSCPBG00000010149) ENSCPBG00000010171 ENSCPBG00000010196 ADGRL1 (ENSCPBG00000010267) ENSCPBG00000011739 ASF1B (ENSCPBG00000011742) ENSCPBG00000011748 ENSCPBG00000011757 ENSCPBG00000011761 ENSCPBG00000011768 NDUFB7 (ENSCPBG00000011786) TECR (ENSCPBG00000011788) DNAJB1 (ENSCPBG00000011797) GIPC1 (ENSCPBG00000011802) ##22 PTGER1 (ENSCPBG00000011808) ENSCPBG00000011817 C19orf67 (ENSCPBG00000011838) PKN1 (ENSCPBG00000011851) DDX39A (ENSCPBG00000011879) Three-toed box turtle DUPLICATION Three-toed box turtle MODERN SPECIES 97 ENSTMTG00000017237 ENSTMTG00000017215 #10 ENSTMTG00000017146 #9 ENSTMTG00000017021 ENSTMTG00000017007 #11 ENSTMTG00000016990 #14 ENSTMTG00000016956 #15 ENSTMTG00000016796 ENSTMTG00000016762 #16 ENSTMTG00000016685 #17 ENSTMTG00000016625 #18 ENSTMTG00000016610 ENSTMTG00000016589 ENSTMTG00000013158 #19 ENSTMTG00000013167 #21 ENSTMTG00000013110 ##22 ENSTMTG00000013092 ENSTMTG00000012931 ENSTMTG00000012676 ENSTMTG00000012559 ENSTMTG00000012517 ENSTMTG00000012498 ENSTMTG00000012448 ENSTMTG00000012421 ENSTMTG00000012364 ENSTMTG00000012342 ENSTMTG00000012326 ENSTMTG00000012310 ENSTMTG00000012291 ENSTMTG00000012281 ENSTMTG00000012268 Archosauria ANCESTRAL SPECIES 67 ENSGT00940000158035 ENSGT01030000234635.a.a.a.b ENSGT00940000159130 ENSGT00950000183036.b ENSGT00940000158718 ENSGT00940000161423 ENSGT00940000159979 ENSGT00530000063777.a.a.a ENSGT00530000063777.a.a.b ENSGT00940000154549.b ENSGT00550000075140 ENSGT00390000016884 ENSGT00940000162025 ENSGT00940000167422 ENSGT00940000160312 ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT00390000000976 ENSGT00390000018759 ENSGT00950000182886.a.a.b Neognathae ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT01030000234635.a.a.a.b ENSGT00940000159130 ENSGT00950000183036.b ENSGT00940000155021 ENSGT00940000158718 ENSGT00940000161423 ENSGT00940000159979 ENSGT00530000063777.a.a.a ENSGT00530000063777.a.a.b ENSGT00940000154549.b ENSGT00550000075140 ENSGT00390000016884 ENSGT00940000162025 ENSGT00940000167422 ENSGT00940000160312 ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT00390000000976 ENSGT00390000018759 ENSGT00950000182886.a.a.b Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT01030000234635.a.a.a.b ENSGT00940000159130 ENSGT00950000183036.b ENSGT00940000155021 ENSGT00940000158718 ENSGT00940000161423 ENSGT00940000159979 ENSGT00530000063777.a.a.a ENSGT00530000063777.a.a.b ENSGT00940000154549.b ENSGT00550000075140 ENSGT00390000016884 ENSGT00940000162025 ENSGT00940000167422 ENSGT00940000160312 ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT00390000000976 ENSGT00390000018759 ENSGT00950000182886.a.a.b Passeriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003420.a.a ##22 Passeriformes_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003420.a.a ##22 Zebra finch MODERN SPECIES 24 ENSTGUG00000023198 ENSTGUG00000022220 S1PR2 (ENSTGUG00000019457) ENSTGUG00000028832 ATP13A1 (ENSTGUG00000029426) ENSTGUG00000020110 ENSTGUG00000026563 PIN1 (ENSTGUG00000028004) OLFM2 (ENSTGUG00000020356) WDR83OS (ENSTGUG00000027701) WDR83 (ENSTGUG00000024056) DHPS (ENSTGUG00000025561) ENSTGUG00000028777 C3 (ENSTGUG00000026277) ENSTGUG00000026606 ENSTGUG00000026029 ##22 DNAJB1 (ENSTGUG00000028620) TECR (ENSTGUG00000029298) NDUFB7 (ENSTGUG00000019936) TRAPPC5 (ENSTGUG00000023204) PCP2 (ENSTGUG00000018878) ENSTGUG00000020304 XAB2 (ENSTGUG00000029015) ENSTGUG00000026107 ENSTGUG00000022595 ENSTGUG00000022079 ENSTGUG00000026867 ENSTGUG00000023637 ENSTGUG00000019157 ENSTGUG00000025465 ENSTGUG00000026670 Flycatcher MODERN SPECIES 140 ENSFALG00000025836 ##22 Great tit MODERN SPECIES 287 MAP2K7 (ENSPMJG00000002457) ENSPMJG00000002448 ENSPMJG00000002445 UBL5 (ENSPMJG00000002443) ENSPMJG00000002415 ENSPMJG00000002407 EMC10 (ENSPMJG00000002345) ENSPMJG00000002340 XAB2 (ENSPMJG00000002318) PCP2 (ENSPMJG00000002303) TRAPPC5 (ENSPMJG00000002296) ENSPMJG00000002286 TECR (ENSPMJG00000002272) GIPC1 (ENSPMJG00000002256) ##22 EVI5L (ENSPMJG00000002230) ENSPMJG00000002223 ENSPMJG00000002203 Neognathae_c ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT00940000154063.C.a.b ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a ENSGT00940000158035 ENSGT01030000234635.a.a.a.b ENSGT00940000159130 ENSGT00950000183036.b ENSGT00940000155021 ENSGT00940000158718 ENSGT00940000161423 ENSGT00940000159979 ENSGT00530000063777.a.a.a ENSGT00530000063777.a.a.b ENSGT00940000154549.b ENSGT00940000167422 ENSGT00940000160312 ENSGT00390000003420.a.a ##22 Golden eagle MODERN SPECIES 2 TNFSF14 (ENSACCG00020003613) ILVBL (ENSACCG00020003587) SYDE1 (ENSACCG00020003564) ENSACCG00020003551 ENSACCG00020003543 MCOLN1 (ENSACCG00020003343) PGLYRP2 (ENSACCG00020003313) ENSACCG00020003295 WIZ (ENSACCG00020003274) AKAP8L (ENSACCG00020003203) AKAP8 (ENSACCG00020003131) BRD4 (ENSACCG00020003099) TECR (ENSACCG00020003055) ENSACCG00020003044 DNAJB1 (ENSACCG00020003032) GIPC1 (ENSACCG00020003020) ##22 ENSACCG00020002999 GBP6 (ENSACCG00020002983) ENSACCG00020002976 ENSACCG00020002962 ENSACCG00020002947 OR10Z1 (ENSACCG00020002930) LRRTM3 (ENSACCG00020002925) CTNNA3 (ENSACCG00020002910) DNAJC12 (ENSACCG00020002889) SIRT1 (ENSACCG00020002874) HERC4 (ENSACCG00020002838) MYPN (ENSACCG00020002779) ATOH7 (ENSACCG00020002730) PBLD (ENSACCG00020002719) HNRNPH3 (ENSACCG00020002701) Phasianidae ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00530000063615.b ENSGT00390000013732 ENSGT00950000183135.A.b ENSGT00390000018759 ENSGT00940000160312 ENSGT00390000003420.a.a ##22 ENSGT00530000063777.a.a.b ENSGT00530000063777.a.a.a ENSGT00940000156787.v ENSGT00940000161423 ENSGT00940000158718 ENSGT00940000155021 ENSGT00950000183036.b ENSGT00940000159130 ENSGT01030000234635.a.a.a.b ENSGT00940000158035 ENSGT00940000154063.C.a.b ENSGT00940000159125 ENSGT01030000234575.c.a.b.c ENSGT00940000153846.a.b Chicken MODERN SPECIES 23 ATP13A1 (ENSGALG00010002581) MVB12A (ENSGALG00010002573) DSN1 (ENSGALG00010003968) PBX4 (ENSGALG00010002547) LPAR2 (ENSGALG00010002533) MAST1 (ENSGALG00010002518) YJU2B (ENSGALG00010003249) MRI1 (ENSGALG00010003248) ENSGALG00010003245 ENSGALG00010003211 ENSGALG00010003208 CC2D1A (ENSGALG00010003191) DCAF15 (ENSGALG00010002857) TECR (ENSGALG00010003933) DNAJB1 (ENSGALG00010003909) GIPC1 (ENSGALG00010003887) ##22 AKAP8 (ENSGALG00010003875) AKAP8L (ENSGALG00010003865) RASAL3 (ENSGALG00010003842) RASAL3 (ENSGALG00010003815) PGLYRP2 (ENSGALG00010003811) CYP4F11 (ENSGALG00010003634) MCOLN1 (ENSGALG00010003627) PNPLA6 (ENSGALG00010003585) SYDE1 (ENSGALG00010003479) ENSGALG00010003476 ILVBL (ENSGALG00010003468) C3 (ENSGALG00010003164) ENSGALG00010003158 VAV1 (ENSGALG00010003064) ENSGALG00010003774 Turkey MODERN SPECIES 1252 ENSMGAG00000013403 NDUFB7 (ENSMGAG00000021215) ENSMGAG00000018450 GIPC1 (ENSMGAG00000017282) ##22 ENSMGAG00000009065 ENSMGAG00000009063 ENSMGAG00000020656 Cyclostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003420.a.a ##22 Hagfish MODERN SPECIES 749 ENSEBUG00000005148 #22 psmd9 (ENSEBUG00000005137) gipc1 (ENSEBUG00000014539) ##22 ENSEBUG00000014632 ENSEBUG00000006442 ENSEBUG00000012110